View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21680_high_8 (Length: 352)

Name: NF21680_high_8
Description: NF21680
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21680_high_8
NF21680_high_8
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (86-337)||(25175563-25175815)
chr6 (86-337)||(27653983-27654235)
chr6 (86-337)||(16825752-16826006)
chr6 (1-326)||(23153458-23153785)
chr6 (1-333)||(14626045-14626377)
chr6 (1-333)||(1650022-1650352)
chr6 (74-326)||(1657748-1657999)
chr6 (74-337)||(35009439-35009702)
chr6 (74-326)||(15862484-15862734)
chr6 (1-69)||(23148266-23148334)
chr6 (74-269)||(29665941-29666137)
chr6 (74-159)||(27751603-27751688)
chr6 (90-174)||(29605612-29605696)
chr6 (1-32)||(4991396-4991427)
chr6 (1-32)||(18002396-18002427)
chr6 (1-32)||(23995247-23995278)
chr6 (1-32)||(26090059-26090090)
chr6 (1-30)||(15742121-15742150)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (86-337)||(25426628-25426880)
chr5 (86-337)||(12374-12626)
chr5 (86-337)||(19499899-19500151)
chr5 (86-337)||(22366481-22366733)
chr5 (111-337)||(18778017-18778244)
chr5 (86-337)||(21073595-21073847)
chr5 (1-337)||(23506965-23507301)
chr5 (111-337)||(43443420-43443647)
chr5 (1-337)||(27182472-27182810)
chr5 (111-337)||(4200010-4200237)
chr5 (111-337)||(27009841-27010068)
chr5 (1-337)||(22053754-22054096)
chr5 (1-337)||(18530989-18531330)
chr5 (74-326)||(34939289-34939540)
chr5 (86-285)||(29188284-29188483)
chr5 (74-206)||(20623100-20623232)
chr5 (74-206)||(21233528-21233660)
chr5 (76-206)||(25900408-25900538)
chr5 (74-206)||(16536328-16536460)
chr5 (74-206)||(37052875-37053007)
chr5 (293-333)||(29190482-29190522)
chr5 (1-32)||(16105967-16105998)
chr5 (1-32)||(20623286-20623317)
chr5 (1-32)||(21233443-21233474)
chr5 (1-32)||(25900321-25900352)
chr5 (1-32)||(37053061-37053092)
chr5 (296-337)||(17471803-17471844)
chr5 (90-174)||(29918127-29918212)
chr5 (81-170)||(32950862-32950951)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (86-337)||(19886661-19886913)
chr2 (1-332)||(462743-463074)
chr2 (1-337)||(8891242-8891580)
chr2 (1-337)||(20627239-20627576)
chr2 (1-337)||(36982365-36982704)
chr2 (1-337)||(19794630-19794967)
chr2 (74-337)||(17396653-17396916)
chr2 (1-337)||(43642882-43643220)
chr2 (1-337)||(24341310-24341652)
chr2 (124-337)||(7507894-7508107)
chr2 (74-337)||(25265390-25265653)
chr2 (1-96)||(22863169-22863266)
chr2 (74-206)||(19689401-19689533)
chr2 (74-206)||(23820202-23820334)
chr2 (74-206)||(14906440-14906572)
chr2 (74-206)||(20015142-20015274)
chr2 (1-32)||(9652797-9652828)
chr2 (1-32)||(14906355-14906386)
chr2 (1-32)||(19689316-19689347)
chr2 (1-32)||(22284278-22284309)
chr2 (1-32)||(23820388-23820419)
chr2 (1-32)||(25213372-25213403)
chr2 (91-172)||(68156-68238)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (86-337)||(47357654-47357906)
chr4 (1-337)||(13246430-13246768)
chr4 (1-337)||(54118169-54118507)
chr4 (111-337)||(10644219-10644446)
chr4 (1-237)||(121989-122225)
chr4 (74-329)||(13048221-13048477)
chr4 (1-337)||(15675010-15675352)
chr4 (1-269)||(10104171-10104445)
chr4 (74-337)||(26680201-26680463)
chr4 (101-337)||(31115629-31115865)
chr4 (1-137)||(33240900-33241042)
chr4 (74-206)||(10488693-10488825)
chr4 (74-206)||(16327926-16328058)
chr4 (241-337)||(111395-111491)
chr4 (90-172)||(40885570-40885652)
chr4 (1-106)||(31132545-31132656)
chr4 (293-337)||(10104450-10104494)
chr4 (1-32)||(14952085-14952116)
chr4 (1-32)||(15135908-15135939)
chr4 (1-32)||(15272212-15272243)
chr4 (1-32)||(16327841-16327872)
chr4 (1-32)||(16609014-16609045)
chr4 (1-32)||(26680517-26680548)
chr4 (91-172)||(15044992-15045074)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-335)||(3509-3843)
scaffold0266 (1-337)||(1124-1461)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (1-337)||(14842488-14842824)
chr3 (86-337)||(55316219-55316471)
chr3 (86-337)||(41270075-41270327)
chr3 (1-337)||(2049810-2050146)
chr3 (1-337)||(12030074-12030410)
chr3 (1-326)||(13838905-13839231)
chr3 (111-337)||(16821139-16821366)
chr3 (74-337)||(13975722-13975985)
chr3 (37-337)||(15858986-15859287)
chr3 (74-337)||(45860805-45861068)
chr3 (64-338)||(51158008-51158282)
chr3 (74-337)||(13954890-13955153)
chr3 (81-337)||(15936634-15936890)
chr3 (1-337)||(16744042-16744377)
chr3 (81-334)||(15938476-15938729)
chr3 (1-333)||(15614838-15615168)
chr3 (74-337)||(17912483-17912744)
chr3 (1-120)||(19260750-19260869)
chr3 (1-137)||(19231981-19232120)
chr3 (74-206)||(2449238-2449370)
chr3 (90-174)||(4145814-4145898)
chr3 (296-337)||(15468555-15468596)
chr3 (224-337)||(47984650-47984763)
chr3 (224-337)||(47993937-47994050)
chr3 (224-337)||(48003224-48003337)
chr3 (224-337)||(48012510-48012623)
chr3 (1-32)||(2449153-2449184)
chr3 (1-32)||(16261777-16261808)
chr3 (1-32)||(16933870-16933901)
chr3 (1-32)||(17912399-17912430)
chr3 (1-32)||(17955885-17955916)
chr3 (1-32)||(23492696-23492727)
chr3 (1-32)||(38168237-38168268)
chr3 (1-32)||(53771365-53771396)
chr3 (1-35)||(15857164-15857198)
chr3 (81-170)||(11986173-11986262)
chr3 (90-131)||(14080715-14080756)
chr3 (296-337)||(22275209-22275250)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-337)||(5991-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-337)||(883-1218)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-337)||(48598-48934)
scaffold0023 (111-337)||(36093-36320)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-337)||(20931345-20931681)
chr1 (1-337)||(41394222-41394558)
chr1 (111-337)||(18601143-18601370)
chr1 (1-337)||(20913037-20913366)
chr1 (86-337)||(5072388-5072640)
chr1 (1-337)||(20893552-20893889)
chr1 (1-337)||(37844375-37844714)
chr1 (1-337)||(20445679-20446018)
chr1 (13-337)||(20531444-20531770)
chr1 (124-337)||(22227809-22228022)
chr1 (124-337)||(22232506-22232719)
chr1 (111-333)||(2116258-2116481)
chr1 (1-271)||(45051489-45051757)
chr1 (74-206)||(51452623-51452755)
chr1 (111-333)||(45051446-45051649)
chr1 (1-32)||(15861327-15861358)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (86-337)||(10989410-10989661)
chr7 (111-337)||(2437457-2437684)
chr7 (1-335)||(16211768-16212102)
chr7 (1-337)||(3059966-3060302)
chr7 (1-337)||(13036939-13037277)
chr7 (111-337)||(13911049-13911277)
chr7 (1-337)||(36052667-36053002)
chr7 (1-332)||(11580662-11580997)
chr7 (111-337)||(13572676-13572903)
chr7 (81-337)||(18253842-18254098)
chr7 (74-331)||(25292338-25292595)
chr7 (74-337)||(47481031-47481294)
chr7 (111-337)||(16478987-16479213)
chr7 (74-337)||(7293017-7293279)
chr7 (75-337)||(13321014-13321278)
chr7 (74-206)||(11516358-11516490)
chr7 (74-206)||(15441564-15441696)
chr7 (74-206)||(30262129-30262261)
chr7 (2-195)||(295893-296087)
chr7 (1-32)||(2029244-2029275)
chr7 (1-32)||(7293333-7293364)
chr7 (1-32)||(11516544-11516575)
chr7 (1-32)||(14113904-14113935)
chr7 (1-32)||(15441479-15441510)
chr7 (1-69)||(15709428-15709500)
chr7 (1-32)||(30262044-30262075)
chr7 (1-32)||(42056189-42056220)
chr7 (91-172)||(13377693-13377775)
chr7 (4-32)||(15516765-15516793)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (9-338)||(16193651-16193980)
chr8 (86-337)||(30120722-30120974)
chr8 (148-337)||(222753-222943)
chr8 (148-337)||(736376-736566)
chr8 (148-337)||(860271-860461)
chr8 (1-337)||(43373393-43373731)
chr8 (86-337)||(16674392-16674644)
chr8 (1-326)||(24928717-24929043)
chr8 (111-337)||(21844597-21844824)
chr8 (111-337)||(21851990-21852217)
chr8 (1-337)||(16404901-16405235)
chr8 (86-333)||(6774258-6774505)
chr8 (86-333)||(24548986-24549233)
chr8 (74-337)||(22907214-22907476)
chr8 (74-326)||(17345581-17345832)
chr8 (74-206)||(5238218-5238350)
chr8 (74-206)||(24661248-24661380)
chr8 (74-206)||(43685677-43685809)
chr8 (148-210)||(691908-691970)
chr8 (1-32)||(5238404-5238435)
chr8 (1-32)||(22907129-22907160)
chr8 (1-32)||(24385653-24385684)
chr8 (1-32)||(24661163-24661194)
chr8 (1-32)||(24716763-24716794)
chr8 (1-32)||(43685863-43685894)
chr8 (91-131)||(38533855-38533895)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-337)||(8878-9214)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-337)||(12115-12449)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (111-337)||(42997-43224)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-326)||(171916-172241)
scaffold0001 (1-326)||(177619-177944)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-337)||(4996-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-337)||(26341-26678)
scaffold0162 (74-207)||(8180-8313)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-333)||(41733-42065)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-326)||(247367-247694)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-337)||(128096-128431)
scaffold0008 (111-337)||(31700-31928)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-337)||(36838-37176)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (3-337)||(19206-19543)
scaffold0195 (74-337)||(21290-21553)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-331)||(272031-272361)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (81-313)||(5552-5785)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-337)||(123088-123427)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (111-337)||(35-262)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (142-337)||(64584-64780)
