View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21683_high_19 (Length: 352)

Name: NF21683_high_19
Description: NF21683
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21683_high_19
NF21683_high_19
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (17-352)||(10644219-10644554)
chr4 (17-352)||(47357654-47357989)
chr4 (25-241)||(13048261-13048477)
chr4 (17-265)||(15675105-15675352)
chr4 (17-250)||(31115629-31115861)
chr4 (85-250)||(10104281-10104445)
chr4 (17-250)||(13246430-13246662)
chr4 (85-352)||(17145575-17145845)
chr4 (17-249)||(54118276-54118507)
chr4 (85-352)||(18248286-18248556)
chr4 (158-352)||(18169109-18169308)
chr4 (158-352)||(7131983-7132182)
chr4 (158-352)||(19020625-19020824)
chr4 (118-250)||(121990-122121)
chr4 (158-352)||(20000862-20001061)
chr4 (158-352)||(15287163-15287362)
chr4 (85-250)||(40885585-40885749)
chr4 (158-352)||(15294272-15294471)
chr4 (17-265)||(26680201-26680447)
chr4 (162-316)||(22738412-22738568)
chr4 (251-352)||(22351982-22352086)
chr4 (251-352)||(26339253-26339357)
chr4 (134-265)||(10488678-10488809)
chr4 (134-265)||(16327942-16328073)
chr4 (243-343)||(8378377-8378480)
chr4 (85-231)||(8374576-8374722)
chr4 (108-246)||(7850090-7850228)
chr4 (17-106)||(111395-111484)
chr4 (85-265)||(18238157-18238337)
chr4 (280-352)||(9795490-9795564)
chr4 (208-265)||(33240890-33240947)
chr4 (181-247)||(15044990-15045057)
chr4 (181-247)||(15109367-15109434)
chr4 (166-265)||(13442676-13442777)
chr4 (85-126)||(13590213-13590254)
chr4 (320-352)||(14996444-14996476)
chr4 (85-125)||(18276501-18276541)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (17-352)||(16821139-16821474)
chr3 (17-352)||(55316219-55316555)
chr3 (17-352)||(41270075-41270411)
chr3 (21-352)||(15614838-15615168)
chr3 (17-352)||(15936553-15936890)
chr3 (20-352)||(15938395-15938729)
chr3 (17-265)||(14842577-14842824)
chr3 (17-265)||(13975738-13975985)
chr3 (17-265)||(45860805-45861052)
chr3 (17-265)||(13954906-13955153)
chr3 (17-265)||(15859040-15859287)
chr3 (16-265)||(51158034-51158282)
chr3 (17-265)||(12030163-12030410)
chr3 (85-352)||(12264710-12264981)
chr3 (17-265)||(2049810-2050057)
chr3 (31-265)||(13838908-13839141)
chr3 (158-352)||(49232575-49232774)
chr3 (17-247)||(17912516-17912744)
chr3 (158-352)||(12902008-12902207)
chr3 (158-352)||(18911132-18911331)
chr3 (158-352)||(22275348-22275547)
chr3 (158-352)||(25058878-25059077)
chr3 (17-352)||(15468258-15468596)
chr3 (158-352)||(1467657-1467856)
chr3 (89-352)||(54651529-54651795)
chr3 (157-352)||(5228451-5228650)
chr3 (187-352)||(18896962-18897130)
chr3 (158-352)||(12811980-12812179)
chr3 (85-265)||(11986182-11986362)
chr3 (134-265)||(2449254-2449385)
chr3 (158-300)||(44229124-44229268)
chr3 (134-265)||(16744131-16744262)
chr3 (17-130)||(47984650-47984763)
chr3 (17-130)||(47993937-47994050)
chr3 (17-130)||(48003224-48003337)
chr3 (17-130)||(48012510-48012623)
chr3 (183-265)||(41661729-41661812)
chr3 (183-265)||(31412333-31412416)
chr3 (85-126)||(11638424-11638465)
chr3 (320-352)||(8268651-8268683)
chr3 (320-352)||(8275751-8275783)
chr3 (85-129)||(15876135-15876179)
chr3 (83-151)||(16880188-16880256)
chr3 (181-264)||(47784767-47784851)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (17-352)||(42997-43333)
scaffold0076 (158-352)||(39242-39441)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (17-352)||(21851881-21852217)
chr8 (17-350)||(21844490-21844824)
chr8 (17-352)||(16674308-16674644)
chr8 (17-352)||(30120722-30121060)
chr8 (21-352)||(6774175-6774505)
chr8 (21-352)||(24548986-24549316)
chr8 (17-206)||(222754-222943)
chr8 (17-206)||(736377-736566)
chr8 (17-206)||(860272-860461)
chr8 (17-265)||(43373484-43373731)
chr8 (16-265)||(16193732-16193980)
chr8 (85-352)||(16195298-16195569)
chr8 (31-265)||(24928807-24929040)
chr8 (158-352)||(22006176-22006375)
chr8 (17-265)||(16404991-16405235)
chr8 (158-352)||(13720846-13721045)
chr8 (31-265)||(17345584-17345816)
chr8 (158-352)||(16872969-16873168)
chr8 (158-352)||(271278-271477)
chr8 (158-352)||(644443-644642)
chr8 (158-352)||(830178-830377)
chr8 (158-352)||(13662183-13662382)
chr8 (158-352)||(22088712-22088911)
chr8 (158-352)||(15319077-15319276)
chr8 (158-352)||(15499446-15499645)
chr8 (17-265)||(22907230-22907476)
chr8 (134-265)||(5238203-5238334)
chr8 (134-265)||(24661264-24661395)
chr8 (134-265)||(43685662-43685793)
chr8 (145-206)||(691909-691970)
chr8 (181-265)||(26011656-26011741)
chr8 (85-265)||(22497209-22497389)
chr8 (85-126)||(5854681-5854722)
chr8 (85-126)||(38533716-38533757)
chr8 (166-265)||(45465126-45465227)
chr8 (165-247)||(15933443-15933527)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (17-352)||(13572676-13573012)
chr7 (17-352)||(13910939-13911277)
chr7 (17-352)||(10989410-10989746)
chr7 (17-352)||(2437457-2437794)
chr7 (17-352)||(16478879-16479213)
chr7 (17-352)||(18253761-18254098)
chr7 (23-247)||(25292372-25292595)
chr7 (17-265)||(47481047-47481294)
chr7 (31-265)||(16211780-16212013)
chr7 (17-265)||(13321014-13321263)
chr7 (17-250)||(36052667-36052896)
chr7 (17-265)||(13037030-13037277)
chr7 (22-265)||(11580755-11580997)
chr7 (158-352)||(15950709-15950908)
chr7 (158-352)||(18979939-18980138)
chr7 (158-352)||(13758509-13758708)
chr7 (158-352)||(15760032-15760231)
chr7 (17-265)||(3059966-3060213)
chr7 (158-352)||(7822867-7823066)
chr7 (158-352)||(7830178-7830377)
chr7 (158-352)||(27101555-27101754)
chr7 (158-352)||(27108903-27109102)
chr7 (158-352)||(27176572-27176771)
chr7 (158-352)||(38783647-38783846)
chr7 (158-352)||(15927707-15927906)
chr7 (158-352)||(14250816-14251015)
chr7 (17-265)||(7293017-7293263)
chr7 (181-316)||(48622623-48622758)
chr7 (134-265)||(11516343-11516474)
chr7 (134-265)||(15441580-15441711)
chr7 (134-265)||(30262145-30262276)
chr7 (272-352)||(15862174-15862257)
chr7 (187-318)||(10000325-10000455)
chr7 (251-318)||(16418731-16418798)
chr7 (160-244)||(296003-296087)
chr7 (181-265)||(16914928-16915013)
chr7 (181-247)||(13377691-13377758)
chr7 (183-265)||(28722274-28722357)
chr7 (181-265)||(9611470-9611555)
chr7 (85-126)||(9723946-9723987)
chr7 (181-265)||(9839041-9839126)
chr7 (183-267)||(28390476-28390561)
chr7 (85-126)||(46474068-46474109)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (17-352)||(27009841-27010177)
chr5 (17-352)||(18777907-18778244)
chr5 (17-352)||(25426628-25426965)
chr5 (17-352)||(43443312-43443647)
chr5 (17-352)||(12374-12711)
chr5 (17-352)||(22366396-22366733)
chr5 (17-352)||(4199900-4200237)
chr5 (17-352)||(19499899-19500236)
chr5 (17-352)||(21073510-21073847)
chr5 (69-352)||(29188201-29188483)
chr5 (17-249)||(23506965-23507196)
chr5 (17-265)||(18531083-18531330)
chr5 (17-265)||(22053849-22054096)
chr5 (85-352)||(35791016-35791287)
chr5 (85-352)||(11211983-11212253)
chr5 (17-250)||(27182578-27182810)
chr5 (31-265)||(34939292-34939524)
chr5 (158-352)||(7425463-7425662)
chr5 (158-352)||(17471506-17471705)
chr5 (158-352)||(23514700-23514899)
chr5 (158-352)||(1219438-1219637)
chr5 (158-352)||(10777888-10778087)
chr5 (158-352)||(21932299-21932498)
chr5 (158-352)||(21938469-21938668)
chr5 (158-352)||(35582175-35582374)
chr5 (158-352)||(36989688-36989887)
chr5 (158-348)||(22883006-22883201)
chr5 (134-265)||(20623085-20623216)
chr5 (134-265)||(21233544-21233675)
chr5 (85-265)||(32950761-32950942)
chr5 (251-352)||(23328791-23328895)
chr5 (251-352)||(24616395-24616499)
chr5 (251-352)||(24712771-24712875)
chr5 (251-352)||(24745789-24745893)
chr5 (135-265)||(25900422-25900552)
chr5 (134-265)||(16536313-16536444)
chr5 (134-265)||(37052860-37052991)
chr5 (158-265)||(23981516-23981625)
chr5 (181-265)||(21310709-21310794)
chr5 (181-247)||(5450861-5450928)
chr5 (183-265)||(26559815-26559898)
chr5 (181-265)||(19862371-19862456)
chr5 (85-126)||(21617083-21617124)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (17-352)||(35-369)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (17-352)||(64439-64780)
scaffold0026 (17-352)||(107747-108084)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (17-352)||(5072304-5072640)
chr1 (17-334)||(18601052-18601370)
chr1 (17-352)||(22227809-22228146)
chr1 (17-352)||(22232506-22232843)
chr1 (21-352)||(2116258-2116589)
chr1 (83-352)||(45051489-45051757)
chr1 (17-265)||(20931345-20931592)
chr1 (17-265)||(20913037-20913277)
chr1 (17-265)||(41394222-41394469)
chr1 (17-250)||(20893657-20893889)
chr1 (158-352)||(18059676-18059875)
chr1 (17-249)||(20445679-20445910)
chr1 (17-241)||(20531444-20531667)
chr1 (158-352)||(17004777-17004976)
chr1 (158-352)||(46523528-46523726)
chr1 (158-345)||(17148706-17148898)
chr1 (158-352)||(38055009-38055208)
chr1 (17-247)||(37844484-37844714)
chr1 (158-352)||(19962417-19962616)
chr1 (251-352)||(22035681-22035785)
chr1 (251-352)||(7640852-7640956)
chr1 (134-247)||(51452608-51452721)
chr1 (158-265)||(22143361-22143470)
chr1 (85-126)||(25093926-25093967)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (17-352)||(19886576-19886913)
chr2 (17-265)||(17396669-17396916)
chr2 (17-250)||(24341420-24341652)
chr2 (17-265)||(19794720-19794967)
chr2 (22-265)||(462743-462985)
chr2 (17-265)||(36982457-36982704)
chr2 (17-265)||(7507860-7508107)
chr2 (17-265)||(20627329-20627576)
chr2 (17-265)||(25265406-25265653)
chr2 (17-249)||(43642989-43643220)
chr2 (17-265)||(8891242-8891489)
chr2 (158-352)||(12728531-12728730)
chr2 (158-352)||(16935732-16935931)
chr2 (158-352)||(17006392-17006591)
chr2 (158-352)||(23777963-23778162)
chr2 (158-352)||(34824614-34824813)
chr2 (158-352)||(3798521-3798720)
chr2 (158-352)||(8943985-8944184)
chr2 (158-352)||(12635786-12635985)
chr2 (158-352)||(11231256-11231455)
chr2 (158-352)||(22513103-22513302)
chr2 (158-352)||(24685699-24685898)
chr2 (158-352)||(28775725-28775924)
chr2 (158-352)||(12641560-12641759)
chr2 (158-352)||(42177887-42178086)
chr2 (251-352)||(23774370-23774474)
chr2 (134-265)||(19689417-19689548)
chr2 (134-265)||(23820187-23820318)
chr2 (134-265)||(14906456-14906587)
chr2 (158-300)||(21142034-21142178)
chr2 (251-318)||(5888585-5888652)
chr2 (134-265)||(20015127-20015258)
chr2 (181-247)||(68154-68221)
chr2 (183-265)||(24277925-24278008)
chr2 (85-126)||(16292940-16292981)
chr2 (181-265)||(24884848-24884933)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (17-352)||(36093-36430)
scaffold0023 (17-265)||(48598-48845)
scaffold0023 (158-352)||(153925-154124)
scaffold0023 (230-349)||(169830-169951)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (17-352)||(25175563-25175901)
chr6 (17-352)||(27653898-27654235)
chr6 (17-341)||(16825678-16826006)
chr6 (21-352)||(1650022-1650352)
chr6 (21-265)||(14626134-14626377)
chr6 (17-265)||(35009455-35009702)
chr6 (31-265)||(23153461-23153694)
chr6 (158-352)||(16232031-16232230)
chr6 (31-265)||(1657764-1657996)
chr6 (85-301)||(29665941-29666157)
chr6 (158-352)||(1556144-1556343)
chr6 (158-352)||(10488838-10489037)
chr6 (158-352)||(16376291-16376490)
chr6 (158-352)||(16383615-16383814)
chr6 (158-352)||(22225656-22225855)
chr6 (158-352)||(18086741-18086940)
chr6 (158-352)||(23977908-23978107)
chr6 (158-352)||(16556057-16556256)
chr6 (158-352)||(16632613-16632812)
chr6 (142-265)||(15862595-15862718)
chr6 (160-352)||(19610159-19610356)
chr6 (191-352)||(22251484-22251648)
chr6 (158-352)||(19299376-19299575)
chr6 (158-352)||(13620712-13620911)
chr6 (251-352)||(29869694-29869798)
chr6 (86-200)||(27740907-27741021)
chr6 (196-265)||(27751603-27751672)
chr6 (183-265)||(19854319-19854402)
chr6 (181-265)||(18629608-18629693)
chr6 (321-352)||(14626045-14626076)
chr6 (183-241)||(29605614-29605672)
chr6 (181-265)||(16887792-16887877)
chr6 (85-126)||(18399005-18399046)
chr6 (183-263)||(17083200-17083280)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (17-349)||(31593-31928)
scaffold0008 (17-250)||(128200-128431)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (17-352)||(21031-21367)
scaffold0139 (17-352)||(13977-14312)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (21-352)||(9266-9596)
scaffold0215 (21-352)||(16164-16494)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (17-352)||(5130-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (17-352)||(3722-4060)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (21-352)||(2966-3299)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (123-352)||(1220-1450)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (113-352)||(13242-13480)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (40-265)||(5551-5776)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (19-265)||(3598-3843)
scaffold0266 (17-265)||(1124-1371)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (17-265)||(12115-12360)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (17-249)||(8878-9109)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (17-265)||(48187-48434)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (17-265)||(6080-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (17-265)||(972-1218)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (17-250)||(148721-148953)
scaffold0025 (17-265)||(8849-9096)
scaffold0025 (181-247)||(53508-53575)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (17-265)||(19206-19453)
scaffold0195 (17-265)||(21290-21537)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (17-265)||(36929-37176)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (17-265)||(34476-34724)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (17-265)||(41648-41895)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (17-249)||(123196-123427)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (17-250)||(5092-5324)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (31-250)||(171919-172137)
scaffold0001 (31-250)||(177622-177840)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (32-265)||(26431-26663)
scaffold0162 (134-265)||(8196-8327)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (85-265)||(13574-13753)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (31-265)||(247458-247691)
scaffold0012 (158-352)||(34076-34275)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (85-352)||(45098-45369)
scaffold0066 (85-301)||(54484-54700)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (158-352)||(1493-1692)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (158-352)||(31448-31647)
scaffold0107 (158-305)||(39785-39934)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (31-250)||(272039-272257)
scaffold0009 (85-126)||(69524-69565)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (158-352)||(1432-1631)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (21-265)||(41733-41976)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (31-265)||(550-783)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (158-352)||(29301-29500)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (158-352)||(2531-2731)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (135-265)||(51198-51328)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (85-265)||(56115-56295)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (158-352)||(7374-7573)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (158-316)||(10296-10456)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (85-265)||(3257-3437)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (17-123)||(48514-48620)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (135-265)||(89470-89600)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (181-316)||(3577-3712)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (181-316)||(54038-54173)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (17-123)||(9-115)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (251-352)||(6831-6935)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (243-352)||(10666-10778)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (17-265)||(37082-37328)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (134-265)||(22656-22787)
scaffold0141 (134-265)||(26911-27042)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (134-265)||(1598-1729)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (251-318)||(7443-7510)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (253-348)||(23671-23769)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (251-352)||(12045-12149)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (85-265)||(22422-22602)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (158-265)||(4-113)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (17-106)||(9382-9471)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (181-265)||(8172-8257)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (280-352)||(13268-13342)
scaffold0032 (158-265)||(104623-104732)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (181-247)||(456-523)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (183-265)||(14200-14283)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (181-247)||(2334-2401)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (183-265)||(108173-108256)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (85-132)||(197386-197433)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (169-265)||(1348-1446)
