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Alignment Overview

Query: NF21677_high_9 (Length: 330)

Name: NF21677_high_9
Description: NF21677
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21677_high_9
NF21677_high_9
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (23-303)||(16376349-16376629)
chr6 (23-303)||(16383673-16383953)
chr6 (23-303)||(10488699-10488979)
chr6 (23-303)||(16556115-16556395)
chr6 (23-303)||(16632671-16632951)
chr6 (23-303)||(22225714-22225994)
chr6 (23-303)||(1556005-1556285)
chr6 (23-303)||(19610018-19610298)
chr6 (103-303)||(16231972-16232172)
chr6 (103-303)||(18086799-18086999)
chr6 (103-303)||(13620770-13620970)
chr6 (103-303)||(23977849-23978049)
chr6 (161-303)||(19299375-19299517)
chr6 (92-303)||(29665942-29666153)
chr6 (197-303)||(22251542-22251648)
chr6 (23-110)||(33314387-33314474)
chr6 (143-303)||(29869752-29869911)
chr6 (88-206)||(27740903-27741021)
chr6 (160-281)||(14626124-14626243)
chr6 (191-303)||(1650077-1650189)
chr6 (224-303)||(16825724-16825803)
chr6 (191-303)||(25175731-25175843)
chr6 (144-281)||(15862592-15862728)
chr6 (130-281)||(35009445-35009595)
chr6 (251-303)||(27653955-27654007)
chr6 (144-281)||(1657754-1657890)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (23-303)||(1467715-1467995)
chr3 (23-303)||(49232436-49232716)
chr3 (23-303)||(25058739-25059019)
chr3 (23-303)||(12902066-12902346)
chr3 (27-302)||(5228317-5228591)
chr3 (67-303)||(22275253-22275489)
chr3 (67-303)||(15468316-15468552)
chr3 (23-303)||(12264768-12265049)
chr3 (103-303)||(18911073-18911273)
chr3 (120-303)||(12811938-12812121)
chr3 (23-303)||(44228985-44229265)
chr3 (97-303)||(54651531-54651737)
chr3 (23-145)||(18897133-18897255)
chr3 (193-303)||(18897020-18897130)
chr3 (45-281)||(11986172-11986408)
chr3 (162-303)||(16821280-16821419)
chr3 (191-303)||(55316387-55316499)
chr3 (134-303)||(15936611-15936779)
chr3 (191-303)||(41270243-41270355)
chr3 (161-303)||(15614973-15615113)
chr3 (134-303)||(15938453-15938621)
chr3 (160-281)||(51158024-51158143)
chr3 (105-239)||(17912530-17912662)
chr3 (191-281)||(15859030-15859120)
chr3 (191-287)||(13839061-13839157)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (23-303)||(11231314-11231594)
chr2 (23-303)||(22513161-22513441)
chr2 (23-303)||(28775783-28776063)
chr2 (23-303)||(24685757-24686037)
chr2 (23-303)||(12728392-12728672)
chr2 (23-303)||(34824475-34824755)
chr2 (23-303)||(16935593-16935873)
chr2 (23-303)||(17006253-17006533)
chr2 (23-303)||(23778021-23778301)
chr2 (103-303)||(8943926-8944126)
chr2 (103-303)||(12635844-12636044)
chr2 (103-303)||(42177945-42178145)
chr2 (103-303)||(3798579-3798779)
chr2 (103-303)||(12641618-12641818)
chr2 (23-303)||(21141895-21142175)
chr2 (143-303)||(23774257-23774416)
chr2 (143-303)||(5888606-5888765)
chr2 (160-287)||(7507844-7507969)
chr2 (191-303)||(19886633-19886745)
chr2 (130-281)||(25265396-25265546)
chr2 (160-281)||(462876-462995)
chr2 (192-281)||(20627319-20627408)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (23-303)||(31309-31589)
scaffold0107 (23-303)||(39646-39926)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (23-303)||(39103-39383)
scaffold0076 (161-303)||(43137-43277)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (23-303)||(271336-271616)
chr8 (23-303)||(644304-644584)
chr8 (23-303)||(830039-830319)
chr8 (23-303)||(22088770-22089050)
chr8 (23-303)||(15319135-15319415)
chr8 (23-303)||(15499504-15499784)
chr8 (23-303)||(22006234-22006514)
chr8 (23-303)||(13662241-13662521)
chr8 (103-303)||(13720904-13721104)
chr8 (23-303)||(16195230-16195511)
chr8 (103-303)||(16873027-16873227)
chr8 (161-303)||(21844544-21844684)
chr8 (161-303)||(21851937-21852077)
chr8 (160-303)||(24549120-24549261)
chr8 (160-302)||(6774231-6774371)
chr8 (142-303)||(16674364-16674524)
chr8 (191-303)||(30120890-30121002)
chr8 (144-281)||(17345690-17345826)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (23-303)||(7822728-7823008)
chr7 (23-303)||(7830039-7830319)
chr7 (23-303)||(27101613-27101893)
chr7 (23-303)||(27108961-27109241)
chr7 (23-303)||(27176433-27176713)
chr7 (23-303)||(38783705-38783985)
chr7 (23-303)||(15950767-15951047)
chr7 (23-303)||(15760090-15760370)
chr7 (103-303)||(18979997-18980197)
chr7 (103-303)||(14250874-14251074)
chr7 (103-303)||(15927648-15927848)
chr7 (103-303)||(13758450-13758650)
chr7 (156-299)||(48622646-48622788)
chr7 (143-303)||(10000346-10000505)
chr7 (143-303)||(16418618-16418777)
chr7 (74-281)||(13321065-13321273)
chr7 (161-303)||(13572816-13572956)
chr7 (160-303)||(16478934-16479075)
chr7 (142-303)||(13910996-13911156)
chr7 (191-303)||(10989577-10989689)
chr7 (191-303)||(18253819-18253931)
chr7 (191-303)||(2437625-2437737)
chr7 (160-281)||(47481037-47481156)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (23-303)||(35582036-35582316)
chr5 (23-303)||(21932357-21932637)
chr5 (23-303)||(21938527-21938807)
chr5 (23-303)||(22883060-22883340)
chr5 (23-303)||(36989746-36990026)
chr5 (23-303)||(1219496-1219776)
chr5 (23-303)||(7425324-7425604)
chr5 (67-303)||(17471564-17471800)
chr5 (103-303)||(10777946-10778146)
chr5 (103-303)||(23514641-23514841)
chr5 (23-303)||(35791074-35791355)
chr5 (23-303)||(11212041-11212321)
chr5 (143-303)||(23328678-23328837)
chr5 (143-303)||(24616282-24616441)
chr5 (143-303)||(24712658-24712817)
chr5 (143-303)||(24745676-24745835)
chr5 (47-281)||(32950717-32950952)
chr5 (161-303)||(27009981-27010121)
chr5 (191-303)||(18777964-18778076)
chr5 (160-303)||(29188256-29188397)
chr5 (191-302)||(43443368-43443479)
chr5 (191-303)||(12542-12654)
chr5 (191-303)||(25426796-25426908)
chr5 (191-303)||(19500067-19500179)
chr5 (191-303)||(22366453-22366565)
chr5 (142-303)||(4199957-4200117)
chr5 (251-303)||(21073567-21073619)
chr5 (144-278)||(34939398-34939531)
chr5 (92-281)||(18531073-18531261)
chr5 (23-70)||(23328558-23328605)
chr5 (25-70)||(24616165-24616210)
chr5 (25-70)||(24712541-24712586)
chr5 (25-70)||(24745559-24745604)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (23-303)||(17004638-17004918)
chr1 (23-303)||(18059734-18060014)
chr1 (23-303)||(38055067-38055347)
chr1 (28-303)||(46523394-46523669)
chr1 (103-303)||(17148647-17148847)
chr1 (161-303)||(19962475-19962617)
chr1 (143-303)||(7640910-7641069)
chr1 (143-303)||(22035568-22035727)
chr1 (160-303)||(22227947-22228088)
chr1 (160-303)||(22232644-22232785)
chr1 (191-303)||(5072360-5072472)
chr1 (191-303)||(18601090-18601202)
chr1 (160-303)||(2116393-2116534)
chr1 (160-303)||(45051561-45051702)
chr1 (160-281)||(20913168-20913287)
chr1 (160-281)||(20931483-20931602)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (23-303)||(29162-29442)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (23-303)||(153983-154263)
scaffold0023 (251-303)||(169884-169936)
scaffold0023 (257-303)||(36327-36373)
scaffold0023 (191-281)||(48765-48855)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (23-303)||(18168970-18169250)
chr4 (23-303)||(19020486-19020766)
chr4 (23-303)||(15287221-15287501)
chr4 (23-303)||(15294330-15294610)
chr4 (103-302)||(7132042-7132241)
chr4 (23-303)||(17145633-17145913)
chr4 (23-303)||(18248218-18248498)
chr4 (103-303)||(20000803-20001003)
chr4 (144-303)||(22738390-22738549)
chr4 (23-233)||(8374508-8374718)
chr4 (143-303)||(26339140-26339299)
chr4 (158-303)||(22352040-22352184)
chr4 (162-303)||(10644360-10644499)
chr4 (239-303)||(8378367-8378431)
chr4 (92-239)||(40885602-40885748)
chr4 (251-303)||(47357882-47357934)
chr4 (74-281)||(15675095-15675301)
chr4 (92-281)||(10104256-10104444)
chr4 (74-239)||(31115680-31115844)
chr4 (23-64)||(22738269-22738310)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (23-303)||(1551-1831)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (23-303)||(10315-10595)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (23-303)||(2392-2672)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (23-272)||(3-252)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (23-297)||(34140-34414)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (103-303)||(1490-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (23-303)||(7432-7712)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (23-303)||(54416-54696)
scaffold0066 (74-303)||(45081-45310)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (156-302)||(54008-54153)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (160-303)||(5188-5329)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (143-303)||(6718-6877)
scaffold0183 (23-70)||(6598-6645)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (156-302)||(3547-3692)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (92-281)||(56105-56294)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (143-303)||(7330-7489)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (191-303)||(3890-4002)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (105-303)||(3045-3242)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (143-303)||(23725-23884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (163-302)||(177-314)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (160-303)||(9321-9462)
scaffold0215 (160-303)||(16219-16360)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (191-303)||(1276-1388)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (161-303)||(64495-64640)
scaffold0026 (191-303)||(107914-108026)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (160-303)||(13297-13438)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (161-303)||(21088-21228)
scaffold0139 (161-303)||(14034-14173)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (251-303)||(10724-10776)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (158-281)||(3324-3447)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (257-303)||(12103-12149)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (191-281)||(41815-41905)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (130-281)||(13613-13763)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (160-281)||(3588-3707)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (137-281)||(962-1105)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (160-281)||(36919-37038)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (190-281)||(12279-12370)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (108-281)||(8934-9106)
scaffold0025 (160-281)||(148859-148978)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (191-281)||(540-630)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (191-281)||(6070-6160)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (191-281)||(34466-34556)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (191-281)||(89460-89550)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (257-303)||(31647-31693)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (160-281)||(19344-19463)
