View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21679_high_11 (Length: 359)

Name: NF21679_high_11
Description: NF21679
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21679_high_11
NF21679_high_11
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (22-274)||(25175563-25175815)
chr6 (22-274)||(27653983-27654235)
chr6 (22-274)||(16825752-16826006)
chr6 (33-359)||(23153458-23153785)
chr6 (26-359)||(14626045-14626377)
chr6 (26-359)||(1650022-1650352)
chr6 (33-286)||(1657748-1657999)
chr6 (22-286)||(35009439-35009702)
chr6 (33-286)||(15862484-15862734)
chr6 (291-359)||(23148266-23148334)
chr6 (90-286)||(29665941-29666137)
chr6 (201-286)||(27751603-27751688)
chr6 (186-270)||(29605612-29605696)
chr6 (328-359)||(4991396-4991427)
chr6 (328-359)||(18002396-18002427)
chr6 (328-359)||(23995247-23995278)
chr6 (328-359)||(26090059-26090090)
chr6 (330-359)||(15742121-15742150)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (22-274)||(25426628-25426880)
chr5 (22-274)||(12374-12626)
chr5 (22-274)||(22366481-22366733)
chr5 (22-249)||(18778017-18778244)
chr5 (22-274)||(19499899-19500151)
chr5 (22-274)||(21073595-21073847)
chr5 (22-359)||(23506965-23507301)
chr5 (22-249)||(43443420-43443647)
chr5 (22-359)||(27182472-27182810)
chr5 (22-249)||(4200010-4200237)
chr5 (22-249)||(27009841-27010068)
chr5 (22-359)||(22053754-22054096)
chr5 (22-359)||(18530989-18531330)
chr5 (33-286)||(34939289-34939540)
chr5 (74-274)||(29188284-29188483)
chr5 (139-286)||(20623085-20623232)
chr5 (139-286)||(21233528-21233675)
chr5 (140-284)||(25900408-25900552)
chr5 (139-286)||(16536313-16536460)
chr5 (139-286)||(37052860-37053007)
chr5 (26-66)||(29190482-29190522)
chr5 (328-359)||(16105967-16105998)
chr5 (328-359)||(20623286-20623317)
chr5 (328-359)||(21233443-21233474)
chr5 (328-359)||(25900321-25900352)
chr5 (328-359)||(37053061-37053092)
chr5 (22-63)||(17471803-17471844)
chr5 (186-270)||(29918127-29918212)
chr5 (190-279)||(32950862-32950951)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (22-274)||(19886661-19886913)
chr2 (27-359)||(462743-463074)
chr2 (22-359)||(8891242-8891580)
chr2 (22-359)||(20627239-20627576)
chr2 (22-359)||(36982365-36982704)
chr2 (22-359)||(19794630-19794967)
chr2 (22-286)||(17396653-17396916)
chr2 (22-359)||(43642882-43643220)
chr2 (22-359)||(24341310-24341652)
chr2 (22-236)||(7507894-7508107)
chr2 (22-286)||(25265390-25265653)
chr2 (139-286)||(19689401-19689548)
chr2 (139-286)||(23820187-23820334)
chr2 (264-359)||(22863169-22863266)
chr2 (139-286)||(14906440-14906587)
chr2 (139-286)||(20015127-20015274)
chr2 (328-359)||(9652797-9652828)
chr2 (328-359)||(14906355-14906386)
chr2 (328-359)||(19689316-19689347)
chr2 (328-359)||(22284278-22284309)
chr2 (328-359)||(23820388-23820419)
chr2 (328-359)||(25213372-25213403)
chr2 (188-269)||(68156-68238)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (22-274)||(47357654-47357906)
chr4 (22-359)||(13246430-13246768)
chr4 (22-359)||(54118169-54118507)
chr4 (22-249)||(10644219-10644446)
chr4 (122-359)||(121989-122225)
chr4 (30-286)||(13048221-13048477)
chr4 (22-359)||(15675010-15675352)
chr4 (90-359)||(10104171-10104445)
chr4 (22-286)||(26680201-26680463)
chr4 (22-259)||(31115629-31115865)
chr4 (139-286)||(10488678-10488825)
chr4 (139-286)||(16327926-16328073)
chr4 (223-359)||(33240900-33241042)
chr4 (22-118)||(111395-111491)
chr4 (188-270)||(40885570-40885652)
chr4 (254-359)||(31132545-31132656)
chr4 (22-66)||(10104450-10104494)
chr4 (328-359)||(14952085-14952116)
chr4 (328-359)||(15135908-15135939)
chr4 (328-359)||(15272212-15272243)
chr4 (328-359)||(16327841-16327872)
chr4 (328-359)||(16609014-16609045)
chr4 (328-359)||(26680517-26680548)
chr4 (188-269)||(15044992-15045074)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (24-359)||(3509-3843)
scaffold0266 (22-359)||(1124-1461)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (22-359)||(14842488-14842824)
chr3 (22-274)||(55316219-55316471)
chr3 (22-274)||(41270075-41270327)
chr3 (22-359)||(2049810-2050146)
chr3 (22-359)||(12030074-12030410)
chr3 (33-359)||(13838905-13839231)
chr3 (22-249)||(16821139-16821366)
chr3 (22-286)||(13975722-13975985)
chr3 (22-323)||(15858986-15859287)
chr3 (22-286)||(45860805-45861068)
chr3 (21-296)||(51158008-51158282)
chr3 (22-286)||(13954890-13955153)
chr3 (22-279)||(15936634-15936890)
chr3 (22-359)||(16744042-16744377)
chr3 (25-279)||(15938476-15938729)
chr3 (26-359)||(15614838-15615168)
chr3 (22-286)||(17912483-17912744)
chr3 (240-359)||(19260750-19260869)
chr3 (223-359)||(19231981-19232120)
chr3 (139-286)||(2449238-2449385)
chr3 (186-270)||(4145814-4145898)
chr3 (22-63)||(15468555-15468596)
chr3 (22-135)||(47984650-47984763)
chr3 (22-135)||(47993937-47994050)
chr3 (22-135)||(48003224-48003337)
chr3 (22-135)||(48012510-48012623)
chr3 (328-359)||(2449153-2449184)
chr3 (328-359)||(16261777-16261808)
chr3 (328-359)||(16933870-16933901)
chr3 (328-359)||(17912399-17912430)
chr3 (328-359)||(17955885-17955916)
chr3 (328-359)||(23492696-23492727)
chr3 (328-359)||(38168237-38168268)
chr3 (328-359)||(53771365-53771396)
chr3 (325-359)||(15857164-15857198)
chr3 (190-279)||(11986173-11986262)
chr3 (229-270)||(14080715-14080756)
chr3 (22-63)||(22275209-22275250)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (22-359)||(5991-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (22-359)||(883-1218)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (22-359)||(48598-48934)
scaffold0023 (22-249)||(36093-36320)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (22-359)||(20931345-20931681)
chr1 (22-359)||(41394222-41394558)
chr1 (22-249)||(18601143-18601370)
chr1 (22-359)||(20913037-20913366)
chr1 (22-274)||(5072388-5072640)
chr1 (22-359)||(20893552-20893889)
chr1 (22-359)||(37844375-37844714)
chr1 (22-359)||(20445679-20446018)
chr1 (22-347)||(20531444-20531770)
chr1 (22-236)||(22227809-22228022)
chr1 (22-236)||(22232506-22232719)
chr1 (26-249)||(2116258-2116481)
chr1 (88-359)||(45051489-45051757)
chr1 (139-286)||(51452608-51452755)
chr1 (26-249)||(45051446-45051649)
chr1 (328-359)||(15861327-15861358)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (22-274)||(10989410-10989661)
chr7 (22-249)||(2437457-2437684)
chr7 (24-359)||(16211768-16212102)
chr7 (22-359)||(3059966-3060302)
chr7 (22-359)||(13036939-13037277)
chr7 (22-249)||(13911049-13911277)
chr7 (22-359)||(36052667-36053002)
chr7 (27-359)||(11580662-11580997)
chr7 (22-249)||(13572676-13572903)
chr7 (22-279)||(18253842-18254098)
chr7 (28-286)||(25292338-25292595)
chr7 (22-286)||(47481031-47481294)
chr7 (22-249)||(16478987-16479213)
chr7 (22-286)||(7293017-7293279)
chr7 (22-285)||(13321014-13321278)
chr7 (139-286)||(11516343-11516490)
chr7 (139-286)||(15441564-15441711)
chr7 (139-286)||(30262129-30262276)
chr7 (165-358)||(295893-296087)
chr7 (328-359)||(2029244-2029275)
chr7 (328-359)||(7293333-7293364)
chr7 (328-359)||(11516544-11516575)
chr7 (328-359)||(14113904-14113935)
chr7 (328-359)||(15441479-15441510)
chr7 (291-359)||(15709428-15709500)
chr7 (328-359)||(30262044-30262075)
chr7 (328-359)||(42056189-42056220)
chr7 (188-269)||(13377693-13377775)
chr7 (328-356)||(15516765-15516793)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (21-351)||(16193651-16193980)
chr8 (22-274)||(30120722-30120974)
chr8 (22-212)||(222753-222943)
chr8 (22-212)||(736376-736566)
chr8 (22-212)||(860271-860461)
chr8 (22-359)||(43373393-43373731)
chr8 (22-274)||(16674392-16674644)
chr8 (33-359)||(24928717-24929043)
chr8 (22-249)||(21844597-21844824)
chr8 (22-249)||(21851990-21852217)
chr8 (22-359)||(16404901-16405235)
chr8 (26-274)||(6774258-6774505)
chr8 (26-274)||(24548986-24549233)
chr8 (22-286)||(22907214-22907476)
chr8 (33-286)||(17345581-17345832)
chr8 (139-286)||(5238203-5238350)
chr8 (139-286)||(24661248-24661395)
chr8 (139-286)||(43685662-43685809)
chr8 (150-212)||(691908-691970)
chr8 (328-359)||(5238404-5238435)
chr8 (328-359)||(22907129-22907160)
chr8 (328-359)||(24385653-24385684)
chr8 (328-359)||(24661163-24661194)
chr8 (328-359)||(24716763-24716794)
chr8 (328-359)||(43685863-43685894)
chr8 (229-269)||(38533855-38533895)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (22-359)||(8878-9214)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (22-359)||(12115-12449)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (22-249)||(42997-43224)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (33-359)||(171916-172241)
scaffold0001 (33-359)||(177619-177944)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (22-350)||(4996-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (22-359)||(26341-26678)
scaffold0162 (139-286)||(8180-8327)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (26-359)||(41733-42065)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (33-359)||(247367-247694)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (22-359)||(128096-128431)
scaffold0008 (22-249)||(31700-31928)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (22-359)||(36838-37176)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (22-357)||(19206-19543)
scaffold0195 (22-286)||(21290-21553)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (28-359)||(272031-272361)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (46-279)||(5552-5785)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (22-359)||(123088-123427)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (22-249)||(35-262)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (22-218)||(64584-64780)
