View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21683_high_30 (Length: 326)

Name: NF21683_high_30
Description: NF21683
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21683_high_30
NF21683_high_30
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (1-266)||(13672329-13672594)
chr7 (1-266)||(18594746-18595011)
chr7 (1-266)||(18616673-18616938)
chr7 (1-266)||(16530517-16530782)
chr7 (1-266)||(16634880-16635145)
chr7 (1-266)||(16761253-16761518)
chr7 (1-260)||(15921439-15921697)
chr7 (1-265)||(20106776-20107040)
chr7 (1-260)||(15064269-15064528)
chr7 (7-260)||(824135-824388)
chr7 (1-50)||(48803297-48803346)
chr7 (1-49)||(16150980-16151028)
chr7 (1-50)||(13656660-13656709)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (1-266)||(20017717-20017982)
chr6 (1-266)||(22167032-22167297)
chr6 (1-266)||(22768607-22768872)
chr6 (4-266)||(20168705-20168967)
chr6 (1-266)||(21561927-21562192)
chr6 (1-265)||(18446708-18446972)
chr6 (1-50)||(18010575-18010624)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (1-266)||(13821381-13821646)
chr4 (1-266)||(15261536-15261801)
chr4 (102-266)||(16680867-16681031)
chr4 (1-260)||(3353097-3353356)
chr4 (112-177)||(15864093-15864158)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (1-266)||(15643551-15643816)
chr3 (1-266)||(3340669-3340934)
chr3 (1-266)||(10161665-10161930)
chr3 (1-266)||(13505992-13506257)
chr3 (1-266)||(12161541-12161806)
chr3 (1-216)||(15945110-15945325)
chr3 (1-265)||(13693379-13693643)
chr3 (112-265)||(14447123-14447276)
chr3 (118-260)||(20158020-20158162)
chr3 (222-266)||(11876009-11876053)
chr3 (17-187)||(17386335-17386505)
chr3 (1-50)||(13196867-13196916)
chr3 (1-50)||(14447012-14447061)
chr3 (1-49)||(4369390-4369438)
chr3 (1-77)||(16654378-16654454)
chr3 (1-49)||(22165781-22165829)
chr3 (3-86)||(10604012-10604095)
chr3 (1-50)||(3278185-3278234)
chr3 (112-260)||(4369179-4369327)
chr3 (112-260)||(10604121-10604269)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (1-266)||(21800151-21800416)
chr1 (1-266)||(19783505-19783770)
chr1 (1-110)||(20392120-20392229)
chr1 (1-265)||(8651525-8651789)
chr1 (1-186)||(8948891-8949077)
chr1 (1-89)||(20072382-20072470)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (1-266)||(24954654-24954919)
chr5 (1-266)||(20439641-20439906)
chr5 (1-266)||(25117623-25117888)
chr5 (1-266)||(25176714-25176979)
chr5 (5-266)||(30764587-30764846)
chr5 (1-260)||(26846145-26846404)
chr5 (1-77)||(18071572-18071648)
chr5 (1-77)||(20597317-20597393)
chr5 (1-77)||(20603614-20603690)
chr5 (1-89)||(23520625-23520713)
chr5 (1-55)||(22318922-22318976)
chr5 (1-86)||(20792260-20792345)
chr5 (1-49)||(20609933-20609981)
chr5 (1-49)||(22947147-22947195)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-266)||(16774129-16774394)
chr2 (1-266)||(24796772-24797037)
chr2 (1-266)||(23160852-23161117)
chr2 (1-266)||(23572109-23572374)
chr2 (1-266)||(27629979-27630244)
chr2 (1-266)||(116004-116269)
chr2 (167-266)||(22870238-22870337)
chr2 (1-260)||(24821561-24821815)
chr2 (9-187)||(25372422-25372600)
chr2 (1-50)||(24170067-24170116)
chr2 (1-49)||(17867497-17867545)
chr2 (1-50)||(25369023-25369072)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (1-266)||(21825884-21826149)
chr8 (112-262)||(22035079-22035229)
chr8 (1-260)||(21942904-21943163)
chr8 (1-260)||(11348395-11348654)
chr8 (1-187)||(22368538-22368724)
chr8 (1-187)||(22289618-22289804)
chr8 (1-86)||(29333263-29333348)
chr8 (1-265)||(22830402-22830666)
chr8 (1-89)||(21100287-21100375)
chr8 (1-74)||(19766161-19766234)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-265)||(24043-24307)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-266)||(28981-29246)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-266)||(19425-19690)
scaffold0004 (1-127)||(253246-253372)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (2-266)||(25859-26119)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (1-266)||(3518-3783)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-266)||(5041-5306)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (81-266)||(3-188)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-265)||(43934-44198)
scaffold0037 (1-265)||(51323-51587)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (1-265)||(10647-10911)
scaffold0059 (1-265)||(18648-18912)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-265)||(234487-234751)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-187)||(132208-132394)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (1-173)||(1870-2040)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-258)||(7944-8200)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-260)||(21361-21620)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (112-242)||(1687-1817)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (1-265)||(6386-6650)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-260)||(22470-22729)
[»] scaffold1620 (1 HSPs)
scaffold1620 (1-50)||(427-476)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-86)||(819-904)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-86)||(24010-24095)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-46)||(10148-10193)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-50)||(32991-33040)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-86)||(19727-19812)
scaffold0018 (148-260)||(19865-19977)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-77)||(12142-12218)
scaffold0230 (112-260)||(11959-12107)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-89)||(8459-8547)
[»] scaffold1879 (1 HSPs)
scaffold1879 (1-50)||(354-403)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-50)||(39172-39221)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-50)||(54968-55017)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-86)||(122032-122117)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-49)||(11257-11305)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-63)||(21620-21682)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-50)||(115374-115423)
scaffold0020 (1-50)||(119678-119727)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13672594 - 13672329
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13672594 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 13672495  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13672494 ctcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 13672395  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13672394 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 13672329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 18594746 - 18595011
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18594746 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 18594845  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18594846 ctcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 18594945  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18594946 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatctgacctatttcctat 18595011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18616938 - 18616673
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18616938 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 18616839  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18616838 ctcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 18616739  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18616738 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatctgacctatttcctat 18616673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16530782 - 16530517
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16530782 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttaggcagtaatatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 16530683  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |    
T  16530682 gtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcactcctagttg 16530583  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16530582 cctaactatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 16530517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 16634880 - 16635145
