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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2188_low_9 (Length: 308)
Name: NF2188_low_9
Description: NF2188
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2188_low_9 |
 | |
|
| [»] chr3 (9 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0413 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] chr1 (6 HSPs) |
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|
| [»] chr4 (2 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold1838 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5004944 - 5004643
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
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| T |
5004944 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtcttttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaatttatatggtgaaattta |
5004845 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5004844 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
5004745 |
T |
|
| Q |
207 |
ttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccatgtggatgat |
306 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5004744 |
ttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccatgtggatgat |
5004645 |
T |
|
| Q |
307 |
ga |
308 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
5004644 |
ga |
5004643 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46404786 - 46404538
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46404786 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
46404687 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46404686 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatatctgtatgataatgttttgtggaatggc---------atttttctattcatatatgt |
46404596 |
T |
|
| Q |
207 |
ttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46404595 |
ttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
46404538 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 16975280 - 16975450
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16975280 |
cttaataagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtttgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
16975379 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgac |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16975380 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataattttatgtggaatgac |
16975450 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11968053 - 11967862
Alignment:
| Q |
68 |
acaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttat |
167 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
11968053 |
acaaaaaatctaaaatatgaatttatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatacgatgtgtgtat-aaaatgttcc |
11967955 |
T |
|
| Q |
168 |
gtggaatgacatttattttatttttctattcatatatg--tttttgtggtatt-gtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatga |
259 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11967954 |
gtagaatgacatttattttattttgatatgcatatatgtttttttgtggtattgggaaagaagtgtt--attttgttgataaactaaagaaatga |
11967862 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 16475304 - 16475381
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaata |
84 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16475304 |
cttactaagtactaagattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaata |
16475381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Original strand, 16975453 - 16975566
Alignment:
| Q |
204 |
tgtttttgtggtattgt-aaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatga--------aaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtc |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16975453 |
tgtttttgtggtattgttaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatatttcagtttggtt |
16975552 |
T |
|
| Q |
295 |
catgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
16975553 |
catgtggatgatga |
16975566 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 148
Target Start/End: Original strand, 8730913 - 8730966
Alignment:
| Q |
96 |
ggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtt-taattatattttatatgat |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8730913 |
ggtaaaatttaatcttttataaaagttattaattctcattatgttttatatgat |
8730966 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 148
Target Start/End: Original strand, 9082800 - 9082853
Alignment:
| Q |
96 |
ggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtt-taattatattttatatgat |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9082800 |
ggtaaaatttaatcttttataaaagttattaattctcattatgttttatatgat |
9082853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11937838 - 11937790
Alignment:
| Q |
260 |
aaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11937838 |
aaatatgagttttatgaaaatattttattttggttcatgtggatgatga |
11937790 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 25005170 - 25005428
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25005170 |
cttactaagtactaagattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaataagaattcatatggtaaaattta |
25005269 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25005270 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataattttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
25005369 |
T |
|
| Q |
207 |
ttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25005370 |
ttttgtggtattgttaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
25005428 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23260802 - 23260493
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23260802 |
cttactaagtattaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctcttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
23260703 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23260702 |
gccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtttgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
23260603 |
T |
|
| Q |
207 |
ttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatga--------aaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccat |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23260602 |
ttttgtggtattgttaaagaagtgttaga-tttgctgataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatatttcagtttggttcat |
23260504 |
T |
|
| Q |
298 |
gtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
23260503 |
gtggatgatga |
23260493 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32450487 - 32450177
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32450487 |
cttactaagtactaggattgtgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaatttta |
32450388 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
206 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32450387 |
actttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgt |
32450288 |
T |
|
| Q |
207 |
ttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatga--------aaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccat |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
32450287 |
ttttgtggtattgttaaagaagtgttagactttgttgataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatatttcattttggttcat |
32450188 |
T |
|
| Q |
298 |
gtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |
|
|
| T |
32450187 |
gtgcatgatga |
32450177 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 34636213 - 34636456
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34636213 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
34636312 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34636313 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggcatgacat--------tttttctattcatatatgt |
34636404 |
T |
|
| Q |
207 |
ttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34636405 |
ttttgtggtatt------aagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
34636456 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10751637 - 10751483
Alignment:
| Q |
154 |
tatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgtttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaat |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10751637 |
tatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgtttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaat |
10751538 |
T |
|
| Q |
254 |
aaatgaaaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10751537 |
aaatgaaaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
10751483 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26182673 - 26182602
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaa |
81 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26182673 |
tactaagtattaggatgatgttatgaattagagttagagattcttgtatgttgagaagaa-aaaacaactaaa |
26182602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 24992447 - 24992578
Alignment:
| Q |
12 |
taagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaacctt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24992447 |
taagtactagggatatgttatgaattataagtagaaattcttgt-ttttgaaaaga--aaaacaattaaaatatttctttacgtggtaaaatttattctt |
24992543 |
T |
|
| Q |
112 |
ttataaaagttattagtttaattatattttatatg |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24992544 |
ttataaaactgattattttaattaagttttatatg |
24992578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 34636450 - 34636483
Alignment:
| Q |
275 |
gaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34636450 |
gaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
34636483 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 8866 - 9124
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8866 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtataaattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcacatggtaaaattta |
8965 |
T |
|
| Q |
107 |
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205 |
Q |
| |
|
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|
|
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8966 |
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9065 |
T |
|
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206 |
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264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9066 |
tttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
9124 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 9118 - 9151
Alignment:
| Q |
275 |
gaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9118 |
gaaaatatttcagattggtccatgtggatgatga |
9151 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15874161 - 15873912
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15874161 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtatgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
15874062 |
T |
|
| Q |
107 |
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206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15874061 |
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15873970 |
T |
|
| Q |
207 |
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264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15873969 |
ttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaaata |
15873912 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21491720 - 21491408
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaa--caaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21491720 |
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21491621 |
T |
|
| Q |
107 |
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205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
21491620 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgcat-aaaatgttatgtagaatgacatttattttattttgatatgcatatatgt |
21491522 |
T |
|
| Q |
206 |
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294 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21491521 |
tttttttgtggtattgggaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaatatagtaatatgagttttatgaaaatatttcattttggtt |
21491422 |
T |
|
| Q |
295 |
catgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
21491421 |
catgtggatgatga |
21491408 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 22077661 - 22077860
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaac |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22077661 |
tactaagtactaggatgatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttaagaagaa--aaacaactaaaatataaatttatatggtaaaatttaac |
22077758 |
T |
|
| Q |
109 |
cttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgttt |
208 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22077759 |
catttcaaaaagttattagtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtagaatgacatttgctttattttcctatgcatatatgttt |
22077858 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18367545 - 18367294
Alignment:
| Q |
12 |
taagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaac-aaaac--aactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaac |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18367545 |
taagaactaggacgatgttatgaattaaaggtagagattcttgtttgttgaaaagaaagaaaaccaaattaaaatatgaatttatatggtaaaatttaac |
18367446 |
T |
|
| Q |
109 |
cttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatg--t |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |
|
|
| T |
18367445 |