scaffold0026 (22-279)||(107747-108003)
scaffold0026 (229-271)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (22-279)||(48187-48443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (140-358)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (22-249)||(21141-21367)
scaffold0139 (22-249)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (22-312)||(148721-149012)
scaffold0025 (22-359)||(8849-9191)
scaffold0025 (265-359)||(146843-146937)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (22-236)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (22-236)||(3722-3936)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (140-359)||(89379-89600)
scaffold0028 (235-359)||(107709-107835)
scaffold0028 (328-359)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (26-249)||(9374-9596)
scaffold0215 (26-249)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (128-274)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (22-286)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (22-286)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (22-286)||(37066-37328)
scaffold0078 (328-359)||(36981-37012)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (22-286)||(41648-41911)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (22-128)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (26-275)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (153-286)||(13636-13769)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (22-128)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (120-249)||(13350-13478)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (139-286)||(26911-27058)
scaffold0141 (139-279)||(22656-22796)
scaffold0141 (328-359)||(22857-22888)
scaffold0141 (328-359)||(27112-27143)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (139-286)||(1582-1729)
scaffold0124 (328-359)||(1497-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (22-118)||(9382-9478)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (193-286)||(3360-3453)
scaffold0361 (24-78)||(3210-3264)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (123-279)||(56106-56262)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (229-270)||(70307-70348)
scaffold0058 (328-359)||(57393-57424)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (328-359)||(6444-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (328-359)||(879-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (328-359)||(9883-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (328-359)||(13286-13317)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (188-270)||(8174-8257)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (328-359)||(80187-80218)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (328-359)||(55904-55935)
scaffold0032 (328-359)||(108076-108107)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (328-359)||(193398-193429)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (188-269)||(2317-2399)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (317-359)||(18015-18057)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (190-236)||(45198-45244)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 219  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  220 taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153785
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 330  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 23153756  T
Q  331 attatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23153757 attatgatgaagactaacccccttacctt 23153785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626045
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||  |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga 14626079  T
Q  326 tgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626078 agatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650022
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 1650056  T
Q  325 atgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650055 a-catgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact 1657901  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactca-attcacaataact 15862581  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 359
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148334
Alignment:
Q  291 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 23148334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 286
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  90 aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 188  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  189 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 286
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  201 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  186 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || ||| ||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002396
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctt 18002396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995278
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctt 23995278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090090
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctt 26090090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742121
Alignment:
Q  330 gattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctt 15742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778017
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18778017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507301
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa 23507263  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507264 atggagatgattatgataaagactaacccccttacctt 23507301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443420
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataaca 43443420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182472
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 27182512  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27182511 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 27182472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200010
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataaca 4200010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010068
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 27010068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053754
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca 22053798  T
Q  320 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22053797 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 22053754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530989
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca 18531032  T
Q  320 aaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18531031 aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctt 18530989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaatgact 34939387  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  74 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttat 173  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  174 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagc 273  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  140 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 239  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  240 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc 284  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 66  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105998
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctt 16105998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623317
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctt 20623317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233443
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctt 21233443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900321
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25900321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053092
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctt 37053092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 63  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  186 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||| |||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  190 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463074
Alignment:
Q  27 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  127 acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 226  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  227 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 326  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 463041  T
Q  327 gatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463042 gatgattatgataaagactaacccccttacctt 463074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891580
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 8891540  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8891541 aaatgatgatgattatgataaagactaacccctttacctt 8891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627239
