View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21672_high_32 (Length: 334)

Name: NF21672_high_32
Description: NF21672
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21672_high_32
NF21672_high_32
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (1-320)||(12687431-12687750)
chr7 (1-320)||(11553123-11553442)
chr7 (1-320)||(14954550-14954869)
chr7 (7-320)||(15154673-15154986)
chr7 (7-320)||(17337-17650)
chr7 (10-308)||(8707544-8707842)
chr7 (10-293)||(15161105-15161388)
chr7 (10-308)||(8198567-8198865)
chr7 (10-308)||(18551791-18552089)
chr7 (10-308)||(44791384-44791682)
chr7 (7-308)||(14332333-14332634)
chr7 (1-308)||(10870925-10871232)
chr7 (10-293)||(11237261-11237544)
chr7 (1-293)||(23516817-23517109)
chr7 (1-308)||(18177672-18177979)
chr7 (10-293)||(13686002-13686286)
chr7 (7-320)||(14037743-14038056)
chr7 (7-320)||(14347773-14348086)
chr7 (7-299)||(15203815-15204107)
chr7 (5-323)||(12206796-12207114)
chr7 (5-299)||(14264264-14264558)
chr7 (5-323)||(15102597-15102915)
chr7 (5-300)||(19147146-19147441)
chr7 (5-300)||(20746545-20746840)
chr7 (58-307)||(15624539-15624788)
chr7 (10-300)||(16072313-16072603)
chr7 (4-300)||(11388447-11388742)
chr7 (5-299)||(8212148-8212442)
chr7 (5-300)||(49152236-49152531)
chr7 (5-299)||(11306283-11306577)
chr7 (28-320)||(16950470-16950762)
chr7 (5-323)||(13665488-13665801)
chr7 (5-299)||(13021292-13021586)
chr7 (28-299)||(14286396-14286667)
chr7 (40-300)||(21661933-21662190)
chr7 (28-323)||(18053949-18054244)
chr7 (5-299)||(14129808-14130102)
chr7 (5-299)||(14433626-14433920)
chr7 (46-299)||(1427-1680)
chr7 (43-320)||(6413484-6413761)
chr7 (175-300)||(35964891-35965016)
chr7 (5-299)||(12455638-12455931)
chr7 (43-299)||(26288057-26288312)
chr7 (28-296)||(23199766-23200034)
chr7 (28-296)||(23505893-23506161)
chr7 (112-300)||(26118624-26118812)
chr7 (167-308)||(4440024-4440165)
chr7 (209-308)||(11772274-11772373)
chr7 (252-323)||(9596238-9596309)
chr7 (202-308)||(21674566-21674672)
chr7 (167-308)||(14936443-14936584)
chr7 (28-148)||(15340454-15340574)
chr7 (205-308)||(7824034-7824137)
chr7 (205-308)||(27107807-27107910)
chr7 (202-308)||(17145291-17145397)
chr7 (235-300)||(12456944-12457009)
chr7 (202-308)||(15364071-15364177)
chr7 (252-299)||(15340613-15340660)
chr7 (202-308)||(12368609-12368715)
chr7 (204-308)||(45146688-45146792)
chr7 (229-308)||(12193714-12193793)
chr7 (7-54)||(12254325-12254372)
chr7 (227-296)||(5432641-5432710)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (7-320)||(20249812-20250125)
chr1 (7-320)||(17045099-17045412)
chr1 (2-308)||(16350695-16351001)
chr1 (7-320)||(19106329-19106642)
chr1 (10-308)||(33391125-33391423)
chr1 (7-308)||(50620340-50620641)
chr1 (7-307)||(19760963-19761263)
chr1 (10-293)||(21830268-21830551)
chr1 (10-308)||(21747500-21747797)
chr1 (7-308)||(51333589-51333890)
chr1 (19-308)||(16369271-16369560)
chr1 (1-326)||(41354547-41354872)
chr1 (10-308)||(21836915-21837213)
chr1 (27-308)||(20136760-20137041)
chr1 (7-320)||(16078736-16079030)
chr1 (7-212)||(50612608-50612813)
chr1 (5-323)||(19664957-19665275)
chr1 (28-321)||(20940146-20940439)
chr1 (5-323)||(19854274-19854592)
chr1 (5-299)||(37677039-37677334)
chr1 (5-299)||(20294372-20294666)
chr1 (5-320)||(20856845-20857160)
chr1 (5-300)||(31550285-31550580)
chr1 (121-300)||(11382670-11382849)
chr1 (1-146)||(21163236-21163381)
chr1 (111-320)||(41307891-41308100)
chr1 (5-300)||(22433220-22433515)
chr1 (5-299)||(20075164-20075458)
chr1 (58-323)||(20835969-20836237)
chr1 (28-282)||(20244183-20244437)
chr1 (5-199)||(20395198-20395392)
chr1 (205-308)||(20831488-20831591)
chr1 (5-74)||(24476940-24477009)
chr1 (167-308)||(46518843-46518984)
chr1 (167-321)||(21202370-21202524)
chr1 (206-317)||(22135645-22135756)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-320)||(12523617-12523936)
chr4 (1-308)||(14159433-14159740)
chr4 (1-320)||(14680508-14680827)
chr4 (25-320)||(15149758-15150053)
chr4 (1-320)||(16355197-16355516)
chr4 (10-308)||(12476550-12476848)
chr4 (10-308)||(23955697-23955995)
chr4 (4-308)||(14652252-14652556)
chr4 (1-308)||(19778557-19778864)
chr4 (10-308)||(8386362-8386660)
chr4 (10-308)||(18297155-18297453)
chr4 (7-308)||(16252209-16252510)
chr4 (10-320)||(40472990-40473300)
chr4 (7-308)||(7090380-7090680)
chr4 (1-293)||(14266678-14266970)
chr4 (7-319)||(18227199-18227511)
chr4 (10-308)||(29039168-29039466)
chr4 (4-308)||(27711280-27711584)
chr4 (10-308)||(14303742-14304039)
chr4 (9-308)||(14851130-14851429)
chr4 (7-308)||(8053387-8053688)
chr4 (10-242)||(15364336-15364568)
chr4 (5-320)||(15003376-15003691)
chr4 (5-300)||(15070358-15070653)
chr4 (5-300)||(15245869-15246164)
chr4 (5-300)||(3264826-3265121)
chr4 (5-299)||(33222863-33223157)
chr4 (5-300)||(1649309-1649604)
chr4 (5-299)||(16145857-16146151)
chr4 (7-300)||(11207263-11207556)
chr4 (5-299)||(20890928-20891221)
chr4 (7-180)||(14927151-14927324)
chr4 (5-300)||(29453569-29453864)
chr4 (5-300)||(44661898-44662193)
chr4 (109-300)||(15359122-15359313)
chr4 (28-323)||(51606190-51606485)
chr4 (160-296)||(15415062-15415198)
chr4 (47-189)||(18164332-18164474)
chr4 (195-320)||(16676455-16676580)
chr4 (132-299)||(16752665-16752832)
chr4 (204-320)||(1640177-1640293)
chr4 (133-323)||(27900459-27900649)
chr4 (28-239)||(42702871-42703082)
chr4 (205-308)||(14997461-14997564)
chr4 (7-77)||(18607825-18607895)
chr4 (167-308)||(16445236-16445377)
chr4 (205-308)||(15293181-15293284)
chr4 (205-296)||(55375394-55375485)
chr4 (167-308)||(12132433-12132574)
chr4 (256-300)||(15077831-15077875)
chr4 (205-308)||(13247790-13247893)
chr4 (5-97)||(15415214-15415306)
chr4 (197-300)||(8706055-8706158)
chr4 (229-308)||(9291004-9291083)
chr4 (127-308)||(9849502-9849683)
chr4 (5-119)||(15319528-15319642)
chr4 (202-319)||(16685396-16685513)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (7-320)||(65383-65696)
scaffold0042 (1-199)||(39925-40123)
scaffold0042 (252-308)||(39846-39902)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (7-320)||(9522285-9522598)
chr3 (1-320)||(12497808-12498127)
chr3 (7-308)||(17489416-17489717)
chr3 (10-308)||(10905779-10906077)
chr3 (1-308)||(14876762-14877069)
chr3 (10-308)||(10005169-10005467)
chr3 (10-308)||(15348508-15348806)
chr3 (10-308)||(48425016-48425314)
chr3 (10-308)||(13252259-13252557)
chr3 (10-308)||(15589655-15589953)
chr3 (7-308)||(15725196-15725497)
chr3 (7-308)||(16492444-16492745)
chr3 (1-320)||(16370973-16371292)
chr3 (10-308)||(16635342-16635640)
chr3 (10-308)||(20062317-20062615)
chr3 (10-308)||(26792662-26792960)
chr3 (10-308)||(43162666-43162964)
chr3 (1-308)||(5425193-5425499)
chr3 (1-308)||(16412545-16412852)
chr3 (1-308)||(53385281-53385588)
chr3 (7-317)||(16691726-16692036)
chr3 (1-293)||(6600307-6600599)
chr3 (1-293)||(15338829-15339121)
chr3 (1-308)||(15402773-15403080)
chr3 (7-308)||(15208457-15208758)
chr3 (1-293)||(16756863-16757155)
chr3 (1-320)||(16807177-16807496)
chr3 (10-296)||(15227228-15227514)
chr3 (19-308)||(15247725-15248014)
chr3 (28-323)||(15953205-15953500)
chr3 (39-326)||(14571456-14571743)
chr3 (5-323)||(18134583-18134901)
chr3 (46-294)||(13972386-13972634)
chr3 (5-300)||(47123518-47123813)
chr3 (58-317)||(12850522-12850781)
chr3 (5-323)||(13322889-13323207)
chr3 (46-326)||(10420279-10420559)
chr3 (5-300)||(11304033-11304328)
chr3 (5-299)||(11961295-11961589)
chr3 (7-300)||(10383545-10383838)
chr3 (43-294)||(14086285-14086536)
chr3 (5-323)||(12360779-12361097)
chr3 (5-299)||(16329920-16330214)
chr3 (40-323)||(8759319-8759602)
chr3 (28-323)||(13941621-13941916)
chr3 (28-323)||(41177119-41177414)
chr3 (105-299)||(16836771-16836965)
chr3 (46-323)||(44776862-44777139)
chr3 (131-296)||(15016019-15016184)
chr3 (46-296)||(16381194-16381441)
chr3 (5-134)||(31689049-31689178)
chr3 (5-136)||(31945046-31945177)
chr3 (202-308)||(17192865-17192971)
chr3 (167-317)||(18748401-18748551)
chr3 (205-308)||(8274662-8274765)
chr3 (205-308)||(16742966-16743069)
chr3 (241-308)||(6712672-6712739)
chr3 (205-308)||(13975308-13975411)
chr3 (205-308)||(15576524-15576627)
chr3 (205-260)||(267569-267624)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-326)||(21325812-21326137)
chr2 (1-320)||(22757015-22757334)
chr2 (10-308)||(27217597-27217895)
chr2 (10-308)||(16924841-16925139)
chr2 (10-308)||(16981733-16982031)
chr2 (10-308)||(16998581-16998879)
chr2 (10-308)||(17063298-17063596)
chr2 (7-320)||(24708034-24708347)
chr2 (1-308)||(21145594-21145901)
chr2 (1-320)||(24675061-24675380)
chr2 (10-308)||(24261951-24262249)
chr2 (19-308)||(24878559-24878848)
chr2 (1-308)||(44386133-44386440)
chr2 (10-308)||(9609717-9610015)
chr2 (10-308)||(10868431-10868729)
chr2 (10-308)||(22325420-22325718)
chr2 (10-308)||(24709614-24709912)
chr2 (39-308)||(23063687-23063956)
chr2 (7-303)||(23138615-23138911)
chr2 (7-303)||(23550405-23550701)
chr2 (10-308)||(27370850-27371148)
chr2 (7-306)||(23188586-23188885)
chr2 (10-308)||(17066959-17067254)
chr2 (7-247)||(27377096-27377336)
chr2 (10-296)||(23087031-23087317)
chr2 (5-300)||(30211489-30211784)
chr2 (4-321)||(23293533-23293850)
chr2 (87-308)||(24825846-24826067)
chr2 (5-300)||(31830234-31830529)
chr2 (43-300)||(27365651-27365908)
chr2 (1-169)||(41609047-41609215)
chr2 (5-300)||(11358446-11358741)
chr2 (5-300)||(20832561-20832856)
chr2 (5-296)||(23276352-23276643)
chr2 (5-300)||(1063327-1063622)
chr2 (39-300)||(45529127-45529382)
chr2 (28-296)||(27787340-27787608)
chr2 (46-323)||(12573970-12574247)
chr2 (5-269)||(24653921-24654185)
chr2 (28-199)||(24944966-24945137)
chr2 (167-308)||(24831751-24831892)
chr2 (5-90)||(24833355-24833440)
chr2 (168-308)||(22276018-22276158)
chr2 (252-308)||(27368396-27368452)
chr2 (205-308)||(12640483-12640586)
chr2 (202-317)||(25128420-25128535)
chr2 (206-317)||(23817608-23817719)
chr2 (202-308)||(22762133-22762239)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (7-320)||(23573621-23573934)
chr5 (10-308)||(22134550-22134848)
chr5 (1-308)||(27610227-27610534)
chr5 (10-308)||(14999945-15000243)
chr5 (10-308)||(22333093-22333391)
chr5 (10-308)||(37291702-37292000)
chr5 (7-320)||(26738899-26739212)
chr5 (1-308)||(19769833-19770140)
chr5 (1-320)||(23440098-23440417)
chr5 (1-308)||(27668696-27669003)
chr5 (10-293)||(27685621-27685904)
chr5 (10-308)||(40708662-40708960)
chr5 (7-308)||(21984511-21984812)
chr5 (7-308)||(25423068-25423369)
chr5 (1-305)||(23516414-23516718)
chr5 (10-308)||(34566376-34566674)
chr5 (1-320)||(18775650-18775969)
chr5 (10-308)||(16356384-16356682)
chr5 (10-308)||(27518289-27518587)
chr5 (10-308)||(41770724-41771022)
chr5 (39-308)||(20798671-20798940)
chr5 (19-308)||(22348316-22348603)
chr5 (7-308)||(23471108-23471409)
chr5 (10-308)||(29476279-29476577)
chr5 (10-323)||(21890950-21891263)
chr5 (7-307)||(20468303-20468603)
chr5 (19-323)||(23442484-23442788)
chr5 (71-308)||(21498242-21498479)
chr5 (7-235)||(20573400-20573628)
chr5 (7-206)||(21343666-21343865)
chr5 (5-320)||(22381058-22381373)
chr5 (5-300)||(24735825-24736120)
chr5 (5-300)||(24749768-24750063)
chr5 (5-288)||(24737011-24737294)
chr5 (5-323)||(22461811-22462129)
chr5 (5-323)||(22236111-22236429)
chr5 (5-300)||(14887205-14887500)
chr5 (5-320)||(23080283-23080598)
chr5 (6-320)||(24798591-24798905)
chr5 (46-296)||(28923986-28924236)
chr5 (5-300)||(37545710-37546006)
chr5 (5-300)||(20342141-20342436)
chr5 (5-300)||(25847934-25848229)
chr5 (46-296)||(28895160-28895410)
chr5 (29-296)||(21564184-21564451)
chr5 (46-296)||(20821353-20821603)
chr5 (5-299)||(22502538-22502832)
chr5 (46-323)||(20773660-20773937)
chr5 (40-323)||(17269524-17269807)
chr5 (5-248)||(21662306-21662548)
chr5 (39-248)||(21665767-21665975)
chr5 (5-226)||(21404713-21404934)
chr5 (204-308)||(21339492-21339596)
chr5 (205-308)||(27011143-27011246)
chr5 (167-317)||(11210891-11211041)
chr5 (227-308)||(24581292-24581373)
chr5 (5-77)||(21625395-21625467)
chr5 (208-308)||(21937394-21937494)
chr5 (208-308)||(23503505-23503605)
chr5 (262-300)||(21831957-21831995)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-320)||(278845-279164)
scaffold0005 (4-308)||(164736-165040)
scaffold0005 (10-308)||(308640-308938)
scaffold0005 (5-299)||(260284-260578)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (1-320)||(1543241-1543560)
chr6 (1-323)||(5839373-5839695)
chr6 (7-320)||(12497837-12498150)
chr6 (7-320)||(12510751-12511064)
chr6 (7-320)||(27331590-27331903)
chr6 (7-320)||(27392330-27392643)
chr6 (1-293)||(28263381-28263673)
chr6 (1-293)||(28342130-28342422)
chr6 (10-308)||(16626886-16627184)
chr6 (10-308)||(24313337-24313635)
chr6 (1-308)||(19864492-19864799)
chr6 (10-308)||(29592089-29592387)
chr6 (1-308)||(25112357-25112664)
chr6 (1-323)||(16963521-16963843)
chr6 (7-308)||(12505166-12505467)
chr6 (1-293)||(27187241-27187533)
chr6 (1-293)||(27261707-27261999)
chr6 (1-293)||(28292556-28292848)
chr6 (7-326)||(22078839-22079158)
chr6 (10-308)||(2874972-2875270)
chr6 (7-308)||(25610030-25610331)
chr6 (5-300)||(21471410-21471705)
chr6 (1-215)||(17032367-17032581)
chr6 (7-305)||(18408115-18408413)
chr6 (7-286)||(21833172-21833451)
chr6 (1-320)||(25765447-25765765)
chr6 (1-323)||(16927794-16928116)
chr6 (28-300)||(25768023-25768295)
chr6 (7-308)||(22762624-22762925)
chr6 (7-320)||(23078280-23078593)
chr6 (5-287)||(25750618-25750900)
chr6 (29-299)||(22796810-22797080)
chr6 (43-300)||(14131356-14131613)
chr6 (49-320)||(15459189-15459460)
chr6 (19-308)||(18197716-18198005)
chr6 (5-300)||(10469026-10469321)
chr6 (5-300)||(18794499-18794794)
chr6 (5-323)||(8766302-8766620)
chr6 (5-300)||(19879107-19879402)
chr6 (79-323)||(17415369-17415613)
chr6 (19-300)||(21564309-21564590)
chr6 (46-293)||(11287782-11288029)
chr6 (46-293)||(11280689-11280936)
chr6 (5-300)||(24364221-24364516)
chr6 (46-293)||(34645770-34646017)
chr6 (112-320)||(18800858-18801066)
chr6 (1-129)||(22433802-22433930)
chr6 (58-296)||(27560798-27561036)
chr6 (103-323)||(14381621-14381841)
chr6 (121-323)||(28282967-28283169)
chr6 (139-296)||(1640715-1640872)
chr6 (202-302)||(11291818-11291918)
chr6 (160-274)||(25750910-25751024)
chr6 (254-320)||(22433927-22433993)
chr6 (205-308)||(1648953-1649056)
chr6 (205-308)||(16382542-16382645)
chr6 (202-317)||(25655489-25655604)
chr6 (205-308)||(25743256-25743359)
chr6 (202-308)||(16098056-16098162)
chr6 (208-305)||(16233221-16233318)
chr6 (207-308)||(18838077-18838178)
chr6 (227-308)||(23996279-23996360)
chr6 (229-308)||(21413107-21413186)
chr6 (5-77)||(1640608-1640680)
chr6 (205-308)||(18571660-18571763)
chr6 (251-300)||(15078541-15078590)
chr6 (5-117)||(18787697-18787809)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (7-320)||(19977980-19978293)
chr8 (1-308)||(17674490-17674797)
chr8 (1-308)||(21167004-21167311)
chr8 (7-320)||(30313599-30313912)
chr8 (7-320)||(15533393-15533706)
chr8 (7-308)||(23650054-23650355)
chr8 (10-308)||(19112706-19113004)
chr8 (7-320)||(22046386-22046699)
chr8 (7-308)||(32600157-32600458)
chr8 (7-295)||(21250955-21251243)
chr8 (1-326)||(19485319-19485644)
chr8 (7-308)||(20018217-20018518)
chr8 (7-308)||(21394332-21394633)
chr8 (7-308)||(21788825-21789126)
chr8 (7-320)||(22164646-22164959)
chr8 (7-308)||(22987214-22987515)
chr8 (1-320)||(16408500-16408819)
chr8 (10-308)||(22120641-22120939)
chr8 (7-308)||(21922202-21922503)
chr8 (7-320)||(22133496-22133809)
chr8 (7-293)||(22032045-22032331)
chr8 (7-259)||(23948902-23949154)
chr8 (5-300)||(20010375-20010670)
chr8 (29-320)||(21681925-21682216)
chr8 (5-300)||(20396600-20396895)
chr8 (10-300)||(20007866-20008156)
chr8 (5-300)||(23654938-23655233)
chr8 (5-323)||(22061885-22062203)
chr8 (5-300)||(21840428-21840723)
chr8 (5-320)||(29303881-29304196)
chr8 (5-299)||(1266250-1266544)
chr8 (39-300)||(19851456-19851717)
chr8 (39-300)||(19857492-19857753)
chr8 (5-323)||(21324861-21325180)
chr8 (7-233)||(15441194-15441420)
chr8 (5-300)||(6679122-6679417)
chr8 (5-320)||(31416929-31417244)
chr8 (5-299)||(804149-804443)
chr8 (28-296)||(20388133-20388401)
chr8 (5-299)||(14565153-14565447)
chr8 (139-308)||(22377920-22378089)
chr8 (139-308)||(22384095-22384264)
chr8 (5-300)||(6603669-6603964)
chr8 (5-299)||(12304769-12305063)
chr8 (28-323)||(31571294-31571589)
chr8 (4-266)||(16265127-16265389)
chr8 (139-299)||(22051008-22051168)
chr8 (5-269)||(28982368-28982632)
chr8 (5-269)||(28987588-28987852)
chr8 (5-204)||(27347237-27347436)
chr8 (235-320)||(23949161-23949246)
chr8 (167-308)||(22315364-22315505)
chr8 (205-308)||(16877562-16877665)
chr8 (202-317)||(21196960-21197075)
chr8 (205-308)||(21850804-21850907)
chr8 (202-308)||(20652800-20652906)
chr8 (202-308)||(24818083-24818189)
chr8 (270-308)||(18856853-18856891)
chr8 (202-323)||(25282339-25282460)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-320)||(43126-43445)
scaffold0028 (19-308)||(8475-8764)
scaffold0028 (61-294)||(50555-50788)
scaffold0028 (195-308)||(13832-13945)
scaffold0028 (205-308)||(106600-106703)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (7-320)||(14338-14651)
scaffold0044 (10-308)||(601-899)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-320)||(5986-6305)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-308)||(109838-110145)
scaffold0029 (5-300)||(112535-112830)
scaffold0029 (46-296)||(96041-96291)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (7-308)||(1117-1418)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (7-308)||(6001-6302)
scaffold0120 (28-321)||(1538-1831)
scaffold0120 (202-308)||(22867-22973)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-308)||(7349-7656)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-320)||(33588-33907)
scaffold0109 (7-320)||(8574-8887)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-308)||(64058-64365)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (7-320)||(654-967)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (7-308)||(4010-4311)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (7-308)||(219444-219745)
scaffold0012 (7-308)||(229021-229322)
scaffold0012 (205-308)||(33022-33125)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (7-307)||(111999-112299)
scaffold0004 (5-300)||(203503-203798)
scaffold0004 (5-300)||(385795-386090)
scaffold0004 (28-320)||(322703-322995)
scaffold0004 (5-320)||(117544-117859)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-308)||(386-693)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (7-320)||(4420-4733)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (7-308)||(32779-33080)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-308)||(14849-15156)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-320)||(180189-180508)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (7-308)||(16965-17266)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-320)||(15471-15783)
scaffold0333 (206-320)||(15832-15946)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (7-320)||(709-1021)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (19-308)||(3130-3419)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (7-308)||(127226-127527)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (7-308)||(26560-26861)
scaffold0011 (5-299)||(148546-148840)
scaffold0011 (5-323)||(195715-196032)
scaffold0011 (5-199)||(68576-68770)
scaffold0011 (167-308)||(121977-122118)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-323)||(6350-6666)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-293)||(6918-7203)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (10-307)||(15107-15404)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (5-302)||(25752-26049)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (7-292)||(162091-162376)
scaffold0001 (7-308)||(448037-448338)
scaffold0001 (40-320)||(90947-91227)
scaffold0001 (118-197)||(175352-175431)
scaffold0001 (202-296)||(78668-78762)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-293)||(27939-28231)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (7-308)||(287-588)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (5-302)||(884-1181)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (7-308)||(9321-9622)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (7-291)||(26-310)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (7-308)||(5199-5500)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (94-320)||(21932-22158)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (39-308)||(13004-13273)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (28-320)||(47123-47415)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (7-308)||(16492-16793)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (39-308)||(14049-14318)
scaffold0106 (5-319)||(31386-31700)
scaffold0106 (242-319)||(17655-17732)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-320)||(838-1156)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (42-320)||(49506-49784)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (5-307)||(116933-117235)
scaffold0037 (227-308)||(98213-98294)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (7-308)||(16443-16744)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (28-320)||(1-293)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (28-300)||(3874-4146)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (5-320)||(18552-18867)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (5-296)||(10778-11069)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (5-320)||(13916-14231)
scaffold0034 (64-323)||(4965-5224)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (19-300)||(26132-26413)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (28-300)||(51898-52170)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (37-320)||(4758-5041)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (5-323)||(27495-27813)
scaffold0139 (5-319)||(1165-1478)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (5-300)||(9774-10064)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (28-323)||(2750-3045)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (5-323)||(74-392)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (19-301)||(995-1277)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (19-300)||(1204-1485)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (5-320)||(3867-4182)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (5-300)||(14062-14356)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (93-308)||(7854-8069)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (106-302)||(9047-9243)
scaffold0507 (202-317)||(351-466)
scaffold0507 (7-98)||(6955-7046)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (28-300)||(5949-6220)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (19-299)||(19973-20253)
scaffold0298 (5-323)||(13373-13691)
scaffold0298 (5-323)||(17143-17461)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (5-296)||(5630-5920)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (5-296)||(25110-25401)
scaffold0234 (208-295)||(16211-16298)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (5-320)||(27202-27516)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (28-326)||(5011-5309)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (39-300)||(7071-7332)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (5-301)||(18825-19121)
scaffold0090 (112-301)||(23094-23283)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (28-300)||(37201-37473)
scaffold0026 (109-320)||(38189-38400)
scaffold0026 (109-300)||(27372-27563)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (5-300)||(49068-49363)
scaffold0053 (5-299)||(57853-58146)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (5-299)||(25901-26195)
scaffold0113 (5-299)||(16652-16946)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-214)||(16929-17142)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (19-320)||(21686-21987)
scaffold0235 (227-308)||(26004-26085)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (10-321)||(14265-14576)
scaffold0203 (10-173)||(9039-9202)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (5-320)||(39715-40030)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (5-300)||(86539-86834)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (5-323)||(10095-10413)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (5-323)||(61225-61543)
scaffold0067 (28-323)||(67613-67908)
scaffold0067 (5-323)||(52191-52509)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (39-295)||(538-794)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (19-233)||(1167-1381)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (5-323)||(49219-49537)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (73-298)||(58443-58668)
scaffold0058 (29-323)||(19120-19414)
scaffold0058 (5-65)||(59042-59102)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (42-296)||(204-458)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (130-308)||(807-985)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (5-323)||(10864-11182)
scaffold0124 (19-323)||(411-715)
scaffold0124 (202-308)||(7837-7943)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (5-323)||(42345-42663)
scaffold0010 (5-323)||(47411-47729)
scaffold0010 (131-188)||(2252-2309)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (5-317)||(20098-20410)
scaffold0114 (1-300)||(43477-43776)
scaffold0114 (1-300)||(44489-44788)
scaffold0114 (10-194)||(36036-36220)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (151-320)||(7519-7688)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (5-300)||(16748-17043)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (43-294)||(33718-33969)
scaffold0076 (205-308)||(40434-40537)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (28-299)||(248612-248883)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (5-299)||(26237-26531)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-298)||(38924-39221)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (39-296)||(28808-29065)
scaffold0064 (39-296)||(40799-41056)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (5-320)||(6159-6475)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (28-299)||(12817-13088)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (5-299)||(42759-43053)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (28-323)||(7250-7543)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (38-193)||(4567-4722)
scaffold0023 (229-308)||(4481-4560)
scaffold0023 (2-73)||(37008-37079)
scaffold0023 (28-77)||(18996-19045)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (5-239)||(4235-4469)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (145-300)||(1910-2065)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (127-298)||(5311-5482)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (28-208)||(13380-13560)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (28-178)||(2023-2173)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (160-300)||(1-141)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (19-188)||(136109-136278)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (103-323)||(10843-11063)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-85)||(6251-6329)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (252-320)||(3734-3802)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (167-308)||(14661-14802)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (184-320)||(1249-1385)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (205-308)||(46330-46433)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (167-296)||(5879-6008)
scaffold0447 (167-296)||(10493-10622)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (167-296)||(8488-8617)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (202-311)||(13081-13190)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (256-321)||(5466-5531)
scaffold0101 (1-53)||(7498-7550)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (241-308)||(8918-8985)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (205-308)||(14764-14867)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (167-305)||(940-1078)
scaffold1710 (242-323)||(102-183)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (202-308)||(3332-3438)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (202-308)||(10829-10935)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (206-308)||(43715-43817)
scaffold0132 (167-296)||(14795-14924)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (227-308)||(26184-26265)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (227-308)||(23592-23673)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (19-127)||(45835-45943)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (205-308)||(413-516)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (229-308)||(3902-3981)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (205-308)||(8271-8374)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (205-308)||(28293-28396)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (202-308)||(3971-4077)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (167-302)||(1087-1222)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (253-323)||(3367-3437)
scaffold0222 (5-116)||(3487-3598)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (227-308)||(1451-1532)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (167-308)||(24018-24159)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (252-308)||(71442-71498)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (229-308)||(9187-9266)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (227-317)||(820-910)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (5-77)||(895-967)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (5-77)||(9195-9267)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 12687431 - 12687750
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  12687431 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 12687530  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  12687531 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagt 12687630  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12687631 gactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 12687730  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  12687731 tgaatcatcttaactttctc 12687750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11553442 - 11553123
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |    
T  11553442 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgat 11553343  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11553342 aagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagt 11553243  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  11553242 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctct 11553143  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  11553142 tgaatcatcttaactttctc 11553123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 14954550 - 14954869
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |    
T  14954550 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgat 14954649  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14954650 aagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagt 14954749  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14954750 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 14954849  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  14954850 tgaatcatcttaactttctc 14954869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15154986 - 15154673
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15154986 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagcca 15154887  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15154886 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 15154787  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  15154786 caaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatc 15154687  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  15154686 atcttaactttctc 15154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17650 - 17337
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  17650 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 17551  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  17550 ccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 17451  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17450 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 17351  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  17350 atcttaactttctc 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 8707544 - 8707842
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8707544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8707643  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8707644 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8707743  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  8707744 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 8707842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15161388 - 15161105
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15161388 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15161289  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15161288 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15161189  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161188 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15161105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 8198567 - 8198865
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8198567 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8198666  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8198667 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8198766  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  8198767 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 8198865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18552089 - 18551791
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18552089 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18551990  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18551989 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18551890  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18551889 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 18551791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44791682 - 44791384
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44791682 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 44791583  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44791582 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 44791483  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  44791482 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 44791384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 14332333 - 14332634
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14332333 atcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagcca 14332432  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14332433 ccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 14332532  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  14332533 caaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatc 14332632  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  14332633 at 14332634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 10870925 - 10871232
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10870925 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggt 10871024  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10871025 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 10871124  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  10871125 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 10871224  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  10871225 tggatcat 10871232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11237544 - 11237261
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11237544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 11237445  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11237444 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 11237345  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11237344 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcat 11237261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23517109 - 23516817
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  23517109 ctctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 23517010  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  23517009 aagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 23516910  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23516909 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcat 23516817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 18177672 - 18177979
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  18177672 ctctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 18177771  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  18177772 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagt 18177871  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  18177872 gactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 18177971  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
     |||||||    
T  18177972 cgaatcat 18177979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 13686002 - 13686286
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatg-aaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccacc 108  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  13686002 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccacc 13686101  T
Q  109 gttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctca 208  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13686102 gttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 13686201  T
Q  209 aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13686202 aaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcat 13686286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 14037743 - 14038056
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  14037743 atcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 14037842  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  14037843 ccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactct 14037942  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14037943 caaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatc 14038042  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    ||||| ||||||||    
T  14038043 attttaactttctc 14038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 14347773 - 14348086
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  14347773 atcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 14347872  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  14347873 ccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactct 14347972  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14347973 caaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatc 14348072  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    ||||| ||||||||    
T  14348073 attttaactttctc 14348086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 299
Target Start/End: Original strand, 15203815 - 15204107
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  | |    
T  15203815 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactcta 15203914  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || || || |||||||||| |  || ||||||    
T  15203915 ccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactct 15204014  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204015 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 15204107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12207114 - 12206796
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  12207114 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgc 12207015  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||    
T  12207014 cactgttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgact 12206915  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  12206914 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctttta 12206815  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    ||| |||||| || |||||    
T  12206814 tcaatttgaccttttctgt 12206796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14264558 - 14264264
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  14264558 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgc 14264459  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14264458 cactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgact 14264359  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14264358 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 14264264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15102915 - 15102597
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  15102915 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgc 15102816  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  15102815 cactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 15102716  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |    
T  15102715 ctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctctta 15102616  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  15102615 tcatcttgactttctctgt 15102597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 19147146 - 19147441
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  |||| ||||| ||| ||    
T  19147146 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgc 19147245  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19147246 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgact 19147345  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19147346 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 19147441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 20746545 - 20746840
