View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2176_low_3 (Length: 738)

Name: NF2176_low_3
Description: NF2176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2176_low_3
NF2176_low_3
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (1-307)||(346390-346696)
chr2 (1-307)||(6171511-6171817)
chr2 (1-305)||(4559281-4559585)
chr2 (1-307)||(11071325-11071631)
chr2 (1-307)||(14777543-14777849)
chr2 (1-306)||(41729175-41729480)
chr2 (1-305)||(42674706-42675010)
chr2 (1-305)||(2050588-2050892)
chr2 (1-303)||(17965707-17966009)
chr2 (1-300)||(9733891-9734190)
chr2 (1-305)||(37192244-37192548)
chr2 (1-304)||(5770155-5770458)
chr2 (1-303)||(638318-638619)
chr2 (1-307)||(37533673-37533978)
chr2 (474-723)||(24894711-24894960)
chr2 (1-302)||(28311742-28312042)
chr2 (1-302)||(37233155-37233455)
chr2 (1-301)||(21737445-21737753)
chr2 (1-268)||(2521434-2521701)
chr2 (1-280)||(41750276-41750555)
chr2 (1-306)||(40950904-40951209)
chr2 (1-301)||(26309993-26310295)
chr2 (25-306)||(23943884-23944165)
chr2 (1-304)||(20426528-20426830)
chr2 (56-309)||(13760685-13760938)
chr2 (1-280)||(34356745-34357022)
chr2 (1-297)||(27358008-27358303)
chr2 (1-297)||(45408981-45409276)
chr2 (1-252)||(39995176-39995435)
chr2 (21-302)||(3902182-3902462)
chr2 (13-306)||(18713714-18714006)
chr2 (1-302)||(14832536-14832836)
chr2 (1-301)||(45693915-45694214)
chr2 (1-266)||(1988073-1988337)
chr2 (16-307)||(40569738-40570031)
chr2 (14-303)||(39819414-39819709)
chr2 (80-306)||(7007306-7007531)
chr2 (21-297)||(4875506-4875781)
chr2 (16-303)||(5002897-5003182)
chr2 (1-163)||(11763416-11763577)
chr2 (21-297)||(41297983-41298255)
chr2 (153-293)||(11763597-11763737)
chr2 (29-299)||(13790018-13790280)
chr2 (148-301)||(3254284-3254437)
chr2 (20-297)||(13539399-13539675)
chr2 (1-137)||(14253412-14253548)
chr2 (1-112)||(6571602-6571713)
chr2 (42-299)||(25724753-25725010)
chr2 (190-301)||(1623078-1623188)
chr2 (4-205)||(1623206-1623405)
chr2 (305-425)||(24895267-24895390)
chr2 (21-264)||(4684945-4685185)
chr2 (21-207)||(37851678-37851864)
chr2 (14-135)||(25454914-25455037)
chr2 (35-137)||(3254142-3254245)
chr2 (244-297)||(2521381-2521434)
chr2 (305-394)||(38104305-38104394)
chr2 (21-137)||(8868728-8868842)
chr2 (27-137)||(516463-516572)
chr2 (183-308)||(14403431-14403558)
chr2 (168-241)||(14253340-14253413)
chr2 (20-69)||(24499400-24499449)
chr2 (228-299)||(14253254-14253325)
chr2 (305-392)||(35316438-35316524)
chr2 (322-393)||(37719872-37719943)
chr2 (245-298)||(36590862-36590915)
chr2 (307-390)||(1110257-1110340)
chr2 (255-297)||(8868938-8868980)
chr2 (307-393)||(15508973-15509059)
chr2 (322-403)||(21447178-21447260)
chr2 (307-393)||(28898072-28898158)
chr2 (307-393)||(42182948-42183034)
chr2 (77-193)||(14137038-14137153)
chr2 (228-308)||(25444919-25444999)
chr2 (323-391)||(27183395-27183463)
chr2 (323-391)||(27832937-27833005)
chr2 (307-420)||(12989250-12989365)
chr2 (36-85)||(25625328-25625377)
chr2 (224-297)||(45212662-45212735)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (1-306)||(13230034-13230339)
chr4 (1-303)||(27762944-27763246)
chr4 (1-306)||(45747841-45748145)
chr4 (1-298)||(48518936-48519233)
chr4 (1-308)||(39730338-39730645)
chr4 (1-307)||(48879049-48879355)
chr4 (1-305)||(42773674-42773978)
chr4 (1-305)||(43722990-43723294)
chr4 (1-305)||(45595994-45596298)
chr4 (1-307)||(35999410-35999716)
chr4 (1-305)||(25932167-25932471)
chr4 (1-305)||(55968045-55968349)
chr4 (1-305)||(41859092-41859395)
chr4 (1-308)||(6279966-6280273)
chr4 (1-305)||(47670088-47670392)
chr4 (1-303)||(40435628-40435930)
chr4 (1-297)||(50672950-50673245)
chr4 (9-309)||(39835360-39835660)
chr4 (1-303)||(41744265-41744568)
chr4 (1-307)||(23686511-23686817)
chr4 (4-305)||(18405282-18405582)
chr4 (1-305)||(935852-936156)
chr4 (9-297)||(34238007-34238295)
chr4 (1-308)||(32953246-32953553)
chr4 (1-307)||(8321969-8322275)
chr4 (21-303)||(27942465-27942747)
chr4 (1-263)||(34049642-34049904)
chr4 (1-305)||(27555153-27555440)
chr4 (1-302)||(18931482-18931783)
chr4 (74-307)||(48873745-48873978)
chr4 (16-304)||(31937929-31938217)
chr4 (1-266)||(39498590-39498855)
chr4 (1-266)||(39501929-39502194)
chr4 (1-218)||(25916080-25916295)
chr4 (23-304)||(7258691-7258971)
chr4 (16-308)||(51968502-51968792)
chr4 (1-309)||(52469419-52469728)
chr4 (86-304)||(36858135-36858351)
chr4 (1-207)||(38414032-38414236)
chr4 (22-310)||(37014451-37014737)
chr4 (13-242)||(47426298-47426520)
chr4 (1-191)||(30415743-30415932)
chr4 (7-304)||(38394634-38394930)
chr4 (16-214)||(36858436-36858634)
chr4 (55-309)||(30790270-30790518)
chr4 (20-193)||(18405592-18405764)
chr4 (148-302)||(10400973-10401126)
chr4 (192-305)||(38413902-38414015)
chr4 (20-295)||(44309497-44309771)
chr4 (21-280)||(48059806-48060065)
chr4 (1-112)||(10400850-10400961)
chr4 (21-262)||(24805150-24805397)
chr4 (1-305)||(12275956-12276259)
chr4 (227-304)||(36860027-36860104)
chr4 (21-207)||(18094073-18094259)
chr4 (209-305)||(18405129-18405224)
chr4 (246-307)||(25916302-25916364)
chr4 (197-299)||(52413959-52414061)
chr4 (55-213)||(32384492-32384650)
chr4 (307-394)||(13069999-13070086)
chr4 (21-238)||(26165155-26165374)
chr4 (1-132)||(22654522-22654655)
chr4 (154-267)||(37296473-37296580)
chr4 (155-280)||(14796314-14796439)
chr4 (307-392)||(25719149-25719234)
chr4 (21-81)||(54478495-54478555)
chr4 (307-394)||(2088699-2088786)
chr4 (197-268)||(54478366-54478437)
chr4 (305-420)||(21776850-21776968)
chr4 (307-354)||(44832522-44832569)
chr4 (311-420)||(19447194-19447306)
chr4 (307-393)||(39016722-39016808)
chr4 (307-393)||(42862456-42862542)
chr4 (258-304)||(47426521-47426567)
chr4 (307-356)||(16178642-16178691)
chr4 (256-301)||(30415706-30415751)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (1-305)||(37392591-37392895)
chr8 (1-305)||(35818469-35818773)
chr8 (1-307)||(32660978-32661285)
chr8 (1-304)||(38363804-38364107)
chr8 (1-303)||(18297836-18298138)
chr8 (1-305)||(12710367-12710671)
chr8 (1-305)||(25837633-25837937)
chr8 (1-307)||(3049729-3050035)
chr8 (1-307)||(7930959-7931265)
chr8 (1-307)||(26601983-26602288)
chr8 (1-305)||(16313552-16313856)
chr8 (1-305)||(38132782-38133087)
chr8 (1-302)||(42755592-42755893)
chr8 (1-303)||(18726664-18726967)
chr8 (1-305)||(26061866-26062170)
chr8 (1-293)||(1554399-1554692)
chr8 (1-300)||(10896262-10896560)
chr8 (5-233)||(41228763-41228990)
chr8 (6-308)||(5020543-5020843)
chr8 (4-302)||(21137180-21137476)
chr8 (1-304)||(29421534-29421839)
chr8 (21-309)||(15226684-15226970)
chr8 (1-248)||(7317156-7317399)
chr8 (13-303)||(33444683-33444969)
chr8 (13-310)||(19160798-19161095)
chr8 (13-262)||(35394156-35394404)
chr8 (129-305)||(40197226-40197402)
chr8 (33-266)||(6805700-6805936)
chr8 (16-305)||(43872026-43872314)
chr8 (20-304)||(31117594-31117874)
chr8 (1-302)||(41432464-41432766)
chr8 (15-307)||(16219002-16219292)
chr8 (91-308)||(37981921-37982139)
chr8 (152-306)||(25899380-25899532)
chr8 (149-305)||(33533585-33533741)
chr8 (25-303)||(12649859-12650137)
chr8 (1-137)||(14763976-14764111)
chr8 (305-420)||(6387618-6387736)
chr8 (1-112)||(40197121-40197232)
chr8 (3-112)||(38437369-38437478)
chr8 (183-308)||(34672080-34672207)
chr8 (305-420)||(13407329-13407447)
chr8 (151-302)||(38437203-38437353)
chr8 (20-112)||(25899548-25899639)
chr8 (246-305)||(35394080-35394139)
chr8 (307-394)||(7599456-7599543)
chr8 (307-382)||(11310412-11310487)
chr8 (263-304)||(41228976-41229017)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (1-305)||(45265093-45265397)
chr7 (1-304)||(35488234-35488537)
chr7 (1-307)||(44565765-44566071)
chr7 (1-305)||(11329715-11330019)
chr7 (1-301)||(45045352-45045652)
chr7 (1-304)||(27213900-27214203)
chr7 (1-301)||(27248019-27248319)
chr7 (1-305)||(9947035-9947340)
chr7 (1-306)||(48341085-48341388)
chr7 (1-305)||(43948967-43949271)
chr7 (1-305)||(33378556-33378868)
chr7 (1-303)||(34930511-34930814)
chr7 (1-305)||(25924682-25924986)
chr7 (1-300)||(38543920-38544220)
chr7 (1-304)||(45448665-45448968)
chr7 (1-305)||(48313844-48314148)
chr7 (1-303)||(27419269-27419571)
chr7 (1-306)||(38396411-38396715)
chr7 (1-299)||(25097796-25098095)
chr7 (1-299)||(39553910-39554209)
chr7 (1-267)||(8419634-8419900)
chr7 (1-305)||(28904231-28904535)
chr7 (1-305)||(41632409-41632708)
chr7 (1-259)||(40212657-40212915)
chr7 (1-277)||(9814263-9814535)
chr7 (1-300)||(44819981-44820280)
chr7 (1-304)||(48160636-48160921)
chr7 (16-301)||(37534163-37534447)
chr7 (16-301)||(30686052-30686336)
chr7 (1-195)||(16825399-16825593)
chr7 (13-299)||(18823890-18824159)
chr7 (1-304)||(6656517-6656819)
chr7 (6-305)||(45722881-45723170)
chr7 (40-305)||(31921811-31922075)
chr7 (3-178)||(25045664-25045838)
chr7 (18-241)||(11000483-11000711)
chr7 (9-304)||(43445936-43446229)
chr7 (16-302)||(45440637-45440918)
chr7 (1-213)||(41684067-41684278)
chr7 (25-298)||(22156248-22156520)
chr7 (25-298)||(22212163-22212435)
chr7 (21-308)||(5543196-5543482)
chr7 (21-303)||(40385692-40385974)
chr7 (1-191)||(6656269-6656457)
chr7 (153-305)||(17276355-17276508)
chr7 (13-265)||(38528764-38529012)
chr7 (152-301)||(31598449-31598598)
chr7 (44-236)||(43569773-43569966)
chr7 (20-259)||(47246130-47246366)
chr7 (305-420)||(24539128-24539246)
chr7 (104-255)||(10902820-10902971)
chr7 (305-420)||(17749751-17749869)
chr7 (253-305)||(16916182-16916234)
chr7 (1-85)||(10902695-10902779)
chr7 (262-306)||(40212625-40212669)
chr7 (307-419)||(11824130-11824242)
chr7 (305-394)||(27888339-27888427)
chr7 (307-394)||(45909515-45909602)
chr7 (307-393)||(25428514-25428600)
chr7 (307-393)||(26703475-26703561)
chr7 (307-392)||(6442224-6442308)
chr7 (307-382)||(19494385-19494460)
chr7 (228-307)||(20601049-20601128)
chr7 (243-298)||(30870944-30870999)
chr7 (307-393)||(13919839-13919925)
chr7 (307-393)||(17354562-17354648)
chr7 (16-82)||(31598623-31598688)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (1-307)||(18411929-18412235)
chr5 (1-307)||(4765605-4765911)
chr5 (1-309)||(29543060-29543368)
chr5 (1-305)||(22935957-22936261)
chr5 (1-302)||(11855700-11856001)
chr5 (1-301)||(19065550-19065850)
chr5 (1-301)||(8646436-8646735)
chr5 (1-307)||(12970575-12970881)
chr5 (1-302)||(27481082-27481383)
chr5 (1-308)||(14206866-14207173)
chr5 (1-307)||(8406614-8406920)
chr5 (1-305)||(28602278-28602581)
chr5 (1-303)||(555751-556053)
chr5 (9-305)||(6091437-6091733)
chr5 (1-305)||(32535659-32535963)
chr5 (1-247)||(36703654-36703900)
chr5 (1-308)||(27480730-27481035)
chr5 (3-302)||(1664456-1664754)
chr5 (1-302)||(42012224-42012530)
chr5 (23-309)||(43346962-43347247)
chr5 (1-245)||(20962373-20962616)
chr5 (153-303)||(36703506-36703656)
chr5 (21-305)||(17251536-17251818)
chr5 (21-305)||(6930364-6930646)
chr5 (67-307)||(26637137-26637372)
chr5 (20-301)||(31583126-31583404)
chr5 (20-289)||(35348590-35348858)
chr5 (14-219)||(40275813-40276017)
chr5 (165-309)||(28429446-28429591)
chr5 (183-299)||(16720910-16721029)
chr5 (21-127)||(19089782-19089888)
chr5 (148-305)||(35602968-35603122)
chr5 (149-301)||(36978323-36978478)
chr5 (21-254)||(41783685-41783914)
chr5 (16-112)||(30899470-30899566)
chr5 (231-306)||(20962281-20962356)
chr5 (165-307)||(30899321-30899463)
chr5 (239-303)||(40276524-40276587)
chr5 (13-140)||(15200603-15200727)
chr5 (20-140)||(28023719-28023840)
chr5 (307-401)||(13456191-13456286)
chr5 (307-393)||(42224626-42224712)
chr5 (1-64)||(28429664-28429727)
chr5 (197-307)||(6696755-6696866)
chr5 (226-289)||(27901697-27901760)
chr5 (307-393)||(26072162-26072248)
chr5 (305-394)||(10142011-10142099)
chr5 (305-390)||(10666727-10666811)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (1-307)||(46666429-46666735)
chr1 (1-304)||(20260131-20260434)
chr1 (1-304)||(9115561-9115864)
chr1 (1-307)||(36361504-36361809)
chr1 (1-302)||(2430223-2430523)
chr1 (1-305)||(52630496-52630800)
chr1 (4-305)||(14788446-14788747)
chr1 (1-305)||(8331737-8332041)
chr1 (1-305)||(12190222-12190526)
chr1 (1-304)||(25789487-25789790)
chr1 (4-306)||(32824643-32824946)
chr1 (1-304)||(39930181-39930484)
chr1 (1-302)||(9831915-9832216)
chr1 (1-307)||(6911206-6911520)
chr1 (4-308)||(2632573-2632876)
chr1 (1-303)||(1597387-1597689)
chr1 (5-307)||(50190814-50191115)
chr1 (9-301)||(51445133-51445424)
chr1 (1-307)||(4683419-4683724)
chr1 (1-307)||(5518549-5518854)
chr1 (1-304)||(38964724-38965027)
chr1 (1-232)||(3572610-3572841)
chr1 (1-303)||(39329347-39329635)
chr1 (1-308)||(5806336-5806628)
chr1 (38-303)||(32202395-32202660)
chr1 (1-298)||(13653581-13653878)
chr1 (1-302)||(35187181-35187483)
chr1 (1-309)||(48916067-48916375)
chr1 (1-303)||(37436666-37436966)
chr1 (1-248)||(6978550-6978797)
chr1 (1-290)||(52699511-52699799)
chr1 (13-308)||(29091392-29091681)
chr1 (129-307)||(47031580-47031758)
chr1 (74-263)||(49823014-49823203)
chr1 (9-305)||(46960351-46960646)
chr1 (14-302)||(1227936-1228225)
chr1 (1-161)||(47037324-47037484)
chr1 (23-304)||(47677368-47677648)
chr1 (21-306)||(24116400-24116684)
chr1 (16-307)||(38519122-38519411)
chr1 (1-259)||(30240782-30241036)
chr1 (3-305)||(17475368-17475658)
chr1 (176-305)||(25473978-25474107)
chr1 (82-302)||(48462258-48462475)
chr1 (1-302)||(31806801-31807093)
chr1 (14-302)||(13931942-13932218)
chr1 (1-299)||(13521053-13521348)
chr1 (1-136)||(19083150-19083285)
chr1 (1-136)||(19131038-19131173)
chr1 (14-302)||(29769230-29769526)
chr1 (1-305)||(9011206-9011511)
chr1 (1-237)||(13440186-13440422)
chr1 (126-233)||(1007566-1007672)
chr1 (1-141)||(11014486-11014626)
chr1 (1-112)||(1007663-1007774)
chr1 (40-304)||(3939225-3939486)
chr1 (149-301)||(49627301-49627454)
chr1 (148-301)||(37261546-37261699)
chr1 (1-178)||(20505034-20505213)
chr1 (209-307)||(45771813-45771911)
chr1 (305-420)||(13114675-13114793)
chr1 (148-308)||(19923655-19923815)
chr1 (251-306)||(37726804-37726859)
chr1 (224-303)||(52186265-52186344)
chr1 (26-212)||(37336514-37336699)
chr1 (1-190)||(52186091-52186262)
chr1 (165-289)||(45813603-45813727)
chr1 (16-141)||(37261734-37261859)
chr1 (148-265)||(13048461-13048578)
chr1 (148-265)||(13053458-13053575)
chr1 (21-141)||(45771963-45772088)
chr1 (307-405)||(11135798-11135897)
chr1 (1-48)||(49822962-49823009)
chr1 (307-393)||(41918054-41918140)
chr1 (305-394)||(41948181-41948269)
chr1 (255-300)||(49824022-49824067)
chr1 (307-394)||(14094035-14094122)
chr1 (19-134)||(19094007-19094122)
chr1 (72-137)||(33702459-33702524)
chr1 (305-382)||(50424912-50424989)
chr1 (16-71)||(52276877-52276930)
chr1 (307-393)||(11430500-11430585)
chr1 (305-409)||(15660950-15661055)
chr1 (342-384)||(30867515-30867557)
chr1 (33-134)||(11077949-11078050)
chr1 (307-356)||(28109927-28109975)
chr1 (305-394)||(30678946-30679034)
chr1 (307-392)||(41958142-41958226)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (1-307)||(8476353-8476659)
chr3 (1-307)||(26848742-26849048)
chr3 (1-305)||(11239165-11239469)
chr3 (1-309)||(33217958-33218266)
chr3 (1-305)||(40907988-40908291)
chr3 (1-301)||(47114902-47115202)
chr3 (9-305)||(48339810-48340106)
chr3 (1-303)||(20414510-20414812)
chr3 (1-306)||(6231546-6231851)
chr3 (1-301)||(31611030-31611330)
chr3 (1-305)||(46359674-46359978)
chr3 (1-307)||(44952028-44952334)
chr3 (1-303)||(1098923-1099224)
chr3 (1-299)||(28124481-28124779)
chr3 (1-304)||(9320493-9320797)
chr3 (1-307)||(24574287-24574601)
chr3 (1-305)||(20297515-20297819)
chr3 (1-307)||(53165770-53166075)
chr3 (4-302)||(43132205-43132502)
chr3 (1-305)||(10822763-10823066)
chr3 (20-302)||(43718994-43719271)
chr3 (1-303)||(31435968-31436269)
chr3 (80-303)||(29512324-29512546)
chr3 (1-303)||(12228301-12228601)
chr3 (41-233)||(19532939-19533130)
chr3 (46-303)||(26849235-26849492)
chr3 (20-304)||(28770274-28770557)
chr3 (1-304)||(27822994-27823300)
chr3 (13-298)||(38140425-38140710)
chr3 (1-269)||(1246947-1247212)
chr3 (148-305)||(6832114-6832271)
chr3 (76-302)||(40584336-40584561)
chr3 (106-302)||(24783934-24784130)
chr3 (21-218)||(32071256-32071450)
chr3 (148-300)||(49216027-49216179)
chr3 (9-303)||(12930994-12931287)
chr3 (4-255)||(2565508-2565749)
chr3 (13-139)||(18460827-18460953)
chr3 (15-305)||(28693485-28693780)
chr3 (129-298)||(18460582-18460749)
chr3 (20-139)||(33647767-33647886)
chr3 (209-301)||(6927817-6927909)
chr3 (13-85)||(27093957-27094029)
chr3 (305-392)||(27243102-27243189)
chr3 (217-312)||(32070985-32071080)
chr3 (305-386)||(13809138-13809219)
chr3 (159-299)||(33650217-33650357)
chr3 (14-88)||(29512631-29512705)
chr3 (228-300)||(45826064-45826136)
chr3 (163-293)||(27093763-27093892)
chr3 (149-303)||(31267540-31267694)
chr3 (226-300)||(55435652-55435726)
chr3 (309-394)||(24748944-24749029)
chr3 (305-382)||(50661568-50661645)
chr3 (20-80)||(6832020-6832079)
chr3 (21-62)||(39932590-39932631)
chr3 (14-213)||(13642886-13643083)
chr3 (33-117)||(45826687-45826771)
chr3 (227-302)||(26085442-26085517)
chr3 (248-301)||(2566471-2566524)
chr3 (307-392)||(18427187-18427271)
chr3 (307-356)||(37600202-37600251)
chr3 (241-305)||(44533945-44534009)
chr3 (270-305)||(19532911-19532946)
chr3 (3-82)||(28139767-28139846)
chr3 (226-308)||(9719574-9719656)
chr3 (209-299)||(21925774-21925864)
chr3 (307-356)||(10769797-10769846)
chr3 (305-394)||(38928043-38928132)
chr3 (307-356)||(46237118-46237167)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (1-305)||(201648-201951)
scaffold0006 (1-298)||(143342-143639)
scaffold0006 (1-299)||(119051-119346)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-307)||(2657420-2657726)
chr6 (1-306)||(1316740-1317044)
chr6 (1-302)||(14170740-14171039)
chr6 (1-312)||(16968640-16968951)
chr6 (2-305)||(18897643-18897946)
chr6 (1-307)||(7053615-7053929)
chr6 (33-307)||(8029023-8029297)
chr6 (99-307)||(10246259-10246467)
chr6 (1-193)||(7344128-7344320)
chr6 (13-305)||(6705822-6706101)
chr6 (1-254)||(345876-346130)
chr6 (4-307)||(14781668-14781960)
chr6 (185-289)||(7344723-7344827)
chr6 (185-299)||(21008208-21008322)
chr6 (49-298)||(8314623-8314873)
chr6 (149-303)||(9762232-9762387)
chr6 (19-133)||(10849846-10849961)
chr6 (243-303)||(11570071-11570131)
chr6 (13-141)||(21008081-21008208)
chr6 (16-83)||(9760430-9760497)
chr6 (149-305)||(12328065-12328216)
chr6 (59-142)||(3869391-3869477)
chr6 (228-307)||(3869216-3869295)
chr6 (1-44)||(8029316-8029359)
chr6 (21-55)||(8314885-8314919)
chr6 (307-393)||(19090250-19090336)
chr6 (305-382)||(35128769-35128846)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (1-302)||(28997-29298)
[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (13-305)||(4188-4482)
[»] scaffold0702 (1 HSPs)
scaffold0702 (13-305)||(3622-3914)
[»] scaffold0238 (2 HSPs)
scaffold0238 (20-178)||(23360-23517)
scaffold0238 (182-309)||(23559-23685)
[»] scaffold1480 (1 HSPs)
scaffold1480 (19-134)||(448-563)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (19-134)||(21853-21968)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (155-280)||(43292-43417)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (308-392)||(27872-27955)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 346390 - 346696
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346390 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 346489  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346490 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 346589  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  346590 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 346689  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  346690 accctaa 346696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6171817 - 6171511
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6171817 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 6171718  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6171717 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 6171618  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6171617 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 6171518  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  6171517 accctaa 6171511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4559585 - 4559281
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4559585 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 4559486  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4559485 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 4559386  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4559385 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcttagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 4559286  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  4559285 accct 4559281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11071631 - 11071325
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11071631 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 11071532  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11071531 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 11071432  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11071431 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 11071332  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  11071331 accctaa 11071325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 14777543 - 14777849
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14777543 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 14777642  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14777643 ggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaac 14777742  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14777743 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 14777842  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  14777843 accctaa 14777849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 41729175 - 41729480
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41729175 atgataggaatggatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattgccagatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 41729274  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41729275 ggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttactaggaatattataaagctaac 41729374  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41729375 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 41729474  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  41729475 acccta 41729480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 42674706 - 42675010
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42674706 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 42674805  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42674806 ggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 42674905  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42674906 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaagaaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 42675005  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  42675006 accct 42675010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2050892 - 2050588
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050892 atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 2050793  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2050792 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataattcctatttttatgattcctaggaatattataaagctaac 2050693  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2050692 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 2050593  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  2050592 accct 2050588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17966009 - 17965707
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  17966009 atgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttaccaaattttattcccgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag 17965910  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17965909 ggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 17965810  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17965809 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 17965710  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  17965709 acc 17965707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 9733891 - 9734190
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9733891 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcccaaggaaaag 9733990  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9733991 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaac 9734090  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9734091 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacac 9734190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37192548 - 37192244
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37192548 atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 37192449  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37192448 ggtgggaataaagtttccatggagattggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 37192349  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37192348 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 37192249  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  37192248 accct 37192244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 5770155 - 5770458
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5770155 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaat 5770254  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5770255 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatggttgctaggaatattataaagctaac 5770354  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5770355 caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 5770454  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  5770455 accc 5770458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 638619 - 638318
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  638619 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaggtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcctaggaatataaaaaatttcccaaggaaaag 638520  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  638519 gg-gggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 638421  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  638420 caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaatcaaacac 638321  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  638320 acc 638318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37533978 - 37533673
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  37533978 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaag 37533879  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37533878 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcccaggaata-tataaagctaac 37533780  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533779 caaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttttattccaaggaatgttattcctagaaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 37533680  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  37533679 accctaa 37533673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 474 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 24894960 - 24894711
Alignment:
Q  474 ataatgtcaaaaagacactggtactgaaattagtgcgcaagcaaaagctcatcatcaatggcgcttaaaaccctatccactttcttaacccctctttctc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24894960 ataatgtcaaaaagacactggtactgaaattagtgcgcaagcaaaagctcatcatcaatggcgcttaaaaccctatccactttcttaacccctctttctc 24894861  T
Q  574 tcccaaaccccaaattccctcaaattcactccaaaccttgtctcattctctgcgaattctctcgtccttccaaatcacgcttaccagaaggcaccggagc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24894860 tcccaaaccccaaattccctcaaattcactccaaaccttgtctcattctctgcgaattctctcgtccttccaaatcacgcttaccagaaggcaccggagc 24894761  T
Q  674 cgctgctccgtcaccaggcgagaagttcctcgaacgccagcagtcatttg 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24894760 cgctgctccgtcaccaggcgagaagttcctcgaacgccagcagtcatttg 24894711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 28311742 - 28312042
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28311742 atgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactgaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatctttcccaaggaaaag 28311841  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28311842 ggtgggaataaagttcccgtggagatgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaac 28311940  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28311941 caaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 28312040  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  28312041 ac 28312042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37233455 - 37233155
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  37233455 atgataggaacatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatcgttcccaaggaaaag 37233356  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37233355 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccttattttcatggttcctaggaatattataaagttaac 37233257  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37233256 caaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 37233157  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  37233156 ac 37233155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 21737445 - 21737753
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21737445 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 21737544  T
Q  93 aggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21737545 aggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 21737644  T
Q  193 aagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21737645 aagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatatttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaa 21737744  T
Q  293 acaaacaca 301  Q
    |||||||||    
T  21737745 acaaacaca 21737753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2521701 - 2521434
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521701 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 2521602  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521601 ggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 2521502  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521501 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaaggaatgttattcct 2521434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41750555 - 41750276
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41750555 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 41750456  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41750455 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagttaac 41750356  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41750355 caaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaattt 41750276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 40950904 - 40951209
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  40950904 atgatagaaatatatatgcttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatacaaaaaaatttccaaggaaaag 40951003  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40951004 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaac 40951103  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  40951104 caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattttcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacat 40951203  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  40951204 acccta 40951209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26310295 - 26309993
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctat--gtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaa 98  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26310295 atgatagaaatgtatatgtctatatgtttgttagaagtttattaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaa 26310196  T
Q  99 agggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagcta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26310195 agggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagcta 26310096  T
Q  199 accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26310095 accaaccatatttttcctaaatttcttgtaataaaattcccatctttatattccaaggaatgctattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 26309996  T
Q  299 aca 301  Q
    |||    
T  26309995 aca 26309993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23944165 - 23943884
Alignment:
Q  25 tttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggag 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23944165 tttgttacaagtttactaaattttattctcggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaacgaaaagggtgggaataaagttcccatggag 23944066  T
Q  125 atgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcct 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23944065 atgagaataaattcataaataatttacctattataatctttatttttatggttcctaggaatattataaaggtaaccaaacatattttttctaaattctt 23943966  T
Q  225 tggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23943965 tacaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccta 23943884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 20426528 - 20426830
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20426528 atgataggaatttatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatccccggatataaaatgttcctgggaatagaaaatttttcccaaggaaaag 20426627  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  20426628 ggtgagaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtt-acctattataatctctatttttatggttggtaggaatattataaagttaac 20426726  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20426727 caaacatattttttctaaatacattgaaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaactttaaacaaacac 20426826  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  20426827 accc 20426830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13760938 - 13760685
Alignment:
Q  56 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13760938 ggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 13760839  T
Q  156 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13760838 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 13760739  T
Q  256 gaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13760738 gaatgttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacactctaaaa 13760685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 34356745 - 34357022
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34356745 atgatagaaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 34356844  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34356845 ggtgggaataaagttcccacgga-atgggaataaattcataaataattttcctattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 34356943  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt 280  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34356944 caaacatatttttcttaaatttcttggaataaaattcctatc-ttatattccaaggaatgctattcctaagaataaattt 34357022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 27358008 - 27358303
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27358008 atgatagggatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatattcatgggaatagaaaaatttacccaaggaaaag 27358107  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  27358108 ggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaatttaat 27358206  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27358207 caaacatatttttgctaaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaataaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaa 27358303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45409276 - 45408981
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45409276 atgataggaatgtatatgcctatgttttttacaagtttactaaattttattaccgggtataaaatattcatgggaatagaaaaatttacccaaggaaaag 45409177  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  45409176 ggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatag-ttacctattataatccttatttttatggttcctagaaatattataaatttaat 45409078  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45409077 caaacatatttttgctaaataccttggaataaaattctcatctttatattccaataaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaa 45408981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 39995176 - 39995435
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39995176 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 39995275  T
Q  93 aggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39995276 aggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 39995375  T
Q  193 aagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 252  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39995376 aagttaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaatttccatctttatattcc 39995435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3902462 - 3902182
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  3902462 tatgtttgttacaagtttactaaattttattctcaggtttaaaatgttcctgggaatagaaaaaaattcccaaagaaaatggtgggaataaagttccctt 3902363  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3902362 ggagatgagaataaattcatatatagtt-acctattataatccctatttttatggttcctgtgaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaat 3902264  T
Q  221 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3902263 atcttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaaaaataaatatggtaaacttgaaacaaacacac 3902182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 18713714 - 18714006
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18713714 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcttggtaataaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaa 18713813  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18713814 gttcccatggagatggaaataaatttatacgtagta-acctattataaaccctatttttatggttcataggaatattataaagttaaccaaacatatttt 18713912  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
    | ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  18713913 ttctaaatatcttggaataatattctcatctttatattccaaggaatgttattcctataaataaatttggtaagcttgaatcaaacacacccta 18714006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14832836 - 14832536
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14832836 atgatagaaatatatatgcctatgtttgttaaaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaag 14832737  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14832736 ggtgggaataaagttctcattgagatgagaataaatttatacgtaattt-cctattataatccttatttttatggttcataggaatattataaagctaac 14832638  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14832637 caaacatattttttctaaatatctaggaataaaattatcatctttatattttaaggaatgttattcttggaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 14832538  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  14832537 ac 14832536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45694214 - 45693915
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45694214 atgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaacgttcatgggaatagaaaatttttcccaaggaaaag 45694115  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||     
T  45694114 ggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaattcatgagtaattt-gcaattataattcctatttttatggttcccaggaatattataatgttaag 45694016  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||| |||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45694015 caaacatttttttttaaaatgccttggaataaaattctcatctttatgttccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 45693916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1988337 - 1988073
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1988337 atgatagaaatatacatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccggatataaaatgttcttgggaatagaaaaattttctcaaggaaaag 1988238  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1988237 ggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcttatatag-ttacctattataatccctatttttttggttccaaggaatattataaagttaac 1988139  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc 266  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1988138 caaacatatttttcccaaaaatcttggaataaaattctcatatttatattctaaggaatgttattc 1988073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40570031 - 40569738
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag-- 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||      
T  40570031 atgcctatgtttgttacaagtttgttaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatttttcccaaagaaaatggtgggaataaagaa 40569932  T
Q  114 -ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
     |||||||||| ||| ||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  40569931 gttcccatggaaatgggaataaaatcatgtataatt-acctattataatccctatttttgaggttccttggaacattataatgttaaccaaacatctttt 40569833  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    | |||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40569832 ttctaaataccttggaataaaatttacatatatatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa 40569738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39819709 - 39819414
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaat---gttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaata 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  39819709 atatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttcattcccgggtatataataatgttcctgggaattgaaaaaaatttccaaagaaaatggtgggaata 39819610  T
Q  111 aagttcccatggagatgagaataaattcataaata---gtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat 207  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| | ||| ||    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39819609 aagttctcatgaagatgagagtaaaattatatatgtttgtttacctaatataatccttatttttaaggttccttggaatattataaagtcaaccaaacat 39819510  T
Q  208 atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39819509 attttttctaaatacctgggaataaaatttccatctttatattccaaagaatgttattcctatgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacc 39819414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7007531 - 7007306
Alignment:
Q  80 aaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcc 179  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  7007531 aaaaaaattcccaaagaaaatggtgggaataaaattaccatggagatgagaataaattcatatgtagtt-acctattatactccctattttaatggttct 7007433  T
Q  180 taggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatt 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||    
T  7007432 taggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatactttagaataaaattctcatctttatatttcaagaaatgttattcctaataataaatt 7007333  T
Q  280 tagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  7007332 tggtaaacttaaaacaaacacacccta 7007306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4875781 - 4875506
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |   ||||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4875781 tatgtttgttacaagtttgctaaattttattttcaa-tataaaacgttctcgagaataaaaaaaaaatcccaaagaaacgggtgggaataaagttcccat 4875683  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc-ctaaa 219  Q
    | |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||  ||||||||||||  |||||    
T  4875682 gaagatgagaataaattcatatgtaatt-acatattataatccctatttttatggttcctcggcatattataatgttaagaaaacatatttttttctaaa 4875584  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  4875583 tacattggaataaaattcacatctttatattccaaagaatattattcctaagaataaatttgacaaacttgaaacaaa 4875506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Original strand, 5002897 - 5003182
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt 115  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  5002897 atgcatatatttgttacaagtttgctaaattttattccaag-tataaaatgtttctgggaatagaaaaaaaattccaaagaatatggtgggaataaagtt 5002995  T
Q  116 cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc 215  Q
     ||||| ||||  |||| |||||||   ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| || | ||||||||||| ||||  |    
T  5002996 tccatgaagatatgaatcaattcatgtgtaact-acctattataatccatatttttatggttcctgaaaatattaaaatgttaaccaaacatcttttatc 5003094  T
Q  216 taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  5003095 caaataccttggaataaaattcgcatctttatattccaaggaatgttattcctataaataaatttggtaaattttaaacaaacacacc 5003182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 11763416 - 11763577
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11763416 atgataggaatatatatgtctatgtttgttataaatttactaaattttattctcggacataaaatatttctgggaatagaaaaaatttccaaaggaaaaa 11763515  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11763516 ggtgggaataaagtttccatgaagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatcc 11763577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Original strand, 41297983 - 41298255
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||    
T  41297983 tatgtatgttacaagtttattaaattttattcccggatataaaatgtttttagaaataaaaaaaatttcccaaagcaaagggtgtgaataaagttctcat 41298082  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat 220  Q
    | ||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||  |||||    
T  41298083 gaagatgagaatatattcatttata-attacctattataatctctattcttatggttccttggaatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaat 41298181  T
Q  221 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
     |     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||| |||||||    
T  41298182 ac---aaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaaaataaatttgatatacttaaaacaaa 41298255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 11763597 - 11763737
Alignment:
Q  153 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11763597 tattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaaattaatcaaacatattttttctagataccttggaataaaattctcatctttatattcc 11763696  T
Q  253 aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaa 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11763697 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa 11763737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13790280 - 13790018
Alignment:
Q  29 ttataagtttactaaattttattcccgggta--taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||| ||| |||||||||||          |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13790280 ttataagtttactaaattttattctagagtacataaaatgttcttggaaatagaaaaaa----------aaaacggtgggaataaagttcccatggagat 13790191  T
Q  127 gagaataaattcata-aatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct-aaattcct 224  Q
    | ||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||  | |||| |||    
T  13790190 gggaataaaatcatgtaata--ttacctattataatccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaatcaaacatctttttttttaaatacct 13790093  T
Q  225 tggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  13790092 tagaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgttattcctacaaataaatttgataaacttgaaacaaaca 13790018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 3254284 - 3254437
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  3254284 ttacttattataacccttatttttatggtttctaggaatattatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttagaataaaattctcatttttat 3254383  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3254384 attccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca 3254437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13539675 - 13539399
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||   ||||||||||||||||||    
T  13539675 ctatgtttgttacaaatttattaaattttattcgcaggtataaaatgtttatgggaatggaaaaaatttctcacagaaactagtgggaataaagttccca 13539576  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 219  Q
    || | ||| ||||| ||||||   || || | |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||| |||||    
T  13539575 tgaacatgggaatagattcatgtgtaatt-atctattataatccttatttttatggtttctgagaatactataatgttaagcaaacatcttttttctaaa 13539477  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    |   || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13539476 tattttagaataaaattctcatctttatgttccaagaaatgttatcaccaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaa 13539399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14253548 - 14253412
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14253548 atgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttctcaaagaaaag 14253449  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatt 137  Q
    |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  14253448 ggtgtgaataaaattttcatgaagatgagaataaatt 14253412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6571713 - 6571602
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6571713 atgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcaggtataaaatgttccggggaatataaaaaatttcccaagaaaaag 6571614  T
Q  101 ggtgggaataaa 112  Q
    ||| ||||||||    
T  6571613 ggtaggaataaa 6571602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25725010 - 25724753
Alignment:
Q  42 aaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcata 141  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||    
T  25725010 aaattttattgctgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaagtttcccaaagaaaagggtgggaataaagttctcatgaagatgagaataatttc-ta 25724912  T
Q  142 aatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattccca- 240  Q
           |||||||||   |||||||| | |||||| | | |||||||| ||   ||||||||||  |||||   ||||  || ||||||||| |||||     
T  25724911 gtgtaactacctattaacctccctattataatggtttccaagaatattacaatattaaccaaacaactttttttaaaatatctaggaataaaactcccat 25724812  T
Q  241 tctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25724811 tccttaaattccaaggaaagttattcttgggaataaatctagtaaacttgaaacaaaca 25724753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1623188 - 1623078
Alignment:
Q  190 ataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt 289  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1623188 ataaagttaaccaaacatatattttctaaatac-ttgaaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattactaggaataaatttagtaaaatt 1623090  T
Q  290 gaaacaaacaca 301  Q
    ||||||||||||    
T  1623089 gaaacaaacaca 1623078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1623405 - 1623206
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||| ||| |||| ||| | ||     
T  1623405 atagaaatatatatgtctatgtt-gttacgagtttattaaatttgattcccggttataaaatgttcctgagtacagagaaatttttccaaagaacatggc 1623307  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  1623306 gggaataaagtttcaatgaatatgagaataaattcatatgtag-ttaccaattataatctctatttttatggttcctacgaataatataaagttaatcaa 1623208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24895390 - 24895267
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   |||||||    
T  24895390 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtgagttccatttccaaagtgtatgacccacattgatttaacccaatgaaagagtgagtgttagagagagt 24895291  T
Q  402 gtccaaaatagattgttgccggta 425  Q
     ||||||| |||  ||||||||||    
T  24895290 atccaaaagagagagttgccggta 24895267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4685185 - 4684945
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtt-cctgggaatagaaaaaatttcc-caaggaaaagggtgggaataaagttccc 118  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| |||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4685185 tatgtttgttataaatttattaaattttatttcagagtataaaacgtttcctggcaatagaaaaaaaaaaatcaaagaaaagggtgtgaataaagttccc 4685086  T
Q  119 atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaa 218  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||   ||    |||||||||||| | ||||||||||| ||| | || |||||||| | ||| |||| |||||||| ||||    
T  4685085 atgaagatgggaacaaattcatgtgta----acctattataattcatatttttatggatccgaaga-tattataatgttaagcaaatatatttttactaa 4684991  T
Q  219 attccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 264  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  4684990 atacctaggaataaaattctcatctttatgttctaaagaatgttat 4684945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37851864 - 37851678
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc 118  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||    | |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  37851864 tatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattccaaagaaaatggtgagaataaagttccc 37851766  T
Q  119 atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||   ||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||    
T  37851765 atgaagatgagaataaattcatgtgta-actacctattataattcatatttttatgattcctaaaaatattataatgttaactaaacat 37851678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25455037 - 25454914
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaat--aa 111  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| || ||||||  ||    
T  25455037 atatgtctatgtttgttacaagtttactaaatttcattctcgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaaaaaaatggagggaataaaa 25454938  T
Q  112 agttcccatggagatgagaataaa 135  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  25454937 agttcccatgaagacgagaataaa 25454914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Original strand, 3254142 - 3254245
Alignment:
Q  35 gtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt-cccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaata 133  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3254142 gtttactaaattttattctcgcgtacaaaatgtttctgggaatagaaaattttttcccaaaggaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgagaata 3254241  T
Q  134 aatt 137  Q
    ||||    
T  3254242 aatt 3254245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2521434 - 2521381
Alignment:
Q  244 ttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2521434 ttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaa 2521381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Original strand, 38104305 - 38104394
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  38104305 taaaatcaatgtatgttccaccactttatttgggttccattcccaaagtgtatgacccacattgaattaattcaatgagagagtgagtgt 38104394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 8868728 - 8868842
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||| | | ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8868728 tatgtttgttacaggattagtaaattttattcctaggtagaaaatgttcctggga-taggaata-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccat 8868825  T
Q  121 ggagatgagaataaatt 137  Q
    | ||||| | |||||||    
T  8868826 gaagatgggtataaatt 8868842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 137
Target Start/End: Original strand, 516463 - 516572
Alignment:
Q  27 tgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagat 126  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||| ||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  516463 tgttataattttagtaaattttatttctgggtataaaatgtttttgggaatataaaaaaatt-ccaaagaaaatggtgagaataaaattcccgtgaagat 516561  T
Q  127 gagaataaatt 137  Q
    |||||||||||    
T  516562 gagaataaatt 516572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Original strand, 14403431 - 14403558
Alignment:
Q  183 gaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatc--tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt 280  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||  |||||||| |||| | ||||||| |||  |||||||||    
T  14403431 gaatattataaagttaaccaaaaatattttttctaaaaaccttagtataaaatttccatctttttatatttcaagaactgttatttctaaaaataaattt 14403530  T
Q  281 agtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
      ||||||| |||||||| |||||||||    
T  14403531 gataaacttaaaacaaactcaccctaaa 14403558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14253413 - 14253340
Alignment:
Q  168 ttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccat 241  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  14253413 ttttatgtttcctaaaaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatattttggaataaaatttccat 14253340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24499449 - 24499400
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttc 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24499449 ctatgtttgttataagtttactaaattttattccatggtataaaatgttc 24499400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14253325 - 14253254
Alignment:
Q  228 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||    
T  14253325 aataaaattctcatccttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaatttaaaacaaaca 14253254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35316524 - 35316438
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt 392  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35316524 taaaattaatgtatgtcccaccattttatgttgattcaatttttaaattgtaga-cccacaatgatttaaatcaataagagagtgagt 35316438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37719943 - 37719872
Alignment:
Q  322 ccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  37719943 ccaccattttaagtggattccatttctaaagtgtatgtcctacattgatttcatccaataaaagagtgagtg 37719872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 36590862 - 36590915
Alignment:
Q  245 tatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36590862 tatattccaacgaatgttattcctaaaaataaatttagtaaacttaaaacaaac 36590915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 390
Target Start/End: Original strand, 1110257 - 1110340
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtga 390  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||  || |||||||||| || |||||| |||||||    
T  1110257 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtatatgtcctacattgatttcacccaataaaagagtga 1110340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Original strand, 8868938 - 8868980
Alignment:
Q  255 ggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8868938 ggaaagttattcgtaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 8868980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 15508973 - 15509059
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||| || |||| | ||||| ||||    
T  15508973 aaatcaatgtatgtcccaccattttttgtgggttccatttccaaagtgtagatcctacattgatttcacccaattaaagagtaagtg 15509059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 403
Target Start/End: Original strand, 21447178 - 21447260
Alignment:
Q  322 ccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg-tagagagtgt 403  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  21447178 ccaccattttatgtgggacccatttccaaagtgtaagacccacattgatttcacacaataaaagagtgggtgttagagagtgt 21447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28898158 - 28898072
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | || |||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  28898158 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggtttcatttccaaagtgtagatcctacattgatttcatccaataaaagagtgagtg 28898072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 42182948 - 42183034
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  42182948 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaaagagttagtg 42183034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14137153 - 14137038
Alignment:
Q  77 tagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggt 176  Q
    |||||||| |||| |||  |||||| |  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||  |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  14137153 tagaaaaattttctcaaaaaaaaggttaagaataaagttctcatgaagacgagaataaattcatatgta-attacttattaaaatctctatttttatggt 14137055  T
Q  177 tcctaggaatattataa 193  Q
    |  | ||||||||||||    
T  14137054 tgttgggaatattataa 14137038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25444999 - 25444919
Alignment:
Q  228 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||    
T  25444999 aataaaattatcatctttatattccaaaaaatgttattccttaaaataaatttgacaaacttaaaacatacacaccctaaa 25444919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27183463 - 27183395
Alignment:
Q  323 caccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgag 391  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  27183463 caccattttatgttaattccattttcaaagtgtatgatccacattgatttaacccaataaaaaagtgag 27183395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27833005 - 27832937
Alignment:
Q  323 caccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgag 391  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  27833005 caccattttatgttaattccattttcaaagtgtatgatccacattgatttaacccaataaaaaagtgag 27832937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 420
Target Start/End: Original strand, 12989250 - 12989365
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagtgt 403  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||    
T  12989250 aaatcaatgtatgtcccaccactttgtatggattctatttccgaagtgtaga-cccacaatgatttaaaccaataagagagtgagtattagagagagtgt 12989348  T
Q  404 ccaaaatagattgttgc 420  Q
     ||||| ||| ||||||    
T  12989349 tcaaaagagagtgttgc 12989365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25625377 - 25625328
Alignment:
Q  36 tttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 85  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25625377 tttactagattttattctgaggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaa 25625328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45212735 - 45212662
Alignment:
Q  224 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||  |||||||||  |||| || |||||||    
T  45212735 ttggaataaaattctcatctttacatttcaaagaatgtaattcctaaaaataaatttgataaatttaaaacaaa 45212662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 13230034 - 13230339
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230034 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 13230133  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230134 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 13230233  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13230234 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 13230333  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  13230334 acccta 13230339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 27762944 - 27763246
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27762944 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaatatttcccaaggaaaag 27763043  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763044 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 27763143  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27763144 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 27763243  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  27763244 acc 27763246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 45747841 - 45748145
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45747841 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 45747940  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45747941 ggggggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc-attataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 45748039  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45748040 caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 45748139  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  45748140 acccta 45748145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 48518936 - 48519233
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48518936 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 48519035  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48519036 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatacctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 48519135  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48519136 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcacatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 48519233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 39730338 - 39730645
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39730338 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 39730437  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39730438 ggtgggaataaagttcacatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaac 39730537  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39730538 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 39730637  T
Q  301 accctaaa 308  Q
    ||||||||    
T  39730638 accctaaa 39730645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 48879355 - 48879049
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48879355 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 48879256  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48879255 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 48879156  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48879155 caaacatatttttcctacattccttggaataatattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 48879056  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  48879055 accctaa 48879049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42773978 - 42773674
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42773978 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctggggataaaaaaaatttcccaaggaaaag 42773879  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42773878 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 42773779  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42773778 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatactccaaggaatgttatttctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 42773679  T
Q  301 accct 305  Q
     ||||    
T  42773678 gccct 42773674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43723294 - 43722990
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723294 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 43723195  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723194 ggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 43723095  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43723094 caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 43722995  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  43722994 accct 43722990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45596298 - 45595994
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45596298 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 45596199  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45596198 ggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 45596099  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45596098 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 45595999  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  45595998 accct 45595994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35999716 - 35999410
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35999716 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 35999617  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35999616 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 35999517  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  35999516 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaa 35999417  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  35999416 accctaa 35999410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25932471 - 25932167
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25932471 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 25932372  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25932371 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 25932272  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25932271 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaatttgggaaacttgaaacaaacac 25932172  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  25932171 accct 25932167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 55968045 - 55968349
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  55968045 atgattggaatgtatatgtctctgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag 55968144  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55968145 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 55968244  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55968245 caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 55968344  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  55968345 accct 55968349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 41859092 - 41859395
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41859092 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-atttcccaaggaaaag 41859190  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41859191 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 41859290  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41859291 caaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 41859390  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  41859391 accct 41859395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 6279966 - 6280273
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6279966 atgatatgaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 6280065  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6280066 ggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 6280165  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6280166 caaatatatttttcataaattccttggaataaaattcctatttttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 6280265  T
Q  301 accctaaa 308  Q
    ||||||||    
T  6280266 accctaaa 6280273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47670392 - 47670088
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47670392 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 47670293  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47670292 ggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagataac 47670193  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47670192 caaatatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 47670093  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  47670092 accct 47670088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40435930 - 40435628
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435930 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 40435831  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40435830 ggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 40435731  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40435730 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 40435631  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  40435630 acc 40435628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 50672950 - 50673245
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50672950 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 50673049  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50673050 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatcccta-ttttatggttcctaggaatattataaagctaac 50673148  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50673149 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaa 50673245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Original strand, 39835360 - 39835660
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39835360 aatgtatatgcatatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 39835459  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39835460 taaagttcccatggagattagaataaattcataaatagtttacctattataatccttatttttatgatttctaggaatattataaagttaaccaaacata 39835559  T
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39835560 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcatagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 39835659  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  39835660 a 39835660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 41744265 - 41744568
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccg-ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744265 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatttctttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa 41744364  T
Q  100 gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744365 gggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataattagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 41744464  T
Q  200 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41744465 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 41744564  T
Q  300 cacc 303  Q
    ||||    
T  41744565 cacc 41744568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23686817 - 23686511
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23686817 atgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatatttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 23686718  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23686717 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataattcatatttttatggttcctaggaatattataaaactaac 23686618  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23686617 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 23686518  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  23686517 accctaa 23686511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 305
Target Start/End: Original strand, 18405282 - 18405582
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18405282 atagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcc-aaggaaaagggt 18405380  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405381 gagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 18405480  T
Q  204 acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18405481 acatatttttcctaaattcctgagaataaaatttccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 18405580  T
Q  304 ct 305  Q
    ||    
T  18405581 ct 18405582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 936156 - 935852
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  936156 atgattggaatatatatccctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcacaagaaaaag 936057  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  936056 ggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaac 935957  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  935956 caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcctatctttatattccaagaaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 935857  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  935856 accct 935852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 34238007 - 34238295
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34238007 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcttgggaatagaaacaatttcccaaggaaaagggtgggaa 34238106  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34238107 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctattttttttgttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 34238206  T
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  34238207 tttttcttaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaa 34238295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32953553 - 32953246
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  32953553 atgataggaatgtatatgcctatctttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 32953454  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32953453 ggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagttttcctattataatccctatttttatggttccttgaaatattataaagctaac 32953354  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||     
T  32953353 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaatgaatattatttctagaaataaattagataaacttgaaacaaacat 32953254  T
Q  301 accctaaa 308  Q
    ||||||||    
T  32953253 accctaaa 32953246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8322275 - 8321969
