View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21671_high_8 (Length: 359)

Name: NF21671_high_8
Description: NF21671
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21671_high_8
NF21671_high_8
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (86-338)||(25175563-25175815)
chr6 (86-338)||(27653983-27654235)
chr6 (86-338)||(16825752-16826006)
chr6 (1-327)||(23153458-23153785)
chr6 (1-334)||(14626045-14626377)
chr6 (1-334)||(1650022-1650352)
chr6 (74-327)||(1657748-1657999)
chr6 (74-338)||(35009439-35009702)
chr6 (74-327)||(15862484-15862734)
chr6 (1-69)||(23148266-23148334)
chr6 (74-270)||(29665941-29666137)
chr6 (74-159)||(27751603-27751688)
chr6 (90-174)||(29605612-29605696)
chr6 (1-32)||(4991396-4991427)
chr6 (1-32)||(18002396-18002427)
chr6 (1-32)||(23995247-23995278)
chr6 (1-32)||(26090059-26090090)
chr6 (1-30)||(15742121-15742150)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (86-338)||(25426628-25426880)
chr5 (86-338)||(12374-12626)
chr5 (86-338)||(22366481-22366733)
chr5 (111-338)||(18778017-18778244)
chr5 (86-338)||(19499899-19500151)
chr5 (86-338)||(21073595-21073847)
chr5 (1-338)||(23506965-23507301)
chr5 (111-338)||(43443420-43443647)
chr5 (1-338)||(27182472-27182810)
chr5 (111-338)||(4200010-4200237)
chr5 (111-338)||(27009841-27010068)
chr5 (1-338)||(22053754-22054096)
chr5 (1-338)||(18530989-18531330)
chr5 (74-327)||(34939289-34939540)
chr5 (86-286)||(29188284-29188483)
chr5 (74-221)||(20623085-20623232)
chr5 (74-221)||(21233528-21233675)
chr5 (76-220)||(25900408-25900552)
chr5 (74-221)||(16536313-16536460)
chr5 (74-221)||(37052860-37053007)
chr5 (294-334)||(29190482-29190522)
chr5 (1-32)||(16105967-16105998)
chr5 (1-32)||(20623286-20623317)
chr5 (1-32)||(21233443-21233474)
chr5 (1-32)||(25900321-25900352)
chr5 (1-32)||(37053061-37053092)
chr5 (297-338)||(17471803-17471844)
chr5 (90-174)||(29918127-29918212)
chr5 (81-170)||(32950862-32950951)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (86-338)||(19886661-19886913)
chr2 (1-333)||(462743-463074)
chr2 (1-338)||(8891242-8891580)
chr2 (1-338)||(20627239-20627576)
chr2 (1-338)||(36982365-36982704)
chr2 (1-338)||(19794630-19794967)
chr2 (74-338)||(17396653-17396916)
chr2 (1-338)||(43642882-43643220)
chr2 (1-338)||(24341310-24341652)
chr2 (124-338)||(7507894-7508107)
chr2 (74-338)||(25265390-25265653)
chr2 (74-221)||(19689401-19689548)
chr2 (74-221)||(23820187-23820334)
chr2 (1-96)||(22863169-22863266)
chr2 (74-221)||(14906440-14906587)
chr2 (74-221)||(20015127-20015274)
chr2 (1-32)||(9652797-9652828)
chr2 (1-32)||(14906355-14906386)
chr2 (1-32)||(19689316-19689347)
chr2 (1-32)||(22284278-22284309)
chr2 (1-32)||(23820388-23820419)
chr2 (1-32)||(25213372-25213403)
chr2 (91-172)||(68156-68238)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (86-338)||(47357654-47357906)
chr4 (1-338)||(13246430-13246768)
chr4 (1-338)||(54118169-54118507)
chr4 (111-338)||(10644219-10644446)
chr4 (1-238)||(121989-122225)
chr4 (74-330)||(13048221-13048477)
chr4 (1-338)||(15675010-15675352)
chr4 (1-270)||(10104171-10104445)
chr4 (74-338)||(26680201-26680463)
chr4 (101-338)||(31115629-31115865)
chr4 (74-221)||(10488678-10488825)
chr4 (74-221)||(16327926-16328073)
chr4 (1-137)||(33240900-33241042)
chr4 (242-338)||(111395-111491)
chr4 (90-172)||(40885570-40885652)
chr4 (1-106)||(31132545-31132656)
chr4 (294-338)||(10104450-10104494)
chr4 (1-32)||(14952085-14952116)
chr4 (1-32)||(15135908-15135939)
chr4 (1-32)||(15272212-15272243)
chr4 (1-32)||(16327841-16327872)
chr4 (1-32)||(16609014-16609045)
chr4 (1-32)||(26680517-26680548)
chr4 (91-172)||(15044992-15045074)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-336)||(3509-3843)
scaffold0266 (1-338)||(1124-1461)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (1-338)||(14842488-14842824)
chr3 (86-338)||(55316219-55316471)
chr3 (86-338)||(41270075-41270327)
chr3 (1-338)||(2049810-2050146)
chr3 (1-338)||(12030074-12030410)
chr3 (1-327)||(13838905-13839231)
chr3 (111-338)||(16821139-16821366)
chr3 (74-338)||(13975722-13975985)
chr3 (37-338)||(15858986-15859287)
chr3 (74-338)||(45860805-45861068)
chr3 (64-339)||(51158008-51158282)
chr3 (74-338)||(13954890-13955153)
chr3 (81-338)||(15936634-15936890)
chr3 (1-338)||(16744042-16744377)
chr3 (81-335)||(15938476-15938729)
chr3 (1-334)||(15614838-15615168)
chr3 (74-338)||(17912483-17912744)
chr3 (1-120)||(19260750-19260869)
chr3 (1-137)||(19231981-19232120)
chr3 (74-221)||(2449238-2449385)
chr3 (90-174)||(4145814-4145898)
chr3 (297-338)||(15468555-15468596)
chr3 (225-338)||(47984650-47984763)
chr3 (225-338)||(47993937-47994050)
chr3 (225-338)||(48003224-48003337)
chr3 (225-338)||(48012510-48012623)
chr3 (1-32)||(2449153-2449184)
chr3 (1-32)||(16261777-16261808)
chr3 (1-32)||(16933870-16933901)
chr3 (1-32)||(17912399-17912430)
chr3 (1-32)||(17955885-17955916)
chr3 (1-32)||(23492696-23492727)
chr3 (1-32)||(38168237-38168268)
chr3 (1-32)||(53771365-53771396)
chr3 (1-35)||(15857164-15857198)
chr3 (81-170)||(11986173-11986262)
chr3 (90-131)||(14080715-14080756)
chr3 (297-338)||(22275209-22275250)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-338)||(5991-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-338)||(883-1218)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-338)||(48598-48934)
scaffold0023 (111-338)||(36093-36320)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-338)||(20931345-20931681)
chr1 (1-338)||(41394222-41394558)
chr1 (111-338)||(18601143-18601370)
chr1 (1-338)||(20913037-20913366)
chr1 (86-338)||(5072388-5072640)
chr1 (1-338)||(20893552-20893889)
chr1 (1-338)||(37844375-37844714)
chr1 (1-338)||(20445679-20446018)
chr1 (13-338)||(20531444-20531770)
chr1 (124-338)||(22227809-22228022)
chr1 (124-338)||(22232506-22232719)
chr1 (111-334)||(2116258-2116481)
chr1 (1-272)||(45051489-45051757)
chr1 (74-221)||(51452608-51452755)
chr1 (111-334)||(45051446-45051649)
chr1 (1-32)||(15861327-15861358)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (86-338)||(10989410-10989661)
chr7 (111-338)||(2437457-2437684)
chr7 (1-336)||(16211768-16212102)
chr7 (1-338)||(3059966-3060302)
chr7 (1-338)||(13036939-13037277)
chr7 (111-338)||(13911049-13911277)
chr7 (1-338)||(36052667-36053002)
chr7 (1-333)||(11580662-11580997)
chr7 (111-338)||(13572676-13572903)
chr7 (81-338)||(18253842-18254098)
chr7 (74-332)||(25292338-25292595)
chr7 (74-338)||(47481031-47481294)
chr7 (111-338)||(16478987-16479213)
chr7 (74-338)||(7293017-7293279)
chr7 (75-338)||(13321014-13321278)
chr7 (74-221)||(11516343-11516490)
chr7 (74-221)||(15441564-15441711)
chr7 (74-221)||(30262129-30262276)
chr7 (2-195)||(295893-296087)
chr7 (1-32)||(2029244-2029275)
chr7 (1-32)||(7293333-7293364)
chr7 (1-32)||(11516544-11516575)
chr7 (1-32)||(14113904-14113935)
chr7 (1-32)||(15441479-15441510)
chr7 (1-69)||(15709428-15709500)
chr7 (1-32)||(30262044-30262075)
chr7 (1-32)||(42056189-42056220)
chr7 (91-172)||(13377693-13377775)
chr7 (4-32)||(15516765-15516793)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (9-339)||(16193651-16193980)
chr8 (86-338)||(30120722-30120974)
chr8 (148-338)||(222753-222943)
chr8 (148-338)||(736376-736566)
chr8 (148-338)||(860271-860461)
chr8 (1-338)||(43373393-43373731)
chr8 (86-338)||(16674392-16674644)
chr8 (1-327)||(24928717-24929043)
chr8 (111-338)||(21844597-21844824)
chr8 (111-338)||(21851990-21852217)
chr8 (1-338)||(16404901-16405235)
chr8 (86-334)||(6774258-6774505)
chr8 (86-334)||(24548986-24549233)
chr8 (74-338)||(22907214-22907476)
chr8 (74-327)||(17345581-17345832)
chr8 (74-221)||(5238203-5238350)
chr8 (74-221)||(24661248-24661395)
chr8 (74-221)||(43685662-43685809)
chr8 (148-210)||(691908-691970)
chr8 (1-32)||(5238404-5238435)
chr8 (1-32)||(22907129-22907160)
chr8 (1-32)||(24385653-24385684)
chr8 (1-32)||(24661163-24661194)
chr8 (1-32)||(24716763-24716794)
chr8 (1-32)||(43685863-43685894)
chr8 (91-131)||(38533855-38533895)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-338)||(8878-9214)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-338)||(12115-12449)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (111-338)||(42997-43224)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-327)||(171916-172241)
scaffold0001 (1-327)||(177619-177944)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-338)||(4996-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-338)||(26341-26678)
scaffold0162 (74-221)||(8180-8327)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-334)||(41733-42065)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-327)||(247367-247694)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-338)||(128096-128431)
scaffold0008 (111-338)||(31700-31928)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-338)||(36838-37176)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (3-338)||(19206-19543)
scaffold0195 (74-338)||(21290-21553)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-332)||(272031-272361)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (81-314)||(5552-5785)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-338)||(123088-123427)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (111-338)||(35-262)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (142-338)||(64584-64780)
scaffold0026 (81-338)||(107747-108003)
scaffold0026 (89-131)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (81-338)||(48187-48443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-220)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (111-338)||(21141-21367)
scaffold0139 (111-338)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (48-338)||(148721-149012)
scaffold0025 (1-338)||(8849-9191)
scaffold0025 (1-95)||(146843-146937)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (124-338)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (124-338)||(3722-3936)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-220)||(89379-89600)
scaffold0028 (1-125)||(107709-107835)
