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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF21684_high_7 (Length: 355)
Name: NF21684_high_7
Description: NF21684
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF21684_high_7 |
 |  |
|
| [»] scaffold0076 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1500 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0191 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0892 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0516 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0155 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1666 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0406 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10644227 - 10644554
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644227 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
10644326 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644327 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat |
10644426 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644427 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
10644526 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644527 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
10644554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 47357662 - 47357992
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47357662 |
atccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
47357761 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
47357762 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
47357861 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357862 |
ccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaaattacatga |
47357961 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357962 |
ttgtgataataactaacccccttaccttaga |
47357992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13048477 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca |
13048378 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13048377 |
acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa |
13048278 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13048277 |
tcatgcatacaaacata |
13048261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15675338 - 15675105
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675338 |
gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag |
15675239 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15675238 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
15675140 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15675139 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
15675105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 31115643 - 31115861
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31115643 |
gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag |
31115742 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31115743 |
ga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
31115841 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31115842 |
atacaaacatatcatcacag |
31115861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104281
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10104445 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
10104347 |
T |
 |
| Q |
161 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10104346 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
10104281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 336
Target Start/End: Original strand, 18248286 - 18248564
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| || | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
18248286 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataatt-tcatatcttaacatttatacatacttt |
18248383 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18248384 |
gaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc |
18248483 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatg |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18248484 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttaccttagatgatg |
18248564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17145845 - 17145572
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| || | ||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
17145845 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcactaattgagtataatt-tcacaacttaacatttatacatacttt |
17145748 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| | | || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17145747 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc |
17145648 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17145647 |
aactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttaga |
17145572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 13246444 - 13246662
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13246444 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
13246543 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13246544 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgc |
13246642 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13246643 |
atacaaacatatcatcacag |
13246662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 18169109 - 18169308
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18169109 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18169208 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18169209 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18169308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54118493 - 54118276
Alignment:
| Q |
7 |
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105 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||| |
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| T |
54118493 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataact-aaatctaacaacaactta |
54118395 |
T |
 |
| Q |
106 |
ggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatg |
205 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
54118394 |
gca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
54118296 |
T |
 |
| Q |
206 |
catacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
54118295 |
catacaaacatatcatcaca |
54118276 |
T |
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Q |
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T |
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232 |
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328 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7131983 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
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7131982 |
aga |
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T |
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Target: chr4; HSP #13
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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| T |
19020625 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
19020724 |
T |
 |
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232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19020725 |
gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt |
19020824 |
T |
 |
| Q |
329 |
ag |
330 |
Q |
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|
|| |
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ag |
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Target: chr4; HSP #14
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193 |
Q |
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T |
 |
| Q |
194 |
catcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
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catcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
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T |
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Q |
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T |
 |
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232 |
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328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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aga |
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T |
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231 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
232 |
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328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
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||| |
|
|
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15287162 |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
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tcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15294371 |
gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15294272 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
15294271 |
aga |
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T |
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159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |
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|
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aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
40885652 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
40885651 |
gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag |
40885585 |
T |
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235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22738412 |
aacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacac |
22738511 |
T |
 |
| Q |
236 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22738512 |
gaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaagacaaacccccttaccttagat |
22738611 |
T |
 |
| Q |
333 |
gatgt |
337 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
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22738612 |
gatgt |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26680269 |
aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatattta |
26680366 |
T |
 |
| Q |
161 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26680367 |
aacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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T |
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Q |
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|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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caagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
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T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
26339352 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
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accttaga |
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
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Q |
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|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
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|
| T |
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aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
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T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
10488778 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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T |
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16328073 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
16327974 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16327973 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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T |
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catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8378377 |
catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta |
8378476 |
T |
 |
| Q |
316 |
accc |
319 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
8378477 |
accc |
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T |
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aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
8374576 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataatt-tcataacttaacatttatacatacttt |
8374673 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgca |
207 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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gaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
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T |
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atctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatc |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | || |||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7850090 |
atctcaattcaacaatcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatc |
7850189 |
T |
 |
| Q |
184 |
atacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatc |
222 |
Q |
| |
|
| ||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7850190 |
acacagttttcatcaatacattcattcaaacataacatc |
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T |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||| | || |||| ||||| |||||||| ||| || || |||||| ||||| | |
|
|
| T |
18238337 |
aacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaa-ttcaacaattagagcacaat--tcacaatatatcattttcacatacta |
18238241 |
T |
 |
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18238240 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
18238157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Original strand, 111409 - 111484
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca |
82 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
111409 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca |
111484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 337
Target Start/End: Original strand, 8378490 - 8378533
Alignment:
| Q |
294 |
tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8378490 |
tacatgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgt |
8378533 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795566
Alignment:
| Q |
256 |
atcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9795490 |
atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttag |
9795566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 33240890 - 33240947
Alignment:
| Q |
184 |
atacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33240890 |
atacaatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
33240947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 15044990 - 15045057
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15044990 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
15045057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15109434 - 15109367
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15109434 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
15109367 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13442777 - 13442676
Alignment:
| Q |
142 |
taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
13442777 |
taacattttcacatactatgaacatgcaatttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaat |
13442678 |
T |
 |
| Q |
240 |
tt |
241 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
13442677 |
tt |
13442676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13590254 - 13590213
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13590254 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
13590213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 329
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996477
Alignment:
| Q |
296 |
catgattgtgataataactaacccccttacctta |
329 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14996444 |
catgattatgataataactaacccccttacctta |
14996477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 101
Target Start/End: Original strand, 18276501 - 18276541
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaa |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
18276501 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaa |
18276541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16821147 - 16821474
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821147 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
16821246 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821247 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
16821346 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821347 |
ttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
16821446 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821447 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
16821474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 55316227 - 55316555
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
55316227 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
55316326 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
55316327 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
55316426 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
55316427 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
55316526 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
55316527 |
attgtgataataactaacccctttacctt |
55316555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 41270083 - 41270411
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
41270083 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
41270182 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
41270183 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaat |
41270282 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41270283 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaattacatg |
41270382 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41270383 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
41270411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 15614848 - 15615174
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
15614848 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttag |
15614947 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15614948 |
ca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgc |
15615046 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
306 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15615047 |
atacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattatga |
15615146 |
T |
 |
| Q |
307 |
taataactaacccccttaccttagatga |
334 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15615147 |
taaagactaacccccttaccttaaatga |
15615174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15936882 - 15936551
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15936882 |
atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
15936783 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15936782 |
acttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
15936684 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
15936683 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
15936584 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15936583 |
tgattataatgataactaacccccataccttag |
15936551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15938724 - 15938393
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15938724 |
atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
15938625 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938624 |
acttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
15938526 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
15938525 |
tcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
15938426 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938425 |
tgattataatgataactaacccccttaccttag |
15938393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14842816 - 14842577
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14842816 |
atccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
14842717 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14842716 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaat |
14842618 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14842617 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
14842577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13975977 - 13975738
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
13975977 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
13975878 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
13975877 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
13975778 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13975777 |
tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
13975738 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
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Target Start/End: Original strand, 45860813 - 45861052
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
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T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
45860913 |
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45861012 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
45861013 |
tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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T |
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Target: chr3; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 1 - 241
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
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T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13955045 |
acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
13954946 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
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tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 15859273 - 15859040
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Q |
| |
|
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gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttag |
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T |
 |
| Q |
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gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15859173 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
