View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2176_low_95 (Length: 248)

Name: NF2176_low_95
Description: NF2176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2176_low_95
NF2176_low_95
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (8-248)||(39635460-39635701)
chr2 (16-248)||(31517179-31517412)
chr2 (25-248)||(3873217-3873441)
chr2 (25-248)||(18806857-18807081)
chr2 (25-248)||(26323159-26323383)
chr2 (8-247)||(16066250-16066490)
chr2 (24-248)||(5733407-5733632)
chr2 (8-248)||(19901094-19901334)
chr2 (25-248)||(33906020-33906244)
chr2 (16-248)||(28329803-28330034)
chr2 (24-248)||(851005-851230)
chr2 (17-241)||(2178734-2178959)
chr2 (24-248)||(4016047-4016272)
chr2 (16-248)||(6174792-6175025)
chr2 (21-248)||(42937727-42937956)
chr2 (26-248)||(4232116-4232339)
chr2 (24-248)||(30270651-30270876)
chr2 (8-242)||(429830-430065)
chr2 (24-242)||(19383907-19384126)
chr2 (26-248)||(16588750-16588973)
chr2 (32-248)||(1482883-1483099)
chr2 (32-248)||(30420159-30420364)
chr2 (72-245)||(1108290-1108464)
chr2 (8-247)||(44947505-44947738)
chr2 (108-248)||(42446625-42446766)
chr2 (115-209)||(22101210-22101305)
chr2 (108-233)||(3585313-3585439)
chr2 (25-78)||(1109447-1109498)
chr2 (8-38)||(1109526-1109556)
chr2 (8-38)||(3873157-3873187)
chr2 (8-38)||(4016297-4016327)
chr2 (8-38)||(18806796-18806826)
chr2 (8-38)||(26323100-26323130)
chr2 (8-38)||(33905963-33905993)
chr2 (8-37)||(1482824-1482853)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (8-248)||(145201-145442)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (16-248)||(36713-36946)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (16-248)||(18594547-18594780)
chr8 (13-248)||(39206596-39206832)
chr8 (8-248)||(41575523-41575764)
chr8 (8-248)||(144404-144645)
chr8 (21-248)||(14422713-14422941)
chr8 (24-248)||(2042496-2042721)
chr8 (21-248)||(13110414-13110642)
chr8 (24-248)||(24113138-24113363)
chr8 (16-248)||(34842329-34842562)
chr8 (16-248)||(39218787-39219020)
chr8 (21-248)||(6144242-6144470)
chr8 (29-248)||(29938071-29938291)
chr8 (25-248)||(35118004-35118228)
chr8 (21-248)||(33278410-33278638)
chr8 (8-248)||(42571604-42571842)
chr8 (24-248)||(7774774-7774998)
chr8 (28-248)||(10836731-10836952)
chr8 (25-248)||(22260603-22260827)
chr8 (26-248)||(34679431-34679654)
chr8 (25-247)||(44804917-44805140)
chr8 (24-248)||(7791421-7791646)
chr8 (21-248)||(4035857-4036085)
chr8 (16-248)||(5320574-5320807)
chr8 (24-248)||(34998868-34999093)
chr8 (24-248)||(7812005-7812230)
chr8 (8-248)||(38167112-38167352)
chr8 (8-247)||(28639289-28639531)
chr8 (17-248)||(36491167-36491399)
chr8 (21-248)||(8021729-8021949)
chr8 (8-248)||(33286993-33287222)
chr8 (103-248)||(40117903-40118049)
chr8 (21-180)||(9807339-9807496)
chr8 (120-248)||(26783801-26783930)
chr8 (53-248)||(66180-66377)
chr8 (108-248)||(2322068-2322209)
chr8 (108-248)||(5005176-5005318)
chr8 (173-248)||(9806883-9806959)
chr8 (108-247)||(39220267-39220407)
chr8 (8-38)||(10836668-10836698)
chr8 (8-38)||(29938601-29938631)
chr8 (8-38)||(35117947-35117977)
chr8 (8-38)||(44804860-44804890)
chr8 (8-37)||(4036111-4036140)
chr8 (8-37)||(8021973-8022002)
chr8 (8-37)||(9807520-9807549)
chr8 (8-37)||(13110666-13110695)
chr8 (8-37)||(33278662-33278691)
chr8 (8-37)||(34679375-34679404)
chr8 (124-157)||(42864909-42864942)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (16-248)||(6086563-6086796)
chr6 (16-248)||(30691861-30692094)
chr6 (16-248)||(2837555-2837788)
chr6 (24-248)||(26946848-26947073)
chr6 (8-241)||(21893472-21893706)
chr6 (24-248)||(3347495-3347720)
chr6 (16-248)||(26704303-26704536)
chr6 (24-248)||(18613548-18613773)
chr6 (16-248)||(3955733-3955963)
chr6 (16-248)||(34887256-34887489)
chr6 (21-248)||(20726801-20727025)
chr6 (8-248)||(16306964-16307205)
chr6 (25-248)||(9459573-9459797)
chr6 (8-248)||(28199465-28199706)
chr6 (25-248)||(11167250-11167474)
chr6 (24-248)||(1153603-1153828)
chr6 (30-248)||(17261051-17261270)
chr6 (8-208)||(30698885-30699086)
chr6 (16-247)||(35198295-35198527)
chr6 (16-166)||(53001-53151)
chr6 (24-189)||(33464399-33464564)
chr6 (96-248)||(52846-52999)
chr6 (181-248)||(33463711-33463779)
chr6 (8-38)||(1153857-1153887)
chr6 (8-38)||(11167503-11167533)
chr6 (8-38)||(18613799-18613829)
chr6 (8-38)||(33464589-33464619)
chr6 (8-37)||(20727049-20727078)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (8-248)||(6611304-6611545)
chr4 (8-248)||(20877055-20877296)
chr4 (16-248)||(54189553-54189786)
chr4 (16-248)||(14987800-14988033)
chr4 (8-247)||(40428664-40428904)
chr4 (8-248)||(1617092-1617333)
chr4 (24-248)||(16700789-16701014)
chr4 (16-241)||(31969696-31969922)
chr4 (24-248)||(19913590-19913815)
chr4 (16-248)||(53717416-53717649)
chr4 (8-248)||(53875665-53875906)
chr4 (19-248)||(54412636-54412866)
chr4 (16-248)||(37968709-37968942)
chr4 (8-248)||(48909854-48910095)
chr4 (21-248)||(27488605-27488833)
chr4 (16-248)||(2481360-2481593)
chr4 (24-248)||(15240988-15241213)
chr4 (8-248)||(30423509-30423749)
chr4 (24-248)||(44784877-44785102)
chr4 (21-248)||(1756721-1756949)
chr4 (25-248)||(28032673-28032897)
chr4 (21-248)||(38055165-38055393)
chr4 (8-248)||(50353809-50354051)
chr4 (8-248)||(23704153-23704394)
chr4 (21-248)||(43289917-43290145)
chr4 (17-248)||(45424487-45424719)
chr4 (21-247)||(37464730-37464957)
chr4 (21-246)||(8591049-8591275)
chr4 (25-248)||(47632042-47632267)
chr4 (28-248)||(23776423-23776644)
chr4 (25-248)||(11639539-11639763)
chr4 (21-248)||(35490730-35490958)
chr4 (12-248)||(44379135-44379372)
chr4 (17-247)||(33703850-33704080)
chr4 (25-248)||(6688588-6688806)
chr4 (24-248)||(15669191-15669416)
chr4 (24-248)||(19164933-19165157)
chr4 (26-248)||(27583594-27583817)
chr4 (24-248)||(27536064-27536285)
chr4 (21-248)||(53353063-53353299)
chr4 (8-248)||(30171588-30171828)
chr4 (61-248)||(50055098-50055286)
chr4 (28-248)||(8932142-8932363)
chr4 (26-248)||(40680000-40680223)
chr4 (16-180)||(23268998-23269162)
chr4 (30-248)||(52139211-52139428)
chr4 (23-247)||(55344784-55345009)
chr4 (24-247)||(38071286-38071504)
chr4 (17-248)||(44375853-44376079)
chr4 (30-234)||(16703843-16704046)
chr4 (86-248)||(28360438-28360602)
chr4 (115-248)||(50053451-50053585)
chr4 (25-138)||(53408138-53408252)
chr4 (16-113)||(23261838-23261935)
chr4 (11-155)||(9595849-9595982)
chr4 (21-101)||(50055301-50055381)
chr4 (173-248)||(23265866-23265942)
chr4 (109-191)||(51780763-51780845)
chr4 (25-113)||(34615904-34615990)
chr4 (25-86)||(55344654-55344715)
chr4 (108-242)||(44548185-44548320)
chr4 (12-51)||(28360603-28360642)
chr4 (8-38)||(6688531-6688561)
chr4 (8-38)||(8590995-8591025)
chr4 (8-38)||(8932091-8932121)
chr4 (8-38)||(15240929-15240959)
chr4 (8-38)||(15669442-15669472)
chr4 (8-38)||(38055419-38055449)
chr4 (8-38)||(38071233-38071263)
chr4 (8-38)||(44784822-44784852)
chr4 (8-38)||(47632295-47632325)
chr4 (8-38)||(52139457-52139487)
chr4 (8-38)||(53408280-53408310)
chr4 (8-38)||(55344601-55344631)
chr4 (8-37)||(1756668-1756697)
chr4 (108-248)||(17493341-17493482)
chr4 (8-37)||(19164878-19164907)
chr4 (8-37)||(27488549-27488578)
chr4 (53-118)||(48748197-48748262)
chr4 (9-37)||(53353323-53353351)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (16-248)||(37698093-37698326)
chr3 (16-248)||(42307855-42308088)
chr3 (16-248)||(25999393-25999626)
chr3 (16-248)||(21581047-21581280)
chr3 (18-247)||(12117610-12117840)
chr3 (16-248)||(22174940-22175173)
chr3 (17-248)||(20842299-20842531)
chr3 (17-248)||(50528934-50529166)
chr3 (21-248)||(54870129-54870357)
chr3 (8-248)||(25494227-25494468)
chr3 (21-248)||(15520097-15520325)
chr3 (21-248)||(38856098-38856326)
chr3 (17-248)||(44609284-44609516)
chr3 (21-248)||(46452117-46452345)
chr3 (16-248)||(15520641-15520874)
chr3 (16-248)||(20699154-20699387)
chr3 (16-248)||(29445493-29445726)
chr3 (24-248)||(38933951-38934175)
chr3 (25-244)||(8042616-8042836)
chr3 (8-248)||(34700346-34700587)
chr3 (8-248)||(42104913-42105154)
chr3 (8-248)||(53028230-53028463)
chr3 (22-241)||(24835655-24835875)
chr3 (17-247)||(2895191-2895426)
chr3 (8-248)||(35226452-35226692)
chr3 (16-248)||(54534278-54534509)
chr3 (21-248)||(48924958-48925184)
chr3 (25-248)||(32359264-32359488)
chr3 (25-232)||(44688782-44688989)
chr3 (19-248)||(26122819-26123049)
chr3 (25-248)||(32244125-32244343)
chr3 (24-209)||(16354390-16354576)
chr3 (103-248)||(35643222-35643368)
chr3 (8-133)||(13696914-13697039)
chr3 (120-248)||(50529827-50529956)
chr3 (18-138)||(24366145-24366265)
chr3 (36-202)||(12915957-12916124)
chr3 (126-248)||(49128054-49128177)
chr3 (25-100)||(50528841-50528916)
chr3 (24-70)||(35643365-35643411)
chr3 (8-38)||(8042864-8042894)
chr3 (8-38)||(32244372-32244402)
chr3 (8-38)||(38934203-38934233)
chr3 (8-38)||(44689017-44689047)
chr3 (8-38)||(50528784-50528814)
chr3 (8-37)||(35643430-35643459)
chr3 (8-37)||(38856350-38856379)
chr3 (8-37)||(46452063-46452092)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (16-248)||(24105635-24105868)
chr5 (16-248)||(27679133-27679366)
chr5 (21-248)||(31883155-31883383)
chr5 (16-248)||(33491160-33491393)
chr5 (21-247)||(16737416-16737643)
chr5 (8-248)||(1165557-1165798)
chr5 (25-248)||(3386459-3386683)
chr5 (25-248)||(9008030-9008254)
chr5 (21-248)||(16069364-16069592)
chr5 (21-248)||(1579047-1579275)
chr5 (21-248)||(1605540-1605768)
chr5 (21-248)||(27420869-27421097)
chr5 (24-247)||(33991152-33991376)
chr5 (24-245)||(4120951-4121173)
chr5 (21-241)||(3921599-3921820)
chr5 (24-248)||(8374311-8374535)
chr5 (25-248)||(19358537-19358761)
chr5 (25-247)||(20992119-20992342)
chr5 (8-214)||(27025001-27025208)
chr5 (16-248)||(35782608-35782841)
chr5 (21-248)||(38598419-38598647)
chr5 (16-217)||(26602906-26603108)
chr5 (31-248)||(5202983-5203200)
chr5 (16-241)||(31410494-31410720)
chr5 (125-248)||(20992354-20992482)
chr5 (21-119)||(35420393-35420491)
chr5 (119-248)||(33284642-33284772)
chr5 (124-209)||(31638195-31638281)
chr5 (108-193)||(41818519-41818604)
chr5 (8-38)||(3386402-3386432)
chr5 (8-38)||(4121198-4121228)
chr5 (8-38)||(9007971-9008001)
chr5 (8-38)||(19358788-19358818)
chr5 (8-38)||(31883413-31883443)
chr5 (8-37)||(1579299-1579328)
chr5 (8-37)||(1605487-1605516)
chr5 (8-37)||(3921844-3921873)
chr5 (8-37)||(8374256-8374285)
chr5 (8-37)||(16737363-16737392)
chr5 (8-37)||(27421121-27421150)
chr5 (8-37)||(33991395-33991424)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (16-248)||(29078524-29078757)
chr1 (16-248)||(39260310-39260543)
chr1 (8-248)||(26663266-26663507)
chr1 (16-248)||(52753111-52753344)
chr1 (25-248)||(20089479-20089703)
chr1 (18-248)||(25897382-25897613)
chr1 (8-248)||(43905662-43905903)
chr1 (16-248)||(29288157-29288388)
chr1 (17-248)||(8120877-8121109)
chr1 (21-248)||(19715130-19715358)
chr1 (16-248)||(970488-970723)
chr1 (21-248)||(26580239-26580467)
chr1 (16-248)||(52696799-52697032)
chr1 (21-248)||(1940716-1940944)
chr1 (25-248)||(38829077-38829301)
chr1 (26-248)||(42370769-42370992)
chr1 (24-248)||(1170416-1170641)
chr1 (28-248)||(16052104-16052325)
chr1 (21-248)||(8079678-8079906)
chr1 (8-247)||(23498469-23498709)
chr1 (21-248)||(33510492-33510720)
chr1 (17-248)||(46760974-46761206)
chr1 (8-238)||(7145226-7145456)
chr1 (25-241)||(2347671-2347889)
chr1 (24-248)||(17591699-17591921)
chr1 (8-248)||(49146180-49146421)
chr1 (25-248)||(32671587-32671810)
chr1 (25-248)||(41928468-41928692)
chr1 (8-248)||(6765467-6765708)
chr1 (17-240)||(17587470-17587694)
chr1 (16-248)||(46409443-46409678)
chr1 (26-248)||(12682828-12683051)
chr1 (24-248)||(5215393-5215618)
chr1 (21-248)||(13996692-13996920)
chr1 (16-241)||(2473737-2473963)
chr1 (16-247)||(15203121-15203353)
chr1 (8-217)||(40149502-40149712)
chr1 (8-248)||(15717793-15718033)
chr1 (53-248)||(1168511-1168707)
chr1 (28-248)||(40092499-40092720)
chr1 (45-248)||(51359210-51359413)
chr1 (21-248)||(15554121-15554341)
chr1 (17-247)||(38171841-38172059)
chr1 (32-248)||(29695683-29695896)
chr1 (128-248)||(52086275-52086396)
chr1 (109-243)||(23322897-23323032)
chr1 (17-65)||(23323036-23323084)
chr1 (8-38)||(2347917-2347947)
chr1 (21-51)||(14004806-14004836)
chr1 (8-38)||(17591947-17591977)
chr1 (8-38)||(19715077-19715107)
chr1 (8-38)||(26580186-26580216)
chr1 (8-38)||(40092756-40092786)
chr1 (8-38)||(41928422-41928452)
chr1 (8-38)||(51359143-51359173)
chr1 (21-50)||(1170656-1170685)
chr1 (8-37)||(15554069-15554098)
chr1 (8-37)||(33510744-33510773)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (16-248)||(12101132-12101365)
chr7 (16-248)||(33359044-33359277)
chr7 (25-248)||(42964959-42965183)
chr7 (21-248)||(43067932-43068160)
chr7 (8-248)||(1803035-1803276)
chr7 (21-248)||(24792291-24792519)
chr7 (8-248)||(5280869-5281109)
chr7 (16-248)||(20346497-20346730)
chr7 (25-247)||(933295-933518)
chr7 (16-248)||(33846483-33846711)
chr7 (8-248)||(43156722-43156962)
chr7 (21-248)||(7164193-7164421)
chr7 (21-248)||(12097549-12097777)
chr7 (17-248)||(15655921-15656153)
chr7 (25-247)||(22649657-22649880)
chr7 (8-237)||(36890775-36891006)
chr7 (24-248)||(42204163-42204389)
chr7 (16-248)||(4477275-4477508)
chr7 (36-248)||(30180998-30181211)
chr7 (16-248)||(6394760-6394993)
chr7 (24-248)||(9452599-9452824)
chr7 (21-217)||(25748527-25748724)
chr7 (26-248)||(32041551-32041774)
chr7 (17-248)||(42673474-42673702)
chr7 (54-248)||(3511332-3511527)
chr7 (8-248)||(46134250-46134491)
chr7 (25-248)||(4347282-4347505)
chr7 (25-242)||(38866559-38866777)
chr7 (8-248)||(43021526-43021763)
chr7 (25-241)||(8630682-8630899)
chr7 (24-248)||(17753609-17753834)
chr7 (24-248)||(46891301-46891527)
chr7 (23-217)||(48865670-48865866)
chr7 (24-217)||(16894469-16894663)
chr7 (115-247)||(19828280-19828413)
chr7 (163-242)||(37704995-37705075)
chr7 (108-248)||(37005857-37005998)
chr7 (108-247)||(43405030-43405170)
chr7 (16-78)||(37705082-37705144)
chr7 (173-247)||(27691437-27691512)
chr7 (115-233)||(36849590-36849709)
chr7 (108-248)||(15655458-15655599)
chr7 (124-191)||(20163886-20163953)
chr7 (8-38)||(933546-933576)
chr7 (8-38)||(9452850-9452880)
chr7 (8-38)||(16894415-16894445)
chr7 (8-38)||(17753861-17753891)
chr7 (8-38)||(22649598-22649628)
chr7 (8-38)||(38866805-38866835)
chr7 (8-38)||(42964899-42964929)
chr7 (8-38)||(46891246-46891276)
chr7 (8-37)||(7164445-7164474)
chr7 (8-37)||(12097503-12097532)
chr7 (8-37)||(24792234-24792263)
chr7 (8-37)||(25748745-25748774)
chr7 (8-37)||(43067879-43067908)
chr7 (8-37)||(48865885-48865914)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (25-248)||(3718-3942)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (24-248)||(267-492)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (24-248)||(10246-10471)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (57-248)||(22956-23148)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (48-247)||(2-202)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (47-248)||(1-204)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39635701 - 39635460
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39635701 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggaggg 39635602  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39635601 taagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 39635502  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39635501 atgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatc 39635460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 31517179 - 31517412
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  31517179 attataattaaaatatatcttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctga 31517278  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31517279 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 31517378  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31517379 agataagcccaaataagctcaaaataagccaatc 31517412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 3873217 - 3873441
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3873217 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 3873316  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  3873317 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcc 3873416  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3873417 cacataagctcaaaataagccaatc 3873441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 18806857 - 18807081
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18806857 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttagg 18806956  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  18806957 cttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagct 18807056  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  18807057 catataagctcaaaataagccaatc 18807081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 26323159 - 26323383
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26323159 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 26323258  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26323259 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtc 26323358  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  26323359 cacataagctcaaaataaaccaatc 26323383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 16066250 - 16066490
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||    
T  16066250 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagattatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagaggg 16066349  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacttt-aaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16066350 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagactt 16066449  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16066450 atgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaat 16066490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5733632 - 5733407
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5733632 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 5733533  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  5733532 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagc 5733433  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5733432 ccacataagctcaaaataaaccaatc 5733407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 19901094 - 19901334
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  19901094 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagaaagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaaggg 19901193  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19901194 tgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggctt 19901292  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19901293 atggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatc 19901334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 33906020 - 33906244
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33906020 aaaaaatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 33906119  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33906120 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 33906219  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  33906220 cacataagttcaaaataagtcaatc 33906244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 28329803 - 28330034
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||  |||||||| |    
T  28329803 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctga 28329900  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  28329901 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgt 28330000  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28330001 agataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 28330034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 851230 - 851005
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  851230 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaa 851131  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||     
T  851130 gcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagc 851031  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  851030 ctacataagcttaaaataagcaaatc 851005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 2178734 - 2178959
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  2178734 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaa 2178833  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||    
T  2178834 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaata 2178933  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataa 241  Q
    || |||||||||||| || |||||||    
T  2178934 gataagtccacataaacttaaaataa 2178959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4016272 - 4016047
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  4016272 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttag 4016173  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  4016172 gcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaac 4016073  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  4016072 tcacataagctcaaaataagccaatc 4016047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 6174792 - 6175025
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  6174792 attataattaaaatacatgttttgaaaatgtggatccagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 6174891  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6174892 aaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 6174991  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    | | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6174992 atataagctcacataagctcaaaataagccaatc 6175025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42937956 - 42937727
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  42937956 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatt 42937857  T
Q  121 taggc-ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagac 218  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||     
T  42937856 taggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagat 42937757  T
Q  219 aagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  42937756 aaactcacataagctcaaaataagccaatc 42937727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Original strand, 4232116 - 4232339
