View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21692_high_15 (Length: 324)

Name: NF21692_high_15
Description: NF21692
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21692_high_15
NF21692_high_15
[»] chr2 (72 HSPs)
chr2 (14-321)||(23060524-23060830)
chr2 (29-321)||(23076453-23076746)
chr2 (29-318)||(22737997-22738286)
chr2 (29-321)||(22731050-22731344)
chr2 (29-321)||(23285876-23286165)
chr2 (29-321)||(22337126-22337420)
chr2 (29-321)||(23660034-23660327)
chr2 (29-321)||(23654203-23654496)
chr2 (29-318)||(298631-298922)
chr2 (29-321)||(37933-38224)
chr2 (29-313)||(20309127-20309409)
chr2 (166-318)||(22105423-22105575)
chr2 (29-177)||(27753730-27753879)
chr2 (166-318)||(21155060-21155211)
chr2 (29-313)||(32451746-32452031)
chr2 (166-323)||(24367780-24367936)
chr2 (166-318)||(18808954-18809105)
chr2 (166-318)||(23130873-23131024)
chr2 (166-318)||(23133340-23133491)
chr2 (48-317)||(23708454-23708725)
chr2 (166-318)||(23709532-23709683)
chr2 (166-318)||(23712013-23712164)
chr2 (166-318)||(26505390-26505541)
chr2 (166-318)||(26507868-26508019)
chr2 (166-318)||(32214921-32215072)
chr2 (166-318)||(34402522-34402673)
chr2 (166-318)||(39682324-39682475)
chr2 (166-318)||(571408-571559)
chr2 (166-318)||(6726006-6726157)
chr2 (166-318)||(23135601-23135752)
chr2 (166-318)||(24898195-24898347)
chr2 (166-318)||(24900678-24900830)
chr2 (166-318)||(24903155-24903307)
chr2 (166-318)||(24905632-24905784)
chr2 (166-318)||(24908107-24908259)
chr2 (166-318)||(32039498-32039649)
chr2 (166-318)||(28577110-28577261)
chr2 (166-318)||(43137310-43137461)
chr2 (178-318)||(25616199-25616339)
chr2 (166-318)||(45029854-45030005)
chr2 (166-318)||(24529528-24529680)
chr2 (206-320)||(28405988-28406103)
chr2 (48-314)||(19671848-19672112)
chr2 (148-305)||(22799063-22799220)
chr2 (166-318)||(38967385-38967537)
chr2 (163-313)||(23103348-23103497)
chr2 (255-321)||(8946668-8946734)
chr2 (148-294)||(23019643-23019789)
chr2 (206-320)||(25175862-25175976)
chr2 (165-313)||(7687-7835)
chr2 (269-321)||(23040247-23040299)
chr2 (250-318)||(24643034-24643101)
chr2 (209-318)||(7679599-7679707)
chr2 (256-320)||(22134251-22134315)
chr2 (46-313)||(20520026-20520295)
chr2 (234-321)||(23071972-23072059)
chr2 (213-313)||(23207296-23207398)
chr2 (256-317)||(18786947-18787009)
chr2 (262-311)||(23287384-23287433)
chr2 (263-311)||(26392403-26392451)
chr2 (150-313)||(23791292-23791456)
chr2 (243-311)||(23038048-23038116)
chr2 (213-313)||(23004767-23004869)
chr2 (183-305)||(25963688-25963809)
chr2 (166-243)||(24642856-24642933)
chr2 (255-313)||(22413181-22413240)
chr2 (264-313)||(9241945-9241994)
chr2 (148-223)||(22740897-22740973)
chr2 (269-305)||(24655396-24655432)
chr2 (269-305)||(24869903-24869939)
chr2 (262-313)||(25108906-25108958)
chr2 (269-305)||(25961592-25961628)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (29-321)||(18818226-18818519)
chr8 (29-321)||(23406390-23406685)
chr8 (29-321)||(21923745-21924038)
chr8 (29-321)||(7372789-7373074)
chr8 (29-321)||(28648860-28649154)
chr8 (29-321)||(20536219-20536512)
chr8 (29-321)||(22626747-22627040)
chr8 (29-318)||(23648567-23648858)
chr8 (29-321)||(18879054-18879341)
chr8 (29-321)||(21918817-21919110)
chr8 (29-321)||(16092157-16092452)
chr8 (29-321)||(6759269-6759561)
chr8 (29-321)||(22875076-22875370)
chr8 (32-321)||(31971268-31971556)
chr8 (29-313)||(45130815-45131098)
chr8 (29-313)||(16199463-16199746)
chr8 (29-194)||(25362957-25363123)
chr8 (166-318)||(14409444-14409595)
chr8 (166-318)||(16413316-16413467)
chr8 (166-318)||(1484413-1484564)
chr8 (166-318)||(5853292-5853443)
chr8 (166-318)||(20403238-20403389)
chr8 (166-318)||(22001764-22001915)
chr8 (166-318)||(20046195-20046346)
chr8 (48-318)||(41598199-41598469)
chr8 (166-318)||(4483292-4483442)
chr8 (166-318)||(4542373-4542524)
chr8 (166-318)||(15203231-15203382)
chr8 (178-318)||(18678069-18678209)
chr8 (166-318)||(19896276-19896430)
chr8 (178-318)||(32121746-32121886)
chr8 (112-313)||(21389353-21389552)
chr8 (206-318)||(26219728-26219838)
chr8 (221-316)||(15070571-15070665)
chr8 (129-313)||(21778697-21778878)
chr8 (166-318)||(45290694-45290846)
chr8 (166-318)||(14823785-14823935)
chr8 (117-313)||(21395888-21396082)
chr8 (117-313)||(21790381-21790575)
chr8 (166-318)||(26223930-26224081)
chr8 (150-314)||(13508024-13508188)
chr8 (129-313)||(19801345-19801527)
chr8 (221-318)||(19937061-19937157)
chr8 (206-318)||(26225288-26225398)
chr8 (166-318)||(25484275-25484419)
chr8 (150-314)||(13597556-13597720)
chr8 (148-305)||(23776772-23776929)
chr8 (206-318)||(38855246-38855358)
chr8 (150-313)||(20498581-20498744)
chr8 (209-318)||(6520382-6520491)
chr8 (213-318)||(21285611-21285716)
chr8 (214-317)||(983407-983512)
chr8 (234-321)||(17140927-17141014)
chr8 (160-314)||(17612059-17612213)
chr8 (235-321)||(21491006-21491092)
chr8 (217-313)||(5866280-5866376)
chr8 (261-317)||(23760893-23760950)
chr8 (206-320)||(21673716-21673830)
chr8 (150-313)||(37116366-37116530)
chr8 (256-320)||(26355742-26355807)
chr8 (129-313)||(17439423-17439609)
chr8 (213-313)||(24353039-24353140)
chr8 (155-305)||(20465982-20466132)
chr8 (209-313)||(19154883-19154989)
chr8 (213-313)||(17266994-17267096)
chr8 (282-321)||(21249395-21249434)
chr8 (282-321)||(21255233-21255272)
chr8 (264-313)||(20502154-20502203)
chr8 (262-311)||(22525579-22525628)
chr8 (155-305)||(30643235-30643385)
chr8 (183-305)||(16410226-16410347)
chr8 (48-85)||(13507920-13507957)
chr8 (48-85)||(13597452-13597489)
chr8 (269-305)||(20533467-20533503)
chr8 (129-168)||(26222999-26223039)
chr8 (265-313)||(28397569-28397617)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (33-321)||(25421543-25421833)
chr5 (33-312)||(25431414-25431695)
chr5 (29-321)||(23390313-23390606)
chr5 (29-321)||(24493580-24493873)
chr5 (29-321)||(8286659-8286953)
chr5 (29-321)||(13025322-13025615)
chr5 (29-321)||(13095506-13095799)
chr5 (29-321)||(9077963-9078257)
chr5 (29-321)||(24529231-24529525)
chr5 (29-321)||(22075030-22075322)
chr5 (48-321)||(1096478-1096752)
chr5 (32-313)||(21292790-21293071)
chr5 (165-321)||(21808343-21808499)
chr5 (29-228)||(21985963-21986164)
chr5 (165-321)||(21729018-21729174)
chr5 (118-318)||(22412198-22412388)
chr5 (166-318)||(264768-264919)
chr5 (129-318)||(18418594-18418781)
chr5 (166-318)||(39363395-39363546)
chr5 (167-318)||(10732941-10733091)
chr5 (224-321)||(21997547-21997644)
chr5 (166-318)||(20909023-20909174)
chr5 (166-318)||(29329945-29330096)
chr5 (166-318)||(42245365-42245516)
chr5 (217-317)||(20902060-20902159)
chr5 (32-195)||(22107193-22107357)
chr5 (166-318)||(29345991-29346142)
chr5 (166-318)||(36154783-36154931)
chr5 (166-318)||(11581199-11581350)
chr5 (48-313)||(22144068-22144335)
chr5 (166-318)||(29348464-29348615)
chr5 (166-318)||(29350937-29351088)
chr5 (166-318)||(39245147-39245298)
chr5 (217-318)||(2154665-2154765)
chr5 (166-318)||(18319033-18319185)
chr5 (166-318)||(32027404-32027555)
chr5 (178-318)||(17517168-17517308)
chr5 (166-318)||(10775675-10775827)
chr5 (221-318)||(31061079-31061175)
chr5 (221-318)||(38619445-38619541)
chr5 (221-318)||(23064522-23064618)
chr5 (235-318)||(20918017-20918099)
chr5 (157-283)||(18356364-18356488)
chr5 (214-313)||(20026942-20027043)
chr5 (150-320)||(21565554-21565723)
chr5 (148-305)||(21873277-21873431)
chr5 (154-313)||(37723922-37724080)
chr5 (221-318)||(24067118-24067214)
chr5 (157-283)||(20910745-20910869)
chr5 (256-320)||(22959576-22959641)
chr5 (256-318)||(21329541-21329604)
chr5 (256-321)||(19660879-19660945)
chr5 (209-318)||(21502154-21502263)
chr5 (213-317)||(26012037-26012141)
chr5 (206-266)||(20766115-20766174)
chr5 (234-313)||(36314596-36314675)
chr5 (243-314)||(26704089-26704160)
chr5 (243-314)||(26973822-26973893)
chr5 (129-314)||(40725871-40726057)
chr5 (263-316)||(26732884-26732937)
chr5 (263-313)||(26740697-26740747)
chr5 (256-320)||(19668910-19668975)
chr5 (152-313)||(22178161-22178323)
chr5 (275-318)||(20806850-20806893)
chr5 (264-313)||(23469822-23469871)
chr5 (213-283)||(29448052-29448123)
chr5 (48-97)||(36154664-36154713)
chr5 (48-97)||(11581081-11581130)
chr5 (264-305)||(20805575-20805616)
chr5 (264-313)||(21328268-21328317)
chr5 (264-309)||(21731514-21731559)
chr5 (264-309)||(21809634-21809679)
chr5 (129-168)||(20766047-20766087)
chr5 (265-305)||(20766997-20767037)
chr5 (269-305)||(26680605-26680641)
chr5 (269-305)||(26952212-26952248)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (29-317)||(26686902-26687191)
chr3 (29-321)||(43840943-43841236)
chr3 (29-321)||(23083178-23083471)
chr3 (29-321)||(13442285-13442578)
chr3 (29-321)||(17487867-17488160)
chr3 (29-319)||(14576649-14576940)
chr3 (29-321)||(17499349-17499642)
chr3 (29-319)||(14572602-14572893)
chr3 (29-321)||(18438545-18438839)
chr3 (29-321)||(25476201-25476495)
chr3 (29-321)||(20698253-20698545)
chr3 (29-321)||(14972865-14973159)
chr3 (29-318)||(40213537-40213827)
chr3 (29-321)||(11424579-11424869)
chr3 (48-314)||(42386428-42386696)
chr3 (118-318)||(24153115-24153315)
chr3 (34-321)||(12399220-12399507)
chr3 (28-317)||(30029855-30030144)
chr3 (150-318)||(29172567-29172734)
chr3 (166-323)||(38961891-38962047)
chr3 (166-318)||(9707607-9707758)
chr3 (166-318)||(17463189-17463340)
chr3 (166-318)||(34159337-34159488)
chr3 (166-318)||(45606907-45607058)
chr3 (166-318)||(55476502-55476653)
chr3 (166-318)||(7781347-7781498)
chr3 (166-318)||(8899105-8899256)
chr3 (166-318)||(12567571-12567722)
chr3 (166-318)||(13544036-13544187)
chr3 (166-318)||(16454281-16454432)
chr3 (166-318)||(17672637-17672788)
chr3 (166-318)||(28848611-28848762)
chr3 (29-194)||(16796685-16796851)
chr3 (166-318)||(13151790-13151942)
chr3 (166-318)||(13154255-13154407)
chr3 (166-323)||(50242828-50242984)
chr3 (166-318)||(6469134-6469285)
chr3 (166-318)||(10247723-10247874)
chr3 (166-318)||(16282811-16282962)
chr3 (166-313)||(53070653-53070799)
chr3 (215-318)||(55500953-55501055)
chr3 (166-318)||(17446655-17446805)
chr3 (206-318)||(36166609-36166719)
chr3 (166-318)||(41123901-41124049)
chr3 (166-313)||(43550478-43550625)
chr3 (206-318)||(21618460-21618570)
chr3 (178-318)||(46822279-46822419)
chr3 (221-318)||(12119780-12119876)
chr3 (221-318)||(15412440-15412536)
chr3 (217-318)||(15977526-15977626)
chr3 (48-313)||(52523563-52523831)
chr3 (221-318)||(8499529-8499625)
chr3 (154-318)||(12511071-12511236)
chr3 (129-314)||(24340640-24340826)
chr3 (48-314)||(23274705-23274973)
chr3 (213-318)||(10556996-10557101)
chr3 (232-318)||(44494820-44494905)
chr3 (150-320)||(16103792-16103960)
chr3 (117-194)||(14179570-14179648)
chr3 (213-317)||(15470939-15471043)
chr3 (150-318)||(27165261-27165429)
chr3 (213-320)||(32307689-32307795)
chr3 (150-320)||(16097340-16097509)
chr3 (232-318)||(17737247-17737335)
chr3 (256-320)||(12174303-12174368)
chr3 (217-321)||(13210333-13210437)
chr3 (129-314)||(37642182-37642368)
chr3 (209-318)||(14234501-14234610)
chr3 (256-320)||(49668120-49668185)
chr3 (222-318)||(53301562-53301658)
chr3 (256-320)||(9512932-9512997)
chr3 (256-320)||(9520907-9520972)
chr3 (48-250)||(2051035-2051238)
chr3 (213-313)||(37251168-37251270)
chr3 (213-313)||(43925977-43926079)
chr3 (268-318)||(28194704-28194755)
chr3 (276-318)||(45577947-45577989)
chr3 (256-320)||(1644718-1644782)
chr3 (213-313)||(22110352-22110454)
chr3 (209-313)||(12377940-12378046)
chr3 (262-311)||(13919350-13919399)
chr3 (183-305)||(11298500-11298621)
chr3 (153-314)||(22147467-22147628)
chr3 (264-305)||(23077530-23077571)
chr3 (48-97)||(53070534-53070583)
chr3 (161-306)||(856162-856304)
chr3 (243-318)||(15878083-15878158)
chr3 (264-313)||(606378-606428)
chr3 (265-311)||(9577646-9577691)
chr3 (57-99)||(12339985-12340027)
chr3 (264-305)||(14878569-14878610)
chr3 (264-313)||(15246037-15246086)
chr3 (157-305)||(19725857-19726004)
chr3 (269-305)||(3389994-3390030)
chr3 (269-305)||(14665424-14665460)
chr3 (243-323)||(17525190-17525270)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (33-321)||(51924-52212)
scaffold0011 (29-321)||(167796-168088)
scaffold0011 (264-313)||(38204-38253)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (29-318)||(22897-23187)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (29-321)||(8349-8639)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (31-321)||(13222-13513)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (29-321)||(38772-39065)
scaffold0145 (116-321)||(32953-33158)
scaffold0145 (217-318)||(9760-9860)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (29-321)||(12698842-12699136)
chr7 (29-321)||(9509200-9509493)
chr7 (29-321)||(38227492-38227785)
chr7 (29-321)||(3564180-3564474)
chr7 (29-321)||(26212007-26212299)
chr7 (118-318)||(18456319-18456519)
chr7 (29-316)||(10589055-10589342)
chr7 (29-321)||(16386064-16386358)
chr7 (29-317)||(15143853-15144143)
chr7 (29-313)||(40443410-40443693)
chr7 (29-313)||(27847650-27847932)
chr7 (166-313)||(13647344-13647491)
chr7 (48-317)||(2279954-2280225)
chr7 (150-318)||(16213695-16213861)
chr7 (213-318)||(48273403-48273508)
chr7 (166-318)||(456332-456483)
chr7 (166-318)||(11393287-11393438)
chr7 (166-318)||(11972507-11972658)
chr7 (166-318)||(14949122-14949273)
chr7 (166-318)||(15376713-15376864)
chr7 (166-318)||(16232531-16232682)
chr7 (166-318)||(18640283-18640434)
chr7 (166-318)||(20385123-20385274)
chr7 (166-318)||(21189595-21189746)
chr7 (166-318)||(32125502-32125653)
chr7 (166-318)||(41522928-41523079)
chr7 (166-318)||(41525390-41525541)
chr7 (183-318)||(24275182-24275316)
chr7 (166-318)||(18430723-18430874)
chr7 (166-318)||(24702249-24702400)
chr7 (166-318)||(27216871-27217022)
chr7 (168-318)||(16410070-16410219)
chr7 (166-318)||(44116520-44116671)
chr7 (166-318)||(3386344-3386495)
chr7 (48-318)||(17061796-17062066)
chr7 (163-318)||(14932685-14932841)
chr7 (163-318)||(15356120-15356276)
chr7 (163-318)||(15360234-15360390)
chr7 (166-318)||(24704699-24704847)
chr7 (221-318)||(13869357-13869453)
chr7 (166-318)||(38898376-38898528)
chr7 (149-318)||(20110567-20110724)
chr7 (217-318)||(13831384-13831484)
chr7 (166-313)||(12756671-12756817)
chr7 (213-318)||(67759-67864)
chr7 (213-318)||(22072927-22073033)
chr7 (206-320)||(18005658-18005772)
chr7 (209-317)||(16219715-16219823)
chr7 (217-321)||(34200797-34200901)
chr7 (209-320)||(811129-811240)
chr7 (129-317)||(1867913-1868101)
chr7 (166-266)||(26355983-26356083)
chr7 (166-266)||(26358435-26358535)
chr7 (234-321)||(28505321-28505408)
chr7 (156-305)||(15211484-15211633)
chr7 (219-320)||(44014190-44014291)
chr7 (243-314)||(18154873-18154944)
chr7 (129-314)||(19486661-19486847)
chr7 (213-317)||(16056343-16056446)
chr7 (209-318)||(47831821-47831930)
chr7 (217-313)||(16495421-16495517)
chr7 (205-283)||(2530132-2530208)
chr7 (48-310)||(12255627-12255892)
chr7 (112-309)||(15008398-15008597)
chr7 (235-321)||(11996051-11996137)
chr7 (255-317)||(12901338-12901401)
chr7 (205-314)||(10063812-10063921)
chr7 (217-321)||(15754893-15754997)
chr7 (262-317)||(14044761-14044817)
chr7 (262-317)||(14354791-14354847)
chr7 (48-97)||(12756552-12756601)
chr7 (129-172)||(48273538-48273582)
chr7 (155-305)||(12321685-12321835)
chr7 (262-313)||(18203831-18203882)
chr7 (154-306)||(17138006-17138155)
chr7 (219-313)||(20220194-20220290)
chr7 (269-305)||(9446216-9446252)
chr7 (269-305)||(20569654-20569690)
chr7 (255-306)||(48991206-48991258)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (29-321)||(3481-3774)
scaffold0292 (29-314)||(361-647)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (29-321)||(1862-2155)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (29-323)||(20360777-20361072)
chr6 (29-318)||(17287613-17287903)
chr6 (29-321)||(29060551-29060845)
chr6 (29-321)||(22780044-22780337)
chr6 (29-321)||(20638100-20638393)
chr6 (29-321)||(18409643-18409937)
chr6 (29-321)||(25629171-25629465)
chr6 (29-321)||(20593784-20594078)
chr6 (29-321)||(19303357-19303650)
chr6 (165-321)||(16496255-16496411)
chr6 (165-321)||(20076711-20076863)
chr6 (166-318)||(12742328-12742479)
chr6 (166-318)||(18334592-18334743)
chr6 (166-318)||(19005057-19005208)
chr6 (166-318)||(19858919-19859070)
chr6 (166-318)||(22782238-22782389)
chr6 (166-318)||(24422558-24422709)
chr6 (166-318)||(30676710-30676861)
chr6 (166-318)||(33861805-33861956)
chr6 (166-318)||(33864289-33864440)
chr6 (48-317)||(25644335-25644607)
chr6 (166-318)||(2291180-2291331)
chr6 (166-318)||(8055040-8055191)
chr6 (166-318)||(25754820-25754971)
chr6 (166-318)||(26924640-26924791)
chr6 (166-318)||(34963384-34963535)
chr6 (48-313)||(18456735-18457000)
chr6 (29-309)||(16920450-16920728)
chr6 (166-318)||(25656640-25656791)
chr6 (186-318)||(25688513-25688644)
chr6 (166-318)||(1540911-1541062)
chr6 (166-318)||(1595560-1595711)
chr6 (183-313)||(18461895-18462024)
chr6 (166-318)||(16448526-16448678)
chr6 (29-311)||(22831524-22831806)
chr6 (166-318)||(3852017-3852168)
chr6 (91-305)||(15041430-15041644)
chr6 (217-318)||(20556943-20557043)
chr6 (148-313)||(18821782-18821946)
chr6 (157-313)||(35245605-35245758)
chr6 (28-305)||(25603201-25603478)
chr6 (150-317)||(20109153-20109322)
chr6 (178-318)||(23992441-23992578)
chr6 (28-305)||(25611539-25611816)
chr6 (205-318)||(19847989-19848102)
chr6 (68-321)||(8227366-8227621)
chr6 (157-283)||(27415887-27416011)
chr6 (29-96)||(18821636-18821703)
chr6 (256-318)||(27333262-27333325)
chr6 (256-318)||(27394002-27394065)
chr6 (213-313)||(23019425-23019525)
chr6 (213-320)||(19652207-19652313)
chr6 (255-317)||(9098557-9098620)
chr6 (214-317)||(19668386-19668491)
chr6 (271-318)||(25714431-25714478)
chr6 (217-315)||(28496477-28496575)
chr6 (217-315)||(29808888-29808986)
chr6 (82-150)||(5834367-5834436)
chr6 (82-150)||(20177096-20177165)
chr6 (82-150)||(22158826-22158895)
chr6 (29-313)||(11185524-11185806)
chr6 (255-311)||(33443068-33443124)
chr6 (261-320)||(4185870-4185930)
chr6 (159-305)||(18907134-18907280)
chr6 (183-305)||(21766718-21766839)
chr6 (217-321)||(1561314-1561418)
chr6 (243-318)||(19873130-19873205)
chr6 (243-318)||(22432259-22432334)
chr6 (243-318)||(22438809-22438884)
chr6 (150-313)||(23076749-23076913)
chr6 (261-320)||(4186379-4186439)
chr6 (262-313)||(35008167-35008219)
chr6 (243-318)||(19862988-19863063)
chr6 (264-309)||(16493169-16493214)
chr6 (264-313)||(18453201-18453250)
chr6 (285-318)||(22080799-22080832)
chr6 (280-320)||(4738626-4738666)
chr6 (269-305)||(19790837-19790873)
chr6 (148-223)||(25642120-25642196)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (29-321)||(50210029-50210323)
chr1 (29-321)||(22532280-22532574)
chr1 (29-321)||(34509791-34510085)
chr1 (29-321)||(27250546-27250839)
chr1 (29-316)||(21026696-21026984)
chr1 (29-318)||(20135201-20135492)
chr1 (29-255)||(22354389-22354616)
chr1 (119-318)||(22468604-22468803)
chr1 (40-220)||(22356002-22356184)
chr1 (40-220)||(22357688-22357870)
chr1 (166-313)||(45574842-45574989)
chr1 (29-306)||(38801208-38801483)
chr1 (150-318)||(23593719-23593886)
chr1 (166-318)||(13988877-13989028)
chr1 (166-318)||(21923291-21923442)
chr1 (166-318)||(21475087-21475238)
chr1 (166-318)||(21840778-21840929)
chr1 (166-318)||(31612324-31612475)
chr1 (48-318)||(433023-433292)
chr1 (166-318)||(29298148-29298298)
chr1 (166-318)||(29776699-29776850)
chr1 (150-318)||(16361928-16362095)
chr1 (166-318)||(16275363-16275515)
chr1 (48-318)||(21346972-21347243)
chr1 (232-321)||(20847175-20847264)
chr1 (48-318)||(21342107-21342378)
chr1 (148-305)||(21787979-21788136)
chr1 (150-313)||(21896195-21896358)
chr1 (151-313)||(21861510-21861672)
chr1 (221-318)||(13212917-13213013)
chr1 (221-318)||(15860064-15860160)
chr1 (217-318)||(21707178-21707278)
chr1 (217-318)||(21711720-21711820)
chr1 (166-314)||(22123067-22123215)
chr1 (48-317)||(16758664-16758936)
chr1 (48-313)||(35260916-35261180)
chr1 (117-194)||(48603652-48603730)
chr1 (221-318)||(40389165-40389261)
chr1 (213-320)||(21754057-21754163)
chr1 (150-317)||(33681022-33681188)
chr1 (157-283)||(33797570-33797694)
chr1 (206-320)||(22921864-22921978)
chr1 (264-318)||(20454606-20454660)
chr1 (29-152)||(20847036-20847161)
chr1 (217-316)||(20918620-20918719)
chr1 (206-317)||(22237642-22237753)
chr1 (243-318)||(21714556-21714631)
chr1 (217-312)||(14295557-14295652)
chr1 (217-320)||(20248291-20248394)
chr1 (213-313)||(50614117-50614219)
chr1 (213-313)||(50621945-50622047)
chr1 (213-313)||(41050036-41050138)
chr1 (256-317)||(52928014-52928076)
chr1 (213-313)||(16368287-16368388)
chr1 (262-313)||(21533923-21533974)
chr1 (183-305)||(18182093-18182214)
chr1 (264-316)||(20958124-20958176)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (29-321)||(44052840-44053133)
chr4 (29-321)||(16239786-16240079)
chr4 (29-321)||(22636446-22636738)
chr4 (29-321)||(12902768-12903061)
chr4 (29-321)||(7893714-7894005)
chr4 (29-321)||(16377338-16377631)
chr4 (29-321)||(14038659-14038953)
chr4 (29-321)||(7088888-7089181)
chr4 (116-321)||(16270140-16270345)
chr4 (29-321)||(23374176-23374469)
chr4 (148-321)||(7798785-7798958)
chr4 (160-321)||(6899902-6900062)
chr4 (29-313)||(14053119-14053403)
chr4 (207-321)||(52873363-52873477)
chr4 (48-318)||(44928759-44929031)
chr4 (166-318)||(18215274-18215425)
chr4 (29-194)||(17047889-17048055)
chr4 (129-318)||(54798681-54798861)
chr4 (29-217)||(3096759-3096947)
chr4 (166-318)||(12307-12458)
chr4 (150-318)||(1837494-1837660)
chr4 (166-318)||(15118352-15118503)
chr4 (166-318)||(19618172-19618323)
chr4 (166-318)||(52312521-52312672)
chr4 (129-318)||(14280327-14280506)
chr4 (32-313)||(6190481-6190763)
chr4 (166-318)||(3515018-3515169)
chr4 (166-318)||(19242710-19242861)
chr4 (166-318)||(23803265-23803416)
chr4 (166-318)||(44615299-44615450)
chr4 (166-318)||(44773087-44773238)
chr4 (166-318)||(50222339-50222490)
chr4 (166-318)||(18239419-18239570)
chr4 (166-318)||(51463868-51464019)
chr4 (166-323)||(14970707-14970863)
chr4 (166-318)||(15355324-15355476)
chr4 (48-318)||(44102225-44102495)
chr4 (48-317)||(52243029-52243302)
chr4 (150-313)||(13790-13953)
chr4 (246-321)||(3096304-3096379)
chr4 (166-318)||(12610961-12611105)
chr4 (103-313)||(17046506-17046714)
chr4 (168-313)||(21815587-21815731)
chr4 (129-314)||(15367708-15367893)
chr4 (129-314)||(15402721-15402906)
chr4 (166-318)||(7641192-7641333)
chr4 (221-314)||(15370036-15370128)
chr4 (221-314)||(15371220-15371312)
chr4 (221-314)||(15373501-15373593)
chr4 (206-315)||(8574864-8574971)
chr4 (221-314)||(16223550-16223642)
chr4 (150-317)||(43198492-43198661)
chr4 (166-313)||(22353852-22353999)
chr4 (157-283)||(43256106-43256230)
chr4 (214-317)||(12288211-12288316)
chr4 (256-320)||(12774019-12774084)
chr4 (148-305)||(15093798-15093955)
chr4 (221-318)||(20149840-20149936)
chr4 (29-128)||(15091101-15091201)
chr4 (209-318)||(39706286-39706395)
chr4 (261-321)||(15551828-15551889)
chr4 (256-320)||(8846368-8846433)
chr4 (29-77)||(7798953-7799001)
chr4 (213-313)||(46640456-46640558)
chr4 (183-305)||(16356924-16357045)
chr4 (157-305)||(16488023-16488171)
chr4 (262-311)||(17333298-17333347)
chr4 (262-313)||(53082202-53082254)
chr4 (230-305)||(16348682-16348757)
chr4 (168-257)||(15464888-15464977)
chr4 (269-305)||(11250619-11250655)
chr4 (269-305)||(15353365-15353401)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (33-280)||(13144-13392)
scaffold0175 (257-321)||(34134-34199)
scaffold0175 (276-321)||(284-329)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (29-321)||(39924-40217)
scaffold0080 (213-313)||(19885-19987)
scaffold0080 (153-305)||(18597-18749)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (29-321)||(8490-8779)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (29-314)||(24118-24406)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (34-321)||(2974-3260)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (29-321)||(5938-6234)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (34-321)||(25907-26195)
scaffold0026 (33-321)||(39869-40157)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (29-321)||(25881-26175)
scaffold0122 (206-318)||(44702-44814)
scaffold0122 (29-195)||(33311-33479)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (29-321)||(39488-39781)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (29-321)||(75031-75324)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (29-321)||(17031-17327)
scaffold0056 (130-313)||(79248-79430)
scaffold0056 (48-97)||(79165-79214)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (64-323)||(4517-4776)
scaffold0228 (64-323)||(12099-12358)
scaffold0228 (64-323)||(22051-22310)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (32-317)||(339770-340053)
scaffold0003 (166-318)||(158450-158601)
scaffold0003 (157-283)||(71350-71474)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (29-321)||(866-1158)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (29-321)||(16416-16710)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (29-314)||(20928-21215)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (29-321)||(4860-5152)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (29-313)||(1971-2256)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (29-321)||(13508-13799)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (29-321)||(15282-15573)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (29-321)||(32775-33066)
scaffold0120 (29-321)||(45939-46230)
scaffold0120 (129-321)||(16124-16315)
scaffold0120 (271-321)||(17389-17439)
scaffold0120 (29-97)||(16323-16392)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (29-311)||(4545-4828)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (129-321)||(3104-3296)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (29-321)||(10243-10533)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (32-242)||(124675-124886)
scaffold0021 (154-313)||(174785-174943)
scaffold0021 (263-321)||(121777-121835)
scaffold0021 (214-313)||(136370-136471)
scaffold0021 (214-313)||(145078-145179)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (29-273)||(779-1021)
scaffold0395 (266-321)||(4888-4943)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (32-321)||(4723-5013)
scaffold0358 (32-267)||(1-237)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (48-321)||(32078-32349)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (29-251)||(27911-28135)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (29-273)||(6669-6914)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (29-313)||(869-1151)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (29-313)||(16301-16583)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (107-269)||(3424-3588)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (29-194)||(1052-1218)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (205-321)||(28425-28541)
scaffold0046 (217-321)||(11303-11407)
scaffold0046 (217-321)||(2008-2112)
scaffold0046 (279-321)||(4563-4605)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (29-313)||(51701-51985)
scaffold0034 (213-317)||(32551-32654)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (29-313)||(1308-1590)
scaffold0106 (29-313)||(7285-7567)
scaffold0106 (264-318)||(15291-15345)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (29-323)||(51591-51883)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (166-318)||(4705-4856)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (166-318)||(20758-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (166-318)||(37832-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (166-318)||(17440-17591)
scaffold0023 (166-318)||(94422-94573)
scaffold0023 (169-318)||(44465-44614)
scaffold0023 (203-320)||(100386-100503)
scaffold0023 (148-305)||(38416-38573)
scaffold0023 (206-320)||(40169-40283)
scaffold0023 (261-321)||(119886-119947)
scaffold0023 (256-320)||(101511-101576)
scaffold0023 (148-240)||(23603-23695)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (29-173)||(3640-3785)
scaffold0165 (29-173)||(7704-7849)
scaffold0165 (129-317)||(27666-27855)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (29-172)||(10323-10468)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (165-318)||(128765-128917)
scaffold0031 (166-313)||(20379-20524)
scaffold0031 (243-304)||(65830-65891)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (166-318)||(10784-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (166-318)||(13403-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (166-318)||(13958-14109)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (166-318)||(16795-16946)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (166-318)||(136691-136842)
scaffold0028 (166-318)||(139160-139311)
scaffold0028 (166-318)||(144098-144249)
scaffold0028 (166-318)||(134222-134373)
scaffold0028 (166-318)||(141629-141780)
scaffold0028 (206-314)||(62216-62321)
scaffold0028 (246-320)||(132670-132745)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (166-318)||(501095-501246)
scaffold0001 (129-318)||(85542-85731)
scaffold0001 (206-320)||(160696-160809)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (32-153)||(17807-17929)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (166-318)||(4308-4459)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (166-318)||(82083-82234)
scaffold0037 (150-317)||(22610-22776)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (166-318)||(11299-11450)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (31-313)||(47014-47288)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (29-313)||(4948-5230)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (166-318)||(12249-12400)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (166-318)||(9253-9404)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (166-318)||(40411-40562)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (150-317)||(8481-8650)
scaffold0621 (206-320)||(6547-6661)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (48-313)||(13147-13415)
scaffold0357 (48-317)||(15935-16206)
scaffold0357 (262-313)||(2680-2732)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (166-315)||(29946-30094)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (166-318)||(117-268)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (210-321)||(11442-11553)