cttttataaaagttattagtttaattatatttta-at------tatattaaaatgttacgtagaatgacatttattttattttgatatgcatatatgttt |
18367353 |
T |
|
| Q |
207 |
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264 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18367352 |
ttttgtggtattgggaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaata |
18367294 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 48576360 - 48576540
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaac |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48576360 |
tactaagtactgggataatgttatgaattagaggtagagattcttatccgttaaaaag---aaaataattaaaatatgaatttatatggtaaaatttaat |
48576456 |
T |
|
| Q |
109 |
cttttataaaagttattag-tttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttt |
191 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48576457 |
atcttattaaagttattagttttaattatatattatatgatgtgtgtatgataatgtgatgcagaatgacatttattctatttt |
48576540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48654450 - 48654339
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaac |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |
|
|
| T |
48654450 |
tactaagtactaggatgatgttgtgaattagaagtacaaattcttgtcttttggaaaga--aaaacaactaaaatatatatttaggtggtaatatttaac |
48654353 |
T |
|
| Q |
109 |
cttttataaaagtt |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |
|
|
| T |
48654352 |
agtttacaaaagtt |
48654339 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Original strand, 9993317 - 9993427
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |
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|
| T |
9993317 |
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9993416 |
T |
|
| Q |
107 |
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117 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
9993417 |
atattttataa |
9993427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35762274 - 35761964
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaac |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35762274 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtatgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaatttatatggtaaaatttaac |
35762175 |
T |
|
| Q |
109 |
cttttat--aaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt |
206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35762174 |
cttttataaaaaagttattagtttaactatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctatgcatatatgt |
35762075 |
T |
|
| Q |
207 |
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297 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35762074 |
ttttgtggtattgttaatgaagtgttagactttgtagataaactaaataaatgaaaatatagaaatatgtgttttatgaaaatatttcattttggttcat |
35761975 |
T |
|
| Q |
298 |
gtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
35761974 |
gtggatgatga |
35761964 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 138 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37667271 - 37667101
Alignment:
| Q |
138 |
ttttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgtttttgtggtattgtaaagaagtgttagactt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37667271 |
ttttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacttttattttatttttctattcatatatgtttttgtggtattgtaaagaagtgttagactt |
37667172 |
T |
|
| Q |
238 |
tgctgataaactaaataaatgaaaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37667171 |
tgctgataaactaaataaatgaaaatatgagttttatgaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
37667101 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9537576 - 9537377
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaac |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9537576 |
tactgagtactaggatgatgttatgaattagaggtatagattcttgtctgttgagaagaa--aaacaagtaaaatataaatttatattgtaaaatttaac |
9537479 |
T |
|
| Q |
109 |
cttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgttt |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
9537478 |
cttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtttgtatgataatgttatgtagaatgacatttatttcatgttgctatgcgtatatgttt |
9537379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37667374 - 37667265
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37667374 |
cttactaagtaataggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatgataaaattta |
37667275 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttata |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
37667274 |
accttttata |
37667265 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Original strand, 16074738 - 16074879
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatg---ttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattt |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16074738 |
tactaagtactgggatgatgatattatgaattagagatagagatttttgtccgttaaaaagaa--aaacaattaaaatatgaattcatatgttaaaattt |
16074835 |
T |
|
| Q |
106 |
aaccttttataaaagttattag-tttaattatattttatatgat |
148 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16074836 |
aatcttttataaaagttattagatttaattatattttatatgat |
16074879 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 190
Target Start/End: Original strand, 16074874 - 16074910
Alignment:
| Q |
154 |
tatgataatgttatgtggaatgacatttattttattt |
190 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16074874 |
tatgataatgtaatgtagaatgacatttattttattt |
16074910 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Original strand, 536895 - 537089
Alignment:
| Q |
62 |
aaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataa |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
536895 |
aaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataa |
536994 |
T |
|
| Q |
162 |
tgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgtttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaa |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
536995 |
tgttatgtggaatggcat--------tttttctattcatatatgtttttgtggtattgtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatgaaa |
537086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4558195 - 4557884
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaaga-acaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaa |
107 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4558195 |
tactaagtattaggatgatgttatgatttagaggtagagattcttgtctgttgagaagagagaaaaaaactaaaatatgaatttatatggtaaaatttaa |
4558096 |
T |
|
| Q |
108 |
ccttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgt- |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
4558095 |
ccttttataaaagttattagtttaatcatattttatataatgtgtgtataataatgttacgtagaatgacttttattttattttgatatgcatatatgtt |