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4232116 aaatatatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggc 4232215  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  4232216 ttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagccc 4232315  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  4232316 acataagcacaaaataagccaatc 4232339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 30270651 - 30270876
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  30270651 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttag 30270750  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  30270751 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaac 30270850  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     || ||||||| ||||||||||||||    
T  30270851 tcatataagcttaaaataagccaatc 30270876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 430065 - 429830
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |  |    
T  430065 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagcgagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattg 429966  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  429965 taagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggctt 429866  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataag 242  Q
    ||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  429865 atgagagtagataaatccacataaattcaaaataag 429830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 19383907 - 19384126
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19383907 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 19384006  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||     
T  19384007 gcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagc 19384106  T
Q  223 ccacataagctcaaaataag 242  Q
     || |||| |||||||||||    
T  19384107 tcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Original strand, 16588750 - 16588973
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16588750 aaatatatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggc 16588849  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||    
T  16588850 ttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagccc 16588949  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  16588950 acataaacacaaaataagccaatc 16588973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Original strand, 1482883 - 1483099
Alignment:
Q  32 atgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatta 131  Q
    |||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  1482883 atgttttgaaaatgtagatacagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttatta 1482982  T
Q  132 aaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataa 230  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  1482983 aaatatggcataagcagcttatgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataa 1483081  T
Q  231 gctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1483082 gctcaaaataagccaatc 1483099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Original strand, 30420159 - 30420364
Alignment:
Q  32 atgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatta 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||            | |||||||||||||||||    
T  30420159 atgttttgaaaaagtggatcctgagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagc------------tgaaaatttaggcttatta 30420246  T
Q  132 aaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataa 230  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30420247 aaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataa 30420346  T
Q  231 gctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30420347 gctcaaaataagccaatc 30420364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108290
Alignment:
Q  72 tacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctat 171  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  172 atttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagcca 245  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 1108290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 44947505 - 44947738
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||    
T  44947505 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggaggg 44947604  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    ||| || |||||||||        ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  44947605 taaactgaaaatttag-------caaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgctt 44947697  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    |||| | |||| ||   |||||||| |||||||||||||||    
T  44947698 atggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaat 44947738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446766
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||  |||||| |||| | ||||| |||  ||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatc 42446766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101305
Alignment:
Q  115 aaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatg 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | | |||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatg 22101305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585313
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||  | | |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagct 233  Q
    |||  ||| || || ||||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagct 3585313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1109498 - 1109447
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataa 78  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  1109498 aaaataaatgttttgaaaaagtggatccagagaga--tgaaggaggttacataa 1109447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 1109556 - 1109526
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109556 taactaacattataattaaaatatatgtttt 1109526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 3873157 - 3873187
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873157 taactaacattataattaaaatatatgtttt 3873187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 4016327 - 4016297
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016327 taactaacattataattaaaatatatgtttt 4016297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 18806796 - 18806826
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806796 taactaacattataattaaaatatatgtttt 18806826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 26323100 - 26323130
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323100 taactaacattataattaaaatatatgtttt 26323130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 33905963 - 33905993
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33905963 taactaacattataattaaaatatatgtttt 33905993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 1482824 - 1482853
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482824 taactaacattataattaaaatatatgttt 1482853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 145201 - 145442
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  145201 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaaggg 145300  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  145301 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 145400  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  145401 atgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatc 145442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36946 - 36713
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36946 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 36847  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36846 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagt 36747  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36746 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 36713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18594780 - 18594547
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18594780 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 18594681  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18594680 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 18594581  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18594580 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 18594547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39206832 - 39206596
Alignment:
Q  13 aacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39206832 aacattataattaaaatatatgttttgaaaaggtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagc 39206733  T
Q  113 taaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatggg 211  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39206732 tgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggg 39206633  T
Q  212 agtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39206632 agtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 39206596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41575764 - 41575523
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  41575764 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggaggg 41575665  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41575664 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 41575565  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41575564 atgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatc 41575523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 144645 - 144404
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  144645 taactaacattataactaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 144546  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  144545 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggctt 144446  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  144445 atgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatc 144404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14422941 - 14422713
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14422941 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 14422842  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14422841 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 14422742  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14422741 agcccacataagctcaaaataaaccaatc 14422713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 2042496 - 2042721
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2042496 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 2042595  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  2042596 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagc 2042695  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2042696 ccacataagctcaaaataagccaatc 2042721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13110642 - 13110414
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13110642 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 13110543  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  13110542 taggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagata 13110443  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13110442 agcccacataagctcaaaataagccaatc 13110414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 24113138 - 24113363
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24113138 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 24113237  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  24113238 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagc 24113337  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  24113338 ccacataagctcaaaataagtcaatc 24113363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 34842329 - 34842562
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||      
T  34842329 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctgg 34842428  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34842429 aaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 34842528  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34842529 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 34842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39219020 - 39218787
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  39219020 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctga 39218921  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39218920 aaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagt 39218821  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39218820 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 39218787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 6144242 - 6144470
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  6144242 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatt 6144341  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacact-ttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  6144342 tatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagata 6144441  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  6144442 agcccatataagctcaaaataagtcaatc 6144470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29938291 - 29938071
Alignment:
Q  29 tatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggctta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29938291 tatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggctta 29938192  T
Q  129 ttaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccaca 227  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  29938191 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccaca 29938092  T
Q  228 taagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29938091 taagctcaaaataagccaatc 29938071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 35118004 - 35118228
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  35118004 aaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttagg 35118103  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  35118104 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcc 35118203  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35118204 cacataagctcaaaataagccaatc 35118228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33278638 - 33278410
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33278638 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 33278539  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |    
T  33278538 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagata 33278439  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33278438 agtccatataaactcaaaataagccaatc 33278410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42571842 - 42571604
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  ||||    
T  42571842 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaaggg 42571743  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42571742 taagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggctt 42571646  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42571645 atggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatc 42571604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7774998 - 7774774
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  7774998 taaaatatatgttttgaaaaagtggatc-agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaa 7774900  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||      
T  7774899 gcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaac 7774800  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  7774799 ccgcataagctcaaaataagccaatc 7774774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 10836731 - 10836952
Alignment:
Q  28 atatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggctt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10836731 atatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctt 10836830  T
Q  128 attaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccac 226  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  10836831 attaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccac 10836930  T
Q  227 ataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10836931 ataagctcaaaataagccaatc 10836952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 22260603 - 22260827
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22260603 aaaatatatgttttgaaaaattggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 22260702  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||      
T  22260703 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagct 22260802  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22260803 cacataagctcaaaataagccaatc 22260827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Original strand, 34679431 - 34679654
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34679431 aaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggc 34679530  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34679531 ttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagccc 34679630  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  34679631 atataagctcaaaataagccaatc 34679654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 44804917 - 44805140
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  44804917 aaaatatatgttttgaaaaagtgaatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttagg 44805016  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |    
T  44805017 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacc 44805116  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaat 247  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  44805117 tacataagctcaaaataagccaat 44805140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7791646 - 7791421
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  7791646 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaa 7791547  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||      
T  7791546 gcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaac 7791447  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
T  7791446 tcacataaactcaaaataagccaatc 7791421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4036085 - 4035857
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  4036085 aattaaaatatatgttttgaaaaattggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatt 4035986  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |    
T  4035985 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagata 4035886  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  4035885 agcccatataagctaaaaataaaccaatc 4035857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5320807 - 5320574
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | |    
T  5320807 attataattaaaatatatattttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttga 5320708  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5320707 aaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagt 5320608  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5320607 agataaactcacataagctcaaaataagccaatc 5320574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 34998868 - 34999093
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  34998868 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttag 34998967  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||      
T  34998968 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaac 34999067  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  34999068 ccgtataagctcaaaataagccaatc 34999093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7812230 - 7812005
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  7812230 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaa 7812131  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||      
T  7812130 gcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaac 7812031  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
T  7812030 tcacataaactcaaaataagccaatc 7812005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 38167112 - 38167352
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||     
T  38167112 taactaacgttctaattaaaatatatgttttgaaaaa-tggttccagcgagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagga 38167210  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  38167211 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 38167310  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  38167311 atgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatc 38167352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28639531 - 28639289
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  28639531 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggaggg 28639434  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggct- 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  28639433 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagctt 28639334  T
Q  206 ---tatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
       ||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  28639333 gtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaat 28639289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36491399 - 36491167
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||| ||    
T  36491399 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaa 36491300  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||    
T  36491299 aatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgatta 36491200  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36491199 gataatcccacataagcttaaaataagccaatc 36491167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8021949 - 8021729
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||| || |        ||||||    
T  8021949 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccggatg--------aaaatt 8021858  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  8021857 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagata 8021758  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8021757 agcccatataagctcaaaataagccaatc 8021729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 33286993 - 33287222
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||||    
T  33286993 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagct------------agaggg 33287080  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |    