scaffold0026 (81-337)||(107747-108003)
scaffold0026 (89-131)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (81-337)||(48187-48443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-207)||(51110-51315)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (111-337)||(21141-21367)
scaffold0139 (111-337)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (48-337)||(148721-149012)
scaffold0025 (1-337)||(8849-9191)
scaffold0025 (1-95)||(146843-146937)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (124-337)||(3722-3936)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (124-337)||(5254-5466)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-207)||(89379-89587)
scaffold0028 (1-125)||(107709-107835)
scaffold0028 (1-32)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (111-333)||(9374-9596)
scaffold0215 (111-333)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (86-231)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (74-337)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (74-337)||(34460-34724)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (231-337)||(9-115)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (74-207)||(13636-13769)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (74-337)||(37066-37328)
scaffold0078 (1-32)||(36981-37012)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (74-337)||(41648-41911)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (85-333)||(2966-3215)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (231-337)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (111-239)||(13350-13478)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (74-206)||(26926-27058)
scaffold0141 (81-206)||(22671-22796)
scaffold0141 (1-32)||(22857-22888)
scaffold0141 (1-32)||(27112-27143)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (74-206)||(1582-1714)
scaffold0124 (1-32)||(1497-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (241-337)||(9382-9478)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (74-167)||(3360-3453)
scaffold0361 (281-335)||(3210-3264)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (81-170)||(56106-56195)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (90-131)||(70307-70348)
scaffold0058 (1-32)||(57393-57424)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-32)||(6444-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-32)||(879-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-32)||(9883-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-32)||(13286-13317)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (90-172)||(8174-8257)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-32)||(80187-80218)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-32)||(55904-55935)
scaffold0032 (1-32)||(108076-108107)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-32)||(193398-193429)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (91-172)||(2317-2399)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-43)||(18015-18057)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (124-170)||(45198-45244)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 183  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  184 atgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  283 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23153785 - 23153458
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||     
T  23153785 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgtg 23153686  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  23153685 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 23153586  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  23153585 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  201 ttgtg-ctaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    |||||   ||  |||||| || | |||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| |||||| |    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 1650118  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||     
T  1650119 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaa 1650218  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||    
T  1650219 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatg 1650317  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650318 aatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 326
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23148334 - 23148266
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148334 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt-ca 172  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  173 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 269  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 159  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 174  Q
    |||||||| ||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 18002396 - 18002427
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002396 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 23995278 - 23995247
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995278 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 26090090 - 26090059
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090090 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 15742121 - 15742150
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742121 aaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 18778017 - 18778244
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778017 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 18778116  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778117 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgctt 18778216  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778217 gggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23507301 - 23506965
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23507301 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 23507202  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  23507201 ccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 23507102  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  23507101 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 43443420 - 43443647
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43443420 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 43443519  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443520 ttggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43443619  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443620 gggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 27182472 - 27182810
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |     
T  27182472 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatg 27182571  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  27182572 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 27182671  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  27182672 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 4200010 - 4200237
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4200010 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaa 4200109  T
Q  211 -gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200110 ttggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgctt 4200209  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200210 gggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27010068 - 27009841
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27010068 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaa 27009969  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27009968 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 27009869  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009868 gggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22053754 - 22054096
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  22053754 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 22053853  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  22053854 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 22053953  T
Q  195 tgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 293  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  22053954 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  294 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 18530989 - 18531330
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaattc 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||    
T  18530989 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaattc 18531088  T
Q  96 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 195  Q
    || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |    
T  18531089 gtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgt 18531188  T
Q  196 gaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 294  Q
    ||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||    
T  18531189 gaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 18531287  T
Q  295 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531288 gatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 285