scaffold0409 (169-265)||(9603-9701)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (181-265)||(2687-2772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (181-241)||(22453-22514)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644554
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 10644518  T
317 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10644519 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 10644554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357989
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaaa 47357953  T
317 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47357954 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 47357989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
25 atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||    
13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
125 acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
225 tcatgcatacaaacata 241  Q
    |||||||||||||||||    
13048277 tcatgcatacaaacata 13048261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675105
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 15675105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115861
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 31115861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104281
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||    
10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
185 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 10104281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246662
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||      
13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacag 13246662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17145845 - 17145575
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||| || | |||  ||| |||||||||||| |||||| |||    
17145845 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcactaattgagtataatt-tcacaacttaacatttatacatacttt 17145748  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| | |  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
17145747 gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc 17145648  T
283 aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
17145647 aactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt 17145575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118276
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| | || ||||    
54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataact-aaat 54118409  T
117 c-aacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54118408 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 54118310  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
54118309 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 54118276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Original strand, 18248286 - 18248556
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||| || | |||  ||||| |||||||||| |||||| |||    
18248286 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataatt-tcatatcttaacatttatacatacttt 18248383  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
18248384 gaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc 18248483  T
283 aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
18248484 aacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttacctt 18248556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 18169109 - 18169308
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
18169109 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 18169208  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18169209 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 18169308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7132182 - 7131983
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
7132182 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 7132083  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7132082 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 7131983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 19020625 - 19020824
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
19020625 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 19020724  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |   |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
19020725 gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 250
Target Start/End: Original strand, 121990 - 122121
Alignment:
118 aacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 217  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
121990 aacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 122088  T
218 catcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
122089 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 122121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 20000862 - 20001061
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    
20000862 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga 20000961  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
20000962 gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 20001061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15287362 - 15287163
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
15287362 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 15287263  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15287262 gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 15287163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885585
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||| |||||| |||    
40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataatt-tcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
184 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||    
40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag 40885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15294471 - 15294272
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
15294471 tcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 15294372  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15294371 gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 15294272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680447
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 26680447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 316
Target Start/End: Original strand, 22738412 - 22738568
Alignment:
162 aacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcac 259  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||| |||    
22738412 aacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacac 22738511  T
260 gaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22738512 gaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22738568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22352086 - 22351982
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
22352086 caagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 22351987  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
22351986 acctt 22351982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 26339253 - 26339357
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
26339253 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 26339352  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
26339353 acctt 26339357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488809
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 10488809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327942
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 16327942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Original strand, 8378377 - 8378480
Alignment:
243 catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 339  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||    
8378377 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta 8378476  T
340 accc 343  Q
    ||||    
8378477 accc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 8374576 - 8374722
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||| || | |||  |||||||||||||||| |||||| |||    
8374576 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataatt-tcataacttaacatttatacatacttt 8374673  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgca 231  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||    
8374674 gaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 8374722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 7850090 - 7850228
Alignment:
108 atctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatc 207  Q
    ||||||| |||||||  |||||| | || |||| || || ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||  |||| |||||||||||    
7850090 atctcaattcaacaatcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatc 7850189  T
208 atacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatc 246  Q
    | ||| || |||||||  ||| ||| |||||||||||||    
7850190 acacagttttcatcaatacattcattcaaacataacatc 7850228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111484
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca 106  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca 111484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18238337 - 18238157
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaattt-agcacaatactcataacttaacatttttacatatt- 182  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||| | || |||| |||||  ||||||||  ||| ||  || |||||| ||||| |     
18238337 aacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaa-ttcaacaattagagcacaat--tcacaatatatcattttcacatacta 18238241  T
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
18238240 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 18238157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
280 atcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 265
Target Start/End: Original strand, 33240890 - 33240947
Alignment:
208 atacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
33240890 atacaatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 33240947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 15044990 - 15045057
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
15044990 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 15045057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15109434 - 15109367
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
15109434 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 15109367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13442777 - 13442676
Alignment:
166 taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat 263  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||  || ||||||||| ||| | |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||    
13442777 taacattttcacatactatgaacatgcaatttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaat 13442678  T
264 tt 265  Q
    ||    
13442677 tt 13442676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13590254 - 13590213
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
13590254 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac 13590213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 352
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996476
Alignment:
320 catgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
14996444 catgattatgataataactaacccccttacctt 14996476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Original strand, 18276501 - 18276541
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
18276501 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaa 18276541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821474
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 16821438  T
317 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16821439 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 16821474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316555
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |    
55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 55316518  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
55316519 attacatgattgtgataataactaacccctttacctt 55316555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270411
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |    
41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaa 41270374  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41270375 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 41270411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615168
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||    
15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
121 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 220  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
221 caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 320  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 15615136  T
321 atgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
15615137 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936553
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15936592  T
317 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
     |   |||||||| | || ||||||||||||| ||||||    
15936591 attgaacatgattataatgataactaacccccatacctt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938395
Alignment:
20 catcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
120 caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 219  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
220 tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt- 318  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||| ||||   ||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt 15938431  T
319 --acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
      |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
15938430 gaacatgattataatgataactaacccccttacctt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842577
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 14842577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975738
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 13975738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861052
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 45861052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954906
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 13954906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859040
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 15859040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158034
Alignment:
16 acatcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaa 115  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||     
51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
116 tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
      ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 51158034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030163
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||   ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 12030163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12264981 - 12264710
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | || |||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
12264981 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt 12264883  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
12264882 gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc 12264783  T
283 aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12264782 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12264710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050057
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||    
2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaattt 2050057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 13838908 - 13839141
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||| |||||||||    
13838908 gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag 13839007  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
13839008 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgc 13839106  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
13839107 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 13839141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 49232575 - 49232774
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
49232575 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 49232674  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
49232675 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 49232774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912516
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |    
17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||| ||||| ||    ||||||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17912644 caactacaacata--tcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 17912516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12902207 - 12902008
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||    
12902207 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga 12902108  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