T  33287081 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcat 33287180  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33287181 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatc 33287222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 248
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118049
Alignment:
Q  103 gagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaa 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  202 ggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatc 40118049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9807496 - 9807339
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  9807496 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagaaa--cgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatt 9807399  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttattta 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9807398 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783930
Alignment:
Q  120 ttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagac 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  219 aagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatc 26783930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 248
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66377
Alignment:
Q  53 agagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagcc-agagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagctt 151  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  152 atgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatc 66377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322209
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||  |||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatc 2322209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5005318 - 5005176
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaa-tatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggct 205  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||  |||| |||| |||||| | ||  ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |||    
T  5005318 taagctaaaaaattgggcttgttaaaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagct 5005219  T
Q  206 tatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5005218 tatggaagtagataagcccacataagcttaagataagccaatc 5005176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9806959 - 9806883
Alignment:
Q  173 tttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  || |||| ||||||||||| |||||    
T  9806959 tttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatc 9806883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220267
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |   ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    ||||  ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaat 39220267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 10836668 - 10836698
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836668 taactaacattataattaaaatatatgtttt 10836698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 29938631 - 29938601
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938631 taactaacattataattaaaatatatgtttt 29938601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 35117947 - 35117977
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35117947 taactaacattataattaaaatatatgtttt 35117977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 44804860 - 44804890
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44804860 taactaacattataattaaaatatatgtttt 44804890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 4036140 - 4036111
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036140 taactaacattataattaaaatatatgttt 4036111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 8022002 - 8021973
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8022002 taactaacattataattaaaatatatgttt 8021973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 9807549 - 9807520
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807549 taactaacattataattaaaatatatgttt 9807520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 13110695 - 13110666
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110695 taactaacattataattaaaatatatgttt 13110666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 33278691 - 33278662
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278691 taactaacattataattaaaatatatgttt 33278662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 34679375 - 34679404
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679375 taactaacattataattaaaatatatgttt 34679404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42864942 - 42864909
Alignment:
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42864942 gcttattaaaatatgacatatgcaacttatgaaa 42864909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 6086563 - 6086796
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6086563 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 6086662  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6086663 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagt 6086762  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6086763 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 6086796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30692094 - 30691861
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  30692094 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctga 30691995  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30691994 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 30691895  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30691894 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 30691861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2837788 - 2837555
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2837788 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 2837689  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2837688 aaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 2837589  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2837588 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 2837555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 26946848 - 26947073
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26946848 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 26946947  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26946948 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26947047  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26947048 ccatataagctcaaaataagccaatc 26947073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21893706 - 21893472
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  21893706 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 21893607  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21893606 taagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggctt 21893507  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataa 241  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21893506 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 21893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 3347495 - 3347720
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3347495 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 3347594  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  3347595 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagc 3347694  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3347695 ccacataagctcaaaataagccaatc 3347720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 26704303 - 26704536
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  26704303 attataatttaaatatatgttttggaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 26704402  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26704403 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagt 26704502  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  26704503 agataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatc 26704536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18613773 - 18613548
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  18613773 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttag 18613674  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18613673 gcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagt 18613574  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  18613573 ccgcataagctcaaaataagtcaatc 18613548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 3955733 - 3955963
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3955733 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 3955829  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3955830 aaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 3955929  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3955930 agataaacccacataagctcaaaataagccaatc 3955963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 34887256 - 34887489
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  34887256 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctga 34887355  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  34887356 aaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagg 34887455  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  34887456 agataaacccacataagctcaaaataagtcaatc 34887489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20727025 - 20726801
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20727025 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggacccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatt 20726926  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20726925 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagtta----tttttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 20726830  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20726829 agcccatataagctcaaaataagccaatc 20726801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 16306964 - 16307205
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  16306964 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaataatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 16307063  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  16307064 taagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggctt 16307163  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  16307164 atgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatc 16307205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9459797 - 9459573
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9459797 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 9459698  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||      
T  9459697 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagct 9459598  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9459597 cacataaactcaaaataagccaatc 9459573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 28199465 - 28199706
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  28199465 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 28199563  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28199564 taagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 28199662  T
Q  207 atgggagta---gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28199663 at-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatc 28199706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11167474 - 11167250
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11167474 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttagg 11167375  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  | || | |||      
T  11167374 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagca 11167275  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11167274 cacataagctcaaaataagccaatc 11167250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1153828 - 1153603
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1153828 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 1153729  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  1153728 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagc 1153629  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  1153628 caacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Original strand, 17261051 - 17261270
Alignment:
Q  30 atatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttat 129  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17261051 atatgttttaaaaaaggggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttat 17261150  T
Q  130 taaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacat 228  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17261151 taaaatatagcataagcagcttatgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacat 17261250  T
Q  229 aagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17261251 aagctcaaaataagccaatc 17261270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 30698885 - 30699086
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  30698885 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggaggg 30698984  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30698985 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 30699084  T
Q  207 at 208  Q
    ||    
T  30699085 at 30699086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35198527 - 35198295
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcta-gagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||| ||     
T  35198527 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaagagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactg 35198428  T
Q  115 aaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacactttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||    
T  35198427 aaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagcttatggaagt 35198328  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35198327 agataagcccacataagttcaaaataagccaat 35198295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53151 - 53001
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  53151 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 53052  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53051 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33464564 - 33464399
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33464564 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 33464465  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaa 189  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  33464464 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52846
Alignment:
Q  96 taagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ct 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  195 ttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 52846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463711
Alignment:
Q  181 tttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatc 33463711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 1153887 - 1153857
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153887 taactaacattataattaaaatatatgtttt 1153857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 11167533 - 11167503
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167533 taactaacattataattaaaatatatgtttt 11167503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 18613829 - 18613799
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613829 taactaacattataattaaaatatatgtttt 18613799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 33464619 - 33464589
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464619 taactaacattataattaaaatatatgtttt 33464589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 20727078 - 20727049
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20727078 taactaacattataattaaaatatatgttt 20727049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 6611304 - 6611545
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  6611304 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggaggg 6611403  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6611404 taagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 6611503  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6611504 atgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatc 6611545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20877296 - 20877055
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  20877296 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggaggg 20877197  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20877196 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 20877097  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20877096 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 20877055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 54189786 - 54189553
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  54189786 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 54189687  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  54189686 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagt 54189587  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54189586 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 54189553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14988033 - 14987800
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  14988033 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctga 14987934  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14987933 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagt 14987834  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14987833 atataagcccacataagctcaaaataagccaatc 14987800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 40428664 - 40428904
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  40428664 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggaggg 40428763  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40428764 taagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggctt 40428863  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40428864 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaat 40428904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1617333 - 1617092
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  1617333 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 1617234  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1617233 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 1617134  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| || |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1617133 atgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatc 1617092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16701014 - 16700789
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16701014 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttag 16700915  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  16700914 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagc 16700815  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16700814 ccacataagctcaaaataagccaatc 16700789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31969922 - 31969696
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  31969922 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 31969823  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31969822 aaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagt 31969723  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataa 241  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  31969722 agataagcccatataagctcaaaataa 31969696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 19913590 - 19913815
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19913590 taaaatgtatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 19913689  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19913690 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 19913789  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19913790 ccacataagctcaaaataagccaatc 19913815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 53717416 - 53717649
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  53717416 attataattaaaatatatcttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 53717515  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53717516 aaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagt 53717615  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  53717616 agataaactcacataagctcaaaataagccaatc 53717649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53875906 - 53875665
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  53875906 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggaggg 53875807  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53875806 taagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 53875707  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  53875706 atgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatc 53875665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 54412866 - 54412636
Alignment:
Q  19 ataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaa 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  54412866 ataattaaaatgtatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaa 54412767  T
Q  119 tttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtaga 217  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54412766 tttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 54412667  T
Q  218 caagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54412666 taagcccacataagctcaaaataagccaatc 54412636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 37968709 - 37968942
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |    
T  37968709 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctga 37968808  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  37968809 aaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagt 37968908  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37968909 agataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 37968942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48910095 - 48909854