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||| ||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa 320  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa 20627278  T
Q  321 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20627277 aatgatgatgattatgataaagactaaccccgttacctt 20627239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982365
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 318  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 36982406  T
Q  319 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982405 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 36982365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794630
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttaca 19794670  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19794669 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 19794630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642882
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| || |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 43642922  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43642921 aaatgatgatgattatgataaagactaacctccttccctt 43642882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341310
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 24341354  T
Q  320 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24341353 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 24341310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||| |    
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctca-a 7508009  T
Q  121 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  221 aacatcaattcatgca 236  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863266
Alignment:
Q  264 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 22863266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652797
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctt 9652797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906355
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctt 14906355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689316
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttacctt 19689316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284309
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttacctt 22284309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820419
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctt 23820419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 269
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  188 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246768
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13246728  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246729 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 13246768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118169
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| |       
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 54118209  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54118208 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 54118169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644446
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 10644446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122225
Alignment:
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttacctt 122225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  30 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaaca 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  130 acttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 229  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  230 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675010
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 15675054  T
Q  320 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15675053 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 15675010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104171
Alignment:
Q  90 aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 189  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  190 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--ta 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  288 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 10104171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg 259  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 359
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241042
Alignment:
Q  223 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  321 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 33241042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111491
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca 118  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactca 111491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40885652 - 40885570
Alignment:
Q  188 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  40885652 tgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 359
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132656
Alignment:
Q  254 agttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  348 cccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctt 31132656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 66  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952116
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctt 14952116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135908
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15135908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272212
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15272212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327841
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctt 16327841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609014
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctt 16609014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680548
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctt 26680548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 269
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  188 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3509
Alignment:
Q  24 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  124 acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 223  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  224 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat 3545  T
Q  324 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3544 gaagatgattatgacaaagactaacccccttacctt 3509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1461
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 320  Q
      |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 1422  T
Q  321 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1423 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842488
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     | |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 14842526  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842525 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctt 14842488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050146
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||| ||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa 2050108  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050109 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 2050146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030074
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa 12030112  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12030111 atgatgatgattatgataatgattaacccccttacctt 12030074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839231
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 331  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 13839203  T
Q  332 ttatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13839204 ttatgatgaagactaacccccttacctt 13839231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttaca 15858990  T
Q  320 aaat 323  Q
    ||||    
T  15858989 aaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  21 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaca 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  121 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  221 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744042
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
      ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 16744080  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  16744079 atgatgatgattatggtaaagactaacctcgttacctt 16744042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  25 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  125 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 224  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  225 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615168
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | || ||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 324  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||  ||| || ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||   ||||||     
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg--caaaatt 15615134  T