15859075 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15859074 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
15859040 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51158267 - 51158034
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| Q |
7 |
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106 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51158167 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
51158069 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
51158068 |
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T |
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Target: chr3; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 7 - 241
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7 |
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106 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12030296 |
ca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
12030198 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12030197 |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12264981 - 12264710
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61 |
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159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |
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|
| T |
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aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
12264883 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
12264882 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc |
12264783 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12264782 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12264710 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 2049824 - 2050057
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2049824 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttag |
2049923 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
2049924 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggc |
2050022 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2050023 |
atacaaacatatcgtcacagttggagcacgaattt |
2050057 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 13838908 - 13839141
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7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
13838908 |
gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag |
13839007 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
13839008 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgc |
13839106 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13839107 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
13839141 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 18911132 - 18911334
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Q |
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|
| T |
18911132 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
18911231 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18911232 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18911331 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
18911332 |
aga |
18911334 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 49232575 - 49232774
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
49232575 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
49232674 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
49232675 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12902207 - 12902006
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12902207 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga |
12902108 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12902107 |
gcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
12902008 |
T |
 |
| Q |
329 |
ag |
330 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
12902007 |
ag |
12902006 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 336
Target Start/End: Original strand, 54651529 - 54651803
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162 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
54651529 |
tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtataatt-tcataacttaacatttatacatactttgcaa |
54651626 |
T |
 |
| Q |
163 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc |
262 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
54651627 |
catgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacc |
54651726 |
T |
 |
| Q |
263 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatg |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54651727 |
cattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 22275348 - 22275547
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231 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || || ||||||||||||| |
|
|
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22275348 |
tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275448 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
22275547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 25058878 - 25059077
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25058878 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
25058977 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatta---catgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25058978 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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Target Start/End: Complemental strand, 15468457 - 15468258
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Q |
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| T |
15468457 |
tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaaga |
15468358 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15468357 |
gcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15468258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17912730 - 17912516
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7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || |
|
|
| T |
17912730 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacata- |
17912632 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
17912631 |
-tcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
17912533 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17912532 |
atacaaacatatcatca |
17912516 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1467856 - 1467657
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
1467856 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1467757 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1467756 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1467657 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 133 - 331
Target Start/End: Original strand, 5228451 - 5228653
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| Q |
133 |
ctcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaag |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5228451 |
ctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaag |
5228550 |
T |
 |
| Q |
231 |
agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5228551 |
agcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacct |
5228649 |
T |
 |
| Q |
328 |
taga |
331 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
5228650 |
taga |
5228653 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
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Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18896962
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| Q |
163 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
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|
| T |
18897130 |
catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc |
18897031 |
T |
 |
| Q |
263 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897030 |
cattttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18896962 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 12811980 - 12812179
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
12811980 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaaga |
12812079 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12812080 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12812179 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11986362 - 11986182
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
11986362 |
aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcactatttgagcacaatt-tcataacttgacattaatacatacttt |
11986265 |
T |
 |
| Q |
161 |
aa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11986264 |
aaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
11986182 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449254
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
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|
| T |
2449385 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
2449286 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
2449285 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
2449254 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
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Target Start/End: Original strand, 44229124 - 44229332
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
44229124 |
tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
44229223 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacct |
327 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | | ||||| |||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44229224 |
gcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacct |
44229322 |
T |
 |
| Q |
328 |
tagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
44229323 |
tagatgatgt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16744262 - 16744131
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| Q |
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
16744262 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggata |
16744163 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16744162 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
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T |
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Target: chr3; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 47984718 - 47984763
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
47984718 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaacttag |
47984763 |
T |
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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Original strand, 47994005 - 47994050
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
47994005 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaacttag |
47994050 |
T |
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Target: chr3; HSP #35
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48003292 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaacttag |
48003337 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48012578 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaacttag |
48012623 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41661729 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattt |
41661812 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
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catgattgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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8268683 |
catgattatgataataactaacccccttaccttaga |
8268648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275748
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| Q |
296 |
catgattgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8275783 |
catgattatgataataactaacccccttaccttaga |
8275748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
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Query Start/End: Original strand, 291 - 334
Target Start/End: Original strand, 30153259 - 30153302
Alignment:
| Q |
291 |
aattacatgattgtgataataactaacccccttaccttagatga |
334 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30153259 |
aattaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagatga |
30153302 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
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Target Start/End: Complemental strand, 31412416 - 31412333
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tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31412416 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
31412333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 11638424 - 11638465
Alignment:
| Q |
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aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11638424 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
11638465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Original strand, 15876135 - 15876179
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactta |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15876135 |
aacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaactta |
15876179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Original strand, 16880188 - 16880256
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| Q |
59 |
ataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagca |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
16880188 |
ataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagca |
16880256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47784851 - 47784767
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
47784851 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 13572684 - 13573015
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1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13572684 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca |
13572783 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
13572784 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaat |
13572883 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13572884 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
13572983 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13572984 |
attgtgataataactaacccccttaccttaga |
13573015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13911269 - 13910939
Alignment:
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Q |
| |
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|
|
| T |
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atccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
13911170 |
T |
 |
| Q |
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actt-aggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13911169 |
actttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaa |
13911070 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--aca |
297 |
Q |
| |
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|
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| T |
13911069 |
ttcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaattacaca |
13910970 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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||||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
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| T |
13910969 |
tgattatgataatcaataacccccttacctt |
13910939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10989418 - 10989746
Alignment:
| Q |
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10989517 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
10989616 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10989617 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaaattatacat |
10989716 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10989717 |
gattatgataatcactaacccccatacctt |
10989746 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 2437465 - 2437794
Alignment:
| Q |
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||| |
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|
| T |
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atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaaca |
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T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
2437565 |
acttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
2437664 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2437665 |
tcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacat |
2437764 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2437765 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
2437794 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16479205 - 16478879
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| || || | |
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|
| T |
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atccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaata |
16479106 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16479105 |
acttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
16479007 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16479006 |
tcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattaaatga |
16478907 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16478906 |
ttatgataatcactaacccccttacctt |
16478879 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18254090 - 18253759
Alignment:
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
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T |
 |
| Q |
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acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253990 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
18253892 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
18253891 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
18253792 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253791 |
tgattataatgataactaacccccttaccttag |
18253759 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25292593 - 25292372
Alignment:
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |
|
|
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgaca |
25292494 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
25292493 |
acctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
25292395 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25292394 |
tcatacatacaaacatatcatca |
25292372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47481280 - 47481047
Alignment:
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
47481280 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttag |
47481181 |
T |
 |
| Q |
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gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47481180 |
ca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
47481082 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
47481081 |
atacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
47481047 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 16211780 - 16212013
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| | ||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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16211879 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16211880 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
16211978 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16211979 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
16212013 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 241
Target Start/End: Original strand, 13321080 - 13321263
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156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
13321080 |
ataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatac |
13321177 |
T |
 |
| Q |
157 |
tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13321178 |
tttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
13321263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 36052681 - 36052896
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
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gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac---ttag |
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T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36052778 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgc |
36052876 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
36052877 |
atacaaacgtatcatcacag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11580988 - 11580755
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Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11580888 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
11580790 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11580789 |
atacaaacatattatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13037263 - 13037030
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
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T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
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T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13037064 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18980138 - 18979936
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134 |
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231 |
Q |
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| T |
18980138 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18980039 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
18980038 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18979939 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
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||| |
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| T |
18979938 |
aga |
18979936 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15950908 - 15950709
Alignment:
| Q |
134 |
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231 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
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| T |
15950808 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15950709 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 13758509 - 13758711
