View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21689_high_8 (Length: 332)

Name: NF21689_high_8
Description: NF21689
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21689_high_8
NF21689_high_8
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (23-159)||(1643836-1643972)
chr6 (23-159)||(31478628-31478764)
chr6 (23-159)||(23414231-23414367)
chr6 (23-159)||(22074630-22074766)
chr6 (23-156)||(16623683-16623816)
chr6 (23-159)||(2076798-2076934)
chr6 (23-159)||(14471548-14471675)
chr6 (23-159)||(22948451-22948578)
chr6 (23-159)||(22952407-22952534)
chr6 (23-159)||(23870895-23871022)
chr6 (23-159)||(23874851-23874978)
chr6 (38-159)||(18918035-18918147)
chr6 (23-159)||(11566196-11566324)
chr6 (23-159)||(12619486-12619614)
chr6 (23-159)||(22862280-22862408)
chr6 (23-159)||(23394402-23394530)
chr6 (23-157)||(16759573-16759699)
chr6 (23-159)||(8243167-8243295)
chr6 (23-159)||(23989254-23989382)
chr6 (56-159)||(19869923-19870017)
chr6 (23-159)||(27556018-27556138)
chr6 (30-104)||(19656817-19656891)
chr6 (127-159)||(1643756-1643788)
chr6 (127-159)||(14471508-14471540)
chr6 (127-159)||(18952947-18952979)
chr6 (127-159)||(18952987-18953019)
chr6 (33-96)||(19774141-19774204)
chr6 (33-159)||(17742687-17742813)
chr6 (129-159)||(23401150-23401180)
chr6 (130-159)||(31478919-31478948)
chr6 (127-159)||(8243088-8243120)
chr6 (127-159)||(11566116-11566148)
chr6 (127-159)||(12619662-12619694)
chr6 (127-159)||(16623379-16623411)
chr6 (127-159)||(16623499-16623531)
chr6 (127-159)||(16759491-16759523)
chr6 (127-159)||(18918195-18918227)
chr6 (127-159)||(19869883-19869915)
chr6 (33-89)||(22805370-22805426)
chr6 (127-159)||(22862200-22862232)
chr6 (127-159)||(23394322-23394354)
chr6 (127-159)||(23989214-23989246)
chr6 (127-159)||(27555978-27556010)
chr6 (127-159)||(31478772-31478804)
chr6 (127-159)||(31478844-31478876)
chr6 (127-159)||(31478996-31479028)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (23-159)||(36633-36769)
scaffold0109 (127-159)||(36817-36849)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (23-159)||(19774896-19775032)
chr3 (23-159)||(14664979-14665115)
chr3 (23-159)||(4589557-4589693)
chr3 (23-159)||(14668135-14668271)
chr3 (23-159)||(17317772-17317908)
chr3 (23-159)||(15464428-15464564)
chr3 (31-159)||(14670391-14670519)
chr3 (23-159)||(16750985-16751117)
chr3 (33-159)||(14681913-14682039)
chr3 (23-159)||(8489828-8489964)
chr3 (23-145)||(12339044-12339165)
chr3 (23-159)||(37440281-37440408)
chr3 (23-159)||(15964282-15964409)
chr3 (23-159)||(15968206-15968333)
chr3 (23-159)||(15972130-15972257)
chr3 (23-159)||(7109033-7109161)
chr3 (23-159)||(7112968-7113096)
chr3 (23-159)||(11069405-11069533)
chr3 (23-159)||(14498662-14498790)
chr3 (23-159)||(22321001-22321129)
chr3 (23-159)||(22336056-22336184)
chr3 (23-159)||(27410288-27410416)
chr3 (23-159)||(4108043-4108171)
chr3 (23-159)||(4111895-4112023)
chr3 (23-159)||(30065317-30065445)
chr3 (23-159)||(55022202-55022330)
chr3 (52-159)||(5220481-5220579)
chr3 (23-155)||(11166173-11166297)
chr3 (23-159)||(28949059-28949187)
chr3 (23-95)||(15616766-15616839)
chr3 (41-101)||(12852972-12853032)
chr3 (95-145)||(11301027-11301077)
chr3 (95-145)||(11854183-11854233)
chr3 (23-101)||(16795895-16795973)
chr3 (30-104)||(14440975-14441049)
chr3 (127-159)||(4589701-4589733)
chr3 (127-159)||(19774856-19774888)
chr3 (129-159)||(27410586-27410616)
chr3 (129-159)||(27410766-27410796)
chr3 (35-96)||(10543097-10543158)
chr3 (127-159)||(5220372-5220404)
chr3 (127-159)||(5220441-5220473)
chr3 (127-159)||(8489972-8490004)
chr3 (127-159)||(11166348-11166380)
chr3 (127-159)||(16751184-16751216)
chr3 (127-159)||(16751256-16751288)
chr3 (127-159)||(17317956-17317988)
chr3 (127-159)||(22320921-22320953)
chr3 (127-159)||(22335976-22336008)
chr3 (127-159)||(27410464-27410496)
chr3 (127-159)||(27410644-27410676)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (23-159)||(20229651-20229787)
chr1 (23-156)||(39244563-39244696)
chr1 (23-156)||(39248118-39248251)
chr1 (23-159)||(21406682-21406818)
chr1 (23-156)||(33796848-33796981)
chr1 (23-159)||(41388663-41388795)
chr1 (23-159)||(1925798-1925925)
chr1 (23-159)||(20924812-20924939)
chr1 (23-125)||(41781942-41782044)
chr1 (23-159)||(1010057-1010185)
chr1 (23-96)||(16376102-16376176)
chr1 (23-101)||(48602865-48602943)
chr1 (23-95)||(52638930-52639003)
chr1 (23-101)||(22131524-22131602)
chr1 (40-104)||(23967335-23967399)
chr1 (107-159)||(16376164-16376216)
chr1 (127-159)||(1009977-1010009)
chr1 (127-159)||(1925973-1926005)
chr1 (127-159)||(16376224-16376256)
chr1 (127-159)||(20924987-20925019)
chr1 (127-159)||(41388803-41388835)
chr1 (127-159)||(41388862-41388894)
chr1 (127-159)||(41388934-41388966)
chr1 (127-159)||(41388974-41389006)
chr1 (127-159)||(52635048-52635080)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (23-159)||(26291698-26291834)
chr7 (23-159)||(2832841-2832977)
chr7 (23-159)||(7519684-7519820)
chr7 (23-159)||(13919139-13919275)
chr7 (23-159)||(15083497-15083633)
chr7 (23-159)||(39721567-39721703)
chr7 (23-159)||(12705303-12705439)
chr7 (23-159)||(1859468-1859604)
chr7 (23-159)||(18424990-18425122)
chr7 (23-159)||(25927887-25928023)
chr7 (23-159)||(2530798-2530934)
chr7 (23-159)||(45170675-45170802)
chr7 (23-159)||(16113575-16113703)
chr7 (23-159)||(16116728-16116856)
chr7 (23-159)||(32443-32571)
chr7 (23-159)||(71411-71539)
chr7 (23-159)||(75520-75648)
chr7 (23-159)||(12718002-12718130)
chr7 (23-159)||(12722913-12723041)
chr7 (23-159)||(16907855-16907983)
chr7 (23-159)||(18278737-18278865)
chr7 (23-159)||(18282700-18282828)
chr7 (35-159)||(12714298-12714413)
chr7 (23-159)||(20487131-20487258)
chr7 (23-101)||(18301685-18301763)
chr7 (33-96)||(32300747-32300810)
chr7 (33-97)||(14257822-14257886)
chr7 (33-96)||(16585087-16585150)
chr7 (127-159)||(71587-71619)
chr7 (127-159)||(71667-71699)
chr7 (127-159)||(75696-75728)
chr7 (127-159)||(75776-75808)
chr7 (127-159)||(12705487-12705519)
chr7 (127-159)||(12714178-12714210)
chr7 (127-159)||(16908030-16908062)
chr7 (127-159)||(18278657-18278689)
chr7 (127-159)||(18282620-18282652)
chr7 (127-159)||(18424869-18424901)
chr7 (127-159)||(26291538-26291570)
chr7 (127-159)||(26291578-26291610)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (23-159)||(21828683-21828819)
chr8 (23-159)||(21410251-21410387)
chr8 (23-159)||(21804743-21804879)
chr8 (31-159)||(14398498-14398626)
chr8 (23-159)||(18863314-18863450)
chr8 (23-159)||(23913597-23913733)
chr8 (23-159)||(30940746-30940873)
chr8 (31-159)||(21386659-21386787)
chr8 (84-159)||(15923992-15924067)
chr8 (23-159)||(22111265-22111393)
chr8 (23-159)||(43251145-43251273)
chr8 (23-159)||(21977316-21977444)
chr8 (23-159)||(21973225-21973353)
chr8 (23-104)||(44385290-44385372)
chr8 (41-104)||(5760109-5760172)
chr8 (127-159)||(14398634-14398666)
chr8 (127-159)||(21386619-21386651)
chr8 (127-159)||(21973401-21973433)
chr8 (127-159)||(21977492-21977524)
chr8 (127-159)||(43251065-43251097)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (23-159)||(11224635-11224771)
chr5 (23-159)||(11230447-11230583)
chr5 (23-159)||(11228458-11228594)
chr5 (31-159)||(24767920-24768048)
chr5 (23-159)||(11220049-11220185)
chr5 (23-156)||(18355546-18355679)
chr5 (23-159)||(15237478-15237614)
chr5 (23-159)||(20911545-20911681)
chr5 (23-159)||(40724260-40724387)
chr5 (31-159)||(10752522-10752646)
chr5 (23-159)||(19473329-19473456)
chr5 (23-101)||(22108023-22108101)
chr5 (23-96)||(20295235-20295309)
chr5 (23-74)||(11226553-11226604)
chr5 (127-159)||(19473504-19473536)
chr5 (127-159)||(20295155-20295187)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (30-156)||(51304-51430)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (31-159)||(10417-10545)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (23-159)||(20160515-20160651)
chr4 (23-159)||(20163293-20163429)
chr4 (23-159)||(20157839-20157975)
chr4 (23-159)||(15224372-15224504)
chr4 (23-159)||(14954836-14954963)
chr4 (23-159)||(25689237-25689364)
chr4 (23-159)||(5757574-5757702)
chr4 (23-159)||(9555864-9555992)
chr4 (23-159)||(12487019-12487147)
chr4 (23-159)||(14758071-14758199)
chr4 (23-159)||(33741714-33741842)
chr4 (23-159)||(27533345-27533472)
chr4 (23-159)||(4561969-4562097)
chr4 (23-96)||(10712244-10712317)
chr4 (23-96)||(10926014-10926087)
chr4 (56-159)||(17807462-17807556)
chr4 (23-101)||(631397-631475)
chr4 (23-101)||(17048753-17048831)
chr4 (107-159)||(10712204-10712256)
chr4 (107-159)||(10925974-10926026)
chr4 (127-159)||(15224148-15224180)
chr4 (127-159)||(27533265-27533297)
chr4 (127-159)||(9555784-9555816)
chr4 (127-159)||(12486939-12486971)
chr4 (127-159)||(14758246-14758278)
chr4 (127-159)||(14758286-14758318)
chr4 (127-159)||(14955011-14955043)
chr4 (127-159)||(15224108-15224140)
chr4 (127-159)||(15224260-15224292)
chr4 (127-159)||(25689157-25689189)
chr4 (127-159)||(27533185-27533217)
chr4 (127-159)||(27533305-27533337)
chr4 (127-159)||(33741554-33741586)
chr4 (127-159)||(33741634-33741666)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (23-159)||(1282714-1282850)
chr2 (23-159)||(31344464-31344600)
chr2 (23-159)||(9784336-9784472)
chr2 (23-159)||(30345660-30345787)
chr2 (23-159)||(41531649-41531776)
chr2 (23-159)||(24629123-24629251)
chr2 (23-159)||(27380076-27380204)
chr2 (23-159)||(27384122-27384250)
chr2 (23-159)||(27601126-27601254)
chr2 (23-159)||(24648689-24648817)
chr2 (23-95)||(10102297-10102370)
chr2 (129-159)||(12902227-12902257)
chr2 (111-159)||(357665-357713)
chr2 (23-59)||(12902160-12902196)
chr2 (127-159)||(24629299-24629331)
chr2 (127-159)||(24648609-24648641)
chr2 (127-159)||(27601046-27601078)
chr2 (127-159)||(30345835-30345867)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (23-156)||(79870-80004)
scaffold0029 (23-159)||(66168-66295)
scaffold0029 (30-159)||(62259-62379)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (23-159)||(160-297)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (23-159)||(6535-6671)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-156)||(208257-208390)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (23-159)||(11297-11432)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (23-159)||(36755-36891)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (35-159)||(9177-9302)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (23-159)||(20850-20988)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (23-116)||(73963-74056)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (23-113)||(190046-190136)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (23-159)||(11756-11884)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (23-159)||(33330-33458)
scaffold0157 (127-159)||(33506-33538)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (23-159)||(67945-68073)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (23-159)||(14756-14883)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (23-159)||(5743-5871)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (23-159)||(59363-59491)
scaffold0028 (127-159)||(59620-59652)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (24-101)||(8134-8211)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (23-101)||(3115-3193)
scaffold0165 (23-101)||(7178-7256)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (23-104)||(241-322)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (41-101)||(8252-8312)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (23-101)||(25240-25318)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (97-145)||(6371-6419)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (33-101)||(7141-7209)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (129-159)||(4700-4730)
