View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21672_high_46 (Length: 306)

Name: NF21672_high_46
Description: NF21672
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21672_high_46
NF21672_high_46
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (6-306)||(27327783-27328084)
chr6 (6-306)||(27388523-27388824)
chr6 (17-306)||(27430021-27430311)
chr6 (6-271)||(18194251-18194516)
chr6 (6-306)||(30694441-30694742)
chr6 (17-306)||(20801835-20802124)
chr6 (6-306)||(26130546-26130848)
chr6 (17-306)||(28258192-28258481)
chr6 (17-306)||(28264816-28265105)
chr6 (17-306)||(28336941-28337230)
chr6 (17-306)||(28343565-28343854)
chr6 (34-306)||(28287435-28287707)
chr6 (17-306)||(1538682-1538971)
chr6 (17-306)||(1544781-1545070)
chr6 (6-306)||(2869862-2870163)
chr6 (6-306)||(2876477-2876778)
chr6 (6-306)||(4233225-4233526)
chr6 (6-299)||(6980744-6981038)
chr6 (6-299)||(20649520-20649814)
chr6 (17-273)||(30597330-30597586)
chr6 (16-239)||(17031017-17031240)
chr6 (6-306)||(20060728-20061029)
chr6 (6-268)||(12762819-12763081)
chr6 (6-306)||(14059343-14059644)
chr6 (17-248)||(16371996-16372227)
chr6 (19-306)||(25110919-25111207)
chr6 (19-306)||(25117522-25117810)
chr6 (17-299)||(8797276-8797559)
chr6 (17-191)||(17037073-17037247)
chr6 (17-239)||(34369711-34369933)
chr6 (6-239)||(8229035-8229267)
chr6 (6-239)||(18931224-18931456)
chr6 (6-239)||(29593547-29593779)
chr6 (19-272)||(34832769-34833021)
chr6 (17-239)||(32564980-32565201)
chr6 (6-239)||(29587406-29587638)
chr6 (17-239)||(17016660-17016881)
chr6 (17-195)||(22331630-22331808)
chr6 (6-239)||(30637857-30638088)
chr6 (53-272)||(25928411-25928629)
chr6 (17-239)||(16551758-16551979)
chr6 (17-239)||(16576974-16577195)
chr6 (17-239)||(16618185-16618406)
chr6 (17-239)||(16628314-16628535)
chr6 (17-239)||(19808673-19808895)
chr6 (19-306)||(3708222-3708509)
chr6 (49-267)||(22758972-22759188)
chr6 (17-196)||(28314761-28314940)
chr6 (19-306)||(24314819-24315105)
chr6 (19-306)||(31316832-31317117)
chr6 (17-196)||(27185899-27186078)
chr6 (17-196)||(27207735-27207914)
chr6 (17-196)||(27241314-27241493)
chr6 (17-196)||(27263162-27263341)
chr6 (19-269)||(25595092-25595342)
chr6 (19-232)||(14098780-14098993)
chr6 (51-272)||(34298395-34298615)
chr6 (19-233)||(4168078-4168291)
chr6 (19-233)||(4208758-4208971)
chr6 (109-306)||(24290881-24291077)
chr6 (167-271)||(18917552-18917654)
chr6 (51-135)||(23277050-23277134)
chr6 (51-100)||(1644990-1645039)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (6-306)||(23171116-23171417)
chr2 (6-306)||(23582373-23582674)
chr2 (6-306)||(29233607-29233908)
chr2 (6-306)||(29346906-29347207)
chr2 (11-306)||(27599342-27599638)
chr2 (6-306)||(24913691-24913992)
chr2 (11-306)||(1843161-1843457)
chr2 (6-306)||(16997128-16997429)
chr2 (6-306)||(17003761-17004062)
chr2 (11-306)||(16928434-16928730)
chr2 (17-306)||(10866449-10866740)
chr2 (17-306)||(10873616-10873907)
chr2 (6-299)||(27617381-27617675)
chr2 (6-299)||(22320713-22321007)
chr2 (6-299)||(22326866-22327160)
chr2 (6-299)||(26877295-26877589)
chr2 (17-289)||(12829168-12829438)
chr2 (19-306)||(37318354-37318641)
chr2 (51-267)||(21139043-21139258)
chr2 (49-250)||(24640730-24640931)
chr2 (51-267)||(21147061-21147276)
chr2 (6-239)||(13306316-13306548)
chr2 (6-239)||(16986091-16986323)
chr2 (6-239)||(27216213-27216445)
chr2 (6-239)||(28431639-28431871)
chr2 (11-239)||(16922679-16922906)
chr2 (17-239)||(27197031-27197253)
chr2 (6-239)||(19489651-19489883)
chr2 (6-239)||(9340430-9340662)
chr2 (6-239)||(9489064-9489296)
chr2 (6-239)||(9608325-9608557)
chr2 (19-306)||(41604471-41604758)
chr2 (19-306)||(41610368-41610655)
chr2 (17-239)||(44380931-44381151)
chr2 (18-250)||(30970718-30970950)
chr2 (17-239)||(27369449-27369670)
chr2 (17-239)||(44387601-44387821)
chr2 (18-250)||(24872146-24872378)
chr2 (18-250)||(24880031-24880263)
chr2 (19-306)||(13970109-13970395)
chr2 (17-233)||(27375965-27376180)
chr2 (19-306)||(24714792-24715078)
chr2 (19-306)||(45057165-45057451)
chr2 (17-272)||(24503224-24503478)
chr2 (18-306)||(19645716-19645994)
chr2 (17-100)||(10101383-10101466)
chr2 (163-267)||(11677569-11677672)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (17-306)||(41294172-41294462)
chr5 (17-306)||(37286518-37286808)
chr5 (17-306)||(37293221-37293511)
chr5 (6-276)||(1692163-1692433)
chr5 (6-306)||(15001405-15001706)
chr5 (6-276)||(27687055-27687325)
chr5 (6-276)||(18038394-18038664)
chr5 (6-306)||(14994762-14995063)
chr5 (6-306)||(19991961-19992262)
chr5 (6-306)||(40707200-40707500)
chr5 (6-306)||(40713842-40714142)
chr5 (6-306)||(22062608-22062909)
chr5 (17-306)||(37544118-37544410)
chr5 (17-306)||(33725937-33726227)
chr5 (6-306)||(22327890-22328190)
chr5 (18-306)||(27516830-27517118)
chr5 (18-306)||(27523467-27523755)
chr5 (17-306)||(22133077-22133366)
chr5 (17-306)||(22139769-22140058)
chr5 (6-299)||(17706657-17706951)
chr5 (18-273)||(23610014-23610269)
chr5 (18-273)||(23841410-23841665)
chr5 (6-273)||(27670156-27670423)
chr5 (17-299)||(34294290-34294573)
chr5 (6-273)||(41097949-41098216)
chr5 (6-299)||(22265030-22265324)
chr5 (6-299)||(24471974-24472268)
chr5 (17-306)||(25406504-25406793)
chr5 (6-299)||(27663516-27663810)
chr5 (6-306)||(27608817-27609118)
chr5 (6-268)||(41769359-41769621)
chr5 (6-306)||(27615423-27615724)
chr5 (17-303)||(22588178-22588462)
chr5 (6-268)||(41775933-41776195)
chr5 (17-289)||(29477692-29477962)
chr5 (17-289)||(29471097-29471367)
chr5 (17-306)||(17284147-17284434)
chr5 (6-306)||(23584217-23584519)
chr5 (6-239)||(25106931-25107163)
chr5 (6-239)||(25166024-25166256)
chr5 (17-272)||(15441692-15441946)
chr5 (17-239)||(21667544-21667765)
chr5 (17-239)||(29316565-29316786)
chr5 (19-306)||(23250016-23250306)
chr5 (17-239)||(22410336-22410558)
chr5 (6-239)||(16354992-16355224)
chr5 (6-239)||(16361651-16361883)
chr5 (17-250)||(23337026-23337259)
chr5 (6-239)||(34564985-34565217)
chr5 (6-239)||(34571640-34571872)
chr5 (17-272)||(21295001-21295255)
chr5 (17-272)||(25535102-25535356)
chr5 (17-239)||(14359557-14359778)
chr5 (153-306)||(22341476-22341629)
chr5 (17-196)||(20776077-20776256)
chr5 (6-157)||(22334544-22334695)
chr5 (17-239)||(22258211-22258431)
chr5 (17-250)||(22325664-22325897)
chr5 (18-250)||(22343632-22343864)
chr5 (19-306)||(19768428-19768714)
chr5 (19-306)||(19775024-19775310)
chr5 (17-272)||(24554648-24554901)
chr5 (19-233)||(25808226-25808440)
chr5 (108-306)||(24020361-24020559)
chr5 (17-100)||(15236518-15236601)
chr5 (108-250)||(22353032-22353174)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (6-306)||(14655143-14655444)
chr7 (6-306)||(18182855-18183155)
chr7 (6-306)||(18176183-18176483)
chr7 (6-276)||(15155896-15156166)
chr7 (6-276)||(15162547-15162817)
chr7 (6-276)||(13684571-13684841)
chr7 (6-276)||(16407021-16407291)
chr7 (6-306)||(44786201-44786502)
chr7 (6-306)||(44792842-44793143)
chr7 (11-306)||(11366278-11366574)
chr7 (23-299)||(49051455-49051732)
chr7 (6-299)||(18164400-18164694)
chr7 (6-213)||(13691249-13691456)
chr7 (6-299)||(9510739-9511033)
chr7 (6-299)||(40523088-40523382)
chr7 (6-306)||(14337448-14337749)
chr7 (17-306)||(20702729-20703016)
chr7 (6-306)||(60403-60704)
chr7 (6-306)||(14330864-14331165)
chr7 (17-306)||(32767755-32768042)
chr7 (17-267)||(18531363-18531612)
chr7 (54-299)||(12703184-12703430)
chr7 (6-239)||(21829-22061)
chr7 (6-239)||(8201801-8202033)
chr7 (17-195)||(4318283-4318461)
chr7 (17-239)||(14148715-14148937)
chr7 (17-239)||(18585038-18585259)
chr7 (17-252)||(23519692-23519925)
chr7 (6-306)||(1347589-1347886)
chr7 (17-272)||(11262442-11262696)
chr7 (17-272)||(12692609-12692863)
chr7 (17-272)||(14953311-14953565)
chr7 (17-239)||(8706142-8706363)
chr7 (17-239)||(10875675-10875895)
chr7 (6-239)||(15022276-15022509)
chr7 (25-239)||(18553278-18553491)
chr7 (18-250)||(6016910-6017142)
chr7 (17-233)||(8719564-8719779)
chr7 (6-194)||(11232011-11232198)
chr7 (6-194)||(11238698-11238885)
chr7 (17-272)||(14959277-14959531)
chr7 (17-272)||(25038948-25039202)
chr7 (17-239)||(10869595-10869815)
chr7 (17-250)||(11554601-11554833)
chr7 (76-272)||(26420113-26420308)
chr7 (17-250)||(11548005-11548237)
chr7 (76-272)||(44408134-44408329)
chr7 (19-233)||(9410096-9410310)
chr7 (17-100)||(33392-33475)
chr7 (17-100)||(70503-70586)
chr7 (51-222)||(13570057-13570227)
chr7 (20-100)||(74615-74695)
chr7 (49-272)||(7536299-7536521)
chr7 (17-92)||(12704396-12704471)
chr7 (110-269)||(19929-20087)
chr7 (6-81)||(12703114-12703189)
chr7 (234-276)||(13691202-13691244)
chr7 (51-100)||(26292680-26292729)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (17-306)||(16345512-16345802)
chr1 (17-306)||(16352160-16352450)
chr1 (6-276)||(41478303-41478574)
chr1 (6-306)||(51328405-51328706)
chr1 (6-306)||(51335039-51335340)
chr1 (6-276)||(18599832-18600102)
chr1 (17-306)||(41356025-41356316)
chr1 (17-306)||(41348588-41348879)
chr1 (17-306)||(47659293-47659585)
chr1 (6-299)||(20215655-20215949)
chr1 (6-306)||(44844609-44844911)
chr1 (17-289)||(21828810-21829082)
chr1 (17-272)||(19111524-19111778)
chr1 (17-289)||(21844323-21844595)
chr1 (17-272)||(19104867-19105121)
chr1 (6-239)||(46157047-46157279)
chr1 (17-201)||(19063704-19063888)
chr1 (25-239)||(20524961-20525175)
chr1 (17-239)||(27898397-27898618)
chr1 (17-239)||(43063014-43063235)
chr1 (17-239)||(44756252-44756473)
chr1 (17-239)||(49334719-49334940)
chr1 (6-239)||(43078587-43078819)
chr1 (17-272)||(23763325-23763579)
chr1 (17-239)||(18626013-18626233)
chr1 (17-239)||(33393994-33394215)
chr1 (18-250)||(50887491-50887723)
chr1 (18-250)||(8305271-8305503)
chr1 (17-272)||(21437908-21438162)
chr1 (19-306)||(33392607-33392894)
chr1 (19-306)||(21806940-21807226)
chr1 (19-306)||(33385963-33386249)
chr1 (51-306)||(21835446-21835700)
chr1 (17-100)||(1011008-1011091)
chr1 (51-100)||(20228581-20228630)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (6-291)||(14268185-14268470)
chr4 (17-306)||(18071246-18071536)
chr4 (6-306)||(18295703-18296004)
chr4 (11-306)||(14298560-14298856)
chr4 (6-276)||(20115251-20115521)
chr4 (11-306)||(14305184-14305480)
chr4 (6-306)||(18024155-18024456)
chr4 (6-306)||(15148535-15148834)
chr4 (17-306)||(6873114-6873404)
chr4 (17-302)||(51493556-51493841)
chr4 (17-306)||(15321832-15322121)
chr4 (6-299)||(19780017-19780311)
chr4 (6-306)||(12475097-12475398)
chr4 (6-306)||(8048223-8048524)
chr4 (6-306)||(8054836-8055137)
chr4 (17-306)||(26284646-26284933)
chr4 (17-306)||(40478228-40478515)
chr4 (6-299)||(23954232-23954526)
chr4 (6-299)||(23960894-23961188)
chr4 (6-306)||(4772174-4772475)
chr4 (17-306)||(40471555-40471842)
chr4 (17-306)||(7900909-7901196)
chr4 (6-306)||(15362210-15362511)
chr4 (6-306)||(22194697-22194998)
chr4 (6-306)||(36884462-36884763)
chr4 (6-306)||(12481727-12482028)
chr4 (6-306)||(15383221-15383521)
chr4 (6-306)||(16231569-16231870)
chr4 (6-239)||(17962052-17962284)
chr4 (49-272)||(35614053-35614275)
chr4 (76-306)||(386129-386357)
chr4 (6-239)||(8384981-8385213)
chr4 (6-239)||(8391636-8391868)
chr4 (6-239)||(14073977-14074209)
chr4 (6-239)||(15256755-15256987)
chr4 (6-239)||(17808560-17808792)
chr4 (19-306)||(30234918-30235205)
chr4 (17-239)||(12349312-12349533)
chr4 (6-239)||(17089705-17089937)
chr4 (17-239)||(12299636-12299857)
chr4 (6-239)||(29040626-29040858)
chr4 (17-239)||(35170774-35170996)
chr4 (18-250)||(53433512-53433744)
chr4 (19-306)||(16956390-16956677)
chr4 (17-272)||(23838547-23838801)
chr4 (17-196)||(55795647-55795825)
chr4 (17-184)||(9271842-9272009)
chr4 (17-272)||(41385483-41385737)
chr4 (17-250)||(12522219-12522452)
chr4 (17-233)||(14679114-14679330)
chr4 (19-306)||(23081668-23081954)
chr4 (17-233)||(14685322-14685539)
chr4 (19-306)||(19941894-19942180)
chr4 (19-306)||(27709825-27710111)
chr4 (17-100)||(17810557-17810640)
chr4 (17-100)||(14757160-14757243)
chr4 (17-59)||(386092-386134)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (17-306)||(57052-57342)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (6-306)||(22115447-22115748)
chr8 (11-276)||(22123117-22123382)
chr8 (6-306)||(8354490-8354792)
chr8 (17-306)||(19496467-19496758)
chr8 (6-306)||(19111304-19111605)
chr8 (6-306)||(19117595-19117896)
chr8 (17-306)||(22048023-22048314)
chr8 (47-306)||(22124296-22124556)
chr8 (17-306)||(18865409-18865699)
chr8 (17-306)||(16882910-16883198)
chr8 (17-306)||(18855014-18855304)
chr8 (6-299)||(17669297-17669591)
chr8 (6-299)||(17675949-17676243)
chr8 (6-299)||(5534166-5534460)
chr8 (6-299)||(21915297-21915591)
chr8 (6-306)||(20019667-20019968)
chr8 (6-306)||(22083909-22084210)
chr8 (17-306)||(29123166-29123453)
chr8 (6-306)||(20013591-20013891)
chr8 (97-306)||(19498515-19498716)
chr8 (6-202)||(28454942-28455138)
chr8 (17-272)||(20527563-20527817)
chr8 (17-239)||(18065478-18065699)
chr8 (17-239)||(19905643-19905864)
chr8 (18-250)||(26934915-26935147)
chr8 (21-306)||(3216340-3216625)
chr8 (110-306)||(23845592-23845788)
chr8 (19-306)||(20023668-20023954)
chr8 (6-52)||(22122149-22122195)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (17-306)||(20057140-20057431)
chr3 (17-306)||(20063778-20064069)
chr3 (17-306)||(3690698-3690988)
chr3 (6-306)||(5221483-5221784)
chr3 (17-306)||(10910978-10911268)
chr3 (6-276)||(16489396-16489666)
chr3 (17-306)||(10904306-10904596)
chr3 (6-299)||(16623781-16624075)
chr3 (6-306)||(13250798-13251099)
chr3 (6-306)||(13257444-13257745)
chr3 (6-306)||(14672926-14673227)
chr3 (17-306)||(10003716-10004006)
chr3 (17-306)||(10010363-10010653)
chr3 (6-297)||(10153461-10153753)
chr3 (6-299)||(37615477-37615771)
chr3 (6-306)||(418079-418380)
chr3 (6-268)||(26788531-26788793)
chr3 (6-268)||(26794121-26794383)
chr3 (6-273)||(31422279-31422546)
chr3 (17-306)||(5149705-5149994)
chr3 (6-306)||(10846010-10846310)
chr3 (6-306)||(26889534-26889835)
chr3 (17-286)||(41201535-41201802)
chr3 (17-289)||(15726669-15726939)
chr3 (17-306)||(15692015-15692302)
chr3 (6-273)||(5106610-5106877)
chr3 (6-273)||(6598831-6599098)
chr3 (6-273)||(6605511-6605778)
chr3 (76-306)||(22643113-22643343)
chr3 (17-306)||(23704506-23704792)
chr3 (17-306)||(23722962-23723248)
chr3 (17-306)||(23741418-23741704)
chr3 (17-272)||(839360-839614)
chr3 (20-273)||(16758311-16758564)
chr3 (6-306)||(53380078-53380377)
chr3 (6-306)||(53386730-53387029)
chr3 (19-300)||(17710331-17710612)
chr3 (6-239)||(48423516-48423748)
chr3 (6-239)||(48430294-48430526)
chr3 (49-272)||(16333287-16333509)
chr3 (17-239)||(12482576-12482797)
chr3 (19-306)||(15991843-15992130)
chr3 (6-306)||(41092073-41092372)
chr3 (17-272)||(7985821-7986074)
chr3 (6-273)||(16747565-16747832)
chr3 (21-306)||(4710378-4710663)
chr3 (6-239)||(16633999-16634231)
chr3 (6-239)||(16640609-16640841)
chr3 (6-239)||(43161274-43161506)
chr3 (6-239)||(43167511-43167743)
chr3 (17-239)||(15584457-15584679)
chr3 (17-239)||(15591115-15591337)
chr3 (17-272)||(24187891-24188145)
chr3 (17-239)||(5201371-5201592)
chr3 (17-239)||(5426440-5426661)
chr3 (6-239)||(1332787-1333018)
chr3 (19-306)||(10236133-10236421)
chr3 (18-250)||(12891541-12891773)
chr3 (18-250)||(17252795-17253027)
chr3 (49-272)||(10325967-10326189)
chr3 (19-226)||(19809188-19809395)
chr3 (17-272)||(28350899-28351153)
chr3 (17-239)||(5420042-5420263)
chr3 (19-306)||(15825742-15826030)
chr3 (17-272)||(20723115-20723369)
chr3 (17-272)||(55149092-55149346)
chr3 (19-306)||(1145291-1145577)
chr3 (22-306)||(410493-410776)
chr3 (19-204)||(13315927-13316112)
chr3 (17-196)||(6608669-6608848)
chr3 (19-306)||(8720895-8721181)
chr3 (19-306)||(9072782-9073068)
chr3 (22-250)||(13321107-13321335)
chr3 (19-306)||(15349988-15350274)
chr3 (51-222)||(15404265-15404435)
chr3 (19-306)||(15343345-15343630)
chr3 (51-222)||(15360856-15361026)
chr3 (51-222)||(15397674-15397844)
chr3 (17-100)||(30066234-30066317)
chr3 (110-306)||(30777054-30777250)
chr3 (17-100)||(11070356-11070439)
chr3 (17-100)||(11165267-11165350)
chr3 (17-92)||(14499621-14499696)
chr3 (51-222)||(15337598-15337767)
chr3 (35-158)||(4290999-4291122)
chr3 (18-59)||(22643077-22643118)
chr3 (242-305)||(15366890-15366954)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (6-306)||(779-1081)
scaffold0052 (6-239)||(10506-10738)
scaffold0052 (6-239)||(56928-57160)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (17-306)||(26720-27010)
scaffold0109 (110-306)||(43392-43588)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (17-306)||(125851-126141)
scaffold0029 (35-306)||(105634-105906)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (17-306)||(38119-38410)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (17-306)||(76402-76693)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (17-306)||(41616-41905)
scaffold0028 (17-306)||(57123-57412)
scaffold0028 (6-299)||(67593-67887)
scaffold0028 (19-306)||(7082-7370)
scaffold0028 (108-306)||(13607-13806)
scaffold0028 (108-306)||(23135-23334)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (6-299)||(9543-9837)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (6-299)||(30612-30906)
scaffold0044 (6-268)||(72625-72887)
scaffold0044 (17-306)||(8140-8427)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (17-306)||(307177-307464)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (6-306)||(59187-59488)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-306)||(139145-139446)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (17-272)||(14278-14532)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (25-250)||(5544-5769)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (17-272)||(29945-30199)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (17-272)||(9454-9708)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (6-238)||(109051-109283)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (17-239)||(8936-9157)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (17-239)||(3816-4037)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (17-239)||(22351-22572)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (6-239)||(38851-39083)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (17-272)||(10291-10545)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (17-272)||(242171-242425)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (19-306)||(78292-78580)
scaffold0004 (17-250)||(58156-58389)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (18-306)||(14732-15020)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (18-306)||(193-481)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (19-306)||(12522-12810)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (19-306)||(74076-74362)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (17-190)||(36903-37075)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (84-306)||(19382-19604)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (17-193)||(32050-32225)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (17-247)||(24713-24943)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (17-100)||(3614-3697)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (17-92)||(12715-12790)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (17-88)||(3006-3077)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (157-267)||(8732-8841)
scaffold0216 (17-98)||(8615-8696)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (19-89)||(3068-3138)
scaffold0156 (163-272)||(2924-3031)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (51-91)||(4049-4089)
scaffold0149 (51-91)||(8480-8520)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 27327783 - 27328084
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27327783 aggatcagagggaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagt 27327882  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27327883 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagac 27327982  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27327983 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttgtgtgctattga 27328082  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  27328083 ta 27328084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 27388523 - 27388824
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27388523 aggatcagagggaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagt 27388622  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27388623 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagac 27388722  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27388723 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttgtgtgctattga 27388822  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  27388823 ta 27388824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 27430021 - 27430311
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27430021 gaacccagaacaacattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 27430120  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430121 ttgtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 27430220  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27430221 atattgatattaattgagcaagaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagatttgataataatgcaatttatgtgctattgata 27430311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Original strand, 18194251 - 18194516
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18194251 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagt 18194350  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18194351 tgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 18194450  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatga 271  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18194451 ttttttaggttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatga 18194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30694742 - 30694441
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  30694742 aggatcagagggaacccaaaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagt 30694643  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30694642 tgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagggtgaacccctaactagtaataagatctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 30694543  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30694542 ttgtttaagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattga 30694443  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  30694442 ta 30694441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20802124 - 20801835
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20802124 gaacccagaacaacattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 20802025  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20802024 t-gtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgttcaagtt 20801926  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20801925 atattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgccattgata 20801835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26130848 - 26130546
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    |||| |||||||    
T  26130848 aggatcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactttcgtctcgcgagctagcccaggatgtagt 26130749  T
Q  106 t-gcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26130748 ttgtttgagtgtttgtacgatctgtgtcgcacgtgtggatcaagagcgaacccctaattggcattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaga 26130649  T
Q  205 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26130648 gttgtttaagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattg 26130549  T
Q  304 ata 306  Q
    |||    
T  26130548 ata 26130546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 28258192 - 28258481
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28258192 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 28258291  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258292 t-gtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 28258390  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa-ggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |  |  ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28258391 acataaatattaattgagcaagaactattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgata 28258481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 28264816 - 28265105
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28264816 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 28264915  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264916 t-gtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 28265014  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa-ggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |  |  ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28265015 acataaatattaattgagcaagaactattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgata 28265105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 28336941 - 28337230
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28336941 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 28337040  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337041 t-gtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 28337139  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa-ggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |  |  ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28337140 acataaatattaattgagcaagaactattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgata 28337230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 28343565 - 28343854
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28343565 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 28343664  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28343665 t-gtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 28343763  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa-ggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |  |  ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28343764 acataaatattaattgagcaagaactattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgata 28343854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28287707 - 28287435
Alignment:
Q  34 agtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcg 133  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28287707 agttggggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt-gtgcgatctgtgtcg 28287609  T
Q  134 caggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattga 233  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  28287608 catgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttacataaatattaattga 28287509  T
Q  234 acatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa-ggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
     || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28287508 gcaagaactattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgata 28287435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 1538682 - 1538971
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1538682 gaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgt 1538781  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  1538782 ttgtgcgatcggtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 1538881  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  1538882 atgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 1538971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 1544781 - 1545070
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1544781 gaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgt 1544880  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  1544881 ttgtgcgatcggtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 1544980  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  1544981 atgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 1545070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 2869862 - 2870163
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  2869862 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaact 2869961  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  2869962 tgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagag 2870061  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2870062 ttgtttaagtcatgataatattaattgaacatgagctaatgtaatgtacatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctattga 2870161  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  2870162 ta 2870163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 2876477 - 2876778
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  2876477 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaact 2876576  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  2876577 tgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagag 2876676  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2876677 ttgtttaagtcatgataatattaattgaacatgagctaatgtaatgtacatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctattga 2876776  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  2876777 ta 2876778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 4233225 - 4233526
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  4233225 aggatcagagggaacccagaacaaccttattttgggagttgagtggtactcgtcatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaact 4233324  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  4233325 tgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagag 4233424  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  4233425 ttgtttaagtcatgataatattaattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctagtga 4233524  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  4233525 ta 4233526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6981038 - 6980744
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  6981038 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 6980939  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6980938 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcgagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagag 6980839  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  6980838 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 6980744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 20649520 - 20649814
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  20649520 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaatt 20649619  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20649620 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 20649719  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  20649720 ttgtctaagttatattaatattaattgaatatgaactattgcattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 20649814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30597586 - 30597330
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||  ||||    
T  30597586 gaacccagaacaaccttggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaatatggaattgtttatgtgt 30597487  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30597486 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagtt 30597387  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    || || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30597386 atattaatattaattgaatatgaactgttgtattgtatattcatgcaagataagaag 30597330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17031240 - 17031017
Alignment:
Q  16 agaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17031240 agaacccaaaacaacattagtttgggaattgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaacagaatgtagttgcttgagtg 17031141  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||     
T  17031140 tttgtgcgatctgtgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagcattttaagc 17031041  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||    
T  17031040 tatgttgttatgaattgagcatga 17031017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20061029 - 20060728
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  20061029 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccaaggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 20060930  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  20060929 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagag 20060830  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20060829 ttgtttaagttatattaatattaattggataagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 20060730  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  20060729 ta 20060728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12763081 - 12762819
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | |    
T  12763081 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagaggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccaggatgaact 12762982  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||  ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12762981 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctagctggtaatgagacctggtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 12762882  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagata 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12762881 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagata 12762819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 14059343 - 14059644
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  14059343 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgagat 14059442  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||| | | ||| ||||| ||    
T  14059443 tgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaaccgctaactggtattgagacctagtgatgttgttaagtacagtctgtatag 14059542  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||| ||   || | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14059543 ttgtttgagccctgataatattaattgaacatgagctaatgtaatgaatatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctattga 14059642  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  14059643 ta 14059644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16372227 - 16371996
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  16372227 gaacccagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 16372128  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  16372127 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 16372028  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgta 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16372027 atgttgatattaattgagcatgaattaatgta 16371996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25111207 - 25110919
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||||||    
T  25111207 acccagaacaactttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgttt 25111108  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  25111107 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 25111008  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  25111007 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtacaattatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgttgtgctaatgata 25110919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25117810 - 25117522
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||||||    
T  25117810 acccagaacaactttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgttt 25117711  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  25117710 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 25117611  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  25117610 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtacaattatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgttgtgctaatgata 25117522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8797559 - 8797276
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||| | ||    
