View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21682_high_14 (Length: 305)

Name: NF21682_high_14
Description: NF21682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21682_high_14
NF21682_high_14
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (31-303)||(16376349-16376621)
chr6 (31-303)||(16383673-16383945)
chr6 (31-303)||(10488707-10488979)
chr6 (31-303)||(16556115-16556387)
chr6 (31-303)||(16632671-16632943)
chr6 (31-303)||(22225714-22225986)
chr6 (31-303)||(1556013-1556285)
chr6 (31-303)||(19610026-19610298)
chr6 (31-231)||(16231972-16232172)
chr6 (31-231)||(18086799-18086999)
chr6 (31-231)||(13620770-13620970)
chr6 (31-231)||(23977849-23978049)
chr6 (31-173)||(19299375-19299517)
chr6 (31-242)||(29665942-29666153)
chr6 (31-137)||(22251542-22251648)
chr6 (31-191)||(29869752-29869911)
chr6 (224-303)||(33314387-33314466)
chr6 (128-246)||(27740903-27741021)
chr6 (53-174)||(14626124-14626243)
chr6 (31-143)||(1650077-1650189)
chr6 (31-110)||(16825724-16825803)
chr6 (31-143)||(25175731-25175843)
chr6 (53-190)||(15862592-15862728)
chr6 (53-204)||(35009445-35009595)
chr6 (31-83)||(27653955-27654007)
chr6 (53-190)||(1657754-1657890)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (31-303)||(1467715-1467987)
chr3 (31-303)||(49232444-49232716)
chr3 (31-300)||(25058750-25059019)
chr3 (31-303)||(12902066-12902338)
chr3 (32-300)||(5228324-5228591)
chr3 (31-267)||(22275253-22275489)
chr3 (31-267)||(15468316-15468552)
chr3 (31-303)||(12264768-12265041)
chr3 (31-231)||(18911073-18911273)
chr3 (31-214)||(12811938-12812121)
chr3 (31-303)||(44228993-44229265)
chr3 (31-237)||(54651531-54651737)
chr3 (189-303)||(18897133-18897247)
chr3 (31-141)||(18897020-18897130)
chr3 (53-289)||(11986172-11986408)
chr3 (31-172)||(16821280-16821419)
chr3 (31-143)||(55316387-55316499)
chr3 (31-200)||(15936611-15936779)
chr3 (31-143)||(41270243-41270355)
chr3 (31-173)||(15614973-15615113)
chr3 (31-200)||(15938453-15938621)
chr3 (53-174)||(51158024-51158143)
chr3 (95-229)||(17912530-17912662)
chr3 (53-143)||(15859030-15859120)
chr3 (47-143)||(13839061-13839157)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (31-303)||(11231314-11231586)
chr2 (31-303)||(22513161-22513433)
chr2 (31-303)||(28775783-28776055)
chr2 (31-303)||(24685757-24686029)
chr2 (31-303)||(12728400-12728672)
chr2 (31-303)||(34824483-34824755)
chr2 (31-303)||(16935601-16935873)
chr2 (31-303)||(17006261-17006533)
chr2 (31-303)||(23778021-23778293)
chr2 (31-231)||(8943926-8944126)
chr2 (31-231)||(12635844-12636044)
chr2 (31-231)||(42177945-42178145)
chr2 (31-231)||(3798579-3798779)
chr2 (31-231)||(12641618-12641818)
chr2 (31-303)||(21141903-21142175)
chr2 (31-191)||(23774257-23774416)
chr2 (31-191)||(5888606-5888765)
chr2 (47-174)||(7507844-7507969)
chr2 (31-143)||(19886633-19886745)
chr2 (53-204)||(25265396-25265546)
chr2 (53-174)||(462876-462995)
chr2 (53-142)||(20627319-20627408)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (31-303)||(31317-31589)
scaffold0107 (31-303)||(39654-39926)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (31-303)||(39111-39383)
scaffold0076 (31-173)||(43137-43277)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (31-303)||(271336-271608)
chr8 (31-303)||(644312-644584)
chr8 (31-303)||(830047-830319)
chr8 (31-303)||(22088770-22089042)
chr8 (31-303)||(15319135-15319407)
chr8 (31-303)||(15499504-15499776)
chr8 (31-302)||(22006234-22006505)
chr8 (31-303)||(13662241-13662513)
chr8 (31-231)||(13720904-13721104)
chr8 (31-231)||(16873027-16873227)
chr8 (31-303)||(16195238-16195511)
chr8 (31-173)||(21844544-21844684)
chr8 (31-173)||(21851937-21852077)
chr8 (31-174)||(24549120-24549261)
chr8 (32-174)||(6774231-6774371)
chr8 (31-192)||(16674364-16674524)
chr8 (31-143)||(30120890-30121002)
chr8 (53-190)||(17345690-17345826)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (31-303)||(7822736-7823008)
chr7 (31-303)||(7830047-7830319)
chr7 (31-303)||(27101613-27101885)
chr7 (31-303)||(27108961-27109233)
chr7 (31-303)||(27176441-27176713)
chr7 (31-303)||(38783705-38783977)
chr7 (31-303)||(15950767-15951039)
chr7 (31-303)||(15760090-15760362)
chr7 (31-231)||(18979997-18980197)
chr7 (31-231)||(14250874-14251074)
chr7 (31-231)||(15927648-15927848)
chr7 (31-231)||(13758450-13758650)
chr7 (35-178)||(48622646-48622788)
chr7 (31-191)||(10000346-10000505)
chr7 (31-191)||(16418618-16418777)
chr7 (53-260)||(13321065-13321273)
chr7 (31-173)||(13572816-13572956)
chr7 (31-174)||(16478934-16479075)
chr7 (31-192)||(13910996-13911156)
chr7 (31-143)||(10989577-10989689)
chr7 (31-143)||(18253819-18253931)
chr7 (31-143)||(2437625-2437737)
chr7 (53-174)||(47481037-47481156)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (31-303)||(35582044-35582316)
chr5 (31-303)||(21932357-21932629)
chr5 (31-303)||(21938527-21938799)
chr5 (31-303)||(22883060-22883332)
chr5 (31-303)||(36989746-36990018)
chr5 (31-303)||(1219496-1219768)
chr5 (31-303)||(7425332-7425604)
chr5 (31-267)||(17471564-17471800)
chr5 (31-231)||(10777946-10778146)
chr5 (31-231)||(23514641-23514841)
chr5 (31-303)||(35791074-35791347)
chr5 (31-303)||(11212041-11212313)
chr5 (31-191)||(23328678-23328837)
chr5 (31-191)||(24616282-24616441)
chr5 (31-191)||(24712658-24712817)
chr5 (31-191)||(24745676-24745835)
chr5 (53-287)||(32950717-32950952)
chr5 (31-173)||(27009981-27010121)
chr5 (31-143)||(18777964-18778076)
chr5 (31-174)||(29188256-29188397)
chr5 (32-143)||(43443368-43443479)
chr5 (31-143)||(12542-12654)
chr5 (31-143)||(25426796-25426908)
chr5 (31-143)||(19500067-19500179)
chr5 (31-143)||(22366453-22366565)
chr5 (31-192)||(4199957-4200117)
chr5 (31-83)||(21073567-21073619)
chr5 (56-190)||(34939398-34939531)
chr5 (53-242)||(18531073-18531261)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (31-303)||(17004646-17004918)
chr1 (31-303)||(18059734-18060006)
chr1 (31-303)||(38055067-38055339)
chr1 (31-303)||(46523397-46523669)
chr1 (31-231)||(17148647-17148847)
chr1 (31-173)||(19962475-19962617)
chr1 (31-191)||(7640910-7641069)
chr1 (31-191)||(22035568-22035727)
chr1 (31-174)||(22227947-22228088)
chr1 (31-174)||(22232644-22232785)
chr1 (31-143)||(5072360-5072472)
chr1 (31-143)||(18601090-18601202)
chr1 (31-174)||(2116393-2116534)
chr1 (31-174)||(45051561-45051702)
chr1 (53-174)||(20913168-20913287)
chr1 (53-174)||(20931483-20931602)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (31-300)||(29173-29442)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (31-300)||(18168981-18169250)
chr4 (31-303)||(19020494-19020766)
chr4 (31-303)||(15287221-15287493)
chr4 (31-303)||(15294330-15294602)
chr4 (32-231)||(7132042-7132241)
chr4 (31-231)||(20000803-20001003)
chr4 (31-290)||(17145633-17145892)
chr4 (31-290)||(18248239-18248498)
chr4 (31-190)||(22738390-22738549)
chr4 (101-290)||(8374529-8374718)
chr4 (31-191)||(26339140-26339299)
chr4 (31-176)||(22352040-22352184)
chr4 (31-172)||(10644360-10644499)
chr4 (31-95)||(8378367-8378431)
chr4 (95-242)||(40885602-40885748)
chr4 (31-83)||(47357882-47357934)
chr4 (53-260)||(15675095-15675301)
chr4 (53-242)||(10104256-10104444)
chr4 (95-260)||(31115680-31115844)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (31-303)||(153983-154255)
scaffold0023 (31-83)||(169884-169936)
scaffold0023 (31-77)||(36327-36373)
scaffold0023 (53-143)||(48765-48855)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (31-303)||(1551-1823)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (31-303)||(10315-10587)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (31-303)||(2400-2672)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (62-303)||(3-244)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (37-303)||(34140-34406)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (31-231)||(1490-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (31-303)||(7432-7704)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (31-290)||(54437-54696)
scaffold0066 (31-260)||(45081-45310)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (32-178)||(54008-54153)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (31-174)||(5188-5329)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (31-191)||(6718-6877)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (32-178)||(3547-3692)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (53-242)||(56105-56294)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (31-191)||(7330-7489)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (31-143)||(3890-4002)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (31-229)||(3045-3242)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (31-191)||(23725-23884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (32-171)||(177-314)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (31-174)||(9321-9462)
scaffold0215 (31-174)||(16219-16360)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (31-143)||(1276-1388)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (31-173)||(64495-64640)
scaffold0026 (31-143)||(107914-108026)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (31-174)||(13297-13438)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (31-173)||(21088-21228)
scaffold0139 (31-173)||(14034-14173)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (31-83)||(10724-10776)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (53-176)||(3324-3447)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (31-77)||(12103-12149)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (53-143)||(41815-41905)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (53-204)||(13613-13763)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (53-174)||(3588-3707)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (53-197)||(962-1105)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (53-174)||(36919-37038)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (53-144)||(12279-12370)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (53-226)||(8934-9106)
scaffold0025 (53-174)||(148859-148978)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (53-143)||(540-630)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (53-143)||(6070-6160)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (53-143)||(34466-34556)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (53-143)||(89460-89550)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (31-77)||(31647-31693)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (53-174)||(19344-19463)
scaffold0195 (53-174)||(21428-21547)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (53-204)||(8186-8336)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 16376349 - 16376621
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376349 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16376448  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16376449 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16376548  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16376549 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 16376621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 16383673 - 16383945
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383673 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16383772  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16383773 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16383872  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16383873 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 16383945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10488979 - 10488707
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488979 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 10488880  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10488879 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 10488780  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10488779 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 10488707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 16556115 - 16556387
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556115 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16556214  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16556215 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16556314  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16556315 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 16556387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 16632671 - 16632943