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  |||| ||||| ||| ||    
T  20746545 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgc 20746644  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20746645 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgact 20746744  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20746745 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 20746840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 307
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624788
Alignment:
Q  58 acatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtca 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  158 atttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatc 257  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||   ||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  258 atggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatca 307  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatca 15624788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072313
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 16072313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11388742 - 11388447
Alignment:
Q  4 tgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaag 103  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || |    
T  11388742 tgaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatg 11388643  T
Q  104 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgac 203  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  11388642 ccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgac 11388543  T
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11388542 tctcaagaacacatgatctcc-tcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttct 11388447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8212442 - 8212148
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| |||| ||| ||    
T  8212442 gaattacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgc 8212343  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  8212342 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 8212243  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8212242 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 8212148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 49152236 - 49152531
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  49152236 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 49152335  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  49152336 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 49152435  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49152436 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 49152531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11306577 - 11306283
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  11306577 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 11306478  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  11306477 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 11306378  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11306377 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 11306283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950470
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| || || ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
     ||||| ||| |  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctc 16950470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 13665488 - 13665801
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  13665488 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 13665587  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||     | ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||  |||    
T  13665588 cactgttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaact 13665682  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| ||| | |||||||| |||||  ||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  13665683 ctcagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 13665782  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13665783 tcatcttgactttctctgt 13665801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 13021292 - 13021586
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| ||  ||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  |||||    
T  13021292 gaatcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagc 13021391  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| | |||||||| ||||||  ||| || |||||||||| |||     
T  13021392 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgacc 13021491  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| || ||  ||||  | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13021492 ctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 13021586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286396
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||  || | ||| |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
     ||||| |||||   ||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttc 14286396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 300
Target Start/End: Original strand, 21661933 - 21662190
Alignment:
Q  40 agttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggac 139  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    || || ||||  ||||||||||  || ||||||||||| |    
T  21661933 agttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggc 21662032  T
Q  140 caataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaag 239  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||| || |  || ||||| ||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||    
T  21662033 caataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcctt---gaaactcaag 21662129  T
Q  240 atccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21662130 atccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttct 21662190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053949
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| ||||| || || ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 18053949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 14129808 - 14130102
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||    
T  14129808 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgc 14129907  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    || ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||    
T  14129908 catcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaact 14130007  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    || ||||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14130008 ctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 14130102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 14433626 - 14433920
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||    
T  14433626 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgc 14433725  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    || ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||    
T  14433726 catcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaact 14433825  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    || ||||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14433826 ctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 14433920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1680 - 1427
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||  |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |    
T  1680 gacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaatctgatacagaccaatga 1581  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||    
T  1580 actttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctt 1481  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1480 tctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttc 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 320
Target Start/End: Original strand, 6413484 - 6413761
Alignment:
Q  43 tgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaa 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||| || |||||    
T  6413484 tgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaa 6413583  T
Q  143 taaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatc 242  Q
    | ||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| || || || ||||| ||||   |    
T  6413584 tgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggc 6413683  T
Q  243 cttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||||||||||    
T  6413684 ctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctc 6413761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964891
Alignment:
Q  175 gcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtc 274  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  275 gactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     |||||||||||| ||||||||||||    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttct 35964891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 12455638 - 12455931
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||  ||||| | ||  |||||    
T  12455638 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagc 12455736  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||| |||     
T  12455737 cactgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgacc 12455836  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| || ||  |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12455837 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 12455931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26288312 - 26288057
Alignment:
Q  43 tgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaa 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  26288312 tgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacgtaccaa 26288213  T
Q  143 taaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatc 242  Q
    | || || || ||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| ||||| || || || || ||||| ||  |    
T  26288212 tgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctg-aaatctagggc 26288114  T
Q  243 cttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    ||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26288113 ctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 26288057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199766
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || | || |||||| |  || ||||| |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 23199766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505893
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || | || |||||| |  || ||||| |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 23505893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26118812 - 26118624
Alignment:
Q  112 ccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaa 211  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| ||||| ||| |||| ||    
T  26118812 ccaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaa 26118713  T
Q  212 acacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    | ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26118712 aaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttct 26118624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Original strand, 4440024 - 4440165
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  4440024 acttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 4440123  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4440124 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcat 4440165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11772373 - 11772274
Alignment:
Q  209 aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11772373 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcat 11772274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 323
Target Start/End: Original strand, 9596238 - 9596309
Alignment:
Q  252 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  9596238 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgt 9596309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21674672 - 21674566
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  21674672 actctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctctt 21674573  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  21674572 gaatcat 21674566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936584
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| | ||   ||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||  ||||| || ||||||||||| |||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcat 14936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340574
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || |||||||||||||  || ||||| |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  128 tctgatacggaccaataaact 148  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  15340554 tctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 7824034 - 7824137
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  7824034 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 7824133  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  7824134 tcat 7824137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27107910 - 27107807
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  27107910 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 27107811  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  27107810 tcat 27107807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17145397 - 17145291
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||| |||||||||||  ||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||    
T  17145397 actcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagaagctttcatattttctt 17145298  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  17145297 gaatcat 17145291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 300
Target Start/End: Original strand, 12456944 - 12457009
Alignment:
Q  235 tcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12456944 tcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 12457009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 15364071 - 15364177
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||  ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |    
T  15364071 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcct 15364170  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  15364171 gaatcat 15364177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 15340613 - 15340660
Alignment:
Q  252 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15340613 cttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttc 15340660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12368715 - 12368609
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    |||||||||||||| || || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||    
T  12368715 actctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctctt 12368616  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    | |||||    
T  12368615 ggatcat 12368609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Original strand, 45146688 - 45146792
Alignment:
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||  |||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |  |||||| |||||||||||||| || |||    
T  45146688 tctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataactcttctatttactctgagacgctttcatcttctcctga 45146787  T
Q  304 atcat 308  Q
    |||||    
T  45146788 atcat 45146792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Original strand, 12193714 - 12193793
Alignment:
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||| |||| |||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  12193714 tgaaaatcaatgtcattcctcctcttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcat 12193793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 12254372 - 12254325
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatga 54  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12254372 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatga 12254325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5432710 - 5432641
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| || |||||| |||||||    
T  5432710 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactttgagacgctctcatctt 5432641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 20249812 - 20250125
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20249812 atcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgcca 20249911  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  20249912 ccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 20250011  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250012 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 20250111  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  20250112 atcttaactttctc 20250125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17045412 - 17045099
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  17045412 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 17045313  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  17045312 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactct 17045213  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17045212 caaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 17045113  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  17045112 atcttaactttctc 17045099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16351001 - 16350695
Alignment:
Q  2 tctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggta 101  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  16351001 tctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggta 16350902  T
Q  102 agccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcg 201  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16350901 agccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtg 16350802  T
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  16350801 actctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 16350702  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    | |||||    
T  16350701 ggatcat 16350695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 19106329 - 19106642
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||  ||| || ||||| || ||||    
T  19106329 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgcca 19106428  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19106429 ccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 19106528  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19106529 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 19106628  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  19106629 atcttaactttctc 19106642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33391423 - 33391125
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33391423 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 33391324  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33391323 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 33391224  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  33391223 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 33391125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50620641 - 50620340
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||    
T  50620641 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgcca 50620542  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  50620541 ccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 50620442  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || ||| | |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50620441 caaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatc 50620342  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  50620341 at 50620340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19761263 - 19760963
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  19761263 atcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgcca 19761164  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | ||| ||||||    
T  19761163 ccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactct 19761064  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19761063 caaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatc 19760964  T
Q  307 a 307  Q
    |    
T  19760963 a 19760963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 21830268 - 21830551
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21830268 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21830367  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21830368 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21830467  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |  | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830468 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 21830551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 21747500 - 21747797
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21747500 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccg 21747599  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  21747600 ttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21747699  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    | | |  |||||||||||| |||| ||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747700 acatatgtggtctccttctagaaactcaagat-ctttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 21747797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51333890 - 51333589
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  51333890 atcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagcca 51333791  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51333790 ccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 51333691  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  51333690 caaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatc 51333591  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  51333590 at 51333589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 16369271 - 16369560
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16369271 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactc 16369370  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  16369371 tttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 16369470  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16369471 atctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcat 16369560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41354872 - 41354547
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  41354872 ctctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 41354773  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  41354772 aagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 41354673  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  41354672 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 41354573  T
Q  301 tgaatcattttgactttctctgtggt 326  Q
     | ||||| |  |||||||| |||||    
T  41354572 cggatcatctgaactttctcagtggt 41354547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 21836915 - 21837213
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21836915 acatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21837014  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21837015 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21837114  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  21837115 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcat 21837213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 308
Target Start/End: Original strand, 20136760 - 20137041
Alignment:
Q  27 aacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgat 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||    
T  20136760 aacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgat 20136859  T
Q  127 atctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctcctt 226  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  20136860 atctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctcctt 20136959  T
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20136960 cttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcat 20137041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16079030 - 16078736
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  16079030 atcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 16078931  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16078930 ccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 16078831  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| |||||||                   |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16078830 caaaaacacgtggtctc-------------------cttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 16078750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50612813 - 50612608
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||    
T  50612813 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgcca 50612714  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  50612713 ccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 50612614  T
Q  207 caaaaa 212  Q
    ||||||    
T  50612613 caaaaa 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19665275 - 19664957
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  19665275 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 19665176  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  19665175 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaact 19665076  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  19665075 ctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 19664976  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19664975 tcatcttgactttctctgt 19664957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940146
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| || |||||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| || || ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctct 321  Q
     ||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctct 20940146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 19854274 - 19854592
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||  || ||    
T  19854274 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgc 19854373  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||  |||    
T  19854374 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaact 19854473  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||   |    
T  19854474 ctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctga 19854573  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19854574 tcatcttgactttctctgt 19854592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 37677039 - 37677334
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| |||| ||| ||    
T  37677039 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgc 37677138  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  37677139 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 37677238  T
Q  205 ctcaa-aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    ||||| ||| ||||| || || || ||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37677239 ctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 37677334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 20294372 - 20294666
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  20294372 gaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 20294471  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  20294472 cactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 20294571  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20294572 ctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 20294666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20857160 - 20856845
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  20857160 gaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgc 20857061  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||     
T  20857060 cacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaacc 20856961  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||| |||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||    
T  20856960 ctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaa 20856861  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  20856860 tcatcttgactttctc 20856845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31550580 - 31550285
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| |||| ||| ||    
T  31550580 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgc 31550481  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||| ||||| |||     
T  31550480 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgacc 31550381  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31550380 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttct 31550285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 300
Target Start/End: Original strand, 11382670 - 11382849
Alignment:
Q  121 tctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |    
T  11382670 tctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgat 11382769  T
Q  221 ctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    | || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11382770 caccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 11382849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 21163236 - 21163381
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21163236 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggt 21163335  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21163336 aagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308100
Alignment:
Q  111 tccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaa 210  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  || |||| |    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  211 aacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattt 310  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||   ||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattt 41308090  T
Q  311 tgactttctc 320  Q
    ||||||||||    
T  41308091 tgactttctc 41308100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22433515 - 22433220
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  22433515 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggc 22433416  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||| |||| || ||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||     
T  22433415 cacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaacc 22433316  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||  |||||||| || || || ||||| |||||   ||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433315 ctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 22433220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20075458 - 20075164
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||| |  |||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||   || ||    
T  20075458 gaatcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgc 20075359  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  20075358 cactgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 20075259  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    || | ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| || | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20075258 cttagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatcttttc 20075164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20835969
Alignment:
Q  58 acatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtca 157  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  158 a---tttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctctt 254  Q
    |    ||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| || || || | ||| | |||  ||||||  | |||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  255 atcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgt 20835969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244437
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||  || |||| ||| ||||| || || ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 282  Q
     ||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20395392 - 20395198
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || || | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  20395392 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 20395293  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggag 199  Q
    |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  20395292 cactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggag 20395198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20831591 - 20831488
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  20831591 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 20831492  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  20831491 tcat 20831488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Original strand, 24476940 - 24477009
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcga 74  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24476940 gaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcga 24477009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Original strand, 46518843 - 46518984
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||   || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||    
T  46518843 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 46518942  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| ||||  || ||||| || ||||||||    
T  46518943 cttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcat 46518984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202370
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| | |||||| ||||| || ||||||   ||||||||||||| ||| || ||  | ||||| |||| ||||||  | ||||||||||| |||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctct 321  Q
    ||| || |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctct 21202370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135645
Alignment:
Q  206 tcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| | ||  ||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||  | |||||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  306 cattttgacttt 317  Q
    ||| || |||||    
T  22135656 catcttaacttt 22135645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 12523617 - 12523936
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| |    
T  12523617 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgat 12523716  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  12523717 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagt 12523816  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12523817 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 12523916  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  12523917 tgaatcatcttaactttctc 12523936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14159433 - 14159740
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14159433 ctctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 14159532  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||     
T  14159533 aagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagt 14159632  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     |||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14159633 aactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 14159732  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  14159733 tgaatcat 14159740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 14680508 - 14680827
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  14680508 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 14680607  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14680608 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagt 14680707  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  14680708 gactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctct 14680807  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  14680808 tgaatcatcttaactttctc 14680827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149758
Alignment:
Q  25 ggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctg 124  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||||| |    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  125 atatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctcc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  225 ttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctc 15149758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16355516 - 16355197
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  16355516 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 16355417  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  16355416 acgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 16355317  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16355316 gactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 16355217  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  16355216 tgaatcatcttaactttctc 16355197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 12476550 - 12476848
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12476550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 12476649  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12476650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 12476749  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  12476750 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 12476848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 23955697 - 23955995
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23955697 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 23955796  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23955797 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 23955896  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  23955897 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 23955995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Original strand, 14652252 - 14652556
Alignment:
Q  4 tgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaag 103  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |    
T  14652252 tgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacg 14652351  T
Q  104 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgac 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||    
T  14652352 ccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 14652451  T
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652452 tctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 14652551  T
Q  304 atcat 308  Q
    |||||    
T  14652552 atcat 14652556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19778864 - 19778557
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |    
T  19778864 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgat 19778765  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19778764 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 19778665  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  19778664 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 19778565  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  19778564 tggatcat 19778557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 8386362 - 8386660
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8386362 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8386461  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8386462 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8386561  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  8386562 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 8386660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 18297155 - 18297453
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18297155 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18297254  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18297255 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18297354  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  18297355 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 18297453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16252510 - 16252209
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| || ||||    
T  16252510 atcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgcca 16252411  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  16252410 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactct 16252311  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16252310 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatc 16252211  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  16252210 at 16252209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 320
Target Start/End: Original strand, 40472990 - 40473300
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  40472990 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcg 40473089  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40473090 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40473189  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatt 309  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  40473190 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatt 40473289  T