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
13758608 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
13758609 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13758708 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
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||| |
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13758709 |
aga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15760231 - 15760029
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
15760131 |
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15760032 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
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||| |
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15760031 |
aga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 7822867 - 7823066
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
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| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
7822967 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7823066 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 7830178 - 7830377
Alignment:
| Q |
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231 |
Q |
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| T |
7830178 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
7830277 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
7830278 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7830377 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 15927707 - 15927909
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
15927807 |
gcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15927906 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
15927907 |
aga |
15927909 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27101754 - 27101555
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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| T |
27101754 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
27101655 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27101654 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
27101555 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27109102 - 27108903
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| Q |
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231 |
Q |
| |
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|
| T |
27109102 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
| T |
27109002 |
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27108903 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 27176572 - 27176771
Alignment:
| Q |
134 |
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231 |
Q |
| |
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| T |
27176572 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
27176671 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27176672 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
27176771 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38783846 - 38783647
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38783746 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
38783647 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 3059980 - 3060213
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| Q |
7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
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|
| T |
3059980 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaa |
3060079 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||||||||| || |||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |
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| T |
3060080 |
ca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgc |
3060178 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3060179 |
atacaaatatattatcacagttggagcacgaattt |
3060213 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14251015 - 14250813
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14250915 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttacctt |
14250816 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
14250815 |
aga |
14250813 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622575
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
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|
| T |
48622758 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca |
48622659 |
T |
 |
| Q |
257 |
tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | | ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48622658 |
tcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
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Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
7293085 |
aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattta |
7293182 |
T |
 |
| Q |
161 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7293183 |
aacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
7293263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516474
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
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|
| T |
11516343 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
11516442 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
11516443 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
11516474 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441580
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
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|
| T |
15441711 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
15441612 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
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|
| T |
15441611 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
15441580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 337
Target Start/End: Original strand, 16418731 - 16418844
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
16418731 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt |
16418830 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
16418831 |
accttagatgatgt |
16418844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262145
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30262276 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
30262177 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
30262176 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
30262145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10000455 - 10000279
Alignment:
| Q |
163 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacc |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||| ||| || | |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10000455 |
catgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaa-acaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacc |
10000357 |
T |
 |
| Q |
263 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10000356 |
catttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgt |
10000279 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 330
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862259
Alignment:
| Q |
248 |
aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862174 |
aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttag |
15862259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 296003
Alignment:
| Q |
136 |
ataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataaca |
220 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
296087 |
ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataaca |
296003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914928
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16915013 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
16914928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 13377691 - 13377758
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13377691 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
13377758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 28722274 - 28722357
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
28722274 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt |
28722357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611555
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9611470 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9611555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9723987 - 9723946
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9723987 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
9723946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839126
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9839041 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9839126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Original strand, 28390476 - 28390561
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttga |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28390476 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttga |
28390561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 46474068 - 46474109
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46474068 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
46474109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21852203 - 21851881
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21852203 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttag |
21852104 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
21852103 |
gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc |
21852004 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatgattgtg |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21852003 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatgattgtg |
21851904 |
T |
 |
| Q |
306 |
ataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21851903 |
ataataactaacccccttacctt |
21851881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21844810 - 21844490
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21844810 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttag |
21844711 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
21844710 |
gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc |
21844611 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatgattgtg |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844610 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatgattgtg |
21844511 |
T |
 |
| Q |
306 |
ataataactaacccccttacc |
326 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844510 |
ataataactaacccccttacc |
21844490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16674636 - 16674305
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
16674636 |
atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
16674537 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |
|
|
| T |
16674536 |
acttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaat |
16674437 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16674436 |
tcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
16674337 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16674336 |
attgtgataataactaacccccttaccttaga |
16674305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 30120736 - 30121060
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30120736 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttag |
30120835 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||| |
|
|
| T |
30120836 |
gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgc |
30120935 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattg |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
30120936 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgatta |
30121035 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30121036 |
tgataatcactaacccccttacctt |
30121060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 24548996 - 24549319
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
24548996 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttag |
24549095 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24549096 |
ca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
24549194 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24549195 |
atacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattatga |
24549294 |
T |
 |
| Q |
307 |
taataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24549295 |
taatcactaacccccttaccttaga |
24549319 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6774495 - 6774175
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
6774495 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttag |
6774396 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6774395 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
6774297 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6774296 |
atacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaattacatgattatga |
6774197 |
T |
 |
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307 |
taataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taatcactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
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Target Start/End: Complemental strand, 222935 - 222754
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Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
222935 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
222836 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
222835 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
222754 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 736558 - 736377
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1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
736558 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
736459 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
736458 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
736377 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 860453 - 860272
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1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
860453 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
860354 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
860353 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
860272 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
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Target Start/End: Complemental strand, 43373717 - 43373484
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106 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag |
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T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43373617 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgc |
43373519 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43373518 |
atacaaacgtatcatcacagttggagcacgaattt |
43373484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16193965 - 16193732
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7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
16193965 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttgg |
16193866 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16193865 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
16193767 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16193766 |
atacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
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T |
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Target: chr8; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 16195298 - 16195577
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159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| |||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
16195298 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
16195396 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
16195397 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatc |
16195496 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatg |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16195497 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatg |
16195577 |
T |
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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24929040 - 24928807
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || || | ||||| |||| ||||||||| |
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|
| T |
24929040 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttag |
24928941 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24928940 |
c-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
24928842 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24928841 |
atacaaacatataatcacagttggagcacgaattt |
24928807 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
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Target Start/End: Complemental strand, 22006375 - 22006176
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231 |
Q |
| |
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|
| T |
22006375 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22006276 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13721045 - 13720843
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
13721045 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
13720946 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13720945 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13720846 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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13720845 |
aga |
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T |
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Target: chr8; HSP #16
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Target Start/End: Complemental strand, 16873168 - 16872966
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16873168 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
16873069 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16873068 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16872969 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
16872968 |
aga |
16872966 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 17345584 - 17345816
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| Q |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
17345584 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttag |
17345682 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17345683 |
ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
17345781 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17345782 |
atataaacataacatcacagttagagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13662282 |
gcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13662183 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
13662182 |
aga |
13662180 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 271477 - 271278
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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271377 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 644443 - 644642
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231 |
Q |
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|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
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644443 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
644543 |
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644642 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 830178 - 830377
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
830178 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
830277 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
830278 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16405169 - 16404991
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
16405169 |
ataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatt |
16405074 |
T |
 |
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
16405073 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
16404991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22088911 - 22088712
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22088911 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22088812 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22088811 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
22088712 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15319276 - 15319077
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15319276 |
tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga |
15319177 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15319176 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15319077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15499645 - 15499446
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15499645 |
tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga |
15499546 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15499545 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15499446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22907408 - 22907230
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
22907408 |
aacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattta |
22907311 |
T |
 |
| Q |
161 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22907310 |
aacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
22907230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238334
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5238203 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
5238302 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
5238303 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
5238334 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661264
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24661395 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
24661296 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
24661295 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
24661264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685793
