View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21691_high_10 (Length: 340)

Name: NF21691_high_10
Description: NF21691
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21691_high_10
NF21691_high_10
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (19-340)||(13880979-13881300)
chr6 (12-340)||(35203683-35204011)
chr6 (12-340)||(25943902-25944230)
chr6 (12-340)||(17692472-17692803)
chr6 (18-340)||(22348595-22348913)
chr6 (20-282)||(14739769-14740034)
chr6 (30-282)||(33333283-33333538)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (19-340)||(10096426-10096747)
chr3 (19-340)||(10203312-10203633)
chr3 (12-301)||(6305544-6305833)
chr3 (12-340)||(29911573-29911901)
chr3 (12-340)||(54190741-54191069)
chr3 (12-340)||(10899242-10899570)
chr3 (12-340)||(16459697-16460025)
chr3 (19-340)||(10610392-10610714)
chr3 (13-340)||(22623599-22623926)
chr3 (19-335)||(47880513-47880829)
chr3 (20-282)||(1308496-1308761)
chr3 (30-280)||(8514721-8514974)
chr3 (44-282)||(22170529-22170770)
chr3 (30-280)||(32477967-32478220)
chr3 (33-180)||(2674430-2674577)
chr3 (30-282)||(3325745-3326000)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (12-340)||(39684480-39684808)
chr2 (12-340)||(2738438-2738766)
chr2 (12-340)||(20052381-20052708)
chr2 (18-335)||(17934323-17934640)
chr2 (12-340)||(22714854-22715182)
chr2 (19-208)||(45569630-45569819)
chr2 (20-282)||(25393511-25393776)
chr2 (30-282)||(19346903-19347158)
chr2 (80-186)||(39485478-39485584)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (12-340)||(9523961-9524289)
chr1 (12-340)||(2396875-2397203)
chr1 (233-282)||(41395876-41395925)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (12-340)||(28330128-28330456)
chr8 (12-340)||(28892997-28893325)
chr8 (12-340)||(16754880-16755208)
chr8 (12-340)||(4814846-4815174)
chr8 (19-272)||(25682552-25682805)
chr8 (18-340)||(21039670-21039991)
chr8 (12-335)||(33034874-33035196)
chr8 (12-300)||(15946896-15947184)
chr8 (5-282)||(26298998-26299278)
chr8 (20-282)||(10686461-10686726)
chr8 (30-282)||(18867877-18868132)
chr8 (30-282)||(35743014-35743269)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (12-340)||(3322408-3322736)
chr7 (12-340)||(7072284-7072612)
chr7 (12-340)||(25407647-25407975)
chr7 (12-340)||(44012151-44012478)
chr7 (12-108)||(25353585-25353681)
chr7 (20-282)||(24263520-24263785)
chr7 (20-282)||(9187342-9187607)
chr7 (30-280)||(16882554-16882807)
chr7 (20-282)||(18411282-18411547)
chr7 (30-282)||(21986545-21986800)
chr7 (30-147)||(21643800-21643917)
chr7 (233-282)||(24272313-24272362)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (12-340)||(764-1092)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (12-338)||(25447720-25448047)
chr5 (20-282)||(43594746-43595011)
chr5 (20-282)||(43627540-43627805)
chr5 (20-282)||(37558799-37559064)
chr5 (20-282)||(27447448-27447713)
chr5 (30-282)||(24557791-24558046)
chr5 (30-282)||(24598823-24599078)
chr5 (30-282)||(33788981-33789236)
chr5 (30-280)||(31399199-31399452)
chr5 (30-282)||(28835927-28836181)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (20-340)||(15314557-15314878)
chr4 (12-281)||(4567572-4567841)
chr4 (12-340)||(36769823-36770151)
chr4 (12-340)||(47564946-47565274)
chr4 (12-340)||(16634724-16635034)
chr4 (30-282)||(9226608-9226863)
chr4 (30-282)||(18858201-18858456)
chr4 (30-282)||(5145533-5145788)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (12-340)||(18559-18887)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (12-122)||(49044-49154)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (20-282)||(16506-16771)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (12-282)||(133-406)
scaffold0006 (12-282)||(8289-8562)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (118-186)||(34734-34802)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 13880979 - 13881300
Alignment:
Q  19 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880979 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggacaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 13881078  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881079 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 13881178  T
Q  219 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13881179 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagagaaacttca 13881278  T
Q  319 gtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13881279 gtttgaggtggagcctatcact 13881300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35204011 - 35203683
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35204011 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 35203912  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35203911 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 35203812  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35203811 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacagaga 35203712  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35203711 aaattcagtttgaggtggagcctatcact 35203683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 25943902 - 25944230
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  25943902 catcaacagagatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 25944001  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25944002 tgtgagactagacaaacttgatgctagagctgtgaaatgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 25944101  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || ||| |    
T  25944102 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacgaagatagaaa 25944201  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  25944202 aaattcagttttaggtggagcctatcact 25944230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17692803 - 17692472
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  17692803 catcaacagggatagatcttaagacacatatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggggctttagcgtttgctca 17692704  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17692703 tgtcagacaagacaaacttgatgttagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaggttgtggaagatggaacctgga 17692604  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagca---gggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacag 308  Q
    | ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||    
T  17692603 ggatcaaaatttattataagcaggggggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctagatacaagctcgaaaacggggatag 17692504  T
Q  309 agaaacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17692503 agaaaattcagtttgaggtggagcctaccact 17692472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22348913 - 22348595
Alignment:
Q  18 cagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcag 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  22348913 cagggatagatctcaagacacctatggagatttggagtgggagaccagtaggctactctaacttgaaggttttcggagctttagcattttctcatgtcag 22348814  T
Q  118 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatca 217  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22348813 acaagataaacttgatgctagagctgtgaagtgtattta----ggttatccttaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggaggatca 22348718  T
Q  218 aaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttc 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||    
T  22348717 aaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagttcagaaacggggatagagaaaattc 22348618  T
Q  318 agtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
T  22348617 aatttgaggtggagcctaccact 22348595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 14739769 - 14740034
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  14739769 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 14739868  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  14739869 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 14739968  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  14739969 aagagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 14740034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Original strand, 33333283 - 33333538
