View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21691_high_17 (Length: 322)

Name: NF21691_high_17
Description: NF21691
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21691_high_17
NF21691_high_17
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (12-303)||(9543687-9543978)
chr7 (12-303)||(6536087-6536378)
chr7 (12-303)||(5389618-5389909)
chr7 (12-303)||(26305159-26305450)
chr7 (12-303)||(26361368-26361659)
chr7 (12-303)||(32099983-32100274)
chr7 (12-303)||(44898902-44899193)
chr7 (12-303)||(8502652-8502943)
chr7 (12-303)||(16140631-16140922)
chr7 (12-303)||(46498717-46499008)
chr7 (12-288)||(42596961-42597237)
chr7 (12-303)||(13283877-13284168)
chr7 (78-251)||(14643279-14643452)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (12-303)||(27413751-27414042)
chr5 (12-303)||(26200772-26201063)
chr5 (12-303)||(33940923-33941214)
chr5 (12-303)||(18362880-18363171)
chr5 (12-288)||(20949458-20949734)
chr5 (32-287)||(23375368-23375615)
chr5 (70-235)||(22456358-22456523)
chr5 (38-159)||(5601807-5601928)
chr5 (78-251)||(20037353-20037526)
chr5 (78-165)||(24299175-24299262)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (12-303)||(16254836-16255127)
chr4 (12-303)||(6693821-6694112)
chr4 (12-288)||(520375-520651)
chr4 (12-303)||(17150976-17151267)
chr4 (12-303)||(7844905-7845196)
chr4 (77-165)||(26813600-26813688)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (12-303)||(21211417-21211708)
chr8 (12-303)||(14892199-14892490)
chr8 (12-301)||(22832342-22832631)
chr8 (78-235)||(33600415-33600572)
chr8 (78-165)||(18234027-18234114)
chr8 (78-165)||(18243478-18243565)
chr8 (78-165)||(12916656-12916743)
chr8 (70-165)||(25035933-25036028)
chr8 (70-165)||(25049970-25050065)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (12-303)||(45015956-45016247)
chr2 (12-303)||(9512211-9512502)
chr2 (12-303)||(18652821-18653112)
chr2 (12-288)||(27168448-27168724)
chr2 (12-303)||(22903742-22904033)
chr2 (38-159)||(1792183-1792304)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (12-303)||(31359164-31359455)
chr6 (12-303)||(16899549-16899840)
chr6 (12-303)||(18161668-18161959)
chr6 (12-288)||(34766959-34767235)
chr6 (12-303)||(18710425-18710716)
chr6 (12-303)||(18704490-18704781)
chr6 (104-303)||(29561121-29561320)
chr6 (12-109)||(29542050-29542147)
chr6 (78-165)||(25895804-25895891)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (12-303)||(6423910-6424201)
chr3 (12-303)||(9538738-9539029)
chr3 (12-303)||(8974449-8974740)
chr3 (12-224)||(12387590-12387802)
chr3 (38-159)||(48979901-48980022)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (12-303)||(16156486-16156777)
chr1 (12-288)||(1987651-1987927)
chr1 (12-273)||(22959930-22960190)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (12-288)||(6030-6306)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (12-303)||(148311-148602)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (12-288)||(7372-7648)
scaffold0313 (12-288)||(11154-11430)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (12-303)||(52979-53268)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (92-301)||(1-210)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (32-287)||(16850-17097)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (134-303)||(27670-27839)
scaffold0141 (12-140)||(20378-20506)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (134-303)||(86973-87142)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (12-174)||(128-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (26-273)||(189005-189251)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (78-165)||(258166-258253)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9543978 - 9543687
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9543978 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactaagatgtct 9543879  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9543878 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcacccaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatcttattggttcactgagagctcatgaa 9543779  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  9543778 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaagctcatcagctgctgaagatgatgt 9543687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 6536087 - 6536378
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6536087 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 6536186  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6536187 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 6536286  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6536287 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5389909 - 5389618
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5389909 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 5389810  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5389809 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 5389710  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  5389709 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 5389618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 26305159 - 26305450
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26305159 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 26305258  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26305259 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 26305358  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26305359 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26305450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26361659 - 26361368
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26361659 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 26361560  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26361559 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 26361460  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26361459 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 32099983 - 32100274
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32099983 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 32100082  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32100083 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 32100182  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  32100183 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 32100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 44898902 - 44899193
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44898902 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 44899001  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44899002 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 44899101  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  44899102 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 44899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 8502652 - 8502943
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8502652 atgaaatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 8502751  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8502752 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 8502851  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8502852 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16140922 - 16140631
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16140922 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 16140823  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16140822 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 16140723  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16140722 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 46498717 - 46499008
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46498717 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 46498816  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46498817 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 46498916  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  46498917 gttgtactttaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaactccatcagttgctgatgaagatgt 46499008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 42596961 - 42597237
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  42596961 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgcct 42597060  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42597061 tccaagtatgtagagacctatggtcactgcaatcactgaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcatttgttcactgagagctcatgaa 42597160  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  42597161 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcaacaaacctcatcagt 42597237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13284168 - 13283877
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  13284168 atgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaatgaaatgagatctcttgggaaggcatactccactcatgagagaatcagaaaaatattaagatgcct 13284069  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13284068 tccaagtatgtggagacctatggtcacttcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcacttagagctcatgaa 13283969  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||    
T  13283968 gttgtacttcaaggagacaaactagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagtaaacttcatcagtaactgatgatgatgt 13283877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14643452 - 14643279
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||  |||    
T  14643452 ctcatgacagaattagaaaaatattaagatgtctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggccct 14643353  T
Q  178 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 251  Q
