View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21681_high_3 (Length: 387)

Name: NF21681_high_3
Description: NF21681
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21681_high_3
NF21681_high_3
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (30-365)||(7452-7787)
scaffold0143 (30-365)||(30785-31120)
scaffold0143 (30-365)||(19562-19897)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (27-365)||(29504902-29505240)
chr6 (27-365)||(13520564-13520902)
chr6 (27-365)||(26789302-26789640)
chr6 (27-365)||(27197671-27198009)
chr6 (27-365)||(27251226-27251564)
chr6 (27-365)||(28163977-28164315)
chr6 (27-365)||(14141766-14142104)
chr6 (30-365)||(33372803-33373138)
chr6 (27-365)||(16677626-16677964)
chr6 (27-365)||(34460878-34461216)
chr6 (30-365)||(27060995-27061330)
chr6 (30-365)||(27626083-27626418)
chr6 (30-365)||(29576503-29576838)
chr6 (27-364)||(30554389-30554726)
chr6 (30-365)||(29553046-29553381)
chr6 (27-365)||(27358482-27358820)
chr6 (27-365)||(27448825-27449163)
chr6 (30-365)||(4761252-4761587)
chr6 (30-365)||(13295323-13295658)
chr6 (30-365)||(16753310-16753645)
chr6 (34-365)||(24867209-24867540)
chr6 (30-365)||(26921866-26922201)
chr6 (30-365)||(27011220-27011555)
chr6 (30-365)||(27022625-27022960)
chr6 (27-365)||(8902075-8902413)
chr6 (30-365)||(3699572-3699907)
chr6 (30-365)||(4528774-4529109)
chr6 (30-365)||(4776369-4776704)
chr6 (30-365)||(22931256-22931591)
chr6 (30-365)||(23853701-23854036)
chr6 (30-365)||(26112784-26113119)
chr6 (30-365)||(28210943-28211278)
chr6 (27-365)||(26774999-26775337)
chr6 (30-365)||(27286736-27287071)
chr6 (30-365)||(27488622-27488957)
chr6 (30-354)||(27179945-27180269)
chr6 (30-354)||(27268970-27269294)
chr6 (30-365)||(4720507-4720842)
chr6 (30-365)||(15420692-15421027)
chr6 (30-364)||(16940400-16940734)
chr6 (30-365)||(4542146-4542481)
chr6 (64-365)||(24302129-24302430)
chr6 (30-365)||(17088815-17089150)
chr6 (31-365)||(20172037-20172371)
chr6 (31-365)||(22163620-22163954)
chr6 (30-241)||(22455610-22455821)
chr6 (215-365)||(15408905-15409055)
chr6 (30-142)||(26992284-26992396)
chr6 (33-297)||(23971210-23971474)
chr6 (33-292)||(18119961-18120220)
chr6 (33-292)||(18212114-18212373)
chr6 (27-292)||(9135798-9136063)
chr6 (33-235)||(27545394-27545596)
chr6 (175-295)||(25707645-25707765)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (27-365)||(18497051-18497389)
chr5 (30-365)||(40469876-40470211)
chr5 (27-365)||(33878626-33878964)
chr5 (30-365)||(3793040-3793375)
chr5 (27-365)||(24586870-24587208)
chr5 (30-365)||(9320975-9321310)
chr5 (30-365)||(43081754-43082089)
chr5 (27-365)||(8661801-8662139)
chr5 (27-365)||(11327133-11327471)
chr5 (27-365)||(30155527-30155865)
chr5 (30-365)||(12135674-12136009)
chr5 (30-365)||(26483893-26484228)
chr5 (27-361)||(24727465-24727799)
chr5 (30-365)||(28652741-28653076)
chr5 (27-365)||(9547035-9547373)
chr5 (27-365)||(34620014-34620352)
chr5 (27-364)||(33519876-33520213)
chr5 (30-365)||(11552854-11553189)
chr5 (30-365)||(23629469-23629804)
chr5 (30-365)||(33296027-33296362)
chr5 (30-365)||(25203777-25204112)
chr5 (30-365)||(25267932-25268267)
chr5 (27-365)||(6877801-6878139)
chr5 (31-365)||(13183119-13183453)
chr5 (27-365)||(30171965-30172303)
chr5 (27-361)||(41678201-41678535)
chr5 (30-365)||(2514561-2514896)
chr5 (30-365)||(22995443-22995778)
chr5 (30-365)||(31434963-31435298)
chr5 (30-365)||(31822733-31823068)
chr5 (30-365)||(37767317-37767652)
chr5 (27-365)||(29887523-29887861)
chr5 (27-361)||(30032924-30033258)
chr5 (27-361)||(37758479-37758813)
chr5 (30-365)||(24973405-24973740)
chr5 (30-365)||(30938134-30938469)
chr5 (30-365)||(32592600-32592935)
chr5 (27-365)||(28956111-28956449)
chr5 (30-358)||(15655091-15655419)
chr5 (30-365)||(13439009-13439344)
chr5 (30-365)||(18124742-18125077)
chr5 (30-361)||(18371864-18372195)
chr5 (30-365)||(37354969-37355304)
chr5 (30-365)||(37667812-37668147)
chr5 (30-365)||(33780988-33781319)
chr5 (30-364)||(22891962-22892296)
chr5 (27-361)||(15755182-15755516)
chr5 (33-364)||(5641290-5641621)
chr5 (30-365)||(13321156-13321491)
chr5 (30-139)||(24684697-24684806)
chr5 (33-292)||(3483602-3483861)
chr5 (27-292)||(11943821-11944086)
chr5 (27-242)||(34469118-34469333)
chr5 (27-292)||(5439624-5439889)
chr5 (27-292)||(15784124-15784389)
chr5 (27-292)||(17957593-17957858)
chr5 (27-292)||(31520803-31521068)
chr5 (123-292)||(36375361-36375530)
chr5 (123-292)||(37000015-37000184)
chr5 (27-297)||(351609-351879)
chr5 (33-235)||(20388445-20388647)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (30-365)||(16747831-16748166)
chr7 (27-365)||(2776740-2777078)
chr7 (27-365)||(31127393-31127731)
chr7 (27-365)||(26681420-26681758)
chr7 (30-365)||(26316162-26316497)
chr7 (27-365)||(26512010-26512348)
chr7 (27-365)||(39209453-39209791)
chr7 (27-365)||(45390706-45391044)
chr7 (30-365)||(5143654-5143989)
chr7 (27-365)||(26666228-26666566)
chr7 (30-365)||(26271400-26271735)
chr7 (27-365)||(4202875-4203213)
chr7 (30-365)||(2158063-2158398)
chr7 (30-365)||(10913183-10913518)
chr7 (31-365)||(2106477-2106811)
chr7 (30-365)||(11421093-11421428)
chr7 (30-365)||(16514744-16515079)
chr7 (27-365)||(3448792-3449130)
chr7 (27-365)||(4141560-4141898)
chr7 (30-365)||(22145684-22146019)
chr7 (30-365)||(5131485-5131820)
chr7 (30-365)||(26534187-26534522)
chr7 (30-365)||(31086936-31087271)
chr7 (30-365)||(31560704-31561039)
chr7 (30-364)||(11444376-11444710)
chr7 (30-361)||(26438746-26439077)
chr7 (30-358)||(16044807-16045132)
chr7 (30-365)||(10845109-10845444)
chr7 (30-364)||(24588849-24589183)
chr7 (27-365)||(26516278-26516616)
chr7 (33-365)||(10842308-10842640)
chr7 (30-365)||(16446320-16446655)
chr7 (27-365)||(45734799-45735131)
chr7 (65-365)||(5161907-5162207)
chr7 (33-292)||(29090008-29090267)
chr7 (33-292)||(2557027-2557286)
chr7 (33-272)||(16127225-16127464)
chr7 (33-292)||(15193575-15193834)
chr7 (27-294)||(797908-798175)
chr7 (27-292)||(16392821-16393086)
chr7 (27-292)||(30369333-30369598)
chr7 (27-292)||(9469806-9470071)
chr7 (27-294)||(16286764-16287031)
chr7 (27-297)||(25726983-25727252)
chr7 (33-235)||(1893019-1893221)
chr7 (35-153)||(16237975-16238093)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (27-365)||(13932965-13933303)
chr2 (27-365)||(22924566-22924904)
chr2 (27-365)||(27120012-27120350)
chr2 (27-364)||(3785981-3786318)
chr2 (30-365)||(27779725-27780060)
chr2 (30-365)||(27819482-27819817)
chr2 (27-365)||(31879774-31880112)
chr2 (30-365)||(40236999-40237334)
chr2 (27-365)||(257071-257409)
chr2 (27-365)||(31889909-31890247)
chr2 (27-365)||(34158332-34158670)
chr2 (30-365)||(9346404-9346739)
chr2 (30-365)||(11631602-11631937)
chr2 (27-365)||(19412919-19413257)
chr2 (27-365)||(32053291-32053629)
chr2 (27-365)||(37682313-37682651)
chr2 (27-365)||(37697578-37697916)
chr2 (30-361)||(21673597-21673928)
chr2 (27-365)||(27807191-27807529)
chr2 (27-365)||(37928857-37929195)
chr2 (30-365)||(34294645-34294980)
chr2 (27-365)||(34865172-34865510)
chr2 (27-365)||(39048237-39048575)
chr2 (27-364)||(16825757-16826094)
chr2 (27-364)||(16895386-16895723)
chr2 (30-365)||(12590299-12590634)
chr2 (30-365)||(20841404-20841739)
chr2 (30-365)||(12659027-12659362)
chr2 (30-365)||(21699589-21699924)
chr2 (30-361)||(39893560-39893891)
chr2 (27-365)||(12713019-12713357)
chr2 (27-365)||(16164968-16165306)
chr2 (30-365)||(27430859-27431194)
chr2 (30-365)||(23124987-23125321)
chr2 (30-361)||(37381168-37381499)
chr2 (27-365)||(37948280-37948618)
chr2 (30-365)||(19452841-19453176)
chr2 (74-365)||(34271338-34271629)
chr2 (33-364)||(27395056-27395387)
chr2 (81-365)||(28885821-28886105)
chr2 (30-208)||(27827951-27828129)
chr2 (30-140)||(28885698-28885808)
chr2 (33-292)||(34701570-34701829)
chr2 (33-292)||(42394029-42394288)
chr2 (27-294)||(21760104-21760371)
chr2 (117-292)||(22949971-22950146)
chr2 (33-235)||(34533991-34534193)
chr2 (27-292)||(12384148-12384413)
chr2 (33-235)||(26723824-26724026)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (30-365)||(18797043-18797378)
chr4 (27-365)||(40102066-40102404)
chr4 (30-365)||(5009380-5009715)
chr4 (30-365)||(54836896-54837231)
chr4 (30-365)||(6573363-6573698)
chr4 (27-365)||(27159746-27160084)
chr4 (33-365)||(39854145-39854477)
chr4 (27-364)||(21973203-21973540)
chr4 (27-364)||(31122942-31123279)
chr4 (33-361)||(36340950-36341278)
chr4 (30-365)||(24116167-24116502)
chr4 (30-365)||(34185389-34185724)
chr4 (30-365)||(1903759-1904094)
chr4 (30-361)||(14102048-14102379)
chr4 (30-365)||(15231377-15231712)
chr4 (30-365)||(17016551-17016886)
chr4 (30-365)||(20334850-20335185)
chr4 (30-364)||(30757265-30757599)
chr4 (30-365)||(24588790-24589125)
chr4 (27-365)||(18313607-18313945)
chr4 (30-365)||(14668521-14668856)
chr4 (30-365)||(33670229-33670564)
chr4 (30-334)||(14759766-14760070)
chr4 (30-365)||(15281366-15281701)
chr4 (209-365)||(5698219-5698375)
chr4 (33-224)||(15387948-15388139)
chr4 (218-364)||(15384778-15384924)
chr4 (33-292)||(14725301-14725560)
chr4 (33-292)||(19767847-19768106)
chr4 (39-235)||(12515746-12515942)
chr4 (33-235)||(1881658-1881860)
chr4 (79-294)||(55784686-55784901)
chr4 (27-297)||(22146066-22146336)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (27-365)||(44564472-44564810)
chr8 (27-365)||(15771062-15771400)
chr8 (27-365)||(31358016-31358354)
chr8 (30-365)||(18712975-18713310)
chr8 (30-365)||(9358116-9358451)
chr8 (30-365)||(19204752-19205087)
chr8 (30-365)||(19691589-19691924)
chr8 (30-365)||(28358342-28358677)
chr8 (30-365)||(14561115-14561450)
chr8 (30-364)||(19677938-19678272)
chr8 (30-365)||(2133650-2133985)
chr8 (30-365)||(18794195-18794530)
chr8 (30-365)||(27605295-27605630)
chr8 (30-365)||(33262225-33262560)
chr8 (30-365)||(12089113-12089448)
chr8 (30-365)||(29832817-29833152)
chr8 (30-361)||(31486265-31486596)
chr8 (27-365)||(21344561-21344899)
chr8 (65-365)||(19657731-19658031)
chr8 (64-365)||(33245894-33246195)
chr8 (33-364)||(22077316-22077633)
chr8 (33-292)||(22412432-22412691)
chr8 (33-292)||(19844661-19844920)
chr8 (33-292)||(14212533-14212792)
chr8 (33-235)||(16768817-16769019)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (27-365)||(32294078-32294416)
chr3 (30-365)||(28112426-28112761)
chr3 (27-365)||(5017164-5017502)
chr3 (27-365)||(5714523-5714861)
chr3 (27-365)||(5725433-5725771)
chr3 (27-365)||(5766597-5766935)
chr3 (30-365)||(5605786-5606121)
chr3 (30-365)||(21678156-21678491)
chr3 (27-361)||(8215185-8215519)
chr3 (27-364)||(51785473-51785810)
chr3 (30-365)||(22384050-22384385)
chr3 (27-365)||(5592829-5593167)
chr3 (27-365)||(31032708-31033046)
chr3 (30-365)||(4627238-4627573)
chr3 (30-365)||(6205356-6205691)
chr3 (30-365)||(7076659-7076994)
chr3 (30-364)||(18228649-18228983)
chr3 (27-365)||(20573315-20573653)
chr3 (27-365)||(29661442-29661780)
chr3 (27-365)||(47026903-47027241)
chr3 (30-365)||(8285942-8286277)
chr3 (30-365)||(11106831-11107166)
chr3 (30-365)||(19697943-19698278)
chr3 (30-365)||(28024735-28025070)
chr3 (30-365)||(4687108-4687443)
chr3 (30-365)||(4725084-4725419)
chr3 (30-365)||(4793107-4793442)
chr3 (30-365)||(15737566-15737901)
chr3 (30-365)||(18246194-18246529)
chr3 (30-365)||(18304126-18304461)
chr3 (30-365)||(20069493-20069828)
chr3 (30-365)||(24331616-24331951)
chr3 (30-365)||(35884219-35884554)
chr3 (27-365)||(8299421-8299759)
chr3 (30-365)||(15889177-15889512)
chr3 (30-365)||(18334083-18334418)
chr3 (30-365)||(29145228-29145563)
chr3 (30-361)||(32442604-32442935)
chr3 (27-365)||(28342627-28342965)
chr3 (27-365)||(48469377-48469715)
chr3 (30-365)||(4420368-4420703)
chr3 (30-365)||(17981421-17981756)
chr3 (30-365)||(18054715-18055050)
chr3 (30-365)||(18273524-18273859)
chr3 (30-365)||(18288825-18289160)
chr3 (30-365)||(31960927-31961262)
chr3 (30-365)||(10399597-10399932)
chr3 (30-365)||(5470441-5470776)
chr3 (30-365)||(8000013-8000348)
chr3 (30-365)||(10646526-10646861)
chr3 (30-365)||(4343148-4343483)
chr3 (30-365)||(22867320-22867655)
chr3 (30-365)||(22882379-22882714)
chr3 (33-365)||(6539214-6539546)
chr3 (30-361)||(16620966-16621297)
chr3 (65-365)||(5653573-5653873)
chr3 (27-242)||(17992526-17992741)
chr3 (238-365)||(17973333-17973460)
chr3 (33-292)||(11924903-11925162)
chr3 (33-292)||(6571810-6572069)
chr3 (33-292)||(22959909-22960168)
chr3 (33-272)||(7088592-7088831)
chr3 (33-292)||(16431861-16432120)
chr3 (33-297)||(15704929-15705193)
chr3 (36-235)||(15918976-15919175)
chr3 (27-294)||(20443567-20443834)
chr3 (81-235)||(15592513-15592667)
chr3 (27-292)||(5950347-5950612)
chr3 (27-292)||(46380784-46381049)
chr3 (27-297)||(6962973-6963243)
chr3 (81-173)||(37260373-37260465)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (27-365)||(9511-9849)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (27-365)||(28153227-28153565)
chr1 (27-364)||(10948568-10948905)
chr1 (30-365)||(10966159-10966494)
chr1 (30-365)||(28588479-28588814)
chr1 (30-365)||(3644629-3644965)
chr1 (30-365)||(16204463-16204798)
chr1 (27-361)||(51641709-51642043)
chr1 (30-365)||(41789739-41790074)
chr1 (27-365)||(21894177-21894516)
chr1 (30-365)||(20464470-20464805)
chr1 (68-365)||(20336845-20337142)
chr1 (36-297)||(22489521-22489782)
chr1 (27-292)||(5628500-5628765)
chr1 (30-71)||(20339024-20339065)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (30-365)||(9528-9863)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (27-365)||(11357-11695)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (30-365)||(16073-16408)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (30-365)||(3559-3894)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (27-364)||(22621-22958)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (27-365)||(5608-5946)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (30-365)||(9537-9872)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (30-365)||(11441-11776)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (30-365)||(13063-13398)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (33-340)||(5125-5432)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (30-359)||(43145-43492)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (179-364)||(22757-22942)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (181-365)||(118762-118946)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (33-292)||(10713-10972)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (36-235)||(34799-34998)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (238-365)||(1979-2109)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (39-235)||(4969-5165)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (27-292)||(29659-29924)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (30-71)||(1347-1388)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (27-91)||(4618-4682)


Alignment Details
Target: scaffold0143 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 7452 - 7787
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7452 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 7551  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7552 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 7651  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7652 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 7751  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7752 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 30785 - 31120
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30785 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 30884  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30885 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 30984  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  30985 tgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 31084  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31085 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 19562 - 19897
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19562 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 19661  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662 cttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 19761  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  19762 cgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcatt 19861  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19862 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 29504902 - 29505240
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29504902 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 29505001  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29505002 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 29505101  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29505102 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 29505201  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29505202 attcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29505240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13520902 - 13520564
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13520902 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 13520803  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13520802 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 13520703  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13520702 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 13520603  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13520602 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13520564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 26789302 - 26789640
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26789302 gtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 26789401  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26789402 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 26789501  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26789502 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 26789601  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789602 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26789640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 27197671 - 27198009
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27197671 gtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 27197770  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27197771 agacttgttgtgctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 27197870  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27197871 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 27197970  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197971 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27198009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27251564 - 27251226
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27251564 gtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 27251465  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27251464 agacttgttgtgctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 27251365  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27251364 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 27251265  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251264 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27251226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 28163977 - 28164315
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28163977 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 28164076  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28164077 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 28164176  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28164177 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 28164276  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28164277 attcttgctgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28164315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14142104 - 14141766
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14142104 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 14142005  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14142004 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 14141905  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14141904 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 14141805  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14141804 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 14141766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33373138 - 33372803
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33373138 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacactgcttgagaaga 33373039  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33373038 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctt 33372939  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33372938 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 33372839  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33372838 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33372803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 16677626 - 16677964
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16677626 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactacctgagcaagaagttcactgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 16677725  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16677726 agacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatgt 16677825  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  16677826 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaagggcaatcaaaggtagc 16677925  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16677926 attcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16677964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34461216 - 34460878
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34461216 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 34461117  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34461116 ggacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 34461017  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34461016 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 34460917  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34460916 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 34460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 27060995 - 27061330
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27060995 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27061094  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061095 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27061194  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27061195 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatattatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27061294  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27061295 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27061330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27626418 - 27626083
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626418 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgaccgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27626319  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27626318 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccaatcaagtatatctt 27626219  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27626218 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27626119  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626118 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27626083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 29576503 - 29576838
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576503 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 29576602  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29576603 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccaatcaagtatatctt 29576702  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29576703 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 29576802  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29576803 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29576838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30554726 - 30554389
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30554726 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 30554627  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30554626 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 30554527  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30554526 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 30554427  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  30554426 attctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 30554389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 29553046 - 29553381
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29553046 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaga 29553145  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553146 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 29553245  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29553246 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 29553345  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29553346 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29553381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27358820 - 27358482
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27358820 gtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 27358721  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27358720 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 27358621  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  27358620 ctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagc 27358521  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27358520 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27358482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27449163 - 27448825
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27449163 gtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 27449064  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27449063 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 27448964  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  27448963 ctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagc 27448864  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27448863 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27448825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 4761252 - 4761587
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761252 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 4761351  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4761352 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatatagaatggatccgataaagtatatctt 4761451  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4761452 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 4761551  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4761552 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4761587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13295658 - 13295323
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295658 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 13295559  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295558 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 13295459  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13295458 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 13295359  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13295358 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 16753310 - 16753645
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753310 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 16753409  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753410 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 16753509  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16753510 tgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 16753609  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16753610 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 16753645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 34 - 365
Target Start/End: Original strand, 24867209 - 24867540
Alignment:
Q  34 gtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttg 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867209 gtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttg 24867308  T
Q  134 ttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgag 233  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867309 ttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgag 24867408  T
Q  234 aaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttg 333  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24867409 aaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttg 24867508  T
Q  334 cagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24867509 ccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24867540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 26921866 - 26922201
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921866 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 26921965  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921966 cctgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 26922065  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26922066 tgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 26922165  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26922166 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26922201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 27011220 - 27011555
