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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF21683_high_19 (Length: 352)
Name: NF21683_high_19
Description: NF21683
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF21683_high_19 |
 |  |
|
| [»] chr4 (37 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (44 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0076 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (36 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (43 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (43 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0026 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (24 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (36 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0023 (4 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (34 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0107 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1500 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0191 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0892 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0155 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0516 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1666 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0406 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644554
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
10644318 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644319 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
10644418 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644419 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
10644518 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644519 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
10644554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357989
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47357654 |
catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
47357753 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
47357754 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
47357853 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47357854 |
acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaaa |
47357953 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357954 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
47357989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
| Q |
25 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13048477 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca |
13048378 |
T |
 |
| Q |
125 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13048377 |
acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa |
13048278 |
T |
 |
| Q |
225 |
tcatgcatacaaacata |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13048277 |
tcatgcatacaaacata |
13048261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675105
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
15675352 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
15675253 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675252 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
15675154 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15675153 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
15675105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115861
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
31115629 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
31115728 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31115729 |
caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
31115827 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31115828 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
31115861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104281
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10104445 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
10104347 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10104346 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
10104281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246662
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
13246430 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
13246529 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246530 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13246628 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13246629 |
tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
13246662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17145845 - 17145575
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| || | ||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
17145845 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcactaattgagtataatt-tcacaacttaacatttatacatacttt |
17145748 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| | | || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17145747 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc |
17145648 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17145647 |
aactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
17145575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118276
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||| |
|
|
| T |
54118507 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataact-aaat |
54118409 |
T |
 |
| Q |
117 |
c-aacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118408 |
ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
54118310 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca |
249 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
54118309 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca |
54118276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Original strand, 18248286 - 18248556
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| || | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
18248286 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataatt-tcatatcttaacatttatacatacttt |
18248383 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18248384 |
gaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc |
18248483 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18248484 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttacctt |
18248556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 18169109 - 18169308
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18169109 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18169208 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18169209 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18169308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7132182 - 7131983
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
7132182 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
7132083 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7132082 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7131983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 19020625 - 19020824
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19020625 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
19020724 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19020725 |
gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt |
19020824 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 250
Target Start/End: Original strand, 121990 - 122121
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118 |
aacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
121990 |
aacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
122088 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
122089 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
122121 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 20000862 - 20001061
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
20000862 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
20000961 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20000962 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
20001061 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15287362 - 15287163
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15287362 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15287263 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15287262 |
gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15287163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885585
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| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
40885749 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
40885652 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
40885651 |
gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag |
40885585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15294471 - 15294272
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15294471 |
tcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15294372 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15294371 |
gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15294272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680447
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
26680201 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
26680300 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26680301 |
caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
26680398 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26680399 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
26680447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 316
Target Start/End: Original strand, 22738412 - 22738568
Alignment:
| Q |
162 |
aacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcac |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22738412 |
aacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacac |
22738511 |
T |
 |
| Q |
260 |
gaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22738512 |
gaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
22738568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22352086 - 22351982
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| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352086 |
caagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
22351987 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
22351986 |
acctt |
22351982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 26339253 - 26339357
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| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26339253 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
26339352 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
26339353 |
acctt |
26339357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488809
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10488678 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
10488777 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
10488778 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
10488809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327942
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| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16328073 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
16327974 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16327973 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
16327942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Original strand, 8378377 - 8378480
Alignment:
| Q |
243 |
catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta |
339 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8378377 |
catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta |
8378476 |
T |
 |
| Q |
340 |
accc |
343 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
8378477 |
accc |
8378480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 8374576 - 8374722
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
8374576 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataatt-tcataacttaacatttatacatacttt |
8374673 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgca |
231 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8374674 |
gaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
8374722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
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| Q |
108 |
atctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatc |
207 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | || |||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7850090 |
atctcaattcaacaatcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatc |
7850189 |
T |
 |
| Q |
208 |
atacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatc |
246 |
Q |
| |
|
| ||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7850190 |
acacagttttcatcaatacattcattcaaacataacatc |
7850228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca |
106 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
111395 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca |
111484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18238337 - 18238157
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaattt-agcacaatactcataacttaacatttttacatatt- |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||| | || |||| ||||| |||||||| ||| || || |||||| ||||| | |
|
|
| T |
18238337 |
aacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaa-ttcaacaattagagcacaat--tcacaatatatcattttcacatacta |
18238241 |
T |
 |
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18238240 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
18238157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
| Q |
280 |
atcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9795490 |
atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
9795564 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
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Target Start/End: Original strand, 33240890 - 33240947
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| Q |
208 |
atacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33240890 |
atacaatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
33240947 |
T |
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Target: chr4; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 15044990 - 15045057
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| Q |
181 |
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247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15044990 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15109434 - 15109367
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15109434 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
15109367 |
T |
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Target: chr4; HSP #34
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Target Start/End: Complemental strand, 13442777 - 13442676
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| Q |
166 |
taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
263 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
13442777 |
taacattttcacatactatgaacatgcaatttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaat |
13442678 |
T |
 |
| Q |
264 |
tt |
265 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
13442677 |
tt |
13442676 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13590254 - 13590213
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13590254 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
13590213 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 352
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996476
Alignment:
| Q |
320 |
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352 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14996444 |
catgattatgataataactaacccccttacctt |
14996476 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Original strand, 18276501 - 18276541
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaa |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
18276501 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaa |
18276541 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821474
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821139 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
16821238 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16821239 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16821338 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821339 |
tcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
16821438 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821439 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
16821474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316555
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
55316219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
55316318 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
55316319 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
55316418 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
55316419 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
55316518 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
55316519 |
attacatgattgtgataataactaacccctttacctt |
55316555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270411
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
41270075 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
41270174 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41270175 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta |
41270274 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
41270275 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaa |
41270374 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41270375 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
41270411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615168
Alignment:
| Q |
21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac |
120 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
15614838 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
15614937 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
220 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15614938 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat |
15615036 |
T |
 |
| Q |
221 |
caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
320 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15615037 |
caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac |
15615136 |
T |
 |
| Q |
321 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15615137 |
atgattatgataaagactaacccccttacctt |
15615168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936553
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15936890 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
15936791 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15936790 |
taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
15936692 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15936691 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
15936592 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||| | || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15936591 |
attgaacatgattataatgataactaacccccatacctt |
15936553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938395
Alignment:
| Q |
20 |
catcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaa |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
15938729 |
catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa |
15938630 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938629 |
caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
15938531 |
T |
 |
| Q |
220 |
tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt- |
318 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
15938530 |
tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt |
15938431 |
T |
 |
| Q |
319 |
--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938430 |
gaacatgattataatgataactaacccccttacctt |
15938395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842577
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14842824 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
14842725 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14842724 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta |
14842626 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14842625 |
tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
14842577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975738
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
13975985 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13975886 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
13975885 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
13975786 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