12902107 gcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 18911132 - 18911331
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
18911132 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 18911231  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18911232 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 18911331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 22275348 - 22275547
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||  |||||||||||||    
22275348 tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaaga 22275447  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
22275448 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22275547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 25058878 - 25059077
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
25058878 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 25058977  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatta---catgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
25058978 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctt 25059077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468258
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||  |  |||| ||||  ||||| | | ||||||||| ||| |||||| ||||||||  |    
15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15468497  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaat 214  Q
    |||  | ||| ||  | || |||| ||||| || | |||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||    
15468496 caatcaaaacatatca-aatttcatcaattaagtataatt-tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccat 15468399  T
215 tatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaa 314  Q
     |||||||| ||||||| |  || ||| ||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15468398 aatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaa 15468299  T
315 aat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15468298 aatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 15468258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1467856 - 1467657
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
1467856 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 1467757  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
1467756 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 1467657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 352
Target Start/End: Original strand, 54651529 - 54651795
Alignment:
89 tcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-tttg-aa 186  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||    
54651529 tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtataatt-tcataacttaacatttatacatactttgcaa 54651626  T
187 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc 286  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||    
54651627 catgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacc 54651726  T
287 cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |   |||||||| |||| |  || ||||||||||||||    
54651727 cattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttacctt 54651795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 352
Target Start/End: Original strand, 5228451 - 5228650
Alignment:
157 ctcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaag 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |   | ||||||||||||||||    
5228451 ctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaag 5228550  T
255 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct 351  Q
    |||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
5228551 agcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacct 5228649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18896962
Alignment:
187 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc 286  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
18897130 catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc 18897031  T
287 cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18897030 cattttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 18896962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 12811980 - 12812179
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| ||| |||||||||    
12811980 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaaga 12812079  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12812080 gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12812179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11986362 - 11986182
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||     
11986362 aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcactatttgagcacaatt-tcataacttgacattaatacatacttt 11986265  T
185 aa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
11986264 aaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt 11986182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449254
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 2449254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 44229124 - 44229268
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
44229124 tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 44229223  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 300  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
44229224 gcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 44229268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16744262 - 16744131
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||    
16744262 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggata 16744163  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
16744162 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 16744131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||||| |  | || ||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||      
47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
117 caacaacaacttag 130  Q
    ||||||||||||||    
47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||||| |  | || ||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||      
47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
117 caacaacaacttag 130  Q
    ||||||||||||||    
47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||||| |  | || ||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||      
48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
117 caacaacaacttag 130  Q
    ||||||||||||||    
48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||||| |  | || ||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||      
48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
117 caacaacaacttag 130  Q
    ||||||||||||||    
48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 41661729 - 41661812
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  | |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
41661729 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattt 41661812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31412416 - 31412333
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| | |||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
31412416 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 31412333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 11638424 - 11638465
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
11638424 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac 11638465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268651
Alignment:
320 catgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
8268683 catgattatgataataactaacccccttacctt 8268651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275751
Alignment:
320 catgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
8275783 catgattatgataataactaacccccttacctt 8275751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 129
Target Start/End: Original strand, 15876135 - 15876179
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactta 129  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
15876135 aacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaactta 15876179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 151
Target Start/End: Original strand, 16880188 - 16880256
Alignment:
83 ataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| ||||    
16880188 ataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagca 16880256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47784851 - 47784767
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| |   ||||||||||||    
47784851 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt 47784767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43333
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-caaatgcaaa 315  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
43197 tcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa 43296  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
43297 attacatgtttgtgatagtaactaacccccttacctt 43333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 39242 - 39441
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
39242 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 39341  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
39342 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 39441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851881
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 21851918  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21851917 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 21851881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844490
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 21844525  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21844524 attacatgattgtgataataactaacccccttacc 21844490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674308
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |    
16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
     ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 16674345  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16674344 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 16674308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30121060
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||    
30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaa 30121021  T
317 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
     |   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
30121022 attacacatgattatgataatcactaacccccttacctt 30121060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774175
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || |||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    
6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
121 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 220  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
221 caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaattac 6774207  T
321 atgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
6774206 atgattatgataatcactaacccccttacctt 6774175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549316
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||    
24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
121 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 220  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
221 caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 24549284  T
321 atgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
24549285 atgattatgataatcactaacccccttacctt 24549316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222754
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736377
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860272
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373484
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||    
43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaattt 43373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193732
Alignment:
16 acatcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaa 115  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
116 tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
    | |||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 16193732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Original strand, 16195298 - 16195569
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | || ||||  |||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
16195298 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt 16195396  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||    
16195397 gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatc 16195496  T
283 aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
16195497 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttacctt 16195569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24929040 - 24928807
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||  || | |||||  |||| |||||||||    
24929040 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttag 24928941  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
      |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24928940 c-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 24928842  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||||  |||||||   ||||||||||||    
24928841 atacaaacatataatcacagttggagcacgaattt 24928807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22006375 - 22006176
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
22006375 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 22006276  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
22006275 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22006176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404991
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||||||| | ||||||| |  | || ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| || |||| |    
16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 16404991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13721045 - 13720846
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
13721045 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 13720946  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
13720945 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 13720846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 17345584 - 17345816
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || ||||| |||||   |||| ||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| |||||||    
17345584 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttag 17345682  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | |||| || ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17345683 ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 17345781  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
17345782 atataaacataacatcacagttagagcacgaattt 17345816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16873168 - 16872969
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    
16873168 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga 16873069  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16873068 gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 16872969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 271477 - 271278
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
271477 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 271378  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
271377 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 271278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 644443 - 644642
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
644443 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 644542  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
644543 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 830178 - 830377
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
830178 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 830277  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
830278 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 830377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13662382 - 13662183
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||  | ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
13662382 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 13662283  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
13662282 gcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 13662183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22088911 - 22088712
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
22088911 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 22088812  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
22088811 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctt 22088712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15319276 - 15319077
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || |||  ||||||||||||    
15319276 tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga 15319177  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15319176 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 15319077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15499645 - 15499446
