View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21676_high_17 (Length: 346)

Name: NF21676_high_17
Description: NF21676
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21676_high_17
NF21676_high_17
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-342)||(3552-3893)
[»] scaffold1365 (1 HSPs)
scaffold1365 (8-341)||(31-363)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (4-341)||(160984-161320)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (4-339)||(12255-12589)
[»] scaffold0382 (3 HSPs)
scaffold0382 (4-342)||(1375-1712)
scaffold0382 (4-342)||(6680-7017)
scaffold0382 (4-172)||(11938-12105)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (4-342)||(14908407-14908744)
chr4 (4-342)||(455722-456059)
chr4 (4-342)||(10295831-10296168)
chr4 (4-342)||(10745956-10746293)
chr4 (4-342)||(10959725-10960062)
chr4 (4-342)||(16849151-16849488)
chr4 (4-342)||(22001577-22001914)
chr4 (4-342)||(36023451-36023788)
chr4 (4-342)||(49512696-49513033)
chr4 (4-342)||(16261025-16261362)
chr4 (4-342)||(18757848-18758185)
chr4 (4-342)||(19949753-19950090)
chr4 (4-342)||(27820289-27820626)
chr4 (4-342)||(30931848-30932185)
chr4 (4-342)||(19606254-19606591)
chr4 (4-342)||(24645491-24645828)
chr4 (4-342)||(27193059-27193396)
chr4 (4-342)||(27661772-27662109)
chr4 (4-342)||(55750610-55750947)
chr4 (4-342)||(14841440-14841777)
chr4 (4-342)||(17923258-17923595)
chr4 (4-342)||(27171223-27171564)
chr4 (4-342)||(14845304-14845639)
chr4 (4-342)||(5017297-5017634)
chr4 (4-342)||(4993153-4993490)
chr4 (4-342)||(16310272-16310609)
chr4 (8-342)||(40462107-40462440)
chr4 (4-342)||(15202161-15202498)
chr4 (4-342)||(15467681-15468020)
chr4 (4-326)||(17242610-17242931)
chr4 (75-342)||(15009396-15009661)
chr4 (8-331)||(15875877-15876186)
chr4 (191-342)||(24023013-24023164)
chr4 (178-342)||(11453028-11453191)
chr4 (178-290)||(11533635-11533746)
chr4 (4-164)||(1272932-1273091)
chr4 (8-54)||(15006852-15006898)
chr4 (197-284)||(22125931-22126018)
chr4 (8-52)||(11533871-11533915)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (4-342)||(4175-4512)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (8-342)||(33134-33467)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (4-342)||(35220980-35221317)
chr5 (4-342)||(6981282-6981619)
chr5 (4-342)||(9341432-9341769)
chr5 (4-342)||(14452059-14452396)
chr5 (4-342)||(14563100-14563437)
chr5 (4-342)||(15745446-15745783)
chr5 (4-342)||(22151993-22152330)
chr5 (4-342)||(22681593-22681930)
chr5 (4-342)||(23483249-23483586)
chr5 (4-342)||(23702257-23702594)
chr5 (4-342)||(24572549-24572886)
chr5 (4-342)||(24821923-24822260)
chr5 (4-342)||(27047284-27047621)
chr5 (4-342)||(27465639-27465976)
chr5 (4-342)||(27617219-27617556)
chr5 (4-342)||(30232473-30232810)
chr5 (4-342)||(31838957-31839294)
chr5 (4-342)||(39357973-39358310)
chr5 (4-342)||(39495934-39496271)
chr5 (4-342)||(40395839-40396176)
chr5 (4-342)||(14035519-14035856)
chr5 (4-342)||(15998343-15998680)
chr5 (4-342)||(23301754-23302091)
chr5 (4-342)||(23367413-23367750)
chr5 (4-342)||(24813390-24813727)
chr5 (4-342)||(34777373-34777710)
chr5 (4-342)||(37735014-37735351)
chr5 (4-342)||(42048257-42048594)
chr5 (4-342)||(17612539-17612876)
chr5 (4-342)||(17724395-17724732)
chr5 (4-342)||(31354011-31354348)
chr5 (4-342)||(36587564-36587901)
chr5 (4-342)||(1116349-1116686)
chr5 (4-342)||(5295589-5295926)
chr5 (4-342)||(13528359-13528696)
chr5 (4-342)||(19469449-19469786)
chr5 (4-342)||(23401388-23401725)
chr5 (4-342)||(24934700-24935037)
chr5 (4-342)||(36693175-36693512)
chr5 (4-342)||(20557224-20557561)
chr5 (4-342)||(20785522-20785859)
chr5 (4-342)||(17451759-17452096)
chr5 (4-342)||(34057410-34057747)
chr5 (4-342)||(21671329-21671666)
chr5 (5-298)||(12860532-12860824)
chr5 (5-54)||(21520364-21520413)
chr5 (5-54)||(21530930-21530979)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (4-342)||(5838292-5838629)
chr1 (4-342)||(7512362-7512699)
chr1 (4-342)||(7694871-7695208)
chr1 (4-342)||(12618552-12618889)
chr1 (4-342)||(36241830-36242167)
chr1 (4-342)||(38100173-38100510)
chr1 (4-342)||(47613332-47613669)
chr1 (4-342)||(51651273-51651610)
chr1 (4-342)||(5645104-5645441)
chr1 (4-342)||(12735616-12735953)
chr1 (4-342)||(3176689-3177026)
chr1 (4-342)||(4172390-4172727)
chr1 (4-342)||(21868751-21869088)
chr1 (4-342)||(22126578-22126915)
chr1 (20-342)||(22446978-22447299)
chr1 (20-342)||(22452212-22452533)
chr1 (4-342)||(19165051-19165388)
chr1 (4-342)||(35643438-35643775)
chr1 (13-342)||(7684236-7684564)
chr1 (4-342)||(149071-149412)
chr1 (140-339)||(21129838-21130037)
chr1 (129-342)||(20934303-20934516)
chr1 (4-230)||(21211123-21211348)
chr1 (200-342)||(17720623-17720765)
chr1 (173-342)||(23390011-23390180)
chr1 (274-342)||(21211346-21211414)
chr1 (175-232)||(14423909-14423966)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (4-341)||(20984386-20984722)
chr7 (4-342)||(462424-462761)
chr7 (4-342)||(18433651-18433988)
chr7 (4-342)||(22094269-22094606)
chr7 (4-342)||(24739229-24739566)
chr7 (4-342)||(26395532-26395869)
chr7 (4-342)||(40047542-40047879)
chr7 (4-342)||(1992684-1993021)
chr7 (4-342)||(8622491-8622828)
chr7 (4-342)||(9090362-9090699)
chr7 (4-342)||(172018-172355)
chr7 (4-342)||(2711051-2711388)
chr7 (4-342)||(4217136-4217473)
chr7 (4-342)||(6872668-6873005)
chr7 (4-342)||(8007504-8007841)
chr7 (4-342)||(10651966-10652303)
chr7 (4-342)||(11010315-11010652)
chr7 (4-342)||(17955552-17955889)
chr7 (4-342)||(20998857-20999194)
chr7 (4-342)||(42870976-42871313)
chr7 (4-341)||(26691180-26691516)
chr7 (4-342)||(15883261-15883597)
chr7 (8-340)||(13661596-13661927)
chr7 (4-342)||(9164692-9165029)
chr7 (4-342)||(9438392-9438729)
chr7 (8-341)||(4417436-4417768)
chr7 (83-342)||(14138775-14139034)
chr7 (4-342)||(4824201-4824527)
chr7 (250-341)||(4420520-4420611)
chr7 (175-339)||(20540816-20540980)
chr7 (190-277)||(5169800-5169887)
chr7 (4-82)||(13126396-13126473)
chr7 (4-89)||(14141283-14141367)
chr7 (216-298)||(16158858-16158940)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (4-342)||(10355-10692)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (4-342)||(14233-14570)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (4-342)||(36262-36599)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (4-342)||(42349-42686)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (4-342)||(1692-2029)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (4-342)||(25679377-25679714)
chr8 (4-342)||(29081538-29081875)
chr8 (4-342)||(32083085-32083422)
chr8 (4-342)||(36298073-36298410)
chr8 (4-342)||(3354024-3354361)
chr8 (4-342)||(9346245-9346582)
chr8 (4-342)||(13693959-13694296)
chr8 (4-342)||(16741819-16742156)
chr8 (4-342)||(19133827-19134164)
chr8 (4-331)||(22668217-22668542)
chr8 (4-342)||(6156213-6156550)
chr8 (4-342)||(15786099-15786436)
chr8 (4-342)||(19229925-19230262)
chr8 (4-342)||(36083068-36083405)
chr8 (4-342)||(44486261-44486598)
chr8 (4-342)||(246955-247292)
chr8 (4-342)||(810075-810412)
chr8 (4-342)||(22151678-22152015)
chr8 (8-342)||(22466536-22466868)
chr8 (4-342)||(30320094-30320431)
chr8 (15-342)||(20377212-20377538)
chr8 (8-342)||(24650045-24650377)
chr8 (4-342)||(19423472-19423809)
chr8 (20-342)||(21293451-21293767)
chr8 (4-341)||(19934267-19934594)
chr8 (33-342)||(17293610-17293916)
chr8 (179-342)||(15080679-15080841)
chr8 (179-342)||(15165407-15165569)
chr8 (178-279)||(14977291-14977392)
chr8 (181-241)||(12798983-12799043)
chr8 (178-259)||(24588604-24588685)
chr8 (4-44)||(23788236-23788276)
chr8 (5-54)||(14977497-14977546)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (4-342)||(9117856-9118193)
chr6 (4-342)||(12722200-12722537)
chr6 (4-342)||(13918346-13918683)
chr6 (4-342)||(18829674-18830011)
chr6 (4-342)||(25792814-25793151)
chr6 (4-342)||(26030520-26030857)
chr6 (4-342)||(26869902-26870239)
chr6 (4-342)||(27346845-27347182)
chr6 (4-342)||(27407585-27407922)
chr6 (4-342)||(34812527-34812864)
chr6 (4-342)||(12860031-12860368)
chr6 (4-342)||(27498803-27499140)
chr6 (4-342)||(32967310-32967647)
chr6 (4-342)||(32306410-32306747)
chr6 (4-342)||(3666526-3666863)
chr6 (4-342)||(4636026-4636363)
chr6 (4-342)||(16954108-16954445)
chr6 (4-342)||(20035289-20035626)
chr6 (4-342)||(27377893-27378230)
chr6 (4-342)||(27468250-27468587)
chr6 (4-342)||(11248860-11249197)
chr6 (4-342)||(22381134-22381471)
chr6 (4-342)||(22810175-22810513)
chr6 (14-342)||(1655880-1656207)
chr6 (4-342)||(26038716-26039053)
chr6 (20-342)||(17052549-17052870)
chr6 (4-342)||(18920868-18921205)
chr6 (4-342)||(16881272-16881609)
chr6 (4-342)||(14064859-14065196)
chr6 (13-339)||(20138265-20138590)
chr6 (13-339)||(22194279-22194604)
chr6 (4-145)||(14058730-14058870)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (4-342)||(509524-509861)
chr3 (4-342)||(5542375-5542712)
chr3 (4-342)||(5622750-5623087)
chr3 (4-342)||(5871050-5871387)
chr3 (4-342)||(6215415-6215752)
chr3 (4-342)||(8779809-8780146)
chr3 (4-342)||(12291543-12291880)
chr3 (4-342)||(13378021-13378358)
chr3 (4-342)||(13388615-13388952)
chr3 (4-342)||(24388872-24389209)
chr3 (4-342)||(4748865-4749202)
chr3 (4-342)||(12242913-12243250)
chr3 (4-342)||(14470767-14471104)
chr3 (4-342)||(19783568-19783905)
chr3 (4-342)||(23762440-23762777)
chr3 (4-342)||(24665016-24665353)
chr3 (4-342)||(29938908-29939245)
chr3 (4-342)||(29988062-29988399)
chr3 (4-342)||(5198247-5198584)
chr3 (4-342)||(5515819-5516156)
chr3 (4-342)||(6495696-6496033)
chr3 (4-342)||(10632177-10632514)
chr3 (4-342)||(13126837-13127174)
chr3 (4-342)||(15656395-15656732)
chr3 (4-342)||(17964831-17965168)
chr3 (4-342)||(20678551-20678888)
chr3 (4-342)||(28319592-28319929)
chr3 (4-342)||(38199798-38200135)
chr3 (4-342)||(39377230-39377567)
chr3 (4-342)||(41688795-41689132)
chr3 (4-342)||(9001143-9001480)
chr3 (4-342)||(9385937-9386274)
chr3 (4-342)||(11277739-11278076)
chr3 (4-342)||(13144280-13144617)
chr3 (4-342)||(17901443-17901780)
chr3 (5-342)||(1058726-1059062)
chr3 (4-342)||(29466559-29466896)
chr3 (4-342)||(1789226-1789562)
chr3 (4-342)||(9987241-9987578)
chr3 (4-342)||(11211448-11211785)
chr3 (4-342)||(37871607-37871944)
chr3 (4-342)||(37880125-37880462)
chr3 (8-339)||(17250118-17250449)
chr3 (4-341)||(13267012-13267348)
chr3 (4-291)||(18127075-18127361)
chr3 (4-248)||(15838462-15838705)
chr3 (156-342)||(4409437-4409623)
chr3 (4-237)||(16439690-16439922)
chr3 (151-263)||(17011332-17011444)
chr3 (216-342)||(16424722-16424848)
chr3 (178-339)||(12751400-12751562)
chr3 (8-241)||(18703903-18704135)
chr3 (4-103)||(4428563-4428661)
chr3 (273-342)||(15838388-15838457)
chr3 (179-266)||(16216752-16216839)
chr3 (307-342)||(17011280-17011315)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (4-342)||(9768137-9768474)
chr2 (4-342)||(10272088-10272425)
chr2 (4-342)||(11400546-11400883)
chr2 (4-342)||(19307793-19308130)
chr2 (4-342)||(21126316-21126653)
chr2 (4-342)||(22939031-22939368)
chr2 (4-342)||(24809748-24810085)
chr2 (4-342)||(34795591-34795928)
chr2 (4-342)||(39175468-39175805)
chr2 (4-342)||(40245710-40246047)
chr2 (4-339)||(18944181-18944515)
chr2 (4-342)||(9902947-9903284)
chr2 (4-342)||(29249322-29249659)
chr2 (4-342)||(4214997-4215334)
chr2 (4-342)||(24333123-24333460)
chr2 (4-342)||(27226540-27226877)
chr2 (4-342)||(35258106-35258443)
chr2 (4-342)||(35268731-35269068)
chr2 (8-342)||(43087799-43088132)
chr2 (4-342)||(43350504-43350841)
chr2 (4-342)||(21167321-21167658)
chr2 (4-342)||(24720438-24720764)
chr2 (4-342)||(28726691-28727028)
chr2 (4-342)||(26872068-26872405)
chr2 (4-342)||(24420319-24420656)
chr2 (4-103)||(28706583-28706681)
chr2 (155-211)||(28706712-28706768)
chr2 (8-103)||(24513787-24513881)
[»] scaffold0863 (1 HSPs)
scaffold0863 (8-342)||(2836-3169)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (4-339)||(4050-4384)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (8-342)||(3555-3888)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (8-342)||(73537-73870)
scaffold0037 (8-342)||(85727-86060)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (4-342)||(130031-130368)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (4-342)||(11870-12207)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (4-342)||(30177-30514)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (4-342)||(38274-38611)
scaffold0047 (4-342)||(42139-42474)
scaffold0047 (127-331)||(3561-3765)
scaffold0047 (8-98)||(3771-3860)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (4-342)||(160359-160696)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (4-342)||(14775-15112)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (4-342)||(21578-21915)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (4-342)||(25572-25905)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (8-281)||(6060-6332)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (4-339)||(7158-7492)
scaffold0004 (117-342)||(3286-3511)
scaffold0004 (8-54)||(3548-3594)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (4-342)||(4764-5101)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (4-342)||(48332-48669)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (20-284)||(2510-2773)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (120-342)||(7467-7689)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (8-342)||(7898-8231)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (75-342)||(14172-14439)
scaffold0359 (4-54)||(10905-10955)
[»] scaffold0594 (1 HSPs)
scaffold0594 (68-339)||(1588-1859)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (8-264)||(38507-38760)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (178-342)||(48815-48979)
[»] scaffold1835 (1 HSPs)
scaffold1835 (24-326)||(601-901)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (24-241)||(10109-10325)
[»] scaffold1578 (1 HSPs)
scaffold1578 (8-203)||(530-724)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (5-339)||(74061-74394)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (4-342)||(7590-7945)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (4-54)||(13303-13353)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (269-339)||(42941-43011)


Alignment Details
Target: scaffold0183 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3893 - 3552
Alignment:
Q  1 aataaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3893 aataaaatatagaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaata 3794  T
Q  101 tacaggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttg 200  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3793 tactggatcagaggttgatcagaagctgtatagaggcatgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgtttg 3694  T
Q  201 tgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttaca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3693 tgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttaca 3594  T
Q  301 caaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3593 gaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1365 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1365
Description:

Target: scaffold1365; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 341
Target Start/End: Original strand, 31 - 363
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  31 tatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgatgaa-cacaccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 129  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
    |||  ||| || || |||||||||||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130 tcaaaggtagaccataagctgtatagaggtatgattggttctttactatacctcactgcatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 229  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |    
T  230 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatatgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatc 329  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  330 cctagattatcagttggttggtttttgtgatgct 363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 160984 - 161320
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  160984 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactcaaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 161082  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  161083 tggaacaaaagtagatcagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatatcttatttagtgtatgcttgtgt 161182  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |  |    
T  161183 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcctttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacagctaatcttggactcctttatagga 161282  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161283 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgct 161320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12589 - 12255
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12589 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagttatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaaggaaagaatatac 12491  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12490 tggaacaaaagttgatcagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttgtacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 12391  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| | || |||||| ||||||||||||| || || |  |    
T  12390 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatctttagatatcttaagggaacatctaatcttggactcctctatagga 12291  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12290 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatg 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1712
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1375 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccagtgcatccaacctgcaccttaagaaaagaaaatac 1473  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1474 tggaactaaagtagaccagaagctgtacagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagactagatattttattcagtgtatgcttgtgt 1573  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  1574 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgagggcaacaactaatcttggactcctttatagga 1673  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 1712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 6680 - 7017
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6680 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 6778  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6779 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 6878  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  6879 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 6978  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6979 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 7017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 11938 - 12105
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11938 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgat-gaacactccagtgcatccaacctgcaccttaagaaaagaaaatac 12036  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctag 172  Q
     ||| |    || || ||||||||||| ||||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  12037 tggaactaaagtagaccagaagctgtacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctag 12105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 14908407 - 14908744
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14908407 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 14908505  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     |||  |  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14908506 tggaaaaaaggtagatcagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatatctcactgcatctaggccaaatattttattcagtgtatgattgtgt 14908605  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |  |    
T  14908606 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactactattaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctcaatagga 14908705  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14908706 aatccctagattatcagttggttggattttgtgatgctg 14908744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 456059 - 455722
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  456059 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 455961  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  455960 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 455861  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  455860 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 455761  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  455760 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 455722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10296168 - 10295831
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10296168 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 10296070  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10296069 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 10295970  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  10295969 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 10295870  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10295869 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 10295831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 10745956 - 10746293
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10745956 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 10746054  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10746055 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 10746154  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  10746155 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 10746254  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10746255 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 10746293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 10959725 - 10960062
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10959725 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 10959823  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10959824 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 10959923  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  10959924 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 10960023  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10960024 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 10960062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16849488 - 16849151
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16849488 aaaatacacaaaggagcttctgaagaagttcaaattcgaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcacacaacctgcaccttaagcaaagaagatac 16849390  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16849389 tggaacaaaagtagatcagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 16849290  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  |    
T  16849289 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctattaagagaatcttcatgtatctgaagggaacaactaatcttagactcctttatagga 16849190  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16849189 aatcgctagattatcagttggttggattttgtgatgctg 16849151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22001914 - 22001577
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22001914 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 22001816  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22001815 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 22001716  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  22001715 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 22001616  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22001615 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 22001577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36023788 - 36023451
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36023788 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 36023690  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36023689 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 36023590  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  36023589 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 36023490  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36023489 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 36023451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49513033 - 49512696
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49513033 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 49512935  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  49512934 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 49512835  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  49512834 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 49512735  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49512734 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 49512696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16261362 - 16261025
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16261362 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 16261264  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
      || |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16261263 tagaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 16261164  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  16261163 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 16261064  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16261063 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 16261025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 18757848 - 18758185
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18757848 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 18757946  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  18757947 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgt 18758046  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  18758047 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttatagga 18758146  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18758147 aatccctagattacaagttgattgaattctgtgatgctg 18758185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 19949753 - 19950090
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19949753 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 19949851  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19949852 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcgctgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 19949951  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  19949952 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 19950051  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19950052 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 19950090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 27820289 - 27820626
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27820289 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27820387  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27820388 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27820487  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27820488 gcaagatttcaatcagatcatagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27820587  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27820588 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27820626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 30931848 - 30932185
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30931848 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 30931946  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30931947 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 30932046  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  30932047 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 30932146  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  30932147 aatccctagattataagttgattgaattctgtgatgctg 30932185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 19606254 - 19606591
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  19606254 aaaatataccaaggagcttcagaagaagttcaagctagaagattgtaaagtaatgaa-cattccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatat 19606352  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| || |||||||  ||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19606353 tggaacaaaggtagaccagaagcaatatagcggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgtttgtgc 19606452  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |  |    
T  19606453 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttggaaggaacaactaatcttggattcctttatagga 19606552  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19606553 aatctctagattatcagttggttggattttgtgacgctg 19606591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24645828 - 24645491
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24645828 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24645730  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24645729 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24645630  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24645629 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24645530  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24645529 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24645491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27193396 - 27193059
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27193396 aaaatatacaaaggagtttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27193298  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27193297 tggaacggtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27193198  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27193197 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27193098  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27193097 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27193059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27662109 - 27661772