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16634880 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttaggcagtaatatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 16634979  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |    
T  16634980 gtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcactcctagttg 16635079  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16635080 cctaactatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 16635145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 16761253 - 16761518
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16761253 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 16761352  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||| || |   |    
T  16761353 gtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtttatgtttagcctattgtttcccttaatcttgtttatctcttggtcttcactcactcctagttg 16761452  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16761453 cctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttactat 16761518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 15921439 - 15921697
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| |||   ||||||||||| |  ||||||||  | | |||      
T  15921439 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggtg 15921538  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||  |    
T  15921539 gtcgaggttttatgaagttcaaagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttg-ttatcccttggtcttcacccactcccaattg 15921637  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |  | ||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  15921638 cctaactatgtatgtgatgataccacctaccactatctctcccctaccattagacctatt 15921697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20107040 - 20106776
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| |||  |||||||||||| |  ||||||||    | ||||     
T  20107040 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacgggcacattgagtttaagtgtataggtcatggggg 20106941  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||       
T  20106940 gacgaggtttaatgaagttcatagagatgagagtctctatgttaagcctattgttttcctcaatcttgtttatcccctggtcttcacccactcccaattt 20106841  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| || || || |||||  ||| ||| |||||||| ||||    
T  20106840 cctagctatgtatgtgatgataccacctaccaccatctctcccttaccatcagacctattaccta 20106776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15064528 - 15064269
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | ||||| ||| | |  ||||||||  | | |||      
T  15064528 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacgttgggtttaagtgtataggccatgggtg 15064429  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||  |    
T  15064428 gtcgaggttttatgaagttcaaagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactcccaattg 15064329  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |  | |||||||| |  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  15064328 cctaactatgtatatgatgataccacctaccactatctctcccctaccattagacctatt 15064269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 824388 - 824135
Alignment:
Q  7 aacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaaggggactcgag 106  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| |||   ||||||||||| |  ||||||||  | | |||   |||||    
T  824388 aacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggtggtcgag 824289  T
Q  107 gttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagc 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |  ||||| || || ||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||  ||  | |    
T  824288 gttttatgaagttcataaagataagggcctctatgttaagcctattgttttcctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactcccaattgcctaac 824189  T
Q  207 tatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  824188 tatgtatgtgatgataccacctaccactatctctcccctaccattagacctatt 824135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 48803297 - 48803346
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  48803297 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 48803346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 16150980 - 16151028
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttag 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16150980 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 16151028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13656709 - 13656660
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13656709 acatacaacaaattcgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 13656660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 20017717 - 20017982
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20017717 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 20017816  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20017817 ctcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 20017916  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20017917 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 20017982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 22167032 - 22167297
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22167032 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 22167131  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22167132 ctcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 22167231  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22167232 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 22167297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 22768607 - 22768872
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22768607 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaattaagatgggcacattcagttggagtgtatagacaaagggga 22768706  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22768707 ctcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcattcacaccgaatcg 22768806  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22768807 cccagctatgtatgttataataccccccactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 22768872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20168967 - 20168705
Alignment:
Q  4 tacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaaggggactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  20168967 tacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgaggtgggttaggcaataaaatcaagatgggcacatttagttggagtgcatagacataggggactc 20168868  T
Q  104 gaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctc 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  20168867 gagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgattttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcgccc 20168768  T
Q  204 agctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20168767 agctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 20168705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 21561927 - 21562192
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21561927 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgaaatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 21562026  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     || |||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| || |   |    
T  21562027 gtcaaggttttatgaagttcatagaaataagggcgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttattccttggtcctcactcactcctagttg 21562126  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  21562127 cccagctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccttaccatcagacctatttcctat 21562192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18446972 - 18446708
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||| |||   ||||||||||| | |||||||||  | | |||      
T  18446972 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggaagtataatgaaaacaggcacattgagtttgagtgtataggccatgggtg 18446873  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||       