T  8797559 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgcgt 8797460  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||   | | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8797459 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacctctaattggtaatgagacctagaaacgtcgttaaatgcagactgtagagttgtttaagtt 8797360  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    || || |||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||    
T  8797359 atattaatatcaatggaatatgaactattatattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatgcaaattatgtgct 8797276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Original strand, 17037073 - 17037247
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgta-gttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  17037073 gaacccagaacaacattagtttgggaattaagtggtacttgccatgacgagtgagaactctcgcctcgcgagcacatccagaatgtaggttgtttgagtg 17037172  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaa 191  Q
     ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17037173 -ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatgacgtttaa 17037247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 34369711 - 34369933
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  34369711 gaacccagaacaacattagtttgtaatttgacttgtactcgccatggcgagtatgtactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 34369810  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  34369811 ttgtgcgatctgtgtcacacgttttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 34369910  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  34369911 atgttgatattaattgagcatga 34369933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8229267 - 8229035
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  8229267 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggttctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 8229168  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  8229167 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 8229068  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  8229067 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 8229035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18931456 - 18931224
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  18931456 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 18931357  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  18931356 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 18931257  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18931256 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 18931224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 29593547 - 29593779
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  29593547 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 29593646  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  29593647 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 29593746  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  29593747 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 29593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34833021 - 34832769
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||| ||    
T  34833021 acccagaacaactttagtttgggaattgtgtggtactcgctatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgctt 34832922  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||| ||| | || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||    
T  34832921 gtgcgatctgtttcgtacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaaaatat 34832822  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  34832821 gttgatattaattgagcatg-attaatgtattgtacaattatgtaagatatgaa 34832769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 32564980 - 32565201
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  32564980 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 32565079  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  32565080 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 32565178  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  32565179 atgttgatattaattgagcatga 32565201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 29587406 - 29587638
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  29587406 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 29587505  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  29587506 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattcgtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 29587605  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  29587606 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 29587638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 17016660 - 17016881
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  17016660 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 17016759  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  17016760 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 17016858  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  17016859 atgttgatattaattgagcatga 17016881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22331808 - 22331630
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  22331808 gaacctagaacaacgttagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgt 22331709  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgca 195  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  22331708 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgca 22331630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 30637857 - 30638088
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  30637857 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 30637955  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||||||||||  | |||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  30637956 tgagtatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggcccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 30638055  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     | ||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  30638056 ct-tttgagttaagttgatattatttgagcatga 30638088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25928629 - 25928411
Alignment:
Q  53 actcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcg 152  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| |  |||   ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| |    
T  25928629 actcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgcattgagtgattgtgcgatatgtgtcgcacgttttgatcaagagtg 25928530  T
Q  153 aacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgt 252  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  25928529 aaaccctaaatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagatatgttgatattaattgagcatgaattaatgtattat 25928430  T
Q  253 atattcatgtaagatatgaa 272  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  25928429 acatt-atgtaagatatgaa 25928411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 16551758 - 16551979
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || ||||     
T  16551758 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtgg 16551857  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  16551858 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 16551956  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16551957 atgttgatattaattgagcatga 16551979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16577195 - 16576974
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || ||||     
T  16577195 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtgg 16577096  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  16577095 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 16576997  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16576996 atgttgatattaattgagcatga 16576974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 16618185 - 16618406
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || ||||     
T  16618185 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtgg 16618284  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  16618285 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 16618383  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16618384 atgttgatattaattgagcatga 16618406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 16628314 - 16628535
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || ||||     
T  16628314 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtgg 16628413  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  16628414 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 16628512  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16628513 atgttgatattaattgagcatga 16628535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19808895 - 19808673
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  19808895 gaacctagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcacgagcacttccagattggagtgtcttgagtgt 19808796  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||  ||||| ||  ||||||| |    
T  19808795 ttgtgcgatctgtgtcgcactttttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaacgcaatctgtaaagccgtttaagat 19808696  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  19808695 atgtcaatattaattgagcatga 19808673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 3708222 - 3708509
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||   ||||  |   ||  || ||||||||    
T  3708222 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgtgagcaactccaggttagtgtgcctagagtgttt 3708321  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  3708322 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttactgcagtctgtaaagctgtttaagatat 3708421  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||| |||||  || | ||||||||||||||    
T  3708422 gttgatattaattgagtatg-attaatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatataactgatgtgctattgata 3708509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22759188 - 22758972
Alignment:
Q  49 tggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaag 148  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    |||   ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  22759188 tggtacttgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagataagagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtatcgcacgt-ttgatcaag 22759090  T
Q  149 agcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgta 248  Q
    || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  22759089 agtgaaaccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagatatgttgatattaattaagcatgaactgatgta 22758990  T
Q  249 ttgtatattcatgtaagat 267  Q
    || || ||| |||||||||    
T  22758989 ttatacatt-atgtaagat 22758972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28314940 - 28314761
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| |||    
T  28314940 gaacccagaacaacattagtt-gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtg 28314842  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |||||||||||||    
T  28314841 tttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccctaagataacgtttaatgcag 28314761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 24314819 - 24315105
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||   ||||||||||    
T  24314819 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcaccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttttgagtgttt 24314918  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||    
T  24314919 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctata-agttgtttaagatat 24315017  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  24315018 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagaaatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 24315105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 31316832 - 31317117
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||   ||||||||||    
T  31316832 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttttgagtgttt 31316931  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||||| |||    
T  31316932 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataat-agacctaatgatgacgttaaatgcagtctata-agctgtttaagatat 31317029  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  31317030 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 31317117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27186078 - 27185899
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| |||    
T  27186078 gaacccagaacaacattagtt-gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtg 27185980  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| | | |||| ||||||||    
T  27185979 tttgcgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaacctaaaggtaacgtctaatgcag 27185899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27207914 - 27207735
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| |||    
T  27207914 gaacccagaacaacattagtt-gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtg 27207816  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| | | |||| ||||||||    
T  27207815 tttgcgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaacctaaaggtaacgtctaatgcag 27207735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Original strand, 27241314 - 27241493
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| |||    
T  27241314 gaacccagaacaacattag-ttgggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtg 27241412  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| | | |||| ||||||||    
T  27241413 tttgcgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaacctaaaggtaacgtctaatgcag 27241493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Original strand, 27263162 - 27263341
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| |||    
T  27263162 gaacccagaacaacattag-ttgggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtg 27263260  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| | | |||| ||||||||    
T  27263261 tttgcgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaacctaaaggtaacgtctaatgcag 27263341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 25595092 - 25595342
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||    |||||| ||    
T  25595092 acccagaacaactttagtttgggaattgttgggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgctt 25595191  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaa---cccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||   |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||   || || ||  ||||||      
T  25595192 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaaccccccctaa--ggtaatgagacctaatgatgacgtttattgcgatctataaagccgtttaata 25595289  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  25595290 tatgttgatattaattgagtatgatttaatgtattaaatatt-atgtaagatat 25595342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14098993 - 14098780
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||  |   ||  ||||||||||     
T  14098993 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgagcaattccaggttagtgtgccttgagtgtt- 14098895  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaat-tggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||   | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  14098894 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccccttatggtaatgaaacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgtttcagata 14098795  T
Q  218 tgttgatattaattg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  14098794 tgttgatattaattg 14098780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 272
Target Start/End: Original strand, 34298395 - 34298615
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt-gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaaga 149  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||  ||||  || ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||    
T  34298395 gtactcgccatggcgagtagataatctcgcctcgcaagcacttccagtttggagt-gcttagagtgtttgtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaaga 34298493  T
Q  150 gcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtat 249  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||    
T  34298494 gtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagatatgttgctattaattgagtatgagttaatgtat 34298593  T
Q  250 tgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    | |  ||| ||||||||||||||    
T  34298594 tatgcatt-atgtaagatatgaa 34298615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4168291 - 4168078
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||   ||||  |   ||  ||||||||||     
T  4168291 acccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccatggcgattaaggattctcgcctcgcgagcaattccaggttagtgtgccttgagtgtt- 4168193  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  || |||    
T  4168192 gtgcgatctgtgtcgcacgtttcgatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgttccagatat 4168093  T
Q  219 gttgatattaattga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  4168092 gttgatattaattga 4168078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4208971 - 4208758
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||   ||||  |   ||  ||||||||||     
T  4208971 acccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccatggcgattaaggattctcgcctcgcgagcaattccaggttagtgtgccttgagtgtt- 4208873  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  || |||    
T  4208872 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgttccagatat 4208773  T
Q  219 gttgatattaattga 233  Q
    |||||||||||||||    
T  4208772 gttgatattaattga 4208758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Original strand, 24290881 - 24291077
Alignment:
Q  109 ttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| || || || ||    
T  24290881 ttgagtgtttgtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctata-agctg 24290979  T
Q  209 tttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  24290980 tttaagatatgttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagaaatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 24291077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 271
Target Start/End: Original strand, 18917552 - 18917654
Alignment:
Q  167 attgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaaga 266  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | ||| ||||||||    
T  18917552 attgagacc-aatgataacgtttaatgcagactgtaaagttgtttaagatatgttgatattaattgagcatgagttaatgtattacacatt-atgtaaga 18917649  T
Q  267 tatga 271  Q
    |||||    
T  18917650 tatga 18917654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 135
Target Start/End: Original strand, 23277050 - 23277134
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgca 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||    |||||| |||||||||||||||||||    
T  23277050 gtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatctgtgtcgca 23277134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1645039 - 1644990
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1645039 gtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaat 1644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23171417 - 23171116
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23171417 aggatcagagggaacccagaacaacactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 23171318  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23171317 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 23171218  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23171217 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattga 23171118  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  23171117 ta 23171116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23582674 - 23582373
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23582674 aggatcagagggaacccagaacaacactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 23582575  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23582574 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 23582475  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23582474 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattga 23582375  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  23582374 ta 23582373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29233908 - 29233607
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29233908 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagt 29233809  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29233808 tgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 29233709  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29233708 ttggttaagttatgttgatattaattgaacatgaactagtgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 29233609  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  29233608 ta 29233607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29347207 - 29346906
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29347207 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagt 29347108  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29347107 tgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 29347008  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29347007 ttggttaagttatgttgatattaattgaacatgaactagtgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 29346908  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  29346907 ta 29346906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27599638 - 27599342
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  27599638 cagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctt 27599539  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27599538 gtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtt 27599439  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599438 taagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 27599342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 24913691 - 24913992
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24913691 aggatcagagggaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgaagt 24913790  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  24913791 tgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagag 24913890  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  24913891 ttgtttaagatatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttgattatgatgcaattgatgtgctattga 24913990  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  24913991 ta 24913992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1843457 - 1843161
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1843457 cagagggaacctagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcttcgcgagcacaaccaggatgcagttgctt 1843358  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1843357 gtgtgttggtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgataacgtttaatgcagtctgtagagttgtt 1843258  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1843257 taagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 1843161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16997429 - 16997128
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16997429 aggaccagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 16997330  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16997329 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 16997230  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16997229 ttgtctaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattga 16997130  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  16997129 ta 16997128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17004062 - 17003761
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17004062 aggaccagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 17003963  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17003962 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 17003863  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17003862 ttgtctaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattga 17003763  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  17003762 ta 17003761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16928730 - 16928434
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  16928730 cagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcct 16928631  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16928630 gagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtc 16928531  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16928530 taggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgata 16928434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10866740 - 10866449
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10866740 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgt 10866641  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  10866640 ttgcgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgcttaagac 10866541  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10866540 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 10866449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10873907 - 10873616
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10873907 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgt 10873808  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  10873807 ttgcgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgcttaagac 10873708  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10873707 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 10873616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27617675 - 27617381
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27617675 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagt 27617576  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27617575 ttcctgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 27617476  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  27617475 ttgtttaagttatattaataataattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 27617381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 22320713 - 22321007
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22320713 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 22320812  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22320813 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 22320912  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  22320913 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 22321007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 22326866 - 22327160
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22326866 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 22326965  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22326966 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 22327065  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  22327066 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 22327160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 26877295 - 26877589
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  26877295 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 26877394  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26877395 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 26877494  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  26877495 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 26877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12829438 - 12829168
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12829438 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 12829339  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  12829338 ttgtgcgatctgtgtcgcacatgttgatcaagagtgaacccctaattggtaattaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 12829240  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaa 289  Q
    ||||||   |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12829239 atgttgtcgttaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaa 12829168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37318641 - 37318354
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||  |||||||||||    
T  37318641 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagcttggagtgtcttgagtgttt 37318542  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  37318541 gtgcgatctgtgtcgcatgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 37318442  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37318441 gttgatattaattgagtatg-attaatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatacaattgatgtgctattgata 37318354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 21139043 - 21139258
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21139043 gtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagag 21139142  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  21139143 tgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacatttaatgcaatctgtaaagtcgtttaagatatgttgatactaattgagcatgaattaatgtatt 21139242  T
Q  251 gtatattcatgtaagat 267  Q
     || ||| |||||||||    
T  21139243 atacatt-atgtaagat 21139258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 24640730 - 24640931
Alignment:
Q  49 tggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaag 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  24640730 tggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacctccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaag 24640829  T
Q  149 agcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgta 248  Q
    || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24640830 agtgaacccctagttggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagatatgttgatattaattgagcatgaattaatgta 24640929  T
Q  249 tt 250  Q
    ||    
T  24640930 tt 24640931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 21147061 - 21147276
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  21147061 gtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacattttgatcaagag 21147160  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  21147161 tgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagatatgttgatactaattgagcatgaattaatgtatt 21147260  T
Q  251 gtatattcatgtaagat 267  Q
     || ||| |||||||||    
T  21147261 atacatt-atgtaagat 21147276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 13306316 - 13306548
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  13306316 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 13306415  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  13306416 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 13306515  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  13306516 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 13306548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16986323 - 16986091
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  16986323 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 16986224  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16986223 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 16986124  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16986123 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 16986091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27216445 - 27216213
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  27216445 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 27216346  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  27216345 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 27216246  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27216245 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 27216213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 28431639 - 28431871
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  28431639 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 28431738  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  28431739 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 28431838  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  28431839 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 28431871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16922906 - 16922679
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||    
T  16922906 cagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgatt 16922807  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
      |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  |    
T  16922806 atgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-at 16922708  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
    | ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16922707 tgagttaagttgatattatttgagcatga 16922679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27197253 - 27197031
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  27197253 gaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgt 27197154  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||  ||||||  |    
T  27197153 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaaaat 27197054  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  27197053 atgtcgatattaattgagcatga 27197031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 19489651 - 19489883
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  19489651 aggatcagagggaacccataacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 19489750  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  19489751 tgtttatgtgtttttgcgatccgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgttcaatgcagtctgtaaag 19489850  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  19489851 ct-attgagttatgttgatattatttgagcatga 19489883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9340662 - 9340430
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  9340662 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 9340563  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  9340562 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 9340463  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9340462 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 9340430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9489296 - 9489064
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  9489296 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 9489197  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  9489196 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 9489097  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9489096 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 9489064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9608557 - 9608325
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  9608557 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 9608458  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  9608457 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 9608358  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9608357 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 9608325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 41604471 - 41604758
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |   ||    |||||||||    
T  41604471 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgtgtgttatgagtgttt 41604570  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  41604571 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 41604670  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  41604671 gttgatattgattgagtatg-attaatgtattgtacatttatgtaagatatggaagtttaattatgatataattgatgtgctattgata 41604758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 41610368 - 41610655
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |   ||    |||||||||    