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| T |
13975785 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
13975738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861052
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
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| T |
45860805 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
45860904 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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| T |
45860905 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
45861004 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
45861005 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
45861052 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954906
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Q |
| |
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|
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| T |
13955153 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13955054 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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| T |
13955053 |
taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
13954954 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13954953 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
13954906 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859040
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
15859287 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
15859188 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15859187 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
15859089 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15859088 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158034
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| Q |
16 |
acatcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaa |
115 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
116 |
tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
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|
|
| T |
51158182 |
ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
51158084 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51158083 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030163
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
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| T |
12030410 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat |
12030311 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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| T |
12030310 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
12030212 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
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| T |
12030211 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12264981 - 12264710
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183 |
Q |
| |
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|
| T |
12264981 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
12264883 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
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| T |
12264882 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc |
12264783 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12264782 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12264710 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050057
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2049810 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat |
2049909 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
2049910 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
2050008 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2050009 |
tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaattt |
2050057 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 13838908 - 13839141
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Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
13838908 |
gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag |
13839007 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
13839008 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgc |
13839106 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13839107 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
13839141 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 49232575 - 49232774
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| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49232575 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
49232674 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49232675 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912516
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| Q |
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catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
17912744 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17912644 |
caactacaacata--tcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
17912547 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17912546 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
17912516 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12902207 - 12902008
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |
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|
| T |
12902207 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga |
12902108 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12902107 |
gcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
12902008 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 18911132 - 18911331
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| Q |
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255 |
Q |
| |
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|
| T |
18911132 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
18911231 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18911232 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18911331 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 22275348 - 22275547
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || || ||||||||||||| |
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|
| T |
22275348 |
tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaaga |
22275447 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275448 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 25058878 - 25059077
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158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
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|
| T |
25058878 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
25058977 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatta---catgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25058978 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctt |
25059077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468258
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||| | | ||||||||| ||| |||||| |||||||| | |
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|
| T |
15468596 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt |
15468497 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaat |
214 |
Q |
| |
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||| | ||| || | || |||| ||||| || | ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |
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| T |
15468496 |
caatcaaaacatatca-aatttcatcaattaagtataatt-tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccat |
15468399 |
T |
 |
| Q |
215 |
tatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaa |
314 |
Q |
| |
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| T |
15468398 |
aatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaa |
15468299 |
T |
 |
| Q |
315 |
aat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15468298 |
aatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15468258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1467856 - 1467657
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| Q |
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1467856 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1467757 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1467756 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1467657 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
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| Q |
89 |
tcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-tttg-aa |
186 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
54651529 |
tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtataatt-tcataacttaacatttatacatactttgcaa |
54651626 |
T |
 |
| Q |
187 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc |
286 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
54651627 |
catgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacc |
54651726 |
T |
 |
| Q |
287 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
54651727 |
cattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Target Start/End: Original strand, 5228451 - 5228650
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| Q |
157 |
ctcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaag |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5228451 |
ctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaag |
5228550 |
T |
 |
| Q |
255 |
agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5228551 |
agcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacct |
5228649 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
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| Q |
187 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc |
286 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897130 |
catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc |
18897031 |
T |
 |
| Q |
287 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897030 |
cattttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18896962 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 12811980 - 12812179
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
12811980 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaaga |
12812079 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12812080 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12812179 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11986362 - 11986182
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| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
184 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
11986362 |
aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcactatttgagcacaatt-tcataacttgacattaatacatacttt |
11986265 |
T |
 |
| Q |
185 |
aa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11986264 |
aaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
11986182 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449254
Alignment:
| Q |
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2449385 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
2449286 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
2449285 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
2449254 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 44229124 - 44229268
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
44229124 |
tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
44229223 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac |
300 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44229224 |
gcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac |
44229268 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16744262 - 16744131
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| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
16744262 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggata |
16744163 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16744162 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
16744131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| | | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47984650 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47984749 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
47984750 |
caacaacaacttag |
47984763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
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Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| | | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47993937 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47994036 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
47994037 |
caacaacaacttag |
47994050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 17 - 130
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| | | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48003224 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48003323 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
48003324 |
caacaacaacttag |
48003337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 17 - 130
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| | | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48012510 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48012609 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
48012610 |
caacaacaacttag |
48012623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41661729 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattt |
41661812 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
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| Q |
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31412416 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
31412333 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
11638465 |
T |
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| Q |
320 |
catgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8268683 |
catgattatgataataactaacccccttacctt |
8268651 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
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| Q |
320 |
catgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8275783 |
catgattatgataataactaacccccttacctt |
8275751 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactta |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15876135 |
aacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaactta |
15876179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
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| Q |
83 |
ataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagca |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
16880188 |
ataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagca |
16880256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatt |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
47784851 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43333
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42997 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat |
43096 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43097 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43196 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-caaatgcaaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43197 |
tcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa |
43296 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43297 |
attacatgtttgtgatagtaactaacccccttacctt |
43333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 39242 - 39441
Alignment:
| Q |
158 |
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39242 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
39341 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39342 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
39441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851881
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21852217 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat |
21852118 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21852117 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca |
21852018 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
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|
| T |
21852017 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
21851918 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21851917 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
21851881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844490
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844824 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat |
21844725 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21844724 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
21844625 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21844624 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
21844525 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacc |
350 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21844524 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacc |
21844490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674308
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16674644 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
16674545 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16674544 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
16674445 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16674444 |
acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
16674345 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
16674344 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
16674308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30121060
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30120722 |
catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
30120821 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
30120822 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
30120921 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
30120922 |
acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaa |
30121021 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30121022 |
attacacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
30121060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774175
Alignment:
| Q |
21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac |
120 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
6774505 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
6774406 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
220 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6774405 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
6774307 |
T |
 |
| Q |
221 |
caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
320 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6774306 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaattac |
6774207 |
T |
 |
| Q |
321 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6774206 |
atgattatgataatcactaacccccttacctt |
6774175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549316
Alignment:
| Q |
21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac |
120 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| |
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|
| T |
24548986 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
24549085 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
220 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24549086 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
24549184 |
T |
 |
| Q |
221 |
caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
320 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24549185 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac |
24549284 |
T |
 |
| Q |
321 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24549285 |
atgattatgataatcactaacccccttacctt |
24549316 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222754
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
222943 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
222844 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
222843 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
222754 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736377
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
736566 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
736467 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
736466 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
736377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860272
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
860461 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
860362 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
860361 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
860272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373484