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27662109 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27662011  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27662010 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27661911  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27661910 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27661811  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27661810 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27661772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 55750610 - 55750947
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  55750610 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 55750708  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  55750709 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 55750808  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  55750809 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 55750908  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  55750909 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 55750947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 14841440 - 14841777
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14841440 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattataaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 14841538  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14841539 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 14841638  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  14841639 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaaatgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 14841738  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14841739 aatacctagattataagttggttggattctgtgatgctg 14841777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17923595 - 17923258
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  17923595 aaaatattcaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaaacaaagaagatac 17923497  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17923496 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 17923397  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  17923396 gcaagatttcaagcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 17923297  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17923296 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 17923258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27171564 - 27171223
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27171564 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27171466  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgta----tgctt 199  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    |||||    
T  27171465 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtacgtatgctt 27171366  T
Q  200 gtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttac 299  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  27171365 gtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtat 27171266  T
Q  300 acaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27171265 aggaaatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27171223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 14845304 - 14845639
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14845304 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 14845402  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||     
T  14845403 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtg- 14845501  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
     ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  14845502 -caaaatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 14845600  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14845601 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 14845639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5017634 - 5017297
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5017634 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5017536  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || | ||| | ||||||| || | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5017535 tggaacagtagtagaccagaagctatacataggtatgattggttctctattataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 5017436  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  5017435 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 5017336  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5017335 aatctctagattataagttgattggattctgtgatgctg 5017297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 4993153 - 4993490
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4993153 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 4993251  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| ||   ||| | ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4993252 tggaacaatagtagaccagaagctatacttaggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 4993351  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  4993352 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 4993451  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4993452 aatctctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4993490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16310609 - 16310272
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16310609 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaaactagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 16310511  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16310510 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagcgtatgcttgtgt 16310411  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  16310410 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 16310311  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  16310310 aatccctagattacaagttgattggattctgtgatgctg 16310272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Original strand, 40462107 - 40462440
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  40462107 tatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 40462205  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     | |  || || |||||| | || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40462206 actgtagtagaccagaagttatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtgtgcttgtgtgcaa 40462305  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |    
T  40462306 gatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatc 40462405  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40462406 cctagattataagttgattggattctgtgatgctg 40462440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 15202161 - 15202498
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15202161 aaaatatacgaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15202259  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | |||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  15202260 tggaactatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttgtctgttatacctcactgcatctagacctgatattttatttagtgtatgcttgtgt 15202359  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  15202360 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcctcaggcatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 15202459  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15202460 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 15202498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 15467681 - 15468020
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15467681 aaaataaacaaaagagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacatgcaccttaagcaaagaagatac 15467779  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtat--gcttgt 201  Q
     ||| ||   || || |||||| |||| ||||| | ||||||| || | ||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  15467780 tggaacaaaagtagaccagaagttgtacagaggtatgattggttctcttttgtatctcactgcatccagatcagatattttattcagtgtatatgcttgt 15467879  T
Q  202 gtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacac 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || |     
T  15467880 gtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactgatcttggactcctgtatag 15467979  T
Q  302 aaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15467980 gaaatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 15468020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17242931 - 17242610
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17242931 aaaatatacaaagaagcttctgaagaagttcaacctggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 17242833  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
      || ||  |||||   ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  17242832 tagaacaaaggttgggtagaagttgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccaaatattttattgagtgtttgcttgtgt 17242733  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| || || || |  |    
T  17242732 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggcagttgaagagaacaactaatcttgggctcctctataaga 17242633  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggtt 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  17242632 aatccctagattatcagttggtt 17242610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 342
Target Start/End: Original strand, 15009396 - 15009661
Alignment:
Q  75 ccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggc 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||  ||| ||  ||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  15009396 ccaacctgcaccttaagcaaaaaagatactggatcaaaggtagactagaagttgtataaaggtatgattggttctttgttatacctcactacatctagac 15009495  T
Q  175 catatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaagg 274  Q
       ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  15009496 aggatattttattcagt--atgcttgtgtgcaagattctaatcagatcctagagaatctcatttaactcctgttaagagaatctgcagatatctgaaagg 15009593  T
Q  275 aacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | |||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15009594 atcaactaatcttggactcctctacaggaaatccctagattatcaattggttggattttgtgatgctg 15009661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Original strand, 15875877 - 15876186
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | |  |||    
T  15875877 tatacaaaggagcttctaaagaagttcaacctggaagattgtaacgtaatgaacacttcaa-tgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagacattgga 15875975  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
      |  ||| || || |||||||||| ||  | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||              |||||||||||||||||    
T  15875976 ataaaggtagaccaaaagctgtataaagctatgattggttctttgttatacctcactacatctaggccaa-------------tgtatgcttgtgtgcaa 15876062  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |  ||| |    
T  15876063 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaactggttttaagagaatctttaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcatctataggaaatc 15876162  T
Q  308 cctagattatcagttggttggatt 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  15876163 cctagattatcagttagttggatt 15876186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Original strand, 24023013 - 24023164
Alignment:
Q  191 tgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttgga 290  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24023013 tgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttgga 24023112  T
Q  291 cttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || || |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24023113 ctcctgtataggaaatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24023164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 342
Target Start/End: Original strand, 11453028 - 11453191
Alignment:
Q  178 atattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaac 277  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11453028 atattttatttagtgtctgtctgtgtgcaagattgc-gtcagatcctagataatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaac 11453126  T
Q  278 aactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||||||||||| | ||||| |  ||| | | ||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  11453127 aactaatcttggattgctttataagaaatctcaagattacaagctagttggattctgtgatgctg 11453191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11533746 - 11533635
Alignment:
Q  178 atattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaac 277  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11533746 atattttatttagtgtctgtctgtgtgcaagattgc-gtcagatcctagataatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaac 11533648  T
Q  278 aactaatcttgga 290  Q
    |||||||||||||    
T  11533647 aactaatcttgga 11533635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 1272932 - 1273091
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1272932 aaaatatacaaataagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgat-gaacactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaatatac 1273030  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcact 164  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| |||||||||    
T  1273031 tggaactaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcact 1273091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Original strand, 15006852 - 15006898
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 54  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15006852 tatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 15006898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22126018 - 22125931
Alignment:
Q  197 cttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaat 284  Q
    ||||||||| || || || ||| |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  22126018 cttgtgtgctaggtttcaatcaaatcctaaagaaactcacttaactgttgttaagagaatctttagatatatgaaaggaactactaat 22125931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 11533915 - 11533871
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaa 52  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11533915 tatacaaaggagcttctgaacaagttcaagctagaggattgtaaa 11533871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 4175 - 4512
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4175 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtaatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 4273  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4274 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 4373  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  4374 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 4473  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4474 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Original strand, 33134 - 33467
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  33134 tataccaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactcaaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 33232  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||   |||||||||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33233 acaaaagttgatcagaagttgtacagaggtatgattggttctttgttacacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 33332  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |    
T  33333 gatttgagtcagatcctagaaaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttataggaaatc 33432  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33433 cttagattattagttggttggattctgtgatgctg 33467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 35220980 - 35221317
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35220980 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 35221078  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35221079 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 35221178  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  35221179 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctttatagga 35221278  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35221279 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 35221317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 6981282 - 6981619
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6981282 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 6981380  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6981381 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 6981480  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  6981481 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 6981580  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6981581 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 6981619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 9341432 - 9341769
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9341432 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9341530  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9341531 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9341630  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9341631 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9341730  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9341731 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9341769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14452396 - 14452059
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14452396 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 14452298  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14452297 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 14452198  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  14452197 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 14452098  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14452097 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 14452059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14563437 - 14563100
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14563437 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 14563339  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14563338 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 14563239  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  14563238 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 14563139  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14563138 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 14563100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 15745446 - 15745783
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15745446 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15745544  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15745545 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 15745644  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  15745645 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 15745744  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15745745 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 15745783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 22151993 - 22152330
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22151993 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 22152091  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22152092 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 22152191  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  22152192 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 22152291  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22152292 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 22152330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 22681593 - 22681930
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22681593 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagtaaagaagatac 22681691  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22681692 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 22681791  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  22681792 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 22681891  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22681892 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 22681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23483586 - 23483249
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23483586 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 23483488  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23483487 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 23483388  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  23483387 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 23483288  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23483287 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 23483249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 23702257 - 23702594
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23702257 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 23702355  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23702356 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 23702455  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  23702456 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 23702555  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23702556 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 23702594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 24572549 - 24572886
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24572549 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24572647  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24572648 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24572747  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24572748 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24572847  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24572848 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24572886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24822260 - 24821923
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24822260 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24822162  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24822161 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24822062  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24822061 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24821962  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24821961 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24821923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27047621 - 27047284
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27047621 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27047523  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27047522 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27047423  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27047422 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27047323  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27047322 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27047284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 27465639 - 27465976
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27465639 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27465737  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27465738 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27465837  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27465838 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27465937  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27465938 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27617556 - 27617219
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27617556 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27617458  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27617457 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27617358  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27617357 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27617258  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27617257 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27617219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30232810 - 30232473
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30232810 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 30232712  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30232711 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 30232612  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  30232611 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 30232512  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30232511 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 30232473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 31838957 - 31839294
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31838957 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 31839055  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31839056 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 31839155  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  31839156 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 31839255  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31839256 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 31839294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 39357973 - 39358310
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39357973 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 39358071  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39358072 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 39358171  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  39358172 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 39358271  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39358272 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 39358310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39496271 - 39495934
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39496271 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 39496173  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39496172 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 39496073  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  39496072 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 39495973  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39495972 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 39495934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 40395839 - 40396176
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40395839 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 40395937  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40395938 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 40396037  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  40396038 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 40396137  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40396138 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 40396176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 14035519 - 14035856
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14035519 aaaatatacaaaggagcttctaaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 14035617  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14035618 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 14035717  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  14035718 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 14035817  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14035818 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 14035856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15998680 - 15998343
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15998680 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcaaccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15998582  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15998581 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 15998482  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |  |    
T  15998481 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacagctaatcttggactcctgtatagga 15998382  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15998381 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 15998343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 23301754 - 23302091
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23301754 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 23301852  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23301853 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactacatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 23301952  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  23301953 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 23302052  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23302053 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 23302091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 23367413 - 23367750
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23367413 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 23367511  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23367512 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgt 23367611  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  23367612 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 23367711  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23367712 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 23367750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 24813390 - 24813727
