View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2198_low_25 (Length: 245)

Name: NF2198_low_25
Description: NF2198
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2198_low_25
NF2198_low_25
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (1-223)||(22072920-22073142)
chr7 (1-210)||(16219611-16219818)
chr7 (8-210)||(811032-811232)
chr7 (1-210)||(16056348-16056554)
chr7 (8-223)||(47831814-47832027)
chr7 (1-223)||(67752-67971)
chr7 (1-210)||(18005666-18005873)
chr7 (8-210)||(44014198-44014395)
chr7 (1-206)||(12901347-12901551)
chr7 (60-210)||(34200806-34200951)
chr7 (60-223)||(16495409-16495567)
chr7 (60-223)||(28505254-28505412)
chr7 (107-223)||(3564363-3564478)
chr7 (60-210)||(11995983-11996128)
chr7 (107-210)||(13647345-13647447)
chr7 (106-210)||(2280117-2280220)
chr7 (60-210)||(15754843-15754988)
chr7 (107-223)||(48273396-48273511)
chr7 (8-215)||(20220090-20220294)
chr7 (107-226)||(24275172-24275289)
chr7 (50-200)||(12255733-12255884)
chr7 (110-210)||(38227501-38227599)
chr7 (110-223)||(18456415-18456526)
chr7 (107-223)||(456325-456439)
chr7 (107-223)||(11393331-11393445)
chr7 (107-223)||(11972500-11972614)
chr7 (107-223)||(14949166-14949280)
chr7 (107-223)||(15376757-15376871)
chr7 (107-223)||(16232524-16232638)
chr7 (107-223)||(16410063-16410177)
chr7 (107-223)||(18640276-18640390)
chr7 (107-223)||(20385167-20385281)
chr7 (107-223)||(21189639-21189753)
chr7 (107-223)||(32125495-32125609)
chr7 (107-223)||(41522921-41523035)
chr7 (107-223)||(41525383-41525497)
chr7 (50-210)||(1867937-1868096)
chr7 (110-223)||(12698838-12698951)
chr7 (48-210)||(14044766-14044928)
chr7 (48-210)||(14354796-14354958)
chr7 (110-210)||(16386249-16386349)
chr7 (107-223)||(18430716-18430830)
chr7 (107-223)||(24702242-24702356)
chr7 (110-210)||(26212016-26212115)
chr7 (107-223)||(27216864-27216978)
chr7 (107-223)||(44116513-44116627)
chr7 (114-229)||(16213682-16213795)
chr7 (8-58)||(16324175-16324225)
chr7 (110-223)||(9509196-9509308)
chr7 (67-223)||(17061919-17062073)
chr7 (107-223)||(3386337-3386451)
chr7 (107-223)||(13831377-13831491)
chr7 (50-207)||(15008441-15008597)
chr7 (118-229)||(13869344-13869453)
chr7 (107-210)||(15144037-15144138)
chr7 (50-207)||(19486686-19486842)
chr7 (110-210)||(10589059-10589158)
chr7 (160-223)||(27847881-27847944)
chr7 (129-223)||(40443398-40443490)
chr7 (107-223)||(38898420-38898535)
chr7 (25-85)||(9389615-9389675)
chr7 (106-210)||(10063816-10063919)
chr7 (1-144)||(15113028-15113170)
chr7 (107-223)||(24704692-24704803)
chr7 (101-200)||(14036284-14036384)
chr7 (101-200)||(14346314-14346414)
chr7 (177-223)||(20110560-20110606)
chr7 (60-144)||(15116565-15116648)
chr7 (158-200)||(48991210-48991252)
chr7 (161-210)||(18154894-18154942)
chr7 (107-215)||(12756715-12756821)
chr7 (107-163)||(26356027-26356083)
chr7 (107-163)||(26358479-26358535)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (1-223)||(38855146-38855365)
chr8 (8-223)||(6520375-6520587)
chr8 (8-221)||(21285606-21285817)
chr8 (14-210)||(23760751-23760945)
chr8 (14-210)||(983312-983507)
chr8 (8-210)||(21673724-21673924)
chr8 (8-215)||(37116362-37116569)
chr8 (60-223)||(5866230-5866388)
chr8 (1-215)||(20498577-20498790)
chr8 (8-215)||(17266893-17267100)
chr8 (60-210)||(21491015-21491160)
chr8 (60-210)||(17140936-17141081)
chr8 (14-215)||(24353035-24353235)
chr8 (106-223)||(16092340-16092456)
chr8 (50-210)||(26355643-26355799)
chr8 (110-232)||(28649046-28649167)
chr8 (110-223)||(18818411-18818523)
chr8 (107-229)||(14409488-14409608)
chr8 (107-225)||(16413360-16413476)
chr8 (60-215)||(17439458-17439613)
chr8 (110-223)||(7372785-7372897)
chr8 (110-210)||(21919002-21919101)
chr8 (8-147)||(22364745-22364882)
chr8 (60-210)||(21249404-21249550)
chr8 (60-210)||(21255242-21255388)
chr8 (106-223)||(22875072-22875187)
chr8 (107-223)||(1484406-1484520)
chr8 (107-223)||(5853336-5853450)
chr8 (107-223)||(15203275-15203389)
chr8 (107-223)||(20403231-20403345)
chr8 (107-223)||(22001757-22001871)
chr8 (116-223)||(6759265-6759371)
chr8 (60-210)||(17612062-17612211)
chr8 (116-223)||(23406386-23406492)
chr8 (50-210)||(13508027-13508186)
chr8 (110-223)||(20536215-20536327)
chr8 (110-223)||(21923930-21924042)
chr8 (110-223)||(22626743-22626854)
chr8 (107-223)||(20046239-20046353)
chr8 (107-223)||(41598192-41598306)
chr8 (50-210)||(13597559-13597718)
chr8 (122-227)||(45290754-45290857)
chr8 (107-223)||(4483285-4483398)
chr8 (107-223)||(4542417-4542531)
chr8 (129-223)||(16199666-16199758)
chr8 (110-223)||(21395984-21396094)
chr8 (110-223)||(21790477-21790587)
chr8 (106-223)||(26219721-26219835)
chr8 (107-232)||(26223914-26224037)
chr8 (129-210)||(31971277-31971356)
chr8 (152-223)||(18879275-18879345)
chr8 (110-223)||(21389454-21389564)
chr8 (110-223)||(21778780-21778890)
chr8 (129-223)||(45131019-45131110)
chr8 (107-223)||(19896269-19896386)
chr8 (106-223)||(26225291-26225405)
chr8 (107-223)||(14823778-14823891)
chr8 (118-210)||(15070575-15070665)
chr8 (101-147)||(40492844-40492890)
chr8 (158-215)||(19154936-19154993)
chr8 (118-223)||(19937061-19937164)
chr8 (107-215)||(19801426-19801531)
chr8 (161-236)||(23648547-23648621)
chr8 (110-236)||(18678104-18678229)
chr8 (60-143)||(18862430-18862512)
chr8 (60-143)||(21383896-21383978)
chr8 (60-143)||(21387316-21387398)
chr8 (60-143)||(21411189-21411271)
chr8 (60-143)||(21805681-21805763)
chr8 (60-143)||(21827799-21827881)
chr8 (110-236)||(32121726-32121851)
chr8 (48-144)||(14103165-14103260)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (1-215)||(23019421-23019633)
chr6 (1-210)||(19668391-19668599)
chr6 (50-210)||(25644340-25644500)
chr6 (59-210)||(9098465-9098615)
chr6 (60-210)||(28496427-28496572)
chr6 (60-210)||(29808838-29808983)
chr6 (1-210)||(19652215-19652420)
chr6 (107-236)||(30676754-30676881)
chr6 (60-210)||(1561323-1561468)
chr6 (106-210)||(20109158-20109261)
chr6 (107-223)||(29060547-29060662)
chr6 (131-223)||(27333241-27333332)
chr6 (131-223)||(27393981-27394072)
chr6 (67-223)||(22782231-22782385)
chr6 (107-236)||(34963364-34963491)
chr6 (110-210)||(16496264-16496363)
chr6 (107-223)||(20593780-20593895)
chr6 (102-232)||(18409821-18409950)
chr6 (8-223)||(22080640-22080839)
chr6 (107-229)||(25656627-25656747)
chr6 (110-223)||(17287798-17287910)
chr6 (107-223)||(12742321-12742435)
chr6 (107-223)||(18334636-18334750)
chr6 (107-223)||(19005050-19005164)
chr6 (107-223)||(19303540-19303654)
chr6 (107-223)||(19858963-19859077)
chr6 (107-223)||(24422551-24422665)
chr6 (107-223)||(25629354-25629469)
chr6 (107-223)||(33861798-33861912)
chr6 (107-223)||(33864282-33864396)
chr6 (107-223)||(2291224-2291338)
chr6 (107-223)||(8055033-8055147)
chr6 (107-223)||(25754813-25754927)
chr6 (107-223)||(26924684-26924798)
chr6 (116-223)||(20076707-20076812)
chr6 (8-210)||(23076750-23076952)
chr6 (107-222)||(25688507-25688620)
chr6 (107-223)||(1540955-1541069)
chr6 (107-223)||(1595553-1595667)
chr6 (107-215)||(18456731-18456837)
chr6 (107-215)||(18461891-18461997)
chr6 (110-210)||(20360962-20361061)
chr6 (107-223)||(20556936-20557050)
chr6 (50-207)||(8227453-8227609)
chr6 (118-223)||(16448582-16448685)
chr6 (162-209)||(22831524-22831571)
chr6 (1-60)||(27333179-27333238)
chr6 (1-60)||(27393919-27393978)
chr6 (8-210)||(35008168-35008370)
chr6 (129-223)||(20638304-20638397)
chr6 (126-207)||(4185839-4185919)
chr6 (158-207)||(16920679-16920728)
chr6 (110-223)||(22780229-22780341)
chr6 (158-223)||(35245593-35245658)
chr6 (107-223)||(3852061-3852175)
chr6 (129-215)||(18821866-18821950)
chr6 (8-86)||(28103799-28103877)
chr6 (167-210)||(11185525-11185568)
chr6 (48-147)||(18696570-18696667)
chr6 (50-178)||(18706356-18706483)
chr6 (168-223)||(25714424-25714478)
chr6 (126-207)||(4186390-4186470)
chr6 (177-236)||(19848063-19848122)
chr6 (60-143)||(22949384-22949466)
chr6 (60-143)||(22953340-22953422)
chr6 (60-143)||(23871828-23871910)
chr6 (60-143)||(23875784-23875866)
chr6 (60-143)||(27325388-27325470)
chr6 (158-209)||(33443068-33443118)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (1-223)||(21329391-21329611)
chr5 (1-223)||(21502049-21502270)
chr5 (1-210)||(26011929-26012136)
chr5 (1-215)||(20026834-20027047)
chr5 (50-210)||(21565562-21565720)
chr5 (61-210)||(22959489-22959633)
chr5 (8-215)||(22178120-22178327)
chr5 (60-210)||(19660791-19660936)
chr5 (61-215)||(22144064-22144217)
chr5 (50-210)||(19668918-19669073)
chr5 (110-210)||(21729066-21729165)
chr5 (110-210)||(21808391-21808490)
chr5 (108-227)||(1096470-1096588)
chr5 (106-223)||(22412191-22412306)
chr5 (110-223)||(24529227-24529339)
chr5 (107-223)||(264812-264926)
chr5 (107-199)||(9077983-9078074)
chr5 (107-223)||(10732984-10733098)
chr5 (107-223)||(20909016-20909130)
chr5 (110-210)||(25431414-25431513)
chr5 (131-223)||(36314584-36314675)
chr5 (107-223)||(39363388-39363502)
chr5 (121-223)||(21997547-21997648)
chr5 (110-223)||(24493576-24493687)
chr5 (110-223)||(25421539-25421651)
chr5 (107-223)||(29329938-29330052)
chr5 (107-223)||(42245409-42245523)
chr5 (107-210)||(20902053-20902154)
chr5 (107-223)||(36154827-36154938)
chr5 (110-223)||(8286844-8286957)
chr5 (110-223)||(13025318-13025429)
chr5 (110-223)||(13095502-13095613)
chr5 (110-223)||(23390498-23390610)
chr5 (118-223)||(39245140-39245243)
chr5 (107-223)||(2154658-2154772)
chr5 (107-223)||(11581243-11581357)
chr5 (110-210)||(22075039-22075138)
chr5 (107-223)||(29345984-29346098)
chr5 (73-177)||(29448055-29448159)
chr5 (107-227)||(37723906-37724023)
chr5 (118-223)||(10775731-10775834)
chr5 (118-223)||(18319089-18319192)
chr5 (107-223)||(29348457-29348571)
chr5 (107-223)||(29350930-29351044)
chr5 (118-229)||(38619432-38619541)
chr5 (50-207)||(40725876-40726032)
chr5 (118-223)||(31061072-31061175)
chr5 (159-223)||(21293020-21293083)
chr5 (107-223)||(32027397-32027511)
chr5 (118-223)||(23064515-23064618)
chr5 (143-223)||(20918028-20918106)
chr5 (106-163)||(20766118-20766174)
chr5 (60-121)||(21741486-21741545)
chr5 (60-143)||(10753603-10753685)
chr5 (60-143)||(21871525-21871607)
chr5 (60-143)||(21875805-21875887)
chr5 (60-143)||(22120149-22120231)
chr5 (60-91)||(36314685-36314716)
chr5 (118-223)||(24067111-24067214)
chr5 (160-209)||(26732884-26732932)
chr5 (110-177)||(18356367-18356432)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (8-223)||(6024-6237)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-210)||(10547-10754)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-210)||(32556-32762)
scaffold0034 (129-210)||(51904-51984)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (1-210)||(15470944-15471150)
chr3 (8-223)||(14234494-14234709)
chr3 (1-210)||(16097348-16097555)
chr3 (9-210)||(12174164-12174360)
chr3 (1-210)||(16103800-16104006)
chr3 (1-210)||(37251061-37251269)
chr3 (60-210)||(13210283-13210428)
chr3 (50-215)||(52523669-52523835)
chr3 (8-215)||(22110252-22110458)
chr3 (106-210)||(42386430-42386533)
chr3 (106-229)||(27165248-27165370)
chr3 (110-223)||(18438541-18438653)
chr3 (73-210)||(32307697-32307830)
chr3 (119-229)||(53301562-53301671)
chr3 (110-210)||(12399229-12399328)
chr3 (108-223)||(14972861-14972975)
chr3 (67-215)||(43925973-43926121)
chr3 (126-216)||(49668094-49668183)
chr3 (107-223)||(8899098-8899212)
chr3 (107-223)||(29172627-29172741)
chr3 (126-216)||(9512934-9513023)
chr3 (126-216)||(9520909-9520998)
chr3 (107-236)||(13544016-13544143)
chr3 (110-223)||(23083363-23083475)
chr3 (110-223)||(24153211-24153322)
chr3 (106-223)||(36166602-36166716)
chr3 (107-223)||(6469178-6469292)
chr3 (107-223)||(9707651-9707765)
chr3 (107-223)||(17463182-17463296)
chr3 (107-223)||(17672630-17672744)
chr3 (107-223)||(25476384-25476499)
chr3 (110-210)||(26686907-26687006)
chr3 (107-223)||(28848655-28848769)
chr3 (107-223)||(34159330-34159444)
chr3 (67-210)||(43550482-43550624)
chr3 (107-223)||(45606951-45607065)
chr3 (107-223)||(55476495-55476609)
chr3 (107-226)||(12567561-12567678)
chr3 (112-223)||(55500946-55501055)
chr3 (110-223)||(20698437-20698549)
chr3 (50-210)||(24340665-24340824)
chr3 (107-223)||(7781391-7781505)
chr3 (110-210)||(14572609-14572707)
chr3 (107-223)||(16454325-16454439)
chr3 (106-210)||(23274707-23274810)
chr3 (107-219)||(38961935-38962045)
chr3 (129-223)||(11424781-11424873)
chr3 (50-207)||(37642207-37642363)
chr3 (107-223)||(13151834-13151949)
chr3 (107-223)||(13154299-13154414)
chr3 (110-223)||(13442281-13442393)
chr3 (110-223)||(17487863-17487975)
chr3 (110-223)||(17499345-17499457)
chr3 (25-121)||(1465329-1465423)
chr3 (107-223)||(10247767-10247881)
chr3 (107-223)||(15977519-15977633)
chr3 (107-223)||(16282855-16282969)
chr3 (107-223)||(17446699-17446812)
chr3 (106-210)||(21618466-21618567)
chr3 (165-229)||(28194691-28194755)
chr3 (107-223)||(40213720-40213834)
chr3 (110-206)||(43840956-43841051)
chr3 (107-215)||(53070697-53070803)
chr3 (118-229)||(15412427-15412536)
chr3 (107-223)||(41123894-41124005)
chr3 (50-168)||(2051141-2051260)
chr3 (118-223)||(12119780-12119883)
chr3 (107-219)||(50242830-50242940)
chr3 (118-229)||(8499516-8499625)
chr3 (102-210)||(12377941-12378050)
chr3 (50-207)||(22147467-22147623)
chr3 (110-210)||(14576835-14576933)
chr3 (1-120)||(49389524-49389642)
chr3 (106-223)||(10556989-10557105)
chr3 (107-215)||(606324-606432)
chr3 (126-223)||(44494813-44494908)
chr3 (168-223)||(17737240-17737294)
chr3 (177-223)||(45577950-45577996)
chr3 (73-193)||(1644642-1644757)
chr3 (60-143)||(14501207-14501290)
chr3 (60-143)||(19776007-19776089)
chr3 (60-143)||(37439421-37439503)
chr3 (177-236)||(46822259-46822318)
chr3 (8-70)||(43927291-43927353)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (1-210)||(12288103-12288311)
chr4 (1-223)||(39706183-39706402)
chr4 (1-215)||(13744-13957)
chr4 (50-210)||(52243136-52243297)
chr4 (8-215)||(53082052-53082258)
chr4 (60-210)||(15551837-15551982)
chr4 (50-210)||(43198495-43198656)
chr4 (8-215)||(46640356-46640562)
chr4 (73-210)||(12774027-12774160)
chr4 (106-223)||(54798752-54798868)
chr4 (107-210)||(16377522-16377622)
chr4 (60-192)||(16596686-16596813)
chr4 (110-223)||(7798781-7798893)
chr4 (106-223)||(14280320-14280435)
chr4 (107-236)||(19618216-19618343)
chr4 (110-223)||(52873369-52873481)
chr4 (110-210)||(12902777-12902876)
chr4 (107-223)||(18215318-18215432)
chr4 (107-223)||(44928923-44929038)
chr4 (110-223)||(7088884-7088996)
chr4 (110-223)||(7893710-7893822)
chr4 (107-223)||(12351-12465)
chr4 (107-223)||(15118396-15118510)
chr4 (107-223)||(44773131-44773245)
chr4 (107-223)||(52312514-52312628)
chr4 (50-210)||(8846376-8846550)
chr4 (107-229)||(3515005-3515125)
chr4 (107-236)||(14970751-14970878)
chr4 (118-227)||(15355380-15355487)
chr4 (110-223)||(16270238-16270349)
chr4 (107-223)||(1837553-1837667)
chr4 (107-223)||(14038655-14038770)
chr4 (25-121)||(15099457-15099551)
chr4 (25-121)||(15190424-15190518)
chr4 (107-223)||(18239463-18239577)
chr4 (107-223)||(19242703-19242817)
chr4 (110-210)||(23374361-23374460)
chr4 (107-223)||(44615292-44615406)
chr4 (107-223)||(50222383-50222497)
chr4 (107-223)||(51463912-51464026)
chr4 (137-210)||(3096313-3096385)
chr4 (129-210)||(6190482-6190563)
chr4 (114-223)||(23803316-23803423)
chr4 (106-229)||(8574867-8574987)
chr4 (110-223)||(6899898-6900009)
chr4 (110-223)||(16239972-16240083)
chr4 (158-223)||(17046494-17046559)
chr4 (110-223)||(22636442-22636554)
chr4 (110-223)||(44052836-44052948)
chr4 (107-223)||(44102218-44102332)
chr4 (103-149)||(15464926-15464972)
chr4 (118-210)||(15367710-15367800)
chr4 (118-210)||(15370038-15370128)
chr4 (118-210)||(15371222-15371312)
chr4 (118-210)||(15373503-15373593)
chr4 (118-210)||(15402723-15402813)
chr4 (107-215)||(21815629-21815735)
chr4 (168-223)||(7641286-7641340)
chr4 (168-223)||(12610954-12611008)
chr4 (129-223)||(14053323-14053415)
chr4 (118-210)||(16223552-16223642)
chr4 (60-143)||(630728-630810)
chr4 (60-143)||(3331970-3332052)
chr4 (60-143)||(13812763-13812845)
chr4 (60-143)||(14953915-14953997)
chr4 (107-210)||(22353853-22353955)
chr4 (60-143)||(25690146-25690228)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (8-210)||(12959-13159)
scaffold0138 (13-147)||(18143-18276)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-216)||(22921763-22921976)
chr1 (1-215)||(21861463-21861676)
chr1 (14-215)||(21896162-21896362)
chr1 (50-210)||(33681027-33681185)
chr1 (50-210)||(22237647-22237805)
chr1 (60-223)||(14295507-14295665)
chr1 (1-215)||(50614009-50614223)
chr1 (1-215)||(50621837-50622051)
chr1 (60-210)||(20918624-20918769)
chr1 (1-215)||(16368180-16368392)
chr1 (8-215)||(50686626-50686833)
chr1 (50-215)||(35261023-35261184)
chr1 (50-210)||(20248299-20248454)
chr1 (8-215)||(41049936-41050142)
chr1 (73-210)||(21754065-21754198)
chr1 (107-232)||(50210212-50210336)
chr1 (67-210)||(45574846-45574988)
chr1 (110-223)||(34509787-34509899)
chr1 (1-210)||(52927876-52928071)
chr1 (51-210)||(16758669-16758828)
chr1 (107-227)||(21840767-21840885)
chr1 (107-223)||(13988870-13988984)
chr1 (107-223)||(21923335-21923449)
chr1 (107-223)||(23593779-23593893)
chr1 (108-223)||(31612317-31612430)
chr1 (107-236)||(16361908-16362035)
chr1 (107-223)||(21475131-21475245)
chr1 (110-210)||(27250731-27250830)
chr1 (107-223)||(29298141-29298254)
chr1 (107-223)||(433016-433128)
chr1 (49-210)||(16093825-16093986)
chr1 (8-121)||(35981589-35981700)
chr1 (110-210)||(21026700-21026799)
chr1 (115-223)||(22123119-22123226)
chr1 (107-223)||(29776692-29776806)
chr1 (25-121)||(49261448-49261542)
chr1 (161-236)||(20454606-20454680)
chr1 (127-210)||(20847173-20847255)
chr1 (60-177)||(22130863-22130975)
chr1 (25-122)||(20636956-20637051)
chr1 (110-223)||(22532276-22532388)
chr1 (110-236)||(22468698-22468823)
chr1 (154-200)||(38801433-38801479)
chr1 (67-223)||(21707171-21707325)
chr1 (67-223)||(21711713-21711867)
chr1 (118-223)||(13212917-13213020)
chr1 (118-223)||(15860064-15860167)
chr1 (118-223)||(16275419-16275522)
chr1 (118-223)||(21342100-21342203)
chr1 (118-223)||(21346965-21347068)
chr1 (60-154)||(51130639-51130729)
chr1 (9-200)||(21161746-21161932)
chr1 (110-236)||(20135181-20135306)
chr1 (60-209)||(26064959-26065107)
chr1 (60-143)||(1924914-1924996)
chr1 (60-143)||(20923928-20924010)
chr1 (107-144)||(12271639-12271676)
chr1 (118-223)||(40389158-40389261)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (8-210)||(6555-6755)
scaffold0621 (1-210)||(8486-8696)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (8-223)||(936-1148)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (3-210)||(12786-12991)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-223)||(6618-6838)
scaffold0333 (1-223)||(13998-14218)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-150)||(8094-8242)
scaffold0556 (1-216)||(6826-7036)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (1-215)||(7626-7839)
chr2 (1-210)||(25175870-25176077)
chr2 (1-210)||(28405996-28406204)
chr2 (1-210)||(18786796-18787004)
chr2 (62-223)||(7679592-7679750)
chr2 (1-215)||(23791288-23791502)
chr2 (107-223)||(22105416-22105531)
chr2 (8-215)||(23207292-23207498)
chr2 (110-223)||(298816-298929)
chr2 (50-210)||(23708561-23708720)
chr2 (8-215)||(25108902-25109109)
chr2 (107-236)||(32214965-32215092)
chr2 (60-210)||(23071905-23072050)
chr2 (110-223)||(23060520-23060632)
chr2 (107-223)||(6725999-6726113)
chr2 (110-210)||(23076462-23076561)
chr2 (60-210)||(19671850-19671998)
chr2 (106-223)||(22337122-22337238)
chr2 (107-223)||(571401-571515)
chr2 (107-223)||(18808947-18809061)
chr2 (107-223)||(23130866-23130980)
chr2 (107-223)||(23133333-23133447)
chr2 (107-223)||(23135594-23135708)
chr2 (107-223)||(23709576-23709690)
chr2 (107-223)||(23712057-23712171)
chr2 (107-223)||(26505383-26505497)
chr2 (107-223)||(26507861-26507975)
chr2 (107-223)||(34402566-34402680)
chr2 (107-223)||(39682317-39682431)
chr2 (60-215)||(20520145-20520299)
chr2 (107-223)||(21155104-21155218)
chr2 (107-219)||(24367782-24367892)
chr2 (107-223)||(28577103-28577217)
chr2 (50-215)||(22413078-22413244)
chr2 (112-223)||(22731238-22731348)
chr2 (129-210)||(38136-38215)
