View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21675_high_21 (Length: 360)

Name: NF21675_high_21
Description: NF21675
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21675_high_21
NF21675_high_21
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (22-348)||(13880979-13881305)
chr6 (15-348)||(35203678-35204011)
chr6 (15-348)||(25943902-25944235)
chr6 (15-348)||(17692467-17692803)
chr6 (21-346)||(22348592-22348913)
chr6 (23-285)||(14739769-14740034)
chr6 (33-285)||(33333283-33333538)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (22-348)||(10096421-10096747)
chr3 (22-348)||(10203307-10203633)
chr3 (15-348)||(29911568-29911901)
chr3 (15-348)||(54190741-54191074)
chr3 (15-304)||(6305544-6305833)
chr3 (15-348)||(10899242-10899575)
chr3 (15-348)||(16459697-16460030)
chr3 (22-348)||(10610387-10610714)
chr3 (16-348)||(22623594-22623926)
chr3 (22-348)||(47880503-47880829)
chr3 (23-285)||(1308496-1308761)
chr3 (33-283)||(8514721-8514974)
chr3 (47-285)||(22170529-22170770)
chr3 (33-283)||(32477967-32478220)
chr3 (36-183)||(2674430-2674577)
chr3 (33-285)||(3325745-3326000)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (15-348)||(39684480-39684813)
chr2 (15-348)||(2738438-2738771)
chr2 (15-348)||(20052376-20052708)
chr2 (21-348)||(17934323-17934650)
chr2 (15-348)||(22714849-22715182)
chr2 (22-211)||(45569630-45569819)
chr2 (23-285)||(25393511-25393776)
chr2 (33-285)||(19346903-19347158)
chr2 (83-189)||(39485478-39485584)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (15-348)||(9523961-9524294)
chr1 (15-343)||(2396875-2397203)
chr1 (236-285)||(41395876-41395925)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (15-348)||(28330128-28330461)
chr8 (15-348)||(28892997-28893330)
chr8 (15-348)||(16754875-16755208)
chr8 (15-348)||(4814841-4815174)
chr8 (21-348)||(21039670-21039996)
chr8 (22-275)||(25682552-25682805)
chr8 (15-350)||(33034874-33035208)
chr8 (15-348)||(15946896-15947229)
chr8 (8-285)||(26298998-26299278)
chr8 (23-285)||(10686461-10686726)
chr8 (33-285)||(18867877-18868132)
chr8 (33-285)||(35743014-35743269)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (15-348)||(3322403-3322736)
chr7 (15-348)||(7072284-7072617)
chr7 (15-348)||(25407647-25407980)
chr7 (15-348)||(44012146-44012478)
chr7 (15-111)||(25353585-25353681)
chr7 (23-285)||(24263520-24263785)
chr7 (23-285)||(9187342-9187607)
chr7 (33-283)||(16882554-16882807)
chr7 (23-285)||(18411282-18411547)
chr7 (33-285)||(21986545-21986800)
chr7 (33-150)||(21643800-21643917)
chr7 (236-285)||(24272313-24272362)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (15-348)||(759-1092)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (15-348)||(25447720-25448054)
chr5 (23-285)||(43594746-43595011)
chr5 (23-285)||(43627540-43627805)
chr5 (23-285)||(37558799-37559064)
chr5 (23-285)||(27447448-27447713)
chr5 (33-285)||(24557791-24558046)
chr5 (33-285)||(24598823-24599078)
chr5 (33-285)||(33788981-33789236)
chr5 (33-283)||(31399199-31399452)
chr5 (33-285)||(28835927-28836181)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (23-348)||(15314557-15314883)
chr4 (15-284)||(4567572-4567841)
chr4 (15-348)||(36769823-36770156)
chr4 (15-348)||(47564946-47565279)
chr4 (15-348)||(16634724-16635039)
chr4 (33-285)||(9226608-9226863)
chr4 (33-285)||(18858201-18858456)
chr4 (33-285)||(5145533-5145788)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (15-348)||(18559-18892)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (15-125)||(49044-49154)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (23-285)||(16506-16771)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (15-285)||(133-406)
scaffold0006 (15-285)||(8289-8562)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (121-189)||(34734-34802)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 13880979 - 13881305
Alignment:
Q  22 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880979 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggacaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 13881078  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881079 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 13881178  T
Q  222 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13881179 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagagaaacttca 13881278  T
Q  322 gtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13881279 gtttgaggtggagcctatcactgatga 13881305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35204011 - 35203678
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35204011 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 35203912  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35203911 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 35203812  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35203811 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacagaga 35203712  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35203711 aaattcagtttgaggtggagcctatcactgatga 35203678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 25943902 - 25944235
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  25943902 catcaacagagatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 25944001  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25944002 tgtgagactagacaaacttgatgctagagctgtgaaatgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 25944101  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || ||| |    
T  25944102 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacgaagatagaaa 25944201  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25944202 aaattcagttttaggtggagcctatcactgatga 25944235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17692803 - 17692467
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  17692803 catcaacagggatagatcttaagacacatatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggggctttagcgtttgctca 17692704  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17692703 tgtcagacaagacaaacttgatgttagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaggttgtggaagatggaacctgga 17692604  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagca---gggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacag 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||    
T  17692603 ggatcaaaatttattataagcaggggggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctagatacaagctcgaaaacggggatag 17692504  T
Q  312 agaaacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17692503 agaaaattcagtttgaggtggagcctaccactaatga 17692467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22348913 - 22348592
Alignment:
Q  21 cagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcag 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  22348913 cagggatagatctcaagacacctatggagatttggagtgggagaccagtaggctactctaacttgaaggttttcggagctttagcattttctcatgtcag 22348814  T
Q  121 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatca 220  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22348813 acaagataaacttgatgctagagctgtgaagtgtattta----ggttatccttaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggaggatca 22348718  T
Q  221 aaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttc 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||    
T  22348717 aaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagttcagaaacggggatagagaaaattc 22348618  T
Q  321 agtttgaggtggagcctatcactgat 346  Q
    | |||||||||||||||| |||||||    
T  22348617 aatttgaggtggagcctaccactgat 22348592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 14739769 - 14740034
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  14739769 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 14739868  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  14739869 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 14739968  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  14739969 aagagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 14740034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Original strand, 33333283 - 33333538