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24813390 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24813488  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24813489 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24813588  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24813589 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24813688  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24813689 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24813727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 34777373 - 34777710
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34777373 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaaaac-tccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 34777471  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  ||  | |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34777472 tggaacagtagtaaaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 34777571  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  34777572 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 34777671  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34777672 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 34777710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37735351 - 37735014
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37735351 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 37735253  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || ||||| || || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37735252 tggaacagtagtagaccagaaactatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 37735153  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  37735152 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 37735053  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37735052 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 37735014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 42048257 - 42048594
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  42048257 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagatgatac 42048355  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42048356 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 42048455  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  42048456 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 42048555  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42048556 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 42048594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 17612539 - 17612876
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17612539 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 17612637  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17612638 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 17612737  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  17612738 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 17612837  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17612838 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 17612876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 17724395 - 17724732
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17724395 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 17724493  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17724494 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 17724593  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  17724594 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 17724693  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17724694 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 17724732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 31354011 - 31354348
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31354011 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 31354109  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31354110 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 31354209  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  31354210 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 31354309  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31354310 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 31354348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36587901 - 36587564
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36587901 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagagtgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 36587803  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36587802 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 36587703  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  36587702 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 36587603  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36587602 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 36587564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1116686 - 1116349
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  1116686 aaaatatacaaaggagcttctgaaaaagttcaagctagaagactgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcatcttaagcaaagaagatac 1116588  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116587 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 1116488  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || |  |    
T  1116487 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaagcaacaactaatcttggactcctgtatagga 1116388  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1116387 aatccctagattataagttggttggattctgtgatgctg 1116349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5295926 - 5295589
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5295926 aaaatatacaaaggagcttctgaagaaattcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5295828  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5295827 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 5295728  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  5295727 gcaagatttcaatcagatcttagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 5295628  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5295627 aatccccagattataagttgattggattctgtgatgctg 5295589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13528696 - 13528359
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |    
T  13528696 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactctaatgcatccaacatgcaccttaagcaaagaagatcc 13528598  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13528597 tggaactaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 13528498  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| || || |  |    
T  13528497 gcaagattcaagtcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaagtatctgaagggaacaactaattttggactcctgtatagga 13528398  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13528397 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 13528359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 19469449 - 19469786
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19469449 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctaaaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 19469547  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19469548 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatagctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 19469647  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  19469648 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 19469747  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19469748 aatccctagattacaagttggttggattctgtgatgctg 19469786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 23401388 - 23401725
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23401388 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 23401486  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23401487 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 23401586  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  23401587 gcaagatttcaattagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 23401686  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23401687 aatccctagattataagttgattgaattctgtgatgctg 23401725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24935037 - 24934700
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24935037 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24934939  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24934938 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24934839  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |  |    
T  24934838 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttgtactcctgtatagga 24934739  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24934738 aatccctagactataagttgattggattctgtgatgctg 24934700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 36693175 - 36693512
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36693175 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 36693273  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36693274 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 36693373  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  36693374 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 36693473  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  36693474 aatccctagattataagttgactggattctgtgatgctg 36693512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 20557224 - 20557561
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20557224 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtgaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 20557322  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | |||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20557323 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttttctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 20557422  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  20557423 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 20557522  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  20557523 aatccctagattataagttaattggattctgtgatgctg 20557561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 20785522 - 20785859
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20785522 aaaatattcaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 20785620  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20785621 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 20785720  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  20785721 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaggtatcttaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 20785820  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20785821 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 20785859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17452096 - 17451759
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17452096 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtggtgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 17451998  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17451997 tggaactatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 17451898  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  17451897 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaaaagaatcatcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 17451798  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17451797 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 17451759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 34057410 - 34057747
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34057410 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 34057508  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34057509 tggaactatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 34057608  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || || |  |    
T  34057609 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaacaaatattggactcctgtatagga 34057708  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34057709 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 34057747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 21671329 - 21671666
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| ||||||  | |||||| ||||    
T  21671329 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctataagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctacaccttgtgcaaagaagatac 21671427  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| ||  |||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21671428 tggaactaaagtagaccagaagctatagtgaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatttagaccagatattttattcaatgtatgcttgtgt 21671527  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |  |    
T  21671528 gcaagatttcaatcagatcctggagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctgtatagga 21671627  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21671628 aatccctagattatcaattggttggattctgtgatgctg 21671666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12860824 - 12860532
Alignment:
Q  5 aaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatataca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |   | || |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||      
T  12860824 aaatatacaaaggaacttctgaaaaagttcaatcttgaagaatgtaaagtgatgactac-tctaatgcatccaacctgcaccttaagcaaaaaagatatc 12860726  T
Q  105 ggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtg 204  Q
    ||  ||  ||| || || ||| |||  ||||| | |||  || | ||||| ||| | ||||  ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12860725 ggcacaaaggtagaccataagttgttcagaggtatgataagttcattgttatacttaactgtttctaaaccaaatattttatttagtgtatgcttgtgtg 12860626  T
Q  205 caagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttcttta 298  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  12860625 caaggttccaattagatcctaaagaatcttatttaactgttgttaagataatctttagatatttgaaatgaacggctaatcttggacttcttta 12860532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 21520413 - 21520364
Alignment:
Q  5 aaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 54  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||    
T  21520413 aaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaaactttaaaattgtaaagt 21520364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 21530979 - 21530930
Alignment:
Q  5 aaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 54  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||    
T  21530979 aaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaaactttaaaattgtaaagt 21530930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5838629 - 5838292
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5838629 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5838531  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5838530 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 5838431  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  5838430 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctttatagga 5838331  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5838330 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 5838292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7512699 - 7512362
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7512699 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 7512601  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7512600 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 7512501  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  7512500 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 7512401  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7512400 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 7512362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 7694871 - 7695208
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7694871 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 7694969  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7694970 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 7695069  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  7695070 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 7695169  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7695170 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 7695208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 12618552 - 12618889
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12618552 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 12618650  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12618651 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 12618750  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  12618751 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 12618850  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12618851 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 12618889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 36241830 - 36242167
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36241830 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 36241928  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36241929 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 36242028  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  36242029 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 36242128  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36242129 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 36242167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38100510 - 38100173
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38100510 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 38100412  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38100411 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 38100312  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  38100311 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 38100212  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38100211 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 38100173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 47613332 - 47613669
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47613332 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 47613430  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47613431 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 47613530  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  47613531 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 47613630  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47613631 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 47613669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 51651273 - 51651610
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  51651273 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 51651371  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  51651372 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 51651471  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  51651472 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 51651571  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  51651572 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 51651610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 5645104 - 5645441
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5645104 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5645202  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5645203 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 5645302  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  5645303 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 5645402  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  5645403 aatccctagattataagttgattggattctatgatgctg 5645441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12735953 - 12735616
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12735953 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccagtgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 12735855  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12735854 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 12735755  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  12735754 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 12735655  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12735654 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 12735616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3177026 - 3176689
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3177026 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 3176928  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3176927 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 3176828  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  3176827 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 3176728  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3176727 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 3176689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4172727 - 4172390
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4172727 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 4172629  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4172628 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagcgtatgcttgtgt 4172529  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |  |    
T  4172528 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcttgtatagga 4172429  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4172428 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4172390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21869088 - 21868751
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21869088 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 21868990  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21868989 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 21868890  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  21868889 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 21868790  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21868789 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 21868751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22126915 - 22126578
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  | |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22126915 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaaatgatgaacacttcat-tgcatccaacctgcaccttaagcaaagaatatac 22126817  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| || |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22126816 tggaacaaaggtagaccagaagctatatagaggtaagattggttctttgttatatctcactgcatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgt 22126717  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  |  |    
T  22126716 gcaagattctagttagatcctggagaatctcatttaactgctgttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctgtagga 22126617  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22126616 aatccctaaattaccagttggttggattttgtgatgctg 22126578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Original strand, 22446978 - 22447299
Alignment:
Q  20 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||| ||     
T  22446978 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaaactgcaccttaagcaaagaagatactggaacaaaggtagac 22447076  T
Q  120 cagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcag 219  Q
    || ||| |||||||||| | ||||||| || | || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22447077 cataagatgtatagaggtatgattggttctctattatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcag 22447176  T
Q  220 atcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |  ||| |||||||||||||    
T  22447177 atcctagagaatctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattatca 22447276  T
Q  320 gttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  22447277 gttggttggattttgtgatgctg 22447299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Original strand, 22452212 - 22452533
Alignment:
Q  20 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||| ||     
T  22452212 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaaactgcaccttaagcaaagaagatactggaacaaaggtagac 22452310  T
Q  120 cagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcag 219  Q
    || ||| |||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22452311 cataagatgtatagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcag 22452410  T
Q  220 atcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |  ||| |||||||||||||    
T  22452411 atcctagagaatctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattatca 22452510  T
Q  320 gttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  22452511 gttggttggattttgtgatgctg 22452533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 19165051 - 19165388
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||     
T  19165051 aaaatataaaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccctaagcaaagaagataa 19165149  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     |||  |   || || |||||||| || ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19165150 tggaagaaaagtagaccagaagctttacagaggtatggttggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 19165249  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    |    
T  19165250 gcaagattccagtcagatcctagagaattttatttaacagctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttattgga 19165349  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165350 aatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 19165388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 35643438 - 35643775
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35643438 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 35643536  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35643537 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 35643636  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  35643637 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 35643736  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  35643737 aatccctagattataagttgattggattctatgatgctg 35643775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7684564 - 7684236
Alignment:
Q  13 aaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||   |     
T  7684564 aaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactggaattgt 7684466  T
Q  113 ggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattc 212  Q
     || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7684465 agtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattt 7684366  T
Q  213 cagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctag 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| | ||||    
T  7684365 caatcagatcctagagaatctcatttaattgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctatataggaaatctctag 7684266  T
Q  313 attatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7684265 attataagttgattggattctgtgatgctg 7684236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 149071 - 149412
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  149071 aaaatatacaaaggagcttctgaaaaagttcaagctagaagactgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcatcttaagcaaagaagatac 149169  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgta----tgctt 199  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    |||||    
T  149170 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtacgtatgctt 149269  T
Q  200 gtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttac 299  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||     
T  149270 gtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatattggactcctgtat 149369  T
Q  300 acaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  149370 aggaaatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 149412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 140 - 339
Target Start/End: Original strand, 21129838 - 21130037
Alignment:
Q  140 gattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcattta 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21129838 gattggttctttgttgtacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaatctcattta 21129937  T
Q  240 accgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||| |||| || || |  ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21129938 actgctgttaagagaatctttagatatctgaagggaacaactattcttagactcctctataggaaatcctgagattatcagctggttggattctgtgatg 21130037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20934516 - 20934303
Alignment:
Q  129 tatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagag 228  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20934516 tatagaggtatgattggttctttgctataccgcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcctagag 20934417  T
Q  229 aatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttgg 328  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | ||||| | || || |  ||| || |||||||||||||||||||    
T  20934416 aatctcatttaactattgttaagagaatcatcaggtatctgaaatgatcaactagttttggaatcctctataggaaatccttagattatcagttggttgg 20934317  T
Q  329 attctgtgatgctg 342  Q
    ||| ||||||||||    
T  20934316 attatgtgatgctg 20934303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 21211123 - 21211348
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21211123 aaaatatacaaaggagcttcttaagaagttcaagttagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttgagcaaagaagatac 21211221  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
      || ||   ||  |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21211222 tagaacaaaagtaaatcagaagttgtatagaggtatgattggttctttgttgtacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtat 21211321  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaa 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21211322 gcaagatttcagtcagatcctagagaa 21211348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17720765 - 17720623
Alignment:
Q  200 gtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttac 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  17720765 gtgtgcaagattccaatcagatcctagagaatctcatttaacagctgttaagagaatctttagatatttaaaaggaacaactaatcttggactcctttat 17720666  T
Q  300 acaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |  ||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  17720665 aggaaatccttagattataagttggttgaattttgtgatgctg 17720623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23390180 - 23390011
Alignment:
Q  173 gccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaa 272  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23390180 gccagatatgttattcagtgtatgcatgtttgcaagatttcagtcagatcctagataatctcatctaacagttgttaagagaatctttaggtatctgaaa 23390081  T
Q  273 ggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| |  ||| |   ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  23390080 ggaacaactcatcttgaaattctttataagaaatctaaagattataagctagttggattctgtgatgctg 23390011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 21211346 - 21211414
Alignment:
Q  274 gaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||||||||||||||||| || || |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211346 gaacaactaatcttggactcctctataggaaatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 21211414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14423966 - 14423909
Alignment:
Q  175 catatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatc 232  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  14423966 catatattttatttagtgtatgtttgtgtgcaatattccaatcaaatcttagagaatc 14423909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20984722 - 20984386
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20984722 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 20984624  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || ||||||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20984623 tggaacagtagtagatcagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 20984524  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  20984523 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 20984424  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20984423 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgct 20984386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 462424 - 462761
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  462424 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 462522  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  462523 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 462622  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  462623 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 462722  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  462723 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 462761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18433988 - 18433651
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  18433988 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtaatgaa-cactccaatgcatccaacccgcaccttaagcaaagaagatac 18433890  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18433889 tggaacaaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 18433790  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  18433789 gcaagatttcaattagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 18433690  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18433689 aatccctagattattagttggttggattctgtgatgctg 18433651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22094606 - 22094269
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22094606 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 22094508  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22094507 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 22094408  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  22094407 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 22094308  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22094307 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 22094269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24739566 - 24739229
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24739566 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24739468  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24739467 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24739368  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24739367 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24739268  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24739267 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24739229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 26395532 - 26395869
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26395532 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 26395630  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26395631 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 26395730  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  26395731 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 26395830  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26395831 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 26395869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 40047542 - 40047879
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40047542 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 40047640  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40047641 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 40047740  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  40047741 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 40047840  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40047841 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 40047879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1993021 - 1992684
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1993021 aaaatatacaaaggagcttctgaaaaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 1992923  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1992922 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 1992823  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |    
T  1992822 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaattttggactcctttatagga 1992723  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1992722 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 1992684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8622828 - 8622491
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8622828 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 8622730  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  8622729 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgctattttattcagtgtatgcttgtgt 8622630  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  8622629 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 8622530  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8622529 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 8622491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9090699 - 9090362
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  9090699 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcactttaagcaaagaagatac 9090601  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9090600 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9090501  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9090500 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9090401  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9090400 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9090362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 172355 - 172018
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  172355 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 172257  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  172256 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagatctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 172157  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  172156 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagataatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 172057  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  172056 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 172018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 2711051 - 2711388
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2711051 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 2711149  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2711150 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 2711249  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | || |  |    
T  2711250 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctaaaaggaacaactaatcttggactcatgtatagga 2711349  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2711350 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 2711388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4217473 - 4217136
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4217473 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatctaacctgcaccttaagcaaagaagatac 4217375  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4217374 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 4217275  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || |  |    
T  4217274 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatctttgactcctgtatagga 4217175  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4217174 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4217136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 6872668 - 6873005
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6872668 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 6872766  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  6872767 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagatctgatattttatttagtgtatgcttgtgt 6872866  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  6872867 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 6872966  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6872967 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 6873005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 8007504 - 8007841
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8007504 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 8007602  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8007603 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 8007702  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  8007703 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 8007802  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8007803 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 8007841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10652303 - 10651966
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10652303 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactttaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 10652205  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| || |||||| | |||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10652204 tggagcaaaggtagaccagaagatatatagaggtatgattagttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtat 10652105  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || | ||    
T  10652104 gcaagattccagtcagatcccaaagaatctcatttaactgctgttaagagaagcttcaggtatttgaaaggaacaattaatcttggactcctctatagaa 10652005  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  10652004 aatccttagattattagttggttgaattttgtgatgctg 10651966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11010652 - 11010315
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11010652 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 11010554  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11010553 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 11010454  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  11010453 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 11010354  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11010353 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 11010315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 17955552 - 17955889
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17955552 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 17955650  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  17955651 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacttgatattttattcagtgtatgcttgtgt 17955750  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  17955751 ggaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 17955850  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17955851 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 17955889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 20998857 - 20999194
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20998857 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 20998955  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  ||  | |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20998956 tggaacagtagtaaaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 20999055  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |  |    
T  20999056 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcttgtatagga 20999155  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20999156 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 20999194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42871313 - 42870976
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42871313 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 42871215  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42871214 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 42871115  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  42871114 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 42871015  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42871014 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 42870976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 26691180 - 26691516
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26691180 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagagtgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 26691278  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26691279 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 26691378  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  26691379 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 26691478  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26691479 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgct 26691516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 15883261 - 15883597
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15883261 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15883359  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15883360 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattt-attcagtgtatgcttgtgt 15883458  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  15883459 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 15883558  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15883559 aatctctagattataagttggttggattctgtgatgctg 15883597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13661927 - 13661596
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  13661927 tatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctgaaagattgtaaagtaatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 13661829  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||  | | || |||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13661828 acaaagatagaccagaagttgtatagagatatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 13661729  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || || |  ||| |    
T  13661728 gattccagtcagatcttagagaatctcatttaactgctgtaaagaaagtctttaggtatctgaaaggatcaactaatcttggactcctctataggaaatc 13661629  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgc 340  Q
    ||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  13661628 cctagaaaattagttggttggattttgtgatgc 13661596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9165029 - 9164692
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  9165029 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactctaatgcatccaacctccaccttaagcaaagaagatac 9164931  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || ||  ||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9164930 tggaactgtagtagactagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9164831  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9164830 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagaaaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9164731  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9164730 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9164692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9438729 - 9438392
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9438729 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9438631  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || ||||| || || | ||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9438630 tggaacagtagtagaccagaaactatacaaaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9438531  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    |    
T  9438530 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcatgtatggga 9438431  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9438430 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9438392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 341
Target Start/End: Original strand, 4417436 - 4417768
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || || | | | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  4417436 tataccaaggagcttctgaagaagttcaagcttgaagaatgtaaagagatgaa-cacaccaatgtatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 4417534  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||   || || ||||||||||| ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4417535 acaaaagtagaccagaagctgtacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcatggtatgcttgtgtgcaa 4417634  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  4417635 gatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttgagagaatcttcaggtatctgaatggaacaactaatcttggacttctttatagaaaatc 4417734  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4417735 cctagattatcagttgattggattctgtgatgct 4417768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14139034 - 14138775
Alignment:
Q  83 caccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatatt 182  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14139034 caccttaagcaaagaagatactggaacaaaggtagattagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatatt 14138935  T
Q  183 ttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaacta 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14138934 ttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaaatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaacta 14138835  T
Q  283 atcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14138834 atcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggattttgtgatgctg 14138775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4824527 - 4824201
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | ||||    
T  4824527 aaaatatacaaaagagcttctgaagaagttcaagttagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaatgagatac 4824429  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |   ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4824428 tggaacaaaggtagatcagaagctgtatagagttatgattggttctttgttatacctcactgcatccagactggatattttattcaacgtatgcttgtgt 4824329  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||           || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| || || |  |    
T  4824328 gc-----------caaatcctagagaatctcatttaactgatgttaagagaatcttcaggtatttaaagggaacaacttatcttggactcctgtatagga 4824240  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4824239 aatccctatattatcagttggttggattttgggatgctg 4824201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 341
Target Start/End: Original strand, 4420520 - 4420611
Alignment:
Q  250 agagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4420520 agagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggacttctttatagaaaatccctagattatcagttgattggattctgtgatgct 4420611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20540980 - 20540816
Alignment:
Q  175 catatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaagg 274  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||| |||||| || |||||||  ||||||||||| || || | |||||||||||| || |||||| |||||||    
T  20540980 catatattttgttaattgtatgcctgtgtgtaagatttcaatcagatcacagagaatctcacttgacagatgttaagagaatttttaggtatctgaaagg 20540881  T
Q  275 aacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20540880 aacaactaatctaggaattctttataacaaatctcaagattataagttggttggattctttgatg 20540816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 277
Target Start/End: Original strand, 5169800 - 5169887
Alignment:
Q  190 gtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaac 277  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5169800 gtgtatggtagtgtgcaagaatccaatcaaatcctagagaaactcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaac 5169887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 13126396 - 13126473
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctg 82  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||    
T  13126396 aaaatataccaaggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaat-gaacactccaatgcatccaacctg 13126473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14141367 - 14141283
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcacctta 89  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  14141367 aaaacatacaaaggagcttctgaagaagttcaagttggaagattataaagtgat-gaacactccaatgcatccaacctgcacctta 14141283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Original strand, 16158858 - 16158940
Alignment:
Q  216 tcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttcttta 298  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||   | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  16158858 tcagatcttagagaatctcacttaactcttcttaagagaatctttagatatttgaaaggaacaataaatctaggactccttta 16158940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 10355 - 10692
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10355 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 10453  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || ||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10454 tggaacaaaagtagatcaaaagttgtatagaggtatgattggttctttgttgtacctcactgtatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 10553  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |    
T  10554 gcaagatttcagtcagatcttagagaatatcatttaactgttgttaagagaatctttagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctttatagga 10653  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10654 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 10692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14570 - 14233
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  14570 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctacaccttaagcaaagaagatac 14472  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14471 tggaacaaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 14372  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || |  |    
T  14371 gcaagatttcattcagatcctagagaatctcatttaacctctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttagacttctgtatagga 14272  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14271 aatccatagattatcagttggttggattctgtgatgctg 14233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36599 - 36262
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36599 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 36501  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36500 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 36401  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  36400 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 36301  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36300 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 36262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 42349 - 42686
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42349 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 42447  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42448 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 42547  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  42548 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 42647  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42648 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 42686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 1692 - 2029
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1692 aaaatatacaaaggagcttctgaagaaattcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 1790  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || ||||||||||| | ||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1791 tggaacaaaagtagaccagaagctgtacataggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 1890  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  1891 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcagctatctgaagggaacaactaatcatggactcctttatagga 1990  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991 aatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 25679377 - 25679714
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25679377 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 25679475  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25679476 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 25679575  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  25679576 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 25679675  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25679676 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 25679714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29081875 - 29081538
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29081875 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 29081777  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29081776 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 29081677  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  29081676 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 29081577  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29081576 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 29081538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 32083085 - 32083422
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32083085 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 32083183  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32083184 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 32083283  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  32083284 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 32083383  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32083384 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 32083422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36298410 - 36298073
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36298410 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 36298312  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36298311 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 36298212  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  36298211 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 36298112  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36298111 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 36298073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 3354024 - 3354361
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3354024 aaaatatacaaaggagcttctaaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 3354122  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3354123 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 3354222  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  3354223 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 3354322  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3354323 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 3354361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9346582 - 9346245
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9346582 aaaatatacaaaggagcttctaaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9346484  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9346483 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9346384  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9346383 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9346284  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9346283 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9346245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 13693959 - 13694296
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13693959 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 13694057  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13694058 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 13694157  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  13694158 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagtcaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 13694257  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13694258 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 13694296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16742156 - 16741819