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27011220 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 27011319  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011320 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27011419  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27011420 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 27011519  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27011520 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27011555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 27022625 - 27022960
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022625 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27022724  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022725 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27022824  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27022825 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27022924  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27022925 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27022960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8902413 - 8902075
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  8902413 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgaga 8902314  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8902313 aaacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 8902214  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8902213 ctttgagaaagctgctgttactgggaatattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 8902114  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8902113 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 8902075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 3699572 - 3699907
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699572 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 3699671  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3699672 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccaataaagtatatctt 3699771  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3699772 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 3699871  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3699872 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 3699907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 4528774 - 4529109
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4528774 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 4528873  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528874 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4528973  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4528974 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 4529073  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4529074 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4529109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 4776369 - 4776704
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4776369 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 4776468  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776469 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4776568  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4776569 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 4776668  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4776669 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4776704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22931591 - 22931256
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931591 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgatatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 22931492  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931491 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaccgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 22931392  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22931391 cgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 22931292  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22931291 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22931256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23854036 - 23853701
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854036 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgatatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 23853937  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853936 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaccgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 23853837  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23853836 cgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 23853737  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23853736 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 23853701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26113119 - 26112784
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26113119 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaaga 26113020  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113019 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 26112920  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26112919 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 26112820  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26112819 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 26112784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 28210943 - 28211278
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28210943 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaaga 28211042  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211043 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 28211142  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28211143 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 28211242  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28211243 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 28211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26775337 - 26774999
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26775337 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgctcgaga 26775238  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26775237 agacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtatat 26775138  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26775137 cttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 26775038  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26775037 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26774999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27287071 - 27286736
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287071 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27286972  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27286971 cttgttgtgctttggcatgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27286872  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27286871 tgagaaagctgctattactgggaagattgcacgttggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 27286772  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27286771 cttgccgatcatcttgcctatcaacctcttgatgat 27286736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 27488622 - 27488957
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488622 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27488721  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488722 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacctggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27488821  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27488822 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 27488921  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27488922 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27488957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Original strand, 27179945 - 27180269
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179945 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27180044  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27180045 cttgttgtgctctggcctaggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27180144  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27180145 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27180244  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaac 354  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27180245 cttgccgatcaccttgcttaccaac 27180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27269294 - 27268970
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269294 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27269195  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269194 cttgttgtgctctggcctaggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27269095  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27269094 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27268995  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaac 354  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27268994 cttgccgatcaccttgcttaccaac 27268970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4720842 - 4720507
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4720842 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaaga 4720743  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720742 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4720643  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4720642 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 4720543  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4720542 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4720507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15421027 - 15420692
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421027 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 15420928  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15420927 cttgttgcgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 15420828  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15420827 tgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaagggaatcaaaggtagcatt 15420728  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15420727 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16940734 - 16940400
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940734 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 16940635  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940634 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 16940535  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16940534 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 16940435  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16940434 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16940400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4542481 - 4542146
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4542481 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaaga 4542382  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542381 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4542282  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4542281 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 4542182  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||  |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4542181 cttgccaatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4542146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 64 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24302430 - 24302129
Alignment:
Q  64 atgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcct 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24302430 atgctatctactatctgagcaagaagttcaccgaccgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcct 24302331  T
Q  164 gcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24302330 gcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgc 24302231  T
Q  264 tggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatg 363  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302230 tgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatg 24302131  T
Q  364 at 365  Q
    ||    
T  24302130 at 24302129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17089150 - 17088815
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17089150 cttggtcaacaagatgggactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 17089051  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089050 cttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 17088951  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||     
T  17088950 tgagaaagcgactgttacagggaagattgcacgatggcagatgctcttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaatggcaatcaaaggtagcatc 17088851  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  17088850 cttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 17088815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 20172037 - 20172371
Alignment:
Q  31 ttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20172037 ttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgagactcggtatactatgcttgagaagac 20172136  T
Q  131 ttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatcttt 230  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  20172137 ttgttgtgctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttc 20172236  T
Q  231 gagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattc 330  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20172237 gagaaacctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattc 20172336  T
Q  331 ttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20172337 ttgccgatcatcttgcctaccaacccctggatgat 20172371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22163954 - 22163620
Alignment:
Q  31 ttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22163954 ttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgagactcggtatactatgcttgagaagac 22163855  T
Q  131 ttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatcttt 230  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  22163854 ttgttgtgctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttc 22163755  T
Q  231 gagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattc 330  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22163754 gagaaacctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattc 22163655  T
Q  331 ttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22163654 ttgccgatcatcttgcctaccaacccctggatgat 22163620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22455821 - 22455610
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455821 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcatcgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 22455722  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455721 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 22455622  T
Q  230 tgagaaagctgc 241  Q
    ||||||||||||    
T  22455621 tgagaaagctgc 22455610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15409055 - 15408905
Alignment:
Q  215 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagcca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  15409055 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaaggga 15408956  T
Q  315 atcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15408955 atcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15408905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Original strand, 26992284 - 26992396
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26992284 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaga 26992383  T
Q  130 cttgttgtgctct 142  Q
    |||||||||||||    
T  26992384 cttgttgtgctct 26992396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23971474 - 23971210
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  23971474 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgatatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 23971375  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  23971374 gttgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttga 23971275  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 297  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| ||  | ||||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  23971274 gaagccagctttaactggaaggattgcttgatggcagatgttattgtccgagtatgatattgtgt 23971210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 18119961 - 18120220
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  18119961 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 18120060  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  18120061 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 18120160  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  18120161 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 18120220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18212373 - 18212114
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  18212373 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgttatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatactctgtacttgagaaaactt 18212274  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  18212273 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 18212174  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  18212173 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 18212114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9136063 - 9135798
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  9136063 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 9135964  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  9135963 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 9135864  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  9135863 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgagtatgatat 9135798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 27545394 - 27545596
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||  |||| |||||||| ||||| || ||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  27545394 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 27545493  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  27545494 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 27545593  T
Q  233 gaa 235  Q
    |||    
T  27545594 gaa 27545596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 295
Target Start/End: Original strand, 25707645 - 25707765
Alignment:
Q  175 tggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgct 274  Q
    |||| ||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||| | || ||||  || || || |||||||||||    
T  25707645 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatttttgagaagcctgctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgct 25707744  T
Q  275 tttgtctgaatatgatattgt 295  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  25707745 attgtccgagtatgatattgt 25707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18497389 - 18497051
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18497389 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 18497290  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18497289 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 18497190  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18497189 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 18497090  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18497089 attcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18497051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40470211 - 40469876
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470211 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 40470112  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470111 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 40470012  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40470011 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 40469912  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469911 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 33878626 - 33878964
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33878626 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 33878725  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33878726 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 33878825  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33878826 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 33878925  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33878926 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33878964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 3793040 - 3793375
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793040 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 3793139  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3793140 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggacccgatcaagtatatctt 3793239  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3793240 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 3793339  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3793340 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 3793375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 24586870 - 24587208
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24586870 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 24586969  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586970 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 24587069  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24587070 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 24587169  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24587170 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24587208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 9320975 - 9321310
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320975 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 9321074  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9321075 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 9321174  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9321175 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 9321274  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9321275 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9321310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 43081754 - 43082089
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081754 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 43081853  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43081854 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctt 43081953  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43081954 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcatt 43082053  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43082054 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 43082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8662139 - 8661801
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8662139 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 8662040  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8662039 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 8661940  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8661939 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 8661840  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8661839 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 8661801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 11327133 - 11327471
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  11327133 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagttcaccgatggtgaaactcggtatacaatgcttgaga 11327232  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11327233 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 11327332  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11327333 ctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 11327432  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327433 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 11327471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 30155527 - 30155865
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30155527 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 30155626  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30155627 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 30155726  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30155727 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 30155826  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30155827 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 30155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 12135674 - 12136009
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135674 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 12135773  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12135774 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 12135873  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12135874 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattatgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 12135973  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12135974 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12136009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 26483893 - 26484228
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26483893 cttggtcaacaggatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 26483992  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26483993 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 26484092  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26484093 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 26484192  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26484193 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26484228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 24727465 - 24727799
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24727465 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 24727564  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24727565 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 24727664  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24727665 cttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 24727764  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24727765 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttga 24727799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 28652741 - 28653076
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28652741 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 28652840  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652841 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 28652940  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28652941 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcatt 28653040  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28653041 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28653076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9547373 - 9547035
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9547373 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgaaa 9547274  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9547273 agacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 9547174  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9547173 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 9547074  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9547073 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9547035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 34620014 - 34620352
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  34620014 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaa 34620113  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34620114 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 34620213  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34620214 ctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 34620313  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34620314 attcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34620352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 33519876 - 33520213
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33519876 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 33519975  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33519976 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 33520075  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33520076 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 33520175  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  33520176 attctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 33520213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 11552854 - 11553189
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552854 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 11552953  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552954 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 11553053  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11553054 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 11553153  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11553154 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11553189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 23629469 - 23629804
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629469 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 23629568  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629569 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 23629668  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23629669 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 23629768  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23629769 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 23629804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 33296027 - 33296362