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  33333283 tcaagatacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 33333382  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||  ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  33333383 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatcaggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 33333482  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  33333483 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 33333538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10096747 - 10096421
Alignment:
Q  22 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10096747 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggacaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 10096648  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10096647 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 10096548  T
Q  222 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10096547 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagagaaacttca 10096448  T
Q  322 gtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10096447 gtttgaggtggagcctatcactgatga 10096421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10203633 - 10203307
Alignment:
Q  22 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10203633 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 10203534  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10203533 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 10203434  T
Q  222 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 321  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10203433 aatttattataaacagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcataaacggggacagagaaacttca 10203334  T
Q  322 gtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10203333 gtttgaggtggagcctatcactgatga 10203307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29911901 - 29911568
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29911901 catcaacaaggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaaatcttcggagctttagcgtttgctca 29911802  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29911801 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 29911702  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  29911701 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcgaaaacggggatagaga 29911602  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29911601 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 29911568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 54190741 - 54191074
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  54190741 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttaaaagttttcggagctttagcgtttgctca 54190840  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54190841 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 54190940  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  54190941 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 54191040  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54191041 aaattcagtttgaggtggagcctatcactgatga 54191074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 6305544 - 6305833
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305544 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 6305643  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305644 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 6305743  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacg 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6305744 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacg 6305833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 10899242 - 10899575
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||    
T  10899242 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttaaaagttttcagagctttagcatttgctca 10899341  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10899342 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 10899441  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10899442 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatgcaagctcggaaacggggacagaga 10899541  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10899542 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 10899575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 16459697 - 16460030
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16459697 catcaacagggatagatctcaacacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgcgca 16459796  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16459797 tgtcatgcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 16459896  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16459897 ggatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacagaga 16459996  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16459997 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 16460030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10610714 - 10610387
Alignment:
Q  22 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  10610714 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctcatgtcaga 10610615  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10610614 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggaggatcaa 10610515  T
Q  222 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacgggga-cagagaaacttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||    
T  10610514 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggataaaagaaaattc 10610415  T
Q  321 agtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10610414 agtttgaggtggagcctaccactaatga 10610387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22623926 - 22623594
Alignment:
Q  16 atcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccat 115  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22623926 atcaacagggatagatctcaaaacacctatggagttttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctcat 22623827  T
Q  116 gtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22623826 gtcaggcaagacaaacttgatgctagagctatgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggag 22623727  T
Q  216 aatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaa 315  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  22623726 gatcaaaatttataataagcagggatgttacttttgatgagacccgaatggggatgaagtgcaaagacttggatataagctcgaaaacggggacagagaa 22623627  T
Q  316 acttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22623626 aattcagtttgaggtggaacctatcactgatga 22623594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47880829 - 47880503
Alignment:
Q  22 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||     
T  47880829 agggatagatctcaagacacctatgtaggtttggagtgggagaccggcagactactctaatttgaaagtttttggagctttagcatttgcttatgtcaga 47880730  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 221  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47880729 caggacaaacttgattctagagctgtgaagtgtattttcatgggatatcctgaaggtgtgaaaggttacagactatggaagatggaacctggaggatcaa 47880630  T
Q  222 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 321  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  47880629 aatttattataagcaaggatgttacttttgatgagacccgcatgaagatgaagtataaagacctggatacaagcttagaaactggggtagagaaaattca 47880530  T
Q  322 gtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  47880529 gtttgtggtggagcctaccagtgatga 47880503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1308761 - 1308496
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  1308761 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 1308662  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  1308661 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 1308562  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  1308561 aaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 1308496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8514974 - 8514721