scaffold0028 (1-32)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (111-334)||(9374-9596)
scaffold0215 (111-334)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (86-232)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (74-338)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (74-338)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (74-338)||(37066-37328)
scaffold0078 (1-32)||(36981-37012)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (74-338)||(41648-41911)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (232-338)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (85-334)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (74-207)||(13636-13769)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (232-338)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (111-240)||(13350-13478)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (74-221)||(26911-27058)
scaffold0141 (81-221)||(22656-22796)
scaffold0141 (1-32)||(22857-22888)
scaffold0141 (1-32)||(27112-27143)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (74-221)||(1582-1729)
scaffold0124 (1-32)||(1497-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (242-338)||(9382-9478)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (74-167)||(3360-3453)
scaffold0361 (282-336)||(3210-3264)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (81-237)||(56106-56262)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (90-131)||(70307-70348)
scaffold0058 (1-32)||(57393-57424)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-32)||(6444-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-32)||(879-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-32)||(9883-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-32)||(13286-13317)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (90-172)||(8174-8257)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-32)||(80187-80218)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-32)||(55904-55935)
scaffold0032 (1-32)||(108076-108107)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-32)||(193398-193429)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (91-172)||(2317-2399)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-43)||(18015-18057)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (124-170)||(45198-45244)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 183  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  184 atgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  284 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23153785 - 23153458
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||     
T  23153785 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgtg 23153686  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  23153685 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 23153586  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  23153585 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    |||||   ||  |||||| || | |||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| |||||| |    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 1650118  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||     
T  1650119 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaa 1650218  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||    
T  1650219 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatg 1650317  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650318 aatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23148334 - 23148266
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148334 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 172  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  173 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 270  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 159  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 174  Q
    |||||||| ||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 18002396 - 18002427
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002396 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 23995278 - 23995247
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995278 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 26090090 - 26090059
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090090 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 15742121 - 15742150
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742121 aaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 18778017 - 18778244
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778017 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 18778116  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778117 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgctt 18778216  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778217 gggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23507301 - 23506965
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23507301 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 23507202  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  23507201 ccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 23507102  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  23507101 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 43443420 - 43443647
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43443420 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 43443519  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443520 ttggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43443619  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443620 gggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 27182472 - 27182810
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |     
T  27182472 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatg 27182571  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  27182572 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 27182671  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  27182672 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 4200010 - 4200237
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4200010 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaa 4200109  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200110 ttggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgctt 4200209  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200210 gggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27010068 - 27009841
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27010068 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaa 27009969  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27009968 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 27009869  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009868 gggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 22053754 - 22054096
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  22053754 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 22053853  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  22053854 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 22053953  T
Q  195 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 294  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  22053954 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  295 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 18530989 - 18531330
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaattc 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||    
T  18530989 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaattc 18531088  T
Q  96 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 195  Q
    || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |    
T  18531089 gtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgt 18531188  T
Q  196 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 295  Q
    ||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||    
T  18531189 gaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 18531287  T
Q  296 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531288 gatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 286
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  76 ggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 175  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  176 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatt 220  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 334
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  294 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 16105998 - 16105967
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105998 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 20623317 - 20623286
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623317 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 21233443 - 21233474
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233443 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 25900321 - 25900352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900321 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 37053092 - 37053061
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053092 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  297 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 174  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 463074 - 462743
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  463074 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 462975  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  462974 ccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 462875  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  462874 ttgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatga 462776  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattga 333  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462775 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8891580 - 8891242