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || |||  ||||||||||||    
15499645 tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga 15499546  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15499545 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 15499446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907230
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 22907230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238334
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 5238334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661264
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 24661264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685793
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 43685793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691909
Alignment:
145 tttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat 206  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 691909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011741
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
26011656 tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 26011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22497389 - 22497209
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatt-tagcacaatactcataacttaacatttttacatatt- 182  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |  |||||| |||||  ||||||||  ||| ||  || |||||| |||||||     
22497389 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagca-caattcaacaattagagcacaat--tcacaatatatcattttcacatatta 22497293  T
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||| |||  ||||  |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
22497292 tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 22497209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 5854681 - 5854722
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
5854681 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 5854722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 38533716 - 38533757
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
38533716 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 38533757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45465227 - 45465126
Alignment:
166 taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat 263  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  ||||| |  |||||||||||||| | || ||||||||||    
45465227 taacattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaat 45465128  T
264 tt 265  Q
    ||    
45465127 tt 45465126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 247
Target Start/End: Original strand, 15933443 - 15933527
Alignment:
165 ttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||    
15933443 ttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 15933527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13573012
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 13572975  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13572976 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 13573012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13910939
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
117 caacaacaactt-aggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa 315  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa 13910978  T
316 att--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
13910977 attacacatgattatgataatcaataacccccttacctt 13910939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989746
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaaa 10989708  T
317 t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
10989709 ttatacatgattatgataatcactaacccccatacctt 10989746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437794
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||    
2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
2437657 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 2437756  T
317 t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
2437757 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 2437794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478879
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || |||||||||||   |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     || || ||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16478915  T
317 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
16478914 ttaaatgattatgataatcactaacccccttacctt 16478879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253761
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18253800  T
317 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
     |   |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
18253799 attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292372
Alignment:
23 caatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |    
25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
123 caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 222  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
223 aatcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    | |||| |||||||||||| |||||    
25292396 attcatacatacaaacatatcatca 25292372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481047
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| ||| |   ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 47481047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 16211780 - 16212013
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| | || || ||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
16211780 gaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 16211879  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
16211880 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 16211978  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
16211979 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 16212013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321263
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||  || ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
117 caacaa-caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaa 213  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
214 ttatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 13321263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052896
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacag 36052896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037030
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||      
13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 13037030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580755
Alignment:
22 tcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaaca 121  Q
    ||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||   ||||    
11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
122 acaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 221  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
222 aaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||    
11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt 11580755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15950908 - 15950709
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
15950908 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 15950809  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15950808 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 15950709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18980138 - 18979939
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
18980138 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 18980039  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18980038 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 18979939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 13758509 - 13758708
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    
13758509 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga 13758608  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
13758609 gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 13758708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15760231 - 15760032
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
15760231 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 15760132  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
15760131 gcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 15760032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060213
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||      
3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||  | |||||||||| || |||| |||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||   ||||||||||||    
3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaattt 3060213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 7822867 - 7823066
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
7822867 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 7822966  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7822967 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 7823066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 7830178 - 7830377
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
7830178 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 7830277  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7830278 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 7830377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27101754 - 27101555
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
27101754 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 27101655  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
27101654 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 27101555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27109102 - 27108903
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
27109102 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 27109003  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
27109002 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 27108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 27176572 - 27176771
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
27176572 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 27176671  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
27176672 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 27176771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38783846 - 38783647
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
38783846 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 38783747  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
38783746 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 38783647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 15927707 - 15927906
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
15927707 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 15927806  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15927807 gcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 15927906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14251015 - 14250816
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||| ||| |||||    
14251015 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga 14250916  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
14250915 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttacctt 14250816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293263
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 7293263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622623
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
48622758 tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca 48622659  T
281 tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
48622658 tcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaa 48622623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516474
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 11516474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441580
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 15441580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262145
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 30262145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 352
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
272 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10000455 - 10000325
Alignment:
187 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc 286  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||| |||  || | |||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
10000455 catgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaa-acaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacc 10000357  T
287 cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt 318  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||    
10000356 catttttatacaacatgagaagatgcaaaatt 10000325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 318
Target Start/End: Original strand, 16418731 - 16418798
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
16418731 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt 16418798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 296003
Alignment:
160 ataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataaca 244  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataaca 296003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914928
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
16915013 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 13377691 - 13377758
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
13377691 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 13377758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 28722274 - 28722357
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||    
28722274 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt 28722357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611555
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
9611470 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 9611555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9723987 - 9723946
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
9723987 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac 9723946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839126
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
9839041 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 9839126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Original strand, 28390476 - 28390561
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttga 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| ||| | |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
28390476 tgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttga 28390561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 46474068 - 46474109
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
46474068 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac 46474109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010177
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 27010140  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27010141 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 27010177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777907
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18777945  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
18777944 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt 18777907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426965
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 25426927  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
25426928 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt 25426965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443312
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||      
43443447 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccattttcatataacatgagaatatgcaatt 43443348  T
317 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
      |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
43443347 acacatgattatgataatcactaacccccttacctt 43443312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12711
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaa 12673  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12674 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 12711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366396
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||    
22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22366434  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
22366433 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt 22366396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199900
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaa 4199938  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
