View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2191_high_2 (Length: 539)

Name: NF2191_high_2
Description: NF2191
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2191_high_2
NF2191_high_2
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (19-528)||(43240877-43241386)
chr1 (19-524)||(49347889-49348395)
chr1 (19-524)||(51441260-51441765)
chr1 (19-516)||(8671210-8671706)
chr1 (19-412)||(51601451-51601844)
chr1 (19-395)||(32083241-32083617)
chr1 (21-528)||(37463363-37463867)
chr1 (21-238)||(1210312-1210529)
chr1 (22-500)||(35828892-35829370)
chr1 (17-528)||(34827596-34828090)
chr1 (24-219)||(27445484-27445679)
chr1 (100-470)||(46226889-46227251)
chr1 (19-124)||(30202626-30202731)
chr1 (105-528)||(40418959-40419381)
chr1 (19-224)||(32066767-32066969)
chr1 (19-151)||(19936175-19936308)
chr1 (184-499)||(7813802-7814115)
chr1 (408-526)||(29173414-29173532)
chr1 (30-158)||(7921574-7921702)
chr1 (19-159)||(28528227-28528367)
chr1 (33-159)||(6640772-6640898)
chr1 (19-153)||(51234267-51234400)
chr1 (24-204)||(52421031-52421209)
chr1 (20-173)||(12807583-12807737)
chr1 (24-155)||(52739968-52740098)
chr1 (364-477)||(3877268-3877380)
chr1 (400-499)||(45833866-45833965)
chr1 (19-73)||(22089826-22089880)
chr1 (24-76)||(9592463-9592515)
chr1 (310-355)||(13820549-13820594)
chr1 (381-500)||(13027348-13027466)
chr1 (362-437)||(16142666-16142741)
chr1 (418-528)||(32405359-32405469)
chr1 (102-258)||(52641033-52641186)
chr1 (73-329)||(16142399-16142649)
chr1 (310-405)||(28527981-28528076)
chr1 (362-437)||(52836517-52836592)
chr1 (122-168)||(32405083-32405129)
chr1 (368-421)||(16273664-16273717)
chr1 (23-96)||(46226782-46226854)
chr1 (19-50)||(8391525-8391556)
chr1 (106-165)||(16273415-16273471)
chr1 (156-257)||(32405146-32405247)
chr1 (19-96)||(52640921-52640998)
chr1 (364-421)||(52641283-52641340)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (19-527)||(36651272-36651780)
chr7 (19-528)||(46356347-46356856)
chr7 (19-524)||(33350302-33350807)
chr7 (19-528)||(11593230-11593746)
chr7 (19-528)||(39906871-39907384)
chr7 (37-524)||(49028562-49029035)
chr7 (20-528)||(32629885-32630380)
chr7 (19-367)||(31004662-31005009)
chr7 (19-348)||(37616373-37616702)
chr7 (19-407)||(36869785-36870173)
chr7 (42-528)||(24177714-24178200)
chr7 (218-469)||(38896947-38897198)
chr7 (21-272)||(38606539-38606789)
chr7 (19-247)||(48918946-48919174)
chr7 (317-528)||(38606315-38606526)
chr7 (25-118)||(35906703-35906796)
chr7 (400-528)||(36870201-36870329)
chr7 (329-528)||(20499387-20499585)
chr7 (388-478)||(22346776-22346866)
chr7 (308-500)||(24426274-24426465)
chr7 (329-528)||(48055623-48055821)
chr7 (19-92)||(43281389-43281462)
chr7 (319-411)||(21520229-21520320)
chr7 (19-93)||(33072666-33072740)
chr7 (29-431)||(43793549-43793941)
chr7 (21-158)||(21517823-21517959)
chr7 (17-152)||(18608187-18608319)
chr7 (17-152)||(18637233-18637365)
chr7 (17-152)||(18650668-18650800)
chr7 (21-117)||(418907-419002)
chr7 (275-421)||(23087867-23088013)
chr7 (374-418)||(38896906-38896950)
chr7 (19-66)||(34869159-34869206)
chr7 (29-159)||(24550195-24550320)
chr7 (45-152)||(18626559-18626663)
chr7 (302-386)||(48918817-48918906)
chr7 (20-115)||(23087599-23087694)
chr7 (302-430)||(17101265-17101385)
chr7 (24-61)||(25579577-25579614)
chr7 (28-96)||(12965652-12965720)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (19-528)||(36565737-36566246)
chr8 (19-528)||(36544428-36544938)
chr8 (17-452)||(12492336-12492771)
chr8 (17-528)||(42854498-42855018)
chr8 (20-528)||(15215768-15216277)
chr8 (19-231)||(4032990-4033202)
chr8 (24-441)||(18849628-18850036)
chr8 (21-438)||(13588807-13589224)
chr8 (25-220)||(8879936-8880131)
chr8 (184-484)||(13983954-13984251)
chr8 (29-438)||(41444809-41445219)
chr8 (24-421)||(28300609-28301002)
chr8 (19-168)||(13984672-13984820)
chr8 (19-219)||(25985128-25985326)
chr8 (28-175)||(29735447-29735587)
chr8 (364-500)||(3284797-3284934)
chr8 (27-181)||(18124802-18124954)
chr8 (19-264)||(33830729-33830971)
chr8 (17-156)||(19293774-19293913)
chr8 (21-224)||(38667140-38667341)
chr8 (24-92)||(25439249-25439317)
chr8 (17-181)||(6510911-6511074)
chr8 (24-153)||(30113697-30113827)
chr8 (396-498)||(45231795-45231897)
chr8 (304-435)||(39706943-39707073)
chr8 (75-153)||(45332039-45332117)
chr8 (19-92)||(25299950-25300023)
chr8 (383-444)||(25984909-25984970)
chr8 (19-80)||(37077490-37077551)
chr8 (109-158)||(43732230-43732279)
chr8 (19-92)||(25288613-25288688)
chr8 (21-61)||(39946601-39946641)
chr8 (139-246)||(35094763-35094870)
chr8 (33-87)||(42493812-42493866)
chr8 (29-70)||(30748232-30748273)
chr8 (131-159)||(3285135-3285163)
chr8 (25-117)||(35601686-35601777)
chr8 (468-500)||(39706880-39706912)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (19-528)||(20318268-20318777)
chr5 (21-511)||(1274559-1275049)
chr5 (17-523)||(1288083-1288589)
chr5 (19-527)||(2075970-2076478)
chr5 (19-528)||(24177801-24178310)
chr5 (21-415)||(10638688-10639081)
chr5 (19-494)||(12492883-12493333)
chr5 (19-528)||(3393988-3394496)
chr5 (19-528)||(3301126-3301635)
chr5 (20-391)||(28977354-28977725)
chr5 (19-206)||(16347899-16348085)
chr5 (21-498)||(43558312-43558774)
chr5 (133-471)||(27265-27602)
chr5 (22-223)||(27302449-27302647)
chr5 (17-181)||(36200406-36200570)
chr5 (100-436)||(37123938-37124275)
chr5 (70-252)||(17341748-17341930)
chr5 (73-424)||(25937459-25937804)
chr5 (28-106)||(43423578-43423656)
chr5 (302-495)||(31502825-31503019)
chr5 (17-152)||(38578998-38579130)
chr5 (33-159)||(6368435-6368561)
chr5 (19-69)||(34272758-34272808)
chr5 (319-500)||(35685160-35685340)
chr5 (19-159)||(21915532-21915672)
chr5 (320-467)||(40383794-40383941)
chr5 (19-95)||(20077313-20077389)
chr5 (133-225)||(23979812-23979904)
chr5 (369-440)||(30418761-30418833)
chr5 (21-159)||(3096828-3096960)
chr5 (25-81)||(28676253-28676308)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (20-528)||(51448206-51448714)
chr3 (82-528)||(52138105-52138551)
chr3 (19-528)||(38849371-38849880)
chr3 (19-333)||(47542207-47542521)
chr3 (19-357)||(25190827-25191165)
chr3 (100-524)||(9258167-9258584)
chr3 (53-405)||(19736569-19736914)
chr3 (17-471)||(27916905-27917360)
chr3 (27-420)||(29816890-29817282)
chr3 (145-405)||(19757387-19757644)
chr3 (20-500)||(48221086-48221569)
chr3 (19-149)||(28245093-28245223)
chr3 (53-222)||(19757651-19757820)
chr3 (21-158)||(26489964-26490101)
chr3 (17-128)||(54425400-54425511)
chr3 (316-474)||(50630114-50630272)
chr3 (32-221)||(44395014-44395200)
chr3 (19-161)||(30345175-30345313)
chr3 (133-224)||(43111626-43111717)
chr3 (29-159)||(46145799-46145929)
chr3 (350-419)||(26388153-26388222)
chr3 (194-228)||(805519-805553)
chr3 (109-159)||(1470683-1470733)
chr3 (458-500)||(19736520-19736562)
chr3 (101-155)||(32490302-32490356)
chr3 (34-158)||(30724311-30724435)
chr3 (305-421)||(43111798-43111914)
chr3 (27-74)||(3186500-3186547)
chr3 (305-368)||(24302292-24302355)
chr3 (102-168)||(1448192-1448258)
chr3 (458-500)||(19757338-19757380)
chr3 (19-52)||(52138553-52138586)
chr3 (102-158)||(1426102-1426158)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (19-528)||(435509-436015)
chr4 (19-528)||(23906797-23907307)
chr4 (19-528)||(1777511-1778021)
chr4 (19-528)||(48623023-48623532)
chr4 (19-528)||(27450669-27451178)
chr4 (19-357)||(56374738-56375076)
chr4 (19-357)||(53707242-53707580)
chr4 (21-528)||(39707740-39708241)
chr4 (19-311)||(48174589-48174881)
chr4 (18-304)||(31960309-31960595)
chr4 (19-209)||(33226805-33226995)
chr4 (19-369)||(16002350-16002714)
chr4 (353-528)||(53703887-53704062)
chr4 (21-206)||(47265703-47265887)
chr4 (233-451)||(1212017-1212235)
chr4 (24-151)||(50286625-50286752)
chr4 (109-528)||(55768963-55769387)
chr4 (29-471)||(10775928-10776367)
chr4 (109-528)||(55833219-55833643)
chr4 (19-103)||(46583320-46583404)
chr4 (18-423)||(3272811-3273209)
chr4 (19-150)||(1211886-1212017)
chr4 (17-393)||(17666532-17666895)
chr4 (39-421)||(17667845-17668221)
chr4 (30-422)||(30852809-30853191)
chr4 (25-247)||(20917540-20917762)
chr4 (17-156)||(54787739-54787878)
chr4 (70-224)||(41427420-41427574)
chr4 (19-80)||(43433643-43433704)
chr4 (72-159)||(30807244-30807331)
chr4 (28-152)||(1629084-1629208)
chr4 (63-156)||(42037510-42037603)
chr4 (30-158)||(7092719-7092847)
chr4 (63-159)||(39754911-39755007)
chr4 (25-92)||(41009855-41009922)
chr4 (17-84)||(45185475-45185542)
chr4 (310-440)||(32911613-32911743)
chr4 (372-528)||(44860386-44860541)
chr4 (304-471)||(42037242-42037409)
chr4 (24-96)||(35690019-35690086)
chr4 (25-155)||(55578687-55578814)
chr4 (191-258)||(35555989-35556056)
chr4 (304-429)||(15183431-15183556)
chr4 (63-116)||(54914728-54914781)
chr4 (326-443)||(41427202-41427321)
chr4 (345-475)||(21060105-21060233)
chr4 (26-131)||(52280701-52280806)
chr4 (19-95)||(8917823-8917899)
chr4 (30-70)||(22421216-22421256)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (19-528)||(452118-452621)
chr2 (19-528)||(2609805-2610314)
chr2 (17-528)||(38453114-38453623)
chr2 (19-528)||(8180072-8180566)
chr2 (20-528)||(24584103-24584611)
chr2 (19-525)||(45368120-45368627)
chr2 (133-403)||(12475031-12475301)
chr2 (19-267)||(4807130-4807378)
chr2 (34-339)||(41763560-41763865)
chr2 (17-358)||(30743070-30743411)
chr2 (19-216)||(3865661-3865858)
chr2 (19-239)||(11992602-11992822)
chr2 (36-522)||(37281388-37281878)
chr2 (339-528)||(16291990-16292179)
chr2 (19-189)||(3244147-3244312)
chr2 (23-492)||(13148635-13149095)
chr2 (24-500)||(14769604-14770077)
chr2 (322-500)||(876462-876637)
chr2 (19-225)||(17581052-17581254)
chr2 (29-158)||(33594775-33594904)
chr2 (17-96)||(6238247-6238326)
chr2 (104-258)||(876679-876833)
chr2 (33-252)||(12904522-12904740)
chr2 (104-222)||(36038803-36038921)
chr2 (102-264)||(13592930-13593089)
chr2 (302-482)||(6465076-6465259)
chr2 (291-335)||(11992853-11992897)
chr2 (19-60)||(41197724-41197765)
chr2 (350-521)||(12904254-12904424)
chr2 (109-175)||(23866285-23866351)
chr2 (394-444)||(34502165-34502215)
chr2 (32-96)||(7292697-7292761)
chr2 (120-168)||(26433840-26433888)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (19-528)||(30745-31254)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (23-537)||(9706044-9706558)
chr6 (17-445)||(5258644-5259073)
chr6 (20-528)||(20428133-20428642)
chr6 (24-414)||(5631208-5631599)
chr6 (137-528)||(30670165-30670556)
chr6 (17-343)||(10100351-10100678)
chr6 (293-528)||(6082677-6082912)
chr6 (19-380)||(33495632-33495983)
chr6 (172-525)||(2680699-2681049)
chr6 (17-528)||(26291059-26291567)
chr6 (19-492)||(27790469-27790942)
chr6 (187-469)||(2208066-2208348)
chr6 (17-148)||(2689313-2689444)
chr6 (345-469)||(3629566-3629690)
chr6 (104-176)||(3632645-3632717)
chr6 (19-60)||(607904-607945)
chr6 (447-528)||(5260172-5260253)
chr6 (29-96)||(6641916-6641983)
chr6 (302-423)||(9369179-9369301)
chr6 (395-499)||(17222490-17222594)
chr6 (23-90)||(6056270-6056337)
chr6 (19-59)||(30679220-30679260)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (19-373)||(12094-12442)
scaffold0113 (383-523)||(13116-13258)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (114-528)||(88514-88927)
scaffold0045 (20-118)||(87106-87204)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (19-213)||(2766-2960)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (17-178)||(82348-82509)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (187-469)||(165-447)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (100-181)||(5816-5897)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (321-453)||(25011-25144)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (345-471)||(9002-9128)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (254-438)||(48641-48827)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (19-92)||(81-156)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 43240877 - 43241386
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43240877 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttccatttctccgtcattttgtacgaaggatccaagatatttaaac 43240976  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43240977 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagatctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 43241076  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43241077 tactcaagtggaatccatacgcttctaaggcttacctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 43241176  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43241177 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 43241276  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43241277 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcgtgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcc 43241376  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  43241377 taaccccttt 43241386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 524
Target Start/End: Original strand, 49347889 - 49348395
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347889 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacacctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 49347988  T
Q  119 c-gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgctt 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49347989 cagtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattcgatatactccgtcttgctt 49348088  T
Q  218 ctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctg 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  49348089 ctactcaagcagaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccgagactacatcatcta 49348188  T
Q  318 caaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49348189 caaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggctgacccttggtgcaa 49348288  T
Q  418 tcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  49348289 tcctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcatgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatc 49348388  T
Q  518 ctaaccc 524  Q
    |||||||    
T  49348389 ctaaccc 49348395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 524
Target Start/End: Original strand, 51441260 - 51441765
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51441260 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttagatctgcttctatttctccgtcattttgtatgaaagacccaagatatttaaac 51441359  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51441360 tgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcaccttcaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 51441459  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51441460 tactcaagcggaatccatactcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 51441559  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51441560 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagaaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 51441659  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  51441660 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcttgcgtcctcacactaatcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaattc 51441759  T
Q  519 taaccc 524  Q
    ||||||    
T  51441760 taaccc 51441765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 8671706 - 8671210
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671706 tgagtctcttctccattttaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 8671607  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671606 cgtgtaacttagggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 8671507  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671506 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaagtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 8671407  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8671406 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacat-caaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgaccctaggtgcaat 8671308  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaat 516  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  8671307 tctattgttatgggaaaatcttcgatagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatatagacaat 8671210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 51601844 - 51601451
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51601844 tgagactcttctctatttccaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 51601745  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51601744 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttt 51601645  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51601644 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 51601545  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttgg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51601544 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagatatggacttagggttgacccttgg 51601451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 395
Target Start/End: Original strand, 32083241 - 32083617
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  32083241 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatttgcctctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaat 32083340  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32083341 tgtgcaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 32083440  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |  ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||    
T  32083441 tactcaggcggaaaccatacgcttctgaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagcaagattacatcatttgc 32083540  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggac 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32083541 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggac 32083617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 528
Target Start/End: Original strand, 37463363 - 37463867
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |    
T  37463363 aggctcttctccatatcaaccacctagcttaaatacaatgatatacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggactcaagatatttaaactg 37463462  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37463463 tgtaactcggagtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga---actccggcttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgtttcta 37463559  T
Q  221 ctcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaa 320  Q
    |  |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||   |||| |||| ||||| ||||  | | || |||||| ||||||||||    
T  37463560 caaaagcagaagccatacacttctaaggcttgtctcaaagtctctaacctcccattcatttccaccctcgactcttcaagcaggactacgtcatctgcaa 37463659  T
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37463660 aaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtaagaacatccaaaactaaagtaaaaaggtaagggcttagggttgacccttggtgcaatcc 37463759  T
Q  421 tattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatccta 520  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||    
T  37463760 tattgttataggaaaatcatcggtaggcccctcctgcatcctcacactagttgcagctccctcatacacatccttgatagctctagtataagcaatccta 37463859  T
Q  521 accccttt 528  Q
    ||||||||    
T  37463860 accccttt 37463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1210529 - 1210312
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1210529 aggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttttatttctccatcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactg 1210430  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210429 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 1210330  T
Q  221 ctcaagcggaatccatac 238  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1210329 ctcaagcggaatccatac 1210312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 500
Target Start/End: Original strand, 35828892 - 35829370
Alignment:
Q  22 ggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||||| | |     
T  35828892 ggctcttttccatttcaaccacacagatcgaattcgatgatttacatatgcttctatttctccgtcgctttgtactatggacccaagatgtttaagcagc 35828991  T
Q  122 gtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctac 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    |||  ||| || ||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  35828992 gtaacttgtggtatgatatgatctctagctttcacctccaaggtagaactactatgtcttttgctaaaattacatttcatatactttgtcttgcttgtac 35829091  T
Q  222 tcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 321  Q
    |||||   |  ||||| ||||||| | |||| ||| | ||||| | ||||   |||| |||||| ||| |||| || | || ||| ||||| | |||| |    
T  35829092 tcaagaaaatgccatatgcttctaggacttgtctcaaagtctccaacctcccattcaattcctctctcgactctccaagcaggacgacatcttgtgcaca 35829191  T
Q  322 aagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||   | ||| ||| || |||| | |||| |||||||||||||||    
T  35829192 aagcatacatatcggtgctagctcttggatgtgttctgtaagtacatccaaaactaagttagaaatatatgggcttaagtttgatccttggtgcaatcct 35829291  T
Q  422 attgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  35829292 attgttatgggaaaatcgtcggcgaccccatcttgtgtactcacactagttgaagtcccctcatgcatatatttgatag 35829370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 528
Target Start/End: Original strand, 34827596 - 34828090
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34827596 catgaggctcttctccatttcaaccattcaacttgaatacaatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaa 34827695  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   | |  | |||||| |||  | |||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  34827696 accttgtaacttagggtatgatatgatctcccactttcacctccatcatgggaccacttcttcttttgatgaagttacattccatatactttgtcttagt 34827795  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    |||||| |  || ||  |||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||   |||| |||||| ||| |||| || | |||||||             
T  34827796 tctacttagtcgaaagtcataggcttctaaggcttgtctctaagtctctaacctcccattcaattcctctctcgactctccaagcaagact--------- 34827886  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
           ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||  || |  |||||||||||||||| |||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||    
T  34827887 -------gcataaatcttgatgctaactcttggatgtgttatgtaagaacatccaaaactaaagtaaaaaagtaaggtcttaagattgatcctt-gtgca 34827978  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag-tcgtaatataggcaa 515  Q
    | ||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||    
T  34827979 agcctattgttattggaaaatcattggtaacctcatcttgagtcctcacactagtggaggccccctcatacatatcttggatagatcg-aatataagcaa 34828077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27445679 - 27445484
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgt 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  27445679 ctcttctccatttcaaccaaccaacttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcattttgtactatggacccaacataattaaaccgtgt 27445580  T
Q  124 aacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27445579 aacttggggtatgataagatctccaactttcacctgcaaggtaaagctacttcttctttgactaaagttacattccatatactccgtgtttcttct 27445484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 470
Target Start/End: Original strand, 46226889 - 46227251
Alignment:
Q  100 ggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||   ||||  |||||||||||||| |    
T  46226889 ggacccaagatatttaaaccgtgtaactcaaggtatggtatgatctccaacttgcacctccaaagtagtactactctgccttttgctgaagttacatttc 46226988  T
Q  200 atatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcaccca 299  Q
    ||| |||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||        |||||| ||||   |||| || ||||||| |||| || |    
T  46226989 ataaactttgttttgcttctactcaggcggaaaccatacgcttctaaaacttg--------tctctaacctcctattcaatttctccctcgactctccaa 46227080  T
Q  300 ccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttag 399  Q
      | | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  46227081 atagggctacatcatatgcaaaaggcatacatcttggtgctaactcttggacgtgtttcgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaaggtaagggcttag 46227180  T
Q  400 ggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactag 470  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||| ||||||| | | ||| ||||||||||    
T  46227181 ggttgatccttggtgcaactctattattataagaaaatcgtcggcagccccaccctacgttctcacactag 46227251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Original strand, 30202626 - 30202731
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202626 tgaggctcttctccatttcaaccacccggcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 30202725  T
Q  119 cgtgta 124  Q
    ||||||    
T  30202726 cgtgta 30202731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 40419381 - 40418959
Alignment:
Q  105 caagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatata 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||    
T  40419381 caagatatttaaactgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatata 40419282  T
Q  205 ctccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttc-acttcctccctcaactcacccaccaa 303  Q
    ||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||   ||  | ||| ||| || ||||  | |  |     
T  40419281 ctatgtcgtgcttctactcgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtag 40419182  T
Q  304 gactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggtt 403  Q
    |||||||||||   ||||||||| || ||| |||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  40419181 gactacatcataa-caaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgtt 40419083  T
Q  404 gacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcg 503  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||  |  | ||||||| ||||||||| ||||       
T  40419082 gaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctc 40418984  T
Q  504 taatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    |||||||||| | |||||| |||||    
T  40418983 taatataggccaccctaacaccttt 40418959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 32066767 - 32066969
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  32066767 tgaggctcttctccattttaaccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaatatttaaac 32066866  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| || ||||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  32066867 tgtgtaactt---gtatgatatgatctccaattttcacctctaaggtagaactacttcaccttttgctaaaattacattacatatactatgtcatgcttc 32066963  T
Q  219 tactca 224  Q
    ||||||    
T  32066964 tactca 32066969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19936308 - 19936175
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtca-ttttgtacgaaggacccaagatatttaaa 117  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19936308 tgaggttcttatccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatatgcttctatttctccttcatttttgtattatggacccaagatatttaaa 19936209  T
Q  118 ccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaact 151  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936208 ccatgtaacttggggtatgatatgatctccaact 19936175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 7814115 - 7813802
Alignment:
Q  184 gctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcc 283  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||   |||| ||||    
T  7814115 gctgaaattacatttcatatactctgtcttgcttctactcaagcggaagccatacacttataaggcttgtctccaagtctc-aacctcccattcaattcc 7814017  T
Q  284 tccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaa 383  Q