T  41610368 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgtgtgttatgagtgttt 41610467  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  41610468 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 41610567  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  41610568 gttgatattgattgagtatg-attaatgtattgtacatttatgtaagatatggaagtttaattatgatataattgatgtgctattgata 41610655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 44380931 - 44381151
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  44380931 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctg-ttgagtgg 44381029  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  44381030 ttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 44381128  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44381129 atgttgatattaattgagcatga 44381151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 30970718 - 30970950
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  30970718 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 30970817  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  30970818 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 30970916  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  30970917 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 30970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27369670 - 27369449
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||| |||| || |||||||     
T  27369670 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgagtgg 27369571  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  27369570 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 27369472  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27369471 atgttgatattaattgagcatga 27369449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 44387601 - 44387821
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  44387601 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctg-ttgagtgg 44387699  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  44387700 ttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 44387798  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44387799 atgttgatattaattgagcatga 44387821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 24872146 - 24872378
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |  |||  ||||||||||    
T  24872146 aacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcatttccagctttgagtgtcttgagtgtt 24872245  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||| ||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  24872246 tgtgcgatctatgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 24872344  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  24872345 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 24872378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 24880031 - 24880263
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |  |||  ||||||||||    
T  24880031 aacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcatttccagctttgagtgtcttgagtgtt 24880130  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  24880131 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaattgagacc-aatgattacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 24880229  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  24880230 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 24880263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 13970109 - 13970395
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  13970109 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgttt 13970208  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  13970209 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 13970307  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  13970308 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 13970395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27376180 - 27375965
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||| |||| || |||||||     
T  27376180 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgagtgg 27376081  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  27376080 ttgtgagatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 27375982  T
Q  217 atgttgatattaattga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  27375981 atgttgatattaattga 27375965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24715078 - 24714792
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||  |  ||     |||||||||    
T  24715078 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctgcagccttgagcgttatgagtgttt 24714979  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||    
T  24714978 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtag-gctgtttaagatat 24714880  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  24714879 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 24714792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 45057165 - 45057451
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  ||     |||||||||    
T  45057165 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagcgttatgagtgttt 45057264  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  45057265 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgatgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 45057363  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  45057364 gttgatattgattgagtatgat-taaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 45057451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24503478 - 24503224
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||   || | || |||   ||||||||    
T  24503478 gaacctagaacaacattagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactttcatattggagtgctttgagtgt 24503379  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  24503378 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaggagcgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 24503279  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| |||||||| |  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  24503278 atgttgttattaattaagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 24503224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 19645716 - 19645994
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  19645716 aacccagaacagtattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgccttgagtgtt 19645815  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||           |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||    
T  19645816 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaatga-----------gacgtttaatgcagtctgcaaagctgtttaagata 19645904  T
Q  218 tgttgata-ttaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||| | |||||||| |||| | |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19645905 tgttgaaatttaattgagcatg-attaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaattatgatgcaattgatgtgctattgata 19645994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 10101383 - 10101466
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10101383 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 10101466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11677672 - 11677569
Alignment:
Q  163 tggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgt 262  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||   |||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||    
T  11677672 tggtaatgagacctaaagatgacgtttaatgcaatatgtaaagccatttaagatataatgatattaattgagcatgaattaatgtattataca-tcatgt 11677574  T
Q  263 aagat 267  Q
    |||||    
T  11677573 aagat 11677569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 41294172 - 41294462
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41294172 gaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacttgaatgtagttgcttgagtgt 41294271  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41294272 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagtt 41294371  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41294372 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattgata 41294462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 37286518 - 37286808
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37286518 gaacctagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 37286617  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37286618 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggcctaatgatgacgtttaatgcagtctgtatagttgtttaagtt 37286717  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37286718 atgttgatattaattggacatgaactaatgtattatatattcatgcaagatatgaaagtttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 37286808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 37293221 - 37293511
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37293221 gaacctagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 37293320  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37293321 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggcctaatgatgacgtttaatgcagtctgtatagttgtttaagtt 37293420  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293421 atgttgatattaattggacatgaactaatgtattatatattcatgcaagatatgaaagtttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 37293511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 1692163 - 1692433
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1692163 aggatcagagagaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 1692262  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1692263 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 1692362  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1692363 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggtt 1692433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 15001405 - 15001706
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  15001405 aggatcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaact 15001504  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15001505 tgcttgagtatttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 15001604  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15001605 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatggaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattga 15001704  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  15001705 ta 15001706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 27687055 - 27687325
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27687055 aggatcagagagaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 27687154  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27687155 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 27687254  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27687255 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggtt 27687325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 18038394 - 18038664
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18038394 aggatcagagggaacccaaaacaactttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 18038493  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18038494 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 18038593  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18038594 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtt 18038664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 14994762 - 14995063
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  14994762 aggatcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaact 14994861  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14994862 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcccacgtgttgatcaaaagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 14994961  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14994962 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatctattgtatattcatgcaagatatggaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattga 14995061  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  14995062 ta 14995063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19992262 - 19991961
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  19992262 aggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagt 19992163  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19992162 tgcttgtgtgttggtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 19992063  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19992062 ttgtttaagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatatgctattga 19991963  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  19991962 ta 19991961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40707500 - 40707200
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40707500 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 40707401  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40707400 tcct-gagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 40707302  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40707301 ttgtttaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 40707202  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  40707201 ta 40707200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40714142 - 40713842
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40714142 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 40714043  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40714042 tcct-gagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 40713944  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40713943 ttgtttaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 40713844  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  40713843 ta 40713842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 22062608 - 22062909
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22062608 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 22062707  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22062708 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 22062807  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22062808 ttgtttaagttatattgatattaattgaatatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 22062907  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  22062908 ta 22062909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37544410 - 37544118
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagt-tgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37544410 gaacccagaacaacatcagtttgggagaatcagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg 37544311  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag- 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37544310 tttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaaga 37544211  T
Q  215 ttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
     ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37544210 ctatattgatattaattgagtatgatctaatgtattgtatattcatgcaagatacgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 37544118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33726227 - 33725937
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  33726227 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 33726128  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33726127 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaagcggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 33726028  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33726027 atgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgata 33725937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 22327890 - 22328190
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  22327890 aggatcagagggaacctagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgcagt 22327989  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22327990 tgctggtgtgtttgtgcgatctgagtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactactaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 22328089  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22328090 ttgtttaagttatgttgata-caattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattga 22328188  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  22328189 ta 22328190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27517118 - 27516830
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||     
T  27517118 aacccagaacaagcttagtt-gggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtc 27517020  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27517019 tgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggtta 27516920  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27516919 tattgatattaattgaatatgagttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 27516830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27523755 - 27523467
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||     
T  27523755 aacccagaacaagcttagtt-gggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtc 27523657  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27523656 tgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggtta 27523557  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27523556 tattgatattaattgaatatgagttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 27523467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22133366 - 22133077
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133366 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 22133267  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  22133266 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 22133167  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  22133166 atgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 22133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22140058 - 22139769
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22140058 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 22139959  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  22139958 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 22139859  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    | ||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  22139858 acgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 22139769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 17706657 - 17706951
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  17706657 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaact 17706756  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17706757 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 17706856  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  17706857 ttgtttgagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 17706951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23610269 - 23610014
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||    
T  23610269 aacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtt 23610170  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23610169 tgtgcgatctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagtta 23610070  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    | || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23610069 tattaatattaattgaatatgaactgttgtattgtatattcatgcaagataagaag 23610014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23841665 - 23841410
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||    
T  23841665 aacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtt 23841566  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23841565 tgtgcgatctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagtta 23841466  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    | || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23841465 tattaatattaattgaatatgaactgttgtattgtatattcatgcaagataagaag 23841410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 27670156 - 27670423
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  27670156 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 27670255  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27670256 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 27670355  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27670356 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaag 27670423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Original strand, 34294290 - 34294573
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||    
T  34294290 gaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgt 34294389  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    || ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34294390 ttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagtt 34294489  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  34294490 atattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 34294573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 41097949 - 41098216
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  41097949 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 41098048  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41098049 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 41098148  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41098149 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaag 41098216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22265324 - 22265030
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22265324 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 22265225  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22265224 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 22265125  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  22265124 ttgtttaagttatattagtattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 22265030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 24471974 - 24472268
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  24471974 aggatcagagggaacctagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 24472073  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24472074 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 24472173  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  24472174 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 24472268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25406793 - 25406504
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406793 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 25406694  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag-ttgtttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||  ||||| ||  | ||||||     
T  25406693 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacttaatgatgacgtttaattcaatctgtaaagcctttttaaga 25406594  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
     ||||||   |||||||| |||| | |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  25406593 catgttgtcgttaattgagcatg-attaatgtattgtgcaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 25406504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 27663516 - 27663810
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  27663516 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 27663615  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  27663616 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcatttaatgcagactgtagag 27663715  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  27663716 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 27663810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27609118 - 27608817
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  27609118 aggatcagagggaacccagaacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 27609019  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  27609018 tgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagag 27608919  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27608918 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 27608819  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  27608818 ta 27608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41769621 - 41769359
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  41769621 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 41769522  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41769521 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 41769422  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagata 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41769421 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagata 41769359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27615724 - 27615423
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| | |    
T  27615724 aggatcagagggaacccagaacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtaaaaccaggatgaact 27615625  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  27615624 tgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagag 27615525  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27615524 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 27615425  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  27615424 ta 27615423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22588462 - 22588178
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588462 gaactcagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccaaggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 22588363  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  22588362 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 22588264  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattg 303  Q
    ||||||   |||||||| |||| | | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  22588263 atgttgtcgttaattgagcatg-attcatgtattgtacaatcatgtaggatatgaaggttaattatgatgcaaatgatttgctattg 22588178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41776195 - 41775933
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  41776195 aggatcagagggaacctagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 41776096  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41776095 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 41775996  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagata 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41775995 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagata 41775933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Original strand, 29477692 - 29477962
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  29477692 gaacccataacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgt 29477791  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  29477792 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 29477890  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaa 289  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29477891 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaa 29477962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Original strand, 29471097 - 29471367
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  29471097 gaacccataacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgt 29471196  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  29471197 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 29471295  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaa 289  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29471296 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaa 29471367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17284434 - 17284147
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17284434 gaacccagaacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccataatttagatgcttgagtgt 17284335  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||   ||||||      
T  17284334 ttgtgcgatctgtgtcccacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcgatctgtaaag-cctttaagac 17284236  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||||| ||||   |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  17284235 atgttgtcgttaattgagcatg-gttaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 17284147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23584519 - 23584217
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | |    
T  23584519 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaacgaaat 23584420  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||  |||||| ||||||||    
T  23584419 tgtttttgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgatcccctaactggtaatgagacctagtgatgtggttagatgcagtctgtagag 23584320  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaa-gatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattg 303  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| || | |||||||  ||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  23584319 ttgtttaagtcatgataatattaattgaacatgagctaatgtaatgtataattatgcaaggttatgaagatttgtttatgatacaatttatgtgctattg 23584220  T
Q  304 ata 306  Q
    |||    
T  23584219 ata 23584217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25107163 - 25106931
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  25107163 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 25107064  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  25107063 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 25106964  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  25106963 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 25106931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25166256 - 25166024
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  25166256 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 25166157  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  25166156 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 25166057  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  25166056 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 25166024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 15441692 - 15441946
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| |  |||   ||||||||    
T  15441692 gaacccataacaacattagttggggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgcattgagtgt 15441791  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  15441792 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagccgtttaagat 15441891  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  15441892 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 15441946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 21667544 - 21667765
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  21667544 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtga 21667643  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  21667644 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 21667742  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  21667743 atgttgatattaattgagcatga 21667765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29316786 - 29316565
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  29316786 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 29316687  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  29316686 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 29316588  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  29316587 atgttgatattaattgagcatga 29316565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23250306 - 23250016
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    ||||||||     
T  23250306 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttc 23250207  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  23250206 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtttgtagagtagtttaagtcat 23250107  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattg--tatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23250106 gatgatattgattgaacatgagctaatgtaatgtatatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgata 23250016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 22410336 - 22410558
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||     
T  22410336 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgagtgg 22410435  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |     ||||| |    
T  22410436 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccgtaattggtaatgagaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaaagctattaagat 22410535  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22410536 atgttgatattaattgagcatga 22410558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16355224 - 16354992
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  16355224 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 16355125  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16355124 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 16355025  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16355024 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 16354992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16361883 - 16361651
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  16361883 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 16361784  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16361783 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 16361684  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16361683 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 16361651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 23337026 - 23337259
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || | |  || ||||||    
T  23337026 gaacccataacaactttagtttggaaattgaatggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggattgcctggagtgt 23337125  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||      
T  23337126 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagac 23337225  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  23337226 atgttgatattaattgagcatgaattaacgtatt 23337259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34565217 - 34564985
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  34565217 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 34565118  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  34565117 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 34565018  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  34565017 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 34564985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34571872 - 34571640
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  34571872 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 34571773  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  34571772 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 34571673  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  34571672 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 34571640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 21295001 - 21295255
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  21295001 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 21295100  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  21295101 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 21295200  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  21295201 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 21295255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25535356 - 25535102
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  25535356 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 25535257  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  25535256 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 25535157  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  25535156 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 25535102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 14359557 - 14359778
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  14359557 gaacctagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgt 14359656  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||   |||| ||  ||||||| |    