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43685662 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
43685761 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
43685762 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
43685793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691909
Alignment:
| Q |
121 |
tttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaat |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691970 |
tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat |
691909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011741
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
26011656 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
26011741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22497389 - 22497209
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatt-tagcacaatactcataacttaacatttttacatatt- |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||| ||| || || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
22497389 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagca-caattcaacaattagagcacaat--tcacaatatatcattttcacatatta |
22497293 |
T |
 |
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22497292 |
tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
22497209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 5854681 - 5854722
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5854681 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
5854722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 38533716 - 38533757
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38533716 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
38533757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45465227 - 45465126
Alignment:
| Q |
142 |
taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
45465227 |
taacattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaat |
45465128 |
T |
 |
| Q |
240 |
tt |
241 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
45465127 |
tt |
45465126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 223
Target Start/End: Original strand, 15933443 - 15933527
Alignment:
| Q |
141 |
ttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15933443 |
ttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca |
15933527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 43005 - 43333
Alignment:
| Q |
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43005 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaaca |
43104 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43105 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
43204 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-caaatgcaaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43205 |
tcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaaattacatg |
43304 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43305 |
tttgtgatagtaactaacccccttacctt |
43333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 39242 - 39441
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39242 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
39341 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39342 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
39441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 27009849 - 27010180
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27009849 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca |
27009948 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27009949 |
acttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaat |
27010048 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27010049 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
27010148 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27010149 |
attgtgataataactaacccccttaccttaga |
27010180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18778236 - 18777907
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18778236 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
18778137 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
18778136 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
18778037 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18778036 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
18777937 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777936 |
gattatgataatcactaacccccttacctt |
18777907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 25426636 - 25426965
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
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Q |
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25426636 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
25426735 |
T |
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200 |
Q |
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| T |
25426736 |
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25426835 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
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| T |
25426836 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
25426935 |
T |
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| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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gattatgataatcactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 43443639 - 43443312
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Q |
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T |
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| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
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T |
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201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
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tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccattttcatataacatgagaatatgcaattacacatga |
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T |
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301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
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43443339 |
ttatgataatcactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12382 - 12711
Alignment:
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100 |
Q |
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T |
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101 |
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200 |
Q |
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| T |
12482 |
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T |
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| Q |
201 |
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298 |
Q |
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| T |
12582 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaattacacat |
12681 |
T |
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| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
12682 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22366725 - 22366396
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
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| T |
22366625 |
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T |
 |
| Q |
201 |
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298 |
Q |
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| T |
22366525 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
22366426 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
22366425 |
gattatgataatcactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4200223 - 4199900
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106 |
Q |
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gaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacataa |
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T |
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| Q |
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206 |
Q |
| |
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| T |
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gagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc |
4200024 |
T |
 |
| Q |
207 |
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304 |
Q |
| |
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| T |
4200023 |
atacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacatgattat |
4199924 |
T |
 |
| Q |
305 |
gataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
4199923 |
gataatccctaacccccttacctt |
4199900 |
T |
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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 19499907 - 19500236
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
19499907 |
atccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
19500006 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
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| T |
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19500106 |
T |
 |
| Q |
201 |
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298 |
Q |
| |
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| T |
19500107 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
19500206 |
T |
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| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
19500207 |
gattatgataatcactaacccccttacctt |
19500236 |
T |
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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21073839 - 21073510
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100 |
Q |
| |
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atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
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T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
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| T |
21073739 |
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21073640 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
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| T |
21073639 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
21073540 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21073539 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188201
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Q |
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|
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atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat |
29188385 |
T |
 |
| Q |
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catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgac |
244 |
Q |
| |
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|
| T |
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catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc |
29188285 |
T |
 |
| Q |
245 |
atgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29188284 |
atgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattataataatcactaacccccttacctt |
29188201 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 23506979 - 23507196
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Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
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|
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23506979 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag |
23507078 |
T |
 |
| Q |
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gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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| T |
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ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
23507177 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
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|
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| T |
23507178 |
atacaaacatatcatcaca |
23507196 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35791287 - 35791013
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aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
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| T |
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aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
35791189 |
T |
 |
| Q |
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gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
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| T |
35791188 |
gaaacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc |
35791089 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35791088 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttaga |
35791013 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18531264 - 18531083
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ataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatt |
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Q |
| |
|
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| T |
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ataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataat |
18531166 |
T |
 |
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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|
| T |
18531165 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22054082 - 22053849
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gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
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| T |
22054082 |
gaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag |
22053983 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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| T |
22053982 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatac |
22053884 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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| T |
22053883 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
22053849 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11212253 - 11211983
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61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
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Q |
| |
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| T |
11212253 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactacttgagtataatt-tcataacttaacatttatacacacttt |
11212156 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
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|
| T |
11212155 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatc |
11212056 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11212055 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
11211983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 7425463 - 7425665
Alignment:
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134 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| | || ||||||||||||||||| |
|
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| T |
7425463 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga |
7425562 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7425563 |
gcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7425662 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
7425663 |
aga |
7425665 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 23514700 - 23514902
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23514700 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
23514799 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23514800 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
23514899 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
23514900 |
aga |
23514902 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
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Target Start/End: Complemental strand, 27182796 - 27182578
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
27182697 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27182696 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgc |
27182598 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27182597 |
atacaaacatatcatcacag |
27182578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 34939292 - 34939524
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| Q |
7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
34939292 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttag |
34939390 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34939391 |
ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
34939489 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34939490 |
atacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
34939524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17471705 - 17471506
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
17471705 |
tcattacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
17471606 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17471605 |
gcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
17471506 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1219637 - 1219435
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| Q |
134 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| | ||||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
1219637 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1219538 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1219537 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
1219438 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
1219437 |
aga |
1219435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10778087 - 10777888
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
10778087 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
10777988 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10777987 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctt |
10777888 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21932498 - 21932299
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21932498 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
21932399 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21932398 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21932299 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21938668 - 21938469
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21938668 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
21938569 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21938568 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21938469 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 35582175 - 35582374
Alignment:
| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35582175 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
35582274 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35582275 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
35582374 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36989887 - 36989688
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||| ||| |
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|
| T |
36989887 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctaga |
36989788 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36989787 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
36989688 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22883201 - 22883006
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22883201 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22883102 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaaccccctta |
324 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22883101 |
gcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 23328791 - 23328898
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227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
23328890 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
23328891 |
accttaga |
23328898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 24616395 - 24616502
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227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24616494 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
24616495 |
accttaga |
24616502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 24712771 - 24712878
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24712870 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
24712871 |
accttaga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 24745789 - 24745896
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24745789 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
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T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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accttaga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623216
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20623085 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
20623184 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
20623185 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
20623216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233544
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21233675 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
21233576 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21233575 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
21233544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Original strand, 32950761 - 32950942
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataac-ttaacatttttacata-tt |
158 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||| ||||||| || || ||| |||||| || |
|
|
| T |
32950761 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagta-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataactttgacctttatacatactt |
32950858 |
T |
 |
| Q |
159 |
tg-aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32950859 |
tgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
32950942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900422
Alignment:
| Q |
111 |
aattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatac |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25900552 |
aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
25900453 |
T |
 |
| Q |
211 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
25900452 |
aaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
25900422 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536444
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
16536313 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata |
16536412 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16536413 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
16536444 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052991
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37052860 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
37052959 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
37052960 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
37052991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23981625 - 23981516
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
23981625 |
tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattaga |
23981526 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
23981525 |
gcacgaattt |
23981516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21310794 - 21310709
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21310794 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
21310709 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5450928 - 5450861
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5450928 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
5450861 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26559898 - 26559815
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26559898 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaattt |
26559815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 19862371 - 19862456
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
19862371 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19862456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 21617083 - 21617124
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21617083 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
21617124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 49 - 372
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttag |
148 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
149 |
gagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc |
248 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
249 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagc-aatgcaaaattacatgattttga |
347 |
T |
 |
| Q |
307 |
taataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
348 |
taataactaacccccttaccttaga |
372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 64772 - 64436
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
64772 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca |
64673 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc--- |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
64672 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaat |
64573 |
T |
 |
| Q |
198 |
--aaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaatt |
294 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
64572 |
ataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt |
64473 |
T |
 |
| Q |
295 |
acatgattgtgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
64472 |
acatgattgtgataataactaacccccttaccttaga |
64436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 107755 - 108086
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
107755 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
107854 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
107855 |
acttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
107953 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
107954 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
108053 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108054 |
tgattataatgataactaacccccttaccttag |
108086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5072632 - 5072304
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
5072632 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
5072533 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5072532 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
5072433 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5072432 |
tcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaaattacatg |
5072333 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5072332 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
5072304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18601362 - 18601052
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
18601362 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
18601263 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
18601262 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
18601163 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18601162 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
18601063 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataat |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18601062 |
attgtgataat |
18601052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 22227817 - 22228146
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22227817 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
22227916 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22227917 |
acttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat |
22228015 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttaca |
297 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22228016 |
tcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtaca |
22228115 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22228116 |
tgattatgataataactaacccccttacctt |
22228146 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 22232514 - 22232843
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22232514 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
22232613 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232614 |
acttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat |
22232712 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttaca |
297 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22232713 |
tcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtaca |
22232812 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232813 |
tgattatgataataactaacccccttacctt |
22232843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 2116268 - 2116595
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| Q |
7 |
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105 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2116268 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataactta |
2116367 |
T |
 |
| Q |
106 |
ggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatg |
205 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2116368 |
gca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
2116466 |
T |
 |
| Q |
206 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtg |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2116467 |
catacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattatg |
2116566 |
T |
 |
| Q |
306 |
ataataactaacccccttaccttagatga |
334 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2116567 |
ataatcactaacccctttaccttaaatga |
2116595 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 334
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051763
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45051489 |
ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt |
45051587 |
T |
 |
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45051588 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc |
45051687 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttaccttagatga |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45051688 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatcacatgattatgataaagactaacccccttaccttaaatga |
45051763 |
T |
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Target: chr1; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 20931359 - 20931592
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7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
20931359 |
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20931458 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20931459 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
20931557 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20931558 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20931592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 20913051 - 20913277
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| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
20913051 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aattaacaacaactttg |
20913143 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20913144 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
20913242 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20913243 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20913277 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20893875 - 20893657
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| Q |
7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20893875 |
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20893776 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20893775 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
20893677 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20893676 |
atacaaacatatcatcacag |
20893657 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18059875 - 18059676
Alignment:
| Q |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18059875 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18059776 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18059775 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18059676 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 41394230 - 41394469
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| Q |
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | |
|
|
| T |
41394230 |
atccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaata |
41394329 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394330 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
41394428 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
41394429 |
ttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
41394469 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 20445693 - 20445910
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttag |
20445792 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20445793 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
20445891 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20445892 |
atacaaacatatcatcaca |
20445910 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 7 - 217
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gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531458 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttag |
20531557 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20531558 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
20531656 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacata |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
20531657 |
atacaaacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| || | |||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
46523528 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctta |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46523628 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctta |
46523727 |
T |
 |
| Q |
330 |
ga |
331 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
46523728 |
ga |
46523729 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaaccccc |
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Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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17148806 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 134 - 328
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || |||||||||||| || | |
|
|
| T |
38055208 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaa |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37844700 - 37844484
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| | ||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37844700 |
gaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
37844601 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactca-taacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatg |
205 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| |||||||| ||| || ||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37844600 |
ca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
37844502 |
T |
 |
| Q |
206 |
catacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37844501 |
catacaaacatatcatca |
37844484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19962616 - 19962417
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| ||| || | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19962616 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga |
19962517 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19962516 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19962417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 22035681 - 22035788
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22035681 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
22035780 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22035781 |
accttaga |
22035788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7640956 - 7640849
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7640956 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
7640857 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
7640856 |
accttaga |
7640849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452721
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
51452608 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
51452707 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |
|
|
| T |
51452708 |
caaacatatcatca |
51452721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22143470 - 22143361
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat--catgcatacaaacataacatcacagcaag |
230 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |
|
|
| T |
22143470 |
tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatca-caaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttag |
22143372 |
T |
 |
| Q |
231 |
agcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22143371 |
agcacgaattt |
22143361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 25093926 - 25093967
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25093926 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
25093967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19886905 - 19886576
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19886905 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
19886806 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
19886805 |
acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
19886706 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19886705 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
19886606 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886605 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
19886576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17396908 - 17396669
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
17396908 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
17396809 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
17396808 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
17396709 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17396708 |
tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
17396669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24341586 - 24341420
Alignment:
| Q |
59 |
ataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatt |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
24341586 |
ataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataat |
24341488 |
T |
 |
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24341487 |
tgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
24341420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 462752 - 462985
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
462752 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
462851 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
462852 |
ca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
462950 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
462951 |
atacaaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
462985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19794959 - 19794720
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19794959 |
atccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaaca |
19794860 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19794859 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaat |
19794761 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19794760 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
19794720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20627562 - 20627329
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| ||||||| | || || | ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20627562 |
gaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaa |
20627463 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
20627462 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgc |
20627364 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20627363 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20627329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36982690 - 36982457
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
36982690 |
gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttgg |
36982591 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36982590 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatga |
36982492 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36982491 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
36982457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 12728531 - 12728733
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12728531 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
12728630 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12728631 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12728730 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
12728731 |
aga |
12728733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25265585 - 25265406
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25265585 |
aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
25265487 |
T |
 |
| Q |
161 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
25265486 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt |
25265406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 8891256 - 8891489
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8891256 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
8891355 |
T |
 |
| Q |
107 |
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206 |
Q |
| |
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| T |
8891356 |
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8891454 |
T |
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| Q |
207 |
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241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8891455 |
atacaaacatattatcacagttggagcacgaattt |
8891489 |
T |
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Target: chr2; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 43643206 - 43642989
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7 |
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Q |
| |
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||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| || |
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| T |
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43643107 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43643106 |
aa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
43643008 |
T |
 |
| Q |
207 |
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225 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43643007 |
atacaaacatatcatcaca |
43642989 |
T |
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Target: chr2; HSP #12
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99 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
100 |
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199 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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7507902 |
T |
 |
| Q |
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241 |
Q |
| |
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||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
7507901 |
ttcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaattt |
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T |
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Target: chr2; HSP #13
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231 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
329 |
aga |
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Q |
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aga |
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T |
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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
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Target Start/End: Original strand, 17006392 - 17006594
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231 |
Q |
| |
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T |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