chr2 (107-223)||(24898239-24898354)
chr2 (107-223)||(24900722-24900837)
chr2 (107-223)||(24903199-24903314)
chr2 (107-223)||(24905676-24905791)
chr2 (107-223)||(24908151-24908266)
chr2 (107-223)||(32039542-32039656)
chr2 (107-223)||(43137303-43137417)
chr2 (110-223)||(20309115-20309225)
chr2 (108-209)||(22134208-22134306)
chr2 (107-223)||(23103396-23103509)
chr2 (129-210)||(32451949-32452030)
chr2 (50-215)||(24697548-24697713)
chr2 (107-223)||(45029898-45030012)
chr2 (152-223)||(23285872-23285942)
chr2 (101-215)||(23004763-23004878)
chr2 (110-223)||(23660030-23660141)
chr2 (1-144)||(22459455-22459598)
chr2 (107-223)||(24529573-24529687)
chr2 (110-223)||(22738182-22738293)
chr2 (107-223)||(38967378-38967493)
chr2 (151-223)||(8946664-8946735)
chr2 (110-210)||(23654388-23654487)
chr2 (168-223)||(24643054-24643108)
chr2 (166-223)||(23040247-23040303)
chr2 (60-143)||(1283666-1283748)
chr2 (60-143)||(30344776-30344858)
chr2 (159-209)||(23287384-23287433)
chr2 (160-209)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (8-210)||(5663-5863)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-210)||(19284-19491)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-210)||(100394-100601)
scaffold0023 (9-210)||(40076-40275)
scaffold0023 (107-225)||(17484-17600)
scaffold0023 (107-223)||(94415-94529)
scaffold0023 (107-223)||(44458-44573)
scaffold0023 (157-210)||(119895-119948)
scaffold0023 (153-210)||(101519-101576)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-210)||(2539-2746)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (8-221)||(1091-1302)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-210)||(10435-10642)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-206)||(62222-62422)
scaffold0028 (123-216)||(132672-132765)
scaffold0028 (107-223)||(136684-136798)
scaffold0028 (107-223)||(139153-139267)
scaffold0028 (107-223)||(144091-144205)
scaffold0028 (107-223)||(134215-134329)
scaffold0028 (107-223)||(141622-141736)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-210)||(129925-130132)
scaffold0010 (103-215)||(60710-60822)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (17-210)||(7983-8175)
scaffold0218 (62-183)||(29238-29354)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (50-210)||(22613-22771)
scaffold0037 (107-223)||(82076-82190)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (13-228)||(6188-6401)
scaffold0420 (164-228)||(13793-13855)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (8-210)||(14598-14798)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-215)||(136261-136475)
scaffold0021 (1-215)||(144969-145183)
scaffold0021 (107-210)||(174786-174886)
scaffold0021 (160-223)||(121773-121835)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-210)||(160704-160910)
scaffold0001 (107-226)||(501085-501202)
scaffold0001 (118-223)||(85635-85738)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (50-210)||(149-307)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (50-210)||(45735-45893)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-215)||(12583-12795)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (8-215)||(128870-129076)
scaffold0022 (8-207)||(78345-78542)
scaffold0022 (106-223)||(116434-116548)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-216)||(2698-2913)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-172)||(2112-2281)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (8-207)||(38339-38538)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (60-223)||(15668-15826)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (60-210)||(11312-11457)
scaffold0046 (60-210)||(2017-2162)
scaffold0046 (110-223)||(28421-28533)
scaffold0046 (174-210)||(4572-4608)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-215)||(53442-53655)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (107-232)||(3185-3309)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (60-223)||(1025-1183)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (103-210)||(27744-27850)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (8-215)||(19785-19991)
scaffold0080 (110-223)||(39920-40031)
scaffold0080 (60-143)||(48939-49021)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (8-210)||(103539-103732)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (8-215)||(97020-97227)
scaffold0006 (8-215)||(106298-106505)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (106-215)||(1047-1155)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (103-210)||(16095-16201)
scaffold0357 (105-215)||(13143-13252)
scaffold0357 (159-215)||(2676-2732)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (106-229)||(38700-38822)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (106-223)||(44705-44821)
scaffold0122 (107-223)||(26064-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (106-223)||(3149-3264)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (60-210)||(25126-25275)
scaffold0123 (50-147)||(620-715)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (94-223)||(15763-15891)
scaffold0020 (1-39)||(15726-15764)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (106-210)||(39497-39599)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (107-232)||(17214-17340)
scaffold0056 (107-215)||(79328-79434)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (106-210)||(75213-75315)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (8-180)||(54-226)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (107-236)||(11279-11406)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-209)||(7952-8161)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (107-227)||(10773-10891)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (110-210)||(4869-4968)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (107-223)||(16599-16714)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (60-210)||(34143-34288)
scaffold0175 (110-180)||(13141-13211)
scaffold0175 (177-210)||(293-326)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (50-200)||(11494-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (50-200)||(38198-38347)
scaffold0124 (60-143)||(24605-24690)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (107-236)||(12293-12420)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (110-223)||(22890-23001)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (123-216)||(32112-32205)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (110-223)||(51920-52032)
scaffold0011 (110-210)||(167980-168079)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (17-215)||(267675-267872)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (107-223)||(13396-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (107-223)||(20751-20865)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (107-223)||(37825-37939)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (107-223)||(16120-16235)
scaffold0120 (110-223)||(32959-33070)
scaffold0120 (110-223)||(45935-46046)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (126-210)||(23901-23984)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (107-223)||(158494-158608)
scaffold0003 (107-210)||(339949-340048)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (107-229)||(4692-4812)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (13-215)||(565-765)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (110-223)||(13218-13330)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (110-223)||(32949-33060)
scaffold0145 (110-223)||(38768-38879)
scaffold0145 (107-223)||(9753-9867)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (110-210)||(24304-24404)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (103-223)||(8486-8605)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (107-227)||(9242-9360)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (107-223)||(13951-14065)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (106-210)||(4528-4630)
scaffold0228 (106-210)||(12110-12212)
scaffold0228 (106-210)||(22062-22164)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (107-223)||(16788-16902)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (107-210)||(29949-30050)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (16-215)||(1706-1904)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (110-223)||(3477-3589)
scaffold0292 (110-210)||(363-461)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (50-210)||(17969-18128)
scaffold0247 (118-219)||(2184-2283)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (110-223)||(1858-1970)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (110-210)||(1050-1149)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (110-223)||(8535-8643)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (110-210)||(20930-21030)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (107-223)||(40404-40518)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (158-210)||(51602-51654)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (106-210)||(25916-26018)
scaffold0026 (106-223)||(39865-39980)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (160-223)||(1296-1359)
scaffold0106 (158-223)||(7273-7338)
scaffold0106 (161-223)||(15291-15352)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (110-209)||(4545-4643)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (110-210)||(10427-10524)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (127-223)||(16289-16382)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (118-223)||(4218-4321)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (110-223)||(1959-2071)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (107-223)||(4301-4415)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (110-223)||(6123-6238)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (138-210)||(4732-4803)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (107-215)||(20423-20528)
scaffold0031 (110-155)||(128824-128869)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (151-210)||(13517-13575)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (50-172)||(225465-225585)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (107-223)||(110-224)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (126-215)||(2690-2780)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (164-223)||(5183-5242)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (107-166)||(3529-3588)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (159-210)||(32087-32137)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (160-223)||(47002-47065)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (107-223)||(12068-12176)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (153-210)||(28813-28871)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (158-223)||(1098-1163)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (129-206)||(11464-11540)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (129-210)||(15485-15564)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (118-223)||(1336-1439)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (107-223)||(161133-161248)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (60-154)||(2398-2488)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (168-215)||(11978-12024)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (60-143)||(6-88)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (106-148)||(27911-27953)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (163-223)||(4888-4947)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (48-144)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22073142 - 22072920
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22073142 ttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtt 22073043  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22073042 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgg 22072943  T
Q  201 ttcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
     || ||||||  |||||||||||    
T  22072942 gtcagtctaagttgattaagatg 22072920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16219611 - 16219818
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16219611 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 16219709  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16219710 tgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatga 16219808  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  16219809 gtcggtctaa 16219818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 811032 - 811232
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  811032 tcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtt 811130  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  811131 tatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 811229  T
Q  208 taa 210  Q
    |||    
T  811230 taa 811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16056554 - 16056348
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16056554 ttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 16056456  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16056455 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg--tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatca 16056358  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  16056357 gtcggtctaa 16056348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47832027 - 47831814
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  47832027 tcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatga-attatgtttgatgtt 47831929  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47831928 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 47831830  T
Q  208 taaaatgattaagatg 223  Q
    |||  |||||||||||    
T  47831829 taagttgattaagatg 47831814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 67971 - 67752
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  67971 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg- 67874  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67873 ttgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 67776  T
Q  200 attcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    | |||||||||  |||||||||||    
T  67775 agtcggtctaagttgattaagatg 67752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18005873 - 18005666
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  18005873 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgt 18005775  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005774 t-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttc-catactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 18005677  T
Q  200 attcggtctaa 210  Q
    | |||||||||    
T  18005676 agtcggtctaa 18005666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44014395 - 44014198
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||| |    
T  44014395 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatat 44014298  T
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||| |   || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44014297 ttgagatgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 44014202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12901551 - 12901347
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  12901551 ttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgta 12901453  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  12901452 tgatg-ttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatg 12901354  T
Q  200 attcggt 206  Q
    | |||||    
T  12901353 agtcggt 12901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34200951 - 34200806
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  34200951 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 34200857  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34200856 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 34200806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495409
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 16495473  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  16495472 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16495409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 28505254 - 28505412
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||   ||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28505254 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggttt-gcat 28505348  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  28505349 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatg 28505412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564478
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 11995983 - 11996128
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11995983 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcat 11996077  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11996078 actgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaa 11996128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13647447 - 13647345
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 13647349  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  13647348 ctaa 13647345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Original strand, 2280117 - 2280220
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 2280215  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  2280216 tctaa 2280220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 15754843 - 15754988
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  15754843 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 15754937  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15754938 actacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15754988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273396
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 20220090 - 20220294
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||    
T  20220090 tcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatga-attatatatgatgtt 20220188  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  20220189 tgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcgg 20220284  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  20220285 tctaagatga 20220294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275172
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttg 226  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  24275191 ctaagttgattaagatgttg 24275172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Original strand, 12255733 - 12255884
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| ||| || || | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  12255733 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaatt-atatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatga 12255831  T
Q  149 -tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
     | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12255832 attgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 12255884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38227599 - 38227501
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38227599 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 38227502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 18456415 - 18456526
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18456415 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18456512  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||||||||||    
T  18456513 agttgattaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 456439 - 456325
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  456439 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 456342  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  456341 ctaagttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 11393331 - 11393445
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11393331 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11393428  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  11393429 ctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11972614 - 11972500