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296027 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 33296126  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296127 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 33296226  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33296227 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 33296326  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33296327 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 25203777 - 25204112
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203777 cttggtcaacaagatgagacgggaaagaaagaacatgctatatactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 25203876  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203877 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 25203976  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25203977 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 25204076  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25204077 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25204112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 25267932 - 25268267
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25267932 cttggtcaacaagatgagacgggaaagaaagaacatgctatatactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 25268031  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268032 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 25268131  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25268132 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 25268231  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268232 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25268267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 6877801 - 6878139
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877801 gtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 6877900  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6877901 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 6878000  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6878001 cttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 6878100  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878101 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 6878139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13183453 - 13183119
Alignment:
Q  31 ttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183453 ttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagatcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 13183354  T
Q  131 ttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatcttt 230  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183353 ttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttt 13183254  T
Q  231 gagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattc 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13183253 gagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtcttaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattc 13183154  T
Q  331 ttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13183153 ttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 13183119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 30171965 - 30172303
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30171965 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 30172064  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30172065 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgatcaagtatat 30172164  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30172165 ctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 30172264  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30172265 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 30172303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 41678201 - 41678535
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678201 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 41678300  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41678301 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 41678400  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41678401 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 41678500  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41678501 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 41678535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 2514561 - 2514896
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514561 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 2514660  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514661 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 2514760  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2514761 cgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 2514860  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514861 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2514896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22995778 - 22995443
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995778 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 22995679  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995678 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 22995579  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22995578 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 22995479  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22995478 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22995443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 31434963 - 31435298
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31434963 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 31435062  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435063 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 31435162  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31435163 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 31435262  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31435263 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31823068 - 31822733
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823068 cttgggcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 31822969  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31822968 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 31822869  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31822868 cgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 31822769  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31822768 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31822733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37767652 - 37767317
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37767652 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 37767553  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767552 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 37767453  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37767452 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 37767353  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  37767352 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29887861 - 29887523
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29887861 gtgcttggtcaataagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 29887762  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  29887761 agacttgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtatat 29887662  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29887661 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcactctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 29887562  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  29887561 atccttgccgataatctcgcctaccaacctctcgatgat 29887523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 30032924 - 30033258
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30032924 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 30033023  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30033024 agacttgttgtgctttagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 30033123  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  30033124 ctttgagaaggctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagc 30033223  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  30033224 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttga 30033258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 37758479 - 37758813
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37758479 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 37758578  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37758579 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 37758678  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37758679 ctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 37758778  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37758779 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 37758813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 24973405 - 24973740
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973405 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 24973504  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||| || | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973505 cttgttgtcctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 24973604  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24973605 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 24973704  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24973705 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24973740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 30938134 - 30938469
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938134 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 30938233  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938234 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 30938333  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30938334 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 30938433  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30938434 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 30938469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32592935 - 32592600
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32592935 cttggtcaacaagatgagaccggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagttcaccaattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 32592836  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592835 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 32592736  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32592735 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 32592636  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32592635 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 32592600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28956449 - 28956111
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28956449 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 28956350  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28956349 agacttgttgcgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacat 28956250  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28956249 ctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 28956150  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28956149 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28956111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15655419 - 15655091
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655419 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 15655320  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655319 cttgttgtgctctggcctgggctgctaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 15655220  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15655219 tgagaaagcggctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 15655120  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctct 358  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15655119 cttgccgatcaccttgcttaccaacctct 15655091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13439344 - 13439009
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13439344 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 13439245  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13439244 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 13439145  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13439144 tgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 13439045  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13439044 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13439009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18125077 - 18124742
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18125077 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 18124978  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||  | ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18124977 cttgttgtgccttggcccgggccgcaaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18124878  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18124877 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgctgttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18124778  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18124777 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18124742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18372195 - 18371864
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18372195 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgaaaaga 18372096  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18372095 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatcagatcaagtatatctt 18371996  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18371995 tgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18371896  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18371895 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 18371864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37355304 - 37354969
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37355304 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaaga 37355205  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355204 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 37355105  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37355104 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 37355005  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  37355004 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37354969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37668147 - 37667812
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668147 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 37668048  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668047 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 37667948  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37667947 tgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 37667848  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  37667847 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttaatgat 37667812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 33780988 - 33781319
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780988 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 33781087  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33781088 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 33781187  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| |||||||||||||||||    
T  33781188 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaa----caaaaggcaatcaaaggtagcatt 33781283  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33781284 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Original strand, 22891962 - 22892296
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  22891962 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatatgatgcttgaaaaga 22892061  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892062 cttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcactatttggtgaatcataaaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 22892161  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22892162 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 22892261  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  22892262 cttgttgatcaccttgcctatcaaccgctcgatga 22892296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15755516 - 15755182
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  15755516 gtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaa 15755417  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15755416 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatat 15755317  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  15755316 ctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagc 15755217  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  15755216 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttga 15755182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 33 - 364
Target Start/End: Original strand, 5641290 - 5641621
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5641290 ggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagactt 5641389  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5641390 gttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 5641489  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  5641490 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctc 5641589  T
Q  333 gcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5641590 gccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 5641621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13321491 - 13321156
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13321491 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgttatctattatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 13321392  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321391 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 13321292  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||     
T  13321291 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcgatcaaaggtagcatc 13321192  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13321191 ctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 13321156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24684806 - 24684697
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684806 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 24684707  T
Q  130 cttgttgtgc 139  Q
    ||||||||||    
T  24684706 cttgttgtgc 24684697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3483861 - 3483602
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  3483861 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 3483762  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  3483761 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 3483662  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  3483661 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 3483602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11944086 - 11943821
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  11944086 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatgctcgaga 11943987  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  11943986 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 11943887  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11943886 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 11943821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Original strand, 34469118 - 34469333
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  || || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||    
T  34469118 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctattccatgctcgaga 34469217  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| ||| || | | |||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||    
T  34469218 agacctgttgcgcactagtctgggctgccaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacat 34469317  T
Q  227 ctttgagaaagctgct 242  Q
    |||||||||| |||||    
T  34469318 ctttgagaaacctgct 34469333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5439889 - 5439624
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  5439889 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 5439790  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  5439789 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 5439690  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5439689 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5439624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15784389 - 15784124
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  15784389 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 15784290  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || || | | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  15784289 agacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 15784190  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15784189 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 15784124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 17957593 - 17957858
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  17957593 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 17957692  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||| ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  17957693 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctgatatctaaaatggatccaatcaagtacat 17957792  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | |  |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  17957793 atttgagaagcccgctttgataggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 17957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 31520803 - 31521068
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  31520803 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 31520902  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  31520903 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 31521002  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  31521003 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatcggaatatgatat 31521068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36375530 - 36375361
Alignment:
Q  123 gagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagt 222  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || || |    
T  36375530 gagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaat 36375431  T
Q  223 atatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    | || ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  36375430 acatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 36375361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37000184 - 37000015
Alignment:
Q  123 gagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagt 222  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || || |    
T  37000184 gagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaat 37000085  T
Q  223 atatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    | || ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37000084 acatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 37000015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 351879 - 351609
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| || || || ||  | || ||| | ||||||||||    
T  351879 gtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgaga 351780  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    | |||||||| ||| | || ||||| || || || || ||||| ||  ||||  | || || |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||  |    
T  351779 aaacttgttgcgctttggcatgggccgctaagcgtctccgtcactacatggtttaccacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacct 351680  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 297  Q
     ||||||||  | ||  | || ||||  || || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  351679 ttttgagaagccggcgttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtctgaatatgatattgtgt 351609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20388647 - 20388445
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| || || || ||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  20388647 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 20388548  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    || | ||| | || |||||||| |  || || ||||| ||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  20388547 gtcgcgctttggcatgggctgctatgcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 20388448  T
Q  233 gaa 235  Q
    |||    
T  20388447 gaa 20388445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16748166 - 16747831
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16748166 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 16748067  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748066 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 16747967  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16747966 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 16747867  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747866 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 16747831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 2776740 - 2777078
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  2776740 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgcga 2776839  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2776840 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 2776939  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2776940 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagc 2777039  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2777040 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2777078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 31127393 - 31127731
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31127393 gtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 31127492  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31127493 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 31127592  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31127593 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 31127692  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127693 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31127731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26681758 - 26681420
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26681758 gtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 26681659  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26681658 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 26681559  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26681558 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgcgggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 26681459  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681458 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26681420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26316497 - 26316162
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316497 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 26316398  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26316397 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 26316298  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26316297 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 26316198  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26316197 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26316162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26512348 - 26512010
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26512348 gtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 26512249  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26512248 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatat 26512149  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26512148 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 26512049  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26512048 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26512010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39209791 - 39209453
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39209791 gtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 39209692  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39209691 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatat 39209592  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39209591 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 39209492  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39209491 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39209453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 45390706 - 45391044
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45390706 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 45390805  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45390806 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 45390905  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45390906 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 45391005  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45391006 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 45391044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5143989 - 5143654
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143989 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 5143890  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143889 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 5143790  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5143789 tgagaaagcagccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 5143690  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5143689 cttgcagatcatcttgcctaccaacctctcgatgat 5143654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26666566 - 26666228