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gcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
 |
| Q |
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aga |
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Q |
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T |
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Target: chr2; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 34824614 - 34824816
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231 |
Q |
| |
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T |
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328 |
Q |
| |
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| T |
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34824813 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
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||| |
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34824814 |
aga |
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T |
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Target: chr2; HSP #16
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
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| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
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23777963 |
T |
 |
| Q |
329 |
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330 |
Q |
| |
|
|| |
|
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ag |
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T |
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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3798720 - 3798518
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231 |
Q |
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3798720 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
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T |
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232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|
| T |
3798620 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
3798521 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
3798520 |
aga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 8943985 - 8944187
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
8944084 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|
| T |
8944085 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
8944184 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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8944185 |
aga |
8944187 |
T |
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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12635985 - 12635783
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|
| T |
12635885 |
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12635786 |
T |
 |
| Q |
329 |
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331 |
Q |
| |
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||| |
|
|
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12635785 |
aga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 134 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12641759 - 12641554
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12641659 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12641560 |
T |
 |
| Q |
329 |
agatga |
334 |
Q |
| |
|
|||||| |
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|
| T |
12641559 |
agatga |
12641554 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11231455 - 11231256
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
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11231455 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11231355 |
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T |
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Target: chr2; HSP #22
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Q |
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|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24685898 - 24685699
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231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24685898 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
24685799 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|
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24685798 |
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24685699 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42178086 - 42177884
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| |
|
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| T |
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 |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
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|
| T |
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 |
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329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
42177886 |
aga |
42177884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 23774370 - 23774477
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23774370 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaaccccctt |
23774469 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
23774470 |
accttaga |
23774477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5888652 - 5888539
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
5888652 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt |
5888553 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
5888552 |
accttagatgatgt |
5888539 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689417
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19689548 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
19689449 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
19689448 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
19689417 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820318
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23820187 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
23820286 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
23820287 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
23820318 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906456
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14906587 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
14906488 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
14906487 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
14906456 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 337
Target Start/End: Original strand, 21142034 - 21142242
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
21142034 |
tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
21142133 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || | ||||| |||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21142134 |
gcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaatttttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacct |
21142232 |
T |
 |
| Q |
328 |
tagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21142233 |
tagatgatgt |
21142242 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015258
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| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
20015127 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg |
20015226 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
20015227 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
20015258 |
T |
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Target: chr2; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 68154 - 68221
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
68154 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
68221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 24277925 - 24278008
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24277925 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
24278008 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16292981 - 16292940
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16292981 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
16292940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884933
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
24884848 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
24884933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9586 - 9257
Alignment:
| Q |
7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
9586 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttag |
9487 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9486 |
ca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
9388 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9387 |
atacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
9288 |
T |
 |
| Q |
307 |
taataactaacccccttaccttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9287 |
taataactaacccccttaccttagatgatgt |
9257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16484 - 16155
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
16484 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttag |
16385 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16384 |
ca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
16286 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16285 |
atacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
16186 |
T |
 |
| Q |
307 |
taataactaacccccttaccttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16185 |
taataactaacccccttaccttagatgatgt |
16155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 36101 - 36430
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36101 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaaca |
36200 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
36201 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
36300 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| |
|
|
| T |
36301 |
tcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacat |
36400 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36401 |
gattatgataatcattaacccccttacctt |
36430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 48612 - 48845
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
48612 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttag |
48711 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48712 |
ca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
48810 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48811 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
48845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 154124 - 153922
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
154124 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
154025 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154024 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
153925 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
153924 |
aga |
153922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169830
Alignment:
| Q |
206 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
169951 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattatacatgatta |
169852 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttac |
325 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
169851 |
tgataatcactaacccccttac |
169830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31920 - 31593
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31920 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
31821 |
T |
 |
| Q |
101 |
actt-aggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
31820 |
actttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaa |
31721 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--aca |
297 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |
|
|
| T |
31720 |
ttcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaattacaca |
31621 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttac |
325 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31620 |
tgattatgataatcactaacccccttac |
31593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 128417 - 128200
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
128417 |
gaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaa |
128319 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
128318 |
ca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
128220 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
128219 |
atacaaacatatcatcacag |
128200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 25175571 - 25175901
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25175571 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
25175670 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
25175671 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
25175770 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-caaatgcaaaat--taca |
297 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25175771 |
tcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaaattataca |
25175870 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175871 |
tgattatggtaatcactaacccccttacctt |
25175901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27654227 - 27653898
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27654227 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
27654128 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
27654127 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
27654028 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27654027 |
tcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
27653928 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27653927 |
gattatgataatcactaaccccctcacctt |
27653898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16825998 - 16825678
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16825998 |
atccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
16825899 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatca--tacaattatcatca |
198 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |
|
|
| T |
16825898 |
aattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatca |
16825799 |
T |
 |
| Q |
199 |
aatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--ac |
296 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
16825798 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacac |
16825699 |
T |
 |
| Q |
297 |
atgattgtgataataactaac |
317 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
16825698 |
atgattatgataatcactaac |
16825678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1650342 - 1650016
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
1650342 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttag |
1650243 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1650242 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
1650144 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtga |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1650143 |
atacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattatga |
1650044 |
T |
 |
| Q |
307 |
taataactaacccccttaccttagatga |
334 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1650043 |
taaagactaacccccttaccttaaatga |
1650016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14626367 - 14626134
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
14626367 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttag |
14626268 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14626267 |
cataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
14626169 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626168 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
14626134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35009688 - 35009455
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35009688 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatag |
35009589 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35009588 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
35009490 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35009489 |
atacaaacttaacatcacagttagagcacgaattt |
35009455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 16232031 - 16232233
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16232031 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16232130 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232131 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16232230 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
16232231 |
aga |
16232233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 23153461 - 23153694
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||| ||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23153461 |
gaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
23153560 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23153561 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
23153659 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23153660 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
23153694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 1556144 - 1556346
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1556144 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1556243 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1556244 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
1556343 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
1556344 |
aga |
1556346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1657996 - 1657764
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1657996 |
gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttag |
1657898 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1657897 |
ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
1657799 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1657798 |
atccaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
1657764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 277
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666157
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatgcatacttt |
29666038 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |
|
|
| T |
29666039 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatc |
29666138 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaaca |
277 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29666139 |
accccattttcatacaaca |
29666157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 10488838 - 10489037
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10488838 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
10488937 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488938 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
10489037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16376490 - 16376291
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
16376490 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16376391 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16376390 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16376291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16383814 - 16383615
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16383814 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16383715 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16383714 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16383615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18086940 - 18086738
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
18086940 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
18086841 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18086840 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttacctt |
18086741 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
18086740 |
aga |
18086738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22225855 - 22225656
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22225855 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaaga |
22225756 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22225755 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt |
22225656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 23977908 - 23978110
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23977908 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
23978007 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23978008 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttacctt |
23978107 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
23978108 |
aga |
23978110 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Original strand, 19610159 - 19610359
Alignment:
| Q |
136 |
ataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
19610159 |
ataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagc |
19610258 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19610259 |
acgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttag |
19610358 |
T |
 |
| Q |
331 |
a |
331 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
19610359 |
a |
19610359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16556256 - 16556057
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
16556256 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga |
16556157 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16556156 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16556057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16632812 - 16632613
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
16632812 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga |
16632713 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16632712 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16632613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 15862595 - 15862718
Alignment:
| Q |
118 |
caatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862595 |
caattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata |
15862694 |
T |
 |
| Q |
218 |
acatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15862695 |
acatcacagttagagcacgaattt |
15862718 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251484