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11972614 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11972517  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  11972516 ctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 14949166 - 14949280
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14949166 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 14949263  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  14949264 ctaagttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 15376757 - 15376871
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15376757 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15376854  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  15376855 ctaagttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16232638 - 16232524
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232638 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16232541  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  16232540 ctaagttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16410177 - 16410063
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16410177 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16410080  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  16410079 ctaagttgattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18640390 - 18640276
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18640390 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18640293  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  18640292 ctaagttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 20385167 - 20385281
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20385167 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20385264  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  20385265 ctaagttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 21189639 - 21189753
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21189639 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21189736  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  21189737 ctaagttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32125609 - 32125495
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32125609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 32125512  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  32125511 ctaagttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41523035 - 41522921
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41523035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 41522938  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  41522937 ctaagttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41525497 - 41525383
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41525497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 41525400  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  41525399 ctaagttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868096
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 147  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgag 1868034  T
Q  148 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1868035 ctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1868096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12698951 - 12698838
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 208  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12698951 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12698853  T
Q  209 aaaatgattaagatg 223  Q
    ||  |||| ||||||    
T  12698852 aagttgatgaagatg 12698838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14044928 - 14044766
Alignment:
Q  48 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatca- 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||     
T  14044928 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgattgatttgta-ttgatattgttatatcag 14044831  T
Q  146 -tgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
      ||| |||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14044830 gagct-gttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 14044766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14354958 - 14354796
Alignment:
Q  48 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatca- 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||     
T  14354958 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgattgatttgta-ttgatattgttatatcag 14354861  T
Q  146 -tgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
      ||| |||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14354860 gagct-gttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 14354796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 16386249 - 16386349
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16386249 agatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16386348  T
Q  210 a 210  Q
    |    
T  16386349 a 16386349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18430830 - 18430716
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18430830 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18430733  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  18430732 ctaagttgattaagatg 18430716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24702356 - 24702242
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24702356 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24702259  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  24702258 ctaagttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26212115 - 26212016
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  26212115 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtcta 26212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27216978 - 27216864
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27216978 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggt 27216881  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  27216880 ctaagttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44116627 - 44116513
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44116627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggt 44116530  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  44116529 ctaagttgattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213682
Alignment:
Q  114 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 213  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  214 gattaagatgttgagg 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  16213697 gattaagatgatgagg 16213682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16324225 - 16324175
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324225 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9509308 - 9509196
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9509308 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9509210  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  9509209 agttgatgaagatg 9509196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 223
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062073
Alignment:
Q  67 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 165  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgcta-ttttgtatactgct 17062016  T
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  17062017 ga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3386451 - 3386337
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3386451 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 3386354  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  3386353 ctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13831491 - 13831377
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13831491 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13831394  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||| |||||||||||    
T  13831393 ctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 147  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaa 15008538  T
Q  148 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15008539 ctg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869344
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13869356  T
Q  218 aagatgttgagg 229  Q
    |||||| |||||    
T  13869355 aagatgatgagg 13869344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144138
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  15144135 ctaa 15144138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486842
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 19486784  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  19486785 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 19486842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589059
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847944
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatg 27847944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443398
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatg 40443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 38898420 - 38898535
Alignment:
Q  107 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898420 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 38898517  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    | |||  |||||||||||    
T  38898518 tttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Original strand, 9389615 - 9389675
Alignment:
Q  25 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacatt 85  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9389615 cagtaagcctggattgtatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacatt 9389675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Original strand, 10063816 - 10063919
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| ||||   || |||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  10063816 tttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 10063914  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  10063915 tctaa 10063919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15113170 - 15113028
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |  | |||||  |  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |     
T  15113170 ttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagtt-atatg 15113072  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 144  Q
    |||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15113071 tgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24704803 - 24704692
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || |   |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24704803 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt---tttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24704709  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  24704708 ctaagttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14036384 - 14036284
Alignment:
Q  101 tgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14036384 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 14036287  T
Q  198 tga 200  Q
    |||    
T  14036286 tga 14036284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14346414 - 14346314
Alignment:
Q  101 tgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14346414 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 14346317  T
Q  198 tga 200  Q
    |||    
T  14346316 tga 14346314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110560
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15116648 - 15116565
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 144  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||   ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  15116648 taatgtgatataattgtatatatattacttgagtt-atatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991210
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatga 48991210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 210
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154942
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaa 18154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 12756715 - 12756821
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||  || |||||    
T  12756715 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaactgctcgagtcggt 12756812  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  12756813 ctaagatga 12756821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 26356027 - 26356083
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 163  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||    
T  26356027 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 26358479 - 26358535
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 163  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||    
T  26358479 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38855146 - 38855365
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  38855146 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-t 38855243  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855244 tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 38855342  T
Q  201 ttcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
     |||||||||  |||||||||||    
T  38855343 gtcggtctaagttgattaagatg 38855365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6520587 - 6520375
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  6520587 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatg-ttgatgtt 6520490  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6520489 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6520391  T
Q  208 taaaatgattaagatg 223  Q
    |||  |||||||||||    
T  6520390 taagttgattaagatg 6520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21285817 - 21285606
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21285817 tcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatga-actatgtttgatgtt 21285719  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21285718 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtc 21285620  T
Q  208 taaaatgattaaga 221  Q
    |||  |||||||||    
T  21285619 taagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 23760751 - 23760945
Alignment:
Q  14 tgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||    
T  23760751 tgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatttgaga 23760848  T
Q  113 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23760849 tgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgattta-catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23760945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 983312 - 983507
Alignment:
Q  14 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  983312 tgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgat 983409  T
Q  114 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttg-tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 983507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21673924 - 21673724
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgt 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || || || ||| |    
T  21673924 tcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaatt-atatt-gatat 21673827  T
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  21673727 ctaa 21673724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37116569 - 37116362
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  37116569 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 37116471  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  37116470 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 37116372  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  37116371 tctaagatga 37116362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 5866230 - 5866388
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  5866230 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 5866324  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  5866325 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 5866388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20498790 - 20498577
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| |     
T  20498790 ttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttga-attatata 20498692  T
Q  101 tg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  20498691 tgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatg 20498593  T
Q  200 attcggtctaaaatga 215  Q
    | ||||||||| ||||    
T  20498592 agtcggtctaagatga 20498577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 17266893 - 17267100
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| || || || | |||||||    
T  17266893 tcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaatt-atatatgatgtt 17266991  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17266992 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 17267091  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  17267092 ctaagatga 17267100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21491160 - 21491015
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  21491160 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatgg-tttgcat 21491066  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21491065 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21491015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17141081 - 17140936
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||  ||||||    
T  17141081 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatgg-attgcat 17140987  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17140986 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17140936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24353235 - 24353035
Alignment:
Q  14 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||  | |  ||||||||||||    
T  24353235 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattg-tatacgatgtttgagat 24353137  T
Q  114 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaa 211  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||     
T  24353136 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T
Q  212 atga 215  Q
    ||||    
T  24353038 atga 24353035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 16092340 - 16092456
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16092340 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 16092438  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||| ||||||    
T  16092439 tctaagttgatgaagatg 16092456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 26355643 - 26355799
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || |    
T  26355643 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatg-gaatatgtt-gatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgat 26355739  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26355740 gattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26355799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649167
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28649144  T
Q  210 aaatgattaagatgttgaggatg 232  Q
    |  |||| |||||| ||| ||||    
T  28649145 agttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 18818411 - 18818523
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18818411 agatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18818509  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  18818510 agttgatgaagatg 18818523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 14409488 - 14409608
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14409488 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 14409585  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  14409586 ctaagttgattaagatgatgagg 14409608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 16413360 - 16413476