T  14359657 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctatttggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgcaatatgta-agccgtttaagat 14359755  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  14359756 atgtcgatattaattgagcatga 14359778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Original strand, 22341476 - 22341629
Alignment:
Q  153 aacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgt 252  Q
    ||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22341476 aacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtatgtagagttgtttaagttatgttgata-caattggacatgaactaatgtattgt 22341574  T
Q  253 atattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341575 atattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 22341629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20776256 - 20776077
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |  ||| |||    
T  20776256 gaacccagaacaacatcagtt-gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgtgtg 20776158  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  20776157 tttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgcaacctaatgataacgtttaatgcag 20776077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 22334544 - 22334695
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  22334544 aggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactatcgcctcgcgagcacagccaggatgcagt 22334643  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaaccc 157  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||    
T  22334644 tgctggtgtgtttgtgcgatctgagtcgcacgtgttgatctagagtgaaccc 22334695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 22258211 - 22258431
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  22258211 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctg-ttgagtgg 22258309  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||  |    
T  22258310 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaatccctaactggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaaaat 22258408  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22258409 atgttgatattaattgagcatga 22258431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 22325664 - 22325897
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  |||||||||    
T  22325664 gaacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgt 22325763  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaa-cccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  22325764 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaaga 22325862  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  22325863 tatgttgatgttaattgagcatgagttaatgtatt 22325897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22343864 - 22343632
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||  | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  22343864 aacccaaaacaacattagtttggaacttgtcttgaactcgccatggcgagtaagaattctcgcatcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 22343765  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  22343764 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 22343666  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22343665 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 22343632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19768714 - 19768428
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  ||     |||||||||    
T  19768714 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagcgttatgagtgttt 19768615  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  19768614 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 19768516  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  19768515 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 19768428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19775310 - 19775024
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  ||     |||||||||    
T  19775310 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagcgttatgagtgttt 19775211  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  19775210 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 19775112  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  19775111 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 19775024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24554901 - 24554648
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  24554901 gaacctagaacaacattagttgggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 24554802  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  24554801 ttgtgcgatctgtgtcgcacgt-ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 24554703  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| |||||| |||  ||||  ||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  24554702 atgttgttattaaatgagtatgagttaatgtattatacatt-aagtaagatatgaa 24554648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 25808226 - 25808440
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  25808226 acccagaacaacttttgtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgttt 25808325  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  25808326 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaagtgcagtctgtaaagctgtttaagatat 25808425  T
Q  219 gttgatattaattga 233  Q
    ||||||||| |||||    
T  25808426 gttgatattgattga 25808440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24020559 - 24020361
Alignment:
Q  108 cttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagtt 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24020559 cttgagcgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgttaatgagacctaatgatgacgtttaatgctgcctgtaaagtt 24020460  T
Q  208 gtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |  | | |||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24020459 gtttaagatatgttggtattaattgaatatg-attaatgtattttgcaattatgtaagatatgaaagtttaactatgatacaattgatgtgctattgata 24020361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 15236518 - 15236601
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15236518 gaacccagaacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 15236601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22353174 - 22353032
Alignment:
Q  108 cttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  22353174 cttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagc 22353076  T
Q  207 tgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22353075 tgtttaagatatgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 22353032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 14655143 - 14655444
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  14655143 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcatagccaggatgtagt 14655242  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14655243 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 14655342  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14655343 ttgtttaagttatattgatattaattgaatatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 14655442  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  14655443 ta 14655444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18183155 - 18182855
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18183155 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagt 18183056  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18183055 tgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 18182956  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18182955 ttgtttaagttatgttgatattaattgaatatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaa-ttatgtgctattga 18182857  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  18182856 ta 18182855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18176483 - 18176183
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18176483 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagt 18176384  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18176383 tgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 18176284  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  18176283 ttgtttaagttatgttgatattaattgaatatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaa-ttatgtgcaattga 18176185  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  18176184 ta 18176183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 15155896 - 15156166
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15155896 aggatcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 15155995  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15155996 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccgtagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 15156095  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15156096 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtt 15156166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 15162547 - 15162817
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15162547 aggatcagagggaacccaggacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 15162646  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15162647 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 15162746  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15162747 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtt 15162817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13684841 - 13684571
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13684841 aggatcagagggaacccataacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 13684742  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13684741 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 13684642  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13684641 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggtt 13684571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 16407021 - 16407291
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16407021 aggatcagagggaacccagaacaacgttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 16407120  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16407121 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgttgacgtttaatgcagtctgtagag 16407220  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16407221 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatacgaaggtt 16407291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 44786201 - 44786502
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44786201 aggaccagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 44786300  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44786301 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 44786400  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44786401 ttgtctaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattga 44786500  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  44786501 ta 44786502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 44792842 - 44793143
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44792842 aggaccagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 44792941  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44792942 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 44793041  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44793042 ttgtctaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattga 44793141  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  44793142 ta 44793143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11366574 - 11366278
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  11366574 cagagggaacccagaacaagtttatgttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgaagttgttt 11366475  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
      |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  11366474 atgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttggc 11366375  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366374 taagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtattctcatgcaagatacgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 11366278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49051732 - 49051455
Alignment:
Q  23 agaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgc 122  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49051732 agaaaaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgc 49051633  T
Q  123 gatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttg 222  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  49051632 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatatta 49051533  T
Q  223 atattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  49051532 ataataattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 49051455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 18164400 - 18164694
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  18164400 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 18164499  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18164500 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 18164599  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  18164600 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 18164694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13691456 - 13691249
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13691456 aggatcagagggaacccataacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 13691357  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13691356 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 13691257  T
Q  206 ttgtttaa 213  Q
    ||||||||    
T  13691256 ttgtttaa 13691249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 9510739 - 9511033
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||   |    
T  9510739 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgagct 9510838  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9510839 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 9510938  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  9510939 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 9511033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 40523088 - 40523382
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  40523088 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 40523187  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40523188 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 40523287  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  40523288 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 40523382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14337749 - 14337448
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  14337749 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 14337650  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| | ||||||    
T  14337649 tgtttgtgtgtttgtgcgatcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagag 14337550  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14337549 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 14337450  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  14337449 ta 14337448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 20702729 - 20703016
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20702729 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 20702828  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  20702829 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 20702927  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  20702928 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 20703016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 60403 - 60704
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  60403 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 60502  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  60503 tgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagcgatgttgtttaatgcagactgtagag 60602  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60603 ttgtttaagttatattaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 60702  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  60703 ta 60704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14331165 - 14330864
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  14331165 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaact 14331066  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| | ||||||    
T  14331065 tgtttgtgtgtttgtgcgatcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagag 14330966  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14330965 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 14330866  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  14330865 ta 14330864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32768042 - 32767755
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32768042 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 32767943  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   | ||||      
T  32767942 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctctaagac 32767844  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  32767843 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 32767755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18531612 - 18531363
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  18531612 gaacccagaacaacattagtttgaaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 18531513  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  18531512 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcatgagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagttgtttaagat 18531413  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagat 267  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  18531412 acgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagat 18531363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Original strand, 12703184 - 12703430
Alignment:
Q  54 ctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcga 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   ||| ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  12703184 ctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggaagagcttgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtga 12703283  T
Q  154 acccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgta 253  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12703284 acccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgta 12703383  T
Q  254 tattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    |||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  12703384 tattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 12703430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22061 - 21829
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22061 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 21962  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  21961 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 21862  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21861 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 21829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 8201801 - 8202033
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  8201801 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 8201900  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  8201901 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 8202000  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  8202001 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 8202033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 195
Target Start/End: Original strand, 4318283 - 4318461
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||    
T  4318283 gaacccagaacaacactagtttgggaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaatggagtgtcttgagtgt 4318382  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgca 195  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4318383 ttgcgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctattgatgatgtttaatgca 4318461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14148937 - 14148715
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  14148937 gaacctagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactcccgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 14148838  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  14148837 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtggatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 14148738  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  14148737 atgtcgatattaattgagcatga 14148715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 18585038 - 18585259
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||     
T  18585038 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtgg 18585137  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  18585138 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 18585236  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |||||||||||||||| |||||    
T  18585237 gtgttgatattaattgagcatga 18585259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Original strand, 23519692 - 23519925
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  23519692 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 23519791  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  23519792 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 23519890  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgt 252  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||    
T  23519891 atgttgatattatttgagcatg-attaatgtattgt 23519925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1347886 - 1347589
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  1347886 aggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagttagcccagaatgtagt 1347787  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |  ||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  1347786 ttgttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaacctaatgatgaagtctaatgcaatctgtaaag 1347688  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgat 305  Q
       ||||||  ||||||  |||||||||||||| | || ||||||||  | |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |  ||||||||||    
T  1347687 -cctttaagacatgttgtaattaattgaacatg-attattgtattgtgcaattgtgtaagatatgaagtttaattatgatgcaaatgaattgctattgat 1347590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11262696 - 11262442
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  11262696 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 11262597  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  11262596 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 11262497  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  11262496 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 11262442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12692863 - 12692609
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  12692863 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgt 12692764  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  12692763 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 12692664  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  12692663 atgttgttattaattgagtatgagctaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 12692609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14953565 - 14953311
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || ||| | ||||||||    
T  14953565 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtggtttgagtgt 14953466  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  14953465 ttgtgcgatctgtgtcgtacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 14953366  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  14953365 atgttgttattaattgagtatgagctaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 14953311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8706363 - 8706142
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  8706363 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 8706264  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||| ||||  || |  ||||| |    
T  8706263 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaaagaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtgaagct-attaagat 8706165  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  8706164 atgttgatattaattgagcatga 8706142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10875895 - 10875675
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  10875895 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctg-ttgagtgg 10875797  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  10875796 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaacctaaggataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 10875698  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  10875697 atgttgatattaattgagcatga 10875675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15022509 - 15022276
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  15022509 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 15022410  T
Q  106 tgcttgagtg-tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    || ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  15022409 tgattatgtgttttgtgcgatctgtgtcgcactttttgatccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaa 15022310  T
Q  205 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
    | |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  15022309 gct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 15022276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 18553278 - 18553491
Alignment:
Q  25 aacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 124  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  18553278 aacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcga 18553377  T
Q  125 tctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgat 224  Q
    |||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| | |||||||    
T  18553378 tctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagatgtgttgat 18553476  T
Q  225 attaattgaacatga 239  Q
    ||||||||| |||||    
T  18553477 attaattgagcatga 18553491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 6016910 - 6017142
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  6016910 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 6017009  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  6017010 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 6017108  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  6017109 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 6017142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8719779 - 8719564
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  8719779 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 8719680  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||| ||||  || |  ||||| |    
T  8719679 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaaagaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtgaagct-attaagat 8719581  T
Q  217 atgttgatattaattga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  8719580 atgttgatattaattga 8719564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Original strand, 11232011 - 11232198
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||||    
T  11232011 aggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagccctgaatgtagt 11232110  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgc 194  Q
    |  ||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||    
T  11232111 ttgttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaacctaatgatgaagtctaatgc 11232198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Original strand, 11238698 - 11238885
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||| ||||||||    
T  11238698 aggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccaaaatgtagt 11238797  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgc 194  Q
    |  ||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||    
T  11238798 ttgttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaacctaatgatgaagtctaatgc 11238885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14959531 - 14959277
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||   |||| || |||   ||||||||    
T  14959531 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcagattggagtgttttgagtgt 14959432  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    || |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  14959431 ttatgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 14959332  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||    
T  14959331 atgttgttattaattgagtatgagctaatttattatgcatt-atgtaagatatgaa 14959277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 25038948 - 25039202
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  25038948 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggtgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 25039047  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  25039048 ttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 25039147  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  25039148 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 25039202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10869815 - 10869595
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| || |||||||     
T  10869815 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtacagaatgtagatg-ttgagtgg 10869717  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||  |||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  10869716 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgaaacttaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 10869618  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  10869617 atgttgatattaattgagcatga 10869595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 11554601 - 11554833
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  11554601 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 11554700  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  11554701 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaa-cccaaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 11554799  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  |||||||||    
T  11554800 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtatt 11554833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26420308 - 26420113
Alignment:
Q  76 ctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacc 175  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  26420308 ctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacc 26420209  T
Q  176 taatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  26420208 taatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagatatgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 26420113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 11548005 - 11548237
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  11548005 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 11548104  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| |    
T  11548105 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaa-cccaaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaacgcaatctgtaaggccgtttaagat 11548203  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  |||||||||    
T  11548204 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtatt 11548237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 272
Target Start/End: Original strand, 44408134 - 44408329
Alignment:
Q  76 ctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacc 175  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  44408134 ctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacc 44408233  T
Q  176 taatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  44408234 taatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagatatgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 44408329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9410310 - 9410096
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat-gtagttgcttgagtgtt 117  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||  | ||| |  || |||||||    
T  9410310 acccaaaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgagcaattccaggttagta-tgcctagagtgtt 9410212  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    |||||||||||||||||| || | |  |||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  9410211 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggaccaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgtttcagata 9410112  T
Q  218 tgttgatattaattga 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  9410111 tgttgatattaattga 9410096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33475 - 33392
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33475 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 33392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 70503 - 70586
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  70503 gaacccagaacaatactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 70586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13570227 - 13570057
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  13570227 gtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagtgttatgagtgtt-gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagag 13570129  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttg 222  Q
     ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  13570128 tgaatccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttg 13570057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 74615 - 74695
Alignment:
Q  20 cccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  74615 cccagaacaatactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 74695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7536521 - 7536299
Alignment:
Q  49 tggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggt-caa 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||  ||| | || |||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||    
T  7536521 tggtactcgccatggcgagtaggaacaatcgcctcgagagcacttccaaattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattcaa 7536422  T
Q  148 gagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgt 247  Q
    |||||||||| || |||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  7536421 gagcgaaccctta-ttggtaatagaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaggatatgttgatattaatcgagcatggattaatgt 7536323  T
Q  248 attgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||    
T  7536322 attatacatt-acgtaagatatgaa 7536299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 12704396 - 12704471
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaca 92  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704396 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaca 12704471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Original strand, 19929 - 20087
Alignment:
Q  110 tgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacc-cctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | | || |||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  19929 tgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatctagagcgaacctccttat-gataatgagacctagtgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctg 20027  T
Q  209 tttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat 269  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  20028 tttaatatatgttgatattaattgagcatgaattaatgtattaaatatt-atgtaagatat 20087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Original strand, 12703114 - 12703189