scaffold0235 (29-148)||(11330-11450)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (206-318)||(116441-116551)
scaffold0022 (213-313)||(128971-129072)
scaffold0022 (213-309)||(78345-78442)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (166-318)||(4225-4377)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (166-318)||(12075-12220)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (29-140)||(20595-20707)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (166-316)||(161089-161239)
scaffold0007 (129-249)||(164553-164674)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (221-323)||(2184-2285)
scaffold0247 (129-314)||(17944-18130)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (221-318)||(1336-1432)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (167-318)||(29568-29720)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (150-313)||(53488-53651)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (206-320)||(19276-19390)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (150-318)||(38641-38809)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (150-317)||(10481-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (150-313)||(12587-12749)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (157-283)||(15362-15486)
scaffold0107 (264-313)||(36199-36248)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (206-320)||(2801-2915)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (206-320)||(5655-5769)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (206-320)||(129917-130031)
scaffold0010 (46-313)||(60548-60818)
scaffold0010 (265-313)||(666-714)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (206-320)||(14692-14806)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (148-305)||(16286-16442)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (163-305)||(29117-29262)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (150-311)||(7998-8161)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (150-314)||(11482-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (150-314)||(38195-38359)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (48-275)||(225465-225692)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (206-313)||(1051-1158)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (217-318)||(15675-15776)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (148-305)||(4741-4898)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (206-320)||(141-255)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (209-318)||(6121-6230)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (209-317)||(12954-13062)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (209-320)||(12778-12889)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (261-320)||(2694-2754)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (129-318)||(23853-24044)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (213-320)||(45794-45901)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (256-318)||(1096-1159)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (256-318)||(6625-6688)
scaffold0333 (256-318)||(14005-14068)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (214-317)||(8075-8180)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (256-320)||(28813-28879)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (256-318)||(15821-15884)
scaffold0020 (265-314)||(178912-178961)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (256-317)||(23927-23989)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (256-320)||(6824-6889)
scaffold0556 (213-257)||(8090-8134)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (217-313)||(1075-1171)
scaffold0184 (269-305)||(4284-4320)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (213-317)||(10542-10646)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (213-317)||(25121-25226)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (156-305)||(192920-193070)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (261-318)||(1083-1141)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (271-313)||(11982-12024)
scaffold0503 (48-97)||(12165-12214)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (153-241)||(1169-1257)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (213-313)||(6284-6386)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (213-309)||(38339-38437)
scaffold0139 (243-318)||(19990-20065)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (214-313)||(569-669)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (154-323)||(26833-26999)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (234-320)||(32110-32197)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (150-313)||(97024-97188)
scaffold0006 (150-313)||(106302-106466)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (265-318)||(36464-36517)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (262-311)||(206575-206624)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (214-317)||(103632-103737)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (155-305)||(46670-46820)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (243-318)||(69804-69879)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (183-305)||(920-1041)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (183-305)||(1853-1974)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (213-313)||(267679-267781)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (161-306)||(1903-2045)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (255-313)||(2694-2753)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (230-305)||(44104-44179)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (264-306)||(10575-10617)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (267-305)||(4999-5037)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (154-306)||(21749-21898)
scaffold0210 (154-306)||(29641-29790)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (206-275)||(2213-2281)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (264-313)||(7450-7499)
scaffold0111 (264-313)||(14569-14618)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (269-305)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (265-313)||(3276-3324)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (265-313)||(30350-30398)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 72)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23060830 - 23060524
Alignment:
Q  14 agagcatgcaagatgaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060830 agagcatgcaagatgaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgat 23060732  T
Q  114 gatgttaattataattgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060731 gatgttaattataattgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaa 23060632  T
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060631 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23060532  T
Q  314 ttgatgaa 321  Q
    ||||||||    
T  23060531 ttgatgaa 23060524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23076746 - 23076453
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23076746 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataat 23076647  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23076646 ctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgactt 23076547  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23076546 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaa 23076453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Original strand, 22737997 - 22738286
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  22737997 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataat 22738096  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  22738097 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 22738196  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738197 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22738286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 22731050 - 22731344
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggg-tagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  22731050 aacagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataa 22731149  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| ||| |    
T  22731150 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaat 22731249  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22731250 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaa 22731344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23286165 - 23285876
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  23286165 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataat 23286066  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | || |||||||||||||||| ||| ||    
T  23286065 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaatt 23285966  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285965 gcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 23285876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22337420 - 22337126
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22337420 aacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataa 22337321  T
Q  128 tt-gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||| ||    
T  22337320 tttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtct 22337221  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337220 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 22337126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23660327 - 23660034
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23660327 aacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataa 23660228  T
Q  128 tt-gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  23660227 tttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatt 23660128  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23660127 tgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaa 23660034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 23654203 - 23654496
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  23654203 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 23654302  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  23654303 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaatt 23654402  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23654403 gcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 23654496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Original strand, 298631 - 298922
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||||    
T  298631 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataat 298730  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  298731 atgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaat 298829  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298830 tgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 37933 - 38224
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    
T  37933 aacatagtgacttgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataat 38032  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     | ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  ||||||| || ||| |     
T  38033 ctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatc 38131  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38132 gaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 38224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20309409 - 20309127
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||  |||| ||||| ||||||    
T  20309409 aacaaagtgacttgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataat 20309310  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  20309309 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 20309211  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309210 gaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105423
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27753879 - 27753730
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27753879 aacagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataat 27753780  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 177  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753779 atgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155211
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 32451746 - 32452031
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||| ||||||| |||    
T  32451746 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaat 32451845  T
Q  129 t-gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatg-ttgttgac 225  Q
    | ||||||||||| | |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||| | |||| || ||||| |||||| |    
T  32451846 ttgtgaagctgtt-atgggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggc 32451943  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451944 ttgca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367780
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaa 24367780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808954
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18808954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130873
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23130873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133340
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23133340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Original strand, 23708454 - 23708725
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||    ||  | ||||| ||||| || || |||||||||||| |||||    
T  23708454 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgatagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataaga 23708553  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||     
T  23708554 tgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttata 23708653  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708654 tcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709683
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712164
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23712164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505390
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507868
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215072
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402673
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34402673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682324
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39682324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571408
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | || | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6726006
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6726006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135601
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135652 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23135601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898347
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24898347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900830
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903307
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905784
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24905784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908259
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24908259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039649
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgat 32039649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577110
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28577110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137310
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | || | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 43137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25616339 - 25616199
Alignment:
Q  178 ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 277  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  25616339 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 25616240  T
Q  278 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25616239 attgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 25616199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030005
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029954 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45030005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529680
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata-atttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||| ||  |||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24529628 tg-atgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 24529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405988
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatga 28405988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19672112 - 19671848
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||    ||| | || || ||||| ||||| |||||||||| | || ||    
T  19672112 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggg-tagttatgaatattatttataatattaatgataatctgtgaagctgatctatga 19672014  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||||| | ||||||||| ||||||  | |||||||||||     
T  19672013 tga-ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattata 19671917  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19671916 tcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799220
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 22799162  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||| |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799163 atgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967385
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103497
Alignment:
Q  163 tgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 261  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| | | |||  || |||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946668
Alignment:
Q  255 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 8946668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 294
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019789
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 23019742  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 294  Q
    ||| |||| ||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23019743 atgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 23019789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175862
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    | ||||||||||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatga 25175862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  165 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  265 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040299
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 23040299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 318
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643101
Alignment:
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7679707 - 7679599
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7679707 tttatgatgttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcag 7679610  T
Q  308 tctaagttgat 318  Q
    |||||||||||    
T  7679609 tctaagttgat 7679599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134315
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatga 22134315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Original strand, 20520026 - 20520295
Alignment:
Q  46 ggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taa 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| | | ||||||||| | |||   ||    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||    
T  20520026 ggttttgcgatctttgttgcacgagatgttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagttgttataa 20520125  T
Q  144 gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatta 243  Q
    ||||  ||||||| | | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||| | | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  20520126 gatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattata-tatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgtta 20520223  T
Q  244 tgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | |||||  |||||||  | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520224 tatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 321
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072059
Alignment:
Q  234 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaa 23072059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23207398 - 23207296
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23207398 agatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23207300  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  23207299 taag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 317
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23791456 - 23791292
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| | || |||||||||||   ||| |||||||| |||| |||| | |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23791456 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata-tataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcat 23791358  T
Q  250 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |  |||||||  | |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791357 gaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23004869 - 23004767
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||   | |||| | |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  23004869 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggttt 23004770  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  23004769 aag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Original strand, 25963688 - 25963809
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  25963688 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 25963786  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  25963787 tattgaactaagttgcatgagtc 25963809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 243
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatta 243  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 313
Target Start/End: Original strand, 22413181 - 22413240
Alignment:
Q  255 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413181 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 223
Target Start/End: Original strand, 22740897 - 22740973
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttg 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | | |||  ||||||||||||||    
T  22740897 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 18818226 - 18818519
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  18818226 aacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataat 18818325  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18818326 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 18818425  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818426 acaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 18818519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23406685 - 23406390
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23406685 aacagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataat 23406586  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgtt--gttgac 225  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  23406585 atgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgac 23406486  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406485 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 23406390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 21923745 - 21924038
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21923745 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataat 21923844  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923845 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 21923944  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923945 gcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 21924038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7373074 - 7372789
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  7373074 aacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataat 7372975  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7372974 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 7372883  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372882 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 7372789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 28648860 - 28649154
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28648860 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 28648959  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||    
T  28648960 tatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgact 28649059  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649060 tgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 28649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20536512 - 20536219
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  20536512 aacagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataat 20536413  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  20536412 ctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 20536313  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536312 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 20536219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22627040 - 22626747
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22627040 aacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataa 22626941  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22626940 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatt 22626841  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626840 tgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 22626747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23648858 - 23648567
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttt-tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23648858 aacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataa 23648759  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |    
T  23648758 tctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtat 23648659  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23648658 tgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23648567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 18879054 - 18879341
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18879054 aacagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataat 18879153  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  18879154 ctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 18879252  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879253 gcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 18879341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 21918817 - 21919110
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||  |||  ||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  21918817 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgat 21918916  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  21918917 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaat 21919015  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21919016 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21919110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 16092157 - 16092452
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16092157 aacagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataa 16092256  T
Q  128 t-tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | |  |||||| |||||||||||||    
T  16092257 tatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgac 16092356  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092357 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 16092452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6759561 - 6759269
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6759561 aacagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 6759462  T
Q  128 t-tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | |  ||| || |||   |||||||    
T  6759461 tctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgac 6759365  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759364 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 6759269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22875370 - 22875076
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggt-tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  22875370 aacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataa 22875271  T
Q  128 t-tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||    
T  22875270 tctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgac 22875171  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22875170 ttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaa 22875076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31971556 - 31971268
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  31971556 agagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctg 31971457  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgca 230  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||| |    
T  31971456 tgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgga 31971358  T
Q  231 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31971357 attgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 31971268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 45130815 - 45131098
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  45130815 aacagagtgacttattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataat 45130914  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  45130915 ctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatt 45131013  T