scaffold0525 (23-59)||(4513-4549)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (24-96)||(4329-4401)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (123-159)||(1009-1045)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1643972 - 1643836
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643972 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 1643873  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643872 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 1643836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 31478628 - 31478764
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478628 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacatacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 31478727  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478728 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 31478764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23414367 - 23414231
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23414367 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 23414268  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23414267 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 23414231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 22074630 - 22074766
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22074630 atcatctatgagttgtcgagttatcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 22074729  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22074730 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 22074766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16623816 - 16623683
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16623816 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaaaaagtacctacgaaaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgac 16623717  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16623716 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 16623683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2076934 - 2076798
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2076934 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgcatgatgtttatgatgtgaattttatgatgttgac 2076835  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  2076834 taagatgttgctatgttgtctatgatattgattatga 2076798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14471675 - 14471548
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||  ||||    
T  14471675 atcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatattgac 14471585  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471584 taagatgatgctatgttgtttaacatattgattatga 14471548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22948578 - 22948451
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||| ||||    
T  22948578 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaattatatgatgttgac 22948488  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22948487 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 22948451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22952534 - 22952407
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||| ||||    
T  22952534 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaattatatgatgttgac 22952444  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22952443 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 22952407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23871022 - 23870895
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||| ||||    
T  23871022 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaattatatgatgttgac 23870932  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23870931 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 23870895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23874978 - 23874851
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||| ||||    
T  23874978 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaattatatgatgttgac 23874888  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23874887 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 23874851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 18918035 - 18918147
Alignment:
Q  38 tcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatg 137  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18918035 tcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatg---------tgaattatatgatgttgactaagatgttgctatg 18918125  T
Q  138 ttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  18918126 ttgtttaacatgttgattatga 18918147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11566324 - 11566196
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  11566324 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 11566234  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11566233 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 11566196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 12619486 - 12619614
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  12619486 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 12619576  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12619577 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 12619614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22862408 - 22862280
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  22862408 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22862318  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22862317 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 22862280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23394530 - 23394402
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  23394530 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 23394440  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23394439 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 23394402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16759699 - 16759573
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  16759699 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 16759609  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 157  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16759608 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 16759573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8243295 - 8243167
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||| |||    
T  8243295 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagat---------tttacgatgtgaattatatgatgttga 8243205  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8243204 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 8243167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23989382 - 23989254
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  23989382 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctgcgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 23989292  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23989291 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 23989254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19870017 - 19869923
Alignment:
Q  56 atgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19870017 atgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt---------gaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatt 19869927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27556138 - 27556018
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                ||||| ||||    
T  27556138 atcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt----------------tgatgttgac 27556055  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27556054 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 27556018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Original strand, 19656817 - 19656891
Alignment:
Q  30 atgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  19656817 atgagttgttgagttgtcttctatctatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtttatgatgt 19656891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1643788 - 1643756
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643788 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 1643756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14471540 - 14471508
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471540 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 14471508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 18952947 - 18952979
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18952947 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 18952979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 18952987 - 18953019
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18952987 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 18953019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 19774141 - 19774204
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  19774141 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 19774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17742813 - 17742687
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt--ttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgt 130  Q
    |||||| ||||||||||| | | | |||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||  |||||||||   |||||  ||| ||| || |||||    
T  17742813 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgttattatgatgttgtttata--atgttgattatgatgt 17742716  T
Q  131 tgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||    
T  17742715 tgttatgttgtttatgatattgattatga 17742687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23401180 - 23401150
Alignment:
Q  129 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23401180 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 23401150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 159
Target Start/End: Original strand, 31478919 - 31478948
Alignment:
Q  130 ttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478919 ttgctatgttgtttaacatattgattatga 31478948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8243120 - 8243088
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8243120 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 8243088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11566148 - 11566116
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11566148 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 11566116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 12619662 - 12619694
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12619662 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 12619694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16623411 - 16623379
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16623411 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 16623379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16623531 - 16623499
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16623531 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 16623499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16759523 - 16759491
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16759523 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 16759491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 18918195 - 18918227
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18918195 atgttgctatgttgtttaacatattgatcatga 18918227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19869915 - 19869883
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19869915 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 19869883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22805426 - 22805370
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattata 89  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  22805426 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata 22805370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22862232 - 22862200
