View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21673_high_13 (Length: 314)

Name: NF21673_high_13
Description: NF21673
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21673_high_13
NF21673_high_13
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (3-294)||(9543687-9543978)
chr7 (3-294)||(6536087-6536378)
chr7 (3-294)||(5389618-5389909)
chr7 (3-294)||(26305159-26305450)
chr7 (3-294)||(26361368-26361659)
chr7 (3-294)||(32099983-32100274)
chr7 (3-294)||(44898902-44899193)
chr7 (3-294)||(8502652-8502943)
chr7 (3-294)||(16140631-16140922)
chr7 (3-294)||(46498717-46499008)
chr7 (3-279)||(42596961-42597237)
chr7 (3-294)||(13283877-13284168)
chr7 (69-242)||(14643279-14643452)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (3-294)||(27413751-27414042)
chr5 (3-294)||(26200772-26201063)
chr5 (3-294)||(33940923-33941214)
chr5 (3-294)||(18362880-18363171)
chr5 (3-279)||(20949458-20949734)
chr5 (23-278)||(23375368-23375615)
chr5 (61-226)||(22456358-22456523)
chr5 (29-150)||(5601807-5601928)
chr5 (69-242)||(20037353-20037526)
chr5 (69-156)||(24299175-24299262)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (3-294)||(16254836-16255127)
chr4 (3-294)||(6693821-6694112)
chr4 (3-279)||(520375-520651)
chr4 (3-294)||(17150976-17151267)
chr4 (3-294)||(7844905-7845196)
chr4 (68-156)||(26813600-26813688)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (3-294)||(21211417-21211708)
chr8 (3-294)||(14892199-14892490)
chr8 (3-292)||(22832342-22832631)
chr8 (69-226)||(33600415-33600572)
chr8 (69-156)||(18234027-18234114)
chr8 (69-156)||(18243478-18243565)
chr8 (69-156)||(12916656-12916743)
chr8 (61-156)||(25035933-25036028)
chr8 (61-156)||(25049970-25050065)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (3-294)||(45015956-45016247)
chr2 (3-294)||(9512211-9512502)
chr2 (3-294)||(18652821-18653112)
chr2 (3-279)||(27168448-27168724)
chr2 (3-294)||(22903742-22904033)
chr2 (29-150)||(1792183-1792304)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (3-294)||(31359164-31359455)
chr6 (3-294)||(16899549-16899840)
chr6 (3-294)||(18161668-18161959)
chr6 (3-279)||(34766959-34767235)
chr6 (3-294)||(18710425-18710716)
chr6 (3-294)||(18704490-18704781)
chr6 (95-294)||(29561121-29561320)
chr6 (3-100)||(29542050-29542147)
chr6 (69-156)||(25895804-25895891)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (3-294)||(6423910-6424201)
chr3 (3-294)||(9538738-9539029)
chr3 (3-294)||(8974449-8974740)
chr3 (3-215)||(12387590-12387802)
chr3 (29-150)||(48979901-48980022)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (3-294)||(16156486-16156777)
chr1 (3-279)||(1987651-1987927)
chr1 (3-264)||(22959930-22960190)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-279)||(6030-6306)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (3-294)||(148311-148602)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (3-279)||(7372-7648)
scaffold0313 (3-279)||(11154-11430)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (3-294)||(52979-53268)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (83-292)||(1-210)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-278)||(16850-17097)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (125-294)||(27670-27839)
scaffold0141 (3-131)||(20378-20506)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (125-294)||(86973-87142)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (3-165)||(128-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (17-264)||(189005-189251)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (69-156)||(258166-258253)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9543978 - 9543687
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9543978 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactaagatgtct 9543879  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9543878 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcacccaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatcttattggttcactgagagctcatgaa 9543779  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  9543778 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaagctcatcagctgctgaagatgatgt 9543687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 6536087 - 6536378
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6536087 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 6536186  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6536187 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 6536286  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6536287 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5389909 - 5389618
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5389909 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 5389810  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5389809 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 5389710  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  5389709 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 5389618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 26305159 - 26305450
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26305159 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 26305258  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26305259 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 26305358  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26305359 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26305450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26361659 - 26361368
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26361659 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 26361560  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26361559 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 26361460  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26361459 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 32099983 - 32100274
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32099983 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 32100082  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32100083 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 32100182  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  32100183 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 32100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 44898902 - 44899193
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44898902 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 44899001  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44899002 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 44899101  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  44899102 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 44899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 8502652 - 8502943
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8502652 atgaaatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 8502751  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8502752 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 8502851  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8502852 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16140922 - 16140631
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16140922 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 16140823  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16140822 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 16140723  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16140722 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 46498717 - 46499008
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46498717 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 46498816  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46498817 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 46498916  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  46498917 gttgtactttaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaactccatcagttgctgatgaagatgt 46499008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 42596961 - 42597237
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  42596961 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgcct 42597060  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42597061 tccaagtatgtagagacctatggtcactgcaatcactgaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcatttgttcactgagagctcatgaa 42597160  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  42597161 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcaacaaacctcatcagt 42597237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13284168 - 13283877
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  13284168 atgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaatgaaatgagatctcttgggaaggcatactccactcatgagagaatcagaaaaatattaagatgcct 13284069  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13284068 tccaagtatgtggagacctatggtcacttcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcacttagagctcatgaa 13283969  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||    
T  13283968 gttgtacttcaaggagacaaactagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagtaaacttcatcagtaactgatgatgatgt 13283877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14643452 - 14643279
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||  |||    
T  14643452 ctcatgacagaattagaaaaatattaagatgtctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggccct 14643353  T