    |||||| |||| |  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||  ||||||| ||||   | | ||||||||||||||||  ||    
T  7814016 tccctcgactctcgaagcatgactacatcatctgcaaaaaacatacatctcaatgttaattcttggat-tgttttttaagtacatccaaaactaaaataa 7813918  T
Q  384 aaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctc 483  Q
    |||||||| | |||| |||  ||| ||||||||||| || | | |||| |||||  ||||||  | ||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  7813917 aaagataaaggcttatggtaaacctttggtgcaatcatactttcatggaaaaatagtcggtaatctcatattgcgttctcatactagtcgaagctctctc 7813818  T
Q  484 atacatatccttgata 499  Q
    |||||| |||||||||    
T  7813817 atacatgtccttgata 7813802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 526
Target Start/End: Original strand, 29173414 - 29173532
Alignment:
Q  408 cttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaat 507  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||| |||||||   ||||    
T  29173414 cttgatgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcatgcgtcctcacactagtcgaaacttccccatgcatatcattgatagctctaat 29173513  T
Q  508 ataggcaatcctaacccct 526  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29173514 ataggcaatcctaacccct 29173532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7921702 - 7921574
Alignment:
Q  30 tccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  7921702 tccatttcaacaacccaacttgaattcgatggtttacatctccttctatttctcaatcgttttgtactatggatccaagatatataaatcgtgtaacttg 7921603  T
Q  130 gggtatgatatgatctccaactttcacct 158  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7921602 tggtaagatatgatctccaactttcacct 7921574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28528367 - 28528227
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| || ||||||||||||| |  |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  28528367 tgaggcactcctcaatttcaaccacccagctcggattcgatggtttacacctccttctatttctccattgttttgtaacatagacccaagatatttaaac 28528268  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28528267 tgtgtaacttgtggtatgctatgatctccaactttcacctc 28528227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6640898 - 6640772
Alignment:
Q  33 atttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggg 132  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6640898 atttcaaccacccaacttggatccaatggtttacacctccttctatttctccataattttgtactatagactcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgg 6640799  T
Q  133 tatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||    
T  6640798 tgtaatatgatctctaactttcacctc 6640772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 51234400 - 51234267
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||    
T  51234400 tgaggctattctccatttcaaccacccaacttgaatttgatgatttacatctgcttcaatttctccatcattttgcactatggactcaagatatttaaac 51234301  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaacttt 153  Q
      || ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  51234300 tatgaaactt-gtttatgatatgatctccaacttt 51234267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52421209 - 52421031
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgt 123  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||| |||||||  ||| |||||||| || |||||||| |||||||||  |||    
T  52421209 ctcttctctatttcaaccacccaacttgaattcgatgattaacatatgcttttatttctatgtc-ttttgtactaaagacccaagctatttaaact-tgt 52421112  T
Q  124 aacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatata 204  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||  |||||| || |||| ||||||    
T  52421111 aacttgtggcatgatatgatctctaactttcacctataaggtagagatacttcaccttttgctgaaattccatttcatata 52421031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 12807583 - 12807737
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaa-ccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||     
T  12807583 gaggctcttctccatttcaaaccacctagaataaattcgatgatttacatcagcttctatttcttcgtcgttttatactatggatccaagatatttaaat 12807682  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctac 173  Q
     ||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12807683 tgtgtaacttgtagtatgatacgatcctcaactttcacctctaaggtagaactac 12807737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Original strand, 52739968 - 52740098
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgt 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |  |||| ||||| ||||||||     
T  52739968 ctcttctccatttcaaccatccaacttgagtaagatgacttacatctacttctatttctccgtcactttgtactataggtccaaaatattcaaaccgtgc 52740067  T
Q  124 aacttggggtatgatatgatctccaactttca 155  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  52740068 aactt-aagcatgatatgatctccaactttca 52740098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 3877380 - 3877268
Alignment:
Q  364 tacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctc 463  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | |||  || |||| |||||||||    
T  3877380 tacatccaaaactaaggtaaaaagatatggactaagg-ttgatccttgatgcaatcatattgttacgggaaaatcgttggtgacctcatcgtgcgtcctc 3877282  T
Q  464 acactagttgaagc 477  Q
    ||||||||||||||    
T  3877281 acactagttgaagc 3877268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 45833965 - 45833866
Alignment:
Q  400 ggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgata 499  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45833965 ggttgacccttgatacaatcttattgttatggaaaaatcgtcaatagccacatcctgcgtcctcacattagtcgaagctccctcatatatatctttgata 45833866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22089880 - 22089826
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgct 73  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22089880 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctgct 22089826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9592515 - 9592463
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9592515 ctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacctctgcttct 9592463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13820594 - 13820549
Alignment:
Q  310 atcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13820594 atcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgt 13820549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 500
Target Start/End: Original strand, 13027348 - 13027466
Alignment:
Q  381 caaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctcc 480  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||| | |||| || |||| | ||||| |||||||||| ||| |||    
T  13027348 caaaaagataagaacttatgattgaccattggtgaaatcctattgttctacgaaaatcgt-ggtaacctcatcctacgtccgcacactagttaaagttcc 13027446  T
Q  481 ctcatacatatccttgatag 500  Q
     | |||||||||||||||||    
T  13027447 gttatacatatccttgatag 13027466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Original strand, 16142666 - 16142741
Alignment:
Q  362 aatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaat 437  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16142666 aatatatcaaaaactaaagtaaaaagataaggtcttaggtttgacctttgatgcaatcctattgttacgagaaaat 16142741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 418 - 528
Target Start/End: Original strand, 32405359 - 32405469
Alignment:
Q  418 tcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatc 517  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| |||||| ||||||  |||||||| | ||| ||||||| ||||   ||||||| |||||     
T  32405359 tcctattgttatgagaaaatcttctgtaaccccattctgcatcctcaaactagtcaaagctcccgcgtacgtatcctttatagctctaatataagcaatt 32405458  T
Q  518 ctaaccccttt 528  Q
    |||||||||||    
T  32405459 ctaaccccttt 32405469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 258
Target Start/End: Original strand, 52641033 - 52641186
Alignment:
Q  102 acccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccat 201  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||    |||| ||||| | |||    
T  52641033 acccaatatatttaaattgtgtaacttg---tatgatatgatctccaactttcacctctaaggtcgaactacttcgccttttattgaaattacactacat 52641129  T
Q  202 atactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctcca 258  Q
    ||| |  || |||||| ||||||| || ||| | |||||||| ||| |||| |||||    
T  52641130 atattatgtattgcttttactcaaacgaaattcgtacgcttccaagacttgtctcca 52641186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 329
Target Start/End: Original strand, 16142399 - 16142649
Alignment:
Q  73 ttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaccta 172  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||| ||| || ||     
T  16142399 ttctttttcttcgtcattttgtattatgaacccaagatatttaaaatgtgtcacttgggatatgatatgccctcccaccttcacctccatggtggaactt 16142498  T
Q  173 cttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctct 272  Q
     ||||  ||  |||||||      ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |||| | ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||    
T  16142499 tttcttattttgctgaag------tccatattctctgtctttcttctactcaatcgaaaaccattctcttctaaagcttgtctcctggtctctaacctct 16142592  T
Q  273 ggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatac 329  Q
      |||| || || |||  |||| ||   ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  16142593 cattcattttcttccttgactctccattcaaaactacatcatttacaaaaagcatac 16142649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28528076 - 28527981
Alignment:
Q  310 atcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttga 405  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  28528076 atcatctgcaaacagcatgcatcttggtgctcaatcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactcaggcggaaaggtaagggcttagtgttga 28527981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 52836592 - 52836517
Alignment:
Q  362 aatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaat 437  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52836592 aatacatccaaatctaaaataaaaatataagggcttaaggttgatcctttgtgtaatcctattgttatgagaaaat 52836517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 168
Target Start/End: Original strand, 32405083 - 32405129
Alignment:
Q  122 gtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  32405083 gtaacttggggtatgatatgatctccaactttaacctctaagctaga 32405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 421
Target Start/End: Original strand, 16273664 - 16273717
Alignment:
Q  368 tccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  16273664 tccaaaactaatgtaaaaagataagggattagggttgacccttggtccaatcct 16273717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 46226782 - 46226854
Alignment:
Q  23 gctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  46226782 gctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacaat-atttacatctgcttttgtttctccatcattttgtac 46226854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8391556 - 8391525
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagctt 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391556 tgaggctcttctccatttcaaccacccagctt 8391525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 165
Target Start/End: Original strand, 16273415 - 16273471
Alignment:
Q  106 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 165  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16273415 aagatatttaaattgtgtaacttg---tatgatatgatctccaactttcatctctaaggt 16273471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 32405146 - 32405247
Alignment:
Q  156 cctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcct 255  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||   ||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  32405146 cctctaaggtagaactactttgccttttgctgaaattacattccatatactctgtcttgtttccacttaaatagaagccatacgcttccaagacttgtct 32405245  T
Q  256 cc 257  Q
    ||    
T  32405246 cc 32405247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 52640921 - 52640998
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 96  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||   |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  52640921 tgaggctcttcttcatttcaacaattcaacttgaatacgataatttacatatgcttttatctctctgtcattttgtac 52640998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 421
Target Start/End: Original strand, 52641283 - 52641340
Alignment:
Q  364 tacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  52641283 tacatcaaaaactaaagtaaaaagataatggattaggattgacccttggtccaatcct 52641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 36651780 - 36651272
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651780 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 36651681  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36651680 cgcgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttcttcttccgctgaagttccattccatatactccgtcttgcttc 36651581  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651580 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 36651481  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651480 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatctaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 36651381  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36651380 cctattgttatgggaaaaacttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaaactccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcc 36651281  T
Q  519 taacccctt 527  Q
    |||||||||    
T  36651280 taacccctt 36651272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 46356347 - 46356856
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46356347 tgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaac 46356446  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46356447 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 46356546  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  46356547 tactcaagcggtatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcttcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaaggctacatcatctgc 46356646  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46356647 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 46356746  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  46356747 cctattgttatgggaaaatctttggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaattc 46356846  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  46356847 taaccccttt 46356856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 524
Target Start/End: Original strand, 33350302 - 33350807
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33350302 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagaccctagatatttaaac 33350401  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33350402 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttcttcttccgctgaagttacattccatatacttcgtcttgcttc 33350501  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33350502 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 33350601  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33350602 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggagttagggttgacccttggtgcaat 33350701  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33350702 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcttcacactagtcgaagctctctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcc 33350801  T
Q  519 taaccc 524  Q
    ||||||    
T  33350802 taaccc 33350807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 11593746 - 11593230
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11593746 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccatcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 11593647  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt-ccgctgaagttacattccatatactccgtct----- 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||         
T  11593646 cgtctaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacctacttctcctttccgctgaagttacatttcatatactccgtctccgtc 11593547  T
Q  213 -tgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacat 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11593546 ttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaagacttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacat 11593447  T
Q  312 catctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11593446 catctgcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttg 11593347  T
Q  412 gtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatatag 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11593346 gtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagtctcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatatag 11593247  T
Q  512 gcaatcctaaccccttt 528  Q
    |||||||||||||||||    
T  11593246 gcaatcctaaccccttt 11593230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 39906871 - 39907384
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaac----cacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatattt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39906871 tgaggctcttctccatttcaaccaaccacccagcttgaatacgatggcttgcatctacttctatttctccgtcattttgtacgaatgacccaagatattt 39906970  T
Q  115 aaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttg 214  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906971 aaaccgtgtaacatgggatatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttg 39907070  T
Q  215 cttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39907071 cttctactcaagcggaatccatatgcttctaagatttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcat 39907170  T
Q  315 ctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39907171 ctgcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtgaaaagataaggacttagggttgacccttggtg 39907270  T
Q  415 caatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggca 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39907271 caatcctattgttatgggaaaatcttccgtagtcccatcctgcatcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggca 39907370  T
Q  515 atcctaaccccttt 528  Q
    ||||||||||||||    
T  39907371 atcctaaccccttt 39907384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 49029035 - 49028562
Alignment:
Q  37 caaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49029035 caaccacccagcttgaatacgatggcatacatctgcttctatttctccatcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatg 49028936  T
Q  137 atatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccat 236  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028935 atctgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttcccctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccat 49028836  T
Q  237 acgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcgg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||              |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49028835 acgcttctaaggcttgcctccaggtctctag--------------cctcccacgactcacctaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatcttgg 49028750  T
Q  337 tgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaa 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028749 tgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaa 49028650  T
Q  437 tcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccc 524  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  49028649 tcttcggtagtcccatcctacgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctaaccc 49028562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 20 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 32630380 - 32629885
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||             | || |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  32630380 gaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatga------------tgtaattctccatcattttgtaatatggacccaagatatttaaacc 32630293  T
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32630292 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 32630193  T
Q  220 actcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgca 319  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32630192 actcaggcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccatttaact-cctccctagactcacctagcaagactacatcatctgca 32630094  T
Q  320 aaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32630093 aaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgttagtacatccaaaactagagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcagtc 32629994  T
Q  420 ctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcct 519  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  32629993 ctattgttatgggaaaatctacggtatccccatcctgcgtcctcacacaggtcgaagctccctcatacatatcctggatagctttaatataggcaatcct 32629894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31005009 - 31004662
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31005009 tgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggagccaagatatttaaac 31004910  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31004909 -gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagtaacattccatatactctgtcttgcttc 31004811  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004810 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 31004711  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaataca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31004710 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccctcaataca 31004662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37616702 - 37616373
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  37616702 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaat 37616603  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37616602 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 37616503  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37616502 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 37616403  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37616402 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttg 37616373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 19 - 407
Target Start/End: Original strand, 36869785 - 36870173
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36869785 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttttatttcttcgtcattttgtactatggatccaagatatttaaac 36869884  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36869885 cgcgtaatttggggtatgatatgctctccaactttcacctccagggtagacatactttcccttttcctgaagttacattccatatactatgtcttgcttc 36869984  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36869985 tactcaagcggaaaccatacgcttctaaagcttgcctccaggcctctagcctcccgttcaattcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgc 36870084  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36870085 aaaaagcatacatctcggtgctagctcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttaaggttgacc 36870173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 42 - 528
Target Start/End: Original strand, 24177714 - 24178200
Alignment:
Q  42 acccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatg 141  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24177714 acccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactattgacccgtgatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatg 24177813  T
Q  142 atctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgct 241  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || ||| ||||||| |    
T  24177814 atctccaaccttcatctacaagctagacctacttcttcttttgctgaagttacattccatatactccatcttgatgctactcatgcagaaaccatacgtt 24177913  T
Q  242 tctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgcta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |  ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24177914 tctaaggcttgcctccaggtctctagtctcccgtttaaatcctccctcgactcaccaagcaagactacgtcatttgcaaaaagcatacatctcggtgcta 24178013  T
Q  342 acgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttc 441  Q
    || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  24178014 actcttgggcgtgttccgtcagtacatccaaaactaaaataaaaagataagaacttagggttgacccttagtgcggtcctattgttgtgggaaagtcttc 24178113  T
Q  442 ggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  24178114 ggtatccccatccggcgtcctcaccctagtcgaagctccctcatacacatccttgatagctttaatttaggcaatcctaaccccttt 24178200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 218 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 38897198 - 38896947
Alignment:
Q  218 ctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38897198 ctactcaagcggaatccatacacttcgaaggcttgcctccaagtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactaaccaaccaagactacatcatctg 38897099  T
Q  318 caaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaa 417  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897098 caaaatgaatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaa 38896999  T
Q  418 tcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacacta 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38896998 tcctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacacta 38896947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38606789 - 38606539
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38606789 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggtttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccg 38606690  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38606689 tgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcacct-caaggtagacccacttctccttttgcaaaaattacattccatatactccgtcttgcttcta 38606591  T
Q  221 ctcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctct 272  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38606590 ctcaggcggaaaccatacacttctaaggcttgcctccaggtctctagcctct 38606539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48919174 - 48918946
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  48919174 tgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatgattcacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggatccaaaatatttaaac 48919075  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48919074 cgtgtaacttggggtgtaatatgatctcctacttttaccttcaatgtagacctacttctccatttgctgaagtcacattccatatactccgtcttgcttc 48918975  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaag 247  Q
    |||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  48918974 tacttaggcgaaaaccatatgcttctaag 48918946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 317 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 38606526 - 38606315
Alignment:
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38606526 gcaaaaagcatacatcttggtgctaactcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactaaagcaaaaagataaggactaagggttgacccttggtgca 38606427  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaat 516  Q
     |||||||||||| | ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||    
T  38606426 gtcctattgttatcgaaaaatctacggtattcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcttggatagctctaatataggcaat 38606327  T
Q  517 cctaaccccttt 528  Q
    ||| | ||||||    
T  38606326 cctcatcccttt 38606315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 35906703 - 35906796
Alignment:
Q  25 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906703 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 35906796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 400 - 528
Target Start/End: Original strand, 36870201 - 36870329
Alignment:
Q  400 ggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgat- 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36870201 ggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatttgcggtatccccatcctgcatcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatg 36870300  T
Q  499 agtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  36870301 actc-taatataggcaatcctaaccccttt 36870329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20499585 - 20499387
Alignment:
Q  329 catctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgtta 428  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20499585 catctcggtgctagctcttggatgtgttccgcaagtacatccaaaagtaaagtaaaaagataagggcttatggttcaaccttggtgcaatcctattgtta 20499486  T
Q  429 tgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    ||| |||| |  || |  | ||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||    
T  20499485 tggaaaaaacgccgatgtctccatcatgtgtcctcacactagttgagactcccttatagatatccttcatagcttgaatataggc-atcctaaccccttt 20499387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22346866 - 22346776
Alignment:
Q  388 ataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagct 478  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22346866 ataaggacttagggttgacccatggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagtctcatccagcgtcctcacactagttgaagct 22346776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 308 - 500
Target Start/End: Original strand, 24426274 - 24426465
Alignment:
Q  308 acatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacc 407  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||  ||||||| | | | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24426274 acatcatccgcaaaaaatatacatctcgatgctaactcttaaatgtgttgcataagtacatccaaaattatagtaaaaagataagcacttatggttgacc 24426373  T
Q  408 cttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    |||||||||||| | ||||||| | |||||| || ||| || |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24426374 cttggtgcaatcatgttgttatagaaaaatcatcagtaacctcatcttgcatcctcaca-tagtcaaagctcactcatacatttccttgatag 24426465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 528
Target Start/End: Original strand, 48055623 - 48055821
Alignment:
Q  329 catctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgtta 428  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48055623 catctcggtgctagctcttggatgtgctccgcaggtacatccaaaagtaaagtaaaaagataagggcttatggttcagccttggtgcaatcctattgtta 48055722  T
Q  429 tgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag-tcgtaatataggcaatcctaacccctt 527  Q
    ||| ||||||  || |  | ||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48055723 tggaaaaatcaccgatgtctccatcctgtgtcctcacactagttgagactcccttatagatatccttcatagctcg-aatataggc-atcctaacccctt 48055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 43281462 - 43281389
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcatttt 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281462 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcatttt 43281389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 411
Target Start/End: Original strand, 21520229 - 21520320
Alignment:
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21520229 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtaaatacatccaaaactaaa-ttaaaatataagcacttagggttgacccttg 21520320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33072740 - 33072666
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33072740 tgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctaattatccgtcattttg 33072666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 431
Target Start/End: Original strand, 43793549 - 43793941
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||  ||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||     
T  43793549 ctccatttcaaccacctagcttagatttgatggtttacatctcct---atttcttcgtcattttgtactatagacccaagatatttaaaatgtgtaacta 43793645  T
Q  129 ggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcg 228  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |   | ||    |||| |||   ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  43793646 gtggtatgatatgatctctaactttcacctctacactcgaaacgcttcgcctcttgctaaatttacattccgtatactctgtcttgcttctactcaagca 43793745  T
Q  229 gaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc-aaaaagcat 327  Q
     || ||||| | |||| ||||||        ||||| | ||||   || | ||| ||| |  |||| || |  | ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43793746 aaaaccatatgtttctgaggctt--------gtctccaacctcccatttaattcttcctttgactctccaagtaggactatatcatttgcaaaaaagcat 43793837  T
Q  328 acatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgtt 427  Q
    |||||| ||||||  | ||||||||||||  || | ||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  43793838 acatcttggtgctcgctcttggatgtgttttgtaagtacatccaacactaaggtgaaaagataagggcttagtgttcaaccttggtgcaatcttattgtt 43793937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Original strand, 21517823 - 21517959
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || |  ||||||| ||||| ||||||| | | | ||||||||||||||| |    
T  21517823 aggctcttctcgatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatatgttattatttcttcgtca-tttgtactatgaatccaagatatttaaactg 21517921  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 158  Q
    ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  21517922 tgtaaattgaggtatcatgtggtctccaactttcacct 21517959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 18608187 - 18608319
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||  | ||||||| || |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| |   ||  |||||||||||    
T  18608187 catgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaa 18608283  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 152  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18608284 aatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18608319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18637365 - 18637233
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||  | ||||||| || |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| |   ||  |||||||||||    
T  18637365 catgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaa 18637269  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 152  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18637268 aatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18637233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18650800 - 18650668
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||  | ||||||| || |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| |   ||  |||||||||||    
T  18650800 catgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaa 18650704  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 152  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18650703 aatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 418907 - 419002
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  418907 aggctcttctccatttcacccacccagcttgaatctgatgt-ttacatctctcactatttctccgtcattttctacaatggacccaagatatttaaa 419002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 23087867 - 23088013
Alignment:
Q  275 ttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaa 374  Q
    |||| ||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |  |||||||||||  || | || ||||||||    
T  23087867 ttcaattcctccgtcaactcgccaattaagactacatcatctgcaaaatacatacatctcagtgctatctgttggatgtgttttgtaagtatatccaaaa 23087966  T
Q  375 ctaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    |||| |  || ||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||    
T  23087967 ctaatgttaatagataagggattaggattaacccttggtccaatcct 23088013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 38896950 - 38896906
Alignment:
Q  374 actaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38896950 actaaggcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 38896906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 34869206 - 34869159
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttac 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34869206 tgaggctcttctccaattcaaccacccagcttgaatatgatggcttac 34869159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 24550195 - 24550320
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||  | ||||  |||||||||||| |||||||||     
T  24550195 ctccatttcaaccacccaacttgaattcaacaatttacatctccttctattaatccgtcgttttgtaatatggactaaagatatttaaatcgtgtaact- 24550293  T
Q  129 ggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
        ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24550294 ----tatgatatgatcttcaactttcacctc 24550320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18626663 - 18626559
Alignment:
Q  45 cagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatc 144  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| |   ||  ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  18626663 cagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatc 18626567  T
Q  145 tccaactt 152  Q
    ||||||||    
T  18626566 tccaactt 18626559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 48918906 - 48918817
Alignment:
Q  302 aagactacatcatctgcaaaaagca-----tacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaa 386  Q
    ||||||||||||||||||||||  |     |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48918906 aagactacatcatctgcaaaaaaaaaaaaatacatctcagtgttaactcttgaatgtgttccgtcgatacatccaaaactaaagtaaaaa 48918817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Original strand, 23087599 - 23087694
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatattta 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||  ||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  23087599 gaggctcttttccatttcaaccatctaacttgaatacaatgatttacatacacttttatttctccttcattttgtactatgaacccaagagattta 23087694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 430
Target Start/End: Original strand, 17101265 - 17101385
Alignment:
Q  302 aagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttaggg 401  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  | ||   |||||  | | ||||||||||||||||     ||| |||||||||||      
T  17101265 aagactaaatcatcttcaaaaagcctacatctcggtgctagctatagg---tgttctattagtacatccaaaactaaa-----aaggtaaggacttagat 17101356  T
Q  402 ttgacccttggtgcaatcctattgttatg 430  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17101357 ttgacccttggtgcaatcatattattatg 17101385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 25579577 - 25579614
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgg 61  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25579577 ctcttctccattttaaccacccaacttgaatacgatgg 25579614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12965720 - 12965652
Alignment:
Q  28 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||  |  || ||||||| ||||||||||    
T  12965720 tctccatttcaaccacccaacttgaattcaatggattacatctcatattacttctccgacattttgtac 12965652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 36565737 - 36566246
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36565737 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaac 36565836  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  36565837 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgttgaagttacatttcatatactctatcttgcttc 36565936  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565937 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 36566036  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566037 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 36566136  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36566137 cctattgttatgggaaaatcttcagtagtctcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcc 36566236  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  36566237 taaccccttt 36566246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 36544938 - 36544428
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  36544938 tgaggctcttatccatttcaaccacccaacttgaatacgatgacttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagccccatgatatttaaac 36544839  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36544838 cttgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttc 36544739  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  36544738 tactcaagtggaatccatacggttctaaggcttgcctctaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctga 36544639  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36544638 aaaaagcatacatctcagtgctaactcttggatgtgttgcatcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagaacttagggttgacccttggtgcaat 36544539  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggc-aatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||     
T  36544538 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatatatatccttgatagccctaatataggcaaatt 36544439  T
Q  518 ctaaccccttt 528  Q
    |||||||||||    
T  36544438 ctaaccccttt 36544428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 452
Target Start/End: Original strand, 12492336 - 12492771
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492336 catgaggctcttctccatttcaaccacccaacctgaatacgatagcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 12492435  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492436 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttatccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 12492535  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12492536 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttacctccaggtctctagcctccagttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatct 12492635  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  12492636 gcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagaacttaagattgacccttggtgca 12492735  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccat 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12492736 atcctattgttatggaaaaatcttcgatagtcccat 12492771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 528
Target Start/End: Original strand, 42854498 - 42855018
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42854498 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctcaaacattttgtacgatggacccaagatatttaa 42854597  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt-----cc----gctgaagttacattccatatactc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  42854598 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctccttttgctgaagttacattccatatactc 42854697  T
Q  208 cgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagact 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |  ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  42854698 cgtcttgcttctactcaggcggaaaccatacgcttttaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagcaagact 42854797  T
Q  308 acatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42854798 acatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttctatcaggacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacc 42854897  T
Q  408 cttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaat 507  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||||    
T  42854898 cttggtgcagtcctattgttataggaaaatctacggtatcttcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcccggatagctctaat 42854997  T
Q  508 ataggcaatcctaaccccttt 528  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  42854998 ttaggcaatcctcaccccttt 42855018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 528
Target Start/End: Original strand, 15215768 - 15216277
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgctt-ctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  15215768 gaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatgatttacatctgctttctatttct--gtcactttgtactatggacccaatatatttaaac 15215865  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15215866 cgtgtaactttgggtatgatatgatctccaactttcacctccatggtagacccacttctccttttgctgaagttacatttcatgtactccgtcttgcttc 15215965  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    | |  ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  15215966 tactcaggcggaaaccatatgcttctaagttttgcctccaggtctctagcctcccacttaagtcctccctcgactcaccaaacaagactacatcgtctgc 15216065  T
Q  319 --aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
      ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15216066 aaaaaaaacatacatctcggtgctaactcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgatccttggtgca 15216165  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaat 516  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||   |||||||||||||    
T  15216166 gtcctattgttatgggaaaatctacggtatcctcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatatatatcatagatagctctaatataggcaat 15216265  T
Q  517 cctaaccccttt 528  Q
    |||  |||||||    
T  15216266 cctcgccccttt 15216277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Original strand, 4032990 - 4033202
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||    
T  4032990 tgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatatgcttttatttctccatcattgtgtactatgaacccaagatacttaaac 4033089  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4033090 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtagaccttctactccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgtttc 4033189  T
Q  219 tactcaagcggaa 231  Q
    |||||| ||||||    
T  4033190 tactcaggcggaa 4033202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 441
Target Start/End: Original strand, 18849628 - 18850036
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||     ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||       |||||||||||||||||    
T  18849628 ctcttatccatttcaaccacccagcttg-----gatgatttacatttgcttctatttctccgtcactttatactaa-------agatatttaaaccgtgt 18849715  T
Q  124 aacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | | ||||||| ||||  | ||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  18849716 aacttggggtatgatatgatctccaatttttacctctaaggcataactacttcaccttttgttgacgttatattccatatactttgtcttggttctactc 18849815  T
Q  224 aagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc---aa 320  Q
    ||| |||| |  ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||   ||| | ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||   ||    
T  18849816 aagtggaaacattacgcttgtaagacttgtctccaagtctctagcctaccgttaaattcctccttcaactctccaaacaagactacatcatctgcaaaaa 18849915  T
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    ||| ||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18849916 aaaacatacatcttggtgctaattgttgggtgtgttccgtaaatatatctaaaactaaaataaaaagataaagaattaaggttgaccgttggtgcaatcc 18850015  T
Q  421 tattgttatgggaaaatcttc 441  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  18850016 tattattatggaaaaatcttc 18850036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13589224 - 13588807
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||  || ||| ||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||| || |||  | |     
T  13589224 aggctcttctccatttcaaccatccaccttgaatatggtgattttcatatgcttctatttcttcatcattttatactaacgacccaatatttttgtatca 13589125  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||   | ||  |||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  13589124 tgtaacttgggatttgatatgatctctcactttcacctccatcatggaaatacttctccttttactgaagttgcattccataaactctatcttgcttgta 13589025  T
Q  221 ctcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaa 320  Q
    |||| |||||| ||   | ||||| ||| ||| ||||| || | || ||||   |||| ||||||| || |||| || | |||||||||||||||  |||    
T  13589024 ctcaggcggaagcctctcccttcttagggttgtctccaagtgtttaacctcccattcaattcctccatcgactctccaagcaagactacatcatcaccaa 13588925  T
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| || | |||||||||| |||   || | ||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  13588924 aaagcatacatcttggtgcaaactcttggatatgttccgtaaacatatccaaaactgaagtttaagggtaatggattatggttgacccttggtgcaatcc 13588825  T
Q  421 tattgttatgggaaaatc 438  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13588824 tattgttatgggaaaatc 13588807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 8879936 - 8880131
Alignment:
Q  25 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgta 124  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||   | |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  8879936 tcttctctatttcaaccatccaacatgaatacgatgctattcatctggttctatttctccttcattttgtactatgagcccaagatatttaaaccgtgta 8880035  T
Q  125 acttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8880036 acttgggatatgatatgattttcaactttcaccttcacggtcgacctacttctccttttgctgaagttacatttcatgtactccgtcttgcttcta 8880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 184 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 13984251 - 13983954
Alignment:
Q  184 gctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |    |||| || |    
T  13984251 gctgaagttacattccatatactctgtcttgcttctactcatgcggaagtcatacacttctaaggcttgtctccaagtctctaactttccattcaatttc 13984152  T
Q  284 tccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaa 383  Q
    |||||| |||| |  | || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||| | ||||| ||||| | ||  ||    
T  13984151 tccctcgactctcaaagcaggactacttcatctgcaaaaa-catacatcttggttctaaatcttggatatgtttcgtaagtacattcaaaa-ttaattaa 13984054  T
Q  384 aaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctc 483  Q
    || | ||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13984053 aagggtaagtgcttagggtt-atccttggtgcaatcatatagttatgagaaaatcgtcagtagccccatcttacgtcctcacactagtcgaagctccctc 13983955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 438
Target Start/End: Original strand, 41444809 - 41445219
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaagga-cccaagatatttaaaccgtgtaact 127  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | |||  |||||  ||||||||||||| | ||||||||||  |  || |||||||||||||||||  ||||||    
T  41444809 ctccatttcaaccaccttgcttgtattcaatgatttacacttgcttctatttctacatcattttgtatcattgaacccaagatatttaaaccaagtaact 41444908  T
Q  128 tggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagc 227  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  | |||| ||||  ||| || ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||    
T  41444909 tgtggtatgatatgatctccacctttcacctctaagttagaaatgcttcgccttttgctaaaattacattccatatactttatcttgcttttactcatgc 41445008  T
Q  228 ggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcat 327  Q
    |||| | |||  ||| ||||||| | ||||| | ||  | || |   || | |||||||||| |||| || |  | ||||||||||||| ||||||  |     
T  41445009 ggaagcaatatccttataaggctcgtctccaagccttaaacccccatttaa-ttcctccctcgactctccaagtaggactacatcatctacaaaaaatag 41445107  T
Q  328 acatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaa-aagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgt 426  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  41445108 acatctcggtgctagcttttggatgtgtttcgtaattacatccaaaattaaagtaaacaaaataagggcttagggttaacccttggtacaatcatattgt 41445207  T
Q  427 tatgggaaaatc 438  Q
    ||||||||||||    
T  41445208 tatgggaaaatc 41445219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 421
Target Start/End: Original strand, 28300609 - 28301002
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgt 123  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||    
T  28300609 ctcttctccaatttaaccatccaacttgaatacgatgatgtacatctgcttttatatctcagtcattttgtaccatgaacccaagatatttaaactgtgt 28300708  T
Q  124 aacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactc 223  Q
    |||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||  |||  | |||| | |||||  |||||||  ||| |||||||||||    
T  28300709 aactt---gtatgatatgatctccagctttcacctctaaggtcgaactacttcgtcttttgatgaaatcacattaaatatactatgtc-tgcttctactc 28300804  T
Q  224 aagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaa 323  Q
       || ||  ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| | | |||  |||| ||||||| || |||| || |  ||||||||||||| | |||||     
T  28300805 ggacgaaagtcatacccttctaagacttgtctccaagtctccaacatctcattcaattcctccatcgactctccaattaagactacatcatgtacaaaac 28300904  T
Q  324 gcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    |||||||||| ||| |||    || ||||  ||  || | |||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  28300905 gcatacatcttggttctagttgtttgatgctttttgtaagtacatctaaaactaatgtaaaaagataagggattagggttgacccttggtccaatcct 28301002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13984820 - 13984672
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  13984820 tgaggctcttcttcatttcaaccatccaacttaaatacgatgatttacatctgcttttatttctttgtcatttt-tactatggacccaagatatttaaac 13984722  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  13984721 cgtgtatcttggggtatgatatgatcttcttctttcaccttcaaggtaga 13984672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25985326 - 25985128
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||  ||| || | |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |  || |||| ||||||||||    
T  25985326 tgaggcactcctccatttcaactacccattttggattcaatggtttacatctccttctatttctccatatttttgtactatagatccaatatatttaaac 25985227  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||  | |||| |||   ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25985226 cgtgtaacttgtggtatgatatga--tccaactttcacctctaagctagaaatgcttcgcctcttgctaaacttacattccatatactctgtcttgcttc 25985129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29735587 - 29735447
Alignment:
Q  28 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaact 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||        |||||| ||| |||||    
T  29735587 tctccatttcaaccacccaacttgaataagatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttgaactatggac-------gtttaaatcgtataact 29735495  T
Q  128 tggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctactt 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29735494 tggggtatgatatgatctcccactttcacctccatggtagaactactt 29735447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 364 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3284934 - 3284797
Alignment:
Q  364 tacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaat-cttcggtagccccatcttgcgtcct 462  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||  | |||||||| |||||    
T  3284934 tacatccaaaactaaggtgaaaagataagggcttagtgttgaaccttggtgcaatactattgttatgagaaaattctttagtgtctccatcttgtgtcct 3284835  T
Q  463 cacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3284834 cacactagtcgagactccctcatacatatccttgatag 3284797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18124954 - 18124802
Alignment:
Q  27 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaac 126  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||  ||| ||||||||||| | ||||    
T  18124954 ttctccatttcaaccattcagcttgaattcgatgagttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga--caaaatatttaaaccatataac 18124857  T
Q  127 ttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt 181  Q
    || || |||| ||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  18124856 ttaggatatggtatgatctcaaacttttacctttaagatagacatacttctcctt 18124802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 33830729 - 33830971
