View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21695_high_9 (Length: 356)

Name: NF21695_high_9
Description: NF21695
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21695_high_9
NF21695_high_9
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (16-268)||(25175563-25175815)
chr6 (16-268)||(27653983-27654235)
chr6 (16-268)||(16825752-16826006)
chr6 (27-355)||(23153458-23153787)
chr6 (20-353)||(14626045-14626377)
chr6 (20-354)||(1650021-1650352)
chr6 (27-280)||(1657748-1657999)
chr6 (16-280)||(35009439-35009702)
chr6 (27-280)||(15862484-15862734)
chr6 (285-355)||(23148266-23148336)
chr6 (84-280)||(29665941-29666137)
chr6 (195-280)||(27751603-27751688)
chr6 (322-356)||(23995247-23995281)
chr6 (322-355)||(18002394-18002427)
chr6 (322-355)||(26090059-26090092)
chr6 (180-264)||(29605612-29605696)
chr6 (322-353)||(4991396-4991427)
chr6 (324-355)||(15742119-15742150)
chr6 (322-356)||(1657659-1657693)
chr6 (322-356)||(15862789-15862823)
chr6 (322-356)||(27751742-27751776)
chr6 (322-356)||(32276657-32276691)
chr6 (322-355)||(18823282-18823315)
chr6 (322-355)||(18839137-18839170)
chr6 (322-354)||(19983192-19983224)
chr6 (322-354)||(35015057-35015089)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (16-268)||(25426628-25426880)
chr5 (16-268)||(12374-12626)
chr5 (16-268)||(22366481-22366733)
chr5 (16-243)||(18778017-18778244)
chr5 (16-268)||(19499899-19500151)
chr5 (16-268)||(21073595-21073847)
chr5 (16-356)||(23506965-23507304)
chr5 (16-243)||(43443420-43443647)
chr5 (16-355)||(27182470-27182810)
chr5 (16-243)||(4200010-4200237)
chr5 (16-243)||(27009841-27010068)
chr5 (16-356)||(22053751-22054096)
chr5 (16-356)||(18530986-18531330)
chr5 (27-280)||(34939289-34939540)
chr5 (68-268)||(29188284-29188483)
chr5 (133-280)||(20623085-20623232)
chr5 (133-280)||(21233528-21233675)
chr5 (134-278)||(25900408-25900552)
chr5 (133-280)||(16536313-16536460)
chr5 (133-280)||(37052860-37053007)
chr5 (322-356)||(16105967-16106001)
chr5 (322-356)||(20623286-20623320)
chr5 (322-356)||(21233440-21233474)
chr5 (322-356)||(25900318-25900352)
chr5 (322-356)||(37053061-37053095)
chr5 (20-60)||(29190482-29190522)
chr5 (322-356)||(108726-108760)
chr5 (322-356)||(16536514-16536548)
chr5 (322-355)||(9730277-9730310)
chr5 (16-57)||(17471803-17471844)
chr5 (180-264)||(29918127-29918212)
chr5 (184-273)||(32950862-32950951)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (16-268)||(19886661-19886913)
chr2 (21-356)||(462743-463077)
chr2 (16-356)||(8891242-8891583)
chr2 (16-356)||(36982362-36982704)
chr2 (16-354)||(20627238-20627576)
chr2 (16-354)||(19794629-19794967)
chr2 (16-280)||(17396653-17396916)
chr2 (16-354)||(43642881-43643220)
chr2 (16-356)||(24341307-24341652)
chr2 (16-230)||(7507894-7508107)
chr2 (16-280)||(25265390-25265653)
chr2 (258-356)||(22863169-22863269)
chr2 (133-280)||(19689401-19689548)
chr2 (133-280)||(23820187-23820334)
chr2 (133-280)||(14906440-14906587)
chr2 (133-280)||(20015127-20015274)
chr2 (322-356)||(9652794-9652828)
chr2 (322-356)||(14906352-14906386)
chr2 (322-356)||(23820388-23820422)
chr2 (322-354)||(19689315-19689347)
chr2 (322-354)||(22284278-22284310)
chr2 (322-353)||(25213372-25213403)
chr2 (182-263)||(68156-68238)
chr2 (322-356)||(17396565-17396599)
chr2 (322-356)||(20015328-20015362)
chr2 (322-355)||(7507756-7507789)
chr2 (322-355)||(28031133-28031166)
chr2 (288-355)||(31146072-31146138)
chr2 (322-355)||(33128372-33128405)
chr2 (322-354)||(22275045-22275077)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (18-356)||(3506-3843)
scaffold0266 (16-356)||(1124-1464)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (16-268)||(47357654-47357906)
chr4 (16-356)||(13246430-13246771)
chr4 (16-354)||(54118168-54118507)
chr4 (16-243)||(10644219-10644446)
chr4 (116-356)||(121989-122228)
chr4 (24-280)||(13048221-13048477)
chr4 (16-356)||(15675007-15675352)
chr4 (84-356)||(10104168-10104445)
chr4 (16-280)||(26680201-26680463)
chr4 (16-253)||(31115629-31115865)
chr4 (217-356)||(33240900-33241045)
chr4 (133-280)||(10488678-10488825)
chr4 (133-280)||(16327926-16328073)
chr4 (16-112)||(111395-111491)
chr4 (248-356)||(31132545-31132659)
chr4 (182-264)||(40885570-40885652)
chr4 (322-356)||(14952085-14952119)
chr4 (322-356)||(15135905-15135939)
chr4 (322-356)||(15272209-15272243)
chr4 (322-356)||(16609011-16609045)
chr4 (322-356)||(26680517-26680551)
chr4 (16-60)||(10104450-10104494)
chr4 (322-354)||(16327840-16327872)
chr4 (182-263)||(15044992-15045074)
chr4 (322-355)||(8045272-8045305)
chr4 (322-355)||(16523146-16523179)
chr4 (323-356)||(55376492-55376525)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (16-356)||(14842485-14842824)
chr3 (16-268)||(55316219-55316471)
chr3 (16-356)||(2049810-2050149)
chr3 (16-356)||(12030071-12030410)
chr3 (16-268)||(41270075-41270327)
chr3 (27-356)||(13838905-13839234)
chr3 (16-243)||(16821139-16821366)
chr3 (16-280)||(13975722-13975985)
chr3 (16-317)||(15858986-15859287)
chr3 (16-280)||(45860805-45861068)
chr3 (15-290)||(51158008-51158282)
chr3 (16-280)||(13954890-13955153)
chr3 (16-273)||(15936634-15936890)
chr3 (16-354)||(16744041-16744377)
chr3 (19-273)||(15938476-15938729)
chr3 (20-354)||(15614838-15615169)
chr3 (16-280)||(17912483-17912744)
chr3 (234-356)||(19260747-19260869)
chr3 (217-354)||(19231981-19232121)
chr3 (133-280)||(2449238-2449385)
chr3 (180-264)||(4145814-4145898)
chr3 (322-356)||(2449150-2449184)
chr3 (322-356)||(16261777-16261811)
chr3 (322-356)||(17912396-17912430)
chr3 (322-356)||(23492696-23492730)
chr3 (322-356)||(38168237-38168271)
chr3 (322-356)||(53771365-53771399)
chr3 (16-57)||(15468555-15468596)
chr3 (322-355)||(16933868-16933901)
chr3 (16-129)||(47984650-47984763)
chr3 (16-129)||(47993937-47994050)
chr3 (16-129)||(48003224-48003337)
chr3 (16-129)||(48012510-48012623)
chr3 (322-354)||(17955884-17955916)
chr3 (319-354)||(15857163-15857198)
chr3 (322-356)||(11986078-11986112)
chr3 (322-356)||(13954802-13954836)
chr3 (322-356)||(14285289-14285323)
chr3 (322-356)||(30153265-30153299)
chr3 (322-356)||(33342204-33342238)
chr3 (322-356)||(45861122-45861156)
chr3 (322-356)||(51961029-51961063)
chr3 (184-273)||(11986173-11986262)
chr3 (223-264)||(14080715-14080756)
chr3 (322-355)||(19947026-19947059)
chr3 (16-57)||(22275209-22275250)
chr3 (322-354)||(2844514-2844546)
chr3 (322-354)||(3992873-3992905)
chr3 (322-354)||(54038024-54038056)
chr3 (322-354)||(55513193-55513225)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (16-356)||(5988-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (16-356)||(880-1218)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (16-356)||(20931345-20931684)
chr1 (16-354)||(41394222-41394559)
chr1 (16-356)||(20913037-20913369)
chr1 (16-243)||(18601143-18601370)
chr1 (16-268)||(5072388-5072640)
chr1 (16-355)||(20893550-20893889)
chr1 (16-356)||(37844372-37844714)
chr1 (16-356)||(20445679-20446021)
chr1 (16-356)||(20531444-20531785)
chr1 (16-230)||(22227809-22228022)
chr1 (16-230)||(22232506-22232719)
chr1 (20-243)||(2116258-2116481)
chr1 (82-354)||(45051489-45051758)
chr1 (133-280)||(51452608-51452755)
chr1 (322-353)||(15861327-15861358)
chr1 (322-356)||(51452809-51452843)
chr1 (322-354)||(21860334-21860366)
chr1 (322-354)||(44034871-44034903)
chr1 (20-60)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (16-355)||(48598-48936)
scaffold0023 (16-243)||(36093-36320)
scaffold0023 (322-355)||(61121-61154)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (15-356)||(16193641-16193980)
chr8 (16-268)||(30120722-30120974)
chr8 (16-356)||(43373390-43373731)
chr8 (16-206)||(222753-222943)
chr8 (16-206)||(736376-736566)
chr8 (16-206)||(860271-860461)
chr8 (16-268)||(16674392-16674644)
chr8 (27-356)||(24928714-24929043)
chr8 (16-243)||(21844597-21844824)
chr8 (16-243)||(21851990-21852217)
chr8 (16-354)||(16404900-16405235)
chr8 (20-268)||(6774258-6774505)
chr8 (20-268)||(24548986-24549233)
chr8 (16-280)||(22907214-22907476)
chr8 (27-280)||(17345581-17345832)
chr8 (133-280)||(5238203-5238350)
chr8 (133-280)||(24661248-24661395)
chr8 (133-280)||(43685662-43685809)
chr8 (144-206)||(691908-691970)
chr8 (322-356)||(5238404-5238438)
chr8 (322-356)||(22907126-22907160)
chr8 (322-356)||(24385650-24385684)
chr8 (322-356)||(24661160-24661194)
chr8 (322-356)||(43685863-43685897)
chr8 (322-354)||(24716762-24716794)
chr8 (322-355)||(2545265-2545298)
chr8 (322-355)||(3431175-3431208)
chr8 (322-355)||(22886654-22886687)
chr8 (322-354)||(274766-274798)
chr8 (322-354)||(641051-641083)
chr8 (322-354)||(826857-826889)
chr8 (223-263)||(38533855-38533895)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (16-268)||(10989410-10989661)
chr7 (16-243)||(2437457-2437684)
chr7 (18-356)||(16211768-16212105)
chr7 (16-353)||(3059966-3060302)
chr7 (16-356)||(13036936-13037277)
chr7 (16-356)||(36052667-36053005)
chr7 (16-243)||(13911049-13911277)
chr7 (21-356)||(11580659-11580997)
chr7 (16-243)||(13572676-13572903)
chr7 (16-273)||(18253842-18254098)
chr7 (22-280)||(25292338-25292595)
chr7 (16-280)||(47481031-47481294)
chr7 (16-243)||(16478987-16479213)
chr7 (16-280)||(7293017-7293279)
chr7 (16-279)||(13321014-13321278)
chr7 (133-280)||(11516343-11516490)
chr7 (133-280)||(15441564-15441711)
chr7 (133-280)||(30262129-30262276)
chr7 (159-352)||(295893-296087)
chr7 (248-356)||(36024372-36024487)
chr7 (322-356)||(2029244-2029278)
chr7 (322-356)||(7293333-7293367)