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16413360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16413457  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgtt 225  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  16413458 ctaagttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 17439458 - 17439613
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 157  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||      
T  17439458 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttat 17439555  T
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
     |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  17439556 gtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatga 17439613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7372897 - 7372785
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7372897 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7372799  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  7372798 agttgatgaagatg 7372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 21919002 - 21919101
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21919002 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21919100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22364882 - 22364745
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||    
T  22364882 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtt 22364784  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 147  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22364783 tgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatg 22364745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21249550 - 21249404
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||    
T  21249550 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcat 21249456  T
Q  160 actgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21249455 actgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21249404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21255388 - 21255242
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||    
T  21255388 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcat 21255294  T
Q  160 actgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21255293 actgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21255242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22875187 - 22875072
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  22875187 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcgg 22875090  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  22875089 tctaaattgatgaagatg 22875072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1484520 - 1484406
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1484520 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 1484423  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  1484422 ctaagttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 5853336 - 5853450
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5853336 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 5853433  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  5853434 ctaagttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 15203275 - 15203389
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15203275 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgct 15203372  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  15203373 ctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20403345 - 20403231
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20403345 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20403248  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  20403247 ctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22001871 - 22001757
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22001871 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 22001774  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  22001773 ctaagttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759265
Alignment:
Q  116 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  216 ttaagatg 223  Q
    | ||||||    
T  6759272 tgaagatg 6759265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 17612062 - 17612211
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 158  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| || |||||||    
T  17612062 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgca 17612159  T
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  17612160 tactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 17612211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406386
Alignment:
Q  116 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  216 ttaagatg 223  Q
    | ||||||    
T  23406393 tgaagatg 23406386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508186
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13508125  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  13508126 tg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 13508186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20536327 - 20536215
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20536327 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20536229  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  20536228 agttgatgaagatg 20536215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 21923930 - 21924042
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | || ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21923930 agatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21924028  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  21924029 agttgatgaagatg 21924042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22626854 - 22626743
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22626854 agatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22626757  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  22626756 agttgatgaagatg 22626743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 20046239 - 20046353
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20046239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20046336  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  20046337 ctaagttgattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41598306 - 41598192
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41598306 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctg-ttgttattcaactaagctgcatgagtcggt 41598209  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  41598208 ctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 13597559 - 13597718
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||| ||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13597559 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13597657  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  13597658 tg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 13597718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 227
Target Start/End: Original strand, 45290754 - 45290857
Alignment:
Q  122 cttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  45290754 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45290851  T
Q  222 tgttga 227  Q
    ||||||    
T  45290852 tgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4483398 - 4483285
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4483398 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggt 4483302  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  4483301 ctaagttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 4542417 - 4542531
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4542417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4542514  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  4542515 ctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199758
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16199758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396094
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21396080  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    | ||| | ||||||    
T  21396081 agatgttgaagatg 21396094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790587
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21790573  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    | ||| | ||||||    
T  21790574 agatgttgaagatg 21790587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26219835 - 26219721
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26219835 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatacta-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 26219739  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||| ||||    
T  26219738 tctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26224037 - 26223914
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| || || | |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  26224037 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattg-ctttattgctg-ttgttatttaattaagctgcatgggtcgat 26223940  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatg 232  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  26223939 ctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971277
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 223
Target Start/End: Original strand, 18879275 - 18879345
Alignment:
Q  152 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  18879275 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389564
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21389550  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    | ||| | ||||||    
T  21389551 agatgttgaagatg 21389564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778890
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21778876  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    | ||| | ||||||    
T  21778877 agatgttgaagatg 21778890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131110
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 45131110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19896386 - 19896269
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata---tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattc 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||| |||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19896386 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 19896289  T
Q  204 ggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  19896288 ggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 26225291 - 26225405
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26225291 tttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactg-ttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 26225387  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  26225388 tctaagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14823891 - 14823778
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  14823891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttg-ttgttatttaactttgctgcatgagt-ggt 14823795  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||| |||||||||||    
T  14823794 ctaaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070575
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15070575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 147
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492890
Alignment:
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 40492890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154993
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga 19154993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937164
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 19937158  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  19937159 aagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 19801426 - 19801531
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19801426 ttgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggt 19801522  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  19801523 ctaagatga 19801531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23648621 - 23648547
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23648621 ctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Original strand, 18678104 - 18678229
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  18678104 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 18678202  T
Q  210 aaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    |  |||||||||||||||  |||||||    
T  18678203 agttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 18862430 - 18862512
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  18862430 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 18862512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383896
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21383896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21387398 - 21387316
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21387398 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21387316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21411271 - 21411189
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21411271 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21411189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21805763 - 21805681
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21805763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21805681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 21827799 - 21827881
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21827799 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21827881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32121851 - 32121726
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||  ||||    
T  32121851 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattcta 32121753  T
Q  210 aaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    |  |||||||||||||||  |||||||    
T  32121752 agttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Original strand, 14103165 - 14103260
Alignment:
Q  48 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 144  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  14103165 taatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 14103260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23019633 - 23019421
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23019633 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 23019535  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  23019534 tgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataa 23019436  T
Q  201 ttcggtctaaaatga 215  Q
     ||||||||| ||||    
T  23019435 gtcggtctaagatga 23019421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19668599 - 19668391
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||     
T  19668599 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatga-attacgta 19668501  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19668500 tgatg-ttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 19668403  T
Q  199 gattcggtctaa 210  Q
    || |||||||||    
T  19668402 gagtcggtctaa 19668391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25644500 - 25644340
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||  |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644500 atgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgc 25644402  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25644401 tgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 25644340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 9098465 - 9098615
Alignment:
Q  59 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgc 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  9098465 ttaatgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgc 9098562  T
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 9098615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 28496427 - 28496572
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28496427 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 28496521  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28496522 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28496572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 29808838 - 29808983
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  29808838 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 29808932  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29808933 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 29808983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19652420 - 19652215
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  19652420 ttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatg-gattatgtt 19652322  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
     |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19652321 -gatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatga 19652225  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  19652224 gtcggtctaa 19652215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Original strand, 30676754 - 30676881
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676754 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 30676851  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30676852 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1561468 - 1561323
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  1561468 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 1561374  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1561373 actacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 1561323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20109261 - 20109158
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20109261 tttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 20109163  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  20109162 tctaa 20109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060547
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatg 29060547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333332
Alignment:
Q  131 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27333332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394072
Alignment:
Q  131 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27394072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782231
Alignment:
Q  67 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 165  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaatt-atgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 22782288  T
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  22782287 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34963491 - 34963364
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34963491 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 34963394  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  34963393 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16496363 - 16496264
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16496363 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16496265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593780
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatg 20593780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Original strand, 18409821 - 18409950
Alignment:
Q  102 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgat 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  18409821 gatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgag 18409919  T
Q  202 tcggtctaaaatgattaagatgttgaggatg 232  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||| ||||    
T  18409920 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 22080640 - 22080839
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgt 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||   |||||    
T  22080640 tcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaatt-atgac-gatgt 22080737  T