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |
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| T |
43373731 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
43373632 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43373631 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta |
43373533 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
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|
| T |
43373532 |
tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaattt |
43373484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193732
Alignment:
| Q |
16 |
acatcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
16193980 |
acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa |
16193881 |
T |
 |
| Q |
116 |
tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
|
| |||||||| || | | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16193880 |
ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt |
16193782 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16193781 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
16193732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Original strand, 16195298 - 16195569
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
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| T |
16195298 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
16195396 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |
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| T |
16195397 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatc |
16195496 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
16195497 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttacctt |
16195569 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24929040 - 24928807
Alignment:
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130 |
Q |
| |
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|
| T |
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gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttag |
24928941 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
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| T |
24928940 |
c-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
24928842 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24928841 |
atacaaacatataatcacagttggagcacgaattt |
24928807 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22006375 - 22006176
Alignment:
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255 |
Q |
| |
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| T |
22006375 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22006276 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22006275 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
22006176 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404991
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116 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||| |||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| | |
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|
| T |
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catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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| T |
16405135 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16405040 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
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| T |
16405039 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13721045 - 13720846
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255 |
Q |
| |
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| T |
13721045 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
13720946 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13720846 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 17345584 - 17345816
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130 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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230 |
Q |
| |
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| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
17345683 |
ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
17345781 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17345782 |
atataaacataacatcacagttagagcacgaattt |
17345816 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16873168 - 16872969
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16873168 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
16873069 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 271477 - 271278
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255 |
Q |
| |
|
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|
| T |
271477 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
271377 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
271278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 644443 - 644642
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255 |
Q |
| |
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| T |
644443 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 830178 - 830377
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
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|
| T |
830178 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
830277 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
830278 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
830377 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13662382 - 13662183
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13662382 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
13662283 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13662282 |
gcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13662183 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22088911 - 22088712
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22088911 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22088812 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22088811 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
22088712 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15319276 - 15319077
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| Q |
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tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15319276 |
tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15319176 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15319077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15499645 - 15499446
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15499645 |
tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga |
15499546 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15499545 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907230
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catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
22907476 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
22907377 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22907376 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
22907279 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22907278 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
22907230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238334
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
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T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
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caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661264
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
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|
| T |
24661395 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
24661296 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
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|
|
| T |
24661295 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
24661264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685793
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43685662 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
43685761 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
43685762 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
43685793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691909
Alignment:
| Q |
145 |
tttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691970 |
tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
691909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011741
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
26011656 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
26011741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22497389 - 22497209
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatt-tagcacaatactcataacttaacatttttacatatt- |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||| ||| || || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
22497389 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagca-caattcaacaattagagcacaat--tcacaatatatcattttcacatatta |
22497293 |
T |
 |
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22497292 |
tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
22497209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 5854681 - 5854722
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5854681 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
5854722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 38533716 - 38533757
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38533716 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
38533757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45465227 - 45465126
Alignment:
| Q |
166 |
taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
263 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
45465227 |
taacattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaat |
45465128 |
T |
 |
| Q |
264 |
tt |
265 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
45465127 |
tt |
45465126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 247
Target Start/End: Original strand, 15933443 - 15933527
Alignment:
| Q |
165 |
ttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15933443 |
ttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca |
15933527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13573012
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
13572676 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13572775 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
13572776 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca |
13572875 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13572876 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
13572975 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13572976 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
13573012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13910939
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13911277 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
13911178 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaactt-aggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13911177 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
13911078 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa |
315 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
13911077 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa |
13910978 |
T |
 |
| Q |
316 |
att--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13910977 |
attacacatgattatgataatcaataacccccttacctt |
13910939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989746
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10989410 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
10989509 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10989510 |
ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
10989608 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
10989609 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaaa |
10989708 |
T |
 |
| Q |
317 |
t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10989709 |
ttatacatgattatgataatcactaacccccatacctt |
10989746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437794
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
2437457 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat |
2437556 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2437557 |
taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
2437656 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2437657 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
2437756 |
T |
 |
| Q |
317 |
t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2437757 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
2437794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478879
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16479213 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat |
16479114 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|| || |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16479113 |
taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16479015 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16479014 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
16478915 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16478914 |
ttaaatgattatgataatcactaacccccttacctt |
16478879 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253761
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18254098 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
18253999 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253998 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18253900 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18253899 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
18253800 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253799 |
attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt |
18253761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292372
Alignment:
| Q |
23 |
caatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaa |
122 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
25292595 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga |
25292496 |
T |
 |
| Q |
123 |
caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
222 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
25292495 |
caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca |
25292397 |
T |
 |
| Q |
223 |
aatcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25292396 |
attcatacatacaaacatatcatca |
25292372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481047
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
47481294 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
47481195 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47481194 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
47481096 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
47481095 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
47481047 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
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Target Start/End: Original strand, 16211780 - 16212013
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Q |
| |
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|
| T |
16211780 |
gaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag |
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T |
 |
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131 |
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230 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |
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| T |
16211880 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
16211978 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16211979 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
16212013 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321263
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17 |
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116 |
Q |
| |
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| T |
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catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaa-caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaa |
213 |
Q |
| |
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| T |
13321114 |
caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
13321211 |
T |
 |
| Q |
214 |
ttatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13321212 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
13321263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052896
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17 |
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116 |
Q |
| |
|
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
36052766 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
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| T |
36052767 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta |
36052862 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
36052863 |
tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacag |
36052896 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037030
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| Q |
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116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |
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| T |
13037277 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13037177 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta |
13037079 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13037078 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
13037030 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580755
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121 |
Q |
| |
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| T |
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tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
11580898 |
T |
 |
| Q |
122 |
acaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
221 |
Q |
| |
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||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11580897 |
acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
11580799 |
T |
 |
| Q |
222 |
aaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11580798 |
aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15950908 - 15950709
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| Q |
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255 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15950809 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|
| T |
15950808 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15950709 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18980138 - 18979939
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18980138 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18980039 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18980038 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18979939 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 13758509 - 13758708
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255 |
Q |
| |
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|
| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
13758608 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13758609 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13758708 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15760231 - 15760032
Alignment:
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158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15760132 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15760131 |
gcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060213
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catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
3059966 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
3060065 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| || |||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
3060066 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta |
3060164 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3060165 |
tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7822967 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7830178 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7830278 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27101654 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
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255 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 27176572 - 27176771
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| |