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  8891580 aaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 8891481  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  8891480 ctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 8891381  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |||||    
T  8891380 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgat 8891282  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891281 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 20627239 - 20627576
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  20627239 aaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgc 20627338  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||     
T  20627339 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaa 20627438  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||    
T  20627439 attgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatg 20627537  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627538 aatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 36982365 - 36982704
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  36982365 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 36982464  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 197  Q
     |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36982465 gctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36982564  T
Q  198 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 297  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||    
T  36982565 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  298 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 19794630 - 19794967
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||     
T  19794630 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtg 19794728  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  19794729 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 19794828  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  |||||    
T  19794829 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgat 19794927  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794928 gaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 43642882 - 43643220
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||     
T  43642882 aagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtg 43642981  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| ||||    
T  43642982 ctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaa 43643081  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  |||||    
T  43643082 aattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgat 43643180  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643181 gaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 24341310 - 24341652
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  24341310 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 24341409  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    | | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||     
T  24341410 catgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 24341509  T
Q  195 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 294  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||    |    
T  24341510 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  295 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  224 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 322  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaat-tgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  323 tcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22863266 - 22863169
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863266 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 9652797 - 9652828
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652797 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 14906355 - 14906386
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906355 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 19689316 - 19689347
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689316 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 22284309 - 22284278
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284309 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 23820419 - 23820388
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820419 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13246768 - 13246430
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||     
T  13246768 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtg 13246669  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13246668 ctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13246569  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  13246568 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 54118169 - 54118507
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  54118169 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 54118268  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| ||||    
T  54118269 ctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaa 54118368  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || |||||    
T  54118369 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgat 54118467  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118468 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10644446 - 10644219
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  10644446 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 10644347  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644346 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 10644247  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644246 gggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 122225 - 121989
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  122225 aaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgct 122126  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  122125 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 122026  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgtta 238  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122025 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 330
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 330  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 15675010 - 15675352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  15675010 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 15675109  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  15675110 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 15675209  T
Q  195 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 294  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  15675210 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  295 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 10104171 - 10104445
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||     
T  10104171 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatc 10104270  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  10104271 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 10104370  T
Q  195 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 270  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104371 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33241042 - 33240900
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  33241042 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 33240943  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 137  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240942 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 111491 - 111395
Alignment:
Q  242 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111491 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 172
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885652
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttca 40885652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31132656 - 31132545
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  31132656 aaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 31132557  T
Q  95 cgtactccaact 106  Q
    ||| ||||||||    
T  31132556 cgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 338
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  294 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 14952116 - 14952085
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15135908 - 15135939
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135908 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15272212 - 15272243
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272212 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 16327841 - 16327872
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327841 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 16609014 - 16609045
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609014 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 26680548 - 26680517
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680548 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 3509 - 3843
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  3509 aaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgct 3608  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  3609 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 3708  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||    
T  3709 ttgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1124
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1461 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtgc 1362  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  1361 tccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 1262  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  1261 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 14842488 - 14842824