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  48910095 taactaacattataattaaaatatatgtattgaaaaagtggatctggagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 48909996  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  48909995 taagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggttt 48909896  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48909895 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatc 48909854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 27488605 - 27488833
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27488605 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 27488704  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27488705 taagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 27488804  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  27488805 agcccagataagctcaacttaagccaatc 27488833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 2481360 - 2481593
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  2481360 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctga 2481459  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  2481460 aaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagt 2481559  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2481560 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 2481593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 15240988 - 15241213
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15240988 taaaatgtatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 15241087  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||      
T  15241088 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaac 15241187  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15241188 ccacataagctcaaaataagccaatc 15241213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 30423509 - 30423749
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||    
T  30423509 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaaggg 30423607  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30423608 taagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30423707  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30423708 atggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatc 30423749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 44784877 - 44785102
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  44784877 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttag 44784976  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||     
T  44784977 gcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagc 44785076  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44785077 ccacataagctcaaaataagccaatc 44785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 1756721 - 1756949
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1756721 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 1756820  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1756821 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagata 1756920  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1756921 agcccatataagctcaaaataagccaatc 1756949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 28032673 - 28032897
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  28032673 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaga 28032772  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  28032773 cttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 28032872  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  28032873 cacataagctcaaaataagtcaatc 28032897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38055393 - 38055165
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  38055393 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatt 38055294  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  38055293 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 38055194  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||    
T  38055193 agcccacataagctcaaaataagtcaatc 38055165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50354051 - 50353809
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaa-tatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagg 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||    
T  50354051 taactaacattataattaaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagg 50353952  T
Q  107 gtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggct 205  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50353951 gtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggct 50353852  T
Q  206 tatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  50353851 tatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatc 50353809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 23704153 - 23704394
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  23704153 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 23704252  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23704253 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggctt 23704352  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23704353 atgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatc 23704394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 43289917 - 43290145
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43289917 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatt 43290016  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43290017 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagata 43290116  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||  || | ||||||||||||||||||||    
T  43290117 agcacataaaagctcaaaataagccaatc 43290145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 45424487 - 45424719
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||    
T  45424487 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaa 45424586  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  45424587 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagta 45424686  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  45424687 gataagccaacataagctcaaaataagtcaatc 45424719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37464957 - 37464730
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||    
T  37464957 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatt 37464858  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |    
T  37464857 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagata 37464758  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  37464757 agcccacataagctcaaaataagccaat 37464730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 8591049 - 8591275
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8591049 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 8591148  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |    
T  8591149 taggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagata 8591248  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaa 246  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8591249 aacccacataaactcaaaataagccaa 8591275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47632267 - 47632042
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  47632267 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaag 47632168  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac--tttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  47632167 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagt 47632068  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  47632067 ccacataaactcaaaataagccaatc 47632042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 23776423 - 23776644
Alignment:
Q  28 atatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggctt 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  23776423 atatatgttttgaaagagtggatcctgagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggctt 23776522  T
Q  128 attaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccac 226  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23776523 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccac 23776622  T
Q  227 ataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23776623 ataagctcaaaataagccaatc 23776644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 11639539 - 11639763
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11639539 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttagg 11639638  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  11639639 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcc 11639738  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||    
T  11639739 cacataagttcaaaataaaccaatc 11639763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 35490730 - 35490958
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35490730 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 35490829  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |    
T  35490830 taggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggata 35490929  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35490930 agcccatataagctcaaaataagccaatc 35490958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Original strand, 44379135 - 44379372
Alignment:
Q  12 taacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44379135 taacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaag 44379234  T
Q  112 ctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgg 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44379235 ctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgg 44379334  T
Q  211 gagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     |||||| ||| | | |||| ||||||||||| |||||    
T  44379335 aagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatc 44379372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33704080 - 33703850
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||    
T  33704080 ttataattaaaatatatgttt-gaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaa 33703982  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  33703981 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagta 33703882  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    || ||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  33703881 gataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 6688588 - 6688806
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6688588 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 6688687  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6688688 cttattaaaatatggcataagca------gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 6688781  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  6688782 cacataaactcaaaataagtcaatc 6688806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15669416 - 15669191
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  15669416 taaaatgtatgttttgaaaaagtggatccagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttag 15669317  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||     
T  15669316 gcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagc 15669217  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15669216 tcacataagctcaaaataagccaatc 15669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 19164933 - 19165157
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19164933 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttag 19165031  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac--tttaaaaaggcttatgggagtagacaag 221  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| |||    
T  19165032 gcttatt-aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataag 19165130  T
Q  222 tccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  19165131 cccacataagctcaaaataagccaatc 19165157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Original strand, 27583594 - 27583817
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583594 aaatatatattttgaaaaagtggatccagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 27583693  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |     
T  27583694 ttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcct 27583793  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  27583794 acataagctcaaaataagtcaatc 27583817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 27536064 - 27536285
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  27536064 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttag 27536163  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    |||     
T  27536164 gcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggagt----aagc 27536259  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27536260 ccgtataagctcaaaataagccaatc 27536285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53353299 - 53353063
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53353299 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatttagagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 53353200  T
Q  121 taggct----tattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    ||||||    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  53353199 taggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagta 53353100  T
Q  216 gacaagtccaca----taagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||| |    |||||||||||||||||||||    
T  53353099 gataagcccatataattaagctcaaaataagccaatc 53353063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30171828 - 30171588
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || || ||    
T  30171828 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaagg 30171730  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  30171729 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagctt 30171630  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| |  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30171629 atggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatc 30171588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055286
Alignment:
Q  61 tcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaacta 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  161 tgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 50055286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 8932142 - 8932363
Alignment:
Q  28 atatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggctt 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||| ||    
T  8932142 atatatattttgaaaaagtggatgcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggttt 8932241  T
Q  128 attaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccac 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || |    
T  8932242 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgc 8932341  T
Q  227 ataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8932342 ataagctcaaaataagccaatc 8932363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Original strand, 40680000 - 40680223
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40680000 aaatatatattttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc 40680099  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||  |    
T  40680100 ttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctc 40680199  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||  |||||||||| |||||    
T  40680200 acataaattcaaaataagtcaatc 40680223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 23268998 - 23269162
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  23268998 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23269097  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttattta 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23269098 aaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52139428 - 52139211
Alignment:
Q  30 atatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  52139428 atatgttttgaaaaagtgtatccagaga--atcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttat 52139331  T
Q  130 taaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacat 228  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||| ||  ||||||    
T  52139330 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacat 52139231  T
Q  229 aagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  52139230 aagttcaaaataagccaatc 52139211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Original strand, 55344784 - 55345009
Alignment:
Q  23 ttaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaattta 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||     
T  55344784 ttaaaatatatgtcttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaatttt 55344883  T
Q  123 ggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaag 221  Q
    ||||||||||||||||  |||  || || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  55344884 ggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaa 55344983  T
Q  222 tccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  55344984 cccacataagctcaaaataagtcaat 55345009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 247
Target Start/End: Original strand, 38071286 - 38071504
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||| || |||||| ||    
T  38071286 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcag 38071379  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||     
T  38071380 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagc 38071479  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  38071480 ccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44376079 - 44375853
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  44376079 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtagatccag------tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaa 44375986  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||| |  ||| ||| ||    
T  44375985 aatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaata 44375886  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44375885 gataagcccacataagcttaaaataagccaatc 44375853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16704046 - 16703843
Alignment:
Q  30 atatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttat 129  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  16704046 atatgttttgaaaaagtggat--acagagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttat 16703949  T
Q  130 taaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacat 228  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  16703948 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacat 16703849  T
Q  229 aagctc 234  Q
    ||||||    
T  16703848 aagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360438
Alignment:
Q  86 agctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaata-tgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttattta 184  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  185 cccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatc 28360438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50053585 - 50053451
Alignment:
Q  115 aaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggag 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50053585 aaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggcttatgggag 50053486  T
Q  214 tagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50053485 tagataagtccatataagctcaaaataagccaatc 50053451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 53408252 - 53408138
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccag-agggtaagctaaaaatttag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  53408252 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttag 53408153  T
Q  124 gcttattaaaatatg 138  Q
    ||||| |||||||||    
T  53408152 gcttaataaaatatg 53408138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 23261838 - 23261935
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23261838 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagct 23261935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 9595849 - 9595982
Alignment:
Q  11 ctaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||         
T  9595849 ctaacattataattaaaatatatattttggaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag----- 9595943  T
Q  111 gctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatga 155  Q
          | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9595944 ------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 50055381 - 50055301
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagcc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  50055381 aattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 23265866 - 23265942
Alignment:
Q  173 tttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23265866 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 23265942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  109 aagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac 191  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34615990 - 34615904
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagct 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  34615990 aaaaaatatgttttgaaaaagtggatcaagagaaaatcgaaggaggttacataaatt--taagctctttattaaggcagaggataagct 34615904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 55344654 - 55344715
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataa 86  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55344654 aaaatatatgtcttgaaaaactggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548320
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||  || ||||| ||| | ||||||| | | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataag 242  Q
    |||  |||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataag 44548320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 28360642 - 28360603
Alignment:
Q  12 taacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatc 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360642 taacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatc 28360603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 6688531 - 6688561