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26666566 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 26666467  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26666466 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 26666367  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666366 ctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 26666267  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26666266 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26666228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26271735 - 26271400
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271735 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 26271636  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26271635 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 26271536  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26271535 tgagaaagctgttgttacgggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 26271436  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26271435 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26271400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 4202875 - 4203213
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4202875 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 4202974  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  4202975 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaaatatat 4203074  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  4203075 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagc 4203174  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4203175 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4203213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 2158063 - 2158398
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158063 cttggtcaacaagatgagactagaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 2158162  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158163 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 2158262  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2158263 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 2158362  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2158363 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 2158398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10913518 - 10913183
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913518 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 10913419  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913418 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 10913319  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10913318 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 10913219  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10913218 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 10913183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2106811 - 2106477
Alignment:
Q  31 ttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106811 ttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 2106712  T
Q  131 ttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatcttt 230  Q
    |||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106711 ttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttt 2106612  T
Q  231 gagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattc 330  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2106611 gagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattc 2106512  T
Q  331 ttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106511 ttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2106477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11421428 - 11421093
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421428 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 11421329  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421328 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 11421229  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11421228 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 11421129  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11421128 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 11421093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16515079 - 16514744
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515079 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 16514980  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16514979 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatagatccgataaagtatatctt 16514880  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16514879 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 16514780  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16514779 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16514744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 3448792 - 3449130
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3448792 gtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 3448891  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3448892 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 3448991  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3448992 cttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 3449091  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3449092 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 3449130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4141898 - 4141560
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141898 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 4141799  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4141798 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 4141699  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4141698 ctttgagaaagcggctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 4141599  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4141598 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4141560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 22145684 - 22146019
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22145684 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctcgagaaga 22145783  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22145784 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctt 22145883  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22145884 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcgaaaggcaatcaaaggtagcatt 22145983  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22145984 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22146019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 5131485 - 5131820
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131485 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 5131584  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131585 cttgttgtgctctggcctaggccgctaaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctt 5131684  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5131685 tgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 5131784  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5131785 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5131820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26534522 - 26534187
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534522 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaaattcaccgatggtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 26534423  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534422 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 26534323  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26534322 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 26534223  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26534222 cttgcagatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 26534187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31087271 - 31086936
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087271 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 31087172  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087171 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 31087072  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31087071 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 31086972  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31086971 cttgccgatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 31086936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31561039 - 31560704
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31561039 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 31560940  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560939 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 31560840  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31560839 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 31560740  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31560739 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31560704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Original strand, 11444376 - 11444710
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444376 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 11444475  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444476 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 11444575  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11444576 cgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 11444675  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11444676 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 11444710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 26438746 - 26439077
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26438746 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgctcgagaaga 26438845  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438846 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 26438945  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26438946 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 26439045  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26439046 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 26439077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 358
Target Start/End: Original strand, 16044807 - 16045132
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16044807 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 16044906  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16044907 cttgt---gctctggcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctt 16045003  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16045004 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggtagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 16045103  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctct 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16045104 cttgccgatcatcttgcctaccaacctct 16045132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 10845109 - 10845444
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10845109 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 10845208  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845209 cttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 10845308  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  10845309 cgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcatt 10845408  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845409 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10845444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24589183 - 24588849
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24589183 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaga 24589084  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24589083 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 24588984  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24588983 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 24588884  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24588883 ctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 24588849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 26516278 - 26516616
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26516278 gtgctcggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 26516377  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26516378 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 26516477  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26516478 ctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 26516577  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26516578 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26516616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10842640 - 10842308
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10842640 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagactt 10842541  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10842540 gttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcga 10842441  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10842440 gaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattctt 10842341  T
Q  333 gcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842340 gccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10842308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16446655 - 16446320
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16446655 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 16446556  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446555 cttgttgtgctctggcctgggccgttaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 16446456  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16446455 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 16446356  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  16446355 cttgctgatcaccttgcttatcaacctctcgatgat 16446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 45734799 - 45735131
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734799 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 45734898  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      |||    
T  45734899 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgat------tat 45734992  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45734993 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 45735092  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45735093 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 45735131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 65 - 365
Target Start/End: Original strand, 5161907 - 5162207
Alignment:
Q  65 tgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctg 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  5161907 tgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctg 5162006  T
Q  165 cgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  5162007 cgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgct 5162106  T
Q  265 ggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5162107 ggcaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatga 5162206  T
Q  365 t 365  Q
    |    
T  5162207 t 5162207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 29090008 - 29090267
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  29090008 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 29090107  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  29090108 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 29090207  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  29090208 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 29090267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 2557027 - 2557286
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  2557027 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 2557126  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  2557127 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 2557226  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  2557227 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 2557286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16127464 - 16127225
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  16127464 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 16127365  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  16127364 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 16127265  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatg 272  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  16127264 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 16127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 15193575 - 15193834
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  |  ||||||| ||||    
T  15193575 ggtcaacaagatgaaaccgggaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtatttgagaaaactt 15193674  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  15193675 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 15193774  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  15193775 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 15193834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 798175 - 797908
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||  || || ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||| | ||| | ||||    
T  798175 gtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttaccgattgtgaatctcgctattccatggtcgaga 798076  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || | | |||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  798075 agacctgttgcgcactagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaggatggatccgatcaagtacat 797976  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 294  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||  || || || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  797975 ctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 797908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16393086 - 16392821
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  16393086 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 16392987  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  16392986 agacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 16392887  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16392886 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 16392821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30369598 - 30369333
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  30369598 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 30369499  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  30369498 agacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 30369399  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  30369398 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 30369333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 9469806 - 9470071
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  9469806 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 9469905  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||| || || | | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  9469906 agacgtgttgtgctctagcctgggctgccagacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 9470005  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  9470006 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 9470071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16287031 - 16286764
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  || || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||    
T  16287031 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctatcccatgctcgaga 16286932  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||| || | | |||||| || | ||||| ||| |  ||||||||||| |||||  |    
T  16286931 aaacctgttgtgcactagcctgggctgcaaaacgcctccgccactatatgattagtcatactacatggttgatatctaagatggatccgatcaagtacgt 16286832  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 294  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||  || || || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  16286831 ctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 16286764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 297
Target Start/End: Original strand, 25726983 - 25727252
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||    
T  25726983 gtgcttggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgaga 25727082  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    | |||||||| ||| | || |||||||| || |  || ||||| ||  |||| ||||| || |||| |||||  |||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  25727083 aaacttgttgcgct-ttgcatgggctgctaagcatctccgtcactacatggttaatcacactacttggttgatgtccaaaatggacccgatcaagtacat 25727181  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 297  Q
     ||||||||  | ||| | || ||||  || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  25727182 ttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgctggcagatgttattgtctgagtatgatattgtgt 25727252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1893221 - 1893019
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  | || |||||  |||| |||||||| || || || ||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  1893221 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacaccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 1893122  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  1893121 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 1893022  T
Q  233 gaa 235  Q
    |||    
T  1893021 gaa 1893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Original strand, 16237975 - 16238093
Alignment:
Q  35 tcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgt 134  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| | || |||||||| ||||||    
T  16237975 tcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctcctatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctatacttgagaaaacttgt 16238074  T
Q  135 tgtgctctagcttgggctg 153  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  16238075 tgtgctttagcctgggctg 16238093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13933303 - 13932965
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13933303 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 13933204  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13933203 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcggcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 13933104  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13933103 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 13933004  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13933003 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13932965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22924904 - 22924566
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22924904 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 22924805  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22924804 agacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 22924705  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22924704 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 22924605  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22924604 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22924566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 27120012 - 27120350
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27120012 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 27120111  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27120112 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 27120211  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27120212 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 27120311  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27120312 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27120350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 3785981 - 3786318
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3785981 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 3786080  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3786081 agacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 3786180  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3786181 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 3786280  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3786281 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 3786318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 27779725 - 27780060
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779725 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27779824  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779825 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27779924  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27779925 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27780024  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27780025 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27780060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 27819482 - 27819817
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819482 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27819581  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819582 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27819681  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27819682 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27819781  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27819782 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27819817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 31879774 - 31880112
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31879774 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 31879873  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31879874 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 31879973  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31879974 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 31880073  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31880074 attcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 31880112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 40236999 - 40237334
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40236999 cttggtcaacaagatgaaacgggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 40237098  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237099 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 40237198  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40237199 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 40237298  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237299 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40237334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 257409 - 257071
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  257409 gtgcttggtcagcaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 257310  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  257309 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 257210  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  257209 ctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 257110  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257109 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 257071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31890247 - 31889909
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31890247 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 31890148  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31890147 agacttgttgtgttctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 31890048  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31890047 ctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 31889948  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31889947 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 31889909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 34158332 - 34158670
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34158332 gtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 34158431  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34158432 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 34158531  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34158532 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 34158631  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34158632 attctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34158670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9346739 - 9346404
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346739 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 9346640  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346639 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 9346540  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9346539 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 9346440  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9346439 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9346404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11631937 - 11631602
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631937 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 11631838  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11631837 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 11631738  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11631737 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 11631638  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11631637 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11631602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19413257 - 19412919