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  33830729 tgagactcttcaacattttaaccatccaacttgaacacgatgatttacatatgcttttatttcttcgtcattttgtacaatggacccaaaatatttaaac 33830828  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     |||||||||    ||||||| ||| |||||||||||  || |||||||| |||||||  | |  ||| || ||||||| ||||||||  || |||||||    
T  33830829 tgtgtaactt---atatgataagatatccaactttcatgtctaaggtagaactacttcgtcgtttgctaaaattacattacatatactatgttttgcttc 33830925  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctc 264  Q
    ||||||  || ||  ||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  33830926 tactcagccgaaagtcatacacttctaagacttgtctccaagtctc 33830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 19293774 - 19293913
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||| | |||||| || |||||||||   ||||| |||||||||||    
T  19293774 catgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaa 19293873  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcac 156  Q
    |||||||||  |||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  19293874 accgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 19293913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38667341 - 38667140
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatattt-aaacc 119  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||  || |||||||| | | ||||||||||||| ||||     
T  38667341 aggctctactctatttcaaccatccaactttaatacgatgatttacatcttcttttatttctctatcgttttgtactatgaacccaagatatttaaaact 38667242  T
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
     ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| ||||  ||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||    
T  38667241 ttgtaactt---gtatgatatgatctccaagtttcacctctaggatagaactacttcgccttttgctaaaactacattacatataccatgtcttgcttct 38667145  T
Q  220 actca 224  Q
    |||||    
T  38667144 actca 38667140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25439317 - 25439249
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcatttt 92  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25439317 ctcttctccatttcaaccatcctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttctccgtcatttt 25439249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 6510911 - 6511074
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttac-atctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatattta 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||  |||  | ||||||| |||||||| ||| ||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  6510911 catgagactcttctccatttcaaccactcaacttgaatgcaatgatttatgacctgcttccatttctccttcactttatactacggatccaagatattta 6511010  T
Q  116 aaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt 181  Q
     ||| ||||||||||||  | || |||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6511011 taccatgtaacttgggg--ttatgtgatcttcaacctttacctccaaggtataactacttcacctt 6511074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 30113697 - 30113827
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttc-tatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtg 122  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |  ||  |||||||||| |||  |     
T  30113697 ctcttctccatttcaaccatttagcttgaatacaatgatttacatctgcttcttttttctccgtcattttatattacagattcaagatatttgaactata 30113796  T
Q  123 taacttggggtatgatatgatctccaacttt 153  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30113797 taatttggagtatgatatgatctccaacttt 30113827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 498
Target Start/End: Original strand, 45231795 - 45231897
Alignment:
Q  396 ttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatcctt 495  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||    
T  45231795 ttaggattgacccttaatgcaatcctattgttatataaaaatcgtcaaaagccccatcatgcgtcctcacactagtcgaaattccctcatacatatactt 45231894  T
Q  496 gat 498  Q
    |||    
T  45231895 gat 45231897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39707073 - 39706943
Alignment:
Q  304 gactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggtt 403  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||| | | || |||| |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||    
T  39707073 gactccatcatcttcaaaaatcatacattttg-tgttaactcttgaatgtgttccataactacacccaaaactaaagtaaaaagaaaagggcttgggatt 39706975  T
Q  404 gacccttggtgcaatcctattgttatgggaaa 435  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  39706974 gaccattactacaatcctattgttatgggaaa 39706943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 153
Target Start/End: Original strand, 45332039 - 45332117
Alignment:
Q  75 ctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaacttt 153  Q
    ||||||||||  | |||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45332039 ctatttctccaccgttttgtactatgaagccaggatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgacatgatctccaacttt 45332117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25300023 - 25299950
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcatttt 92  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  25300023 tgaggctcttctccatttcaaaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccatcatttt 25299950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25984970 - 25984909
Alignment:
Q  383 aaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggt 444  Q
    |||||||||||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25984970 aaaagataagggattaatgttaaaccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggt 25984909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 37077551 - 37077490
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctattt 80  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  37077551 tgagactcttctccatttcaaccacttagcttgaatacgatgatttacatcggcttctattt 37077490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 158
Target Start/End: Original strand, 43732230 - 43732279
Alignment:
Q  109 atatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 158  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43732230 atatttaaaccgtgttacttgtgctatgatatgatctccaactttcacct 43732279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25288688 - 25288613
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccaccca--gcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcatttt 92  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25288688 tgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccgtcatttt 25288613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 39946641 - 39946601
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgg 61  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39946641 aggctcttctccatttcaaccatccagcttgaatacgatgg 39946601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35094870 - 35094763
Alignment:
Q  139 atgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||   ||| |||| | || |||||||||||||| || |||||||||| || || ||| || |||    
T  35094870 atgatctccaactttcacctccaagttagaaatgcttcggtttctgctgtaattgcattccatatactctgtattgcttctacccaggcagaagccttac 35094771  T
Q  239 gcttctaa 246  Q
     |||||||    
T  35094770 acttctaa 35094763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 87
Target Start/End: Original strand, 42493812 - 42493866
Alignment:
Q  33 atttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtc 87  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42493812 attttaaccacccagcttaaattccatggtttacatctccttctatttctccgtc 42493866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 30748273 - 30748232
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 70  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  30748273 ctccatttcaaccacctagcttgaattcgatggtttacatct 30748232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3285163 - 3285135
Alignment:
Q  131 ggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285163 ggtatgatatgatctccaactttcacctc 3285135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 35601777 - 35601686
Alignment:
Q  25 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaa 117  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||   |||||||| | |||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35601777 tcttctccatttctatcacccaa-ttgaattcgataatttacatctacgtctatttctctgtcattttgtattatggatccaagatatttaaa 35601686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39706912 - 39706880
Alignment:
Q  468 tagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39706912 tagttgaagctccctcatacatatctttgatag 39706880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20318777 - 20318268
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20318777 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 20318678  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20318677 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaactacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 20318578  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  20318577 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccatgaagactacatcatctgc 20318478  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20318477 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttgaatgtgtttcgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 20318378  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20318377 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaaactccctcatacatatccttgatagccataatataggcaatcc 20318278  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  20318277 taaccccttt 20318268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 1275049 - 1274559
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275049 aggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 1274950  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274949 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtagacctacttctcctttcgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 1274850  T
Q  221 ctcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaa 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274849 ctcaaccggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcatgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaa 1274750  T
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1274749 aaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaattc 1274650  T
Q  421 tattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatatag 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1274649 tattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatctttgatagccctaatatag 1274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 523
Target Start/End: Original strand, 1288083 - 1288589
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1288083 catgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggactcaagatatttaa 1288182  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1288183 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacttacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 1288282  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  1288283 tctactcaagcagaatccatacgcttctaaggcttgtctccaggtctctagtctcccgttcacttcctccctcgaatcacccaccaagaccacatcatct 1288382  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1288383 gcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaatataaggacttagggttgacccttggtgca 1288482  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1288483 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaat 1288582  T
Q  517 cctaacc 523  Q
    | |||||    
T  1288583 cataacc 1288589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 527
Target Start/End: Original strand, 2075970 - 2076478
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075970 tgaggctcttcttcatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 2076069  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2076070 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaactgcttctccttccgctgaagttacattccatgtactctgtcttgcttc 2076169  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076170 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccagctctctagcctcccgttcacttcctcccttgactcacccaccaagactacatcatctgc 2076269  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076270 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 2076369  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  2076370 cctattgttgtgggaaaatcttcggtagtctcatcatgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccatgatataggcaatcc 2076469  T
Q  519 taacccctt 527  Q
    |||||||||    
T  2076470 taacccctt 2076478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24178310 - 24177801
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24178310 tgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatctttaaac 24178211  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178210 cgtgtaacttagggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 24178111  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24178110 tactcaagcggaatccatacacttctaaggcttgccttcaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcactcaccaagactacatcatctgc 24178011  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178010 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatcccaaactaaagtaaaaagattaggacttagggttgacccttggtgcaat 24177911  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  24177910 cctattgttatcggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctaatataggcaatgc 24177811  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  24177810 taaccccttt 24177801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10639081 - 10638688
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639081 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 10638982  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10638981 tgtaacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtctttcttcta 10638882  T
Q  221 ctcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaa 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10638881 ctcaagc-gaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctaccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaa 10638783  T
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10638782 aaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgc 10638688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 494
Target Start/End: Original strand, 12492883 - 12493333
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492883 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 12492982  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492983 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaacttttacctccaaggtagagctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 12493082  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||          ||||||||||||||||||||                |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12493083 tactcaagc----------cgcttctaaggcttgcctcc---------------cgttcacttcctccctcgactcacccaccaagattacatcatctgc 12493157  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12493158 aaaaagcatacatcttggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggagttagggttgacccttggtgcaat 12493257  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatcct 494  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12493258 cctattgttatgggaaaatattcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcct 12493333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3394496 - 3393988
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3394496 tgaggctcatctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaac 3394397  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3394396 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaa-ttacattccatatactctgtcttgcttc 3394298  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |  ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  3394297 tactcaggcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagcaagactgcatcatctgc 3394198  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3394197 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactagagtaaagagataaggacttagggtttacccttggtgcaat 3394098  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||    
T  3394097 cctattgttatgggaaaatctacgatatccccatcccgcgtcctcacattagtcgaagcttcctcatacatatcctggataactctaatataggcaatcc 3393998  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    | ||||||||    
T  3393997 tcaccccttt 3393988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3301635 - 3301126
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  3301635 tgaggctcatctctatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttgcatctgcttctatttctccttcatttggtactatggacccaagatatttaaac 3301536  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3301535 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 3301436  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||    
T  3301435 tactcaggcggaaaccatactcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaattcctccctcaactcaccaagcaagattgcatcatctgc 3301336  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  3301335 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactagagtaaagagataaggacttagggtttacccttggtggagt 3301236  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||    
T  3301235 ccttttgttaagggaaaatctacagtatccccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcatggataactctaatataggcaatcc 3301136  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    | ||||||||    
T  3301135 tcaccccttt 3301126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 391
Target Start/End: Original strand, 28977354 - 28977725
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977354 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctacttctattactccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 28977453  T
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977454 gtgtgacttggggtatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacctacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 28977553  T
Q  220 actcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28977554 actcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggcctatagcctcccgttcacttcctcccttgacccacccaccaagactacatcatctgca 28977653  T
Q  320 aaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28977654 aaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataa 28977725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 16347899 - 16348085
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  16347899 tgaggctcttctccatttcaaccaccta-cttgaatacgatgatttacatacgcttttatttctccgtcattttgtactatggacacaagatatttaaac 16347997  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16347998 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttttgctgaagttacatttcatatact 16348085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 498
Target Start/End: Original strand, 43558312 - 43558774
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  43558312 aggctattctccatttccactaccctgcttgaattcgatgatttacatctgcttctatttctctgtggttttgtacaatggacctaagatatttaaatcg 43558411  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||   ||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||   |||||||| ||    
T  43558412 tgtaacttgtggtatgctatgatctccaactttcacctctgagctagaaacactttgccttttgctaaatctacattccatatactttatcttgcttgta 43558511  T
Q  221 ctcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaa 320  Q
    |||   || ||  ||||||||||||||| ||        ||||| | | ||   || | ||||||||||||||| || |  | ||||||||||||| |||    
T  43558512 ctccgacgaaagtcatacgcttctaaggttt--------gtctccaacatcccattaaattcctccctcaactctccaagaaggactacatcatctacaa 43558603  T
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    || ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||        | ||||||||||||| |||||||||    
T  43558604 aacgcatatatctcggtgttagctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtgaaaag-------ttgagggttgacccttagtgcaatcc 43558696  T
Q  421 tattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgat 498  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  43558697 tattgttattggaaaatttgcggtggccctatcctgcgtcctcgcactagttgaggccccctcatacatttccttgat 43558774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 133 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27602 - 27265
Alignment:
Q  133 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||   | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  27602 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggcataactacttcgcctattgttgaagttacattccctatactctgtcttgcttttactcaagcggaag 27503  T
Q  233 ccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatc 332  Q
     | ||||||||||| |||||  || | ||||| | | ||   |||| ||||||||||  ||| || | || ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  27502 tcctacgcttctaacgcttgtatctaagtctccaacttcccattcaattcctccctcgtctctccaaacaggactacatcatcgacaaaaaacatacatc 27403  T
Q  333 tcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatggg 432  Q
    ||| ||||||| ||||||| || ||||  | |||||||||||| |||  |||||| ||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  27402 tcgttgctaactcttggatatggtccgcaagtacatccaaaacaaaaataaaaaggtaagagctta-ggttgatccttcgtgcaatcctattgttacggg 27304  T
Q  433 aaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagt 471  Q
    |||||| |||  || ||| || | |||||||||||||||    
T  27303 aaaatcgtcgaaaggcccctcatacgtcctcacactagt 27265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Original strand, 27302449 - 27302647
Alignment:
Q  22 ggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||   |||||||||||| | |||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  27302449 ggctcttttccatttcaaccactcaacttgaatacgatgatttacatct---tctatttctccgccgttttgtattatggacacaagatatttaaaccgt 27302545  T
Q  122 gtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctac 221  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27302546 gtagtttgaggtatgatatgatctccaacactcaccttcaaggtagaactactttaccttttgttgaagttacattccatatactcagtcttgtttctac 27302645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36200570 - 36200406
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||| |||| ||||||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  36200570 catgagtctcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgctactatttctatgtcattttgtactatgaacccaaaatatttaa 36200471  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt 181  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  36200470 acggtgtaacttgaggtatgatatgacctcccactttcacctccatagtagaactacttctcctt 36200406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 37124275 - 37123938
Alignment:
Q  100 ggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttcc-gctgaagttacattc 198  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||   |||||| ||||||||    
T  37124275 ggactcaagctatttaaacaatgtaacttgttgtatgatttgatctccaactttcacctctaaggtagaaatacttcacatttttgctgaaattacattc 37124176  T
Q  199 catatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcaccc 298  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||   | ||  | |||||||||||| |||| |||||  |||| | | ||| ||||| ||| |||||  |||| |      
T  37124175 catatactctatcttgcttctgctcagatgaaaatcttacgcttctaagacttgtctccaattctccaacatctcgttcaattcgtcccttgactctcaa 37124076  T
Q  299 accaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggactta 398  Q
    | || |||||| |||||| |||||||||||  ||||| | ||| |  ||| |||| |||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  37124075 aacaggactacctcatctacaaaaagcatatgtctcgatactagctattgaatgtattctataaatacatccaaaactaaagtaagaagataagggctta 37123976  T
Q  399 gggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaa 436  Q
     | ||||  ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  37123975 tgattgattcttggtgtaatcttattgttatgagaaaa 37123938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 252
Target Start/End: Original strand, 17341748 - 17341930
Alignment:
Q  70 tgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac 169  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17341748 tgcttctatttctctatcattttctactatggacccaatatatttaaaccatgtaatttcaggtatgatatgatctccaacttccacctccaaggtagaa 17341847  T
Q  170 ctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttg 252  Q
    | | ||  ||||   || ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||| || |||||| ||| | |||||||    
T  17341848 ccatttggcctttttctaaagttacattccatatactcaattttgcttctattcaggcgaaaaccatacacttatgaggcttg 17341930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25937804 - 25937459
Alignment:
Q  73 ttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacc-tccaaggtagacct 171  Q
    ||||||||||  |||| ||||| | | |||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |    
T  25937804 ttctatttctttgtcaatttgtgctatggacccaagatatttaatttgtgtaatttggggaatgatatgatctccaactttcaccttttaaggtagaaat 25937705  T
Q  172 acttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctc 271  Q
    ||||||||||  |||||| ||||  | ||||||||  |||||| || |||||| | | || |||||| ||| ||| ||||        ||||| | | ||    
T  25937704 acttctccttttgctgaaattactcttcatatactttgtcttgattttactcaggtgtaacccatacccttgtaatgctt--------gtctccaacgtc 25937613  T
Q  272 tggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacat-cc 370  Q
    |  | || |||||||||| |||| || | ||| |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| | || | | |||||       
T  25937612 tcatacaattcctccctcgactctccaagcaaaactatatcatctacaaaaaagttacatctcggtgctaacacttggatgtatcccataagtacataaa 25937513  T
Q  371 aaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctatt 424  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25937512 aaaactaaagtataaatacaaggacttaggattgatccttggtgcaatcctatt 25937459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 43423578 - 43423656
Alignment:
Q  28 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccca 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43423578 tctccatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctgtttctccgtcattttgtactacggaccca 43423656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 31502825 - 31503019
Alignment:
Q  302 aagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacg---cttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggactta 398  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||   ||||||| ||||  || | ||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||    
T  31502825 aagactatctcatctgcaaaaagcatgcatcttggtgct--cgtttcttggatttgttttgtaagtacatccaaaattaaggtgaaaagataaggacgta 31502922  T
Q  399 gggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatcctt 495  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  | || ||| | ||||||||| |||| ||  | || ||||||||||||||    
T  31502923 gtgttgaaccttggtacaatcctattgttaaggggaaatcttcggtgtctccttctggtgtcctcacagtagtcgagaccccatcatacatatcctt 31503019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 38578998 - 38579130
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||   ||| |||  |||||||||||||| |   || ||||||||||||    
T  38578998 catgaggcactcctccatttcaaccactcagcttggattcgatcgtttacatct---tctgttttcccgtcattttgtactatcaactcaagatatttaa 38579094  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 152  Q
    || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  38579095 actgtgtaacttgtgctataatatgatctccaactt 38579130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 159