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632671 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16632770  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16632771 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16632870  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16632871 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 16632943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 22225714 - 22225986
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225714 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 22225813  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225814 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 22225913  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22225914 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 22225986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1556285 - 1556013
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1556285 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1556186  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1556185 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcata 1556086  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1556085 ttccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggat 1556013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19610298 - 19610026
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 19610199  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19610198 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttataaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcata 19610099  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  19610098 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggat 19610026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16232172 - 16231972
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232172 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16232073  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16232072 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 16231973  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  16231972 t 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 18086799 - 18086999
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18086799 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18086898  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18086899 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 18086998  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  18086999 t 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 13620770 - 13620970
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13620770 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13620869  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13620870 gaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 13620969  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  13620970 t 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23978049 - 23977849
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23978049 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23977950  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  23977949 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 23977850  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  23977849 t 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19299517 - 19299375
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299517 gtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 19299418  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299417 ggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29666153 - 29665942
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||| || ||||| || |||||    
T  29666153 gtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggt 29666054  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| |||| || ||| |  |||||||||||| ||||||||     
T  29666053 gaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatg 29665954  T
Q  231 ttccattaatgt 242  Q
    ||| ||| ||||    
T  29665953 ttcaattgatgt 29665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Original strand, 22251542 - 22251648
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251542 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 22251641  T
Q  131 gaaatta 137  Q
    |||||||    
T  22251642 gaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 29869752 - 29869911
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29869752 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 29869850  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29869851 gaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 303
Target Start/End: Original strand, 33314387 - 33314466
Alignment:
Q  224 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33314387 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 33314466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740903
Alignment:
Q  128 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattc 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| || ||  |  ||||| |||||| ||||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattc 27740922  T
Q  228 atattccattaatgtggtt 246  Q
    || ||| ||| ||||||||    
T  27740921 atgttcaattgatgtggtt 27740903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Original strand, 14626124 - 14626243
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  14626124 aattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 14626221  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14626222 gtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 1650077 - 1650189
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||| | ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  1650077 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 1650176  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  1650177 gaaattacatgtt 1650189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 110
Target Start/End: Original strand, 16825724 - 16825803
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  16825724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 16825803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25175843 - 25175731
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  25175843 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 25175744  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  25175743 gaaattacatgtt 25175731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15862728 - 15862592
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||| |||||||   || |||    
T  15862728 aattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 15862631  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 190  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15862630 gtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 15862592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 35009445 - 35009595
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||    
T  35009445 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 35009542  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 204  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  35009543 gtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt 35009595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Original strand, 27653955 - 27654007
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtga 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  27653955 gtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtga 27654007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 1657754 - 1657890
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||| |||||||   || |||    
T  1657754 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 1657851  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 190  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1657852 gtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 1657890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 1467715 - 1467987
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467715 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1467814  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1467815 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 1467914  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1467915 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 1467987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 49232716 - 49232444
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49232716 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 49232617  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232616 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 49232517  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49232516 ttccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 49232444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25059019 - 25058750
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 25058920  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25058919 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 25058820  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtg 300  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  25058819 ttccattgatgttgttattgttaacttatgctattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtg 25058750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 12902066 - 12902338
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12902066 gtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12902165  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12902166 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 12902265  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12902266 ttccattgatgttgttattattaactgatactattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtggat 12902338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5228591 - 5228324
Alignment:
Q  32 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5228591 tatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtg 5228493  T
Q  132 aaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5228492 aaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatat 5228393  T
Q  232 tccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtg 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5228392 tccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtg 5228324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22275489 - 22275253
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22275489 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 22275390  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22275389 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 22275290  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgt 267  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22275289 ttccattgatgttgttattgttaactgatgttattgt 22275253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 267
Target Start/End: Original strand, 15468316 - 15468552
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15468415  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15468416 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 15468515  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgt 267  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15468516 ttccattgatgttgttattgttaactgatgttattgt 15468552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 12264768 - 12265041
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12264768 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12264867  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  12264868 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcat 12264967  T
Q  230 attccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
     ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  12264968 gttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggat 12265041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18911273 - 18911073
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18911174  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18911173 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 18911074  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  18911073 t 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12812121 - 12811938
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812121 gtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 12812022  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812021 ggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44229265 - 44228993