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623100
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233660
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900538
Alignment:
Q  76 ggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 175  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  176 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536328
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052875
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||   |||||| |||||||||| |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37052875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 333
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  293 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 16105998 - 16105967
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105998 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 20623317 - 20623286
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623317 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 21233443 - 21233474
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233443 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 25900321 - 25900352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900321 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 37053092 - 37053061
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053092 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 337
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  296 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 174  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 463074 - 462743
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  463074 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 462975  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  462974 ccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 462875  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  462874 ttgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatga 462776  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattga 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462775 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8891580 - 8891242
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  8891580 aaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 8891481  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  8891480 ctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 8891381  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |||||    
T  8891380 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgat 8891282  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891281 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 20627239 - 20627576
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  20627239 aaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgc 20627338  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||     
T  20627339 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaa 20627438  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||    
T  20627439 attgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatg 20627537  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627538 aatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 36982365 - 36982704
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  36982365 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 36982464  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 197  Q
     |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36982465 gctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36982564  T
Q  198 agattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 296  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||    
T  36982565 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  297 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 19794630 - 19794967
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||     
T  19794630 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtg 19794728  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  19794729 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 19794828  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  |||||    
T  19794829 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgat 19794927  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794928 gaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 43642882 - 43643220
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||     
T  43642882 aagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtg 43642981  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| ||||    
T  43642982 ctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaa 43643081  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  |||||    
T  43643082 aattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgat 43643180  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643181 gaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 24341310 - 24341652
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  24341310 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 24341409  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    | | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||     
T  24341410 catgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 24341509  T
Q  195 tgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 293  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||    |    
T  24341510 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  294 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttct 222  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  223 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 321  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaat-tgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  322 tcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22863266 - 22863169
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863266 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689533
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820202
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906572
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015142
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 9652797 - 9652828
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652797 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 14906355 - 14906386
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906355 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 19689316 - 19689347
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689316 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 22284309 - 22284278
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284309 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 23820419 - 23820388
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820419 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13246768 - 13246430
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||     
T  13246768 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtg 13246669  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13246668 ctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13246569  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  13246568 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 54118169 - 54118507
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  54118169 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 54118268  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| ||||    
T  54118269 ctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaa 54118368  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || |||||    
T  54118369 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgat 54118467  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118468 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10644446 - 10644219
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  10644446 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 10644347  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644346 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 10644247  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644246 gggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 122225 - 121989
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  122225 aaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgct 122126  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  122125 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 122026  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgtta 237  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122025 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 329
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggg-tgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 329  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15675010 - 15675352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  15675010 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 15675109  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  15675110 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 15675209  T