Q  310 ttgactttctc 320  Q
    |  ||||||||    
T  40473290 tgaactttctc 40473300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 7090380 - 7090680
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7090380 atcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 7090479  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  7090480 ccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactct 7090578  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7090579 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatc 7090678  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  7090679 at 7090680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14266970 - 14266678
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  14266970 ctctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 14266871  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |     
T  14266870 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggt 14266771  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266770 gactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14266678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18227511 - 18227199
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| || ||||    
T  18227511 atcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgcca 18227412  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  18227411 ctgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 18227312  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18227311 caaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 18227212  T
Q  307 attttgactttct 319  Q
    || || |||||||    
T  18227211 atcttaactttct 18227199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29039466 - 29039168
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  29039466 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29039367  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29039366 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 29039267  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  29039266 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 29039168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Original strand, 27711280 - 27711584
Alignment:
Q  4 tgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaag 103  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27711280 tgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27711379  T
Q  104 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgac 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27711380 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgac 27711479  T
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27711480 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 27711579  T
Q  304 atcat 308  Q
    |||||    
T  27711580 atcat 27711584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14304039 - 14303742
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14304039 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 14303940  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14303939 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggg-tcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 14303841  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  14303840 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcat 14303742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14851429 - 14851130
Alignment:
Q  9 cacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccacc 108  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  14851429 cacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacc 14851330  T
Q  109 gttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctca 208  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | ||| |||||| |    
T  14851329 gttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaa 14851230  T
Q  209 aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14851229 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcat 14851130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8053688 - 8053387
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8053688 atcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagcca 8053589  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
     |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8053588 tcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 8053489  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  8053488 caaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatc 8053389  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  8053388 at 8053387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 15364336 - 15364568
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15364336 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15364435  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15364436 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15364535  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatc 242  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15364536 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatc 15364568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15003691 - 15003376
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  15003691 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgc 15003592  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  15003591 cactgttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaact 15003492  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  15003491 ctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctta 15003392  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  15003391 tcatcttgactttctc 15003376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 15070358 - 15070653
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| | ||| ||    
T  15070358 gaatcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgc 15070457  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||| |  |||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15070458 cactgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgact 15070557  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070558 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 15070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 15245869 - 15246164
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  |||| ||||| ||| ||    
T  15245869 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgc 15245968  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  15245969 cactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaact 15246068  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||   ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15246069 ctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 15246164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3265121 - 3264826
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  3265121 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 3265022  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  3265021 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 3264922  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3264921 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 3264826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 33222863 - 33223157
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  33222863 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgc 33222962  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||     
T  33222963 cactgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgacc 33223062  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33223063 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 33223157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1649604 - 1649309
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||  || ||    
T  1649604 gaattacatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgc 1649505  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  1649504 cacagttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaact 1649405  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || | ||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1649404 cttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 1649309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 16145857 - 16146151
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  16145857 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 16145956  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  16145957 cacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 16146056  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| ||  | || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16146057 ctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 16146151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11207556 - 11207263
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||    
T  11207556 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 11207457  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  11207456 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 11207357  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11207356 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 11207263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 20890928 - 20891221
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||  |||||||  |  || ||    
T  20890928 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttgg-aaacccatcctatatgc 20891026  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  20891027 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 20891126  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20891127 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 20891221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14927324 - 14927151
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  14927324 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgcca 14927225  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgt 180  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927224 ctgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29453864 - 29453569
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  29453864 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 29453765  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||| ||||| |||     
T  29453764 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgacc 29453665  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29453664 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 29453569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44662193 - 44661898
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  44662193 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 44662094  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||||  ||     
T  44662093 cactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaacc 44661994  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44661993 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 44661898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15359122
Alignment:
Q  109 gttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctca 208  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  209 aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  |||| || | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 15359122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606190
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||  |||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 51606190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415062
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcat 259  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  260 ggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 15415062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  47 acacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaa 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  147 cttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacacca 189  Q
    ||| || ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676455
Alignment:
Q  195 aggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 294  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  295 ttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    || |||| |||||| || ||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctc 16676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 299
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752832
Alignment:
Q  132 atacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttga 231  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  232 aaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    || |||||  |||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 16752832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640177
Alignment:
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  304 atcattttgactttctc 320  Q
    ||||| || ||||||||    
T  1640193 atcatcttaactttctc 1640177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 323
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900649
Alignment:
Q  133 tacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaa 232  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||| || || || ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  233 aatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    | ||||| || ||||| | ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgt 27900649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703082
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 42703070  T
Q  228 ttgaaaatcaag 239  Q
    |||||| |||||    
T  42703071 ttgaaactcaag 42703082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 14997461 - 14997564
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14997461 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaa 14997560  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  14997561 tcat 14997564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18607895 - 18607825
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaag 77  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18607895 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaag 18607825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16445377 - 16445236
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||| ||||   || || ||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16445377 acttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataact 16445278  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  16445277 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 16445236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15293284 - 15293181
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  15293284 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 15293185  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  15293184 tcat 15293181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 55375485 - 55375394
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  55375485 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 55375394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132433
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| | ||   || |||||||||||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||  ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| || | ||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcat 12132433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Original strand, 15077831 - 15077875
Alignment:
Q  256 tcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15077831 tcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 15077875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 13247790 - 13247893
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13247790 ctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaa 13247889  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  13247890 tcat 13247893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15415306 - 15415214
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactc 97  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||  ||||||||||    
T  15415306 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactc 15415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Original strand, 8706055 - 8706158
Alignment:
Q  197 gagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||| ||||| | ||||||||  |||||||| | ||| ||||| || ||||| | ||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8706055 gagccactcttagaaacacataatctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatctt 8706154  T
Q  297 ttct 300  Q
    ||||    
T  8706155 ttct 8706158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Original strand, 9291004 - 9291083
Alignment:
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  9291004 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 9291083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9849683 - 9849502
Alignment:
Q  127 atctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtca-taggagcgactctcaaaaacacatggtctcct 225  Q
    |||||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||  | |||||||||||||  || |||||     
T  9849683 atctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactagg-tcaactctcaaaaacatttgatctccg 9849585  T
Q  226 tcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     ||||||| |||| |||||||||    ||||||||  ||||||| |  | ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9849584 acttgaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcat 9849502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 15319528 - 15319642
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  |||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||| || | ||  |||||||||| ||| ||    
T  15319528 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaacccactctgtatgc 15319627  T
Q  105 caccgttccaactct 119  Q
    ||| |||||||||||    
T  15319628 cactgttccaactct 15319642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 319
Target Start/End: Original strand, 16685396 - 16685513
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    |||||||||||| |||| || ||  ||||||| | || ||||||| | ||||||||||| ||| | || || | |||||| |||||| ||||||| || |    
T  16685396 actctcaaaaacccatgatcaccaacttgaaattaaatatccttcatcctcttatcatgataaattttctgcctactctgagacgctctcatcttctcct 16685495  T
Q  302 gaatcattttgactttct 319  Q
    ||||||| || |||||||    
T  16685496 gaatcatcttaactttct 16685513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 65383 - 65696
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  65383 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagcca 65482  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  65483 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactct 65582  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  65583 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 65682  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  65683 atcttaactttctc 65696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40123 - 39925
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||  |    
T  40123 ctctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaat 40024  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggag 199  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40023 acgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggag 39925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39902 - 39846
Alignment:
Q  252 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39902 cttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcat 39846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 9522285 - 9522598
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9522285 atcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 9522384  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  9522385 ccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 9522484  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9522485 caaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatc 9522584  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    ||||| || |||||    
T  9522585 attttaaccttctc 9522598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 12497808 - 12498127
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  12497808 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 12497907  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  12497908 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 12498007  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12498008 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 12498107  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  12498108 tgaatcatcttaactttctc 12498127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 17489416 - 17489717
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  17489416 atcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 17489515  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  17489516 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 17489615  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17489616 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 17489715  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  17489716 at 17489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 10905779 - 10906077
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10905779 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10905878  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10905879 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10905978  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  10905979 aaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 10906077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14877069 - 14876762
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |    
T  14877069 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgat 14876970  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  14876969 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 14876870  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14876869 aactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 14876770  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  14876769 tgaatcat 14876762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 10005169 - 10005467
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10005169 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10005268  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10005269 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10005368  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  10005369 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 10005467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15348806 - 15348508
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15348806 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15348707  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15348706 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15348607  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15348606 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 15348508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 48425016 - 48425314
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48425016 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 48425115  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48425116 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 48425215  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  48425216 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 48425314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 13252259 - 13252557
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13252259 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 13252358  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13252359 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 13252458  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  13252459 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcat 13252557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15589953 - 15589655
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15589953 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15589854  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15589853 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15589754  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  15589753 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 15589655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15725497 - 15725196
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15725497 atcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagcca 15725398  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15725397 ccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactct 15725298  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  15725297 aaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatc 15725198  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  15725197 at 15725196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16492745 - 16492444
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  16492745 atcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 16492646  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16492645 ccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 16492546  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16492545 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 16492446  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  16492445 at 16492444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 16370973 - 16371292
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |    
T  16370973 ctctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaat 16371072  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||     
T  16371073 acgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagt 16371172  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16371173 gactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 16371272  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  16371273 tgaatcatcttaactttctc 16371292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 16635342 - 16635640
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  16635342 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16635441  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16635442 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16635541  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16635542 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 16635640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20062615 - 20062317
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20062615 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 20062516  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20062515 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 20062416  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  20062415 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 20062317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26792960 - 26792662
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  26792960 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcg 26792861  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  26792860 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaa 26792761  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  26792760 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 26792662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 43162666 - 43162964
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  43162666 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 43162765  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43162766 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 43162865  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  43162866 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 43162964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5425499 - 5425193
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5425499 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 5425400  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  5425399 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 5425300  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  5425299 gactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 5425201  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  5425200 tggatcat 5425193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16412852 - 16412545
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |  | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  16412852 ctctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 16412753  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16412752 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 16412653  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||    
T  16412652 gactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctct 16412553  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  16412552 tggatcat 16412545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53385588 - 53385281
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  53385588 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 53385489  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  53385488 aagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagt 53385389  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  53385388 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 53385289  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  53385288 tggatcat 53385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 317
Target Start/End: Original strand, 16691726 - 16692036
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  16691726 atcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgcca 16691825  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16691826 ccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 16691925  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16691926 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 16692025  T
Q  307 attttgacttt 317  Q
    || || |||||    
T  16692026 atcttaacttt 16692036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 6600307 - 6600599
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  6600307 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 6600406  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6600407 aagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 6600506  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6600507 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 6600599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 15338829 - 15339121
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || || | ||||||||||||||    
T  15338829 ctctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 15338928  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  15338929 aagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagt 15339028  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339029 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15339121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15403080 - 15402773
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || || | ||||||||||||||    
T  15403080 ctctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 15402981  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  15402980 aagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagt 15402881  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15402880 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 15402781  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  15402780 tggatcat 15402773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 15208457 - 15208758
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||  |||    
T  15208457 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactcca 15208556  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  15208557 ccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 15208656  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15208657 caaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatc 15208756  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  15208757 at 15208758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16757155 - 16756863
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  16757155 ctctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 16757056  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16757055 aagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 16756956  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16756955 gactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcat 16756863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16807496 - 16807177
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  16807496 ctctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 16807397  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| | |||  || | ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||     
T  16807396 acgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagt 16807297  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16807296 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctct 16807197  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  16807196 tgaatcattttaactttctc 16807177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227514
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatctt 15227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248014
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     |||||||||||||| |||   |  ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcat 15248014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953205
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||| ||||| ||||| ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgt 15953205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 326
Target Start/End: Original strand, 14571456 - 14571743
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||    
T  14571456 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataagga 14571555  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14571556 ccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaa 14571655  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgtggt 326  Q
    |  ||||||| | ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||    
T  14571656 gggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtggt 14571743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18134901 - 18134583
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  ||||| ||||  |||||    
T  18134901 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagc 18134802  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18134801 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaact 18134702  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||| | || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  18134701 ctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccga 18134602  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  18134601 tcattttgactttatctgt 18134583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13972634 - 13972386
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13972634 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataa 13972535  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13972534 acttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 13972435  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 294  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13972434 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 13972386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 47123518 - 47123813
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  47123518 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 47123617  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  47123618 cacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgact 47123717  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47123718 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttct 47123813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850522
Alignment:
Q  58 acatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtca 157  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  158 atttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatc 257  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||  ||| ||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  258 atggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgacttt 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgacttt 12850522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13323207 - 13322889
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| |  |  || ||    
T  13323207 gaataacatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgc 13323108  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  13323107 cactgttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaact 13323008  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  13323007 ctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatga 13322908  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13322907 tcatcttgactttctctgt 13322889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10420559 - 10420279
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| | ||  || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  10420559 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatga 10420460  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||    
T  10420459 actttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtcttt 10420360  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgtggt 326  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||    
T  10420359 cctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggt 10420279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11304328 - 11304033
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  11304328 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 11304229  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||    
T  11304228 cactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaact 11304129  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11304128 ctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttct 11304033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11961589 - 11961295
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |  ||| | ||||  |||||    
T  11961589 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagc 11961490  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| |||     
T  11961489 cactattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgacc 11961390  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  11961389 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttc 11961295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 10383545 - 10383838
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  || ||||    
T  10383545 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10383644  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||| ||    
T  10383645 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 10383744  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10383745 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 10383838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Original strand, 14086285 - 14086536
Alignment:
Q  43 tgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaa 142  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  14086285 tgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaa 14086384  T
Q  143 taaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatc 242  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  14086385 taaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtc 14086484  T
Q  243 cttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 294  Q
    |||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14086485 cttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 14086536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12361097 - 12360779
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  12361097 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 12360998  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||  ||||||| ||  |||    
T  12360997 cactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaact 12360898  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    |    
T  12360897 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttccctta 12360798  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12360797 tcatcttgactttctctgt 12360779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16330214 - 16329920
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  16330214 gaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 16330115  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | | | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  16330114 cactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgacc 16330015  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16330014 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttc 16329920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8759602 - 8759319