scaffold0195 (160-281)||(21428-21547)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (130-281)||(8186-8336)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16376629 - 16376349
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
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16376629 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16376530  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16376529 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16376430  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16376429 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16376349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16383953 - 16383673
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
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16383953 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16383854  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16383853 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16383754  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16383753 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16383673  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 10488699 - 10488979
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
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10488699 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 10488798  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10488799 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 10488898  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10488899 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 10488979  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16556395 - 16556115
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
16556395 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16556296  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16556295 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16556196  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16556195 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16556115  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16632951 - 16632671
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
16632951 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16632852  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16632851 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16632752  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16632751 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16632671  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22225994 - 22225714
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22225994 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 22225895  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22225894 caatcaaaacatttcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22225795  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22225794 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 22225714  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 1556005 - 1556285
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
1556005 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 1556104  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1556105 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1556204  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1556205 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 1556285  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 19610018 - 19610298
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||    
19610018 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaactacatctcattt 19610117  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19610118 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataattttataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 19610217  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
19610218 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatac 19610298  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 16231972 - 16232172
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16231972 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16232071  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16232072 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 16232171  T
303 c 303  Q
    |    
16232172 c 16232172  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18086999 - 18086799
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18086999 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18086900  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18086899 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18086800  T
303 c 303  Q
    |    
18086799 c 18086799  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13620970 - 13620770
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
13620970 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaattt 13620871  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13620870 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13620771  T
303 c 303  Q
    |    
13620770 c 13620770  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 23977849 - 23978049
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23977849 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23977948  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
23977949 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 23978048  T
303 c 303  Q
    |    
23978049 c 23978049  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299517
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
19299375 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19299474  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19299475 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatac 19299517  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 303
Target Start/End: Original strand, 29665942 - 29666153
Alignment:
92 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 191  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||| || |||| |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
29665942 acatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatgcatactttgaa 29666041  T
192 acatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaac 291  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
29666042 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcacc 29666141  T
292 ccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||    
29666142 ccattttcatac 29666153  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251542
Alignment:
197 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
297 ttcatac 303  Q
    |||||||    
22251548 ttcatac 22251542  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 33314474 - 33314387
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33314474 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaat 33314387  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29869911 - 29869752
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
29869911 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacacttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 29869812  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
29869811 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 29869752  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 27740903 - 27741021
Alignment:
88 aaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactt 187  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  |  || || |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
27740903 aaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactt 27741002  T
188 tgaaacatgtaatttcacc 206  Q
     ||||||||||||||||||    
27741003 cgaaacatgtaatttcacc 27741021  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14626243 - 14626124
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||    
14626243 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 14626146  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
14626145 gagcacgaatttagcaataatt 14626124  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1650189 - 1650077
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  ||  || | |||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||    
1650189 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 1650090  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
1650089 cccattttcatac 1650077  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16825803 - 16825724
Alignment:
224 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
16825803 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 16825724  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 25175731 - 25175843
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| |||||  || ||| |  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
25175731 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 25175830  T
291 cccattttcatac 303  Q
     ||||||||||||    
25175831 tccattttcatac 25175843  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862728
Alignment:
144 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  |    
15862592 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaa 15862689  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    | ||| | ||||||  ||||||||||||||  |||||||    
15862690 acataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaatt 15862728  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35009595 - 35009445
Alignment:
130 aacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatca 228  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||    
35009595 aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 35009498  T
229 attcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||| |||||  ||  || | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
35009497 attcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 35009445  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27654007 - 27653955
Alignment:
251 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||    
27654007 tcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatac 27653955  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1657890 - 1657754
Alignment:
144 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||   ||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||||   |    
1657890 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaa 1657793  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    | ||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
1657792 acataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 1657754  T