Q  228 -gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131014 tgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 16199463 - 16199746
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    
T  16199463 aacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataat 16199562  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||| | ||| ||    
T  16199563 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaatt 16199661  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199662 gaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Original strand, 25362957 - 25363123
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||    
T  25362957 aacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataat 25363056  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 194  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  25363057 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409595
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14409595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413467
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484413
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1484413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853443
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403238
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20403238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001764
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22001764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046346
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20046346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41598469 - 41598199
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    |||   || || ||||| || || |||||| ||| |||| ||    
T  41598469 ttttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaaactgatttatga 41598370  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41598369 tgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 41598271  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598270 tcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41598199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483292
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4483292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542524
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203382
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgat 15203382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678209
Alignment:
Q  178 ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 277  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 18678168  T
Q  278 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18678169 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 18678209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896276
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 262  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121746
Alignment:
Q  178 ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 277  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 32121787  T
Q  278 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  32121786 attgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgat 32121746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 313
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389552
Alignment:
Q  112 atgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatt 210  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  211 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219728
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  306 ggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgat 26219728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778878
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 228  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  229 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21778878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290846
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823785
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgat 14823785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 313
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396082
Alignment:
Q  117 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 215  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  216 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 313
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790575
Alignment:
Q  117 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 215  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  216 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223930
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || || ||||  | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgat 26223930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508188
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    | || || || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508124 gatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Original strand, 19801345 - 19801527
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||    
T  19801345 tgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactt 19801443  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801444 gcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937157
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 19937157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225398
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  306 ggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgat 26225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484419
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgat 25484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597720
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    | || ||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597656 gatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 23776871  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23776872 atgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855358
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  305 cggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgat 38855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520382
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  308 tctaagttgat 318  Q
    |||||||||||    
T  6520392 tctaagttgat 6520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285611
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  312 agttgat 318  Q
    |||||||    
T  21285617 agttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  312 agttga 317  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140927
Alignment:
Q  234 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 17140927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612213
Alignment:
Q  160 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 259  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  260 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21491006
Alignment:
Q  235 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21491006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866376
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 317
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760950
Alignment:
Q  261 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37116530 - 37116366
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| |||| | | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  37116530 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattata-tatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37116432  T
Q  250 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116431 gaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355807
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 26355807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Original strand, 17439423 - 17439609
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||||| ||| |||  || |||||||| || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| |||| | | || ||| |||||||||||| ||    
T  17439423 tgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattata-tatgatgtttgagatgttgttgattt 17439521  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439522 gcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24353140 - 24353039
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24353140 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 24353043  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  24353042 taag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466132
Alignment:
Q  155 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 253  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| ||    
T  20465982 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 20466080  T
Q  254 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    || ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466081 ttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Original strand, 19154883 - 19154989
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  | | | |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19154883 tttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 19154982  T
Q  307 gtctaag 313  Q
    || ||||    
T  19154983 gtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 17266994 - 17267096
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  | |||||  | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17266994 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 17267092  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  17267093 taag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249395
Alignment:
Q  282 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21249395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255233
Alignment:
Q  282 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21255233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 30643235 - 30643385
Alignment:
Q  155 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 253  Q
    ||||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| ||    
T  30643235 gttgattataatatgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 30643333  T
Q  254 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    || ||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30643334 ttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 30643385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Original strand, 16410226 - 16410347
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || ||||| |||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16410226 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16410324  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||||| |||||| ||||||||||    
T  16410325 tatttcactaagttgcatgagtc 16410347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 85
Target Start/End: Original strand, 13507920 - 13507957
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaa 85  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13507920 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaa 13507957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 85
Target Start/End: Original strand, 13597452 - 13597489
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaa 85  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13597452 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaa 13597489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 168
Target Start/End: Original strand, 26222999 - 26223039
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 168  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26222999 tgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25421833 - 25421543
Alignment:
Q  33 gagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25421833 gagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 25421734  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25421733 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgca 25421634  T
Q  231 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421633 attgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 25421543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25431695 - 25431414
Alignment:
Q  33 gagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25431695 gagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 25431596  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25431595 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgca 25431496  T
Q  231 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431495 attgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 23390313 - 23390606
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  23390313 aacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataat 23390412  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  23390413 ctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 23390512  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390513 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 23390606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24493873 - 24493580
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  24493873 aacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataa 24493774  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24493773 tctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 24493674  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493673 tgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 24493580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 8286659 - 8286953
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |    
T  8286659 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatatt 8286758  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||| ||    
T  8286759 atgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaatt 8286858  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286859 gcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 8286953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13025615 - 13025322
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13025615 aacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataa 13025516  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13025515 tatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 13025416  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025415 tgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 13025322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13095799 - 13095506
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13095799 aacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataa 13095700  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13095699 tatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 13095600  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095599 tgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 13095506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9078257 - 9077963
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9078257 aacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 9078158  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  9078157 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgact 9078058  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9078057 tgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaa 9077963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24529525 - 24529231
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  24529525 aacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataa 24529426  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | |  ||| |||||||||||||||||    
T  24529425 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgact 24529326  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529325 tgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 24529231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22075322 - 22075030
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  22075322 aacagagtgacttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 22075224  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22075223 atgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaat 22075125  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22075124 tgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaa 22075030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1096752 - 1096478
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagat 146  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  1096752 ttttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagat 1096653  T
Q  147 gtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgt 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |  |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1096652 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgt 1096553  T
Q  247 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
     ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096552 tatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 1096478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Original strand, 21292790 - 21293071
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||| |||  |||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  21292790 agagtgactttttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctg 21292889  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgca 230  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||| ||| ||  |    
T  21292890 tgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttga 21292988  T
Q  231 at--tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21292989 atattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808499
Alignment:
Q  165 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 263  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtata 21808441  T
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21808442 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21808499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Original strand, 21985963 - 21986164
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  21985963 aacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataa 21986062  T
Q  128 -ttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| | || ||| | |||||||||||||||    
T  21986063 tttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgagatatgaatttataatgaagatgttgttgact 21986162  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  21986163 tg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729174
Alignment:
Q  165 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 263  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtata 21729116  T
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21729117 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21729174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412198
Alignment:
Q  118 ttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagat 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | |  |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264919
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 264919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 129 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18418781 - 18418594
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||| ||    
T  18418781 tgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaagatgttg-tgaatt 18418684  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418683 gcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363395
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39363395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733091
Alignment:
Q  167 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 266  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  267 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10733091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 224 - 321
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997644
Alignment:
Q  224 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 21997644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909023
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329945
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29329945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245516
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 42245516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 317
Target Start/End: Original strand, 20902060 - 20902159
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902060 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 22107193 - 22107357
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||    
T  22107193 agagtgccttgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctg 22107292  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 195  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22107293 tgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345991
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29345991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154931
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36154931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 11581199 - 11581350
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11581199 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 11581298  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581299 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11581350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22144335 - 22144068
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||    ||  | ||||| ||||| || |  ||||||| |||| |||||    
T  22144335 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgttataaga 22144236  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  22144235 tgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttata 22144136  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144135 tcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348464
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29348464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350937
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245147
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| ||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245198 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39245147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 2154665 - 2154765
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154665 gttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2154763  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  2154764 at 2154765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319185
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027404
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 32027404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Original strand, 17517168 - 17517308
Alignment:
Q  178 ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 277  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  17517168 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 17517267  T
Q  278 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17517268 attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 17517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775827
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061079
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 31061079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619445
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064522
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 318
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918099
Alignment:
Q  235 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20918099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |   ||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  257 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 313
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565554
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| |||  ||| |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatg-tttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    | || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 21565554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21873431 - 21873277
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||   |  ||  ||||||||||| | |||    
T  21873431 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaagatgttg---aaatgagattgatattatgaagtc 21873335  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873334 atgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37724080 - 37723922
Alignment:
Q  154 tgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | | |||  || |||||||| ||| ||  | ||||||| || ||||||||||    
T  37724080 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgct 37723981  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723980 gtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24067214 - 24067118
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  24067214 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgat 24067118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959641
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 22959641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329604
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21329604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 321
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660945
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 19660945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502263
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  308 tctaagttgat 318  Q
    |||||||||||    
T  21502253 tctaagttgat 21502263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Original strand, 26012037 - 26012141
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26012037 agatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26012135  T
Q  312 agttga 317  Q
    ||||||    
T  26012136 agttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314596
Alignment:
Q  234 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704089
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26704089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973822
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26973822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40726057 - 40725871
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| ||||    
T  40726057 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttactt 40725958  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
     |    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725957 acgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 263 - 316
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 313
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668910
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatga 19668910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  152 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg- 250  Q
    ||||||| | || |||||||||||   ||| |||||||| |||| |||| | | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||     
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata-tatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  251 -ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178260 gctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 318
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806893
Alignment:
Q  275 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgat 20806893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29448123 - 29448052
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448123 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Original strand, 36154664 - 36154713
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt 97  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36154664 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 36154713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Original strand, 11581081 - 11581130
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt 97  Q
    |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11581081 ttttgcgatctttgtcgtacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 11581130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 309
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 309
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 168
Target Start/End: Original strand, 20766047 - 20766087
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 168  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20766047 tgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26687191 - 26686902
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26687191 aacagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataat 26687092  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  26687091 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgactt 26686992  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686991 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43841236 - 43840943
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43841236 aacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataat 43841137  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43841136 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 43841037  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43841036 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaa 43840943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 23083178 - 23083471
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||    