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16742156 aaaatatacaaaggagcttctaaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 16742058  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16742057 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggctctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 16741958  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | ||    
T  16741957 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagaa 16741858  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16741857 aatccctagattataagttggttggattctgtgatgctg 16741819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19134164 - 19133827
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19134164 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 19134066  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19134065 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctaaacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 19133966  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  19133965 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 19133866  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19133865 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 19133827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22668542 - 22668217
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || | ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22668542 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaattgatgaa-cactccaatgcatccaacctgtaccttaagcaaagaagatac 22668444  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
      |||||  |||  |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22668443 tagatcaaaggtaaatcagaagctatatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatatttaattcagtgtatgcttgtgt 22668344  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  22668343 gcaagattcca-tcagatcctagagaatctcatttaattgttgtaaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggacttctctatagaa 22668245  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggatt 331  Q
    || | |||||||||||||||||||||||    
T  22668244 aatctctagattatcagttggttggatt 22668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6156550 - 6156213
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || |  || |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6156550 aaaatatacaaaggagcttttgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cattccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 6156452  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6156451 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 6156352  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  6156351 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 6156252  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6156251 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 6156213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 15786099 - 15786436
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15786099 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgta-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15786197  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15786198 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 15786297  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  15786298 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagataatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctatatagga 15786397  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  15786398 aatccctagattataagttaattggattctgtgatgctg 15786436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19230262 - 19229925
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19230262 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 19230164  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19230163 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 19230064  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  19230063 gcaagatttcaactagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 19229964  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19229963 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 19229925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36083405 - 36083068
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36083405 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 36083307  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36083306 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 36083207  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  36083206 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 36083107  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36083106 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 36083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44486598 - 44486261
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44486598 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaataatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 44486500  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44486499 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 44486400  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  44486399 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 44486300  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  44486299 aatccctagattataagttgactggattctgtgatgctg 44486261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 247292 - 246955
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || |    
T  247292 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatgc 247194  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  247193 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 247094  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  247093 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctaaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 246994  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  246993 aatccctagattataagtttattggattctgtgatgctg 246955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 810412 - 810075
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || |    
T  810412 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatgc 810314  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  810313 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 810214  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  810213 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctaaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 810114  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  810113 aatccctagattataagtttattggattctgtgatgctg 810075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 22151678 - 22152015
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22151678 aaaatatacaaaggagcttttgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 22151776  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
    ||||||    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || | || ||||  |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22151777 aggatctaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctattataccctactgcatctagagcagatattttgttcagtgtatgcttgtgt 22151876  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |  |    
T  22151877 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcctgtatagga 22151976  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22151977 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 22152015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Original strand, 22466536 - 22466868
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||    
T  22466536 tatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctgaaagattgtaaattgatgaa-ctctccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatacttga 22466634  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
    |||  |||  ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22466635 tcaaaggtatatcagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggtcagatatttaattcagtgtatgcttgtgtgcaa 22466734  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |  ||| |    
T  22466735 gattcca-tcagatcctagagaatctcatttaattgttgttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggacttacctataggaaatc 22466833  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22466834 tctagattatcagttggttggattttgtggtgctg 22466868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 30320094 - 30320431
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30320094 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 30320192  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| || | ||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30320193 tggaacaatagtagaccagaagctatacataggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 30320292  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  30320293 gcaagatttcaatcagatcctcgagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 30320392  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30320393 aatctctagattataagttggttggattctgtgatgctg 30320431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 20377212 - 20377538
Alignment:
Q  15 aggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcgg 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  | |||| |||| | |||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||    
T  20377212 aggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgacgaacacttcaa-tgcatctaaccggcaccttaagcaaagaagatactggaacaaagg 20377310  T
Q  115 ttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattcca 214  Q
    | || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20377311 tagaccagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatgtaggctagatattttattcagtgtatgcatgtgtgcaagattcca 20377410  T
Q  215 gtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagat 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || |  ||| ||||||||    
T  20377411 gtcagatcctatagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatatgaaaggaaaaactaatcttggactcctctataggaaatccctagat 20377510  T
Q  315 tatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || |||||||||||||| || |||||||    
T  20377511 taccagttggttggattttgcgatgctg 20377538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24650377 - 24650045
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  24650377 tatacgaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccagcctgcaccttaagcaaagaagatattgga 24650279  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||   || || |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24650278 acaaaagtagaccagaagttgtatagaggtatgattggt-ctttgttatacttcactgcatctaggccagctattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 24650180  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |    
T  24650179 gattccagtcagatcctaaagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatc 24650080  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24650079 cttagattatcagttagttggattttgtgatgctg 24650045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19423809 - 19423472
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19423809 aaaatatacaaaggagcttctgaaaaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 19423711  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
      || | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  19423710 tagaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacatgatattttattcagtgtatgcttgtgt 19423611  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  19423610 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactacagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 19423511  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19423510 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 19423472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21293767 - 21293451
Alignment:
Q  20 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgat 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || || | | | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||   || |||    
T  21293767 cttctgaagaagttcaagcttgaagaatgtaaagagatgaa-cacaccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactggaacaaaagtagat 21293669  T
Q  120 cagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcag 219  Q
    |  |||||||| ||||| | | |     ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21293668 cgaaagctgtacagaggtatgtt-----ctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcag 21293574  T
Q  220 atcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatca 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||    
T  21293573 atcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattatca 21293474  T
Q  320 gttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  21293473 gttggttggattttgtgatgctg 21293451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19934594 - 19934267
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || | |||         |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  19934594 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtggtgaa-cactc---------caacctacaccttaagcaaagaagatac 19934505  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19934504 tggaacaaaggtagatcagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctataccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 19934405  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  | || |  |    
T  19934404 gcaagatcttagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaatggaacaactaatctttgactcatctatagga 19934305  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19934304 aatcccaagattatcagttggttggattctatgatgct 19934267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 342
Target Start/End: Original strand, 17293610 - 17293916
Alignment:
Q  33 tcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgatcagaagctgtata 132  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || | ||| |||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||| || || |||||||||     
T  17293610 tcaagctggaagattataaagtgatgaa-cactctaatgcatccaactagcaccttaagcaaagaagatactggaacaaaggtagaccaaaagctgtatg 17293708  T
Q  133 gaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatc 232  Q
    || | | ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  17293709 gatgtatgattggttccttgttatacatcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatccaagaaaatc 17293808  T
Q  233 tcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattc 332  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  17293809 tcatttaactgctgttaacagaattttcaggtatttgaagggaacaactaatcttagactcctct--aggaaatccctagattatcagttggttgaattt 17293906  T
Q  333 tgtgatgctg 342  Q
    ||||||||||    
T  17293907 tgtgatgctg 17293916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 15080679 - 15080841
Alignment:
Q  179 tattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaaca 278  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  15080679 tattttgtttagtgtatgtttgtgtgcaaaattccaatcaggtcctagataatctcatttaattgttgttaagataatcttca-gtatctaaaaggaaca 15080777  T
Q  279 actaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||  | ||||| ||  || ||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||    
T  15080778 actaatcttggcttactttatacggaatcccaagattataagcttgttagattctttgatgctg 15080841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15165569 - 15165407
Alignment:
Q  179 tattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaaca 278  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  15165569 tattttgtttagtgtatgtttgtgtgcaaaattccaatcaggtcctagagaatctcatttaattgttgttaagataatcttca-gtatctaaaaggaaca 15165471  T
Q  279 actaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | |||||||||  | ||||| ||  || ||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||    
T  15165470 attaatcttggcttactttatacggaatcccaagattataagcttgttagattctttgatgctg 15165407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14977392 - 14977291
Alignment:
Q  178 atattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaac 277  Q
    ||||| |||||||||| || |||| ||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  14977392 atattctattcagtgtctgtttgtctgcaagatttcaatcatatccttgagaatctcacttaactgttgttaagaaaatcttcagatatctgaaaggaac 14977293  T
Q  278 aa 279  Q
    ||    
T  14977292 aa 14977291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12799043 - 12798983
Alignment:
Q  181 ttttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaac 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12799043 ttttatttagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcctagagaatcacacttaac 12798983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24588685 - 24588604
Alignment:
Q  178 atattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatctt 259  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| || |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24588685 atattctattcattgtatacttatgcgcaagactccaatcatatcctaaagaatctcatttaaatgttgttaagagaatctt 24588604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 23788276 - 23788236
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaag 44  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23788276 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaag 23788236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14977546 - 14977497
Alignment:
Q  5 aaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 54  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  14977546 aaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaaattggaggattgtaaagt 14977497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 9117856 - 9118193
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9117856 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9117954  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9117955 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9118054  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9118055 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9118154  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9118155 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9118193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 12722200 - 12722537
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12722200 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 12722298  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12722299 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 12722398  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  12722399 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 12722498  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12722499 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 12722537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13918683 - 13918346
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13918683 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 13918585  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13918584 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 13918485  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  13918484 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 13918385  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13918384 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 13918346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 18829674 - 18830011
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18829674 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcgagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 18829772  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18829773 tggaactaaagtagaccagaagctatacagaggtacgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 18829872  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || |  |    
T  18829873 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaaaaactaatcttggactcctgtatagga 18829972  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18829973 aatctctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 18830011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25793151 - 25792814
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25793151 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 25793053  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25793052 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 25792953  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  25792952 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 25792853  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25792852 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 25792814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26030857 - 26030520
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26030857 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 26030759  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26030758 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 26030659  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  26030658 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 26030559  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26030558 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 26030520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26870239 - 26869902
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26870239 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 26870141  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26870140 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 26870041  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  26870040 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 26869941  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26869940 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 26869902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27347182 - 27346845
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27347182 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27347084  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27347083 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27346984  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27346983 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27346884  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27346883 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27346845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27407922 - 27407585
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27407922 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27407824  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27407823 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27407724  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27407723 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27407624  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27407623 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27407585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 34812527 - 34812864
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34812527 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 34812625  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34812626 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 34812725  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  34812726 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 34812825  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34812826 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 34812864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12860368 - 12860031
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12860368 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 12860270  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
      || |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12860269 tagaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 12860170  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  12860169 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 12860070  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12860069 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 12860031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27499140 - 27498803
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27499140 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27499042  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||| | || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  27499041 tggaacagtagtagaccagaagttatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgt 27498942  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  27498941 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttatagga 27498842  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  27498841 aatccctagattacaagttgattggattctgtgatgctg 27498803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 32967310 - 32967647
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  32967310 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacttgcaccttaagcaaagaagatac 32967408  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32967409 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 32967508  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  32967509 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 32967608  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32967609 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 32967647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 32306410 - 32306747
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32306410 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 32306508  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32306509 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 32306608  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  32306609 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 32306708  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32306709 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 32306747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3666863 - 3666526
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  3666863 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaaactagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatat 3666765  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3666764 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 3666665  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  3666664 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 3666565  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3666564 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 3666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4636363 - 4636026
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4636363 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatcgaacctgcaccttaagcaaagaagatac 4636265  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4636264 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 4636165  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  4636164 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 4636065  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4636064 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4636026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16954445 - 16954108
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16954445 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagttagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 16954347  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  16954346 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacgtgatattttattcagtgtatgcttgtgt 16954247  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  16954246 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 16954147  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16954146 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 16954108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 20035289 - 20035626
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20035289 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 20035387  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20035388 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcaatgtatgcttgtgt 20035487  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  20035488 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactacagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 20035587  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20035588 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 20035626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27378230 - 27377893
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27378230 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27378132  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27378131 tggaacaatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27378032  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27378031 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcattaaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27377932  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27377931 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27377893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27468587 - 27468250
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27468587 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27468489  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27468488 tggaacaatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27468389  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27468388 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcattaaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27468289  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27468288 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27468250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11249197 - 11248860