T  18446872 gtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttacctcaatcttgttgatcccttggtcttcacccactcccaattt 18446773  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  |||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  18446772 cctagctatttatgtgatgataccacctaccactatctctcccctaccatcagacctattaccta 18446708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18010624 - 18010575
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  18010624 acatacaacaaattttcttccaccttggtgttagtccgagatgggttagg 18010575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13821646 - 13821381
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13821646 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 13821547  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13821546 ctcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 13821447  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13821446 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 13821381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 15261536 - 15261801
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15261536 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 15261635  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  15261636 ttcgagtttttatgaaattcatagagataacggtttctatgttcagcctattgttaccctcgatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaaccg 15261735  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15261736 cctagctatgtatgttatgataccaccaactacgatttctcccctactatcggacctatttcctat 15261801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16681031 - 16680867
Alignment:
Q  102 tcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |   ||    
T  16681031 tcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttctttatcccttggtcttcactcactcctagttgc 16680932  T
Q  202 tcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16680931 ctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactattggacctatttcctat 16680867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3353356 - 3353097
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||||| | |||||| ||    | |||      
T  3353356 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggaagtacaatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaggacatgggtg 3353257  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| || ||  |    
T  3353256 gacggggcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcttcacccactcccaattg 3353157  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  3353156 cctagctatgtatgtgatgataccacccacaactatctctcccctaccatccgacctatt 3353097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15864158 - 15864093
Alignment:
Q  112 atgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccct 177  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15864158 atgaagttcatagaaataagggtctctatgttaagcctattgttaccctcaattttgtttatccct 15864093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15643816 - 15643551
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15643816 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 15643717  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15643716 ctcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 15643617  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15643616 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 15643551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 3340669 - 3340934
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3340669 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 3340768  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  3340769 ttcgaggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaaccg 3340868  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340869 cctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 3340934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 10161665 - 10161930
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  10161665 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtgcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacatagggga 10161764  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10161765 ctcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctctatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 10161864  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10161865 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 10161930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 13505992 - 13506257
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13505992 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 13506091  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  13506092 ttcggggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcaatcacgcctaaccg 13506191  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13506192 cctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctccccgactatcggacctatttcctat 13506257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 12161541 - 12161806
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12161541 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggtaaggcagtaagatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 12161640  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |   |    
T  12161641 gtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtctctatgtttaacctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcactcactcctagtag 12161740  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  12161741 cccagctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccttaccatcggacctatttcctat 12161806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15945325 - 15945110
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  15945325 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaaataggtacattaagcttgagcgtataaacaaagggga 15945226  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| || ||| |    
T  15945225 ttcgagttttaatgaaattcatagagataagggtttctatgttcagcctattgtttccctcaatcttgtatagcccttggtcttcactcacgcctaactg 15945126  T
Q  201 ctcagctatgtatgtt 216  Q
    |  |||||||||||||    
T  15945125 cctagctatgtatgtt 15945110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13693643 - 13693379
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| | || |||||||   ||||| ||||||| ||||||||||   | |||      
T  13693643 acatacaacaaattttcatccacctcggtgttagtctgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttgagcttgagtgtataagtcatgggtg 13693544  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||| |||  | ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  13693543 gtcgaggtttaatgaagttcatagagacaaggatctctatgttaagcctattattcccctcaatcttgttgatcccttggtcctcacccactcccaattg 13693444  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  |||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  13693443 cctagctatgtatattatgataccacctacaactatctctcccctaccatcagacctattaccta 13693379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 265
Target Start/End: Original strand, 14447123 - 14447276
Alignment:
Q  112 atgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgt 211  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| || ||  ||  ||||||||    
T  14447123 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagtctattgttaccctcaattttgtttatcccttggtcctcacccacccccaattgcctagctatgt 14447222  T
Q  212 atgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    ||||  | |||||||| || ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||    
T  14447223 atgtgataataccacccacaactatctctccccaactgtcagacctattaccta 14447276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 260
Target Start/End: Original strand, 20158020 - 20158162
Alignment:
Q  118 ttcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgtatgttg 217  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| || ||  ||  ||||||||||||      
T  20158020 ttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtga 20158119  T
Q  218 tgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  20158120 tgataccacccacaactatctctcccctaccatctgacctatt 20158162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Original strand, 11876009 - 11876053