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  44229265 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 44229166  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || ||||||||||||||||||     
T  44229165 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatg 44229066  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||||| ||  ||  | |||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  44229065 ttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggat 44228993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 54651737 - 54651531
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || || ||    
T  54651737 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagt 54651638  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||     
T  54651637 gaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 54651538  T
Q  231 ttccatt 237  Q
    |||||||    
T  54651537 ttccatt 54651531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Original strand, 18897133 - 18897247
Alignment:
Q  189 tgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggta 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18897133 tgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggta 18897232  T
Q  289 tagttaattgtggat 303  Q
    || ||||||||||||    
T  18897233 tacttaattgtggat 18897247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Original strand, 18897020 - 18897130
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18897119  T
Q  131 gaaattacatg 141  Q
    | |||||||||    
T  18897120 ggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 289
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986408
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| | ||| ||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtt 252  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || |  |||| |||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | |  | ||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctatt 11986371  T
Q  253 aactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtat 289  Q
    |||||||| | ||||  |||||| |||| ||||||||    
T  11986372 aactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtat 11986408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16821419 - 16821280
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||  ||||| | |||||||||| || ||||| || | |||    
T  16821419 gtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggt 16821320  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 172  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16821319 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 55316499 - 55316387
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  55316499 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 55316400  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  55316399 gaaattacatgtt 55316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 15936611 - 15936779
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| | | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  15936611 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 15936710  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgata 200  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  15936711 gaaattacatg-ttcaaa-tgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgata 15936779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41270355 - 41270243
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  41270355 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 41270256  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    | |||||||||||    
T  41270255 ggaattacatgtt 41270243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15615113 - 15614973
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||| |||||||| |||||  | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||    
T  15615113 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggt 15615014  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  15615013 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 15938453 - 15938621
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   |||| | | ||| ||  ||  | |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  15938453 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 15938552  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgata 200  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  15938553 gaaattacatg-ttcaaa-tgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgata 15938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Original strand, 51158024 - 51158143
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  51158024 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 51158121  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  51158122 gtaaaaatgataagttgtgaaa 51158143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Original strand, 17912530 - 17912662
Alignment:
Q  95 tatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaa 193  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||| ||||| |||  |||||||| ||    
T  17912530 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatg-aa 17912626  T
Q  194 tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 229  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||| | ||||||||    
T  17912627 tttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcat 17912662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Original strand, 15859030 - 15859120
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  15859030 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15859120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13839157 - 13839061
Alignment:
Q  47 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  13839157 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 11231314 - 11231586
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231314 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 11231413  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11231414 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 11231513  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11231514 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 11231586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 22513161 - 22513433
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513161 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 22513260  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22513261 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 22513360  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22513361 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 22513433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 28775783 - 28776055
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775783 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 28775882  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28775883 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 28775982  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28775983 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 28776055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 24685757 - 24686029
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685757 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 24685856  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24685857 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcata 24685956  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24685957 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttaggtatacttaattgtggat 24686029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12728672 - 12728400
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12728672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12728573  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12728572 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcata 12728473  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12728472 ttccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 12728400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34824755 - 34824483
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34824755 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 34824656  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34824655 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcata 34824556  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34824555 ttccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 34824483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16935873 - 16935601
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16935873 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 16935774  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935773 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 16935674  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16935673 ttccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 16935601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17006533 - 17006261
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17006533 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 17006434  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006433 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 17006334  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17006333 ttccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 17006261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 23778021 - 23778293
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23778021 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 23778120  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23778121 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcata 23778220  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23778221 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 23778293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8944126 - 8943926
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8944126 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggt 8944027  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8944026 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 8943927  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  8943926 t 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 12635844 - 12636044
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12635844 gtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12635943  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12635944 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 12636043  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  12636044 t 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 42177945 - 42178145
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 42178044  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  42178045 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 42178144  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  42178145 t 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 3798579 - 3798779
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3798579 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 3798678  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  3798679 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 3798778  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  3798779 t 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 12641618 - 12641818
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12641618 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggct 12641717  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  12641718 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 12641817  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  12641818 t 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21142175 - 21141903
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  21142175 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggat 21142076  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || ||||||||||||||||||     
T  21142075 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatg 21141976  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||||| ||  ||  | |||||||||| | ||||  |||||||| || |||||||||  ||||| |||||    
T  21141975 ttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggat 21141903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23774416 - 23774257
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23774416 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 23774318  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23774317 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 5888606 - 5888765