4557996 |
T |
|
| Q |
207 |
-ttttgtggtattg-taaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatga--------aaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtcca |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
4557995 |
tttttgtggtattgagaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaatatataaatatgagttttatgaaaatatttcattttggttca |
4557896 |
T |
|
| Q |
297 |
tgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
|
|
| T |
4557895 |
tgtggatgatga |
4557884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 536756 - 536891
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
536756 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
536855 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatatttta |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
536856 |
accttttataaaagttattagtttaattatatttta |
536891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 537083 - 537116
Alignment:
| Q |
275 |
gaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
537083 |
gaaaatatttcagtttggtccatgtggatgatga |
537116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Original strand, 49499045 - 49499348
Alignment:
| Q |
14 |
agtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaacctttt |
113 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
49499045 |
agtactaggatcatgttatgaattagaggtggagattcttgtctgttgagaagaaaaaaaaaactaaaatatgaatttatatagtaaaatttaacctttt |
49499144 |
T |
|
| Q |
114 |
ataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatg-tttttgt |
212 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
49499145 |
ataaaaattattagtttaattatattttatataatgtgtgtat-aagatgttacgtagaatgacatttattttattttgatatgcatatatgttttttgt |
49499243 |
T |
|
| Q |
213 |
ggtatt-gtaaagaagtgttagactttgctgataaactaaataaatga--------aaatacgagttttacgaaaatatttcagtttggtccatgtggat |
303 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49499244 |
ggtattgggaaagaagtgttggattttgttgataaactaaagaaatgaaaatatagaaatatgagttttatgaaaatatttcattttggttcatgtggat |
49499343 |
T |
|
| Q |
304 |
gatga |
308 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
49499344 |
gatga |
49499348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28969403 - 28969204
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaac |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28969403 |
tactaagtactaggatgatgttatgaattagaggtagaaattcttgtctgttgagaagaa--aaacaactaaaatattaatttatatggtaaaatttaac |
28969306 |
T |
|
| Q |
109 |
cttttataaaagttattagtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatatgttt |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28969305 |
attttataaaagttattagtttaattatattctatatgatgtgtgtatgataattttatgtagaatgacatttattttattttgctatgcatatatgttt |
28969206 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1838 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1838
Description:
Target: scaffold1838; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 221 - 397
Alignment:
| Q |
26 |
atgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttatt |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
221 |
atgttatgaattagagatagagattcttgtttgttaaaaagaa--aaataattaaaatataaatctatatggtaaaatttaaccttttataaaagttatt |
318 |
T |
|
| Q |
126 |
agtttaattatattttatatgatgtctgtatgataatgttatgtggaatgacatttattttatttttctattcatatat |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
319 |
agtttaattatattttatatgatgtgtgtatgataatgttatgtagaatgccatttattttattttgccatgcatatat |
397 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32735516 - 32735391
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32735516 |
cttactaagtgctaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgcattcatatggtgaaattta |
32735417 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaa |
132 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32735416 |
accttttataaaagatattagtttaa |
32735391 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28267766 - 28267692
Alignment:
| Q |
9 |
tactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatat |
85 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28267766 |
tactaagtactaggatgatgttgtgaattagaagtacaaattcttatcttttgaaaaga--aaaacaactaaaatat |
28267692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 140
Target Start/End: Original strand, 29270702 - 29270792
Alignment:
| Q |
48 |
attcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattt |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | | | || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29270702 |
attcttgtcttttgaaaagaa--aaacaattaaaatatgtagttacatagtaaaatttaatattttataaaaattattattttaattatattt |
29270792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 1193624 - 1193765
Alignment:
| Q |
7 |
cttactaagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaattta |
106 |
Q |
| |
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|||||||||| |||| | | |||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||| | || |
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| T |
1193624 |
cttactaagtgctagtactttgttattaaacaggggtagcaattcttgtcttttgaaaagaagaaaacaattaaaatatttatttacatggtaaagtcta |
1193723 |
T |
|
| Q |
107 |
accttttataaaagttattagtttaattatattttatatgat |
148 |
Q |
| |
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| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |
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| T |
1193724 |
atattttataagagtgattattttaattgagttttatatgat |
1193765 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12775024 - 12774954
Alignment:
| Q |
13 |
aagtactaggattatgttatgaattagaggtagagattcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatat |
85 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
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| T |
12775024 |
aagtactaggatgatgttgtgaattagaagtacaaattcttatcttttggaaaga--aaaacaactaaaatat |
12774954 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Original strand, 35839168 - 35839268
Alignment:
| Q |
48 |
attcttgtctgttgaaaagaacaaaacaactaaaatatgaattcatatggtaaaatttaaccttttataaaagttattagtttaattatattttatatga |
147 |
Q |
| |
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| T |
35839168 |
attcttgtcttttgaaaagaagaaaacaattaaaatatttatttacatggtaaaatctaatattttataagagtgattattttaattgagttttatatga |
35839267 |
T |
|
| Q |
148 |
t |
148 |
Q |
| |
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| |
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| T |
35839268 |
t |
35839268 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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