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22862232 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 22862200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23394354 - 23394322
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23394354 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 23394322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23989246 - 23989214
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23989246 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 23989214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27556010 - 27555978
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27556010 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 27555978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 31478772 - 31478804
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31478772 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 31478804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 31478844 - 31478876
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31478844 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 31478876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 31478996 - 31479028
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31478996 atgttgctatgttgtttaacatcttgattatga 31479028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 36633 - 36769
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 36732  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36733 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 36769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 36817 - 36849
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36817 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 36849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19775032 - 19774896
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775032 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 19774933  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774932 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 19774896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14665115 - 14664979
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14665115 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 14665016  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14665015 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 14664979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 4589557 - 4589693
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4589557 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttcac 4589656  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4589657 taagatgttgctatgttgtttaagataatgattatga 4589693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14668271 - 14668135
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14668271 atcatctatgagttgtcgagttatcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 14668172  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14668171 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 14668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 17317772 - 17317908
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17317772 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtaccaacgaatattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 17317871  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17317872 aaagatgttgctatgttgtttaacatattggttatga 17317908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15464564 - 15464428
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15464564 atcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 15464465  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15464464 taaaatattgctatgttgtttaagatattgattatga 15464428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14670519 - 14670391
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgt 130  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14670519 tgagttgttgagttgtcttcaacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgt 14670420  T
Q  131 tgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14670419 tgctatgttgtttatgatattgattatga 14670391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 16750985 - 16751117
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |     
T  16750985 atcatctatgagttgttaagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttcatgatgtgaattatatgat----at 16751080  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751081 tattatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 16751117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14682039 - 14681913
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttg 132  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14682039 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttg 14681940  T
Q  133 ctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14681939 ctatgttgtctatgatattgattatga 14681913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 8489828 - 8489964
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  8489828 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgat 8489927  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||  |||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  8489928 tataatgttatgatgttgtttaagatattgattatga 8489964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12339165 - 12339044
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12339165 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacc-atgtgttgttaaagaagtacctatgaagattttacgatgtttatgatgtgaattatataatgttgac 12339067  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaa 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12339066 taagatgtttctatgttgtttaa 12339044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 37440281 - 37440408
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  37440281 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 37440371  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37440372 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 37440408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15964409 - 15964282
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  15964409 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 15964319  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15964318 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 15964282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15968333 - 15968206
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  15968333 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 15968243  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15968242 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 15968206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15972257 - 15972130
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  15972257 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 15972167  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15972166 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 15972130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7109161 - 7109033
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  7109161 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 7109071  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7109070 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 7109033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7113096 - 7112968
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  7113096 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 7113006  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7113005 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 7112968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11069533 - 11069405
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  11069533 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 11069443  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11069442 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 11069405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14498790 - 14498662
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  14498790 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 14498700  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14498699 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 14498662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22321129 - 22321001
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  22321129 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22321039  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22321038 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 22321001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22336184 - 22336056
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  22336184 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22336094  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22336093 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 22336056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 27410288 - 27410416
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  27410288 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 27410378  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27410379 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 27410416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 4108043 - 4108171
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  4108043 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4108133  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  4108134 ctaaaatattgctacgttgtttaagataatgattatga 4108171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 4111895 - 4112023
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  4111895 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4111985  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  4111986 ctaaaatattgctacgttgtttaagataatgattatga 4112023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30065445 - 30065317
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  30065445 atcatccatgagtttgtcgagtggtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 30065355  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30065354 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 30065317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 55022330 - 55022202
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||| |||    
T  55022330 atcatccatgagtttgtcgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 55022240  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55022239 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 55022202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5220579 - 5220481
Alignment:
Q  52 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatatt 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5220579 acctaagtgttgttaaagaagtacctatgaagattata---------tgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatatt 5220489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 11166173 - 11166297
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  11166173 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacaaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 11166263  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgatt 155  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11166264 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatt 11166297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28949187 - 28949059