Q  107 ttgagatgttgttgact-tacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||             |||||||||||||||| ||||    
T  22080738 ttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgtt-------------taactaagctgcatgagtcgg 22080821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25656747 - 25656627
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25656747 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 25656650  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  25656649 ctaagttgattaagatgatgagg 25656627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 17287798 - 17287910
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17287798 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17287896  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||||||||||    
T  17287897 agttgattaagatg 17287910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12742435 - 12742321
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12742435 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12742338  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  12742337 ctaagttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 18334636 - 18334750
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18334636 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18334733  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  18334734 ctaagttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19005164 - 19005050
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19005164 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19005067  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  19005066 ctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303654
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19303637  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  19303638 ctaagatgatgaagatg 19303654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 19858963 - 19859077
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19858963 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19859060  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  19859061 ctaagttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24422665 - 24422551
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24422665 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24422568  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  24422567 ctaagttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629469
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatg 25629469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33861912 - 33861798
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33861912 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 33861815  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  33861814 ctaagttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33864396 - 33864282
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33864396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 33864299  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  33864298 ctaagttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 2291224 - 2291338
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2291224 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 2291321  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  2291322 ctaagttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8055147 - 8055033
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8055147 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8055050  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  8055049 ctaagttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25754927 - 25754813
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25754927 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 25754830  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  25754829 ctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 26924684 - 26924798
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26924684 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26924781  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  26924782 ctaagttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076707
Alignment:
Q  116 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20076715  T
Q  216 ttaagatg 223  Q
    | ||||||    
T  20076714 tgaagatg 20076707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23076952 - 23076750
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||    
T  23076952 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatga-attatatatgatgtt 23076854  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct-ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    | || ||||||||| |  || |||||||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  23076853 taagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 23076754  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  23076753 ctaa 23076750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688507
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  207 ctaaaatgattaagat 222  Q
    ||||  ||||||||||    
T  25688522 ctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 1540955 - 1541069
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1540955 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 1541052  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  1541053 ctaagttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1595667 - 1595553
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  1595667 ttgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 1595570  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  1595569 ctaagttgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18456837 - 18456731
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18456837 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18456740  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  18456739 ctaagatga 18456731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18461997 - 18461891
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18461997 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18461900  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  18461899 ctaagatga 18461891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 20360962 - 20361061
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20360962 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 20361060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 20556936 - 20557050
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  20556936 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 20557033  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  20557034 ctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227609
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 8227551  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  8227552 tg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 8227609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 16448582 - 16448685
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  16448582 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatt 16448679  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  16448680 aagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831524
Alignment:
Q  162 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 27333179 - 27333238
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgtt 60  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27333179 ttgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttgtt 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 27393919 - 27393978
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgtt 60  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27393919 ttgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttgtt 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35008370 - 35008168
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  35008370 tcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaatt-atatatgatgtt 35008272  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    | || |||| |||| |  || |||||||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  35008271 taagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 35008172  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  35008171 ctaa 35008168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Original strand, 20638304 - 20638397
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||    
T  20638304 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 4185839 - 4185919
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  4185839 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 16920679 - 16920728
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16920679 atactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 22780229 - 22780341
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22780229 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 22780327  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  22780328 agttgatgaagatg 22780341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35245658 - 35245593
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 35245593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 3852061 - 3852175
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3852061 ttgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggt 3852158  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  3852159 ctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 215
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821950
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 18821950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 28103799 - 28103877
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacatta 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28103799 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 28103877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185525
Alignment:
Q  167 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 11185525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18696667 - 18696570
Alignment:
Q  48 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 147  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18696667 taatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgttggagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 18696570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18706483 - 18706356
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 147  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||      
T  18706483 atgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaa 18706386  T
Q  148 ctggttttgcatactgcctatgttgctgttt 178  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  18706385 ct-gttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714424
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25714424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186390
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848122
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22949466 - 22949384
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22949466 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22949384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22953422 - 22953340
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22953422 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22953340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23871910 - 23871828
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23871910 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23871828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23875866 - 23875784
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23875866 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23875784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 27325388 - 27325470
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| | || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  27325388 taatgttatataattatatatatattgcattaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 27325470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443068
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21329391 - 21329611
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21329391 ttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 21329489  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329490 tgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 21329588  T
Q  201 ttcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
     |||||||||  |||||||||||    
T  21329589 gtcggtctaagttgattaagatg 21329611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21502049 - 21502270
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21502049 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgt 21502147  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21502148 ttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgct-gatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatg 21502246  T
Q  200 attcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    | |||||||||  |||||||||||    
T  21502247 agtcggtctaagttgattaagatg 21502270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 26011929 - 26012136
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26011929 ttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 26012027  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26012028 tgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatg-ttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 26012126  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  26012127 gtcggtctaa 26012136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20026834 - 20027047
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  20026834 ttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaatt-atgtt 20026932  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026933 tgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactg-ttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 20027030  T
Q  199 gattcggtctaaaatga 215  Q
    || ||||||||| ||||    
T  20027031 gagtcggtctaagatga 20027047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21565720 - 21565562
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  21565720 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 21565622  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21565621 gatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21565562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 22959489 - 22959633
Alignment:
Q  61 aatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcata 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || ||||  |||||||||||||||| || ||| |||||    
T  22959489 aatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcata 22959583  T
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22959584 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22959633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 22178120 - 22178327
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||   ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  22178120 tcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 22178218  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  22178219 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagct-gttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcgg 22178317  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  22178318 tctaagatga 22178327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 19660791 - 19660936
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||| ||| |||||  |||||||| | ||| |||||||    
T  19660791 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatgg-tttgcat 19660885  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19660886 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 19660936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22144217 - 22144064
Alignment:
Q  61 aatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22144217 aatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatg-ttgttttgcat 22144120  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22144119 actacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 22144064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19669073 - 19668918
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||||| | |    
T  19669073 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgat 19668978  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  19668977 gattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaa 19668918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 21729066 - 21729165
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21729066 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21729164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 21808391 - 21808490
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21808391 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21808489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1096588 - 1096470
Alignment:
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096588 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1096490  T
Q  208 taaaatgattaagatgttga 227  Q
    |||  |||| ||||||||||    
T  1096489 taagttgatgaagatgttga 1096470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22412306 - 22412191
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22412306 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtcgg 22412209  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  22412208 tctaagttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529227
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  24529240 agttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 264812 - 264926
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  264812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 264909  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  264910 ctaagttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077983
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatg 9077983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 10732984 - 10733098
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10732984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10733081  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  10733082 ctaagttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20909130 - 20909016
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20909130 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 20909033  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  20909032 ctaagttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25431513 - 25431414
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25431513 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtcta 25431415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314584
Alignment:
Q  131 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 36314584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39363502 - 39363388
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39363502 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 39363405  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  39363404 ctaagttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 223
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997648
Alignment:
Q  121 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 220  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T
Q  221 atg 223  Q
    |||    
T  21997646 atg 21997648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24493687 - 24493576
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24493687 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtcta 24493590  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  24493589 agttgatgaagatg 24493576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25421651 - 25421539
