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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2176_low_6 (Length: 678)

Name: NF2176_low_6
Description: NF2176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2176_low_6
NF2176_low_6
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (19-668)||(54013680-54014324)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 614; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 614; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 54014324 - 54013680
Alignment:
Q  19 actttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaata 118  Q
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T  54014324 actttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaata 54014225  T
Q  119 tgtacataaatatctatctgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggacctatcctatattgg 218  Q
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T  54014224 tgttcataaatatctatatgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggaccgatcctatattgg 54014125  T
Q  219 aacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaaca 318  Q
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T  54014124 aacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaaca 54014025  T
Q  319 tctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgat 418  Q
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T  54014024 tctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgat 54013925  T
Q  419 tttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatatacacaccaacgtaag 518  Q
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T  54013924 tttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatacacacaccaacgtaag 54013825  T
Q  519 tttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagtaacaaaacaaagtacgaatctctcttacttac 618  Q
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T  54013824 tttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagtaa-----caaagtacgaatctctcttacttac 54013730  T
Q  619 actcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagccccctcattcat 668  Q
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T  54013729 actcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagccccctcattcat 54013680  T

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