4199937 ttacacatgattatgataatccctaacccccttacctt 4199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500236
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 19500198  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
19500199 ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctt 19500236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073510
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 21073548  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
21073547 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 21073510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 69 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188201
Alignment:
69 atcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaa 168  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||     
29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
169 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T
269 atgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
29188284 atgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattataataatcactaacccccttacctt 29188201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507196
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 23507196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531083
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||| |||||| ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 18531083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053849
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 22053849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 35791287 - 35791016
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | || |||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
35791287 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt 35791189  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
35791188 gaaacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc 35791089  T
283 aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
35791088 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 35791016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11212253 - 11211983
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| | || || | |||  |||||||||||||||| |||| | |||    
11212253 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactacttgagtataatt-tcataacttaacatttatacacacttt 11212156  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
11212155 gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatc 11212056  T
283 aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
11212055 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt 11211983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182578
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||      
27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacag 27182578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 34939292 - 34939524
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| |||  ||||||    
34939292 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttag 34939390  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | |||| || ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
34939391 ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 34939489  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
34939490 atacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 34939524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 7425463 - 7425662
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| |  || |||||||||||||||||    
7425463 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga 7425562  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7425563 gcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 7425662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17471705 - 17471506
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
17471705 tcattacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 17471606  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
17471605 gcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 17471506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 23514700 - 23514899
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
23514700 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 23514799  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
23514800 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 23514899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1219637 - 1219438
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| | ||||| |  || ||| |||||||||||||    
1219637 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 1219538  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
1219537 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacctt 1219438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10778087 - 10777888
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
10778087 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 10777988  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
10777987 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctt 10777888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21932498 - 21932299
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
21932498 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 21932399  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
21932398 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 21932299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21938668 - 21938469
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
21938668 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 21938569  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
21938568 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 21938469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 35582175 - 35582374
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
35582175 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 35582274  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
35582275 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 35582374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36989887 - 36989688
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| ||||||||| |||    
36989887 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctaga 36989788  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
36989787 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 36989688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22883201 - 22883006
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
22883201 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 22883102  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaaccccctta 348  Q
    |||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
22883101 gcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 22883006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623216
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 20623216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233544
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 21233544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 32950761 - 32950942
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataac-ttaacatttttacata-tt 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||  ||||||| || || ||| |||||| ||    
32950761 aacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagta-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataactttgacctttatacatactt 32950858  T
183 tg-aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||  |||||||||||||    
32950859 tgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt 32950942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 23328791 - 23328895
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
23328791 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 23328890  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
23328891 acctt 23328895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 24616395 - 24616499
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
24616395 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24616494  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
24616495 acctt 24616499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 24712771 - 24712875
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
24712771 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24712870  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
24712871 acctt 24712875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 24745789 - 24745893
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
24745789 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24745888  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
24745889 acctt 24745893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900422
Alignment:
135 aattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatac 234  Q
    |||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
235 aaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 25900422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536444
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 16536444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052991
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 37052991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23981625 - 23981516
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||  || ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |   |||    
23981625 tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattaga 23981526  T
256 gcacgaattt 265  Q
    ||||||||||    
23981525 gcacgaattt 23981516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21310794 - 21310709
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
21310794 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5450928 - 5450861
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
5450928 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 5450861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26559898 - 26559815
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| | |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
26559898 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaattt 26559815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 19862371 - 19862456
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
19862371 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 19862456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 21617083 - 21617124
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
21617083 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 21617124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 35 - 369
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
235 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagc-aatgcaaaa 333  T
317 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
334 ttacatgattttgataataactaacccccttacctt 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64439
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 64581  T
217 tcatc-----aaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatg 311  Q
    |||||     || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
64580 tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatg 64481  T
312 c-aaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
64480 caaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt 64439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108084
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  | | |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 108045  T
317 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
     |   |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
108046 attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072304
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |    
5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaa 5072341  T
316 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5072340 attacatgattgtgataataactaacccccttacctt 5072304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601052
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |    
18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaa 315  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18601170 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 18601071  T
316 attacatgattgtgataat 334  Q
    |||||||||||||||||||    
18601070 attacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228146
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||| |||||   ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22228008 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22228107  T
317 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
22228108 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232843
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||| |||||   ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22232705 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22232804  T
317 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
22232805 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116589
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcaca-tctcaaatcaa 119  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| | | |||||| ||    
2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
120 caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 219  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
220 tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatta 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
2116457 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaaatta 2116556  T
320 catgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
2116557 catgattatgataatcactaacccctttacctt 2116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 352
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051757
Alignment:
83 ataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatt 182  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
283 aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatcacatgattatgataaagactaacccccttacctt 45051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931592
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 20931592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913277
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||       |||    
20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 20913277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394469
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| |  | || |||||||||||   |||||||||||||| || |||||| |||||||      
41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 41394469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893657
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||| |||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||      
20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 20893657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18059875 - 18059676
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
18059875 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 18059776  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18059775 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 18059676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445910
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| | | ||| |    
20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 20445910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531667
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| | | ||| |    
20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacata 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
20531643 tcatcaattcatgcatacaaacata 20531667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 17004777 - 17004976
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
17004777 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 17004876  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
17004877 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 17004976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 46523528 - 46523726
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||  || | |||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
46523528 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 46523627  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
46523628 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctt 46523726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 17148706 - 17148898
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    
17148706 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga 17148805  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaaccccc 345  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||    
17148806 gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccc 17148898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38055208 - 38055009
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || |||||||||||| || |    
38055208 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaa 38055109  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