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Target: chr3 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1467995 - 1467715
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
1467995 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 1467896  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1467895 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 1467796  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
1467795 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 1467715  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 49232436 - 49232716
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
49232436 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 49232535  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
49232536 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 49232635  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
49232636 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 49232716  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 25058739 - 25059019
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
25058739 catcatcaattcacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcataagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 25058838  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
25058839 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 25058938  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
25058939 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 25059019  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12902346 - 12902066
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
12902346 catcattaatccacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagtatcagttaataataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 12902247  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12902246 caatcaaaacatatcaaatttaatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12902147  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
12902146 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatac 12902066  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 302
Target Start/End: Original strand, 5228317 - 5228591
Alignment:
27 atcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 126  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
5228317 atcaattcacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacacctcatttcaat 5228416  T
127 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
5228417 caaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 5228516  T
227 caattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
5228517 caattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa-tgttcatcaacccattttcata 5228591  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 67 - 303
Target Start/End: Original strand, 22275253 - 22275489
Alignment:
67 acaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcata 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
22275253 acaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatg 22275352  T
167 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
22275353 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacg 22275452  T
267 aatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22275453 aatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 22275489  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 67 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15468552 - 15468316
Alignment:
67 acaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcata 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
15468552 acaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatg 15468453  T
167 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
15468452 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacg 15468353  T
267 aatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
15468352 aatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatac 15468316  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12265049 - 12264768
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
12265049 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 12264950  T
123 caatcaaaacatatcaaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccata 221  Q
    |||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12264949 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 12264850  T
222 atcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12264849 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 12264768  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 18911073 - 18911273
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18911073 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18911172  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18911173 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18911272  T
303 c 303  Q
    |    
18911273 c 18911273  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 120 - 303
Target Start/End: Original strand, 12811938 - 12812121
Alignment:
120 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacatacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
12811938 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataaattcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacatacca 12812037  T
220 taatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
12812038 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatac 12812121  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 44228985 - 44229265
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
44228985 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 44229084  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
44229085 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 44229184  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
44229185 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 44229265  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 303
Target Start/End: Original strand, 54651531 - 54651737
Alignment:
97 aatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatg 196  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
54651531 aatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgcaacatg 54651630  T
197 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 296  Q
     |||||||| || || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
54651631 caatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccatt 54651730  T
297 ttcatac 303  Q
    |||||||    
54651731 ttcatac 54651737  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18897255 - 18897133
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
18897255 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 18897156  T
123 caatcaaaacatatcaaatttca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||    
18897155 caatcaaaacatatcaaatttca 18897133  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18897020
Alignment:
193 catgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacc 292  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
18897130 catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc 18897031  T
293 cattttcatac 303  Q
    |||||||||||    
18897030 cattttcatac 18897020  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11986408 - 11986172
Alignment:
45 atacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttc 144  Q
    |||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||| |  | | |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||| |||    
11986408 atacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattc 11986309  T
145 atcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaa 244  Q
    |  | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || ||| ||| | ||||    
11986308 actatttgagcacaatttcataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaa 11986209  T
245 atagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
11986208 ataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 303
Target Start/End: Original strand, 16821280 - 16821419
Alignment:
162 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaaga 261  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||| | |||||  || ||| | |||||||||||    
16821280 tcatagcttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaaga 16821377  T
262 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
16821378 gcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatac 16821419  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 55316387 - 55316499
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
55316387 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 55316486  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
55316487 cccattttcatac 55316499  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15936779 - 15936611
Alignment:
134 tatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattc 232  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||||| || |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||    
15936779 tatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacaca-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc 15936682  T
233 aagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    | |||||  || ||| | | ||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
15936681 atgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatac 15936611  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 41270243 - 41270355
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
41270243 aacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 41270342  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
41270343 cccattttcatac 41270355  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 15614973 - 15615113
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| |  ||||| |||    
15614973 ttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaag 15615070  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
15615071 agcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 15615113  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15938621 - 15938453
Alignment:
134 tatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattc 232  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||||| || |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||    
15938621 tatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacaca-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc 15938524  T
233 aagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    | |  ||  || ||| | | ||||   ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
15938523 atgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatac 15938453  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 51158143 - 51158024
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
51158143 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 51158046  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
51158045 gagcacgaatttagcaacaatt 51158024  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17912662 - 17912530
Alignment:
105 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttc 203  Q
    |||||||| | |||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
17912662 atgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaatt-catcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatattt--aaacatgtaatttc 17912566  T
204 acccataaacataccataatcatcaattcaagcata 239  Q
    ||| | || ||||| || |||||||||||| |||||    
17912565 accaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 17912530  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15859120 - 15859030
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   ||||||||||||| ||||||||    
15859120 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 15859030  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 287
Target Start/End: Original strand, 13839061 - 13839157
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||    
13839061 aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcat 13839157  T