chr7 (322-356)||(11516544-11516578)
chr7 (322-356)||(14113901-14113935)
chr7 (322-356)||(15441476-15441510)
chr7 (285-356)||(15709428-15709503)
chr7 (322-356)||(30262041-30262075)
chr7 (322-356)||(42056186-42056220)
chr7 (322-356)||(3049905-3049939)
chr7 (322-356)||(13321334-13321368)
chr7 (182-263)||(13377693-13377775)
chr7 (322-356)||(25124450-25124484)
chr7 (322-356)||(47480942-47480976)
chr7 (322-355)||(371417-371450)
chr7 (323-356)||(25292250-25292283)
chr7 (322-354)||(126738-126770)
chr7 (322-350)||(15516765-15516793)
chr7 (322-354)||(32493946-32493978)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (16-356)||(8878-9217)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (16-356)||(12115-12452)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (27-356)||(171916-172244)
scaffold0001 (27-356)||(177619-177947)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (16-243)||(42997-43224)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (16-344)||(4996-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (16-356)||(26338-26678)
scaffold0162 (133-280)||(8180-8327)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (20-356)||(41733-42068)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (27-356)||(247364-247694)
scaffold0012 (322-356)||(34073-34107)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (16-356)||(128093-128431)
scaffold0008 (16-243)||(31700-31928)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (16-354)||(36837-37176)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (16-351)||(19206-19543)
scaffold0195 (16-280)||(21290-21553)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (22-356)||(272031-272364)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (16-355)||(123086-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (40-273)||(5552-5785)
scaffold0772 (322-356)||(5846-5880)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (16-243)||(35-262)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (16-212)||(64584-64780)
scaffold0026 (16-273)||(107747-108003)
scaffold0026 (223-265)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (16-273)||(48187-48443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (134-352)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (16-243)||(21141-21367)
scaffold0139 (16-243)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (16-306)||(148721-149012)
scaffold0025 (16-356)||(8849-9194)
scaffold0025 (259-356)||(146843-146940)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (16-230)||(5254-5466)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (134-356)||(89376-89600)
scaffold0028 (229-356)||(107706-107835)
scaffold0028 (322-353)||(130880-130911)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (16-230)||(3722-3936)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (20-243)||(9374-9596)
scaffold0215 (20-243)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (122-268)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (16-280)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (16-280)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (16-280)||(37066-37328)
scaffold0078 (322-356)||(36978-37012)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (16-280)||(41648-41911)
scaffold0125 (314-355)||(41957-41998)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (16-122)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (20-269)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (147-280)||(13636-13769)
scaffold0132 (322-356)||(13824-13858)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (16-122)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (114-243)||(13350-13478)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (133-280)||(26911-27058)
scaffold0141 (133-273)||(22656-22796)
scaffold0141 (322-356)||(22857-22891)
scaffold0141 (322-356)||(27112-27146)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (133-280)||(1582-1729)
scaffold0124 (322-356)||(1494-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (16-112)||(9382-9478)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (187-280)||(3360-3453)
scaffold0361 (18-72)||(3210-3264)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (117-273)||(56106-56262)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (322-356)||(6441-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (322-356)||(876-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (322-356)||(9880-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (322-356)||(13283-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (322-356)||(57390-57424)
scaffold0058 (223-264)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (322-356)||(55904-55938)
scaffold0032 (322-356)||(108073-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (311-356)||(18015-18060)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (322-354)||(80187-80219)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (322-354)||(193397-193429)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (182-264)||(8174-8257)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (322-356)||(17207-17241)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (182-263)||(2317-2399)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (322-356)||(17302-17336)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (322-356)||(34306-34340)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (184-230)||(45198-45244)
scaffold0066 (322-356)||(45338-45372)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (322-356)||(12416-12450)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (322-355)||(5475-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (322-355)||(4345-4378)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (322-355)||(5549-5582)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (323-356)||(339-372)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (323-356)||(25532-25565)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 213  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  214 taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153787
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 324  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 23153756  T
Q  325 attatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23153757 attatgatgaagactaacccccttaccttag 23153787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626045
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||  |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga 14626079  T
Q  320 tgatgattatgataaagactaacccccttacctt 353  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626078 agatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650021
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 1650056  T
Q  319 atgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650055 a-catgattatgataaagactaacccccttacctta 1650021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact 1657901  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 280
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactca-attcacaataact 15862581  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 355
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148336
Alignment:
Q  285 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 23148336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 280
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  84 aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 182  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  183 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  195 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995281
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 23995281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002394
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 18002394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090092
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 26090092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 264
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  180 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || ||| ||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 322 - 353
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742119
Alignment:
Q  324 gattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttaccttag 15742119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657659
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 1657659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862823
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 15862823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751776
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 27751776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276657
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 32276657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823282
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 18823282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839137
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 18839137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983192
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 19983192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015057
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 35015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778017