Alignment:
Q  40 agttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggac 139  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  8759602 agttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggac 8759503  T
Q  140 caataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaag 239  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  8759502 caatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaag 8759403  T
Q  240 atccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
      |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  8759402 ggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 8759319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941916
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 13941916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177414
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 41177414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16836965 - 16836771
Alignment:
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  16836965 caccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaact 16836866  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16836865 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttc 16836771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 323
Target Start/End: Original strand, 44776862 - 44777139
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  44776862 gacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatga 44776961  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    ||||||| || || ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||| || || ||||| || |||||  ||||    
T  44776962 acttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggcctt 44777061  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  44777062 cctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 44777139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15016019
Alignment:
Q  131 gatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttg 230  Q
    |||||||| |||||||| |||| || | |||||| ||||| |  || | ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  231 aaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatctt 15016019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16381441 - 16381194
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16381441 gacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 16381342  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    ||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || ||  |||| |||||  ||||    
T  16381341 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatcccgaaactcaagggcctt 16381242  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
     || | ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  16381241 tctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatctt 16381194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31689178 - 31689049
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  31689178 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgc 31689079  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgata 134  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31689078 cactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 31945046 - 31945177
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||   || ||    
T  31945046 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgc 31945145  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacg 136  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31945146 cactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 17192865 - 17192971
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||| ||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  17192865 actctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 17192964  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  17192965 gaatcat 17192971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748551
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | |||    ||||| ||||||||||| || ||  ||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| |||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgacttt 317  Q
    ||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaacttt 18748551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8274765 - 8274662
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  8274765 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 8274666  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  8274665 tcat 8274662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16743069 - 16742966
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  16743069 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 16742970  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  16742969 tcat 16742966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6712739 - 6712672
Alignment:
Q  241 tccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  6712739 tccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcat 6712672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13975411 - 13975308
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||| || ||||    
T  13975411 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaa 13975312  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  13975311 tcat 13975308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 15576524 - 15576627
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  15576524 ctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 15576623  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  15576624 tcat 15576627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 267624 - 267569
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatg 260  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  267624 ctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatg 267569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21326137 - 21325812
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  21326137 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 21326038  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||     
T  21326037 acgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 21325938  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325937 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 21325838  T
Q  301 tgaatcattttgactttctctgtggt 326  Q
    |||||||| || |||||||| |||||    
T  21325837 tgaatcatcttaactttctcagtggt 21325812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22757334 - 22757015
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  22757334 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 22757235  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  22757234 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 22757135  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22757134 gactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 22757035  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||  || ||||||||    
T  22757034 tgaatcaccttaactttctc 22757015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 27217597 - 27217895
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27217597 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27217696  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27217697 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27217796  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  27217797 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcat 27217895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 16924841 - 16925139
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16924841 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16924940  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16924941 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16925040  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16925041 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 16925139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 16981733 - 16982031
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16981733 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16981832  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16981833 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16981932  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16981933 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 16982031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 16998581 - 16998879
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16998581 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16998680  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16998681 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16998780  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16998781 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 16998879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 17063298 - 17063596
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17063298 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 17063397  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17063398 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17063497  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  17063498 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 17063596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24708347 - 24708034
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  24708347 atcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 24708248  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  24708247 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 24708148  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24708147 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 24708048  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  24708047 atcttaactttctc 24708034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21145901 - 21145594
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  21145901 ctctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 21145802  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  21145801 aagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagt 21145702  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21145701 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 21145602  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  21145601 tgaatcat 21145594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 24675061 - 24675380
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||| |    
T  24675061 ctctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgat 24675160  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |     
T  24675161 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggt 24675260  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  24675261 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctct 24675360  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  24675361 tgaatcatcttaactttctc 24675380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 24261951 - 24262249
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  24261951 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24262050  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24262051 ttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24262150  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24262151 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 24262249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24878848 - 24878559
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24878848 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactc 24878749  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  24878748 tttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 24878649  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24878648 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 24878559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44386440 - 44386133
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44386440 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggt 44386341  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  44386340 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 44386241  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||    
T  44386240 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctct 44386141  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  44386140 tggatcat 44386133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 9609717 - 9610015
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  9609717 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 9609816  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9609817 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 9609916  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  9609917 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 9610015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 10868431 - 10868729
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  10868431 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 10868530  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10868531 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10868630  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||    
T  10868631 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcat 10868729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22325718 - 22325420
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22325718 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22325619  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22325618 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22325519  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22325518 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 22325420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 24709614 - 24709912
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24709614 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24709713  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24709714 ttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24709813  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24709814 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 24709912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Original strand, 23063687 - 23063956
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23063687 aagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagatatctgaaacgga 23063786  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23063787 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttcttgaaactcaa 23063886  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23063887 gatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 23063956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Original strand, 23138615 - 23138911
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  23138615 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgcca 23138714  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  23138715 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactct 23138814  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138815 caaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Original strand, 23550405 - 23550701
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  23550405 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgcca 23550504  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  23550505 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactct 23550604  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550605 caaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 27370850 - 27371148
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  27370850 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccg 27370949  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27370950 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27371049  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27371050 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 27371148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Original strand, 23188586 - 23188885
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| || ||||    
T  23188586 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgcca 23188685  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23188686 tcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 23188785  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23188786 caaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 23188885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 17066959 - 17067254
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  17066959 acatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgc-aattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccg 17067055  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17067056 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17067155  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  17067156 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 17067254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27377336 - 27377096
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || || || || ||||    
T  27377336 atcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgcca 27377237  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  27377236 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 27377137  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttcc 247  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27377136 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcc 27377096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Original strand, 23087031 - 23087317
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||  || ||||| |    
T  23087031 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgccactg 23087130  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| | ||| |||||||||    
T  23087131 ttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaa 23087230  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23087231 aaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatctt 23087317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30211784 - 30211489
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| ||  |||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||   || ||    
T  30211784 gaatcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgc 30211685  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
     |||   |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| || |  || ||||| ||||| |||| | | | ||||    
T  30211684 aaccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgact 30211585  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30211584 ctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttct 30211489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 321
Target Start/End: Original strand, 23293533 - 23293850
Alignment:
Q  4 tgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaag 103  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  ||||| ||||  || |    
T  23293533 tgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatg 23293632  T
Q  104 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgac 203  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  23293633 ccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaac 23293732  T
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    ||||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       
T  23293733 tctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctg 23293832  T
Q  304 atcattttgactttctct 321  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  23293833 atcatcttgactttctct 23293850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24826067 - 24825846
Alignment:
Q  87 taaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctaca 186  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  24826067 taaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaaca 24825968  T
Q  187 ccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacg 286  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| | ||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24825967 ccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacg 24825868  T
Q  287 ctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24825867 ctttcatcttttcttggatcat 24825846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 31830234 - 31830529
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  31830234 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 31830333  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  31830334 cacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgact 31830433  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31830434 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttct 31830529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27365908 - 27365651
Alignment:
Q  43 tgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaa 142  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27365908 tgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaa 27365809  T
Q  143 taaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatc 242  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27365808 tgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtc 27365709  T
Q  243 cttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27365708 cttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttct 27365651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41609215 - 41609047
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  41609215 ctctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggt 41609116  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgact 169  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41609115 aagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11358741 - 11358446
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  11358741 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 11358642  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||||    
T  11358641 cactgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgact 11358542  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11358541 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 11358446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 20832561 - 20832856
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  20832561 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 20832660  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||| ||||| |||     
T  20832661 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgacc 20832760  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20832761 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttct 20832856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 23276352 - 23276643
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  23276352 gaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 23276451  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||||||||  | |    
T  23276452 cactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaat 23276551  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23276552 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 23276643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 1063327 - 1063622
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||| | ||||  || ||    
T  1063327 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgc 1063426  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||| ||||| |||     
T  1063427 cacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgacc 1063526  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1063527 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttct 1063622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 300
Target Start/End: Original strand, 45529127 - 45529382
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | || ||| |||| ||| ||| |||||||||||  || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  45529127 aagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaatctgatatggg 45529226  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
     |||||||| |||| |||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||    
T  45529227 tcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatgg------tcttcaaactcaa 45529320  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  45529321 gatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttct 45529382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787608
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 27787608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 323
Target Start/End: Original strand, 12573970 - 12574247
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12573970 gacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 12574069  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    ||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || || | ||| ||||| || || |||||||| |||||  ||||    
T  12574070 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 12574169  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  12574170 cctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 12574247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 24653921 - 24654185
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  24653921 gaataacatgcgaaggatccgctaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 24654020  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||  |  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||     
T  24654021 cactgttccaaccttcactgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaacc 24654120  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactctt 269  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24654121 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945137
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| || | ||| |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 24945137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24831892 - 24831751
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||   || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24831892 acttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttctcttatcatgataact 24831793  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| ||| | |||||||| || ||||||||    
T  24831792 cttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcat 24831751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24833440 - 24833355
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaa 90  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  24833440 gaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaa 24833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 308
Target Start/End: Original strand, 22276018 - 22276158
Alignment:
Q  168 cttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactc 267  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  22276018 cttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 22276117  T
Q  268 ttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    || |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22276118 ttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 22276158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368396
Alignment:
Q  252 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 27368396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12640586 - 12640483
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  12640586 ctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 12640487  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  12640486 tcat 12640483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 25128420 - 25128535
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||| || | |||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  25128420 actctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctctt 25128519  T
Q  302 gaatcattttgacttt 317  Q
    ||||||| || |||||    
T  25128520 gaatcatcttaacttt 25128535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23817719 - 23817608
Alignment:
Q  206 tcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || || |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  23817719 tcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggat 23817620  T
Q  306 cattttgacttt 317  Q
    ||| || |||||    
T  23817619 catcttaacttt 23817608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22762239 - 22762133
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| ||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |  | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  22762239 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctgagacgctttcatcttctctt 22762140  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    | |||||    
T  22762139 ggatcat 22762133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 23573621 - 23573934
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  23573621 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 23573720  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23573721 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 23573820  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23573821 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 23573920  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  23573921 atcttaactttctc 23573934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 22134550 - 22134848
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22134550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactg 22134649  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22134650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22134749  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22134750 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 22134848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 27610227 - 27610534
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27610227 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactcggt 27610326  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27610327 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 27610426  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  27610427 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctct 27610526  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  27610527 tggatcat 27610534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15000243 - 14999945
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15000243 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15000144  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15000143 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15000044  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15000043 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 14999945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22333391 - 22333093
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22333391 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22333292  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22333291 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22333192  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22333191 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcat 22333093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37292000 - 37291702
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | | |||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37292000 acatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 37291901  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37291900 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 37291801  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  37291800 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcat 37291702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26739212 - 26738899
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| || ||||    
T  26739212 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcca 26739113  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||    
T  26739112 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccct 26739013  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||| ||||| || || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26739012 caaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 26738913  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  26738912 atcttaactttctc 26738899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 19769833 - 19770140
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  19769833 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 19769932  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19769933 aagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 19770032  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  19770033 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 19770132  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  19770133 tggatcat 19770140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 23440098 - 23440417
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |    
T  23440098 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgat 23440197  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |||     
T  23440198 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagt 23440297  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23440298 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 23440397  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  23440398 tgaatcattttaactttctc 23440417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27669003 - 27668696
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  27669003 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 27668904  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27668903 aagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 27668804  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  27668803 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 27668704  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  27668703 tggatcat 27668696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27685904 - 27685621
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27685904 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27685805  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27685804 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 27685705  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685704 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 27685621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 40708662 - 40708960
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40708662 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 40708761  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40708762 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40708861  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  40708862 aaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 40708960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21984812 - 21984511
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  21984812 atcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 21984713  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  21984712 ccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactct 21984613  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21984612 caaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 21984513  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  21984512 at 21984511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 25423068 - 25423369
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  | || ||||    
T  25423068 atcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgcca 25423167  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  25423168 ccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactct 25423267  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25423268 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 25423367  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  25423368 at 25423369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 23516414 - 23516718
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |    
T  23516414 ctctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgat 23516513  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||     
T  23516514 atgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagt 23516613  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516614 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23516713  T
Q  301 tgaat 305  Q
    |||||    
T  23516714 tgaat 23516718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 34566376 - 34566674
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  34566376 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 34566475  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34566476 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 34566575  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  34566576 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 34566674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 18775650 - 18775969
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  18775650 ctctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 18775749  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||     
T  18775750 acatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagt 18775849  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||    
T  18775850 gactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctct 18775949  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  18775950 tgaatcatcttaactttctc 18775969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 16356384 - 16356682
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  16356384 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16356483  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16356484 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16356583  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16356584 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 16356682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 27518289 - 27518587
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27518289 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27518388  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27518389 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27518488  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  27518489 aaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 27518587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 41770724 - 41771022
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41770724 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 41770823  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41770824 ttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 41770923  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  41770924 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcat 41771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Original strand, 20798671 - 20798940
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20798671 aagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatatttgatacgga 20798770  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20798771 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 20798870  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  20798871 gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcat 20798940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 22348316 - 22348603
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22348316 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactc 22348415  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  22348416 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 22348515  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||||||  |||| |||||||  || || | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22348516 gtctccttcccgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcat 22348603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 23471108 - 23471409
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| || ||||    
T  23471108 atcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcca 23471207  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||||||    
T  23471208 ccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactct 23471307  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23471308 caaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatc 23471407  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  23471408 at 23471409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29476577 - 29476279
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29476577 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29476478  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  29476477 ttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaa 29476378  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  29476377 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcat 29476279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890950
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatt 309  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||     