Target Start/End: Original strand, 6368435 - 6368561
Alignment:
Q  33 atttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggg 132  Q
    ||||||||||  ||||||| || | |||| ||| ||||  || |||||||||||| |||||||| |  ||  |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  6368435 atttcaaccattcagcttggattcaatggtttatatctctttttatttctccgtcgttttgtactatagatacaagatatttaaattgtgtaacttgtgg 6368534  T
Q  133 tatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6368535 tatgttatgatctccatctttcacctc 6368561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 34272808 - 34272758
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatc 69  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34272808 tgaggctcttctccattttaaccacccaacttgaatacgatggcttacatc 34272758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 35685340 - 35685160
Alignment:
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | || |||||||    
T  35685340 aaaaaacatacatcttggtgctacctcttgaatgtgttccataaatac-tccaaaactaaagcaaaaagataagagtttaaggttgatcattagtgcaat 35685242  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    | | || ||||| ||||||  |  ||  | ||||| | |||||||| |||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  35685241 catgtttttatgagaaaattgtttgtgcctccatcctacgtcctcaaactagtggaagccctcacatacatgtccttgatag 35685160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21915672 - 21915532
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |||| |  | |||| |||  | | ||||||||||| ||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||    
T  21915672 tgaggcactcctccatttcaactacccaacttggactcaatggtttaattttccttctatttcttcgttattttgtactattgaaccaatatatttaaac 21915573  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21915572 cgtgtaacttgtattatgatataatctcgaactttcacctc 21915532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 40383941 - 40383794
Alignment:
Q  320 aaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatc 419  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||  || | ||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||  ||||| | ||||||| |||    
T  40383941 aaaagcatacatctcagtgctagctcttgaatatgttatgtaagtacatccaagactaaagtaaaaagataatggtttaatgttgatcattggtgcgatc 40383842  T
Q  420 ctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacac 467  Q
     || |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  40383841 ataatgttattgaaaaatcgtcggtggccctatcttgcttcctcacac 40383794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 20077313 - 20077389
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgta 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20077313 tgaggctcttctccatttcaaccatccaacctgaaaatgatgatttgcatctgctttaatttctccgtcattttgta 20077389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23979904 - 23979812
Alignment:
Q  133 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |||  | |||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||    
T  23979904 tatgatatgatctccaactttcacctctaaggttgaactactttgtcttttgttgaagttacattacatataccatgtcttgcttttactcaa 23979812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30418833 - 30418761
Alignment:
Q  369 ccaaaactaaagcaaaaag-ataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatctt 440  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30418833 ccaaaaccaaagtaaaaaggataaggacttggaatggacccttggtgcagtcctattgttatgggaaaatctt 30418761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3096960 - 3096828
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||  ||| |||      |||||||||||| |   ||||||||||||||||||     
T  3096960 aggctctcatccatttcaaccacccaacttgaatttgatggtttatatccccttatat------gtcattttgtactataaacccaagatatttaaacca 3096867  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    ||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  3096866 tgtaacttgtgctgagatatgatctctaactttcacctc 3096828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28676308 - 28676253
Alignment:
Q  25 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttc 81  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  28676308 tcttctccatttcaaccacaca-cttgaatacgatgatttgcatatgcttctatttc 28676253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 528
Target Start/End: Original strand, 51448206 - 51448714
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51448206 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 51448305  T
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51448306 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttct 51448405  T
Q  220 actcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51448406 actcaagcggaatccatacgcttctaagacttgcctctaggtctctagcgtcccgttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgca 51448505  T
Q  320 aaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatc 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51448506 aaaagcatacatctcgatgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatc 51448605  T
Q  420 ctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcct 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  51448606 ctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacaccagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaaacct 51448705  T
Q  520 aaccccttt 528  Q
    |||||||||    
T  51448706 aaccccttt 51448714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 52138551 - 52138105
Alignment:
Q  82 tccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138551 tccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt 52138452  T
Q  182 ccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcactt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  52138451 ccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaaacagaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttccctt 52138352  T
Q  282 cctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagc 381  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52138351 cctcccttgactcacccaccaagactacatcatgtgtaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagt 52138252  T
Q  382 aaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52138251 aaaaagataaggacttagggttgatccttggtgcaattctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccc 52138152  T
Q  482 tcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  52138151 tcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctaaccccttt 52138105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 38849880 - 38849371
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  38849880 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactgtggacccaagatatttaaac 38849781  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38849780 cgtgtaaattgaggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttttgatgtagttacattccatatactccgtcttacttt 38849681  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  38849680 tactcaagcggaaaccatacgattatagggcttgcctccagatctctagcctcctattcaattcctccttcgactcaccaagcaagactacatcatctac 38849581  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38849580 aaaaagcatacatctcggtgcttactcttggacgtgttccgcccgtacatccaaaactaaataaaaaagataaggacttacaattgacccttggtgcaat 38849481  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  38849480 cctactgttatggaaaaatctttggtagccccattttgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctaatataggcaatca 38849381  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  38849380 taaccccttt 38849371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 333
Target Start/End: Original strand, 47542207 - 47542521
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47542207 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 47542306  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47542307 cgtgtaacttggggtatgaaatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacattccatacactccgtcttgcttc 47542406  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47542407 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 47542506  T
Q  319 aaaaagcatacatct 333  Q
    |||||||||||||||    
T  47542507 aaaaagcatacatct 47542521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25191165 - 25190827
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  25191165 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatttgcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaac 25191066  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191065 cgtgtaacttgggctatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 25190966  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||| || |||||  || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||   || |  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25190965 tacttaatcggaaatcacacacttctaaggcgtgcctctaggtctctagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgc 25190866  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25190865 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttc 25190827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 9258584 - 9258167
Alignment:
Q  100 ggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||| |||    ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  9258584 ggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatatctaatgttcacctctaag----acctacttctccttttgttgaagttacattcc 9258489  T
Q  200 atatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcc----tccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |    || ||||||||||||||| | ||| || | ||||| |||||    
T  9258488 atatactccgtcttgcttctactcaggcggaaaccacacgcttttaaggcttgtcaatttctaggtctctagcctctcggtcaatttc-ccctcgactca 9258390  T
Q  296 cccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggac 395  Q
    || | || |||       ||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9258389 ccaagcatgacg------tcgacagaaaacatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggac 9258296  T
Q  396 ttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatcctt 495  Q
    || |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  9258295 ttggggttgtccattggtgccatcctattgttgtgggaaaatattcggtaaccccatcatgtgtcctcacaatagtcgaagctctctcatacatatcgtt 9258196  T
Q  496 gatagtcgtaatataggcaatcctaaccc 524  Q
     ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  9258195 tatagctctaatatagacaatcctaaccc 9258167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19736914 - 19736569
Alignment:
Q  53 atacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 152  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||| || ||||||||| | ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19736914 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatgg----aagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19736819  T
Q  153 tcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttg 252  Q
    |||||||||||||||  |||||   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||    
T  19736818 tcacctccaaggtaggactactctgccttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttctactaaggcggatgccatacacttctaaggcttg 19736719  T
Q  253 cctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatg 352  Q
     ||| | |||||||  |||   |||| ||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19736718 tctctaagtctctaatctcccattcaattcctccctcaactctccaagcaggactgcatcatctgcaaaaagcatacatcttggtgctaactcttggatg 19736619  T
Q  353 tgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttga 405  Q
    |||||||||   |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||    
T  19736618 tgttccgtc---acatccaaaactaaagtaaaaatgtaaggactgaaggttga 19736569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27917360 - 27916905
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  27917360 catgaggctcttctctatttcagctacccaacttgaatacgatgatttatatatgcttatatttctccgtcattttgtactatggactcaagatatttaa 27917261  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||| |   ||||| |    
T  27917260 accgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcaccttcaaggtagaactagttctccttttactgaagttacaatccatataatttatcttgat 27917161  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagact-acatcatc 315  Q
    |||||||  || |||  ||||||||| ||||||||| || || |||| || |||||  |||| ||||||||||   || |  | || |||| ||||||||    
T  27917160 tctactctggcagaagtcatacgcttataaggcttgtcttcaagtctttaacctctcattcaattcctccctcgtgtctctaagcaggactaacatcatc 27917061  T
Q  316 tgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgc 415  Q
    | |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |      | |||| | |||||||||| |||||  ||||| |||| || |||||||||||||    
T  27917060 ttcaaaactcatacatctcggtactaacttttggatgtttattagaagtacaactaaaactaaagtaaaaatgtaagggcttatggatgacccttggtgc 27916961  T
Q  416 aatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagt 471  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |  |||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  27916960 aatcctattgttatggggaaattgtttgtagtcccatcgtgtgtcctaacactagt 27916905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 29817282 - 29816890
Alignment:
Q  27 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaac 126  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||   ||||| ||||||||||||||| | || |  ||||||||| |||||||||||    
T  29817282 ttctctatttcaaccacccaacttgaatacgatgatttacatctgccgttatttatccgtcattttgtactatggtca-aagatatttgaaccgtgtaac 29817184  T
Q  127 ttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaag 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  29817183 ttatggtatgatatgatctccaactttcacctccaagatagaacaacttcaccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttgattctattcagg 29817084  T
Q  227 cggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagca 326  Q
    | ||| ||| || ||||||||||||| ||| | |||| ||  |||  ||||| ||| |||||  |||| || |  | ||||  ||||||| |||||| ||    
T  29817083 cagaagccacacacttctaaggcttgtctctaagtctataagctcgcgttcaattcatcccttgactctccaagtaggactgtatcatcttcaaaaaaca 29816984  T
Q  327 tacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29816983 tacatctcggtgctaactctaggatgtgttttgtaagtacatccaaacctaaggtaaaaaggtaagggcttagggttgagccttggtgcaatcc 29816890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19757644 - 19757387
Alignment:
Q  145 tccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  19757644 tccaactttcacctccaaggtaggactactttgccttttgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttctactaaggcggatgccatacgcttct 19757545  T
Q  245 aaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacg 344  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19757544 aaggcttgtctccaagtctctaacctcccattcaattcctccctcaactctccaagcaggactgcatcatctgcaaaaagcatacatcttggtgctaact 19757445  T
Q  345 cttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttga 405  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||    
T  19757444 cttggatgtgttccgtc---acatccaaaactaaagtaaaaatgtaaggactgaaggttga 19757387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 48221569 - 48221086
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 119  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||      
T  48221569 gaggttcttcttcatttcaaccatccagtttgaattcgatgatttacatatgcttctacttctctgtcattttgtactatgaatccaagatatttaaaat 48221470  T
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||  |||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  48221469 gtgtaacttgtggtatgatatgatcttcaactttcacctctaagatagaactactacaccttttgctgaaattacattacatatactatgtcttacttct 48221370  T
Q  220 actcaagcggaatccata---cgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    ||| ||| |||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||||  | ||||   |||| |||||| ||| |||| |    ||  |||||||||| |    
T  48221369 acttaagtggaaaccataatgtgcttctaaggcttgtctccaagtcttcaacctcccattcaattcctctctcgactctcaatgcagaactacatcatat 48221270  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
    ||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |  | |||||| |||||||||| |||||  || |  | || |||||   |||||||||    
T  48221269 gcaaagagtgtacatctcgatgctaactcttggatgtgttttgcaagtacatctaaaactaaagtaaaaatttatgatcctaaggttggttcttggtgca 48221170  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| | | |||| ||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  48221169 atcctattgttatggaaaattcgtcggtggtcgcatcctgcatcctcacactagctgaatccacctcatacatatctttgatag 48221086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28245223 - 28245093
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28245223 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccatcattttgtacgaaggatccaagatatttaagc 28245124  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28245123 cgtgtaacttggggtattatatgatctccaa 28245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19757820 - 19757651
Alignment:
Q  53 atacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 152  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757820 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19757721  T
Q  153 tcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 222  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19757720 tcacctccaaggtaggactactttgccttttgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttctact 19757651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26490101 - 26489964
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||| |     
T  26490101 aggctattcttcatctcaaccactcaacttcaatatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttatatcatggaaccaagatatttaaatca 26490002  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26490001 tgtaacttggagtatgatatgatctcccactttcacct 26489964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 54425400 - 54425511
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| || ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  54425400 catgagactctttttcatttcaaccgcctagcttaaatacgatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttttactatggatccaagatatttaa 54425499  T
Q  117 accgtgtaactt 128  Q
    ||||||||||||    
T  54425500 accgtgtaactt 54425511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 474
Target Start/End: Original strand, 50630114 - 50630272
Alignment:
Q  316 tgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgc 415  Q
    |||||||| ||| || || ||||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |     
T  50630114 tgcaaaaatcatgcaccttggtgctagcacttggatgtgttccgtaagtaaatccaaaactaaagtaaaaagataagggcttagggttgaaccttggggt 50630213  T
Q  416 aatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttga 474  Q
    ||||||||| || |||||||||  | |||  | ||||| || |||||||||| ||||||    
T  50630214 aatcctattattgtgggaaaattattggtttcaccatcatgtgtcctcacacaagttga 50630272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44395200 - 44395014
Alignment:
Q  32 catttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg 131  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||| ||  ||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  44395200 catttcaaccacttaacttgaattcgatggtttacatct---tctatttctctgttgtttagtactatggacccgagatatttaaatcgtgtaacttgcg 44395104  T
Q  132 gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctac 221  Q
     | || |||||||||||||||||| ||| ||  ||||  | |||  ||||  ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44395103 ttgtggtatgatctccaactttcatctctaaactagaaatgctttgccttttgctaaagttgcattccatatactctatcttgcttctac 44395014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30345313 - 30345175
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| || || || ||||||||  || |||||||| | | |||    ||||||||||    
T  30345313 tgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatactatgatttatatatgtttttatttctctttctttttgtactatgaacc----atatttaaac 30345218  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 161  Q
    | |||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30345217 cttgtagcttggggtatgatatgagcttccactttcacctcca 30345175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 224
Target Start/End: Original strand, 43111626 - 43111717
Alignment:
Q  133 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactca 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  43111626 tatgatatgatctccaactgtcacctctaaggtacaactacttcttcttttgctgaaattacattacatatactatgtcttacttctactca 43111717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46145929 - 46145799
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 128  Q
    ||||||| |||||| | | ||||||| | |||| ||||| ||  ||||||| || |||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  46145929 ctccattccaaccatctaacttgaattcaatggtttacacctctttctattgctacgtcgttttgtactatggactcaaaatatttaaaccgtataactt 46145830  T
Q  129 ggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    | ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  46145829 gtggtatgacataatctccaactttaacctc 46145799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26388222 - 26388153
Alignment:
Q  350 atgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatc 419  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  26388222 atgtgtttcgtaattacatccaaaactaaagtaaaaaaataagggctaagggttaacccttggtgcaatc 26388153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 805553 - 805519
Alignment:
Q  194 cattccatatactccgtcttgcttctactcaagcg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  805553 cattccatatactccgtcttgcttctactcaagcg 805519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 159
Target Start/End: Original strand, 1470683 - 1470733
Alignment:
Q  109 atatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1470683 atatttaaaccatgcaacttttggtatgatatgatctccaactttcacctc 1470733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19736562 - 19736520
Alignment:
Q  458 gtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19736562 gtcctcatactagtcgaagctccctcatacatatccttgatag 19736520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Original strand, 32490302 - 32490356
Alignment:
Q  101 gacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttca 155  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32490302 gacccaagaaatttaaattgtgtaacttgtggtatgatatgatcttcaactttca 32490356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Original strand, 30724311 - 30724435
Alignment:
Q  34 tttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggt 133  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||   |||||| |  |||||||||||  | ||||||||  | | | ||||||||| ||||| |||||||||   ||    
T  30724311 tttctaccacccaacttgaattcgataatttacatatcattctatttctcacttattttgtaatatgtatccaagatatctaaactgtgtaacttatagt 30724410  T
Q  134 atgatatgatctccaactttcacct 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  30724411 atgatatgatctccaacgttcacct 30724435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 421
Target Start/End: Original strand, 43111798 - 43111914
Alignment:
Q  305 actacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttg 404  Q
    |||| ||||||||||||| |  || |||| ||||||| |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||  |    
T  43111798 actatatcatctgcaaaatgattatatcttggtgctagcaattggacgtgtttcgtaagtacatccaaaaccaatgaaaaaagataagggattagggccg 43111897  T
Q  405 acccttggtgcaatcct 421  Q
    ||||||||| |||||||    
T  43111898 acccttggtccaatcct 43111914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3186547 - 3186500
Alignment:
Q  27 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgctt 74  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  3186547 ttcttcatttcaaccacccaacttgaatacgatgttttacatctgctt 3186500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 368
Target Start/End: Original strand, 24302292 - 24302355
Alignment:
Q  305 actacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacat 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||| |||| |||||||    
T  24302292 actacattatctgcaaaaagcatacatctcagtgttaaattttggatgtgtaccgtaaatacat 24302355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 168
Target Start/End: Original strand, 1448192 - 1448258
Alignment:
Q  102 acccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 168  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  1448192 acccaaaatatttaaaccatgcaacttttgatatgatatgatctccaacttttacctctaagctaga 1448258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 458 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19757380 - 19757338
Alignment:
Q  458 gtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19757380 gtcctcatactagtcgaagctccctcgtacatatccttgatag 19757338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 52138586 - 52138553
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttga 52  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138586 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 52138553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Original strand, 1426102 - 1426158
Alignment:
Q  102 acccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 158  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1426102 acccaaaatatttaaaccatacaacttttggtataatatgatctccaactttcacct 1426158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 436015 - 435509
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  436015 tgaggctcttctccatttcaaccactcagcttgaatacgatgacttacatctgcttctatttctccgtcattttatacgaaggacccaagatatttaaac 435916  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  435915 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcgtgcttc 435816  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  435815 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagacta---catctgc 435719  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  435718 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcact 435619  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  435618 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcttgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcc 435519  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  435518 taaccccttt 435509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 23906797 - 23907307
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906797 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 23906896  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906897 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 23906996  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatc-tg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23906997 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttccttcctcgactcacccaccaagactacatcatcttg 23907096  T
Q  318 caaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23907097 caaaaagcatacatctcggtgctaactcttggttgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaa 23907196  T
Q  418 tcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  23907197 tcctattgttatgggaaaatcttcggtagtctcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctaatatagacaatc 23907296  T
Q  518 ctaaccccttt 528  Q
    |||||||||||    
T  23907297 ctaaccccttt 23907307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 1777511 - 1778021