Alignment:
Q  222 accaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11876009 accaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 11876053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17386505 - 17386335
Alignment:
Q  17 cttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaaggggactcgaggttttatgaa 116  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    | |||    ||| | || |||||    
T  17386505 cttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaa 17386406  T
Q  117 attcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcac 187  Q
     |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17386405 gttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcac 17386335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 13196867 - 13196916
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13196867 acatacaacaaatttgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 13196916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 14447012 - 14447061
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14447012 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 14447061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 4369438 - 4369390
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttag 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4369438 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 4369390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16654454 - 16654378
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgag 77  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | |||||||||||    
T  16654454 acatacaacaaattttcttacacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgag 16654378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 22165781 - 22165829
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttag 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22165781 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 22165829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Original strand, 10604012 - 10604095
Alignment:
Q  3 atacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgt 86  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  10604012 atacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacaatgagtttgagtgt 10604095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3278234 - 3278185
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3278234 acatacatcaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 3278185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4369327 - 4369179
Alignment:
Q  112 atgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgt 211  Q
    ||||| |||||| ||||||| || ||||| |  || |||||| | ||||| || ||||| |||||| |||| |||| ||| || ||  ||  ||||||||    
T  4369327 atgaagttcataaagataagggtctctatgtaaagcctattgattccctcaatgttgttaatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatgt 4369228  T
Q  212 atgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    ||||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  4369227 atgtgatgataccacccacaactatctctcccctactatcaaacctatt 4369179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 260
Target Start/End: Original strand, 10604121 - 10604269
Alignment:
Q  112 atgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgt 211  Q
    ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||  | |||||| |||| |||| ||| || ||  ||  ||||||||    
T  10604121 atgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatttttgtaatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatgt 10604220  T
Q  212 atgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    ||||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  10604221 atgtgatgataccacccacaactatctctcccctactatcaaacctatt 10604269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 21800151 - 21800416
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21800151 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 21800250  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21800251 ctcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 21800350  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21800351 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 21800416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19783770 - 19783505
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19783770 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtcagagataggttagaaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 19783671  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| || |   |    
T  19783670 gtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttataccttggtcctcactcactcctagttg 19783571  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  19783570 cccagctatgtatatgatgataccaccaactactatttctcccttaccatcagacctatttcctat 19783505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20392229 - 20392120
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20392229 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 20392130  T
Q  101 ctcgaggttt 110  Q
     |||||||||    
T  20392129 ttcgaggttt 20392120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8651789 - 8651525
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | || ||| ||| | ||||||||||  | |||||||||  | | ||||     
T  8651789 acatacaacaaattttcttccacctcagtgttagtccgagataggttaggaagtataattaaaataggcacattgaatttgagtgtataggccatggggg 8651690  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  8651689 gacgaggtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattg 8651590  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||    
T  8651589 cctagctatgtatgtgatgataccacctactactatatctcccttaccatcagacctattaccta 8651525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 8948891 - 8949077
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| |||   ||||||||||| |  | ||||||  | | | ||     
T  8948891 acatacaacaaattttcttcaacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaaatgtatatgccatgtggg 8948990  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttg-tttatccctgggtcttca 186  Q
      |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  8948991 gacgaggtttaatgaagttcatagagatgagggtctctatgttaagcttattgtttccctcaatcttgttttatcccttggtcttca 8949077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 20072382 - 20072470
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtata 89  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||| |||||||||    
T  20072382 acatacaaaaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtata 20072470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 24954654 - 24954919
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24954654 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 24954753  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24954754 ctcaagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 24954853  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24954854 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 24954919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 20439641 - 20439906
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  20439641 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaagtgggcacattaagcttgagcatataaacaaagggga 20439740  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |   |    
T  20439741 ttcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcatcactcacgcctagttg 20439840  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20439841 cctagctatgtatgttatgataccatcaactactatttctcctcgactatcggacctatttcctat 20439906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 25117623 - 25117888
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25117623 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaatatcaaagtgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 25117722  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |        