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Target: chr2 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11231594 - 11231314
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11231594 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 11231495  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11231494 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 11231395  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
11231394 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 11231314  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22513441 - 22513161
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22513441 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22513342  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22513341 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22513242  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22513241 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 22513161  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28776063 - 28775783
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
28776063 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 28775964  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28775963 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 28775864  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
28775863 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 28775783  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24686037 - 24685757
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
24686037 catcatcaatccacaattaagtatacctaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 24685938  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24685937 caatcaaaacacatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 24685838  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
24685837 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 24685757  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 12728392 - 12728672
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
12728392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 12728491  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12728492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12728591  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12728592 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 12728672  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 34824475 - 34824755
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
34824475 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 34824574  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
34824575 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34824674  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
34824675 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 34824755  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 16935593 - 16935873
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
16935593 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 16935692  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
16935693 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 16935792  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16935793 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 16935873  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 17006253 - 17006533
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
17006253 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 17006352  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
17006353 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 17006452  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17006453 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 17006533  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23778301 - 23778021
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
23778301 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 23778202  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
23778201 caatcaaatcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 23778102  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
23778101 tcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 23778021  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 8943926 - 8944126
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103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
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8943926 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 8944025  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
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8944026 cacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 8944125  T
303 c 303  Q
    |    
8944126 c 8944126  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12636044 - 12635844
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12636044 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12635945  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
12635944 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcata 12635845  T
303 c 303  Q
    |    
12635844 c 12635844  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42178145 - 42177945
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42178145 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 42178046  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
42178045 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 42177946  T
303 c 303  Q
    |    
42177945 c 42177945  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3798779 - 3798579
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3798779 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 3798680  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
3798679 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 3798580  T
303 c 303  Q
    |    
3798579 c 3798579  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12641818 - 12641618
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12641818 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12641719  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
12641718 cagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 12641619  T
303 c 303  Q
    |    
12641618 c 12641618  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 21141895 - 21142175
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
21141895 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 21141994  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
21141995 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 21142094  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
21142095 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 21142175  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 23774257 - 23774416
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23774257 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23774356  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
23774357 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 23774416  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5888765 - 5888606
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
5888765 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 5888667  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     || |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
5888666 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 5888606  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7507969 - 7507844
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||    
7507969 tttcataacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa 7507872  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcat 287  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||    
7507871 gagcacgaatttagcaataattattcat 7507844  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19886745 - 19886633
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
19886745 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 19886646  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
19886645 cccattttcatac 19886633  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25265546 - 25265396
Alignment:
130 aacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatca 228  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||    
25265546 aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 25265449  T
229 attcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||| |||||  || ||| | ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
25265448 attcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 25265396  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Original strand, 462876 - 462995
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
462876 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttg 462973  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
462974 gagcacgaatttagcaacaatt 462995  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20627408 - 20627319
Alignment:
192 acatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||  |||||  || ||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||    
20627408 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaatt 20627319  T

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Target: scaffold0107 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 31309 - 31589
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
31309 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 31408  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31409 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 31508  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
31509 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 31589  T

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Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 39646 - 39926
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
39646 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatgaaatatgaataacatctcattt 39745  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
39746 caaaaaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataa 39845  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
39846 tcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 39926  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39383
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
39103 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 39202  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39203 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 39302  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
39303 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 39383  T

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Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 43137 - 43277
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | || |||||||    
43137 ttcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaag 43234  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
43235 agcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatac 43277  T