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688531 taactaacattataattaaaatatatgtttt 6688561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 8590995 - 8591025
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8590995 taactaacattataattaaaatatatgtttt 8591025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 8932091 - 8932121
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932091 taactaacattataattaaaatatatgtttt 8932121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 15240929 - 15240959
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15240929 taactaacattataattaaaatatatgtttt 15240959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15669472 - 15669442
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669472 taactaacattataattaaaatatatgtttt 15669442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 38055449 - 38055419
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055449 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38055419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 38071233 - 38071263
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071233 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38071263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 44784822 - 44784852
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44784822 taactaacattataattaaaatatatgtttt 44784852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 47632325 - 47632295
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632325 taactaacattataattaaaatatatgtttt 47632295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 52139487 - 52139457
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139487 taactaacattataattaaaatatatgtttt 52139457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 53408310 - 53408280
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408310 taactaacattataattaaaatatatgtttt 53408280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 55344601 - 55344631
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344601 taactaacattataattaaaatatatgtttt 55344631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 1756668 - 1756697
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756668 taactaacattataattaaaatatatgttt 1756697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493341
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||| |||||| |||||| |||||  | ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || |||||||| | || || ||||  |||||||||| |||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatc 17493341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 19164878 - 19164907
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164878 taactaacattataattaaaatatatgttt 19164907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 27488549 - 27488578
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488549 taactaacattataattaaaatatatgttt 27488578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 48748262 - 48748197
Alignment:
Q  53 agagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaa 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||| ||| ||||    
T  48748262 agagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 53353351 - 53353323
Alignment:
Q  9 aactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353351 aactaacattataattaaaatatatgttt 53353323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 37698093 - 37698326
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  37698093 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 37698192  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37698193 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 37698292  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37698293 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 37698326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 42307855 - 42308088
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  42307855 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 42307954  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42307955 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagt 42308054  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42308055 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 42308088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25999626 - 25999393
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25999626 attataattaaaacatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 25999527  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  25999526 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagt 25999427  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25999426 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 25999393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21581280 - 21581047
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  21581280 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctga 21581181  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21581180 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 21581081  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21581080 agataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 21581047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Original strand, 12117610 - 12117840
Alignment:
Q  18 tataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  12117610 tataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaa 12117709  T
Q  118 atttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12117710 atttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatag 12117809  T
Q  217 acaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12117810 ataagcccacataagctcaaaataagccaat 12117840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 22174940 - 22175173
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  22174940 attataattaaaatatatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctga 22175039  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  22175040 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagt 22175139  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22175140 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 22175173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 20842299 - 20842531
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  20842299 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 20842398  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20842399 aatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagta 20842498  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20842499 gataagctcacataagctcaaaataagccaatc 20842531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50529166 - 50528934
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||| ||    
T  50529166 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaa 50529067  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  50529066 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagta 50528967  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50528966 gataagcccacataagctcaaaataagccaatc 50528934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 54870129 - 54870357
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  54870129 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatt 54870228  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  54870229 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagata 54870328  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  54870329 aacccacataaactcaaaataagccaatc 54870357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 25494227 - 25494468
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  25494227 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaactggattcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggaggg 25494326  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25494327 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 25494426  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25494427 atgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatc 25494468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 15520097 - 15520325
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15520097 aatttaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 15520196  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15520197 taggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 15520296  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15520297 agcccacataagctcaaaataagccaatc 15520325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38856326 - 38856098
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38856326 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 38856227  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  38856226 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagata 38856127  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38856126 agcccatataagctcaaaataagccaatc 38856098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 44609284 - 44609516
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||| ||    
T  44609284 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaa 44609383  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  44609384 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagta 44609483  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609484 gataagtccacataagctcaaaataagccaatc 44609516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 46452117 - 46452345
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  46452117 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatt 46452216  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  46452217 taggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 46452316  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  46452317 agcccatataagctcaacttaagccaatc 46452345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15520874 - 15520641
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  15520874 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctga 15520775  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  15520774 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagt 15520675  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15520674 agataaacccacataagctcaaaataagccaatc 15520641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20699387 - 20699154
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  20699387 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctga 20699288  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  20699287 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagt 20699188  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20699187 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 20699154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29445726 - 29445493
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  29445726 attataattaaaatatatcttttgaaaaagtggatccagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 29445627  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29445626 aaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagt 29445527  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29445526 agataaactcacataagctcaaaataagccaatc 29445493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38934175 - 38933951
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  38934175 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttag 38934076  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||     
T  38934075 acttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag- 38933977  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38933976 ccacataagctcaaaataagccaatc 38933951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8042836 - 8042616
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8042836 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 8042737  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||      
T  8042736 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagct 8042637  T
Q  224 cacataagctcaaaataagcc 244  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8042636 cacataagctcaaaataagcc 8042616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34700587 - 34700346
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||| |||||    
T  34700587 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaaatggatccagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggaggg 34700488  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34700487 taaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggctt 34700388  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| |||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  34700387 atggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatc 34700346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 42104913 - 42105154
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  42104913 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaactgaattcagagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgaggg 42105012  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||    
T  42105013 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgttt 42105112  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42105113 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 42105154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53028463 - 53028230
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  53028463 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 53028364  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacactttaaaaaggctta 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       || ||||||| ||||    
T  53028363 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgataagctatttttatttatttac-------ctctaaaaagactta 53028271  T
Q  208 tgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53028270 tgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 53028230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 24835655 - 24835875
Alignment:
Q  22 attaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24835655 attaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattt 24835754  T
Q  122 aggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaa 220  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  24835755 aggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataa 24835854  T
Q  221 gtccacataagctcaaaataa 241  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  24835855 gtctatataagctcaaaataa 24835875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2895426 - 2895191
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaatt----gataagctcgttgttaagccagagggtaagc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2895426 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagc 2895327  T
Q  113 taaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatggg 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2895326 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcg 2895227  T
Q  212 agtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  2895226 agtagataaacccacataagctcaaaataagtcaat 2895191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35226692 - 35226452
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||||    
T  35226692 taactaacgttctaattaaaatatatgttttgaaaaa-tggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggaggg 35226594  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35226593 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 35226494  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35226493 atggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatc 35226452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 54534278 - 54534509
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  54534278 attataattaaaatatatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 54534377  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54534378 aaatttaggcttatt-gaatatggcataagcagcttat-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagt 54534475  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54534476 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 54534509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 48924958 - 48925184
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48924958 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatt 48925057  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacactttaaaaaggcttatgggagtagacaa 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  48925058 tagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac-ttttaaaaaagcttatggaagtagataa 48925156  T
Q  221 gtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
      ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  48925157 acccatataaactctaaataagccaatc 48925184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32359488 - 32359264
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  32359488 aaaatatatgcttggaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttagg 32359389  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| | |||| || ||    
T  32359388 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatc 32359289  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32359288 cacataagctcaaaataagccaatc 32359264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44688989 - 44688782
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  44688989 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaag 44688890  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  44688889 cttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacc 44688791  T
Q  224 cacataagc 232  Q
    |||||||||    
T  44688790 cacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26123049 - 26122819
Alignment:
Q  19 ataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  26123049 ataatttaaatatatgttttgaaaaagtagacctagagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaa 26122950  T
Q  119 tttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtaga 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  26122949 tttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaataga 26122850  T
Q  218 caagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26122849 taaacccacataagctcaaaataagccaatc 26122819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32244343 - 32244125
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||||||||||||  |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  32244343 aaaatatatgtttgaaaaaagtggat------agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaag 32244250  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  32244249 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatc 32244150  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32244149 cacataagctcaaaataagccaatc 32244125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16354576 - 16354390
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  16354576 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttag 16354477  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatg 209  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16354476 gcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 16354390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643222
Alignment:
Q  103 gagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  202 ggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35643268 ggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatc 35643222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13697039 - 13696914
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  13697039 taactaacattctaattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggaggg 13696940  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  13696939 taagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529956
Alignment:
Q  120 ttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagac 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  219 aagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatc 50529956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24366265 - 24366145
Alignment:
Q  18 tataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  24366265 tataagtaaaatatatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaa 24366166  T
Q  118 atttaggcttattaaaatatg 138  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24366165 atttatgcttattaaaatatg 24366145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12916124 - 12915957
Alignment:
Q  36 tttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaat 135  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  12916124 tttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaat 12916025  T
Q  136 atgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaag 202  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12916024 atgacataagcagtttatgaaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaag 12915957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128054
Alignment:
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||| | |||||||| |||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatc 49128054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 50528841 - 50528916
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50528841 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35643411 - 35643365
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggagg 70  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35643411 taaaatatatcttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggagg 35643365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 8042894 - 8042864
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042894 taactaacattataattaaaatatatgtttt 8042864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 32244402 - 32244372
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244402 taactaacattataattaaaatatatgtttt 32244372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 38934233 - 38934203