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 |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38783846 - 38783647
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| |
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| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38783746 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
38783647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 15927707 - 15927906
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
15927707 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
15927806 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15927807 |
gcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15927906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14251015 - 14250816
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
14251015 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
14250916 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14250915 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttacctt |
14250816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293263
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
7293017 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
7293116 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7293117 |
caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
7293214 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7293215 |
ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
7293263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622623
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
48622758 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca |
48622659 |
T |
 |
| Q |
281 |
tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48622658 |
tcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaa |
48622623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516474
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11516343 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
11516442 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
11516443 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
11516474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441580
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15441711 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
15441612 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
15441611 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
15441580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262145
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30262276 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
30262177 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
30262176 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
30262145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
| Q |
272 |
aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862174 |
aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15862257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10000455 - 10000325
Alignment:
| Q |
187 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||| ||| || | |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10000455 |
catgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaa-acaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacc |
10000357 |
T |
 |
| Q |
287 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt |
318 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
10000356 |
catttttatacaacatgagaagatgcaaaatt |
10000325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 318
Target Start/End: Original strand, 16418731 - 16418798
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt |
318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
16418731 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt |
16418798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 296003
Alignment:
| Q |
160 |
ataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
296087 |
ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataaca |
296003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914928
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16915013 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
16914928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 13377691 - 13377758
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13377691 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
13377758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 28722274 - 28722357
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
28722274 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt |
28722357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611555
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9611470 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9611555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9723987 - 9723946
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9723987 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
9723946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839126
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| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9839041 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9839126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Original strand, 28390476 - 28390561
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttga |
267 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28390476 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttga |
28390561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 46474068 - 46474109
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46474068 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
46474109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010177
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
27009841 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
27009940 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
27009941 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca |
27010040 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27010041 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
27010140 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27010141 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
27010177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777907
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18778244 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
18778145 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
18778144 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
18778045 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18778044 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
18777945 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777944 |
ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
18777907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426965
Alignment:
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25426628 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25426727 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
25426728 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25426827 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25426828 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
25426927 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25426928 |
ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
25426965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443312
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
43443547 |
caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
43443448 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43443447 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccattttcatataacatgagaatatgcaatt |
43443348 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43443347 |
acacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
43443312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12711
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12374 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
12473 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12474 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
12573 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12574 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaa |
12673 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12674 |
ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366396
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22366733 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat |
22366634 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|
| T |
22366633 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
22366534 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22366533 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
22366434 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22366433 |
ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
22366396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199900
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4200237 |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4200137 |
caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
4200038 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4200037 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaa |
4199938 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4199937 |
ttacacatgattatgataatccctaacccccttacctt |
4199900 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500236
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19499899 |
catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19499998 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19499999 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19500098 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19500099 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
19500198 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19500199 |
ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
19500236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073510
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21073847 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
21073748 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
21073747 |
taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
21073648 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21073647 |
acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
21073548 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073547 |
ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21073510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 69 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188201
Alignment:
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69 |
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168 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
29188483 |
atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat |
29188385 |
T |
 |
| Q |
169 |
catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgac |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |
|
|
| T |
29188384 |
catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc |
29188285 |
T |
 |
| Q |
269 |
atgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29188284 |
atgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattataataatcactaacccccttacctt |
29188201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507196
Alignment:
| Q |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23506965 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
23507064 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23507065 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
23507163 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca |
249 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23507164 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca |
23507196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531083
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
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|||||||||| || ||||||| | |||| |||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
18531330 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
18531231 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18531230 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18531132 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
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|
| T |
18531131 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
18531083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053849
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
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|
| T |
22054096 |
catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
22053997 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22053996 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
22053898 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22053897 |
tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
22053849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 35791287 - 35791016
Alignment:
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85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
35791287 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
35791189 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
35791188 |
gaaacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc |
35791089 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|
| T |
35791088 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
35791016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11212253 - 11211983
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| | || || | ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
11212253 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactacttgagtataatt-tcataacttaacatttatacacacttt |
11212156 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
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|
| T |
11212155 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatc |
11212056 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11212055 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
11211983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182578
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
27182810 |
catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
27182711 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182710 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta |
27182612 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27182611 |
tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacag |
27182578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 34939292 - 34939524
Alignment:
| Q |
31 |
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130 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
34939292 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttag |
34939390 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34939391 |
ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
34939489 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34939490 |
atacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
34939524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 7425463 - 7425662
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7425463 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga |
7425562 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7425563 |
gcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7425662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17471705 - 17471506
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
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| T |
17471705 |
tcattacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
17471606 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17471605 |
gcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
17471506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 23514700 - 23514899
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23514700 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
23514799 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23514800 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
23514899 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1219637 - 1219438
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| | ||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1219637 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1219538 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1219537 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
1219438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10778087 - 10777888
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10778087 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
10777988 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10777987 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctt |
10777888 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21932498 - 21932299
Alignment:
| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21932498 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
21932399 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21932398 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21932299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21938668 - 21938469
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21938668 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
21938569 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21938568 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21938469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 35582175 - 35582374
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35582175 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
35582274 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35582275 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
35582374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36989887 - 36989688
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
36989887 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctaga |
36989788 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36989787 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
36989688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22883201 - 22883006
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22883201 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22883102 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaaccccctta |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22883101 |
gcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta |
22883006 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623216
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20623085 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
20623184 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
20623185 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
20623216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233544
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| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21233675 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
21233576 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21233575 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
21233544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 32950761 - 32950942
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85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataac-ttaacatttttacata-tt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||| ||||||| || || ||| |||||| || |
|
|
| T |
32950761 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagta-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataactttgacctttatacatactt |
32950858 |
T |
 |
| Q |
183 |
tg-aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32950859 |
tgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
32950942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 23328791 - 23328895
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
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 |
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acctt |
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| |
|
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|
|
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acctt |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 24616395 - 24616499
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24616395 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24616494 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24616495 |