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Target: chr8 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 271616 - 271336
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
271616 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 271517  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
271516 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 271417  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
271416 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 271336  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 644304 - 644584
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
644304 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 644403  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
644404 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 644503  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
644504 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 644584  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 830039 - 830319
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 830138  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 830238  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 830319  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22089050 - 22088770
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22089050 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22088951  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
22088950 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataa 22088851  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
22088850 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatac 22088770  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15319415 - 15319135
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
15319415 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15319316  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15319315 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15319216  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15319215 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 15319135  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15499784 - 15499504
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
15499784 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15499685  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15499684 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15499585  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15499584 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 15499504  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22006514 - 22006234
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
22006514 catcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 22006415  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22006414 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 22006315  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22006314 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 22006234  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13662521 - 13662241
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
13662521 catcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 13662422  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
13662421 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 13662322  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
13662321 tcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatac 13662241  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13721104 - 13720904
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13721104 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13721005  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13721004 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13720905  T
303 c 303  Q
    |    
13720904 c 13720904  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 16195230 - 16195511
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||   ||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
16195230 catcatcaatccataattatatatacctaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 16195329  T
123 caatcaaaacatatcaaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccata 221  Q
    |||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16195330 caacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 16195429  T
222 atcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
16195430 atcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 16195511  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16873227 - 16873027
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16873227 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16873128  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
16873127 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 16873028  T
303 c 303  Q
    |    
16873027 c 16873027  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21844684 - 21844544
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
21844684 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 21844587  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
21844586 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatac 21844544  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21852077 - 21851937
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||| |||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
21852077 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 21851980  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
21851979 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatac 21851937  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Original strand, 24549120 - 24549261
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
24549120 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 24549217  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
24549218 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 24549261  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6774371 - 6774231
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
6774371 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 6774274  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
6774273 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcata 6774231  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16674524 - 16674364
Alignment:
142 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataa 240  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||| | || ||||| |  | ||| |||||| ||||||    
16674524 ttcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataa 16674427  T
241 gaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     || ||| | |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
16674426 aaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatac 16674364  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 30120890 - 30121002
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | ||| |||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
30120890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 30120989  T
291 cccattttcatac 303  Q
    | |||||||||||    
30120990 ctcattttcatac 30121002  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Original strand, 17345690 - 17345826
Alignment:
144 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||   ||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  |    
17345690 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataa 17345787  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    | ||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||    
17345788 acataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaatt 17345826  T

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Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 7822728 - 7823008
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
7822728 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7822827  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7822828 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7822927  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
7822928 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 7823008  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 7830039 - 7830319
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
7830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7830138  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7830238  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
7830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 7830319  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27101893 - 27101613
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
27101893 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27101794  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27101793 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27101694  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27101693 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 27101613  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27109241 - 27108961
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
27109241 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27109142  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27109141 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27109042  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27109041 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 27108961  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 27176433 - 27176713
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
27176433 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27176532  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27176533 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27176632  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27176633 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 27176713  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38783985 - 38783705
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
38783985 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38783886  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38783885 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38783786  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
38783785 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 38783705  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15951047 - 15950767
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
15951047 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 15950948  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15950947 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15950848  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
15950847 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 15950767  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15760370 - 15760090
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
15760370 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcattattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15760271  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
15760270 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataa 15760171  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
15760170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatac 15760090  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18980197 - 18979997
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18980197 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18980098  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18980097 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18979998  T
303 c 303  Q
    |    
18979997 c 18979997  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14251074 - 14250874
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14251074 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 14250975  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14250974 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 14250875  T
303 c 303  Q
    |    
14250874 c 14250874  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 15927648 - 15927848
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15927648 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 15927747  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
15927748 cacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcata 15927847  T
303 c 303  Q
    |    
15927848 c 15927848  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 13758450 - 13758650
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13758450 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13758549  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
13758550 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 13758649  T
303 c 303  Q
    |    
13758650 c 13758650  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48622788 - 48622646
Alignment:
156 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcaca 255  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||    
48622788 ataatttcacaacttaacaattatgcatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcaca 48622690  T
256 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttc 299  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
48622689 gtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttc 48622646  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10000505 - 10000346
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
10000505 tcatcaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 10000407  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||| | |  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
10000406 aaacaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatac 10000346  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 16418618 - 16418777
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
16418618 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 16418716  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     || |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
16418717 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 16418777  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 281
Target Start/End: Original strand, 13321065 - 13321273
Alignment:
74 catcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaa--aacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactta 171  Q
    ||||| ||||||| ||  |||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||  ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||     
13321065 catcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaa-caatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttg 13321163  T
172 acatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaattt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||  |||||||||||||    
13321164 acatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 13321263  T
272 aacaacaatt 281  Q
    | ||||||||    
13321264 agcaacaatt 13321273  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 13572816 - 13572956
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | || || || || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
13572816 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 13572913  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
13572914 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 13572956  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16479075 - 16478934
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | || ||| ||    
16479075 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaa 16478978  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
16478977 gagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatac 16478934  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13911156 - 13910996
Alignment:
142 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataa 240  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||| | || ||||| || | |||||||||| |||||     
13911156 ttcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatac 13911059  T
241 gaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     || ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
13911058 aaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatac 13910996  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 10989577 - 10989689
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
10989577 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaa 10989676  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
10989677 cccattttcatac 10989689  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18253931 - 18253819
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | | ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 18253832  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
18253831 cccattttcatac 18253819  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 2437625 - 2437737
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |     
2437625 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattat 2437724  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
2437725 cccattttcatac 2437737  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 47481156 - 47481037
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||  |    
47481156 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtta 47481059  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
47481058 gagcacgaatttagcaacaatt 47481037  T