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25421651 agatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25421553  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  25421552 agttgatgaagatg 25421539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29330052 - 29329938
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29330052 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29329955  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29329954 ctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 42245409 - 42245523
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42245409 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 42245506  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  42245507 ctaagttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Original strand, 20902053 - 20902154
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20902053 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 20902150  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  20902151 ctaa 20902154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 36154827 - 36154938
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36154827 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 36154921  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  36154922 ctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 8286844 - 8286957
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 208  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8286844 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8286942  T
Q  209 aaaatgattaagatg 223  Q
    ||  |||| ||||||    
T  8286943 aagttgatgaagatg 8286957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13025429 - 13025318
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13025429 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtcta 13025332  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  13025331 agttgatgaagatg 13025318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13095613 - 13095502
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13095613 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtcta 13095516  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  13095515 agttgatgaagatg 13095502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 23390498 - 23390610
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23390498 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23390596  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  23390597 agttgatgaagatg 23390610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39245243 - 39245140
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  39245243 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 39245146  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  39245145 aagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 2154658 - 2154772
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2154658 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 2154755  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  2154756 ctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 11581243 - 11581357
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11581243 ttgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11581340  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  11581341 ctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22075138 - 22075039
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22075138 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtcta 22075040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29346098 - 29345984
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29346098 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcggt 29346001  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29346000 ctaagttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448055
Alignment:
Q  73 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgt 170  Q
    |||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaatt-acgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagct-gttttatatactgcctatgt 29448062  T
Q  171 tgctgtt 177  Q
    |||||||    
T  29448061 tgctgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37724023 - 37723906
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37724023 ttgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagt 37723927  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttga 227  Q
    |||| ||| | ||||||||||    
T  37723926 ctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 10775731 - 10775834
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  10775731 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 10775828  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  10775829 aagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 18319089 - 18319192
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  18319089 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatt 18319186  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  18319187 aagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29348571 - 29348457
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  29348571 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctg-ttcttatttaactaagctgtatgagtcggt 29348474  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29348473 ctaagttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29351044 - 29350930
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  29351044 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctg-ttcttatttaactaagctgtatgagtcggt 29350947  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29350946 ctaagttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619432
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 38619444  T
Q  218 aagatgttgagg 229  Q
    |||||| |||||    
T  38619443 aagatgatgagg 38619432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725876
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 40725934  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40725933 tgcttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 40725876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061072
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 31061078  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  31061077 aagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 223
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293083
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatg 21293083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32027511 - 32027397
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  32027511 ttgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggt 32027414  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  32027413 ctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064515
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 23064521  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  23064520 aagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 20918028 - 20918106
Alignment:
Q  143 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  20918028 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Original strand, 20766118 - 20766174
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20766118 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741545
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10753685 - 10753603
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  10753685 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 10753603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 21871525 - 21871607
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21871525 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21871607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 21875805 - 21875887
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21875805 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 22120149 - 22120231
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22120149 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttatat 22120231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36314716 - 36314685
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatga 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314716 taatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24067214 - 24067111
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||  |||||    
T  24067214 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgatt 24067117  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  24067116 aagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18356432 - 18356367
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  18356432 agatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--tttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 6024 - 6237
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6024 tcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtt 6122  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6123 tatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6221  T
Q  208 taaaatgattaagatg 223  Q
    |||  |||||||||||    
T  6222 taagttgattaagatg 6237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10754 - 10547
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10754 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatga-attatgtt 10656  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10655 cgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatga 10557  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  10556 gtcggtctaa 10547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32762 - 32556
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  32762 ttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtt 32664  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32663 tgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 32566  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  32565 gtcggtctaa 32556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 51904 - 51984
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51904 ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15471150 - 15470944
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15471150 ttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtt 15471053  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15471052 tgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatga 15470954  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  15470953 gtcggtctaa 15470944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14234709 - 14234494
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtt--tcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg 105  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14234709 tcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatg 14234611  T
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatg 14234494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16097555 - 16097348
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16097555 ttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtt 16097457  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16097456 tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 16097358  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  16097357 gtcggtctaa 16097348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 12174164 - 12174360
Alignment:
Q  9 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  12174164 cttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatc-aatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatt 12174261  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12174262 tgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12174357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16104006 - 16103800
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  16104006 ttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaatt-atgtt 16103908  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16103907 tgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatga 16103810  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  16103809 gtcggtctaa 16103800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 37251061 - 37251269
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || |     
T  37251061 ttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-attta 37251159  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37251160 tgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 37251257  T
Q  199 gattcggtctaa 210  Q
    || |||||||||    
T  37251258 gactcggtctaa 37251269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 13210283 - 13210428
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  13210283 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 13210377  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13210378 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13210428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523835
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 147  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 52523767  T
Q  148 -ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  52523768 act-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 52523835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 22110252 - 22110458
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||||||  || | | ||||| |    
T  22110252 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatga-attctatatgatg-t 22110349  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22110350 tgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 22110448  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  22110449 tctaagatga 22110458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42386533 - 42386430
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42386533 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcgg 42386435  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  42386434 tctaa 42386430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27165370 - 27165248
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165370 tttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 27165272  T
Q  206 tctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    |||||  ||||||||||| |||||    
T  27165271 tctaagttgattaagatgatgagg 27165248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438541
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  18438554 agttgatgaagatg 18438541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307697
Alignment:
Q  73 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 172  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 32307735  T
Q  173 ctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32307734 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32307697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 53301562 - 53301671
Alignment:
Q  119 tgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatta 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||    
T  53301562 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 53301660  T
Q  219 agatgttgagg 229  Q
    ||||| |||||    
T  53301661 agatgatgagg 53301671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12399328 - 12399229
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12399328 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12399230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14972975 - 14972861
Alignment:
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14972975 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14972877  T
Q  208 taaaatgattaagatg 223  Q
    |||  |||| ||||||    
T  14972876 taagttgatgaagatg 14972861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925973
Alignment:
Q  67 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgc 164  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgc 43926024  T
Q  165 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43926023 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 43925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Original strand, 49668094 - 49668183
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49668094 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8899212 - 8899098
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899212 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8899115  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8899114 ctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 29172627 - 29172741
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29172627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29172724  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29172725 ctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9513023 - 9512934
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9513023 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9520998 - 9520909
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9520998 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13544143 - 13544016
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13544143 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13544046  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  13544045 ctaagttgattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 23083363 - 23083475
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23083363 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23083461  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  23083462 agttgatgaagatg 23083475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 24153211 - 24153322
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24153211 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24153308  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||||||||||    
T  24153309 agttgattaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36166716 - 36166602
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36166716 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 36166620  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  36166619 tctaagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469292
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 6469275  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  6469276 ctaagttgattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 9707651 - 9707765
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9707651 ttgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9707748  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9707749 ctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17463296 - 17463182
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17463296 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17463199  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  17463198 ctaagttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17672744 - 17672630
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17672744 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17672647  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  17672646 ctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476499
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatg 25476499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26687006 - 26686907
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26687006 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26686908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 28848655 - 28848769
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28848655 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28848752  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  28848753 ctaagttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34159444 - 34159330