T  23083178 aacatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaat 23083277  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083278 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgactt 23083377  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083378 gcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 23083471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13442578 - 13442285
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |   |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13442578 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataat 13442479  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  13442478 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 13442379  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442378 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 13442285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17488160 - 17487867
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17488160 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataat 17488061  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  17488060 ctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 17487961  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487960 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 17487867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Original strand, 14576649 - 14576940
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  14576649 aacaaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataa 14576748  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14576749 tctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 14576848  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14576849 tgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatg 14576940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17499642 - 17499349
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17499642 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataat 17499543  T
Q  129 t-gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  17499542 ttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 17499443  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499442 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 17499349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14572893 - 14572602
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14572893 aacagagtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataa 14572794  T
Q  128 tt-gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    || |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14572793 tttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 14572694  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 319  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572693 ctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18438839 - 18438545
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18438839 aacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataa 18438740  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |  |||   |||||||||||||||    
T  18438739 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgact 18438640  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18438639 tgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa 18438545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 25476201 - 25476495
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  25476201 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaa 25476300  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  25476301 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgact 25476400  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25476401 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa 25476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 20698253 - 20698545
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20698253 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataat 20698352  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||| ||    
T  20698353 ctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaatt 20698451  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698452 gcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 20698545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14973159 - 14972865
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14973159 aacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 14973060  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |  |||| | |||||||||||| |    
T  14973059 tctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatt 14972960  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972959 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 14972865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Original strand, 40213537 - 40213827
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40213537 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 40213636  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  40213637 tctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgact 40213736  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40213737 tgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 40213827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 11424579 - 11424869
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  11424579 aacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaa 11424678  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  ||| || |||   |||||| |    
T  11424679 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatt 11424775  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11424776 tgctattgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa 11424869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 48 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42386696 - 42386428
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgttt-aaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42386696 ttttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaaga 42386597  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42386596 tgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatg 42386497  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386496 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153315
Alignment:
Q  118 ttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagat 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  24153314 at 24153315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12399507 - 12399220
Alignment:
Q  34 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtg 132  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  || | | || |||||| |||  ||| |||||| || ||||| |||||| ||||    
T  12399507 agtgacttgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtg 12399409  T
Q  133 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  12399408 aagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcat 12399310  T
Q  232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12399309 ttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 12399220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30030144 - 30029855
Alignment:
Q  28 gaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||||    
T  30030144 gaacagaatgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataa 30030045  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  30030044 tatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaat 30029946  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30029945 tgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Original strand, 29172567 - 29172734
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29172567 ttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29172666  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172667 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 323
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962047
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaa 38962047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707758
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463189
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17463189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159337
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34159337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607058
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45607058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476502
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 55476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781498
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7781498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899105
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 8899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567571
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544036
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454432
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 16454432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672637
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17672637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848762
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848711 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28848762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16796851 - 16796685
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||  |||||||||| || | ||||||||||    
T  16796851 aacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataat 16796752  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 194  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16796751 atgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151942
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154407
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13154407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242828
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaa 50242828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469285
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  | | || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6469285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247874
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 10247874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282962
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500953
Alignment:
Q  215 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  315 tgat 318  Q
    ||||    
T  55500956 tgat 55500953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446805
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgat 17446805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166609
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  306 ggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgat 36166609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123901
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41123901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550625
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  306 ggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822279
Alignment:
Q  178 ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 277  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgct 46822320  T
Q  278 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46822319 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 46822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119876
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412440
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15412440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15977626 - 15977526
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977626 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15977528  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  15977527 at 15977526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 313
Target Start/End: Original strand, 52523563 - 52523831
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgg-gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taag 144  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  || |  || | ||| ||||| || || || ||||||||| ||||    
T  52523563 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgagaagctgttataag 52523661  T
Q  145 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||| ||||    
T  52523662 atga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttat 52523760  T
Q  245 gtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523761 atcatgaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499529
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12511236 - 12511071
Alignment:
Q  154 tgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 252  Q
    |||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |    
T  12511236 tgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgtt 12511137  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  12511136 gttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgat 12511071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Original strand, 24340640 - 24340826
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| ||||    
T  24340640 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttactt 24340739  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| || || || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24340740 gcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23274973 - 23274705
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgt-ttaaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||    ||||| || || ||||| || || ||||||||||  ||| ||    
T  23274973 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgagccttgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgaattatga 23274874  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| | | ||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||     
T  23274873 tgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattata 23274774  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274773 tcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10557101 - 10556996
Alignment:
Q  213 agatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557101 agatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10557003  T
Q  312 agttgat 318  Q
    |||||||    
T  10557002 agttgat 10556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 232 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494820
Alignment:
Q  232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 44494820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103792
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| | |||||  |||| |||  ||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatg-tttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16103792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  117 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470939
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  312 agttga 317  Q
    ||||||    
T  15470944 agttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165261
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| ||||| || ||||  | ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27165261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32307795 - 32307689
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307795 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32307698  T
Q  312 agttgatga 320  Q
    |||||||||    
T  32307697 agttgatga 32307689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097340
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| |||  ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatg-tttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    | || ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16097340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737247
Alignment:
Q  232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174368
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 12174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210437
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  316 gatgaa 321  Q
    | ||||    
T  13210432 gttgaa 13210437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Original strand, 37642182 - 37642368
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| ||||    
T  37642182 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttactt 37642281  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
     |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642282 acgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234501
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  308 tctaagttgat 318  Q
    |||||||||||    
T  14234511 tctaagttgat 14234501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668185
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 49668185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 53301562 - 53301658
Alignment:
Q  222 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301562 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 53301658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512932
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9512932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520907
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9520907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 250
Target Start/End: Original strand, 2051035 - 2051238
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataatt-gtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||    ||  | ||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||    
T  2051035 ttttgcgatctttgtcgcatgagttgttgagagttgaacattgaggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatttgtgaagctgctataaga 2051134  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||     
T  2051135 tga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 2051233  T
Q  246 tcatg 250  Q
    |||||    
T  2051234 tcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43926079 - 43925977
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43926079 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 43925981  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  43925980 taag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194704
Alignment:
Q  268 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28194704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 318
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577989
Alignment:
Q  276 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45577989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644782
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatga 1644782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 22110352 - 22110454
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22110352 agatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 22110450  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  22110451 taag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12378046 - 12377940
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||    
T  12378046 tttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcg 12377947  T
Q  307 gtctaag 313  Q
    |||||||    
T  12377946 gtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Original strand, 11298500 - 11298621
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  11298500 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 11298598  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  11298599 tatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147628
Alignment:
Q  153 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 252  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| |    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    | ||||| |||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22147567 g-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077571
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23077571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Original strand, 53070534 - 53070583
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt 97  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53070534 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 53070583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856162
Alignment:
Q  161 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttg 259  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||||||||||  |||||  |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  856304 tatgatgtattataatgtt-tatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 856209  T
Q  260 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  856208 taatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcg 856162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878158
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 15878158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12340027 - 12339985
Alignment:
Q  57 ctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtat 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12340027 ctttgtcgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtat 12339985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878610
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 305
Target Start/End: Original strand, 19725857 - 19726004
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19725857 tgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatga-gtcatgctgtt 19725954  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
      |||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19725955 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19726004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665424
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14665424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 323
Target Start/End: Original strand, 17525190 - 17525270
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  17525190 atgtcatactgttgttgcactctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaa 17525270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 52212 - 51924
Alignment:
Q  33 gagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52212 gagtgtcttgttaggttttgcgacctt-gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgt 52114  T
Q  132 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52113 gaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaa 52014  T
Q  232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52013 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 51924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 167796 - 168088
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  167796 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 167895  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  167896 ctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 167994  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  167995 gcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 168088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23187 - 22897
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23187 aacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataa 23088  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23087 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 22988  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22987 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 8349 - 8639
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggg-tagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8349 aacagagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataa 8448  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8449 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgact 8548  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8549 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 8639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13513 - 13222
Alignment:
Q  31 cagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataatt- 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  13513 cagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataattt 13414  T
Q  130 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  13413 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 13314  T
Q  230 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13313 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa 13222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39065 - 38772
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39065 aacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataa 38966  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  38965 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatt 38866  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38865 tgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaa 38772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32953
Alignment:
Q  116 tgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaag 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  215 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  315 tgatgaa 321  Q
    |||||||    
T  32959 tgatgaa 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9860 - 9760
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9860 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9762  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  9761 at 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12699136 - 12698842
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  12699136 aacaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataat 12699037  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  12699036 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 12698937  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698936 gcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 12698842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9509493 - 9509200
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9509493 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataat 9509394  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  9509393 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 9509294  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509293 gcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 9509200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38227785 - 38227492
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38227785 aacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataa 38227686  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38227685 tatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 38227586  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38227585 tgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaa 38227492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 3564180 - 3564474
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3564180 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 3564279  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
      | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  3564280 cctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgact 3564379  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564380 tacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 3564474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26212299 - 26212007
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  26212299 aacagagtgatttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 26212201  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  26212200 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaat 26212102  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  26212101 tgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaa 26212007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456519
Alignment:
Q  118 ttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagat 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  18456518 at 18456519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10589342 - 10589055
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10589342 aacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttggacctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataat 10589243  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| || || ||| ||||||||||||| ||    
T  10589242 ctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaatt 10589144  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589143 gcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 16386064 - 16386358
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||    
T  16386064 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataat 16386163  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||| |||      
T  16386164 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttg-agaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaa 16386262  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16386263 tacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 16386358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 317
Target Start/End: Original strand, 15143853 - 15144143
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||    
T  15143853 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataa 15143952  T
Q  128 t-tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| | |  ||| || ||||||||||| |    
T  15143953 tctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggc 15144052  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||||| |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144053 ttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40443693 - 40443410
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    