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  8514974 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 8514875  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  8514874 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 8514775  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 283  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  8514774 ataagtagggatgttaccttcgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagac 8514721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 285
Target Start/End: Original strand, 22170529 - 22170770
Alignment:
Q  47 gaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctg 146  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||     
T  22170529 gaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctt 22170628  T
Q  147 tgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttattataagcagggatgt 243  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||    
T  22170629 tgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttgataagtagggatgt 22170728  T
Q  244 tacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22170729 tacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 22170770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32478220 - 32477967
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  32478220 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 32478121  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  32478120 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 32478021  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 283  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  32478020 ataagtagggatgttaccttcgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagac 32477967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Original strand, 2674430 - 2674577
Alignment:
Q  36 agacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaacttga 135  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  2674430 agacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttga 2674529  T
Q  136 tgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 183  Q
      |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2674530 gcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 2674577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Original strand, 3325745 - 3326000
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||  | ||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||  ||    
T  3325745 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaactagaagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacatgct 3325844  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||| ||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  3325845 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtgaaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 3325944  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3325945 attagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 3326000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 39684480 - 39684813
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684480 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggaagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 39684579  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684580 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 39684679  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39684680 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagaga 39684779  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684780 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 39684813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 2738438 - 2738771
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738438 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagatcggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 2738537  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738538 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgagaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 2738637  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2738638 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatgcaagctcggaaacggggacagaga 2738737  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738738 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 2738771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20052708 - 20052376
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  20052708 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcg-agctttagcgtttgctca 20052610  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20052609 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagaccgtggaagatggaacctgga 20052510  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  20052509 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 20052410  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20052409 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 20052376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 17934323 - 17934650
Alignment:
Q  21 cagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcag 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17934323 cagggataggtctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcatttgcccatgtcag 17934422  T
Q  121 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatca 220  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17934423 acaagacaaacttgatgctagatatgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctagagaatca 17934522  T
Q  221 aaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttc 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  17934523 aaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagagaaaattc 17934622  T
Q  321 agtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  17934623 agtttgaggtggagcctaccattgatga 17934650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22715182 - 22714849
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  22715182 catcaacagggatagatctcaacacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgttttctca 22715083  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22715082 tgtcattcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 22714983  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22714982 ggatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 22714883  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22714882 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 22714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Original strand, 45569630 - 45569819
Alignment:
Q  22 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45569630 agggatagaactcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatatcagg 45569729  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45569730 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacct 45569819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25393776 - 25393511
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || | ||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  25393776 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcatctttgaaggtttacggagctttggcatatgcacatatcaagc 25393677  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  25393676 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 25393577  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25393576 aagagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 25393511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19347158 - 19346903
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  19347158 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 19347059  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   |||| ||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  19347058 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtgaaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 19346959  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  19346958 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 19346903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 189
Target Start/End: Original strand, 39485478 - 39485584
Alignment:
Q  83 ttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtga 182  Q
    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  39485478 ttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtga 39485577  T
Q  183 aaggtta 189  Q
    | |||||    
T  39485578 agggtta 39485584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 9523961 - 9524294
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9523961 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 9524060  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524061 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 9524160  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9524161 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacagaga 9524260  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524261 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 9524294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2397203 - 2396875
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  2397203 catcaacatggatagatctcaaaacacctatggaggtttggagtgggagaccagtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 2397104  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2397103 tgtcaagcaggacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaagtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 2397004  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||    
T  2397003 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggacacaagctcagaaatgggggaagaga 2396904  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 343  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2396903 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 2396875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41395925 - 41395876
Alignment:
Q  236 agggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41395925 agggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 41395876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 28330128 - 28330461
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330128 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 28330227  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330228 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctaaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 28330327  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28330328 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttaatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagaga 28330427  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330428 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 28330461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 28892997 - 28893330
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28892997 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 28893096  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28893097 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 28893196  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28893197 gaatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagaga 28893296  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28893297 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 28893330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16755208 - 16754875
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755208 catcaacaaggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 16755109  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755108 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 16755009  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16755008 gaatcaaaatttataataagcagggatgttacttttgatgagacccgaatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacaaaga 16754909  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754908 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 16754875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4815174 - 4814841
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4815174 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcagagctttaacgtttgccca 4815075  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4815074 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 4814975  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4814974 ggatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatgcaagctcggaaacggggacagaga 4814875  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4814874 aaattcagtttgaggtggaccctatcactgatga 4814841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 21039670 - 21039996
Alignment:
Q  21 cagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcag 120  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  21039670 cagggatatatctcaagacacctatggaggtttgtagtgggagaccggtagactactctaacttgaatgttttcagagctttagcatttgctcatgtcag 21039769  T
Q  121 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatca 220  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21039770 acaagacaa-cttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctggaggatca 21039868  T
Q  221 aaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttc 320  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  21039869 aaatttattataagcaggtatgttacttttgataagatccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggagatagagaaaattc 21039968  T
Q  321 agtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
T  21039969 aatttgaggtggagcctaccactgatga 21039996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 25682552 - 25682805
Alignment:
Q  22 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25682552 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 25682651  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25682652 caagacaaacttgatgctaaagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggaggatcaa 25682751  T
Q  222 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagt 275  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25682752 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagt 25682805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Original strand, 33034874 - 33035208
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||| | ||    
T  33034874 catcaacagggatagatctgaagacacctatgaaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttaaaagtttttagagctttagcattttctca 33034973  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  33034974 tgtcagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatcgaacttgga 33035073  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||    
T  33035074 ggatcaaaatttattataagcagggatg-tacttttgatgagacccgcaaggggatgaagtggaaagacctgggaacaagctcagaaatgggggtagaga 33035172  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatgatg 350  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33035173 aaattcagtttgaggtggagcctaccgctgatgatg 33035208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 15946896 - 15947229
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |     
T  15946896 catcaacatggataaatctcaagacacctatggatgtttggagtgggagactgccagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgcacg 15946995  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| |   ||| ||||||  ||| ||||    
T  15946996 tgtcaaacatgacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtgtttttattggttatcttgaaggtgtgaaaggttacaagttgttgaagataaaacatgga 15947095  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |   | | |    
T  15947096 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgtatgagtatgaagtgcaaaaacctggaaacaagctcagaaacatgagtacata 15947195  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15947196 aaattcagtttaaggtggagcctaccactgatga 15947229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26299278 - 26298998
Alignment:
Q  8 agatggacatcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgt 107  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||| || |    
T  26299278 agatggccatcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggttttcggagctttggcat 26299179  T
Q  108 ttgcccatgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatgga 207  Q
     ||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||    