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  28949187 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 28949097  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    | || || |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28949096 ccaaaattttgctatgttgtttaagatgttgattatga 28949059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15616839 - 15616766
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15616839 atcatccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 15616766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 101
Target Start/End: Original strand, 12852972 - 12853032
Alignment:
Q  41 agttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12852972 agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 12853032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Original strand, 11301027 - 11301077
Alignment:
Q  95 tttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11301027 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgctgtttaa 11301077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11854233 - 11854183
Alignment:
Q  95 tttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaa 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11854233 tttatgatgagaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaa 11854183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16795973 - 16795895
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16795973 atcatctatgagttgctgagttgtattctactcatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 16795895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14441049 - 14440975
Alignment:
Q  30 atgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  14441049 atgagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtgcttatgaagattatacgatgtttatgatgt 14440975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 4589701 - 4589733
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589701 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 4589733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19774888 - 19774856
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774888 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 19774856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 159
Target Start/End: Original strand, 27410586 - 27410616
Alignment:
Q  129 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410586 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 27410616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 159
Target Start/End: Original strand, 27410766 - 27410796
Alignment:
Q  129 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410766 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 27410796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 10543097 - 10543158
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  10543097 ttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 10543158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5220404 - 5220372
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5220404 atgttgctatgttgtttaaaatattgattatga 5220372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5220473 - 5220441
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5220473 atgttgctatgttgtttaaaatattgattatga 5220441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 8489972 - 8490004
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8489972 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 8490004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 11166348 - 11166380
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11166348 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 11166380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 16751184 - 16751216
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16751184 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 16751216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 16751256 - 16751288
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16751256 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 16751288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 17317956 - 17317988
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17317956 atgtagctatgttgtttaacatattgattatga 17317988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22320953 - 22320921
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22320953 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 22320921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22336008 - 22335976
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22336008 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 22335976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 27410464 - 27410496
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27410464 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 27410496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 27410644 - 27410676
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27410644 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 27410676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 20229651 - 20229787
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229651 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccgcctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 20229750  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229751 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 20229787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 39244563 - 39244696
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39244563 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgac 39244662  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39244663 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 39244696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 39248118 - 39248251
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39248118 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgac 39248217  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39248218 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 39248251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21406818 - 21406682
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21406818 atcatctatgagctgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21406719  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21406718 taagaggttgctatgttgtttaacatgttgattatga 21406682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33796981 - 33796848
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  33796981 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccacccatgtgttattaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgac 33796882  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33796881 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 33796848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 41388663 - 41388795
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    |     
T  41388663 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttcatggtgtgaattatatgat----at 41388758  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388759 tattatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 41388795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 1925798 - 1925925
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  1925798 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 1925888  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1925889 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 1925925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 20924812 - 20924939
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  20924812 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 20924902  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20924903 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 20924939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Original strand, 41781942 - 41782044
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41781942 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 41782041  T
Q  123 taa 125  Q
    |||    
T  41782042 taa 41782044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1010185 - 1010057
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  1010185 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 1010095  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1010094 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 1010057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 16376102 - 16376176
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376102 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 16376176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 48602943 - 48602865
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48602943 atcatctatgagttgctgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 48602865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52639003 - 52638930
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639003 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 52638930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 22131524 - 22131602
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22131524 atcatctatgagttgttgagctgtcatctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 22131602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23967399 - 23967335
Alignment:
Q  40 gagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23967399 gagttgtcttctacatatgtgttgttaatgaagtacttatgaagattatacgatgtttatgatgt 23967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 16376164 - 16376216
Alignment:
Q  107 attatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16376164 attatacgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 16376216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1010009 - 1009977
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1010009 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 1009977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 1925973 - 1926005
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1925973 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 1926005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 16376224 - 16376256
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16376224 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 16376256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 20924987 - 20925019
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20924987 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 20925019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 41388803 - 41388835
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41388803 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 41388835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 41388862 - 41388894
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41388862 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 41388894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 41388934 - 41388966
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41388934 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 41388966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 41388974 - 41389006
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41388974 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 41389006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52635080 - 52635048
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635080 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 52635048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26291834 - 26291698
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26291834 atcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 26291735  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  26291734 taagatgttgctatgttgtttaaggtgttgattatga 26291698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 2832841 - 2832977