T  40443693 aacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataat 40443594  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  40443593 ctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaatt 40443495  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40443494 gaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 27847650 - 27847932
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| ||||  |||| ||||||    
T  27847650 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataat 27847749  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  27847750 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 27847848  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | ||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27847849 gaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 27847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647344
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Original strand, 2279954 - 2280225
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    ||| | ||||| | ||| || || |||||||||||| |||||    
T  2279954 ttttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattatttatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataaga 2280053  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||  | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  2280054 tgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattata 2280153  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280154 tcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213695
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16213695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273403
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  313 gttgat 318  Q
    ||||||    
T  48273408 gttgat 48273403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456332
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393438
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11393438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972507
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949273
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376864
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15376864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232531
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16232531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640283
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18640283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385274
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20385274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189746
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21189746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125502
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32125502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522928
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525390
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275182
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430723
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18430723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702249
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24702249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216871
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 27216871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410070
Alignment:
Q  168 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 267  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 16410121  T
Q  268 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410120 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116520
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44116520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386344
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386395 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Original strand, 17061796 - 17062066
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||    |||   || || ||||| || || |||||||||| |||| ||    
T  17061796 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccatggggtagttatgaatattacatataatattaataatgatctgtgaagctgatttatga 17061895  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17061896 tgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatg 17061994  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||  |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061995 tcatgct-attttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17062066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 318
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932841
Alignment:
Q  163 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 14932841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 318
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356276
Alignment:
Q  163 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15356276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 318
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360390
Alignment:
Q  163 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15360390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704699
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869357
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13869357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898528
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   | |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110567
Alignment:
Q  149 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtca 248  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  249 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20110567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13831484 - 13831384
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13831484 gttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattg 13831386  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  13831385 at 13831384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||  | |||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 67864 - 67759
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67864 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 67766  T
Q  312 agttgat 318  Q
    |||||||    
T  67765 agttgat 67759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072927
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  312 agttgat 318  Q
    |||||||    
T  22072933 agttgat 22072927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18005772 - 18005658
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 18005674  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  18005673 cggtctaagttgatga 18005658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 317
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219823
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  308 tctaagttga 317  Q
    ||||||||||    
T  16219814 tctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200797
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  316 gatgaa 321  Q
    | ||||    
T  34200802 gttgaa 34200797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Original strand, 811129 - 811240
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  811129 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  308 tctaagttgatga 320  Q
    |||||||||||||    
T  811228 tctaagttgatga 811240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 317
Target Start/End: Original strand, 1867913 - 1868101
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 228  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| |||| | | || ||| |||||||||| | |||    
T  1867913 tgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattata-tatgatgtttgagatgttgttcatttg 1868011  T
Q  229 caattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    || |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868012 ca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 266
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  266 g 266  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 266
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  266 g 266  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 321
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505408
Alignment:
Q  234 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaa 28505408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  156 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||| | ||| |||| || ||||||||| || ||  || ||||||| |||||||||| ||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  256 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014190
Alignment:
Q  219 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  318 tga 320  Q
    |||    
T  44014192 tga 44014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154944
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Original strand, 19486661 - 19486847
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| ||||    
T  19486661 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttactt 19486760  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
     |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19486761 acgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T
Q  312 agttga 317  Q
    ||||||    
T  16056348 agttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47831930 - 47831821
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | | | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47831930 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  308 tctaagttgat 318  Q
    |||||||||||    
T  47831831 tctaagttgat 47831821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495421
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 283
Target Start/End: Original strand, 2530132 - 2530208
Alignment:
Q  205 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530132 aatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Original strand, 12255627 - 12255892
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattg-ggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taag 144  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || |  || || || ||||| || || | ||||| |||| ||||    
T  12255627 ttttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataat-atattaatgatgatctatgaagttgttataag 12255725  T
Q  145 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  | ||| ||| ||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  12255726 atg-attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttat 12255824  T
Q  245 gtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
     |||||  |   |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255825 atcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 309
Target Start/End: Original strand, 15008398 - 15008597
Alignment:
Q  112 atgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatat 209  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||| | | || |    
T  15008398 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattata-tatgatgt 15008496  T
Q  210 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    || || ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  15008497 ttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 15008594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 321
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996137
Alignment:
Q  235 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaa 11996137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  255 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 314
Target Start/End: Original strand, 10063812 - 10063921
Alignment:
Q  205 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgag 303  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  10063812 aatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgag 10063910  T
Q  304 tcggtctaagt 314  Q
    || ||||||||    
T  10063911 tcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15754997
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  316 gatgaa 321  Q
    | ||||    
T  15754992 gttgaa 15754997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Original strand, 12756552 - 12756601
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt 97  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12756552 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 12756601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48273582 - 48273538
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48273582 tgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 12321685 - 12321835
Alignment:
Q  155 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 253  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||  |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||||||    
T  12321685 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctg 12321783  T
Q  254 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    || ||||   |||  |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  12321784 ttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtc 12321835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138155
Alignment:
Q  154 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 252  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 17138101  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17138102 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcg 17138155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 313
Target Start/End: Original strand, 20220194 - 20220290
Alignment:
Q  219 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220194 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48991258 - 48991206
Alignment:
Q  255 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  48991258 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3774 - 3481
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3774 aacagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataat 3675  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  3674 ctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 3575  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3574 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa 3481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 647 - 361
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  647 aacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataa 548  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  547 tatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgact 448  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  447 tccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2155 - 1862
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  2155 aacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataat 2056  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  2055 ctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 1956  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1955 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 1862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 20360777 - 20361072
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20360777 aacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataat 20360876  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  20360877 atgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 20360976  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20360977 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaa 20361072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Original strand, 17287613 - 17287903
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  17287613 aacagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataac 17287712  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17287713 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 17287812  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287813 gcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17287903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29060845 - 29060551
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29060845 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataa 29060746  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  29060745 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgact 29060646  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29060645 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaa 29060551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 22780044 - 22780337
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  22780044 aacagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataat 22780143  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22780144 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 22780243  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22780244 gcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa 22780337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 20638100 - 20638393
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20638100 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataat 20638199  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| | | ||    
T  20638200 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaatt 20638299  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20638300 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaa 20638393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 18409643 - 18409937
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18409643 aacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 18409742  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| | |  ||  || ||||||||||||||    
T  18409743 tatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgact 18409842  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409843 tgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 18409937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 25629171 - 25629465
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25629171 aacagagtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataa 25629270  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  25629271 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgact 25629370  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629371 tgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 25629465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20594078 - 20593784
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20594078 aacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataa 20593979  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||  ||| || ||||||||||||||    
T  20593978 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgact 20593879  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20593878 tgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaa 20593784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 19303357 - 19303650
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||    
T  19303357 aacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataa 19303456  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  19303457 tctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgact 19303556  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19303557 tgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaa 19303650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496255
Alignment:
Q  165 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 263  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtata 16496313  T
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16496312 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 16496255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076711
Alignment:
Q  165 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 20076711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742328
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12742328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334743
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18334743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005057
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859070
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782238
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22782238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422558
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676861
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861805
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33861805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864289
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25644607 - 25644335
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt-attgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taag 144  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||   || |  || ||||| ||||| || || |||||||||| | || |    
T  25644607 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgctgagagttgaaccttggggtagttataaagattatat-atgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatg 25644509  T
Q  145 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    |||  ||||||||| || ||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttat 25644409  T
Q  245 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644408 atcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291331
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055040
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754820
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25754820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924791
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26924791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963384
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18457000 - 18456735
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||    |||   || || ||||| || || |||||||||| |||| ||    
T  18457000 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggcagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatga 18456901  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18456900 tgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 18456802  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456801 tcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 309
Target Start/End: Original strand, 16920450 - 16920728
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  | |||||| |||  |||||||  |||| ||||| ||||||    
T  16920450 aacaaagtgacttgttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataat 16920549  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     | ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| |     
T  16920550 ctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatg 16920648  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    | | |||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920649 gaatttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656640
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  | |||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656691 gc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688513
Alignment:
Q  186 attacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 285  Q
    |||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  286 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541062
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1541011 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 1541062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595560
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 1595560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448678
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22831806 - 22831524
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||  | |||||| |||  ||||| |  |||| ||||| ||||||    
T  22831806 aacagagtgacttgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataat 22831707  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaat--atttaagatgttgttgac 225  Q
     ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  ||  || |||||||||| |||     
T  22831706 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaa 22831608  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||| | ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831607 ttgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852168
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 305
Target Start/End: Original strand, 15041430 - 15041644
Alignment:
Q  91 gggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 189  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| ||||||||||    
T  15041430 gggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcatta 15041528  T
Q  190 cttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 289  Q
    |||||  | | ||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||||||    
T  15041529 cttgagattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaa 15041628  T
Q  290 ctaagctgcatgagtc 305  Q
    ||||| ||||||||||    
T  15041629 ctaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557043
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 20557041  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  20557042 at 20557043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| | |||| || ||||| |||||| |||||  |||||||| |||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatg 18821879  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245605
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  257 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Original strand, 25603201 - 25603478
Alignment:
Q  28 gaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||| |||||| | |||||||||| || ||||||  ||  |||||||||| |||||| | || ||    
T  25603201 gaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaa 25603300  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||| |||| || |||||| || || |    
T  25603301 tctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-gaat 25603399  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603400 tataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23992578 - 23992441
Alignment:
Q  178 ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 277  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  23992578 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 23992482  T
Q  278 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992481 attgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Original strand, 25611539 - 25611816
Alignment:
Q  28 gaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||| |||||  | |||||||||| || ||||||  || ||||||||||| |||||| |  | ||    
T  25611539 gaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttacttagagttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaa 25611638  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | | |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||| |||| || |||||| || || |    
T  25611639 tctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-gaat 25611737  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25611738 tataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 318
Target Start/End: Original strand, 19847989 - 19848102
Alignment:
Q  205 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19847989 aatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19848088  T
Q  305 cggtctaagttgat 318  Q
    | ||||||||||||    
T  19848089 cagtctaagttgat 19848102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 321
Target Start/End: Original strand, 8227366 - 8227621
Alignment:
Q  68 gagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatga 165  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||    ||||| || || ||||| || || |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |    
T  8227366 gagttgttgagagttgaaccttagggtagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 8227465  T
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  8227466 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 8227564  T
Q  266 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8227565 gcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaa 8227621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| || |||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Original strand, 18821636 - 18821703
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtag 96  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18821636 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtag 18821703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333325
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27333325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394065
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27394065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019425
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  312 ag 313  Q
    ||    
T  23019426 ag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19652313 - 19652207
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19652313 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 19652216  T
Q  312 agttgatga 320  Q
    |||||||||    
T  19652215 agttgatga 19652207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  255 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  311 aagttga 317  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714431
Alignment:
Q  271 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25714431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Original strand, 5834367 - 5834436
Alignment:
Q  82 tgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5834367 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 5834436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20177165 - 20177096
Alignment:
Q  82 tgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20177165 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 20177096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Original strand, 22158826 - 22158895
Alignment:
Q  82 tgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22158826 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 22158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11185806 - 11185524
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||  | | ||  | |||||| |||  ||||||||  ||| |||||   ||||    
T  11185806 aacatagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaat 11185707  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||  ||  |||   |||||| || ||| ||    
T  11185706 ctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaatt 11185608  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | ||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185607 gaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  255 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 320
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185930
Alignment:
Q  261 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18907280 - 18907134
Alignment:
Q  159 attatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 257  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || |||||||| |    
T  18907280 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgt 18907182  T
Q  258 tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||   |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907181 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766718
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561314
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  316 gatgaa 321  Q
    | ||||    
T  1561319 gttgaa 1561314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873130
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 19873130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432259
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 22432259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438809
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 22438809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23076913 - 23076749
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| |||| | | || |||||| ||||||||| |  || ||||||||||||| ||      
T  23076913 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattata-tatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctg 23076815  T
Q  250 gctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | | |||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076814 gatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4186439 - 4186379
Alignment:
Q  261 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4186439 atactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862988
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 19862988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 318
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080832
Alignment:
Q  285 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22080832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 320
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738666
Alignment:
Q  280 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 223
Target Start/End: Original strand, 25642120 - 25642196
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttg 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | | |||  ||||||||||||||    
T  25642120 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 50210029 - 50210323
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50210029 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 50210128  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  50210129 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgact 50210228  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210229 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 50210323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22532574 - 22532280
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattat-a 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  22532574 aacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatga 22532475  T
Q  127 attgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  22532474 actgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaat 22532375  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22532374 tgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaa 22532280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34510085 - 34509791
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34510085 aacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 34509986  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | |  ||| |||||||||||||||||    
T  34509985 tctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgact 34509886  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509885 tgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 34509791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 27250546 - 27250839
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  27250546 aacagagtcccttgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataat 27250645  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  27250646 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 27250745  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27250746 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 27250839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21026984 - 21026696
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  21026984 aacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 21026885  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  21026884 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaat 21026786  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026785 tgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20135492 - 20135201
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttt-tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  20135492 aacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataa 20135393  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |    
T  20135392 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaat 20135293  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20135292 tgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20135201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 22354389 - 22354616
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  22354389 aacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataat 22354488  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  22354489 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 22354588  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354589 gcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468803
Alignment:
Q  119 taattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  218 ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 22356002 - 22356184
Alignment:
Q  40 ttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22356002 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22356101  T
Q  139 tttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||    
T  22356102 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttg 22356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 22357688 - 22357870
Alignment:
Q  40 ttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22357688 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22357787  T
Q  139 tttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||    
T  22357788 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttg 22357870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45574989
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Original strand, 38801208 - 38801483
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa- 127  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||  | |||||| |||  |||||||| ||||  |||| |||||     
T  38801208 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataat 38801307  T
Q  128 ttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||| ||| ||    
T  38801308 ttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaatt 38801406  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    | | ||||||| |||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801407 gaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593886
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988877
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923442
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21923442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475238
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 21475238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840778
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612324
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 31612324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 433292 - 433023
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||    |||   || || ||||| || || ||| |||||| |||| ||    
T  433292 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaatattataaataatattaatgatgatctgtaaagctgatttatga 433193  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  433192 tgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 433093  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433092 tcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 433023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298148
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29298148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776699
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361928
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | ||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361995 gttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275515
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21347243 - 21346972
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattata-attgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    ||||| || || |||||  |  |||||||||||| |||| ||    
T  21347243 ttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtggttatgaatattaattataatattaatgctgtattgtgaagctgatttatga 21347144  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    ||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21347143 tgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 21347045  T
Q  245 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347044 gtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21346972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 321
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847264
Alignment:
Q  232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 20847264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21342378 - 21342107
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattata-attgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    ||||| || || |||||  |  |||||||||||| |||| ||    
T  21342378 ttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtggttatgaatattaattataatattaatgctgtattgtgaagctgatttatga 21342279  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    ||  ||||||||| ||||  |||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||   | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21342278 tgatttgatgttg-ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 21342180  T
Q  245 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342179 gtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||| ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 313
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  151 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg 250  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  251 ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 13212917 - 13213013
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212917 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860160
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 15860160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21707278 - 21707178
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707278 gttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21707180  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  21707179 at 21707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21711820 - 21711720
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711820 gttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21711722  T
Q  317 at 318  Q
    ||    
T  21711721 at 21711720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123215
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| || |  | |||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  266 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16758936 - 16758664
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    ||  | ||||| ||||| || || |||||||||||| ||| |    
T  16758936 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataata 16758837  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||| ||   ||||||||||  ||| | |||||||| ||||     
T  16758836 tgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-gatgttgttgtattgtatttgatattgttata 16758738  T
Q  246 tcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758737 tcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 313
Target Start/End: Original strand, 35260916 - 35261180
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgg-gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taag 144  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||| || |  || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||| ||||    
T  35260916 ttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtat-atgatattaacgataatatgtgaagttgttataag 35261014  T
Q  145 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    |||  ||||||||| | || ||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||   | ||| ||| |||||||| |   ||||| |||||||| ||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttat 35261111  T
Q  245 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261112 atcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  117 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40389261 - 40389165
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  40389261 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgat 40389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21754163 - 21754057
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754163 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21754066  T
Q  312 agttgatga 320  Q
    |||||||||    
T  21754065 agttgatga 21754057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| |||  ||| |||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatg-tttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921978
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||| ||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatga 22921978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 264 - 318
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454660
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Original strand, 20847036 - 20847161
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||  |||||||||| || |||||  |||||    
T  20847036 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataat 20847135  T
Q  129 -tgtgaagctgttt-aagatgtgttg 152  Q
     | ||||||||||| |||||||||||    
T  20847136 ctatgaagctgtttaaagatgtgttg 20847161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237642
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  305 cggtctaagttga 317  Q
    |||||||||||||    
T  22237654 cggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714556
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21714556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 312
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295652
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 312  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248291
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  316 gatga 320  Q
    |||||    
T  20248295 gatga 20248291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 50614117 - 50614219
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50614117 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50614215  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  50614216 taag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 50621945 - 50622047
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50621945 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50622043  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  50622044 taag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 41050036 - 41050138
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  41050036 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtct 41050135  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  41050136 aag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 317
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 16368287 - 16368388
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16368287 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 16368385  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  16368386 aag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Original strand, 18182093 - 18182214
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  |  |||||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  18182093 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaata-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 18182191  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  18182192 tatttaactaagttgcatgagtc 18182214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20958176 - 20958124
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20958176 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttg 20958124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44053133 - 44052840
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44053133 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataat 44053034  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  44053033 ctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 44052934  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44052933 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaa 44052840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 16239786 - 16240079
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16239786 aacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataa 16239885  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16239886 tctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgact 16239985  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16239986 tgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaa 16240079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22636738 - 22636446
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  22636738 aacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataat 22636639  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  22636638 ctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 22636540  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636539 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 22636446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12903061 - 12902768
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  12903061 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataat 12902962  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  12902961 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 12902862  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12902861 acaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 12902768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7894005 - 7893714
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  7894005 aacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataa 7893906  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7893905 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgact 7893809  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7893808 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaa 7893714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 16377338 - 16377631
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgt-tgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattata 126  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16377338 aacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattata 16377437  T
Q  127 at-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  ||| || |||||||||||||    
T  16377438 atctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgac 16377537  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377538 ttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 16377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14038953 - 14038659
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14038953 aacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataa 14038854  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  14038853 tctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgact 14038754  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038753 tgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa 14038659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7089181 - 7088888
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  7089181 aacagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 7089082  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||| ||| ||    
T  7089081 ctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaatt 7088982  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088981 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 7088888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 321
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270345
Alignment:
Q  116 tgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaag 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  215 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  315 tgatgaa 321  Q
    |||||||    
T  16270339 tgatgaa 16270345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 23374176 - 23374469
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||||    
T  23374176 aacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataat 23374275  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  23374276 ctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga-gaattatttgaatatttaagatgttgttgaat 23374374  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23374375 tgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaa 23374469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798785
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 7798785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899902
Alignment:
Q  160 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttg 6899964  T
Q  260 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaa 6899902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 14053119 - 14053403
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    
T  14053119 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataat 14053218  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaag-atgttgttgact 226  Q
     |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||   |||| |||||| ||| |    
T  14053219 ctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaat 14053317  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14053318 tgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873477
Alignment:
Q  207 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  307 gtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaa 52873477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Original strand, 44928759 - 44929031
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||    |||   || || ||||| || || |||||||||| |||| ||    
T  44928759 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatga 44928858  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  || |||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  44928859 tgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatg 44928958  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928959 tcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44929031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215425
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18215425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Original strand, 17047889 - 17048055
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa- 127  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||   |||||| ||     
T  17047889 aacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaac 17047988  T
Q  128 ttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 194  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 318
Target Start/End: Original strand, 54798681 - 54798861
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||    
T  54798681 tgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 54798770  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798771 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 54798861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3096947 - 3096759
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  3096947 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataat 3096848  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatg 217  Q
     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  3096847 atgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12458
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837660
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118503
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618323
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312521
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14280506 - 14280327
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||    
T  14280506 tgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatctatatttgagatgttgttgactt 14280417  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280416 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14280327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6190763 - 6190481
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataatt-g 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||  ||||| |  ||||| ||||||| |||| |    
T  6190763 agagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaatatgatattaattacaattcg 6190664  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat-tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatg-ttgttgacttg 228  Q
    |||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||| | |||| || ||||| |||||  |||     
T  6190663 tgaagctg-ttatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgctta 6190566  T
Q  229 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190565 c-attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515018
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242710
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19242710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803416
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23803416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615299
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44615299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773238
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222490
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50222490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239570
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239519 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18239570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464019
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 323
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970863
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaa 14970863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355476
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44102495 - 44102225
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctg-tttaaga 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||    |||   || || ||||| || || |||||||||| |||| ||    
T  44102495 ttttgcgatctttgtagcacgagtcgttgagagttgaaccttgggatagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatga 44102396  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  |||||| || ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44102395 tgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatg 44102297  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102296 tcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44102225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Original strand, 52243029 - 52243302
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgg-gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taag 144  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  || |  || | ||| ||||| || || |||||||||||| ||||    
T  52243029 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgtaaagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgtgaagctgttataag 52243127  T
Q  145 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||  | ||| ||| |||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttat 52243227  T
Q  245 gtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
     |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243228 atcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096304
Alignment:
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 3096304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610961
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12610961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17046714 - 17046506
Alignment:
Q  103 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 201  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||      
T  17046714 gacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgt 17046616  T