Q  195 tgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 293  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  15675210 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  294 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 10104171 - 10104445
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||     
T  10104171 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatc 10104270  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  10104271 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 10104370  T
Q  195 tgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 269  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104371 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33241042 - 33240900
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  33241042 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 33240943  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 137  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240942 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488693
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328058
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 111491 - 111395
Alignment:
Q  241 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111491 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 172
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885652
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttca 40885652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31132656 - 31132545
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  31132656 aaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatt 31132557  T
Q  95 cgtactccaact 106  Q
    ||| ||||||||    
T  31132556 cgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 337
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  293 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 14952116 - 14952085
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15135908 - 15135939
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135908 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15272212 - 15272243
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272212 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 16327841 - 16327872
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327841 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 16609014 - 16609045
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609014 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 26680548 - 26680517
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680548 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 3509 - 3843
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  3509 aaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgct 3608  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  3609 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 3708  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||    
T  3709 ttgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1124
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1461 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtgc 1362  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  1361 tccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 1262  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  1261 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 14842488 - 14842824
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14842488 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 14842587  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  14842588 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaa 14842687  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  14842688 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2050146 - 2049810
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2050146 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 2050047  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||| |    
T  2050046 ccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaa 2049947  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  2049946 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 12030074 - 12030410
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12030074 aaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 12030173  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||      
T  12030174 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaag 12030273  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12030274 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13839231 - 13838905
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  13839231 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtgc 13839132  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  13839131 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 13839032  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  13839031 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 337
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  37 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  135 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgtt 233  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  234 gttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15859283  T
Q  334 gatg 337  Q
    ||||    
T  15859284 gatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 338
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  64 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 163  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  164 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaa 262  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  263 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 338  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggg-tgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 279  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  280 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16744042 - 16744377
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16744042 aaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgct 16744141  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  16744142 ccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaa 16744241  T
Q  201 ttgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    |||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || || |  |||||||    
T  16744242 ttgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatga 16744339  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744340 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 81 - 334
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 279  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  280 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 334  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614838
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| || |    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat-gtaattttg--cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgc 15615072  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  15615071 tcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaat 15614972  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||    
T  15614971 atggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatg 15614873  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614872 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| |  |||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 19260750 - 19260869
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19260750 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgct 19260849  T
Q  101 ccaactatgttgttatgttt 120  Q
    | || |||| || |||||||    
T  19260850 ctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19232120 - 19231981
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  19232120 aaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 19232021  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 137  Q
     |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232020 gctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449370
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 174  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 337
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  296 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  224 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 323  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  324 atggattgatgatg 337  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  224 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 323  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  324 atggattgatgatg 337  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  224 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 323  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  324 atggattgatgatg 337  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  224 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 323  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  324 atggattgatgatg 337  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 2449153 - 2449184