T  26299178 atgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattgga 26299079  T
Q  208 acc---tggagaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    | |   ||||| |||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  26299078 atctagtggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 26298998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 10686461 - 10686726
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  10686461 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 10686560  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  10686561 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 10686660  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10686661 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 10686726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Original strand, 18867877 - 18868132
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  18867877 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaatgttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 18867976  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  18867977 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 18868076  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18868077 attagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 18868132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35743269 - 35743014
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  35743269 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 35743170  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  35743169 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 35743070  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  35743069 ataagtagggatgttacctttgatgagacccgaatggggatgaagtgtaaagacct 35743014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3322736 - 3322403
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3322736 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 3322637  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3322636 tatcaggcaagacaaacttgatgctagagcggtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 3322537  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |    
T  3322536 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacaggaa 3322437  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3322436 aaattcagtttgaggtggagcctatcactgatga 3322403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 7072284 - 7072617
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7072284 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcatttgccca 7072383  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7072384 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggt 7072483  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7072484 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggagatgaagtgcaaagacatggatacaagctcggaaacggggacagaga 7072583  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7072584 aaattcagtttgaggtggagcctatcactgatga 7072617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 25407647 - 25407980
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25407647 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagacgggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctca 25407746  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25407747 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctaga 25407846  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  25407847 ggatcaaaaattattataagcagggatgttacttttgatgagacccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 25407946  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25407947 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 25407980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44012478 - 44012146
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  44012478 catcaacagggatagatttgaagacacttatagaggtttggagtgggagaccggcagactactctaatttgaaagtttt-ggagctttagcatttgctca 44012380  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  44012379 tgtcagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctgaa 44012280  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  | |||    
T  44012279 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggaaacaaactcagaaacgggggtataga 44012180  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44012179 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 44012146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Original strand, 25353585 - 25353681
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgc 111  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25353585 catcaacagggatagatctcaggacagctatggaggtttggagtgggagaccgttagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgc 25353681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 24263520 - 24263785
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  24263520 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 24263619  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  24263620 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 24263719  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24263720 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 24263785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 9187342 - 9187607
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    ||||| || || |||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  9187342 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcaaactactcatctttgaaggtttttggagctttggcatatgcgcatatcaagc 9187441  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  9187442 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagctgtggaaattggaatctagtggaggatc 9187541  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||||  | || || | ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  9187542 aaaagtcttgattagtatggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagagtaaagacct 9187607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16882807 - 16882554
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  16882807 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 16882708  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  16882707 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 16882608  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 283  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16882607 ataagtagggatgttaccttcgatgagacccagatggggatgaagtgtaaagac 16882554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18411547 - 18411282
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| || || ||||||||  | | ||| ||| ||| ||    
T  18411547 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggtttttggagctttgacatatgcgcatatcaagc 18411448  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | |||||  ||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  18411447 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcatttgttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 18411348  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18411347 aaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 18411282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21986800 - 21986545
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||||    ||||| || |||| |||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  21986800 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaatcggcagactactcatctttgaaggttttcgaagctttggcatatgcacatatcaagcaagacaagct 21986701  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||  ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  21986700 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatctggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 21986601  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  21986600 ataagtagggatgttacctttgatgagactcggatggggatgaagtgtaaagacct 21986545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21643917 - 21643800
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  21643917 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggctgattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 21643818  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaa 150  Q