T  25117723 ttcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatctcttggtcttcactcactcctagttt 25117822  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25117823 cctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 25117888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 25176714 - 25176979
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25176714 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaatatcaaagtgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 25176813  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |        
T  25176814 ttcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatctcttggtcttcactcactcctagttt 25176913  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25176914 cctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 25176979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 30764587 - 30764846
Alignment:
Q  5 acaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaaggggactcg 104  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||    
T  30764587 acaacaaattcgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagacaataatatcaaaatgggcacgttgagtttg--tgtataaacaaaggggattcg 30764684  T
Q  105 aggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |   ||  |    
T  30764685 aggttttatgaaattcatagctataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactaactcctagttgccta 30764784  T
Q  205 gctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30764785 gctatgtatgttatgataccaccaactacgatttctcccctactatcggacctatttcctat 30764846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26846404 - 26846145
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | | |||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| | |||||| ||    | |||      
T  26846404 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttattccaagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaggacatgggtg 26846305  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      || || || ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  26846304 gacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccttggtcctcacccactcccaattg 26846205  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  26846204 cctagctatgtatgtgatgataccacccacaactatctctcccctactatcagacctatt 26846145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18071648 - 18071572
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgag 77  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | |||||||||||    
T  18071648 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgag 18071572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 20597317 - 20597393
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgag 77  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | |||||||||||    
T  20597317 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgag 20597393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 20603614 - 20603690
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgag 77  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | |||||||||||    
T  20603614 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgag 20603690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 23520625 - 23520713
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtata 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||| |||||||||    
T  23520625 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtata 23520713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 22318922 - 22318976
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaata 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22318922 acatacaacaaatttgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaaata 22318976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 20792260 - 20792345
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgt 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  20792260 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacaatgagtttgagtgt 20792345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 20609933 - 20609981
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttag 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20609933 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 20609981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22947195 - 22947147
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttag 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22947195 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 22947147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16774394 - 16774129
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16774394 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaaaggga 16774295  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16774294 ctcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 16774195  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16774194 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 16774129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 24796772 - 24797037
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24796772 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtatagacaaagggga 24796871  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24796872 ctcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcg 24796971  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24796972 cccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactattggacctatttcctat 24797037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 23160852 - 23161117
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23160852 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 23160951  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  23160952 ttcggggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaaccg 23161051  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23161052 tccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 23161117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 23572109 - 23572374
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23572109 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 23572208  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  23572209 ttcggggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaaccg 23572308  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23572309 tccagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 23572374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27630244 - 27629979
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27630244 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 27630145  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  27630144 ttcggggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaaccg 27630045  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27630044 tctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttttcccctactatcggacctatttcctat 27629979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 116269 - 116004
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  116269 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgagttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 116170  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  116169 ttctggtttttatgaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatcccttgatcttcactcacgcctaaccg 116070  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  116069 cctagctatgtatgttatgataccaccaactacgatttcgcccctactatcggacctatttcctat 116004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22870337 - 22870238
Alignment:
Q  167 tgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || |   || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22870337 tgtttatcccttggtcctcactcactcctagttgcccagctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccttaccatcggacctatttcctat 22870238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 24821561 - 24821815
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||||| | |||||| || |  | |||      