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14842488 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 14842587  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  14842588 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaa 14842687  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  14842688 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2050146 - 2049810
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2050146 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 2050047  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||| |    
T  2050046 ccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaa 2049947  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  2049946 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 12030074 - 12030410
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12030074 aaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 12030173  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||      
T  12030174 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaag 12030273  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12030274 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13839231 - 13838905
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  13839231 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtgc 13839132  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  13839131 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 13839032  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  13839031 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 338
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  37 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  135 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgtt 234  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  235 gttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15859283  T
Q  335 gatg 338  Q
    ||||    
T  15859284 gatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 339
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  64 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 163  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  164 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaa 263  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  264 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 339  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 338
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 280  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  281 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 16744042 - 16744377
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16744042 aaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgct 16744141  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  16744142 ccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaa 16744241  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    |||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || || |  |||||||    
T  16744242 ttgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatga 16744339  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744340 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 335
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 280  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  281 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 335  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614838
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| || |    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat-gtaattttg--cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgc 15615072  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  15615071 tcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaat 15614972  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||    
T  15614971 atggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatg 15614873  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614872 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| |  |||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 19260750 - 19260869
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19260750 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgct 19260849  T
Q  101 ccaactatgttgttatgttt 120  Q
    | || |||| || |||||||    
T  19260850 ctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19232120 - 19231981
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  19232120 aaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 19232021  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 137  Q
     |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232020 gctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 174  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  297 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  225 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 324  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  325 atggattgatgatg 338  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  225 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 324  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  325 atggattgatgatg 338  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  225 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 324  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  325 atggattgatgatg 338  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  225 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 324  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  325 atggattgatgatg 338  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 2449153 - 2449184
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449153 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 16261808 - 16261777
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261808 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 16933870 - 16933901
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933870 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 17912399 - 17912430
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912399 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 17955885 - 17955916
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955885 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 23492727 - 23492696
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492727 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 38168268 - 38168237
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168268 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 53771396 - 53771365
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771396 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 15857164 - 15857198
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 35  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857164 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  297 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 5991 - 6326
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5991 aaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 6090  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | || |    
T  6091 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaa 6190  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||    
T  6191 ttgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 883 - 1218
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  883 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 982  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  983 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaa 1082  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  | ||||||| | |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  1083 ttgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48934 - 48598
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48934 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 48835  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |    
T  48834 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaa 48735  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |||||||    
T  48734 ttgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20931681 - 20931345
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20931681 aaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 20931582  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20931581 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 20931482  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  20931481 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41394558 - 41394222
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41394558 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 41394459  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  41394458 ccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 41394359  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||   |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||    
T  41394358 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 41394260  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394259 atcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 18601143 - 18601370
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18601143 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 18601242  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18601243 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgctt 18601342  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601343 gggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20913366 - 20913037