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8322275 atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatattcttgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaag 8322176  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8322175 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaac 8322076  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8322075 caaacatatttttcctaaattccttgtaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 8321976  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  8321975 accctaa 8321969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27942747 - 27942465
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942747 tatgtttattataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 27942648  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat 220  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27942647 tgaaatgagaataaattcataaataatttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaat 27942548  T
Q  221 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27942547 tccttgaaataaaattctcatatttatattcctaaaaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 27942465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 34049642 - 34049904
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34049642 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccagggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaat 34049741  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34049742 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttttcctattataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaac 34049841  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34049842 caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta 34049904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27555440 - 27555153
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||                ||||||||||||||||||||    
T  27555440 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcgcgggtataaaa----------------aaaaatttcccaaggaaaag 27555357  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27555356 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaac 27555258  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27555257 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 27555158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18931783 - 18931482
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  18931783 atgataggaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattcccgtgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaagaaaaat 18931684  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18931683 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatttataaataattttcctattataatccctatttttatagttcataggaatattataaagctaac 18931584  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18931583 caaacatatttttcttaaattccttggaataaaatttctatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttgataaacttaaaacaaacac 18931484  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  18931483 ac 18931482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 74 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 48873978 - 48873745
Alignment:
Q  74 gaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48873978 gaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttat 48873879  T
Q  174 ggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48873878 ggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctacattccttggaataatattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaa 48873779  T
Q  274 taaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48873778 taaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa 48873745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Original strand, 31937929 - 31938217
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa-gggtgggaataaagt 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31937929 atgcatatgtttgttagaagtttattaaattttattcccaaatataaaatgttcttgggaataaaaaaaattttccaaggaaaaagggtgggaataaagt 31938028  T
Q  115 tcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31938029 tcccatggagatgagaataaattcataaacagtt-acctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttc 31938127  T
Q  215 ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31938128 ctaaataccttggaataaaattttcatctttaaattccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 31938217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39498855 - 39498590
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  39498855 atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaag 39498756  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39498755 ggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 39498656  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39498655 caaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattc 39498590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39502194 - 39501929
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  39502194 atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaag 39502095  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39502094 ggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 39501995  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501994 caaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattc 39501929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25916080 - 25916295
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25916080 atgataggaatgtat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 25916177  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25916178 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaat 25916277  T
Q  201 caaacatatttttcctaa 218  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  25916278 caaacatattttttctaa 25916295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7258971 - 7258691
Alignment:
Q  23 tgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgg 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||     
T  7258971 tgtttgttacaagtttactaaattttatttccgcgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccaaaagaaaagagtgggaataaagttcccatga 7258872  T
Q  123 agatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattc 222  Q
    | ||| ||||||||||||   ||   ||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||    |||| |    
T  7258871 atatgggaataaattcatttgta-actacttattatagtcctaatttttatggttccttggaatattaaaatgttaaccaaacatcttttattcaaatac 7258773  T
Q  223 cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7258772 cttggaataaaattcccatatttatattccaaggaatgttattcctgagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 7258691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51968792 - 51968502
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa-gggtgggaataaagt 114  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51968792 atgcctatgtttgttacaagtttgctaaattttattcttgagtataaaacgttcctgggaatagaaaatgtttcccaaagaaaaagggtgggaataaagt 51968693  T
Q  115 tcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc 214  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||  || || ||  |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||| |||||     
T  51968692 tcccatgaagatggaaataatttcatatgtaatt-ac--attataatccttatttttatggttctcagaaatattataatgttaaacaaacatctttttt 51968596  T
Q  215 ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51968595 ctatataccttggaataaaattctcatctttacgtacgaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 51968502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 52469728 - 52469419
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||   ||| |||||||||      
T  52469728 atgatagaattgcatatgtctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccggcaataaaatgtttctaggaatagaaatttttttccaaggaaatt 52469629  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52469628 ggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattccaatatag-ttacctattataatctctatatttatggttcataggaatattataaagctaac 52469530  T
Q  201 caaacat-atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc-aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    |||||||  ||||| ||||||   |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  52469529 caaacatgtttttttctaaatattttggtataaaatttcaatctttatattccaaaggaatgttattcctaagaataaatttgattaacttaaaacaaac 52469430  T
Q  299 acaccctaaaa 309  Q
    ||| |||||||    
T  52469429 acatcctaaaa 52469419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36858351 - 36858135
Alignment:
Q  86 tttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaa 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36858351 tttcccaaagaaaagggtgggaataaaattctcatggagatgggaataaattcatatatagtt-acctgttataatccttatttttatggttcctaggaa 36858253  T
Q  186 tattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaa 285  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  36858252 tattacaaagttatccaaacatatttttcttaaatacctt-gaatgaaattcccatctgtgtattacaaggaatgttattcttaagaataaattttataa 36858154  T
Q  286 acttgaaacaaacacaccc 304  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  36858153 acttgtaacaagcacaccc 36858135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38414236 - 38414032
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38414236 atgatagaaatatacatgtctatgtttgtaataagtttactaaattttattccatg-tataaaatgtttccgggaatataaaaaatttcccaaggaaaag 38414138  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  38414137 ggtgggaataaagttctcatggagatggtaataaattcatatgtag-ttacctattataattcctatttttatggtttctaagaatattataaagttacc 38414039  T
Q  201 caaacat 207  Q
    |||||||    
T  38414038 caaacat 38414032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 37014451 - 37014737
Alignment:
Q  22 atgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatg 121  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  37014451 atgtttgttatgagtttattaaattttatatccaggtataacatgttcataggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagagtggaaataaagttctcatg 37014550  T
Q  122 gagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatt 221  Q
     ||||||||||||||||||   || ||| | || |||||| | |||||||| | || || | |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||     
T  37014551 aagatgagaataaattcatgtgtaattt-cttactataattcttatttttaagatttct-gaaatattataatgttaaccaaacatcttttttctaaata 37014648  T
Q  222 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaat 310  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  37014649 tcttcgaataaaattcgcatctttatattccaaaaaatattattcttaggaataaattttgtaaacttgaaacaaatacatcccaaaat 37014737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 47426298 - 47426520
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag-gaaaagggtgggaataa 111  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||  |||||||||| |||||    
T  47426298 tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttcttgatataaaatgttcctggaaatagaaaaatattatcaagaaaaaagggtggcaataa 47426397  T
Q  112 agttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattt 211  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47426398 agttcccatgaagatgaaaataaattcataaatag-ttacctattataatcccta-------ggttcctaggaatattataaagttaaccaaatatattt 47426489  T
Q  212 ttcctaaattccttggaataaaattcccatc 242  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47426490 tttctaaatacctttgaataaaattcccatc 47426520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30415932 - 30415743
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     
T  30415932 atgataggaatatatatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattcccaaatataaaatgttctttggaatagaaaaaatttcccaaagaaaat 30415833  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattat 191  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30415832 ggtgggaataaaatttccataaagatgaaaataatttcataaata-attacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattat 30415743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38394930 - 38394634
Alignment:
Q  7 ggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg-tgg 105  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  38394930 ggaatatacatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcctag-tataaaatatttctggaaatataaaaaaattcccaaagaaaaggggtgg 38394832  T
Q  106 gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaac 205  Q
    |||||||||||  || ||||||  ||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||| |||||    
T  38394831 gaataaagttctgatagagatggaaataaattcatgagtaattt-cctattataattcctatttttatggttcccaaaaatattataatattaagcaaac 38394733  T
Q  206 atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    || ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38394732 atcttttttctaaataccttgaaataaaattctcatatttatgttctaagaaatattagtcttagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 38394634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 36858436 - 36858634
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaat---ttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||  ||  |||||||||||||||||    
T  36858436 atgcttatgtttgttacaagtttactaaattttatgcccgggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaaattc--aaataaaagggtgggaataaa 36858533  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  36858534 gttcccatgaagatgagaataatttcatatgtaatt-acatattataatccctatttttatggtttccgggaatattataatgttaaacaaacatatttt 36858632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30790518 - 30790270
Alignment:
Q  55 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||| | ||     || ||  ||    
T  30790518 gggtataaaatgtttctgagaatagaaaagtttttccaatgaaaaggatgggaataaagtttccatgaagatggaaataaaattat-----gtgtaatta 30790424  T
Q  155 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 254  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30790423 ttataaattctatttttaaggttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaatactttggaataaatttctcatctttatattccaa 30790324  T
Q  255 ggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 309  Q
     |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30790323 -gaatgttactcctagaaataaatttgctaaacttgaaacaaacacacccaaaaa 30790270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18405764 - 18405592
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  18405764 ctatgtttgttacaagtttacaaaattttatttctaggtataaaatgttcctaggaatagaaaatttttcctaaagaaaagggtgggaataaagttctca 18405665  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataa 193  Q
    |  ||||| |||||||| |||   ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18405664 ttaagatgggaataaatccatgtgta-attacctattataatctctatttttatggttcctagaaatattataa 18405592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 302
Target Start/End: Original strand, 10400973 - 10401126
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  10400973 ttacctattataatccttatttttatggttccgaggaatattataaa-ctaaccaaacatgttttttctatatatcttggaataaaattctcatttttat 10401071  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    | | ||| |||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10401072 acttcaaagaatgttatttccagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac 10401126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38414015 - 38413902
Alignment:
Q  192 aaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttga 291  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  38414015 aaagttaaccaaacatattttttctaaataccttggaattaaattctcatctttatattccaaggaatgttatttctaaaattaaatttggtaaacttga 38413916  T
Q  292 aacaaacacaccct 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  38413915 aacaaacacgccct 38413902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44309771 - 44309497
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44309771 ctatgtttgttacaaggttactaaattttattcctag-tataaaacgttctagagaatagaaaaaaatttcctaaagaaaagggtgggaataaagttccc 44309673  T
Q  119 atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaa 218  Q
    ||| | |||| |||  ||| ||   ||  ||| || ||||||||||||||||||   |||    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  44309672 atgaatatgaaaatttattaatgtgta-attatctgttataatccctatttttagtattctcgagaatattataatgttaaccatacatatttttcctaa 44309574  T
Q  219 attccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaaca 295  Q
    |  | ||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  44309573 acactttgaaattaaattctcatctttatgttctaagaaatattattcttaaaaataaatttagtaaacttcaaaca 44309497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48060065 - 48059806
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||   || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||    
T  48060065 tatgtttgttacgagtttattaaattttatttttggatataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaataaaatggtgggaataaagttctcat 48059966  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata-tttttcctaaa 219  Q
      | ||   |||||||||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||  |||  ||||||| ||||| |||||    
T  48059965 aaaaatataaataaattcatatata-attacctattataattcttatttttataattcctagaaatattataaaattaattaaacatatttttttctaaa 48059867  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattt 280  Q
    | | | | |||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||||| || ||||||||||    
T  48059866 tacatcgaaataaaattctcatcattatattctaaaaaatattattcgtaagaataaattt 48059806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 10400850 - 10400961
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||      
T  10400850 atgatagaaatgtatatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattcttgggtataaaatattcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaatt 10400949  T
Q  101 ggtgggaataaa 112  Q
    ||||||||||||    
T  10400950 ggtgggaataaa 10400961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 24805150 - 24805397
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg-gaataaagttccca 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  24805150 tatgtttgttacaaatttactaaattttattttcgggaataaaacatt-ttgggaatagaaaaaatttcacaaagaaaatggtggaaaataaagttccca 24805248  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatt-------tttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    || | ||| |||||||| |||   ||  |||||||||||| ||||||||       ||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  24805249 tgaatatgggaataaatccatgtgta-attacctattatattccctatttttatggtttatggttcccagtaatattataatgttaagcaaacatctttt 24805347  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 262  Q
    | |||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24805348 ttctaaataccttaaagtaaaattcacatctttatgttccaaggaatgtt 24805397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12275956 - 12276259
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||   |||     
T  12275956 atgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgttcttggaaaaagaaatattttcccaaaagaaaa 12276055  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||| || |||||   ||  || | |||||    || |||||| | ||||  |  ||||||| ||| | ||||    
T  12276056 ggtgggaataaaattcccataaaaatgagaaaaagttcatgtgtaacttgcttattaatcgccatattttgaaggtt-atgagaatattttaatgttaac 12276154  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa-ca 299  Q
    | |||||||  || ||||||   ||| |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12276155 cgaacatatgctttctaaatattttgaaataaaattcacatctttatatt-caaaaaatgttattcctataaataaatttagtaaacttgaaacaaatca 12276253  T
Q  300 caccct 305  Q
    ||||||    
T  12276254 caccct 12276259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 36860027 - 36860104
Alignment:
Q  227 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36860027 gaataaaatttccatttttatgttccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 36860104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18094259 - 18094073
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc 118  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||    | |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  18094259 tatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattccaaagaaaatggtgagaataaagttccc 18094161  T
Q  119 atggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||   ||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||    
T  18094160 atgaagatgagaataaattcatgtgta-actacctattataattcatatttttatgattcctaaaaatattataatgttaactaaacat 18094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18405224 - 18405129
Alignment:
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  18405224 ttttttctaaataccttggaataca-ttcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaagaataaatttggcaaacttaaaacaaacacaccct 18405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 307
Target Start/End: Original strand, 25916302 - 25916364
Alignment:
Q  246 atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt-gaaacaaacacaccctaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25916302 atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttagaaacaaacacaccctaa 25916364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52414061 - 52413959
Alignment:
Q  197 taaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaa 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  52414061 taaccaaacatattttttctaattcgcttgaaataaaattcacatctttatattccaagggttgttatttctaagaataaatttggtaaatttgaagcaa 52413962  T
Q  297 aca 299  Q
    |||    
T  52413961 aca 52413959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Original strand, 32384492 - 32384650
Alignment:
Q  55 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct 153  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||| ||||| ||    | || ||||    
T  32384492 gggtataaaacgttcatggaaacagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaaattcccataaagattggaacaaatttatgtgcaatt-acct 32384590  T
Q  154 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttt 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  32384591 attataatccctaattttatggtttccaggaatattataatgttaagcaaacatactttt 32384650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Original strand, 13069999 - 13070086
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||   || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13069999 aaatcaatgtatgttccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtaggtcctacattgattttactcaataaaagagtgagtgt 13070086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26165374 - 26165155
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||  || |||||  ||| |||||||||||||||    
T  26165374 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcatgaatataaaatgtt-cttagaatagaaaagttttcataaagaaaatagtgagaataaagttcccat 26165276  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacc---tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat-atttttcct 216  Q
      ||||||||||||| | ||  |||  |||||   ||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||||   |||||||||||  ||||| ||    
T  26165275 taagatgagaataaaattatgtata-attacctattattatattccctatttttaaggttctttgaaatattataatattaaccaaacatctttttttct 26165177  T
Q  217 aaattccttggaataaaattcc 238  Q
    |||| | || ||||||||||||    
T  26165176 aaatactttagaataaaattcc 26165155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22654522 - 22654655
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tcccaaggaaa 98  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||  |||    
T  22654522 atgatagaaatatacatgcctatgtttattacaagttaactaatttttattctcgggtaaaaaatgttattgcgaatagaaaaactttctccaaaaaaaa 22654621  T
Q  99 agggtgggaataaagttcccatggagatgagaat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  22654622 agggtgggaataaagttttcatgaaaatgagaat 22654655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37296580 - 37296473
Alignment:
Q  154 attataatccctattttt-atggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 252  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37296580 attataatctctattttttaaggttcttagggatattctaatgttaaccaaacattttttt-------tccttggaataaaattcacatatttatattcc 37296488  T
Q  253 aaggaatgttattcc 267  Q
    |||||||||||||||    
T  37296487 aaggaatgttattcc 37296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14796439 - 14796314
Alignment:
Q  155 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 254  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14796439 ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa 14796340  T
Q  255 ggaatgttattcctaggaataaattt 280  Q
      ||| |||||||||  |||||||||    
T  14796339 aaaatattattcctaaaaataaattt 14796314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25719234 - 25719149
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt 392  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  25719234 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggtttcatttccaaaatgtaggacccacaatgatttaacccaatcagagagtgagt 25719149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 54478555 - 54478495
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  54478555 tatgtttgttataagtttactaaatttcattcatgggtataaaatgttattggaaatagaa 54478495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2088786 - 2088699
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||| ||||||   ||||| |||||||||||    
T  2088786 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtggattccatttccaaagtgtagatcctgcattaatttaagctaataaaagagtgagtgt 2088699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54478437 - 54478366
Alignment:
Q  197 taaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcct 268  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  54478437 taaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcacatatttatatttcaagaaatgctattcct 54478366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21776968 - 21776850
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||| || ||||||| || || ||||| |||||||   |||||||    
T  21776968 taaaatcaatgtatgtcctaccactttatgtggattttatttccaaaatgtatgacccatatcgatttaattcgatgagagaatgagtgttagagagagt 21776869  T
Q  402 gtccaaaatagattgttgc 420  Q
    ||| |||| ||| ||||||    
T  21776868 gtcaaaaagagagtgttgc 21776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 354
Target Start/End: Original strand, 44832522 - 44832569
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtg 354  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44832522 aaattaatgtatgtcccaccattttatgtggattccatttccaaagtg 44832569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Original strand, 19447194 - 19447306
Alignment:
Q  311 caatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagtgtccaa 407  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  ||| || |  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||| |||    
T  19447194 caatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaaatgcaggaccgacaatgatttaactcaattagagagtgagtattaaagagagtgttcaa 19447293  T
Q  408 aatagattgttgc 420  Q
    || ||| ||||||    
T  19447294 aagagagtgttgc 19447306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 39016722 - 39016808
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | | |||||||||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  39016722 aaatcaatgtatgtcccaccattttacgtgggttccatttccaaagtgtagtatctacattgattttacctaataaaagagtaagtg 39016808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42862542 - 42862456
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||  |||  | |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  42862542 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtgaaacataaattgatttcacccaataaaagagtgagtg 42862456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 304
Target Start/End: Original strand, 47426521 - 47426567
Alignment:
Q  258 atgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47426521 atgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaatcacaccc 47426567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 16178642 - 16178691
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta 356  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16178642 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgta 16178691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30415751 - 30415706
Alignment:
Q  256 gaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30415751 gaatattattcctaagaataaatttagtaatcttcaaacaaacaca 30415706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 37392591 - 37392895
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37392591 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 37392690  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37392691 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 37392790  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37392791 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 37392890  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  37392891 accct 37392895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 35818469 - 35818773
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35818469 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 35818568  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35818569 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 35818668  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35818669 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 35818768  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  35818769 accct 35818773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 32660978 - 32661285
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagg-aaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32660978 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagggaaaa 32661077  T
Q  100 gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32661078 gggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaa 32661177  T
Q  200 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32661178 ccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 32661277  T
Q  300 caccctaa 307  Q
    ||||||||    
T  32661278 caccctaa 32661285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38364107 - 38363804
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38364107 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 38364008  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38364007 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 38363908  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38363907 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 38363808  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  38363807 accc 38363804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18298138 - 18297836
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298138 atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 18298039  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18298038 ggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctaac 18297939  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18297938 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 18297839  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  18297838 acc 18297836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12710671 - 12710367
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710671 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 12710572  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710571 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 12710472  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12710471 gaaacatatttttcctacatttcttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 12710372  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  12710371 accct 12710367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25837937 - 25837633
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  25837937 atgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttacaaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaaaaaaag 25837838  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25837837 ggtggcaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaac 25837738  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25837737 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 25837638  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  25837637 accct 25837633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3050035 - 3049729
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  3050035 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaag 3049936  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3049935 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagataac 3049836  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3049835 caaacatattttttctaaattccttcgaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacac 3049736  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  3049735 accctaa 3049729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7931265 - 7930959
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7931265 atgatagaaatgtatatgtatatgtttgttataagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 7931166  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7931165 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 7931066  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7931065 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 7930966  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  7930965 accctaa 7930959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 26601983 - 26602288
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26601983 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgg-tataaaatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 26602081  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26602082 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttagctattataatccctatttttatggttccaaggaatattataaagctaac 26602181  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26602182 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatgtttcaaggaatgttatttctagcaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 26602281  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  26602282 accctaa 26602288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 16313552 - 16313856
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16313552 atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaat 16313651  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16313652 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaac 16313751  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16313752 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 16313851  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  16313852 accct 16313856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 38132782 - 38133087
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaaggaaaa 99  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38132782 atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaggaaaa 38132881  T
Q  100 gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38132882 gggtgggaataaagttctcatggagatgtgaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 38132981  T
Q  200 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38132982 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 38133081  T
Q  300 caccct 305  Q
    ||||||    
T  38133082 caccct 38133087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42755893 - 42755592
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42755893 atgatagaaatgtatatgcctatgttagttacaagtttactaaaatttattcctttgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 42755794  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42755793 ggtgggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 42755694  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42755693 caaatatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttcatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 42755594  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  42755593 ac 42755592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18726664 - 18726967
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaaggaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18726664 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaggaaaa 18726763  T
Q  100 gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18726764 gggtgggaataaagttctcatggagatggaaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 18726863  T
Q  200 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18726864 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattttcatctttatattccaattaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 18726963  T
Q  300 cacc 303  Q
    ||||    
T  18726964 cacc 18726967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26062170 - 26061866
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26062170 atgatagaaatgtatattcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgtccctgggaatagaaaaaaattcccaagaaaaag 26062071  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26062070 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 26061971  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26061970 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattacaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacac 26061871  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  26061870 accct 26061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 1554399 - 1554692
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1554399 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaag 1554498  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1554499 ggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcatacataatttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaaactaac 1554598  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatc-tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaa 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1554599 caaccatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa 1554692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 10896262 - 10896560