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  11249197 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagttagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccctaagcaaagaagatac 11249099  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11249098 tggaacaaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacatcattgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttatgt 11248999  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  11248998 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaggtatctgaaggaaacaactaatcttggactcctttatagga 11248899  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11248898 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 11248860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22381471 - 22381134
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22381471 aaaatatacaaaggagcttctgaagaaattcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaattcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 22381373  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || ||  |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381372 tggaacaaaagtagactagaagctgtacagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 22381273  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |    
T  22381272 gcatgatttcagtcagatcctagaaaacctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacgactaatcttggactcctttatagga 22381173  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  22381172 aatccttagattataagttggttggattttttgatgctg 22381134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22810513 - 22810175
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||     
T  22810513 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagcttgaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacttgcacctaaagcaaagaagatat 22810415  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22810414 tggaacaaaggtagaccagaagctgtatataggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 22810315  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcct-agagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacaca 302  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||     
T  22810314 gcaagatttcagtcaaatcctaaaagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcatgtatttgaagggaacaactaatcttggactgctctatacg 22810215  T
Q  303 aaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  22810214 aaatccctagattatcaagtggttggattttgtgatgctg 22810175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1656207 - 1655880
Alignment:
Q  14 aaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||  || || | | | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||       
T  1656207 aaggagcttctgaagaagttcaagcttgaagaatttaaagagatgaa-cacaccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactggaacaaaa 1656109  T
Q  114 gttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattcc 213  Q
    || || |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1656108 gtagaccagaagttgtacagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttc 1656009  T
Q  214 agtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctaga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| | |||| || || |    
T  1656008 agtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctaaaggggacaactaatcttggactcctttatagaaaatccttaaa 1655909  T
Q  314 ttatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1655908 ttatcagttggttggattttgtgatgctg 1655880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26039053 - 26038716
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  26039053 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaaccagcaccttaagcaaagaagatac 26038955  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26038954 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtatatgcctgtgt 26038855  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |  |    
T  26038854 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcaattaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcttgtatagga 26038755  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26038754 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 26038716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17052870 - 17052549
Alignment:
Q  20 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | | | |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |    || ||     
T  17052870 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagagatgaa-cacaccaatgcatccaacctgcactttaagcaaagaagatacgggaactaaagtagac 17052772  T
Q  120 cagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcag 219  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| || |||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17052771 cagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatatctcactgcatctagacgtgatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagataccagtcag 17052672  T
Q  220 atcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatca 319  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||    
T  17052671 atcctagagaatctcatttaactgctattaagagaatcttcaggtatatgaaaggaacaactaatcttagactcctttataggaaatccctagattatca 17052572  T
Q  320 gttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17052571 gttggttggattctgtgatgctg 17052549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 18920868 - 18921205
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18920868 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 18920966  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18920967 tggaactatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggctctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 18921066  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  18921067 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactacagttaaaagaatcttcagatatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 18921166  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  18921167 aatccctagattacaagttgattggattctgtgatgctg 18921205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16881609 - 16881272
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||| || ||||    
T  16881609 aaaatatacaaaagagcttctgaagaagttcaagttagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctacactttaagcaaataagatac 16881511  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||| |||    
T  16881510 tggaacaaaagtagatcagaagctgtatagagttatgattggttctttgttatacctcactacatctagactagatattttagtcagtgtatgcttttgt 16881411  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    |    
T  16881410 gcaagatttcagtcagatcttagagaatctcatttaactattgtttagagaatcttcatgtatttgaagggaacaactaatcttggacttctctatggga 16881311  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16881310 aatccctagattatcagttggttggattctctgacgctg 16881272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 14064859 - 14065196
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||     
T  14064859 aaaataaacaaaggagcttctgaagaagttcaaactagaagactgcaaagtgatgaa-cactccaatgcatcctacctgcaccttaagcaaagaagatag 14064957  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  14064958 tggaacaaaagtagaccagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatatttcactgcatctagaccatatattttgttcagtgtgtgtctgtgt 14065057  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| || || |  |    
T  14065058 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcacttaactgctgttaaaagaatctttaggtgtttgaaaggaacaactattcttggactcctctataaga 14065157  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14065158 aatccattgattatcagttgactggattctgtgatgctg 14065196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Original strand, 20138265 - 20138590
Alignment:
Q  13 aaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||  | |||| | || ||||||||||||||||| ||| || ||||| || |       
T  20138265 aaaggagcttctgaagaagttcaagcttgatgattgtaaagagatgaacacttcaa-tacatccaacctgcaccttaagcaaataagatacatgagctaa 20138363  T
Q  113 ggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattc 212  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||| |  || ||| |  |||| | ||| ||| ||||||  ||  |||||||||| | ||||||||||||| |||  ||     
T  20138364 ggtagatcagaagttgtttagaggtataataggttcactgttattcctaactacatctacacctaatattttatttattgtatgcttgtgttcaacgttt 20138463  T
Q  213 cagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctag 312  Q
    || ||| || ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || |||    
T  20138464 caatcatattctagagaatctaatgtaacagttgttaagagaatctttagatatttgaaaggaacaactaatcttgtacttctttataacaaatccttag 20138563  T
Q  313 attatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20138564 attataagttggttggattctatgatg 20138590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22194604 - 22194279
Alignment:
Q  13 aaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||  | |||| | || ||||||||||||||||| ||| || ||||| || |       
T  22194604 aaaggagcttctgaagaagttcaagcttgatgattgtaaagagatgaacacttcaa-tacatccaacctgcaccttaagcaaataagatacatgagctaa 22194506  T
Q  113 ggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattc 212  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||| |  || ||| |  |||| | ||| ||| ||||||  ||  |||||||||| | ||||||||||||| |||  ||     
T  22194505 ggtagatcagaagttgtttagaggtataataggttcactgttattcctaactacatctacacctaatattttatttattgtatgcttgtgttcaacgttt 22194406  T
Q  213 cagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctag 312  Q
    || ||| || ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || |||    
T  22194405 caatcatattctagagaatctaatgtaacagttgttaagagaatctttagatatttgaaaggaacaactaatcttgtacttctttataacaaatccttag 22194306  T
Q  313 attatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22194305 attataagttggttggattctatgatg 22194279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 14058730 - 14058870
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||  ||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||     
T  14058730 aaaatacacaaaggagcttctgaagaagttcaaactagaagactgcaaagtgat-gaacactccaatgcatcctacctgcaccttaagcaaagaagatag 14058828  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattgg 145  Q
     ||| ||   || || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  14058829 tggaacaaaagtagaccagaagctgtatagaggtatgattgg 14058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 509524 - 509861
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  509524 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 509622  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  509623 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 509722  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  509723 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 509822  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  509823 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 509861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 5542375 - 5542712
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5542375 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5542473  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5542474 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 5542573  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  5542574 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 5542673  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5542674 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 5542712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 5622750 - 5623087
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5622750 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5622848  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5622849 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 5622948  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  5622949 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 5623048  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5623049 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 5623087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 5871050 - 5871387
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5871050 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5871148  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5871149 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 5871248  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  5871249 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 5871348  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5871349 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 5871387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 6215415 - 6215752
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6215415 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 6215513  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6215514 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 6215613  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  6215614 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 6215713  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6215714 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 6215752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8780146 - 8779809
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8780146 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 8780048  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8780047 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 8779948  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  8779947 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 8779848  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8779847 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 8779809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 12291543 - 12291880
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12291543 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 12291641  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12291642 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 12291741  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  12291742 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 12291841  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12291842 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 12291880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 13378021 - 13378358
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13378021 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaacaccccaa-tgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 13378119  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13378120 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 13378219  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  13378220 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 13378319  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13378320 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 13378358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 13388615 - 13388952
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13388615 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaacaccccaa-tgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 13388713  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13388714 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 13388813  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  13388814 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 13388913  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13388914 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 13388952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 24388872 - 24389209
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24388872 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24388970  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24388971 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24389070  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24389071 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24389170  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24389171 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24389209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4749202 - 4748865
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4749202 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 4749104  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4749103 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgtcatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 4749004  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  4749003 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 4748904  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4748903 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4748865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 12242913 - 12243250
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12242913 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 12243011  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12243012 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 12243111  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  12243112 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatatga 12243211  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12243212 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 12243250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14471104 - 14470767
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14471104 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 14471006  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  14471005 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgt 14470906  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  14470905 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 14470806  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14470805 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 14470767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19783905 - 19783568
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19783905 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatcaaacctgcaccttaagcaaagaagatac 19783807  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19783806 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 19783707  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  19783706 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 19783607  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19783606 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 19783568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23762777 - 23762440
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23762777 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 23762679  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23762678 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatatagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 23762579  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  23762578 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 23762479  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23762478 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 23762440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24665353 - 24665016
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24665353 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24665255  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24665254 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24665155  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24665154 gcaagatttcaatcagattctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24665055  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24665054 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24665016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 29938908 - 29939245
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  29938908 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcatcttaagcaaagaagatac 29939006  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29939007 tggaactaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttgttcagcgtatgcttgtgt 29939106  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |    
T  29939107 gcaagattccaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactccattatagga 29939206  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29939207 aatccctagattatcagttggttggattctttgatgctg 29939245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 29988062 - 29988399
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  29988062 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcatcttaagcaaagaagatac 29988160  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29988161 tggaactaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttgttcagcgtatgcttgtgt 29988260  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |    
T  29988261 gcaagattccaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactccattatagga 29988360  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29988361 aatccctagattatcagttggttggattctttgatgctg 29988399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5198584 - 5198247
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5198584 aaaatatacaaaggagcttctgaaaaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5198486  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     | | ||   || ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5198485 tgaaacaaaagtagatcagaagttgtatagaggtatgattggttctttgttatacttcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 5198386  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || || |  |    
T  5198385 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagataatctttagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctctatatga 5198286  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198285 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 5198247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5516156 - 5515819
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5516156 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 5516058  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  5516057 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgt 5515958  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  5515957 gtaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 5515858  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5515857 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 5515819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 6495696 - 6496033
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6495696 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 6495794  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6495795 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 6495894  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  6495895 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 6495994  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6495995 aatctctagattataagttgattggattctgtgatgctg 6496033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 10632177 - 10632514
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10632177 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 10632275  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10632276 tggaacaatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 10632375  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  10632376 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgataggaacaactaatcttggactcctgtatagga 10632475  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10632476 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 10632514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13127174 - 13126837
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13127174 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 13127076  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13127075 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgt 13126976  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  13126975 gcaagatttcaatcagttcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 13126876  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13126875 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 13126837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 15656395 - 15656732
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15656395 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15656493  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15656494 tggaactaaagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttataactcactgcatctagaccagatattttatttagtgtatgcttgtgt 15656593  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |  |    
T  15656594 gcaagatttcaaacagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcctgtatagga 15656693  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656694 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 15656732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17965168 - 17964831
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  17965168 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaattgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaatcaaagaagatac 17965070  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||||||   || ||||||||||| || ||||| | ||||||| || |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17965069 tggatcaaaagtagatcagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatatctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 17964970  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| || || |  |    
T  17964969 gcaagattccaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatttgggactcctgtatagga 17964870  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17964869 aatctctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 17964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 20678551 - 20678888
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20678551 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 20678649  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20678650 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 20678749  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  20678750 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 20678849  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  20678850 aatccctagattataagctgattggattctgtgatgctg 20678888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 28319592 - 28319929
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28319592 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 28319690  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28319691 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 28319790  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  28319791 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 28319890  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28319891 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 28319929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38200135 - 38199798
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38200135 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 38200037  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38200036 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 38199937  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  38199936 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 38199837  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38199836 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 38199798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39377567 - 39377230
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39377567 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 39377469  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39377468 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 39377369  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  39377368 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 39377269  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39377268 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 39377230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41689132 - 41688795
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41689132 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 41689034  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  41689033 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttctgt 41688934  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || |  |    
T  41688933 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactagtcttggactcctgtatagga 41688834  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41688833 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 41688795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 9001143 - 9001480
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9001143 aaaatatacaaaagagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaacacttcaa-tgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9001241  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || ||  ||||||| || ||||| | ||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9001242 tggaacagtagtagactagaagctatacagaggtatgattgattctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcggtgtatgcttgtgt 9001341  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9001342 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9001441  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9001442 aatccctagattatctgttggttggattctgtgatgctg 9001480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 9385937 - 9386274