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcc 81  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12703114 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcc 12703189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13691244 - 13691202
Alignment:
Q  234 acatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13691244 acatgaactaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggtt 13691202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26292729 - 26292680
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26292729 gtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaat 26292680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 16345512 - 16345802
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16345512 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 16345611  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16345612 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 16345711  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16345712 atattgatattcattgagcaagaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 16345802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 16352160 - 16352450
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16352160 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 16352259  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352260 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 16352359  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16352360 atattgatattcattgagcaagaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 16352450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 41478303 - 41478574
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacca-gaatgtag 104  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  41478303 aggatcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccaagaatgtaa 41478402  T
Q  105 ttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41478403 ttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaga 41478502  T
Q  205 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41478503 gttgtttaagttatgttgatattaaatgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatacgaaggtt 41478574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 51328405 - 51328706
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51328405 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 51328504  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51328505 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 51328604  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51328605 ttgtttaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 51328704  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  51328705 ta 51328706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 51335039 - 51335340
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51335039 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 51335138  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51335139 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 51335238  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51335239 ttgtttaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 51335338  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  51335339 ta 51335340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 18599832 - 18600102
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18599832 aggatcagagggaacccataacaactttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 18599931  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18599932 tgcttgaatgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccccagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 18600031  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18600032 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggtt 18600102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 41356025 - 41356316
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41356025 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 41356124  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||      
T  41356125 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagac 41356224  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41356225 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctaatgata 41356316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 41348588 - 41348879
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41348588 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 41348687  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||      
T  41348688 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagac 41348787  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41348788 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctaatgata 41348879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47659585 - 47659293
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  47659585 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgt 47659486  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaa--g 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||       
T  47659485 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattagcattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaaaga 47659386  T
Q  215 ttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47659385 ctatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatgtgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 47659293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 20215655 - 20215949
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  20215655 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 20215754  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20215755 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 20215854  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  20215855 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 20215949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 44844609 - 44844911
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacc-agaatgtag 104  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| |     
T  44844609 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaacccaggatgaac 44844708  T
Q  105 ttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  44844709 ttgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtaga 44844808  T
Q  205 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattg 303  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44844809 gttgtttaagttatattaatattaattggataagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattg 44844908  T
Q  304 ata 306  Q
    |||    
T  44844909 ata 44844911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21829082 - 21828810
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21829082 gaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccttggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatgtagttgcttgagtgt 21828983  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag-ttgtttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  | |||||      
T  21828982 ttgtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaagcctttttaata 21828883  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaa 289  Q
     ||||||   ||||| || |||| | |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21828882 catgttgtcgttaatcgagcatg-attaatgtattgtgcaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaa 21828810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19111778 - 19111524
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  19111778 gaacccagaacaacattagtttggatattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 19111679  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  19111678 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaataatgatgtttaatgcagtctgtaaagccgtttaagat 19111579  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  19111578 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 19111524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21844595 - 21844323
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844595 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccttggtgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 21844496  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag-ttgtttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||  ||||| ||  | |||||      
T  21844495 ttgtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgatgtctaatgcaatctgtaaagcctttttaata 21844396  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaa 289  Q
     ||||||   ||||| || |||| | |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21844395 catgttgtcgttaatcgagcatg-attaatgtattgtgcaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaa 21844323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19105121 - 19104867
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  19105121 gaacccataacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 19105022  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  19105021 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaaaagtgaacccctaattggtaatgagacctaataatgatgtttaatgcagtctgtaaagccgtttaagat 19104922  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  19104921 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaaggtatgaa 19104867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 46157047 - 46157279
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  46157047 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 46157146  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  46157147 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 46157246  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  46157247 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 46157279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19063888 - 19063704
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  19063888 gaacccagaacaacattagtttggatattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 19063789  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgt 201  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  19063788 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaataatgatgtttaatgcagtctgt 19063704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 20524961 - 20525175
Alignment:
Q  25 aacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | || |||  |||||||||||||||||    
T  20524961 aacaacattagtttggaagttgattggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaaattggagtgccttgagtgtttgtgcga 20525060  T
Q  125 tctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgat 224  Q
    ||||||||||| || ||| |||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||| | |||    
T  20525061 tctgtgtcgcacgttttgatcaaaagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagatatttcgat 20525160  T
Q  225 attaattgaacatga 239  Q
    ||||||||| |||||    
T  20525161 attaattgagcatga 20525175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 27898397 - 27898618
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  27898397 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 27898496  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  27898497 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 27898595  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27898596 atgttgatattaattgagcatga 27898618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 43063014 - 43063235
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  43063014 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 43063113  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  43063114 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 43063212  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  43063213 atgttgatattaattgagcatga 43063235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44756473 - 44756252
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  44756473 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 44756374  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  44756373 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 44756275  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44756274 atgttgatattaattgagcatga 44756252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49334940 - 49334719
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  49334940 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 49334841  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  49334840 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 49334742  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  49334741 atgttgatattaattgagcatga 49334719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43078819 - 43078587
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  43078819 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 43078720  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  43078719 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 43078620  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43078619 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 43078587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23763579 - 23763325
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  23763579 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 23763480  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  23763479 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 23763380  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  23763379 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 23763325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 18626013 - 18626233
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  18626013 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctg-ttgagtgg 18626111  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||  ||||| || |  |||||||    
T  18626112 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaaagcaatctgtaaagct-attaagtt 18626210  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  18626211 atgttgatattatttgagcatga 18626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33394215 - 33393994
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||     
T  33394215 gaacccaaaacaacattagttgggaatttaagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtgg 33394116  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  33394115 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 33394017  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  33394016 atgttgatattaattgagcatga 33393994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 50887491 - 50887723
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  50887491 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 50887590  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  50887591 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 50887689  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  50887690 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 50887723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8305503 - 8305271
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |  |||   ||||||| |    
T  8305503 aacccagaacaacattagtttggaacttgtctcgtactcgccatggcgagtaagaattcttgcctcgcgagcacttccaggttagagtgtgttgagtgct 8305404  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  8305403 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttaaggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagata 8305304  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8305303 tgttgatattaattgagcatgaattaatgtatt 8305271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21438162 - 21437908
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  21438162 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgt 21438063  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  21438062 ttgtgcgatctgtgtcgcacattttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaacctaatgatgaagtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 21437963  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  21437962 atgttgttattaattgagtatgagctaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 21437908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 33392607 - 33392894
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  33392607 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttt 33392706  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaat-tggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| | | || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  33392707 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccattatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagata 33392805  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||| ||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  33392806 tgttgagattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 33392894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 21806940 - 21807226
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  21806940 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgttt 21807039  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  21807040 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 21807138  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||| ||||||||||    
T  21807139 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgcgctattgata 21807226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 33385963 - 33386249
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  33385963 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttt 33386062  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  33386063 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 33386161  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||| ||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  33386162 gttgagattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 33386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21835700 - 21835446
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  21835700 gtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgtttgtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagag 21835601  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||  ||| | ||| |||||    
T  21835600 cgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatatgttgatattgattgagtatg-attaaggtatt 21835503  T
Q  251 gtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||| ||||||||||    
T  21835502 gtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgcgctattgata 21835446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1011091 - 1011008
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1011091 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 1011008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Original strand, 20228581 - 20228630
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20228581 gtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaat 20228630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 291
Target Start/End: Original strand, 14268185 - 14268470
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14268185 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgtagt 14268284  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14268285 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcgcatgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagag 14268384  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  14268385 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagtttgataatgatgtaatt 14268470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18071536 - 18071246
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18071536 gaacccagaacaacattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 18071437  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071436 ttgtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 18071337  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18071336 atattgatattaattgagcaagaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagatttgataataatgcaatttatgtgctattgata 18071246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18296004 - 18295703
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18296004 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 18295905  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18295904 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 18295805  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18295804 ttgtttaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 18295705  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  18295704 ta 18295703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Original strand, 14298560 - 14298856
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14298560 cagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctt 14298659  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14298660 gtgtgttggtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtt 14298759  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14298760 taagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 14298856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20115521 - 20115251
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20115521 aggatcagagggaacccagaacaactttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 20115422  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20115421 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcggacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 20115322  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  20115321 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcgtgcaagatacgaaggtt 20115251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Original strand, 14305184 - 14305480
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14305184 cagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctt 14305283  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14305284 gtgtgttggtgcgatatgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtt 14305383  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305384 taagttatgttgatattaattggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgata 14305480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 18024155 - 18024456
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  18024155 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 18024254  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18024255 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagagatgacgtttaatgcagcctgtagag 18024354  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18024355 ttgtttaagttatattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 18024454  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  18024455 ta 18024456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15148834 - 15148535
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  15148834 aggatcagagggaacccaaaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 15148735  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15148734 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctattgatgaagtttaatgcagtcggtagag 15148635  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgat 305  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15148634 ttg-ttaagttatattgatattaattgaacatgaactaatgtattgtataatcatgcaagatatgaaggttgataataatgcaatttatgtgctattgat 15148536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 6873114 - 6873404
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873114 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 6873213  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||   ||||||      
T  6873214 ttgtgcgttctgtgtcgcccgtgctgatcaagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatgacgtttaatgtaatctgtaaagccttttaagac 6873313  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  6873314 atgttgtcattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 6873404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Original strand, 51493556 - 51493841
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51493556 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 51493655  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag-ttgtttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||     
T  51493656 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagcctttttaaga 51493755  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctatt 302  Q
     ||||||   |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||||||    
T  51493756 catgttgtcgttaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctatt 51493841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 15321832 - 15322121
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15321832 gaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtaattgcttgagtgt 15321931  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  15321932 ttatgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaatagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 15322031  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  15322032 atgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 15322121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 19780017 - 19780311
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  19780017 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 19780116  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19780117 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 19780216  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  19780217 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataggaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 19780311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12475398 - 12475097
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  12475398 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 12475299  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12475298 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 12475199  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12475198 ttgtttaagttatattaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 12475099  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  12475098 ta 12475097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 8048223 - 8048524
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  8048223 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 8048322  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  8048323 tgtttgtgtgtttgtgcgatcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagag 8048422  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8048423 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 8048522  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  8048523 ta 8048524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 8054836 - 8055137
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  8054836 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 8054935  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  8054936 tgtttgtgtgtttgtgcgatcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagag 8055035  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8055036 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgttattga 8055135  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  8055136 ta 8055137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 26284646 - 26284933
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26284646 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 26284745  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  26284746 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 26284844  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  26284845 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 26284933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40478515 - 40478228
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40478515 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 40478416  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||   ||||||      
T  40478415 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatttgtaaag-cctttaagac 40478317  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  40478316 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtataatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 40478228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23954526 - 23954232
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  23954526 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 23954427  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23954426 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 23954327  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  23954326 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 23954232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23961188 - 23960894
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  23961188 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 23961089  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23961088 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 23960989  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  23960988 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 23960894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4772475 - 4772174
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  4772475 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 4772376  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||    
T  4772375 tggctatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcaatctgtagag 4772276  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4772275 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagctaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 4772176  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  4772175 ta 4772174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40471842 - 40471555
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40471842 gaacctagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 40471743  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||   ||||||      
T  40471742 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatttgtaaag-cctttaagac 40471644  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  40471643 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtataatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 40471555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 7900909 - 7901196
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7900909 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 7901008  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||  ||||| ||   ||||||      
T  7901009 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgaagtctaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 7901107  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||| |||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  7901108 atgttgtcattaattgagcatg-attattgtattgtacaattgtgtaaggtatgaagtttaattatgatgcaaataatttgctattgata 7901196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15362511 - 15362210
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  15362511 aggatcagagggaaccgagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 15362412  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15362411 tgattatgtgcttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagag 15362312  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15362311 ttgtttaagttatattaatattaattggataagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 15362212  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  15362211 ta 15362210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22194998 - 22194697
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22194998 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 22194899  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22194898 tgattttgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagggatgttgtttaatgcagactgtagag 22194799  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22194798 ttgtttaagttatattaatattaattggataagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 22194699  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  22194698 ta 22194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 36884462 - 36884763
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  36884462 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 36884561  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  36884562 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagag 36884661  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36884662 ttgtttaagttatatcaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 36884761  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  36884762 ta 36884763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12482028 - 12481727
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  12482028 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 12481929  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcag-gtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||| |   |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12481928 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcactgtgatnn-caagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtaga 12481830  T
Q  205 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattg 303  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12481829 gttgtntaagttatattaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattg 12481730  T
Q  304 ata 306  Q
    |||    
T  12481729 ata 12481727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 15383221 - 15383521
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| | |    
T  15383221 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacagccaggatgaact 15383320  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||  | ||||| ||| ||||||||    
T  15383321 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactagttgatcaagagtgaacccctatctggtaatgagacctagtgatgttg-ttaatacagactgtagag 15383419  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15383420 ttgtttaagttatattaatattaattggataagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 15383519  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  15383520 ta 15383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 16231569 - 16231870
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||| | |    
T  16231569 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtatagccaggatgaact 16231668  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  16231669 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactagttgatcaagagtaaacccctatctggtaatgagacctagtgatgttgtttaatacagactgtagag 16231768  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16231769 ttgtttaagttatattaatattaattggataagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 16231868  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  16231869 ta 16231870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 17962052 - 17962284
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  17962052 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 17962151  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
     | ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  17962152 cgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 17962251  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17962252 ct-attaagatatgttgatattaattgagcatga 17962284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35614275 - 35614053
Alignment:
Q  49 tggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaag 148  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  35614275 tggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaag 35614176  T
Q  149 agcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgta 248  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35614175 agtgaacccctagttggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagatatgttgatattaattgagcatgaattaatgta 35614076  T
Q  249 ttgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    || || ||| ||||||| ||||||    
T  35614075 ttatacatt-atgtaagttatgaa 35614053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 306
Target Start/End: Original strand, 386129 - 386357
Alignment:
Q  76 ctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacc 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  386129 ctcgcctcccgagcacaaccagaatgtagatgcttgagtgtttgtgcgatatgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacc 386228  T
Q  176 taatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||  ||||||   |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  386229 taatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagacatgttgtcgttaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagt 386326  T
Q  276 taataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  386327 taattatgatgcaaatgatttgctattgata 386357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8385213 - 8384981
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  8385213 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 8385114  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  8385113 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 8385014  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  8385013 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 8384981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8391868 - 8391636
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  8391868 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 8391769  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  8391768 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 8391669  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  8391668 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 8391636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14074209 - 14073977
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  14074209 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 14074110  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  14074109 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 14074010  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  14074009 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 14073977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15256987 - 15256755
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  15256987 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 15256888  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  15256887 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 15256788  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  15256787 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 15256755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17808792 - 17808560
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  17808792 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 17808693  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  17808692 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 17808593  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  17808592 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 17808560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 30234918 - 30235205
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||  || |||     ||||||||    
T  30234918 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaatcctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtataaggagtgttt 30235017  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| ||   | ||||||| |||||||    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  30235018 gtgcgatctgtgtcgcacgttcagatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgacgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 30235117  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  30235118 gttgatattaattgagcatg-attaatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgatttgctattgata 30235205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 12349312 - 12349533
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  12349312 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 12349411  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  12349412 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 12349510  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12349511 atgttgatattaattgagcatga 12349533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 17089705 - 17089937
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  17089705 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagtggagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 17089804  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  17089805 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 17089904  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  17089905 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 17089937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 12299636 - 12299857
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  12299636 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 12299735  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  12299736 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 12299834  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12299835 atgttgatattaattgagcatga 12299857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 29040626 - 29040858
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  29040626 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 29040725  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  29040726 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 29040825  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  29040826 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 29040858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35170996 - 35170774
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  35170996 gaacctagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgtctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 35170897  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||  ||||| |   ||||||| |    
T  35170896 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaacgcaatctgtaaaaccgtttaagat 35170797  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  35170796 atgtcaatattaattgagcatga 35170774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53433744 - 53433512
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  53433744 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 53433645  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  53433644 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 53433546  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  53433545 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 53433512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 16956390 - 16956677
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  16956390 acccagaacaactttagtttgggaattgtttcgtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttt 16956489  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  16956490 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 16956589  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   | || ||||||||||||||    
T  16956590 gttgatattgattgagtatg-attaatgtattgtacatttatgtaagatatggaagtttaattatgacatagttgatgtgctattgata 16956677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23838801 - 23838547
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  23838801 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 23838702  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||  |  ||||||  |    
T  23838701 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacatttaatgcaatctgtaaggccgtttaatat 23838602  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  23838601 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 23838547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 55795825 - 55795647
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||  | |||||||     
T  55795825 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagcag-ttgagtgg 55795727  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  55795726 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacccaatgataacgtttaatgcag 55795647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 9271842 - 9272009
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgta-gttgcttgagtg 115  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||    
T  9271842 gaacccagaacaactttagtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagtatgaccagaatgtaggttgtttgagtg 9271941  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatga 184  Q
     | ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  9271942 -tagtgcgatctgtgtcgcacgtattgatcaagagtgaacctctaattggtaatgaaacctagtgatga 9272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 41385483 - 41385737
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   |||||||     
T  41385483 gaacctagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgc 41385582  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  41385583 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctgattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 41385682  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  41385683 atgttgttattaattgagtatgagataatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 41385737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12522452 - 12522219
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||  ||||   |||||| ||||||||||||  | ||  || |||   ||||||||    
T  12522452 gaacctagaacaacattagttggggagttggcttgtactcgccatggaaagtagatactctcacctcgcgagcacttctagtttggagtgcattgagtgt 12522353  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||      
T  12522352 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagac 12522253  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  12522252 atgttgatattaattgagcatgaattaacgtatt 12522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14679330 - 14679114
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| |  |||   ||||||||    
T  14679330 gaacctagaacaacattagtagggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgctttgagtgt 14679231  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  14679230 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgattaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 14679131  T
Q  217 atgttgatattaattga 233  Q
    |||||| ||||||||||    
T  14679130 atgttgttattaattga 14679114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23081954 - 23081668
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  23081954 acccaaaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgttt 23081855  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  23081854 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 23081756  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  23081755 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 23081668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14685539 - 14685322
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat-gtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||| ||||||| |||| || || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| | | |||   |||||||    
T  14685539 gaacctagaacaacattatttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttggagtgctttgagtg 14685440  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||  |  |||||||     
T  14685439 tttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgattaatgcaatctgtaaggccgtttaaga 14685340  T
Q  216 tatgttgatattaattga 233  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  14685339 tatgttgttattaattga 14685322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 19941894 - 19942180
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    ||||||||     
T  19941894 acccagaacaactttagtttggaaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttc 19941993  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  19941994 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 19942092  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  19942093 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 19942180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27710111 - 27709825
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  ||     |||||||||    
T  27710111 acccataacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagcgttatgagtgttt 27710012  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||     | |  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  27710011 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttaagatgataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 27709913  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  27709912 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 27709825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17810640 - 17810557
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17810640 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 17810557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 14757160 - 14757243
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14757160 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgccttgcgagcacatccagaat 14757243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 386092 - 386134
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgcc 59  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  386092 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgcc 386134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 57342 - 57052
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  57342 gaacccagaacaacattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 57243  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57242 ttgtgcgatctgtgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 57143  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  57142 atattgatattaattgagcaagaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagatttgataataatgcaatttatgtgctattgata 57052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 22115447 - 22115748
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  22115447 aggatcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagt 22115546  T
Q  106 t-gcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22115547 ttgtttgagtgta-gtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaga 22115645  T
Q  205 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  22115646 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattg 22115745  T
Q  304 ata 306  Q
    |||    
T  22115746 ata 22115748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 22123117 - 22123382
Alignment:
Q  11 cagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgctt 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  22123117 cagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgttt 22123216  T
Q  111 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22123217 gagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtt 22123316  T
Q  211 taagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22123317 taagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtt 22123382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 8354490 - 8354792
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8354490 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtattcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagt 8354589  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8354590 tgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 8354689  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaa-tttatgtgctattg 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8354690 ttgtttaggttatgttaatattaattgaacatggactaaggcattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattg 8354789  T
Q  304 ata 306  Q
    |||    
T  8354790 ata 8354792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19496758 - 19496467
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19496758 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 19496659  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||      
T  19496658 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagac 19496559  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19496558 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctaatgata 19496467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19111605 - 19111304
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19111605 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 19111506  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19111505 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 19111406  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19111405 ttgtctaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattga 19111306  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  19111305 ta 19111304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19117896 - 19117595
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19117896 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 19117797  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19117796 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 19117697  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19117696 ttgtctaggttatattgatattaattgaatatgaattaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattga 19117597  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  19117596 ta 19117595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22048314 - 22048023
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22048314 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtataaccagaaggtagttgcttgagtgt 22048215  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||      
T  22048214 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgaggcctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagac 22048115  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22048114 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 22048023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 306
Target Start/End: Original strand, 22124296 - 22124556
Alignment:
Q  47 agtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtt-gcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtc 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |     
T  22124296 agtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcctagaatgtagtttgtttgagtgta-gtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatt 22124394  T
Q  146 aagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22124395 aagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaagatgaactaat 22124494  T
Q  246 gtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22124495 gtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattgata 22124556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18865699 - 18865409
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18865699 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 18865600  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| || || |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||   ||||||      
T  18865599 ttgtgcgttctgtgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatgacgtttaatgtaatctgtaaagccttttaagac 18865500  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  18865499 atgttgtcattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 18865409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 16882910 - 16883198
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16882910 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagcggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 16883009  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  16883010 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 16883109  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  16883110 atgttgtcgttaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 16883198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18855304 - 18855014
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855304 gaacccagaacaacactagtgtgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 18855205  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || || |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||   ||||||      
T  18855204 ttgtgcgatctgtgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatgacgtttaatgtaatctgtaaagccttttaagac 18855105  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  18855104 atgttgtcattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttaattatgatgaaaatgatttgctattgata 18855014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 17669297 - 17669591
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  17669297 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 17669396  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17669397 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 17669496  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  17669497 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 17669591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 17675949 - 17676243
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  17675949 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 17676048  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17676049 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 17676148  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  17676149 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 17676243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 5534166 - 5534460
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  5534166 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 5534265  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5534266 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctaatgatgtcgtttaatgcagactgtagag 5534365  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  5534366 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactatcatattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 5534460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 21915297 - 21915591
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  21915297 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 21915396  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| || || || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21915397 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactgataatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 21915496  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  21915497 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 21915591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 20019667 - 20019968
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| | |    
T  20019667 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaact 20019766  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| | ||||||    
T  20019767 tgtttgtgtgtttgtgcgatcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagag 20019866  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20019867 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 20019966  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  20019967 ta 20019968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22084210 - 22083909
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22084210 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgaggggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 22084111  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22084110 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagag 22084011  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22084010 ttgtttaagttatattaatattaattggataagaactatggtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 22083911  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  22083910 ta 22083909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29123453 - 29123166
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29123453 gaacccagaacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 29123354  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  29123353 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 29123255  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  29123254 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 29123166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 20013591 - 20013891
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| | |    
T  20013591 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaact 20013690  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| | ||||||    
T  20013691 tgtttgtgtgtt-gtgcgatcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagag 20013789  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    | || ||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20013790 tagtctaagtcatgataatattgattgaacatgagttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattga 20013889  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  20013890 ta 20013891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19498716 - 19498515
Alignment:
Q  97 gaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||      |||    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  19498716 gaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaa------acc----attggtattgagacctagtgatgatgtttactgcag 19498627  T
Q  197 cctgtagagttgtttaagt-tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttat 294  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  19498626 cctgtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttat 19498527  T
Q  295 gtgctattgata 306  Q
    |||||| |||||    
T  19498526 gtgctaatgata 19498515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28455138 - 28454942
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| | |    
T  28455138 aggatcagagggaacccagaacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgggagtacaaccaggatgaact 28455039  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgta 202  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  28455038 tgcttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 28454942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20527817 - 20527563
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  20527817 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 20527718  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  20527717 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 20527618  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  20527617 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 20527563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18065699 - 18065478
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| || |||||||     
T  18065699 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagttcagaatgtagctgtttgagtgg 18065600  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| | || |  ||||| |    
T  18065599 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgaaaagct-attaagat 18065501  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  18065500 atgttgatattaattgagcatga 18065478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19905864 - 19905643
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  19905864 gaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgt 19905765  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  19905764 ttgtgcaatctgtgtcgcacat-ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 19905666  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  19905665 atgtcgatattaattgagcatga 19905643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 26934915 - 26935147
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  26934915 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 26935014  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  26935015 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 26935113  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  26935114 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 26935147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3216625 - 3216340
Alignment:
Q  21 ccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgt 120  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||  |||||||||||||    
T  3216625 ccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgtctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgt 3216526  T
Q  121 gcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaa-cccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatg 219  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||||| ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||     
T  3216525 gcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaagacagtctgtaaagctgtttaagatata 3216427  T
Q  220 ttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| |||||||| | | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  3216426 ttgatattaattgagcatg-attaaagtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgatttgctattgata 3216340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 306
Target Start/End: Original strand, 23845592 - 23845788
Alignment:
Q  110 tgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  23845592 tgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgt 23845691  T
Q  210 ttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  23845692 ttaagatatgttgatattgattgagtatg-attaatgtattgtacatttatgtaagatatggaagtttaattatgatataattgatgtgctattgata 23845788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 20023668 - 20023954
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  20023668 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttt 20023767  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    |||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  20023768 gtgcgattggtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 20023866  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  20023867 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 20023954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 52
Target Start/End: Original strand, 22122149 - 22122195
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggt 52  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22122149 aggatcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggt 22122195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 20057140 - 20057431
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20057140 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 20057239  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttg-tttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20057240 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgttttaaat 20057339  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20057340 tatattgatattaattgagcatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 20057431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 20063778 - 20064069
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20063778 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 20063877  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttg-tttaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20063878 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgttttaaat 20063977  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20063978 tatattgatattaattgagcatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 20064069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3690988 - 3690698
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3690988 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 3690889  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690888 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattgggattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 3690789  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3690788 atattgatattcattgagcaagaactaatgtattgtatatgcatgcaagatatgaaggtttgataaaaatgcaatttatgtgctattgata 3690698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5221784 - 5221483
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  5221784 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgacacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatatagt 5221685  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  5221684 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagag 5221585  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  5221584 ttggttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttgaaaataatgccatttatgtgctattga 5221485  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  5221484 ta 5221483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10911268 - 10910978
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10911268 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 10911169  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911168 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 10911069  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10911068 atgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgata 10910978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 16489396 - 16489666
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16489396 aggatcagagggaacccagaacaactttagtttgggagatgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtact 16489495  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16489496 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgctgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagag 16489595  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16489596 ttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtatattcgtgcaagatatgaaggtt 16489666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10904596 - 10904306
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10904596 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 10904497  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10904496 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcatgagtgaacccctaattggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 10904397  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10904396 atgttgatattaaatggacatgaactaatgtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgata 10904306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 16623781 - 16624075
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16623781 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagt 16623880  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16623881 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagag 16623980  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  16623981 ttgtctaagttatattaatattgattgaataagaactattgtattgtatattcatgcaaaataagaagatgtgataatgatgcaaattatgtgct 16624075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13251099 - 13250798
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13251099 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 13251000  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13250999 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 13250900  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13250899 ttgtttaggttatattgatattaattgaatatgagttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 13250800  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  13250799 ta 13250798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13257745 - 13257444