acctt |
24616499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 24712771 - 24712875
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24712771 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24712870 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24712871 |
acctt |
24712875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 24745789 - 24745893
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24745789 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24745888 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24745889 |
acctt |
24745893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900422
Alignment:
| Q |
135 |
aattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatac |
234 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25900552 |
aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
25900453 |
T |
 |
| Q |
235 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
25900452 |
aaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
25900422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536444
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
16536313 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata |
16536412 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16536413 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
16536444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052991
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37052860 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
37052959 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
37052960 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
37052991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23981625 - 23981516
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
23981625 |
tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattaga |
23981526 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
23981525 |
gcacgaattt |
23981516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21310794 - 21310709
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21310794 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
21310709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5450928 - 5450861
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5450928 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
5450861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26559898 - 26559815
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26559898 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaattt |
26559815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 19862371 - 19862456
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
19862371 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19862456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 21617083 - 21617124
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21617083 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
21617124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 35 - 369
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
35 |
catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
134 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
234 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
235 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagc-aatgcaaaa |
333 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
334 |
ttacatgattttgataataactaacccccttacctt |
369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64439
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
64780 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
64681 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
64680 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
64581 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatc-----aaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatg |
311 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
64580 |
tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatg |
64481 |
T |
 |
| Q |
312 |
c-aaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
64480 |
caaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
64439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108084
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
107747 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
107846 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
107847 |
taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
107945 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
107946 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
108045 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108046 |
attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt |
108084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072304
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
5072640 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
5072541 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
5072540 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
5072441 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
5072440 |
acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaa |
5072341 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5072340 |
attacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
5072304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601052
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
18601370 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
18601271 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18601270 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
18601171 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa |
315 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18601170 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
18601071 |
T |
 |
| Q |
316 |
attacatgattgtgataat |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18601070 |
attacatgattgtgataat |
18601052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228146
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22227809 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22227908 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22227909 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22228007 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22228008 |
tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
22228107 |
T |
 |
| Q |
317 |
---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22228108 |
attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
22228146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232843
Alignment:
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17 |
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116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22232506 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22232605 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232606 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22232704 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22232705 |
tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
22232804 |
T |
 |
| Q |
317 |
---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232805 |
attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
22232843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116589
Alignment:
| Q |
21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcaca-tctcaaatcaa |
119 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | |||||| || |
|
|
| T |
2116258 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa |
2116357 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
219 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2116358 |
caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
2116456 |
T |
 |
| Q |
220 |
tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2116457 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaaatta |
2116556 |
T |
 |
| Q |
320 |
catgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2116557 |
catgattatgataatcactaacccctttacctt |
2116589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 352
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051757
Alignment:
| Q |
83 |
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182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45051489 |
ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt |
45051587 |
T |
 |
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45051588 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc |
45051687 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45051688 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatcacatgattatgataaagactaacccccttacctt |
45051757 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931592
Alignment:
| Q |
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116 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20931345 |
catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
20931444 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20931445 |
taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20931543 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20931544 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20931592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913277
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
20913037 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat |
20913129 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20913130 |
taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20913228 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20913229 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20913277 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394469
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
41394222 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca |
41394321 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394322 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta |
41394420 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
41394421 |
tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
41394469 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893657
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
20893889 |
catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc |
20893790 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20893789 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta |
20893691 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20893690 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
20893657 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18059875 - 18059676
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| Q |
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18059875 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18059776 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18059676 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445910
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | ||| | |
|
|
| T |
20445679 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20445778 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445779 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20445877 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca |
249 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20445878 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca |
20445910 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531667
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | ||| | |
|
|
| T |
20531444 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20531543 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531544 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20531642 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacata |
241 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531643 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
20531667 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 17004777 - 17004976
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
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17004777 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
17004876 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17004877 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 46523528 - 46523726
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| || | |||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
46523528 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
46523627 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46523628 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
46523726 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 17148706 - 17148898
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
17148706 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
17148805 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaaccccc |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17148806 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38055208 - 38055009
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || |||||||||||| || | |
|
|
| T |
38055208 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaa |
38055109 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38055108 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
38055009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844484
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |
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|
| T |
37844714 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
37844615 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactca-taacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| || ||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
37844614 |
taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
37844516 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37844515 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
37844484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19962616 - 19962417
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| ||| || | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19962616 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga |
19962517 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19962516 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19962417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 22035681 - 22035785
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22035681 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
22035780 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
22035781 |
acctt |
22035785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7640956 - 7640852
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7640956 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
7640857 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
7640856 |
acctt |
7640852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 247
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452721
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
51452608 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
51452707 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |
|
|
| T |
51452708 |
caaacatatcatca |
51452721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22143470 - 22143361
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat--catgcatacaaacataacatcacagcaag |
254 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |
|
|
| T |
22143470 |
tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatca-caaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttag |
22143372 |
T |
 |
| Q |
255 |
agcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22143371 |
agcacgaattt |
22143361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 25093926 - 25093967
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25093926 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
25093967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886576
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19886913 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19886814 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
19886813 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19886714 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19886713 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
19886614 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886613 |
ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19886576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396669
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
17396916 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
17396817 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
17396816 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
17396717 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17396716 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
17396669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341420
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
24341652 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
24341553 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341552 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta |
24341454 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24341453 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
24341420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794720
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
19794967 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
19794868 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19794867 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
19794769 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19794768 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
19794720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462985
Alignment:
| Q |
22 |
tcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaaca |
121 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
462743 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
462842 |
T |
 |
| Q |
122 |
acaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
221 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
462843 |
acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc |
462941 |
T |
 |
| Q |
222 |
aaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
462942 |
aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
462985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982457
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
36982704 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
36982605 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
36982604 |
caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta |
36982506 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36982505 |
tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
36982457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507860
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7508107 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat |
7508008 |
T |
 |
| Q |
116 |
tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7508007 |
t-aacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
7507910 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7507909 |
atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaattt |
7507860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627329
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||| | || || | ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
20627576 |
catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat |
20627477 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20627476 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20627378 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20627377 |
tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20627329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265406
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||| | | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || | |
|
|
| T |
25265653 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
25265554 |
T |
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| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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| T |
25265553 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
25265455 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
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25265454 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt |
25265406 |
T |
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Target: chr2; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642989