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934233 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 44689047 - 44689017
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44689047 taactaacattataattaaaatatatgtttt 44689017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 50528784 - 50528814
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528784 taactaacattataattaaaatatatgtttt 50528814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 35643459 - 35643430
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643459 taactaacattataattaaaatatatgttt 35643430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 38856379 - 38856350
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856379 taactaacattataattaaaatatatgttt 38856350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 46452063 - 46452092
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452063 taactaacattataattaaaatatatgttt 46452092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 24105635 - 24105868
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24105635 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 24105734  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24105735 taatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 24105834  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24105835 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 24105868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 27679133 - 27679366
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  27679133 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 27679232  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27679233 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagt 27679332  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27679333 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 27679366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31883383 - 31883155
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883383 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatt 31883284  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  31883283 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagata 31883184  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31883183 agtccacataagctcaaaataagtcaatc 31883155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 33491160 - 33491393
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33491160 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 33491259  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33491260 aaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagt 33491359  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33491360 agataaacccacataagctcaaaataagccaatc 33491393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 16737416 - 16737643
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16737416 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 16737515  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16737516 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagata 16737615  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  16737616 agcccatataagctcaaaataagccaat 16737643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 1165557 - 1165798
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  1165557 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaactggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggaggg 1165656  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1165657 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 1165756  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1165757 atggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatc 1165798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 3386459 - 3386683
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3386459 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 3386558  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3386559 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtc 3386658  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3386659 cacataagctcaaaataagccaatc 3386683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 9008030 - 9008254
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9008030 aaaatatatgttttgaaaaagtagatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 9008129  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9008130 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 9008229  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9008230 cacataagctcaaaataagccaatc 9008254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16069592 - 16069364
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16069592 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 16069493  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16069492 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 16069393  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||    
T  16069392 agcctacataagctcaaaataagtcaatc 16069364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1579275 - 1579047
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1579275 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 1579176  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1579175 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 1579076  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1579075 agcccatataagctcaaaataagccaatc 1579047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 1605540 - 1605768
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1605540 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 1605639  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1605640 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 1605739  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1605740 agcccatataagctcaaaataagccaatc 1605768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27421097 - 27420869
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27421097 aattaaaatatatgttttaaaaatgtggatccagggagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 27420998  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27420997 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 27420898  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27420897 agcccatataagctcaaaataagccaatc 27420869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33991376 - 33991152
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  33991376 taaaatatatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttag 33991277  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33991276 gcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagt 33991177  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||    
T  33991176 ccacataaactcaaaataagtcaat 33991152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4121173 - 4120951
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4121173 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 4121074  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||      
T  4121073 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaac 4120974  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagcca 245  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4120973 ccacataagctcaaaataagcca 4120951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3921820 - 3921599
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  3921820 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatt 3921721  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  3921720 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagata 3921621  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataa 241  Q
    || ||| |||| ||||||||||    
T  3921620 agcccatataaactcaaaataa 3921599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 8374311 - 8374535
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  8374311 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatc-ataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttag 8374409  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  8374410 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagc 8374509  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8374510 ccacataagcttaaaataaggcaatc 8374535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19358761 - 19358537
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  19358761 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttagg 19358662  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  19358661 cttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagct 19358562  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  19358561 cacataagctcaaaataaggcaatc 19358537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 20992119 - 20992342
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  20992119 aaaaaatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttagg 20992218  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  20992219 cttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagac 20992318  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20992319 cacataagctcaaaataagccaat 20992342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27025208 - 27025001
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  27025208 taactaacattataatcaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggaggg 27025109  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  27025108 taagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtctt 27025009  T
Q  207 atgggagt 214  Q
    ||||||||    
T  27025008 atgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 35782608 - 35782841
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagc-cagagggtaagcta 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| |||     
T  35782608 attataattaaaatacatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgt-aagcacggagggtaggctg 35782706  T
Q  115 aaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggag 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35782707 aaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgag 35782806  T
Q  214 tagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  35782807 tagataagcccacataagctcaaaataaggcaatc 35782841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 38598419 - 38598647
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  38598419 aattaaaatatatgttttgaaaaaacggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatt 38598518  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  38598519 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagata 38598618  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  38598619 agctcacataagttcaaagtaagccaatc 38598647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 26602906 - 26603108
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || |    
T  26602906 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactga 26603005  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26603006 aaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 26603105  T
Q  215 aga 217  Q
    |||    
T  26603106 aga 26603108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5203200 - 5202983
Alignment:
Q  31 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatt 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5203200 tatgttttgaaaa-gtggatctagagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 5203102  T
Q  131 aaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacata 229  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||    
T  5203101 gaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacata 5203002  T
Q  230 agctcaaaataagccaatc 248  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  5203001 aactcaaaataagtcaatc 5202983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31410720 - 31410494
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| | |    
T  31410720 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcaaaagagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttga 31410621  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  31410620 aaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggt 31410521  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataa 241  Q
    ||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  31410520 agataaacccatataaactcaaaataa 31410494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992482
Alignment:
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  224 c----acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatc 20992482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Original strand, 35420393 - 35420491
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  35420393 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaaaataaaaat 35420491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 248
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284772
Alignment:
Q  119 tttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtaga 217  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  218 caagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatc 33284772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638195
Alignment:
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatg 209  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatg 31638195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Original strand, 41818519 - 41818604
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac 193  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41818519 taagctaaaaaattgaacttattaaaatacaatataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacac 41818604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 3386402 - 3386432
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386402 taactaacattataattaaaatatatgtttt 3386432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 4121228 - 4121198
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121228 taactaacattataattaaaatatatgtttt 4121198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 9007971 - 9008001
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9007971 taactaacattataattaaaatatatgtttt 9008001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 19358818 - 19358788
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358818 taactaacattataattaaaatatatgtttt 19358788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 31883443 - 31883413
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883443 taactaacattataattaaaatatatgtttt 31883413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 1579328 - 1579299
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579328 taactaacattataattaaaatatatgttt 1579299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 1605487 - 1605516
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605487 taactaacattataattaaaatatatgttt 1605516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 3921873 - 3921844
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921873 taactaacattataattaaaatatatgttt 3921844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 8374256 - 8374285
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374256 taactaacattataattaaaatatatgttt 8374285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 16737363 - 16737392
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737363 taactaacattataattaaaatatatgttt 16737392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 27421150 - 27421121
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421150 taactaacattataattaaaatatatgttt 27421121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 33991424 - 33991395
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991424 taactaacattataattaaaatatatgttt 33991395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29078757 - 29078524
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29078757 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 29078658  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29078657 aaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 29078558  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29078557 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 29078524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 39260310 - 39260543
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39260310 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 39260409  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39260410 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagt 39260509  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39260510 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 39260543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26663507 - 26663266
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  26663507 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaaatggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggaggg 26663408  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26663407 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 26663308  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26663307 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 26663266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 52753111 - 52753344
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  52753111 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctga 52753210  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52753211 aaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagt 52753310  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52753311 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 52753344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20089703 - 20089479
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20089703 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagg 20089604  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  20089603 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcc 20089504  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20089503 cacataagctcaaaataagccaatc 20089479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25897613 - 25897382
Alignment:
Q  18 tataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  25897613 tataattaaaatatatattttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaa 25897514  T
Q  118 atttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtag 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25897513 atttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtag 25897414  T
Q  217 acaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    | | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  25897413 atatgcccacataagctcaaaataagtcaatc 25897382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43905903 - 43905662
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  43905903 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggaggg 43905804  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43905803 taaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 43905704  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43905703 ataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatc 43905662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29288388 - 29288157
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29288388 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 29288291  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29288290 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 29288191  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29288190 agataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 29288157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8121109 - 8120877
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| || ||    
T  8121109 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaa 8121010  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8121009 aatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagta 8120910  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120909 gataagtccacataagctcaaaataagccaatc 8120877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 19715130 - 19715358
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19715130 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatt 19715229  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  19715230 taggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagata 19715329  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19715330 agctcacataagctcaaaataaaccaatc 19715358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 970488 - 970723
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  970488 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 970587  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaac--tatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatggga 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  970588 aaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggga 970687  T
Q  213 gtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  970688 gtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 970723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 26580239 - 26580467
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26580239 aattaaaatatatgttttgaaaatgtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatt 26580338  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  26580339 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagata 26580438  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26580439 agcccacataagctcaaaataagccaatc 26580467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52697032 - 52696799
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  52697032 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctga 52696933  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  52696932 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagt 52696833  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52696832 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 52696799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 1940716 - 1940944