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Target: chr5 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 35582036 - 35582316
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
35582036 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 35582135  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35582136 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 35582235  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
35582236 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 35582316  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21932637 - 21932357
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21932637 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21932538  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21932537 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21932438  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
21932437 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 21932357  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21938807 - 21938527
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21938807 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21938708  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21938707 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21938608  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
21938607 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 21938527  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22883340 - 22883060
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22883340 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22883241  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22883240 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataa 22883141  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22883140 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 22883060  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36990026 - 36989746
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
36990026 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 36989927  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36989926 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 36989827  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
36989826 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 36989746  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1219776 - 1219496
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
1219776 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatgaaatatgaatcacatctcattt 1219677  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1219676 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1219577  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1219576 tcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 1219496  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 7425324 - 7425604
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
7425324 catcatcaatccataattaagtatatccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 7425423  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
7425424 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 7425523  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
7425524 ccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatac 7425604  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 67 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17471800 - 17471564
Alignment:
67 acaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcata 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
17471800 acaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatt 17471701  T
167 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
17471700 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacg 17471601  T
267 aatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17471600 aatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatac 17471564  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10778146 - 10777946
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10778146 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 10778047  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
10778046 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 10777947  T
303 c 303  Q
    |    
10777946 c 10777946  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 23514641 - 23514841
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23514641 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23514740  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
23514741 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 23514840  T
303 c 303  Q
    |    
23514841 c 23514841  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35791355 - 35791074
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||   ||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
35791355 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 35791256  T
123 caatcaaaacatatcaaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccata 221  Q
    |||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
35791255 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcactcacaaacataccata 35791156  T
222 atcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35791155 atcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 35791074  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11212321 - 11212041
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
11212321 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 11212222  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||  | ||||||| ||| ||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
11212221 caacaacaacatattaaaattcactacttgagtataatttcataacttaacatttatacacactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 11212122  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
11212121 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 11212041  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 23328678 - 23328837
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23328678 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23328777  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
23328778 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 23328837  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 24616282 - 24616441
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
24616282 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24616381  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
24616382 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 24616441  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 24712658 - 24712817
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
24712658 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24712757  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
24712758 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 24712817  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 24745676 - 24745835
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
24745676 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24745775  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
24745776 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 24745835  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 281
Target Start/End: Original strand, 32950717 - 32950952
Alignment:
47 acccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcat 146  Q
    |||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||| |  | | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||| ||||     
32950717 acccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattcac 32950816  T
147 caattaagcataatttcataactta-acatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaa 245  Q
    || || |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| |||  || | |||||    
32950817 catttgagcacaatttcataactttgacctttatacatactttgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaa 32950916  T
246 tagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
32950917 taacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 27009981 - 27010121
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | |  ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
27009981 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 27010078  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
27010079 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 27010121  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18778076 - 18777964
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
18778076 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaa 18777977  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
18777976 cccattttcatac 18777964  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29188397 - 29188256
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
29188397 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 29188300  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
29188299 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccattttcatac 29188256  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43443479 - 43443368
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
43443479 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaa 43443380  T
291 cccattttcata 302  Q
     |||||||||||    
43443379 tccattttcata 43443368  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 12542 - 12654
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
12542 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 12641  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
12642 cccattttcatac 12654  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 25426796 - 25426908
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
25426796 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 25426895  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
25426896 cccattttcatac 25426908  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 19500067 - 19500179
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||    
19500067 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaa 19500166  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
19500167 cccattttcatac 19500179  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22366565 - 22366453
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||    
22366565 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaa 22366466  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
22366465 cccattttcatac 22366453  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4200117 - 4199957
Alignment:
142 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataa 240  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||     
4200117 ttcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatac 4200020  T
241 gaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     || ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||    
4200019 aaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatac 4199957  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21073619 - 21073567
Alignment:
251 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
21073619 tcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatac 21073567  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Original strand, 34939398 - 34939531
Alignment:
144 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||   ||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  |    
34939398 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaa 34939495  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaaca 278  Q
    | ||| | ||||||  |||||||||||||| |||||    
34939496 acataacatcacagttagagcacgaatttagcaaca 34939531  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18531261 - 18531073
Alignment:
92 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttga 190  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| | || ||||| || ||||| |||||| |||||| ||       
18531261 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattg-- 18531164  T
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   ||||||||||||| ||||||||    
18531163 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 18531073  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Original strand, 23328558 - 23328605
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 70  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
23328558 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 23328605  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Original strand, 24616165 - 24616210
Alignment:
25 tcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 70  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
24616165 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 24616210  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Original strand, 24712541 - 24712586
Alignment:
25 tcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 70  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
24712541 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 24712586  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Original strand, 24745559 - 24745604
Alignment:
25 tcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 70  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
24745559 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 24745604  T

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Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 17004638 - 17004918
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
17004638 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 17004737  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17004738 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 17004837  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
17004838 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 17004918  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18060014 - 18059734
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
18060014 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18059915  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18059914 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 18059815  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18059814 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 18059734  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38055347 - 38055067
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
38055347 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38055248  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38055247 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38055148  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
38055147 tcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 38055067  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Original strand, 46523394 - 46523669
Alignment:
28 tcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatc 127  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
46523394 tcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatc 46523493  T
128 aaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
46523494 aaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatc 46523593  T
228 aattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
46523594 aattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 46523669  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 17148647 - 17148847
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17148647 atatgatttacatctcatttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 17148746  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
17148747 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 17148846  T
303 c 303  Q
    |    
17148847 c 17148847  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19962617 - 19962475
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
19962617 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19962518  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19962517 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatac 19962475  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7641069 - 7640910
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7641069 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 7640970  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
7640969 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 7640910  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 22035568 - 22035727
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22035568 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 22035667  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
22035668 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 22035727  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Original strand, 22227947 - 22228088
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||    
22227947 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaa 22228044  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
22228045 gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 22228088  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Original strand, 22232644 - 22232785
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||    
22232644 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaa 22232741  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
22232742 gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 22232785  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5072472 - 5072360
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
5072472 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 5072373  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
5072372 cccattttcatac 5072360  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18601202 - 18601090
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
18601202 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaa 18601103  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
18601102 cccattttcatac 18601090  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Original strand, 2116393 - 2116534
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
2116393 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 2116490  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||||    
2116491 aagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatac 2116534  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Original strand, 45051561 - 45051702
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  ||  || | |||||| ||    
45051561 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaa 45051658  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
45051659 gaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 45051702  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Original strand, 20913168 - 20913287
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
20913168 tttcataacttatcatttttacata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 20913265  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
20913266 gagcacgaatttagcaacaatt 20913287  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Original strand, 20931483 - 20931602
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
20931483 tttcataacttatcatttttacata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 20931580  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
20931581 gagcacgaatttagcaacaatt 20931602  T