    |||  |||||||| ||||    
T  21643817 tgagcctagagctttgaa 21643800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 24272313 - 24272362
Alignment:
Q  236 agggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24272313 agggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 24272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 759
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1092 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 993  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  992 tgttaggcaagacaaacttgatgctagagctgtaaaatgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 893  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  892 ggatcaaaatttattataagcaaggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcgaaaacagggacagaga 793  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  792 aaattcagtttgaggtggagcctatcactgatga 759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 25447720 - 25448054
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25447720 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctca 25447819  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctg-aaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgg 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25447820 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctga 25447919  T
Q  214 agaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagag 313  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  25447920 aggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaatggggatagag 25448019  T
Q  314 aaacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25448020 aaaattcagtttgaggtggagcctatcattgatga 25448054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43595011 - 43594746
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  43595011 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 43594912  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  43594911 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 43594812  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  43594811 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacct 43594746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43627805 - 43627540
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  43627805 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 43627706  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  43627705 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 43627606  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  43627605 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacct 43627540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 37558799 - 37559064
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  37558799 gggatagacttcaagacacttatggaggtatggagtgggaaaccggtggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 37558898  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  37558899 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 37558998  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  37558999 aagagtcgtgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 37559064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27447713 - 27447448
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  27447713 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 27447614  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  27447613 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 27447514  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || ||   | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  27447513 aagagccttgataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatgaggatgaagtgtaaagacct 27447448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Original strand, 24557791 - 24558046
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || || |||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  24557791 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggcagattactcatcattgaaggtttttggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 24557890  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  24557891 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 24557990  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24557991 attagcagggacgttacctttgatgagactcgtatggggatgaagtgtaaagacct 24558046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Original strand, 24598823 - 24599078
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || || |||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  24598823 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggcagattactcatcattgaaggtttttggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 24598922  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  24598923 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 24599022  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24599023 attagcagggacgttacctttgatgagactcgtatggggatgaagtgtaaagacct 24599078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33789236 - 33788981
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  33789236 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggtggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 33789137  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  33789136 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 33789037  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  33789036 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 33788981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 283
Target Start/End: Original strand, 31399199 - 31399452
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  31399199 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcgaattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 31399298  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  31399299 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 31399398  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 283  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  31399399 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagac 31399452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28836181 - 28835927
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||    ||||  || ||||||||||| || | |||  || ||| ||||||||| ||    
T  28836181 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggtagattactcatctttgatggttttcggagcttt-gcatatgcgtatatcaagcaagacaagct 28836083  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacct---ggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |   |||||||  ||||| ||   |||| |||||||||  |     
T  28836082 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgagaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 28835983  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  28835982 attagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 28835927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Original strand, 15314557 - 15314883
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcag-actactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15314557 gggatagatctcaagacacctatggatgtttggagtgggagaccggtaggactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgttttctcatgtcagg 15314656  T
Q  122 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15314657 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgagttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggaggatcaa 15314756  T
Q  222 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 321  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15314757 aatttattataagcagggatgttatttttgatgagacccacatggggatgaagtgcaaagacctagatacaagctcagaaacggggatagagaaaattca 15314856  T
Q  322 gtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15314857 gtttgaggtggagcctaccactgatga 15314883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Original strand, 4567572 - 4567841