Q  169 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 242  Q
     || ||||| |||||  | || |||||||||||| || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14643352 agaggatcttattggaacgcttagagctcatgaaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14643279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 27413751 - 27414042
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413751 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 27413850  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27413851 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 27413950  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  27413951 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 27414042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26201063 - 26200772
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26201063 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 26200964  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26200963 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 26200864  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26200863 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 33940923 - 33941214
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33940923 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 33941022  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33941023 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 33941122  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33941123 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 33941214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 18362880 - 18363171
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18362880 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 18362979  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18362980 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 18363079  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18363080 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 20949458 - 20949734
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20949458 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 20949557  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949558 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaggatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 20949657  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20949658 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 20949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23375615 - 23375368
Alignment:
Q  23 actacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacaccta 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     |||||||||||| |||||    
T  23375615 actacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggagaccta 23375521  T
Q  123 tggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaa 222  Q
    |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23375520 tgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaagacaa 23375424  T
Q  223 accagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23375423 accagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 23375368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22456523 - 22456358
Alignment:
Q  61 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatct 160  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||     
T  22456523 atattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtcttcctaatatatggagacctatggttacagaaatcactcaagccaaagatttaaattcc 22456424  T
Q  161 atgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaacca 226  Q
     ||    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22456423 ttggctttagaagatctcattggaacactaagagctcatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 22456358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 5601807 - 5601928
Alignment:
Q  29 atagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtca 128  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |    
T  5601807 atagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgtcttccaactcaatggagacccatggtta 5601906  T
Q  129 ctgcaatcactcaggccaaaga 150  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  5601907 cggcaatcactcaagctaaaga 5601928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 20037353 - 20037526
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 168  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| |||| ||  ||    |    
T  20037353 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaacacgtggagacctatggttacaacaatcactcaagccaacgatctaaattccttggcttt 20037452  T
Q  169 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 242  Q
     ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  20037453 agaaaatctcattggaacacttagagctcatgaagttctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 20037526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24299262 - 24299175
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24299262 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 24299175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 16254836 - 16255127
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16254836 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaatattgagatgtct 16254935  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254936 tccaagtatgtggagacctatggtcactgtaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 16255035  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255036 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgctgatgatgatgt 16255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 6693821 - 6694112
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6693821 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 6693920  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6693921 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 6694020  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6694021 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 520651 - 520375
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  520651 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaaacatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 520552  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520551 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 520452  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  520451 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 17150976 - 17151267
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  17150976 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagatatcttgaaaaggcatattctactcatgtttgaattagaaaaatattaagatgtct 17151075  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17151076 tccaagtgtttggagacctatggtcaatgcaattactcaggccaaagatttataatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 17151175  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  17151176 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 17151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7845196 - 7844905
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  7845196 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcttattctacttatgatagaatcagaaaaatattaagatgtct 7845097  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7845096 tccaagtgtatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaatctagaagatctcattggctcattgagagctcatgaa 7844997  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  7844996 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgcattgaaagcatctcaacaaagctcattagtagctgatgatgatgt 7844905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 26813600 - 26813688
Alignment:
Q  68 actcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  26813600 actcatgatcgaataagaaaaattttaagatgtcttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 26813688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21211708 - 21211417
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21211708 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 21211609  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21211608 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 21211509  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  21211508 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgatgatgaagatgt 21211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14892490 - 14892199
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14892490 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggtatattctactcatgatagaattagaaaaatattgagatgtct 14892391  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892390 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggcagaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 14892291  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14892290 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 14892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 292
Target Start/End: Original strand, 22832342 - 22832631
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||||||    
T  22832342 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattccactcatgaaagaatcggaaagattccgagatgtct 22832441  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22832442 tccaattatgtggagacctatcgtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcctgaa 22832541  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgat 292  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  22832542 gtagtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgat 22832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33600572 - 33600415