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13257745 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagt 13257646  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13257645 ttcctgagtgtctgtgcgatctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 13257546  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13257545 ttgtttaggttatattgatattaattgaatatgagttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 13257446  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  13257445 ta 13257444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 14672926 - 14673227
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  14672926 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 14673025  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14673026 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagagatgacgtttaatgcagcctgtagag 14673125  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14673126 ttgtttaagttatattgatattaattgaatatgaattaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 14673225  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  14673226 ta 14673227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10004006 - 10003716
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  10004006 gaacccagaacaacttcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 10003907  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10003906 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 10003807  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10003806 atgttgatattaaatggacatgaactaaggtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgata 10003716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10010653 - 10010363
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  10010653 gaacccagaacaacttcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 10010554  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010553 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 10010454  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10010453 atgttgatattaaatggacatgaactaaggtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgata 10010363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Original strand, 10153461 - 10153753
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  10153461 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaact 10153560  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  10153561 tgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcatttaatgcagactgtagag 10153660  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtg 297  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||    
T  10153661 ttgtttaagttatattaatatcaattgaatatgaactattatattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatgcaaattatgtg 10153753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37615771 - 37615477
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  37615771 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 37615672  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37615671 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 37615572  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  37615571 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 37615477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 418380 - 418079
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  418380 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 418281  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  418280 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagag 418181  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  418180 ttgtttaagttatattaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattga 418081  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  418080 ta 418079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Original strand, 26788531 - 26788793
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  26788531 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 26788630  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26788631 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 26788730  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagata 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26788731 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagata 26788793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Original strand, 26794121 - 26794383
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  26794121 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 26794220  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26794221 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 26794320  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagata 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26794321 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagata 26794383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 31422279 - 31422546
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  31422279 aggatcagagggaacctagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 31422378  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31422379 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 31422478  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31422479 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaag 31422546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 5149705 - 5149994
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5149705 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 5149804  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  5149805 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacataatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 5149904  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  |||| |||| |||| | |||||||||||  | | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  5149905 atgttgtcattatttgagcatg-attaatgtattgttcaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 5149994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 10846010 - 10846310
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  10846010 aggatcagagggaacccagaacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaact 10846109  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  10846110 tgtttgtgtgtt-gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagag 10846208  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag-gttaataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10846209 ttgtttaagtcatgataatattaattgaacatgagctaatgtaatatacatttatgcaagatatgaagaattgataatgatacaatttatgtgctattga 10846308  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  10846309 ta 10846310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26889835 - 26889534
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  26889835 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 26889736  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  26889735 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagag 26889636  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26889635 ttgtttaagttatattaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 26889536  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  26889535 ta 26889534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Original strand, 41201535 - 41201802
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41201535 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 41201634  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  41201635 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 41201733  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatg 286  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  41201734 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatttgaaagttaattatgatg 41201802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Original strand, 15726669 - 15726939
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15726669 gaacccagaacaacactagtttgggagataagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 15726768  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  15726769 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaattatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 15726867  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaa 289  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15726868 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaa 15726939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 15692015 - 15692302
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||    
T  15692015 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcataacctgaatttagatgcttgagtgt 15692114  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  15692115 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 15692213  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  15692214 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 15692302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 5106610 - 5106877
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  5106610 aggatcagagggagcccagaacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaact 5106709  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5106710 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtagtgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 5106809  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5106810 ttgtttaagttatattaatatcaattgaatatgaactattatattgtatattcatgcaagataagaag 5106877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6599098 - 6598831
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  6599098 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 6598999  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  6598998 tgtttatgtgtttgtgcaatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagactgtaaag 6598899  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6598898 ttgtttaagttatattaatatcaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaag 6598831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6605778 - 6605511
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  6605778 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 6605679  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  6605678 tgtttatgtgtttgtgcaatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagactgtaaag 6605579  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6605578 ttgtttaagttatattaatatcaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaag 6605511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 306
Target Start/End: Original strand, 22643113 - 22643343
Alignment:
Q  76 ctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacc 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || | || ||||||||  ||||||||||||||    
T  22643113 ctcgcctcgcgagcacaaccataatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctatgtcgcacgttttgatcgatagtgaacccctgcttggtattgagacc 22643212  T
Q  176 taatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aagg 274  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||     
T  22643213 taatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttg-ttaagatatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtataattatgcaagatatgcaagt 22643311  T
Q  275 ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  22643312 ttgattataatgcaattgatgtgctattgata 22643343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 23704506 - 23704792
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23704506 gaacccagaacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 23704605  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||| | ||    |||||      
T  23704606 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcgatctgcaaag--ccttaagac 23704703  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||||| ||||   |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  23704704 atgttgtcgttaattgagcatg-gttaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 23704792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 23722962 - 23723248
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23722962 gaacccagaacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 23723061  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||| | ||    |||||      
T  23723062 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcgatctgcaaag--ccttaagac 23723159  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||||| ||||   |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  23723160 atgttgtcgttaattgagcatg-gttaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 23723248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 23741418 - 23741704
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23741418 gaacccagaacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 23741517  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||| | ||    |||||      
T  23741518 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcgatctgcaaag--ccttaagac 23741615  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||||| ||||   |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  23741616 atgttgtcgttaattgagcatg-gttaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 23741704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 839614 - 839360
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  839614 gaacctagaacaacattagttggggagttgacttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtattgagtgt 839515  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  839514 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaagtggtaatgagaccttatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 839415  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  839414 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagttatgaa 839360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Original strand, 16758311 - 16758564
Alignment:
Q  20 cccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttg 119  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| | | | ||| ||  |||||||    
T  16758311 cccagaacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttg 16758410  T
Q  120 tgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatg 219  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||     
T  16758411 tgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgccgtttaacgcagactgtagagttgttaaagttata 16758510  T
Q  220 ttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16758511 ttaatatcaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaag 16758564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 53380078 - 53380377
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| | |    
T  53380078 aggatcagaggggacccataacaaccttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaact 53380177  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| |  || |||||||||   ||| | |||||||||| ||||||||    
T  53380178 tgtttgtgt-tttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagacctataaatgtcatttaatgcagactgtagag 53380275  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  53380276 ttgtttaagtcatattaatattaattgaatatgaactattgaattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgcttttga 53380375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 53386730 - 53387029
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| | |    
T  53386730 aggatcagaggggacccataacaaccttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaact 53386829  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| |  || |||||||||   ||| | |||||||||| ||||||||    
T  53386830 tgtttgtgt-tttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagacctataaatgtcatttaatgcagactgtagag 53386927  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  53386928 ttgtttaagtcatattaatattaattgaatatgaactattgaattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgcttttga 53387027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 17710331 - 17710612
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||  |||||||||||    
T  17710331 acccagaacaactttagtttgggaattgaatggtactcgccaaggcaagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgtcttgagtgttt 17710430  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcg-aacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  17710431 gtgcgatctgtgtcgcatgtttggatcaagagtgaaacccctta-tgataatgagacctattgatgacgtttaatgcagtctgtaaagttgtttaagata 17710529  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgcta 300  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||||||| ||| | | |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17710530 tgttgatattaattgagtatg-attaatgtatggtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatacaattgatgtgcta 17710612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48423748 - 48423516
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  48423748 aggatcagagggaacccagaacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 48423649  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  48423648 tgcttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 48423549  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  48423548 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 48423516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48430526 - 48430294
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  48430526 aggatcagagggaacccagaacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 48430427  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  48430426 tgcttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 48430327  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  48430326 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 48430294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16333509 - 16333287
Alignment:
Q  49 tggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaag 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  16333509 tggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaag 16333410  T
Q  149 agcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgta 248  Q
    || ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16333409 agtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagatatgttgatattaattgagcatgaattaatgta 16333310  T
Q  249 ttgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    || || ||| ||||||||||||||    
T  16333309 ttatacatt-atgtaagatatgaa 16333287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12482797 - 12482576
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  12482797 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 12482698  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  12482697 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 12482599  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12482598 atgttgatattaattgagcatga 12482576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 15991843 - 15992130
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||  |  |||  ||||| |||||    
T  15991843 acccaaaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgaatgttt 15991942  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  15991943 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 15992042  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15992043 gttgatattaattgagtatg-attaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaactatgatacaattgatgtgctattgata 15992130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 41092073 - 41092372
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtag- 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||     
T  41092073 aggagcagagggaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagt 41092172  T
Q  105 ttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  41092173 ttgtttgagtg-tagtgcgatctgtgttgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgaagtctaatgcaatctgtaaa 41092271  T
Q  205 gttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgt--atattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctatt 302  Q
    |   ||||||  ||||||  |||||||||||||| | || ||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||    
T  41092272 g-cctttaagacatgttgtcattaattgaacatg-attattgtattgtgcaaatt-gtgtaagatatgaagtttaattatgatgcaaatgatttgctatt 41092368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7986074 - 7985821
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    |||| || |||   ||||||||    
T  7986074 gaacctagaacaacattagtttgggagttggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagcattttcagattggagtgcattgagtgt 7985975  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||  |    
T  7985974 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctta-tggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaaaat 7985876  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  7985875 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 7985821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 16747565 - 16747832
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| | | | |    
T  16747565 aggatcagagaaagcccagaacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaact 16747664  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||  |||||||    
T  16747665 tgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtagattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgctgtttaacgcagattgtagag 16747764  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaag 273  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16747765 ttgttaaagttatattaatatcaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaag 16747832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4710663 - 4710378
Alignment:
Q  21 ccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgt 120  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||  |  |||   ||||||||||||    
T  4710663 ccagaacaactttagtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgagctcctccagctttgagtattttgagtgtttgt 4710564  T
Q  121 gcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgt 220  Q
    ||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  4710563 gcgatatgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagctgtttaagatatgt 4710464  T
Q  221 tgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||| || ||  ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  4710463 tgatattgatcgactatg-attaatgtattgtacatttatgtaagatatgaaagtttaattatgatataattgatgtgctattgata 4710378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16634231 - 16633999
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  16634231 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 16634132  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16634131 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 16634032  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16634031 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 16633999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16640841 - 16640609
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  16640841 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 16640742  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16640741 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 16640642  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16640641 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 16640609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43161506 - 43161274
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  43161506 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 43161407  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  43161406 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 43161307  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43161306 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 43161274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43167743 - 43167511
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  43167743 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 43167644  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  43167643 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 43167544  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43167543 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 43167511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 15584457 - 15584679
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  15584457 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 15584556  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcct-gtagagttgtttaagt 215  Q
    | |||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| || |  |||||     
T  15584557 tggtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccttatgataacgtttaatgcagtctggtaaagct-attaaga 15584655  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatga 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  15584656 tatgttgatattaattgagcatga 15584679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 15591115 - 15591337
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  15591115 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 15591214  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcct-gtagagttgtttaagt 215  Q
    | |||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| || |  |||||     
T  15591215 tggtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccttatgataacgtttaatgcagtctggtaaagct-attaaga 15591313  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatga 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  15591314 tatgttgatattaattgagcatga 15591337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24188145 - 24187891
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  24188145 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 24188046  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  24188045 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 24187946  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  24187945 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 24187891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5201592 - 5201371
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  5201592 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcacctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 5201493  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |  ||||| |    
T  5201492 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaaagcagtctgtaaagct-attaagat 5201394  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5201393 atgttgatattaattgagcatga 5201371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 5426440 - 5426661
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||| |||| || ||| |||     
T  5426440 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgggtgg 5426539  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  5426540 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 5426638  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5426639 atgttgatattaattgagcatga 5426661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 1332787 - 1333018
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  1332787 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 1332885  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  1332886 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcgctttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 1332985  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1332986 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 1333018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 10236133 - 10236421
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||||||    
T  10236133 acccagaacaactttagtttgggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgttt 10236232  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  10236233 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 10236332  T
Q  219 gtt-gatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||  ||||||||  |||   |||||||||||  | | |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10236333 gttggaatttaattgagtatg-gttaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatacaattgatgtgctattgata 10236421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12891773 - 12891541
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  12891773 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 12891674  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  12891673 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 12891575  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  12891574 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 12891541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 17252795 - 17253027
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||  ||||||||||    
T  17252795 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtt 17252894  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggta-ttgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  17252895 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaattgagacc-aatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagat 17252993  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  17252994 atgttgatattaattgagcatgagttaatgtatt 17253027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10326189 - 10325967
Alignment:
Q  49 tggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggt-caa 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||    
T  10326189 tggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgtgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattcaa 10326090  T
Q  148 gagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgt 247  Q
    |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10326089 gagcgaaccctta-ttggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaggatatgttgatattaattgagcatgaattaatgt 10325991  T
Q  248 attgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||    
T  10325990 attatacatt-atgtaagatatgaa 10325967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19809395 - 19809188
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||||||    
T  19809395 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgttt 19809296  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    |||||||||||||||||  | | | ||||||| ||||||||   || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  19809295 gtgcgatctgtgtcgcacatttggatcaagagtgaacccctttatgataatgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgtttcagatat 19809196  T
Q  219 gttgatat 226  Q
    ||||||||    
T  19809195 gttgatat 19809188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 28350899 - 28351153
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  28350899 gaacccagaacaacattagttggggagttggcttcaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 28350998  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||| ||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  28350999 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttaatcaagagtgaatccctttatggtaatgagatctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagcagtttaagat 28351098  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28351099 atgttgatattaattgagtatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 28351153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 5420042 - 5420263
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||| |||| || ||| |||     
T  5420042 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtctagaacgtagctgtttgggtgg 5420141  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  5420142 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacataatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 5420240  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5420241 atgttgatattaattgagcatga 5420263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15826030 - 15825742
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||||||    
T  15826030 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagttttgagtgtcttgagtgttt 15825931  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||    
T  15825930 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaggctgtttaagatat 15825831  T
Q  219 gttgata-ttaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||| | ||||||||  |||   |||||||||||  | | | |||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  15825830 gttgaaatttaattgagtatg-gttaatgtattgtgcaattaagtaagatatgaaggtttaactatgatataattgatgtgctattgata 15825742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20723369 - 20723115
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || || ||  | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  20723369 gaacctagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 20723270  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  20723269 ttgtgcgatctgtgtcgcatgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 20723170  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  20723169 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 20723115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 55149346 - 55149092
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| |  |||   ||||||||    
T  55149346 gaacctagaacaacattagttgggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgctttgagtgt 55149247  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  55149246 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtgtaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 55149147  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  55149146 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 55149092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 1145291 - 1145577
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  1145291 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttt 1145390  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  1145391 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 1145489  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  1145490 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 1145577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 410493 - 410776
Alignment:
Q  22 cagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtg 121  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    ||||||||||||    
T  410493 cagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgtttgtg 410592  T
Q  122 cgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgtt 221  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  410593 cgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatatgtt 410691  T
Q  222 gatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  410692 gatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 410776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 13315927 - 13316112
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||||||    
T  13315927 acccagaacaacactggtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtaataactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgttt 13316026  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtaga 204  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13316027 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgaaacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaga 13316112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6608848 - 6608669
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||   ||| |||    
T  6608848 gaacccagaacaacattagtt-gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtg 6608750  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcag 196  Q