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18778017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507304
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa 23507263  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507264 atggagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 23507304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443420
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataaca 43443420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182470
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 27182512  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27182511 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 27182470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200010
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataaca 4200010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010068
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 27010068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053751
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca 22053798  T
Q  314 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22053797 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 22053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530986
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca 18531032  T
Q  314 aaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18531031 aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 18530986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 280
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaatgact 34939387  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  68 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttat 167  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  168 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagc 267  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  134 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 233  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  234 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc 278  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106001
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 16106001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623320
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 20623320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233440
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 21233440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900318
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 25900318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053095
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 37053095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108726
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 108726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536548
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatcttaga 16536548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730277
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 9730277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 57  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 264
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  180 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||| |||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  184 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463077
Alignment:
Q  21 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  121 acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 220  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  221 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 320  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 463041  T
Q  321 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463042 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891583
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 8891540  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8891541 aaatgatgatgattatgataaagactaacccctttaccttaga 8891583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982362
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 312  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 36982406  T
Q  313 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982405 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 36982362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627238
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||| ||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa 314  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa 20627278  T
Q  315 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20627277 aatgatgatgattatgataaagactaaccccgttacctta 20627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794629
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttaca 19794670  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794669 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642881
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| || |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 43642922  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43642921 aaatgatgatgattatgataaagactaacctccttccctta 43642881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341307
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 24341354  T
Q  314 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24341353 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 24341307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||| |    
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctca-a 7508009  T
Q  115 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  215 aacatcaattcatgca 230  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863269
Alignment:
Q  258 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 22863268  T
Q  356 a 356  Q
    |    
T  22863269 a 22863269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652794
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 9652794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906352
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 14906352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820422
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 23820422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689315
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttacctta 19689315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284310
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 322 - 353
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 263
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  182 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396565
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaga 17396565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015362
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttaccttaga 20015362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507756
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 7507756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031133
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 28031133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146072
Alignment:
Q  288 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 31146072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128405
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 33128405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275077
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttacctta 22275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3506
Alignment:
Q  18 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  118 acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 217  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  218 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat 3545  T
Q  318 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3544 gaagatgattatgacaaagactaacccccttaccttaga 3506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1464
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 314  Q
      |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 1422  T
Q  315 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1423 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246771
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13246728  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246729 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 13246771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118168
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| |       
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 54118209  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54118208 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644446
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 10644446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 116 - 356
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122228
Alignment:
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttaccttaga 122228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  24 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  124 acttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 223  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  224 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675007