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20913366 aaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgct 20913267  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20913266 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 20913167  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||       | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  20913166 ttgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaa-------tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 20893552 - 20893889
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |     
T  20893552 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcttg 20893650  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  20893651 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 20893750  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  20893751 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 37844375 - 37844714
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |     
T  37844375 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatg 37844474  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tga 197  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || |||    
T  37844475 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtga 37844574  T
Q  198 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 297  Q
    | |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  37844575 aaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  298 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20446018 - 20445679
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20446018 aaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20445919  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 197  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||    
T  20445918 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20445819  T
Q  198 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 297  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  20445818 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  298 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531444
Alignment:
Q  13 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||     
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| |||||||| ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  20531570 ttggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 20531472  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531471 gggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22227924  T
Q  224 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 323  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22227923 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22227824  T
Q  324 catggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||    
T  22227823 catggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22232621  T
Q  224 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 323  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22232620 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22232521  T
Q  324 catggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||    
T  22232520 catggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2116481 - 2116258
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  2116481 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 2116382  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 309  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||    
T  2116381 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgct 2116283  T
Q  310 tgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  2116282 tgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051489
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||      
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat-gtgattttg--cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgt 45051661  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  45051660 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 45051561  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 272  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051560 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45051649 - 45051446
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  45051649 tgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 45051550  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||                  || ||||||||| | |||||    
T  45051549 ttggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat------------------tg-ttgatgaatcactgctt 45051470  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  45051469 gggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2437684 - 2437457
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2437684 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaa 2437585  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437584 ttggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 2437485  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  2437484 gagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16212102 - 16211768
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  16212102 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgct 16212003  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  16212002 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16211903  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  16211902 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 336  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3060302 - 3059966
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3060302 aaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 3060203  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  3060202 ccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaa 3060103  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  3060102 ttatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatga 3060004  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060003 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 13036939 - 13037277
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  13036939 aaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 13037038  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13037039 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13037138  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || |||||    
T  13037139 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 13911049 - 13911277
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13911049 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 13911148  T
Q  211 agggtgaatttctcct-aagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 309  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13911149 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttct 13911248  T
Q  310 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911249 tgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36053002 - 36052667
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  ||    
T  36053002 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttata 36052903  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36052902 ctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 36052803  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||    
T  36052802 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 11580662 - 11580997
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattcg 96  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||||    
T  11580662 aaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattcg 11580761  T
Q  97 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 196  Q
    | |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  11580762 tgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 11580861  T
Q  197 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 296  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  11580862 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  297 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 333  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13572903 - 13572676
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13572903 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 13572804  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13572803 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 13572704  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572703 gggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 338
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 280  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  281 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 332
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 332  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| |  |||||| || ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  75 tggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  174 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 271  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| |  |||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  272 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  2 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||      
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 195  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 2029275 - 2029244
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029275 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 7293364 - 7293333
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293364 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 11516575 - 11516544
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516575 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 14113904 - 14113935
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113904 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15441479 - 15441510
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441479 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15709500 - 15709428