     || ||||| |||||  | || |||||||||||| || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14643352 agaggatcttattggaacgcttagagctcatgaaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14643279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 27413751 - 27414042
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413751 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 27413850  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27413851 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 27413950  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  27413951 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 27414042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26201063 - 26200772
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26201063 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 26200964  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26200963 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 26200864  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26200863 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 33940923 - 33941214
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33940923 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 33941022  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33941023 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 33941122  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33941123 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 33941214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 18362880 - 18363171
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18362880 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 18362979  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18362980 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 18363079  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18363080 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 20949458 - 20949734
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20949458 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 20949557  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949558 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaggatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 20949657  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20949658 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 20949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23375615 - 23375368
Alignment:
Q  32 actacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacaccta 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     |||||||||||| |||||    
T  23375615 actacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggagaccta 23375521  T
Q  132 tggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaa 231  Q
    |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23375520 tgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaagacaa 23375424  T
Q  232 accagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 287  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23375423 accagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 23375368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22456523 - 22456358
Alignment:
Q  70 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatct 169  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||     
T  22456523 atattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtcttcctaatatatggagacctatggttacagaaatcactcaagccaaagatttaaattcc 22456424  T
Q  170 atgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaacca 235  Q
     ||    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22456423 ttggctttagaagatctcattggaacactaagagctcatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 22456358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 5601807 - 5601928
Alignment:
Q  38 atagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtca 137  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |    
T  5601807 atagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgtcttccaactcaatggagacccatggtta 5601906  T
Q  138 ctgcaatcactcaggccaaaga 159  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  5601907 cggcaatcactcaagctaaaga 5601928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Original strand, 20037353 - 20037526
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 177  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| |||| ||  ||    |    
T  20037353 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaacacgtggagacctatggttacaacaatcactcaagccaacgatctaaattccttggcttt 20037452  T
Q  178 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 251  Q
     ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  20037453 agaaaatctcattggaacacttagagctcatgaagttctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 20037526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24299262 - 24299175
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24299262 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 24299175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 16254836 - 16255127
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16254836 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaatattgagatgtct 16254935  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254936 tccaagtatgtggagacctatggtcactgtaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 16255035  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255036 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgctgatgatgatgt 16255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 6693821 - 6694112
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6693821 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 6693920  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6693921 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 6694020  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6694021 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 520651 - 520375
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  520651 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaaacatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 520552  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520551 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 520452  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  520451 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 17150976 - 17151267
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  17150976 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagatatcttgaaaaggcatattctactcatgtttgaattagaaaaatattaagatgtct 17151075  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17151076 tccaagtgtttggagacctatggtcaatgcaattactcaggccaaagatttataatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 17151175  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  17151176 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 17151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7845196 - 7844905
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  7845196 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcttattctacttatgatagaatcagaaaaatattaagatgtct 7845097  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7845096 tccaagtgtatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaatctagaagatctcattggctcattgagagctcatgaa 7844997  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  7844996 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgcattgaaagcatctcaacaaagctcattagtagctgatgatgatgt 7844905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Original strand, 26813600 - 26813688
Alignment:
Q  77 actcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  26813600 actcatgatcgaataagaaaaattttaagatgtcttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 26813688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21211708 - 21211417
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21211708 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 21211609  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21211608 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 21211509  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  21211508 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgatgatgaagatgt 21211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14892490 - 14892199
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14892490 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggtatattctactcatgatagaattagaaaaatattgagatgtct 14892391  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892390 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggcagaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 14892291  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14892290 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 14892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Original strand, 22832342 - 22832631
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||||||    
T  22832342 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattccactcatgaaagaatcggaaagattccgagatgtct 22832441  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22832442 tccaattatgtggagacctatcgtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcctgaa 22832541  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgat 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  22832542 gtagtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgat 22832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33600572 - 33600415