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449153 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 16261808 - 16261777
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261808 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 16933870 - 16933901
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933870 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 17912399 - 17912430
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912399 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 17955885 - 17955916
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955885 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 23492727 - 23492696
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492727 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 38168268 - 38168237
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168268 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 53771396 - 53771365
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771396 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 15857164 - 15857198
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 35  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857164 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  296 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 5991 - 6326
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5991 aaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 6090  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | || |    
T  6091 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaa 6190  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||    
T  6191 ttgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 883 - 1218
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  883 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 982  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  983 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaa 1082  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  | ||||||| | |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  1083 ttgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48934 - 48598
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48934 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 48835  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |    
T  48834 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaa 48735  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |||||||    
T  48734 ttgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20931681 - 20931345
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20931681 aaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 20931582  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20931581 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 20931482  T
Q  201 ttgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  20931481 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41394558 - 41394222
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41394558 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 41394459  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  41394458 ccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 41394359  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||   |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||    
T  41394358 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 41394260  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394259 atcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 18601143 - 18601370
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18601143 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 18601242  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18601243 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgctt 18601342  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601343 gggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20913366 - 20913037
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20913366 aaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgct 20913267  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20913266 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 20913167  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||       | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  20913166 ttgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaa-------tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 20893552 - 20893889
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |     
T  20893552 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcttg 20893650  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  20893651 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 20893750  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  20893751 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 37844375 - 37844714
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |     
T  37844375 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatg 37844474  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tga 197  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || |||    
T  37844475 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtga 37844574  T
Q  198 agattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 296  Q
    | |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  37844575 aaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  297 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20446018 - 20445679
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20446018 aaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20445919  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 197  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||    
T  20445918 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20445819  T
Q  198 agattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 296  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  20445818 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  297 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531444
Alignment:
Q  13 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||     
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aa 209  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| |||||||| ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  210 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  20531570 ttggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 20531472  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531471 gggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg-ctaaagggtgaatttct 222  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||| |    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22227924  T
Q  223 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 322  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22227923 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22227824  T
Q  323 catggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||    
T  22227823 catggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg-ctaaagggtgaatttct 222  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||| |    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22232621  T
Q  223 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 322  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22232620 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22232521  T
Q  323 catggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||    
T  22232520 catggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2116481 - 2116258
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  2116481 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 2116382  T
Q  210 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 308  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||    
T  2116381 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgct 2116283  T
Q  309 tgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  2116282 tgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051489
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||      
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat-gtgattttg--cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgt 45051661  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  45051660 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 45051561  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 271  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051560 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452623
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45051649 - 45051446
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  45051649 tgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 45051550  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||                  || ||||||||| | |||||    
T  45051549 ttggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat------------------tg-ttgatgaatcactgctt 45051470  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  45051469 gggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgt-aatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2437684 - 2437457