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9385937 aaaatatacaaaagagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9386035  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9386036 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagcgtatgcttgtgt 9386135  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9386136 gcaagatttcaatcagatcctagataatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9386235  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9386236 aatccctagattacaagttggttggattctgtgatgctg 9386274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 11277739 - 11278076
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11277739 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 11277837  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11277838 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 11277937  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  11277938 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 11278037  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11278038 aatccctagattataagttgattagattctgtgatgctg 11278076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13144617 - 13144280
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  13144617 aaaatatacaaaagagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaaaaagatac 13144519  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || ||||||||||| ||||  | |||| || || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13144518 tggaacaaaagtagaccagaagctgtacagagctatgatttgttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 13144419  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  13144418 gcatgatttcagtcagatcctaaagaatctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttatagga 13144319  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13144318 aatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 13144280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 17901443 - 17901780
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17901443 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 17901541  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17901542 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 17901641  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  17901642 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 17901741  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  17901742 aatccctagattataagttgatttgattctgtaatgctg 17901780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1059062 - 1058726
Alignment:
Q  5 aaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatataca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||     
T  1059062 aaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacatgcaccttgagcaaagaatatact 1058964  T
Q  105 ggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtg 204  Q
    ||| |    || ||  ||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1058963 ggaactaaagtagaatagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactacatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtg 1058864  T
Q  205 caagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaa 304  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |  ||    
T  1058863 caagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctgtataggaa 1058764  T
Q  305 aaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1058763 atccctagattaccagttggttggattctgtgatgctg 1058726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 29466559 - 29466896
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  29466559 aaaatatacaaaggagcttctgaaaaagttcaagctagaagactgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcatcttaagcaaagaagatac 29466657  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29466658 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 29466757  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  29466758 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 29466857  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29466858 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 29466896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 1789226 - 1789562
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1789226 aaaatatacaaatgagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatcaaacctgcaccttaagcaaagaagatac 1789324  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| |  |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  1789325 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtataattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattt-attcagtgtatgcttgtgt 1789423  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  1789424 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 1789523  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1789524 aatccctagattataagttggttgtattctgtgatgctg 1789562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 9987241 - 9987578
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9987241 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagttagaagattgtaaattgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9987339  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| |||||||| | ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9987340 tggaacagtagtagaccagaagctatatagaggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9987439  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| || || |  |    
T  9987440 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcagatctctgaaagaaacaactaatcttggactcctgtatagga 9987539  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9987540 aatctctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9987578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 11211448 - 11211785
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11211448 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatacaacctgcaccttaagcaaagaagatac 11211546  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||| | || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  11211547 tggaactgtagtggaccagaagttatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttatgt 11211646  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  11211647 gcaagatttcaatcagatcctagataatctcatttaactacagttaagagaatcttcaggtatatgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 11211746  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11211747 aatccctagattacaagttggttggattctgtgatgctg 11211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37871944 - 37871607
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  37871944 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacttgcaccttaagcaaagaagaaac 37871846  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37871845 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 37871746  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  37871745 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 37871646  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37871645 gatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 37871607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37880462 - 37880125
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  37880462 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacttgcaccttaagcaaagaagaaac 37880364  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37880363 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 37880264  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  37880263 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 37880164  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37880163 gatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 37880125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 339
Target Start/End: Original strand, 17250118 - 17250449
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||  |||    
T  17250118 tatacaaaggagcttcggaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgtaccttaagaaaataagatattgga 17250216  T
Q  108 t-cagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgca 206  Q
      ||  |||  | ||||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17250217 aacaaaggtaaaccagaagctgtatagaggtatgattggttgtttgttatacctcattgcatctaggacatatattttattcagtgtatgcttttgtgca 17250316  T
Q  207 agattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||| || ||    |||     
T  17250317 agattccagtcagatcctagagaatctcatttaactactattaaaagaatctttagatatctaaaagaaacaactaatcttggactcctctatcggaaat 17250416  T
Q  307 ccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17250417 ccctagattatcagttggttggattttgtgatg 17250449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 13267012 - 13267348
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13267012 aaaatatacaaaggagattctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 13267110  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||| | || ||||| | ||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13267111 tggaactatagtagaccagaagttatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatccaaacctgatattttattctgtgtatgcttgtgt 13267210  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |  |    
T  13267211 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaattttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcatgtatagga 13267310  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgct 341  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13267311 aatccctagattacaagttggttggattctgtgatgct 13267348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 18127075 - 18127361
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| ||||||   |||||| |||||||| || ||| ||||    
T  18127075 aaaatatacaaaggagcttatgaagaagttcaagctggaagattttaaagtgatgaa-cactccaatgcatttaacctgtaccttaagcaatgaagatac 18127173  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     | ||||  |||  | || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18127174 tgaatcaaaggtacaccaaaagctgtatagaggtatgattggttctttgttgtacctcattgcatctaaaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 18127273  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggac 291  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18127274 gcaagattccaatcagatccatgagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcagatatttgaaaggaacaacaaatcttggac 18127361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15838705 - 15838462
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |  || |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15838705 aaaatatacaaaagagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagttatgaa-cattccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15838607  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || ||||  ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15838606 tggaacaaaagtagaccagatactgtacagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 15838507  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgtt 248  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15838506 gcaagatttcagtcagaccctagagaatctcatttaacagctgtt 15838462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4409623 - 4409437
Alignment:
Q  156 tacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaa 255  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4409623 tacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaaaagaa 4409524  T
Q  256 tcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4409523 tcttcaggtatctgaaaggaacaactaattttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4409437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 16439690 - 16439922
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16439690 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 16439788  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16439789 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 16439888  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatt 237  Q
    ||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  16439889 gcaagatttaaatcagatccaagagaatctcatt 16439922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17011444 - 17011332
Alignment:
Q  151 tgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaa 250  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17011444 tgttatacctcactgcatcaagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaa 17011345  T
Q  251 gagaatcttcagg 263  Q
    |||||||||||||    
T  17011344 gagaatcttcagg 17011332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Original strand, 16424722 - 16424848
Alignment:
Q  216 tcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |||||||||    
T  16424722 tcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagatt 16424821  T
Q  316 atcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16424822 ataagttgattggattctgtgatgctg 16424848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12751562 - 12751400
Alignment:
Q  178 atattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaac 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  12751562 atattttatttagtgtttgcttgtgtgcaagattacaatcagatcttagagaatttcactaaaccgttgttaagataatcttcaggtatatgaaagaaac 12751463  T
Q  278 aactaatcttggacttctttacac-aaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
     |||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12751462 gactaatcttggcttgctttatacaaaaaaaccaagattataagtttgttggattctgtgatg 12751400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Original strand, 18703903 - 18704135
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  || || | | | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  18703903 tatactaaggagcttctgaagaagtttaagcttgaagactgtaaagagatgaa-cacactaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 18704001  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
    |||  |||  |||| ||| ||| |||||| | ||| ||| ||| ||| || |||||  ||||||| | | ||||| |||||| |  ||||||||||| ||    
T  18704002 tcaaaggtaaatcaaaagttgtttagaggtatgataggttcttggttatatctcacaacatctagactagatattatattcaattaatgcttgtgtgtaa 18704101  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaac 241  Q
    |||| || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  18704102 gatttcaatcagatcctaaagaatctcacttaac 18704135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4428661 - 4428563
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  4428661 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgat-gaacactccaatgcatccaaactgcaccttaagcaaagaagatac 4428563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15838457 - 15838388
Alignment:
Q  273 ggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15838457 ggaacaactaatcttggactcctttataggaagtccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 15838388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16216839 - 16216752
Alignment:
Q  179 tattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtat 266  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| |||||| || | |||||  |||||||| ||||    
T  16216839 tattttattcagtgtgtgtttgtgtgcaagatcccaatcagattctgtagaatcttatttaatcgatattaaggtaatcttcatgtat 16216752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17011315 - 17011280
Alignment:
Q  307 ccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17011315 ccctagattatcatttggttggattctgtgatgctg 17011280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 9768137 - 9768474
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9768137 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9768235  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9768236 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9768335  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9768336 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9768435  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9768436 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9768474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10272425 - 10272088
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10272425 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 10272327  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10272326 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 10272227  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  10272226 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 10272127  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10272126 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 10272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 11400546 - 11400883
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11400546 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 11400644  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11400645 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 11400744  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  11400745 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 11400844  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11400845 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 11400883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 19307793 - 19308130
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19307793 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 19307891  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19307892 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 19307991  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  19307992 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 19308091  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19308092 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 19308130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 21126316 - 21126653
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21126316 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 21126414  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21126415 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 21126514  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  21126515 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 21126614  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21126615 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 21126653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 22939031 - 22939368
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22939031 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 22939129  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22939130 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 22939229  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  22939230 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 22939329  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22939330 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 22939368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 24809748 - 24810085
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24809748 aaaatatacaaaggagcttctgaagaaattcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24809846  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || ||||||||||| | ||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24809847 tggaacaaaagtagaccagaagctgtacataggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 24809946  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  24809947 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcagctatctgaagggaacaactaatcatggactcctttatagga 24810046  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24810047 aatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 24810085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 34795591 - 34795928
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34795591 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 34795689  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34795690 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 34795789  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  34795790 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 34795889  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34795890 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 34795928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 39175468 - 39175805
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39175468 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 39175566  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39175567 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 39175666  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  39175667 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 39175766  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39175767 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 39175805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40246047 - 40245710
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40246047 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 40245949  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40245948 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 40245849  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  40245848 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 40245749  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40245748 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 40245710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18944515 - 18944181
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18944515 aaaatatacaaaggagcttttgaagaagttcaagctgaaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 18944417  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18944416 tggaacaaaggtagaccagaagctgtatagagatatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggtcagatattttattcagtgtatgcttgtgt 18944317  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |  |    
T  18944316 gcaagattccaatcagatcatagagaatctcatttaactattgttaagagaatcttcagatatttgaaaggaacaattaatcttggacttctctatagga 18944217  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18944216 aatccctggattatcagttggttggattttgtgatg 18944181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 9902947 - 9903284
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9902947 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagttagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 9903045  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9903046 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 9903145  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  9903146 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 9903245  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9903246 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 9903284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29249659 - 29249322
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29249659 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 29249561  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29249560 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 29249461  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |  |    
T  29249460 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaattaatcttggactcctgtatagga 29249361  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29249360 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 29249322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4215334 - 4214997
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4215334 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 4215236  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||| | | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  4215235 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaagtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcaatgtatgcttgtgt 4215136  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  4215135 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 4215036  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4215035 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4214997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 24333123 - 24333460
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24333123 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24333221  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24333222 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24333321  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24333322 gcaagatttcaatcagattctagagaatctcatttaattgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24333421  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24333422 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24333460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27226877 - 27226540
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27226877 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 27226779  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27226778 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 27226679  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  27226678 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 27226579  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27226578 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 27226540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35258443 - 35258106
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35258443 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 35258345  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35258344 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 35258245  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  35258244 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 35258145  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35258144 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 35258106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35269068 - 35268731
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35269068 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaaatgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 35268970  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35268969 tggaacagtagtagaccagaagctttacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 35268870  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  35268869 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 35268770  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35268769 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 35268731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43088132 - 43087799
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  43088132 tatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 43088034  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43088033 actgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 43087934  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |    
T  43087933 gatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatc 43087834  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43087833 cctagattataagttgattggattctgtgatgctg 43087799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43350841 - 43350504
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43350841 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctataagagtgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 43350743  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43350742 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 43350643  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  43350642 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 43350543  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43350542 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 43350504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 21167321 - 21167658
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  21167321 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgtatccaacctgcaccttaagcaaagaaggtac 21167419  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21167420 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattgattctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 21167519  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  21167520 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctatatagga 21167619  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21167620 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 21167658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24720764 - 24720438
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24720764 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24720666  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     | | ||  ||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  24720665 tgaaacaaaggtagatcagaagttgtatagaggtgtgattggttctttgttataccttactgcatctaggccaaatattttcttcagtttatgcttgtgt 24720566  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||           ||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24720565 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaaaagaatcttc-----------aggaacaactaatcttggactcctctatagga 24720477  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24720476 aatccttagattatcagttggttggattttgtgatgctg 24720438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 28726691 - 28727028
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28726691 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 28726789  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || | ||| | ||||||| || | || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28726790 tggaactgtagtagaccagaagctatacaaaggtatgattggttctctattatacatcactgcatctagacctgatattttattcagtgtacgcttgtgt 28726889  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  28726890 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 28726989  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  28726990 aattcctagattataagttaattggattctgtgatgctg 28727028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26872405 - 26872068