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||    
T  10896262 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaaaatc-aagaaaaag 10896360  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10896361 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaac 10896460  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10896461 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 10896560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 41228763 - 41228990
Alignment:
Q  5 taggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41228763 taggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccgaggaaaagggtg 41228862  T
Q  105 ggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaa 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41228863 ggaataaagttcctatggagat-agaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagctaaccaaa 41228961  T
Q  205 catatttttcctaaattccttggaataaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41228962 catatttttcctaaattccttggaataaa 41228990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Original strand, 5020543 - 5020843
Alignment:
Q  6 aggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg 105  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5020543 aggaatatatatgcatatgtttcttacaagtttactaaagtttactctcgggtataaaatgtttctgtgaatagaaaaattttcccaaggaaaagggtgg 5020642  T
Q  106 gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaac 205  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  5020643 gaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataagtag-ttacctattataatccatatttttatgattccca-gaatattataaagttaaccaaac 5020740  T
Q  206 atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  5020741 atatttttcctaaataccttagaataaaattatcatctttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacact 5020840  T
Q  306 aaa 308  Q
    |||    
T  5020841 aaa 5020843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 21137180 - 21137476
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||| |||| ||||| |||    
T  21137180 atagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtttgtgggaatataaatatttttccaaagaaaatggt 21137279  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21137280 ggaaataaagttctcgtggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatccgtatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaa 21137378  T
Q  204 acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  21137379 acatattttttttaaataccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaaatgttatt-ctagtaataaatttgataaactaaaaacaaacacac 21137476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 29421534 - 29421839
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  29421534 atgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttattaaattttattctcgggtataaaatatttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaat 29421633  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29421634 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatttatatgtag-ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaat 29421732  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataa---aattcccatctttata-ttccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaa 296  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||||||   ||||  |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29421733 caaatatattttttctaaataccttagaataaaacaattttcatctttatatttccaaataatgttattcataggaataaatttcgtaaa-ttaaaacaa 29421831  T
Q  297 acacaccc 304  Q
    ||||||||    
T  29421832 acacaccc 29421839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15226970 - 15226684
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15226970 tatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatattcctgcgaatagaaaagatt-cccaaagaaaagggtgggaataaagttcccat 15226872  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat 220  Q
    | ||||||||||||| | ||    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15226871 gaagatgagaataaaattatgtggaatt-acctattataatccctatttttaaggttccttggatttttataaagttaaccaaacatattttttctaaat 15226773  T
Q  221 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 309  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15226772 accttgaaataaaattctcatctttatattccaaggaaagttattcctaataataaatttggtaaaattgaaacaaacgcaccctaaaa 15226684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7317399 - 7317156
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||     
T  7317399 atgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc-ggatataaagtgttcctagga-tagaaaaattttcccaagaaaaat 7317302  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7317301 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcgtaaatagtt-acctattataatccctattttcatggttc-taggaatattataaagttaac 7317204  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7317203 caaacatatttttcctaaataccttagaataaaattcacatctttata 7317156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Original strand, 33444683 - 33444969
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  33444683 tatatgtctatgtttgttacaagtt-actaaattttattcccgg-tataaaatgttcttgggaatagaaaaaattgcccaaagaaaatggtgggaataaa 33444780  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33444781 gttcccatgaagatgaga-taatttcatatgtagtt-acctattagaatcactatttgtatgattgctaggaatattataaagttaaccaaacatatttt 33444878  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    | |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33444879 ttctaaataccttgaaataaaattttcatctttatattccatgaaatgttattcttatgaataaattcagtaaacttgaaacaaacacacc 33444969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 19160798 - 19161095
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  19160798 tatatgcagatgtttgttacaagtttactaaatttcattcccgtgtataaaatattcttgggaatataaaaaaaattccaaagaaaagggtgggaataaa 19160897  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata-ttt 211  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19160898 gttgtcatggagatgagaatgaattcatatgta-attacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataatgctaaccaaacatatttt 19160996  T
Q  212 ttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaat 310  Q
    || |||||| || || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19160997 tttctaaataccctgaaataaatttctcatctttatattccaaagaatgttattcttgagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccataaaat 19161095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35394404 - 35394156
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  35394404 tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttctacgtaatagaaaaaaatttccaagaaaaatggtgggaataaa 35394305  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35394304 gttcctaaggagatgggaacaaactcatatatagtt-acctattataatccttatttttatggttcataggaatattataaagttaaccaaacatatttt 35394206  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 262  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35394205 tcttaaataccttggaataaaattctcatctttatatttcaaggaatgtt 35394156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 40197226 - 40197402
Alignment:
Q  129 gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40197226 gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttaga 40197325  T
Q  229 ataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  40197326 ataaaattcccatctttatattccaaagaatattattcctaggaataaatttggtaaacttgaagcaaacaaaccct 40197402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 266
Target Start/End: Original strand, 6805700 - 6805936
Alignment:
Q  33 aagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6805700 aagtttactaaattttattcccgagtataatatgttcttgggaatagaaaatttttcctaaagaaaagggtgagaataaagttctcatggagatgagaat 6805799  T
Q  133 aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatt----ccttgga 228  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  6805800 aaattcataaatagat-acctattaaaatctctattttcatggttcctgggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatatataccttgga 6805898  T
Q  229 ataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6805899 ataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattc 6805936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Original strand, 43872026 - 43872314
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||||  ||| |||||||||||    
T  43872026 atgcctatgtttgttacaagtttgttaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatataaatattttttcaaagaaattggtaggaataaagtt 43872125  T
Q  116 cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc 215  Q
    |  ||||||||| ||||||| |||   |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  43872126 catatggagatgggaataaaatcacgtata-attacctattataatccctatttttgaggttccttgaaacattataatgttaaccaaacatcttttttc 43872224  T
Q  216 taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43872225 taaataccttggaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacaccct 43872314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 31117594 - 31117874
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31117594 ctatgtttgttacgattttattaaattttatttccgaatataaaatgttcttcagaatagaaaaaaatttccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 31117693  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatat---ttttcct 216  Q
    ||| |||      |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||| ||    
T  31117694 tggggat------aaattcataaatagtt-acctattataatatctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaagcatatatttttttct 31117786  T
Q  217 aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31117787 aaatactttgaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaatataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 31117874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41432766 - 41432464
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||  |||||| || |||||    
T  41432766 atgataggaatacacatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattccc-ggtataaaacgtttatgggaatagaaaatttttccctagaaaaag 41432668  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggaga-tgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||    
T  41432667 ggtggaaataaagttcccatggagattgagaataaattcatgagtaattt-cctattataattcctatttttatggctcccaagaatattataatgttaa 41432569  T
Q  200 ccaaac--atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaa 297  Q
     |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||    
T  41432568 gcaaacatatattttttttaaatgccttggaataaaatttccatctttatgtttcaagaaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaaa 41432469  T
Q  298 cacac 302  Q
    |||||    
T  41432468 cacac 41432464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 16219002 - 16219292
Alignment:
Q  15 tatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||   ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||  |    
T  16219002 tatgcctatgtttgttacaagtttactagattttattccggggtttaaaacgttctcaggaatagtaaaatttccccaaagaaaagg-tgggaataatct 16219100  T
Q  115 tcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc 214  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||    || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  16219101 tcccatgaagatgggaataaatccacgtgtaatt-acctattataatccccattttcatggttcccaagaatattataatgttaaccaaacatctttttt 16219199  T
Q  215 ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  16219200 ctaaataccttggaataaaattctcatctttaagttccaaggaacgttattcctaggaataaattggataaacttaaaacaaacacaccctaa 16219292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 308
Target Start/End: Original strand, 37981921 - 37982139
Alignment:
Q  91 caaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatatta 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||  || || || | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  37981921 caaggaaaagggtggaaataaagttcctatgaaaatgagaataaatttatatgtaatt-acttgttataatccctatttttatggttcccataaatatta 37982019  T
Q  191 taaagctaaccaaacatatttttcct--aaattccttggaataaaa-ttcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaac 287  Q
    ||| | ||| ||||||| |||||  |  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  37982020 taatgttaagcaaacatcttttttttttaaataccttggaataaaaattctcatctttatgttc-aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaac 37982118  T
Q  288 ttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  37982119 ttgaaacaaacacaccttaaa 37982139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25899532 - 25899380
Alignment:
Q  152 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 251  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| |  |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25899532 ctattatattccatatttttaaggttccttggaat--tataatgtcaaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcctatctttatattc 25899435  T
Q  252 caaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  25899434 caaggaatgttattcctaaaaataaatttgttacacttgaaacaaacacacccta 25899380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 33533585 - 33533741
Alignment:
Q  149 tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||| |||| | ||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  33533585 tacctattataattcctatttttaaggttcttgagaatatcataatgttaatcaaacatctttattctaaatacattggaataaaattcacatctttata 33533684  T
Q  249 ttccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  33533685 ttcaaaggaataatattcctaggaataaatttgacaaacttgaaacaaacacaccct 33533741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12650137 - 12649859
Alignment:
Q  25 tttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggag 124  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||| ||| |||||||||  || | ||| |||||  |||||||||||||||||||| |     
T  12650137 tttgttacaagattattaaattttatttctgtgtataaaatattcatggaaatagaaaat-ttacgcaaagaaaatagtgggaataaagttcccatgaaa 12650039  T
Q  125 atgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct--aaattc 222  Q
    |||| |||||||||| |  ||  | ||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||  |  ||||      
T  12650038 atgaaaataaattcacatgtaact-acctattataatctctattttttaagttcctaagaatattataatgttaatcaaacatcttttttttttaaataa 12649940  T
Q  223 cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
     ||| |||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12649939 tttgaaataaaattcacatcattgtattacaaggattgttattcgtagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 12649859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 14763976 - 14764111
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |  ||| |||||     
T  14763976 atgatagaaatatacatgcatatgtttgtttcaagtttactaaattttattcacgggtataaaatgttcatgagaatagaaaaaaaat-tcaatgaaaaa 14764074  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatt 137  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  14764075 ggtgggaataaagttcacatgaagatgataataaatt 14764111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Original strand, 6387618 - 6387736
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||   |||||||    
T  6387618 taaaatcaatgtatgtcccaccattttatgtgggttccatttccaaagtatacgacccacattgttttaacccaataagagaatgagtgttagagagagt 6387717  T
Q  402 gtccaaaatagattgttgc 420  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  6387718 gtccaaaagggattgttgc 6387736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 40197121 - 40197232
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||     
T  40197121 atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttataagtttactaaaatttattctttgatataaaatgtttctgggaatagaaaaaaaatttcaaggaaaaa 40197220  T
Q  101 ggtgggaataaa 112  Q
    ||||||||||||    
T  40197221 ggtgggaataaa 40197232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38437478 - 38437369
Alignment:
Q  3 gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg 102  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  38437478 gataggaatacatatatctatgtttgttacaagtttacaaaattttattttcgggtataaaacgttcctgagaatagaaaatttttcccaaagaaaaggg 38437379  T
Q  103 tgggaataaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  38437378 tggaaataaa 38437369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34672207 - 34672080
Alignment:
Q  183 gaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt--atattccaaggaatgttattcctaggaataaattt 280  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  34672207 gaatattataaagttaaccaaaaatattttttctaaaaaccttagtataaaatttccatctttttatatttcaaggactgttatttctaaaaataaattt 34672108  T
Q  281 agtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34672107 gataaacttaaaacaaacacaccctaaa 34672080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13407447 - 13407329
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |||||||    
T  13407447 taaaatcaatgtatgtcccaccattttaagtgggttctattttcaaagtgtatgacccacattgatttaacccaatgagagaatgagtgttagagagagt 13407348  T
Q  402 gtccaaaatagattgttgc 420  Q
    || ||||| ||| ||||||    
T  13407347 gttcaaaagagagtgttgc 13407329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38437353 - 38437203
Alignment:
Q  151 cctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||  | ||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38437353 cctattataattcctatttttatggttcccagaaatactgtagtgttaaacaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaattctcatccttatatt 38437254  T
Q  251 ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
      ||  ||| |||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38437253 -aaaaaaatattatttttaagaatgaatttaataaacttgaaacaaacacac 38437203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25899639 - 25899548
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  25899639 ctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttccgggtat-aaatgttcctcggaatagaaaagtttttccaaagaaaatggtgagaataaa 25899548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35394139 - 35394080
Alignment:
Q  246 atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35394139 atattccaaagaatgttattactaagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 35394080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7599543 - 7599456
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  7599543 aaatcaatgtatatcccagcactttatgtgggttccttttccaaagtgtaggtcctacattgattttactcaataaaaaagtgagtgt 7599456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11310487 - 11310412
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa 382  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11310487 aaatcaatgtatgtcccaccatattatgtgaatttcattttcaaagtgtatgacccacgttgatttaattcaataa 11310412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 304
Target Start/End: Original strand, 41228976 - 41229017
Alignment:
Q  263 attcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41228976 attccttggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 41229017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 45265093 - 45265397
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45265093 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 45265192  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45265193 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 45265292  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45265293 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 45265392  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  45265393 accct 45265397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 35488234 - 35488537
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35488234 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 35488333  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35488334 ggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 35488433  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35488434 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 35488533  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  35488534 accc 35488537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44566071 - 44565765
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566071 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 44565972  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44565971 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 44565872  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44565871 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 44565772  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  44565771 accctaa 44565765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11330019 - 11329715
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330019 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 11329920  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329919 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 11329820  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11329819 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 11329720  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  11329719 accct 11329715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45045652 - 45045352
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045652 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 45045553  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045552 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 45045453  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45045452 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatattattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 45045353  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  45045352 a 45045352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27213900 - 27214203
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27213900 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 27213999  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27214000 ggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctgtttttatggttcctaggaatattataaagctaac 27214099  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27214100 caaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 27214199  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  27214200 accc 27214203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27248319 - 27248019
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248319 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttactgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 27248220  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27248219 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatagttcataggaatattataaagctaac 27248120  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27248119 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattctaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 27248020  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  27248019 a 27248019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 9947035 - 9947340
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9947035 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 9947134  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9947135 ggtgggaataaagttcccatggagatgagattaaattcataaatagtttacctattacaatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaac 9947234  T
Q  201 caaacata-tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9947235 caaacatatttttttctacattccttggaataaaattcccatctttatattacaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 9947334  T
Q  300 caccct 305  Q
    ||||||    
T  9947335 caccct 9947340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48341388 - 48341085
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48341388 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgg-tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 48341290  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48341289 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 48341190  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48341189 caaacatatttttcataaattccttggaataaaattccc-tctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 48341091  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  48341090 acccta 48341085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43949271 - 43948967
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43949271 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 43949172  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949171 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 43949072  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  43949071 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaatac 43948972  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  43948971 accct 43948967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33378868 - 33378556
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  33378868 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 33378769  T
Q  93 aggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378768 aggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 33378669  T
Q  193 aagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33378668 aagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaa 33378569  T
Q  293 acaaacacaccct 305  Q
    |||||||||||||    
T  33378568 acaaacacaccct 33378556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 34930511 - 34930814
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgttt-gttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34930511 atgatagaaatgtatatgcctatgttttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaa 34930610  T
Q  100 gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34930611 gggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttatctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 34930710  T
Q  200 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34930711 ccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 34930810  T
Q  300 cacc 303  Q
    ||||    
T  34930811 cacc 34930814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 25924682 - 25924986
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25924682 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctttgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccccaggaaaag 25924781  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25924782 ggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 25924881  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25924882 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcttaggaataaatttggtaaacatgaaacaaacac 25924981  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  25924982 accct 25924986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38544220 - 38543920
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  38544220 atgataggaatgtatatgcctatgtttattacaggtttactaaattttattcccgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttctcaagaaaaat 38544121  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38544120 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 38544021  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaac-ttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38544020 caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtaaactttgaaacaaaca 38543921  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  38543920 c 38543920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45448968 - 45448665
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45448968 atgataggaatgtagatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 45448869  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45448868 ggtgggaataaagttcccatagagaggggaataaattcataaatagtttatctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 45448769  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45448768 caaacatatttttcctaaattctttagaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcataggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 45448669  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  45448668 accc 45448665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48314148 - 48313844
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48314148 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttagaagtttactaaattttattcccggatataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 48314049  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48314048 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatttataaatagttttcctattataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaac 48313949  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48313948 caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 48313849  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  48313848 accct 48313844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 27419269 - 27419571
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27419269 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 27419368  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27419369 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatctctatttttatggtccctaggaatattataaagctaac 27419468  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27419469 caaacatattttttctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaagaaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 27419568  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  27419569 acc 27419571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 38396411 - 38396715
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38396411 atgataggaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 38396510  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396511 ggtgggaataaagttcccacggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 38396610  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38396611 caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatc-ttatattccaatgaatgctattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 38396709  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  38396710 acccta 38396715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25098095 - 25097796
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25098095 atgataggaatgtatatgcccatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaag 25097996  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25097995 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaac 25097896  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc-aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25097895 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaaaaaatattattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaaca 25097796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39554209 - 39553910
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39554209 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 39554110  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39554109 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 39554010  T
Q  201 caaacata-tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  39554009 caaaaatattttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattactaagaataaatttgataaacttcaaacaaaca 39553910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 8419634 - 8419900
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419634 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 8419733  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419734 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 8419833  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcc 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419834 caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcc 8419900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 28904231 - 28904535
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||| |||||    
T  28904231 atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttataagaaaaag 28904330  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28904331 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 28904430  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28904431 caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 28904530  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  28904531 accct 28904535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 41632409 - 41632708
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41632409 atgatagaaatgtatatgcctatgtttattacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcttaggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 41632508  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41632509 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcataggaatattataaagctaac 41632608  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41632609 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcaaaggaatgttatt-----gaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 41632703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40212915 - 40212657
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40212915 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccggggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 40212816  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40212815 ggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 40212716  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40212715 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcctaggaat 40212657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 9814263 - 9814535
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9814263 atgataggaatgtatatg----tgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 9814358  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9814359 ggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatctattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaat 9814458  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9814459 caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattgtcatctttatattccaagaaatgttattcctaggaataaa 9814535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44820280 - 44819981
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||| ||  | ||||||||| | ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44820280 atgatagaaatgtatttgtatgtgtttgttacatgtttattaaaatttattccttggtataaaatgttcctcggaacagaaaaaatttcccaaggaaaag 44820181  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44820180 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattatagtccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 44820081  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44820080 caaatatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattttaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 44819981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 48160636 - 48160921
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||                 |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  48160636 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc-----------------tgggaagagaaaaaatttcc-aaggaaaat 48160717  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160718 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 48160817  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160818 caaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 48160917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 37534163 - 37534447
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt 115  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37534163 atgcatatgtttgttacaagtttactaacttttatttccgggtataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt 37534262  T
Q  116 cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37534263 cccatggagatgtgaataaattcataaatagtt-acttattataatccctattattatagttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcc 37534361  T
Q  216 taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37534362 taaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttatttctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacaca 37534447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 30686052 - 30686336
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt 115  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  30686052 atgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaaaggtgggaataaagtt 30686151  T
Q  116 cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc 215  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30686152 cctagggagatgggaataaattcataaatagtt-acttattataatcgctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcc 30686250  T
Q  216 taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  30686251 taaataccttgcaataaaattttcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 30686336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16825399 - 16825593
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825399 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 16825498  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825499 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaag 16825593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18824159 - 18823890
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18824159 tatatgcctatgtttgttacaagttcactaaattttattcccgggtataaaatgtttttgggaatagaaaaattttcccaaggaaaaaggtgggaataaa 18824060  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||               ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18824059 gtt-ccatggagatgggaataaattcataaata-attacctattataatccctat---------------gaatattataaagttaaccaaacatatttt 18823977  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18823976 tcctaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 18823890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 6656517 - 6656819