T  24821561 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtacaatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtagaacatgggtg 24821660  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      ||||| || ||||| |||||||||||||| || |     || || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  24821661 gacgaggcttaatgaagttcatagagataagggtct-----ttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcctcacccactcccaattg 24821755  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  24821756 cctagctatgtatgtgatgataccacccacaactatctctcccctaccatcagacctatt 24821815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 25372422 - 25372600
Alignment:
Q  9 caaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaaggggactcgaggt 108  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    | |||    ||| |     
T  25372422 caaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgc 25372521  T
Q  109 tttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcac 187  Q
    || ||||| |||||||||||||| || | ||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25372522 ttaatgaagttcatagagataagggtctatatgttaaacctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcac 25372600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 24170116 - 24170067
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24170116 acatacaaaaaatttgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 24170067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17867497 - 17867545
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttag 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  17867497 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 17867545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 25369023 - 25369072
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  25369023 acatacaacaaattgtcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 25369072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21826149 - 21825884
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21826149 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggga 21826050  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  21826049 ttcgggtttttatgaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttgatcttcactcacgccgaaccg 21825950  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21825949 cctagctatgtatgttatgataccaccaactacgatttctcccctactatcggacctatttcctat 21825884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 262
Target Start/End: Original strand, 22035079 - 22035229
Alignment:
Q  112 atgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgt 211  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |  ||||||||    
T  22035079 atgaaattcatagcaacaagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaacttcctagctatgt 22035178  T
Q  212 atgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttc 262  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22035179 atgttatggtaccaccaactacgatttctcccctactattggacctatttc 22035229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 21942904 - 21943163
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || |||||||   ||||||||||| |  ||||||||  | | |||      
T  21942904 acatacaacaaattttcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggtg 21943003  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||| || ||  |    
T  21943004 gtcgaggttttatgaagttcatagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatccattggtcttcacccactcccaattg 21943103  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |  | ||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  21943104 cctaactatgtatgtgatgataccacctaccactatctctcccctaccattagacctatt 21943163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 11348395 - 11348654
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| |||   ||||||||||| |  ||||||||  | | |||      
T  11348395 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggtg 11348494  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||| || ||  |    
T  11348495 gtcgaggttttatgaatttcaaagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatccattggtcttcacccactcccaattg 11348594  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |  | |||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  11348595 cctaactatgtctgtgatgataccacctaccactatctctcccctaccattagacctatt 11348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22368724 - 22368538
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || |||||||   ||||||||||| |  ||||||||  | | |||      
T  22368724 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggtg 22368625  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcac 187  Q
     || ||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  22368624 gtcaaggttttataaagttcatagagataagggcctctatgttaagcctattttttccctcaatcttgttaatcccttggtcttcac 22368538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22289804 - 22289618
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| | |||| | || ||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    | |||      
T  22289804 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgagataggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtg 22289705  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcac 187  Q
      ||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22289704 gacgatgattaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcac 22289618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29333348 - 29333263
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgt 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  29333348 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgt 29333263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22830666 - 22830402
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||| | || ||| ||| |  |||||||||| | |||||||||    | |||      
T  22830666 acatacaacaaattttcttccacctcggtattagtccgagatgggttaggaagtataattaaaatatgcacattgagtttgagtgtatatgtcatgggtg 22830567  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      ||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| |  ||  |    
T  22830566 gacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcttattgtttccctcaatcttgtttatcccttggttctcactcactctcaattg 22830467  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |   ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||    
T  22830466 ccttgctatatatgtgatgataccacccactactatctctcccttaccatcagacctattaccta 22830402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 21100287 - 21100375
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtata 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||| |||||||||    
T  21100287 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtata 21100375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19766234 - 19766161
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacatt 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||    
T  19766234 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttagaaagtaaaatcaaaataggcacatt 19766161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24307 - 24043
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24307 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggtaataatatcaaaataggcacattaagcttgagtgtataaacaaagggga 24208  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  24207 ttcgaggttttaggaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaaccg 24108  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24107 cctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttccta 24043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29246 - 28981
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29246 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaagttggcacattgagcttgagcgtataaacaaagggga 29147  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |        
T  29146 ttcgaggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctagttt 29047  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29046 cctagctatgtatgttatgataccaccaactactatttctcccctactatcggacctatttcctat 28981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 19425 - 19690