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 15675054  T
Q  314 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15675053 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 15675007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104168
Alignment:
Q  84 aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 183  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  184 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--ta 281  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  282 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 10104168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg 253  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 356
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241045
Alignment:
Q  217 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  315 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 33241045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111491
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactca 111491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132659
Alignment:
Q  248 agttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  342 cccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||    
T  31132645 cccccttaccttaga 31132659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40885652 - 40885570
Alignment:
Q  182 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  40885652 tgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952119
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 14952119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135905
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 15135905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272209
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 15272209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609011
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 16609011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680551
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 26680551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 60  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 263
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  182 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045305
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 8045305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523179
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 16523179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376492
Alignment:
Q  323 tgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 55376492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842485
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     | |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 14842526  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842525 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 14842485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050149
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||| ||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa 2050108  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050109 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 2050149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030071
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa 12030112  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12030111 atgatgatgattatgataatgattaacccccttaccttaga 12030071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 356
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839234
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 325  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 13839203  T
Q  326 ttatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13839204 ttatgatgaagactaacccccttaccttaga 13839234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttaca 15858990  T
Q  314 aaat 317  Q
    ||||    
T  15858989 aaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  15 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaca 114  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  115 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  215 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744041
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
      ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 16744080  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16744079 atgatgatgattatggtaaagactaacctcgttacctta 16744041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  19 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  119 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 218  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  219 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615169
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | || ||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||  ||| || ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 15615134  T
Q  319 atgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615135 a-catgattatgataaagactaacccccttacctta 15615169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||  |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260747
Alignment:
Q  234 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 333  Q
    ||||||| || |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  334 aagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttaccttaga 19260747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 354
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232121
Alignment:
Q  217 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttacctta 19232121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  180 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449150
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 2449150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261811
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 16261811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912396
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 17912396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492730
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 23492730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168271
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 38168271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771399
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 53771399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933868
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16933868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  116 taacaacaacttag 129  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  116 taacaacaacttag 129  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  116 taacaacaacttag 129  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  116 taacaacaacttag 129  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955884
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857163
Alignment:
Q  319 atgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986078
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 11986078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954802
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaga 13954802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285323
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 14285323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153299
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaga 30153299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342238
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttaccttaga 33342238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861156
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaga 45861156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961029
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 51961029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  184 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 264
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  223 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 264  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947059
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 19947059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844546
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 2844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992905
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3992905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54038024
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 54038024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513225
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 55513225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5988
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctca-at 6228  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 6029  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028 gtgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 5988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 880
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||| ||    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctca-at 1120  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaa 921  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931684