Q  202 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcat 300  Q
    ||  |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17046615 ttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 17046519  T
Q  301 gagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||    
T  17046518 gagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  168 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 267  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  268 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15367893 - 15367708
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgact 226  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||    
T  15367893 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgact 15367795  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367794 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15402906 - 15402721
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgact 226  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||    
T  15402906 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgact 15402808  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402807 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641333
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7641333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370036
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371220
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373501
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 315
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574971
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  306 ggtctaagtt 315  Q
    ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223550
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  250 gctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |   | ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353852
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  311 aagttga 317  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774019
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 12774019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093798
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||| ||||||| ||  || |||||||||||| | |||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtc 15093856  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||| ||||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15093855 atgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20149936 - 20149840
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20149936 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20149840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15091201 - 15091101
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15091201 aacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataa 15091102  T
Q  128 t 128  Q
    |    
T  15091101 t 15091101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Original strand, 39706286 - 39706395
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39706384  T
Q  308 tctaagttgat 318  Q
    |||||||||||    
T  39706385 tctaagttgat 39706395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551828
Alignment:
Q  261 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 15551828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846368
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatga 8846368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 7799001 - 7798953
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttga 77  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7799001 aacaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtttcacgagttgttga 7798953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 46640456 - 46640558
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46640456 agatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 46640554  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  46640555 taag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Original strand, 16356924 - 16357045
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16356924 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16357022  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  16357023 tatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 305
Target Start/End: Original strand, 16488023 - 16488171
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || |||||| |    
T  16488023 tgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaag-aattgatattatgaagttatgctgct 16488121  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16488122 tttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16488171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 16348682 - 16348757
Alignment:
Q  230 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348682 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 257
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  168 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 257  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||  | ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 33 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13392 - 13144
Alignment:
Q  33 gagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13392 gagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgt 13293  T
Q  132 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaa 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13292 gaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaa 13193  T
Q  232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13192 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34134
Alignment:
Q  257 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaa 34134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 284
Alignment:
Q  276 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaa 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40217 - 39924
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggt-tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40217 aacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 40118  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  40117 tctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgaca 40018  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40017 tgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaa 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Original strand, 18597 - 18749
Alignment:
Q  153 atgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc 251  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || || |    
T  18597 atgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaacg-aattgatattatgaagttattc 18695  T
Q  252 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18696 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8779 - 8490
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  8779 aacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaat 8680  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  8679 ctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgactt 8584  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583 gcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 8490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Original strand, 24118 - 24406
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  24118 aacaaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataat 24217  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttga-ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |    
T  24218 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaat 24317  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24318 tgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Original strand, 2974 - 3260
Alignment:
Q  34 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtg 132  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2974 agtgccttgtt-gtttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtg 3072  T
Q  133 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||||| |    
T  3073 aagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatt 3172  T
Q  233 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3173 tgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 3260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 5938 - 6234
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||     
T  5938 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaa 6037  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  6038 atgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 6137  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6138 gcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 6234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26195 - 25907
Alignment:
Q  34 agtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgt 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26195 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgt 26096  T
Q  132 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaa 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||     
T  26095 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcat 25996  T
Q  232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25995 ttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaa 25907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40157 - 39869
Alignment:
Q  33 gagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataatt-g 130  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  40157 gagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaaccttggg-tagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttg 40059  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  40058 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgca 39959  T
Q  231 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
     ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39958 tttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaa 39869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 25881 - 26175
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25881 aacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 25980  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | |  ||| || ||| |||||||| |    
T  25981 tctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaat 26080  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26081 tacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 26175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44814
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  306 ggtctaagttgat 318  Q
     ||||||||||||    
T  44802 agtctaagttgat 44814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 33311 - 33479
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||   || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311 aacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 33410  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 195  Q
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33411 cctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaa 33479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39781 - 39488
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39781 aacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataa 39682  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||||||    
T  39681 tctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 39582  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39581 tgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 39488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 75031 - 75324
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  75031 aacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataa 75130  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||||||    
T  75131 tctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 75230  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75231 tgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 75324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 17031 - 17327
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17031 aacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataa 17130  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  17131 tctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgact 17230  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctg--tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17231 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 17327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 313
Target Start/End: Original strand, 79248 - 79430
Alignment:
Q  130 gtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 228  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||||    
T  79248 gtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttg 79346  T
Q  229 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79347 catttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Original strand, 79165 - 79214
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt 97  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  79165 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaaccttggggtagt 79214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 64 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4776 - 4517
Alignment:
Q  64 gcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 162  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776 gcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 4677  T
Q  163 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 262  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4676 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatat 4577  T
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4576 actgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 4517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 64 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12358 - 12099
Alignment:
Q  64 gcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 162  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358 gcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 12259  T
Q  163 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 262  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12258 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatat 12159  T
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12158 actgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 12099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 64 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22310 - 22051
Alignment:
Q  64 gcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 162  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22310 gcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 22211  T
Q  163 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 262  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22210 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatat 22111  T
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22110 actgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 22051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 317
Target Start/End: Original strand, 339770 - 340053
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  339770 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctg 339869  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | |  ||| || |||||||||||||||| |    
T  339870 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-a 339968  T
Q  231 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339969 tttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158601
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| || |||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 866 - 1158
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  866 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataat 965  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  966 ctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 1064  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1065 gcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 16416 - 16710
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16416 aacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatag 16515  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  ||| || ||||| ||||||||    
T  16516 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgact 16615  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16616 tccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaa 16710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21215 - 20928
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  21215 aacagagtgacttgttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataac 21116  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | || ||||| |||||||||||||| ||    
T  21115 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaatt 21016  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21015 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5152 - 4860
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| | |  |||||||||| |  ||||  ||||||    
T  5152 aacagagtgacttgttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataat 5054  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgact 226  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||||| |    
T  5053 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga-gaattatttgaatacttaagatgttgttgaat 4955  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4954 tgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2256 - 1971
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||| | |||| | |||||    
T  2256 aacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataat 2157  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  2156 atgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaatt 2057  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056 gcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13799 - 13508
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    
T  13799 aacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataat 13700  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||||||| ||| |     
T  13699 ctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatc 13601  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13600 gaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 13508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 15282 - 15573
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    | |||||| |||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  15282 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 15381  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  15382 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaatt 15480  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15481 gaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaa 15573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 32775 - 33066
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||||    
T  32775 aacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataa 32874  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    | ||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  32875 tctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataatg-aatatttaagatgttgttgaa 32971  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32972 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 33066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46230 - 45939
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||||    
T  46230 aacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataa 46131  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    | ||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  46130 tctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataatg-aatatttaagatgttgttgaa 46034  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46033 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 45939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16315 - 16124
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |  ||| || ||||| ||||| |||    
T  16315 tgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggctt 16218  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16217 gcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 16124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 321
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17439
Alignment:
Q  271 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaa 17439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16392 - 16323
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt 97  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16392 aacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagt 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4828 - 4545
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  4828 aacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataa 4729  T
Q  128 tt-gtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac 225  Q
    || |||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  4728 tttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaa 4631  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||  | |||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4630 ttatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 321
Target Start/End: Original strand, 3104 - 3296
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | |  ||| || |||||||||||| ||     
T  3104 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatta 3203  T
Q  229 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3204 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 3296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 10243 - 10533
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  10243 aacagagtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataat 10342  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||| ||    
T  10343 ctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaatt 10441  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10442 gaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 10533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 124886 - 124675
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  124886 agagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctg 124787  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||| ||| |||||    
T  124786 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgca 124687  T
Q  231 attgatattatt 242  Q
    ||||||||||||    
T  124686 attgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174785
Alignment:
Q  154 tgttgattatgatgtgatataatgttatgt-gcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 252  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||| | | |||  || |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121777
Alignment:
Q  263 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 121777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 313
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 313
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 779 - 1021
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||| |    
T  779 aacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatga 878  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  879 tatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgact 978  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 273  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  979 tgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 321
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4943
Alignment:
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaa 4943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5013 - 4723
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-t 129  Q
    |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||  |||||||  |||| ||||| |||||| |    
T  5013 agagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatct 4914  T
Q  130 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgc 229  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||  |||  |||||| ||| ||| ||||    
T  4913 gtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgc 4815  T
Q  230 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4814 aattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 237 - 1
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-t 129  Q
    |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||  |||||||  |||| ||||| |||||| |    
T  237 agagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatct 138  T
Q  130 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgc 229  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||  |||  |||||| ||| ||| ||||    
T  137 gtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgc 39  T
Q  230 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 267  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38 aattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32349 - 32078
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagat 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32349 ttttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 32250  T
Q  147 gtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgt 246  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  32249 atgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 32151  T
Q  247 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32150 catgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 32078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28135 - 27911
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | || ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28135 aacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 28036  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 226  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |  |||||| ||||||||||||||    
T  28035 cctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 27936  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgc 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27935 tgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6914 - 6669
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||  || |||||||| | |||| |||||||    
T  6914 aacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataat 6815  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  6814 ctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaatt 6715  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 273  Q
    || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6714 gctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 869 - 1151
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||| |||  | |||||  |||| ||||| ||||||    
T  869 aacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataat 968  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  969 ctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 1067  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1068 gaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16583 - 16301
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16583 aacagagtgacttgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataat 16484  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  ||| |||||| ||| ||    
T  16483 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaatt 16385  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16384 gaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 269
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  107 taatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt 204  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |     
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  205 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 269  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 1052
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||    
T  1218 aacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataat 1119  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 194  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1118 ctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28541 - 28425
Alignment:
Q  205 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28541 aatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 28442  T
Q  305 cggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||    
T  28441 cggtctaagttgatgaa 28425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11303
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  316 gatgaa 321  Q
    | ||||    
T  11308 gttgaa 11303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 2008
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  316 gatgaa 321  Q
    | ||||    
T  2013 gttgaa 2008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4563
Alignment:
Q  279 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 51701 - 51985
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||| ||||||| |||    
T  51701 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaat 51800  T
Q  129 t-gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatg-ttgttgac 225  Q
    | ||||||||||| | ||  | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| | |||| || ||||| |||||| |    
T  51801 ttgtgaagctgtt-atgagatattaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggc 51898  T
Q  226 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51899 ttgca-ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32654 - 32551
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32654 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 32557  T
Q  312 agttga 317  Q
    ||||||    
T  32556 agttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1590 - 1308
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||| |||  |||||||  |||| ||||| ||||||    