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 168  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |  || |||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||  ||    |    
T  33600572 ctcatgacagaatcagaaaaatcctcagatgtcttcctaaaatatggagacctatggttacagcaatcactcaatccaaagacttaaattccttggcttt 33600473  T
Q  169 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaacca 226  Q
     ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33600472 agaagatctcattggaacactaagagcccatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 33600415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 18234027 - 18234114
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18234027 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18234114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 18243478 - 18243565
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18243478 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18243565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 12916656 - 12916743
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  12916656 ctcatgacagaattagaaaaatattaagatgtctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagacaaagatctaaa 12916743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25036028 - 25035933
Alignment:
Q  61 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25036028 atattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25035933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25050065 - 25049970
Alignment:
Q  61 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25050065 atattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25049970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 45015956 - 45016247
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015956 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 45016055  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45016056 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 45016155  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45016156 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagtcaagctcatcagttgctgatgatgatgt 45016247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9512502 - 9512211
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9512502 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 9512403  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9512402 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 9512303  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  9512302 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 9512211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 18652821 - 18653112
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18652821 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 18652920  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18652921 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 18653020  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18653021 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 18653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27168724 - 27168448
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27168724 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 27168625  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168624 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 27168525  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27168524 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaagtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 22903742 - 22904033
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| | ||| ||||||||| |||| || ||    
T  22903742 atgagatgtatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagacatatttcactcatgagataatcagaaaaatattgagttgcct 22903841  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903842 tccaagtatgtggagacctatggtaactgcaattactcaggccaaagatttgaaatctatgaacttggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 22903941  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||    
T  22903942 gttgtacttcaaggagacaaaccaatgaagaaggtaaagtcacttgccttaaaagcctctcagcaaacctcatcagtagctgaagatgatgt 22904033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 1792183 - 1792304
Alignment:
Q  29 atagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtca 128  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |    
T  1792183 atagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgtcttccaactcaatggagacccatggtta 1792282  T
Q  129 ctgcaatcactcaggccaaaga 150  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  1792283 cggcaatcactcaagctaaaga 1792304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 31359164 - 31359455
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31359164 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 31359263  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31359264 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 31359363  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  31359364 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 31359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 16899549 - 16899840
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16899549 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattcaactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 16899648  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16899649 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 16899748  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16899749 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 18161668 - 18161959
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18161668 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 18161767  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18161768 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 18161867  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18161868 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18161959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 34766959 - 34767235
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34766959 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 34767058  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34767059 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 34767158  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34767159 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 34767235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18710716 - 18710425
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  18710716 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtct 18710617  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18710616 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgca 18710517  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18710516 gttgtacttcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18710425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18704781 - 18704490
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  18704781 atgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtct 18704682  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18704681 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgca 18704582  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18704581 gttgtacttcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18704490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 294
Target Start/End: Original strand, 29561121 - 29561320
Alignment:
Q  95 agatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagag 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29561121 agatgtctttcaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 29561220  T
Q  195 ctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  29561221 ctcatgaagtcgtacttcaaggagataaaccagtgaagaatgtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 29561320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 29542050 - 29542147
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 100  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  29542050 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgaaatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 29542147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 25895804 - 25895891
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25895804 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 25895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 6423910 - 6424201
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6423910 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgaggtgtct 6424009  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6424010 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctataaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 6424109  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  6424110 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 6424201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 9538738 - 9539029
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9538738 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 9538837  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9538838 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 9538937  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  9538938 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 9539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 8974449 - 8974740
