View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2176_high_3 (Length: 738)
Name: NF2176_high_3
Description: NF2176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2176_high_3 |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0702 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0238 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1480 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0069 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 346390 - 346696
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
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| T |
346390 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
346489 |
T |
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| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
346490 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
346589 |
T |
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| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
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|
| T |
346590 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
346689 |
T |
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| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
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| T |
346690 |
accctaa |
346696 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6171817 - 6171511
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
6171817 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat |
6171718 |
T |
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| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
6171717 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
6171618 |
T |
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| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
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| T |
6171617 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
6171518 |
T |
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| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
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| T |
6171517 |
accctaa |
6171511 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4559585 - 4559281
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4559585 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
4559486 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
4559485 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
4559386 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
4559385 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcttagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
4559286 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
4559285 |
accct |
4559281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11071631 - 11071325
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
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| T |
11071631 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag |
11071532 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
11071531 |
ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaac |
11071432 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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| T |
11071431 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
11071332 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
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|
|
| T |
11071331 |
accctaa |
11071325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 14777543 - 14777849
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
14777543 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat |
14777642 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
14777643 |
ggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaac |
14777742 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
14777743 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
14777842 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
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||||||| |
|
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| T |
14777843 |
accctaa |
14777849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 41729175 - 41729480
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41729175 |
atgataggaatggatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattgccagatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
41729274 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41729275 |
ggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttactaggaatattataaagctaac |
41729374 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41729375 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
41729474 |
T |
 |
| Q |
301 |
acccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
41729475 |
acccta |
41729480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 42674706 - 42675010
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42674706 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag |
42674805 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
42674806 |
ggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
42674905 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674906 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaagaaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
42675005 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
42675006 |
accct |
42675010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2050892 - 2050588
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2050892 |
atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
2050793 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2050792 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataattcctatttttatgattcctaggaatattataaagctaac |
2050693 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2050692 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
2050593 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
2050592 |
accct |
2050588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17966009 - 17965707
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
17966009 |
atgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttaccaaattttattcccgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag |
17965910 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17965909 |
ggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
17965810 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17965809 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
17965710 |
T |
 |
| Q |
301 |
acc |
303 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
17965709 |
acc |
17965707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 9733891 - 9734190
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9733891 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcccaaggaaaag |
9733990 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9733991 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaac |
9734090 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9734091 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacac |
9734190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37192548 - 37192244
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37192548 |
atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
37192449 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37192448 |
ggtgggaataaagtttccatggagattggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
37192349 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37192348 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
37192249 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
37192248 |
accct |
37192244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 5770155 - 5770458
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5770155 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaat |
5770254 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5770255 |
ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatggttgctaggaatattataaagctaac |
5770354 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5770355 |
caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
5770454 |
T |
 |
| Q |
301 |
accc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
5770455 |
accc |
5770458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 638619 - 638318
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
638619 |
atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaggtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcctaggaatataaaaaatttcccaaggaaaag |
638520 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
638519 |
gg-gggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
638421 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
638420 |
caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaatcaaacac |
638321 |
T |
 |
| Q |
301 |
acc |
303 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
638320 |
acc |
638318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37533978 - 37533673
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaag |
37533879 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37533878 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcccaggaata-tataaagctaac |
37533780 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37533779 |
caaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttttattccaaggaatgttattcctagaaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
37533680 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
37533679 |
accctaa |
37533673 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 474 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 24894960 - 24894711
Alignment:
| Q |
474 |
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573 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24894960 |
ataatgtcaaaaagacactggtactgaaattagtgcgcaagcaaaagctcatcatcaatggcgcttaaaaccctatccactttcttaacccctctttctc |
24894861 |
T |
 |
| Q |
574 |
tcccaaaccccaaattccctcaaattcactccaaaccttgtctcattctctgcgaattctctcgtccttccaaatcacgcttaccagaaggcaccggagc |
673 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24894860 |
tcccaaaccccaaattccctcaaattcactccaaaccttgtctcattctctgcgaattctctcgtccttccaaatcacgcttaccagaaggcaccggagc |
24894761 |
T |
 |
| Q |
674 |
cgctgctccgtcaccaggcgagaagttcctcgaacgccagcagtcatttg |
723 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24894760 |
cgctgctccgtcaccaggcgagaagttcctcgaacgccagcagtcatttg |
24894711 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 28311742 - 28312042
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28311742 |
atgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactgaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatctttcccaaggaaaag |
28311841 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28311842 |
ggtgggaataaagttcccgtggagatgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaac |
28311940 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28311941 |
caaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
28312040 |
T |
 |
| Q |
301 |
ac |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
28312041 |
ac |
28312042 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37233455 - 37233155
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37233455 |
atgataggaacatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatcgttcccaaggaaaag |
37233356 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37233355 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccttattttcatggttcctaggaatattataaagttaac |
37233257 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233256 |
caaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
37233157 |
T |
 |
| Q |
301 |
ac |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
37233156 |
ac |
37233155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 21737445 - 21737753
Alignment:
| Q |
1 |
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92 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21737445 |
atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca |
21737544 |
T |
 |
| Q |
93 |
aggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata |
192 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21737545 |
aggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata |
21737644 |
T |
 |
| Q |
193 |
aagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaa |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21737645 |
aagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatatttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaa |
21737744 |
T |
 |
| Q |
293 |
acaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
21737745 |
acaaacaca |
21737753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2521701 - 2521434
Alignment:
| Q |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521701 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
2521602 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521601 |
ggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
2521502 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcct |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521501 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaaggaatgttattcct |
2521434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41750555 - 41750276
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750555 |
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41750456 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41750455 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagttaac |
41750356 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750355 |
caaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaattt |
41750276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 40950904 - 40951209
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
40950904 |
atgatagaaatatatatgcttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatacaaaaaaatttccaaggaaaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40951004 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaac |
40951103 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40951104 |
caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattttcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacat |
40951203 |
T |
 |
| Q |
301 |
acccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
40951204 |
acccta |
40951209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26310295 - 26309993
Alignment:
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1 |
atgataggaatgtatatgcctat--gtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaa |
98 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26310295 |
atgatagaaatgtatatgtctatatgtttgttagaagtttattaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaa |
26310196 |
T |
 |
| Q |
99 |
agggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagcta |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26310195 |
agggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagcta |
26310096 |
T |
 |
| Q |
199 |
accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
298 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26310095 |
accaaccatatttttcctaaatttcttgtaataaaattcccatctttatattccaaggaatgctattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
26309996 |
T |
 |
| Q |
299 |
aca |
301 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
26309995 |
aca |
26309993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23944165 - 23943884
Alignment:
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25 |
tttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggag |
124 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23944165 |
tttgttacaagtttactaaattttattctcggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaacgaaaagggtgggaataaagttcccatggag |
23944066 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcct |
224 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23944065 |
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23943966 |
T |
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225 |
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306 |
Q |
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| T |
23943965 |
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23943884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 20426528 - 20426830
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20426528 |
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20426627 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
20426628 |
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20426726 |
T |
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| Q |
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300 |
Q |
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| T |
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20426826 |
T |
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| Q |
301 |
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304 |
Q |
| |
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|||| |
|
|
| T |
20426827 |
accc |
20426830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13760938 - 13760685
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13760938 |
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13760839 |
T |
 |
| Q |
156 |
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255 |
Q |
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| T |
13760838 |
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13760739 |
T |
 |
| Q |
256 |
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309 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13760738 |
gaatgttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacactctaaaa |
13760685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 34356745 - 34357022
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34356745 |
atgatagaaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat |
34356844 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
34356845 |
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34356943 |
T |
 |
| Q |
201 |
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280 |
Q |
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| T |
34356944 |
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34357022 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 27358008 - 27358303
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
27358008 |
atgatagggatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatattcatgggaatagaaaaatttacccaaggaaaag |
27358107 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
27358108 |
ggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaatttaat |
27358206 |
T |
 |
| Q |
201 |
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297 |
Q |
| |
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| T |
27358207 |
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27358303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45409276 - 45408981
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
45409276 |
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45409177 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
45409176 |
ggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatag-ttacctattataatccttatttttatggttcctagaaatattataaatttaat |
45409078 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
297 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
45409077 |
caaacatatttttgctaaataccttggaataaaattctcatctttatattccaataaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaa |
45408981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 39995176 - 39995435
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttccca |
92 |
Q |
| |
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|
| T |
39995176 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca |
39995275 |
T |
 |
| Q |
93 |
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192 |
Q |
| |
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|
| T |
39995276 |
aggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata |
39995375 |
T |
 |
| Q |
193 |
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252 |
Q |
| |
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|
| T |
39995376 |
aagttaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaatttccatctttatattcc |
39995435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3902462 - 3902182
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |
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| T |
3902462 |
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3902363 |
T |
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| Q |
121 |
ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat |
220 |
Q |
| |
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|
| T |
3902362 |
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3902264 |
T |
 |
| Q |
221 |
tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
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|
| T |
3902263 |
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3902182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 18713714 - 18714006
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18713714 |
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18713813 |
T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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| T |
18713814 |
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18713912 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta |
306 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18713913 |
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18714006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14832836 - 14832536
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
14832836 |
atgatagaaatatatatgcctatgtttgttaaaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaag |
14832737 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
14832736 |
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14832638 |
T |
 |
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300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14832637 |
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14832538 |
T |
 |
| Q |
301 |
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302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14832537 |
ac |
14832536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45694214 - 45693915
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45694214 |
atgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaacgttcatgggaatagaaaatttttcccaaggaaaag |
45694115 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
45694114 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaattcatgagtaattt-gcaattataattcctatttttatggttcccaggaatattataatgttaag |
45694016 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45694015 |
caaacatttttttttaaaatgccttggaataaaattctcatctttatgttccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
45693916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1988337 - 1988073
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
1988337 |
atgatagaaatatacatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccggatataaaatgttcttgggaatagaaaaattttctcaaggaaaag |
1988238 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
1988237 |
ggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcttatatag-ttacctattataatccctatttttttggttccaaggaatattataaagttaac |
1988139 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1988138 |
caaacatatttttcccaaaaatcttggaataaaattctcatatttatattctaaggaatgttattc |
1988073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40570031 - 40569738
Alignment:
| Q |
16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag-- |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40570031 |
atgcctatgtttgttacaagtttgttaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatttttcccaaagaaaatggtgggaataaagaa |
40569932 |
T |
 |
| Q |
114 |
-ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||| |
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|
| T |
40569931 |
gttcccatggaaatgggaataaaatcatgtataatt-acctattataatccctatttttgaggttccttggaacattataatgttaaccaaacatctttt |
40569833 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
40569832 |
ttctaaataccttggaataaaatttacatatatatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
40569738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39819709 - 39819414
Alignment:
| Q |
14 |
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110 |
Q |
| |
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39819709 |
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39819610 |
T |
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| Q |
111 |
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207 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39819609 |
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39819510 |
T |
 |
| Q |
208 |
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303 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39819509 |
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39819414 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
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Target Start/End: Complemental strand, 7007531 - 7007306
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Q |
| |
|
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|
| T |
7007531 |
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7007433 |
T |
 |
| Q |
180 |
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279 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7007432 |
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7007333 |
T |
 |
| Q |
280 |
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306 |
Q |
| |
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| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7007332 |
tggtaaacttaaaacaaacacacccta |
7007306 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4875781 - 4875506
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21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4875781 |
tatgtttgttacaagtttgctaaattttattttcaa-tataaaacgttctcgagaataaaaaaaaaatcccaaagaaacgggtgggaataaagttcccat |
4875683 |
T |
 |
| Q |
121 |
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219 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4875682 |
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4875584 |
T |
 |
| Q |
220 |
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297 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4875583 |
tacattggaataaaattcacatctttatattccaaagaatattattcctaagaataaatttgacaaacttgaaacaaa |
4875506 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Original strand, 5002897 - 5003182
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115 |
Q |
| |
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|||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5002897 |
atgcatatatttgttacaagtttgctaaattttattccaag-tataaaatgtttctgggaatagaaaaaaaattccaaagaatatggtgggaataaagtt |
5002995 |
T |
 |
| Q |
116 |
cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||| | |
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|
| T |
5002996 |
tccatgaagatatgaatcaattcatgtgtaact-acctattataatccatatttttatggttcctgaaaatattaaaatgttaaccaaacatcttttatc |
5003094 |
T |
 |
| Q |
216 |
taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
5003095 |
caaataccttggaataaaattcgcatctttatattccaaggaatgttattcctataaataaatttggtaaattttaaacaaacacacc |
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T |
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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 11763416 - 11763577
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11763416 |
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11763515 |
T |
 |
| Q |
101 |
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163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11763516 |
ggtgggaataaagtttccatgaagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatcc |
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T |
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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Original strand, 41297983 - 41298255
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| Q |
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tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41297983 |
tatgtatgttacaagtttattaaattttattcccggatataaaatgtttttagaaataaaaaaaatttcccaaagcaaagggtgtgaataaagttctcat |
41298082 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat |
220 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
41298083 |
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41298181 |
T |
 |
| Q |
221 |
tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
297 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
41298182 |
ac---aaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaaaataaatttgatatacttaaaacaaa |
41298255 |
T |
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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 11763597 - 11763737
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tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11763597 |
tattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaaattaatcaaacatattttttctagataccttggaataaaattctcatctttatattcc |
11763696 |
T |
 |
| Q |
253 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaa |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11763697 |
aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa |
11763737 |
T |
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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13790280 - 13790018
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13790280 |
ttataagtttactaaattttattctagagtacataaaatgttcttggaaatagaaaaaa----------aaaacggtgggaataaagttcccatggagat |
13790191 |
T |
 |
| Q |
127 |
gagaataaattcata-aatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct-aaattcct |
224 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
13790190 |
gggaataaaatcatgtaata--ttacctattataatccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaatcaaacatctttttttttaaatacct |
13790093 |
T |
 |
| Q |
225 |
tggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13790092 |
tagaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgttattcctacaaataaatttgataaacttgaaacaaaca |
13790018 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 3254284 - 3254437
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148 |
ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
3254284 |
ttacttattataacccttatttttatggtttctaggaatattatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttagaataaaattctcatttttat |
3254383 |
T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3254384 |
attccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca |
3254437 |
T |
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Target: chr2; HSP #45
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Target Start/End: Complemental strand, 13539675 - 13539399
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ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539675 |
ctatgtttgttacaaatttattaaattttattcgcaggtataaaatgtttatgggaatggaaaaaatttctcacagaaactagtgggaataaagttccca |
13539576 |
T |
 |
| Q |
120 |
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219 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||| |||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
13539575 |
tgaacatgggaatagattcatgtgtaatt-atctattataatccttatttttatggtttctgagaatactataatgttaagcaaacatcttttttctaaa |
13539477 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
297 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539476 |
tattttagaataaaattctcatctttatgttccaagaaatgttatcaccaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaa |
13539399 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14253548 - 14253412
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
14253548 |
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14253449 |
T |
 |
| Q |
101 |
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137 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14253448 |
ggtgtgaataaaattttcatgaagatgagaataaatt |
14253412 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6571713 - 6571602
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1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6571713 |
atgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcaggtataaaatgttccggggaatataaaaaatttcccaagaaaaag |
6571614 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |
|
|
| T |
6571613 |
ggtaggaataaa |
6571602 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25725010 - 25724753
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42 |
aaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcata |
141 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
25725010 |
aaattttattgctgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaagtttcccaaagaaaagggtgggaataaagttctcatgaagatgagaataatttc-ta |
25724912 |
T |
 |
| Q |
142 |
aatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattccca- |
240 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| | |||||| | | |||||||| || |||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25724911 |
gtgtaactacctattaacctccctattataatggtttccaagaatattacaatattaaccaaacaactttttttaaaatatctaggaataaaactcccat |
25724812 |
T |
 |
| Q |
241 |
tctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25724811 |
tccttaaattccaaggaaagttattcttgggaataaatctagtaaacttgaaacaaaca |
25724753 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1623188 - 1623078
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190 |
ataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1623188 |
ataaagttaaccaaacatatattttctaaatac-ttgaaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattactaggaataaatttagtaaaatt |
1623090 |
T |
 |
| Q |
290 |
gaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
1623089 |
gaaacaaacaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1623405 - 1623206
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| Q |
4 |
ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt |
103 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||| ||| |||| ||| | || |
|
|
| T |
1623405 |
atagaaatatatatgtctatgtt-gttacgagtttattaaatttgattcccggttataaaatgttcctgagtacagagaaatttttccaaagaacatggc |
1623307 |
T |
 |
| Q |
104 |
gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
1623306 |
gggaataaagtttcaatgaatatgagaataaattcatatgtag-ttaccaattataatctctatttttatggttcctacgaataatataaagttaatcaa |
1623208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24895390 - 24895267
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305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24895390 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtgagttccatttccaaagtgtatgacccacattgatttaacccaatgaaagagtgagtgttagagagagt |
24895291 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaatagattgttgccggta |
425 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
24895290 |
atccaaaagagagagttgccggta |
24895267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4685185 - 4684945
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtt-cctgggaatagaaaaaatttcc-caaggaaaagggtgggaataaagttccc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4685185 |
tatgtttgttataaatttattaaattttatttcagagtataaaacgtttcctggcaatagaaaaaaaaaaatcaaagaaaagggtgtgaataaagttccc |
4685086 |
T |
 |
| Q |
119 |
atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaa |
218 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| | || |||||||| | ||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
4685085 |
atgaagatgggaacaaattcatgtgta----acctattataattcatatttttatggatccgaaga-tattataatgttaagcaaatatatttttactaa |
4684991 |
T |
 |
| Q |
219 |
attccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat |
264 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
4684990 |
atacctaggaataaaattctcatctttatgttctaaagaatgttat |
4684945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37851864 - 37851678
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37851864 |
tatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattccaaagaaaatggtgagaataaagttccc |
37851766 |
T |
 |
| Q |
119 |
atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat |
207 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
37851765 |
atgaagatgagaataaattcatgtgta-actacctattataattcatatttttatgattcctaaaaatattataatgttaactaaacat |
37851678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25455037 - 25454914
Alignment:
| Q |
14 |
atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaat--aa |
111 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||| || |
|
|
| T |
25455037 |
atatgtctatgtttgttacaagtttactaaatttcattctcgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaaaaaaatggagggaataaaa |
25454938 |
T |
 |
| Q |
112 |
agttcccatggagatgagaataaa |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
25454937 |
agttcccatgaagacgagaataaa |
25454914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Original strand, 3254142 - 3254245
Alignment:
| Q |
35 |
gtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt-cccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaata |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3254142 |
gtttactaaattttattctcgcgtacaaaatgtttctgggaatagaaaattttttcccaaaggaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgagaata |
3254241 |
T |
 |
| Q |
134 |
aatt |
137 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
3254242 |
aatt |
3254245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2521434 - 2521381
Alignment:
| Q |
244 |
ttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521434 |
ttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaa |
2521381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Original strand, 38104305 - 38104394
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38104305 |
taaaatcaatgtatgttccaccactttatttgggttccattcccaaagtgtatgacccacattgaattaattcaatgagagagtgagtgt |
38104394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 8868728 - 8868842
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8868728 |
tatgtttgttacaggattagtaaattttattcctaggtagaaaatgttcctggga-taggaata-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccat |
8868825 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatgagaataaatt |
137 |
Q |
| |
|
| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
8868826 |
gaagatgggtataaatt |
8868842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 137
Target Start/End: Original strand, 516463 - 516572
Alignment:
| Q |
27 |
tgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||| |||| ||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
516463 |
tgttataattttagtaaattttatttctgggtataaaatgtttttgggaatataaaaaaatt-ccaaagaaaatggtgagaataaaattcccgtgaagat |
516561 |
T |
 |
| Q |
127 |
gagaataaatt |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
516562 |
gagaataaatt |
516572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Original strand, 14403431 - 14403558
Alignment:
| Q |
183 |
gaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatc--tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt |
280 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
14403431 |
gaatattataaagttaaccaaaaatattttttctaaaaaccttagtataaaatttccatctttttatatttcaagaactgttatttctaaaaataaattt |
14403530 |
T |
 |
| Q |
281 |
agtaaacttgaaacaaacacaccctaaa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14403531 |
gataaacttaaaacaaactcaccctaaa |
14403558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14253413 - 14253340
Alignment:
| Q |
168 |
ttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccat |
241 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14253413 |
ttttatgtttcctaaaaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatattttggaataaaatttccat |
14253340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24499449 - 24499400
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttc |
69 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24499449 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattccatggtataaaatgttc |
24499400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14253325 - 14253254
Alignment:
| Q |
228 |
aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
14253325 |
aataaaattctcatccttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaatttaaaacaaaca |
14253254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35316524 - 35316438
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt |
392 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35316524 |
taaaattaatgtatgtcccaccattttatgttgattcaatttttaaattgtaga-cccacaatgatttaaatcaataagagagtgagt |
35316438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37719943 - 37719872
Alignment:
| Q |
322 |
ccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37719943 |
ccaccattttaagtggattccatttctaaagtgtatgtcctacattgatttcatccaataaaagagtgagtg |
37719872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 36590862 - 36590915
Alignment:
| Q |
245 |
tatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36590862 |
tatattccaacgaatgttattcctaaaaataaatttagtaaacttaaaacaaac |
36590915 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 390
Target Start/End: Original strand, 1110257 - 1110340
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtga |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
1110257 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtatatgtcctacattgatttcacccaataaaagagtga |
1110340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Original strand, 8868938 - 8868980
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| Q |
255 |
ggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
297 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8868938 |
ggaaagttattcgtaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
8868980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||| || |||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
15508973 |
aaatcaatgtatgtcccaccattttttgtgggttccatttccaaagtgtagatcctacattgatttcacccaattaaagagtaagtg |
15509059 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 322 - 403
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| Q |
322 |
ccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg-tagagagtgt |
403 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
21447178 |
ccaccattttatgtgggacccatttccaaagtgtaagacccacattgatttcacacaataaaagagtgggtgttagagagtgt |
21447260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | || |||||||||| | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28898158 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggtttcatttccaaagtgtagatcctacattgatttcatccaataaaagagtgagtg |
28898072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| || |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
42182948 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaaagagttagtg |
42183034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
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| Q |
77 |
tagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggt |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14137153 |
tagaaaaattttctcaaaaaaaaggttaagaataaagttctcatgaagacgagaataaattcatatgta-attacttattaaaatctctatttttatggt |
14137055 |
T |
 |
| Q |
177 |
tcctaggaatattataa |
193 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||| |
|
|
| T |
14137054 |
tgttgggaatattataa |
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T |
 |
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Target: chr2; HSP #74
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| Q |
228 |
aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25444999 |
aataaaattatcatctttatattccaaaaaatgttattccttaaaataaatttgacaaacttaaaacatacacaccctaaa |
25444919 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
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| Q |
323 |
caccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgag |
391 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
27183463 |
caccattttatgttaattccattttcaaagtgtatgatccacattgatttaacccaataaaaaagtgag |
27183395 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
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| Q |
323 |
caccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgag |
391 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
27833005 |
caccattttatgttaattccattttcaaagtgtatgatccacattgatttaacccaataaaaaagtgag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 420
Target Start/End: Original strand, 12989250 - 12989365
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagtgt |
403 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
12989250 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttgtatggattctatttccgaagtgtaga-cccacaatgatttaaaccaataagagagtgagtattagagagagtgt |
12989348 |
T |
 |
| Q |
404 |
ccaaaatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
12989349 |
tcaaaagagagtgttgc |
12989365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25625377 - 25625328
Alignment:
| Q |
36 |
tttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
85 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25625377 |
tttactagattttattctgaggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaa |
25625328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45212735 - 45212662
Alignment:
| Q |
224 |
ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
45212735 |
ttggaataaaattctcatctttacatttcaaagaatgtaattcctaaaaataaatttgataaatttaaaacaaa |
45212662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 13230034 - 13230339
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230034 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
13230133 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230134 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
13230233 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230234 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
13230333 |
T |
 |
| Q |
301 |
acccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
13230334 |
acccta |
13230339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 27762944 - 27763246
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27762944 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatatttcccaaggaaaag |
27763043 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27763044 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
27763143 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27763144 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
27763243 |
T |
 |
| Q |
301 |
acc |
303 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
27763244 |
acc |
27763246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 45747841 - 45748145
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45747841 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
45747940 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45747941 |
ggggggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc-attataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
45748039 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45748040 |
caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
45748139 |
T |
 |
| Q |
301 |
acccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
45748140 |
acccta |
45748145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 48518936 - 48519233
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48518936 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
48519035 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519036 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatacctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
48519135 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519136 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcacatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
48519233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 39730338 - 39730645
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730338 |
atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
39730437 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39730438 |
ggtgggaataaagttcacatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaac |
39730537 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730538 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
39730637 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaaa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
39730638 |
accctaaa |
39730645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 48879355 - 48879049
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48879355 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
48879256 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48879255 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
48879156 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48879155 |
caaacatatttttcctacattccttggaataatattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
48879056 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
48879055 |
accctaa |
48879049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42773978 - 42773674
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773978 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctggggataaaaaaaatttcccaaggaaaag |
42773879 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773878 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
42773779 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773778 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatactccaaggaatgttatttctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
42773679 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
42773678 |
gccct |
42773674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43723294 - 43722990
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43723294 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
43723195 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43723194 |
ggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
43723095 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43723094 |
caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
43722995 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
43722994 |
accct |
43722990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45596298 - 45595994
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45596298 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
45596199 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45596198 |
ggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
45596099 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45596098 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
45595999 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
45595998 |
accct |
45595994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35999716 - 35999410
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35999716 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
35999617 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35999616 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
35999517 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35999516 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaa |
35999417 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
35999416 |
accctaa |
35999410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25932471 - 25932167
Alignment:
| Q |
1 |
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| T |
25932171 |
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25932167 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 55968045 - 55968349
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
55968345 |
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55968349 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 41859092 - 41859395
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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Q |
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| T |
41859391 |
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41859395 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 6279966 - 6280273
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
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6280273 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47670392 - 47670088
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
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47670293 |
T |
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101 |
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200 |
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300 |
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Q |
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| T |
47670092 |
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47670088 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40435930 - 40435628
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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40435930 |
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40435831 |
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| Q |
101 |
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200 |
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40435631 |
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Q |
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| T |
40435630 |
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40435628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 50672950 - 50673245
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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297 |
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| T |
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50673245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Original strand, 39835360 - 39835660
Alignment:
| Q |
9 |
aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa |
108 |
Q |
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308 |
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| T |
39835660 |
a |
39835660 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 41744265 - 41744568
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccg-ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa |
99 |
Q |
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| T |
41744565 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23686817 - 23686511
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
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| T |
23686817 |
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T |
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101 |
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200 |
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| T |
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300 |
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| T |
23686617 |
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| T |
23686517 |
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23686511 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 305
Target Start/End: Original strand, 18405282 - 18405582
Alignment:
| Q |
4 |
ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt |
103 |
Q |
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18405282 |
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18405380 |
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104 |
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203 |
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18405580 |
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| T |
18405581 |
ct |
18405582 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 936156 - 935852
Alignment:
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1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
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| T |
936156 |
atgattggaatatatatccctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcacaagaaaaag |
936057 |
T |
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101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
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T |
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Q |
| |
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| T |
935856 |
accct |
935852 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 34238007 - 34238295
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
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| T |
34238007 |
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34238106 |
T |
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| Q |
109 |
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208 |
Q |
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34238206 |
T |
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| Q |
209 |
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297 |
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| T |
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34238295 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32953553 - 32953246
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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| T |
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32953454 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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300 |
Q |
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| T |
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32953254 |
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308 |
Q |
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| T |
32953253 |
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32953246 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8322275 - 8321969
Alignment:
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100 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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T |
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300 |
Q |
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| Q |
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307 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27942747 - 27942465
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120 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
121 |
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220 |
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| T |
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27942548 |
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| Q |
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303 |
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| |
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|
| T |
27942547 |
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27942465 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 34049642 - 34049904
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
34049742 |
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34049841 |
T |
 |
| Q |
201 |
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263 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34049842 |
caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta |
34049904 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27555440 - 27555153
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
27555356 |
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27555258 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
27555257 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
27555158 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18931783 - 18931482
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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18931684 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
18931683 |
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18931584 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
18931583 |
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18931484 |
T |
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Q |
| |
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|| |
|
|
| T |
18931483 |
ac |
18931482 |
T |
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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 74 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 48873978 - 48873745
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Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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48873879 |
T |
 |
| Q |
174 |
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273 |
Q |
| |
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|
| T |
48873878 |
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48873779 |
T |
 |
| Q |
274 |
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307 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
48873778 |
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48873745 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Original strand, 31937929 - 31938217
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
31937929 |
atgcatatgtttgttagaagtttattaaattttattcccaaatataaaatgttcttgggaataaaaaaaattttccaaggaaaaagggtgggaataaagt |
31938028 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc |
214 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31938029 |
tcccatggagatgagaataaattcataaacagtt-acctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttc |
31938127 |
T |
 |
| Q |
215 |
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304 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31938128 |
ctaaataccttggaataaaattttcatctttaaattccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39498855 - 39498590
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100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |
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|
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atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39498755 |
ggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
39498656 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39498655 |
caaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattc |
39498590 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39502194 - 39501929
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| Q |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |
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| T |
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atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaag |
39502095 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39502094 |
ggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
39501995 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc |
266 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39501994 |
caaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25916080 - 25916295
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25916080 |
atgataggaatgtat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
25916177 |
T |
 |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25916178 |
ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaat |
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T |
 |
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201 |
caaacatatttttcctaa |
218 |
Q |
| |
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| T |
25916278 |
caaacatattttttctaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7258971 - 7258691
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23 |
tgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgg |
122 |
Q |
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7258872 |
T |
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| Q |
123 |
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222 |
Q |
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| T |
7258871 |
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7258773 |
T |
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223 |
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304 |
Q |
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| T |
7258772 |
cttggaataaaattcccatatttatattccaaggaatgttattcctgagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc |
7258691 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51968792 - 51968502
Alignment:
| Q |
16 |
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114 |
Q |
| |
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| T |
51968792 |
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51968693 |
T |
 |
| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
51968692 |
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51968596 |
T |
 |
| Q |
215 |
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308 |
Q |
| |
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||| || |||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
51968595 |
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51968502 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 52469728 - 52469419
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100 |
Q |
| |
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| T |
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52469629 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
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52469530 |
T |
 |
| Q |
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298 |
Q |
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| T |
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52469430 |
T |
 |
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309 |
Q |
| |
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||| ||||||| |
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| T |
52469429 |
acatcctaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36858351 - 36858135
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Q |
| |
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36858253 |
T |
 |
| Q |
186 |
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285 |
Q |
| |
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| T |
36858252 |
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36858154 |
T |
 |
| Q |
286 |
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304 |
Q |
| |
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| T |
36858153 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38414236 - 38414032
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| Q |
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100 |
Q |
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| T |
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38414138 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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38414039 |
T |
 |
| Q |
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207 |
Q |
| |
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| T |
38414038 |
caaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 37014451 - 37014737
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| Q |
22 |
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121 |
Q |
| |
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| T |
37014451 |
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37014550 |
T |
 |
| Q |
122 |
gagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatt |
221 |
Q |
| |
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| T |
37014551 |
aagatgagaataaattcatgtgtaattt-cttactataattcttatttttaagatttct-gaaatattataatgttaaccaaacatcttttttctaaata |
37014648 |
T |
 |
| Q |
222 |
ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaat |
310 |
Q |
| |
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| T |
37014649 |
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37014737 |
T |
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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 47426298 - 47426520
Alignment:
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111 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |
|
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| T |
47426298 |
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47426397 |
T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
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47426489 |
T |
 |
| Q |
212 |
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242 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47426490 |
tttctaaatacctttgaataaaattcccatc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30415932 - 30415743
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
30415932 |
atgataggaatatatatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattcccaaatataaaatgttctttggaatagaaaaaatttcccaaagaaaat |
30415833 |
T |
 |
| Q |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattat |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30415832 |
ggtgggaataaaatttccataaagatgaaaataatttcataaata-attacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38394930 - 38394634
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| Q |
7 |
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105 |
Q |
| |
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||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |
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|
| T |
38394930 |
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38394832 |
T |
 |
| Q |
106 |
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205 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |
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|
| T |
38394831 |
gaataaagttctgatagagatggaaataaattcatgagtaattt-cctattataattcctatttttatggttcccaaaaatattataatattaagcaaac |
38394733 |
T |
 |
| Q |
206 |
atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
| |
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|| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38394732 |
atcttttttctaaataccttgaaataaaattctcatatttatgttctaagaaatattagtcttagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc |
38394634 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 36858436 - 36858634
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| Q |
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atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaat---ttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858436 |
atgcttatgtttgttacaagtttactaaattttatgcccgggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaaattc--aaataaaagggtgggaataaa |
36858533 |
T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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| T |
36858534 |
gttcccatgaagatgagaataatttcatatgtaatt-acatattataatccctatttttatggtttccgggaatattataatgttaaacaaacatatttt |
36858632 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30790518 - 30790270
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gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || || |
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| T |
30790518 |
gggtataaaatgtttctgagaatagaaaagtttttccaatgaaaaggatgggaataaagtttccatgaagatggaaataaaattat-----gtgtaatta |
30790424 |
T |
 |
| Q |
155 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa |
254 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
30790423 |
ttataaattctatttttaaggttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaatactttggaataaatttctcatctttatattccaa |
30790324 |
T |
 |
| Q |
255 |
ggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa |
309 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30790323 |
-gaatgttactcctagaaataaatttgctaaacttgaaacaaacacacccaaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18405764 - 18405592
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119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || |
|
|
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18405665 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataa |
193 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
18405664 |
ttaagatgggaataaatccatgtgta-attacctattataatctctatttttatggttcctagaaatattataa |
18405592 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
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247 |
Q |
| |
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ttacctattataatccttatttttatggttccgaggaatattataaa-ctaaccaaacatgttttttctatatatcttggaataaaattctcatttttat |