38055108 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 38055009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844484
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||      
37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactca-taacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||  ||| ||  ||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 37844484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19962616 - 19962417
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| |||  || |  || ||| ||| |||||||||    
19962616 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga 19962517  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
19962516 gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 19962417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 22035681 - 22035785
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
22035681 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 22035780  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
22035781 acctt 22035785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7640956 - 7640852
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
7640956 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 7640857  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
7640856 acctt 7640852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 247
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452721
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
234 caaacataacatca 247  Q
    |||||||| |||||    
51452708 caaacatatcatca 51452721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22143470 - 22143361
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat--catgcatacaaacataacatcacagcaag 254  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||  || ||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||| ||  ||    
22143470 tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatca-caaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttag 22143372  T
255 agcacgaattt 265  Q
    |||||||||||    
22143371 agcacgaattt 22143361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 25093926 - 25093967
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
25093926 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac 25093967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886576
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 19886614  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
19886613 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 19886576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396669
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt 17396669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341420
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| |    || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 24341420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794720
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 19794720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462985
Alignment:
22 tcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaaca 121  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||   ||||    
462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
122 acaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 221  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
222 aaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||    
462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaattt 462985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982457
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||| |  | || ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 36982457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507860
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaa 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||||     
7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 7508008  T
116 tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
    | |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7508007 t-aacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||    
7507909 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaattt 7507860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627329
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||| | || || | ||| |||||  ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 20627329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265406
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||  |  | || ||||| |||||   | |||||||||||||||||  || ||||  || |    
25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt 25265406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642989
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || ||||| |||||   ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     || ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 43642989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891489
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||| | |||||      
8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||    
8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt 8891489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 12728531 - 12728730
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
12728531 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 12728630  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12728631 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12728730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 16935732 - 16935931
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
16935732 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 16935831  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16935832 gcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 16935931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 17006392 - 17006591
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
17006392 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 17006491  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
17006492 gcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 17006591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23778162 - 23777963
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||    
23778162 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaaga 23778063  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
23778062 gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 34824614 - 34824813
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
34824614 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 34824713  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
34824714 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacctt 34824813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3798720 - 3798521
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    
3798720 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga 3798621  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
3798620 gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 3798521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 8943985 - 8944184
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
8943985 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 8944084  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
8944085 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 8944184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12635985 - 12635786
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
12635985 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 12635886  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12635885 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcatacaacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12635786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11231455 - 11231256
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
11231455 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 11231356  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
11231355 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 11231256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22513302 - 22513103
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
22513302 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 22513203  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
22513202 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22513103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24685898 - 24685699
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
24685898 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 24685799  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
24685798 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 24685699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28775924 - 28775725
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
28775924 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 28775825  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
28775824 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 28775725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12641759 - 12641560
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    
12641759 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga 12641660  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12641659 gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12641560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 42178086 - 42177887
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||| ||| |||||    
42178086 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga 42177987  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
42177986 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 42177887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 23774370 - 23774474
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||    
23774370 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaaccccctt 23774469  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
23774470 acctt 23774474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689417
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 19689417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820318
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 23820318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906456
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 14906456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 21142034 - 21142178
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
21142034 tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 21142133  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 300  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21142134 gcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 21142178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5888652 - 5888585
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
5888652 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt 5888585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015258
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 20015258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 68154 - 68221
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
68154 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 68221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 24277925 - 24278008
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
24277925 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 24278008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16292981 - 16292940
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
16292981 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac 16292940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884933
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||    
24884848 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 24884933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36430
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
36293 acatcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaaa 36392  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
36393 ttacacatgattatgataatcattaacccccttacctt 36430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48845
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||| | |||||      
48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     | ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 48845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 154124 - 153925
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
154124 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 154025  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
154024 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 153925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169830
Alignment:
230 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||     
169951 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattatacatgatta 169852  T
328 tgataataactaacccccttac 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
169851 tgataatcactaacccccttac 169830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175901
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-caaatgcaaa 315  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa 25175862  T
316 at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
25175863 attatacatgattatggtaatcactaacccccttacctt 25175901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653898
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 27653936  T
317 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
27653935 ttacacatgattatgataatcactaaccccctcacctt 27653898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825678
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatca--tacaat 214  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||     
16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
215 tatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaa 314  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaa 16825707  T
315 aatt--acatgattgtgataataactaac 341  Q
    ||||  |||||||| ||||||| ||||||    
16825706 aattacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650022
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || |||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    
1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
121 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 220  Q
     | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
221 caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 320  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattac 1650054  T
321 atgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
1650053 atgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626134
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||    
14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
121 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 220  Q
    |||||||||| | || ||||||||||   ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
221 caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 14626134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009455
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||   | |||||||||||||||||  || ||||  || |    
35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaattt 35009455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 23153461 - 23153694
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||| | ||||||| ||| ||||||| | || || ||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||| | |||||   |||||||||||||    
23153461 gaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 23153560  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23153561 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 23153659  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
23153660 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 23153694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 16232031 - 16232230
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
16232031 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 16232130  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16232131 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 16232230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1657996 - 1657764
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| |  | || ||||| |||||   |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| |||||||    
1657996 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttag 1657898  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | |||| || ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1657897 ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 1657799  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
1657798 atccaaacataacatcacagttagagcacgaattt 1657764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 301
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666157