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Q |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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| T |
43643120 |
taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43643022 |
T |
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| Q |
217 |
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249 |
Q |
| |
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| T |
43643021 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891489
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116 |
Q |
| |
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catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
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T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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| T |
8891342 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta |
8891440 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
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| T |
8891441 |
tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt |
8891489 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
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Target Start/End: Original strand, 12728531 - 12728730
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Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 16935732 - 16935931
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Q |
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T |
 |
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256 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
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Q |
| |
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T |
 |
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Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
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Target Start/End: Complemental strand, 23778162 - 23777963
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Q |
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T |
 |
| Q |
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352 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 34824614 - 34824813
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255 |
Q |
| |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
256 |
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352 |
Q |
| |
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34824714 |
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34824813 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
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255 |
Q |
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3798720 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
3798621 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|
| T |
3798620 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 8943985 - 8944184
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255 |
Q |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
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T |
 |
| Q |
256 |
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352 |
Q |
| |
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| T |
8944085 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
8944184 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12635985 - 12635786
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255 |
Q |
| |
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| T |
12635985 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
12635886 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12635885 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcatacaacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12635786 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11231455 - 11231256
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255 |
Q |
| |
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| T |
11231455 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|
| T |
11231355 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
11231256 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22513302 - 22513103
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
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|
| T |
22513302 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22513203 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22513202 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24685898 - 24685699
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255 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
24685799 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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24685798 |
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24685699 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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255 |
Q |
| |
|
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|
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28775924 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
28775825 |
T |
 |
| Q |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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28775824 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
28775725 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12641759 - 12641560
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255 |
Q |
| |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
12641660 |
T |
 |
| Q |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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| T |
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 |
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Q |
| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23774370 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaaccccctt |
23774469 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
23774470 |
acctt |
23774474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689417
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| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19689548 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
19689449 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
19689448 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
19689417 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820318
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| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23820187 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
23820286 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
23820287 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
23820318 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906456
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| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14906587 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
14906488 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
14906487 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
14906456 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
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Target Start/End: Original strand, 21142034 - 21142178
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158 |
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255 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
21142034 |
tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
21142133 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21142134 |
gcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac |
21142178 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5888652 - 5888585
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| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt |
318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
5888652 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt |
5888585 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015258
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| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
20015127 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg |
20015226 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
20015227 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
20015258 |
T |
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Target: chr2; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 68154 - 68221
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247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
68154 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
68221 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
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Target Start/End: Original strand, 24277925 - 24278008
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| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24277925 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
24278008 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Target Start/End: Complemental strand, 16292981 - 16292940
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85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16292981 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
16292940 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884933
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| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
24884848 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
24884933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36430
Alignment:
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catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36093 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat |
36192 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
36193 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
36292 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
36293 |
acatcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaaa |
36392 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36393 |
ttacacatgattatgataatcattaacccccttacctt |
36430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48845
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
48598 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
48697 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48698 |
tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48796 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48797 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
48845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 154124 - 153925
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
154124 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
154025 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154024 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
153925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169830
Alignment:
| Q |
230 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattg |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
169951 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattatacatgatta |
169852 |
T |
 |
| Q |
328 |
tgataataactaacccccttac |
349 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
169851 |
tgataatcactaacccccttac |
169830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175901
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25175563 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25175662 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
25175663 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25175762 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-caaatgcaaa |
315 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25175763 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa |
25175862 |
T |
 |
| Q |
316 |
at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175863 |
attatacatgattatggtaatcactaacccccttacctt |
25175901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653898
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27654235 |
catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat |
27654136 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
27654135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
27654036 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27654035 |
acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
27653936 |
T |
 |
| Q |
317 |
tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27653935 |
ttacacatgattatgataatcactaaccccctcacctt |
27653898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825678
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16826006 |
catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
16825907 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatca--tacaat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
16825906 |
taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac |
16825807 |
T |
 |
| Q |
215 |
tatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaa |
314 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16825806 |
taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaa |
16825707 |
T |
 |
| Q |
315 |
aatt--acatgattgtgataataactaac |
341 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
16825706 |
aattacacatgattatgataatcactaac |
16825678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650022
Alignment:
| Q |
21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac |
120 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
1650352 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
1650253 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
220 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650252 |
cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
1650154 |
T |
 |
| Q |
221 |
caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
320 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1650153 |
caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac |
1650054 |
T |
 |
| Q |
321 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650053 |
atgattatgataaagactaacccccttacctt |
1650022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626134
Alignment:
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21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac |
120 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||| |
|
|
| T |
14626377 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac |
14626278 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626277 |
aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
14626179 |
T |
 |
| Q |
221 |
caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626178 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
14626134 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009455
Alignment:
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || | |
|
|
| T |
35009702 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
35009603 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009602 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
35009504 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35009503 |
tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaattt |
35009455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 23153461 - 23153694
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130 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||| ||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23153461 |
gaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
23153560 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23153561 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
23153659 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23153660 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
23153694 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 16232031 - 16232230
Alignment:
| Q |
158 |
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255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16232031 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16232130 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232131 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16232230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1657996 - 1657764
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31 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1657996 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttag |
1657898 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1657897 |
ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
1657799 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1657798 |
atccaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
1657764 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 301
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666157
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatgcatacttt |
29666038 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |
|
|
| T |
29666039 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatc |
29666138 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaaca |
301 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29666139 |
accccattttcatacaaca |
29666157 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 1556144 - 1556343
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1556144 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1556243 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1556244 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
1556343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 10488838 - 10489037
Alignment:
| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10488838 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
10488937 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488938 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
10489037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16376490 - 16376291
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16376490 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16376391 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16376390 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16376291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16383814 - 16383615
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16383814 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16383715 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16383714 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16383615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22225855 - 22225656
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22225855 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaaga |
22225756 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22225755 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt |
22225656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18086940 - 18086741
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
18086940 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
18086841 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18086840 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttacctt |
18086741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 23977908 - 23978107
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158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23977908 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
23978007 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23978008 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttacctt |
23978107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16556256 - 16556057
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
16556256 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga |
16556157 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16556156 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16556057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16632812 - 16632613
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
16632812 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga |
16632713 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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| T |
16632712 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16632613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 265
Target Start/End: Original strand, 15862595 - 15862718
Alignment:
| Q |
142 |
caatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacata |
241 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862595 |
caattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata |
15862694 |
T |
 |
| Q |
242 |
acatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15862695 |
acatcacagttagagcacgaattt |
15862718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 352