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2437684 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaa 2437585  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437584 ttggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 2437485  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  2437484 gagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16212102 - 16211768
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  16212102 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgct 16212003  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  16212002 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16211903  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  16211902 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 335  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3060302 - 3059966
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3060302 aaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 3060203  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  3060202 ccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaa 3060103  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  3060102 ttatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatga 3060004  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060003 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 13036939 - 13037277
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  13036939 aaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 13037038  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13037039 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13037138  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || |||||    
T  13037139 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 13911049 - 13911277
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13911049 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 13911148  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaa-gttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 308  Q
      |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13911149 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttct 13911248  T
Q  309 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911249 tgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36053002 - 36052667
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  ||    
T  36053002 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttata 36052903  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36052902 ctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 36052803  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||    
T  36052802 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 11580662 - 11580997
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattcg 96  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||||    
T  11580662 aaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattcg 11580761  T
Q  97 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 196  Q
    | |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  11580762 tgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 11580861  T
Q  197 aagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 295  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  11580862 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  296 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 332  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13572903 - 13572676
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13572903 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 13572804  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13572803 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 13572704  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572703 gggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 279  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  280 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 331
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 331  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  210 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| |  |||||| || ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  75 tggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  174 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 270  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| |  |||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  271 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516358
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441696
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262261
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  2 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||      
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 195  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 2029275 - 2029244
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029275 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 7293364 - 7293333
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293364 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 11516575 - 11516544
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516575 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 14113904 - 14113935
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113904 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15441479 - 15441510
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441479 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15709500 - 15709428
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 69  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709500 aaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 30262044 - 30262075
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262044 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 42056189 - 42056220
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056189 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  4 gtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 16193651 - 16193980
Alignment:
Q  9 ggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16193651 ggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 16193750  T
Q  109 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct- 207  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  16193751 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16193850  T
Q  208 aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 307  Q
    ||  ||||||||| | | || ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||    
T  16193851 aattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 16193949  T
Q  308 ttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193950 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 148 - 337
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  247 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 148 - 337
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  247 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 148 - 337
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  247 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 43373393 - 43373731
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||     
T  43373393 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgtg 43373492  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  43373493 ctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 43373592  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  43373593 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 86 - 337
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 24928717 - 24929043
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24928717 aaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 24928816  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  24928817 tccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 24928916  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||    |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  24928917 attgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 21844597 - 21844824
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21844597 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21844696  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844697 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21844796  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844797 gggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 21851990 - 21852217
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21851990 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21852089  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852090 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21852189  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852190 gggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16404901 - 16405235
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||     