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||     
T  6656517 atgatatgaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt-attttcgagtataaaatgtttctgggaatagaaaagttttcccaatgaaaaa 6656615  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  6656616 tatgggaataaagttcccatggagatgggaataaagtcataaatagtt-acctattataatctatatttttttggttcttagaaatattataaagttaac 6656714  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg-ttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
     |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6656715 aaaacatattttttccaaataccttggaataaaattctcatatttctattccaaggaatgtttattcctaagaataaatttagtaaacttgaaagaaaca 6656814  T
Q  300 caccc 304  Q
    |||||    
T  6656815 caccc 6656819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45723170 - 45722881
Alignment:
Q  6 aggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  45723170 aggaatatatatgcctatgtttgtcacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaagaaaaatggtgg 45723071  T
Q  106 gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaac 205  Q
    |||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||    
T  45723070 gaataaagttcccatgaaaatagaaataaattcataaatag-ttacctattataatccatatttttatgatttctaggaatattataaagttaattaaac 45722972  T
Q  206 atatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||||||| |         |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  45722971 atattttttc---------tggaataaaatttccatctttatatttcaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaataaagacaccct 45722881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Original strand, 31921811 - 31922075
Alignment:
Q  40 ctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattca 139  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31921811 ctaaattttattcctgagtataaaatgtttgtgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattca 31921910  T
Q  140 taaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaat--tc 237  Q
    || |||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||    
T  31921911 tatatagt---cctattataatgtctatttttatggttcctagaaatattataaagttaaccatacatattttttctaaataccttggaataaaattctc 31922007  T
Q  238 ccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31922008 ccatatttatattccaaagaatgttattcatggtaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 31922075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 25045664 - 25045838
Alignment:
Q  3 gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25045664 gataggaatatatatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcgtaaggaaaaggg 25045763  T
Q  103 tgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  25045764 tgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-attacatattataatccatattttcatggttc 25045838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11000711 - 11000483
Alignment:
Q  18 gcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcc 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11000711 gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatattcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcc 11000612  T
Q  118 catggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgg-------ttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatt 210  Q
    |||| | |||||||||||||||||   || |  |||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  11000611 catgcatatgagaataaattcatatgaag-tcgcctattataatccctatttttatggttcttacttcttaggaatattataaagttaacctaacata-t 11000514  T
Q  211 tttcctaaattccttggaataaaattcccat 241  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  11000513 tttcttaaatatcttggaataaaatttccat 11000483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 43445936 - 43446229
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  43445936 aatgtatatgcctatatttgttataagtttactaaattttattctcgaatataaaatgttcatgagaataaaaaagttttcccaaagaaaatggtgggaa 43446035  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||   ||  |||||||||||| | ||||| ||||  |||| |  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  43446036 taaagttctcatggagatgagaataaaattatgtgta-attacctattatatttcctatctttaatgttctttagaatattataatgttaaccaaacata 43446134  T
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  43446135 ttttt-ctaaataccttaaaataaaattcctatctttatattccgataaatgttattcatagaaatcaatttggtacactttaaacaaacaaaccc 43446229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45440918 - 45440637
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt 115  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  45440918 atgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctcggaatataaaaattttcccaaagaaagtagtgggaataaagtt 45440819  T
Q  116 cccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcc 215  Q
    | |||||||||| ||| ||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||||||| |||||      
T  45440818 ctcatggagatgggaaaaaaatcatgtata-attacctattataatccctagttttaaggttacttggaatattataatgttaatcaaacatcttttt-t 45440721  T
Q  216 taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    |||||  ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45440720 taaatatcttggaataaaatttacatc--tatattctaagaaatgttattactatgaataaatttggtaaac-tgaaacaaacacac 45440637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41684067 - 41684278
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  41684067 atgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttatttccggatataagatgttcttgggaatagaaaattttgcccaaagaaaag 41684166  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  41684167 agtgggaataaagttctcatggagatgaaaataaatttatatgtag-ttacctattataatctctatttttatggttcctataaatattataaaattaac 41684265  T
Q  201 caaacatattttt 213  Q
    |||||||||||||    
T  41684266 caaacatattttt 41684278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 22156248 - 22156520
Alignment:
Q  25 tttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgga 123  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  22156248 tttgttacaagtttaataaattttaatcccgcgtataaaacgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtaggaataaagttctcataga 22156347  T
Q  124 gatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcc 223  Q
    ||||||||||| ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||  | ||| ||||||| ||||| ||| || ||    
T  22156348 gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatggttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatacc 22156445  T
Q  224 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||    
T  22156446 ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac 22156520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 22212163 - 22212435
Alignment:
Q  25 tttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgga 123  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  22212163 tttgttacaagtttaataaattttaatcccgcgtataaaacgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtaggaataaagttctcataga 22212262  T
Q  124 gatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcc 223  Q
    ||||||||||| ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||  | ||| ||||||| ||||| ||| || ||    
T  22212263 gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatggttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatacc 22212360  T
Q  224 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||    
T  22212361 ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac 22212435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 308
Target Start/End: Original strand, 5543196 - 5543482
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| ||||||||||||   |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  5543196 tatgtttgttacaagtttactaaattttattctctcgtataaaactttcttgggaatagaaattttttcccaaagaaaaatagtgggaataaagttccca 5543295  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 219  Q
    || ||||| ||| ||||||||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||    
T  5543296 tgaagatgggaacaaattcatgtgta-attacctattataatccatatttttatggttcccgggaacattataatgttaagcaaacatcttttttctaaa 5543394  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||  |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543395 tacctt-gaataaaattctcatctttatgtttcaaataatgatattcttagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccctaaa 5543482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 40385692 - 40385974
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagga-aaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  40385692 tatgtttgttagaagtttactgaattttattcctgtctataaaatgtttctgggaatagaaaaaatatcccaaaaagaaatggtgggaataaagttccca 40385791  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 219  Q
    |  |||||  |||||| ||||   ||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||  ||||    
T  40385792 ttaagatggaaataaactcatgtgtaact-acctattataatccatatttttatggttcttaggaatattataatgttaaccaaatatcttttttttaaa 40385890  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||| | |||||||    
T  40385891 taccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaaatgttattactaagaataaatttgatacacttgaaagagacacacc 40385974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6656269 - 6656457
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||  |||||    
T  6656269 atgatatgaatatatatacctatgtttgttataagtttactaaattt-attttcgagtataaaatatttctggaaatagaaaagttttcccaataaaaag 6656367  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattat 191  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6656368 ggtggaaataaagtttccatggagatgggaataaaatcataaatag-ttacctattataatctgtatttttttggttcctaagaatattat 6656457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Original strand, 17276355 - 17276508
Alignment:
Q  153 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa-ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 251  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  17276355 tattgtaatccttatttttaaggtttcttggaatattataatgttaaaccaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaatttacatctatatattc 17276454  T
Q  252 caaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17276455 caaggaatgttattcctagaaataaattttgtaaaattgaaacaaacacaccct 17276508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 38528764 - 38529012
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||| ||||| |||| |||||||    
T  38528764 tatatgcttatgtttgttacaagtttactagattttattcttgggtataaaatgttattgggaatagaataaatat--caaagaaaaaggtgagaataaa 38528861  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||   ||  || | ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  38528862 gttctcatgaagatgagaataaatttatgtgta-attgcatattataatccctatttttaaagtttctcagaatattataatgttaaccaaacat-tttt 38528959  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt 265  Q
    |  |||||   ||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38528960 ttttaaataagttgaaataaaatttacatttttatattccaagaaatgttatt 38529012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31598598 - 31598449
Alignment:
Q  152 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 251  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31598598 ctattataaatcctatttttatgattcccaggtatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatattc 31598499  T
Q  252 caaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31598498 caagaaatgttattcccaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca 31598449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 43569773 - 43569966
Alignment:
Q  44 attttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||  ||||||||||||||    
T  43569773 attttattcccgggtataaaatattcttcgaaatataaaaatttacctaagaaaaagggtgggaataaaattcacatgaggatgtaaataaattcataaa 43569872  T
Q  144 tagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaac--atatttttcctaaattccttggaataaaatt 236  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  43569873 ta-attatctattataatccctatttttatgatttctaaaaatattataaagttaatcaaacatatatttttgttaaataccttagaataaaatt 43569966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 47246130 - 47246366
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||| | ||   |||   || |||||||||| ||||||||||||||    
T  47246130 ctatgtttgttacaagtttactgaattttattctcaggtataaaatgttcttaggaattg-aattttttttaaaagaaaagggtgagaataaagttccca 47246228  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat-atttttcctaa 218  Q
    || | ||||||||||||||||   ||   || ||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| | | |||||||||  ||||| ||||    
T  47246229 tgaatatgagaataaattcatgtgtaaactatctattataatccctatttttaaggt--ctaggagtattataatgttgaccaaacatctttttttctaa 47246326  T
Q  219 attccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 259  Q
    || | || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  47246327 atacttttgaataaaattcacat-tttatattccaaagaat 47246366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24539246 - 24539128
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    |||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||    
T  24539246 taaaatcaatatatgtcccaccactttatatggattccatttccaaaatgtatgacccacattgatttaacccaatgagagagtgagtgttagagagagt 24539147  T
Q  402 gtccaaaatagattgttgc 420  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  24539146 gtccaaaagagagtgttgc 24539128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 255
Target Start/End: Original strand, 10902820 - 10902971
Alignment:
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||   | |||||||| || | |||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  10902820 gggaataaagttcacatgaagatgagaataaattcatgtgtaaactgcctattatgattcatatttttaaggttccaatgaatattataatgttaaccaa 10902919  T
Q  204 acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 255  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10902920 acatctttttcataaataccttgggctaaaattcacatctttatatcccaag 10902971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Original strand, 17749751 - 17749869
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    |||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||    
T  17749751 taaaatcaatatatgtcccaccactttatatggatttcatttccaaaatgtatgacccacattgatttaacccaatgagagagtgagtgttagagagagt 17749850  T
Q  402 gtccaaaatagattgttgc 420  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  17749851 gtccaaaagagagtgttgc 17749869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 16916182 - 16916234
Alignment:
Q  253 aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16916182 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 16916234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 10902695 - 10902779
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 85  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  10902695 atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttttggatataaaatgtttttgggaatagaaaaaa 10902779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40212669 - 40212625
Alignment:
Q  262 tattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40212669 tattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccta 40212625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 419
Target Start/End: Original strand, 11824130 - 11824242
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt-gtagagagtgtcc 405  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| | ||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  11824130 aaatcaatgtatgtcccaccattttgtgtagcttcaattttcaaagtgta-aacccacaatgatttaaatcaataagaaagtgagtattagagagtgttc 11824228  T
Q  406 aaaatagattgttg 419  Q
    |||| ||| |||||    
T  11824229 aaaagagagtgttg 11824242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Original strand, 27888339 - 27888427
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27888339 taaaatcaatgtatgtcccaccactttgtgtgggttcaatttttaaagtgta-gacccacaatgatttaaaccaataagagagtgagtgt 27888427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Original strand, 45909515 - 45909602
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||   || |||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  45909515 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaattgtaggtcctacattgattttacccaataaaagagtgagtgt 45909602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25428600 - 25428514
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | || |||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  25428600 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttacatttccaaagtgtagatcctacattgattttatccaataaaagagtgagtg 25428514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26703561 - 26703475
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  26703561 aaatcaatgtatgtctcaccactttatgtgggttccatttctaaagtgtaggtcctacatttatttcacccaataaaagagtgagtg 26703475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 6442224 - 6442308
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  6442224 aaatcaatgtatgttccaccattttgtggggattcaattttcaaagtgta-gacccacaatgatttaaaccaataaaagagtgagt 6442308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19494460 - 19494385
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa 382  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| | || |||||||||| || ||||||    
T  19494460 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtagatcctacattgatttcacccaataa 19494385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20601128 - 20601049
Alignment:
Q  228 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| | ||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20601128 aataaaactcccttatttatattcccaagaataatattcttagaaataagtttaataaacttaaaacaaacacaccctaa 20601049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30870999 - 30870944
Alignment:
Q  243 tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    ||||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30870999 tttatattttaaagaatgttattcttaagaataaatttagtaaatttgaaacaaac 30870944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 13919839 - 13919925
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||   || |||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  13919839 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaatgagtgagtg 13919925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17354648 - 17354562
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||   || |||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  17354648 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttctatttccaaagtgtaggtcctacattgattttacccaataaaaaagtgagtg 17354562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31598688 - 31598623
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa 82  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31598688 atgcttatatttgttacaagtttactaaattttattacaaggtataaaacgttcct-ggaatagaaa 31598623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18412235 - 18411929
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18412235 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaa 18412136  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18412135 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 18412036  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18412035 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 18411936  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  18411935 accctaa 18411929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 4765605 - 4765911
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4765605 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 4765704  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4765705 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 4765804  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4765805 caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 4765904  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  4765905 accctaa 4765911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 29543060 - 29543368
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  29543060 atgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag 29543159  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29543160 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 29543259  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29543260 caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 29543359  T
Q  301 accctaaaa 309  Q
    |||||||||    
T  29543360 accctaaaa 29543368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 22935957 - 22936261
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22935957 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 22936056  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22936057 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 22936156  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22936157 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 22936256  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  22936257 accct 22936261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 11855700 - 11856001
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11855700 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 11855799  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11855800 ggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 11855899  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11855900 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 11855999  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  11856000 ac 11856001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 19065550 - 19065850
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19065550 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 19065649  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19065650 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaac 19065749  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19065750 caaacatatattttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 19065849  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  19065850 a 19065850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 8646436 - 8646735
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8646436 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggttataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 8646535  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8646536 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac 8646634  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8646635 caaacataattttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 8646734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 12970575 - 12970881
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12970575 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcttaaggaaaag 12970674  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12970675 ggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattacaatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaac 12970774  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12970775 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 12970874  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  12970875 accctaa 12970881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27481383 - 27481082
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27481383 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatattcctgagaataaaaaatatttcccaaggaaaag 27481284  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27481283 ggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcataaatagtttacatattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 27481184  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27481183 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 27481084  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  27481083 ac 27481082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14206866 - 14207173
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14206866 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 14206965  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14206966 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 14207065  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14207066 caaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaggaataaattttgtaaacttgaaacaaacac 14207165  T
Q  301 accctaaa 308  Q
    ||||||||    
T  14207166 accctaaa 14207173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8406920 - 8406614
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8406920 atgataggaatgtacatgcctatatttgttacaagtttgctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 8406821  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8406820 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttttcctattataatccctatttttttggttccttggaatattataaagctaac 8406721  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8406720 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 8406621  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  8406620 accctaa 8406614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28602581 - 28602278
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28602581 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg-tataaaatgtttctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 28602483  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28602482 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttgtatggttcctaggaatattataaagctaac 28602383  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28602382 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 28602283  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  28602282 accct 28602278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 555751 - 556053
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  555751 atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttccagggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 555850  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  555851 ggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctaatttgatggttcctaggaatattataaagctaac 555950  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  555951 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 556050  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  556051 acc 556053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6091733 - 6091437
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6091733 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaaggaaaagagtgggaa 6091634  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6091633 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 6091534  T
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6091533 tttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6091437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32535963 - 32535659
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32535963 atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttatttcttggtataaaatgttattgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaag 32535864  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32535863 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataacccctatttttatggttcctgagaatattataaagctaac 32535764  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32535763 caaacatatttttcctaaattccttggattaaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 32535664  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  32535663 accct 32535659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36703900 - 36703654
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36703900 atgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaag 36703801  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36703800 ggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctattttgatggttcctaggaatattataaagctaac 36703701  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36703700 caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattctcatctttat 36703654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27481035 - 27480730
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  27481035 atgataggaatatgtatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgtgtataaaatgttcatgggaatagaaaattttttccaaggaaaag 27480936  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  27480935 g-tgagaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagct-acctattataatttctatttttatggttcatagaaatattataaagttaac 27480838  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  27480837 caagcatattttttctaaataccttgaaataaaattctcatctttatatttcaagaaatattattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaataaacac 27480738  T
Q  301 accctaaa 308  Q
    ||| ||||    
T  27480737 accttaaa 27480730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1664754 - 1664456
Alignment:
Q  3 gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg 102  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||| |||    
T  1664754 gatagaaatctatatgcttatgtttgttacaaattgactaaattttattaccagctataaaatgttcctgagaatagaaattttttcccaaagaaacggg 1664655  T
Q  103 tgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacca 202  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1664654 tgggaattaaattcccatggagatgagaataaatttatatgtagtt-acctattataatccctatttttatggttcataagaatattataaagttaacca 1664556  T
Q  203 aacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1664555 aacatattttttctaaataccttgaaataaaattctcatctttatatttcaagaaatattattctcaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 1664456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 42012224 - 42012530
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42012224 atgatagaaatacatatgtctatgtttgttacaaatttactaaattttattctcgagtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttccgaaggaaaag 42012323  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || || |    
T  42012324 ggtgggaataaagttcacatggagatcagaataaattcttatatag-ttacctattataatccatatttttatggttccaaggagtattatatagttacc 42012422  T
Q  201 ca----aa--catatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaac 294  Q
     |    ||  ||||||||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42012423 tattataatccatattttttccaaataccttagaacaaaattcccatctttttattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttagtaaacttgaaac 42012522  T
Q  295 aaacacac 302  Q
    ||||||||    
T  42012523 aaacacac 42012530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 309
Target Start/End: Original strand, 43346962 - 43347247
Alignment:
Q  23 tgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  43346962 tgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaattgtttctggcaatagaaaagtttttccaatgaaaagggtgggaataaagttcccatga 43347061  T
Q  123 agatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattc 222  Q
    ||||||||||||| | ||   || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||||| | ||||| |||||| |    
T  43347062 agatgagaataaaattatgcgtaatt-acctattttaatccctatttttaaggttccttcgaatattacattgttaaccaaactttttttttctaaatac 43347160  T
Q  223 cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 309  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43347161 cttagaataaacttctcatctttatattccaataaatgttattcctaagaataaatttcgaaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 43347247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20962616 - 20962373
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20962616 atgataggaatacacgtgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcggatataaaacgtttctgggaatagaaaatttttcccaaggaaaag 20962517  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||     
T  20962516 ggtgggagtaaagttctcatggagatgagaataaattaatgagtaattt-cctattataattcctatttttatggttcccagaaatattataatgttaag 20962418  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt 245  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20962417 caaacatattttttttaaatgccttggaataaaattcccatcttt 20962373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36703656 - 36703506
Alignment:
Q  153 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  36703656 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttaaattcc 36703557  T
Q  253 aaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36703556 aaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacc 36703506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17251818 - 17251536
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17251818 tatgtttgttataattttactaaattttattctcgagtataaaatgttcatgataatagaaaaaatttcccaaagaaaatgatgggaataaagtttccat 17251719  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc-ctaaa 219  Q
    | |||||| |||||||||||   ||  | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| |||||  |||||    
T  17251718 gaagatgaaaataaattcatgtgtaact-atatattataatccctatttttatggttc-taggaatattaaaatgttaaccaaacatctttttatctaaa 17251621  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17251620 taccttggaaaaaaattcctatccttatattccaagaaatgttatt-gtaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaccct 17251536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6930646 - 6930364
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  6930646 tatgtttgttacaagtttactaaattttattttcggatataaaatattattgggaatagaaaaa-tttcccaaagaaaattgtgggaataaagttcccat 6930548  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat 220  Q
    | |||||  |||||||| |||  ||||| | ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  6930547 gaagatggaaataaatttatatctagtt-atctattataatctctatctgtaaggtttctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttttaaat 6930449  T
Q  221 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
     ||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  6930448 accttaaaataaaattctcatcttgatatttcaaggaatgttattcatatgaataaatttgataaacttaaaacaaacacaccct 6930364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 307
Target Start/End: Original strand, 26637137 - 26637372
Alignment:
Q  67 ttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatcccta 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||     |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||  | |||||||||||||| ||    
T  26637137 ttcctggaaatagaaaaaatttctgagagaaaagggtg-----aaagttcctatggatatgagaataaattcaaatgtaact-acctattataatccata 26637230  T
Q  167 tttt-tatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26637231 ttttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacacattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt 26637330  T
Q  266 cctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  26637331 cctaaaaataaatttgataaacttgaaataaacacaccctaa 26637372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 31583126 - 31583404
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31583126 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaacgttcccaggaatagaaaaaattttccaaagaaaaaggtgggaataaagttccca 31583225  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 219  Q
       ||||| |||  ||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| | || || ||||| |||||    
T  31583226 caaagatg-gaaataattcatatgta-agtacctattataatccctatttttacggttcctgagaatattataatgttaaaccaatat-ttttttctaaa 31583322  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |  |||| ||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31583323 tatcttgaaataatatttccatctttatgtttcaaagaatgttattcgtagaaataaatttagtaaacttaaaacaaacaca 31583404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 289
Target Start/End: Original strand, 35348590 - 35348858
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35348590 ctatgtttgttacaagtttactaaattgtatttt-gggtataaaatgtttttgggaatagaaaat-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttccca 35348687  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaaca--tatttttccta 217  Q
    || ||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| | |||  |||||  | ||||| ||     
T  35348688 tgaagatgagaataaattcacatgta-attacctattataattcatatttttatggttcccgggaatattataatgttaaaaaaacattttttttttctg 35348786  T
Q  218 aattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt 289  Q
     || ||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  35348787 tataccttaaaataaaattctcatctttatgttccaatgaatgttattcttaagaataaatttgataaactt 35348858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 40275813 - 40276017
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag 113  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  40275813 atatgtctatgtttgttacaagtttgctaaattttattcccagatatgaaatattcctgggaatagaaaagttttcccaaagaaaatgatgggaataaag 40275912  T
Q  114 ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttt 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||   ||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  40275913 ttcccatgaagatgggaataaaattatctcta-ataacctattaaaatccctatttttaaggttccatggaatattataatattaaccaaacatcttttt 40276011  T
Q  214 cctaaa 219  Q
     |||||    
T  40276012 tctaaa 40276017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28429591 - 28429446
Alignment:
Q  165 tatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct-aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta 263  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||  | |||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28429591 tatttttaaggtttctgagaatattataatgttaaccaaacatctttttttttaaatactttggaataaaattcacatctttatatttcaaggaatgtta 28429492  T
Q  264 ttcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 309  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28429491 tttctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 28429446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Original strand, 16720910 - 16721029
Alignment:
Q  183 gaatattataaagctaaccaaacatat---ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatt 279  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||   ||||  |||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16720910 gaatattataatgataatcaaacatatatatttttttaaatatctttgaataaaattcacatttttatattccaatgaatgttattcctaggaataaatt 16721009  T
Q  280 tagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16721010 tagtaaacttgaaacaaaca 16721029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 19089782 - 19089888
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||    
T  19089782 tatgtttgttataagtttattaaattttattcttgagtataaaacgtttttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatgatgggtataaagttctcat 19089881  T
Q  121 ggagatg 127  Q
    | |||||    
T  19089882 gaagatg 19089888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 35602968 - 35603122
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||  ||||| | || |||||||||| | ||||||||    
T  35602968 ttacctattatataccatatttttaaggttccttggaatattaaaatgttaaccaaacattttttt--taaatactttagaataaaatttctatctttat 35603065  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  35603066 attccaaaaaatgttattcctaaaaat-aatttggtacacttgaaccaaacacaccct 35603122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 301
Target Start/End: Original strand, 36978323 - 36978478
Alignment:
Q  149 tacctattataatccctatttttat-ggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcct--aaattccttggaataaaattcccatcttt 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||  |  |||| ||||  |||||||||| ||| |||    
T  36978323 taccttttataatccctattttttcaggctcctgtgaatattataatgctaactaaacatgttttttttttaaataccttaaaataaaattctcatattt 36978422  T
Q  246 atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36978423 atattctaaagaatgttattcctataaataaatttaataaacttgaaacaaacaca 36978478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 41783685 - 41783914
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||   | | ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  41783685 tatgtttgttataagtttactaaattttattctcggatataaaatgtttctgaaaatagaaaaaagaattcaaagaaaaaggttgggaataaagtttcca 41783784  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 219  Q
    |  ||||| ||| ||||||||     || ||  ||||||| ||  |||||||| ||||| | | |||||||||| |  || ||||||||||||| | |||    
T  41783785 taaagatgtgaacaaattcat-----gtgtaattattatagtcaatatttttaaggttctttgtaatattataatgtaaaacaaacatattttttcaaaa 41783879  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaa 254  Q
    | ||||  |||||||||  ||| | ||||||||||    
T  41783880 taccttaaaataaaatttacatgtgtatattccaa 41783914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30899566 - 30899470
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  30899566 atgcttatgtatgttacaagttttctaaattttattcctggatataaaatattcttgggaatagaaacaattttccaaagaaaagggtgagaataaa 30899470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20962356 - 20962281
Alignment:
Q  231 aaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  20962356 aaaatttccatctttatgttccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttaaaacaaacacatccta 20962281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30899463 - 30899321
Alignment:
Q  165 tatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 264  Q
    |||||||| ||||| |  |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  30899463 tatttttaaggttcgtgagaatataataaagttaaccaaacatcttttttctaaatacattg-aataaatttctcatctttatatttcaaaaaatgttat 30899365  T
Q  265 tcct-aggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30899364 ttcttaacaataaattttgtaaacttgaaacaaacacatcctaa 30899321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Original strand, 40276524 - 40276587
Alignment:
Q  239 catctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40276524 catctttatattc-aaggaatgttattaccaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 40276587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 15200603 - 15200727
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  15200603 tatatgtctatgtttgttataaatttattaaattttattctcaggcataaaatgtttctggg-atagaaaaaa-ttcccaaagaaca-ggtgggaataaa 15200699  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcat 140  Q
     |||| ||  |||| | |||||||||||    
T  15200700 attcctataaagataaaaataaattcat 15200727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28023840 - 28023719
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag-ttccc 118  Q
    |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||| |    
T  28023840 ctatatttgttacaagttcattaaattttattctcacatataaaatgtgtttgggaatagaaaaaatttctcaaacaaaagggtgagaataaagtttctc 28023741  T
Q  119 atggagatgagaataaattcat 140  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  28023740 acgaagatgagaataaattcat 28023719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13456286 - 13456191
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg-tagagagt 401  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  13456286 aaatcaatgtatttcccaccattttatgtgggttccattttcaaagtgtaggacctacattgatttcacctaataaaagagtgagtgctagagagt 13456191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42224712 - 42224626
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  42224712 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaaagagtgagtg 42224626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 28429727 - 28429664
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaa 64  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28429727 atgatagaaatatacatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgaatataaaa 28429664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 307
Target Start/End: Original strand, 6696755 - 6696866
Alignment:
Q  197 taaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg-ttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaaca 295  Q
    ||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||  |||  | |||||||    
T  6696755 taaccaaacacttttttcatattttcctaggaataaaaatcacacctttatattccagggaaagataattcctaggaataaattgtgtatccatgaaaca 6696854  T
Q  296 aacacaccctaa 307  Q
    ||| ||||||||    
T  6696855 aacgcaccctaa 6696866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27901760 - 27901697
Alignment:
Q  226 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaactt 289  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||    
T  27901760 ggaataaaattcatatctttatattctaaagaatgttgttcttaagaataaattttgtaaactt 27901697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 26072162 - 26072248
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||    
T  26072162 aaatcaatgtatgtctcaccactttatgtggaattcatttccaaagtgtaggtcccacattgttttcacccaataaaagagtgagtg 26072248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10142099 - 10142011
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||| ||| | ||||||||  |||||||| | || ||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  10142099 taaaatcaatgtatgtcccaccactttgtgttggttccattttcaaagtgtaga-ccaacaattatttaaatcaataagagagtgagtgt 10142011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10666811 - 10666727
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtga 390  Q
    |||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | | |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  10666811 taaaatcattgtatatcctaccactttatgtgggttccatttttaaattgtaga-ctcacattaatttaaaccaataagagagtga 10666727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46666735 - 46666429
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46666735 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 46666636  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46666635 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 46666536  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46666535 caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 46666436  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  46666435 accctaa 46666429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 20260131 - 20260434
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260131 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 20260230  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20260231 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaag 20260330  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20260331 caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 20260430  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  20260431 accc 20260434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9115864 - 9115561
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9115864 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 9115765  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9115764 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 9115665  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9115664 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 9115565  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  9115564 accc 9115561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36361809 - 36361504
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36361809 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 36361710  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36361709 gg-gggaataaagttcccatggagatgagagtaaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaac 36361611  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36361610 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatttttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 36361511  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  36361510 accctaa 36361504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2430523 - 2430223
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430523 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 2430424  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2430423 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac 2430325  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430324 caaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaacgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 2430225  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  2430224 ac 2430223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 52630800 - 52630496
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  52630800 atgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaagaaaag 52630701  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52630700 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 52630601  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52630600 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 52630501  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  52630500 accct 52630496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14788747 - 14788446
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788747 ataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattatattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 14788648  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788647 gggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 14788548  T
Q  204 acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14788547 acatattttgcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacacacc 14788448  T
Q  304 ct 305  Q
    ||    
T  14788447 ct 14788446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8332041 - 8331737
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  8332041 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttgcaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaaatttcaaggaaaag 8331942  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331941 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 8331842  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8331841 caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 8331742  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  8331741 accct 8331737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12190222 - 12190526
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12190222 atgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaat 12190321  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12190322 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagttttcctattataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaac 12190421  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12190422 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 12190521  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  12190522 accct 12190526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25789790 - 25789487
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25789790 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 25789691  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25789690 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 25789591  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25789590 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 25789491  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  25789490 accc 25789487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32824946 - 32824643
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa-ggaaaaggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32824946 ataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaattgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaaggaaaaggg 32824847  T
Q  103 tgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacca 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32824846 tgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacca 32824747  T
Q  203 aacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32824746 aacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttcgtaaatttgaaacaaacacac 32824647  T
Q  303 ccta 306  Q
    ||||    
T  32824646 ccta 32824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39930484 - 39930181
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39930484 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaag 39930385  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39930384 ggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 39930285  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39930284 caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 39930185  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  39930184 accc 39930181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 9831915 - 9832216
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9831915 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaggaaaag 9832014  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9832015 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 9832114  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9832115 caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccgaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 9832214  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  9832215 ac 9832216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6911520 - 6911206
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttccca 92  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  6911520 atgataagaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 6911421  T
Q  93 aggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6911420 aggaaaatggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattaaa 6911321  T
Q  193 aagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6911320 aagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaa 6911221  T
Q  293 acaaacacaccctaa 307  Q
    |||||||||||||||    
T  6911220 acaaacacaccctaa 6911206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2632876 - 2632573
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2632876 ataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggt 2632777  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2632776 gg-aataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagttaaccaa 2632678  T
Q  204 acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2632677 acatatttttcctaaattcgctggaataaaattcccatatttatattctaaggaatgttattcctagaaataaatttagtaaacttgaaacaaatacacc 2632578  T
Q  304 ctaaa 308  Q
    |||||    
T  2632577 ctaaa 2632573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 1597387 - 1597689
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  1597387 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaatttttccaagaaaaag 1597486  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1597487 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagttaac 1597586  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1597587 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 1597686  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  1597687 acc 1597689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 50190814 - 50191115
Alignment:
Q  5 taggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50190814 taggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaaggtg 50190913  T
Q  105 ggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaa 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50190914 ggaataaagttcccatgaagatg-gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaatcaaa 50191012  T
Q  205 catatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50191013 catatttttcctaaattcctcgaaataaaattctcatctttatattctaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 50191112  T
Q  305 taa 307  Q
    |||    
T  50191113 taa 50191115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 51445133 - 51445424
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51445133 aatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcttag-tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 51445231  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51445232 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaaggtaaccaaacata 51445331  T
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51445332 tttttcctaaattccttggaataaaattctcatctatatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 51445424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 4683419 - 4683724
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  4683419 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttactaaattttattcccggatataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaag 4683518  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4683519 gg-gggaataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaac 4683617  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||    
T  4683618 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaaaaatgttattcttagaaataaatttgataaacttgaaacaatcac 4683717  T
Q  301 accctaa 307  Q
    | |||||    
T  4683718 atcctaa 4683724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 5518549 - 5518854
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5518549 atgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaggaaaaa 5518648  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5518649 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatttatatatagtt-acctattataatccctatttttatggttcctaggaatgttataaagttaac 5518747  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||     
T  5518748 cgaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattccaatgaataaatttggtaaacttcaaacaaacag 5518847  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  5518848 accctaa 5518854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 38964724 - 38965027
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  38964724 atgatagaaatgtatatgcttatgtttgttacaagtttacaaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagagaaag 38964823  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  38964824 ggtgggaataaagttcccatggagattggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttattaggaatattataaagctatc 38964923  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38964924 caaagatatatttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacac 38965023  T
Q  301 accc 304  Q
    ||||    
T  38965024 accc 38965027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3572610 - 3572841
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3572610 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 3572709  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3572710 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 3572809  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3572810 caaacatatttttcctaaattccttggaataa 3572841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39329635 - 39329347
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  39329635 atgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag 39329536  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39329535 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 39329436  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||              || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39329435 caaacatattttttctaaattccttggaa--------------ttttattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 39329350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 5806336 - 5806628
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  5806336 atgatagaaatgtatatgcct----ttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattttccaaggaa--- 5806428  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
            |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5806429 --------taaagttcccatggagatggaaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 5806520  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5806521 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 5806620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 32202395 - 32202660
Alignment:
Q  38 tactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatt 137  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32202395 tactaaaatttaatccttggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatt 32202494  T
Q  138 cataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32202495 cataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattc 32202594  T
Q  238 ccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32202595 tcatctttatattccaaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 32202660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13653878 - 13653581
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13653878 atgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaat 13653779  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13653778 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagttaac 13653680  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaat-aaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13653679 caaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 13653581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35187483 - 35187181
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35187483 atgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcgtgggaatagaaaaaatttcccaaggagaag 35187384  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35187383 ggtgggaataaagttcccatggagataagaataagttcataaatagtttacctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaaactaac 35187284  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaac-ttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35187283 caaacatatatttcctaaattctttagaataaaatttccatctttatatttcaagaaatattattcctaagaataaatttggtaaactttgaaacaaaca 35187184  T
Q  300 cac 302  Q
    |||    
T  35187183 cac 35187181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 48916067 - 48916375
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  48916067 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattttcgggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaagataag 48916166  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48916167 gatgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatatgtag-ttgcctattataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagttaac 48916265  T
Q  201 caaacata-tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48916266 caaacatatttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatattctaaggaatgttattcctaagaataaatttgataaacttgaaacaaaca 48916365  T
Q  300 caccctaaaa 309  Q
    ||| ||||||    
T  48916366 cactctaaaa 48916375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 37436666 - 37436966
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  37436666 atgataggaatgtatatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattttcggatataaaatgttactgagaatagaaaat-tttcccaaagaaaag 37436764  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37436765 ggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtt-atctattataatccttatttttatggttcctaagaatattataaagttaac 37436863  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37436864 caaacatatttttcctaaacaccttgaaataaaatttccatatttatattccaaggaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 37436963  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  37436964 acc 37436966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6978797 - 6978550
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6978797 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttcgtataaaatgtttcagggaatagaaaaaatttctcaaggaaaag 6978698  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6978697 ggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagctaac 6978598  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6978597 caaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttata 6978550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 52699511 - 52699799
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  52699511 atgataggaatacacatgcctatgtttgttacaagtttactgaattttattcccgggtataaaacgttcctgggaatagaacatttttcccaaagaaaag 52699610  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||     
T  52699611 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatgagtaattt-cctattataattcctattttcatggttcccaggaatattataatgttaag 52699709  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttg 290  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52699710 caaacttattttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttg 52699799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29091681 - 29091392
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  29091681 tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgagtaaaaaatgttcatcggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaaggtgggaataaa 29091582  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    |||||||||||||     ||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29091581 gttcccatggaga-----ataaatttacacatagtt-acctattataaaccctatttttatggttcctagtaatattataaagttaaccaaacatatttt 29091488  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29091487 ttataaataccttggaataaaattcccatctttatattttaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 29091392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47031758 - 47031580
Alignment:
Q  129 gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47031758 gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgga 47031659  T
Q  229 ataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47031658 ataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa 47031580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 74 - 263
Target Start/End: Original strand, 49823014 - 49823203
Alignment:
Q  74 gaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49823014 gaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgataataaattcataaataatttacctattataatccctatttttat 49823113  T
Q  174 ggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49823114 ggttcctaggaatattataaacctaaccaaacatattttttctaaattccatggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta 49823203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46960646 - 46960351
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  46960646 aatgcatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttcccaatgaaaagggtgggaa 46960547  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat- 207  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |  |   ||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||     
T  46960546 taaagttcccatgaagatga-aataaaattgtgtgta-attacctattataaactctatttttaaggttcattggaatattataatgttaaccaaacatc 46960449  T
Q  208 atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  46960448 tttttttctaaatatcttggaataaatttctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttgataaatttgaaacaaacacaccct 46960351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 1227936 - 1228225
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag 113  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |||||||  ||||||||||    
T  1227936 atatgcctatgcttgttacaagtttattaaattttattttcaggtataaaatgtttcttggaatagaaaagatttccgaaagaaaaggtcgggaataaag 1228035  T
Q  114 ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttt 213  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||  | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1228036 ttcccatgaagattagaataaaattatgtagaatt-acctattataatccctatttttaaggttccttgaaatattataaagttcaccaaacatattttt 1228134  T
Q  214 c--ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
       |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1228135 tttctaaattctttggaataaaattctcatctttatattccaaggaaggttattcatagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac 1228225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47037484 - 47037324
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47037484 atgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 47037385  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47037384 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataat 47037324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47677648 - 47677368
Alignment:
Q  23 tgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgg 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||     
T  47677648 tgtttgttataaatttactaaattttatttccgggtataaaatgttccattgaatagaaaagttttcccaaaggaaaggatgggaataaagttcccatga 47677549  T
Q  123 agatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattc 222  Q
    ||||| ||||||| | ||   || || || |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||      
T  47677548 agatgggaataaaattatgtgtaatt-acatattataatccctatttttaaggttccttagaatattacaaagttaaccaaacatattttttttaaatat 47677450  T
Q  223 cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  47677449 cttggaataaaattctcatctttatattccaagaaattttattcctaagaataaatttcataaactttaaataaacacaccc 47677368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 24116400 - 24116684
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24116400 tatgtttgtcacaagtttactaaattttattcccgggtataaaacgttcctgtaaataaaaaagaattcccaaagaaaagggagggaataaagctcccat 24116499  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaat 220  Q
    | ||||||||||| ||| ||   || || |||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||| ||    
T  24116500 gaagatgagaatatatttatgtgtaatt-acctattataattcctatttttatggtttccaaaaatattttaatgttaagcaaacatcttttttctatat 24116598  T
Q  221 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24116599 accttgaaataaaattctcatctttatattctaaggaatgttattcttaagaataaatttgttaaacttaaaacaaacacacccta 24116684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Original strand, 38519122 - 38519411
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt-gggaataaagt 114  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  38519122 atgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgtttttgggaa--gaaaaattttcccaaagaaaaggtttgggaataaagt 38519219  T
Q  115 tcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc 214  Q
    ||||||| | || || | ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||| ||||||| |||||     
T  38519220 tcccatgaa-attaggaaaaattcatgtataaattacctattataatccctatttttatggtttccaagaatattataatgttaaacaaacatctttttt 38519318  T
Q  215 ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  38519319 ctaaatacattggaataaaattttcatttttatgttccaaaaaatgttattcctacgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaacctaa 38519411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30241036 - 30240782
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30241036 atgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgga-ataaaaagttattgggaatagaaaaaaattcccaaagaaaag 30240938  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
     ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30240937 agtgagaataaagttctcatgaagatgagaataaatttatatgtaatt-acctattataatccctacttttatggttcttaggaatattataaagttaac 30240839  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 259  Q
    |||||||||||||  | || |  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  30240838 caaacatattttt--ttaaatatttggaataaaatttccatttttatatttcaaggaat 30240782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Original strand, 17475368 - 17475658
Alignment:
Q  3 gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg 102  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  17475368 gatagaaatatatatgtttatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaataaataaaatttcccaaagaaaagag 17475467  T
Q  103 tgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacca 202  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || ||||||     || || ||        ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||| ||    
T  17475468 tgggaataaagttccaatagagatgggagtaaatt-----attgtgta--------aatacctatttttatagttcccgggaatatcataatgttaagca 17475554  T
Q  203 aacat-atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  17475555 aacatctttttttctaaataccttggaataaaatttccatttttattttccatagaatgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacgaacaca 17475654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25474107 - 25473978
Alignment:
Q  176 ttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25474107 ttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata 25474008  T
Q  276 aatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25474007 aatttgataaacttgaaacaaacacaccct 25473978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48462475 - 48462258
Alignment:
Q  82 aaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttccta 181  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48462475 aaaatttccgaag-aaaaggatgggtataaagttcccatggaattgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccttatttttatggttccta 48462378  T
Q  182 ggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattta 281  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||     
T  48462377 caaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaa-tatttggaatataattctcatctttatactccaaagaatgttattcataaaaataaatttg 48462279  T
Q  282 gtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
     ||||||| ||||||| ||||    
T  48462278 ataaacttaaaacaaatacac 48462258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 31806801 - 31807093
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  31806801 atgatagaaatatacatgcttatgtttgttac--gtttactaaattttattctcgaacataaaacgttcctgggaatagaaaaaaattcccaaataaaag 31806898  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||  ||| ||||||||      ||||||||||||||    |||||||||| | |||     
T  31806899 ggtggaaataaagttcccatgaagatgagaacaaattcatgtgta-attatctattata------atttttatggttcccgcaaatattataatgttaag 31806991  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||||||    
T  31806992 caaacatattttttctaaataccttagaataaaattttcatctttatgttccaagaaatattattcttagaaataaatttgatcaacttgaaataaacac 31807091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Original strand, 13931942 - 13932218
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaag 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||     
T  13931942 atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatgttcct-ggaatagaaatgttttcctaaagaaaagggtgggaataaat 13932040  T
Q  114 ttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata--ttt 211  Q
    |||||      |||| |||||| | ||   ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||     ||| ||||||  ||||||||||||  |||    
T  13932041 ttccc------atgaaaataaaattatgtgta-attacctattataat-cctatttttaaggttcc-----atactataaaattaaccaaacatattttt 13932127  T
Q  212 ttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    || || ||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13932128 tttctgaataccttgaaataaagtttccatctttatatttcaatgaatgttattccttgaaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 13932218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13521348 - 13521053
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13521348 atgatagaaatatacatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaag 13521249  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||| ||||||||| |||   ||||||||||||| |||    ||   ||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  | | ||    
T  13521248 ggtggaaataaagtttccagaaagatgagaataaa-tcaggtgta-actatttattataatccctattcttaaggttccggggaatattatagtgttcac 13521151  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
     |||||  ||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||  || |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  13521150 gaaacaccttttttctaaa-tacttgaaataaaattcacatctttatattctagtgaatgttatttttaagaataaatttggtaaacttaaatcaaaca 13521053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19083150 - 19083285
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19083150 atgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaaag 19083249  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaat 136  Q
    ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  19083250 ggtggaaataaagtttccaggcatatgagaataaat 19083285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19131038 - 19131173
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19131038 atgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaaag 19131137  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaat 136  Q
    ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  19131138 ggtggaaataaagtttccaggcatatgagaataaat 19131173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29769526 - 29769230
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa-gggtgggaataaa 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29769526 atatgtctatgtttgttacaaaattactaaattttattctttgacataaaatgttcctggcaatagaacaattttcctaaagaaaaagggtgggaataaa 29769427  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||  | ||| || ||||||| | |||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  29769426 gtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-attacctattataatctatgtttctaaggttccttgaaatattataatgttaactaaacatttttt 29769328  T
Q  213 ---tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt-----cctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
       | ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||       || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29769327 ttcttctaaatatcttgaaataaaattcacatctttatattccaaagaatgttattattcatataagaataaatttagtaaacttaaaacaaacacac 29769230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 9011206 - 9011511
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc-tgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaa 99  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| | || |||| |||||  |||||||| |||||    
T  9011206 atgataggaatatacatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattttcgg-tataaaaggtttcgtgagaatcgaaaatttttcccaaagaaaa 9011304  T
Q  100 gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    |||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||||||||||| | |||    
T  9011305 gggtcggaataaagttcccatagtggtgggaataaattcatgagtaattt-cctattataattcttatttt-atggtctccaggaatattataatgttaa 9011402  T
Q  200 ccaaacatatttttc---ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaa 296  Q
     ||||||| |||||    |||||| | || ||| ||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||    
T  9011403 gcaaacatttttttttttctaaatactttagaagaaaattttcatctttatgttccgaggaatattattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaa 9011502  T
Q  297 acacaccct 305  Q
    |||||||||    
T  9011503 acacaccct 9011511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13440422 - 13440186
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa-aaaatttcccaaggaaaa 99  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||| |||||    
T  13440422 atgatagaaatataaatgactatgtttgttagaattttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaattccaaagaaaa 13440323  T
Q  100 gggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaa 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||||||| | | |    
T  13440322 gggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcatatgta-actacctattataatccatattcttaaagttccatggaatattataatgttca 13440224  T
Q  200 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattc 237  Q
    || ||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  13440223 ccgaacaccttttttctaaatatcttgaaataaaattc 13440186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1007672 - 1007566
Alignment:
Q  126 tgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcctt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  1007672 tgagaataaattcataaatagtt-acctattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagttaatcaaacatatttttcctaaatacttt 1007574  T
Q  226 ggaataaa 233  Q
    ||||||||    
T  1007573 ggaataaa 1007566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 11014486 - 11014626
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||    
T  11014486 atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttaataaattatattcacggatataaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttcaaaagaaaag 11014585  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcata 141  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11014586 ggtggaaataaagttctcatgaagatgagaataaattcata 11014626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1007774 - 1007663
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  1007774 atgatatgaatatatatgtctaggtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaattttaccaagaaaaag 1007675  T
Q  101 ggtgggaataaa 112  Q
    |||| |||||||    
T  1007674 ggtgagaataaa 1007663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3939486 - 3939225
Alignment:
Q  40 ctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattca 139  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| ||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3939486 ctaaattttattcctggaaatgaaatattattgggaatagaaaaaaattccaaag-aaaagtgtaggaatcaagtttccattaagatgagaataaattca 3939388  T
Q  140 taaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattccc 239  Q
    || || ||| |||||||||||||  |||||||| | |||||   |||||||||| | ||| ||||||| |||||  |||||  |||  |||||||||| |    
T  3939387 tacatggtt-acctattataatctatatttttaag-ttccttaaaatattataatgttaatcaaacatgttttttttaaatatcttaaaataaaattcac 3939290  T
Q  240 atctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3939289 ttttttatattccaaagaatgttattcctaaaaatatatttgataaacttaaaacaaacacaccc 3939225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49627454 - 49627301
Alignment:
Q  149 tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt-tcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||| |||| |  ||||| |  |  ||||||||||||||||||||    
T  49627454 tacctattataatccatatttttatggttctttgaaatattataatgttaaccaaacattttttcttttaaatactctacaataaaattcccatctttat 49627355  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49627354 attccaagaaatgttattcttaaaaataaatttggtaaatttgaaacaaacaca 49627301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37261699 - 37261546
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  37261699 ttacctattataatccatatttttaacgttctttggaatattataatattaaccaaacatcttttttctaaatatctaagaataaaattcacatatttat 37261600  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    ||||||| |||||||| || ||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37261599 attccaatgaatgttaatcataaaaataaatttgataaacttgaaacaaacaca 37261546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 20505034 - 20505213
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaat---agaaaaaatttcccaaggaa 97  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||   | |||||| || |||| |||    
T  20505034 atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataaaatattcctgggaataagaaaaaaaaattaccaaagaa 20505133  T
Q  98 aagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttc 178  Q
    || ||||  ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||   ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20505134 aaaggtgaaaataaagcttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacatattataatccctatttttatggttc 20505213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45771911 - 45771813
Alignment:
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45771911 ttttttctaaataccttggaataaaattctcacctttatgttccaagaaaggttattcatgggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa 45771813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13114793 - 13114675
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    |||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||   |||||||    
T  13114793 taaaatcaatatatgtcccaccactttatatggattccatttccaaaatgtataacccacattgatttaacccaatgagatagtgagtgttagagagagt 13114694  T
Q  402 gtccaaaatagattgttgc 420  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  13114693 gtccaaaagagagtgttgc 13114675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 19923655 - 19923815
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19923655 ttacctattataatccctacttttttggttctcaaaaacattataatgttaaacaaacatattttttctaaatatcttagaataaaattctcatctttat 19923754  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
     ||| ||| ||||||||| |||  |||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  19923755 gttctaagaaatgttatttctaaaaataaatttgatgaacttaaaacaaacacaccataaa 19923815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37726859 - 37726804
Alignment:
Q  251 ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacccta 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37726859 ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtgaacttgaaacaaacacacccta 37726804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 303
Target Start/End: Original strand, 52186265 - 52186344
Alignment:
Q  224 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  52186265 ttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattccttaaaataaatttggtaaacttaaaacaaatacacc 52186344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 212
Target Start/End: Original strand, 37336514 - 37336699
Alignment:
Q  26 ttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaga 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||  ||||||||||||    || |||| ||| || ||||||||||||||  || | ||     
T  37336514 ttgttacaagtttactaaattttattctcagatataaaatattattgggaatagaaatttctttccaaagaatagagtgggaataaagttttcacgaagg 37336613  T
Q  126 tgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  37336614 agagaataaattcatgtata-attacctattataatctctatttttatggtttcttaaaatattaaaatgttaaccaaacatgtttt 37336699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 52186091 - 52186262
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||                 |    
T  52186091 atgatagaaatatatatgtctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgacgataaaatgtttctgggaatagaaa-----------------g 52186173  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatatta 190  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  52186174 ggtgggaattaagttcacattgagatgtgaataaatttctacatagtt-acctattataatttctatttttatggtttctaagaatatta 52186262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 289
Target Start/End: Original strand, 45813603 - 45813727
Alignment:
Q  165 tatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 264  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||||   |||| ||| || ||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  45813603 tattcttaaggttctttggaatattataatcttaacaaaatatcttttttctaaataccttaaaataaaattcacatctttatatttcaatgaatgttat 45813702  T
Q  265 tcctaggaataaatttagtaaactt 289  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||    
T  45813703 tcctaagaataaatttgataaactt 45813727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37261859 - 37261734
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaat-aaagt 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| |||||    
T  37261859 atgcatatgtttgttacaagtttattaaattttattccc-gacataaaatctttttgggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaggttgagaataaaagt 37261761  T
Q  115 tcccatggagatgagaataaattcata 141  Q
    || || | ||||  |||||||||||||    
T  37261760 tctcacgaagatatgaataaattcata 37261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 13048461 - 13048578
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||| | | ||| ||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  13048461 ttacctattataatccttatttttagtgttcctgagaatattatcatgttaagcaaacatattttctttaaataccttagcataaaattcctttctttat 13048560  T
Q  248 attccaaggaatgttatt 265  Q
     ||||||| |||||||||    
T  13048561 gttccaagaaatgttatt 13048578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 13053458 - 13053575
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||| | | ||| ||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  13053458 ttacctattataatccttatttttagtgttcctgagaatattatcatgttaagcaaacatattttctttaaataccttagcataaaattcctttctttat 13053557  T
Q  248 attccaaggaatgttatt 265  Q
     ||||||| |||||||||    
T  13053558 gttccaagaaatgttatt 13053575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45772088 - 45771963
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctg-----ggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtt 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||| ||     |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||  |    
T  45772088 tatgtttgttataagtttattaaattttatttctggatataaaacgttcgtgtcatgggaatagaaaattttttccaaagaaaatggtgggaataaaaat 45771989  T
Q  116 cccatggagatgagaataaattcata 141  Q
      |||| |||||||||||||||||||    
T  45771988 ttcatgaagatgagaataaattcata 45771963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 405
Target Start/End: Original strand, 11135798 - 11135897
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg-tagagagtgtcc 405  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  11135798 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataaaagagtgagtgctagagagagtcc 11135897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 49822962 - 49823009
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaatttt 48  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49822962 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt 49823009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 41918054 - 41918140
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||   || |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  41918054 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtggattccattttcaaagtgtaggtcctacattgattttacccaataaaagagtgagtg 41918140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41948269 - 41948181
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41948269 taaaatcaatgtatattctaccactttgtgttggttcaattttcaaagtgta-aatccacaatgatttaaatcaataagagagtgagtgt 41948181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Original strand, 49824022 - 49824067
Alignment:
Q  255 ggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  49824022 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 49824067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14094122 - 14094035
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  14094122 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgatttcactcaatcaaaaagtgagtgt 14094035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19094122 - 19094007
Alignment:
Q  19 cctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc 118  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |||  || ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  19094122 cctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttctagatataaaatgttcctgataatgaaataacattcccaaagaaaactgtgggaataaagttccc 19094023  T
Q  119 atggagatgagaataa 134  Q
    ||| | |||| |||||    
T  19094022 atgaatatgaaaataa 19094007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 137
Target Start/End: Original strand, 33702459 - 33702524
Alignment:
Q  72 gggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  33702459 gggaatagaaaaaatttcccgaataaaaaggtgagaataaaattcccatgacgatgagaataaatt 33702524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50424989 - 50424912
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa 382  Q
    ||||||||||  |||  |||||| |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50424989 taaaatcaatccataccccaccactttatgtaagttccatttccaaagtgtatgacccacattgatttaacccaataa 50424912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 52276930 - 52276877
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcct 71  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  52276930 atgcctatatttgttacaagtttactaaattttatt--cggatataaaatgttcct 52276877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Original strand, 11430500 - 11430585
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   || ||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  11430500 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgaattcac-caataaaagagtgagtg 11430585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 409
Target Start/End: Original strand, 15660950 - 15661055
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt---agagagt 401  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||||| || ||  ||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||    
T  15660950 taaaatcaatgcatgtcccaccactttatgcgggttttatttccaaaatgtatgac--acattgatttaacccaataatagagtgagtgttagagagagt 15661047  T
Q  402 gtccaaaa 409  Q
    ||||||||    
T  15661048 gtccaaaa 15661055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30867557 - 30867515
Alignment:
Q  342 catttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataaga 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  30867557 catttctaaagtgtagaacccacattgatttaacctaataaga 30867515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11078050 - 11077949
Alignment:
Q  33 aagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||   |||||||||||||  | ||||||||    
T  11078050 aagtttattaaattttatttctggatataacatgtttttgggaatagaaaaattttccaaaaaaaaaaggtgaacataaagttcccattaaaatgagaat 11077951  T
Q  133 aa 134  Q
    ||    
T  11077950 aa 11077949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 28109927 - 28109975
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta 356  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28109927 aaatcaatgcatgttccaccattttatgtgggttccatttc-aaagtgta 28109975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30679034 - 30678946
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| ||||  |||||||| | | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30679034 taaaatcaatgtatgtcccaccactttgtgtgggttcaattttcaaagtgtaga-ctcacaatgatttaagccaataagagagtgagtgt 30678946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 41958142 - 41958226
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt 392  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || || ||| ||||  |||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  41958142 aaatcaatgtatgtcccaccattttgtgggggttcaattttcaaagtgtaga-cccacagtgatttaaaccaataagagagtgagt 41958226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 8476353 - 8476659
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8476353 atgattggaatgtatatgcctgtgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 8476452  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8476453 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 8476552  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8476553 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 8476652  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  8476653 accctaa 8476659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26849048 - 26848742
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26849048 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaag 26848949  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26848948 ggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 26848849  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26848848 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 26848749  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  26848748 accctaa 26848742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 11239165 - 11239469
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239165 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 11239264  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239265 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 11239364  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11239365 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 11239464  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  11239465 accct 11239469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 33217958 - 33218266
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33217958 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttattaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 33218057  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33218058 ggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaac 33218157  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33218158 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 33218257  T
Q  301 accctaaaa 309  Q
    |||||||||    
T  33218258 accctaaaa 33218266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40908291 - 40907988
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40908291 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 40908192  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40908191 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac 40908093  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40908092 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 40907993  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  40907992 accct 40907988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 47114902 - 47115202
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  47114902 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaag 47115001  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115002 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 47115101  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47115102 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 47115201  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  47115202 a 47115202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 48339810 - 48340106
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48339810 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 48339909  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48339910 taaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 48340009  T
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48340010 tttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattctaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48340106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 20414510 - 20414812
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20414510 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttataaatttactaaattttattcccgggtataaaatgttcttggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaag 20414609  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20414610 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaat 20414709  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20414710 caaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 20414809  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  20414810 acc 20414812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 6231546 - 6231851
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  6231546 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaatgaaaat 6231645  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231646 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 6231745  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6231746 caaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatatttcaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 6231845  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  6231846 acccta 6231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31611030 - 31611330
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  31611030 atgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaag 31611129  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31611130 ggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 31611229  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31611230 caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcataagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 31611329  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  31611330 a 31611330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46359978 - 46359674
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46359978 atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcttgtgaatagaaaatatttcccaaggaaaag 46359879  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46359878 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaac 46359779  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  46359778 caaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 46359679  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  46359678 accct 46359674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44952334 - 44952028
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44952334 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 44952235  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttccta-ggaatattataaagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  44952234 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatg-ttcctaaggaatattataaagttaa 44952136  T
Q  200 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44952135 ccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 44952036  T
Q  300 caccctaa 307  Q
    ||||||||    
T  44952035 caccctaa 44952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1099224 - 1098923
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099224 atgatagaaatgtatatccctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 1099125  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1099124 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-tttacctattataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctagc 1099026  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1099025 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 1098926  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  1098925 acc 1098923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 28124481 - 28124779
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28124481 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctcggaatataaaaaatttcccaaggaaaag 28124580  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28124581 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacatattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaac 28124680  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28124681 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatatttatattccaaggaatgttaatcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 28124779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 9320493 - 9320797
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9320493 atgataggaatgtatatacttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaaa 9320592  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320593 ggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatagtttacttattatgatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 9320692  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattcctt-ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9320693 caaacatatttttcctaaattccttaggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttcataaacttgaaacaaaca 9320792  T
Q  300 caccc 304  Q
    |||||    
T  9320793 caccc 9320797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24574601 - 24574287
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        || |||| ||||||||||||||||||    
T  24574601 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgtttctggaaatagaaaaaatttccca 24574502  T
Q  93 aggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 192  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24574501 agaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattata 24574402  T
Q  193 aagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24574401 aagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattctcatctttatatttcaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaa 24574302  T
Q  293 acaaacacaccctaa 307  Q
    |||||||||||||||    
T  24574301 acaaacacaccctaa 24574287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20297819 - 20297515
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20297819 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaag 20297720  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20297719 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagtcaac 20297620  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20297619 caaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattccaaagaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacac 20297520  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  20297519 accct 20297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 53165770 - 53166075
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  53165770 atgataggaatatatatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgtttctgggaatagaaaattttttccaagaaaaag 53165869  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  53165870 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatatctatttttatgattcctaggaatattataaggttaac 53165968  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  53165969 caaacatatttttcctaaataccttggaataaaatacccatctttatatttcaaggaatgttattcttagaaataaattggataaacttgaaacaaacac 53166068  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  53166069 accctaa 53166075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 43132205 - 43132502
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  43132205 ataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattttcatgtataaaatgtacctgagaatataaattttttcccaaggaaaagggt 43132304  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43132305 gggaatagagttcccacggagatgagattaaattcataaatagtt-acctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaa 43132403  T
Q  204 acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43132404 acatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 43132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 10822763 - 10823066
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10822763 atgatagaagtgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaaaaaattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccctaggaaaag 10822862  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10822863 ggtgggaataaagttttcatggagatgggaataaaatcataaatagtt-atctataataatccctatttgtatggttcctaagaatattataaagttaac 10822961  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10822962 caaacatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattgtaaggaatgttattcctagaaataaatttgctaaacttgaaacaaacac 10823061  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  10823062 accct 10823066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 302
Target Start/End: Original strand, 43718994 - 43719271
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43718994 ctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggcataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagatccca 43719093  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 219  Q
    ||||||||      |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43719094 tggagatgg-----aattcataaataatttacttattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 43719188  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43719189 ttccttggaataaaattctcaactttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 43719271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 31435968 - 31436269
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||      
T  31435968 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgttcctgaaaatagaaaaattttcccaaagaaatt 31436067  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  31436068 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattctaatgtag-ttacctattataatccttatttttatgattccaagaaatattataaaactaac 31436166  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31436167 caaacatgttttttctatataccttggaataaaattcctatctttatattctaaagaatgttatttccaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 31436266  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  31436267 acc 31436269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29512546 - 29512324
Alignment:
Q  80 aaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29512546 aaaaaatttcccaaggaaaagggtggaaataaagttcccatagagatg-gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcc 29512448  T
Q  180 taggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatt 279  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29512447 tatgaatattataaagctaaccaaacgtatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatgttattcctaggaataaatt 29512348  T
Q  280 tagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  29512347 tggtaaatttgaaacaaacacacc 29512324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12228301 - 12228601
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  12228301 atgatagaaatatatatgcctatgtttattacaagtttactaaattttattctcgggtacaaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaag 12228400  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  12228401 g-tgagaataaagttcccatggagatgagaataaaatcatatgtagtt-atctattataatacttatttttatgattcctaagaatatcataaaactaac 12228498  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  12228499 caaacatattttttttaaataccttagaataaaattctcatctttatatttcaaataatgttattcccaagaataaatttgataaacttgtaacaaacac 12228598  T
Q  301 acc 303  Q
    |||    
T  12228599 acc 12228601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19533130 - 19532939
Alignment:
Q  41 taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  19533130 taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaatttttttccaaggaaaagggtgggaataaagtttccttggagatgggaataaattcat 19533031  T
Q  141 aaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaa 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19533030 aaatag-ttacctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaa 19532939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 303
Target Start/End: Original strand, 26849235 - 26849492
Alignment:
Q  46 tttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt-tcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaat 144  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | | ||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26849235 tttactcccgggtataaaaagtttctgggaatagaaaaaaaaattcaaagaaaaatggtgggaataaagttcctacagagatgagaataaattcataaat 26849334  T
Q  145 agtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctt 244  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  26849335 agtt-acctattataatctctatttttatggttcctatgaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaataccttgaaataaaatttccatctt 26849433  T
Q  245 tatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26849434 tatattccaagaaatattattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacacc 26849492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 28770274 - 28770557
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  28770274 ctatgtttggtacaagtttactaaatttgattcctgggtataaaacgttcctagcaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtgggaataaagttctca 28770373  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 219  Q
    || ||||| |||| | ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| | ||| |||||||  |||| ||| |    
T  28770374 tgaagatgggaatgatttcatatgtaatt-acctattataatccctatttttatggttcccgataatattataacgttaaacaaacatcatttttctata 28770472  T
Q  220 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 304  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28770473 taccttggaataaaattctcatcattatgttccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaccc 28770557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27823300 - 27822994
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  27823300 atgatagaaatataaatgtctatgtttgctataagtttactaaattttattcccgagtataaaacgttcatcgaaataggaaaattttcccaaagaaaag 27823201  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||   ||  |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||     
T  27823200 ggtgggaataaaattctcatgaagatgagaacaaattcatgtgta-attacctgttataatccatatttttatgatttctaggaatattataatgttaag 27823102  T
Q  201 caaaca----tatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaa 296  Q
    |||| |    | ||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  27823101 caaatattttttttttttctaaataccttaaaataaaattctcatatttatgttcgaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaa 27823002  T
Q  297 acacaccc 304  Q
    ||||||||    
T  27823001 acacaccc 27822994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Original strand, 38140425 - 38140710
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaat--gttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaata 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||   ||| |||| |||||||||| |||||    
T  38140425 tatatgtcaatgtttgttataagtttactataatttattgacgagtataaaatatgttcctaggaatagaaatttttttccaaagaaaagggtgagaata 38140524  T
Q  111 aagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatt 210  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||   || ||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||    
T  38140525 aagttcc-atgaagatgagaataagttcatgtgtaattt-cctattataatccttattttttaggttcccaggaatattataatgttaatcaaacatctt 38140622  T
Q  211 tttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  38140623 ttttctatataccttggaataaaattcacacctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaattttataaaattgaaacaaac 38140710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 1246947 - 1247212
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  1246947 atgatagaaatacatatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaagaataaaatgttcctggtaatagaaaaaatttccgaaggaaaaa 1247046  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||| || ||||    
T  1247047 ggtgggaat--agttcacatggagatcggaataaattcttatatag-ttatctattataatccatatttttatagtaccaaggagtattatagagttaac 1247143  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattccta 269  Q