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  310 ttgactttctctgt 323  Q
    ||||||||||||||    
T  21890963 ttgactttctctgt 21890950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20468603 - 20468303
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  || ||||    
T  20468603 atcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgcca 20468504  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    | ||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  20468503 ctgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 20468404  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20468403 caaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatc 20468304  T
Q  307 a 307  Q
    |    
T  20468303 a 20468303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442484
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||  ||| ||||| |||||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | || |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttc 318  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  319 tctgt 323  Q
    |||||    
T  23442488 tctgt 23442484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498242
Alignment:
Q  71 tcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgactt 170  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  171 caaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttt 270  Q
    |||  ||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || |  ||  |||| | |||||||||||||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  271 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 21498242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 20573400 - 20573628
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20573400 atcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 20573499  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  20573500 ccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactct 20573599  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaat 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20573600 caaaaatacatgatctccttcttgaaaat 20573628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21343865 - 21343666
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  21343865 atcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 21343766  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  21343765 ccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Original strand, 22381058 - 22381373
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  |||||    
T  22381058 gaatcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagc 22381157  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  22381158 caccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgacc 22381257  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |    
T  22381258 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttccctta 22381357  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||||||||| |||||    
T  22381358 tcattttgaccttctc 22381373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24736120 - 24735825
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  24736120 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgc 24736021  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  24736020 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgact 24735921  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24735920 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttct 24735825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24750063 - 24749768
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  24750063 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgc 24749964  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  24749963 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgact 24749864  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24749863 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttct 24749768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24737294 - 24737011
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  24737294 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgc 24737195  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  24737194 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgact 24737095  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgct 288  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  24737094 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgct 24737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 22461811 - 22462129
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  22461811 gaatgacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgc 22461910  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||     
T  22461911 cacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaacc 22462010  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||    
T  22462011 ctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaa 22462110  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22462111 tcatcttgactttctctgt 22462129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22236429 - 22236111
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || |     
T  22236429 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatga 22236330  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  22236329 cactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaacc 22236230  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  22236229 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 22236130  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  22236129 ccatcttgactttctctgt 22236111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14887500 - 14887205
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  14887500 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 14887401  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  14887400 cactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 14887301  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14887300 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 14887205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23080598 - 23080283
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||  |||||    
T  23080598 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagc 23080499  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||     
T  23080498 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgacc 23080399  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |  ||  |||| || | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |    
T  23080398 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttccctta 23080299  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  23080298 tcatcttgactttctc 23080283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24798905 - 24798591
Alignment:
Q  6 aatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcc 105  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || |||    
T  24798905 aatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcc 24798806  T
Q  106 accgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactc 205  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  24798805 acagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactc 24798706  T
Q  206 tcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    ||| ||| ||||| || || ||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    ||    
T  24798705 tcagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttat 24798606  T
Q  306 cattttgactttctc 320  Q
    |||| ||||||||||    
T  24798605 cattctgactttctc 24798591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28924236 - 28923986
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  28924236 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 28924137  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  28924136 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtcttt 28924037  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28924036 cctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 28923986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37546006 - 37545710
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  37546006 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 37545907  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  37545906 cacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 37545807  T
Q  205 ctca-aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| |||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37545806 ctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 37545710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 20342141 - 20342436
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  20342141 gaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgc 20342240  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| | ||||    
T  20342241 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgact 20342340  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || |  || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20342341 ctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 20342436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 25847934 - 25848229
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||  ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| |||| ||| ||    
T  25847934 gaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgc 25848033  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  25848034 cacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 25848133  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||  | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25848134 ctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 25848229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28895410 - 28895160
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||  || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  28895410 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 28895311  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  28895310 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtcttt 28895211  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895210 cctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 28895160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564184
Alignment:
Q  29 catacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||||| || | |||||| || |||||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  129 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttct 228  Q
    |||||| ||||||||||||   || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||  |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtctt 21564184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Original strand, 20821353 - 20821603
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| | ||  || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  20821353 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatga 20821452  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||    
T  20821453 actttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtcttt 20821552  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    | | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20821553 cttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 20821603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 22502538 - 22502832
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  22502538 gaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 22502637  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  22502638 cactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 22502737  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22502738 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttc 22502832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 323
Target Start/End: Original strand, 20773660 - 20773937
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  20773660 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 20773759  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||| ||| |||||| | ||||| ||||| | ||| || ||    
T  20773760 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctcttt 20773859  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    ||  | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  20773860 ccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcttgactttctctgt 20773937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17269807 - 17269524
Alignment:
Q  40 agttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggac 139  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |||||||||||||    
T  17269807 agttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacggac 17269708  T
Q  140 caataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaag 239  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  17269707 caatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaag 17269608  T
Q  240 atccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
      |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  17269607 ggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 17269524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21662548 - 21662306
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||  || |     
T  21662548 gaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgt 21662449  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||    
T  21662448 cattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgact 21662350  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttcct 248  Q
    || | ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  21662349 cttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcct 21662306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21665975 - 21665767
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||  || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  21665975 aagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgataca-a 21665877  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  21665876 ccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaa 21665777  T
Q  239 gatccttcct 248  Q
    | || |||||    
T  21665776 ggtctttcct 21665767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 21404713 - 21404934
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||  || ||    
T  21404713 gaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgc 21404812  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
     || || ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||  ||| |||| ||||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | ||| ||||    
T  21404813 aactgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgact 21404912  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctcctt 226  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  21404913 ctaaaaaacacatgatctcctt 21404934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339492
Alignment:
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  304 atcat 308  Q
    |||||    
T  21339496 atcat 21339492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 27011143 - 27011246
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  27011143 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 27011242  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  27011243 tcat 27011246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11211041 - 11210891
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||   || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  11211041 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcctcttatcatgataact 11210942  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgacttt 317  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  11210941 cttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaacttt 11210891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Original strand, 24581292 - 24581373
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  24581292 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 24581373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 21625395 - 21625467
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaag 77  Q
    |||||||||| || ||||||   |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21625395 gaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaag 21625467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21937494 - 21937394
Alignment:
Q  208 aaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatca 307  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  21937494 aaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatca 21937395  T
Q  308 t 308  Q
    |    
T  21937394 t 21937394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Original strand, 23503505 - 23503605
Alignment:
Q  208 aaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatca 307  Q
    ||||||||||| || ||   |||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23503505 aaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatca 23503604  T
Q  308 t 308  Q
    |    
T  23503605 t 23503605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21831995 - 21831957
Alignment:
Q  262 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831995 taactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 21831957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 279164 - 278845
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  279164 ctctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 279065  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||     
T  279064 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagt 278965  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  278964 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttct 278865  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  278864 tgaatcatcttaactttctc 278845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 165040 - 164736
Alignment:
Q  4 tgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaag 103  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |    
T  165040 tgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacg 164941  T
Q  104 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgac 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||    
T  164940 ccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 164841  T
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164840 tctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 164741  T
Q  304 atcat 308  Q
    |||||    
T  164740 atcat 164736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 308640 - 308938
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  308640 acatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 308739  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  308740 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 308839  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  308840 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 308938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 260284 - 260578
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||  ||||  ||||  || ||    
T  260284 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgc 260383  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || || || |||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  260384 caccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaact 260483  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  260484 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 260578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1543560 - 1543241
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1543560 ctctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 1543461  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  1543460 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagt 1543361  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  1543360 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctct 1543261  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  1543260 tgaatcatcttaactttctc 1543241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5839695 - 5839373
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  5839695 ctctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgat 5839596  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  5839595 acgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagt 5839496  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5839495 gactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctct 5839396  T
Q  301 tgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  5839395 taaatcatcttgactttctctgt 5839373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 12497837 - 12498150
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  12497837 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 12497936  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||| ||||||    
T  12497937 ccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 12498036  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12498037 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 12498136  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  12498137 atcttaactttctc 12498150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12511064 - 12510751
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  12511064 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 12510965  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||| ||||||    
T  12510964 ccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 12510865  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12510864 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 12510765  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  12510764 atcttaactttctc 12510751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27331903 - 27331590
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27331903 atcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 27331804  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  27331803 ccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 27331704  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331703 caaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 27331604  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    ||||| ||||||||    
T  27331603 attttaactttctc 27331590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27392643 - 27392330
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27392643 atcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 27392544  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  27392543 ccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 27392444  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392443 caaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 27392344  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    ||||| ||||||||    
T  27392343 attttaactttctc 27392330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28263673 - 28263381
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  28263673 ctctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 28263574  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28263573 aagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 28263474  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28263473 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 28263381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28342422 - 28342130
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  28342422 ctctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 28342323  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28342322 aagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 28342223  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28342222 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 28342130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16627184 - 16626886
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16627184 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16627085  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16627084 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16626985  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16626984 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcat 16626886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24313635 - 24313337
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24313635 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24313536  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24313535 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24313436  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  24313435 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 24313337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 19864492 - 19864799
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  19864492 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 19864591  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||     
T  19864592 acgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagt 19864691  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19864692 gactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 19864791  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  19864792 tgaatcat 19864799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29592387 - 29592089
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  29592387 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29592288  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29592287 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 29592188  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  29592187 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 29592089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 25112357 - 25112664
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  25112357 ctctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 25112456  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25112457 aagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 25112556  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  25112557 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctct 25112656  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  25112657 tgaatcat 25112664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16963843 - 16963521
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||| | | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || || || |    
T  16963843 ctctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgat 16963744  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  16963743 acgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 16963644  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963643 gactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 16963544  T
Q  301 tgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  16963543 tgaatcatctttactttctctgt 16963521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 12505166 - 12505467
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  12505166 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 12505265  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||| ||||||    
T  12505266 ccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 12505365  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12505366 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatc 12505465  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  12505466 at 12505467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 27187241 - 27187533
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  27187241 ctctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggt 27187340  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27187341 aagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 27187440  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27187441 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 27187533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27261999 - 27261707
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  27261999 ctctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggt 27261900  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27261899 aagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 27261800  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27261799 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 27261707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28292848 - 28292556
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  28292848 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 28292749  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28292748 aagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 28292649  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28292648 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 28292556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22079158 - 22078839
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  22079158 atcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 22079059  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  22079058 ccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactct 22078959  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22078958 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatc 22078859  T
Q  307 attttgactttctctgtggt 326  Q
    || || || ||||| |||||    
T  22078858 atcttaaccttctcagtggt 22078839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2875270 - 2874972
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  2875270 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 2875171  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2875170 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 2875071  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  2875070 aaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcat 2874972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25610331 - 25610030
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| || || || ||||    
T  25610331 atcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgcca 25610232  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| | ||||||    
T  25610231 ccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactct 25610132  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25610131 caaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatc 25610032  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  25610031 at 25610030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 21471410 - 21471705
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  21471410 gaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 21471509  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  21471510 cactgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgact 21471609  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471610 ctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 21471705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17032367 - 17032581
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17032367 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 17032466  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  17032467 aagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagt 17032566  T
Q  201 gactctcaaaaacac 215  Q
    |||||||||||||||    
T  17032567 gactctcaaaaacac 17032581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18408413 - 18408115
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||| | | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  18408413 atcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgcca 18408314  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||    
T  18408313 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactct 18408214  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18408213 caaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaat 18408115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21833451 - 21833172
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  21833451 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 21833352  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  21833351 ccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactct 21833252  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacg 286  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21833251 caaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25765765 - 25765447
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  25765765 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 25765666  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | |     
T  25765665 acaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcaca-gcgt 25765567  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||    
T  25765566 gactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctct 25765467  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  25765466 tgaatcatctttactttctc 25765447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16928116 - 16927794
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||| | | ||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||| ||||||| ||| || |  || |    
T  16928116 ctctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaagacgat 16928017  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||     
T  16928016 acgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagt 16927917  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16927916 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttct 16927817  T
Q  301 tgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||||| || |||||| ||||    
T  16927816 tgaatcatctttactttccctgt 16927794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768295
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 25768295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22762925 - 22762624
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||    
T  22762925 atcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgcca 22762826  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  22762825 tcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 22762726  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  22762725 cacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatc 22762626  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  22762625 at 22762624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 23078280 - 23078593
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  23078280 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 23078379  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||| ||||| ||||||    
T  23078380 ccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactct 23078479  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23078480 caaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatc 23078579  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  23078580 atcttaactttctc 23078593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 287
Target Start/End: Original strand, 25750618 - 25750900
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  25750618 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 25750717  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| ||||    
T  25750718 cactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgact 25750817  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgc 287  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25750818 ctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796810
Alignment:
Q  29 catacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||||| |||||||| || || |||||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  129 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttct 228  Q
     |||||| ||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    ||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttc 22796810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14131613 - 14131356
Alignment:
Q  43 tgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaa 142  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14131613 tgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatacggaccaa 14131514  T
Q  143 taaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatc 242  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || ||    
T  14131513 taaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtc 14131414  T
Q  243 cttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14131413 cttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctgttct 14131356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Original strand, 15459189 - 15459460
Alignment:
Q  49 acatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaact 148  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15459189 acatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaact 15459288  T
Q  149 tcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttcct 248  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15459289 ttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcct 15459388  T
Q  249 tctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||    
T  15459389 acgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctc 15459460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18198005 - 18197716
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||  || ||    
T  18198005 ggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattc 18197906  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | ||| |||| ||| ||| |||||    
T  18197905 tttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatg 18197806  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     | ||| |||||||| | ||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18197805 atatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcat 18197716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10469321 - 10469026
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  10469321 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 10469222  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  10469221 cacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 10469122  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10469121 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 10469026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 18794499 - 18794794
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| | |  | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  18794499 gaataacatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgc 18794598  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18794599 cactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgact 18794698  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| |  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18794699 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttct 18794794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8766620 - 8766302
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||    
T  8766620 gaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagc 8766521  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||  ||     
T  8766520 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaacc 8766421  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||   |    
T  8766420 ctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctga 8766321  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  8766320 tcatcttgactttctctgt 8766302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 19879107 - 19879402
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||  |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |  |||||    
T  19879107 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagc 19879206  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  19879207 cactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgact 19879306  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19879307 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttct 19879402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 323
Target Start/End: Original strand, 17415369 - 17415613
Alignment:
Q  79 tgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcac 178  Q
    |||||||  ||||||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  17415369 tgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 17415468  T
Q  179 gtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgact 278  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||| || | |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17415469 gtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgact 17415568  T
Q  279 ctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    || ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||    
T  17415569 ctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgt 17415613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564309
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||| |||||| |||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || |  ||||||||||  || ||||| |||||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttct 21564309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11288029 - 11287782