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  33333283 tcaagatacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 33333382  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||  ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  33333383 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatcaggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 33333482  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  33333483 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 33333538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10096747 - 10096426
Alignment:
Q  19 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10096747 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggacaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 10096648  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10096647 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 10096548  T
Q  219 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10096547 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagagaaacttca 10096448  T
Q  319 gtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10096447 gtttgaggtggagcctatcact 10096426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10203633 - 10203312
Alignment:
Q  19 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10203633 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 10203534  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10203533 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 10203434  T
Q  219 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 318  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10203433 aatttattataaacagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcataaacggggacagagaaacttca 10203334  T
Q  319 gtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10203333 gtttgaggtggagcctatcact 10203312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Original strand, 6305544 - 6305833
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305544 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 6305643  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6305644 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 6305743  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacg 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6305744 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacg 6305833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29911901 - 29911573
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29911901 catcaacaaggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaaatcttcggagctttagcgtttgctca 29911802  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29911801 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 29911702  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  29911701 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcgaaaacggggatagaga 29911602  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29911601 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 29911573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 54190741 - 54191069
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  54190741 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttaaaagttttcggagctttagcgtttgctca 54190840  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54190841 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 54190940  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  54190941 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 54191040  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  54191041 aaattcagtttgaggtggagcctatcact 54191069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 10899242 - 10899570
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||    
T  10899242 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttaaaagttttcagagctttagcatttgctca 10899341  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10899342 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 10899441  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10899442 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatgcaagctcggaaacggggacagaga 10899541  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10899542 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 10899570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 16459697 - 16460025
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16459697 catcaacagggatagatctcaacacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgcgca 16459796  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16459797 tgtcatgcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 16459896  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16459897 ggatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacagaga 16459996  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16459997 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 16460025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10610714 - 10610392
Alignment:
Q  19 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  10610714 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctcatgtcaga 10610615  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10610614 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggaggatcaa 10610515  T
Q  219 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacgggga-cagagaaacttc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||    
T  10610514 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggataaaagaaaattc 10610415  T
Q  318 agtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  10610414 agtttgaggtggagcctaccact 10610392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22623926 - 22623599
Alignment:
Q  13 atcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccat 112  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22623926 atcaacagggatagatctcaaaacacctatggagttttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctcat 22623827  T
Q  113 gtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22623826 gtcaggcaagacaaacttgatgctagagctatgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggag 22623727  T
Q  213 aatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaa 312  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  22623726 gatcaaaatttataataagcagggatgttacttttgatgagacccgaatggggatgaagtgcaaagacttggatataagctcgaaaacggggacagagaa 22623627  T
Q  313 acttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
T  22623626 aattcagtttgaggtggaacctatcact 22623599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47880829 - 47880513
Alignment:
Q  19 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||     
T  47880829 agggatagatctcaagacacctatgtaggtttggagtgggagaccggcagactactctaatttgaaagtttttggagctttagcatttgcttatgtcaga 47880730  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 218  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47880729 caggacaaacttgattctagagctgtgaagtgtattttcatgggatatcctgaaggtgtgaaaggttacagactatggaagatggaacctggaggatcaa 47880630  T
Q  219 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 318  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  47880629 aatttattataagcaaggatgttacttttgatgagacccgcatgaagatgaagtataaagacctggatacaagcttagaaactggggtagagaaaattca 47880530  T
Q  319 gtttgaggtggagccta 335  Q
    ||||| |||||||||||    
T  47880529 gtttgtggtggagccta 47880513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1308761 - 1308496
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  1308761 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 1308662  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  1308661 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 1308562  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  1308561 aaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 1308496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8514974 - 8514721
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  8514974 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 8514875  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  8514874 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 8514775  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 280  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  8514774 ataagtagggatgttaccttcgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagac 8514721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 22170529 - 22170770