Alignment:
| Q |
167 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccatt |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22251648 |
taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt |
22251549 |
T |
 |
| Q |
267 |
ttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22251548 |
ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt |
22251484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 19299376 - 19299575
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| || |||||||| ||| || | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19299376 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga |
19299475 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19299476 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19299575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13620911 - 13620710
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
13620911 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
13620812 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13620811 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt |
13620712 |
T |
 |
| Q |
329 |
ag |
330 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
13620711 |
ag |
13620710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29869798 - 29869691
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29869798 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaaccccctt |
29869699 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
29869698 |
accttaga |
29869691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 27740907 - 27741021
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| Q |
62 |
acatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt-- |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
27740907 |
acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatacttcg |
27741004 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaacatgtaatttcacc |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
27741005 |
aaacatgtaatttcacc |
27741021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 241
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751672
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| Q |
172 |
tcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 19854319 - 19854402
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19854319 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
19854402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18629693 - 18629608
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
18629693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
18629608 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
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| Q |
297 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626076 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29605614 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16887877 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt |
16887792 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 18399005 - 18399046
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18399005 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
18399046 |
T |
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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17083280 - 17083200
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159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
239 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
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17083280 |
tgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
17083200 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21359 - 21031
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21359 |
atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaaca |
21260 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21259 |
acttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaat |
21161 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21160 |
taatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacat |
21061 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21060 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
21031 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14304 - 13977
Alignment:
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1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
14304 |
atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaaca |
14205 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14204 |
acttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaat |
14106 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14105 |
tcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacg-atttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacat |
14007 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14006 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
13977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 3730 - 4068
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3730 |
atccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
3829 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttt-tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3830 |
acttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
3928 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttac |
296 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
3929 |
ttcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtac |
4028 |
T |
 |
| Q |
297 |
atgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatg |
336 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4029 |
atgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatg |
4068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5458 - 5130
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1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5458 |
atccatgaatatgcaa-cccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
5360 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5359 |
actcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
5261 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttaca |
297 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
5260 |
tcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtaca |
5161 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5160 |
tgattatgataataactaactcccttacctt |
5130 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0529 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:
Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 2976 - 3302
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7 |
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105 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2976 |
gaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaactta |
3075 |
T |
 |
| Q |
106 |
ggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatg |
205 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3076 |
gca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
3174 |
T |
 |
| Q |
206 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3175 |
gatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacataatta |
3274 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttaccttaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3275 |
tgataataattaacccccttaccttaga |
3302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 99 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1220
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| Q |
99 |
caacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
1450 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
1351 |
T |
 |
| Q |
199 |
aatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattaca |
297 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1350 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaattaca |
1251 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1250 |
tgattgtgataataactaacccccctacctt |
1220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13242
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aaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13480 |
aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
13382 |
T |
 |
| Q |
189 |
attatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13381 |
attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatga |
13282 |
T |
 |
| Q |
289 |
aaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13281 |
aaaattacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
13242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Original strand, 5551 - 5776
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| Q |
16 |
aacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattc |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5551 |
aacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattc |
5650 |
T |
 |
| Q |
116 |
accaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5651 |
accaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaaca |
5750 |
T |
 |
| Q |
216 |
taacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
5751 |
taacatcaaagttggagcacgaattt |
5776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3830 - 3598
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8 |
aatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagg |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3830 |
aatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagc |
3731 |
T |
 |
| Q |
108 |
agaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgca |
207 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3730 |
a-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
3632 |
T |
 |
| Q |
208 |
tacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3631 |
tacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
3598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 1138 - 1371
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7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1138 |
gaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag |
1237 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
1238 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgc |
1336 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1337 |
atactaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
1371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 8892 - 9109
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| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8892 |
gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaa |
8991 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8992 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgc |
9090 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9091 |
atacaaacataacatcaca |
9109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12123 - 12360
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
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| T |
12123 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaaca |
12220 |
T |
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| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
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| T |
12221 |
acttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
12319 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12320 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaattt |
12360 |
T |
 |
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Target: scaffold0049 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
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Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
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Target Start/End: Original strand, 48195 - 48434
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100 |
Q |
| |
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| T |
48195 |
atccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
48294 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
48295 |
acttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
48393 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48394 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattt |
48434 |
T |
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Target: scaffold0413 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
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Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6318 - 6080
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
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| T |
6318 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaaca |
6220 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
6219 |
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6121 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
6080 |
T |
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Target: scaffold0175 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
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Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1210 - 972
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||||| | ||||||| |
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| T |
1210 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaaca |
1112 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaa |
200 |
Q |
| |
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| T |
1111 |
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1013 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1012 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
972 |
T |
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Target: scaffold0025 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
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Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
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Target Start/End: Original strand, 148735 - 148953
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106 |
Q |
| |
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| T |
148735 |
gaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag |
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T |
 |
| Q |
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206 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
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| T |
148835 |
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T |
 |
| Q |
207 |
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226 |
Q |
| |
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atacaaacatatcatcacag |
148953 |
T |
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158 |
Q |
| |
|
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| T |
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9013 |
T |
 |
| Q |
159 |
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241 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9014 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaattt |
9096 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 53508 - 53575
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
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|
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53508 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatca |
53575 |
T |
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Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
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Target Start/End: Original strand, 19220 - 19453
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gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |
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| T |
19220 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttag |
19319 |
T |
 |
| Q |
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gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
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| T |
19320 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
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T |
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| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
19419 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
19453 |
T |
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Target: scaffold0195; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 21304 - 21537
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| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttag |
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T |
 |
| Q |
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gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
21404 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc |
21502 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21503 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
21537 |
T |
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Target: scaffold0077 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
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Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
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gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
37162 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttag |
37063 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37062 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgc |
36964 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36963 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
36929 |
T |
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Target: scaffold0075 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
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Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
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Target Start/End: Complemental strand, 34716 - 34476
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atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaatcaacaac |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |
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|
| T |
34716 |
atccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaac |
34617 |
T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
34616 |
aacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
34518 |
T |
 |
| Q |
200 |
atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34517 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
34476 |
T |
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Target: scaffold0125 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
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Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
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Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||| | | || |||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41662 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatag |
41761 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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|
|
| T |
41762 |
ca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
41860 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41861 |
atacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
41895 |
T |
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Q |
| |
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||||||||| |||||||| |||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
123413 |
gaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttag |
123314 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
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| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
123313 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
123215 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
123214 |
atacaaacatatcatcaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0218; HSP #1
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gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
106 |
Q |
| |
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| T |
5310 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttg |
5211 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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| T |
5210 |
ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgc |
5112 |
T |
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| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
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| T |
5111 |
atacaaacatatcgtcacag |
5092 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
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Target: scaffold0001; HSP #1
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106 |
Q |
| |
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| T |
171919 |
gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag |
172018 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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| T |
172019 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc |
172117 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
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|
|
| T |
172118 |
atacaaacatatcatcacag |
172137 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 177622 - 177840
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7 |
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106 |
Q |
| |
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|
| T |
177622 |
gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag |
177721 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |
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| T |
177722 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc |
177820 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
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|
|
| T |
177821 |
atacaaacatatcatcacag |
177840 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