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T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
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| | ||| |||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
10401072 |
acttcaaagaatgttatttccagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac |
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Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
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192 |
aaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttga |
291 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| |
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| T |
38414015 |
aaagttaaccaaacatattttttctaaataccttggaattaaattctcatctttatattccaaggaatgttatttctaaaattaaatttggtaaacttga |
38413916 |
T |
 |
| Q |
292 |
aacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |
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| T |
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aacaaacacgccct |
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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
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| |
|
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| T |
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ctatgtttgttacaaggttactaaattttattcctag-tataaaacgttctagagaatagaaaaaaatttcctaaagaaaagggtgggaataaagttccc |
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T |
 |
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119 |
atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaa |
218 |
Q |
| |
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| T |
44309672 |
atgaatatgaaaatttattaatgtgta-attatctgttataatccctatttttagtattctcgagaatattataatgttaaccatacatatttttcctaa |
44309574 |
T |
 |
| Q |
219 |
attccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaaca |
295 |
Q |
| |
|
| | ||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44309573 |
acactttgaaattaaattctcatctttatgttctaagaaatattattcttaaaaataaatttagtaaacttcaaaca |
44309497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48060065 - 48059806
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48060065 |
tatgtttgttacgagtttattaaattttatttttggatataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaataaaatggtgggaataaagttctcat |
48059966 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata-tttttcctaaa |
219 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
48059965 |
aaaaatataaataaattcatatata-attacctattataattcttatttttataattcctagaaatattataaaattaattaaacatatttttttctaaa |
48059867 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt |
280 |
Q |
| |
|
| | | | |||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
48059866 |
tacatcgaaataaaattctcatcattatattctaaaaaatattattcgtaagaataaattt |
48059806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 10400850 - 10400961
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10400850 |
atgatagaaatgtatatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattcttgggtataaaatattcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaatt |
10400949 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
10400950 |
ggtgggaataaa |
10400961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 24805150 - 24805397
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg-gaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24805150 |
tatgtttgttacaaatttactaaattttattttcgggaataaaacatt-ttgggaatagaaaaaatttcacaaagaaaatggtggaaaataaagttccca |
24805248 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatt-------tttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
24805249 |
tgaatatgggaataaatccatgtgta-attacctattatattccctatttttatggtttatggttcccagtaatattataatgttaagcaaacatctttt |
24805347 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt |
262 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24805348 |
ttctaaataccttaaagtaaaattcacatctttatgttccaaggaatgtt |
24805397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12275956 - 12276259
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
12275956 |
atgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgttcttggaaaaagaaatattttcccaaaagaaaa |
12276055 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||| || || | ||||| || |||||| | |||| | ||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
12276056 |
ggtgggaataaaattcccataaaaatgagaaaaagttcatgtgtaacttgcttattaatcgccatattttgaaggtt-atgagaatattttaatgttaac |
12276154 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa-ca |
299 |
Q |
| |
|
| ||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12276155 |
cgaacatatgctttctaaatattttgaaataaaattcacatctttatatt-caaaaaatgttattcctataaataaatttagtaaacttgaaacaaatca |
12276253 |
T |
 |
| Q |
300 |
caccct |
305 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
12276254 |
caccct |
12276259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 36860027 - 36860104
Alignment:
| Q |
227 |
gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36860027 |
gaataaaatttccatttttatgttccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc |
36860104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18094259 - 18094073
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18094259 |
tatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattccaaagaaaatggtgagaataaagttccc |
18094161 |
T |
 |
| Q |
119 |
atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat |
207 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
18094160 |
atgaagatgagaataaattcatgtgta-actacctattataattcatatttttatgattcctaaaaatattataatgttaactaaacat |
18094073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18405224 - 18405129
Alignment:
| Q |
209 |
tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18405224 |
ttttttctaaataccttggaataca-ttcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaagaataaatttggcaaacttaaaacaaacacaccct |
18405129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 307
Target Start/End: Original strand, 25916302 - 25916364
Alignment:
| Q |
246 |
atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt-gaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25916302 |
atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttagaaacaaacacaccctaa |
25916364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52414061 - 52413959
Alignment:
| Q |
197 |
taaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaa |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
52414061 |
taaccaaacatattttttctaattcgcttgaaataaaattcacatctttatattccaagggttgttatttctaagaataaatttggtaaatttgaagcaa |
52413962 |
T |
 |
| Q |
297 |
aca |
299 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
52413961 |
aca |
52413959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Original strand, 32384492 - 32384650
Alignment:
| Q |
55 |
gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| || | || |||| |
|
|
| T |
32384492 |
gggtataaaacgttcatggaaacagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaaattcccataaagattggaacaaatttatgtgcaatt-acct |
32384590 |
T |
 |
| Q |
154 |
attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttt |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
32384591 |
attataatccctaattttatggtttccaggaatattataatgttaagcaaacatactttt |
32384650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Original strand, 13069999 - 13070086
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13069999 |
aaatcaatgtatgttccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtaggtcctacattgattttactcaataaaagagtgagtgt |
13070086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26165374 - 26165155
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165374 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttattcatgaatataaaatgtt-cttagaatagaaaagttttcataaagaaaatagtgagaataaagttcccat |
26165276 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatgagaataaattcataaatagtttacc---tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat-atttttcct |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
26165275 |
taagatgagaataaaattatgtata-attacctattattatattccctatttttaaggttctttgaaatattataatattaaccaaacatctttttttct |
26165177 |
T |
 |
| Q |
217 |
aaattccttggaataaaattcc |
238 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
26165176 |
aaatactttagaataaaattcc |
26165155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22654522 - 22654655
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tcccaaggaaa |
98 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| || ||| |
|
|
| T |
22654522 |
atgatagaaatatacatgcctatgtttattacaagttaactaatttttattctcgggtaaaaaatgttattgcgaatagaaaaactttctccaaaaaaaa |
22654621 |
T |
 |
| Q |
99 |
agggtgggaataaagttcccatggagatgagaat |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
22654622 |
agggtgggaataaagttttcatgaaaatgagaat |
22654655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37296580 - 37296473
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| Q |
154 |
attataatccctattttt-atggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
37296580 |
attataatctctattttttaaggttcttagggatattctaatgttaaccaaacattttttt-------tccttggaataaaattcacatatttatattcc |
37296488 |
T |
 |
| Q |
253 |
aaggaatgttattcc |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
37296487 |
aaggaatgttattcc |
37296473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
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Alignment:
| Q |
155 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa |
254 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||| ||||||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
14796439 |
ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa |
14796340 |
T |
 |
| Q |
255 |
ggaatgttattcctaggaataaattt |
280 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14796339 |
aaaatattattcctaaaaataaattt |
14796314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25719234 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggtttcatttccaaaatgtaggacccacaatgatttaacccaatcagagagtgagt |
25719149 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #66
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| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa |
81 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
54478555 |
tatgtttgttataagtttactaaatttcattcatgggtataaaatgttattggaaatagaa |
54478495 |
T |
 |
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Query Start/End: Original strand, 307 - 394
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2088786 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtggattccatttccaaagtgtagatcctgcattaatttaagctaataaaagagtgagtgt |
2088699 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
197 |
taaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcct |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
54478437 |
taaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcacatatttatatttcaagaaatgctattcct |
54478366 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
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| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||||| || || ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21776968 |
taaaatcaatgtatgtcctaccactttatgtggattttatttccaaaatgtatgacccatatcgatttaattcgatgagagaatgagtgttagagagagt |
21776869 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21776868 |
gtcaaaaagagagtgttgc |
21776850 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 354
Target Start/End: Original strand, 44832522 - 44832569
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtg |
354 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44832522 |
aaattaatgtatgtcccaccattttatgtggattccatttccaaagtg |
44832569 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Original strand, 19447194 - 19447306
Alignment:
| Q |
311 |
caatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagtgtccaa |
407 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||| || | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |
|
|
| T |
19447194 |
caatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaaatgcaggaccgacaatgatttaactcaattagagagtgagtattaaagagagtgttcaa |
19447293 |
T |
 |
| Q |
408 |
aatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |
|
|
| T |
19447294 |
aagagagtgttgc |
19447306 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 39016722 - 39016808
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
39016722 |
aaatcaatgtatgtcccaccattttacgtgggttccatttccaaagtgtagtatctacattgattttacctaataaaagagtaagtg |
39016808 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42862542 - 42862456
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42862542 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtgaaacataaattgatttcacccaataaaagagtgagtg |
42862456 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 304
Target Start/End: Original strand, 47426521 - 47426567
Alignment:
| Q |
258 |
atgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47426521 |
atgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaatcacaccc |
47426567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 16178642 - 16178691
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta |
356 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16178642 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgta |
16178691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30415751 - 30415706
Alignment:
| Q |
256 |
gaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30415751 |
gaatattattcctaagaataaatttagtaatcttcaaacaaacaca |
30415706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 37392591 - 37392895
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392591 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
37392690 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392691 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
37392790 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392791 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
37392890 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
37392891 |
accct |
37392895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 35818469 - 35818773
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818469 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
35818568 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818569 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
35818668 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818669 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
35818768 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
35818769 |
accct |
35818773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 32660978 - 32661285
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagg-aaaa |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32660978 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagggaaaa |
32661077 |
T |
 |
| Q |
100 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661078 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaa |
32661177 |
T |
 |
| Q |
200 |
ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661178 |
ccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
32661277 |
T |
 |
| Q |
300 |
caccctaa |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
32661278 |
caccctaa |
32661285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38364107 - 38363804
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38364107 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag |
38364008 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38364007 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
38363908 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38363907 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
38363808 |
T |
 |
| Q |
301 |
accc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
38363807 |
accc |
38363804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18298138 - 18297836
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18298138 |
atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
18298039 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18298038 |
ggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctaac |
18297939 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18297938 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
18297839 |
T |
 |
| Q |
301 |
acc |
303 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
18297838 |
acc |
18297836 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12710671 - 12710367
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710671 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
12710572 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710571 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
12710472 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710471 |
gaaacatatttttcctacatttcttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
12710372 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
12710371 |
accct |
12710367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25837937 - 25837633
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
25837937 |
atgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttacaaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaaaaaaag |
25837838 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837837 |
ggtggcaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaac |
25837738 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837737 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
25837638 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
25837637 |
accct |
25837633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3050035 - 3049729
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
3050035 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaag |
3049936 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3049935 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagataac |
3049836 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3049835 |
caaacatattttttctaaattccttcgaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
3049736 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
3049735 |
accctaa |
3049729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7931265 - 7930959
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7931265 |
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7931166 |
T |
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101 |
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200 |
Q |
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| T |
7931165 |
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7931066 |
T |
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300 |
Q |
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7931065 |
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7930966 |
T |
 |
| Q |
301 |
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307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
7930965 |
accctaa |
7930959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 26601983 - 26602288
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgg-tataaaatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
26602081 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
26602082 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttagctattataatccctatttttatggttccaaggaatattataaagctaac |
26602181 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
26602182 |
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26602281 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
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||||||| |
|
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| T |
26602282 |
accctaa |
26602288 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 16313552 - 16313856
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
16313652 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaac |
16313751 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
16313752 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
16313851 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
16313852 |
accct |
16313856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 38132782 - 38133087
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
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| T |
38132782 |
atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaggaaaa |
38132881 |
T |
 |
| Q |
100 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
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| T |
38132882 |
gggtgggaataaagttctcatggagatgtgaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
38132981 |
T |
 |
| Q |
200 |
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299 |
Q |
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| T |
38132982 |
ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
38133081 |
T |
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| Q |
300 |
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305 |
Q |
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| T |
38133082 |
caccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42755893 - 42755592
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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|
|
| T |
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atgatagaaatgtatatgcctatgttagttacaagtttactaaaatttattcctttgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
42755794 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
42755793 |
ggtgggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
42755694 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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| T |
42755693 |
caaatatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttcatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
42755594 |
T |
 |
| Q |
301 |
ac |
302 |
Q |
| |
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|| |
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| T |
42755593 |
ac |
42755592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18726664 - 18726967
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
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|
| T |
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18726763 |
T |
 |
| Q |
100 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
| |
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|
| T |
18726764 |
gggtgggaataaagttctcatggagatggaaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
18726863 |
T |
 |
| Q |
200 |
ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
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| T |
18726864 |
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18726963 |
T |
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| Q |
300 |
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303 |
Q |
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| T |
18726964 |
cacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26062170 - 26061866
Alignment:
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
26062170 |
atgatagaaatgtatattcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgtccctgggaatagaaaaaaattcccaagaaaaag |
26062071 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
26062070 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac |
26061971 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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| T |
26061970 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattacaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacac |
26061871 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
26061870 |
accct |
26061866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 1554399 - 1554692
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaag |
1554498 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1554499 |
ggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcatacataatttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaaactaac |
1554598 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatc-tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaa |
293 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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caaccatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa |
1554692 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 10896262 - 10896560
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |
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| T |
10896262 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaaaatc-aagaaaaag |
10896360 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
10896361 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaac |
10896460 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10896461 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
10896560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 41228763 - 41228990
Alignment:
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5 |
taggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtg |
104 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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taggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccgaggaaaagggtg |
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T |
 |
| Q |
105 |
ggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaa |
204 |
Q |
| |
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|
| T |
41228863 |
ggaataaagttcctatggagat-agaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagctaaccaaa |
41228961 |
T |
 |
| Q |
205 |
catatttttcctaaattccttggaataaa |
233 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
41228962 |
catatttttcctaaattccttggaataaa |
41228990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Original strand, 5020543 - 5020843
Alignment:
| Q |
6 |
aggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg |
105 |
Q |
| |
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|||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
5020543 |
aggaatatatatgcatatgtttcttacaagtttactaaagtttactctcgggtataaaatgtttctgtgaatagaaaaattttcccaaggaaaagggtgg |
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T |
 |
| Q |
106 |
gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaac |
205 |
Q |
| |
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| T |
5020643 |
gaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataagtag-ttacctattataatccatatttttatgattccca-gaatattataaagttaaccaaac |
5020740 |
T |
 |
| Q |
206 |
atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
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| T |
5020741 |
atatttttcctaaataccttagaataaaattatcatctttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacact |
5020840 |
T |
 |
| Q |
306 |
aaa |
308 |
Q |
| |
|
||| |
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|
| T |
5020841 |
aaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 21137180 - 21137476
Alignment:
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4 |
ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt |
103 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||| |
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| T |
21137180 |
atagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtttgtgggaatataaatatttttccaaagaaaatggt |
21137279 |
T |
 |
| Q |
104 |
gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa |
203 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21137280 |
ggaaataaagttctcgtggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatccgtatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaa |
21137378 |
T |
 |
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204 |
acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
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|
| T |
21137379 |
acatattttttttaaataccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaaatgttatt-ctagtaataaatttgataaactaaaaacaaacacac |
21137476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 29421534 - 29421839
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
29421534 |
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29421633 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
29421634 |
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29421732 |
T |
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296 |
Q |
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| T |
29421733 |
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29421831 |
T |
 |
| Q |
297 |
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304 |
Q |
| |
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|||||||| |
|
|
| T |
29421832 |
acacaccc |
29421839 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15226970 - 15226684
Alignment:
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21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15226970 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatattcctgcgaatagaaaagatt-cccaaagaaaagggtgggaataaagttcccat |
15226872 |
T |
 |
| Q |
121 |
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220 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
15226871 |
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15226773 |
T |
 |
| Q |
221 |
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309 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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accttgaaataaaattctcatctttatattccaaggaaagttattcctaataataaatttggtaaaattgaaacaaacgcaccctaaaa |
15226684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7317399 - 7317156
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
7317399 |
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7317302 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
7317301 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcgtaaatagtt-acctattataatccctattttcatggttc-taggaatattataaagttaac |
7317204 |
T |
 |
| Q |
201 |
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248 |
Q |
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|
| T |
7317203 |
caaacatatttttcctaaataccttagaataaaattcacatctttata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Original strand, 33444683 - 33444969
Alignment:
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13 |
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112 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |
|
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| T |
33444683 |
tatatgtctatgtttgttacaagtt-actaaattttattcccgg-tataaaatgttcttgggaatagaaaaaattgcccaaagaaaatggtgggaataaa |
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T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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| T |
33444781 |
gttcccatgaagatgaga-taatttcatatgtagtt-acctattagaatcactatttgtatgattgctaggaatattataaagttaaccaaacatatttt |
33444878 |
T |
 |
| Q |
213 |
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303 |
Q |
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| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
33444879 |
ttctaaataccttgaaataaaattttcatctttatattccatgaaatgttattcttatgaataaattcagtaaacttgaaacaaacacacc |
33444969 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 19160798 - 19161095
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13 |
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112 |
Q |
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| T |
19160798 |
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19160897 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata-ttt |
211 |
Q |
| |
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|
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| T |
19160898 |
gttgtcatggagatgagaatgaattcatatgta-attacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataatgctaaccaaacatatttt |
19160996 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaat |
310 |
Q |
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| T |
19160997 |
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19161095 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35394404 - 35394156
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13 |
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112 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35394404 |
tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttctacgtaatagaaaaaaatttccaagaaaaatggtgggaataaa |
35394305 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
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| T |
35394304 |
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35394206 |
T |
 |
| Q |
213 |
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262 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35394205 |
tcttaaataccttggaataaaattctcatctttatatttcaaggaatgtt |
35394156 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 40197226 - 40197402
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| Q |
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gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgga |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttaga |
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T |
 |
| Q |
229 |
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305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
40197326 |
ataaaattcccatctttatattccaaagaatattattcctaggaataaatttggtaaacttgaagcaaacaaaccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 266
Target Start/End: Original strand, 6805700 - 6805936
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33 |
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132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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6805700 |
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6805799 |
T |
 |
| Q |
133 |
aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatt----ccttgga |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6805800 |
aaattcataaatagat-acctattaaaatctctattttcatggttcctgggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatatataccttgga |
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T |
 |
| Q |
229 |
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266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6805899 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Original strand, 43872026 - 43872314
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16 |
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115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
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43872026 |
atgcctatgtttgttacaagtttgttaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatataaatattttttcaaagaaattggtaggaataaagtt |
43872125 |
T |
 |
| Q |
116 |
cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc |
215 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| | ||||||||||| ||||| | |
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|
| T |
43872126 |
catatggagatgggaataaaatcacgtata-attacctattataatccctatttttgaggttccttgaaacattataatgttaaccaaacatcttttttc |
43872224 |
T |
 |
| Q |
216 |
taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43872225 |
taaataccttggaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 31117594 - 31117874
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20 |
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119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31117594 |
ctatgtttgttacgattttattaaattttatttccgaatataaaatgttcttcagaatagaaaaaaatttccaagaaaaagggtgggaataaagttccca |
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T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatat---ttttcct |
216 |
Q |
| |
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| T |
31117694 |
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31117786 |
T |
 |
| Q |
217 |
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304 |
Q |
| |
|
|||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31117787 |
aaatactttgaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaatataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41432766 - 41432464
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
41432766 |
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41432668 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggaga-tgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| |
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|
| T |