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || || | ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  11288029 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11287930  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11287929 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11287830  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11287829 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11280936 - 11280689
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| || || | ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  11280936 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11280837  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || ||| |||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11280836 actttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11280737  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11280736 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 24364221 - 24364516
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  24364221 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 24364320  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| ||||| |||     
T  24364321 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgacc 24364420  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24364421 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 24364516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645770
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| || | ||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 34645770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 320
Target Start/End: Original strand, 18800858 - 18801066
Alignment:
Q  112 ccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaa 211  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  18800858 ccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaa 18800957  T
Q  212 acacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatttt 311  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  18800958 atacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatctt 18801057  T
Q  312 gactttctc 320  Q
    |||||||||    
T  18801058 gactttctc 18801066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 22433802 - 22433930
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  22433802 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 22433901  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatc 129  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22433902 acgccaccgttccaactctttccgatatc 22433930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27561036 - 27560798
Alignment:
Q  58 acatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtca 157  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27561036 acatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 27560937  T
Q  158 atttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatc 257  Q
    | ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||  |||| || | ||| ||    
T  27560936 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 27560837  T
Q  258 atggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27560836 atggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 27560798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14381841 - 14381621
Alignment:
Q  103 gccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcga 202  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14381841 gccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 14381742  T
Q  203 ctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 302  Q
    | |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||      
T  14381741 ccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctct 14381642  T
Q  303 aatcattttgactttctctgt 323  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  14381641 tatcatcttgactttctctgt 14381621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28283169 - 28282967
Alignment:
Q  121 tctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggt 220  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  28283169 tctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgat 28283070  T
Q  221 ctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    | || |||||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||    
T  28283069 caccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttc 28282970  T
Q  321 tgt 323  Q
    |||    
T  28282969 tgt 28282967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 296
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640872
Alignment:
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| | ||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    | ||||| || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 1640872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 302
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 25750910 - 25751024
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcat 259  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||    
T  25750910 ttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcat 25751009  T
Q  260 ggtaactcttttgtc 274  Q
    |||||||||| ||||    
T  25751010 ggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 320
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22433993
Alignment:
Q  254 tatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctc 22433993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1649056 - 1648953
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1649056 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaa 1648957  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  1648956 tcat 1648953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16382645 - 16382542
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  16382645 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 16382546  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  16382545 tcat 16382542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 25655489 - 25655604
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||  ||||| || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  25655489 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 25655588  T
Q  302 gaatcattttgacttt 317  Q
    ||||||| || |||||    
T  25655589 gaatcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25743359 - 25743256
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  25743359 ctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaa 25743260  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  25743259 tcat 25743256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 16098056 - 16098162
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  16098056 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctctt 16098155  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    | |||||    
T  16098156 ggatcat 16098162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 305
Target Start/End: Original strand, 16233221 - 16233318
Alignment:
Q  208 aaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16233221 aaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaat 16233318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18838178 - 18838077
Alignment:
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| | |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18838178 caaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatc 18838079  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  18838078 at 18838077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Original strand, 23996279 - 23996360
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  23996279 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 23996360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21413186 - 21413107
Alignment:
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21413186 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcat 21413107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 1640608 - 1640680
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaag 77  Q
    |||| ||||| || |||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1640608 gaataacatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaag 1640680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 18571660 - 18571763
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| | || || ||||    
T  18571660 ctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaa 18571759  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  18571760 tcat 18571763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15078590 - 15078541
Alignment:
Q  251 tcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttct 15078541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 117
Target Start/End: Original strand, 18787697 - 18787809
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || | ||  ||||||||||  || ||    
T  18787697 gaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgc 18787796  T
Q  105 caccgttccaact 117  Q
    ||| |||||||||    
T  18787797 cactgttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 19977980 - 19978293
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  19977980 atcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgcca 19978079  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  19978080 ccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 19978179  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19978180 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 19978279  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  19978280 atcttaactttctc 19978293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17674797 - 17674490
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  17674797 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 17674698  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  17674697 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 17674598  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  17674597 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 17674498  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  17674497 tggatcat 17674490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21167311 - 21167004
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |    
T  21167311 ctctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgat 21167212  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  21167211 acgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 21167112  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21167111 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 21167012  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  21167011 tgaatcat 21167004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30313912 - 30313599
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  30313912 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 30313813  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  30313812 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 30313713  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  30313712 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatc 30313613  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  30313612 atcttaactttctc 30313599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 15533393 - 15533706
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  15533393 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 15533492  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  15533493 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactct 15533592  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15533593 caaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatc 15533692  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    ||||| ||||||||    
T  15533693 attttaactttctc 15533706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 23650054 - 23650355
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  23650054 atcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagcca 23650153  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23650154 ccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactct 23650253  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  23650254 caaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatc 23650353  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  23650354 at 23650355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 19112706 - 19113004
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  19112706 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 19112805  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19112806 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19112905  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  19112906 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 19113004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 22046386 - 22046699
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||    
T  22046386 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgcca 22046485  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  22046486 ccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactct 22046585  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  22046586 caaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatc 22046685  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  22046686 atcttaactttctc 22046699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 32600157 - 32600458
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||  | |||| ||| |||||||| || ||||    
T  32600157 atcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgcca 32600256  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  32600257 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 32600356  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32600357 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 32600456  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  32600457 at 32600458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 21250955 - 21251243
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  21250955 atcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 21251054  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  21251055 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21251154  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 295  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21251155 caaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatct 21251243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19485644 - 19485319
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  19485644 ctctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 19485545  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19485544 aagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 19485445  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  19485444 gactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 19485345  T
Q  301 tgaatcattttgactttctctgtggt 326  Q
     | ||||| |  |||||||| |||||    
T  19485344 cggatcatctgaactttctcagtggt 19485319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20018518 - 20018217
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20018518 atcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagcca 20018419  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20018418 ccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 20018319  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  20018318 caaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatc 20018219  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  20018218 at 20018217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21394633 - 21394332
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21394633 atcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgcca 21394534  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  21394533 ccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21394434  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21394433 caaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatc 21394334  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  21394333 at 21394332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21789126 - 21788825
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21789126 atcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgcca 21789027  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  21789026 ccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21788927  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21788926 caaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatc 21788827  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  21788826 at 21788825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22164959 - 22164646
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||||    
T  22164959 atcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgcca 22164860  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| |    
T  22164859 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgacttt 22164760  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22164759 caaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatc 22164660  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  22164659 atcttaactttctc 22164646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 22987214 - 22987515
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  22987214 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 22987313  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||  |||| ||||||    
T  22987314 ccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactct 22987413  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22987414 aaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 22987513  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  22987514 at 22987515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16408819 - 16408500
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  16408819 ctctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 16408720  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||     
T  16408719 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagt 16408620  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  16408619 gactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctct 16408520  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  16408519 tgaatcatcttaactttctc 16408500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22120939 - 22120641
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22120939 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 22120840  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22120839 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaa 22120740  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22120739 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcat 22120641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21922503 - 21922202
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21922503 atcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 21922404  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  21922403 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactct 21922304  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21922303 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatc 21922204  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  21922203 at 21922202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22133809 - 22133496
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  || ||||| || ||||    
T  22133809 atcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgcca 22133710  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||    
T  22133709 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctct 22133610  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22133609 caaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatc 22133510  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  22133509 atcttaactttctc 22133496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 293
Target Start/End: Original strand, 22032045 - 22032331
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||    
T  22032045 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgcca 22032144  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  22032145 acgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 22032244  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    ||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032245 caaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 22032331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 23948902 - 23949154
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  23948902 atcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgcca 23949001  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||||||    
T  23949002 ccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactct 23949101  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  23949102 caaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcat 23949154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20010670 - 20010375
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  20010670 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 20010571  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||||    
T  20010570 cactgttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgact 20010471  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20010470 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 20010375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21682216 - 21681925
Alignment:
Q  29 catacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||||| |||||||| || || |||||    
T  21682216 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 21682117  T
Q  129 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttct 228  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  21682116 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 21682017  T
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  21682016 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctc 21681925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20396895 - 20396600
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| || ||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||    
T  20396895 gaatcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgc 20396796  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  20396795 cactatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgact 20396696  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396695 ctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 20396600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008156
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttct 20008156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 23654938 - 23655233
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |   ||  |    
T  23654938 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatatac 23655037  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  23655038 cactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 23655137  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23655138 ctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttct 23655233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22062203 - 22061885
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  22062203 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 22062104  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||     
T  22062103 cacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaacc 22062004  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| || || || ||||| |||||| |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |    
T  22062003 ctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctga 22061904  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22061903 tcatcttgactttctctgt 22061885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 21840428 - 21840723
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||  |||| ||||| ||| ||    
T  21840428 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgc 21840527  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||||  |||    
T  21840528 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaact 21840627  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21840628 cttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttct 21840723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29304196 - 29303881
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||   |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  |||||    
T  29304196 gaatcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagc 29304097  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | ||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  29304096 cactgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgacc 29303997  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |    
T  29303996 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttccctta 29303897  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    ||||| ||||||||||    
T  29303896 tcattctgactttctc 29303881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 1266250 - 1266544
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  1266250 gaataacatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 1266349  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  1266350 cactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaact 1266449  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266450 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 1266544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 300
Target Start/End: Original strand, 19851456 - 19851717
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||    
T  19851456 aagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatgga 19851555  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19851556 ccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaa 19851655  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |  |||| || | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19851656 gggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 19851717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 300
Target Start/End: Original strand, 19857492 - 19857753
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||    
T  19857492 aagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatgga 19857591  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19857592 ccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaa 19857691  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |  |||| || | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19857692 gggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 19857753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21325180 - 21324861
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagg-tgcggtgctaaacccactcggtaag 103  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||  ||||| ||||  || |    
T  21325180 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatg 21325081  T
Q  104 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgac 203  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  21325080 ccactgttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaac 21324981  T
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
     |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  21324980 cctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctctt 21324881  T
Q  304 atcattttgactttctctgt 323  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  21324880 atcatcttgactttctctgt 21324861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Original strand, 15441194 - 15441420
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||  ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |  || || || ||||    
T  15441194 atcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgcca 15441293  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  15441294 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactct 15441393  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaa 233  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15441394 caaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 6679122 - 6679417
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  6679122 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 6679221  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||     
T  6679222 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgacc 6679321  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6679322 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 6679417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31417244 - 31416929
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||| | ||||  || ||    
T  31417244 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgc 31417145  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  31417144 cactgttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaact 31417045  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |    
T  31417044 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttccctta 31416945  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  31416944 tcatcttgactttctc 31416929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 804443 - 804149
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  804443 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 804344  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  804343 cactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 804244  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  804243 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 804149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388401
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||  || | ||| || |||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||| ||| ||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatctt 20388401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 14565153 - 14565447
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  14565153 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 14565252  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  14565253 cactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 14565352  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14565353 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 14565447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377920
Alignment:
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 22377920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384095
Alignment:
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 22384095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 6603669 - 6603964
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  6603669 gaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 6603768  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||| ||||| |||     
T  6603769 cactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgacc 6603868  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6603869 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 6603964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 12304769 - 12305063
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  12304769 gaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 12304868  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  12304869 cactgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 12304968  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    || | ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12304969 ctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 12305063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571294
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || || ||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| ||||| || || ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgt 31571294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16265389 - 16265127
Alignment:
Q  4 tgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaag 103  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || |    
T  16265389 tgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatg 16265290  T
Q  104 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgac 203  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||| |||    
T  16265289 ccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgac 16265190  T
Q  204 tctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
     |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  16265189 cctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 299
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051168
Alignment:
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |  ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 22051168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 28982368 - 28982632
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||  ||| ||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  28982368 gaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 28982467  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||     
T  28982468 cactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgacc 28982567  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactctt 269  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28982568 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 28987588 - 28987852
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||  ||| ||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  28987588 gaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 28987687  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||     
T  28987688 cactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgacc 28987787  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactctt 269  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  28987788 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 27347237 - 27347436
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||   || ||    
T  27347237 gaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgc 27347336  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  27347337 cactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 320
Target Start/End: Original strand, 23949161 - 23949246
Alignment:
Q  235 tcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  23949161 tcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctc 23949246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315505
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || | ||||   ||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 22315505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16877665 - 16877562
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  16877665 ctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 16877566  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  16877565 tcat 16877562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21197075 - 21196960
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||| | || | |||||| ||||||||||| || ||||    
T  21197075 actctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctctt 21196976  T
Q  302 gaatcattttgacttt 317  Q
    ||||||| || |||||    
T  21196975 gaatcatcttaacttt 21196960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21850907 - 21850804
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21850907 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaa 21850808  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  21850807 tcat 21850804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20652906 - 20652800
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| || | |||||| || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  20652906 actctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcctcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctctt 20652807  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    | |||||    
T  20652806 ggatcat 20652800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24818189 - 24818083
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |  ||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||| |||||||||||| |    
T  24818189 actcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctctcatcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcct 24818090  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  24818089 gaatcat 24818083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 308
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856891
Alignment:
Q  270 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 18856891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 323
Target Start/End: Original strand, 25282339 - 25282460
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| || |  |||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||| | ||| || ||||||| ||||    
T  25282339 actctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcgatgtccttcctcctcttattatgataactcttctgcctactccgagacactctcatcttctctt 25282438  T
Q  302 gaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| || || || ||||||||    
T  25282439 gaatgatcttaaccttctctgt 25282460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 43126 - 43445
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  43126 ctctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagt 43225  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  43226 atgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagt 43325  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  43326 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctct 43425  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  43426 tgaatcatcttaactttctc 43445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 8475 - 8764
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8475 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactc 8574  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  8575 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 8674  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8675 gtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 8764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 50788 - 50555
Alignment:
Q  61 tcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatt 160  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  50788 tcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaact 50689  T
Q  161 tctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatg 260  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| | |||    
T  50688 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatg 50589  T
Q  261 gtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 294  Q
      | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50588 acagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 50555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 308
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13945
Alignment:
Q  195 aggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 294  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  295 ttttcttgaatcat 308  Q
    || |||||||||||    
T  13932 ttctcttgaatcat 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 106703 - 106600
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||||    
T  106703 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaa 106604  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  106603 tcat 106600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 14338 - 14651
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  14338 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgcca 14437  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  14438 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 14537  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14538 caaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 14637  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  14638 atcttaactttctc 14651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Original strand, 601 - 899
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  601 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccg 700  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  701 ttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 800  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  801 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6305
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |    
T  5986 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgat 6085  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||     
T  6086 acgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagt 6185  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6186 gactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 6285  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  6286 tgaatcatcttaactttctc 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 110145 - 109838
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  110145 ctctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 110046  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  110045 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 109946  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  109945 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctct 109846  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  109845 tggatcat 109838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 112535 - 112830