    ||||||||||||||   ||| | || ||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||||||    
T  1247144 caaacatatttttctcgaatactttagaataaaattctcatctatttattctaaaaaatgttattccta 1247212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 6832114 - 6832271
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6832114 ttacctattataatccttatttttaaggttctttggaatactatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttggaataaaattctcatctttat 6832213  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6832214 attccaagtaatgttattcttaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaccct 6832271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40584561 - 40584336
Alignment:
Q  76 atagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgg 175  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||   || |  |||||||||| | |||||||||| ||    
T  40584561 atagaaaagtttttccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaaattatgtgtaatc-acctattatatttcctatttttaagg 40584463  T
Q  176 ttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata 275  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  40584462 ttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatatttgaaggaatgttattcttaggaata 40584363  T
Q  276 aatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    |||||  || |||||||||||||||||    
T  40584362 aatttgttacacttgaaacaaacacac 40584336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24784130 - 24783934
Alignment:
Q  106 gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagct-aaccaaa 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||   || || |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  24784130 gaataaagttcccatgaagatgggaataaaattatgtgtaatt-acctattataatctttatttttaaggttccttggaatattctaaagtttaaccaaa 24784032  T
Q  205 catatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24784031 catattttttttaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcttatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 24783934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32071450 - 32071256
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccat 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||  || |||||||| | |||||||||| | ||    
T  32071450 tatgtttgttacaagtttactaaattttatttt-gggtatgaaatgttcatggaaatagaaagattttcttaaagaaaagggcgagaataaagttac-at 32071353  T
Q  121 ggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaa 218  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32071352 ggagatgagaataaatttgtatgtagtt-acctattataatctttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaa 32071256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 49216179 - 49216027
Alignment:
Q  148 ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49216179 ttacctattataatctatatttttaaggttctttggaattttataaggttaaccaaacatattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttat 49216080  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  49216079 attccaaggaacattattcctaagaataattttggaaaacttaaaacaaacac 49216027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 12930994 - 12931287
Alignment:
Q  9 aatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaa 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||    
T  12930994 aatgcatatggctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg-tataaaatgtttatgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaa 12931092  T
Q  109 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatg-gttcctaggaatattataaagctaaccaaacat 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| | ||   ||  |||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  12931093 taaagttcccatagagatgggaataaaattatgtgta-attacctattatattccttatttttaagatttccttgaaatattataattttaatcaaacat 12931191  T
Q  208 atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
     |||||  ||||| |||| ||||||  ||   |||||||| ||  || |||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12931192 cttttttttaaataccttagaataatttttttatctttatgttataaagaatgttacttttaggaataaatttggtacacttgaaacaaacacacc 12931287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 2565508 - 2565749
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    |||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| ||||| |||    
T  2565508 atagaaatatatatacctgtgtttgttacaagtttgttaaattt-atttccgggtataaaatgtttcttggaatagaaaattttttccaaagaaaatggt 2565606  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagt--ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacc 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||          |||||||| || ||||||||||||| ||||     
T  2565607 gggaataaagttcccatgaagatgagagtaaattcatacgtagtagttacctattataa----------tatggttcatatgaatattataaagttaact 2565696  T
Q  202 aaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 255  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  2565697 aaacatattttt-ttaaataccttgaaataaaattctcatctttgtatttcaag 2565749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18460953 - 18460827
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18460953 tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtggaaataaa 18460854  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattca 139  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18460853 gttctcttggagatgaaaataaattca 18460827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Original strand, 28693485 - 28693780
Alignment:
Q  15 tatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag-----ggtggg--a 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||     ||||||  |    
T  28693485 tatgcttatgtttgttataagtcaattaaattttattcatgagtataaaacgatcctgagaatagaaaaattttctcaaagaaaagaaaagggtggggga 28693584  T
Q  108 ataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacat 207  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||  |||||  | |||||||||   ||||||||||||| |  | |||||||||| | |||  ||||||    
T  28693585 ataaagttctcatgaagatgagaatat-ttcatatgtagttgtc-tattataatttttatttttatggtttccggaaatattataatgttaaataaacat 28693682  T
Q  208 atttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
     ||||| ||| |  ||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28693683 cttttttctataaaccttgaaataaaattctcatcttaaagtttcaaggaaaattatttctaggaataaatttagtaaatttgaaacaaacacaccct 28693780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18460749 - 18460582
Alignment:
Q  129 gaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgga 228  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||| ||||| |    
T  18460749 gaataaattcatatgtagtt-accgattataatccctgtttttatggttc-tatgaatattataaagttaaccaaatatatttcttttaaataccttgta 18460652  T
Q  229 ataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    || |||||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  18460651 atcaaattctcatctttatatttcgaaaaatgttattcgtagaaataaatttgataaacttgaaacaaac 18460582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Original strand, 33647767 - 33647886
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||| ||     
T  33647767 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaacgtttctgagaatataaaaaaatttccaaagaaaagagtggaaataaagtttcct 33647866  T
Q  120 tggagatgagaataaattca 139  Q
    || |||||||||||||||||    
T  33647867 tgaagatgagaataaattca 33647886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6927909 - 6927817
Alignment:
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  6927909 ttttttctaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagtaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 6927817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27094029 - 27093957
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27094029 tatatgcctatgtttgttataagtttactatatcttattctcgggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaa 27093957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 392
Target Start/End: Original strand, 27243102 - 27243189
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt 392  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27243102 taaaatcaatgcatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtatgacccacattgatttaacccaatgagagagtgagt 27243189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32071080 - 32070985
Alignment:
Q  217 aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaaatca 312  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||| |||| ||| ||||    
T  32071080 aaataccttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataggaataaatttgataaatttaaaacaaacccaccataatatca 32070985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 386
Target Start/End: Original strand, 13809138 - 13809219
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagaga 386  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13809138 taaaatcaatgtatgtcccaccattttatgtgggttccatttccaaagtatatgacccacattgttttaacccaataagaga 13809219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Original strand, 33650217 - 33650357
Alignment:
Q  159 aatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 258  Q
    |||| |||||||||||||| |   ||||||||||| | ||| ||||||| |||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||  ||    
T  33650217 aatctctatttttatggtttccgagaatattataatgttaagcaaacatttttttattcaataccttagaataaaattctcatctttagatttcaaataa 33650316  T
Q  259 tgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33650317 tgttattcataaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 33650357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 29512705 - 29512631
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt 88  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29512705 atatgcctacgtttgtttcaagtttactaaattttattcctgagtataaaatgttcatcggaatagaaaaaattt 29512631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45826136 - 45826064
Alignment:
Q  228 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45826136 aataaaactcccattcttatattcccaggaaagttattcctaggaataaatctagtaaactggaaacaaacac 45826064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27093892 - 27093763
Alignment:
Q  163 cctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 262  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||  | ||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27093892 cctatttttaatgttccttggaatattatattgttaatcaaacatctttttcttaa-taccttgaaataaaattcacatctttatattctaaggaatatt 27093794  T
Q  263 attcctaggaataaatttagtaaacttgaaa 293  Q
    |||  || ||||||||||  ||||| |||||    
T  27093793 atttttaagaataaatttgataaacatgaaa 27093763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 303
Target Start/End: Original strand, 31267540 - 31267694
Alignment:
Q  149 tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||  | | |||||||||| | | || |||||| ||||| |||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  31267540 tacctattataatccttatttttaaagtttatggaaatattataatgttgactaaacatcttttttctaaataccttaaaatgaaattcacatctttata 31267639  T
Q  249 ttccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    ||  ||| |||||||||||||  |||||||    ||||||| |||||||||||||    
T  31267640 ttttaagaaatgttattcctaaaaataaatccgataaacttaaaacaaacacacc 31267694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Original strand, 55435652 - 55435726
Alignment:
Q  226 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55435652 ggaataaaactcccatctttatattcccgggaaagttattcacaagaataaatctagtaaacttgaaacaaacac 55435726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24749029 - 24748944
Alignment:
Q  309 atcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  24749029 atcaatgtatgtcccaccattttatgtgggttccatttctaaagtgtaggtcctacattgatttcatccaataaaagagtgagtgt 24748944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50661645 - 50661568
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa 382  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50661645 taaaatcaatgcatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaaatgtatgacccacattgatttaacccaataa 50661568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 6832020 - 6832079
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaataga 80  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  6832020 ctatgtttgttacaagtttactaaattttatt-ccaggtataaaatattcctgggaataga 6832079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Original strand, 39932590 - 39932631
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39932590 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccggatataa 39932631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13643083 - 13642886
Alignment:
Q  14 atatgcctatgtttgttataagtttac-taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||| |||  |  |||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||  |||| ||||| ||||||    
T  13643083 atatgtctatgtttgttacaagttaacctaatttttgttcttgattataaaatgttcttaggaatagaaaagtttttccaaaaaaaatggtgg-aataaa 13642985  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | ||    | || ||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13642984 gtttccatgaaaatgagaataaaattatgtggaatt-acctattataatctctatttgtaaggttccttg-aatattataaagttaaccaaacagatttt 13642887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45826771 - 45826687
Alignment:
Q  33 aagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcc 117  Q
    ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  45826771 aagtttattaaattttatttcatgatataaaatgttcctgggaatagaagaacattcacaaagaaaaggatgggaaaaaagttcc 45826687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26085517 - 26085442
Alignment:
Q  227 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 302  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26085517 gaataaaattcatatctttatgttcgaaagaatcttatttctaaaaataaatttagtaaacttgaaacgaacacac 26085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 2566471 - 2566524
Alignment:
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2566471 attccaaggaatattatttcaagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 2566524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18427271 - 18427187
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt 392  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  18427271 aaatcaatgtatgtcccaccattttgtgtgggttctattttcaaagtgtaga-cccacaatgatttaaaccaataagagagtgagt 18427187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37600251 - 37600202
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta 356  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37600251 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttctaaagtgta 37600202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44534009 - 44533945
Alignment:
Q  241 tctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    |||||||||||| | ||||   |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44534009 tctttatattcccaagaataacattcataagaataaatttagtaaactttaaacaaacacaccct 44533945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19532946 - 19532911
Alignment:
Q  270 ggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19532946 ggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 19532911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 28139767 - 28139846
Alignment:
Q  3 gataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa 82  Q
    ||||| ||| || |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28139767 gatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagattagtaaattttattttcggatataaaacgttcttgggaatagaaa 28139846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9719656 - 9719574
Alignment:
Q  226 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaaa 308  Q
    ||||||||| | | ||| ||||||||||| ||| ||||||  |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  9719656 ggaataaaacttcgatcattatattccaaagaaagttattaatgagaataaatctactaaacttgaaacaaacactccctaaa 9719574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Original strand, 21925774 - 21925864
Alignment:
Q  209 tttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21925774 ttttttctaaataccttataataaaatttcgatctttatgttctgaggaatcttacttctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 21925864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10769846 - 10769797
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta 356  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10769846 aaatcaatgtatgtcccaccactttatatgggttccatttctaaagtgta 10769797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38928132 - 38928043
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtgt 394  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||| ||| ||||||||| ||||||||   |  |||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  38928132 taaaatcaatgtatatccctctactttatatgggttccatttccaaagtgtaggtcttacattgatttcacccaataaaagagtgagtgt 38928043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46237167 - 46237118
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgta 356  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  46237167 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttctaaaatgta 46237118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 201951 - 201648
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201951 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 201852  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  201851 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaac 201753  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  201752 caaacatatttttcctaaattccttagaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 201653  T
Q  301 accct 305  Q
    |||||    
T  201652 accct 201648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 143639 - 143342
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  143639 atgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaat 143540  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  143539 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagttaac 143441  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaat-aaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  143440 caaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 143342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 119346 - 119051
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  119346 atgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcatgagtataaaatgttcctgggaatagaaaattttttccaaagaaaag 119247  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||| |||||||||  || | ||||||||||||| ||||   ||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  | | ||    
T  119246 ggtggaaataaagttttcaggcagatgagaataaa-tcatgtgta-actacctattataatccctattcttaaggttccggggaatattatagtgttcac 119149  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 299  Q
    ||||||  ||||| ||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  119148 caaacaccttttttctaaatatc-tgaaataaaattcacatctttatattccaatgaatgttatttttaagaataaatttggtaaacttaaagcaaaca 119051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2657726 - 2657420
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657726 atgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 2657627  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  2657626 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccatatttttatgattactaggaatattataaagttaac 2657527  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2657526 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 2657427  T
Q  301 accctaa 307  Q
    |||||||    
T  2657426 accctaa 2657420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1317044 - 1316740
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1317044 atgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaa-tttcccaaggaaaag 1316946  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1316945 ggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 1316846  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1316845 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 1316746  T
Q  301 acccta 306  Q
    ||||||    
T  1316745 acccta 1316740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14171039 - 14170740
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14171039 atgataggaatctatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcc-aaggaaaag 14170941  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14170940 ggtgggaataaagttcccatggagatg-gaataaattcataaatagtttacctattacaatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 14170842  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14170841 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 14170742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16968951 - 16968640
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16968951 atgataggaatctatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 16968852  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16968851 ggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaac 16968752  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16968751 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacac 16968652  T
Q  301 accctaaaatca 312  Q
    ||| ||| ||||    
T  16968651 accttaagatca 16968640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18897946 - 18897643
Alignment:
Q  2 tgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897946 tgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagg 18897847  T
Q  102 gtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897846 gtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaacc 18897747  T
Q  202 aaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18897746 aaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacaca 18897647  T
Q  302 ccct 305  Q
    ||||    
T  18897646 ccct 18897643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 7053615 - 7053929
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7053615 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 7053714  T
Q  93 aggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7053715 aggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattata 7053814  T
Q  193 aagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7053815 aagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatatttatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaa 7053914  T
Q  293 acaaacacaccctaa 307  Q
    |||||||||||||||    
T  7053915 acaaacacaccctaa 7053929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8029297 - 8029023
Alignment:
Q  33 aagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaat 132  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8029297 aagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaat 8029198  T
Q  133 aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8029197 aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataa 8029098  T
Q  233 aattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8029097 aatttccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaa 8029023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Original strand, 10246259 - 10246467
Alignment:
Q  99 agggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagcta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10246259 agggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagcta 10246358  T
Q  199 accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10246359 accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 10246458  T
Q  299 acaccctaa 307  Q
    |||||||||    
T  10246459 acaccctaa 10246467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 7344128 - 7344320
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344128 atgataggaatgtatatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 7344227  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344228 ggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataa 7344320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 6705822 - 6706101
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6705822 tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaagggtgggaataaa 6705921  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||            ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6705922 gttcccatggagatgagaataatttcatatgta-ttta------------cctgtttttatagttcttaggaatattataaagttaaccaaatatatttt 6706008  T
Q  213 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  6706009 ttctaaataccttagaataaaattctcatctttatatttcaaggaatgttattcctagaaataaaattggtaaacttgaaacaaacataccct 6706101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 345876 - 346130
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  345876 atgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcggatataaaacgtttttaggaatagaaaatttttcccaaagaaaag 345975  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatgg-ttcct-aggaatattataaagcta 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||    
T  345976 ggtgggaataaagttccaatggagatgagaataaattcatgagtaattt-cctattaaaattcctatttttatggtttcctcaggaatgttataatgtta 346074  T
Q  199 accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 254  Q
    | ||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  346075 agcaaacatcttttttctaaatgtcttagaataaaattctcatctttatattccaa 346130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Original strand, 14781668 - 14781960
Alignment:
Q  4 ataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggt 103  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||   ||||| || |||||||||    
T  14781668 ataggaatatacatacatatgtttgttacaagtttactaaattttattcctaggtataaaatgctcatgggaatagaaattttttccaaaagaaaagggt 14781767  T
Q  104 gggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaa 203  Q
    ||     |||||     ||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  14781768 gg-----aagtta----ggagatgggaataaattcatgagtaatt-acctattataaatcctacttttatggttcccaggaatattataatgttaagcaa 14781857  T
Q  204 acatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||     
T  14781858 acatcttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatgttccaatgaatgttattcccaggaataaatttggtaaa-atgaaacaaacacact 14781956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 185 - 289
Target Start/End: Original strand, 7344723 - 7344827
Alignment:
Q  185 atattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagta 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7344723 atattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatatttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgata 7344822  T
Q  285 aactt 289  Q
    |||||    
T  7344823 aactt 7344827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 21008208 - 21008322
Alignment:
Q  185 atattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagta 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||    
T  21008208 atattataaagttaaccaaacatattttttctaaatgccttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataaaaataaatttaata 21008307  T
Q  285 aacttgaaacaaaca 299  Q
    |||||||||||||||    
T  21008308 aacttgaaacaaaca 21008322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8314873 - 8314623
Alignment:
Q  49 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg-tgggaataaagttcccatggagat-gagaataaattcataaatag 146  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||  ||||  | || |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |  ||     
T  8314873 attcccgtatataaaatgtttctggcaatagaaaatttttccaaaaaaaaaatgatgagaataaagtttccatgaagattgagaataaattcaaatgtaa 8314774  T
Q  147 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 246  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||  ||| | ||    
T  8314773 tt-acctattataatccctatttttaaggttccttgaattattataatgttaactaaacattttttttctaaatatcttagaataaaatttacatgtgta 8314675  T
Q  247 tattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaac 298  Q
    |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8314674 tattgcaagtaatgttaattctaggaataaatttgataaacttaaaacaaac 8314623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 303
Target Start/End: Original strand, 9762232 - 9762387
Alignment:
Q  149 tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttc-ctaaattccttggaataaaattcccatctttat 247  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| |  ||||||||||| | || |||| ||| |||||  |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  9762232 tacctattataatctttatttttaaggttcatgagaatattataatgttacccaatcatctttttatctaaatacctttgaataaaattcacatatttat 9762331  T
Q  248 attccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9762332 aatccaaggaatgttattcctaataataaacttggtaaacttgaaacaaacacacc 9762387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 10849846 - 10849961
Alignment:
Q  19 cctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aaggaaaagggtgggaataaagttcc 117  Q
    ||||| || |||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10849846 cctatattagttacaagtttagtaacttttcttcctgggtgtaaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaaagggtgggaataaagttcc 10849945  T
Q  118 catggagatgagaata 133  Q
    |||| ||||| |||||    
T  10849946 catgaagatgggaata 10849961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 303
Target Start/End: Original strand, 11570071 - 11570131
Alignment:
Q  243 tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11570071 tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaagacacc 11570131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Original strand, 21008081 - 21008208
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||    
T  21008081 tatatgcctctatttgttacaggtttactaaattttattcccgaacatgaaatgttcttgggaatagaaaaaaaat-tcaaacaaaaaggtgggaataaa 21008179  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcata 141  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  21008180 gttctcatagagatgggaataaattcata 21008208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 9760430 - 9760497
Alignment:
Q  16 atgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa 83  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||||||||    
T  9760430 atgcctatttttgttataagtttactaaattttatttcaggatataaaatgttcatgagaatagaaaa 9760497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12328216 - 12328065
Alignment:
Q  149 tacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 248  Q
    |||||||||||| |||||||   | |||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| | ||| |||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||    
T  12328216 tacctattataaaccctatt---aaggttccttagaatattataacgttaatcaaacatctcttttctaaatacattg-aatgaaattcacatctttata 12328121  T
Q  249 ttccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  12328120 tt-caaagaatgttattactagaaataaatttggtaaatttgaaacagacagaccct 12328065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3869477 - 3869391
Alignment:
Q  59 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgg---gaataaagttcccatggagatgagaataaattcataa 142  Q
    |||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||||| |||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3869477 ataaaatgttcaatggaatagaaaagttttcccaaagaaaatggtggtgagaataaagttcccacgaagatgagaataaattcataa 3869391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3869295 - 3869216
Alignment:
Q  228 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctaa 307  Q
    ||||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  3869295 aataaaactctcatccttatatttccaggaaagttattcttgggaataaatctactaaacttgaaacaaacaccccctaa 3869216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 8029359 - 8029316
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaa 44  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8029359 atgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa 8029316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 8314919 - 8314885
Alignment:
Q  21 tatgtttgttataagtttactaaattttattcccg 55  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8314919 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 8314885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19090336 - 19090250
Alignment:
Q  307 aaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagtg 393  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   || ||||||| || |  |||||| ||||||||||    
T  19090336 aaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccatttccaaagtgtaggtcctacattgaattcaaccaataaaagagtgagtg 19090250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35128846 - 35128769
Alignment:
Q  305 taaaatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataa 382  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||   || |||||||||| || ||||||    
T  35128846 taaaatcaatgtatgtcccaccactttatgtgggttccattttcaaagtgtaggtcctacattgatttcacccaataa 35128769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 28997 - 29298
Alignment:
Q  1 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28997 atgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaag 29096  T
Q  101 ggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29097 ggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagttttcctattataatccctatttttataattcctaggaatattataaagctaac 29196  T
Q  201 caaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  29197 caaacatattttttctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaaaaatgttattcataggaataaatttgataaacttaaaataaacac 29296  T
Q  301 ac 302  Q
    ||    
T  29297 ac 29298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0662 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4188
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  4482 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaa 4383  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagt----ttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || ||||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||     
T  4382 gttcccatggagatgaaaataaa---attaatagtgtaattacctattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacatt 4286  T
Q  209 ttttt-cctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  4285 ttttttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccct 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 3622 - 3914
Alignment:
Q  13 tatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  3622 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaa 3721  T
Q  113 gttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  3722 gttcccatggagatgaaaataaaattatgtgtaatt-acctattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacatttttt 3820  T
Q  213 -tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 305  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  3821 ttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccct 3914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Original strand, 23360 - 23517
Alignment:
Q  20 ctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccca 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||   ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  23360 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataaaatattcctgggaatataaatttttttccaaagaaaacggtgggaataaagtttcca 23459  T
Q  120 tggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttc 178  Q
    || |||||| |||||||||||   ||   |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23460 tgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacctattataatccctatttttaaggttc 23517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 309
Target Start/End: Original strand, 23559 - 23685
Alignment:
Q  182 ggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaattta 281  Q
    |||||||||||| | | ||| ||||  ||||| |||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||     
T  23559 ggaatattataatgttcaccgaacaccttttttctaagtactttagaataaaattcc-atttttatattccaagaaatattattcttaaaaataaatttg 23657  T
Q  282 gtaaacttgaaacaaacacaccctaaaa 309  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  23658 gtaaacttaaaataaacaaaccttaaaa 23685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1480 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:

Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 448 - 563
Alignment:
Q  19 cctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc 118  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||  || ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  448 cctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcctaaatataaaatgttcctgggaatgaaataacattcccaaagaaaattgtgggaataaagttccc 547  T
Q  119 atggagatgagaataa 134  Q
    ||| |||||| |||||    
T  548 atgaagatgaaaataa 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 21853 - 21968
Alignment:
Q  19 cctatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttccc 118  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||  || ||  |||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  21853 cctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcctagatataaaatgttcctgggtatgaaataacattcccaaaaaaaattgtgggaataaagttccc 21952  T
Q  119 atggagatgagaataa 134  Q
    ||| |||||| |||||    
T  21953 atgaagatgaaaataa 21968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 280
Target Start/End: Original strand, 43292 - 43417
Alignment:
Q  155 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 254  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43292 ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa 43391  T
Q  255 ggaatgttattcctaggaataaattt 280  Q
      ||| |||||||||  |||||||||    
T  43392 aaaatattattcctaaaaataaattt 43417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 392
Target Start/End: Original strand, 27872 - 27955
Alignment:
Q  308 aatcaatgtatattccaccattttatgtggattccatttctaaagtgtataacccacattgatttaactcaataagagagtgagt 392  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  27872 aatcaatgtatgtcccaccactttgtgtgggttctatttccaaagtgtaga-cccacaatgatttaaaccaataagagagtgagt 27955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University