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2832841 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 2832940  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2832941 taagatgttgctatgttgtttaaaatattgattatga 2832977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 7519684 - 7519820
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7519684 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 7519783  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7519784 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 7519820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 13919139 - 13919275
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13919139 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 13919238  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13919239 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 13919275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15083633 - 15083497
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15083633 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 15083534  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15083533 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 15083497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39721703 - 39721567
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39721703 atcatccatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 39721604  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39721603 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 39721567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 12705303 - 12705439
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12705303 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 12705402  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12705403 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 12705439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 1859468 - 1859604
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1859468 atcatctacgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 1859567  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1859568 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 1859604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18425122 - 18424990
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |     
T  18425122 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat----at 18425027  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425026 tattatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 18424990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 25927887 - 25928023
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25927887 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgacgtgaattatatgatgttgac 25927986  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  25927987 taagatgttgctatgttgtctatgatattgattatga 25928023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 2530798 - 2530934
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||     
T  2530798 atcatctaagagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacccatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattataagatattgat 2530897  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2530898 tatgatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 2530934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 45170675 - 45170802
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  45170675 atcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 45170765  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45170766 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 45170802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16113703 - 16113575
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  16113703 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 16113613  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16113612 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 16113575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16116856 - 16116728
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  16116856 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 16116766  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16116765 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 16116728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32571 - 32443
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  32571 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 32481  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32480 ctaaaatattgctacgttgtttaaaatattgattatga 32443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 71411 - 71539
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  71411 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 71501  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  71502 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 71539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 75520 - 75648
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  75520 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 75610  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  75611 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 75648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12718130 - 12718002
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||    
T  12718130 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt---------gaattatatgatgttga 12718040  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12718039 ctaaaatgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 12718002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12723041 - 12722913
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||    
T  12723041 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt---------gaattatatgatgttga 12722951  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12722950 ctaaaatgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 12722913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 16907855 - 16907983
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  16907855 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 16907945  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16907946 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 16907983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18278865 - 18278737
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  18278865 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 18278775  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18278774 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 18278737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18282828 - 18282700
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  18282828 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 18282738  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18282737 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 18282700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12714413 - 12714298
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgct 134  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  12714413 ttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgct 12714323  T
Q  135 atgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  12714322 atgttgtttaagatattgattatga 12714298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20487258 - 20487131
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20487258 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagatta---------tatgatgtgaattatatgatgttgac 20487168  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  20487167 taagatgttgctatgttatctatgatattgattatga 20487131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18301763 - 18301685
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18301763 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacacgatgttcatga 18301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 32300810 - 32300747
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  32300810 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtt 32300747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14257886 - 14257822
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttt 97  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||    
T  14257886 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgttt 14257822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16585150 - 16585087
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  16585150 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16585087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 71587 - 71619
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  71587 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 71619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 71667 - 71699
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  71667 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 71699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 75696 - 75728
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  75696 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 75728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 75776 - 75808
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  75776 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 75808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 12705487 - 12705519
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12705487 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 12705519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12714210 - 12714178
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12714210 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 12714178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 16908030 - 16908062
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16908030 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 16908062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18278689 - 18278657
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18278689 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 18278657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18282652 - 18282620
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18282652 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 18282620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18424901 - 18424869
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18424901 atgttgctatgttatttaacatattgattatga 18424869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26291570 - 26291538
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26291570 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 26291538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26291610 - 26291578
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26291610 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 26291578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 21828683 - 21828819
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21828683 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21828782  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21828783 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 21828819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21410387 - 21410251
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21410387 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21410288  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21410287 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 21410251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21804879 - 21804743