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8974449 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 8974548  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8974549 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 8974648  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  8974649 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 8974740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 12387590 - 12387802
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  12387590 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatcttttggaaaggcatattccacttatgagagagtcagaaaaatattgagatgcct 12387689  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12387690 tccaagtatgcgaagacctatggtcactgcaattactcaggctaaatatttacaatatatgaacttggaagatctcattgattcactgatagctcatgaa 12387789  T
Q  203 gttgtacttcaag 215  Q
    |||||||||||||    
T  12387790 gttgtacttcaag 12387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 48979901 - 48980022
Alignment:
Q  29 atagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtca 128  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |    
T  48979901 atagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgtcttccaactcaatggagacccatggtta 48980000  T
Q  129 ctgcaatcactcaggccaaaga 150  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  48980001 cggcaatcactcaagctaaaga 48980022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 16156486 - 16156777
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16156486 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgataaaattagaaaaatactgagatgtct 16156585  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16156586 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggcaaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 16156685  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16156686 gttgtacttcaacgagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacctgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16156777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1987927 - 1987651
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  1987927 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgact 1987828  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1987827 tccaagtatgtggagacctatggtcactgaaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaatctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 1987728  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1987727 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaatctcatcagt 1987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 22959930 - 22960190
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    |||| |||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | |||| | |||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  22959930 atgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatataccactcatgatagaatcaggaagatactaagatgtct 22960029  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22960030 tccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgactttggaagaactca-tggttcactaagagctcatgaa 22960128  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 264  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  22960129 gttatactttaaggagataaaccagtgaggaaggtaaaatcacttaccttaaaagcttctca 22960190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6306 - 6030
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6306 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 6207  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6206 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 6107  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6106 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 148311 - 148602
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  148311 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattatactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtct 148410  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  148411 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctagaggatctcattggttcactgagagctcatgac 148510  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  148511 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaagtaaaaacacttaccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 148602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7648
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7372 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 7471  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 7571  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7572 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 11154 - 11430
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11154 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 11253  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11254 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 11353  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11354 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 11430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 53268 - 52979
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  53268 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaata--gagatgtct 53171  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53170 tccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctcgaagatctcattggatcactgagagctcatgaa 53071  T
Q  203 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  53070 gttatacttcaaggagacaaactagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcatcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 52979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 83 - 292
Target Start/End: Original strand, 1 - 210
Alignment:
Q  83 agaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agaaaaatattgagatgtcttccaagtatttggagacctatggtcactgcaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 100  T
Q  183 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacactttccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgc 200  T
Q  283 tgatgatgat 292  Q
    ||||||||||    
T  201 tgatgatgat 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Original strand, 16850 - 17097
Alignment:
Q  23 actacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacaccta 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     |||||||||||| |||||    
T  16850 actacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggagaccta 16944  T
Q  123 tggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaa 222  Q
    |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16945 tgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaagacaa 17041  T
Q  223 accagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17042 accagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 27670 - 27839
Alignment:
Q  125 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 224  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27670 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 27769  T
Q  225 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  27770 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 27839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 20378 - 20506
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  20378 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtct 20477  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactg 131  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20478 tccaagaatgtggagacctatggtcactg 20506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 87142 - 86973
Alignment:
Q  125 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 224  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  87142 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 87043  T
Q  225 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  87042 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 86973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 128 - 290
Alignment:
Q  3 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 102  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  128 atgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttagaaaagcatattccactcatgaaagaataagaaaaataatgagatgtct 227  T
Q  103 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaa 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  228 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 189251 - 189005
Alignment:
Q  17 agatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtgga 116  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | ||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  189251 agattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatagcactcatgatagaattaggaagatactaagatgtcttccaagtacatgga 189152  T
Q  117 cacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagg 216  Q
      ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  189151 ggcctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgactttggaagtactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaagg 189053  T
Q  217 agacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 264  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  189052 agataaaccaatgagaaaggtaaaatcacttgccttaaaagcttctca 189005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 258166 - 258253
Alignment:
Q  69 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 156  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  258166 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaaaacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 258253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University