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||| | |||| |||    
29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| | ||||    
29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatc 29666138  T
283 aacccattttcatacaaca 301  Q
    | |||||||||||||||||    
29666139 accccattttcatacaaca 29666157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 1556144 - 1556343
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
1556144 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 1556243  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
1556244 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 1556343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 10488838 - 10489037
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
10488838 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 10488937  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
10488938 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 10489037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16376490 - 16376291
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
16376490 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 16376391  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16376390 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 16376291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16383814 - 16383615
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
16383814 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 16383715  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16383714 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 16383615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22225855 - 22225656
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||| ||||    
22225855 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaaga 22225756  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
22225755 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt 22225656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18086940 - 18086741
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
18086940 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 18086841  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
18086840 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttacctt 18086741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 23977908 - 23978107
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    
23977908 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga 23978007  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
23978008 gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttacctt 23978107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16556256 - 16556057
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||| ||    
16556256 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga 16556157  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16556156 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 16556057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16632812 - 16632613
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||| ||    
16632812 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga 16632713  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16632712 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 16632613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 265
Target Start/End: Original strand, 15862595 - 15862718
Alignment:
142 caatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacata 241  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
15862595 caattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata 15862694  T
242 acatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
15862695 acatcacagttagagcacgaattt 15862718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 352
Target Start/End: Original strand, 19610159 - 19610356
Alignment:
160 ataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc 257  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| |  || ||| |||||||||||||||    
19610159 ataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagc 19610258  T
258 acgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
19610259 acgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 19610356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251484
Alignment:
191 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccatt 290  Q
    |||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
291 ttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
22251548 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt 22251484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 19299376 - 19299575
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| |||  || |  || ||| ||| |||||||||    
19299376 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga 19299475  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
19299476 gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 19299575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13620911 - 13620712
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||| ||| |||||    
13620911 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga 13620812  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||  |  |||||||||||||||||    
13620811 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29869798 - 29869694
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
29869798 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaaccccctt 29869699  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
29869698 acctt 29869694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Original strand, 27740907 - 27741021
Alignment:
86 acatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt-- 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||      
27740907 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatacttcg 27741004  T
184 gaacatgtaatttcacc 200  Q
     ||||||||||||||||    
27741005 aaacatgtaatttcacc 27741021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751672
Alignment:
196 tcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaattt 27751672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 19854319 - 19854402
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
19854319 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 19854402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18629693 - 18629608
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
18629693 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14626076 - 14626045
Alignment:
321 atgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
14626076 atgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Original strand, 29605614 - 29605672
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacata 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||  || |||||||| ||||||||    
29605614 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata 29605672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16887877 - 16887792
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||    
16887877 tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt 16887792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 18399005 - 18399046
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
18399005 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 18399046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17083280 - 17083200
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat 263  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||    
17083280 tgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 17083200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31593
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
117 caacaacaactt-aggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa 315  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
31728 aacatcaattcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa 31629  T
316 att--acatgattgtgataataactaacccccttac 349  Q
    |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
31628 attacacatgattatgataatcactaacccccttac 31593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128200
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 128332  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||| ||  | |||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
128331 -aacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 128200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21031
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21168 tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 21069  T
317 t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
21068 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 21031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 13977
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||    
14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
14113 tcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacg-atttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 14015  T
317 t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
14014 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 13977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9266
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||    
9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
121 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 220  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
221 caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9397 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 9298  T
321 atgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9297 atgattgtgataataactaacccccttacctt 9266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16164
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaac 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||    
16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
121 aacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 220  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
221 caaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16295 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattac 16196  T
321 atgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16195 atgattgtgataataactaacccccttacctt 16164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5130
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
5466 catcatcaatccatgaatatgcaa-cccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     |||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
5268 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaa 5169  T
317 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
        ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
5168 attgtacatgattatgataataactaactcccttacctt 5130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 3722 - 4060
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttt-tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa 315  Q
    |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
3921 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 4020  T
316 a---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
4021 aattgtacatgattatgataataactaaaccccttacctt 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3299
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaatcaa 119  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||| | ||||||| |  | || |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
120 caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 219  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
220 tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat-- 317  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattg 3264  T
318 tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
3265 tacataattatgataataattaacccccttacctt 3299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 123 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1220
Alignment:
123 caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
223 aatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattaca 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaattaca 1251  T
322 tgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
1250 tgattgtgataataactaacccccctacctt 1220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 113 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13242
Alignment:
113 aaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 212  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
213 attatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatga 13282  T
313 aaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
13281 aaaattacatgattatgataatcactaacccccttacctt 13242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 265
Target Start/End: Original strand, 5551 - 5776
Alignment:
40 aacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattc 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
5551 aacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattc 5650  T
140 accaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaaca 239  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
5651 accaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaaca 5750  T
240 taacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||   ||||||||||||    
5751 taacatcaaagttggagcacgaattt 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3598
Alignment:
19 tcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca 118  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
119 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 218  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
219 atcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 3598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1371
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||    
1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12360
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
      |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
12215 --acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaattt 12360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9109
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca 249  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcaca 9109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48434
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattt 48434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6080
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt 6227  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6226 -aacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 972
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |    
1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt 1119  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1118 -aacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148953
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||| | || ||  |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9096
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| ||| |   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaattt 9096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 53508 - 53575
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
53508 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatca 53575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19453
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 19453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21537
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 21537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36929
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||| ||||||||||| || ||| | |||||      
37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34476
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaa 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |  | || |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||||     
34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
116 tcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 215  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||  ||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
216 atcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 34476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41895
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | || ||||  |||||   | |||||||||||||||||  || ||||  || |    
41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 41895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123196
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | || ||      
123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcaca 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 123196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5092
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | ||||       
5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||    
5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacag 5092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 171919 - 172137
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||    