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21804879 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 21804780  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21804779 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 21804743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Original strand, 14398498 - 14398626
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgt 130  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14398498 tgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacatatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgt 14398597  T
Q  131 tgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14398598 tgctatgttgtttaagatattgattatga 14398626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 18863314 - 18863450
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18863314 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttgac 18863413  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18863414 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 18863450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23913733 - 23913597
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23913733 atcatctatgagttgttaatttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 23913634  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23913633 taagatgttgctatgttgtctatgatattgattatga 23913597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 30940746 - 30940873
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  30940746 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 30940836  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30940837 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 30940873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21386787 - 21386659
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgt 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||    
T  21386787 tgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacttataaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgattataatgt 21386688  T
Q  131 tgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |   ||||||||||| |||||||||||||    
T  21386687 tatgatgttgtttaagatattgattatga 21386659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 159
Target Start/End: Original strand, 15923992 - 15924067
Alignment:
Q  84 attatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15923992 attatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 15924067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22111393 - 22111265
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  22111393 atcatccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 22111303  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22111302 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 22111265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43251273 - 43251145
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||| |||    
T  43251273 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 43251183  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43251182 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 43251145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 21977316 - 21977444
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  21977316 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 21977406  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    | || || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21977407 ccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 21977444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 21973225 - 21973353
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  21973225 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 21973315  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    | || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21973316 ccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgtttatga 21973353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Original strand, 44385290 - 44385372
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaaga-agtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44385290 atcatctatgtgttgttgagttgtcttctacccatgtgttattaaagggagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt 44385372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5760172 - 5760109
Alignment:
Q  41 agttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  5760172 agttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtttatgatgt 5760109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 14398634 - 14398666
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14398634 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 14398666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21386651 - 21386619
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21386651 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 21386619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 21973401 - 21973433
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21973401 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 21973433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 21977492 - 21977524
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21977492 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 21977524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43251097 - 43251065
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43251097 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 43251065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11224771 - 11224635
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11224771 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11224672  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11224671 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 11224635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11230583 - 11230447
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11230583 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11230484  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11230483 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 11230447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11228594 - 11228458
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11228594 atcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctaggaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11228495  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11228494 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 11228458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Original strand, 24767920 - 24768048
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgt 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24767920 tgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgt 24768019  T
Q  131 tgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24768020 tgctatgttgtttaagatattgattatga 24768048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11220185 - 11220049
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11220185 atcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtagctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11220086  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11220085 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 11220049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18355679 - 18355546
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  18355679 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgac 18355580  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18355579 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 18355546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 15237478 - 15237614
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  15237478 atcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatattgat 15237577  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15237578 tatgatattgttatgttgtttaacatattggttatga 15237614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 20911545 - 20911681
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  20911545 atcatctattagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaaatatataatgttgac 20911644  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20911645 taagatatcgctatgttgtttaagatattgattatga 20911681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 40724260 - 40724387
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  40724260 atcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 40724350  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724351 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 40724387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10752646 - 10752522
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgt 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |   ||||    
T  10752646 tgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtacatacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat----attgttatgt 10752551  T
Q  131 tgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10752550 tgctatgttgtttaacatgttgattatga 10752522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 19473329 - 19473456
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  19473329 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 19473419  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19473420 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 19473456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 22108023 - 22108101
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22108023 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 22108101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20295309 - 20295235
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295309 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 20295235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11226604 - 11226553
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagta 74  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11226604 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagta 11226553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 19473504 - 19473536
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19473504 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 19473536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20295187 - 20295155
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20295187 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 20295155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Original strand, 51304 - 51430
Alignment:
Q  30 atgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatg 129  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51304 atgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaagatg 51403  T
Q  130 ttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51404 ttgctatgttgtttaacatgttgatta 51430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Original strand, 10417 - 10545
Alignment:
Q  31 tgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgt 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10417 tgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgt 10516  T
Q  131 tgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10517 tgctatgttgtttaagatattgattatga 10545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 20160515 - 20160651
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20160515 atcatctatgaattgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 20160614  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20160615 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 20160651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 20163293 - 20163429