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19413257 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 19413158  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19413157 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 19413058  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19413057 ctttgagaaagctgccgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 19412958  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19412957 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 19412919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 32053291 - 32053629
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32053291 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 32053390  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32053391 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgattaagtatat 32053490  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32053491 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcagaaggcaatcaaaggtagc 32053590  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32053591 attcttgccgatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 32053629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37682651 - 37682313
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37682651 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 37682552  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37682551 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 37682452  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37682451 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 37682352  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37682351 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37697916 - 37697578
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37697916 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 37697817  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37697816 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 37697717  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37697716 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 37697617  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37697616 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37697578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21673928 - 21673597
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673928 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 21673829  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21673828 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctt 21673729  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21673728 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 21673629  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21673628 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 21673597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 27807191 - 27807529
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27807191 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 27807290  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27807291 agacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 27807390  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27807391 ctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 27807490  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807491 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27807529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 37928857 - 37929195
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37928857 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 37928956  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37928957 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 37929056  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37929057 ctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 37929156  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37929157 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37929195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 34294645 - 34294980
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294645 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactacttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 34294744  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294745 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 34294844  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34294845 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 34294944  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34294945 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34294980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 34865172 - 34865510
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34865172 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 34865271  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34865272 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 34865371  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34865372 ctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 34865471  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34865472 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 34865510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39048575 - 39048237
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39048575 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactacctaagtaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 39048476  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39048475 agacttgttgtgctctagcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 39048376  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39048375 ctttgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 39048276  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39048275 attcttgcagatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39048237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16826094 - 16825757
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16826094 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 16825995  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16825994 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 16825895  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16825894 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 16825795  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16825794 attctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16825757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 16895386 - 16895723
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16895386 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 16895485  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16895486 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 16895585  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16895586 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 16895685  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16895686 attctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16895723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 12590299 - 12590634
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590299 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 12590398  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590399 cttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 12590498  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12590499 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 12590598  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12590599 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12590634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 20841404 - 20841739
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841404 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 20841503  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841504 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 20841603  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20841604 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 20841703  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20841704 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 20841739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 12659027 - 12659362
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659027 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 12659126  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659127 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 12659226  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12659227 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 12659326  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12659327 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21699924 - 21699589
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21699924 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagtaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 21699825  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699824 cttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 21699725  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21699724 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcatgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 21699625  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699624 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 39893560 - 39893891
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893560 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 39893659  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39893660 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctt 39893759  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39893760 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcatt 39893859  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39893860 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 39893891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12713357 - 12713019
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12713357 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 12713258  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12713257 agacttgttgtgctttggcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 12713158  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12713157 cttcgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 12713058  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12713057 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 12713019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 16164968 - 16165306
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16164968 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctcgaga 16165067  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16165068 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccgataaagtatat 16165167  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16165168 ctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 16165267  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16165268 attcttgcagatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 16165306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27431194 - 27430859
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431194 cttggtcaacaaggcgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27431095  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431094 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27430995  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27430994 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtcggaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27430895  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27430894 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27430859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23125321 - 23124987
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125321 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 23125222  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125221 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 23125122  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23125121 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatacgatattgtg-ttcaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 23125023  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23125022 cttgccgatcatcttgcgtaccaacctcttgatgat 23124987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 37381168 - 37381499
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37381168 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacgatgcttgagaaga 37381267  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381268 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 37381367  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37381368 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacggtggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 37381467  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37381468 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 37381499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37948618 - 37948280
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37948618 gtgcttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgctcgaga 37948519  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37948518 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 37948419  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37948418 ctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 37948319  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  37948318 attcttgccgatcaccttgcttgtcaacctcttgatgat 37948280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19453176 - 19452841
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19453176 cttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 19453077  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453076 cttgttgtgctccggcctgggccgccaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatataacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 19452977  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  | |||||||||||||||    
T  19452976 cgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcatt 19452877  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452876 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 74 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34271629 - 34271338
Alignment:
Q  74 ctatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34271629 ctatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattat 34271530  T
Q  174 ttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgc 273  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34271529 ttggtgaaccatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgc 34271430  T
Q  274 ttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34271429 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34271338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 33 - 364
Target Start/End: Original strand, 27395056 - 27395387
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  27395056 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagactt 27395155  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27395156 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttgggtgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttga 27395255  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27395256 gaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattttgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctt 27395355  T
Q  333 gcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27395356 gctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 27395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 81 - 365
Target Start/End: Original strand, 28885821 - 28886105
Alignment:
Q  81 agcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtga 180  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28885821 agcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaaacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtga 28885920  T
Q  181 atcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtc 280  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  28885921 atcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatatagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatgcttttgtc 28886020  T
Q  281 tgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28886021 tgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacctcttgatgat 28886105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Original strand, 27827951 - 27828129
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827951 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27828050  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27828051 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27828129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 28885698 - 28885808
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885698 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 28885797  T
Q  130 cttgttgtgct 140  Q
    |||||||||||    
T  28885798 cttgttgtgct 28885808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 34701570 - 34701829
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  34701570 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 34701669  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  34701670 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 34701769  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  34701770 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 34701829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 42394029 - 42394288
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  42394029 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 42394128  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  42394129 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 42394228  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  42394229 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 42394288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21760371 - 21760104
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||  || || ||||| || || ||| ||||||||||||| || || || ||| |||| ||| | ||||| ||||    
T  21760371 gtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgattgtgaatctcgctattccatgctcgaga 21760272  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || | | |||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||    
T  21760271 agacctgttgcgcactagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacat 21760172  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 294  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||  || || || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  21760171 ctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 21760104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 292
Target Start/End: Original strand, 22949971 - 22950146
Alignment:
Q  117 atgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccga 216  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| |    
T  22949971 atgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaa 22950070  T
Q  217 taaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    | ||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  22950071 tcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 22950146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34534193 - 34533991
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||  |||| |||||||| ||||| || ||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  34534193 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 34534094  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  34534093 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 34533994  T
Q  233 gaa 235  Q
    |||    
T  34533993 gaa 34533991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 12384148 - 12384413
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  12384148 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 12384247  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || || | | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  12384248 agacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 12384347  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  12384348 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 12384413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26724026 - 26723824
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||  |||| |||||||| || || || ||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  26724026 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 26723927  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  26723926 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 26723827  T
Q  233 gaa 235  Q
    |||    
T  26723826 gaa 26723824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18797378 - 18797043
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18797378 cttggacaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctcgagaaga 18797279  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797278 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18797179  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797178 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18797079  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18797078 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18797043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40102404 - 40102066
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40102404 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 40102305  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40102304 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 40102205  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40102204 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 40102105  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102104 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40102066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 5009380 - 5009715
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009380 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 5009479  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5009480 cttgttgtgctctggcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 5009579  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5009580 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 5009679  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5009680 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 54836896 - 54837231
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836896 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 54836995  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836996 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 54837095  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54837096 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 54837195  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54837196 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 54837231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 6573363 - 6573698
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573363 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 6573462  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573463 cttgttgtgctttagtttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 6573562  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6573563 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 6573662  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6573663 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 6573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27160084 - 27159746
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27160084 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 27159985  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27159984 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 27159885  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27159884 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 27159785  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27159784 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27159746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 33 - 365
Target Start/End: Original strand, 39854145 - 39854477
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854145 ggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 39854244  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39854245 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcga 39854344  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39854345 gaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattctt 39854444  T
Q  333 gcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39854445 gcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 39854477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 21973203 - 21973540
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21973203 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 21973302  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21973303 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 21973402  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21973403 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 21973502  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21973503 attctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 21973540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31123279 - 31122942
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31123279 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 31123180  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31123179 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 31123080  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31123079 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 31122980  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31122979 attctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 31122942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 33 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36341278 - 36340950
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341278 ggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacacgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 36341179  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341178 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttga 36341079  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36341078 gaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctt 36340979  T
Q  333 gcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36340978 gccgatcaccttgcttaccaacctcttga 36340950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 24116167 - 24116502
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116167 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 24116266  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116267 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 24116366  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24116367 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 24116466  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116467 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 24116502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34185724 - 34185389
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185724 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 34185625  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185624 cttgttgtgctctggcctgggccgataaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 34185525  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34185524 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 34185425  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34185424 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34185389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 1903759 - 1904094
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  1903759 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatatgatgcttgaaaaga 1903858  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903859 cttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 1903958  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1903959 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 1904058  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1904059 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttaatgat 1904094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 14102048 - 14102379
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14102048 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 14102147  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14102148 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 14102247  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14102248 tgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 14102347  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14102348 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 14102379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 15231377 - 15231712
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15231377 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcgttatacgatgcttgaaaaga 15231476  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231477 cttgttgtgctctggcctgggccaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 15231576  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15231577 tgagaaagctgctgttactggaaaggttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 15231676  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231677 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 15231712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 17016551 - 17016886