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 69  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709500 aaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 30262044 - 30262075
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262044 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 42056189 - 42056220
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056189 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  4 gtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 16193651 - 16193980
Alignment:
Q  9 ggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16193651 ggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 16193750  T
Q  109 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  16193751 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16193850  T
Q  209 aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 308  Q
    ||  ||||||||| | | || ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||    
T  16193851 aattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 16193949  T
Q  309 ttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193950 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 148 - 338
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  248 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 148 - 338
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  248 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 148 - 338
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  248 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 43373393 - 43373731
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||     
T  43373393 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgtg 43373492  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  43373493 ctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 43373592  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  43373593 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 338
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 24928717 - 24929043
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24928717 aaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 24928816  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  24928817 tccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 24928916  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||    |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  24928917 attgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 21844597 - 21844824
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21844597 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21844696  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844697 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21844796  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844797 gggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 21851990 - 21852217
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21851990 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21852089  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852090 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21852189  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852190 gggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 16404901 - 16405235
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||     
T  16404901 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtg 16404999  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| ||||    
T  16405000 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaa 16405099  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||  |||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||    
T  16405100 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgat 16405195  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405196 gaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 334
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 285  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  286 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 5238435 - 5238404
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238435 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 22907129 - 22907160
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907129 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 24385653 - 24385684
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385653 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 24661163 - 24661194
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661163 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 24716763 - 24716794
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716763 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 43685894 - 43685863
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685894 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533855
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 38533855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9214 - 8878
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  9214 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgct 9115  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| |    
T  9114 ccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaa 9015  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  9014 ttgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12449 - 12115
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12449 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 12351  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    || |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||     
T  12350 tctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 12251  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  12250 attgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttg-taat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 172241 - 171916
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  172241 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgct 172142  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |    
T  172141 ccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaa 172042  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  172041 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 177944 - 177619
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  177944 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgct 177845  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |    
T  177844 ccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaa 177745  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  177744 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  10 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  109 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 208  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  209 aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 308  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  309 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 26341 - 26678
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| |    
T  26341 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtgc 26440  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  26441 tccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 26540  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  26541 attgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42065 - 41733
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42065 aaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 41966  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  41965 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaa 41866  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   ||||||    
T  41865 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 247367 - 247694
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  247367 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 247466  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  247467 ctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 247566  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  247567 aattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 128096 - 128431
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  128096 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 128195  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| |||| |    
T  128196 tcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaa 128295  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||| ||  || |||||| |  || |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||    
T  128296 ttgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  211 agggtgaatttctcct-aagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 309  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  310 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 36838 - 37176
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||     
T  36838 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtg 36937  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36938 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 37037  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 298  Q
     |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  37038 aattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 37136  T
Q  299 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37137 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  3 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  200 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 299  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  300 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 272361 - 272031
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  272361 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtact 272262  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |    
T  272261 ccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaa 272162  T