41432667 |
ggtggaaataaagttcccatggagattgagaataaattcatgagtaattt-cctattataattcctatttttatggctcccaagaatattataatgttaa |
41432569 |
T |
 |
| Q |
200 |
ccaaac--atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |
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|
| T |
41432568 |
gcaaacatatattttttttaaatgccttggaataaaatttccatctttatgtttcaagaaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaaa |
41432469 |
T |
 |
| Q |
298 |
cacac |
302 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
41432468 |
cacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 16219002 - 16219292
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114 |
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| |
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||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||| | |
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16219002 |
tatgcctatgtttgttacaagtttactagattttattccggggtttaaaacgttctcaggaatagtaaaatttccccaaagaaaagg-tgggaataatct |
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T |
 |
| Q |
115 |
tcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc |
214 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |
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| T |
16219101 |
tcccatgaagatgggaataaatccacgtgtaatt-acctattataatccccattttcatggttcccaagaatattataatgttaaccaaacatctttttt |
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T |
 |
| Q |
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ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
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16219200 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 308
Target Start/End: Original strand, 37981921 - 37982139
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190 |
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| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || || || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
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T |
 |
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taaagctaaccaaacatatttttcct--aaattccttggaataaaa-ttcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaac |
287 |
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| |
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taatgttaagcaaacatcttttttttttaaataccttggaataaaaattctcatctttatgttc-aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaac |
37982118 |
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ttgaaacaaacacaccctaaa |
308 |
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37982119 |
ttgaaacaaacacaccttaaa |
37982139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25899532 - 25899380
Alignment:
| Q |
152 |
ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25899532 |
ctattatattccatatttttaaggttccttggaat--tataatgtcaaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcctatctttatattc |
25899435 |
T |
 |
| Q |
252 |
caaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25899434 |
caaggaatgttattcctaaaaataaatttgttacacttgaaacaaacacacccta |
25899380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 33533585 - 33533741
Alignment:
| Q |
149 |
tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33533585 |
tacctattataattcctatttttaaggttcttgagaatatcataatgttaatcaaacatctttattctaaatacattggaataaaattcacatctttata |
33533684 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33533685 |
ttcaaaggaataatattcctaggaataaatttgacaaacttgaaacaaacacaccct |
33533741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12650137 - 12649859
Alignment:
| Q |
25 |
tttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggag |
124 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||| ||| ||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12650137 |
tttgttacaagattattaaattttatttctgtgtataaaatattcatggaaatagaaaat-ttacgcaaagaaaatagtgggaataaagttcccatgaaa |
12650039 |
T |
 |
| Q |
125 |
atgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct--aaattc |
222 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
12650038 |
atgaaaataaattcacatgtaact-acctattataatctctattttttaagttcctaagaatattataatgttaatcaaacatcttttttttttaaataa |
12649940 |
T |
 |
| Q |
223 |
cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12649939 |
tttgaaataaaattcacatcattgtattacaaggattgttattcgtagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc |
12649859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 14763976 - 14764111
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
14763976 |
atgatagaaatatacatgcatatgtttgtttcaagtttactaaattttattcacgggtataaaatgttcatgagaatagaaaaaaaat-tcaatgaaaaa |
14764074 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatt |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
14764075 |
ggtgggaataaagttcacatgaagatgataataaatt |
14764111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Original strand, 6387618 - 6387736
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6387618 |
taaaatcaatgtatgtcccaccattttatgtgggttccatttccaaagtatacgacccacattgttttaacccaataagagaatgagtgttagagagagt |
6387717 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6387718 |
gtccaaaagggattgttgc |
6387736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 40197121 - 40197232
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
40197121 |
atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttataagtttactaaaatttattctttgatataaaatgtttctgggaatagaaaaaaaatttcaaggaaaaa |
40197220 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
40197221 |
ggtgggaataaa |
40197232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38437478 - 38437369
Alignment:
| Q |
3 |
gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg |
102 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38437478 |
gataggaatacatatatctatgtttgttacaagtttacaaaattttattttcgggtataaaacgttcctgagaatagaaaatttttcccaaagaaaaggg |
38437379 |
T |
 |
| Q |
103 |
tgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
38437378 |
tggaaataaa |
38437369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34672207 - 34672080
Alignment:
| Q |
183 |
gaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt--atattccaaggaatgttattcctaggaataaattt |
280 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
34672207 |
gaatattataaagttaaccaaaaatattttttctaaaaaccttagtataaaatttccatctttttatatttcaaggactgttatttctaaaaataaattt |
34672108 |
T |
 |
| Q |
281 |
agtaaacttgaaacaaacacaccctaaa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34672107 |
gataaacttaaaacaaacacaccctaaa |
34672080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13407447 - 13407329
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13407447 |
taaaatcaatgtatgtcccaccattttaagtgggttctattttcaaagtgtatgacccacattgatttaacccaatgagagaatgagtgttagagagagt |
13407348 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
13407347 |
gttcaaaagagagtgttgc |
13407329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38437353 - 38437203
Alignment:
| Q |
151 |
cctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | || | ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
38437353 |
cctattataattcctatttttatggttcccagaaatactgtagtgttaaacaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaattctcatccttatatt |
38437254 |
T |
 |
| Q |
251 |
ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38437253 |
-aaaaaaatattatttttaagaatgaatttaataaacttgaaacaaacacac |
38437203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25899639 - 25899548
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
25899639 |
ctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttccgggtat-aaatgttcctcggaatagaaaagtttttccaaagaaaatggtgagaataaa |
25899548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35394139 - 35394080
Alignment:
| Q |
246 |
atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35394139 |
atattccaaagaatgttattactaagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct |
35394080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7599543 - 7599456
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
7599543 |
aaatcaatgtatatcccagcactttatgtgggttccttttccaaagtgtaggtcctacattgattttactcaataaaaaagtgagtgt |
7599456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11310487 - 11310412
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11310487 |
aaatcaatgtatgtcccaccatattatgtgaatttcattttcaaagtgtatgacccacgttgatttaattcaataa |
11310412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 304
Target Start/End: Original strand, 41228976 - 41229017
Alignment:
| Q |
263 |
attcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41228976 |
attccttggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc |
41229017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 45265093 - 45265397
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265093 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
45265192 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265193 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
45265292 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265293 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
45265392 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
45265393 |
accct |
45265397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 35488234 - 35488537
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488234 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
35488333 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488334 |
ggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
35488433 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488434 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
35488533 |
T |
 |
| Q |
301 |
accc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
35488534 |
accc |
35488537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44566071 - 44565765
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44566071 |
atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
44565972 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44565971 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
44565872 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44565871 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
44565772 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
44565771 |
accctaa |
44565765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11330019 - 11329715
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11330019 |
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11329920 |
T |
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101 |
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200 |
Q |
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| T |
11329919 |
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11329820 |
T |
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300 |
Q |
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11329720 |
T |
 |
| Q |
301 |
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305 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
11329719 |
accct |
11329715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45045652 - 45045352
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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| T |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
45045552 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
45045453 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
45045452 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatattattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
45045353 |
T |
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| Q |
301 |
a |
301 |
Q |
| |
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| T |
45045352 |
a |
45045352 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27213900 - 27214203
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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ggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctgtttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
27214100 |
caaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
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T |
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| Q |
301 |
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304 |
Q |
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|||| |
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| T |
27214200 |
accc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27248319 - 27248019
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatagttcataggaatattataaagctaac |
27248120 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
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27248020 |
T |
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| Q |
301 |
a |
301 |
Q |
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| T |
27248019 |
a |
27248019 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 9947035 - 9947340
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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| T |
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9947134 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
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9947234 |
T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
| |
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| T |
9947235 |
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9947334 |
T |
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| Q |
300 |
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305 |
Q |
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| T |
9947335 |
caccct |
9947340 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48341388 - 48341085
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgg-tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat |
48341290 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
48341189 |
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48341091 |
T |
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| Q |
301 |
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306 |
Q |
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| T |
48341090 |
acccta |
48341085 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43949271 - 43948967
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
43949271 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
43949172 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
43949171 |
ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
43949072 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
43949071 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaatac |
43948972 |
T |
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| Q |
301 |
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305 |
Q |
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||||| |
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| T |
43948971 |
accct |
43948967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33378868 - 33378556
Alignment:
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Q |
| |
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|
|
| T |
33378868 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca |
33378769 |
T |
 |
| Q |
93 |
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192 |
Q |
| |
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|
| T |
33378768 |
aggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata |
33378669 |
T |
 |
| Q |
193 |
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292 |
Q |
| |
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|
| T |
33378668 |
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33378569 |
T |
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| Q |
293 |
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305 |
Q |
| |
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| T |
33378568 |
acaaacacaccct |
33378556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 34930511 - 34930814
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
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| T |
34930511 |
atgatagaaatgtatatgcctatgttttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaa |
34930610 |
T |
 |
| Q |
100 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
| |
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|
| T |
34930611 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttatctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
34930710 |
T |
 |
| Q |
200 |
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299 |
Q |
| |
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| T |
34930711 |
ccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
34930810 |
T |
 |
| Q |
300 |
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303 |
Q |
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| T |
34930811 |
cacc |
34930814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 25924682 - 25924986
Alignment:
| Q |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
25924682 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctttgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccccaggaaaag |
25924781 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
25924782 |
ggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
25924881 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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| T |
25924882 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcttaggaataaatttggtaaacatgaaacaaacac |
25924981 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
25924982 |
accct |
25924986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38544220 - 38543920
Alignment:
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1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
38544220 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttattacaggtttactaaattttattcccgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttctcaagaaaaat |
38544121 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
38544120 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
38544021 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaac-ttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
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| T |
38544020 |
caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtaaactttgaaacaaaca |
38543921 |
T |
 |
| Q |
300 |
c |
300 |
Q |
| |
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| |
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| T |
38543920 |
c |
38543920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45448968 - 45448665
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
45448968 |
atgataggaatgtagatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag |
45448869 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
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| T |
45448868 |
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45448769 |
T |
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300 |
Q |
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| T |
45448768 |
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45448669 |
T |
 |
| Q |
301 |
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304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
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| T |
45448668 |
accc |
45448665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48314148 - 48313844
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttagaagtttactaaattttattcccggatataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat |
48314049 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
48314048 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatttataaatagttttcctattataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaac |
48313949 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
48313948 |
caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
48313849 |
T |
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| Q |
301 |
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305 |
Q |
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||||| |
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| T |
48313848 |
accct |
48313844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 27419269 - 27419571
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
27419368 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
27419369 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatctctatttttatggtccctaggaatattataaagctaac |
27419468 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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| T |
27419469 |
caaacatattttttctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaagaaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
27419568 |
T |
 |
| Q |
301 |
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303 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
27419569 |
acc |
27419571 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 38396411 - 38396715
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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atgataggaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat |
38396510 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
38396511 |
ggtgggaataaagttcccacggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
38396610 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
38396611 |
caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatc-ttatattccaatgaatgctattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
38396709 |
T |
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| Q |
301 |
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306 |
Q |
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|||||| |
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| T |
38396710 |
acccta |
38396715 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25098095 - 25097796
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
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| T |
25097995 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaac |
25097896 |
T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
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| T |
25097895 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaaaaaatattattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaaca |
25097796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39554209 - 39553910
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
39554209 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
39554110 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
39554109 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
39554010 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacata-tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
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| T |
39554009 |
caaaaatattttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattactaagaataaatttgataaacttcaaacaaaca |
39553910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 8419634 - 8419900
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
8419733 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
8419734 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
8419833 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcc |
267 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8419834 |
caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcc |
8419900 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 28904231 - 28904535
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
28904231 |
atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttataagaaaaag |
28904330 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
28904331 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaac |
28904430 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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| T |
28904431 |
caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
28904530 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
28904531 |
accct |
28904535 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 41632409 - 41632708
Alignment:
| Q |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
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| T |
41632409 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttattacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcttaggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag |
41632508 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
41632509 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcataggaatattataaagctaac |
41632608 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
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|
| T |
41632609 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcaaaggaatgttatt-----gaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
41632703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40212915 - 40212657
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
40212815 |
ggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
40212716 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat |
259 |
Q |
| |
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|
| T |
40212715 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcctaggaat |
40212657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 9814263 - 9814535
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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atgataggaatgtatatg----tgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag |
9814358 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
9814359 |
ggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatctattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaat |
9814458 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaa |
277 |
Q |
| |
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|
| T |
9814459 |
caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattgtcatctttatattccaagaaatgttattcctaggaataaa |
9814535 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44820280 - 44819981
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| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
44820280 |
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44820181 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
44820180 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattatagtccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
44820081 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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| T |
44820080 |
caaatatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattttaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
44819981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 48160636 - 48160921
Alignment:
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1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
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atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc-----------------tgggaagagaaaaaatttcc-aaggaaaat |
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 |
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Q |
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| T |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
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T |
 |
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201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48160818 |
caaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
48160917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 37534163 - 37534447
Alignment:
| Q |
16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534163 |
atgcatatgtttgttacaagtttactaacttttatttccgggtataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt |
37534262 |
T |
 |
| Q |
116 |
cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc |
215 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534263 |
cccatggagatgtgaataaattcataaatagtt-acttattataatccctattattatagttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcc |
37534361 |
T |
 |
| Q |
216 |
taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534362 |
taaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttatttctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacaca |
37534447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 30686052 - 30686336
Alignment:
| Q |
16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30686052 |
atgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaaaggtgggaataaagtt |
30686151 |
T |
 |
| Q |
116 |
cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc |
215 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30686152 |
cctagggagatgggaataaattcataaatagtt-acttattataatcgctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcc |
30686250 |
T |
 |
| Q |
216 |
taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30686251 |
taaataccttgcaataaaattttcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttaaaacaaacaca |
30686336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16825399 - 16825593
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825399 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
16825498 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaag |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825499 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaag |
16825593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18824159 - 18823890
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18824159 |
tatatgcctatgtttgttacaagttcactaaattttattcccgggtataaaatgtttttgggaatagaaaaattttcccaaggaaaaaggtgggaataaa |
18824060 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18824059 |
gtt-ccatggagatgggaataaattcataaata-attacctattataatccctat---------------gaatattataaagttaaccaaacatatttt |
18823977 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18823976 |
tcctaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
18823890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 6656517 - 6656819
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
6656517 |
atgatatgaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt-attttcgagtataaaatgtttctgggaatagaaaagttttcccaatgaaaaa |
6656615 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| |
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|
| T |
6656616 |
tatgggaataaagttcccatggagatgggaataaagtcataaatagtt-acctattataatctatatttttttggttcttagaaatattataaagttaac |
6656714 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg-ttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6656715 |
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6656814 |
T |
 |
| Q |
300 |
caccc |
304 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
6656815 |
caccc |
6656819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45723170 - 45722881
Alignment:
| Q |
6 |
aggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
45723170 |
aggaatatatatgcctatgtttgtcacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaagaaaaatggtgg |
45723071 |
T |
 |
| Q |
106 |
gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaac |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
45723070 |
gaataaagttcccatgaaaatagaaataaattcataaatag-ttacctattataatccatatttttatgatttctaggaatattataaagttaattaaac |
45722972 |
T |
 |
| Q |
206 |
atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
45722971 |
atattttttc---------tggaataaaatttccatctttatatttcaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaataaagacaccct |
45722881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Original strand, 31921811 - 31922075
Alignment:
| Q |
40 |
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139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31921811 |
ctaaattttattcctgagtataaaatgtttgtgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattca |
31921910 |
T |
 |
| Q |
140 |
taaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaat--tc |
237 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
31921911 |
tatatagt---cctattataatgtctatttttatggttcctagaaatattataaagttaaccatacatattttttctaaataccttggaataaaattctc |
31922007 |
T |
 |
| Q |
238 |
ccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31922008 |
ccatatttatattccaaagaatgttattcatggtaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct |
31922075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 25045664 - 25045838
Alignment:
| Q |
3 |
gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg |
102 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25045664 |
gataggaatatatatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcgtaaggaaaaggg |
25045763 |
T |
 |
| Q |
103 |
tgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
25045764 |
tgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-attacatattataatccatattttcatggttc |
25045838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11000711 - 11000483
Alignment:
| Q |
18 |
gcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcc |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11000711 |
gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatattcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcc |
11000612 |
T |
 |
| Q |
118 |
catggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgg-------ttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatt |
210 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
| T |
11000611 |
catgcatatgagaataaattcatatgaag-tcgcctattataatccctatttttatggttcttacttcttaggaatattataaagttaacctaacata-t |
11000514 |
T |
 |
| Q |
211 |
tttcctaaattccttggaataaaattcccat |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11000513 |
tttcttaaatatcttggaataaaatttccat |
11000483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 43445936 - 43446229
Alignment:
| Q |
9 |
aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
43445936 |
aatgtatatgcctatatttgttataagtttactaaattttattctcgaatataaaatgttcatgagaataaaaaagttttcccaaagaaaatggtgggaa |
43446035 |
T |
 |
| Q |
109 |
taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
43446036 |
taaagttctcatggagatgagaataaaattatgtgta-attacctattatatttcctatctttaatgttctttagaatattataatgttaaccaaacata |
43446134 |
T |
 |
| Q |
209 |
tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
43446135 |
ttttt-ctaaataccttaaaataaaattcctatctttatattccgataaatgttattcatagaaatcaatttggtacactttaaacaaacaaaccc |
43446229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45440918 - 45440637
Alignment:
| Q |
16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45440918 |
atgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctcggaatataaaaattttcccaaagaaagtagtgggaataaagtt |
45440819 |
T |
 |
| Q |
116 |
cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc |
215 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
45440818 |
ctcatggagatgggaaaaaaatcatgtata-attacctattataatccctagttttaaggttacttggaatattataatgttaatcaaacatcttttt-t |
45440721 |
T |
 |
| Q |
216 |
taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45440720 |
taaatatcttggaataaaatttacatc--tatattctaagaaatgttattactatgaataaatttggtaaac-tgaaacaaacacac |
45440637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41684067 - 41684278
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
41684067 |
atgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttatttccggatataagatgttcttgggaatagaaaattttgcccaaagaaaag |
41684166 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41684167 |
agtgggaataaagttctcatggagatgaaaataaatttatatgtag-ttacctattataatctctatttttatggttcctataaatattataaaattaac |
41684265 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatattttt |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
41684266 |
caaacatattttt |
41684278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
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Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 22156248 - 22156520
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| Q |
25 |
tttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgga |
123 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
22156248 |
tttgttacaagtttaataaattttaatcccgcgtataaaacgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtaggaataaagttctcataga |
22156347 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcc |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||| || || |
|
|
| T |
22156348 |
gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatggttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatacc |
22156445 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22156446 |
ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 22212163 - 22212435
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| Q |
25 |
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123 |
Q |
| |
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| T |
22212163 |
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22212262 |
T |
 |
| Q |
124 |
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223 |
Q |
| |
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| T |
22212263 |
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22212360 |
T |
 |
| Q |
224 |
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298 |
Q |
| |
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|| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22212361 |
ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac |
22212435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 308
Target Start/End: Original strand, 5543196 - 5543482
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5543196 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttattctctcgtataaaactttcttgggaatagaaattttttcccaaagaaaaatagtgggaataaagttccca |
5543295 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa |
219 |
Q |
| |
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|| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| |
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| T |
5543296 |
tgaagatgggaacaaattcatgtgta-attacctattataatccatatttttatggttcccgggaacattataatgttaagcaaacatcttttttctaaa |
5543394 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa |
308 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5543395 |
tacctt-gaataaaattctcatctttatgtttcaaataatgatattcttagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccctaaa |
5543482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 40385692 - 40385974
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagga-aaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40385692 |
tatgtttgttagaagtttactgaattttattcctgtctataaaatgtttctgggaatagaaaaaatatcccaaaaagaaatggtgggaataaagttccca |
40385791 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa |
219 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
40385792 |
ttaagatggaaataaactcatgtgtaact-acctattataatccatatttttatggttcttaggaatattataatgttaaccaaatatcttttttttaaa |
40385890 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
40385891 |
taccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaaatgttattactaagaataaatttgatacacttgaaagagacacacc |
40385974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6656269 - 6656457
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
6656269 |
atgatatgaatatatatacctatgtttgttataagtttactaaattt-attttcgagtataaaatatttctggaaatagaaaagttttcccaataaaaag |
6656367 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattat |
191 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6656368 |
ggtggaaataaagtttccatggagatgggaataaaatcataaatag-ttacctattataatctgtatttttttggttcctaagaatattat |
6656457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Original strand, 17276355 - 17276508
Alignment:
| Q |
153 |
tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa-ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
17276355 |
tattgtaatccttatttttaaggtttcttggaatattataatgttaaaccaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaatttacatctatatattc |
17276454 |
T |
 |
| Q |
252 |
caaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17276455 |
caaggaatgttattcctagaaataaattttgtaaaattgaaacaaacacaccct |
17276508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 38528764 - 38529012
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
38528764 |
tatatgcttatgtttgttacaagtttactagattttattcttgggtataaaatgttattgggaatagaataaatat--caaagaaaaaggtgagaataaa |
38528861 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||| |
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|
| T |
38528862 |
gttctcatgaagatgagaataaatttatgtgta-attgcatattataatccctatttttaaagtttctcagaatattataatgttaaccaaacat-tttt |
38528959 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt |
265 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38528960 |
ttttaaataagttgaaataaaatttacatttttatattccaagaaatgttatt |
38529012 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31598598 - 31598449
Alignment:
| Q |
152 |
ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31598598 |
ctattataaatcctatttttatgattcccaggtatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatattc |
31598499 |
T |
 |
| Q |
252 |
caaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31598498 |
caagaaatgttattcccaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca |
31598449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 43569773 - 43569966
Alignment:
| Q |
44 |
attttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaa |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43569773 |
attttattcccgggtataaaatattcttcgaaatataaaaatttacctaagaaaaagggtgggaataaaattcacatgaggatgtaaataaattcataaa |
43569872 |
T |
 |
| Q |
144 |
tagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaac--atatttttcctaaattccttggaataaaatt |
236 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
43569873 |
ta-attatctattataatccctatttttatgatttctaaaaatattataaagttaatcaaacatatatttttgttaaataccttagaataaaatt |
43569966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 47246130 - 47246366
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||| | || ||| || |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
47246130 |
ctatgtttgttacaagtttactgaattttattctcaggtataaaatgttcttaggaattg-aattttttttaaaagaaaagggtgagaataaagttccca |
47246228 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat-atttttcctaa |
218 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | | ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47246229 |
tgaatatgagaataaattcatgtgtaaactatctattataatccctatttttaaggt--ctaggagtattataatgttgaccaaacatctttttttctaa |
47246326 |
T |
 |
| Q |
219 |
attccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat |
259 |
Q |
| |
|
|| | || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47246327 |
atacttttgaataaaattcacat-tttatattccaaagaat |
47246366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24539246 - 24539128
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24539246 |
taaaatcaatatatgtcccaccactttatatggattccatttccaaaatgtatgacccacattgatttaacccaatgagagagtgagtgttagagagagt |
24539147 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
24539146 |
gtccaaaagagagtgttgc |
24539128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 255
Target Start/End: Original strand, 10902820 - 10902971
Alignment:
| Q |
104 |
gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||| || | |||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
10902820 |
gggaataaagttcacatgaagatgagaataaattcatgtgtaaactgcctattatgattcatatttttaaggttccaatgaatattataatgttaaccaa |
10902919 |
T |
 |
| Q |
204 |
acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag |
255 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10902920 |
acatctttttcataaataccttgggctaaaattcacatctttatatcccaag |
10902971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Original strand, 17749751 - 17749869
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| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17749751 |
taaaatcaatatatgtcccaccactttatatggatttcatttccaaaatgtatgacccacattgatttaacccaatgagagagtgagtgttagagagagt |
17749850 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
17749851 |
gtccaaaagagagtgttgc |
17749869 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 16916182 - 16916234
Alignment:
| Q |
253 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16916182 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
16916234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 10902695 - 10902779
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| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
85 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10902695 |
atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttttggatataaaatgtttttgggaatagaaaaaa |
10902779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40212669 - 40212625
Alignment:
| Q |
262 |
tattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212669 |
tattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccta |
40212625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 419
Target Start/End: Original strand, 11824130 - 11824242
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt-gtagagagtgtcc |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| ||| | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
11824130 |
aaatcaatgtatgtcccaccattttgtgtagcttcaattttcaaagtgta-aacccacaatgatttaaatcaataagaaagtgagtattagagagtgttc |
11824228 |
T |
 |
| Q |
406 |
aaaatagattgttg |
419 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |
|
|
| T |
11824229 |
aaaagagagtgttg |
11824242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
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| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27888339 |
taaaatcaatgtatgtcccaccactttgtgtgggttcaatttttaaagtgta-gacccacaatgatttaaaccaataagagagtgagtgt |
27888427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Original strand, 45909515 - 45909602
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45909515 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaattgtaggtcctacattgattttacccaataaaagagtgagtgt |
45909602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25428600 - 25428514
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | || |||||||||| | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25428600 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttacatttccaaagtgtagatcctacattgattttatccaataaaagagtgagtg |
25428514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26703561 - 26703475
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26703561 |
aaatcaatgtatgtctcaccactttatgtgggttccatttctaaagtgtaggtcctacatttatttcacccaataaaagagtgagtg |
26703475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 6442224 - 6442308
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| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6442224 |
aaatcaatgtatgttccaccattttgtggggattcaattttcaaagtgta-gacccacaatgatttaaaccaataaaagagtgagt |
6442308 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19494460 - 19494385
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
19494460 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtagatcctacattgatttcacccaataa |
19494385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20601128 - 20601049
Alignment:
| Q |
228 |
aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | |||||||||| | |||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20601128 |
aataaaactcccttatttatattcccaagaataatattcttagaaataagtttaataaacttaaaacaaacacaccctaa |
20601049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30870999 - 30870944
Alignment:
| Q |
243 |
tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
298 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30870999 |
tttatattttaaagaatgttattcttaagaataaatttagtaaatttgaaacaaac |
30870944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 13919839 - 13919925
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13919839 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaatgagtgagtg |
13919925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17354648 - 17354562
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||| || |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
17354648 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttctatttccaaagtgtaggtcctacattgattttacccaataaaaaagtgagtg |
17354562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31598688 - 31598623
Alignment:
| Q |
16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa |
82 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31598688 |
atgcttatatttgttacaagtttactaaattttattacaaggtataaaacgttcct-ggaatagaaa |
31598623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18412235 - 18411929
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412235 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaa |
18412136 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412135 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
18412036 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412035 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
18411936 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
18411935 |
accctaa |
18411929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 4765605 - 4765911
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765605 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
4765704 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765705 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
4765804 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765805 |
caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
4765904 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
4765905 |
accctaa |
4765911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 29543060 - 29543368
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
29543060 |
atgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag |
29543159 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543160 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
29543259 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543260 |
caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
29543359 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaaaa |
309 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
29543360 |
accctaaaa |
29543368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 22935957 - 22936261
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22935957 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
22936056 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936057 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
22936156 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936157 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
22936256 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
22936257 |
accct |
22936261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 11855700 - 11856001
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855700 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
11855799 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11855800 |
ggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac |
11855899 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855900 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
11855999 |
T |
 |
| Q |
301 |
ac |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
11856000 |
ac |
11856001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 19065550 - 19065850
Alignment:
| Q |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065550 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
19065649 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065650 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaac |
19065749 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065750 |
caaacatatattttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
19065849 |
T |
 |
| Q |
301 |
a |
301 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
19065850 |
a |
19065850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 8646436 - 8646735
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8646436 |
atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggttataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
8646535 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8646536 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac |
8646634 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8646635 |
caaacataattttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
8646734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 12970575 - 12970881
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12970575 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcttaaggaaaag |
12970674 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970675 |
ggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattacaatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaac |
12970774 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970775 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
12970874 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
12970875 |
accctaa |
12970881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27481383 - 27481082
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27481383 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatattcctgagaataaaaaatatttcccaaggaaaag |
27481284 |
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| T |
27481083 |
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27481082 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14206866 - 14207173
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
14207166 |
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14207173 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8406920 - 8406614
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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8406621 |
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Q |
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| T |
8406620 |
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8406614 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28602581 - 28602278
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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28602483 |
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101 |
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Q |
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T |
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300 |
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28602283 |
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| T |
28602282 |
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28602278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 555751 - 556053
Alignment:
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1 |
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Q |
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T |
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101 |
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200 |
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| T |
555851 |
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555950 |
T |
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201 |
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300 |
Q |
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556050 |
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Q |
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556051 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6091733 - 6091437
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
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| T |
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109 |
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208 |
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| T |
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6091534 |
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209 |
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305 |
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6091437 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32535963 - 32535659
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
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| T |
32535963 |
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32535864 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
32535863 |
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32535764 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
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| T |
32535763 |
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32535664 |
T |
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| Q |
301 |
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305 |
Q |
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||||| |
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| T |
32535663 |
accct |
32535659 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36703900 - 36703654
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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| T |
36703900 |
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36703801 |
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| Q |
101 |
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200 |
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36703800 |
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36703701 |
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247 |
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| T |
36703700 |
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36703654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27481035 - 27480730
Alignment:
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100 |
Q |
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| T |
27481035 |
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27480936 |
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| Q |
101 |
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200 |
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| T |
27480935 |
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300 |
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| T |
27480837 |
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27480738 |
T |
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308 |
Q |
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| T |
27480737 |
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27480730 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1664754 - 1664456
Alignment:
| Q |
3 |
gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg |
102 |
Q |
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| T |
1664754 |
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1664655 |
T |
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103 |
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202 |
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| T |
1664654 |
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1664556 |
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302 |
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| |
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| T |
1664555 |
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1664456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 42012224 - 42012530
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
42012224 |
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T |
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101 |
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200 |
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| T |
42012324 |
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42012422 |
T |
 |
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294 |
Q |
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| T |
42012423 |
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42012522 |
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302 |
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| T |
42012523 |
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42012530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 309
Target Start/End: Original strand, 43346962 - 43347247
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23 |
tgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgg |
122 |
Q |
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| T |
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tgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaattgtttctggcaatagaaaagtttttccaatgaaaagggtgggaataaagttcccatga |
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T |
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| Q |
123 |
agatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattc |
222 |
Q |
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| T |
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agatgagaataaaattatgcgtaatt-acctattttaatccctatttttaaggttccttcgaatattacattgttaaccaaactttttttttctaaatac |
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T |
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223 |
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309 |
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| T |
43347161 |
cttagaataaacttctcatctttatattccaataaatgttattcctaagaataaatttcgaaaacttgaaacaaacacaccctaaaa |
43347247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20962616 - 20962373
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20962616 |
atgataggaatacacgtgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcggatataaaacgtttctgggaatagaaaatttttcccaaggaaaag |
20962517 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
20962516 |
ggtgggagtaaagttctcatggagatgagaataaattaatgagtaattt-cctattataattcctatttttatggttcccagaaatattataatgttaag |
20962418 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20962417 |
caaacatattttttttaaatgccttggaataaaattcccatcttt |
20962373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36703656 - 36703506
Alignment:
| Q |
153 |
tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
36703656 |
tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttaaattcc |
36703557 |
T |
 |
| Q |
253 |
aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703556 |
aaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacc |
36703506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17251818 - 17251536
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17251818 |
tatgtttgttataattttactaaattttattctcgagtataaaatgttcatgataatagaaaaaatttcccaaagaaaatgatgggaataaagtttccat |
17251719 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc-ctaaa |
219 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
17251718 |
gaagatgaaaataaattcatgtgtaact-atatattataatccctatttttatggttc-taggaatattaaaatgttaaccaaacatctttttatctaaa |
17251621 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17251620 |
taccttggaaaaaaattcctatccttatattccaagaaatgttatt-gtaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaccct |
17251536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6930646 - 6930364
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6930646 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttattttcggatataaaatattattgggaatagaaaaa-tttcccaaagaaaattgtgggaataaagttcccat |
6930548 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat |
220 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6930547 |
gaagatggaaataaatttatatctagtt-atctattataatctctatctgtaaggtttctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttttaaat |
6930449 |
T |
 |
| Q |
221 |
tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6930448 |
accttaaaataaaattctcatcttgatatttcaaggaatgttattcatatgaataaatttgataaacttaaaacaaacacaccct |
6930364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 307
Target Start/End: Original strand, 26637137 - 26637372
Alignment:
| Q |
67 |
ttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatcccta |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
26637137 |
ttcctggaaatagaaaaaatttctgagagaaaagggtg-----aaagttcctatggatatgagaataaattcaaatgtaact-acctattataatccata |
26637230 |
T |
 |
| Q |
167 |
tttt-tatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt |
265 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26637231 |
ttttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacacattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt |
26637330 |
T |
 |
| Q |
266 |
cctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26637331 |
cctaaaaataaatttgataaacttgaaataaacacaccctaa |
26637372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 31583126 - 31583404
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31583126 |
ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaacgttcccaggaatagaaaaaattttccaaagaaaaaggtgggaataaagttccca |
31583225 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| | || || ||||| ||||| |
|
|
| T |
31583226 |
caaagatg-gaaataattcatatgta-agtacctattataatccctatttttacggttcctgagaatattataatgttaaaccaatat-ttttttctaaa |
31583322 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31583323 |
tatcttgaaataatatttccatctttatgtttcaaagaatgttattcgtagaaataaatttagtaaacttaaaacaaacaca |
31583404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 289
Target Start/End: Original strand, 35348590 - 35348858
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35348590 |
ctatgtttgttacaagtttactaaattgtatttt-gggtataaaatgtttttgggaatagaaaat-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttccca |
35348687 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaaca--tatttttccta |
217 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| | ||||| || |
|
|
| T |
35348688 |
tgaagatgagaataaattcacatgta-attacctattataattcatatttttatggttcccgggaatattataatgttaaaaaaacattttttttttctg |
35348786 |
T |
 |
| Q |
218 |
aattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt |
289 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35348787 |
tataccttaaaataaaattctcatctttatgttccaatgaatgttattcttaagaataaatttgataaactt |
35348858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 40275813 - 40276017
Alignment:
| Q |
14 |
atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag |
113 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
40275813 |
atatgtctatgtttgttacaagtttgctaaattttattcccagatatgaaatattcctgggaatagaaaagttttcccaaagaaaatgatgggaataaag |
40275912 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| | || || | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40275913 |
ttcccatgaagatgggaataaaattatctcta-ataacctattaaaatccctatttttaaggttccatggaatattataatattaaccaaacatcttttt |
40276011 |
T |
 |
| Q |
214 |
cctaaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
40276012 |
tctaaa |
40276017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28429591 - 28429446
Alignment:
| Q |
165 |
tatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct-aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta |
263 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28429591 |
tatttttaaggtttctgagaatattataatgttaaccaaacatctttttttttaaatactttggaataaaattcacatctttatatttcaaggaatgtta |
28429492 |
T |
 |
| Q |
264 |
ttcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa |
309 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28429491 |
tttctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa |
28429446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Original strand, 16720910 - 16721029
Alignment:
| Q |
183 |
gaatattataaagctaaccaaacatat---ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatt |
279 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16720910 |
gaatattataatgataatcaaacatatatatttttttaaatatctttgaataaaattcacatttttatattccaatgaatgttattcctaggaataaatt |
16721009 |
T |
 |
| Q |
280 |
tagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16721010 |
tagtaaacttgaaacaaaca |
16721029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 19089782 - 19089888
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| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
19089782 |
tatgtttgttataagtttattaaattttattcttgagtataaaacgtttttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatgatgggtataaagttctcat |
19089881 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatg |
127 |
Q |
| |
|
| ||||| |
|
|
| T |
19089882 |
gaagatg |
19089888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 35602968 - 35603122
Alignment:
| Q |
148 |
ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
35602968 |
ttacctattatataccatatttttaaggttccttggaatattaaaatgttaaccaaacattttttt--taaatactttagaataaaatttctatctttat |
35603065 |
T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35603066 |
attccaaaaaatgttattcctaaaaat-aatttggtacacttgaaccaaacacaccct |
35603122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 149 - 301
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| Q |
149 |
tacctattataatccctatttttat-ggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct--aaattccttggaataaaattcccatcttt |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
36978323 |
taccttttataatccctattttttcaggctcctgtgaatattataatgctaactaaacatgttttttttttaaataccttaaaataaaattctcatattt |
36978422 |
T |
 |
| Q |
246 |
atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36978423 |
atattctaaagaatgttattcctataaataaatttaataaacttgaaacaaacaca |
36978478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
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Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41783685 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattctcggatataaaatgtttctgaaaatagaaaaaagaattcaaagaaaaaggttgggaataaagtttcca |
41783784 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa |
219 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| |||||||| || || ||||||| || |||||||| ||||| | | |||||||||| | || ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
41783785 |
taaagatgtgaacaaattcat-----gtgtaattattatagtcaatatttttaaggttctttgtaatattataatgtaaaacaaacatattttttcaaaa |
41783879 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaa |
254 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
41783880 |
taccttaaaataaaatttacatgtgtatattccaa |
41783914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30899566 - 30899470
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16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30899566 |
atgcttatgtatgttacaagttttctaaattttattcctggatataaaatattcttgggaatagaaacaattttccaaagaaaagggtgagaataaa |
30899470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20962356 - 20962281
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| Q |
231 |
aaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20962356 |
aaaatttccatctttatgttccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttaaaacaaacacatccta |
20962281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30899463 - 30899321
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165 |
tatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat |
264 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |
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|
| T |
30899463 |
tatttttaaggttcgtgagaatataataaagttaaccaaacatcttttttctaaatacattg-aataaatttctcatctttatatttcaaaaaatgttat |
30899365 |
T |
 |
| Q |
265 |
tcct-aggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30899364 |
ttcttaacaataaattttgtaaacttgaaacaaacacatcctaa |
30899321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Original strand, 40276524 - 40276587
Alignment:
| Q |
239 |
catctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40276524 |
catctttatattc-aaggaatgttattaccaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
40276587 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 15200603 - 15200727
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
15200603 |
tatatgtctatgtttgttataaatttattaaattttattctcaggcataaaatgtttctggg-atagaaaaaa-ttcccaaagaaca-ggtgggaataaa |
15200699 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcat |
140 |
Q |
| |
|
|||| || |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15200700 |
attcctataaagataaaaataaattcat |
15200727 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28023840 - 28023719
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag-ttccc |
118 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
28023840 |
ctatatttgttacaagttcattaaattttattctcacatataaaatgtgtttgggaatagaaaaaatttctcaaacaaaagggtgagaataaagtttctc |
28023741 |
T |
 |
| Q |
119 |
atggagatgagaataaattcat |
140 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28023740 |
acgaagatgagaataaattcat |