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  4567572 catcaacatggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagatcggcagactactctaatttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 4567671  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4567672 tgtcagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 4567771  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacc 284  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4567772 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacc 4567841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 36769823 - 36770156
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  |    
T  36769823 catcaacagggatagatctcaagacacctatgaatgtttggagtgggagaccgggaaactactctaatttgaaagtttttggagctttagcatttgctta 36769922  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36769923 tgtcagacaggacatacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttattctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctgga 36770022  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||  |||||    
T  36770023 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaaaacccggaaacaagctcagaaacaggggtagaga 36770122  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36770123 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 36770156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 47564946 - 47565279
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  47564946 catcaacagggataaatctcaagacacctatggacgtttggagtgggagaccgacagactactctaatttgaaagtttttggagctttagcatttgctca 47565045  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  47565046 tgctagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctgaa 47565145  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  47565146 ggatcaaaatttattataagtagagatgttacttttgatgagacccgcatgtgaatgaagtgcaaagacctggaaacaagctcagaaacgggggtagaga 47565245  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47565246 aaattcagtttgaggtggagcctaccactgatga 47565279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 16634724 - 16635039
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  16634724 catcaacaaggatagatcttaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcaaactactctaatttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 16634823  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||| |                   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  16634824 tgtcaaacaggacaaacttgatgctagagtta------------------gttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctaga 16634905  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || | |    
T  16634906 ggatcaaaatttattataagcatggatgttacttttgatgaggcccgtatggggatgaagtgcaaagacctggaaacaagcttataaatgggggcacaaa 16635005  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16635006 aaattcagtttgaggtggatcctaccactgatga 16635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Original strand, 9226608 - 9226863
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  9226608 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 9226707  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  9226708 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 9226807  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  9226808 ataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 9226863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18858456 - 18858201
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  18858456 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 18858357  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  18858356 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 18858257  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18858256 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 18858201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5145788 - 5145533
Alignment:
Q  33 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 132  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| | ||||||| ||    
T  5145788 tcaagacacctatggaagtatggaatgggaaaccggcagactactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagaaagacaagct 5145689  T
Q  133 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 229  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | || ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  5145688 tgagactagagctttgaaatgtgtctttattcgttatccagaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 5145589  T
Q  230 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || || |||||| |||| |||||||||| ||  || ||||||||||| ||||||||    
T  5145588 attagtagggatattacctttgatgagacccgtatagggatgaagtgtaaagacct 5145533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 18559 - 18892
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18559 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggaggccggcaaactactctaatttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 18658  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 214  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18659 tgttagacaggacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaagctgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 18758  T
Q  215 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  18759 ggatcaaaatttattataagcagggatgtcacttttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggaggaagaga 18858  T
Q  315 aacttcagtttgaggtggagcctatcactgatga 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859 aaattcagtttgaggtggagcctatcactgatga 18892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 49154 - 49044
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49154 catcaacagggatagatctcgagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 49055  T
Q  115 tgtcaggcaag 125  Q
    |||||||||||    
T  49054 tgtcaggcaag 49044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 16506 - 16771
Alignment:
Q  23 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 122  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  16506 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 16605  T
Q  123 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 219  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  16606 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 16705  T
Q  220 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16706 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 16771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 133
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  406 catcaacaggaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaagcggcagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 307  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---t 211  Q
    | ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   |    
T  306 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 207  T
Q  212 ggagaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    |||| |||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  206 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8562 - 8289
Alignment:
Q  15 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 114  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  8562 catcaacaggaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaagcggcagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 8463  T
Q  115 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---t 211  Q
    | ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   |    
T  8462 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 8363  T
Q  212 ggagaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 285  Q
    |||| |||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  8362 ggaggatcaaaagtcttaattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 8289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34802 - 34734
Alignment:
Q  121 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggtta 189  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34802 gcaagacaagcttaaggctagagctgtgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggtta 34734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University