Alignment:
Q  44 gaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctg 143  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||     
T  22170529 gaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctt 22170628  T
Q  144 tgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttattataagcagggatgt 240  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||    
T  22170629 tgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttgataagtagggatgt 22170728  T
Q  241 tacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22170729 tacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 22170770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32478220 - 32477967
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  32478220 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 32478121  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  32478120 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 32478021  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 280  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  32478020 ataagtagggatgttaccttcgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagac 32477967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 180
Target Start/End: Original strand, 2674430 - 2674577
Alignment:
Q  33 agacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaacttga 132  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  2674430 agacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttga 2674529  T
Q  133 tgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaa 180  Q
      |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2674530 gcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaa 2674577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Original strand, 3325745 - 3326000
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||  | ||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||  ||    
T  3325745 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaactagaagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacatgct 3325844  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||| ||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  3325845 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtgaaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 3325944  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3325945 attagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 3326000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 39684480 - 39684808
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684480 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggaagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 39684579  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684580 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 39684679  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39684680 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagaga 39684779  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684780 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 39684808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 2738438 - 2738766
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738438 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagatcggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 2738537  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738538 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgagaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 2738637  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2738638 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatgcaagctcggaaacggggacagaga 2738737  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738738 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 2738766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20052708 - 20052381
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  20052708 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcg-agctttagcgtttgctca 20052610  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20052609 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagaccgtggaagatggaacctgga 20052510  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  20052509 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 20052410  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20052409 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 20052381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Original strand, 17934323 - 17934640
Alignment:
Q  18 cagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcag 117  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17934323 cagggataggtctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcatttgcccatgtcag 17934422  T
Q  118 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatca 217  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17934423 acaagacaaacttgatgctagatatgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctagagaatca 17934522  T
Q  218 aaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttc 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  17934523 aaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagagaaaattc 17934622  T
Q  318 agtttgaggtggagccta 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17934623 agtttgaggtggagccta 17934640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22715182 - 22714854
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  22715182 catcaacagggatagatctcaacacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgttttctca 22715083  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22715082 tgtcattcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 22714983  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22714982 ggatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 22714883  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22714882 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 22714854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 45569630 - 45569819
Alignment:
Q  19 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45569630 agggatagaactcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatatcagg 45569729  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45569730 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacct 45569819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25393776 - 25393511
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || | ||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  25393776 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcatctttgaaggtttacggagctttggcatatgcacatatcaagc 25393677  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  25393676 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 25393577  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25393576 aagagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 25393511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19347158 - 19346903
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  19347158 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 19347059  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   |||| ||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  19347058 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtgaaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 19346959  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  19346958 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 19346903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 186
Target Start/End: Original strand, 39485478 - 39485584
Alignment:
Q  80 ttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtga 179  Q
    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  39485478 ttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtga 39485577  T
Q  180 aaggtta 186  Q
    | |||||    
T  39485578 agggtta 39485584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 9523961 - 9524289