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5888606 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 5888704  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5888705 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 7507844 - 7507969
Alignment:
Q  47 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttca 146  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| ||||    
T  7507844 atgaataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 7507942  T
Q  147 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    || |||||| ||||  ||||||||||||    
T  7507943 aa-tatgtaaaaataataagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 19886633 - 19886745
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  19886633 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 19886732  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  19886733 gaaattacatgtt 19886745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 25265396 - 25265546
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||    
T  25265396 aattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 25265493  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 204  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  25265494 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt 25265546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 462995 - 462876
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  462995 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 462898  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  462897 gtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 142
Target Start/End: Original strand, 20627319 - 20627408
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||  |||||  ||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||    
T  20627319 aattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 20627408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31589 - 31317
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31589 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 31490  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31489 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 31390  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31389 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 31317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39926 - 39654
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39926 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggt 39827  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  39826 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatgttattcata 39727  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39726 tttcattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 39654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39383 - 39111
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39383 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 39284  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39283 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 39184  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39183 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 39111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43277 - 43137
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| || | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  43277 gtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 43178  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43177 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgaa 43137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 271336 - 271608
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271336 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 271435  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  271436 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 271535  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  271536 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 271608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 644584 - 644312
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644584 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 644485  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  644484 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 644385  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  644384 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 644312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 830319 - 830047
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830319 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 830220  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  830219 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 830120  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  830119 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 830047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 22088770 - 22089042
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22088770 gtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggt 22088869  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22088870 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 22088969  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22088970 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 22089042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 15319135 - 15319407
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319135 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 15319234  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15319235 gaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatg 15319334  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15319335 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 15319407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 15499504 - 15499776
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499504 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 15499603  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15499604 gaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatg 15499703  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15499704 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 15499776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 31 - 302
Target Start/End: Original strand, 22006234 - 22006505
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22006234 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 22006333  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006334 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 22006433  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtgga 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22006434 ttccattgatgtggttattgttaactgatgttattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtgga 22006505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 13662241 - 13662513
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggt 13662340  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662341 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 13662440  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  13662441 ttccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacataattatggat 13662513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 13720904 - 13721104
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13721003  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13721004 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 13721103  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  13721104 t 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 16873027 - 16873227
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16873027 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16873126  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  16873127 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 16873226  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  16873227 t 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16195511 - 16195238
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16195511 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16195412  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16195411 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcat 16195312  T
Q  230 attccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
     ||||||| |||| |||  | |||||||||| | |||   ||||||||||| || ||||||  ||||| |||||    
T  16195311 gttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttaggtatatataattatggat 16195238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 21844544 - 21844684
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  21844544 gtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggt 21844643  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844644 gaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 21851937 - 21852077
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  21851937 gtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggt 21852036  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    ||||||| ||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21852037 gaaattaaatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24549261 - 24549120
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  24549261 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 24549162  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  24549161 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 24549120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 6774231 - 6774371
Alignment:
Q  32 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||    
T  6774231 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 6774330  T
Q  132 aaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  6774331 aaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 6774371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 16674364 - 16674524
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||| |||||| ||| |  | ||||| || | |||    
T  16674364 gtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggt 16674463  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 192  Q
    ||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  16674464 gaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaa 16674524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30121002 - 30120890
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||| ||| |  | ||||| || | |||    
T  30121002 gtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggt 30120903  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  30120902 gaaattacatgtt 30120890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17345826 - 17345690
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||| |||||||   || |||    
T  17345826 aattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 17345729  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 190  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17345728 gtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 17345690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7823008 - 7822736
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7823008 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 7822909  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7822908 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 7822809  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7822808 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 7822736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7830319 - 7830047
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830319 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 7830220  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7830219 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 7830120  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7830119 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 7830047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 27101613 - 27101885
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101613 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 27101712  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27101713 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 27101812  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27101813 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 27101885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 27108961 - 27109233