Target Start/End: Original strand, 19610159 - 19610356
Alignment:
| Q |
160 |
ataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
257 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19610159 |
ataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagc |
19610258 |
T |
 |
| Q |
258 |
acgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19610259 |
acgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19610356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251484
Alignment:
| Q |
191 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccatt |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22251648 |
taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt |
22251549 |
T |
 |
| Q |
291 |
ttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22251548 |
ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt |
22251484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 19299376 - 19299575
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| ||| || | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19299376 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga |
19299475 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19299476 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19299575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13620911 - 13620712
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
13620911 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
13620812 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13620811 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt |
13620712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29869798 - 29869694
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29869798 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaaccccctt |
29869699 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
29869698 |
acctt |
29869694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Original strand, 27740907 - 27741021
Alignment:
| Q |
86 |
acatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt-- |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
27740907 |
acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatacttcg |
27741004 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaacatgtaatttcacc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
27741005 |
aaacatgtaatttcacc |
27741021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751672
Alignment:
| Q |
196 |
tcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaattt |
27751672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 19854319 - 19854402
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19854319 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
19854402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18629693 - 18629608
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
18629693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
18629608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14626076 - 14626045
Alignment:
| Q |
321 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626076 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
14626045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Original strand, 29605614 - 29605672
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacata |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29605614 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata |
29605672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16887877 - 16887792
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16887877 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt |
16887792 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 18399005 - 18399046
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18399005 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
18399046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17083280 - 17083200
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
263 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
17083280 |
tgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
17083200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31593
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31928 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
31829 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaactt-aggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31828 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact |
31729 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa |
315 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
31728 |
aacatcaattcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa |
31629 |
T |
 |
| Q |
316 |
att--acatgattgtgataataactaacccccttac |
349 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31628 |
attacacatgattatgataatcactaacccccttac |
31593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128200
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
128431 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt |
128332 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
128331 |
-aacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
128234 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
128233 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
128200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21031
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21367 |
catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat |
21268 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21267 |
taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
21169 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21168 |
tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
21069 |
T |
 |
| Q |
317 |
t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21068 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 13977
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14312 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat |
14213 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14212 |
tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
14114 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14113 |
tcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacg-atttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
14015 |
T |
 |
| Q |
317 |
t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14014 |
ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9266
Alignment:
| Q |
21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac |
120 |
Q |
| |
|
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| T |
9596 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
9497 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
220 |
Q |
| |
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| T |
9496 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
9398 |
T |
 |
| Q |
221 |
caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
320 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
9397 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
9298 |
T |
 |
| Q |
321 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
9297 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
9266 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16164
Alignment:
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120 |
Q |
| |
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|
| T |
16494 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
16395 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
220 |
Q |
| |
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| T |
16394 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
16296 |
T |
 |
| Q |
221 |
caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
320 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16295 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac |
16196 |
T |
 |
| Q |
321 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
16164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
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Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5130
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5466 |
catcatcaatccatgaatatgcaa-cccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
5368 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|
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| T |
5367 |
taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
5269 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
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|
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| T |
5268 |
tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaa |
5169 |
T |
 |
| Q |
317 |
---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5168 |
attgtacatgattatgataataactaactcccttacctt |
5130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 3722 - 4060
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catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3722 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
3821 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttt-tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
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| T |
3822 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
3920 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa |
315 |
Q |
| |
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| T |
3921 |
atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa |
4020 |
T |
 |
| Q |
316 |
a---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4021 |
aattgtacatgattatgataataactaaaccccttacctt |
4060 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0529 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:
Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3299
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atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaatcaa |
119 |
Q |
| |
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|
| T |
2966 |
atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa |
3065 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
219 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3066 |
caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
3164 |
T |
 |
| Q |
220 |
tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat-- |
317 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3165 |
tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattg |
3264 |
T |
 |
| Q |
318 |
tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3265 |
tacataattatgataataattaacccccttacctt |
3299 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 123 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1220
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222 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1450 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
1351 |
T |
 |
| Q |
223 |
aatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattaca |
321 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
1350 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaattaca |
1251 |
T |
 |
| Q |
322 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1250 |
tgattgtgataataactaacccccctacctt |
1220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 113 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13242
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212 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13480 |
aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
13382 |
T |
 |
| Q |
213 |
attatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13381 |
attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatga |
13282 |
T |
 |
| Q |
313 |
aaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13281 |
aaaattacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
13242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 265
Target Start/End: Original strand, 5551 - 5776
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5551 |
aacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattc |
5650 |
T |
 |
| Q |
140 |
accaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaaca |
239 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5651 |
accaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaaca |
5750 |
T |
 |
| Q |
240 |
taacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
5751 |
taacatcaaagttggagcacgaattt |
5776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3598
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19 |
tcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
3843 |
tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
3744 |
T |
 |
| Q |
119 |
acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3743 |
acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
3645 |
T |
 |
| Q |
219 |
atcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3644 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
3598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1371
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1124 |
catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
1223 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1224 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1322 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1323 |
ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
1371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12360
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
12115 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt |
12214 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12215 |
--acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta |
12311 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12312 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaattt |
12360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9109
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catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8878 |
catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
8977 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
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| T |
8978 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
9076 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca |
249 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9077 |
tcatcgattcatgcatacaaacataacatcaca |
9109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48434
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catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
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Q |
| |
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|
| T |
48187 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
48286 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
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Q |
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| T |
48287 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48385 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48386 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattt |
48434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6080
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6326 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt |
6227 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6226 |
-aacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
6129 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6128 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
6080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 972
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1218 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt |
1119 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1118 |
-aacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1021 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1020 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148953
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||| | || || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
148721 |
catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
148820 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
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||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
148821 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
148919 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
148920 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
148953 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9096
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |
|
|
| T |
8849 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt |
8948 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8949 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
9047 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9048 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaattt |
9096 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 53508 - 53575
Alignment:
| Q |
181 |
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247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
53508 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatca |
53575 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19453
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19206 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
19305 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19306 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
19404 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19405 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
19453 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21537
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
21290 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
21389 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21390 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
21488 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21489 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
21537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36929
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||| |
|
|
| T |
37176 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc |
37077 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37076 |
caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta |
36978 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36977 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
36929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34476
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34724 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat |
34625 |
T |
 |
| Q |
116 |
tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34624 |
tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
34526 |
T |
 |
| Q |
216 |
atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34525 |
atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
34476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41895
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || |||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || | |
|
|
| T |
41648 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
41747 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41748 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
41846 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41847 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
41895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123196
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | || || |
|
|
| T |
123427 |
catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc |
123328 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123327 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
123229 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca |
249 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
123228 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca |
123196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5092
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
5324 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc |
5225 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5224 |
taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta |
5126 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
5125 |
tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacag |
5092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 171919 - 172137
Alignment:
| Q |
31 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
171919 |
gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag |
172018 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
172019 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc |