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016551 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 17016650  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016651 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 17016750  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17016751 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 17016850  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17016851 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17016886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20335185 - 20334850
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335185 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 20335086  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335085 cttgttgtgctttggcctgggcctccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 20334986  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20334985 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 20334886  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  20334885 cttgccgatcaccctgcttaccaacctcttgatgat 20334850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Original strand, 30757265 - 30757599
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757265 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 30757364  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757365 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 30757464  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30757465 cgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 30757564  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30757565 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 30757599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24589125 - 24588790
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589125 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgataactactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 24589026  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589025 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 24588926  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24588925 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 24588826  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24588825 cttgctgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 24588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18313945 - 18313607
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18313945 gtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 18313846  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18313845 agacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 18313746  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  18313745 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagc 18313646  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18313645 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18313607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 14668521 - 14668856
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668521 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 14668620  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14668621 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgtctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccaagatggatccgataaagtatatctt 14668720  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14668721 tgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctaaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 14668820  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14668821 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 14668856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33670564 - 33670229
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670564 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgttatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 33670465  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670464 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 33670365  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33670364 cgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 33670265  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  33670264 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 33670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14760070 - 14759766
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760070 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 14759971  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759970 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 14759871  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14759870 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 14759771  T
Q  330 cttgc 334  Q
    |||||    
T  14759770 cttgc 14759766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15281701 - 15281366
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15281701 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 15281602  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||  |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281601 cttgttgctctctggcctgggccgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 15281502  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  15281501 cgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccaaatatgacattatgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcatt 15281402  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15281401 cttgccgatcatcttgcctaccaaccgcttgatgat 15281366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 209 - 365
Target Start/End: Original strand, 5698219 - 5698375
Alignment:
Q  209 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaa 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5698219 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5698318  T
Q  309 aagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5698319 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5698375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15388139 - 15387948
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  15388139 ggtcaacaagacaagactggaaagaaagagcatgctatctactatttgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccgatatacgatgcttgagaagactt 15388040  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||    
T  15388039 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtat 15387948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15384924 - 15384778
Alignment:
Q  218 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15384924 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagtcaatc 15384825  T
Q  318 aaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  15384824 aaaggtagcattcttgcatatcacgttgcctatcagcctcttgatga 15384778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14725560 - 14725301
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  14725560 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 14725461  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  14725460 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 14725361  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14725360 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgaatatgatat 14725301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 19767847 - 19768106
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  19767847 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 19767946  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  19767947 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtttccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 19768046  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  19768047 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 19768106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Original strand, 12515746 - 12515942
Alignment:
Q  39 caagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtg 138  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||  | ||  ||||||||   || |||||||||||||| ||||    
T  12515746 caagaagaaactggaaggaaagaacatgttatttactatttgagcaagaagtttacagatagtgagtctcggtatttcatacttgagaagacttgatgtg 12515845  T
Q  139 ctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 235  Q
    || |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||| || |||| ||||| ||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  12515846 ctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 12515942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1881860 - 1881658
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||  |||| |||||||| ||||| || ||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  1881860 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 1881761  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  1881760 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 1881661  T
Q  233 gaa 235  Q
    |||    
T  1881660 gaa 1881658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 294
Target Start/End: Original strand, 55784686 - 55784901
Alignment:
Q  79 tgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggt 178  Q
    ||||||||||||| || || || ||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  55784686 tgagcaagaagtttactgattgtgaatctcgctattccatgctcgagaagacctgttgcgcactagcctgggctgccaaacgcctccgtcactatatgat 55784785  T
Q  179 gaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttg 278  Q
     | |||||| |||| ||||| ||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||| | || ||||  || || || ||||||||| | ||     
T  55784786 tagtcatactacttggttgatatctaagatggacccgatcaagtacatctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttatta 55784885  T
Q  279 tctgaatatgatattg 294  Q
    || |||||||||||||    
T  55784886 tccgaatatgatattg 55784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22146336 - 22146066
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| || || || ||  | || ||| | ||||||||||    
T  22146336 gtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgaga 22146237  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    | |||||||| ||| | || ||||| || || || || ||||| ||  ||||  | || || |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||  |    
T  22146236 aaacttgttgcgctttggcatgggccgctaagcgtctccgtcactacatggtttaccacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacct 22146137  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 297  Q
     ||||||||  | ||  | || ||||  || || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22146136 ttttgagaagccggcgttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtctgaatatgatattgtgt 22146066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 44564472 - 44564810
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44564472 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 44564571  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44564572 agacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 44564671  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44564672 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 44564771  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44564772 attcttgccgatcatctggcttaccaacctcttgatgat 44564810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 15771062 - 15771400
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  15771062 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagtttaccgattgtgaaactcggtatacaatgtttgaga 15771161  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15771162 ggacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 15771261  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15771262 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 15771361  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15771362 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15771400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 31358016 - 31358354
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31358016 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 31358115  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31358116 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 31358215  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31358216 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 31358315  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31358316 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 31358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 18712975 - 18713310
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712975 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 18713074  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713075 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18713174  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18713175 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18713274  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18713275 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 18713310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 9358116 - 9358451
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358116 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 9358215  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358216 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 9358315  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9358316 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaagactcaaaaggcaatcaagggtagcatt 9358415  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9358416 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9358451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19205087 - 19204752
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19205087 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaga 19204988  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19204987 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 19204888  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19204887 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 19204788  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19204787 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 19204752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 19691589 - 19691924
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691589 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 19691688  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691689 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 19691788  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19691789 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 19691888  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19691889 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 19691924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28358677 - 28358342
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358677 cttggtcaacaagatgaaaccgggaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 28358578  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28358577 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 28358478  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28358477 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtatt 28358378  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28358377 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28358342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 14561115 - 14561450
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561115 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 14561214  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561215 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 14561314  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14561315 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 14561414  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14561415 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 14561450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Original strand, 19677938 - 19678272
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19677938 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 19678037  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678038 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 19678137  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19678138 cgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 19678237  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19678238 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 19678272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2133985 - 2133650
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133985 cttggtcaacaagatgagactggaaggaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcatcgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 2133886  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133885 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 2133786  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2133785 tgagaaagctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 2133686  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2133685 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 2133650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 18794195 - 18794530
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794195 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 18794294  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794295 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttgatgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18794394  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18794395 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18794494  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18794495 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18794530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27605630 - 27605295
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605630 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 27605531  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605530 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 27605431  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27605430 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 27605331  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27605330 cttgtcgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27605295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 33262225 - 33262560
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262225 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 33262324  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262325 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 33262424  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||     
T  33262425 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatc 33262524  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  33262525 ctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 33262560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12089448 - 12089113
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12089448 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaaga 12089349  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089348 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 12089249  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12089248 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 12089149  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12089148 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 12089113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 29832817 - 29833152
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29832817 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 29832916  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832917 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 29833016  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||     
T  29833017 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatc 29833116  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  29833117 ctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 29833152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31486596 - 31486265
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31486596 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaga 31486497  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31486496 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 31486397  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31486396 tgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 31486297  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31486296 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 31486265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21344899 - 21344561
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21344899 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 21344800  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |  | | | ||||||||    
T  21344799 agacttgttgtgctttggcctaggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaaccgcccagctcaagtatat 21344700  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21344699 ctctgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctgacagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 21344600  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21344599 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 21344561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 65 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19658031 - 19657731
Alignment:
Q  65 tgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctg 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  19658031 tgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctg 19657932  T
Q  165 cgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgct 264  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  19657931 cgccattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagttgctgttactgggaagattgcacgct 19657832  T
Q  265 ggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657831 ggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatga 19657732  T
Q  365 t 365  Q
    |    
T  19657731 t 19657731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 64 - 365
Target Start/End: Original strand, 33245894 - 33246195
Alignment:
Q  64 atgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcct 163  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||    
T  33245894 atgctatctactatctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcct 33245993  T
Q  164 gcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  33245994 gcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgc 33246093  T
Q  264 tggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatg 363  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33246094 tgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagcttaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatg 33246193  T
Q  364 at 365  Q
    ||    
T  33246194 at 33246195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22077633 - 22077316
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||    
T  22077633 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaactttaccgactgcgaagcccaatatacgatgcttgagaagactt 22077534  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||||||||||||||      ||        || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  22077533 gttgtgctctagcttgggc------ac--------cactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttga 22077448  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    |||||||| |||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22077447 gaaagctgatgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctt 22077348  T
Q  333 gcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22077347 gctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22077316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 22412432 - 22412691
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  22412432 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 22412531  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  22412532 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 22412631  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  22412632 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 22412691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 19844661 - 19844920
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  19844661 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcaagctatctactatttgagtaagaagttcaccgattgtgagtcccgatattcggtacttgagaaaactt 19844760  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  19844761 gttgtgatttagcctgggctgccaaacgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttga 19844860  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||| ||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  19844861 gaagccagctttaactagaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 19844920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 14212533 - 14212792
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  14212533 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 14212632  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  14212633 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 14212732  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  14212733 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 14212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 16768817 - 16769019
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||  |||| |||||||| || || || ||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  16768817 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 16768916  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  16768917 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 16769016  T
Q  233 gaa 235  Q
    |||    
T  16769017 gaa 16769019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 32294078 - 32294416
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32294078 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 32294177  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32294178 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 32294277  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32294278 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 32294377  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32294378 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 32294416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28112761 - 28112426
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112761 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 28112662  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28112661 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 28112562  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28112561 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 28112462  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28112461 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28112426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 5017164 - 5017502
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5017164 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 5017263  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5017264 agacttgttgtgctctagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 5017363  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5017364 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 5017463  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5017464 attcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5017502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 5714523 - 5714861
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5714523 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 5714622  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5714623 agacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 5714722  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5714723 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 5714822  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5714823 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5714861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 5725433 - 5725771
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5725433 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 5725532  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5725533 agacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 5725632  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5725633 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 5725732  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5725733 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5725771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5766935 - 5766597
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5766935 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 5766836  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5766835 agacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 5766736  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5766735 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 5766636  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5766635 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5766597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5606121 - 5605786
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606121 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 5606022  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5606021 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 5605922  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5605921 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 5605822  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5605821 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 21678156 - 21678491