Q  201 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 300  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || |||||||    
T  272161 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  301 ataattgcttgggtatgcatattcatggattg 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 81 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 280  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  281 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 314  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 123088 - 123427
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  123088 aaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 123187  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 197  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  123188 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 123287  T
Q  198 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 297  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  123288 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  298 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 35
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  262 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaa 163  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 63  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  62 gggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 338
Target Start/End: Original strand, 64584 - 64780
Alignment:
Q  142 ttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatg 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  64584 ttgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatt 64683  T
Q  242 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64684 tgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 280  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  281 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  89 taaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 280  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  281 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51328
Alignment:
Q  2 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactc 101  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  102 caactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 201  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  202 tgtgctaaaagggtgaatt 220  Q
    |||||| ||  ||||||||    
T  51310 tgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 21141 - 21367
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21141 tgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaa 21240  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21241 ttggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgctt 21339  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||    
T  21340 gagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  48 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  146 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgag 245  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  246 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9191 - 8849
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  9191 aaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaatt 9092  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  9091 cgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 8992  T
Q  195 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 294  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |  |    
T  8991 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgt 8893  T
Q  295 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8892 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 146937 - 146843
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  146937 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattc 146843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  224 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 323  Q
     || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  324 catggattgatgatg 338  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttc 222  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  223 tcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 322  Q
    | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  323 tcatggattgatgatg 338  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 89379 - 89600
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  89379 aaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 89478  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| ||||    
T  89479 ctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaa 89578  T
Q  199 gattgtgctaaaagggtgaatt 220  Q
     |||||||| ||  ||||||||    
T  89579 aattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 107709 - 107835
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||     
T  107709 aaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgtg 107808  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatg 125  Q
    |||||||| || || ||| ||||||||    
T  107809 ctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 334
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 334
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 310  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  311 gggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 232
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttg 232  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||   | |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 272  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  273 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||    |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 36981 - 37012
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36981 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 273  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  274 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 232 - 338
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  232 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 331  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  332 gatgatg 338  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  85 ttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 184  Q
    ||||||||||||| |||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  185 tgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 283  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  284 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 334  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13636
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 207  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 232 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  232 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 331  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  332 gatgatg 338  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 240
Target Start/End: Original strand, 13350 - 13478
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  13350 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 13449  T
Q  211 agggtgaatttctcctaagttgttgttaat 240  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13450 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaat 13478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 22888 - 22857
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 27143 - 27112
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27143 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 221  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 1497 - 1528
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1497 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9382
Alignment:
Q  242 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 338  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9478 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 167  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  282 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 336  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 237
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56262
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg--ttcatatatg 178  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||  || |  ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  179 caaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgtt 237  Q
     | |||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgtt 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 57393 - 57424
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57393 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 6444 - 6475
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6444 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 879 - 910
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 9883 - 9914
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9883 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 13286 - 13317
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13286 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 80218 - 80187
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80218 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 55935 - 55904
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55935 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 108076 - 108107
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108076 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 193398 - 193429
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193398 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 18057 - 18015
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 43  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18057 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 170  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University