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  1940716 aattaaaatatatgttttgaaaaagtagatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatt 1940815  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1940816 taggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 1940915  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1940916 agcccatataagctcaaaataagccaatc 1940944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38829301 - 38829077
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38829301 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 38829202  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  38829201 cttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcc 38829102  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  38829101 gacataagctcaaaataagccaatc 38829077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Original strand, 42370769 - 42370992
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42370769 aaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggc 42370868  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  42370869 ttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctc 42370968  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  42370969 acataagctcaaaataagtcaatc 42370992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 1170416 - 1170641
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  1170416 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttag 1170515  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  1170516 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagc 1170615  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1170616 ccacaaaagctcaaaataagccaatc 1170641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16052325 - 16052104
Alignment:
Q  28 atatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggctt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16052325 atatatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggctt 16052226  T
Q  128 attaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccac 226  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||    
T  16052225 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccac 16052126  T
Q  227 ataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16052125 ataaactcaaaataagccaatc 16052104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 8079678 - 8079906
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8079678 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattaagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaact 8079777  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8079778 taggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagata 8079877  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8079878 agcccacataagctcaaaataagccaatc 8079906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23498709 - 23498469
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  23498709 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggaggg 23498610  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23498609 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggctt 23498510  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
     ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23498509 gtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaat 23498469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33510720 - 33510492
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33510720 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 33510621  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  33510620 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagata 33510521  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  33510520 agctcatataagctcaaaataagccaatc 33510492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46761206 - 46760974
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  46761206 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaa 46761107  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  46761106 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagta 46761007  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || |||  || ||||| |||||||||| |||||    
T  46761006 gataagctcatataagttcaaaataagtcaatc 46760974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7145456 - 7145226
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  7145456 taactaacattataattaatatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggaggg 7145357  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7145356 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggctt 7145258  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaa 238  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  7145257 atgggagtagataaatacacataagctcaaaa 7145226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2347889 - 2347671
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2347889 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttagg 2347790  T
Q  125 cttatt-aaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2347789 cttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 2347690  T
Q  223 ccacataagctcaaaataa 241  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  2347689 ccgcataaactcaaaataa 2347671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17591921 - 17591699
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  17591921 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttag 17591822  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||     
T  17591821 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag- 17591723  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17591722 ccacataagctc--aataagccaatc 17591699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49146421 - 49146180
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  49146421 taactaacattataattaaaatataagttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggaggg 49146322  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||    
T  49146321 taagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaactt 49146222  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  49146221 atgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatc 49146180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32671810 - 32671587
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  32671810 aaaatatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttagg 32671712  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  32671711 cttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatc 32671612  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32671611 cacataagctcaaaataagccaatc 32671587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 41928468 - 41928692
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  41928468 aaaaaatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttagg 41928567  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41928568 cttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtc 41928667  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  41928668 cacataagttcaaaataagccaatc 41928692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6765708 - 6765467
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  6765708 taactaacattataattaaaatatatgttttaaaaaagtggatcgagatagaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggaggg 6765609  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6765608 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggctt 6765509  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||   |||||| || | ||||||| |||||||||||||||||    
T  6765508 ataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatc 6765467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Original strand, 17587470 - 17587694
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  17587470 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaa 17587569  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  17587570 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaata 17587669  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaata 240  Q
    || |||  |||||||||||||||||    
T  17587670 gataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46409678 - 46409443
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaa--gccagagggtaagct 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  | |  ||||||||||    
T  46409678 attataatgaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagct 46409579  T
Q  114 aaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatggga 212  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  46409578 gaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgaga 46409479  T
Q  213 gtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46409478 ttagataagtccacataagctcaaaataagtcaatc 46409443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12683051 - 12682828
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12683051 aaatatatattttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggc 12682952  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  12682951 ttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagccc 12682852  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  12682851 acataaactcaaaataagtcaatc 12682828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5215618 - 5215393
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  5215618 taaaatatatgttttgaaaaggtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttag 5215519  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||     
T  5215518 gcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagc 5215419  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5215418 ccacataagctcaaaataagccaatc 5215393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 13996692 - 13996920
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  13996692 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatt 13996791  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  13996792 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagata 13996891  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||||||    
T  13996892 aacccacataatttcaaaataagccaatc 13996920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2473963 - 2473737
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||| |    
T  2473963 attataattaaaatatatgttttgaaaatgtggatccaaagagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctga 2473864  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  2473863 aaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgt 2473764  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataa 241  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2473763 agataagcccacataagctcaaaataa 2473737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15203353 - 15203121
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||| |    
T  15203353 attataattaaaacatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctga 15203254  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203253 aaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagt 15203154  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    ||| ||  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15203153 agataaacccacaaaagcttaaaataagtcaat 15203121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40149712 - 40149502
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  40149712 taaccaacattataattaatatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggaggg 40149613  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40149612 taaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 40149513  T
Q  207 atgggagtaga 217  Q
    |||||||||||    
T  40149512 atgggagtaga 40149502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15718033 - 15717793
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  15718033 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccaaagagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggaggg 15717934  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15717933 taagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggctt 15717835  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||  | |||| | | | |||||| ||||||||||| |||||    
T  15717834 atgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatc 15717793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1168707 - 1168511
Alignment:
Q  53 agagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagctta 152  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1168707 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 1168608  T
Q  153 tgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1168607 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 1168511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40092720 - 40092499
Alignment:
Q  28 atatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggctt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  40092720 atatatgttttgaaaaagtggatccagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggctt 40092621  T
Q  128 attaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccac 226  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||     
T  40092620 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcat 40092521  T
Q  227 ataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  40092520 ataagctcaaaataagtcaatc 40092499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Original strand, 51359210 - 51359413
Alignment:
Q  45 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatat 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  51359210 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 51359309  T
Q  145 gcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacactttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagcc 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  51359310 gcaccttatgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaaacctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagcc 51359409  T
Q  245 aatc 248  Q
    ||||    
T  51359410 aatc 51359413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 15554121 - 15554341
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  15554121 aattaaaatatatgttttgaaaaaatggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatt 15554220  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||        | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15554221 taggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa--------atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 15554312  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15554313 agcccatataagctcaacttaagccaatc 15554341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38172059 - 38171841
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||| ||    
T  38172059 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaa 38171960  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||             ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  38171959 aatttaggc-------------acataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagta 38171873  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    || |||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  38171872 gataagttcacataaattcaaaataagtcaat 38171841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29695896 - 29695683
Alignment:
Q  32 atgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatta 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||      ||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29695896 atgttttgaaaaagtagatctagagagaattgaatgaggttacataatttt-----cttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatta 29695802  T
Q  132 aaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac--tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacata 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  || |||||   ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  29695801 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgta 29695702  T
Q  230 agctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29695701 agctcaaaataagccaatc 29695683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086275
Alignment:
Q  128 attaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccac 226  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  227 ataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatc 52086275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 243
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  109 aagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggctta 207  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||  |||||  ||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  208 tgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagc 243  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 23323084 - 23323036
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23323084 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaa 23323036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 2347947 - 2347917
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347947 taactaacattataattaaaatatatgtttt 2347917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 51
Target Start/End: Original strand, 14004806 - 14004836
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatc 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14004806 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatc 14004836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17591977 - 17591947
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591977 taactaacattataattaaaatatatgtttt 17591947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 19715077 - 19715107
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715077 taactaacattataattaaaatatatgtttt 19715107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 26580186 - 26580216
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580186 taactaacattataattaaaatatatgtttt 26580216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 40092786 - 40092756
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092786 taactaacattataattaaaatatatgtttt 40092756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 41928422 - 41928452
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928422 taactaacattataattaaaatatatgtttt 41928452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 51359143 - 51359173
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359143 taactaacattataattaaaatatatgtttt 51359173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 1170685 - 1170656
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggat 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170685 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggat 1170656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 15554069 - 15554098
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554069 taactaacattataattaaaatatatgttt 15554098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 33510773 - 33510744
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510773 taactaacattataattaaaatatatgttt 33510744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 12101132 - 12101365
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  12101132 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctga 12101231  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12101232 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 12101331  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12101332 agataaacccacataagctcaaaataagccaatc 12101365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 33359044 - 33359277
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  33359044 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctga 33359143  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  33359144 aaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagt 33359243  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33359244 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 33359277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 42964959 - 42965183
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42964959 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttagg 42965058  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  42965059 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcc 42965158  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42965159 cacataagctcaaaataagccaatc 42965183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 43067932 - 43068160
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43067932 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 43068031  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  43068032 taggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 43068131  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  43068132 agcccatataagctcaaaataagtcaatc 43068160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1803276 - 1803035
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  1803276 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggg 1803177  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1803176 taagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggctt 1803077  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1803076 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 1803035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 24792291 - 24792519
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24792291 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 24792390  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24792391 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagata 24792490  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  24792491 agcccagataagctcaacttaagccaatc 24792519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5281109 - 5280869