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678156 cttggtcaacaagatgaaacgggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 21678255  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678256 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggatgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 21678355  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21678356 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 21678455  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21678456 cttgccgatcatcttgcctgccaacctcttgatgat 21678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 8215185 - 8215519
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8215185 gtgcttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctacctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 8215284  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8215285 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 8215384  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8215385 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 8215484  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8215485 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 8215519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 51785473 - 51785810
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  51785473 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 51785572  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51785573 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 51785672  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51785673 cttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 51785772  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51785773 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 51785810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22384385 - 22384050
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384385 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 22384286  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384285 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 22384186  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22384185 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 22384086  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22384085 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22384050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5593167 - 5592829
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5593167 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 5593068  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5593067 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatat 5592968  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5592967 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaacgcaaaaggcaatcaaaggtagc 5592868  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5592867 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5592829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31033046 - 31032708
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31033046 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 31032947  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31032946 agacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 31032847  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31032846 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 31032747  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31032746 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctctagatgat 31032708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 4627238 - 4627573
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627238 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 4627337  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4627338 cttgttgtgctctagcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctt 4627437  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4627438 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 4627537  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4627538 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4627573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 6205356 - 6205691
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205356 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 6205455  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205456 cttgttgtgctctggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 6205555  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6205556 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 6205655  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6205656 ctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 6205691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 7076659 - 7076994
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076659 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 7076758  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7076759 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgacatccagaatggatccgataaaatatatctt 7076858  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  7076859 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtatt 7076958  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7076959 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7076994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Original strand, 18228649 - 18228983
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228649 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 18228748  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18228749 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 18228848  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18228849 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18228948  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18228949 ctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 18228983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20573653 - 20573315
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20573653 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 20573554  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20573553 agacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 20573454  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20573453 ctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 20573354  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20573353 attcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 20573315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29661780 - 29661442
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29661780 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 29661681  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29661680 agacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 29661581  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29661580 ctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 29661481  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29661480 attcttgcagatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 29661442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 47026903 - 47027241
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47026903 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 47027002  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47027003 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 47027102  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47027103 ctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 47027202  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47027203 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 47027241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8286277 - 8285942
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286277 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 8286178  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286177 cttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 8286078  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8286077 tgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 8285978  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8285977 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 8285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11107166 - 11106831
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107166 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 11107067  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107066 cttgttgtgctttggcctgggcctctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 11106967  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11106966 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 11106867  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11106866 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 11106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 19697943 - 19698278
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19697943 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 19698042  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698043 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 19698142  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19698143 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcccgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 19698242  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698243 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19698278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 28024735 - 28025070
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28024735 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagttcaccaattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 28024834  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024835 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 28024934  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28024935 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 28025034  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28025035 cttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28025070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 4687108 - 4687443
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687108 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 4687207  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687208 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4687307  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4687308 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagacagtcaaaggtagcatt 4687407  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4687408 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4687443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 4725084 - 4725419
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725084 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 4725183  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725184 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4725283  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4725284 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggaaatcaaaggtagcatt 4725383  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4725384 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4725419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4793442 - 4793107
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793442 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 4793343  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793342 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4793243  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4793242 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 4793143  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4793142 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15737901 - 15737566
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737901 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 15737802  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15737801 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctt 15737702  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15737701 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaatgtagcatt 15737602  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15737601 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 18246194 - 18246529
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246194 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 18246293  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246294 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18246393  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18246394 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 18246493  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18246494 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18246529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18304461 - 18304126
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  18304461 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagg 18304362  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304361 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18304262  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18304261 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18304162  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18304161 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 18304126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 20069493 - 20069828
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20069493 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatgcaatgcttgagaaga 20069592  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069593 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 20069692  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20069693 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctagcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 20069792  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20069793 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 20069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 24331616 - 24331951
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331616 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 24331715  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331716 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 24331815  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24331816 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 24331915  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24331916 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 24331951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 35884219 - 35884554
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35884219 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaga 35884318  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884319 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 35884418  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35884419 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaattaaaggtagcatt 35884518  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35884519 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 35884554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 8299421 - 8299759
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8299421 gtgcttggtcaacaagatgagattggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 8299520  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8299521 agacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatat 8299620  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  8299621 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtaga 8299720  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8299721 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 8299759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15889512 - 15889177
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889512 cttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatataagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 15889413  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15889412 cttgttgtgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccggtaaagtatatctt 15889313  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15889312 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 15889213  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15889212 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15889177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 18334083 - 18334418
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334083 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 18334182  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334183 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18334282  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18334283 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18334382  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18334383 ctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18334418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29145563 - 29145228
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145563 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 29145464  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145463 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 29145364  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29145363 tgagaaagcggctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 29145264  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29145263 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29145228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 32442604 - 32442935
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442604 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 32442703  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442704 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 32442803  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32442804 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 32442903  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32442904 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 32442935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 28342627 - 28342965
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342627 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 28342726  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28342727 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 28342826  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  28342827 ctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagc 28342926  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28342927 attcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 28342965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 48469377 - 48469715
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469377 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 48469476  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48469477 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaaccatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatat 48469576  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48469577 ctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 48469676  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48469677 attcttgccaatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 48469715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 4420368 - 4420703
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420368 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctattatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 4420467  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420468 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4420567  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4420568 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 4420667  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4420668 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4420703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17981756 - 17981421
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17981756 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaga 17981657  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17981656 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 17981557  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17981556 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 17981457  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17981456 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 17981421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 18054715 - 18055050
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054715 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatttaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 18054814  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054815 cttgttgtgctctggtctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18054914  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18054915 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18055014  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18055015 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18055050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18273859 - 18273524
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  18273859 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaggaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagg 18273760  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273759 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18273660  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18273659 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18273560  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  18273559 cttgccgatcaccttgcttaccaatctcttgatgat 18273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18289160 - 18288825
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  18289160 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaggaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagg 18289061  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289060 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 18288961  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18288960 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 18288861  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  18288860 cttgccgatcaccttgcttaccaatctcttgatgat 18288825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31961262 - 31960927
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961262 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 31961163  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961162 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 31961063  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  31961062 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaagacagcatt 31960963  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31960962 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31960927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 10399597 - 10399932
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399597 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 10399696  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399697 cttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 10399796  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10399797 tgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 10399896  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  10399897 cttgtcgatcaccttgcttaccaacctcttaatgat 10399932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 5470441 - 5470776
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5470441 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctagagaaga 5470540  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470541 cttgttgtgctctagcgtgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 5470640  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5470641 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 5470740  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5470741 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5470776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 8000013 - 8000348
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8000013 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 8000112  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8000113 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctt 8000212  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8000213 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 8000312  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  8000313 cttgccgatcacctggcttaccagcctctcgatgat 8000348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 10646526 - 10646861
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646526 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 10646625  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10646626 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctt 10646725  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10646726 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 10646825  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  10646826 cttgccgatcacctggcttaccagcctctcgatgat 10646861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4343483 - 4343148
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343483 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 4343384  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343383 cttgttgtgctttagcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 4343284  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4343283 tgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 4343184  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4343183 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4343148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22867655 - 22867320
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22867655 cttggtcaacaagataaaaccggaaagaaagagcatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 22867556  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867555 cttgttgtgcactagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 22867456  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22867455 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 22867356  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22867355 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 22867320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22882714 - 22882379
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22882714 cttggtcaacaagataaaaccggaaagaaagagcatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaaga 22882615  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882614 cttgttgtgcactagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 22882515  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22882514 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 22882415  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22882414 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 22882379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 33 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6539546 - 6539214
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539546 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 6539447  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539446 gttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttga 6539347  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6539346 gaaagcggccgttacggggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattctt 6539247  T
Q  333 gcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6539246 gccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 6539214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16621297 - 16620966
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16621297 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcactgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 16621198  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16621197 cttgttgtgctctggtctgggccgccaaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcagataaagtatatctt 16621098  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  16621097 cgagaaacctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcatt 16620998  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16620997 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttga 16620966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 65 - 365
Target Start/End: Original strand, 5653573 - 5653873
Alignment:
Q  65 tgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctg 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||    
T  5653573 tgctatctactatctaagcaagaagctcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttatgctctggcctgggccgctaaacgcttg 5653672  T
Q  165 cgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  5653673 cgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgct 5653772  T
Q  265 ggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5653773 gacaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcctgcctaccaacctcttgatga 5653872  T
Q  365 t 365  Q
    |    
T  5653873 t 5653873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17992741 - 17992526