    ||||||||||| ||||||||  | | | ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  6608749 tttgtgcgatccgtgtcgcacctttcgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagataacgtttaatgcag 6608669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 8720895 - 8721181
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    ||||||||     
T  8720895 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttc 8720994  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  8720995 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 8721093  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  8721094 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 8721181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 9072782 - 9073068
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    ||||||||     
T  9072782 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttc 9072881  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  9072882 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 9072980  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  9072981 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 9073068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13321335 - 13321107
Alignment:
Q  22 cagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtg 121  Q
    |||||||| |||||||||| | | |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||   || |||    |||||| |||||    
T  13321335 cagaacaacattagtttggaactagtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcactttcaagttgaagtgtaatgagtgcttgtg 13321236  T
Q  122 cgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgtt 221  Q
    |||| ||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||    
T  13321235 cgatatgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttatgatatgtt 13321136  T
Q  222 gatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||    
T  13321135 ggtactaattgaacatgaattaatgtatt 13321107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 15349988 - 15350274
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  15349988 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcacctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttt 15350087  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  15350088 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 15350186  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | |||  ||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  15350187 gttgatattgattgagtatg-attaagttattgtatatttatgtaagaaatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 15350274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Original strand, 15404265 - 15404435
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  15404265 gtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagtgttatgagtgtt-gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagag 15404363  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttg 222  Q
     ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  15404364 tgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttg 15404435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 15343345 - 15343630
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  15343345 acccataacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttgtgagtgttt 15343444  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  15343445 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 15343543  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||| ||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  15343544 gttga-attgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagaaatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 15343630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15361026 - 15360856
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  15361026 gtactcgccatggtgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagtgttatgagtgtt-gtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagag 15360928  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttg 222  Q
     ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  15360927 tgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttg 15360856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Original strand, 15397674 - 15397844
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  15397674 gtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagtgttatgagtgtt-gtgggatctgtgtcgcacgttttgatcaagag 15397772  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttg 222  Q
     ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  15397773 tgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttg 15397844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 30066317 - 30066234
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30066317 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 30066234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 306
Target Start/End: Original strand, 30777054 - 30777250
Alignment:
Q  110 tgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  30777054 tgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtaaagctgt 30777153  T
Q  210 ttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| | |||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   | || ||||||||||||||    
T  30777154 ttaggatatgttgatattgattgagtatg-attaatgtattgtacatttatgtaagatatggaagtttaattatgacatagttgatgtgctattgata 30777250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11070439 - 11070356
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11070439 gaacccagaacaacactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 11070356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 11165267 - 11165350
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11165267 gaacccaaaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 11165350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14499696 - 14499621
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaca 92  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14499696 gaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaca 14499621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15337767 - 15337598
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagag 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  |  |||    |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||    
T  15337767 gtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgggagcacctccagctttgagtgttatgagtgtt-gtgcgatctgtgtcgcacgttttcatcaagag 15337669  T
Q  151 cgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttg 222  Q
     ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  15337668 tgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctg-aaagctgtttaagatatgttg 15337598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4291122 - 4290999
Alignment:
Q  35 gtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgc 134  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||   |  |||    |||||||||||||||||||||||||    
T  4291122 gtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccaaccttgagtgttatgagtgtttgtgcgatctgtgtcgc 4291023  T
Q  135 aggtgttggtcaagagcgaacccc 158  Q
    | || ||| |||||||||||||||    
T  4291022 acgttttgatcaagagcgaacccc 4290999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Original strand, 22643077 - 22643118
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgcc 59  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22643077 aacccagaacaacactagtttgggagttgagttgtactcgcc 22643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 305
Target Start/End: Original strand, 15366890 - 15366954
Alignment:
Q  242 taatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgat 305  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  15366890 taatgtattgtacatttatgtaagatatggaagtttaattatgatataattgatgtgctattgat 15366954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 779 - 1081
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  779 aggatcagagggaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaagt 878  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  879 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctggtgatgtcgttaaatgcagtctgtagag 978  T
Q  206 -ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattg 303  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  979 tttgtttaagatatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgattatgatgcaatttatgtgctattg 1078  T
Q  304 ata 306  Q
    |||    
T  1079 ata 1081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10738 - 10506
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  10738 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 10639  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  10638 tgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 10539  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  10538 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 10506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 57160 - 56928
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  57160 aggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 57061  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  57060 tgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 56961  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  56960 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 56928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27010 - 26720
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27010 gaacccaaaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacctgaatgtagttgcttgagtgt 26911  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26910 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatccagagtgaacccctatttggtaatgagacttaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagat 26811  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatga-aggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26810 atattgatattaattgaacacgaactaatgtattgtataattatgcaagatatgacagtttgattatgatgcaattgatgtgctattgata 26720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43588 - 43392
Alignment:
Q  110 tgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgt 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  43588 tgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtattgagacctaatgatgacgtctaatgcagtctgtaaagctgt 43489  T
Q  210 ttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  43488 ttaaaatatgttgatattaattgaacatg-attaatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgatttgctattgata 43392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 125851 - 126141
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  125851 gaacccagaacagcactggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgt 125950  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  125951 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacttaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagat 126050  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  126051 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtataattatgcaagatatgaaagtttgattatgatccaattgatgtgctattgata 126141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 105634 - 105906
Alignment:
Q  35 gtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  105634 gtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgc 105733  T
Q  135 aggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaa 234  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  105734 acgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacttaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagatatgttaatattaattgaa 105833  T
Q  235 catgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  105834 catgaactaatgtattgtataattatgcaagatatgaaagtttgattatgatccaattgatgtgctattgata 105906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38410 - 38119
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38410 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgt 38311  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  38310 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagccagtagagttgtttaagac 38211  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38210 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 38119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 76402 - 76693
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  76402 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgt 76501  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaag-t 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  76502 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagccagtagagttgtttaagac 76601  T
Q  216 tatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  76602 tatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgata 76693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41905 - 41616
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41905 gaacccagaacaacactagtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 41806  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  41805 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 41706  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  41705 atgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 41616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 57412 - 57123
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57412 gaacccagaacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 57313  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  57312 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtggtgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagac 57213  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  57212 atgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgata 57123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 67887 - 67593
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  67887 aggatcagagggaacctagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 67788  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  67787 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 67688  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  67687 ttgtttaagttatattaatattaactgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 67593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7370 - 7082
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||||||    
T  7370 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgttt 7271  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  7270 gtgcgatatgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatat 7171  T
Q  219 gttgata-ttaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||| | ||||||||  ||| | |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7170 gttgaaatttaattgagtatg-attaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaactatgatacaattgatgtgctattgata 7082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13806 - 13607
Alignment:
Q  108 cttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagtt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  13806 cttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagct 13707  T
Q  208 gtttaagttatgttgata-ttaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgat 305  Q
    ||||||| |||||| | | ||||||||  ||| | |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  13706 gtttaagatatgttcaaatttaattgagtatg-attaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaactatgatacaattgatgtgctattgat 13608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23334 - 23135
Alignment:
Q  108 cttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagtt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23334 cttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagct 23235  T
Q  208 gtttaagttatgttgata-ttaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgat 305  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||  ||| | |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23234 gtttaagatatgttgaaatttaattgagtatg-attaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaactatgatacaattgatgtgttattgat 23136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 9543 - 9837
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| | |    
T  9543 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcacctcgcgagtacaaccaggatgaact 9642  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9643 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 9742  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  9743 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 9837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30906 - 30612
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  30906 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 30807  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30806 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag 30707  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgct 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||    
T  30706 ttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaactattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct 30612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Original strand, 72625 - 72887
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  72625 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 72724  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  72725 tgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagattgtagag 72824  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagata 268  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  72825 ttgtttaagttatattaatatcaatcgaatatgaactattgtattgtatattcatgcaagata 72887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8427 - 8140
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8427 gaacccagaacaacattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 8328  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    || | ||   ||||||      
T  8327 ttgtgcaatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcgatttgcaaag-cctttaagac 8229  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  8228 atgttgtcgttaattgagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaatgatttgctgttgata 8140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 307464 - 307177
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  307464 gaacccagaacaacactaatttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgt 307365  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||||      
T  307364 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacttgatgatgacgtttaatgcaatctgtaaag-cctttaagac 307266  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||||    
T  307265 atgttgtcgttaattaagcatg-attaatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagttaattatgatgcaaataatttgctgttgata 307177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 59187 - 59488
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||   |    
T  59187 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagct 59286  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||    
T  59287 tgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgttgttgtttaatgcagactgtagag 59386  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  59387 ttgtttaagttatattaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 59486  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  59487 ta 59488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 139446 - 139145
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||   |    
T  139446 aggatcagagggaacccagaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagct 139347  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||    
T  139346 tgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgttgttgtttaatgcagactgtagag 139247  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaaggt-taataatgatgcaatttatgtgctattga 304  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  139246 ttgtttaagttatattaatattaattggttaagaactattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattga 139147  T
Q  305 ta 306  Q
    ||    
T  139146 ta 139145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 14278 - 14532
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  14278 gaacccagaacaacattagttggggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 14377  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  14378 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 14477  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  14478 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 14532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 5544 - 5769
Alignment:
Q  25 aacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 124  Q
    ||||| ||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  5544 aacaacattaggttggaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcactaccagattggagtgccttgagtgtttgtgcga 5643  T
Q  125 tctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgat 224  Q
    |||| |||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5644 tctgcgtcgcacgttttgatcatgagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagttgtttaagatatgttgat 5743  T
Q  225 attaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
     |||||||| |||||| |||||||||    
T  5744 gttaattgagcatgaattaatgtatt 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 29945 - 30199
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| |||| || || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  29945 gaacctagaacaacattatttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 30044  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  30045 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaaatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 30144  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  30145 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 30199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9708 - 9454
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  9708 gaacccagaacaacattagttggggagttggcctgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 9609  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |    
T  9608 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccgtttaagat 9509  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9508 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 9454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 109051 - 109283
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |    
T  109051 aggatcagagggaacccagaacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcacctcgcgagtacaaccagaatgagat 109150  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||  |||| ||   || ||||||||    
T  109151 tgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtaataccgttaaacaaagtctgtagag 109250  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatg 238  Q
     |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  109251 atgtttaggttatgttaacattaattgaacatg 109283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9157 - 8936
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  9157 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 9058  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  9057 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 8959  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  8958 atgttgatattaattgagcatga 8936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 3816 - 4037
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  3816 gaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 3915  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  3916 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 4014  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  4015 atgttgatattaattgagcatga 4037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22572 - 22351
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||     
T  22572 gaacccaaaacaacattagttgggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgg 22473  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||| |    
T  22472 ttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagct-attaagat 22374  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22373 atgttgatattaattgagcatga 22351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39083 - 38851
Alignment:
Q  6 aggagcagagagaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagt 105  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  39083 aggatcagagggaacctagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaact 38984  T
Q  106 tgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagag 205  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  38983 tgattatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaag 38884  T
Q  206 ttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 239  Q
     |  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  38883 ct-attgagttaagttgatattatttgagcatga 38851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10545 - 10291
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  10545 gaacccagaacaacattagttggggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgt 10446  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||  ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||  ||||||| |    
T  10445 ttgtgcgatctgtgtcacacgttttgatcaagagtgagtccctttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcaatatgtaaagccgtttaagat 10346  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  10345 atgttgatattaattgagcatgaattaatgtattatacatt-atgtaagatatgaa 10291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 242425 - 242171
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  242425 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 242326  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  242325 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 242226  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaa 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  242225 atgttgttattaattgagtatgagttaatgtattatgcatt-atgtaagatatgaa 242171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 78580 - 78292
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||  |||||||| ||    
T  78580 acccagaacaactttagtttgggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgctt 78481  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||||||||||||| || | |  |||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| |||    
T  78480 gtgcgatctgtgtcgcacgtttggaccaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgcaaaactgtttaagatat 78381  T
Q  219 gttgata-ttaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||| | ||||||||  |||   |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  78380 gttgaaatttaattgagtatg-tttaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaattatgatgcaattgatgtgctattgata 78292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 58156 - 58389
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||    
T  58156 gaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgt 58255  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||| |    
T  58256 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaggccgtttaagat 58355  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgtatt 250  Q
    |||| | ||||||||||  ||||  |||||||||    
T  58356 atgtggttattaattgagtatgagttaatgtatt 58389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 14732 - 15020
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||  || |||    |||||| |    
T  14732 aacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagagctctcgccttgtgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgct 14831  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  14832 tgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagata 14931  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||| || | | ||| |||||||| | | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  14932 tgttgatattaattgagcaag-attaaagtattgtacaattatgtaagatatgaaaatttaattatgatgcaattgatttgctattgata 15020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 481 - 193
Alignment:
Q  18 aacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||  || |||    |||||| |    
T  481 aacccagaacatcattagtttggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcacgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgct 382  T
Q  118 tgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtta 217  Q
    |||||||| ||||||||| || | | ||||||| |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||    
T  381 tgtgcgatttgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtttgtaaagctgtttaagata 282  T
Q  218 tgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    |||||||||||||||| || | | ||| |||||||| | | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||    
T  281 tgttgatattaattgagca-ggattaaagtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgattttctattgata 193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12810 - 12522
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |  |||  |||||||||||    
T  12810 acccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttcaagttttgagtgtcttgagtgttt 12711  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    || |||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||    
T  12710 gtacgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaggctgtttaagatat 12611  T
Q  219 gttgata-ttaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatgaagg-ttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||| | ||||||||  |||   |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  12610 gttgaaatttaattgagtatg-gttaatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaactatgatacaaatgatgtgctattgata 12522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 74362 - 74076
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  |  |||    |||||||||    
T  74362 acccagaacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgagcacctccagccttgagtgttatgagtgttt 74263  T
Q  119 gtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttat 218  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  74262 gtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta-agctgtttaagatat 74164  T
Q  219 gttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatat-gaaggttaataatgatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  74163 gttgatattgattgagtatg-attaaggtattgtatatttatgtaagatatggaagtttaattatgaaataattgatgtgctattgata 74076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37075 - 36903
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||    
T  37075 gaacccagaacagcattagcttggaacttgacttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgt 36976  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgttta 190  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36975 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaa-tggtaatgagacctaaagatgacgttta 36903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Original strand, 19382 - 19604
Alignment:
Q  84 gcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 183  Q
    ||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19382 gcgagcacttccagaatggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 19481  T
Q  184 acgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgtaagatatg-aaggttaataat 282  Q
    ||||||||||||  ||||| |   |||||||   |||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||| ||    
T  19482 acgtttaatgcaatctgtaaaaccgtttaagacgtgttgtcattaattgagcatg-attaatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattat 19580  T
Q  283 gatgcaatttatgtgctattgata 306  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  19581 gatgcaattgatttgctattgata 19604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 32050 - 32225
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtg 115  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||| |||    
T  32050 gaacccagaacaaccttag-ttgggagattgagtggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtt-tttgtgtg 32147  T
Q  116 tttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatg 193  Q
    ||||||||||||||||||||    ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  32148 tttgtgcgatctgtgtcgcaccatttgatcaagagtggacccctaattggtaatgaaacctaaggataacgtttaatg 32225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Original strand, 24713 - 24943
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 116  Q
    ||||| |||| || ||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||  | ||| || |||   ||||||||    
T  24713 gaacctagaataacattagttggggagttggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttctagattggagtgcattgagtgt 24812  T
Q  117 ttgtgcgatctgtgtcgcaggtgttggtcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||| ||| ||||||  | |||  |  ||||||| |    
T  24813 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcaacgaaacctaatgatgatgttaaatgcaatcagtaaggccgtttaagat 24912  T
Q  217 atgttgatattaattgaacatgaactaatgt 247  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  24913 atgttgacattaattgagcatgaattaatgt 24943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 3614 - 3697
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3614 gaacccagaacaacactagttagggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaat 3697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12790 - 12715
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaca 92  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790 gaacctagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaca 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 3077 - 3006
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 88  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3077 gaacccagaacaacgttagtttgggaattgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 3006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 267
Target Start/End: Original strand, 8732 - 8841
Alignment:
Q  157 cctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatat 256  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||    
T  8732 cctaattggtaatgaaacctaatgatgatgtttaatgcagtctgtaaagttgtttaatatatgttgatgttaattgagcatgaattaatgtattatacat 8831  T
Q  257 tcatgtaagat 267  Q
    | |||||||||    
T  8832 t-atgtaagat 8841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 8615 - 8696
Alignment:
Q  17 gaacccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaga 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8615 gaacccagaacaacattaggttggaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcactaccaga 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3138 - 3068
Alignment:
Q  19 acccagaacaagattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagc 89  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3138 acccagaacaaccttagtttgggaattgtttggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagc 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3031 - 2924
Alignment:
Q  163 tggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatgaactaatgtattgtatattcatgt 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||||| || ||| ||||    
T  3031 tggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtccaagatatgttgatattaattgagcatg-agttatgtattatacatt-atgt 2934  T
Q  263 aagatatgaa 272  Q
    ||||||||||    
T  2933 aagatatgaa 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4089 - 4049
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcac 91  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4089 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcac 4049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8520 - 8480
Alignment:
Q  51 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcac 91  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8520 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcac 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University