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27108961 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 27109060  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27109061 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 27109160  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27109161 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 27109233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27176713 - 27176441
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176713 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 27176614  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27176613 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 27176514  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27176513 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 27176441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 38783705 - 38783977
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783705 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 38783804  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38783805 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 38783904  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38783905 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 38783977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 15950767 - 15951039
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15950767 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15950866  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950867 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 15950966  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15950967 ttccattgatgtgattattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 15951039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 15760090 - 15760362
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15760090 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggt 15760189  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15760190 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcata 15760289  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15760290 ttccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaataatgaattgggtatacttaattgtggat 15760362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 18979997 - 18980197
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18979997 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18980096  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18980097 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 18980196  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  18980197 t 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 14250874 - 14251074
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14250874 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 14250973  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14250974 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 14251073  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  14251074 t 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15927848 - 15927648
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15927848 gtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggt 15927749  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  15927748 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 15927649  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  15927648 t 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13758650 - 13758450
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13758650 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13758551  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  13758550 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 13758451  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  13758450 t 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 48622646 - 48622788
Alignment:
Q  35 gaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48622646 gaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaa 48622745  T
Q  135 ttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 178  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  48622746 ttacatg-ttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaaattat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 10000346 - 10000505
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  | | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10000346 gtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 10000444  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10000445 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16418777 - 16418618
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16418777 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 16418679  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  16418678 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13321273 - 13321065
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  13321273 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtat 13321174  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt--ttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattg 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| || |||  ||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||  || |||    
T  13321173 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattg-ttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttg 13321075  T
Q  251 ttaactgatg 260  Q
    |||| |||||    
T  13321074 ttaattgatg 13321065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13572956 - 13572816
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || || || || | |||    
T  13572956 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggt 13572857  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  13572856 gaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Original strand, 16478934 - 16479075
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| || | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  16478934 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 16479033  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16479034 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16479075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 13910996 - 13911156
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| | || ||||| || | |||    
T  13910996 gtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggt 13911095  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 192  Q
    ||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13911096 gaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaa 13911156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10989689 - 10989577
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  10989689 gtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 10989590  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  10989589 gaaattacatgtt 10989577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 18253819 - 18253931
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| | | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  18253819 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 18253918  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  18253919 gaaattacatgtt 18253931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2437737 - 2437625
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  2437737 gtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 2437638  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  2437637 gaaattacatgtt 2437625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Original strand, 47481037 - 47481156
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| |||||| |||    
T  47481037 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tat 47481134  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  47481135 gtaaaaatgataagttgtgaaa 47481156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35582316 - 35582044
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582316 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 35582217  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35582216 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 35582117  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35582116 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 35582044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 21932357 - 21932629
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932357 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 21932456  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21932457 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 21932556  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21932557 ttccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 21932629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 21938527 - 21938799
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938527 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 21938626  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21938627 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 21938726  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21938727 ttccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 21938799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 22883060 - 22883332
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22883060 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggat 22883159  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22883160 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 22883259  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22883260 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 22883332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 36989746 - 36990018
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989746 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 36989845  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36989846 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 36989945  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36989946 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 36990018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 1219496 - 1219768
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1219496 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1219595  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219596 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 1219695  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1219696 tttcattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 1219768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7425604 - 7425332
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  7425604 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 7425505  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7425504 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 7425405  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||    
T  7425404 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttggatatacttaattatggat 7425332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 267
Target Start/End: Original strand, 17471564 - 17471800
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17471564 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 17471663  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17471664 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcata 17471763  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgt 267  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17471764 ttccattgatgttgttattgttaactgatgttattgt 17471800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 10777946 - 10778146
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10777946 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 10778045  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10778046 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 10778145  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  10778146 t 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23514841 - 23514641
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23514742  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23514741 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 23514642  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  23514641 t 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 35791074 - 35791347