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17992741 gtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 17992642  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17992641 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 17992542  T
Q  227 ctttgagaaagctgct 242  Q
    ||||||||||||||||    
T  17992541 ctttgagaaagctgct 17992526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 238 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17973460 - 17973333
Alignment:
Q  238 ctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcaga 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17973460 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 17973361  T
Q  338 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17973360 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17973333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11925162 - 11924903
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  11925162 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 11925063  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  11925062 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtacatatttga 11924963  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  11924962 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 11924903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 6571810 - 6572069
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| |  | |||||||| ||||    
T  6571810 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtctcgatattctgtacttgagaaaactt 6571909  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| | || ||||| ||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  6571910 gttgtgctttggcctgggccgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttga 6572009  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  6572010 gaagccagctttaactggaaggatcgctcgctggcaaatgttattgtccgagtatgatat 6572069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 22959909 - 22960168
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  22959909 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 22960008  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  22960009 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 22960108  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  22960109 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 22960168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7088831 - 7088592
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  7088831 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 7088732  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  7088731 gttgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 7088632  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatg 272  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  7088631 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 7088592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 16431861 - 16432120
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  16431861 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgttatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatactctgtacttgagaaaactt 16431960  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  16431961 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 16432060  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  16432061 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 16432120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Original strand, 15704929 - 15705193
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  15704929 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagaacatgctatctactatttgagtaagaaattcactgattgtgagtcccgatactctgtacttgagaaaactt 15705028  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  ||||| || || ||||| || |||||    
T  15705029 gttgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggacccaatcaagtacatatttga 15705128  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 297  Q
    |||  | ||| | || |||| ||| || |||||||||||| | || || || |||||||| ||||    
T  15705129 gaagccagctttaaccggaaggattgctcgctggcagatgttattatccgagtatgatatcgtgt 15705193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Original strand, 15918976 - 15919175
Alignment:
Q  36 caacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgtt 135  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| || || || || || ||| | ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  15918976 caacaagatgaaattggaaggaaggagcacgccatttattatttaagcaaaaagtttactgactgtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgtt 15919075  T
Q  136 gtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 235  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  15919076 gtgctctggcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaa 15919175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 20443567 - 20443834
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||  || || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||    
T  20443567 gtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctattccatgctcgaga 20443666  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| || | | |||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||    
T  20443667 agacttgttgcgcactagcctgggctgctaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacat 20443766  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 294  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||  || || || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  20443767 ctttgagaaacctgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 20443834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15592667 - 15592513
Alignment:
Q  81 agcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtga 180  Q
    ||||||||||| || ||| | ||| |||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || | |    
T  15592667 agcaagaagtttactgacggtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgttgtgctctagcctgggttgccaaacgcctccgtcattatatgatta 15592568  T
Q  181 atcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 235  Q
     |||||| |||| | ||| ||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  15592567 gtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaa 15592513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5950612 - 5950347
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  5950612 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 5950513  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  5950512 agacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 5950413  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5950412 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5950347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 46380784 - 46381049
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  46380784 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 46380883  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || || || |||| | ||  ||| | ||||||||| || || || ||    
T  46380884 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacat 46380983  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||| | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  46380984 atttgagaaacccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 46381049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6963243 - 6962973
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| || || || ||  | || ||| | ||||||||||    
T  6963243 gtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgaga 6963144  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    | |||||||| ||| | || ||||| || || || || ||||| ||  ||||  | || || |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||  |    
T  6963143 aaacttgttgcgctttggcatgggccgctaagcgtctccgtcactacatggtttaccacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacct 6963044  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 297  Q
     ||||||||  | ||  | || ||||  || || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6963043 ttttgagaagccggcgttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtctgaatatgatattgtgt 6962973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37260465 - 37260373
Alignment:
Q  81 agcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattat 173  Q
    ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37260465 agcaagaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattat 37260373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 9511 - 9849
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9511 gtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 9610  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9611 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 9710  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9711 ctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 9810  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9811 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 28153227 - 28153565
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28153227 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 28153326  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28153327 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 28153426  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28153427 ctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 28153526  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28153527 attcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 28153565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 10948568 - 10948905
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10948568 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 10948667  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10948668 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 10948767  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10948768 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 10948867  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10948868 attcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatga 10948905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 10966159 - 10966494
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966159 cttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 10966258  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10966259 cttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctt 10966358  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10966359 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 10966458  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10966459 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 10966494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 28588479 - 28588814
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588479 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 28588578  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588579 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 28588678  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28588679 tgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 28588778  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588779 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 28588814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 3644629 - 3644965
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaa-ctcggtatacaatgcttgagaag 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3644629 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaaactcggtatacaatgcttgagaag 3644728  T
Q  129 acttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644729 acttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatct 3644828  T
Q  229 ttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcat 328  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3644829 ttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 3644928  T
Q  329 tcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3644929 tcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 3644965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16204798 - 16204463
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204798 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 16204699  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204698 cttgttgtgctctggcctaggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 16204599  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16204598 tgagaaagctgctgttactggaaagattgcccgctggaagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 16204499  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204498 cttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 16204463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 51641709 - 51642043
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  51641709 gtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 51641808  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  51641809 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaaccatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacat 51641908  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51641909 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatactgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 51642008  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttga 361  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51642009 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 51642043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41790074 - 41789739
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41790074 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 41789975  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41789974 cttgttgtgctctagcttgggctgctaagcgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 41789875  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41789874 tgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 41789775  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41789774 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 41789739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21894516 - 21894177
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaaca-tgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgag 125  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  21894516 gtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcactgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgtttgag 21894417  T
Q  126 aagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtata 225  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21894416 aggacttgttgtgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtata 21894317  T
Q  226 tctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtag 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21894316 tctttgagaaagcggctgttactgggaaggttgcacgctggcagatgctattgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtag 21894217  T
Q  326 cattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894216 cattcttgctgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21894177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 20464470 - 20464805
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20464470 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatacttgaaaaga 20464569  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464570 cttgttgtgctctggcctgggccgcaaaatgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 20464669  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  20464670 cgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcatt 20464769  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20464770 cttgccaatcatcttgcctgccaacctcttgatgat 20464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 68 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20337142 - 20336845
Alignment:
Q  68 tatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  20337142 tatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaaacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgt 20337043  T
Q  168 cattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20337042 cattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggc 20336943  T
Q  268 agatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20336942 agatgctcttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaaccccttgatgat 20336845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Original strand, 22489521 - 22489782
Alignment:
Q  36 caacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgtt 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||  | || ||| || | |||||||| |||||||    
T  22489521 caacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattcagtacttgagaaaacttgtt 22489620  T
Q  136 gtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 235  Q
    ||| | |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  22489621 gtgatttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaa 22489720  T
Q  236 agctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 297  Q
      | ||| | ||||||| ||| || || ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  22489721 gccagctttaactggaaggattgctcgatggcagatgttattgtccgagtatgatatcgtgt 22489782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5628765 - 5628500
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  5628765 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgaga 5628666  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || || || |||| | ||  ||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  5628665 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacat 5628566  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||| | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5628565 atttgagaaacccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5628500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 20339065 - 20339024
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatc 71  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20339065 cttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagaacatgctatc 20339024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 9528 - 9863
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9528 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 9627  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9628 cttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 9727  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9728 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 9827  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9828 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11695 - 11357
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  11695 gtgcttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgaga 11596  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11595 agacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatat 11496  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11495 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 11396  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11395 attcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 16073 - 16408
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16073 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 16172  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16173 cttgttgtgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 16272  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16273 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 16372  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16373 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 3559 - 3894
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3559 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 3658  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3659 cttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctt 3758  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3759 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 3858  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3859 cttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 3894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22958 - 22621
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22958 gtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 22859  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22858 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacat 22759  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22758 ctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 22659  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22658 attctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 22621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5946 - 5608
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5946 gtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaga 5847  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5846 agacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatat 5747  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc 326  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5746 cttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc 5647  T
Q  327 attcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5646 attcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 9537 - 9872
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9537 cttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaga 9636  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9637 cttgttgtgctctggccttggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaaatatatctt 9736  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9737 tgagaaagctgctgttactgggaagattgcaagctggcagatgctcttgtctgaatatgatgttgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 9836  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9837 cttgccgatcatcttgcctaccaaccttttgatgat 9872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 11441 - 11776
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11441 cttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaaga 11540  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11541 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 11640  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11641 tgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatt 11740  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11741 cttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 13063 - 13398
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13063 cttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaga 13162  T
Q  130 cttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctt 229  Q
    ||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13163 cttgttgtgctttagcctgggccactaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctt 13262  T
Q  230 tgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcatt 329  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13263 tgagaaggcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatt 13362  T
Q  330 cttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13363 cttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5432 - 5125
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5432 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatctactatctaagcaagaagtttaccgactgcgaaattcggtatacgatgcttgagaagactt 5333  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  5332 gctgtgctctagcctgggctgccaaacgccttcgtcattacctggtaaatcatactacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatcttcga 5233  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattctt 332  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5232 gaagcctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctt 5133  T
Q  333 gcagatca 340  Q
    || |||||    
T  5132 gccgatca 5125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43492 - 43145
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaaga-tgatactggaaa-gaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgc-gaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43492 cttggtcaacaagaatgagactggaaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtagaaactcggtatacaatgcttgaga 43393  T
Q  127 agacttgtt-gtgctctagct--tgggctgccaaacg-cctgcgtc-attatttggt-gaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaa 220  Q
    ||||||||| || || | | |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43392 agacttgtttgtccttttggtcctgggccgctaaacgacctgcgtctattatttggttgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaa 43293  T
Q  221 gt-atatctttgag-aaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgc-ttttgtctgaatat-gatattgtgtt-taaaactc-aaaagcca 314  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  43292 gtaatatctttgagtaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgctttttgtctgaatatagatattgtgttcaaaaactcaaaaaggca 43193  T
Q  315 atcaaaggtagc--attcttgcagatca-tcttgcctaccaacctctt 359  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  43192 atcaaaggtagctatttcttgccgatcattcttgcttaccaacctctt 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 364
Target Start/End: Original strand, 22757 - 22942
Alignment:
Q  179 gaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttg 278  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  22757 gaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttg 22856  T
Q  279 tctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatga 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22857 tctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 118946 - 118762
Alignment:
Q  181 atcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtc 280  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  118946 atcatacaacttgggtgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtc 118847  T
Q  281 tgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
    ||||||||| |||||||| ||  |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118846 tgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 118762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 10713 - 10972
Alignment:
Q  33 ggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 132  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  10713 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 10812  T
Q  133 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttga 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||| || |||||    
T  10813 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 10912  T
Q  233 gaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
    |||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  10913 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 10972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34998 - 34799
Alignment:
Q  36 caacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgtt 135  Q
    ||||||||||| |||||||  || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  34998 caacaagatgaaactggaagaaaggagcacgccatttattatctaagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgtt 34899  T
Q  136 gtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||| |||| | ||| ||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  34898 gtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaa 34799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 238 - 365
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2109
Alignment:
Q  238 ctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaagccaatcaaaggtagc---attcttgc 334  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||   ||||||||    
T  1979 ctgctgttactaggaagattggacgctggcagatgctcttgtctgaatatggcattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattattcttgc 2078  T
Q  335 agatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 365  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2079 cgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5165 - 4969
Alignment:
Q  39 caagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtg 138  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||  | ||  ||||||||   || |||||||||||||| ||||    
T  5165 caagaagaaactggaaggaaagaacatgttatttactatttgagcaagaagtttacagatagtgagtctcggtatttcatacttgagaagacttgatgtg 5066  T
Q  139 ctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 235  Q
    || |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||| || |||| ||||| ||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5065 ctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Original strand, 29659 - 29924
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgaga 126  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || || || || ||| | ||||||||||| || || || ||| |||| ||  | ||||| ||||    
T  29659 gtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatgctcgaga 29758  T
Q  127 agacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaactttgttgaaatccagaatggatccgataaagtatat 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||| | ||  ||| | ||||||||| || | ||| ||    
T  29759 agacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaggtacat 29858  T
Q  227 ctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 292  Q
     ||||||||  | ||| | || |||| ||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  29859 atttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 29924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1388 - 1347
Alignment:
Q  30 cttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatc 71  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1388 cttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagaacatgctatc 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4682 - 4618
Alignment:
Q  27 gtgcttggtcaacaagatgatactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagtt 91  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||    
T  4682 gtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtt 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University