28023719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13456286 - 13456191
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg-tagagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13456286 |
aaatcaatgtatttcccaccattttatgtgggttccattttcaaagtgtaggacctacattgatttcacctaataaaagagtgagtgctagagagt |
13456191 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42224712 - 42224626
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42224712 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaaagagtgagtg |
42224626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 28429727 - 28429664
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaa |
64 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28429727 |
atgatagaaatatacatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgaatataaaa |
28429664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 307
Target Start/End: Original strand, 6696755 - 6696866
Alignment:
| Q |
197 |
taaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg-ttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaaca |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
6696755 |
taaccaaacacttttttcatattttcctaggaataaaaatcacacctttatattccagggaaagataattcctaggaataaattgtgtatccatgaaaca |
6696854 |
T |
 |
| Q |
296 |
aacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |
|
|
| T |
6696855 |
aacgcaccctaa |
6696866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27901760 - 27901697
Alignment:
| Q |
226 |
ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27901760 |
ggaataaaattcatatctttatattctaaagaatgttgttcttaagaataaattttgtaaactt |
27901697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 26072162 - 26072248
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26072162 |
aaatcaatgtatgtctcaccactttatgtggaattcatttccaaagtgtaggtcccacattgttttcacccaataaaagagtgagtg |
26072248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10142099 - 10142011
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| ||| ||| | |||||||| |||||||| | || ||| | |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10142099 |
taaaatcaatgtatgtcccaccactttgtgttggttccattttcaaagtgtaga-ccaacaattatttaaatcaataagagagtgagtgt |
10142011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10666811 - 10666727
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtga |
390 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | | |||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10666811 |
taaaatcattgtatatcctaccactttatgtgggttccatttttaaattgtaga-ctcacattaatttaaaccaataagagagtga |
10666727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46666735 - 46666429
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666735 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
46666636 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666635 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
46666536 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666535 |
caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
46666436 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
46666435 |
accctaa |
46666429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 20260131 - 20260434
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260131 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
20260230 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260231 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaag |
20260330 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260331 |
caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
20260430 |
T |
 |
| Q |
301 |
accc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20260431 |
accc |
20260434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9115864 - 9115561
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115864 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
9115765 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115764 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
9115665 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115664 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
9115565 |
T |
 |
| Q |
301 |
accc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
9115564 |
accc |
9115561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36361809 - 36361504
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36361809 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
36361710 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36361709 |
gg-gggaataaagttcccatggagatgagagtaaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaac |
36361611 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36361610 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatttttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
36361511 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
36361510 |
accctaa |
36361504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2430523 - 2430223
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430523 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
2430424 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2430423 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac |
2430325 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430324 |
caaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaacgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
2430225 |
T |
 |
| Q |
301 |
ac |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
2430224 |
ac |
2430223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 52630800 - 52630496
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
52630800 |
atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaagaaaag |
52630701 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52630700 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
52630601 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52630600 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
52630501 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
52630500 |
accct |
52630496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14788747 - 14788446
Alignment:
| Q |
4 |
ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt |
103 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
14788447 |
ct |
14788446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8332041 - 8331737
Alignment:
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100 |
Q |
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| T |
8331741 |
accct |
8331737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12190222 - 12190526
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
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200 |
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12190521 |
T |
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301 |
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Q |
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| T |
12190522 |
accct |
12190526 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25789790 - 25789487
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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T |
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25789491 |
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Q |
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| T |
25789490 |
accc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32824946 - 32824643
Alignment:
| Q |
4 |
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102 |
Q |
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| T |
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32824847 |
T |
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| Q |
103 |
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Q |
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| T |
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32824747 |
T |
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| Q |
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302 |
Q |
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| T |
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32824647 |
T |
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| Q |
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Q |
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| T |
32824646 |
ccta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39930484 - 39930181
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
39930384 |
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| Q |
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300 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
| |
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|||| |
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| T |
39930184 |
accc |
39930181 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 9831915 - 9832216
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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9832014 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
9832015 |
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9832114 |
T |
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300 |
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| T |
9832115 |
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9832214 |
T |
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302 |
Q |
| |
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| T |
9832215 |
ac |
9832216 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6911520 - 6911206
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Q |
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| T |
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6911421 |
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192 |
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| T |
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6911221 |
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307 |
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| T |
6911220 |
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6911206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2632876 - 2632573
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
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| T |
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2632678 |
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303 |
Q |
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| T |
2632677 |
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| T |
2632577 |
ctaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 1597387 - 1597689
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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| T |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaatttttccaagaaaaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
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| T |
1597487 |
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1597586 |
T |
 |
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201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
1597587 |
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1597686 |
T |
 |
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301 |
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303 |
Q |
| |
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||| |
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| T |
1597687 |
acc |
1597689 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 50190814 - 50191115
Alignment:
| Q |
5 |
taggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtg |
104 |
Q |
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| T |
50190814 |
taggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaaggtg |
50190913 |
T |
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| Q |
105 |
ggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaa |
204 |
Q |
| |
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| T |
50190914 |
ggaataaagttcccatgaagatg-gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaatcaaa |
50191012 |
T |
 |
| Q |
205 |
catatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
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| T |
50191013 |
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50191112 |
T |
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305 |
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307 |
Q |
| |
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||| |
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| T |
50191113 |
taa |
50191115 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 51445133 - 51445424
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9 |
aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa |
108 |
Q |
| |
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| T |
51445133 |
aatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcttag-tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa |
51445231 |
T |
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| Q |
109 |
taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata |
208 |
Q |
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| T |
51445232 |
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51445331 |
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301 |
Q |
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51445332 |
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51445424 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 4683419 - 4683724
Alignment:
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Q |
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4683518 |
T |
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200 |
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T |
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300 |
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4683717 |
T |
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307 |
Q |
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| T |
4683718 |
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4683724 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 5518549 - 5518854
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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5518747 |
T |
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300 |
Q |
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| T |
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5518847 |
T |
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| Q |
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307 |
Q |
| |
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||||||| |
|
|
| T |
5518848 |
accctaa |
5518854 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 38964724 - 38965027
Alignment:
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100 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
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38964923 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
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caaagatatatttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacac |
38965023 |
T |
 |
| Q |
301 |
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304 |
Q |
| |
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|||| |
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|
| T |
38965024 |
accc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3572610 - 3572841
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Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
| |
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|
| T |
3572710 |
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3572809 |
T |
 |
| Q |
201 |
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232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
3572810 |
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3572841 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39329635 - 39329347
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39329435 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 5806336 - 5806628
Alignment:
| Q |
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Q |
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|
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5806428 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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5806520 |
T |
 |
| Q |
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300 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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5806620 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 32202395 - 32202660
Alignment:
| Q |
38 |
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Q |
| |
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||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
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32202494 |
T |
 |
| Q |
138 |
cataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattc |
237 |
Q |
| |
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|
| T |
32202495 |
cataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattc |
32202594 |
T |
 |
| Q |
238 |
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303 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32202595 |
tcatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc |
32202660 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13653878 - 13653581
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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atgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaat |
13653779 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13653778 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagttaac |
13653680 |
T |
 |
| Q |
201 |
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298 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13653679 |
caaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
13653581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35187483 - 35187181
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35187483 |
atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcgtgggaatagaaaaaatttcccaaggagaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35187383 |
ggtgggaataaagttcccatggagataagaataagttcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaaactaac |
35187284 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaac-ttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
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|
| T |
35187283 |
caaacatatatttcctaaattctttagaataaaatttccatctttatatttcaagaaatattattcctaagaataaatttggtaaactttgaaacaaaca |
35187184 |
T |
 |
| Q |
300 |
cac |
302 |
Q |
| |
|
||| |
|
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| T |
35187183 |
cac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 48916067 - 48916375
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |
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|
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48916067 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattttcgggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaagataag |
48916166 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
48916167 |
gatgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatatgtag-ttgcctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagttaac |
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T |
 |
| Q |
201 |
caaacata-tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48916266 |
caaacatatttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatattctaaggaatgttattcctaagaataaatttgataaacttgaaacaaaca |
48916365 |
T |
 |
| Q |
300 |
caccctaaaa |
309 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
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| T |
48916366 |
cactctaaaa |
48916375 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 37436666 - 37436966
Alignment:
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1 |
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Q |
| |
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|
| T |
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atgataggaatgtatatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattttcggatataaaatgttactgagaatagaaaat-tttcccaaagaaaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
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|
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T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37436864 |
caaacatatttttcctaaacaccttgaaataaaatttccatatttatattccaaggaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
37436963 |
T |
 |
| Q |
301 |
acc |
303 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
37436964 |
acc |
37436966 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6978797 - 6978550
Alignment:
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1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
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| |
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| T |
6978797 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttcgtataaaatgtttcagggaatagaaaaaatttctcaaggaaaag |
6978698 |
T |
 |
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ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
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Q |
| |
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|
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6978697 |
ggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagctaac |
6978598 |
T |
 |
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248 |
Q |
| |
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|
| T |
6978597 |
caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttata |
6978550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 52699511 - 52699799
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
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52699511 |
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52699610 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
52699611 |
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52699709 |
T |
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201 |
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290 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
52699710 |
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52699799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29091681 - 29091392
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
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| T |
29091681 |
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29091582 |
T |
 |
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
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|
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| T |
29091581 |
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29091488 |
T |
 |
| Q |
213 |
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308 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29091487 |
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29091392 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47031758 - 47031580
Alignment:
| Q |
129 |
gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgga |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47031758 |
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47031659 |
T |
 |
| Q |
229 |
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307 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47031658 |
ataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
47031580 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 74 - 263
Target Start/End: Original strand, 49823014 - 49823203
Alignment:
| Q |
74 |
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173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49823014 |
gaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgataataaattcataaataatttacctattataatccctatttttat |
49823113 |
T |
 |
| Q |
174 |
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263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49823114 |
ggttcctaggaatattataaacctaaccaaacatattttttctaaattccatggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta |
49823203 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46960646 - 46960351
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
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|
| T |
46960646 |
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46960547 |
T |
 |
| Q |
109 |
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207 |
Q |
| |
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| T |
46960546 |
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46960449 |
T |
 |
| Q |
208 |
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305 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
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| T |
46960448 |
tttttttctaaatatcttggaataaatttctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttgataaatttgaaacaaacacaccct |
46960351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 1227936 - 1228225
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1227936 |
atatgcctatgcttgttacaagtttattaaattttattttcaggtataaaatgtttcttggaatagaaaagatttccgaaagaaaaggtcgggaataaag |
1228035 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttt |
213 |
Q |
| |
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|||||||| |||| |||||||| | || | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| |
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| T |
1228036 |
ttcccatgaagattagaataaaattatgtagaatt-acctattataatccctatttttaaggttccttgaaatattataaagttcaccaaacatattttt |
1228134 |
T |
 |
| Q |
214 |
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302 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1228135 |
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1228225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47037484 - 47037324
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47037484 |
atgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
47037385 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataat |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47037384 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataat |
47037324 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47677648 - 47677368
Alignment:
| Q |
23 |
tgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgg |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47677648 |
tgtttgttataaatttactaaattttatttccgggtataaaatgttccattgaatagaaaagttttcccaaaggaaaggatgggaataaagttcccatga |
47677549 |
T |
 |
| Q |
123 |
agatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattc |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | || || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47677548 |
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47677450 |
T |
 |
| Q |
223 |
cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
47677449 |
cttggaataaaattctcatctttatattccaagaaattttattcctaagaataaatttcataaactttaaataaacacaccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 24116400 - 24116684
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24116400 |
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24116499 |
T |
 |
| Q |
121 |
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220 |
Q |
| |
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| ||||||||||| ||| || || || |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||| || |
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|
| T |
24116500 |
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24116598 |
T |
 |
| Q |
221 |
tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta |
306 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24116599 |
accttgaaataaaattctcatctttatattctaaggaatgttattcttaagaataaatttgttaaacttaaaacaaacacacccta |
24116684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Original strand, 38519122 - 38519411
Alignment:
| Q |
16 |
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114 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
38519122 |
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38519219 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc |
214 |
Q |
| |
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||||||| | || || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |
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| T |
38519220 |
tcccatgaa-attaggaaaaattcatgtataaattacctattataatccctatttttatggtttccaagaatattataatgttaaacaaacatctttttt |
38519318 |
T |
 |
| Q |
215 |
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307 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38519319 |
ctaaatacattggaataaaattttcatttttatgttccaaaaaatgttattcctacgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaacctaa |
38519411 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30241036 - 30240782
Alignment:
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
30241036 |
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30240938 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30240937 |
agtgagaataaagttctcatgaagatgagaataaatttatatgtaatt-acctattataatccctacttttatggttcttaggaatattataaagttaac |
30240839 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30240838 |
caaacatattttt--ttaaatatttggaataaaatttccatttttatatttcaaggaat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Original strand, 17475368 - 17475658
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
17475368 |
gatagaaatatatatgtttatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaataaataaaatttcccaaagaaaagag |
17475467 |
T |
 |
| Q |
103 |
tgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacca |
202 |
Q |
| |
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||||||||||||||| || |||||| || |||||| || || || ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||| || |
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| T |
17475468 |
tgggaataaagttccaatagagatgggagtaaatt-----attgtgta--------aatacctatttttatagttcccgggaatatcataatgttaagca |
17475554 |
T |
 |
| Q |
203 |
aacat-atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17475555 |
aacatctttttttctaaataccttggaataaaatttccatttttattttccatagaatgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacgaacaca |
17475654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25474107 - 25473978
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176 |
ttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25474107 |
ttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata |
25474008 |
T |
 |
| Q |
276 |
aatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25474007 |
aatttgataaacttgaaacaaacacaccct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48462475 - 48462258
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| |
|
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|
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aaaatttccgaag-aaaaggatgggtataaagttcccatggaattgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccttatttttatggttccta |
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T |
 |
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ggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattta |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |
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|
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48462377 |
caaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaa-tatttggaatataattctcatctttatactccaaagaatgttattcataaaaataaatttg |
48462279 |
T |
 |
| Q |
282 |
gtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
48462278 |
ataaacttaaaacaaatacac |
48462258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 31806801 - 31807093
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
31806801 |
atgatagaaatatacatgcttatgtttgttac--gtttactaaattttattctcgaacataaaacgttcctgggaatagaaaaaaattcccaaataaaag |
31806898 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
31806899 |
ggtggaaataaagttcccatgaagatgagaacaaattcatgtgta-attatctattata------atttttatggttcccgcaaatattataatgttaag |
31806991 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31806992 |
caaacatattttttctaaataccttagaataaaattttcatctttatgttccaagaaatattattcttagaaataaatttgatcaacttgaaataaacac |
31807091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 13931942 - 13932218
Alignment:
| Q |
14 |
atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13931942 |
atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcct-ggaatagaaatgttttcctaaagaaaagggtgggaataaat |
13932040 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata--ttt |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| | || || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13932041 |
ttccc------atgaaaataaaattatgtgta-attacctattataat-cctatttttaaggttcc-----atactataaaattaaccaaacatattttt |
13932127 |
T |
 |
| Q |
212 |
ttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13932128 |
tttctgaataccttgaaataaagtttccatctttatatttcaatgaatgttattccttgaaataaatttgataaacttgaaacaaacacac |
13932218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13521348 - 13521053
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13521348 |
atgatagaaatatacatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaag |
13521249 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
13521248 |
ggtggaaataaagtttccagaaagatgagaataaa-tcaggtgta-actatttattataatccctattcttaaggttccggggaatattatagtgttcac |
13521151 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13521150 |
gaaacaccttttttctaaa-tacttgaaataaaattcacatctttatattctagtgaatgttatttttaagaataaatttggtaaacttaaatcaaaca |
13521053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19083150 - 19083285
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19083150 |
atgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaaag |
19083249 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaat |
136 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
19083250 |
ggtggaaataaagtttccaggcatatgagaataaat |
19083285 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19131038 - 19131173
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19131038 |
atgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaaag |
19131137 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaat |
136 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
19131138 |
ggtggaaataaagtttccaggcatatgagaataaat |
19131173 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29769526 - 29769230
Alignment:
| Q |
14 |
atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa-gggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29769526 |
atatgtctatgtttgttacaaaattactaaattttattctttgacataaaatgttcctggcaatagaacaattttcctaaagaaaaagggtgggaataaa |
29769427 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||||| | |||||||||| | |||| |||||| |||| |
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|
| T |
29769426 |
gtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-attacctattataatctatgtttctaaggttccttgaaatattataatgttaactaaacatttttt |
29769328 |
T |
 |
| Q |
213 |
---tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt-----cctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29769327 |
ttcttctaaatatcttgaaataaaattcacatctttatattccaaagaatgttattattcatataagaataaatttagtaaacttaaaacaaacacac |
29769230 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 9011206 - 9011511
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | || |||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
9011206 |
atgataggaatatacatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattttcgg-tataaaaggtttcgtgagaatcgaaaatttttcccaaagaaaa |
9011304 |
T |
 |
| Q |
100 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
9011305 |
gggtcggaataaagttcccatagtggtgggaataaattcatgagtaattt-cctattataattcttatttt-atggtctccaggaatattataatgttaa |
9011402 |
T |
 |
| Q |
200 |
ccaaacatatttttc---ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaa |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| | || ||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
9011403 |
gcaaacatttttttttttctaaatactttagaagaaaattttcatctttatgttccgaggaatattattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaa |
9011502 |
T |
 |
| Q |
297 |
acacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
9011503 |
acacaccct |
9011511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13440422 - 13440186
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa-aaaatttcccaaggaaaa |
99 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
13440422 |
atgatagaaatataaatgactatgtttgttagaattttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaattccaaagaaaa |
13440323 |
T |
 |
| Q |
100 |
gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| | | | |
|
|
| T |
13440322 |
gggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcatatgta-actacctattataatccatattcttaaagttccatggaatattataatgttca |
13440224 |
T |
 |
| Q |
200 |
ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattc |
237 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
13440223 |
ccgaacaccttttttctaaatatcttgaaataaaattc |
13440186 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1007672 - 1007566
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| Q |
126 |
tgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcctt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
1007672 |
tgagaataaattcataaatagtt-acctattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagttaatcaaacatatttttcctaaatacttt |
1007574 |
T |
 |
| Q |
226 |
ggaataaa |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
1007573 |
ggaataaa |
1007566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 11014486 - 11014626
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| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | || |||||| |
|
|
| T |
11014486 |
atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttaataaattatattcacggatataaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttcaaaagaaaag |
11014585 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcata |
141 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11014586 |
ggtggaaataaagttctcatgaagatgagaataaattcata |
11014626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1007774 - 1007663
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
1007774 |
atgatatgaatatatatgtctaggtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaattttaccaagaaaaag |
1007675 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |
|
|
| T |
1007674 |
ggtgagaataaa |
1007663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3939486 - 3939225
Alignment:
| Q |
40 |
ctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattca |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3939486 |
ctaaattttattcctggaaatgaaatattattgggaatagaaaaaaattccaaag-aaaagtgtaggaatcaagtttccattaagatgagaataaattca |
3939388 |
T |
 |
| Q |
140 |
taaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattccc |
239 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
3939387 |
tacatggtt-acctattataatctatatttttaag-ttccttaaaatattataatgttaatcaaacatgttttttttaaatatcttaaaataaaattcac |
3939290 |
T |
 |
| Q |
240 |
atctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc |
304 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3939289 |
ttttttatattccaaagaatgttattcctaaaaatatatttgataaacttaaaacaaacacaccc |
3939225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49627454 - 49627301
Alignment:
| Q |
149 |
tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt-tcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49627454 |
tacctattataatccatatttttatggttctttgaaatattataatgttaaccaaacattttttcttttaaatactctacaataaaattcccatctttat |
49627355 |
T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49627354 |
attccaagaaatgttattcttaaaaataaatttggtaaatttgaaacaaacaca |
49627301 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37261699 - 37261546
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148 |
ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
37261699 |
ttacctattataatccatatttttaacgttctttggaatattataatattaaccaaacatcttttttctaaatatctaagaataaaattcacatatttat |
37261600 |
T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37261599 |
attccaatgaatgttaatcataaaaataaatttgataaacttgaaacaaacaca |
37261546 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 20505034 - 20505213
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1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaat---agaaaaaatttcccaaggaa |
97 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
20505034 |
atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataaaatattcctgggaataagaaaaaaaaattaccaaagaa |
20505133 |
T |
 |
| Q |
98 |
aagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttc |
178 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20505134 |
aaaggtgaaaataaagcttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacatattataatccctatttttatggttc |
20505213 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 307
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209 |
tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45771911 |
ttttttctaaataccttggaataaaattctcacctttatgttccaagaaaggttattcatgggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
45771813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13114793 - 13114675
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13114793 |
taaaatcaatatatgtcccaccactttatatggattccatttccaaaatgtataacccacattgatttaacccaatgagatagtgagtgttagagagagt |
13114694 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaatagattgttgc |
420 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
13114693 |
gtccaaaagagagtgttgc |
13114675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 19923655 - 19923815
Alignment:
| Q |
148 |
ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19923655 |
ttacctattataatccctacttttttggttctcaaaaacattataatgttaaacaaacatattttttctaaatatcttagaataaaattctcatctttat |
19923754 |
T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa |
308 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19923755 |
gttctaagaaatgttatttctaaaaataaatttgatgaacttaaaacaaacacaccataaa |
19923815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37726859 - 37726804
Alignment:
| Q |
251 |
ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37726859 |
ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtgaacttgaaacaaacacacccta |
37726804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 303
Target Start/End: Original strand, 52186265 - 52186344
Alignment:
| Q |
224 |
ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
52186265 |
ttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattccttaaaataaatttggtaaacttaaaacaaatacacc |
52186344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 212
Target Start/End: Original strand, 37336514 - 37336699
Alignment:
| Q |
26 |
ttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaga |
125 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||| || | || |
|
|
| T |
37336514 |
ttgttacaagtttactaaattttattctcagatataaaatattattgggaatagaaatttctttccaaagaatagagtgggaataaagttttcacgaagg |
37336613 |
T |
 |
| Q |
126 |
tgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37336614 |
agagaataaattcatgtata-attacctattataatctctatttttatggtttcttaaaatattaaaatgttaaccaaacatgtttt |
37336699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 52186091 - 52186262
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
52186091 |
atgatagaaatatatatgtctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgacgataaaatgtttctgggaatagaaa-----------------g |
52186173 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatatta |
190 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
52186174 |
ggtgggaattaagttcacattgagatgtgaataaatttctacatagtt-acctattataatttctatttttatggtttctaagaatatta |
52186262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 289
Target Start/End: Original strand, 45813603 - 45813727
Alignment:
| Q |
165 |
tatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat |
264 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| | |||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
45813603 |
tattcttaaggttctttggaatattataatcttaacaaaatatcttttttctaaataccttaaaataaaattcacatctttatatttcaatgaatgttat |
45813702 |
T |
 |
| Q |
265 |
tcctaggaataaatttagtaaactt |
289 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
45813703 |
tcctaagaataaatttgataaactt |
45813727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37261859 - 37261734
Alignment:
| Q |
16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaat-aaagt |
114 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
37261859 |
atgcatatgtttgttacaagtttattaaattttattccc-gacataaaatctttttgggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaggttgagaataaaagt |
37261761 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcccatggagatgagaataaattcata |
141 |
Q |
| |
|
|| || | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37261760 |
tctcacgaagatatgaataaattcata |
37261734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 13048461 - 13048578
Alignment:
| Q |
148 |
ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13048461 |
ttacctattataatccttatttttagtgttcctgagaatattatcatgttaagcaaacatattttctttaaataccttagcataaaattcctttctttat |
13048560 |
T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttatt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13048561 |
gttccaagaaatgttatt |
13048578 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 13053458 - 13053575
Alignment:
| Q |
148 |
ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13053458 |
ttacctattataatccttatttttagtgttcctgagaatattatcatgttaagcaaacatattttctttaaataccttagcataaaattcctttctttat |
13053557 |
T |
 |
| Q |
248 |
attccaaggaatgttatt |
265 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13053558 |
gttccaagaaatgttatt |
13053575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45772088 - 45771963
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctg-----ggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||| || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
45772088 |
tatgtttgttataagtttattaaattttatttctggatataaaacgttcgtgtcatgggaatagaaaattttttccaaagaaaatggtgggaataaaaat |
45771989 |
T |
 |
| Q |
116 |
cccatggagatgagaataaattcata |
141 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45771988 |
ttcatgaagatgagaataaattcata |
45771963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 405
Target Start/End: Original strand, 11135798 - 11135897
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg-tagagagtgtcc |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
11135798 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaaagagtgagtgctagagagagtcc |
11135897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 49822962 - 49823009
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaatttt |
48 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
49822962 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt |
49823009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 41918054 - 41918140
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41918054 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtggattccattttcaaagtgtaggtcctacattgattttacccaataaaagagtgagtg |
41918140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41948269 - 41948181
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41948269 |
taaaatcaatgtatattctaccactttgtgttggttcaattttcaaagtgta-aatccacaatgatttaaatcaataagagagtgagtgt |
41948181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Original strand, 49824022 - 49824067
Alignment:
| Q |
255 |
ggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49824022 |
ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
49824067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14094122 - 14094035
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
14094122 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcactcaatcaaaaagtgagtgt |
14094035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19094122 - 19094007
Alignment:
| Q |
19 |
cctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19094122 |
cctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttctagatataaaatgttcctgataatgaaataacattcccaaagaaaactgtgggaataaagttccc |
19094023 |
T |
 |
| Q |
119 |
atggagatgagaataa |
134 |
Q |
| |
|
||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
19094022 |
atgaatatgaaaataa |
19094007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 137
Target Start/End: Original strand, 33702459 - 33702524
Alignment:
| Q |
72 |
gggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatt |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33702459 |
gggaatagaaaaaatttcccgaataaaaaggtgagaataaaattcccatgacgatgagaataaatt |
33702524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50424989 - 50424912
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
50424989 |
taaaatcaatccataccccaccactttatgtaagttccatttccaaagtgtatgacccacattgatttaacccaataa |
50424912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 52276930 - 52276877
Alignment:
| Q |
16 |
atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcct |
71 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52276930 |
atgcctatatttgttacaagtttactaaattttatt--cggatataaaatgttcct |
52276877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 11430500 - 11430585
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| || || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11430500 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgaattcac-caataaaagagtgagtg |
11430585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
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| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt |
401 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15660950 |
taaaatcaatgcatgtcccaccactttatgcgggttttatttccaaaatgtatgac--acattgatttaacccaataatagagtgagtgttagagagagt |
15661047 |
T |
 |
| Q |
402 |
gtccaaaa |
409 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
15661048 |
gtccaaaa |
15661055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
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| Q |
342 |
catttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataaga |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30867557 |
catttctaaagtgtagaacccacattgatttaacctaataaga |
30867515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11078050 - 11077949
Alignment:
| Q |
33 |
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132 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
11078050 |
aagtttattaaattttatttctggatataacatgtttttgggaatagaaaaattttccaaaaaaaaaaggtgaacataaagttcccattaaaatgagaat |
11077951 |
T |
 |
| Q |
133 |
aa |
134 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
11077950 |
aa |
11077949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 28109927 - 28109975
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta |
356 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28109927 |
aaatcaatgcatgttccaccattttatgtgggttccatttc-aaagtgta |
28109975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30679034 - 30678946
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
30679034 |
taaaatcaatgtatgtcccaccactttgtgtgggttcaattttcaaagtgtaga-ctcacaatgatttaagccaataagagagtgagtgt |
30678946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 41958142 - 41958226
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| || || ||| |||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41958142 |
aaatcaatgtatgtcccaccattttgtgggggttcaattttcaaagtgtaga-cccacagtgatttaaaccaataagagagtgagt |
41958226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 8476353 - 8476659
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476353 |
atgattggaatgtatatgcctgtgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
8476452 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476453 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
8476552 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476553 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
8476652 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
8476653 |
accctaa |
8476659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26849048 - 26848742
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26849048 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaag |
26848949 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26848948 |
ggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac |
26848849 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26848848 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
26848749 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
26848748 |
accctaa |
26848742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 11239165 - 11239469
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239165 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
11239264 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239265 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
11239364 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239365 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
11239464 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
11239465 |
accct |
11239469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 33217958 - 33218266
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33217958 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttattaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
33218057 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33218058 |
ggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac |
33218157 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33218158 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
33218257 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaaaa |
309 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
33218258 |
accctaaaa |
33218266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40908291 - 40907988
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908291 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
40908192 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40908191 |
ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac |
40908093 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908092 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
40907993 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
40907992 |
accct |
40907988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 47114902 - 47115202
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
47114902 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaag |
47115001 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47115002 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
47115101 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
47115102 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
47115201 |
T |
 |
| Q |
301 |
a |
301 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
47115202 |
a |
47115202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 48339810 - 48340106
Alignment:
| Q |
9 |
aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
48339810 |
aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa |
48339909 |
T |
 |
| Q |
109 |
taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata |
208 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48339910 |
taaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata |
48340009 |
T |
 |
| Q |
209 |
tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48340010 |
tttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattctaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
48340106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 20414510 - 20414812
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20414510 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttataaatttactaaattttattcccgggtataaaatgttcttggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaag |
20414609 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20414610 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaat |
20414709 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
20414710 |
caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
20414809 |
T |
 |
| Q |
301 |
acc |
303 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
20414810 |
acc |
20414812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 6231546 - 6231851
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaatgaaaat |
6231645 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
6231646 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
6231745 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
6231746 |
caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
6231845 |
T |
 |
| Q |
301 |
acccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6231846 |
acccta |
6231851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31611030 - 31611330
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
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|
| T |
31611030 |
atgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag |
31611129 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
31611130 |
ggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
31611229 |
T |
 |
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201 |
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300 |
Q |
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31611329 |
T |
 |
| Q |
301 |
a |
301 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
31611330 |
a |
31611330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46359978 - 46359674
Alignment:
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Q |
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|
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46359879 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
46359878 |
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46359779 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
46359778 |
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46359679 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
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||||| |
|
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| T |
46359678 |
accct |
46359674 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44952334 - 44952028
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
44952235 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttccta-ggaatattataaagctaa |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
44952234 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatg-ttcctaaggaatattataaagttaa |
44952136 |
T |
 |
| Q |
200 |
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299 |
Q |
| |
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| T |
44952135 |
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44952036 |
T |
 |
| Q |
300 |
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307 |
Q |
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|||||||| |
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| T |
44952035 |
caccctaa |
44952028 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1099224 - 1098923
Alignment:
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100 |
Q |
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||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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atgatagaaatgtatatccctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
1099124 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-tttacctattataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctagc |
1099026 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
1099025 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
1098926 |
T |
 |
| Q |
301 |
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303 |
Q |
| |
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||| |
|
|
| T |
1098925 |
acc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 28124481 - 28124779
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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| T |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctcggaatataaaaaatttcccaaggaaaag |
28124580 |
T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
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| T |
28124581 |
ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacatattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaac |
28124680 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
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| T |
28124681 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatatttatattccaaggaatgttaatcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
28124779 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 9320493 - 9320797
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
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atgataggaatgtatatacttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaaa |
9320592 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
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ggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatagtttacttattatgatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
9320692 |
T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
| |
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| T |
9320693 |
caaacatatttttcctaaattccttaggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttcataaacttgaaacaaaca |
9320792 |
T |
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| Q |
300 |
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304 |
Q |
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||||| |
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| T |
9320793 |
caccc |
9320797 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24574601 - 24574287
Alignment:
| Q |
1 |
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92 |
Q |
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|
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|
| T |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgtttctggaaatagaaaaaatttccca |
24574502 |
T |
 |
| Q |
93 |
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192 |
Q |
| |
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| T |
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24574402 |
T |
 |
| Q |
193 |
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292 |
Q |
| |
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| T |
24574401 |
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24574302 |
T |
 |
| Q |
293 |
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307 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |
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| T |
24574301 |
acaaacacaccctaa |
24574287 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20297819 - 20297515
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20297819 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaag |
20297720 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
20297719 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagtcaac |
20297620 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20297619 |
caaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattccaaagaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacac |
20297520 |
T |
 |
| Q |
301 |
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305 |
Q |
| |
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||||| |
|
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| T |
20297519 |
accct |
20297515 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 53165770 - 53166075
Alignment:
| Q |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
53165870 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatatctatttttatgattcctaggaatattataaggttaac |
53165968 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
53165969 |
caaacatatttttcctaaataccttggaataaaatacccatctttatatttcaaggaatgttattcttagaaataaattggataaacttgaaacaaacac |
53166068 |
T |
 |
| Q |
301 |
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307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
53166069 |
accctaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 43132205 - 43132502
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
43132205 |
ataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattttcatgtataaaatgtacctgagaatataaattttttcccaaggaaaagggt |
43132304 |
T |
 |
| Q |
104 |
gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa |
203 |
Q |
| |
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| T |
43132305 |
gggaatagagttcccacggagatgagattaaattcataaatagtt-acctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaa |
43132403 |
T |
 |
| Q |
204 |
acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
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|
| T |
43132404 |
acatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 10822763 - 10823066
Alignment:
| Q |
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atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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atgatagaagtgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaaaaaattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccctaggaaaag |
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T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
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| T |
10822863 |
ggtgggaataaagttttcatggagatgggaataaaatcataaatagtt-atctataataatccctatttgtatggttcctaagaatattataaagttaac |
10822961 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
10822962 |
caaacatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattgtaaggaatgttattcctagaaataaatttgctaaacttgaaacaaacac |
10823061 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
10823062 |
accct |
10823066 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 302
Target Start/End: Original strand, 43718994 - 43719271
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119 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
43718994 |
ctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggcataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagatccca |
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T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa |
219 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tggagatgg-----aattcataaataatttacttattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa |
43719188 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccttggaataaaattctcaactttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 31435968 - 31436269
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| Q |
1 |
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| T |
31436267 |
acc |
31436269 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29512546 - 29512324
Alignment:
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80 |
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179 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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29512448 |
T |
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279 |
Q |
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| T |
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29512348 |
T |
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303 |
Q |
| |
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| ||||| |||||||||||||||| |
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| T |
29512347 |
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29512324 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12228301 - 12228601
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
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12228498 |
T |
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300 |
Q |
| |
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| T |
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12228598 |
T |
 |
| Q |
301 |
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303 |
Q |
| |
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||| |
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| T |
12228599 |
acc |
12228601 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19533130 - 19532939
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140 |
Q |
| |
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| T |
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19533031 |
T |
 |
| Q |
141 |
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233 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 303
Target Start/End: Original strand, 26849235 - 26849492
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tttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt-tcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaat |
144 |
Q |
| |
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| T |
26849235 |
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T |
 |
| Q |
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244 |
Q |
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| T |
26849335 |
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26849433 |
T |
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| Q |
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303 |
Q |
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| T |
26849434 |
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26849492 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 28770274 - 28770557
Alignment:
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119 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| || |
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| T |
28770274 |
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28770373 |
T |
 |
| Q |
120 |
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219 |
Q |
| |
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| T |
28770374 |
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28770472 |
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| Q |
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304 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28770473 |
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28770557 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27823300 - 27822994
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100 |
Q |
| |
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| T |
27823300 |
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27823201 |
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 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
27823200 |
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27823102 |
T |
 |
| Q |
201 |
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296 |
Q |
| |
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| T |
27823101 |
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27823002 |
T |
 |
| Q |
297 |
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304 |
Q |
| |
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| T |
27823001 |
acacaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Original strand, 38140425 - 38140710
Alignment:
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110 |
Q |
| |
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|||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |
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|
| T |
38140425 |
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38140524 |
T |
 |
| Q |
111 |
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210 |
Q |
| |
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||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| || |
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| T |
38140525 |
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38140622 |
T |
 |
| Q |
211 |
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298 |
Q |
| |
|
||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38140623 |
ttttctatataccttggaataaaattcacacctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaattttataaaattgaaacaaac |
38140710 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
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Target Start/End: Original strand, 1246947 - 1247212
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100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1246947 |
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1247046 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||| || |||| |