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  5281109 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggg 5281011  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5281010 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 5280911  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| || |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5280910 atgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatc 5280869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20346730 - 20346497
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  20346730 attataattaaaataaatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 20346631  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20346630 aaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagt 20346531  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20346530 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 20346497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 933518 - 933295
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  933518 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttagg 933419  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  933418 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtc 933319  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  933318 cacatgagctcaaaataagccaat 933295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 33846483 - 33846711
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      |||||| |    
T  33846483 attataattaaaatatatgtcttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctga 33846577  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33846578 aaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 33846677  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33846678 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 33846711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43156962 - 43156722
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  43156962 taactaatattataattaaaatatatgttttgaaaa-gtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggaggg 43156864  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43156863 taagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 43156764  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43156763 atgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 43156722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7164421 - 7164193
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7164421 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggattcagatagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 7164322  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |    
T  7164321 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagata 7164222  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7164221 agcccatataagctcaaaataagccaatc 7164193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 12097549 - 12097777
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12097549 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 12097648  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  12097649 taggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagata 12097748  T
Q  220 agtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||  || ||||||||||  ||||||||||    
T  12097749 agctcatataagctcaacttaagccaatc 12097777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15656153 - 15655921
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||| ||    
T  15656153 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaa 15656054  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  15656053 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagca 15655954  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15655953 gataagcccacataagctcaaaataagccaatc 15655921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 22649657 - 22649880
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  22649657 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttagg 22649756  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22649757 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 22649856  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22649857 cacataagctcaaaataagccaat 22649880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 36890775 - 36891006
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaa-agtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||    
T  36890775 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagg 36890874  T
Q  107 gtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggct 205  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36890875 gtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagct 36890974  T
Q  206 tatgggagtagacaagtccacataagctcaaa 237  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  36890975 tatgggagtagataagcctacataagctcaaa 36891006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42204389 - 42204163
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42204389 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttag 42204290  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac--tttaaaaaggcttatgggagtagacaag 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||| |||    
T  42204289 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataag 42204190  T
Q  222 tccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  42204189 cccacataagctcaaaataagccaatc 42204163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 4477275 - 4477508
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | |    
T  4477275 attataattaaaatatatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttga 4477374  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  4477375 aaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagt 4477474  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4477475 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 4477508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Original strand, 30180998 - 30181211
Alignment:
Q  36 tttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaat 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30180998 tttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 30181097  T
Q  136 atgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctc 234  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30181098 atggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctc 30181197  T
Q  235 aaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||    
T  30181198 aaaataagccaatc 30181211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6394993 - 6394760
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  6394993 attataattaaaatatatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactga 6394894  T
Q  116 aaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  6394893 aaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaat 6394794  T
Q  215 agacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6394793 agataagcccacataagctcaaaataagccaatc 6394760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9452824 - 9452599
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  9452824 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttag 9452725  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  9452724 gcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagt 9452625  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    
T  9452624 tcacataagctcaaaataagtcaatc 9452599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25748724 - 25748527
Alignment:
Q  21 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25748724 aattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatt 25748625  T
Q  121 taggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtaga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25748624 taggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtaga 25748527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32041774 - 32041551
Alignment:
Q  26 aaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  32041774 aaatatatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggc 32041675  T
Q  126 ttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtcc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  32041674 ttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagccc 32041575  T
Q  225 acataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  32041574 acataagcacaaaataagccaatc 32041551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42673702 - 42673474
Alignment:
Q  17 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||    
T  42673702 ttataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaa 42673603  T
Q  117 aatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42673602 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc----tgtttttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagta 42673507  T
Q  216 gacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  42673506 gataagcccacataagctccaaataagtcaatc 42673474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511332
Alignment:
Q  54 gagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  154 gaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatc 3511332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 46134250 - 46134491
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  46134250 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtgcatccagagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggaggg 46134349  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  46134350 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagtt 46134449  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || |||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  46134450 ataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatc 46134491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4347505 - 4347282
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  4347505 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttagg 4347407  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |    
T  4347406 cttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcc 4347307  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||||| |||||||| |||||    
T  4347306 cacataagcttaaaataagtcaatc 4347282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38866777 - 38866559
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  38866777 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatg 38866678  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||  |    
T  38866677 cttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacc 38866578  T
Q  224 cacataagctcaaaataag 242  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38866577 cacataagctcaaaataag 38866559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 43021526 - 43021763
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagaggg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |    
T  43021526 taactaacattataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagag 43021625  T
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||||    |   ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43021626 taagctgaaaatttag----accgaaatatgccataagcagcttatgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagactt 43021721  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || | |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43021722 attgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatc 43021763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8630899 - 8630682
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  8630899 aaaaaatatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttagg 8630800  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |  |    
T  8630799 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacc 8630700  T
Q  224 cacataagctcaaaataa 241  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  8630699 cacataacctcaaaataa 8630682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17753834 - 17753609
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  17753834 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttag 17753735  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||     
T  17753734 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagc 17753635  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
        ||||||||||||||||| ||||    
T  17753634 ttgtataagctcaaaataagctaatc 17753609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 46891301 - 46891527
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  46891301 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttag 46891400  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac--tttaaaaaggcttatgggagtagacaag 221  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||| |||    
T  46891401 gctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataag 46891500  T
Q  222 tccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     | | ||||||||||||||||||||||    
T  46891501 cctatataagctcaaaataagccaatc 46891527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48865866 - 48865670
Alignment:
Q  23 ttaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaattta 122  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  48865866 ttaaaatatatgttttggaaaaatggatc--gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaattta 48865769  T
Q  123 ggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacttt----aaaaaggcttatgggagtaga 217  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||    
T  48865768 ggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtaga 48865670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Original strand, 16894469 - 16894663
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||    |||||||||| |||||||||    
T  16894469 taaaataaatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttag 16894568  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16894569 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtaga 16894663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19828413 - 19828280
Alignment:
Q  115 aaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggag 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19828413 aaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgggag 19828314  T
Q  214 tagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  19828313 tagataagccaacataaactcaaaataagccaat 19828280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704995
Alignment:
Q  163 ataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataag 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataag 37704995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37005998
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggctt 206  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    || | |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatc 37005998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405030
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac-actttaaaaaggctt 206  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   | |  || ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    || |||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaat 43405030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 37705144 - 37705082
Alignment:
Q  16 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  37705144 attataattaaaatatatgttttgaaaaagtggatcaagaaataatcgaagaaggttacataa 37705082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 27691437 - 27691512
Alignment:
Q  173 tttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||    
T  27691437 tttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaat 27691512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849709
Alignment:
Q  115 aaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggag 213  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||   |||||| ||||| ||||||| |||||||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  214 tagacaagtccacataagct 233  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagct 36849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655599
Alignment:
Q  108 taagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggctt 206  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||  ||| |||| |||| ||| | || |||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  207 atgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||  ||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatc 15655599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaac 191  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 933576 - 933546
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933576 taactaacattataattaaaatatatgtttt 933546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 9452880 - 9452850
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452880 taactaacattataattaaaatatatgtttt 9452850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 16894415 - 16894445
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894415 taactaacattataattaaaatatatgtttt 16894445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17753891 - 17753861
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753891 taactaacattataattaaaatatatgtttt 17753861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 22649598 - 22649628
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649598 taactaacattataattaaaatatatgtttt 22649628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 38866835 - 38866805
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866835 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38866805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 42964899 - 42964929
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964899 taactaacattataattaaaatatatgtttt 42964929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Original strand, 46891246 - 46891276
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgtttt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46891246 taactaacattataattaaaatatatgtttt 46891276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 7164474 - 7164445
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164474 taactaacattataattaaaatatatgttt 7164445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 12097503 - 12097532
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097503 taactaacattataattaaaatatatgttt 12097532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 24792234 - 24792263
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792234 taactaacattataattaaaatatatgttt 24792263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 25748774 - 25748745
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748774 taactaacattataattaaaatatatgttt 25748745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 43067879 - 43067908
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43067879 taactaacattataattaaaatatatgttt 43067908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 48865914 - 48865885
Alignment:
Q  8 taactaacattataattaaaatatatgttt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865914 taactaacattataattaaaatatatgttt 48865885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3942 - 3718
Alignment:
Q  25 aaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  3942 aaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttagg 3843  T
Q  125 cttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacac-tttaaaaaggcttatgggagtagacaagtc 223  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  3842 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcc 3743  T
Q  224 cacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||    
T  3742 cacataagttcaaaataaaccaatc 3718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 267 - 492
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  267 taaaatatatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaa 366  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||      
T  367 gcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaac 466  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
T  467 tcacataaactcaaaataagccaatc 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10471 - 10246
Alignment:
Q  24 taaaatatatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  10471 taaaatatatgttttgaaaatgtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttag 10372  T
Q  124 gcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagt 222  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||      
T  10371 gcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaac 10272  T
Q  223 ccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||    
T  10271 ccatataagctcaaaataagtcaatc 10246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 248
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23148
Alignment:
Q  57 agaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgcagcttatgaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  157 actatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaatc 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatc 23148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 247
Target Start/End: Original strand, 2 - 202
Alignment:
Q  48 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgca 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  2 gatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagca 101  T
Q  148 gcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagtagacaagtccacataagctcaaaataagccaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||  ||||||||    
T  102 gcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaa 201  T
Q  247 t 247  Q
    |    
T  202 t 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 248
Target Start/End: Original strand, 1 - 204
Alignment:
Q  47 ggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacatatgc 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  1 ggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagc 99  T
Q  147 agcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaggcttatgggagta---gacaagtccacataagctcaaaataag 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  100 agcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataag 198  T
Q  243 ccaatc 248  Q
     |||||    
T  199 tcaatc 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University