T  16404901 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtg 16404999  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| ||||    
T  16405000 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaa 16405099  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||  |||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||    
T  16405100 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgat 16405195  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405196 gaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 284  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  285 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238218
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661380
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685677
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  148 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 5238435 - 5238404
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238435 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 22907129 - 22907160
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907129 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 24385653 - 24385684
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385653 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 24661163 - 24661194
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661163 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 24716763 - 24716794
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716763 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 43685894 - 43685863
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685894 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533855
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 38533855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9214 - 8878
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  9214 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgct 9115  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| |    
T  9114 ccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaa 9015  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  9014 ttgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12449 - 12115
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12449 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 12351  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    || |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||     
T  12350 tctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 12251  T
Q  200 attgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  12250 attgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttg-taat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 172241 - 171916
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  172241 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgct 172142  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |    
T  172141 ccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaa 172042  T
Q  201 ttgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  172041 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 177944 - 177619
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  177944 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgct 177845  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |    
T  177844 ccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaa 177745  T
Q  201 ttgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||    
T  177744 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  10 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  109 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct- 207  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  208 aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 307  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  308 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 26341 - 26678
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| |    
T  26341 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtgc 26440  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  26441 tccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 26540  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  26541 attgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 207
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8313
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 207  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 8313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42065 - 41733
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42065 aaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 41966  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  41965 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaa 41866  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   ||||||    
T  41865 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 247367 - 247694
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  247367 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 247466  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  247467 ctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 247566  T
Q  199 gattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  247567 aattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 128096 - 128431
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  128096 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 128195  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| |||| |    
T  128196 tcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaa 128295  T
Q  201 ttgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||| ||  || |||||| |  || |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||    
T  128296 ttgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaa-gttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 308  Q
      |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  309 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 36838 - 37176
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||     
T  36838 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtg 36937  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36938 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 37037  T
Q  199 gattgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 297  Q
     |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  37038 aattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 37136  T
Q  298 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37137 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  3 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtac 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  100 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 199  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  200 attgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 298  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  299 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 272361 - 272031
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  272361 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtact 272262  T
Q  101 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 200  Q
    |||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |    
T  272261 ccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaa 272162  T
Q  201 ttgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 299  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || |||||||    
T  272161 ttgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  300 ataattgcttgggtatgcatattcatggattg 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 279  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  280 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 313  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 123088 - 123427
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 97  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  123088 aaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 123187  T
Q  98 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 197  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  123188 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 123287  T
Q  198 agattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 296  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  123288 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  297 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 35
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  262 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaa 163  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 63  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  62 gggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 142 - 337
Target Start/End: Original strand, 64584 - 64780
Alignment:
Q  142 ttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatg 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  64584 ttgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatt 64683  T