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1777511 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatttgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaa 1777610  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1777611 cgtgtaacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtattgcttc 1777710  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1777711 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggtttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 1777810  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1777811 ataaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagttaaaagataaggatttagggttgacccttggtgcaat 1777910  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttg-aagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     
T  1777911 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcctacgtcctcacactagttgaaagctccctcatacatatcattgatagccctaatataggcaatt 1778010  T
Q  518 ctaaccccttt 528  Q
    |||||||||||    
T  1778011 ctaaccccttt 1778021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 48623023 - 48623532
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48623023 tgaggcttttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaat 48623122  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48623123 cgtgtaatttggggtatgatatgctctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 48623222  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48623223 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccagatctatagcctcccgttcacttcctccctcgactcatccaccaagactacatcatctgc 48623322  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48623323 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttacgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagaacttagggttgaaccttggtgcaat 48623422  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  48623423 cctattgataagagaaaatcttcggtagtcaaatcatgcatcctcacactagtcgaagctccctcgtacatatctttgatagccctaatataggcaatcc 48623522  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  48623523 taaccccttt 48623532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 27450669 - 27451178
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  27450669 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcattttgcactatggacccaagatatgtaaac 27450768  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27450769 tgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtatacccacttctccttttgctgaagttacattccaaatactccgtcttgcttc 27450868  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  27450869 tactcaagcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctcgaggtctctagcctcccatttgactcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatcggc 27450968  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27450969 aaaaagcatacatctcggtgttaactcttggatgtgtttcgttagtacatccaaaactaaagtaaaaagagaaggacttagggttgacccttggtgcagt 27451068  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||    
T  27451069 tctattgttatgggaaaatctacgctatccccatcatgcgtcttcacactagtggaagctccctcatacatatcccagatagctctaatataggcaatcc 27451168  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    | | ||||||    
T  27451169 tcatcccttt 27451178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 56375076 - 56374738
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56375076 tgaggctcttctcaatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttatatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 56374977  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56374976 cgtgtaacttggggtatgatatgctctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 56374877  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56374876 tactcaagcggaatccatacacttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 56374777  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56374776 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttc 56374738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 53707580 - 53707242
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53707580 tgagtctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttagac 53707481  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53707480 cgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccactgaagttacattcgatatactccgtcttgcttc 53707381  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707380 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 53707281  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53707280 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttc 53707242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 39708241 - 39707740
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  39708241 aggctcttatccatttcaaccatccagcttgaatacgaggatttacacctgcttctatttctccgtcattttgtactatcgacccaagatatttaaaccg 39708142  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcta 220  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39708141 cataacttgaggtataatatgatctccaaatttcacctccaagatagacctaattctccttttgctgaagttatattccatatactccgtcttgcttcta 39708042  T
Q  221 ctcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaa 320  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||     |  || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39708041 ctcaggcagaaaccatacgcttctaaggcttgtcaccatgtctctagcctc-----ccgttgctccctcgactcaccaaacaagactacatcatctgcaa 39707947  T
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39707946 aaaacatacatatcggtgcaaactcttggatgtgttctgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttaacccttagtgcaatcc 39707847  T
Q  421 tattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatccta 520  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  39707846 tattgttatgggaaaatctttggtag-cccatcatgcgtcctcacgctagtcaaaactccctcatacatttccttgatagctctaatataggcaatccaa 39707748  T
Q  521 accccttt 528  Q
    ||||||||    
T  39707747 accccttt 39707740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 48174589 - 48174881
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174589 tgaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcactttgtacgaaggacccaagatatttaaac 48174688  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174689 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 48174788  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48174789 tactcaagcggaattcatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctctctcgactcacccaccaagactacat 48174881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Original strand, 31960309 - 31960595
Alignment:
Q  18 atgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960309 atgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaa 31960408  T
Q  118 ccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgctt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31960409 ccgtgtaaattggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactctgtcttgctt 31960508  T
Q  218 ctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  31960509 ctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgtttagttcctccctcgactcacccaccaag 31960595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33226995 - 33226805
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33226995 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 33226896  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33226895 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttgtccttccgctgaagttacattccatatactccg 33226805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16002714 - 16002350
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  16002714 tgaggctcttctcaatttcaaccactcagcttaaatacgatgatttacatctgcttctatgtctccgtcattttgtactatggaaccaagat-tttaaac 16002616  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccata---------------t 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||| ||||||||               |    
T  16002615 cgtgtaatttggggtatgatatgatttccaacttttacctccaaggtagactaacttctccttttgctaaagttatattccataaagttatattccatat 16002516  T
Q  204 actccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaa 303  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  16002515 actttgtcttgcttctactcaagcgcaaaccatacgcttctaaggcttgtctctaggtctctagcctcccgttcaattcctccctcaactcaccaagcaa 16002416  T
Q  304 gactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatc 369  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16002415 gactacgtcatatgcaaaaaacatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtaagtacatc 16002350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 353 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 53704062 - 53703887
Alignment:
Q  353 tgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccat 452  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53704062 tgttccatcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttacgggaaaatcttcggtagtcccat 53703963  T
Q  453 cttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  53703962 cctgtgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctaaccccttt 53703887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 47265703 - 47265887
Alignment:
Q  21 aggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccg 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||      
T  47265703 aggctcttcttcatttcaatcacccagcttgaa-acgatggcttacatttgcttctatttctccgtcattttatactatggatccaagatatttaaacta 47265801  T
Q  121 tgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatact 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  47265802 tgtaacttggggtatgatatgacctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttttgctgaagttacatttcatatact 47265887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 451
Target Start/End: Original strand, 1212017 - 1212235
Alignment:
Q  233 ccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatc 332  Q
    |||||| ||||| |||| || ||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1212017 ccatacccttctgaggcatgtctctaggtttctagcctcccgttcaatttctccctcgactcgccaatcaagactacatcatctccaaaaagcatacatc 1212116  T
Q  333 tcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatggg 432  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  || | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1212117 tcggtgctaactcttagatgtgttatgtaagtacatccaaaactaaagtgaaaagataaggacttagggttgaaccttggtgcaatcctattgttatggg 1212216  T
Q  433 aaaatcttcggtagcccca 451  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  1212217 aaaatattcggtagcccca 1212235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 50286752 - 50286625
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50286752 ctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacacaatatatttaaaccgtgt 50286653  T
Q  124 aacttggggtatgatatgatctccaact 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50286652 aacttggggtatgatatgatctccaact 50286625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 528
Target Start/End: Original strand, 55768963 - 55769387
Alignment:
Q  109 atatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactcc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||  | ||  ||| || |||||||  ||||||||     
T  55768963 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtagaacttcttagctttttgctaaaattacattttatatactct 55769062  T
Q  209 gtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagacta 308  Q
     | ||| ||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||| ||  || |||| |  |||   |||| |||||| ||| | || || | || |||||    
T  55769063 ttattgtttctacttaggcggaagccatacacctctaaggcttgtcttaag-tctccaatctcccattcaattcctctctcgaatctccaaacaggacta 55769161  T
Q  309 catcatctgcaaaaa-gcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgac- 406  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | ||||| | ||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||     
T  55769162 cattatctgcaaaaaagcatagaactcggagttaggtcttggatgtgttccataaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagggttcagggttgaca 55769261  T
Q  407 -----ccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagt 501  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||     
T  55769262 ccaacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaattgtctgtggctccatcttgcgtcctcaaactagtcgaagctccct-atacatatcattgatagc 55769360  T
Q  502 cgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||    
T  55769361 tctaatataagcaatcctaatcccttt 55769387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 10775928 - 10776367
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||   |  | |||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10775928 ctccatttcaaccacccattttgaattctatggtttacatct---taaacttctccatcattttgtattatagacccaagatatttaaaccatgtaactt 10776024  T
Q  129 ggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcg 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||   | ||| ||||  ||| || |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| |||    
T  10776025 gtggtatgatatgatctccaactttcccctctaaactagaaacatttcgccttttgctaaaattacattccatatagtatgtcgtgcttctgctcaggcg 10776124  T
Q  229 gaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcata 328  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| ||||| || ||   ||||   || | |||||| ||| |||| ||    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  10776125 gaagccatacatttctaaggcttgtctccaagtgtcctacctcccatttaattcctctctcgactctccatgtaggactatatcatctgcaaaaagcata 10776224  T
Q  329 catctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgtta 428  Q
    ||||| ||||    | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10776225 catcttggtgtccgctcttgaatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaaatgaaaagataagggcttggtgttgaaccttggtgcaatcctattgtca 10776324  T
Q  429 tgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagt 471  Q
    |||||||||| || ||  | ||| |||| || |||||||||||    
T  10776325 tgggaaaatcgtcagtgtctccaccttgtgttctcacactagt 10776367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 528
Target Start/End: Original strand, 55833219 - 55833643
Alignment:
Q  109 atatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactcc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||  | ||  ||| || |||||||  ||||||||     
T  55833219 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtagaacttcttagctttttgctaaaattacattttatatactct 55833318  T
Q  209 gtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagacta 308  Q
     | ||| ||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||| ||  || |||| |  |||   |||| |||||| ||| | || || | || |||||    
T  55833319 ttattgtttctacttaggcggaagccatacacctctaaggcttgtcttaag-tctccaatctcccattcaattcctctctcgaatctccaaacaggacta 55833417  T
Q  309 catcatctgcaaaaa-gcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgac- 406  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| | ||||| | ||   |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||     
T  55833418 cattatccgcaaaaaagcatagaactcggagttaggtcttggatgtgttccataaacacatccaaaactaaagtaaaaagataagggttcagggttgaca 55833517  T
Q  407 -----ccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagt 501  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||     
T  55833518 ccaacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaattgtctgtggctccatcttgcgtcctcaaactagtcgaagctccct-atacatatcattgatagc 55833616  T
Q  502 cgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||    
T  55833617 tctaatataagcaatcctaatcccttt 55833643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 46583320 - 46583404
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggac 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46583320 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggac 46583404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3273209 - 3272811
Alignment:
Q  18 atgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  ||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  3273209 atgaggctcatctccatttcaaccatccaacttgaattcgatggtttatatttgcttctatttctttgtcgttttgtactatggacctaagatgtttaaa 3273110  T
Q  118 ccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccata-tactccgtcttgct 216  Q
      |||||||||| |||       |||||  |||||| ||||| ||||||||  |||||   |||  ||| || |||||||||||| || |  | ||  ||    
T  3273109 ttgtgtaacttgtggt-------gatctttaactttaacctctaaggtagaaatactttgtcttttgcttaaattacattccataataatttgcctctct 3273017  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    ||| |||| | | || ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| | |||||  |||| |||||||||| |||| |  | ||| |||| || ||||    
T  3273016 tctgctcaggtgtaagccatatgcttttaaggcttgtctccaag-ctccaacctctcattcaattcctccctcgactctctaagcaatactatattatct 3272918  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||  | |||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3272917 acaaaaagcatacatctcaatgctaacgcttagattcgttctataaatagatccaaaactaatgtaaaaatataaagacttagggttgatccttggtgca 3272818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 1211886 - 1212017
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1211886 tgaggctcttctccatttcaactacctaacttgaatacgatgatttacacctgcttctatttctctgttattttgtactatggacacaagatatttaaac 1211985  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaac 150  Q
      |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1211986 tatgtaacgtaaggtatgatatgatctccaac 1212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Original strand, 17666532 - 17666895
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  17666532 catgatgctcttctccatttcaacaatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttcttcgacattttgtactttgaacccaagatatttaa 17666631  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    || ||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||||| ||||  | |||| || |||| |||||| |  ||||||||    
T  17666632 actgtgtaacttg---tatgatatgatctctaacgttcacctctaagatagaaatacttcgccttttgatgaaattgcattacatatatt--gtcttgct 17666726  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    ||||||||  || ||  |||| ||||||||| ||||  ||||         | ||   |||| ||||| |||| || | || |  ||||||||||||| |    
T  17666727 tctactcagacgaaagtcatatgcttctaagacttgtatccaa--------catccaattcaattccttcctcgacactccaattaagactacatcatat 17666818  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataagg 393  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||  || | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17666819 tcaaaatgcatacatctcggtgctagttgttggatgtgttatgtaagtacatccaaaactaatgtaaaaagataagg 17666895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 421
Target Start/End: Original strand, 17667845 - 17668221
Alignment:
Q  39 accacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgat 138  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||| | |||||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||  | |||||||   ||||||    
T  17667845 accatccaacttgaatacgatgatttacatttgcgtttatttctaagtcattttgtactatgaacccaatatatttaaactatataacttg---tatgat 17667941  T
Q  139 atgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatac 238  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||  | |||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||  |  ||  |||||    
T  17667942 atgatatccaactttcacctctaaggtataactacttcgcctt-tgttgaaattacattacatataat--gtcttgcttctactcagacaaaagtcatac 17668038  T
Q  239 gcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtg 338  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| | | ||   |||| | |||||||  || | |  |  ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  17668039 gcttctaagacttgtctccaagtctccaacatcccattcaatccctcccttgacactcaaattaagactacatcatcttcaaaacacatacatcttggtg 17668138  T
Q  339 ctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    |||    ||||||||||| ||| | |||| ||||||| || | ||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||    
T  17668139 ctagttgttggatgtgtttcgtaagtacacccaaaacaaatgtaaaaagataagggattaggattcacccttggtccaatcct 17668221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30853191 - 30852809
Alignment:
Q  30 tccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg 129  Q
    |||||||||| |||||  |||||||  |||||||   ||||  || |||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30853191 tccatttcaatcaccccacttgaatttgatggctgttatctctttttatttctctgtcgctttgtactatggacccaagatatttaaactgtgtagcttg 30853092  T
Q  130 gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcgg 229  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||  | | ||  |||  ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  30853091 tggtatgacatgttctccaaatttcaactctaagctagaattccgtcaacttttgctaaagttacattccatataatc--tcttgcttctactcaggcgg 30852994  T
Q  230 aatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatac 329  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||         ||||   || |  ||||||||| |||| || |  | ||||  || ||| |||||||| || |    
T  30852993 aagccatatgcttctaaggcttgtcttcaa--------cctcacatttaactcctccctcgactctccgagtaggactgtataatccgcaaaaagtatgc 30852902  T
Q  330 atctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatccta 422  Q
    ||||||||| |  | ||||||||| |||||| | | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30852901 atctcggtgatggctcttggatgtattccgtaagtgcgttcaaaactaaagtaaaaagataagggcttagagttgacccttggtgcagtccta 30852809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20917762 - 20917540
Alignment:
Q  25 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgta 124  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||| ||| | ||| |   ||||||||||| |||||    
T  20917762 tcttctccattttaaccatctagattgaattcgatgacttacatatgtttctatttctccgttgttttatactatggagctcggatatttaaactgtgta 20917663  T
Q  125 acttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactca 224  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||   ||| || | ||||| | | || |||||||  || ||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  20917662 acttatggtatgatatgatcttcaactttcacccttaagataaaactactacacatttcgctgaaactatattccatatactatgtcttacttctactta 20917563  T
Q  225 agcggaatccatacgcttctaag 247  Q
    |||||||  ||||| ||||||||    
T  20917562 agcggaagtcatacacttctaag 20917540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 54787739 - 54787878
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||| | |||||| || |||||||||   ||||| |||||||||||    
T  54787739 catgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaa 54787838  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcac 156  Q
    |||||||||  |||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  54787839 accgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 54787878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41427574 - 41427420
Alignment:
Q  70 tgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac 169  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| | |  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||     
T  41427574 tgcttatatttctccgtcattctgtactatgagcacaagatatttaagtcgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaattttcacttttaaggtagaa 41427475  T
Q  170 ctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactca 224  Q
    |||||||   ||  |||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  41427474 ctacttcgttttttgctgaaattacatttcatataccatgtcttgcttctactca 41427420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 43433704 - 43433643
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctattt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43433704 tgaggctcttctccatttcaatcacccagcttgaatacgatggtttacatctgcttctattt 43433643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30807331 - 30807244
Alignment:
Q  72 cttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30807331 cttctatttctcagtcattttgtactatagactccaaacatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctc 30807244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1629208 - 1629084
Alignment:
Q  28 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaact 127  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| ||| | | |  ||||||||||||||  |||||||    
T  1629208 tctccatttcaaccactcaagttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcgttttatactatgaattcaagatatttaaactatgtaact 1629109  T
Q  128 tggggtatgatatgatctccaactt 152  Q
    || || | ||||||||||| |||||    
T  1629108 tgtggcacgatatgatctcaaactt 1629084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42037603 - 42037510
Alignment:
Q  63 ttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcac 156  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  42037603 ttacatctccttatatttctcagtcattttgtactatagattcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgggatgatatgatcttcaaatttcac 42037510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 7092719 - 7092847
Alignment:
Q  30 tccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||   ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  7092719 tccatttcaaccacccaacttgaataatatgatgtacatctgcatctatttattcgttattttatactatagacccacaatatttaaaccgtgtaattta 7092818  T
Q  130 gggtatgatatgatctccaactttcacct 158  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7092819 agatatgatatgatcttcaactttcacct 7092847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 159
Target Start/End: Original strand, 39754911 - 39755007
Alignment:
Q  63 ttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 159  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |  |||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39754911 ttacatctccttctatttctttgtcgttttgtactatagacccatgatatttaaagtgtgtgacttgtggtatgatatgatcttcaactttcacctc 39755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 41009855 - 41009922
Alignment:
Q  25 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcatttt 92  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41009855 tcttctccatttcaaccacctaacttgaatacgaagatttacatttgcttctatttctccgtcatttt 41009922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 45185475 - 45185542
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctcc 84  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  45185475 catgaggctcttctccctttcaaccactaagcttgaatacaatgatttacatctgcttctatttctcc 45185542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 440
Target Start/End: Original strand, 32911613 - 32911743
Alignment:
Q  310 atcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgaccct 409  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| |  | ||||| | |||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32911613 atcatctacaaaaagcatgcatcttggtgttggctcttggttttgttccataagtatgtccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagagttgacact 32911712  T
Q  410 tggtgcaatcctattgttatgggaaaatctt 440  Q
    ||||| | ||  |||||||||| || |||||    
T  32911713 tggtgtagtctcattgttatggaaagatctt 32911743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 44860541 - 44860386
Alignment:
Q  372 aaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagt 471  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||| |||| |   ||| |||| ||||||||    
T  44860541 aaactaaagtaaaaa-ataagggcttaggattgacccttggtgcaatcttgttgttatgataaaatcgtcggtggccctacactgcatccttacactagt 44860443  T
Q  472 tgaagctccctcatacatatccttgatag-tcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
     || |  | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  44860442 cgatgtcctctcatacatatcctagatagctcg-aatatagacattcctaaccccttt 44860386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 42037409 - 42037242
Alignment:
Q  304 gactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggtt 403  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||   | | ||||||||||||||| |  ||||  |||||  |||| |||    