171919 gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag 172018  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
172019 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc 172117  T
231 atacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||||||| ||||||||    
172118 atacaaacatatcatcacag 172137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 177622 - 177840
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||    
177622 gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag 177721  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
177722 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc 177820  T
231 atacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||||||| ||||||||    
177821 atacaaacatatcatcacag 177840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26663 - 26431
Alignment:
32 aatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| | ||||    |||||||||||||     
26663 aatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagc 26564  T
132 agaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgca 231  Q
    | ||||||||||||| || |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||    
26563 a-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgca 26465  T
232 tacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
26464 tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 26431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8196
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||    
8227 caaacataacatcacagttagagcacgaattt 8196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 13574 - 13753
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg 184  Q
    |||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||    
13574 aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 13672  T
185 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
13673 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt 13753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 247691 - 247458
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||   |||||||||||||    
247691 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 247592  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
247591 ca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgc 247493  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
247492 atacaaacatatcattacagttggagcacgaattt 247458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34275 - 34076
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| | |||||||||||    
34275 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaaga 34176  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct 351  Q
    ||||||||||  ||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |   |||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
34175 gcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacct 34077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Original strand, 45098 - 45369
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||| || |||||  ||| ||||| |||||| |||||| |||    
45098 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcaaaacttgacatttatacatacttt 45195  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||| |||||||||| |||  |||| ||||||    
45196 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatc 45295  T
283 aacccattttcatacaac-atgagcaaatgcaa-aatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
45296 aacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 301
Target Start/End: Original strand, 54484 - 54700
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||| |||||| |||    
54484 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt 54581  T
184 gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc 282  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||  ||||||||| |||  |||| ||||||    
54582 gaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatc 54681  T
283 aacccattttcatacaaca 301  Q
    |||||||||||||||||||    
54682 aacccattttcatacaaca 54700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1692 - 1493
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||     
1692 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagt 1593  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
1592 gcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt 1493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 31448 - 31647
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
31448 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 31547  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
31548 gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 31647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 39785 - 39934
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||| || |||||||| ||||||| |  || |||  ||||||||||||    
39785 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaaga 39884  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag 305  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39885 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag 39934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 272039 - 272257
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||| | |||||  |||| |||||||||    
272039 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag 272138  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
272139 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattc 272237  T
231 atacaaacataacatcacag 250  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
272238 atacaaacatatcattacag 272257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 69524 - 69565
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
69524 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 69565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1432
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| ||| ||| |||||    
1631 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga 1532  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
1531 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41976
Alignment:
21 atcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatc-ataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaa 119  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| | || | ||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||| | |||||   ||    
41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatc-atctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaa 41831  T
120 caacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 219  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
41832 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatca 41930  T
220 tcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
41931 tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 41976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 550
Alignment:
31 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| || ||  ||||||||||||| |||| |||||| | || ||   ||||  |||||||    
783 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttag 684  T
131 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc 230  Q
     | ||||||||||||| || |||||  ||| |||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
683 ca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 585  T
231 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
584 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt 550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 29301 - 29500
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||  || |||| ||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
29301 tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga 29400  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
29401 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 29500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Original strand, 2531 - 2731
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||||| ||||||| |  || ||| |||||| ||||||    
2531 tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaaga 2630  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa----ttacatgattgtgataataactaacccccttacct 351  Q
    |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
2631 gcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacct 2730  T
352 t 352  Q
    |    
2731 t 2731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51198
Alignment:
135 aattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatac 234  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
235 aaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| ||| ||||||||   ||||||||||||    
51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaattt 51198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 56295 - 56115
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||     
56295 aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt 56198  T
185 aa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
56197 aaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt 56115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7573 - 7374
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| |  || ||| ||||||| |||||    
7573 tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga 7474  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7473 gcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctt 7374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10456 - 10296
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||    
10456 tcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaaga 10357  T
256 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
10356 gcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 10296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 3257 - 3437
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt 183  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| | |||| |||||| |||    
3257 aacatcaattgaacaataatcacatatcctctcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagtacaatt-tcataacttgatatttatacatacttt 3354  T
184 gaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
3355 gaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaattt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
117 caacaac 123  Q
     ||||||    
48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89470
Alignment:
135 aattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatac 234  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
235 aaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    ||| ||| ||||||||   ||||||||||||    
89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaattt 89470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 316
Target Start/End: Original strand, 3577 - 3712
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| | |  || | |||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||    
3577 tttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttca 3676  T
281 tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
3677 tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 316
Target Start/End: Original strand, 54038 - 54173
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || | | |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
54038 tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca 54137  T
281 tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
54138 tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa 54173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||    
115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
117 caacaac 123  Q
     ||||||    
15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 6831 - 6935
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
6831 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 6930  T
348 acctt 352  Q
    |||||    
6931 acctt 6935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10666
Alignment:
243 catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
10778 catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 10679  T
340 acccccttacctt 352  Q
    |||||||||||||    
10678 acccccttacctt 10666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37082
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | |||||      
37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
117 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 216  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
217 tcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 37082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22787
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 22787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27042
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 27042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1598
Alignment:
134 aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata 233  Q
    ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
234 caaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 318
Target Start/End: Original strand, 7443 - 7510
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
7443 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23769 - 23671
Alignment:
253 agagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||   |  ||| | |||||||||||||||||||||    
23769 agagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaaccccctta 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
251 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccct 346  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||    
12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
347 tacctt 352  Q
    ||||||    
12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22602 - 22422
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaattt-agcacaatactcataacttaacatttttacatattt 183  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||  ||||| |||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||||    
22602 aacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaa-ttcaataatttgagcataat--tcataagttagcatttatacatattt 22506  T
184 -gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
     ||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||    
22505 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt 22422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 113 - 4
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |  || ||| | |||||||||||    
113 tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaaga 14  T
256 gcacgaattt 265  Q
    ||||||||||    
13 gcacgaattt 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9471
Alignment:
17 catcatcaatccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca 106  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatca 9471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 8172 - 8257
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
8172 tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
280 atcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 104732 - 104623
Alignment:
158 tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatca-tgcatacaaacataacatcacagcaaga 255  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||  || ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||  |||    
104732 tcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttaga 104633  T
256 gcacgaattt 265  Q
    ||| ||||||    
104632 gcatgaattt 104623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 456 - 523
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
456 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14283
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
14200 tgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 14283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2334
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
2401 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 2334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 108173 - 108256
Alignment:
183 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| | |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
108173 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 108256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 197433 - 197386
Alignment:
85 aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
197433 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagga 197386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1446 - 1348
Alignment:
169 catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
1446 cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9701 - 9603
Alignment:
169 catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
9701 cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 9603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2772
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
2687 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt 2772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22514 - 22453
Alignment:
181 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacata 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
22514 tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacata 22453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University