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 177  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |  || |||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||  ||    |    
T  33600572 ctcatgacagaatcagaaaaatcctcagatgtcttcctaaaatatggagacctatggttacagcaatcactcaatccaaagacttaaattccttggcttt 33600473  T
Q  178 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaacca 235  Q
     ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33600472 agaagatctcattggaacactaagagcccatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 33600415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Original strand, 18234027 - 18234114
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18234027 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18234114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Original strand, 18243478 - 18243565
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18243478 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18243565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Original strand, 12916656 - 12916743
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  12916656 ctcatgacagaattagaaaaatattaagatgtctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagacaaagatctaaa 12916743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25036028 - 25035933
Alignment:
Q  70 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25036028 atattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25035933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25050065 - 25049970
Alignment:
Q  70 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25050065 atattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25049970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 45015956 - 45016247
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015956 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 45016055  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45016056 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 45016155  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45016156 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagtcaagctcatcagttgctgatgatgatgt 45016247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9512502 - 9512211
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9512502 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 9512403  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9512402 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 9512303  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  9512302 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 9512211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 18652821 - 18653112
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18652821 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 18652920  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18652921 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 18653020  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18653021 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 18653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27168724 - 27168448
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27168724 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 27168625  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168624 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 27168525  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27168524 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaagtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 22903742 - 22904033
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| | ||| ||||||||| |||| || ||    
T  22903742 atgagatgtatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagacatatttcactcatgagataatcagaaaaatattgagttgcct 22903841  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903842 tccaagtatgtggagacctatggtaactgcaattactcaggccaaagatttgaaatctatgaacttggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 22903941  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||    
T  22903942 gttgtacttcaaggagacaaaccaatgaagaaggtaaagtcacttgccttaaaagcctctcagcaaacctcatcagtagctgaagatgatgt 22904033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 1792183 - 1792304
Alignment:
Q  38 atagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtca 137  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |    
T  1792183 atagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgtcttccaactcaatggagacccatggtta 1792282  T
Q  138 ctgcaatcactcaggccaaaga 159  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  1792283 cggcaatcactcaagctaaaga 1792304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 31359164 - 31359455
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31359164 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 31359263  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31359264 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 31359363  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  31359364 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 31359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 16899549 - 16899840
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16899549 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattcaactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 16899648  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16899649 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 16899748  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16899749 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 18161668 - 18161959
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18161668 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 18161767  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18161768 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 18161867  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18161868 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18161959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 34766959 - 34767235
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34766959 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 34767058  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34767059 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 34767158  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34767159 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 34767235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18710716 - 18710425
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  18710716 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtct 18710617  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18710616 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgca 18710517  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18710516 gttgtacttcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18710425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18704781 - 18704490
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  18704781 atgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtct 18704682  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18704681 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgca 18704582  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18704581 gttgtacttcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18704490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Original strand, 29561121 - 29561320
Alignment:
Q  104 agatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagag 203  Q
    ||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29561121 agatgtctttcaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 29561220  T
Q  204 ctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  29561221 ctcatgaagtcgtacttcaaggagataaaccagtgaagaatgtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 29561320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Original strand, 29542050 - 29542147
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 109  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  29542050 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgaaatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 29542147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Original strand, 25895804 - 25895891
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25895804 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 25895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 6423910 - 6424201
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6423910 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgaggtgtct 6424009  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6424010 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctataaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 6424109  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  6424110 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 6424201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 9538738 - 9539029
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9538738 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 9538837  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9538838 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 9538937  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  9538938 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 9539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 8974449 - 8974740