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9523961 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 9524060  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524061 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 9524160  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9524161 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacagaga 9524260  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524261 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 9524289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2397203 - 2396875
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  2397203 catcaacatggatagatctcaaaacacctatggaggtttggagtgggagaccagtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 2397104  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2397103 tgtcaagcaggacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaagtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 2397004  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||    
T  2397003 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggacacaagctcagaaatgggggaagaga 2396904  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2396903 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 2396875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41395925 - 41395876
Alignment:
Q  233 agggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41395925 agggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 41395876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 28330128 - 28330456
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330128 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 28330227  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330228 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctaaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 28330327  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28330328 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttaatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagaga 28330427  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330428 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 28330456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 28892997 - 28893325
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28892997 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 28893096  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28893097 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 28893196  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28893197 gaatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacagaga 28893296  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28893297 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 28893325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16755208 - 16754880
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755208 catcaacaaggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtggaagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 16755109  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755108 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 16755009  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16755008 gaatcaaaatttataataagcagggatgttacttttgatgagacccgaatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggggacaaaga 16754909  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754908 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 16754880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4815174 - 4814846
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4815174 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcagagctttaacgtttgccca 4815075  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4815074 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 4814975  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4814974 ggatcaaaatttatcataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatgcaagctcggaaacggggacagaga 4814875  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||    
T  4814874 aaattcagtttgaggtggaccctatcact 4814846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 25682552 - 25682805
Alignment:
Q  19 agggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25682552 agggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 25682651  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25682652 caagacaaacttgatgctaaagctgtgaagtgtattttcatgggttatcttgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggaggatcaa 25682751  T
Q  219 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagt 272  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25682752 aatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagt 25682805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Original strand, 21039670 - 21039991
Alignment:
Q  18 cagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcag 117  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  21039670 cagggatatatctcaagacacctatggaggtttgtagtgggagaccggtagactactctaacttgaatgttttcagagctttagcatttgctcatgtcag 21039769  T
Q  118 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatca 217  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21039770 acaagacaa-cttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctggaggatca 21039868  T
Q  218 aaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttc 317  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  21039869 aaatttattataagcaggtatgttacttttgataagatccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggagatagagaaaattc 21039968  T
Q  318 agtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
T  21039969 aatttgaggtggagcctaccact 21039991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Original strand, 33034874 - 33035196
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||| | ||    
T  33034874 catcaacagggatagatctgaagacacctatgaaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttaaaagtttttagagctttagcattttctca 33034973  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  33034974 tgtcagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatcgaacttgga 33035073  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||    
T  33035074 ggatcaaaatttattataagcagggatg-tacttttgatgagacccgcaaggggatgaagtggaaagacctgggaacaagctcagaaatgggggtagaga 33035172  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagccta 335  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  33035173 aaattcagtttgaggtggagccta 33035196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 15946896 - 15947184
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |     
T  15946896 catcaacatggataaatctcaagacacctatggatgtttggagtgggagactgccagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcatttgcacg 15946995  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| |   ||| ||||||  ||| ||||    
T  15946996 tgtcaaacatgacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtgtttttattggttatcttgaaggtgtgaaaggttacaagttgttgaagataaaacatgga 15947095  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaac 300  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  15947096 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgtatgagtatgaagtgcaaaaacctggaaacaagctcagaaac 15947184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26299278 - 26298998
Alignment:
Q  5 agatggacatcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgt 104  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||| || |    
T  26299278 agatggccatcaacggggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggttttcggagctttggcat 26299179  T
Q  105 ttgcccatgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatgga 204  Q
     ||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||    
T  26299178 atgcgcatatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattgga 26299079  T
Q  205 acc---tggagaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    | |   ||||| |||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  26299078 atctagtggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 26298998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 10686461 - 10686726