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26872405 aaaatacacgaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 26872307  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
      || |    || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26872306 tagaactatagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgcgt 26872207  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  26872206 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactacagttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 26872107  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26872106 aatccctagattacaagttggttggattctgtgatgctg 26872068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 24420319 - 24420656
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  || |||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24420319 aaaatatacaaaaaagcttctgaagaagttcaagctaaaaaattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 24420417  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    ||  | || ||||| || ||||| | ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24420418 tggaactatagtaaaccaaaagctatacagaggtatgatgggttcttcgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 24420517  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  24420518 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 24420617  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24420618 aatccctagataataagttggttggattctgtgatgctg 24420656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 28706583 - 28706681
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  28706583 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgat-gaacactccaatgcatccaacctgcaccctaagcaaagaagatac 28706681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Original strand, 28706712 - 28706768
Alignment:
Q  155 gtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatt 211  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28706712 gtatctcactgcatctagaccagatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagatt 28706768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24513881 - 24513787
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  24513881 tatacaaaggagcttctaaagaagttcaaacttgaagattgtaaagtgat-gaacactccaatgcatccaagctgcaccttaagcaaagaagatac 24513787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0863 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0863
Description:

Target: scaffold0863; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Original strand, 2836 - 3169
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||    
T  2836 tatacaaaggagcttatgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaatgag-ccctccaatgcatccaacctacaccttaagcaaagaagatactgga 2934  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||  ||| || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2935 acaaaggtagaccagaagctgtatagagctatgattggttctttgttttacctcattgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttatgtgcaa 3034  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || || |  ||| |    
T  3035 gattccagtcagatcctggagaatctcatttcactattgttaagagaatcttcaagtatctgaaaggagcaactaatcttggactcctctataggaaatc 3134  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135 cctagattatcagttggttggattttgtgatgctg 3169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4384 - 4050
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  4384 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactctaatgcatccaacctgcaccttaagcaaataagatac 4286  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| | ||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||     
T  4285 tggaacaaaggtaggtcagaagttgtatagaggtatgattgattctttgttatacctcactgcatctagaccggatattttattcagtgtatgcttgtgc 4186  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || || |  |    
T  4185 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctctatagga 4086  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4085 aatccctagattatcagttggttggattctgtgatg 4050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3888 - 3555
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  | |    
T  3888 tatacaaaggagcttctgaagaagttcaatctggaagattgtagagtgatgaa-cactctaatgcatccaatctgcaccttaagcaaagaagatattgaa 3790  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
    |||  ||| || |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789 tcaaaggtagaccagaagttgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 3690  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || || |  ||| |    
T  3689 gattccaatcagatcctagagaaactgatttaactgttgttaagagaattttcaggtatctgaaaggatcaactagtcttggactcctctataggaaatc 3590  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3589 cttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 3555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 73870 - 73537
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||    
T  73870 tatactaaggagcttctgaagaagttcaagcttgaagattgtaaagtgatgaacacaccaaa-gcatccaacctgcaccttaagcaatgaagatactgga 73772  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
    |||  | ||||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73771 tcaaagtttgattagaagaagtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 73672  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |    
T  73671 gattccagtcagatcttagagaatctcatttaacaactgttaagaaaatcttcaggtatctgaaaggaacaacaaatcttggactcctttacaggaaatc 73572  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  73571 cttagattataagttggttagattctgttatgctg 73537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 86060 - 85727
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||    
T  86060 tatactaaggagcttctgaagaagttcaagcttgaagattgtaaagtgatgaacacaccaaa-gcatccaacctgcaccttaagcaatgaagatactgga 85962  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
    |||  | ||||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85961 tcaaagtttgattagaagaagtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 85862  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |    
T  85861 gattccagtcagatcttagagaatctcatttaacaactgttaagaaaatcttcaggtatctgaaaggaacaacaaatcttggactcctttacaggaaatc 85762  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  85761 cttagattataagttggttagattctgttatgctg 85727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 130031 - 130368
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  130031 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaaactagaagattgaaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 130129  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   ||  |||||||| |||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130130 tggaacaaaagtatatcagaagttgtatagaggtatgattggttctttattatacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 130229  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||  ||||||||||| || || |  |    
T  130230 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctattaagagaatctttagatatctgaagggaacaaaaaatcttggactcctctatagga 130329  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130330 aattcctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 130368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12207 - 11870
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12207 aaaatattcaaaggagcttatgaagaagttcaaactggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 12109  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     | |  |  ||| || |||||| |||||||| | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12108 tgaaataaaggtagaccagaagatgtatagaagtatgattggttcattgttatacctcactgcatctatgccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 12009  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  12008 gcaagatttgagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctatagga 11909  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11908 aatacctagattatcagttggttggattttttgatgctg 11870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 30177 - 30514
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  30177 aaaatatacaaaggagattatgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactcaaatgcatccaacaagcaccttaagcaaagaagatac 30275  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||  ||    
T  30276 tggaacaaaagtagatcagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattctatgtatgcttacgt 30375  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |  |    
T  30376 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcagatatctgaagggaacaacaaatcttggacttctctatagga 30475  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30476 aatccctagattatcaattggttggattctatgatgctg 30514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 38274 - 38611
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38274 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattataaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 38372  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38373 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 38472  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  38473 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaaatgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 38572  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38573 aatacctagattataagttggttggattctgtgatgctg 38611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 42139 - 42474
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42139 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 42237  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |||  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||     
T  42238 tggaacagtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtg- 42336  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
     ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  42337 -caaaatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagga 42435  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42436 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 42474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3765 - 3561
Alignment:
Q  127 tgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctag 226  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||     
T  3765 tgtatagaggtacgattggttctttgttatacatcactgtatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgcggaagattccagccagatcatat 3666  T
Q  227 agaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggtt 326  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  3665 agaatctcatttaacagttattaatagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctatattatcagttggtt 3566  T
Q  327 ggatt 331  Q
    |||||    
T  3565 ggatt 3561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3860 - 3771
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaa 98  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3860 tatacaaaggagcttctaaagaagttcaaactggaagattgtaaagtgat-gaacactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaa 3771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 160359 - 160696
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  160359 aaaatatacaaatgagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaaaaagatac 160457  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||   || || ||||||||||| ||||  | |||| || || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  160458 tggaacaaaagtagaccagaagctgtacagagctatgatttgttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgt 160557  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  160558 gcatgatttcagtcagatcctaaagaatctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttatagga 160657  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160658 aatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 160696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15112 - 14775
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15112 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctggaaggctgtaaagttgtgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 15014  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| ||  ||| || ||||||||||| ||||  |  |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013 tggaacaaaggtagaccagaagctgtacagagatattattggttcttttctatacctaactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 14914  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |    
T  14913 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatattcaggtatctaaaaggaacaactaatctttgactcctctatagga 14814  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14813 aatcccaagattatcagttggttggattttgtgatgctg 14775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 21578 - 21915
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||     
T  21578 aaaatatactaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctacaccttaagcaaagaagatat 21676  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     |||||||| ||  | || ||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  21677 gggatcagcagtaaaccaaaagttgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactacatctaggccagatattttatttagtgtatgcatgtgt 21776  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  21777 gcaagatttcaatcagatcctagagaatcttatttaactgctattaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctctatagga 21876  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21877 aatccatagattatcagttggttggatcttgtgatgctg 21915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25905 - 25572
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  25905 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaaacaaagaagatac 25807  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||  ||   || || ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    |||    
T  25806 tggtacaaaagtagaccagaagctgtacagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatg----tgt 25711  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |    
T  25710 gcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatctttagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctttatagga 25611  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25610 aatccctagattatcagttggttggattctatgatgctg 25572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Original strand, 6060 - 6332
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||    
T  6060 tatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatacttga 6158  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||   || ||  |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6159 acaaaagtagacaagaagcagtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattctattcagtgtatgcttgtgtgcaa 6258  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaact 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6259 gattccagtcagatccaagagaatctcatttaactgctgttatgagaatcttcaggtatctgaaaggaacaact 6332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 7158 - 7492
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7158 aaaatatacaaaggagcttctgaaaaagttcaagctggaagacagtaaagtcatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatac 7256  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     | | ||  ||||   ||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7257 tgaaacaaaggttatccagcagctgtacagaggtatgattggttctttgttatacctaactgcatctaggcaagatattttattcagtgtatgcttgtgt 7356  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  7357 gctagattccagtcagatcctagagaatcttatttaacttatgttaagaaaatcttcagatatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctatagta 7456  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7457 aatccctagattatcagttggttggattttgtgatg 7492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 117 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3511 - 3286
Alignment:
Q  117 gatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagt 216  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511 gatcagaagttgtatagaggtatgattggttctttgttataccttactgcatctagggatgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagt 3412  T
Q  217 cagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagatta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||||||    
T  3411 cagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctagatta 3312  T
Q  317 tcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3311 tcagttggttggattttgtgatgctg 3286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3548
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 54  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3594 tatacaaaggagcttttgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 3548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 4764 - 5101
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4764 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagtttaagctagaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatat 4862  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| |    || || |||||| |||| ||||| | ||||||| || | || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4863 tggaactaaagtagaccagaagttgtacagaggtatgattggttctctattatacctcactgcatctagaccagatattttatttagtgtatgcttgtgt 4962  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | || |  |    
T  4963 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcatgtatagga 5062  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5063 aatcccgagattatcaattggttggattatgtgatgctg 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 48332 - 48669
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  48332 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagactgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcatcttaagcaaagaagatac 48430  T
Q  104 aggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48431 tggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactacatctatacctgatattttattcagtgtatgcttgtgt 48530  T
Q  204 gcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaa 303  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |  |    
T  48531 gcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaattaatcttggactcctgtatagga 48630  T
Q  304 aaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48631 aatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 48669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2510
Alignment:
Q  20 cttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgat 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||| ||| ||     
T  2773 cttctgaagaagttcaagatggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaaaatattggaacagaggtagac 2675  T
Q  120 cagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcag 219  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2674 cagaagctttttagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccaaatattttattcagcgtatgcttgtgtgcaagattccaggcag 2575  T
Q  220 atcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaat 284  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2574 atcctagagaatctcattcaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaattaat 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 342
Target Start/End: Original strand, 7467 - 7689
Alignment:
Q  120 cagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcag 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7467 cagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactacatctaggtcagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaataag 7566  T
Q  220 atcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatca 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |  ||||||||||    
T  7567 atcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggacttctctataggaaatcattagattatca 7666  T
Q  320 gttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  7667 gttggttggattttgtgatgctg 7689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8231 - 7898
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||  ||    
T  8231 tatacaaaggagcttatgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaatgaa-cactccaatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagacactaga 8133  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||  ||| ||  |||||||||||||||  | |||   | || | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8132 acaaaggtagactagaagctgtatagagttatgatccattctctattatacctcactgcatctaagccaaatattttattcagtgtatgtttgtgtgcaa 8033  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaac 307  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || |  ||| |    
T  8032 aattctagtcagatcctggagaatctcatttaactgccgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactcatcttggacttgtctataggaaatc 7933  T
Q  308 cctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7932 cctagattattagttggttggattttgtgatgctg 7898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 342
Target Start/End: Original strand, 14172 - 14439
Alignment:
Q  75 ccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggc 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||  ||| || |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14172 ccaacctgcaccttaagcaaataagatactggaacaaaggtagaccagaagttgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggc 14271  T
Q  175 catatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaagg 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14272 cagatattttattcagtgtatgcttgtgtgaaagattacaatcagatcctagagaatctcatttaactactgttaagagaatcttcatgtatttgaaagg 14371  T
Q  275 aacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    |||||||||||||||||| || || |  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  14372 aacaactaatcttggactcctctataggaaatcccaagattattagttggttgaattttgtgatgctg 14439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 10905 - 10955
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 54  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905 aaaatatacaaaggagcttcagaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 10955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 339
Target Start/End: Original strand, 1588 - 1859
Alignment:
Q  68 aatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgca 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||  ||| ||  ||||| | |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1588 aatgcatccaacctgcaccttaagcaaagaagatactggaacaaaggtagactagaagttatatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgca 1687  T
Q  168 tctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatg 267  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||     
T  1688 tctaggccagatattttattaaatatatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctaaagaatctcatttaactattgttaagagaatcttcaggtatc 1787  T
Q  268 tgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  | |  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1788 tgaaaggaacaactaatcttggaatcctcaataggaagtccctagattattagttggttggattctgtgatg 1859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38760 - 38507
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || | ||  ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  38760 tatacaaacgagcttctgaagaagttcaagctggaaaatggtaaagtaatgaa-cactacaatgcattcaacctgcaccttaagcaaagaagatactgga 38662  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaa 207  Q
     ||  ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38661 acaaaggtagatcataagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatct--gctagatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaa 38564  T
Q  208 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38563 gattccagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggt 38507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 178 - 342
Target Start/End: Original strand, 48815 - 48979
Alignment:
Q  178 atattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48815 atattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaac 48914  T
Q  278 aactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 342  Q
    ||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48915 aactaatcttggactcctttattggaaatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 48979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1835 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1835
Description:

Target: scaffold1835; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 901 - 601
Alignment:
Q  24 tgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgatcaga 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| ||   || || ||||    
T  901 tgaagaagttcaagctggaaaattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaacctacaccttaagcaaagaagatactggaacaaatgtagaccaga 803  T
Q  124 agctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcc 223  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  802 agctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctag-ccagatattttattcagagtatgcttctgtgcaatattccagtctgatcc 704  T
Q  224 tagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttg 323  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| || || |  ||| || |||||||| |||||    
T  703 tagagaatctcatttaagtgctgttaagagaatattcaagtatttgaaaggaacaaccaatattggactcctctataggaaatccttagattattagttg 604  T
Q  324 gtt 326  Q
    |||    
T  603 gtt 601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10109
Alignment:
Q  24 tgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacaggatcagcggttgatcaga 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | || || ||||    
T  10325 tgaagaagttcaaactggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatctaacctgcaccttaagcaaagaagatactggatcaacagtagaccaga 10227  T
Q  124 agctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcc 223  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10226 agctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactacatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcc 10127  T
Q  224 tagagaatctcatttaac 241  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10126 tagagaatctcatttaac 10109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1578 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1578
Description:

Target: scaffold1578; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 530
Alignment:
Q  8 tatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatatacagga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||    
T  724 tatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtgatgaa-cactccaatgcatccaaccttcaccttaagcaaagaagatactgga 626  T
Q  108 tcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgt 203  Q
     ||  ||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  625 acaaaggtagaccagaagctgtatagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggtcagatattttatttagtgtatgcttgtgt 530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 74394 - 74061
Alignment:
Q  5 aaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgcacccaacctgcaccttaagaaaagaatataca 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||  | |||| | || ||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  74394 aaatacacaaaggagcttctgaagaagttcaagcttgatgattgtaaagagatgaacacttcaa-tacatccaacctgcaccttaagcaaataagataca 74296  T
Q  105 ggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtg 204  Q
     || |   ||| ||||||||| ||| |||||| |  || ||| | ||||| | ||| ||| ||||||  ||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  74295 tgagctaaggtagatcagaagttgtgtagaggtataataggttcattgttattcctaactacatctacacctaatattttatttattgtatgcttgtgtg 74196  T
Q  205 caagattccagtcagatcctagagaatctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaa 304  Q
    |||  || || ||| || ||| ||||||| || ||||   ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||    
T  74195 caacgtttcaatcatattctaaagaatctaatgtaacaattgttaagagaatctttagatatttgaaaggaacaactaatcttgaacttctttataacaa 74096  T
Q  305 aaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    |  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  74095 atacttagattataagttggttggattctgtgatg 74061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 7590 - 7945
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttc-aagctggaagattgtaaagtaataaaaccctcaaatgca-cccaacctgcaccttaag-aaaagaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  |  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |    
T  7590 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaaagctagaagattgtaaagtgatgaacactccaaatgcatccaaacctgcaccttaagcaaaagaaga 7689  T
Q  101 tacaggatcagcggttgatcagaagctgtatagaggcacgattggtactttgttgta-cctcactgcatctaggccat-ata-ttttattcagtgta-tg 196  Q
    ||| ||| | |  || || |||||||| || ||||| | ||||||| || |||| || ||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||    
T  7690 tactggaactgtagtagaccagaagctatacagaggtatgattggttctctgttataccctcactgcatctagaccttgatatttttattcagtgtattg 7789  T
Q  197 cttgtgt-gcaaga-ttccagtcaga-tcctagagaa-tctcattt-aaccgctg-ttaagagaa-tcttcaggtatgtgaaagg-aacaact-aatctt 287  Q
    ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  7790 cttgtgtagcaagattttcaatcagattcctagagaattctcatttaaactgcagtttaagagaattcttcaggtatctgaaaggtaacaactaaatctt 7889  T
Q  288 ggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttgga-ttctgtgatgctg 342  Q
    | ||| || || |  ||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7890 gtactcctgtataggaaatccctagactataagttgattggacttctgtgatgctg 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 13303 - 13353
Alignment:
Q  4 aaaatatacaaaggatcttctgaagaagttcaagctggaagattgtaaagt 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13303 aaaatatacaaaggagcttctgaagaagttcaagctagaagattgtaaagt 13353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43011 - 42941
Alignment:
Q  269 gaaaggaacaactaatcttggacttctttacacaaaaaccctagattatcagttggttggattctgtgatg 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43011 gaaaggaacaactaatcttagactcctctatagaaaatccctagattatcagttggttggattttgtgatg 42941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University