T  42037409 gactatatcatctgcaaaaaaaatacatctcggtgctcgctcttggatgtgttttctaagtacatccaaaactaaggtgaaaatgtaagggattagtgtt 42037310  T
Q  404 gacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagt 471  Q
    || ||||||| ||||| |||| || ||||| |||||| | |  | ||| |||| ||||||||||||||    
T  42037309 gaaccttggtacaatcttattattttgggagaatcttagatgtctccaccttgtgtcctcacactagt 42037242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35690086 - 35690019
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     ||||||||||||| ||||||||||    
T  35690086 ctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatttaca-----ttctatttctccggcattttgtac 35690019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 55578814 - 55578687
Alignment:
Q  25 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgta 124  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  |||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |  || ||||||||||||||   |  |    
T  55578814 tcttctccattttaaccacctaacttaaatacgatgatttatgtatgcttctatttctcagtcattttatactatagatccaagatatttaaa---tcaa 55578718  T
Q  125 acttggggtatgatatgatctccaactttca 155  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55578717 atttgtggtatgatatgatctcaaactttca 55578687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Original strand, 35555989 - 35556056
Alignment:
Q  191 ttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctcca 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||| |||||    
T  35555989 ttacattccatatgctctgtcttgcttctactcaagtgaaaaccatatgtttctaaggcttgtctcca 35556056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15183556 - 15183431
Alignment:
Q  304 gactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggtt 403  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| || | ||||||  | ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  15183556 gactatatcatatgcaaaaaacatatatattggtgctcgctcttggatgtattatgtaaatacatccaaaactaaagtgaaaagataagggcttagtgtt 15183457  T
Q  404 gacccttggtgcaatcctattgttat 429  Q
     |   ||| || ||||||||||||||    
T  15183456 aaagtttgatgtaatcctattgttat 15183431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Original strand, 54914728 - 54914781
Alignment:
Q  63 ttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  54914728 ttacatctgtttctatttctccatcattttataccatggacccaagatatttaa 54914781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41427321 - 41427202
Alignment:
Q  326 atacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaaga--taaggacttagggttgacccttggtgcaatcctat 423  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| |||||  || | ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  || | ||||||| || |||||||||||||    
T  41427321 atacatcttagtgctaactcttggacgtgttttgtaagtacttccaaaactaaagtaaaaaaaaataagagctaatggttgacactcggtgcaatcctat 41427222  T
Q  424 tgttatgggaaaatcttcgg 443  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  41427221 tgttatggaaaaatcgtcgg 41427202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21060233 - 21060105
Alignment:
Q  345 cttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggt 444  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | || ||| |||||| ||||||| | ||||||  ||||  ||  |    
T  21060233 cttggatgtgttatgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaggataagtgcttatgattaacctttggtgtaatcctactcttatgg--aaatagtcatt 21060136  T
Q  445 agccccatcttgcgtcctcacactagttgaa 475  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  21060135 agccccatcttgcatcctcatattagttgaa 21060105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Original strand, 52280701 - 52280806
Alignment:
Q  26 cttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaa 125  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||   |||||  ||||||  ||||||| | |||||||||    ||||||| ||||||||| |||||||    
T  52280701 cttctccatttcaaccacacaacgtgaatacgattatttacacttgcttcagtttctcctttattttgtactttagacccaaaatatttaaatcgtgtaa 52280800  T
Q  126 cttggg 131  Q
    | ||||    
T  52280801 cctggg 52280806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 8917823 - 8917899
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgta 95  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||| |||||| ||||||  |||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8917823 tgaggctcttctcaatttcaattatccaacttgaaaacgatgatttatgtctgcttttatttctctgtcattttgta 8917899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Original strand, 22421216 - 22421256
Alignment:
Q  30 tccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  22421216 tccatttcaaccacccagcttgaattcaatggtttacatct 22421256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Original strand, 452118 - 452621
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452118 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 452217  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452218 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaac------ctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 452311  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  452312 tactcaagtggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgt 452411  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452412 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 452511  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  452512 cctattgttatgggaaaatcttcggtagtctcatcctgcgtcctcacactagtcgaacctccctcatacatattcttgatagccctaatataggcaatcc 452611  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  452612 taaccccttt 452621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2610314 - 2609805
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610314 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggtttacatctgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 2610215  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2610214 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttc 2610115  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610114 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtttctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 2610015  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610014 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 2609915  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2609914 cctattgttatgggaaaatctttggtagtcccatcctgcgtcctcacactaatcgaagctctctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcc 2609815  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    | ||||||||    
T  2609814 ttaccccttt 2609805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 528
Target Start/End: Original strand, 38453114 - 38453623
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38453114 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtatgaaggacccaagatatttaa 38453213  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38453214 atcgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac-tacttctccttccgctgatgttacattccatatactccgtcttgct 38453312  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38453313 tctacttaagcggaatccatacgcttctatggtttgcctccag-tctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatct 38453411  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38453412 gcaaaatacatacatctcggtgctaactcttggatgtgttttgtcaatacatccaaaactaaagtaaagagatgaggacttagggttgacccttggtgca 38453511  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38453512 atcctattgttatgggaaaatcttcggtaatcccatcctgcgtcctcacactagtcgaaactctctcatacatatccttgatagccctaatataggcaat 38453611  T
Q  517 cctaaccccttt 528  Q
    ||||||||||||    
T  38453612 cctaaccccttt 38453623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8180566 - 8180072
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  8180566 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttataagaaggacccaaaatatttaaac 8180467  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8180466 cgtgtaacttggagtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccactgaaattacattccatatactctgtcttgcttc 8180367  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||| |||||||               ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180366 tactcaagtggaatcc---------------ttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 8180282  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8180281 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgtttcgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttatggttgacccttggcgcaat 8180182  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8180181 cctattgttatgggaaaatcttcggtagttccatcctgcgacctcacactagtcgaagctccctcgtacatatccttgatagccctaatattggcaatcc 8180082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 528
Target Start/End: Original strand, 24584103 - 24584611
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 119  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24584103 gaggctattctccatttccaccacccagcttgaatatgatggcttaaatctgcctatatttctccatcattttgtactatggacccaagatatttaaacc 24584202  T
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24584203 gtgtaacttgcggtctgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacataattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgtttct 24584302  T
Q  220 actcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgca 319  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||   |||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24584303 actcaagcggaaatcatacgcttctaagactggcctttgggtctctagcctcccgttcaattcctcccttgactcaccaagcaagactacatcatctgca 24584402  T
Q  320 aaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatc 419  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24584403 aaaaacatacatctcggtgataactcttggatgtgttccgttagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatc 24584502  T
Q  420 ctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcct 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  24584503 ctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcctgcgtcttcacagtagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctgatataggcaatcct 24584602  T
Q  520 aaccccttt 528  Q
    |||||||||    
T  24584603 aaccccttt 24584611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Original strand, 45368120 - 45368627
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  45368120 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 45368219  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctac--ttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45368220 cgtgtaatttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgct 45368318  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  45368319 tctactcaggcgaaaaccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatct 45368418  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368419 gcaaaaagcatacatctcggtgctaattcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 45368518  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaat 516  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  45368519 gtcctattgttatgggaaaatctacggtatccccatcctgcatcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcctggatagctctaatataggcaat 45368618  T
Q  517 cctaacccc 525  Q
    ||| |||||    
T  45368619 cctcacccc 45368627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 133 - 403
Target Start/End: Original strand, 12475031 - 12475301
Alignment:
Q  133 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12475031 tatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttatactcaagaggaat 12475130  T
Q  233 ccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475131 ccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatc 12475230  T
Q  333 tcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggtt 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  12475231 tcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagaaaaggacttaaggtt 12475301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4807378 - 4807130
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4807378 tgagactcttctccatttcaaccacccatcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagacccaagatatttaaac 4807279  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807278 tgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 4807179  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctag 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4807178 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaagtctctag 4807130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 34 - 339
Target Start/End: Original strand, 41763560 - 41763865
Alignment:
Q  34 tttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41763560 tttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaatcgtgcaacttggggt 41763659  T
Q  134 atgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatc 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41763660 atgatataatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaggcggaaac 41763759  T
Q  234 catacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatct 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763760 catacgctactaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaaaagcatacatct 41763859  T
Q  334 cggtgc 339  Q
    ||||||    
T  41763860 cggtgc 41763865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30743411 - 30743070
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  30743411 catgaggctcttctcaatttcaatcactcagcttgaatacgatgatttatatctacttctatttatccgtcattttgtactattgacctaagatatttaa 30743312  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30743311 accgtgtaacttgggatatggtatgatctccaactttcacctccaaggtagaccaatttctccttttgctgaagttacattccatatactctgtctttct 30743212  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  30743211 tctacccaggcggaaaccatatgcttctaaggtttgtctccaagtctctagcgaccagttcaattcctccctcgactcaccaagcaaaactacatcatct 30743112  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttcc 358  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30743111 gcaaaattcatacatctcggtactaattcttggatgtgttcc 30743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3865858 - 3865661
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3865858 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttacatttgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagttattgaaac 3865759  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3865758 cgtgtaacttgggatacaatatgatctccaactttcacctccaaggtagacgtacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgct 3865661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 11992602 - 11992822
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  11992602 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaac 11992701  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11992702 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacccacttctctttttactgaagttacattccatatacttcgtcttgcttc 11992801  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacg 239  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  11992802 tactcaggcggaaaccatacg 11992822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 37281878 - 37281388
Alignment:
Q  36 tcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtat 135  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37281878 tcaaccacccaacttgaataggatgatttacatctacttctatttctccttcattttatactatggagctaagatatttaaaatgtgtaacttggggtat 37281779  T
Q  136 gatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagt--tacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatc 233  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||  | ||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  37281778 gacatgatctcaaactttcacctccaaggtagaactactttgtcttttgttgaagtactacatttcatatactttgtcttgcttctactcaagcggaagc 37281679  T
Q  234 catacgcttctaa---ggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcataca 330  Q
    ||||  |||||||   | ||   ||||| ||| ||  |||||  |||| ||| |  ||| |||  |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37281678 cataaacttctaacatgactcatctccaagtccctgacctctcattcaattcatatctcgactatcccaacacgactaaatcatctacaaaaagcataca 37281579  T
Q  331 tctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatg 430  Q
     || ||||||||| | |||||||||| ||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | | || |||||| |||||||||    
T  37281578 ccttggtgctaacccatggatgtgtttcgtaagtacatctaaacctaaagtaaaaagataagggcttagg-ttgactcatagtccaatccaattgttatg 37281480  T
Q  431 ggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaac 522  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  37281479 ggaaaatcgtcggtagccctctcatgtttcctcacactagttgaagctcccttatacatatccttgatagttctaatataatcaatcctaac 37281388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 339 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16292179 - 16291990
Alignment:
Q  339 ctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatc 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  16292179 ctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttgatgcaatcctaatgttatgggaaaatt 16292080  T
Q  439 ttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16292079 ttcggtagtcccatcctgtgtcctcacactagtcgaagctctctcatacatatccttgatagtcctaatataggcaatcctaaccccttt 16291990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 3244147 - 3244312
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244147 tgaggctcatctccatttctaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 3244246  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaa 189  Q
    ||||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244247 cgtgtaacttgg-----gatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaa 3244312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13149095 - 13148635
Alignment:
Q  23 gctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtg 122  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  13149095 gctcttcttcatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttgtatctacttctatttctccgtcattttgtactatggacctgagatatttaaaccgtg 13148996  T
Q  123 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  |||||| |||||||    
T  13148995 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggttaaactatttctccttttgctgaagttacaccccatataatatgtcttg-ttctact 13148897  T
Q  223 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaa 322  Q
     |||| |||  ||||| |||||||   ||         |||||| ||||   |||| || |||  || |||| || | |   ||| |||||||| |||||    
T  13148896 taagcagaactcatacacttctaaaattt--------atctctaacctcccattcaatttctcattcgactctccaagcggaactgcatcatctacaaaa 13148805  T
Q  323 agcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatccta 422  Q
     ||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  13148804 tgcatacatcttagtgctagctcttggatgtgttctgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaaagtaagggtttacggtagacctttggtgcaattcta 13148705  T
Q  423 ttgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatc 492  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||| || |||| |||||||||||    
T  13148704 ttgttatcgaaaaatcttcagtagccccatcttacgtctttactctagttaaaactccatcatacatatc 13148635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14770077 - 14769604
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccaccc-agcttgaatacgat-----ggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     |  |||||| |||||  ||||||| ||  |||||||| | || || ||||||||||||    
T  14770077 ctcttctccatttcaaccaccccagcttgaatatgatataatgatttacatatgcttgaatttctctgttgttttgtactatggccctaagatatttaaa 14769978  T
Q  118 ccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgctt 217  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||         ||||  || ||| ||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14769977 ccgtgtaacttatgctatgatatgatctccaacttaca---------tagaaataattcgcctttagctaaaattacattccatatactctgtcttgctt 14769887  T
Q  218 ctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctg 317  Q
    ||| ||| ||  || ||  || ||||||||||||| || || ||||| | |||||  || | ||| |||||| |||| || | || ||||||||||||      
T  14769886 ctattcacgcaaaagccggacacttctaaggcttgtcttcaagtctccaacctctcattgaattcgtccctcgactctccaagcatgactacatcatcgc 14769787  T
Q  318 caaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagata-aggacttagggttgacccttggtgca 416  Q
     ||||| ||||||| | ||||||| | |||| ||||||   || | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14769786 aaaaaaacatacatattggtgctagctcttgaatgtgtgatgtaagtacatccaaaattaaagtaaaaagatacagggcttagggttgacccttggtgca 14769687  T
Q  417 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
    ||| ||||||| ||||||| | | |||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  14769686 atcatattgttttgggaaattgt-cggtggccccatcccgtgtcctcacactagttgatgctctctcatacatatcattgatag 14769604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 322 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 876637 - 876462
Alignment:
Q  322 aagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  876637 aagcatacatcttggtgctcgctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaacgaaggtgaaaagataagggcttagtgttgaaccttggtgcaatcct 876538  T
Q  422 attgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatag 500  Q
     ||||||||||||||||||| ||  | |||  ||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  876537 gttgttatgggaaaatcttcagtgtctcca--ttgtgtcctcacactagtcg-agacccctcatacatatccttgatag 876462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17581254 - 17581052
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |  |||||||||||| |||||||  |||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  17581254 tgagactcttctccatttgaaccatccaacttgaatatgaggatttacatctgcttttatttctttgtcattttgtacaatgaacccaaga-atttaaac 17581156  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||| | ||   |||||  |||||| ||||||||  | ||||||||    
T  17581155 tgtgtaactt---gtatgatatgatctctaactttcacttctaaggtcgaactacttcgcattttactgaaactacattacatatactatggcttgcttc 17581059  T
Q  219 tactcaa 225  Q
    |||||||    
T  17581058 tactcaa 17581052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Original strand, 33594775 - 33594904
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 128  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |   ||| ||||||||||||| |||||| |     
T  33594775 ctccatctcaaccacccagtttgaatttgatgttttacatctccttctatttctccgacgttttgtactatatacctaagatatttaaactgtgtaaatg 33594874  T
Q  129 ggggtatgatatgatctccaactttcacct 158  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33594875 ctggtatgatatgaactccaactttcacct 33594904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Original strand, 6238247 - 6238326
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  6238247 catgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttacatatgtttttatttctccgacattttgtac 6238326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 876833 - 876679
Alignment:
Q  104 ccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatat 203  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     ||||||||   ||| || ||||||||||||     
T  876833 ccaacatatttaaactgtgtaacttgtggtaggatatgatctccaactttcacctctatgctaggaacgcttctcctctggctaaaattacattccataa 876734  T
Q  204 actccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctcca 258  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||    
T  876733 actcggtcttgcttctaactaagcgaaagccatatgtttctaaggcttgtctcca 876679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12904740 - 12904522
Alignment:
Q  33 atttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggg 132  Q
    |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||||| || | | |||||| | ||||||||| |  ||| | | ||||||||||||||||||||| |     
T  12904740 atttcaaccacctaacttgaattctatggtttacatctcctccaacttctccattattttgtactatagacaccatatatttaaaccgtgtaacttgtga 12904641  T
Q  133 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaat 232  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||     ||| ||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||     
T  12904640 tatgatatgatctccaatttgtacctctaaactagaaacgtttcgccttttgct-aaattacattctatatactccgtcttatttctactcatgtggaag 12904542  T
Q  233 ccatacgcttctaaggcttg 252  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  12904541 ccaaacgtttctaaggcttg 12904522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36038921 - 36038803
Alignment:
Q  104 ccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatat 203  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||| ||||||| ||||  |||||| | ||||||||||     
T  36038921 ccaagatatttaaatgatgtaaattggggtatgatatgatcttcaactttcagttataaggtagaactacttcgccttttgctgaaatcacattccatac 36038822  T
Q  204 actccgtcttgcttctact 222  Q
    ||||  |||| ||||||||    
T  36038821 actctatcttccttctact 36038803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 264
Target Start/End: Original strand, 13592930 - 13593089
Alignment:
Q  102 acccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccat 201  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||  |||  | |||||||||||| ||     
T  13592930 acccaagatatctaaactgtgtaacttc---tatgatatgatcttcaactttcacctctaagtttgaactacttcgtcttttgttgaagttacattacac 13593026  T
Q  202 atactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctc 264  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |  ||  | |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  13593027 ataccatgtcttgcttctactcaaacaaaagtcttacggttctaagacttgactccaggtctc 13593089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6465259 - 6465076
Alignment:
Q  302 aagactacatcatctgcaaaaagcatacatctc-ggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaa-gataaggacttag 399  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||| |  ||||||| | ||||||| |||||||| |   || |||| ||||||| ||||| ||||||   ||||    
T  6465259 aagactatatcatctgtaaatagcagacatttttggtgctagctcttggatatgttccgttagagcaaccaacactaaagtaaaaaagataagtgattag 6465160  T
Q  400 ggttga-cccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccct 482  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | | || ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  6465159 ggtttaacccttggtgcaatcctattgttatggggaaatcgtcggtggtctcttcctgcatcctcatactagttgaagccccct 6465076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 335
Target Start/End: Original strand, 11992853 - 11992897
Alignment:
Q  291 actcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcg 335  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992853 actcaccaagcaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcg 11992897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 41197724 - 41197765
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatg 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41197724 tgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatg 41197765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12904424 - 12904254
Alignment:
Q  350 atgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccc 449  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| |||||  ||||  ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | |    
T  12904424 atgtgttccatacatacatccaaaa-taaagtgaaaacgtaagggcttattgttgaactttggtgcaatcctattgttatgtgaaaatcgtcgttatcac 12904326  T
Q  450 catcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaa 521  Q
    || |||  |||||||  ||||| || ||   ||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||    