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  10686461 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 10686560  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  10686561 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 10686660  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10686661 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 10686726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Original strand, 18867877 - 18868132
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  18867877 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaatgttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 18867976  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  18867977 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 18868076  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18868077 attagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 18868132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35743269 - 35743014
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  35743269 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 35743170  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  35743169 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 35743070  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  35743069 ataagtagggatgttacctttgatgagacccgaatggggatgaagtgtaaagacct 35743014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3322736 - 3322408
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3322736 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 3322637  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3322636 tatcaggcaagacaaacttgatgctagagcggtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 3322537  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |    
T  3322536 gaatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggacaggaa 3322437  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3322436 aaattcagtttgaggtggagcctatcact 3322408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 7072284 - 7072612
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7072284 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcatttgccca 7072383  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7072384 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggt 7072483  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7072484 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggagatgaagtgcaaagacatggatacaagctcggaaacggggacagaga 7072583  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7072584 aaattcagtttgaggtggagcctatcact 7072612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 25407647 - 25407975
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25407647 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagacgggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctca 25407746  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25407747 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctaga 25407846  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  25407847 ggatcaaaaattattataagcagggatgttacttttgatgagacccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaacggggatagaga 25407946  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25407947 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 25407975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44012478 - 44012151
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  44012478 catcaacagggatagatttgaagacacttatagaggtttggagtgggagaccggcagactactctaatttgaaagtttt-ggagctttagcatttgctca 44012380  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  44012379 tgtcagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctgaa 44012280  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  | |||    
T  44012279 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggaaacaaactcagaaacgggggtataga 44012180  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44012179 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 44012151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 25353585 - 25353681
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25353585 catcaacagggatagatctcaggacagctatggaggtttggagtgggagaccgttagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgc 25353681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 24263520 - 24263785
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  24263520 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 24263619  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  24263620 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 24263719  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24263720 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 24263785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 9187342 - 9187607
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    ||||| || || |||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  9187342 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcaaactactcatctttgaaggtttttggagctttggcatatgcgcatatcaagc 9187441  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  9187442 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagctgtggaaattggaatctagtggaggatc 9187541  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||||  | || || | ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  9187542 aaaagtcttgattagtatggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagagtaaagacct 9187607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16882807 - 16882554
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  16882807 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 16882708  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  16882707 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 16882608  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 280  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16882607 ataagtagggatgttaccttcgatgagacccagatggggatgaagtgtaaagac 16882554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18411547 - 18411282
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| || || ||||||||  | | ||| ||| ||| ||    
T  18411547 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcttctttgaaggtttttggagctttgacatatgcgcatatcaagc 18411448  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | |||||  ||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  18411447 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcatttgttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 18411348  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18411347 aaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 18411282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21986800 - 21986545
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||||    ||||| || |||| |||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  21986800 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaatcggcagactactcatctttgaaggttttcgaagctttggcatatgcacatatcaagcaagacaagct 21986701  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||  ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  21986700 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatctggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 21986601  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  21986600 ataagtagggatgttacctttgatgagactcggatggggatgaagtgtaaagacct 21986545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21643917 - 21643800
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  21643917 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggctgattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 21643818  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaa 147  Q
    |||  |||||||| ||||    
T  21643817 tgagcctagagctttgaa 21643800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 282
Target Start/End: Original strand, 24272313 - 24272362
Alignment:
Q  233 agggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24272313 agggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 24272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 764