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20163293 atcatctatgagttgtcgggttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 20163392  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20163393 taagatgtttctatgttgtttaagatattgattatga 20163429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 20157839 - 20157975
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20157839 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaataagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 20157938  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20157939 tgagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 20157975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15224504 - 15224372
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |     
T  15224504 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat----at 15224409  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15224408 tgttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatga 15224372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 14954836 - 14954963
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  14954836 atcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 14954926  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14954927 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 14954963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25689364 - 25689237
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||| ||||    
T  25689364 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaattatatgatgttgac 25689274  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25689273 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 25689237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 5757574 - 5757702
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  5757574 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 5757664  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5757665 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 5757702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9555992 - 9555864
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  9555992 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 9555902  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9555901 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 9555864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12487147 - 12487019
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  12487147 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 12487057  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12487056 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 12487019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 14758071 - 14758199
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  14758071 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 14758161  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14758162 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 14758199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33741842 - 33741714
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  33741842 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 33741752  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33741751 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 33741714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27533472 - 27533345
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  27533472 atcatccatgagttgtcgagttgcgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgac 27533382  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  27533381 taaaatgttgctatgttgtttaagataatgaatatga 27533345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 4561969 - 4562097
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  4561969 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaggattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4562059  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4562060 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 4562097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10712317 - 10712244
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10712317 atcatctatgagttgtcgagttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 10712244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10926087 - 10926014
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10926087 atcatctatgagttgtcgagttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 10926014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17807556 - 17807462
Alignment:
Q  56 atgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||    
T  17807556 atgtgttgttaaagaagtacctacgaagattttacgatgt---------gaattatatgatgttgactaaaatattgctaagttgtttaacatgttgatt 17807466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 631397 - 631475
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  631397 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 631475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 17048753 - 17048831
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17048753 atcatctatgagttgctgagttgtattatacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 17048831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10712256 - 10712204
Alignment:
Q  107 attatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10712256 attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 10712204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10926026 - 10925974
Alignment:
Q  107 attatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10926026 attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 10925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15224180 - 15224148
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224180 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 15224148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27533297 - 27533265
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27533297 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 27533265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9555816 - 9555784
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9555816 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 9555784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12486971 - 12486939
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12486971 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 12486939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 14758246 - 14758278
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14758246 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 14758278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 14758286 - 14758318
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14758286 atgttgctatgttgtttaagatattgattatga 14758318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 14955011 - 14955043
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14955011 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 14955043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15224140 - 15224108
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15224140 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 15224108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15224292 - 15224260
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15224292 atgttgctatgttgtttaacatcttgattatga 15224260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25689189 - 25689157
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25689189 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 25689157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27533217 - 27533185
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27533217 atgttgctatgttgtttaacatattgatcatga 27533185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27533337 - 27533305
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27533337 atgttgctatgttgtttaacatattgatcatga 27533305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33741586 - 33741554
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33741586 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 33741554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33741666 - 33741634
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33741666 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 33741634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1282850 - 1282714
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1282850 atcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 1282751  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1282750 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 1282714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31344600 - 31344464
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||    
T  31344600 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaactatataaagttgac 31344501  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31344500 taagatgttgctatgttgtttaagatattgattatga 31344464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9784472 - 9784336
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9784472 atcatctatgagttgttgagttttcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagtttatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 9784373  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
     |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  9784372 caagatgttgccatgttgtctatgatattgattatga 9784336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 30345660 - 30345787
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  30345660 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 30345750  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30345751 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 30345787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 41531649 - 41531776
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||    
T  41531649 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 41531739  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41531740 taaaagattgctatgttgtttaacatgttgattatga 41531776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 24629123 - 24629251
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  24629123 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 24629213  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24629214 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 24629251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 27380076 - 27380204
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  27380076 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 27380166  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27380167 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 27380204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 27384122 - 27384250
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  27384122 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 27384212  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27384213 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 27384250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27601254 - 27601126
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  27601254 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 27601164  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27601163 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 27601126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24648817 - 24648689
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||| |||    