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34159444 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 34159347  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  34159346 ctaagttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 210
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550624
Alignment:
Q  67 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||     
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaatt-atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgca 43550580  T
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43550581 tatgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 43550624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 45606951 - 45607065
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45606951 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 45607048  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  45607049 ctaagttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 55476609 - 55476495
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  55476609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 55476512  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  55476511 ctaagttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12567678 - 12567561
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12567678 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12567581  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttg 226  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  12567580 ctaagttgattaagatgttg 12567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500946
Alignment:
Q  112 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  212 atgattaagatg 223  Q
     |||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698549
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  20698536 agttgatgaagatg 20698549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340824
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 24340763  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24340764 tg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 24340824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 7781391 - 7781505
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7781391 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 7781488  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  7781489 ctaagttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14572707 - 14572609
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14572707 agatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14572610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 16454325 - 16454439
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16454325 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 16454422  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  16454423 ctaagttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23274810 - 23274707
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  23274810 tttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 23274712  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  23274711 tctaa 23274707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 38961935 - 38962045
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38961935 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38962032  T
Q  207 ctaaaatgattaa 219  Q
    ||||  |||||||    
T  38962033 ctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424873
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 11424873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642363
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 37642305  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  37642306 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 37642363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 13151834 - 13151949
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13151834 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 13151931  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  13151932 tctaagttgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 13154299 - 13154414
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13154299 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 13154396  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  13154397 tctaagttgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13442393 - 13442281
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13442393 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13442295  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  13442294 agttgatgaagatg 13442281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17487975 - 17487863
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17487975 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17487877  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  17487876 agttgatgaagatg 17487863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17499457 - 17499345
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17499457 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17499359  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  17499358 agttgatgaagatg 17499345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 1465329 - 1465423
Alignment:
Q  25 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 121  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1465329 cagtaagcctggattgtttattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 10247767 - 10247881
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10247767 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcggt 10247864  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  10247865 ctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977519
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 16282855 - 16282969
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282855 ttgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16282952  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  16282953 ctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 17446699 - 17446812
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17446699 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gt 17446795  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  17446796 ctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21618567 - 21618466
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21618567 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 21618471  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  21618470 tctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194691
Alignment:
Q  165 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgagg 28194691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213834
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43841051 - 43840956
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43841051 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 43840956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 53070697 - 53070803
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53070697 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 53070794  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  53070795 ctaagatga 53070803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412427
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 15412439  T
Q  218 aagatgttgagg 229  Q
    |||||| |||||    
T  15412438 aagatgatgagg 15412427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41124005 - 41123894
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41124005 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 41123911  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  41123910 ctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 147  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 2051239  T
Q  148 -ctggttttgcatactgcctat 168  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  2051240 act-gttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119883
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  12119878 aagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50242940 - 50242830
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50242940 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50242843  T
Q  207 ctaaaatgattaa 219  Q
    ||||  |||||||    
T  50242842 ctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499516
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 8499528  T
Q  218 aagatgttgagg 229  Q
    |||||| |||||    
T  8499527 aagatgatgagg 8499516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12378050 - 12377941
Alignment:
Q  102 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  12378050 gatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagcta-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatg 12377952  T
Q  200 attcggtctaa 210  Q
    | |||||||||    
T  12377951 agtcggtctaa 12377941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147623
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 22147565  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  22147566 tg-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtc 22147623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 14576835 - 14576933
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14576835 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtcta 14576932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 49389524 - 49389642
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  49389524 ttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatga-attatgtt 49389622  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttg 120  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  49389623 tgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10557105 - 10556989
Alignment:
Q  106 tttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcg 204  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  10557105 tttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 10557008  T
Q  205 gtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  10557007 gtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606432
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattc 203  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatg--tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 606420  T
Q  204 ggtctaaaatga 215  Q
    ||| ||| ||||    
T  606421 ggtataagatga 606432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737240
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577996
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 193
Target Start/End: Original strand, 1644642 - 1644757
Alignment:
Q  73 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 172  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||    
T  1644642 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgattt-gcatactgcctatgttg 1644737  T
Q  173 ctgtttgttatttaactaagc 193  Q
     || |||||||||||||||||    
T  1644738 ttg-ttgttatttaactaagc 1644757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14501290 - 14501207
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14501290 taatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14501207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19776089 - 19776007
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  19776089 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 19776007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 37439421 - 37439503
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  37439421 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 37439503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822259
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 43927353 - 43927291
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatat 70  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| ||||    
T  43927353 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12288103 - 12288311
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  12288103 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtt 12288201  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288202 tgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 12288299  T
Q  199 gattcggtctaa 210  Q
    || |||||||||    
T  12288300 gagtcggtctaa 12288311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39706183 - 39706402
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  39706183 ttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatg-t 39706280  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39706281 tgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 39706379  T
Q  201 ttcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
     |||||||||  |||||||||||    
T  39706380 gtcggtctaagttgattaagatg 39706402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13744 - 13957
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  13744 ttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atata 13842  T
Q  101 tga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13843 tgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatg 13941  T
Q  200 attcggtctaaaatga 215  Q
    | ||||||||| ||||    
T  13942 agtcggtctaagatga 13957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 52243136 - 52243297
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 147  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| || | |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  52243136 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttg-gattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatga 52243234  T
Q  148 -ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52243235 act-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 53082052 - 53082258
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||    
T  53082052 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtt 53082150  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||  || |||||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  53082151 tgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 53082248  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  53082249 tctaagatga 53082258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15551982 - 15551837
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||    
T  15551982 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatgg-attgcat 15551888  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15551887 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15551837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 43198495 - 43198656
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||     
T  43198495 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatga 43198593  T
Q  149 -tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
     | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43198594 attgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 43198656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 46640356 - 46640562
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  46640356 tcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 46640454  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
     |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  46640455 -gagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 46640552  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  46640553 tctaagatga 46640562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12774160 - 12774027
Alignment:
Q  73 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 172  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12774160 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 12774065  T
Q  173 ctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12774064 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12774027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 54798752 - 54798868
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  54798752 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttattcaactaagctgcatgagtcgg 54798850  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  54798851 tctaagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377622
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 16377618  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  16377619 ctaa 16377622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16596813 - 16596686
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  16596813 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 16596719  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596718 actacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7798893 - 7798781
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7798893 agatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7798795  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  7798794 agttgatgaagatg 7798781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14280435 - 14280320
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14280435 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 14280338  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  14280337 tctaagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Original strand, 19618216 - 19618343
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19618216 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19618313  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19618314 ctaagttgattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873481
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 52873467  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  52873468 agttgatgaagatg 52873481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12902876 - 12902777
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12902876 agatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12902778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 18215318 - 18215432
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18215318 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18215415  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  18215416 ctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 44928923 - 44929038
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44928923 ttgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44929021  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  44929022 ctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088884
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  7088897 agttgatgaagatg 7088884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7893822 - 7893710
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7893822 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgaatcggtcta 7893724  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  7893723 agttgatgaagatg 7893710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 12351 - 12465
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12351 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12448  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  12449 ctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 15118396 - 15118510
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15118396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15118493  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  15118494 ctaagttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 44773131 - 44773245
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44773131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44773228  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  44773229 ctaagttgattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52312628 - 52312514