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20931643  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931644 atgaggatgattatgataaaggctaacccccttaccttaga 20931684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394559
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | ||||       
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 41394520  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394521 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913369
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |       |    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaa-------t 20913129  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20913328  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20913329 atgaggatgattacgataaagactaacccccttaccttaga 20913369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601143
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18601143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893550
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||       
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttaca 20893592  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20893591 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 20893550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844372
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  215 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttac 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac 37844416  T
Q  313 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844415 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 37844372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446021
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-ac 312  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac 20445977  T
Q  313 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20445978 aaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttaccttaga 20446021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531785
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 20531742  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  20531743 aaatgatgatgattatgataaagactaatttccttaccttaga 20531785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  216 acatcaattcatgca 230  Q
     ||||||||||||||    
T  22228008 tcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  216 acatcaattcatgca 230  Q
     ||||||||||||||    
T  22232705 tcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116481
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcacattaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| |||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  119 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 218  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  219 tcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataaca 2116481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 354
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051758
Alignment:
Q  82 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 181  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  182 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat- 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||  |||||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  281 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaacccccttacctta 45051758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 322 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452843
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttaccttaga 51452843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860366
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 21860366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034871
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 44034871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48936
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 48896  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48897 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 48936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61121
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 61121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193641
Alignment:
Q  15 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaca 114  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  115 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  215 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca 16193682  T
Q  315 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16193681 aatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttaccttaga 16193641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373390
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 43373433  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373432 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 43373390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928714
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || ||||||    ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 325  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga 24928745  T
Q  326 ttatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24928744 ttatgataaagactaaccccattaccttaga 24928714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844597
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21844597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851990
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21851990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404900
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||  |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac- 16404941  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16404940 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | || ||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 280
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact 17345679  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  144 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238438
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 5238438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907126
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 22907126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385650
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 24385650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661160
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 24661160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685897
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 43685897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716762
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545298
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 2545298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431175
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 3431175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886687
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttaccttag 22886687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274798
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 274798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641051
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 641051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826857
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 826857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 263
Target Start/End: Original strand, 38533855 - 38533895
Alignment:
Q  223 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38533855 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaatt 38533895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437684
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataaca 2437684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212105
Alignment:
Q  18 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta 117  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  118 acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 217  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  218 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat 16212066  T
Q  318 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212067 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 16212105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 353
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060302
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa 3060264  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3060265 atgatgatgattatgataaagacttacccccttacctt 3060302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036936
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||       
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13036979  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13036978 aaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttaga 13036936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36053005
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36052962  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052963 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 36053005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911049