T  24648817 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 24648727  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24648726 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttggttatga 24648689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 10102297 - 10102370
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 95  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10102297 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgtcgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 10102370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 159
Target Start/End: Original strand, 12902227 - 12902257
Alignment:
Q  129 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902227 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 12902257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 357713 - 357665
Alignment:
Q  111 tatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  357713 tatgatgttgattacgatgttgctatgttgtttatgatattgattatga 357665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 59
Target Start/End: Original strand, 12902160 - 12902196
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgt 59  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12902160 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 12902196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 24629299 - 24629331
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24629299 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 24629331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24648641 - 24648609
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24648641 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 24648609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27601078 - 27601046
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27601078 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 27601046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 30345835 - 30345867
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30345835 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 30345867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 80004 - 79870
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  80004 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacctatgtgttattaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatggtgttga 79905  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  79904 ctaagatgttgctatgtcgtttaacatgttgatta 79870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 66168 - 66295
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||    
T  66168 atcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatacgatg---------tgaattatatgatgttgac 66258  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  66259 taagatgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 66295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 159
Target Start/End: Original strand, 62259 - 62379
Alignment:
Q  30 atgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatg 129  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||    
T  62259 atgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatacgatg---------tgaattatatgatgttgactaagatg 62349  T
Q  130 ttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  62350 ttgctatgttgtttaacatgttgattatga 62379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 160 - 297
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  160 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttga 259  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  260 ctaagatgttgctgtgttgtttaagatattgattatga 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6671
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6535 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 6634  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  6635 taagatgttgctatgttgtctatgatattgattatga 6671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 208257 - 208390
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  208257 atcatctatgagttgtcgacttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgac 208356  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgatta 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  208357 taagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 208390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11432 - 11297
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11432 atcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtcttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 11333  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11332 taagatattgctatg-tgtttaagatattgattatga 11297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 36755 - 36891
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36755 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgac 36854  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  36855 taagatgttgctatgttgtctatgatattgattatga 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9302 - 9177
Alignment:
Q  35 ttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaaga-ttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgc 133  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9302 ttgtcgagctgtcttatacctaagtgttgttaaagaagtacctatgaagaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgc 9203  T
Q  134 tatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  9202 tatgttgtttaagatattgattatga 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 20850 - 20988
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaa--gaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatg 120  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20850 atcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgacgtgaattatatgatgttg 20949  T
Q  121 actaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20950 actaagatgttgctatgttgtatatgatattgattatga 20988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Original strand, 73963 - 74056
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat 116  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73963 atcatctaagagttgtcgagttgtcttctacctaagtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttaagatgtgaattatatgat 74056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Original strand, 190046 - 190136
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  190046 atcatctatgagttgtcgagttgtcttcttcccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatat 190136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11884 - 11756
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||    
T  11884 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttga 11794  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11793 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 11756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 33330 - 33458
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  33330 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 33420  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33421 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 33458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 33506 - 33538
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33506 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 33538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 67945 - 68073
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  67945 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 68035  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68036 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 68073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 14756 - 14883
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgac 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||         |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14756 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagat---------tttacgatgtgaattatatgatgttgac 14846  T
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14847 taaattattgctatgttgtttaacatgttgattatga 14883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 5743 - 5871
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  5743 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 5833  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5834 ctaaaatattgctatgttgtttgacatgttgattatga 5871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 59363 - 59491
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagtt-gtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatga 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||| |||    
T  59363 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgatgattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 59453  T
Q  122 ctaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    | || || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  59454 ccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatga 59491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 59620 - 59652
Alignment:
Q  127 atgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  59620 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatga 59652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 8134 - 8211
Alignment:
Q  24 tcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8134 tcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 8211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3193 - 3115
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3193 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7256 - 7178
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7256 atcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 322 - 241
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 104  Q
    |||||| ||||||||  ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  322 atcatctatgagttgctgagttttattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt 241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 101
Target Start/End: Original strand, 8252 - 8312
Alignment:
Q  41 agttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8252 agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 25240 - 25318
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| | ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25240 atcatctacgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 25318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6419 - 6371
Alignment:
Q  97 tatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6419 tatgatgtgaattatataatgctgactaagatgttgctatgttgtttaa 6371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7209 - 7141
Alignment:
Q  33 agttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 101  Q
    |||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7209 agttgttgagttgtctgctacccctgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 159
Target Start/End: Original strand, 4700 - 4730
Alignment:
Q  129 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4700 gttgctatgttgtttaacatattgattatga 4730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 59
Target Start/End: Original strand, 4513 - 4549
Alignment:
Q  23 atcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgt 59  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4513 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 4549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4401 - 4329
Alignment:
Q  24 tcatcaatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 96  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  4401 tcatccatgagtcgttaagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Original strand, 1009 - 1045
Alignment:
Q  123 taagatgttgctatgttgtttaacatattgattatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1009 taagatgttgctatgttgtttatgatattgattatga 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University