Q  325 atgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615135 ac-atgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||  |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 240 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260750
Alignment:
Q  240 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 339  Q
    ||||||| || |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  340 aagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctt 19260750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 359
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232120
Alignment:
Q  223 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 319  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttacctt 19232120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  186 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 63  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  122 taacaacaacttag 135  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  122 taacaacaacttag 135  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  122 taacaacaacttag 135  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  122 taacaacaacttag 135  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449153
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctt 2449153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261808
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctt 16261808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933870
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctt 16933870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912399
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctt 17912399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955885
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttacctt 17955885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492727
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctt 23492727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168268
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctt 38168268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771396
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctt 53771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857164
Alignment:
Q  325 atgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 15857164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  190 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  229 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 63  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5991
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctca-at 6228  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 6029  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028 gtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 5991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 883
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||| ||    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctca-at 1120  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaa 921  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctt 883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48934
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 48896  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48897 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 48934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931681
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20931643  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20931644 atgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctt 20931681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394558
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | ||||       
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 41394520  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394521 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 41394558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601143
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18601143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913366
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |       |    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaa-------t 20913129  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20913328  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20913329 atgaggatgattacgataaagactaacccccttacctt 20913366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893552
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||       
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttaca 20893592  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20893591 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 20893552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844375
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  221 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac 37844416  T
Q  319 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844415 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 37844375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446018
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-ac 318  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac 20445977  T
Q  319 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20445978 aaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctt 20446018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531770
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 20531742  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531743 aaatgatgatgattatgataaagactaa 20531770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  222 acatcaattcatgca 236  Q
     ||||||||||||||    
T  22228008 tcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  222 acatcaattcatgca 236  Q
     ||||||||||||||    
T  22232705 tcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116481
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcacattaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| |||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  125 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 224  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  225 tcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataaca 2116481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 359
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051757
Alignment:
Q  88 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 187  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  188 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat- 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||  |||||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  287 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    || | |  ||||||||||||  ||||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaatg--caaaatcac-atgattatgataaagactaacccccttacctt 45051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051649
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||                  ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa-ca------------------ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 45051526  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  45051527 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 45051625  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  45051626 caattcatgcatacaaacgtaaca 45051649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437684
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataaca 2437684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 359
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212102
Alignment:
Q  24 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta 123  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  124 acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 223  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  224 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat 16212066  T
Q  324 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212067 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 16212102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060302
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa 3060264  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3060265 atgatgatgattatgataaagacttacccccttacctt 3060302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036939
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||       
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13036979  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13036978 aaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctt 13036939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911049
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  122 taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  221 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 13911049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36053002
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36052962  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052963 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 36053002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580662
Alignment:
Q  27 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca 126  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  127 acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 226  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  227 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa 11580699  T
Q  323 tgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11580698 tgatgatgattatgataaagactaatccccttacctt 11580662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572903
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 13572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
Alignment:
Q  28 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  128 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 227  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  228 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
      || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 285
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  122 taacaa-caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 218  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  219 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca 285  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295893
Alignment:
Q  165 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtac 264  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || ||  ||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  265 gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 358  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029275
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctt 2029275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293364
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctt 7293364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516575
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctt 11516575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113904
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctt 14113904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441479
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15441479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 359
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709500
Alignment:
Q  291 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctt 15709500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262044
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctt 30262044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056189
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctt 42056189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 269
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  188 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttac 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193651
Alignment:
Q  21 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaca 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  121 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  221 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 320  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca 16193682  T
Q  321 aatgatgatgattatgataaagactaacccc 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193681 aatgatgatgattatgataaagactaacccc 16193651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373393
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 43373433  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373432 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 43373393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928717
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || ||||||    ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 331  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga 24928745  T
Q  332 ttatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24928744 ttatgataaagactaaccccattacctt 24928717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844597
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21844597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851990
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21851990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404901
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||  |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac- 16404941  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16404940 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctt 16404901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | || ||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact 17345679  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  150 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238435
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctt 5238435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907129
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctt 22907129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385653
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctt 24385653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661163
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctt 24661163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716763
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttacctt 24716763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685894
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctt 43685894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 269
Target Start/End: Original strand, 38533855 - 38533895
Alignment:
Q  229 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 269  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38533855 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaatt 38533895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9214
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa 9176  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9177 atgaagatgattatgataaagactaacccccttacctt 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12449
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at 12213  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    || ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12214 ta-caacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaa 12410  T
Q  321 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 aattaagatgattatgataaagactaacccccttacctt 12449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172241
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 332  Q
    | |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 172214  T
Q  333 tatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  172215 tatgataaagactaacccccttacctt 172241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177944
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 332  Q
    | |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 177917  T
Q  333 tatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  177918 tatgataaagactaacccccttacctt 177944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 5026  T
Q  321 aatgatgatgattatgataaagactaaccc 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5025 aatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26341
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 26380  T
Q  321 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26379 aatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctt 26341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42065
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 325  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 42031  T
Q  326 tgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42032 tgatgattatgataaagaccaacccccttacctt 42065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247367
Alignment:
Q  33 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  133 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 232  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  233 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 330  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 247396  T
Q  331 attatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  247395 attatgataaagactaacccccttacctt 247367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128096
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at 128333  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa 128134  T
Q  322 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128133 atgaagatgattatgataaagactaacccccttacctt 128096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  122 taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  221 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36838
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||       
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36878  T
Q  320 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36877 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 36838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 357
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19543
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 318  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 19504  T
Q  319 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 357  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19505 aaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272361
Alignment:
Q  28 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| ||||||    ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  128 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 227  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  228 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg 327  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg 272329  T
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttacctt 272361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 279
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  46 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattca 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  146 cccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 245  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  246 aacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123088
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |       
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 318  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca 123129  T
Q  319 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  123128 aaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctt 123088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 35 - 262
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 64584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 279
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  229 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattta 271  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 279
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 140 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51110
Alignment:
Q  140 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 239  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  240 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 339  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  340 aagactaacccccttacct 358  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  51128 aagactaatctccttacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21141
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataaca 21141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||| ||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 312  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9191
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||  |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca 9147  T
Q  320 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  9148 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttacctt 9191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Original strand, 146843 - 146937
Alignment:
Q  265 gaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146843 gaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  222 acatcaattcatgca 236  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  221 aacatcaattcatgca 236  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89379
Alignment:
Q  140 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 239  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  240 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 337  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  338 taaagactaacccccttacctt 359  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  89400 tgaagactaacccccttacctt 89379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107709
Alignment:
Q  235 catacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 332  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  333 tatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctt 107709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  126 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 225  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  226 caattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  128 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 227  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  228 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |       
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||      
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  121 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  221 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||       
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36981
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctt 36981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  122 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 221  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  222 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  122 taacaac 128  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  26 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcacattaa 124  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||  | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  125 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 224  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  225 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaa 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||   ||| |||||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 286
Target Start/End: Original strand, 13636 - 13769
Alignment:
Q  153 agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaaca 252  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13636 agcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13735  T
Q  253 tagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13736 aagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  122 taacaac 128  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13478 - 13350
Alignment:
Q  120 attaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaac 219  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13478 attaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat 13380  T
Q  220 taacatcaattcatgcatacaaacataaca 249  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13379 tatcatcaattcatgcatacaaacataaca 13350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 279
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22888
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctt 22888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27143
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctt 27143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  139 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  239 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1497
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctt 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9478
Alignment:
Q  22 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactca 9478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 286
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  193 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  24 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 78  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56106
Alignment:
Q  123 aacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaa--catgtaatttcaccaacaattatacaact 220  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  | ||  |||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  56262 aacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaatt 56165  T
Q  221 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 279  Q
    | |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  56164 atcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  229 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57393
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctt 57393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6444
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctt 6444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 879
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctt 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9883
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctt 9883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13286
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctt 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 270
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  188 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 270  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80218
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttacctt 80218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55935
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctt 55935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108076
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctt 108076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193398
Alignment:
Q  328 atgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttacctt 193398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  188 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 359
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18057
Alignment:
Q  317 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 359  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 18057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  190 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 236  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University