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1092 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 993  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  992 tgttaggcaagacaaacttgatgctagagctgtaaaatgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 893  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  892 ggatcaaaatttattataagcaaggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcgaaaacagggacagaga 793  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  792 aaattcagtttgaggtggagcctatcact 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 338
Target Start/End: Original strand, 25447720 - 25448047
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25447720 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgtttgctca 25447819  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctg-aaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgg 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25447820 tgtcagacaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctga 25447919  T
Q  211 agaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagag 310  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  25447920 aggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcggaaatggggatagag 25448019  T
Q  311 aaacttcagtttgaggtggagcctatca 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25448020 aaaattcagtttgaggtggagcctatca 25448047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43595011 - 43594746
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  43595011 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 43594912  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  43594911 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 43594812  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  43594811 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacct 43594746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43627805 - 43627540
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  43627805 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 43627706  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  43627705 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 43627606  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  43627605 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacct 43627540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 37558799 - 37559064
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  37558799 gggatagacttcaagacacttatggaggtatggagtgggaaaccggtggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 37558898  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  37558899 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 37558998  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  37558999 aagagtcgtgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 37559064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27447713 - 27447448
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  27447713 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 27447614  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  27447613 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 27447514  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || ||   | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  27447513 aagagccttgataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatgaggatgaagtgtaaagacct 27447448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Original strand, 24557791 - 24558046
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || || |||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  24557791 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggcagattactcatcattgaaggtttttggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 24557890  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  24557891 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 24557990  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24557991 attagcagggacgttacctttgatgagactcgtatggggatgaagtgtaaagacct 24558046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Original strand, 24598823 - 24599078
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || || |||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  24598823 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggcagattactcatcattgaaggtttttggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 24598922  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  24598923 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 24599022  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24599023 attagcagggacgttacctttgatgagactcgtatggggatgaagtgtaaagacct 24599078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33789236 - 33788981
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  33789236 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggtggattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 33789137  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  33789136 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatataagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 33789037  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  33789036 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 33788981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 280
Target Start/End: Original strand, 31399199 - 31399452
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  31399199 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcgaattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 31399298  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||  ||||| |||  |     
T  31399299 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggatacaagttgtggaaattggaatctagtggaagatcaagagtcttg 31399398  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagac 280  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  31399399 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagac 31399452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28836181 - 28835927
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||    ||||  || ||||||||||| || | |||  || ||| ||||||||| ||    
T  28836181 tcaagacacctatggaagtatggagtgggaaaccggtagattactcatctttgatggttttcggagcttt-gcatatgcgtatatcaagcaagacaagct 28836083  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacct---ggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |   |||||||  ||||| ||   |||| |||||||||  |     
T  28836082 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgagaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 28835983  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  28835982 attagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 28835927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 15314557 - 15314878
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcag-actactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcagg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15314557 gggatagatctcaagacacctatggatgtttggagtgggagaccggtaggactactctaacttgaaagttttcggagctttagcgttttctcatgtcagg 15314656  T
Q  119 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctggagaatcaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15314657 caagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgagttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctggaggatcaa 15314756  T
Q  219 aagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagagaaacttca 318  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15314757 aatttattataagcagggatgttatttttgatgagacccacatggggatgaagtgcaaagacctagatacaagctcagaaacggggatagagaaaattca 15314856  T
Q  319 gtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  15314857 gtttgaggtggagcctaccact 15314878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 281
Target Start/End: Original strand, 4567572 - 4567841
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  4567572 catcaacatggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggagatcggcagactactctaatttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 4567671  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4567672 tgtcagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacagactgtggaagatggaacctgga 4567771  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacc 281  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4567772 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaagacc 4567841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 36769823 - 36770151