T  12904325 caccttatgtcctcattctagtcgaggcctactcatacatatccttcatatctaaaatataggcaatcctaa 12904254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23866351 - 23866285
Alignment:
Q  109 atatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctactt 175  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  23866351 atatttaaattgtgtaatttgtggtatgatatgatctctaactttcacatctaagttagaactactt 23866285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 444
Target Start/End: Original strand, 34502165 - 34502215
Alignment:
Q  394 acttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggt 444  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34502165 acttagggttgatacttggtgtaatcctattgttatgagaaaatcgtcggt 34502215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7292761 - 7292697
Alignment:
Q  32 catttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 96  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  7292761 catttcaaccacccaacttggatttgatggtttacatctccttctattcccccgtcagtttgtac 7292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26433888 - 26433840
Alignment:
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 168  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  26433888 gtgtaacttgtggtatgacatgatctccaactttcatctctaagttaga 26433840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31254 - 30745
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31254 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcctacatctacttttatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatgtttaaac 31155  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31154 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactcagtcttgcttc 31055  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31054 tactcaagcggaatccatacacttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgc 30955  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30954 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttaggattgacccttggtgcagt 30855  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30854 cctattgttttgggaaaatcttcggtagtcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcc 30755  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    ||||||||||    
T  30754 taaccccttt 30745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 23 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 9706558 - 9706044
Alignment:
Q  23 gctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9706558 gctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacacctgcttctatttctccatcattttgtaccatggacccaagatatttaaaccgtg 9706459  T
Q  123 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9706458 taacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtatacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccatcttgcttctact 9706359  T
Q  223 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct-gcaaa 321  Q
    || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |  | ||||||| ||||||| | |||||||||||||| | | |||    
T  9706358 caggcgggaaccatactcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaacttctccctcgactcaccaagcaagactacatcatttgggaaa 9706259  T
Q  322 aagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 421  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  9706258 aagcatacaactcggtgctaactcttggatgtgtttcgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttaaggttgacccttggtgcagtcat 9706159  T
Q  422 attgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaa 521  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   |||| ||||||||||| |    
T  9706158 attgttatgggaaaatctacggtatcctcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcctggaaagctctaatttaggcaatcctca 9706059  T
Q  522 cccctttgcttctaca 537  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9706058 ccccttt-cttctaca 9706044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 445
Target Start/End: Original strand, 5258644 - 5259073
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5258644 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatgtacatcagcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaa 5258743  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5258744 actgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgct 5258843  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |  ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  5258844 tctactcaggcggaagccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagcaagacttcatcatct 5258943  T
Q  317 gcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaag-caaaaagataaggacttagggttgacccttggtgc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258944 gcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaaagataaggacttagggtttacccttggtgc 5259043  T
Q  416 aatcctattgttatgggaaaatcttcggta 445  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5259044 aatcctattgttatgggaaagtctacggta 5259073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 528
Target Start/End: Original strand, 20428133 - 20428642
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaacc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  20428133 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttggatacgatgatttacatctgcttctatttttccgtcgttttgtactgtggacccaatatatttaaacc 20428232  T
Q  120 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 219  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20428233 gcgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctcctaggtagacctaattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttcc 20428332  T
Q  220 actca-agcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||   || |  ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20428333 actcatggcgaaaaccatacgcttctaaggcttgcctctagatatctagcctcccatttaactcctcccttgactcaccaagcaagactacatcatctgc 20428432  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  20428433 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttgaatgtgttccgtaagtacatccaaagctaaagtaataagataaaaacttagggttgacccttggtgcagt 20428532  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcc 518  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  20428533 cctattgttatgggaaaatatacggtatccccatcctacttcctcacactagtcgaagctcccacatacatatcctggatagctctaatataggcaatcc 20428632  T
Q  519 taaccccttt 528  Q
    | ||||||||    
T  20428633 tcaccccttt 20428642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 24 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5631599 - 5631208
Alignment:
Q  24 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaaga-tatttaaaccgtg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  5631599 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaaaaatatttaaaccgtg 5631500  T
Q  123 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5631499 taacttggggtatgatatgatctctaactttcacctgcaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttctact 5631400  T
Q  223 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaa 322  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||   || |  ||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||| |||||||    
T  5631399 catgcggaaaccatactcttctaaggcttgcctacaggtctccagcctcccatttaactcctccctcgactcaccaagaaagactagatcatatgcaaaa 5631300  T
Q  323 agcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtg 414  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  5631299 aacatgcatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttaagattgaccctaggtg 5631208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 137 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30670556 - 30670165
Alignment:
Q  137 atatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  30670556 atatgatctccaactttcacctccaaggtatacctacttctccttttgctaaagatacattctatatactccgtcttgcttcttctcaagcgaaaaccat 30670457  T
Q  237 acgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30670456 acgcttataaggcttgcctctaggtctctaacctcccgttcaattcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcaa 30670357  T
Q  337 tgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaa 436  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30670356 tgctaactcttggatgtattccgtcagtacacccaaaactaaagtaaaaagacaaggatttatggttgacccttggtgcaatcttattgttatgggaaaa 30670257  T
Q  437 tcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    |||| |||| || |||| ||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30670256 tcttaggtaacctcatcatgcatcctcacactagtcaaaactcccttatacatatcctggatagctctaatataggcaatcttaacctcttt 30670165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 10100351 - 10100678
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10100351 catgaggctcttctccattccaaccacccagcttgaatacgatgatttatatcagcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaa 10100450  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100451 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcattttgctaaagttacattccatatactccgtcttgct 10100550  T
Q  217 tctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatct 316  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||| | ||||| |||| ||||||  | ||| ||||||||||||    
T  10100551 tctactcaggcggaaaccatatgcttctaaggctcacctcctggtctctagcctccagtttaattccttcctcgactcactaagcaatactacatcatct 10100650  T
Q  317 gc-aaaaagcatacatctcggtgctaac 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  10100651 gcaaaaaaacatacatctcggtgctaac 10100678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 293 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 6082912 - 6082677
Alignment:
Q  293 tcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6082912 tcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataag 6082813  T
Q  393 gacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatc 492  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6082812 aacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttacgagaaaatcttcggtagtctcatcttgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatc 6082713  T
Q  493 cttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6082712 cttgatagttctaatataggcaatcctaaccccttt 6082677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33495983 - 33495632
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||            
T  33495983 tgagactcttctccatttcaaccatccagcttgaatatgatgagttacatatgcttctatttctccgttattttgtactatggacccaagat-------- 33495892  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33495891 -gtgtaactaggg-tatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacctacttctccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttgcttc 33495794  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  33495793 tactcaggcggaaaccatacgcttttaaggtttgactccaagtctctagcctcctgttcaattcctccctcaactcaccaagcaagactacatcatatgc 33495694  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaag 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33495693 aaaaagcatacatctcgatgctaaatcttggatgtgttccgtcagtacattcaaaactaaag 33495632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 172 - 525
Target Start/End: Original strand, 2680699 - 2681049
Alignment:
Q  172 acttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctc 271  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  2680699 acttctccttttgctgaaattacatttcatatactctgtcttgcttctacgcagatgaaaatcatacgcttctaaggcttgtctccaagtctctagcatc 2680798  T
Q  272 tggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatcca 371  Q
      ||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | ||||||||    
T  2680799 ccgttcagttcctcactcgactcatcaagcaagactacgtcatccgcaaaatgtatacatctcgatgctaacacttggatgtgttatgtaagtacatcca 2680898  T
Q  372 aaactaaag-caaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactag 470  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  2680899 aaactaaagtaaaaaagataaggacttacggttgaccc-tggtgcaa---tattgttatggaaaaattttcggtagccccatcctgtgttctcacactag 2680994  T
Q  471 ttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaacccc 525  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||    
T  2680995 tcgaagctccttcatgcatatccttgatagctctaaaataggcaatgctaacccc 2681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 26291567 - 26291059
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||  || | | ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  26291567 catgaggttattctacatttcaaccatccaacttgaatacgttgatttgcgtatgcttctatttctccatcattttctactatggactcaagatatttaa 26291468  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatata--ctccgtcttg 214  Q
    || ||||||||| |||||||||||     |||||||||||||   ||||| | ||||| | ||||  | ||||||||||||  |||||  ||  ||||||    
T  26291467 acggtgtaacttagggtatgatat-----ccaactttcacctttcaggtacaactactacgccttttgttgaagttacattatatatatactttgtcttg 26291373  T
Q  215 cttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcat 314  Q
     |||||||||  || ||| |||||||||||||| |||   |||| |||  || ||||   | || |||||||||| |||  || | || |||||||||||    
T  26291372 tttctactcagacgaaattcatacgcttctaagacttctatccaagtcattaacctcccatgcaattcctccctcgactttccaagcaggactacatcat 26291273  T
Q  315 ctgcaaaaa-gcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggt 413  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||| | ||||||    
T  26291272 ctgtaaaaaagcatacatcacggtgttaactcttggatgtgttccgtaaatacatccaaaattaaagtgaaacgacaag-acttagggttggcacttggt 26291174  T
Q  414 gcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggc 513  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |||| |||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||    
T  26291173 gcaatcctattgttatgaaaaaattgtcaatagcgccatcttaagtcctcaaactacttgaagctccctcatacatatcgttgatagttatcatataagc 26291074  T
Q  514 aatcctaaccccttt 528  Q
    |||||||| ||||||    
T  26291073 aatcctaaacccttt 26291059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27790942 - 27790469
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||  ||| |  ||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  27790942 tgaggctcttctctatttcaaccactcaactttattatgatgatttagacttgcttctatttatgcgtcattttgtactatggatccaagatatttaaac 27790843  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    | ||||| |||| ||||  ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||| |||||  | |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  27790842 catgtaatttggagtattttatgacctcccaccttcacctccatggtagaactacttatccttttgttgaagttacactccatataccctgtcttgcttc 27790743  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||| || ||| ||   |||| |||| ||||||||  || | || |||| ||||   |||| |||||||||| || | || | || ||||||||||| ||     
T  27790742 tacccaggcgaaagttatacacttcaaaggcttgtatcaaagtatctaacctcccattcaattcctccctcgacactccaaacatgactacatcatatgt 27790643  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaat 418  Q
     |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| | | | | ||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  27790642 gaaaagcatacatcttgatgctaacttttggatgtgtttcataagtgcattcaaaactaaagtaaaaaggtaagggtttagggttgacccttggtataat 27790543  T
Q  419 cctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatc 492  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||  | |||| ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  27790542 ccttttgttatgggaaaatcgtaggtatactcatcatgtatcctcacactagtcgaaactccatcatacatatc 27790469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 469
Target Start/End: Original strand, 2208066 - 2208348
Alignment:
Q  187 gaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctcc 286  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||   |||||| |||||| || | ||||| ||||||| |||    |||| |||||||    
T  2208066 gaagttacattccatatattttgtcttacttctactcaggcggaagttatacgcatctaagactagtctccaagtctctaaccttccattcaattcctcc 2208165  T
Q  287 ctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaa 386  Q
    ||| | |  || | |||||||||||||| ||| |||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2208166 ctcgattttccaagcaagactacatcatttgccaaagtcgtacatcttggtgctaactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaa 2208265  T
Q  387 gataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacacta 469  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  2208266 ggtaagggcttaggattgacccttggtgcaatcatattgatatggaaaaatcgttggtagtcccatcttgcatcctcatacta 2208348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2689444 - 2689313
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  2689444 catgaggcacttctccatttcaatcatccagcttgactacgatgatttacatctgattctatttctccgtcgttttgtactatagacccaaaatatttaa 2689345  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2689344 accgtgtaacttagggtatgatatgatctcca 2689313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 345 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3629690 - 3629566
Alignment:
Q  345 cttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggt 444  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3629690 cttgaatgtgttccataagtacatccaaaactaaagtaaaaagataagggcttaaggttgacccttagtgcaatcctattgttatgggaaaatcgtcggt 3629591  T
Q  445 agccccatcttgcgtcctcacacta 469  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||    
T  3629590 aaccctatcttgcgttctcacacta 3629566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3632717 - 3632645
Alignment:
Q  104 ccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttc 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3632717 ccaagatatttaaatcgtgtaatttagggtatgatatgatctccaactttcacctcaaaggtagaactacttc 3632645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 607945 - 607904
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  607945 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatg 607904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 528
Target Start/End: Original strand, 5260172 - 5260253
Alignment:
Q  447 ccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||| |||||| | ||||||||    
T  5260172 ccccattttgcatcctcacactagttgaagctccctcatacatatcctatatagctctaatataagcaatcatcaccccttt 5260253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Original strand, 6641916 - 6641983
Alignment:
Q  29 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 96  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  6641916 ctccatttcaaccacccaactttaattcaatggtttacatctccttctatttctctctcattttgtac 6641983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 423
Target Start/End: Original strand, 9369179 - 9369301
Alignment:
Q  302 aagactacatcatctgcaaaaag-catacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||  |  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |      
T  9369179 aagactatatcatttgcaaaaaaacatacatcttggtgctcgcttttggatgtgtttcgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataaggactcaat 9369278  T
Q  401 gttgacccttggtgcaatcctat 423  Q
     |||| | |||||||||||||||    
T  9369279 attgaactttggtgcaatcctat 9369301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 499
Target Start/End: Original strand, 17222490 - 17222594
Alignment:
Q  395 cttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatcct 494  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    | |||||||| |||| ||||||| | ||  ||| |||||||||||| |    
T  17222490 cttagtgttgaaccttgttgcaatcatattgttatgagaaaatcttcgacgtctccatcttgtgtccgcacactattcgagactctctcatacatatctt 17222589  T
Q  495 tgata 499  Q
    |||||    
T  17222590 tgata 17222594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Original strand, 6056270 - 6056337
Alignment:
Q  23 gctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcatt 90  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6056270 gctcttctacatttcaaccacccaacttgcctacgatattttacatatgcttctatttcttcgtcatt 6056337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 30679260 - 30679220
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 59  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30679260 tgagcctcttctctatttcaaccacccaacttgaatacgat 30679220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 12094 - 12442
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12094 tgaggttcttctccatttcaacgacccagcttaaatacgatggcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaac 12193  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12194 catgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcaccgcgaaggtagacctacttctccttttgctgaagttacattctatataatccgtcttacttc 12293  T
Q  219 tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      || || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  12294 tactcaagcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctctaggtctctagcc------tccctccctccctcgactcaccaagcaagactacatcatcttc 12387  T
Q  319 aaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12388 aaaaagcatacatctcggtgctaactcttgaatgtgttctgtcaatacatccaaa 12442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 383 - 523
Target Start/End: Original strand, 13116 - 13258
Alignment:
Q  383 aaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccct 482  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13116 aaaaggtaaggactcagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagtcccatcttgcgtcctcacactagtcgaagctccct 13215  T
Q  483 c--atacatatccttgatagtcgtaatataggcaatcctaacc 523  Q
    |  |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  13216 catatacatatccttgatagctctaatataggcaatcttaacc 13258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 528
Target Start/End: Original strand, 88514 - 88927
Alignment:
Q  114 taaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtctt 213  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  88514 taaaccatgtaacttgaagtatggtatgatttccatctttcatctccaaggtaaacctacttctccttttgctgaagttacattccatatactctgtctt 88613  T
Q  214 gcttc-------tactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagac 306  Q
    |||||       |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||    
T  88614 gcttcctctacgtactcatgtggaaaccatacgcttctaaggcttgcctccaaatctctagcctcccgttcaattcatccctcgactcatctaacaagac 88713  T
Q  307 tacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaa----cgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    | ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  88714 tacatcatctgcaaaaagcatacatctcagtgctaattaacccttagatgtgttcctttagtacatccaaaagtaatgtaaaaagttaaggacttagggt 88813  T
Q  403 tgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatagtc 502  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||            ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  88814 tgacccttggtgcaatcctatggttacgggaaaatctttggtagccccatcttgggtc------------gaacctccctcatacatatccttgatagct 88901  T
Q  503 gtaatataggcaatcctaaccccttt 528  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    
T  88902 ctaatataggcaatcctaactccttt 88927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 87106 - 87204
Alignment:
Q  20 gaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | | |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  87106 gaggcttttctccatttcaaccatcaaacatgaatatgatgagttacatctgattctatttctccgacattttatactatggacccaagatatttaaac 87204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 2766 - 2960
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2766 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 2865  T
Q  119 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2866 cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaatgtagactgacttctccttccgctgaagttacattccatatatttcgtctt 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 82509 - 82348
Alignment:
Q  17 catgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  82509 catgaggctctttcccattgcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttttactatggacccaagatatttaa 82410  T
Q  117 accgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctc 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  82409 accgtgtaacttgtggtatgatataatctccaactttcgcctccaaggcagacctacttctc 82348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 469
Target Start/End: Original strand, 165 - 447
Alignment:
Q  187 gaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctggttcacttcctcc 286  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||   |||||| |||||| || | ||||| ||||||| |||    |||| |||||||    
T  165 gaagttacattccatatattttgtcttacttctactcaggcggaagttatacgcatctaagactagtctccaagtctctaaccttccattcaattcctcc 264  T
Q  287 ctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaa 386  Q
    ||| | |  || | |||||||||||||| ||| |||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  265 ctcgattttccaagcaagactacatcatttgccaaagtcgtacatcttggtgctaactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaa 364  T
Q  387 gataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcttgcgtcctcacacta 469  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  365 ggtaagggcttaggattgacccttggtgcaatcatattgatatggaaaaatcgttggtagtcccatcttgcatcctcatacta 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5897 - 5816
Alignment:
Q  100 ggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcctt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  5897 ggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaagatataactacttctcctt 5816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 453
Target Start/End: Original strand, 25011 - 25144
Alignment:
Q  321 aaagcatacatctcggtgctaacgcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 420  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |  |||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  25011 aaagaatagatctcggtgctaactcttagatgtgttccataagaacattcaaaactaaagtaaaaagataaaggtttaggcttgacccttggtgcaatcc 25110  T
Q  421 tattgttatgg-gaaaatcttcggtagccccatc 453  Q
    || || |||||  |||||  ||||||||||||||    
T  25111 taatgctatggacaaaattgtcggtagccccatc 25144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 9128 - 9002
Alignment:
Q  345 cttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggt 444  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||||||||   ||||||||| |  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9128 cttggatgtgttttgtaagtacatccaaaactaaaatgaaaagataatggtttagtgttgtaccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcgtcggt 9029  T
Q  445 agccccatcttgcgtcctcacactagt 471  Q
      | ||| | || ||||||||||||||    
T  9028 gtctccaccatgtgtcctcacactagt 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 48641 - 48827
Alignment:
Q  254 ctccaggtctctagcctctggttcacttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaa---gcatacatctcggtgctaacgcttgga 350  Q
    ||||| ||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||||||| |||| |    
T  48641 ctccaagtctctaacctcccattcaattcctccctcgactctccaagcaaaactacatcatctgaaaaaaaaagcatacatttcgatgctaactcttgca 48740  T
Q  351 tgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatc 438  Q
    | || |  || | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  48741 tatgctttgtaagtacatc-aaaactaaaggaaaaagataagaacttagggttgacatttggtgcaattctattttgatggaaaaatc 48827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Original strand, 81 - 156
Alignment:
Q  19 tgaggctcttctccatttcaaccaccca--gcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcatttt 92  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  81 tgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccgtcatttt 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University