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagt 35791173  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  35791174 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcat 35791273  T
Q  230 attccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
     ||||||| |||| |||  | |||||||||| | |||   ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  35791274 gttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttgggtatacataattatggat 35791347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 11212041 - 11212313
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11212041 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 11212140  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  11212141 gaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaaattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg 11212240  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  11212241 ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtggattatgacttgggtatacataattatggat 11212313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23328837 - 23328678
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23328837 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 23328739  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23328738 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24616441 - 24616282
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  24616441 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggat 24616343  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24616342 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24712817 - 24712658
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  24712817 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggat 24712719  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24712718 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24745835 - 24745676
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  24745835 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggat 24745737  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24745736 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950717
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| | ||  ||| |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  153 gtataaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgt 251  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| |||  |||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |  | |    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgttgatgctat 32950753  T
Q  252 taactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggt 287  Q
    ||||||||| | ||||  |||||| |||| ||||||    
T  32950752 taactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggt 32950717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27010121 - 27009981
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || |||||  | | |||    
T  27010121 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggt 27010022  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  27010021 gaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 18777964 - 18778076
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  18777964 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 18778063  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  18778064 gaaattacatgtt 18778076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Original strand, 29188256 - 29188397
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  29188256 gtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 29188355  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  29188356 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 29188397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 43443368 - 43443479
Alignment:
Q  32 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtg 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | ||||    
T  43443368 tatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtg 43443467  T
Q  132 aaattacatgtt 143  Q
    ||||||||||||    
T  43443468 aaattacatgtt 43443479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12654 - 12542
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  12654 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 12555  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  12554 gaaattacatgtt 12542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25426908 - 25426796
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  25426908 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 25426809  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  25426808 gaaattacatgtt 25426796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19500179 - 19500067
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  19500179 gtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 19500080  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  19500079 gaaattacatgtt 19500067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 22366453 - 22366565
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  22366453 gtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 22366552  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  22366553 gaaattacatgtt 22366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 4199957 - 4200117
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  4199957 gtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 4200056  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 192  Q
    ||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4200057 gaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaa 4200117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Original strand, 21073567 - 21073619
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtga 83  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  21073567 gtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtga 21073619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34939531 - 34939398
Alignment:
Q  56 tgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgta 155  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||| |||||||   || ||||||    
T  34939531 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgta 34939434  T
Q  156 taaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 190  Q
     |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  34939433 aaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 34939398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 242
Target Start/End: Original strand, 18531073 - 18531261
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||    
T  18531073 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 18531170  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 242  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  18531171 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 18531261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17004918 - 17004646
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004918 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 17004819  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17004818 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 17004719  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17004718 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 17004646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 18059734 - 18060006
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059734 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 18059833  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059834 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 18059933  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18059934 ttccattgatgtggttattgtcaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 18060006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 38055067 - 38055339
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055067 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 38055166  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38055167 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 38055266  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38055267 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggat 38055339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46523669 - 46523397
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  46523669 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggt 46523570  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46523569 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 46523470  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  46523469 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggat 46523397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17148847 - 17148647
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17148847 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 17148748  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  17148747 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcata 17148648  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  17148647 t 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 19962475 - 19962617
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962475 gtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 19962574  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962575 ggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 7640910 - 7641069
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7640910 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 7641008  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7641009 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22035727 - 22035568
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 22035629  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  22035628 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22228088 - 22227947
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || |  ||    
T  22228088 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagt 22227989  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227988 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22232785 - 22232644
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || |  ||    
T  22232785 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagt 22232686  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232685 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 5072360 - 5072472
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  5072360 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 5072459  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  5072460 gaaattacatgtt 5072472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 18601090 - 18601202
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  18601090 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 18601189  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  18601190 gaaattacatgtt 18601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2116534 - 2116393
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||||| || |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  2116534 gtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 2116435  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  2116434 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 2116393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45051702 - 45051561
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||| |||||| | ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  45051702 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 45051603  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  45051602 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 45051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20913287 - 20913168
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||| | |||    
T  20913287 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20913190  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20913189 gtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20931602 - 20931483
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||| | |||    
T  20931602 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20931505  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20931504 gtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29442 - 29173