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||  |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |  |||||    
T  112535 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagc 112634  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  112635 cactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgact 112734  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  112735 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttct 112830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 96291 - 96041
Alignment:
Q  46 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| | ||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  96291 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 96192  T
Q  146 acttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcctt 245  Q
    |||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  96191 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtcttt 96092  T
Q  246 ccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96091 cctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 96041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1418
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1117 atcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 1216  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  1217 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactct 1316  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1317 aaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatc 1416  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  1417 at 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 6001 - 6302
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  6001 atcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 6100  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  6101 ccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactct 6200  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6201 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatc 6300  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  6301 at 6302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1538
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||| ||| |  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctct 321  Q
     ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctct 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 22867 - 22973
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | |||||||| || |    
T  22867 actctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcct 22966  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  22967 gaatcat 22973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 7349 - 7656
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |    
T  7349 ctctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgct 7448  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  7449 aagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 7548  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7549 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 7648  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  7649 tgaatcat 7656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33907 - 33588
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |    
T  33907 ctctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgat 33808  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  33807 acgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagt 33708  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  33707 gactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 33608  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  33607 tgaatcatcttaactttctc 33588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 8574 - 8887
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  8574 atcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 8673  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| |    
T  8674 ctgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgacttt 8773  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  8774 caataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatc 8873  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  8874 atcttaactttctc 8887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 64365 - 64058
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  64365 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgat 64266  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||   ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||     
T  64265 acgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagt 64166  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  64165 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 64066  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  64065 tgaatcat 64058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 654 - 967
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || || || ||||    
T  654 atcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgcca 753  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  754 ccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 853  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  854 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 953  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  954 atcttaactttctc 967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 4010 - 4311
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | || ||||    
T  4010 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgcca 4109  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  4110 ccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 4209  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4210 caaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatc 4309  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  4310 at 4311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 219745 - 219444
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || ||||    
T  219745 atcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgatacgcca 219646  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  219645 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 219546  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || ||| |||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  219545 caaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 219446  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  219445 at 219444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 229021 - 229322
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||| ||| || | |||||| ||||    
T  229021 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggtacgcca 229120  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  229121 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactct 229220  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229221 caaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 229320  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  229321 at 229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33125 - 33022
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  33125 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaa 33026  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  33025 tcat 33022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Original strand, 111999 - 112299
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  111999 atcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 112098  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  112099 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 112198  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | | ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  112199 caaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatc 112298  T
Q  307 a 307  Q
    |    
T  112299 a 112299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 203798 - 203503
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  203798 gaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgc 203699  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||  |||| |||| | ||| ||||    
T  203698 cactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgact 203599  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  203598 cttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 203503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 385795 - 386090
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  385795 gaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 385894  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||    
T  385895 cactgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgact 385994  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| | ||| ||||| |||||||| |||||   ||| |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  385995 ctcagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttct 386090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Original strand, 322703 - 322995
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||  |||||||| || |||||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| || || ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
     ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctc 322995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Original strand, 117544 - 117859
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  117544 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 117643  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||     
T  117644 cactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaacc 117743  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||   |    
T  117744 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctga 117843  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  117844 tcatcttgactttctc 117859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 386 - 693
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  386 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggt 485  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  486 aagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 585  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||    
T  586 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctct 685  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    || |||||    
T  686 tggatcat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4420
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  4733 atcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 4634  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| |    
T  4633 ctgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgacttt 4534  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  4533 caataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatc 4434  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  4433 atcttaactttctc 4420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33080 - 32779
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33080 atcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 32981  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  32980 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactct 32881  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || |||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  32880 caaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatc 32781  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  32780 at 32779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14849 - 15156
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  14849 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggt 14948  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||     
T  14949 acgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagt 15048  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||   ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15049 gactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttct 15148  T
Q  301 tgaatcat 308  Q
    ||||||||    
T  15149 tgaatcat 15156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 180189 - 180508
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |    
T  180189 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgat 180288  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||     
T  180289 acgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagt 180388  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  180389 aactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 180488  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  180489 tgaatcatcttaactttctc 180508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 16965 - 17266
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||    
T  16965 atcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgcca 17064  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | ||| ||||||    
T  17065 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactct 17164  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17165 caaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatc 17264  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  17265 at 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 15471 - 15783
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  || |||| |||||| ||||| || ||||    
T  15471 atcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaa-tgtggtggtaaacctactcgatatgcca 15569  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  |||| |    
T  15570 ccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgt 15669  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 15769  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    ||||| ||||||||    
T  15770 attttaactttctc 15783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15946
Alignment:
Q  206 tcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  306 cattttgactttctc 320  Q
    |||||| ||||||||    
T  15932 cattttaactttctc 15946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 709
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  1021 atcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgcca 922  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  921 ccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactct 822  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  821 c-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatc 723  T
Q  307 attttgactttctc 320  Q
    || || ||||||||    
T  722 atcttaactttctc 709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 3130 - 3419
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  3130 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 3229  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  3230 tttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 3329  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     |||||||||||||| | ||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3330 atctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcat 3419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 127527 - 127226
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  127527 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 127428  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  127427 ccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 127328  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  127327 caaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatc 127228  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  127227 at 127226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26861 - 26560
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  26861 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 26762  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  26761 ccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactct 26662  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || |||||||| || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661 caaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 26562  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  26561 at 26560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 148546 - 148840
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||| ||| ||    
T  148546 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgc 148645  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  148646 cactgttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 148745  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || ||||  || | |||  |||| || |  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  148746 ctcagaaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 148840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 196032 - 195715
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  196032 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 195933  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  195932 cactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaacc 195833  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||   |    
T  195832 ctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatga 195734  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  195733 tcatcttgactttctctgt 195715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 68770 - 68576
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  68770 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 68671  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggag 199  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  68670 cactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 68576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 122118 - 121977
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||   || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  122118 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 122019  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  122018 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 121977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 323
Target Start/End: Original strand, 6350 - 6666
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  |||    
T  6350 atcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatatacca 6449  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  6450 ccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 6549  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6550 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatc 6649  T
Q  307 attttgactttctctgt 323  Q
    || || || ||||||||    
T  6650 atcttaaccttctctgt 6666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 6918 - 7203
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagg-tgcggtgctaaacccactcggtaagccacc 108  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6918 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccacc 7017  T
Q  109 gttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctc- 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7018 gttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 7117  T
Q  208 aaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |  | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7118 aaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 7203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15404 - 15107
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  15404 acatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 15305  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  15304 ttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 15205  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatca 307  Q
    | | ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15204 agatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatca 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26049 - 25752
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||    
T  26049 gaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 25950  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  25949 cacggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgact 25850  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 302  Q
    || ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25849 ctaaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 25752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 162091 - 162376
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  162091 atcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 162190  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  162191 ccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactct 162290  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 292  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||  | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  162291 caaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 448037 - 448338
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |  ||||    
T  448037 atcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgcca 448136  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||  ||| | ||||| ||||||    
T  448137 ccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactct 448236  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
     ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  448237 aaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatc 448336  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  448337 at 448338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 91227 - 90947
Alignment:
Q  40 agttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggac 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  91227 agttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctaatatggac 91128  T
Q  140 caataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaag 239  Q
     ||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  91127 taataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaag 91028  T
Q  240 atccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
      ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  91027 ggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctc 90947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175431
Alignment:
Q  118 ctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcatagg 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 78762 - 78668
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| || || ||||||||    
T  78762 actctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatctt 78668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 27939 - 28231
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  27939 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgat 28038  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||     
T  28039 acgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagt 28138  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28139 aactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 588 - 287
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  588 atcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 489  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||  ||||||    
T  488 ccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactct 389  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  388 caaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatc 289  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  288 at 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 884 - 1181
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||    
T  884 gaatcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgc 983  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  984 cactgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 1083  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 302  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  1084 ctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttg 1181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 9321 - 9622
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9321 atcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgcca 9420  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | || ||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  9421 ccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 9520  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  9521 caacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatc 9620  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  9621 at 9622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 26
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  310 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgcca 211  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  210 ccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 111  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 291  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  110 aaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 5199 - 5500
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||| |||||||  | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || ||||    
T  5199 atcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgcca 5298  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  5299 ccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 5398  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5399 caaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 5498  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  5499 at 5500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 320
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22158
Alignment:
Q  94 actcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtca 193  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  194 taggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 293  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  294 cttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctc 22158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13273 - 13004
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||  || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |    
T  13273 aagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaa 13174  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    | ||||||  |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13173 ctaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaa 13074  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13073 gatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcat 13004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47415
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||  || |||| ||||||||| ||||| ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctc 47415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16793 - 16492
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||   | ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  16793 atcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 16694  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16693 ccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 16594  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16593 caaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatc 16494  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  16493 at 16492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14318
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  14049 aagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacaga 14148  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  14149 ccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaa 14248  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14249 gatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 14318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 319
Target Start/End: Original strand, 31386 - 31700
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  31386 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 31485  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||    
T  31486 cactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaact 31585  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  31586 ctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctga 31685  T
Q  305 tcattttgactttct 319  Q
    |||| ||||||||||    
T  31686 tcatcttgactttct 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Original strand, 17655 - 17732
Alignment:
Q  242 ccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttct 319  Q
    ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  17655 ccttcctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 17732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1156 - 838
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| || ||||| |    
T  1156 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaactcgat 1057  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    |  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||     
T  1056 attccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 957  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  956 gactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctct 858  T
Q  301 tgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  857 tgaatcatcttaactttctc 838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 320
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49784
Alignment:
Q  42 ttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggacca 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  142 ataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagat 241  Q
    |||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| || ||| ||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  242 ccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    | ||||| | ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctc 49784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 117235 - 116933
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| ||  |||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| || ||    
T  117235 gaatcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgc 117136  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | ||| ||||    
T  117135 caccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgact 117036  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  117035 ctcaaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgga 116936  T
Q  305 tca 307  Q
    |||    
T  116935 tca 116933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Original strand, 98213 - 98294
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  98213 cttgaaactcaatatccttactcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 98294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16744 - 16443
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagcca 106  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||  | || ||||    
T  16744 atcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgcca 16645  T
Q  107 ccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactct 206  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||  |||| ||| ||    
T  16644 ccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccct 16545  T
Q  207 caaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 306  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544 aaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 16445  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  16444 at 16443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Original strand, 1 - 293
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |  || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctc 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4146
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttct 4146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18867 - 18552
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  18867 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgc 18768  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  18767 cactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaact 18668  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  18667 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctta 18568  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  18567 tcatcttgactttctc 18552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11069 - 10778
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||  || ||    
T  11069 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgc 10970  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||    
T  10969 cactgttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgact 10870  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869 ctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14231 - 13916
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || || ||||  || ||    
T  14231 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgc 14132  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  14131 cactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 14032  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    || ||||||||||| || || |||||||| |||||  |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  14031 cttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttccctta 13932  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  13931 tcatcttgactttctc 13916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4965
Alignment:
Q  64 tgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttct 163  Q
    ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  164 ttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggta 263  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||  | || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| ||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  264 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgt 4965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26413
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     ||||| |||||||| |||||  |||| || | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttct 26413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51898
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttct 51898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Original strand, 4758 - 5041
Alignment:
Q  37 caaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacg 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||    
T  4758 caaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacg 4857  T
Q  137 gaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatc 236  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  4858 gaccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactc 4957  T
Q  237 aagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    |||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  4958 aagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctc 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 27495 - 27813
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  27495 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 27594  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  27595 cactgttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaact 27694  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27695 ctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttga 27794  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27795 tcatcttgactttctctgt 27813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1478 - 1165
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||   ||||| |||   || ||    
T  1478 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgc 1379  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||  || |    
T  1378 cactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataa-cttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgatt 1280  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  1279 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctta 1180  T
Q  305 tcattttgactttct 319  Q
    |||| ||||||||||    
T  1179 tcatcttgactttct 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 9774 - 10064
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  9774 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 9873  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  9874 cactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaact 9973  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||     | |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9974 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca-----cgtcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 10064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3045
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| | ||| ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 74 - 392
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||    
T  74 gaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgc 173  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  174 cactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaact 273  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  || | || | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    |    
T  274 ctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttccctta 373  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  374 tcatcttgactttctctgt 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Original strand, 995 - 1277
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  995 ggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactc 1094  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| || |||||    
T  1095 tttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatg 1194  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
     ||||||||||  || ||||| || || || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  1195 atctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctt 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1204
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| | |   || ||||| |||||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttct 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Original strand, 3867 - 4182
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |  ||| | |||  ||| ||    
T  3867 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgc 3966  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  3967 cactgttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 4066  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  4067 ctcagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctctta 4166  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  4167 tcatcttgactttctc 4182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 14062 - 14356
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| ||    
T  14062 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgc 14161  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14162 cactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgact 14260  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14261 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 14356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8069
Alignment:
Q  93 cactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtc 192  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  193 ataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 292  Q
    |  | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  293 tcttttcttgaatcat 308  Q
    | || |||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcat 8069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 302
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9243
Alignment:
Q  106 accgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactc 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  206 tcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 302  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 9243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 466 - 351
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||    
T  466 actctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctctt 367  T
Q  302 gaatcattttgacttt 317  Q
    ||||||| || |||||    
T  366 gaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Original strand, 6955 - 7046
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcg 98  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  6955 atcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaacccactcg 7046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5949
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaaa-catcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||| |||||||||  |||| ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttct 5949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20253
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
     ||||| |||||||| |||||  |||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttc 20253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13691 - 13373
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  13691 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 13592  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  13591 cactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 13492  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    || | ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  13491 cttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 13392  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13391 tcatcttgactttctctgt 13373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17461 - 17143