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8974449 atgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtct 8974548  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8974549 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 8974648  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  8974649 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 8974740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 12387590 - 12387802
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  12387590 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatcttttggaaaggcatattccacttatgagagagtcagaaaaatattgagatgcct 12387689  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12387690 tccaagtatgcgaagacctatggtcactgcaattactcaggctaaatatttacaatatatgaacttggaagatctcattgattcactgatagctcatgaa 12387789  T
Q  212 gttgtacttcaag 224  Q
    |||||||||||||    
T  12387790 gttgtacttcaag 12387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 48979901 - 48980022
Alignment:
Q  38 atagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtca 137  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||||| |    
T  48979901 atagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgtcttccaactcaatggagacccatggtta 48980000  T
Q  138 ctgcaatcactcaggccaaaga 159  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  48980001 cggcaatcactcaagctaaaga 48980022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 16156486 - 16156777
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16156486 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgataaaattagaaaaatactgagatgtct 16156585  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16156586 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggcaaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 16156685  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16156686 gttgtacttcaacgagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacctgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16156777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1987927 - 1987651
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  1987927 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgact 1987828  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1987827 tccaagtatgtggagacctatggtcactgaaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaatctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaa 1987728  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1987727 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaatctcatcagt 1987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 22959930 - 22960190
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    |||| |||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | |||| | |||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  22959930 atgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatataccactcatgatagaatcaggaagatactaagatgtct 22960029  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22960030 tccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgactttggaagaactca-tggttcactaagagctcatgaa 22960128  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 273  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  22960129 gttatactttaaggagataaaccagtgaggaaggtaaaatcacttaccttaaaagcttctca 22960190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6306 - 6030
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6306 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 6207  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6206 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 6107  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6106 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 148311 - 148602
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  148311 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattatactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtct 148410  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  148411 tccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctagaggatctcattggttcactgagagctcatgac 148510  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  148511 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaagtaaaaacacttaccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 148602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7648
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7372 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 7471  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 7571  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7572 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 11154 - 11430
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11154 atgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtct 11253  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11254 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 11353  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11354 gttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 11430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53268 - 52979
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  53268 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaata--gagatgtct 53171  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaa 211  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53170 tccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctcgaagatctcattggatcactgagagctcatgaa 53071  T
Q  212 gttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  53070 gttatacttcaaggagacaaactagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcatcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 52979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 92 - 301
Target Start/End: Original strand, 1 - 210
Alignment:
Q  92 agaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agaaaaatattgagatgtcttccaagtatttggagacctatggtcactgcaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 100  T
Q  192 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacactttccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgc 200  T
Q  292 tgatgatgat 301  Q
    ||||||||||    
T  201 tgatgatgat 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 16850 - 17097
Alignment:
Q  32 actacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacaccta 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     |||||||||||| |||||    
T  16850 actacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggagaccta 16944  T
Q  132 tggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaa 231  Q
    |||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16945 tgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaagacaa 17041  T
Q  232 accagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 287  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17042 accagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 27670 - 27839
Alignment:
Q  134 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 233  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27670 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 27769  T
Q  234 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  27770 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 27839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 20378 - 20506
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  20378 atgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtct 20477  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactg 140  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20478 tccaagaatgtggagacctatggtcactg 20506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 87142 - 86973
Alignment:
Q  134 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 233  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  87142 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 87043  T
Q  234 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  87042 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 86973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Original strand, 128 - 290
Alignment:
Q  12 atgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtct 111  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  128 atgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttagaaaagcatattccactcatgaaagaataagaaaaataatgagatgtct 227  T
Q  112 tccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaa 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  228 tccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 189251 - 189005
Alignment:
Q  26 agatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtgga 125  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | ||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  189251 agattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatagcactcatgatagaattaggaagatactaagatgtcttccaagtacatgga 189152  T
Q  126 cacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaagg 225  Q
      ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  189151 ggcctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgactttggaagtactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaagg 189053  T
Q  226 agacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 273  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  189052 agataaaccaatgagaaaggtaaaatcacttgccttaaaagcttctca 189005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Original strand, 258166 - 258253
Alignment:
Q  78 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  258166 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaaaacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 258253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University