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Target: scaffold0213 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 29162 - 29442
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
29162 catcatcaatacacaattaagtataaccaaatcataattcactaacaataacataaattaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 29261  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
29262 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataa 29361  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29362 tcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 29442  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 154263 - 153983
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
154263 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacccacaatagcataagttaacaataaccacatcaatggaatatgattcacatctcattt 154164  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
154163 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataa 154064  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
154063 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 153983  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 169936 - 169884
Alignment:
251 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
169936 tcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 169884  T

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Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 303
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36373
Alignment:
257 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatac 36373  T

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Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Original strand, 48765 - 48855
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   ||||||||||||| ||||||||    
48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 48855  T

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Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 18168970 - 18169250
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
18168970 catcatcaattcacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagcattatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18169069  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
18169070 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 18169169  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18169170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 18169250  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 19020486 - 19020766
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
19020486 catcatcaatccacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 19020585  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19020586 caatcaaaacatatcaaatttcatccattaaggataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 19020685  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
19020686 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 19020766  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15287501 - 15287221
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
15287501 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15287402  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15287401 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15287302  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
15287301 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatac 15287221  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15294610 - 15294330
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
15294610 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15294511  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15294510 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15294411  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
15294410 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatac 15294330  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7132241 - 7132042
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7132241 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 7132142  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7132141 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 7132042  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17145913 - 17145633
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
17145913 catcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 17145814  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||  | ||||||||||| ||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17145813 caacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 17145714  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
17145713 tcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatac 17145633  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 18248218 - 18248498
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||| | |||||  |||||| || |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
18248218 catcatcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 18248317  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||  | ||||||| ||| ||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
18248318 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcatatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 18248417  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
18248418 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 18248498  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Original strand, 20000803 - 20001003
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20000803 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 20000902  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
20000903 cacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 20001002  T
303 c 303  Q
    |    
20001003 c 20001003  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 303
Target Start/End: Original strand, 22738390 - 22738549
Alignment:
144 catcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
22738390 catcaattaagcataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaa 22738489  T
244 aatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
22738490 aatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatac 22738549  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 8374508 - 8374718
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||| | |||||  |||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
8374508 catcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 8374607  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||  | ||||||| ||| ||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
8374608 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataa 8374707  T
223 tcatcaattca 233  Q
    |||||||||||    
8374708 tcatcaattca 8374718  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 26339140 - 26339299
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26339140 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 26339239  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
26339240 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 26339299  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22352184 - 22352040
Alignment:
158 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagc 257  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||  || | |    
22352184 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataac 22352086  T
258 aagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
22352085 aagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 22352040  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 303
Target Start/End: Original strand, 10644360 - 10644499
Alignment:
162 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaaga 261  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||    
10644360 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 10644457  T
262 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
10644458 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 10644499  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Original strand, 8378367 - 8378431
Alignment:
239 aagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
8378367 aagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 8378431  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40885748 - 40885602
Alignment:
92 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 191  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
40885748 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttcataacttgacatttatacatactttg-a 40885650  T
192 acatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcata 239  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||| |||||    
40885649 acatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcata 40885602  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Original strand, 47357882 - 47357934
Alignment:
251 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
47357882 tcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 47357934  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15675301 - 15675095
Alignment:
74 catcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaa 172  Q
    ||||| ||||||| ||  |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |    
15675301 catcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttca 15675202  T
173 catttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaattta 272  Q
    ||||| |||||| ||   |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   |||||||||||||    
15675201 catttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 15675104  T
273 acaacaatt 281  Q
     ||||||||    
15675103 gcaacaatt 15675095  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10104444 - 10104256
Alignment:
92 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttga 190  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||       
10104444 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg-- 10104347  T
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   ||||||| ||||| ||||||||    
10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaatt 10104256  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 239
Target Start/End: Original strand, 31115680 - 31115844
Alignment:
74 catcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaa 172  Q
    ||||| ||||||| ||  |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| ||  ||| |||| ||||| |||||||||| || ||||| |    
31115680 catcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttca 31115779  T
173 catttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcata 239  Q
    ||||| |||||| |  | |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||    
31115780 catttttacataat--ggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 31115844  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Original strand, 22738269 - 22738310
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcac 64  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
22738269 catcattaatccacaattaagtatacccaagtcataattcac 22738310  T

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Target: scaffold0761 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1551
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| | |||||||||||    
1831 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaattttatatgatttacatctcattt 1732  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1731 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1632  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1631 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 1551  T

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Target: scaffold0467 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10595 - 10315
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
10595 catcatcaatccacaattaagtatacccaagtcatgattccctcacaatagcatcagttaacaacaacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 10496  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
10495 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 10396  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
10395 tcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatac 10315  T

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Target: scaffold0383 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 2392 - 2672
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
2392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaaccatgattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 2491  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 2591  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
2592 gcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 2672  T

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Target: scaffold1666 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 3
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
252 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataactacatcaatgtaatatgaattacatctcattt 153  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
152 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 53  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaattta 272  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
52 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34414 - 34140
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
34414 catcatcaatccataatttagtatacccaagtcatgattcactcacaatagcatcagttaatagcaacaacattaatggaacatgaatcatatctcattt 34315  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||  | |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
34314 caacaacaacatatccaaattcatcaattaagtataacttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34215  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattt 297  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
34214 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaacccattt 34140  T