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29442 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggt 29343  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29342 gaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 29243  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29242 ttccattgatgtggttattgttaatttatgttattgttagtgaattatgatttggttatacttaattgtg 29173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18169250 - 18168981
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18169250 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18169151  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169150 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 18169051  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  18169050 ttccattgatgtggttattgttaaataatgctattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtg 18168981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19020766 - 19020494
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19020766 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 19020667  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19020666 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 19020567  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19020566 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtggat 19020494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 15287221 - 15287493
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  15287221 gtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 15287320  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15287321 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 15287420  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  15287421 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggat 15287493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 15294330 - 15294602
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  15294330 gtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 15294429  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15294430 gaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 15294529  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  15294530 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggat 15294602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 231
Target Start/End: Original strand, 7132042 - 7132241
Alignment:
Q  32 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7132042 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtg 7132141  T
Q  132 aaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132142 aaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20001003 - 20000803
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20001003 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggt 20000904  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  20000903 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 20000804  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  20000803 t 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Original strand, 17145633 - 17145892
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17145633 gtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 17145732  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  17145733 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg 17145832  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtata 290  Q
    ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  17145833 ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtata 17145892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18248498 - 18248239
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  18248498 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggat 18248399  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  18248398 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg 18248299  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtata 290  Q
    ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  ||||||||||| || ||||||    
T  18248298 ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgactttggtata 18248239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22738549 - 22738390
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22738549 gtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 22738450  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22738449 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8374718 - 8374529
Alignment:
Q  101 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||| |||    
T  8374718 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaattttaata 8374619  T
Q  201 tgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtata 290  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||||    
T  8374618 tgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtata 8374529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26339299 - 26339140
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26339299 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 26339201  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26339200 gaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Original strand, 22352040 - 22352184
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| | ||  |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22352040 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 22352138  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22352139 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10644499 - 10644360
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || |  ||    
T  10644499 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagt 10644400  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 172  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644399 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8378431 - 8378367
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttctt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378431 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttctt 8378367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 242
Target Start/End: Original strand, 40885602 - 40885748
Alignment:
Q  95 tatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaat 194  Q
    ||||| ||||||| |||| || | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  40885602 tatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattatgctcaattggtgaact 40885700  T
Q  195 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 242  Q
    ||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  40885701 ttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 40885748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 47357934 - 47357882
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtga 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  47357934 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtga 47357882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 15675095 - 15675301
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||    
T  15675095 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 15675192  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgt 251  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||  || ||||    
T  15675193 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgt 15675292  T
Q  252 taactgatg 260  Q
    ||| |||||    
T  15675293 taattgatg 15675301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 242
Target Start/End: Original strand, 10104256 - 10104444
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||| |||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||    
T  10104256 aattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 10104353  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 242  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  10104354 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 10104444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31115844 - 31115680
Alignment:
Q  95 tatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaa 193  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| |  | |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||     
T  31115844 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcc--attatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaattggtgaat 31115747  T
Q  194 tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatg 260  Q
    |||  || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||  || ||||||| |||||    
T  31115746 tttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatg 31115680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 153983 - 154255
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  153983 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 154082  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  154083 gaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcata 154182  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  154183 ttccattgatgtggttattgttaacttatgctattgtgggtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Original strand, 169884 - 169936
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtga 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  169884 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtga 169936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36373 - 36327
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 77  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  36373 gtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 36327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 48855 - 48765
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  48855 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 1551 - 1823
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1650  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1651 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 1750  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |   ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1751 taaaattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 1823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 10315 - 10587
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10315 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 10414  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10415 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 10514  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10515 ttccattgatgttgttgttgttaactgatgctattgtgagggaatcatgacttgggtatacttaattgtggat 10587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2672 - 2400
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggt 2573  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2572 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcata 2473  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2472 ttccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaatcatggtttgggtatacttaattgtggat 2400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 62 - 303
Target Start/End: Original strand, 3 - 244
Alignment:
Q  62 taaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3 taaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatg 102  T
Q  162 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  103 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaactgatgc 202  T
Q  262 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  203 tattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 34140 - 34406
Alignment:
Q  37 aaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatt 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34140 aaatgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatt 34239  T
Q  137 acatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34240 acatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccat 34339  T
Q  237 taatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||    
T  34340 taatgttgttgctattaactgatgctattgtgagtgaatcatgacttgggtatactaaattatggat 34406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 1490 - 1690
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1589  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1590 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 1689  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  1690 t 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 303
Target Start/End: Original strand, 7432 - 7704
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  7432 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggat 7531  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || ||||||||||||||||||     
T  7532 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatg 7631  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggat 303  Q