Q  241 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64684 tgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaag-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 279  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  280 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  89 taaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 279  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  280 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51315
Alignment:
Q  2 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactc 101  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  102 caactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 201  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  202 tgtgct 207  Q
    ||||||    
T  51310 tgtgct 51315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 21141 - 21367
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21141 tgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaa 21240  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21241 ttggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgctt 21339  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||    
T  21340 gagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  211 g-ggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  48 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  146 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgag 244  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  245 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9191 - 8849
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatt 94  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||    
T  9191 aaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaatt 9092  T
Q  95 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 194  Q
    ||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  9091 cgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 8992  T
Q  195 tgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 293  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |  |    
T  8991 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgt 8893  T
Q  294 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8892 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 146937 - 146843
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  146937 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattc 146843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtg-ctaaagggtgaatttc 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| | ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  222 tcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 321  Q
    | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  322 tcatggattgatgatg 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttct 222  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  223 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 322  Q
     || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  323 catggattgatgatg 337  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 89379 - 89587
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||     
T  89379 aaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtg 89478  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 198  Q
    |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| ||||    
T  89479 ctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaa 89578  T
Q  199 gattgtgct 207  Q
     ||||||||    
T  89579 aattgtgct 89587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 107709 - 107835
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgta 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||     
T  107709 aaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgtg 107808  T
Q  99 ctccaactatgttgttatgtttgtatg 125  Q
    |||||||| || || ||| ||||||||    
T  107809 ctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 333
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  210 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 333
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  210 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 309  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  310 gggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  86 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 185  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  186 gataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttg 231  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||   | |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 271  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  272 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 337
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  231 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 330  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  331 gatgatg 337  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13636
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 207  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa-gggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||    |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 36981 - 37012
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36981 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 272  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  273 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  85 ttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 184  Q
    ||||||||||||| |||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  185 tgataagttatgaagattgtgct-aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 282  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  283 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 333  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  231 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 330  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  331 gatgatg 337  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 13350 - 13478
Alignment:
Q  111 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct-aa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  13350 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 13449  T
Q  210 agggtgaatttctcctaagttgttgttaat 239  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13450 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaat 13478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26926
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22671
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  181 aaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 22888 - 22857
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 27143 - 27112
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27143 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1714
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  174 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 206  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 1497 - 1528
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1497 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9382
Alignment:
Q  241 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 337  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9478 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  74 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 167  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  281 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 335  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 170
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56195
Alignment:
Q  81 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 57393 - 57424
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57393 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 6444 - 6475
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6444 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 879 - 910
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 9883 - 9914
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9883 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 13286 - 13317
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13286 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  90 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 80218 - 80187
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80218 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 55935 - 55904
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55935 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 108076 - 108107
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108076 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 193398 - 193429
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193398 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  91 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 172  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 18057 - 18015
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 43  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18057 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  124 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 170  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University