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  17461 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 17362  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  17361 cactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaacc 17262  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    || | ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  17261 ctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 17162  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  17161 tcatcttgactttctctgt 17143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5920 - 5630
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||  || ||    
T  5920 gaatcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgc 5821  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
     || || |||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||| |||| | || |||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  5820 aactgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgact 5721  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5720 ctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatcctt-ttgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatctt 5630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25401 - 25110
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  25401 gaatcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgc 25302  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || | ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||||    
T  25301 cactgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgact 25202  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25201 cttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 25110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16298 - 16211
Alignment:
Q  208 aaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 295  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  16298 aaaaacacatgatccccaacttgaaagtctatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatct 16211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Original strand, 27202 - 27516
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||| ||    
T  27202 gaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgc 27301  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  27302 cacggttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaact 27401  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| | ||| |||||||| |||||  ||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||   |    
T  27402 ctcagaaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctctta 27500  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    |||| |||||||||||    
T  27501 tcatcttgactttctc 27516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5011
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| ||||  |||||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||  |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgtggt 326  Q
    |||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggt 5011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7332 - 7071
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||    
T  7332 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactctctcagatatctggtatgga 7233  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||    
T  7232 ccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgacactcaa 7133  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |  | || || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7132 gggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 18825 - 19121
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  18825 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgc 18924  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18925 cactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgact 19024  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | | ||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19025 ctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttctt 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 301
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23283
Alignment:
Q  112 ccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaa 211  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  212 acacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | | ||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttctt 23283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37473
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||||| ||||   |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||| ||||   ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 37473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38189
Alignment:
Q  109 gttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctca 208  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  209 aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcat 38201  T
Q  309 tttgactttctc 320  Q
     |||||||||||    
T  38200 cttgactttctc 38189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27372
Alignment:
Q  109 gttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctca 208  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  209 aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttct 27372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 49363 - 49068
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||  ||| ||    
T  49363 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgc 49264  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    | | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |  |||    
T  49263 cgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttact 49164  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  49163 ctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttct 49068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 58146 - 57853
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  58146 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 58047  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  58046 caccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaact 57947  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||||||| ||||| || || |  ||||| |||||  |||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  57946 ctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttc 57853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26195 - 25901
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  26195 gaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 26096  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  26095 cactgttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaact 25996  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25995 ctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttc 25901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 16652 - 16946
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| || |  || ||    
T  16652 gaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgc 16751  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  16752 cactattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 16851  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16852 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttc 16946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16929 - 17142
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |    
T  16929 ctctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaat 17028  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  17029 acgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagt 17128  T
Q  201 gactctcaaaaaca 214  Q
    ||||||||||||||    
T  17129 gactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21686
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | || ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttc 318  Q
    ||  || |||||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  319 tc 320  Q
    ||    
T  21687 tc 21686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26085
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcat 26085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14265
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaa 209  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  210 aaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatt 309  Q
    ||| ||||| || || || | ||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  310 ttgactttctct 321  Q
    |||||| |||||    
T  14276 ttgactatctct 14265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaa 173  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Original strand, 39715 - 40030
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||| ||| ||    
T  39715 gaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgc 39814  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||  |||    
T  39815 cactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaact 39914  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  39915 ctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctta 40014  T
Q  305 tcattttgactttctc 320  Q
    | || |||||||||||    
T  40015 taatcttgactttctc 40030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 86834 - 86539
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||  || ||    
T  86834 gaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgc 86735  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
     ||||  ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | ||| ||||    
T  86734 aaccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgact 86635  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  86634 ctaaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttct 86539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10413 - 10095
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  10413 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgc 10314  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  10313 cacagttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaacc 10214  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |    
T  10213 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctga 10114  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  10113 tcatcttgactttctctgt 10095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 61543 - 61225
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  61543 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgc 61444  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||     
T  61443 cactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaacc 61344  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  61343 ctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctga 61244  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  61243 tcatcttgactttctctgt 61225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67613
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||| ||| ||||| || || ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
     ||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgt 67613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 52509 - 52191
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||  || ||    
T  52509 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgc 52410  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||     
T  52409 cactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaacc 52310  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  52309 ctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctga 52210  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  52209 tcatcttgactttctctgt 52191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 295
Target Start/End: Original strand, 538 - 794
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  538 aagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatttgatacgga 637  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  638 ccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaa 737  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 295  Q
    | |||||||| | ||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  738 ggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatct 794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1381
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  219 gtctccttcttgaaa 233  Q
     ||||| ||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaa 1381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 49537 - 49219
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  49537 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggc 49438  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||     
T  49437 cacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgacc 49338  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  49337 ctcagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctga 49238  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  49237 tcatcttgactttttctgt 49219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58443
Alignment:
Q  73 gaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttca 172  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  173 aggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttg 272  Q
      ||| |||| ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  273 tcgactctgcgacgctttcatctttt 298  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcatctttt 58443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19414
Alignment:
Q  29 catacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| || || |||||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  129 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttct 228  Q
    |||||||| |||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  || |||| ||| ||||| || || ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgt 19414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 59102 - 59042
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatg 65  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  59102 gaatcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 296
Target Start/End: Original strand, 204 - 458
Alignment:
Q  42 ttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggacca 141  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  204 ttgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaaatctgatacggacca 303  T
Q  142 ataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagat 241  Q
    || ||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  304 atgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggt 403  T
Q  242 ccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    | ||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  404 ctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 807
Alignment:
Q  130 tgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttctt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  230 gaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
     ||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcat 807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 10864 - 11182
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  10864 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 10963  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  10964 cactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaacc 11063  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    || | ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  11064 ctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 11163  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11164 tcatcttgactttctctgt 11182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 411
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatg 218  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || || | ||| |||||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  219 gtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttc 318  Q
     || || || ||||| |||||  ||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttc 416  T
Q  319 tctgt 323  Q
    |||||    
T  415 tctgt 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7943 - 7837
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |    
T  7943 actctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcct 7844  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  7843 gaatcat 7837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42663 - 42345
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  42663 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 42564  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||     
T  42563 cacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaacc 42464  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  42463 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctga 42364  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  42363 tcatcttgactttctctgt 42345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 47729 - 47411
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  47729 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 47630  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||  ||     
T  47629 cacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaacc 47530  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  47529 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctga 47430  T
Q  305 tcattttgactttctctgt 323  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  47429 tcatcttgactttctctgt 47411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2309
Alignment:
Q  131 gatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacacc 188  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacc 2309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 317
Target Start/End: Original strand, 20098 - 20410
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  20098 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggc 20197  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    |||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  ||     
T  20198 cacaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaacc 20297  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||| ||||||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20298 ctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaa 20397  T
Q  305 tcattttgacttt 317  Q
    |||| ||||||||    
T  20398 tcatcttgacttt 20410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 43477 - 43776
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  |    
T  43477 ctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctat 43576  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||     
T  43577 aggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagt 43676  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     || |||| ||||||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43677 aaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttct 43776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 44489 - 44788
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  |    
T  44489 ctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctat 44588  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||     
T  44589 aggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagt 44688  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
     || |||| ||||||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44689 aaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttct 44788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36220
Alignment:
Q  10 acatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  110 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcat 194  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 320
Target Start/End: Original strand, 7519 - 7688
Alignment:
Q  151 ggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttc 250  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  7519 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 7618  T
Q  251 tcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  7619 gcttatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17043 - 16748
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  17043 gaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgc 16944  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||     
T  16943 cactgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgacc 16844  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16843 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttct 16748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33969 - 33718
Alignment:
Q  43 tgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaa 142  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  33969 tgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaa 33870  T
Q  143 taaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatc 242  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  33869 taaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtc 33770  T
Q  243 cttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 294  Q
    |||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33769 cttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 33718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 40434 - 40537
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  40434 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 40533  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  40534 tcat 40537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248883
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  ||||||||  |||||||| | ||||| |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||| || || ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
     ||||| || ||   ||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 248883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 26237 - 26531
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||||||||| ||  ||||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  |||||  |||  |||||    
T  26237 gaatcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagc 26336  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||     
T  26337 cactgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacc 26436  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26437 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 26531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39221 - 38924
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||  |    
T  39221 ctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctat 39122  T
Q  101 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagc 200  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||| |||||     
T  39121 atgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagt 39022  T
Q  201 gactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctttt 298  Q
    |||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39021 gactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatctttt 38924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29065 - 28808
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || | ||   |||||||||  || ||||| || |||||||| || || |||||||| |||    
T  29065 aagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatgga 28966  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    |||||||||   || ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28965 ccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaa 28866  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    | ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  28865 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatctt 28808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41056 - 40799
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || | ||   |||||||||  || ||||| || |||||||| || || |||||||| |||    
T  41056 aagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatgga 40957  T
Q  139 ccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaa 238  Q
    |||||||||   || ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40956 ccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaa 40857  T
Q  239 gatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    | ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  40856 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatctt 40799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Original strand, 6159 - 6475
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||| |||  | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | | ||  ||||| | ||  || ||    
T  6159 gaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgc 6258  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  6259 cacagttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaacc 6358  T
Q  205 ctca-aaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 303  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  6359 ctcaggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatg 6458  T
Q  304 atcattttgactttctc 320  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6459 atcatcttgactttctc 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12817
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
     ||||| |||||  |||| || | ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttc 12817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 42759 - 43053
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  | |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||  |||||    
T  42759 gaataacatgtgaaggatccgctagatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagc 42858  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||     
T  42859 cactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgacc 42958  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 299  Q
    || | ||| ||||| || || || ||||| || ||   ||| || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42959 ctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 43053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7250
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||  ||||| ||||  || ||||| ||||||||   |||||| |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaacc--ttctgaaa 7446  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||  || |||| ||| ||||| || || ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  228 ttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
     ||||| | |||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgt 7250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4722 - 4567
Alignment:
Q  38 aaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacgg 137  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  4722 aaagatgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacgg 4623  T
Q  138 accaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtca 193  Q
    |||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4622 accaataaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4481
Alignment:
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 4481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 37079 - 37008
Alignment:
Q  2 tctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcg 73  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37079 tctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcg 37008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18996
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaag 77  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaag 18996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4469 - 4235
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  4469 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgc 4370  T
Q  105 caccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgact 204  Q
    ||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  4369 cacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 4270  T
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaag 239  Q
    || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  4269 cttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Original strand, 1910 - 2065
Alignment:
Q  145 aacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatcct 244  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||    
T  1910 aactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcct 2009  T
Q  245 tccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2010 tcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttct 2065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 298
Target Start/End: Original strand, 5311 - 5482
Alignment:
Q  127 atctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctcctt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || |    
T  5311 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 5410  T
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctttt 298  Q
    | ||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5411 cctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttt 5482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| | ||| |||||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctca 208  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  28 acatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  128 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcac 178  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 300
Target Start/End: Original strand, 1 - 141
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcat 259  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  260 ggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 300  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttct 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 136109 - 136278
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||||| ||||||||||    
T  136109 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactc 136208  T
Q  119 tttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacacc 188  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  136209 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 323
Target Start/End: Original strand, 10843 - 11063
Alignment:
Q  103 gccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaatttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcga 202  Q
    ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||  |    
T  10843 gccactgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaa 10942  T
Q  203 ctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 302  Q
    | || | ||||||||| || || || ||||| |||||  |||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||      
T  10943 ccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctct 11042  T
Q  303 aatcattttgactttctctgt 323  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  11043 gatcatcttgactttctctgt 11063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Original strand, 6251 - 6329
Alignment:
Q  7 atcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtg 85  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6251 atcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtg 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3802 - 3734
Alignment:
Q  252 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3802 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctc 3734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14802
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| | ||   ||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcat 14802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1249
Alignment:
Q  184 acaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcg 283  Q
    ||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  284 acgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctc 320  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctc 1249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 46330 - 46433
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  46330 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 46429  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  46430 tcat 46433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 296
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6008
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||   || |||||||||||||| || ||  ||||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatctt 6008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 296
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10622
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||   || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatctt 10622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 296
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8617
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||   || |||||||||||||| || ||  ||||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatctt 8617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 311
Target Start/End: Original strand, 13081 - 13190
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  13081 actctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 13180  T
Q  302 gaatcatttt 311  Q
    | ||||||||    
T  13181 ggatcatttt 13190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5531 - 5466
Alignment:
Q  256 tcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctct 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  5531 tcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctct 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 7550 - 7498
Alignment:
Q  1 ctctgaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatg 53  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  7550 ctctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8985 - 8918
Alignment:
Q  241 tccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8985 tccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcat 8918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14764
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14867 ctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaa 14768  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  14767 tcat 14764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1078 - 940
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||   || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  1078 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 979  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  978 cttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 323
Target Start/End: Original strand, 102 - 183
Alignment:
Q  242 ccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||    
T  102 ccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgt 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 3332 - 3438
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| || |  ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  3332 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 3431  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  3432 gaatcat 3438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 10829 - 10935
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| || |||||| ||||||| ||||    
T  10829 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctctt 10928  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  10929 gaatcat 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 308
Target Start/End: Original strand, 43715 - 43817
Alignment:
Q  206 tcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 305  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  43715 tcaaaaacacatgatcaccaagttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaat 43814  T
Q  306 cat 308  Q
    |||    
T  43815 cat 43817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 296
Target Start/End: Original strand, 14795 - 14924
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| ||||   || || ||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  14795 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 14894  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 296  Q
     || |||| |||||| ||| | ||||||||    
T  14895 tttctgtctactctgagacaccttcatctt 14924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26184
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcat 26184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Original strand, 23592 - 23673
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  23592 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcat 23673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45943
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagccaccgttccaactc 118  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||| |    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 45934  T
Q  119 tttctgata 127  Q
    | |||||||    
T  45935 tctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 516 - 413
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  516 ctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 417  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  416 tcat 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3981 - 3902
Alignment:
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  3981 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcat 3902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 8271 - 8374
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  8271 ctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaa 8370  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  8371 tcat 8374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28396 - 28293
Alignment:
Q  205 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaa 304  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| || |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| || || || |||||||| |||||||    
T  28396 ctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaa 28297  T
Q  305 tcat 308  Q
    ||||    
T  28296 tcat 28293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3971
Alignment:
Q  202 actctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctt 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| || |    
T  4077 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcct 3978  T
Q  302 gaatcat 308  Q
    |||||||    
T  3977 gaatcat 3971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1087
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||| || ||  |  |||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 302  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3367
Alignment:
Q  253 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgactttctctgt 323  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||||||    
T  3437 ttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgt 3367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3598 - 3487
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgctaaacccactcggtaagc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||  || ||    
T  3598 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgc 3499  T
Q  105 caccgttccaac 116  Q
    ||| ||||||||    
T  3498 cactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1451
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| |||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcat 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Original strand, 24018 - 24159
Alignment:
Q  167 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagcgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaact 266  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||  |||   ||||| ||||||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  24018 acttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 24117  T
Q  267 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||| |||| ||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24118 cttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcat 24159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71498
Alignment:
Q  252 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcat 71498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Original strand, 9187 - 9266
Alignment:
Q  229 tgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcat 308  Q
    ||||| |||| |||||| ||  |||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9187 tgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagctcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcat 9266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 820
Alignment:
Q  227 cttgaaaatcaagatccttccttctcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttgacttt 317  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| || | |||||| || || ||||||||||| | |||||| || |||||    
T  910 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatcttctgcctactctgagatgcattcatcttttcctaaatcatcttaacttt 820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 967 - 895
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaag 77  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  967 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaag 895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9267
Alignment:
Q  5 gaatcacatgggacggatccggaacatacctccaaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaag 77  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||| ||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  9195 gaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaag 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University