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  116 taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  215 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 13911049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580659
Alignment:
Q  21 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  121 acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 220  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  221 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa 11580699  T
Q  317 tgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11580698 tgatgatgattatgataaagactaatccccttaccttaga 11580659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572903
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 13572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
Alignment:
Q  22 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  122 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 221  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  222 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
      || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  116 taacaa-caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 212  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  213 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca 279  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295893
Alignment:
Q  159 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtac 258  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || ||  ||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  259 gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 352  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024487
Alignment:
Q  248 agttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaa----tgatgatgattatgataaagactaa 341  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  342 -cccccttaccttaga 356  Q
     |||||||||||||||    
T  36024472 ccccccttaccttaga 36024487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029278
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 2029278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293367
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 7293367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516578
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 11516578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113901
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 14113901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441476
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 15441476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709503
Alignment:
Q  285 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttaccttaga 15709503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262041
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 30262041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056186
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 42056186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049939
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaga 3049939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321368
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 13321368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 263
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  182 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124484
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 25124484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480942
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 47480942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371450
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25292283 - 25292250
Alignment:
Q  323 tgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25292283 tgattatgataaagactaacccccttatcttaga 25292250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126770
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 126770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttac 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493946
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 32493946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9217
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa 9176  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9177 atgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 9217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12452
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at 12213  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    || ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12214 ta-caacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 314  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaa 12410  T
Q  315 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 aattaagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 12452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 356
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172244
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 326  Q
    | |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 172214  T
Q  327 tatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172215 tatgataaagactaacccccttaccttaga 172244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 356
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177947
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 326  Q
    | |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 177917  T
Q  327 tatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177918 tatgataaagactaacccccttaccttaga 177947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 314  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 5026  T
Q  315 aatgatgatgattatgataaagactaaccc 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5025 aatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26338
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 314  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 26380  T
Q  315 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26379 aatgatcatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 26338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42068
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 319  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 42031  T
Q  320 tgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42032 tgatgattatgataaagaccaacccccttaccttaga 42068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247364
Alignment:
Q  27 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  127 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 226  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  227 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 324  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 247396  T
Q  325 attatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247395 attatgataaagactaacccccttaccttaga 247364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34073
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 34073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128093
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at 128333  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa 128134  T
Q  316 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128133 atgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 128093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  116 taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  215 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36837
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||       
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36878  T
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36877 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19543
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 312  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 19504  T
Q  313 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 351  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19505 aaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272364
Alignment:
Q  22 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| ||||||    ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  122 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 221  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  222 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg 321  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg 272329  T
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 272364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123086
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |       
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 312  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca 123129  T
Q  313 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  123128 aaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttag 123086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 273
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  40 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattca 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  140 cccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 239  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  240 aacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5880