    ||||||||| ||  || || |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  7632 ttccattaaggttattgttattaactgatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtatacataattatggat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54696 - 54437
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || |||||    
T  54696 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggt 54597  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  54596 gaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg 54497  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtata 290  Q
    ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  |||||| |||| |||||||||    
T  54496 ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtata 54437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45310 - 45081
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  | ||| |||||||||||| || ||||| || |||||    
T  45310 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggt 45211  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  45210 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg 45111  T
Q  231 ttccattaatgtggttattgttaactgatg 260  Q
    ||||||| |||| |||  | ||||||||||    
T  45110 ttccattgatgttgttgctattaactgatg 45081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 54153 - 54008
Alignment:
Q  32 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54153 tatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtg 54054  T
Q  132 aaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 178  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54053 aaattacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattat 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Original strand, 5188 - 5329
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5288 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6877 - 6718
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6877 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 6779  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  6778 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3547
Alignment:
Q  32 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| | | ||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3692 tatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtg 3593  T
Q  132 aaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 178  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3592 aaattacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattat 3547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 242
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56294
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| | ||| ||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||| |||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 56294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7489 - 7330
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||  ||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7489 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggat 7391  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7390 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4002 - 3890
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  3902 gaaattacatgtt 3890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3242 - 3045
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||| | |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  3242 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3143  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 229  Q
    |||||||||||||   || |||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| ||||||||    
T  3142 gaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcat 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 23725 - 23884
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| | | ||  | | ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23725 gtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatgttgttgttt-cttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggat 23823  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 191  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23824 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 314 - 177
Alignment:
Q  32 tatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||    
T  314 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtg 215  T
Q  132 aaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 171  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  214 aaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatg 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Original strand, 9321 - 9462
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  9321 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 9420  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  9421 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Original strand, 16219 - 16360
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  16219 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 16318  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16319 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1388
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||| |  | ||||| || | |||    
T  1276 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 1375  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  1376 gaaattacatgtt 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 64495 - 64640
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttga-----attgatgattatggtatgttta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||     ||||||||| || ||||| ||     
T  64495 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattg 64594  T
Q  126 tgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    | |||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  64595 ttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 64640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 108026 - 107914
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| | | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  108026 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 107927  T
Q  131 gaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||    
T  107926 gaaattacatgtt 107914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Original strand, 13297 - 13438
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||  ||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||    
T  13297 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 13396  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13397 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 13438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 21088 - 21228
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||| | | |||||||||| ||  |||| || |  ||    
T  21088 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagt 21187  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  21188 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaa 21228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 14034 - 14173
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |   ||||| |||||||||||| ||  |||| || |  ||    
T  14034 gtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagt 14132  T
Q  131 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 173  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||    
T  14133 gaaattacatgtt--gaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Original strand, 10724 - 10776
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtga 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtga 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3324
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||  ||  ||||| |||||| |||||  | ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtat 3348  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaatt 176  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  3347 gtataaatatcaagttatgaaatt 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 77
Target Start/End: Original strand, 12103 - 12149
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12103 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41905 - 41815
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  41905 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 41815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13763 - 13613
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||    
T  13763 aattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 13666  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 204  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  13665 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgtt 13613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Original strand, 3588 - 3707
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  3588 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 3685  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  3686 gtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Original strand, 962 - 1105
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  962 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 1059  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 197  Q
    ||| ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1060 gtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Original strand, 36919 - 37038
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  36919 aattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 37016  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  37017 gtaaaaatgataagttgtgaaa 37038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12370 - 12279
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||||    
T  12370 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgttt 12279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9106 - 8934
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||    
T  9106 aattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 9009  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgatt 226  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||    
T  9008 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgatt 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 148978 - 148859
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  148978 aattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 148881  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  148880 gtaaaaatgataagttgtgaaa 148859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Original strand, 540 - 630
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  540 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6160
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  6070 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Original strand, 34466 - 34556
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  34466 aattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 34556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Original strand, 89460 - 89550
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 143  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  89460 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 89550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 77
Target Start/End: Original strand, 31647 - 31693
Alignment:
Q  31 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  31647 gtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 31693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19463 - 19344
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  19463 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 19366  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  19365 gtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21547 - 21428
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  21547 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 21450  T
Q  153 gtataaatgttaagttatgaaa 174  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  21449 gtaaaaatgataagttgtgaaa 21428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 8186 - 8336
Alignment:
Q  53 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttatgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||| ||||||| |||| || ||||| || | |||||||||||| |||   || |||    
T  8186 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggtt--caattat 8283  T
Q  153 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 204  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  8284 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University