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Target: scaffold1500 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1490
Alignment:
103 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1690 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 1591  T
203 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
1590 cacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 1491  T
303 c 303  Q
    |    
1490 c 1490  T

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Target: scaffold0191 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7712 - 7432
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
7712 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacatcagttaataacaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 7613  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
7612 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 7513  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
7512 tcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatac 7432  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 54416 - 54696
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 122  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
54416 catcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 54515  T
123 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 222  Q
    |||  | ||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
54516 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaatta 54615  T
223 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
54616 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatac 54696  T

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Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 303
Target Start/End: Original strand, 45081 - 45310
Alignment:
74 catcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaac 173  Q
    |||||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||| || | ||||||| ||||| ||    
45081 catcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcaaaacttgac 45180  T
174 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
45181 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaa 45280  T
274 caacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
45281 caacaattattcatcaacccattttcatac 45310  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Original strand, 54008 - 54153
Alignment:
156 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcaca 255  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    
54008 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcaca 54106  T
256 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
54107 gtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcata 54153  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5329 - 5188
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
5329 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 5232  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
5231 gagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatac 5188  T

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Target: scaffold0183 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 6718 - 6877
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
6718 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 6817  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
6818 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 6877  T

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Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Original strand, 6598 - 6645
Alignment:
23 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 70  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
6598 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 6645  T

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Target: scaffold0892 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3692
Alignment:
156 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcaca 255  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||| | | |||||    
3547 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcaca 3645  T
256 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
3646 gtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcata 3692  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 56294 - 56105
Alignment:
92 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 191  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||| |||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
56294 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttaaa 56195  T
192 acatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
56194 acatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7489
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
7330 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 7428  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     || |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
7429 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 7489  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 3890 - 4002
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
3890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 3989  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
3990 cccattttcatac 4002  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 303
Target Start/End: Original strand, 3045 - 3242
Alignment:
105 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttc 203  Q
    |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||    
3045 atgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttc 3142  T
204 acccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||| | || ||||| || |||||||||||| | |||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
3143 accaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 3242  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23884 - 23725
Alignment:
143 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 242  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||     
23884 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataag- 23786  T
243 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||| | |  || | | ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
23785 aaacaacaacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatac 23725  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 302
Target Start/End: Original strand, 177 - 314
Alignment:
163 cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagag 262  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||||    
177 cataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 274  T
263 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 302  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
275 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcata 314  T

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Target: scaffold0215 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9462 - 9321
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||    
9462 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 9365  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
9364 aagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 9321  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16360 - 16219
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||    
16360 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 16263  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
16262 aagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 16219  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1388 - 1276
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
1388 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 1289  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
1288 cccattttcatac 1276  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 64640 - 64495
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaat-----tcaagcataagaaaatagcttcaca 255  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||     ||| |||||  || ||| | |||||    
64640 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcaca 64543  T
256 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
64542 gcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 64495  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 107914 - 108026
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 290  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | | ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 108013  T
291 cccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||    
108014 cccattttcatac 108026  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13297
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||  ||    
13438 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaa 13341  T
260 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
13340 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 13297  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21228 - 21088
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | || ||||  || |||||||||| | | |||  || ||| | ||||| ||||    
21228 ttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaag 21131  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
21130 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 21088  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 14034
Alignment:
161 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||||  | || ||||  || |||||||||||| |||||   | ||| | ||||||||||    
14173 ttcataacttatcatttttacatatttc--aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaag 14076  T
261 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
14075 agcacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatac 14034  T

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Target: scaffold0092 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10776 - 10724
Alignment:
251 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
10776 tcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 10724  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 281
Target Start/End: Original strand, 3324 - 3447
Alignment:
158 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagc 257  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||| |||||  ||  || | |||||||    
3324 aatttcataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagc 3423  T
258 aagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
     |||||||||||||| || |||||    
3424 tagagcacgaatttagcatcaatt 3447  T

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Target: scaffold0516 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12103
Alignment:
257 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 12103  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Original strand, 41815 - 41905
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
41815 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 41905  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 281
Target Start/End: Original strand, 13613 - 13763
Alignment:
130 aacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatca 228  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||    
13613 aacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 13710  T
229 attcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||| |||||  || ||| | ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
13711 attcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 13763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3707 - 3588
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
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3707 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 3610  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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3609 gagcacgaatttagcaacaatt 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1105 - 962
Alignment:
137 caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaag 235  Q
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1105 caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 1008  T
236 cataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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1007 catacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 962  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37038 - 36919
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
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37038 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 36941  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||    
36940 gagcacgaatttaacaacaatt 36919  T

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Target: scaffold0302 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 281
Target Start/End: Original strand, 12279 - 12370
Alignment:
190 aaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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12279 aaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 12370  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Original strand, 8934 - 9106
Alignment:
108 aatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacc 206  Q
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8934 aatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcacc 9031  T
207 cataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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9032 aacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaatt 9106  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Original strand, 148859 - 148978
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
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148859 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 148956  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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148957 gagcacaaatttaacaacaatt 148978  T

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Target: scaffold1542 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 630 - 540
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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630 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 540  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 6070
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 6070  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34556 - 34466
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
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34556 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataatt 34466  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 89550 - 89460
Alignment:
191 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   ||||||||||||| ||||||||    
89550 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 89460  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31647
Alignment:
257 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 303  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatac 31647  T

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Target: scaffold0195 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Original strand, 19344 - 19463
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
19344 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 19441  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
19442 gagcacgaatttagcaacaatt 19463  T

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Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Original strand, 21428 - 21547
Alignment:
160 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 259  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
21428 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 21525  T
260 gagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
21526 gagcacgaatttagcaacaatt 21547  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8336 - 8186
Alignment:
130 aacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatca 228  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   ||| |||||||||||| | || ||||| || |||| ||    
8336 aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcacca 8239  T
229 attcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 281  Q
    ||||| |||||  || ||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
8238 attcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 8186  T

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