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Target Start/End: Complemental strand, 26663 - 26431
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8 |
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107 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26663 |
aatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagc |
26564 |
T |
 |
| Q |
108 |
agaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgca |
207 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |
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|
| T |
26563 |
a-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgca |
26465 |
T |
 |
| Q |
208 |
tacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26464 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
26431 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
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Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8196
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209 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
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aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata |
8228 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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caaacataacatcacagttagagcacgaattt |
8196 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Original strand, 13574 - 13753
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160 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13574 |
aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
13672 |
T |
 |
| Q |
161 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
13673 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt |
13753 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
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Target Start/End: Original strand, 45098 - 45373
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159 |
Q |
| |
|
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|
| T |
45098 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcaaaacttgacatttatacatacttt |
45195 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
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|
| T |
45196 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatc |
45295 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaac-atgagcaaatgcaa-aatt--acatgattgtgataataactaacccccttaccttagat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45296 |
aacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagat |
45373 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 332
Target Start/End: Original strand, 54484 - 54759
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159 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
54484 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
54581 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
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||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
54582 |
gaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatc |
54681 |
T |
 |
| Q |
259 |
aacccattttcatacaac-atgagcaaatgcaa-aatt--acatgattgtgataataactaacccccttaccttagat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
54682 |
aacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttaccttagat |
54759 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 247691 - 247458
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7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
247691 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag |
247592 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
247591 |
ca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgc |
247493 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
247492 |
atacaaacatatcattacagttggagcacgaattt |
247458 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34275 - 34070
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
34275 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaaga |
34176 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34175 |
gcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacct |
34077 |
T |
 |
| Q |
328 |
tagatga |
334 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
34076 |
tagatga |
34070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1692 - 1490
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1692 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagt |
1593 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1592 |
gcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1493 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
1492 |
aga |
1490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1500 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:
Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1429
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134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
1631 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
1532 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1531 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1432 |
T |
 |
| Q |
329 |
aga |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
1431 |
aga |
1429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 31448 - 31647
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31448 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
31547 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31548 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
31647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 281
Target Start/End: Original strand, 39785 - 39934
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39785 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaaga |
39884 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39885 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag |
39934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
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Target Start/End: Original strand, 272039 - 272257
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gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
272039 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag |
272138 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
272139 |
ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattc |
272237 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
272238 |
atacaaacatatcattacag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 69524 - 69565
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61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
69524 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
69565 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
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Target Start/End: Original strand, 41794 - 41976
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cataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatat |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41794 |
catagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatat |
41892 |
T |
 |
| Q |
158 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41893 |
ttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
41976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
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Target: scaffold1542; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| || || ||||||||||||| |||| |||||| | || || |||| ||||||| |
|
|
| T |
783 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttag |
684 |
T |
 |
| Q |
107 |
gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgc |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
683 |
ca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc |
585 |
T |
 |
| Q |
207 |
atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
584 |
atacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
550 |
T |
 |
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231 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||||| ||||||| | || ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
2531 |
tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaaga |
2630 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa----ttacatgattgtgataataactaacccccttacct |
327 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
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T |
 |
| Q |
328 |
taga |
331 |
Q |
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|||| |
|
|
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taga |
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T |
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Target: scaffold0213; HSP #1
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | || |||| || |||| ||| ||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29301 |
tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
29400 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29401 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
29500 |
T |
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Target: scaffold0018; HSP #1
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210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51328 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac |
51229 |
T |
 |
| Q |
211 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51228 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
51198 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
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Target: scaffold0467; HSP #1
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10456 |
tcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaaga |
10357 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
10356 |
gcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttacctt |
10257 |
T |
 |
| Q |
329 |
agatgatg |
336 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
10256 |
agatgatg |
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T |
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Target: scaffold0084; HSP #1
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160 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
56295 |
aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
56198 |
T |
 |
| Q |
161 |
aa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
56197 |
aaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
56115 |
T |
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Target: scaffold0191; HSP #1
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231 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||| ||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
7573 |
tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
7474 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7473 |
gcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Target: scaffold0017; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || | | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
54038 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca |
54137 |
T |
 |
| Q |
257 |
tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54138 |
tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgt |
54221 |
T |
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Target: scaffold0361; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||| ||||||||| | |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
3257 |
aacatcaattgaacaataatcacatatcctctcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagtacaatt-tcataacttgatatttatacatacttt |
3354 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaac-atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3355 |
gaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaattt |
3437 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #1
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210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
89600 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
89501 |
T |
 |
| Q |
211 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
89500 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
89470 |
T |
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Target: scaffold0183; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6831 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
6930 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
6931 |
accttaga |
6938 |
T |
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Target: scaffold0892 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
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Target: scaffold0892; HSP #1
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| | | || | |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3577 |
tttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttca |
3676 |
T |
 |
| Q |
257 |
tcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3677 |
tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa |
3712 |
T |
 |
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Target: scaffold0092 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
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Target: scaffold0092; HSP #1
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219 |
catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10778 |
catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta |
10679 |
T |
 |
| Q |
316 |
acccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
10678 |
acccccttacctt |
10666 |
T |
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Target: scaffold0003 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
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Target: scaffold0003; HSP #1
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
7443 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt |
7542 |
T |
 |
| Q |
324 |
accttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
7543 |
accttagatgatgt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
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Target: scaffold0104; HSP #1
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1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaac |
99 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48522 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac |
48620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0516 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
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Target: scaffold0516; HSP #1
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccct |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12149 |
caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct |
12051 |
T |
 |
| Q |
323 |
taccttagatgatgt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
12050 |
taccttagatgatgt |
12036 |
T |
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Back To:
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22656 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
22755 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22756 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
22787 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
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110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26911 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
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T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
27011 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
27042 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
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aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
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Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1729 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
1630 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1629 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
1598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37213 - 37082
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37213 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
37114 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
37113 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
37082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 329
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41664
Alignment:
| Q |
297 |
atgattgtgataataactaacccccttacctta |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41632 |
atgattgtgataaaaactaacccccttacctta |
41664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 9
Alignment:
| Q |
1 |
atccaggaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaac |
99 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||| |||||| |
|
|
| T |
107 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaattaacaac |
9 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0155 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:
Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23769 - 23664
Alignment:
| Q |
229 |
agagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttac |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23769 |
agagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaacccccttaa |
23670 |
T |
 |
| Q |
326 |
cttaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
23669 |
cttaga |
23664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:
Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22602 - 22422
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaattt-agcacaatactcataacttaacatttttacatattt |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||| ||||| |||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22602 |
aacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaa-ttcaataatttgagcataat--tcataagttagcatttatacatattt |
22506 |
T |
 |
| Q |
160 |
-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22505 |
tgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt |
22422 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1666 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:
Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 113 - 4
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||| | || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
113 |
tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaaga |
14 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
13 |
gcacgaattt |
4 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13266
Alignment:
| Q |
256 |
atcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttaccttag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13342 |
atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttag |
13266 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 104732 - 104623
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatca-tgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
104732 |
tcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttaga |
104633 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
104632 |
gcatgaattt |
104623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 8172 - 8257
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8172 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Original strand, 9396 - 9471
Alignment:
| Q |
7 |
gaatatgcaaacccaagcaattattcatcgatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca |
82 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9396 |
gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatca |
9471 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
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Target Start/End: Original strand, 456 - 523
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
456 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0406 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:
Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14283
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14200 |
tgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
14283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2334
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2401 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
2334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
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Target Start/End: Original strand, 108173 - 108256
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaat-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
108173 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
108256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 197433 - 197386
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagga |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
197433 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagga |
197386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1446 - 1348
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| Q |
145 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
1446 |
cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9701 - 9603
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| Q |
145 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaaatc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
9701 |
cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
9603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
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Target: scaffold0700; HSP #1
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
2687 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
2772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-atcatgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22514 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacata |
22453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
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| Q |
297 |
atgattgtgataataactaacccccttacctta |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31212 |
atgattgtgataaaaactaacccccttacctta |
31180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University