172117 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
172118 |
atacaaacatatcatcacag |
172137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 177622 - 177840
Alignment:
| Q |
31 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
177622 |
gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag |
177721 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
177722 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc |
177820 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
177821 |
atacaaacatatcatcacag |
177840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26663 - 26431
Alignment:
| Q |
32 |
aatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagg |
131 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26663 |
aatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagc |
26564 |
T |
 |
| Q |
132 |
agaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgca |
231 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
26563 |
a-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgca |
26465 |
T |
 |
| Q |
232 |
tacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26464 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
26431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8196
Alignment:
| Q |
134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
8327 |
aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata |
8228 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8227 |
caaacataacatcacagttagagcacgaattt |
8196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 13574 - 13753
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13574 |
aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
13672 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
13673 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt |
13753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 247691 - 247458
Alignment:
| Q |
31 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
247691 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
247592 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
247591 |
ca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgc |
247493 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
247492 |
atacaaacatatcattacagttggagcacgaattt |
247458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34275 - 34076
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
34275 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaaga |
34176 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34175 |
gcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacct |
34077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Original strand, 45098 - 45369
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
45098 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcaaaacttgacatttatacatacttt |
45195 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
45196 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatc |
45295 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaac-atgagcaaatgcaa-aatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45296 |
aacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt |
45369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 301
Target Start/End: Original strand, 54484 - 54700
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
54484 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
54581 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
282 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
54582 |
gaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatc |
54681 |
T |
 |
| Q |
283 |
aacccattttcatacaaca |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54682 |
aacccattttcatacaaca |
54700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1692 - 1493
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1692 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagt |
1593 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1592 |
gcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 31448 - 31647
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31448 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
31547 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31548 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
31647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 39785 - 39934
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39785 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaaga |
39884 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39885 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag |
39934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 272039 - 272257
Alignment:
| Q |
31 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
272039 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag |
272138 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
272139 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattc |
272237 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacag |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
272238 |
atacaaacatatcattacag |
272257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 69524 - 69565
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
69524 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
69565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1500 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:
Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1432
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
1631 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
1532 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1531 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41976
Alignment:
| Q |
21 |
atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatc-ataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaa |
119 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| | || | ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||| || |
|
|
| T |
41733 |
atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatc-atctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaa |
41831 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41832 |
caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatca |
41930 |
T |
 |
| Q |
220 |
tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41931 |
tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
41976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:
Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 550
Alignment:
| Q |
31 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| || || ||||||||||||| |||| |||||| | || || |||| ||||||| |
|
|
| T |
783 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttag |
684 |
T |
 |
| Q |
131 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
230 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
683 |
ca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
585 |
T |
 |
| Q |
231 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
584 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:
Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 29301 - 29500
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | || |||| || |||| ||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29301 |
tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
29400 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29401 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
29500 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
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Target: scaffold0383; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 2531 - 2731
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||||| ||||||| | || ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
2531 |
tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaaga |
2630 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa----ttacatgattgtgataataactaacccccttacct |
351 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2631 |
gcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
2730 |
T |
 |
| Q |
352 |
t |
352 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
2731 |
t |
2731 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
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Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
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135 |
aattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51328 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac |
51229 |
T |
 |
| Q |
235 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51228 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
51198 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
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Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 56295 - 56115
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aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
184 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
56295 |
aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
56198 |
T |
 |
| Q |
185 |
aa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
56197 |
aaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
56115 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0191 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:
Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7573 - 7374
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158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
7573 |
tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
7474 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7473 |
gcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7374 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
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Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
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| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10456 |
tcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaaga |
10357 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10356 |
gcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
10296 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
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Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
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Target Start/End: Original strand, 3257 - 3437
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| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||| ||||||||| | |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
3257 |
aacatcaattgaacaataatcacatatcctctcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagtacaatt-tcataacttgatatttatacatacttt |
3354 |
T |
 |
| Q |
184 |
gaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3355 |
gaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaattt |
3437 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
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Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
48514 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat |
48613 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaac |
123 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
48614 |
taacaac |
48620 |
T |
 |
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Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
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| Q |
135 |
aattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
89600 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
89501 |
T |
 |
| Q |
235 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
89500 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
89470 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0892 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
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Target: scaffold0892; HSP #1
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| | | || | |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3577 |
tttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttca |
3676 |
T |
 |
| Q |
281 |
tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3677 |
tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa |
3712 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
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Target: scaffold0017; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 54038 - 54173
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| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || | | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
54038 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca |
54137 |
T |
 |
| Q |
281 |
tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
54138 |
tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa |
54173 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
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Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
115 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat |
16 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaac |
123 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
15 |
taacaac |
9 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
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Target: scaffold0183; HSP #1
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6831 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
6930 |
T |
 |
| Q |
348 |
acctt |
352 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
6931 |
acctt |
6935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
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Target: scaffold0092; HSP #1
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243 |
catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta |
339 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10778 |
catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta |
10679 |
T |
 |
| Q |
340 |
acccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
10678 |
acccccttacctt |
10666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
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Target: scaffold0078; HSP #1
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| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
37328 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc |
37229 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37228 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
37131 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
37130 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
37082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22656 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
22755 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22756 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
22787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
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134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26911 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
27010 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
27011 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
27042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
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Target: scaffold0124; HSP #1
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134 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1729 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
1630 |
T |
 |
| Q |
234 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1629 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
1598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0003; HSP #1
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251 |
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318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
7443 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt |
7510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0155 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
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Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23769 - 23671
Alignment:
| Q |
253 |
agagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23769 |
agagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaaccccctta |
23671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0516 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:
Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
| Q |
251 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccct |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12149 |
caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct |
12051 |
T |
 |
| Q |
347 |
tacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
12050 |
tacctt |
12045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:
Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22602 - 22422
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaattt-agcacaatactcataacttaacatttttacatattt |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||| ||||| |||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22602 |
aacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaa-ttcaataatttgagcataat--tcataagttagcatttatacatattt |
22506 |
T |
 |
| Q |
184 |
-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22505 |
tgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt |
22422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1666 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:
Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 113 - 4
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
113 |
tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaaga |
14 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
13 |
gcacgaattt |
4 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9471
Alignment:
| Q |
17 |
catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9382 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatca |
9471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 8172 - 8257
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8172 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
| Q |
280 |
atcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13342 |
atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
13268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 104732 - 104623
Alignment:
| Q |
158 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatca-tgcatacaaacataacatcacagcaaga |
255 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
104732 |
tcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttaga |
104633 |
T |
 |
| Q |
256 |
gcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
104632 |
gcatgaattt |
104623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 456 - 523
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
456 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0406 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:
Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14283
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14200 |
tgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
14283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2334
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2401 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
2334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 108173 - 108256
Alignment:
| Q |
183 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
108173 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
108256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 197433 - 197386
Alignment:
| Q |
85 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagga |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
197433 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagga |
197386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1446 - 1348
Alignment:
| Q |
169 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
1446 |
cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9701 - 9603
Alignment:
| Q |
169 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
9701 |
cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
9603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2772
Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
2687 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
2772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Alignment:
| Q |
181 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacata |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22514 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacata |
22453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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