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|
| T |
1247047 |
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1247143 |
T |
 |
| Q |
201 |
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269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||| |
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|
| T |
1247144 |
caaacatatttttctcgaatactttagaataaaattctcatctatttattctaaaaaatgttattccta |
1247212 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 6832114 - 6832271
Alignment:
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ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
6832114 |
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6832213 |
T |
 |
| Q |
248 |
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305 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6832214 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40584561 - 40584336
Alignment:
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76 |
atagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgg |
175 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || | |||||||||| | |||||||||| || |
|
|
| T |
40584561 |
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40584463 |
T |
 |
| Q |
176 |
ttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata |
275 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
40584462 |
ttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatatttgaaggaatgttattcttaggaata |
40584363 |
T |
 |
| Q |
276 |
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302 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40584362 |
aatttgttacacttgaaacaaacacac |
40584336 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24784130 - 24783934
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| Q |
106 |
gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagct-aaccaaa |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||| | || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |
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| T |
24784130 |
gaataaagttcccatgaagatgggaataaaattatgtgtaatt-acctattataatctttatttttaaggttccttggaatattctaaagtttaaccaaa |
24784032 |
T |
 |
| Q |
205 |
catatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24784031 |
catattttttttaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcttatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac |
24783934 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32071450 - 32071256
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21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| | |||| || |||||||| | |||||||||| | || |
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| T |
32071450 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttatttt-gggtatgaaatgttcatggaaatagaaagattttcttaaagaaaagggcgagaataaagttac-at |
32071353 |
T |
 |
| Q |
121 |
ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaa |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32071352 |
ggagatgagaataaatttgtatgtagtt-acctattataatctttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 49216179 - 49216027
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ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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ttacctattataatctatatttttaaggttctttggaattttataaggttaaccaaacatattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttat |
49216080 |
T |
 |
| Q |
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attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49216079 |
attccaaggaacattattcctaagaataattttggaaaacttaaaacaaacac |
49216027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 12930994 - 12931287
Alignment:
| Q |
9 |
aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
12930994 |
aatgcatatggctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg-tataaaatgtttatgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaa |
12931092 |
T |
 |
| Q |
109 |
taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatg-gttcctaggaatattataaagctaaccaaacat |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
12931093 |
taaagttcccatagagatgggaataaaattatgtgta-attacctattatattccttatttttaagatttccttgaaatattataattttaatcaaacat |
12931191 |
T |
 |
| Q |
208 |
atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| || || |||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12931192 |
cttttttttaaataccttagaataatttttttatctttatgttataaagaatgttacttttaggaataaatttggtacacttgaaacaaacacacc |
12931287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 2565508 - 2565749
Alignment:
| Q |
4 |
ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt |
103 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
2565508 |
atagaaatatatatacctgtgtttgttacaagtttgttaaattt-atttccgggtataaaatgtttcttggaatagaaaattttttccaaagaaaatggt |
2565606 |
T |
 |
| Q |
104 |
gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagt--ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacc |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2565607 |
gggaataaagttcccatgaagatgagagtaaattcatacgtagtagttacctattataa----------tatggttcatatgaatattataaagttaact |
2565696 |
T |
 |
| Q |
202 |
aaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
2565697 |
aaacatattttt-ttaaataccttgaaataaaattctcatctttgtatttcaag |
2565749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18460953 - 18460827
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18460953 |
tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtggaaataaa |
18460854 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattca |
139 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18460853 |
gttctcttggagatgaaaataaattca |
18460827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Original strand, 28693485 - 28693780
Alignment:
| Q |
15 |
tatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag-----ggtggg--a |
107 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |
|
|
| T |
28693485 |
tatgcttatgtttgttataagtcaattaaattttattcatgagtataaaacgatcctgagaatagaaaaattttctcaaagaaaagaaaagggtggggga |
28693584 |
T |
 |
| Q |
108 |
ataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
28693585 |
ataaagttctcatgaagatgagaatat-ttcatatgtagttgtc-tattataatttttatttttatggtttccggaaatattataatgttaaataaacat |
28693682 |
T |
 |
| Q |
208 |
atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28693683 |
cttttttctataaaccttgaaataaaattctcatcttaaagtttcaaggaaaattatttctaggaataaatttagtaaatttgaaacaaacacaccct |
28693780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18460749 - 18460582
Alignment:
| Q |
129 |
gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgga |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| | |
|
|
| T |
18460749 |
gaataaattcatatgtagtt-accgattataatccctgtttttatggttc-tatgaatattataaagttaaccaaatatatttcttttaaataccttgta |
18460652 |
T |
 |
| Q |
229 |
ataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
298 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18460651 |
atcaaattctcatctttatatttcgaaaaatgttattcgtagaaataaatttgataaacttgaaacaaac |
18460582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Original strand, 33647767 - 33647886
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||| || |
|
|
| T |
33647767 |
ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaacgtttctgagaatataaaaaaatttccaaagaaaagagtggaaataaagtttcct |
33647866 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattca |
139 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33647867 |
tgaagatgagaataaattca |
33647886 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6927909 - 6927817
Alignment:
| Q |
209 |
tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6927909 |
ttttttctaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagtaataaatttgataaacttaaaacaaacaca |
6927817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27094029 - 27093957
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa |
85 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27094029 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactatatcttattctcgggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaa |
27093957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 392
Target Start/End: Original strand, 27243102 - 27243189
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27243102 |
taaaatcaatgcatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtatgacccacattgatttaacccaatgagagagtgagt |
27243189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32071080 - 32070985
Alignment:
| Q |
217 |
aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaatca |
312 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
32071080 |
aaataccttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataggaataaatttgataaatttaaaacaaacccaccataatatca |
32070985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 386
Target Start/End: Original strand, 13809138 - 13809219
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagaga |
386 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13809138 |
taaaatcaatgtatgtcccaccattttatgtgggttccatttccaaagtatatgacccacattgttttaacccaataagaga |
13809219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Original strand, 33650217 - 33650357
Alignment:
| Q |
159 |
aatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa |
258 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| || |
|
|
| T |
33650217 |
aatctctatttttatggtttccgagaatattataatgttaagcaaacatttttttattcaataccttagaataaaattctcatctttagatttcaaataa |
33650316 |
T |
 |
| Q |
259 |
tgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33650317 |
tgttattcataaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
33650357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 29512705 - 29512631
Alignment:
| Q |
14 |
atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt |
88 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29512705 |
atatgcctacgtttgtttcaagtttactaaattttattcctgagtataaaatgttcatcggaatagaaaaaattt |
29512631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45826136 - 45826064
Alignment:
| Q |
228 |
aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45826136 |
aataaaactcccattcttatattcccaggaaagttattcctaggaataaatctagtaaactggaaacaaacac |
45826064 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27093892 - 27093763
Alignment:
| Q |
163 |
cctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
27093892 |
cctatttttaatgttccttggaatattatattgttaatcaaacatctttttcttaa-taccttgaaataaaattcacatctttatattctaaggaatatt |
27093794 |
T |
 |
| Q |
263 |
attcctaggaataaatttagtaaacttgaaa |
293 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
27093793 |
atttttaagaataaatttgataaacatgaaa |
27093763 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 303
Target Start/End: Original strand, 31267540 - 31267694
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| Q |
149 |
tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||| | | || |||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31267540 |
tacctattataatccttatttttaaagtttatggaaatattataatgttgactaaacatcttttttctaaataccttaaaatgaaattcacatctttata |
31267639 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
303 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31267640 |
ttttaagaaatgttattcctaaaaataaatccgataaacttaaaacaaacacacc |
31267694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
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226 |
ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55435652 |
ggaataaaactcccatctttatattcccgggaaagttattcacaagaataaatctagtaaacttgaaacaaacac |
55435726 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
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| Q |
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atcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24749029 |
atcaatgtatgtcccaccattttatgtgggttccatttctaaagtgtaggtcctacattgatttcatccaataaaagagtgagtgt |
24748944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa |
382 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
50661645 |
taaaatcaatgcatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaaatgtatgacccacattgatttaacccaataa |
50661568 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
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| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaataga |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6832020 |
ctatgtttgttacaagtttactaaattttatt-ccaggtataaaatattcctgggaataga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
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| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataa |
62 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39932590 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccggatataa |
39932631 |
T |
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Target: chr3; HSP #57
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14 |
atatgcctatgtttgttataagtttac-taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13643083 |
atatgtctatgtttgttacaagttaacctaatttttgttcttgattataaaatgttcttaggaatagaaaagtttttccaaaaaaaatggtgg-aataaa |
13642985 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
||| ||||| | ||||||||||| | || | || ||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13642984 |
gtttccatgaaaatgagaataaaattatgtggaatt-acctattataatctctatttgtaaggttccttg-aatattataaagttaaccaaacagatttt |
13642887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45826771 - 45826687
Alignment:
| Q |
33 |
aagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
45826771 |
aagtttattaaattttatttcatgatataaaatgttcctgggaatagaagaacattcacaaagaaaaggatgggaaaaaagttcc |
45826687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26085517 - 26085442
Alignment:
| Q |
227 |
gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26085517 |
gaataaaattcatatctttatgttcgaaagaatcttatttctaaaaataaatttagtaaacttgaaacgaacacac |
26085442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 2566471 - 2566524
Alignment:
| Q |
248 |
attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2566471 |
attccaaggaatattatttcaagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca |
2566524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18427271 - 18427187
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18427271 |
aaatcaatgtatgtcccaccattttgtgtgggttctattttcaaagtgtaga-cccacaatgatttaaaccaataagagagtgagt |
18427187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37600251 - 37600202
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta |
356 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37600251 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttctaaagtgta |
37600202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44534009 - 44533945
Alignment:
| Q |
241 |
tctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
44534009 |
tctttatattcccaagaataacattcataagaataaatttagtaaactttaaacaaacacaccct |
44533945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19532946 - 19532911
Alignment:
| Q |
270 |
ggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19532946 |
ggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct |
19532911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 28139767 - 28139846
Alignment:
| Q |
3 |
gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa |
82 |
Q |
| |
|
||||| ||| || |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28139767 |
gatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagattagtaaattttattttcggatataaaacgttcttgggaatagaaa |
28139846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9719656 - 9719574
Alignment:
| Q |
226 |
ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||| ||||||||||| ||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9719656 |
ggaataaaacttcgatcattatattccaaagaaagttattaatgagaataaatctactaaacttgaaacaaacactccctaaa |
9719574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Original strand, 21925774 - 21925864
Alignment:
| Q |
209 |
tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21925774 |
ttttttctaaataccttataataaaatttcgatctttatgttctgaggaatcttacttctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca |
21925864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10769846 - 10769797
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta |
356 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10769846 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatatgggttccatttctaaagtgta |
10769797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38928132 - 38928043
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || | | ||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38928132 |
taaaatcaatgtatatccctctactttatatgggttccatttccaaagtgtaggtcttacattgatttcacccaataaaagagtgagtgt |
38928043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46237167 - 46237118
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta |
356 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
46237167 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttctaaaatgta |
46237118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 201951 - 201648
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201951 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
201852 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
201851 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac |
201753 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201752 |
caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
201653 |
T |
 |
| Q |
301 |
accct |
305 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
201652 |
accct |
201648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 143639 - 143342
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
143639 |
atgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaat |
143540 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
143539 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagttaac |
143441 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaat-aaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143440 |
caaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
143342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 119346 - 119051
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
119346 |
atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcatgagtataaaatgttcctgggaatagaaaattttttccaaagaaaag |
119247 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
119246 |
ggtggaaataaagttttcaggcagatgagaataaa-tcatgtgta-actacctattataatccctattcttaaggttccggggaatattatagtgttcac |
119149 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
119148 |
caaacaccttttttctaaatatc-tgaaataaaattcacatctttatattccaatgaatgttatttttaagaataaatttggtaaacttaaagcaaaca |
119051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2657726 - 2657420
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657726 |
atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
2657627 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2657626 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccatatttttatgattactaggaatattataaagttaac |
2657527 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657526 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac |
2657427 |
T |
 |
| Q |
301 |
accctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
2657426 |
accctaa |
2657420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1317044 - 1316740
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1317044 |
atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaa-tttcccaaggaaaag |
1316946 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316945 |
ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
1316846 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316845 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
1316746 |
T |
 |
| Q |
301 |
acccta |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
1316745 |
acccta |
1316740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14171039 - 14170740
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14171039 |
atgataggaatctatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcc-aaggaaaag |
14170941 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170940 |
ggtgggaataaagttcccatggagatg-gaataaattcataaatagtttacctattacaatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
14170842 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170841 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac |
14170742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16968951 - 16968640
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968951 |
atgataggaatctatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
16968852 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968851 |
ggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaac |
16968752 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968751 |
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T |
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301 |
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312 |
Q |
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|
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| T |
16968651 |
accttaagatca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18897946 - 18897643
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101 |
Q |
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18897946 |
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18897847 |
T |
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| Q |
102 |
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201 |
Q |
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| T |
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18897747 |
T |
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301 |
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18897647 |
T |
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Q |
| |
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18897646 |
ccct |
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T |
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Target: chr6; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 7053615 - 7053929
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Q |
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T |
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192 |
Q |
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| T |
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T |
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292 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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307 |
Q |
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||||||||||||||| |
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7053915 |
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T |
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Target: chr6; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 33 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8029297 - 8029023
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132 |
Q |
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T |
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232 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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307 |
Q |
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|
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Target: chr6; HSP #8
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T |
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Q |
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|
|
| T |
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accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac |
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T |
 |
| Q |
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307 |
Q |
| |
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||||||||| |
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|
| T |
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acaccctaa |
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Target: chr6; HSP #9
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T |
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| Q |
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193 |
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T |
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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
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Q |
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T |
 |
| Q |
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212 |
Q |
| |
|
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| T |
6705922 |
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6706008 |
T |
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| Q |
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305 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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T |
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Target: chr6; HSP #11
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Q |
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T |
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Q |
| |
|
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| T |
345976 |
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346074 |
T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Target: chr6; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 4 - 307
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|
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T |
 |
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203 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |
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| T |
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T |
 |
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303 |
Q |
| |
|
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Target: chr6; HSP #13
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|
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T |
 |
| Q |
285 |
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289 |
Q |
| |
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|
|
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aactt |
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Target: chr6; HSP #14
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Q |
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|
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|
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T |
 |
| Q |
285 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
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aacttgaaacaaaca |
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 |
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tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta |
246 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| | |||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| | || |
|
|
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tt-acctattataatccctatttttaaggttccttgaattattataatgttaactaaacattttttttctaaatatcttagaataaaatttacatgtgta |
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T |
 |
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247 |
tattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac |
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Q |
| |
|
|||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
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|
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tacctattataatctttatttttaaggttcatgagaatattataatgttacccaatcatctttttatctaaatacctttgaataaaattcacatatttat |
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T |
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attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc |
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|
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 |
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catggagatgagaata |
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Q |
| |
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|
|
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catgaagatgggaata |
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| |
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atgcctatttttgttataagtttactaaattttatttcaggatataaaatgttcatgagaatagaaaa |
9760497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12328216 - 12328065
Alignment:
| Q |
149 |
tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | ||| |||||| | ||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12328216 |
tacctattataaaccctatt---aaggttccttagaatattataacgttaatcaaacatctcttttctaaatacattg-aatgaaattcacatctttata |
12328121 |
T |
 |
| Q |
249 |
ttccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
12328120 |
tt-caaagaatgttattactagaaataaatttggtaaatttgaaacagacagaccct |
12328065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3869477 - 3869391
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| Q |
59 |
ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg---gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataa |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3869477 |
ataaaatgttcaatggaatagaaaagttttcccaaagaaaatggtggtgagaataaagttcccacgaagatgagaataaattcataa |
3869391 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3869295 - 3869216
Alignment:
| Q |
228 |
aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa |
307 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3869295 |
aataaaactctcatccttatatttccaggaaagttattcttgggaataaatctactaaacttgaaacaaacaccccctaa |
3869216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 8029359 - 8029316
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaa |
44 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8029359 |
atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa |
8029316 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 8314919 - 8314885
Alignment:
| Q |
21 |
tatgtttgttataagtttactaaattttattcccg |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314919 |
tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg |
8314885 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19090336 - 19090250
Alignment:
| Q |
307 |
aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| || | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19090336 |
aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgaattcaaccaataaaagagtgagtg |
19090250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35128846 - 35128769
Alignment:
| Q |
305 |
taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
35128846 |
taaaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataa |
35128769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 28997 - 29298
Alignment:
| Q |
1 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28997 |
atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaag |
29096 |
T |
 |
| Q |
101 |
ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29097 |
ggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagttttcctattataatccctatttttataattcctaggaatattataaagctaac |
29196 |
T |
 |
| Q |
201 |
caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
29197 |
caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaaaaatgttattcataggaataaatttgataaacttaaaataaacac |
29296 |
T |
 |
| Q |
301 |
ac |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
29297 |
ac |
29298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0662 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:
Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4188
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4482 |
tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaa |
4383 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagt----ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
4382 |
gttcccatggagatgaaaataaa---attaatagtgtaattacctattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacatt |
4286 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttttt-cctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4285 |
ttttttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccct |
4188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0702 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:
Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 3622 - 3914
Alignment:
| Q |
13 |
tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3622 |
tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaa |
3721 |
T |
 |
| Q |
113 |
gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| | || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
3722 |
gttcccatggagatgaaaataaaattatgtgtaatt-acctattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacatttttt |
3820 |
T |
 |
| Q |
213 |
-tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct |
305 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3821 |
ttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccct |
3914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0238
Description:
Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Original strand, 23360 - 23517
Alignment:
| Q |
20 |
ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23360 |
ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataaaatattcctgggaatataaatttttttccaaagaaaacggtgggaataaagtttcca |
23459 |
T |
 |
| Q |
120 |
tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttc |
178 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23460 |
tgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacctattataatccctatttttaaggttc |
23517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 309
Target Start/End: Original strand, 23559 - 23685
Alignment:
| Q |
182 |
ggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattta |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||| |||| ||||| |||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
23559 |
ggaatattataatgttcaccgaacaccttttttctaagtactttagaataaaattcc-atttttatattccaagaaatattattcttaaaaataaatttg |
23657 |
T |
 |
| Q |
282 |
gtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa |
309 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23658 |
gtaaacttaaaataaacaaaccttaaaa |
23685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1480 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:
Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 448 - 563
Alignment:
| Q |
19 |
cctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
448 |
cctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcctaaatataaaatgttcctgggaatgaaataacattcccaaagaaaattgtgggaataaagttccc |
547 |
T |
 |
| Q |
119 |
atggagatgagaataa |
134 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
548 |
atgaagatgaaaataa |
563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0069 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:
Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 21853 - 21968
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| Q |
19 |
cctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21853 |
cctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcctagatataaaatgttcctgggtatgaaataacattcccaaaaaaaattgtgggaataaagttccc |
21952 |
T |
 |
| Q |
119 |
atggagatgagaataa |
134 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
21953 |
atgaagatgaaaataa |
21968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 280
Target Start/End: Original strand, 43292 - 43417
Alignment:
| Q |
155 |
ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa |
254 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||| ||||||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
43292 |
ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa |
43391 |
T |
 |
| Q |
255 |
ggaatgttattcctaggaataaattt |
280 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43392 |
aaaatattattcctaaaaataaattt |
43417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 392
Target Start/End: Original strand, 27872 - 27955
Alignment:
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aatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27872 |
aatcaatgtatgtcccaccactttgtgtgggttctatttccaaagtgtaga-cccacaatgatttaaaccaataagagagtgagt |
27955 |
T |
 |
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