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  |    
T  36769823 catcaacagggatagatctcaagacacctatgaatgtttggagtgggagaccgggaaactactctaatttgaaagtttttggagctttagcatttgctta 36769922  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36769923 tgtcagacaggacatacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttattctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctgga 36770022  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||  |||||    
T  36770023 ggatcaaaatttattataagcagggatgttacttttgatgagacccgcatggggatgaagtgcaaaaacccggaaacaagctcagaaacaggggtagaga 36770122  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36770123 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 36770151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 47564946 - 47565274
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  47564946 catcaacagggataaatctcaagacacctatggacgtttggagtgggagaccgacagactactctaatttgaaagtttttggagctttagcatttgctca 47565045  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  47565046 tgctagacaggacaaacttgatgctagagttgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctgaa 47565145  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  47565146 ggatcaaaatttattataagtagagatgttacttttgatgagacccgcatgtgaatgaagtgcaaagacctggaaacaagctcagaaacgggggtagaga 47565245  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47565246 aaattcagtttgaggtggagcctaccact 47565274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 16634724 - 16635034
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  16634724 catcaacaaggatagatcttaagacacctatggaggtttggagtgggagaccggcaaactactctaatttgaaagttttcggagctttagcatttgctca 16634823  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||| |                   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  16634824 tgtcaaacaggacaaacttgatgctagagtta------------------gttatcctgaaggtgtgaaaggttacaaactgtggaagatggaacctaga 16634905  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || | |    
T  16634906 ggatcaaaatttattataagcatggatgttacttttgatgaggcccgtatggggatgaagtgcaaagacctggaaacaagcttataaatgggggcacaaa 16635005  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  16635006 aaattcagtttgaggtggatcctaccact 16635034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Original strand, 9226608 - 9226863
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  9226608 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 9226707  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  9226708 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 9226807  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  9226808 ataagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 9226863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18858456 - 18858201
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  18858456 tcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagcaagacaagct 18858357  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| ||||| |||  |     
T  18858356 tgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaagagtcttg 18858257  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18858256 ataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 18858201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5145788 - 5145533
Alignment:
Q  30 tcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggcaagacaaact 129  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| | ||||||| ||    
T  5145788 tcaagacacctatggaagtatggaatgggaaaccggcagactactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagaaagacaagct 5145689  T
Q  130 tgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatcaaaagttatt 226  Q
    |||  |||||||| |||| ||| | || ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   ||||| |||||||||  |     
T  5145688 tgagactagagctttgaaatgtgtctttattcgttatccagaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatcaaaagtcttg 5145589  T
Q  227 ataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || || |||||| |||| |||||||||| ||  || ||||||||||| ||||||||    
T  5145588 attagtagggatattacctttgatgagacccgtatagggatgaagtgtaaagacct 5145533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 18559 - 18887
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18559 catcaacagggatagatctcaagacacctatggaggtttggagtgggaggccggcaaactactctaatttgaaagttttcggagctttagcgtttgccca 18658  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 211  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18659 tgttagacaggacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaagctgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacctgga 18758  T
Q  212 gaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagcttagaaacggggacagaga 311  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  18759 ggatcaaaatttattataagcagggatgtcacttttgatgagacccgtatggggatgaagtgcaaagacctggatacaagctcagaaacggaggaagaga 18858  T
Q  312 aacttcagtttgaggtggagcctatcact 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18859 aaattcagtttgaggtggagcctatcact 18887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 49154 - 49044
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49154 catcaacagggatagatctcgagacacctatggaggtttggagtgggagaccggtagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 49055  T
Q  112 tgtcaggcaag 122  Q
    |||||||||||    
T  49054 tgtcaggcaag 49044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 16506 - 16771
Alignment:
Q  20 gggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgcccatgtcaggc 119  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||| ||    
T  16506 gggatagacttcaagacacctatggaggtatggagtgggaaaccggcagattactcctctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgcatatcaagc 16605  T
Q  120 aagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---tggagaatc 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |   |||||||  ||||| |   ||||| |||    
T  16606 aagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaaggggtacaagttgtggaaattggaatctagtggaggatc 16705  T
Q  217 aaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    || |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16706 aagagtcttgataagtagggatgttacctttgatgagacccggatggggatgaagtgtaaagacct 16771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 133
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  406 catcaacaggaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaagcggcagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 307  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---t 208  Q
    | ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   |    
T  306 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 207  T
Q  209 ggagaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    |||| |||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  206 ggaggatcaaaagtcttgattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8562 - 8289
Alignment:
Q  12 catcatcagggatagatctcaagacacttatggaggtttggagtgggagaccggcagactactctaacttgaaagtcttcggagctttagcgtttgccca 111  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| || | ||| ||    
T  8562 catcaacaggaatagacttcaagacacctatggaagtatggagtgggaaagcggcagattactcatctttgaaggttttcggagctttggcatatgcgca 8463  T
Q  112 tgtcaggcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggttatagactgtggaagatggaacc---t 208  Q
    | ||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||  ||||| |   |    
T  8462 tatcaagcaagacaagcttgagcctagagctttgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggttacaagttgtggaaattggaatctagt 8363  T
Q  209 ggagaatcaaaagttattataagcagggatgttacttttgatgagatccacatggggatgaagtgcaaagacct 282  Q
    |||| |||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  8362 ggaggatcaaaagtcttaattagtagggatgttacctttgatgagacccgtatggggatgaagtgtaaagacct 8289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34802 - 34734
Alignment:
Q  118 gcaagacaaacttgatgctagagctgtgaagtgtattttcatgggttatcctgaaggtgtgaaaggtta 186  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34802 gcaagacaagcttaaggctagagctgtgaaatgtgtcttcattggttatccggaaggtgtgaagggtta 34734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University