T  1590 aacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataat 1491  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  1490 ctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 1392  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | ||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1391 gaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7567 - 7285
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||| |||  |||||||  |||| ||||| ||||||    
T  7567 aacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataat 7468  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  7467 ctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 7369  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | ||||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7368 gaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 318
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15345
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgat 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51883 - 51591
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  | |||||| |||  |||||||   ||| ||||| ||||||    
T  51883 aacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataat 51784  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     ||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  51783 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaatt 51685  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    | | ||| ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51684 gaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaa 51591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4705
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20758
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37832
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 37832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17591
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94422
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44465
Alignment:
Q  169 gatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 267  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  268 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 100503 - 100386
Alignment:
Q  203 ttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatg 301  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  100503 ttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 100405  T
Q  302 agtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||||||||||||||||||    
T  100404 agtcggtctaagttgatga 100386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 38416 - 38573
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||    
T  38416 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 38515  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||| |||| ||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38516 atgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 38573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Original strand, 40169 - 40283
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40169 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagt 40267  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    | ||||||||||||||    
T  40268 cagtctaagttgatga 40283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119886
Alignment:
Q  261 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101511
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 101511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Original strand, 23603 - 23695
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatta 240  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  23603 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3785 - 3640
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||    
T  3785 aacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataat 3686  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 173  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3685 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7849 - 7704
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||    
T  7849 aacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataat 7750  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 173  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7749 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 317
Target Start/End: Original strand, 27666 - 27855
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||  | ||| ||| |||||||||||| ||    
T  27666 tgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgattt 27765  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
     || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27766 acatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10468 - 10323
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 127  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  10468 aacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataa 10369  T
Q  128 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 172  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10368 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128765
Alignment:
Q  165 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgat 128765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 20477  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20478 g-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 304
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10784
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13403
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13454 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13958
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16795
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16846 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136691
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139160
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 139160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144098
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134222
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgat 134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141629
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 62321 - 62216
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||   |||| | |||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  62321 atatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagt 62226  T
Q  305 cggtctaagt 314  Q
    |||| |||||    
T  62225 cggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132670
Alignment:
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 132670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501095
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 318
Target Start/End: Original strand, 85542 - 85731
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgact 226  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   | |||| || ||| |||| ||||||    
T  85542 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgact 85640  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85641 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 160809 - 160696
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  160809 atatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagt 160712  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  160711 cggtctaagttgatga 160696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 17807 - 17929
Alignment:
Q  32 agagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tg 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17807 agagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctg 17906  T
Q  131 tgaagctgtttaagatgtgttga 153  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17907 tgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4308
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82083
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| |||  ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatg-tttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    | || ||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11299
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47288 - 47014
Alignment:
Q  31 cagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-t 129  Q
    ||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||  ||||       |||||| |    
T  47288 cagagtgacttgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatct 47195  T
Q  130 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgc 229  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||  |||  |||||||||| ||| |||     
T  47194 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 47096  T
Q  230 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47095 aattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 47014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 4948 - 5230
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    ||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||  || ||||| || | ||||||||||||    
T  4948 aacagagtgacttattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataat 5047  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
     |||||| |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  5048 atgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 5146  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147 gaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12400
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| || |  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9253
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40411
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 40411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6547
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatga 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13415 - 13147
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||| | ||    ||||| | ||| || || |||||||||||| |||||    
T  13415 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataaga 13316  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaata-tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 244  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  13315 tgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 13216  T
Q  245 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215 atcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Original strand, 15935 - 16206
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||| | ||    ||||| | ||| || || |||||||||||| |||||    
T  15935 ttttgcgatctttgtcgcacaagttgttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataaga 16034  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    ||| ||| |||||||||||| || || |||||||| ||||     
T  16035 tgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttata 16134  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16135 tcatgttgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29994 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 117
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 321
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11553
Alignment:
Q  210 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  310 taagttgatgaa 321  Q
    ||||||| ||||    
T  11542 taagttgttgaa 11553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 11330 - 11450
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11330 aacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataat 11429  T
Q  129 -tgtgaagctgtttaagatgt 148  Q
     |||||||||| |||| ||||    
T  11430 ctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116441
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  306 ggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgat 116441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 128971 - 129072
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  128971 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtct 129069  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  129070 aag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 78442 - 78345
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78442 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4225
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    || || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4277 tg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12075
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20707 - 20595
Alignment:
Q  29 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20707 aacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataat 20608  T
Q  129 -tgtgaagctgtt 140  Q
     ||||||||||||    
T  20607 ctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 316
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161239
Alignment:
Q  166 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 264  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   | |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 316  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 249
Target Start/End: Original strand, 164553 - 164674
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgact 226  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   | |||| || |||||||| ||||||    
T  164553 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgact 164651  T
Q  227 tgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  164652 tgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2285
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatta 2282  T
Q  321 aaa 323  Q
    |||    
T  2283 aaa 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Original strand, 17944 - 18130
Alignment:
Q  129 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 227  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| ||||    
T  17944 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttactt 18043  T
Q  228 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| || || || ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18044 gcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1432
Alignment:
Q  221 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1336 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29568
Alignment:
Q  167 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  266 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgat 29568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53651
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19276
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  19291 cggtctaagttgatga 19276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38809
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| |||||||| ||||  | ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    | || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38741 gttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgat 38809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||| | |||||| |||| |||  ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatg-tttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||| ||||  | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  157 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 283  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2915
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||| ||||||    
T  2900 cggtctaagatgatga 2915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Original strand, 60548 - 60818
Alignment:
Q  46 ggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgg-gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtt-ta 142  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  60548 ggttttgtgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtat-atgatattaatgataatctgtgaagctgttata 60646  T
Q  143 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatt 242  Q
    | |||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  60647 aaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggt 60745  T
Q  243 atgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60746 atatcatgagctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14806
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  14791 cggtctaagttgatga 14806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 16286 - 16442
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  |  |||||||||||| | |||    
T  16286 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaat-taattgatattatgaagtc 16384  T
Q  248 atgctgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||| |||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16385 atgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  163 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatat--ttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 259  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  260 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    ||  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  250 --gctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
      ||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8098 gagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11482
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11546 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38359
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  250 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38295 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 225692 - 225465
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattat-aattgtgaagctgtt-taaga 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    |||   ||||| ||||| || || |||||||||| | || ||    
T  225692 ttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaagattatatatgatattaataatgaactgtgaagctgatatatga 225593  T
Q  146 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatg 245  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  225592 tgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattata 225494  T
Q  246 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 275  Q
    ||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  225493 tcacgctg-ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||| ||| | | | |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  305 cggtctaag 313  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15675
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 315  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  316 gat 318  Q
    |||    
T  15677 gat 15675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 4741 - 4898
Alignment:
Q  148 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 247  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||    
T  4741 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 4840  T
Q  248 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    | |||||| ||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  4841 aagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtc 4898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 141
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  305 cggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  156 cggtctaagttgatga 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Original strand, 6121 - 6230
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6121 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  308 tctaagttgat 318  Q
    |||||||||||    
T  6220 tctaagttgat 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12954
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  308 tctaagttga 317  Q
    ||||||||||    
T  12963 tctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12778
Alignment:
Q  209 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 307  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  308 tctaagttgatga 320  Q
    |||||||||||||    
T  12790 tctaagttgatga 12778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 320
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2754
Alignment:
Q  261 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24044 - 23853
Alignment:
Q  129 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttg----a 224  Q
    |||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | | |||  || |||||||| ||    |    
T  24044 tgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgtttta 23946  T
Q  225 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
     |||  |||| ||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23945 tttgatattgttat-atgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 320
Target Start/End: Original strand, 45794 - 45901
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45794 agatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45892  T
Q  312 agttgatga 320  Q
    |||||||||    
T  45893 agttgatga 45901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1096
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6625
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 14005
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  311 aagttga 317  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28879
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 28879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15884
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178912
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 314  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 178912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 317
Target Start/End: Original strand, 23927 - 23989
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  256 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8134 - 8090
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8134 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1171
Alignment:
Q  217 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  312 agttga 317  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25226 - 25121
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25226 agatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 25129  T
Q  310 taagttga 317  Q
    ||||||||    
T  25128 taagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193070
Alignment:
Q  156 ttgattatgatgtgatataatgttatg-tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||||||| | ||| |||| || ||||||||| || ||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  255 ttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 318
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1141
Alignment:
Q  261 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  271 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12214 - 12165
Alignment:
Q  48 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagt 97  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12214 ttttgcgatctttgtcacacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 12165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 241
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1257
Alignment:
Q  153 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattat 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||| |||  |||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1169 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattatttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattat 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 6284 - 6386
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  6284 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtc 6382  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  6383 taag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38339
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19990
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgat 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  669 gatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 572  T
Q  311 aag 313  Q
    |||    
T  571 aag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26999 - 26833
Alignment:
Q  154 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 252  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| |     
T  26999 tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat--catgatt 26904  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaaa 323  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  26903 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaa 26833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32110
Alignment:
Q  234 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 320  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 32110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 97188 - 97024
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| |||| | | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  97188 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattata-tatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 97090  T
Q  250 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |  |||||||  | |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97089 gaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 106466 - 106302
Alignment:
Q  150 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 249  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| |||| | | || ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  106466 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattata-tatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 106368  T
Q  250 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |  |||||||  | |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106367 gaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36464
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  262 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 103632 - 103737
Alignment:
Q  214 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc--tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtct 310  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  103632 gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttt-tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtct 103730  T
Q  311 aagttga 317  Q
    |||||||    
T  103731 aagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 46670 - 46820
Alignment:
Q  155 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 253  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| | || |||||     
T  46670 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaagttatgcta 46768  T
Q  254 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    || ||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  46769 ttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtc 46820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69804
Alignment:
Q  243 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 318  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 69804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 920
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  1041 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 943  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  942 tattgaactaagttgcatgagtc 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1853
Alignment:
Q  183 tgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||  ||||    
T  1974 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgt 1876  T
Q  283 tatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  1875 tatttaactaagttgcatgagtc 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 267781 - 267679
Alignment:
Q  213 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 309  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  267781 agatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 267683  T
Q  310 taag 313  Q
    ||||    
T  267682 taag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1903
Alignment:
Q  161 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttg 259  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 1950  T
Q  260 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2753 - 2694
Alignment:
Q  255 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2753 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44179 - 44104
Alignment:
Q  230 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44179 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 306
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10617
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 10617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 305
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  267 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Original strand, 21749 - 21898
Alignment:
Q  154 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 252  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  21749 tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 21844  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21845 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 21898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Original strand, 29641 - 29790
Alignment:
Q  154 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct- 252  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  29641 tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 29736  T
Q  253 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 306  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29737 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 29790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 275
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2281
Alignment:
Q  206 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 275  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  2213 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  264 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 305
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  269 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  265 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 313  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University