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19425 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 19524  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| || || ||       
T  19525 gtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgtttagcctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcctaactaactcctaatta 19624  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  19625 cccagctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccttaccatcagacctatttcctat 19690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 253246 - 253372
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || |||||||   ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||     
T  253246 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttgagtttgagtgtataatccaaggggg 253345  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagaga 127  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||    
T  253346 gtcgaggttttatgaagttcatagaga 253372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 25859 - 26119
Alignment:
Q  2 catacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaaggggac 101  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  25859 catacagcaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaagatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaaggggag 25958  T
Q  102 tcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgc 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    ||||| || ||  ||    
T  25959 tcgaggttttatgaagttcatagagataagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtc----ctcactcctaattgc 26054  T
Q  202 tcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26055 ccagctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccctaccatcggacctatttcctat 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 3518 - 3783
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3518 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggga 3617  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| || |   |    
T  3618 gtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttattccttggtcctcactcactcctagttg 3717  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  3718 cccagctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccttaccatcagacctatttcctat 3783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 5041 - 5306
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  5041 acatacaacaaattctcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaattaaaataggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggta 5140  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |    
T  5141 gtcgaggtttgatgaagttcatagagacaagagtttctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatccattggtcttcactcactcccaattg 5240  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  5241 cctagctatgtatgtgatgataccaccaactactatttctcccttaccatcagacctattacctat 5306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Original strand, 3 - 188
Alignment:
Q  81 gagtgtataaacaaaggggactcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctggg 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  3 gagtgtataaacaaaggggattcgaggttttatgaaattcattgctataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttgg 102  T
Q  181 tcttcactcacaccgaaccgctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttcctat 266  Q
    ||||||||||| || |   ||  | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  103 tcttcactcactcctagttgcctaactatgtatgttatgataccaccaactacaatttctcccctactatcggacctatttcctat 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44198 - 43934
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || |||||||   ||||||||||  |  ||||||||  | | |||      
T  44198 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgatttttagtgtatatgccatgggtg 44099  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||  |    
T  44098 gtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccactcccaattg 43999  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  43998 cctagctatgtatgtgatgataccacctaccactatctctcccctaccatcagacctattaccta 43934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51587 - 51323
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || |||||||   ||||||||||  |  ||||||||  | | |||      
T  51587 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgatttttagtgtatatgccatgggtg 51488  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||  |    
T  51487 gtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccactcccaattg 51388  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  51387 cctagctatgtatgtgatgataccacctaccactatctctcccctaccatcagacctattaccta 51323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10911 - 10647
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    | |||      
T  10911 acatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtg 10812  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  10811 gacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattg 10712  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  |||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||    
T  10711 cctagctatatatgtgatgataccaccgactactatctctcccttaccatcagacctattaccta 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18912 - 18648
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    | |||      
T  18912 acatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtg 18813  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  18812 gacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattg 18713  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  |||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||    
T  18712 cctagctatatatgtgatgataccaccgactactatctctcccttaccatcagacctattaccta 18648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 234487 - 234751
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    | |||      
T  234487 acatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtg 234586  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  234587 gacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattg 234686  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
    |  |||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||    
T  234687 cctagctatatatgtgatgataccaccgactactatctctcccttaccatcagacctattaccta 234751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 132394 - 132208
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| |  ||||||||  | | |||      
T  132394 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttaagtgtataggccatgggtg 132295  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcac 187  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |  ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  132294 gtcgaggttttatgaagttcaaagagaaaagggcctctatgttaagcctattgttaccctcaatcttgttaatcccttggtcttcac 132208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2040 - 1870
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || |||||||   | ||||||||| | |||||||||| | | ||||     
T  2040 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacagtcacattgagtttgagtgtataagccatggggg 1941  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttat 173  Q
     ||||||||||||||| |||||  ||| ||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1940 gtcgaggttttatgaagttcat--agacaagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttat 1870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 7944 - 8200
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||| | || |||||||   ||||| ||||  || ||||||||| | | |||      
T  7944 acatacaacaaattttcttccagctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttgatttg-agtgtataagccatgggtg 8042  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||| |||  | ||||| || || ||||| || ||||  |||||||| |||||| |||| |||| ||| || ||  |    
T  8043 gtcgaggtttaatgaagttcatagagacaaggatctctatgttaagcctattattccccttaatcttgttgatcccttggtcctcacccactcccaattg 8142  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggaccta 258  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  8143 cctagctatgtatgttatgataccacctacaactatctctcccctaccatcagaccta 8200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21620 - 21361