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaga 5880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 35 - 262
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 64584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  223 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattta 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51110
Alignment:
Q  134 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 233  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  234 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 333  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  334 aagactaacccccttacct 352  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  51128 aagactaatctccttacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21141
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataaca 21141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||| ||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9194
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||  |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca 9147  T
Q  314 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9148 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttaccttaga 9194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 146843 - 146940
Alignment:
Q  259 gaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146843 gaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 146940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  216 acatcaattcatgca 230  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89376
Alignment:
Q  134 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 233  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  234 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 331  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  332 taaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  89400 tgaagactaacccccttaccttaga 89376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107706
Alignment:
Q  229 catacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 326  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  327 tatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttaccttaga 107706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 322 - 353
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  215 aacatcaattcatgca 230  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  120 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 219  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  220 caattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  122 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 221  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  222 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 268  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |       
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||      
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  115 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  215 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||       
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36978
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 36978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  116 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 215  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  216 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41998
Alignment:
Q  314 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 41998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  116 taacaac 122  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  20 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcacattaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||  | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  119 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 218  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  219 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaa 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||   ||| |||||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 280
Target Start/End: Original strand, 13636 - 13769
Alignment:
Q  147 agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaaca 246  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13636 agcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13735  T
Q  247 tagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13736 aagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13858
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 13858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  116 taacaac 122  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13478 - 13350
Alignment:
Q  114 attaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaac 213  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13478 attaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat 13380  T
Q  214 taacatcaattcatgcatacaaacataaca 243  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13379 tatcatcaattcatgcatacaaacataaca 13350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22891
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 22891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27146
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 27146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  133 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 232  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  233 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1494
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9478
Alignment:
Q  16 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactca 9478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 280
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  187 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  18 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 72  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56106
Alignment:
Q  117 aacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaa--catgtaatttcaccaacaattatacaact 214  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  | ||  |||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  56262 aacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaatt 56165  T
Q  215 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 273  Q
    | |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  56164 atcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6441
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 6441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 876
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9880
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 9880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13283
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 13283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57390
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 57390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  223 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 264  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55938
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 55938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108073
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 108073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18060
Alignment:
Q  311 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 18060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80219
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193397
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttacctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttacctta 193397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 264
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  182 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 264  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17207
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 17207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  182 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17302
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttaccttaga 17302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34306
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 34306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  184 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 230  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45372
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 45372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12416
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaga 12416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5475
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4345
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttaccttag 4345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5582
Alignment:
Q  322 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 5582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 356
Target Start/End: Original strand, 339 - 372
Alignment:
Q  323 tgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 356
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25565
Alignment:
Q  323 tgattatgataaagactaacccccttaccttaga 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 25565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University