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtata-aacaaagggg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| | |||||| ||  |||  || |    
T  21620 acatacaacaaattttcttccacctcagtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaggacatgggtg 21521  T
Q  100 actcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaacc 199  Q
      | | || || ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| | || ||| || ||      
T  21520 gat-ggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccttggtccttacccactcccaatt 21422  T
Q  200 gctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
     |  ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21421 tcctagctatgtatgtgatgataccacccacaactatctctcccctactatcagacctatt 21361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1817 - 1687
Alignment:
Q  112 atgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgt 211  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| || ||  ||  ||||||||    
T  1817 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgttaccctcaattttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatgt 1718  T
Q  212 atgttgtgataccaccaactactatttctcc 242  Q
    ||||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  1717 atgtgatgataccacccacaactatctctcc 1687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6650 - 6386
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtataaacaaagggga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||  | | ||||||||| | |||||||||    | |||      
T  6650 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaatatagccacattgagtttgagtgtataggtcatgggtg 6551  T
Q  101 ctcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccg 200  Q
      ||| | || ||||| ||||||||  |||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||  |    
T  6550 gacgatgcttaatgaagttcatagaattaagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccactcccaattg 6451  T
Q  201 ctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatttccta 265  Q
       |||||| || ||  |||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  6450 gctagctatataggtgatgatgccacccactactatctctcctttaccatcagacctattaccta 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 22470 - 22729
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtata-aacaaagggg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| | |||||| ||  |||  || |    
T  22470 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaggacatgggcg 22569  T
Q  100 actcgaggttttatgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaacc 199  Q
    |  || || || ||||| |||||| ||||||  || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||| | | || ||      
T  22570 a-acggggcttaatgaagttcataaagataaaggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcctcaccctctcccaagt 22668  T
Q  200 gctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    |   ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22669 gtctagctatgtatgtgatgataccacccacaactatctctcccctactatcagacctatt 22729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 427 - 476
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  427 acatacaacaaatttgcttccacctccgtgttagtccgagatgggttagg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 904 - 819
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgt 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  904 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgt 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24095 - 24010
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgt 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  24095 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgt 24010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 10193 - 10148
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10193 acatacaacaaatttgcttccacctcagtgttagtccgagatgggt 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 32991 - 33040
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  32991 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtgcgagatgggttagg 33040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 19727 - 19812
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgt 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  19727 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtacaatcaaaataggcacattgagtttgagtgt 19812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 260
Target Start/End: Original strand, 19865 - 19977
Alignment:
Q  148 ctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgtatgttgtgataccaccaactactatttctcctctac 247  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||| ||| || ||  ||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  19865 ctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgataccacccacaactatctctcccctac 19964  T
Q  248 tatcggacctatt 260  Q
     ||| ||||||||    
T  19965 catcagacctatt 19977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12218 - 12142
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgag 77  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||| | |||||||||||    
T  12218 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgag 12142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12107 - 11959
Alignment:
Q  112 atgaaattcatagagataagagtttctatctttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctgggtcttcactcacaccgaaccgctcagctatgt 211  Q
    ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||| | |||||| |||| |||| ||| || ||  ||  ||||||||    
T  12107 atgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatgt 12008  T
Q  212 atgttgtgataccaccaactactatttctcctctactatcggacctatt 260  Q
    ||||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  12007 atgtgatgataccacccacaactatctctcccctactatcaaacctatt 11959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8547
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgtata 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||| |||||||||    
T  8459 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtata 8547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 354 - 403
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  354 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 39172 - 39221
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  39172 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtccaagatgggttagg 39221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 55017 - 54968
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  55017 acatacaacaaatttgcttccacctcggtgttaatccgagatgggttagg 54968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 122117 - 122032
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctggagtgt 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | || ||||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  122117 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaatataggcacattgagtttgagtgt 122032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 11305 - 11257
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttag 49  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  11305 acatacaacaaattcgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 11257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21682 - 21620
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaaa 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||| || | |||||||    
T  21682 acatacaacaaattttcttccacctcggtgttattccgagatgggttaggaaagataatcaaa 21620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 115423 - 115374
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  115423 acatacaacaaatttgcctccacctcggtgttaatccgagatgggttagg 115374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 119727 - 119678
Alignment:
Q  1 acatacaacaaatttgcttccacctcaatgttagttcgagatgggttagg 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  119727 acatacaacaaatttgcctccacctcggtgttaatccgagatgggttagg 119678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University