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  52312628 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 52312531  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  52312530 ctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8846550 - 8846376
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgactt----------------acatttgat 133  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||                 |||| |||    
T  8846550 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgat 8846452  T
Q  134 attgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  8846451 attgttatctcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaa 8846376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3515125 - 3515005
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3515125 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggt 3515028  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  3515027 ctaagttgattaagatgatgagg 3515005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970878
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  14970849 ctaagttgattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Original strand, 15355380 - 15355487
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  15355380 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 15355477  T
Q  218 aagatgttga 227  Q
    ||||||||||    
T  15355478 aagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 16270238 - 16270349
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16270238 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtcta 16270335  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  16270336 acttgatgaagatg 16270349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 1837553 - 1837667
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1837553 ttgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 1837650  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  1837651 ctaagttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038655
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15099551 - 15099457
Alignment:
Q  25 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 121  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15099551 cagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15190518 - 15190424
Alignment:
Q  25 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 121  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15190518 cagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 18239463 - 18239577
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18239463 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18239560  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  18239561 ctaagttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19242817 - 19242703
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242817 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19242720  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  19242719 ctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 23374361 - 23374460
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23374361 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttcta 23374459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44615406 - 44615292
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44615406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44615309  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  44615308 ctaagttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 50222383 - 50222497
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50222383 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50222480  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  50222481 ctaagttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 51463912 - 51464026
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  51463912 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 51464009  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  51464010 ctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3096385 - 3096313
Alignment:
Q  137 gttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3096385 gttacatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 3096313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190482
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803423
Alignment:
Q  114 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 213  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  214 gattaagatg 223  Q
    ||||||||||    
T  23803414 gattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Original strand, 8574867 - 8574987
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8574867 tttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 8574963  T
Q  206 tctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    |||||  | ||||||||| |||||    
T  8574964 tctaagttaattaagatgatgagg 8574987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6900009 - 6899898
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6900009 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtcta 6899912  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  6899911 agttgatgaagatg 6899898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 16239972 - 16240083
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  16239972 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagttggtcta 16240069  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  16240070 agttgatgaagatg 16240083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046494
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 17046494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22636554 - 22636442
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22636554 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22636456  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  22636455 agttgatgaagatg 22636442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44052948 - 44052836
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  44052948 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggccta 44052850  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  44052849 agttgatgaagatg 44052836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44102332 - 44102218
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44102332 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44102235  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  44102234 ctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 149
Target Start/End: Original strand, 15464926 - 15464972
Alignment:
Q  103 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15464926 atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgct 15464972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15367800 - 15367710
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15367800 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15367710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370038
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15370038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371222
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15371222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373503
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15373503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15402813 - 15402723
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15402813 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15402723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 21815629 - 21815735
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||| |  | |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  21815629 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctg-tcgttatttaactaagctgcacgagtcggt 21815726  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  21815727 ctaagatga 21815735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641340
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610954
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053415
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatg 14053415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223552
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 16223552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 630728 - 630810
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  630728 taatgttatataattggatatatattgcatgcatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 630810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3332052 - 3331970
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  3332052 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttatat 3331970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 13812763 - 13812845
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  13812763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 13812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 14953915 - 14953997
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14953915 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14953997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22353955 - 22353853
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| || |  | ||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22353955 ttgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggt 22353857  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  22353856 ctaa 22353853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25690228 - 25690146
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  25690228 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 25690146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13159 - 12959
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13159 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacga-attatgtttgatgtt 13061  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  13060 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgct-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtc 12962  T
Q  208 taa 210  Q
    |||    
T  12961 taa 12959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 18143 - 18276
Alignment:
Q  13 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  18143 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgaga 18241  T
Q  113 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 147  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  18242 tgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatg 18276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22921763 - 22921976
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  22921763 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattt-tgt 22921861  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22921862 t-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatg 22921959  T
Q  200 attcggtctaaaatgat 216  Q
    | ||||||||| |||||    
T  22921960 agtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21861463 - 21861676
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| |     
T  21861463 ttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttga-attatata 21861561  T
Q  101 tg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  21861562 tgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatg 21861660  T
Q  200 attcggtctaaaatga 215  Q
    | ||||||||| ||||    
T  21861661 agtcggtctaagatga 21861676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Original strand, 21896162 - 21896362
Alignment:
Q  14 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||    
T  21896162 tgttgttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatga-attatatatgaatgtttgaga 21896260  T
Q  113 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaa 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  21896261 tgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaaga 21896359  T
Q  213 tga 215  Q
    |||    
T  21896360 tga 21896362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33681185 - 33681027
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  33681185 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgat 33681087  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33681086 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 33681027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22237805 - 22237647
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  22237805 atgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 22237707  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22237706 gattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295665
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 14295601  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  14295602 actacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatg 14295665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 50614009 - 50614223
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||| || | |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||       
T  50614009 ttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-ataaa 50614107  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50614108 agatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 50614206  T
Q  199 gattcggtctaaaatga 215  Q
    || ||||||||| ||||    
T  50614207 gagtcggtctaagatga 50614223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 50621837 - 50622051
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||| || | |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||       
T  50621837 ttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-ataaa 50621935  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50621936 agatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 50622034  T
Q  199 gattcggtctaaaatga 215  Q
    || ||||||||| ||||    
T  50622035 gagtcggtctaagatga 50622051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20918769 - 20918624
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20918769 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 20918675  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20918674 actgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20918624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16368180 - 16368392
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||       
T  16368180 ttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-ataaa 16368278  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
     |||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  | |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16368279 cgatgtt-gagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatg 16368376  T
Q  200 attcggtctaaaatga 215  Q
    | ||||||||| ||||    
T  16368377 agtcggtctaagatga 16368392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50686833 - 50686626
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||    
T  50686833 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtt 50686735  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||  ||||    |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  50686734 tgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaact-attttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcgg 50686636  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  50686635 tctaagatga 50686626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261184
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||    
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaatt-atgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgc 35261118  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35261119 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 35261184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20248454 - 20248299
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |    
T  20248454 atgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 20248359  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20248358 gattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaa 20248299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 41049936 - 41050142
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| |||  |||| | ||||| |    
T  41049936 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttga-attatatatgatg-t 41050033  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||    
T  41050034 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcgg 41050132  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  41050133 tctaagatga 41050142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754065
Alignment:
Q  73 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 172  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21754198 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 21754103  T
Q  173 ctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21754102 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21754065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210336
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatg 232  Q
    ||||  |||| |||||| ||| ||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 210
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574988
Alignment:
Q  67 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 165  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcc 45574944  T
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45574945 tatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 45574988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509787
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  34509800 agttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 52927876 - 52928071
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52927876 ttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtt 52927974  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| |||||||||            ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52927975 tgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 52928061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16758828 - 16758669
Alignment:
Q  51 tgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--c 148  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  |    
T  16758828 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaac 16758730  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16758729 tggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 16758669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840767
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttga 227  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  21840787 ctaagttgattaagatgttga 21840767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13988984 - 13988870
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13988984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13988887  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  13988886 ctaagttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 21923335 - 21923449
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21923335 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21923432  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  21923433 ctaagttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 23593779 - 23593893
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23593779 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23593876  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  23593877 ctaagttgattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31612430 - 31612317
Alignment:
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31612430 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 31612333  T
Q  208 taaaatgattaagatg 223  Q
    |||  |||||||||||    
T  31612332 taagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16362035 - 16361908
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16362035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16361938  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  16361937 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 21475131 - 21475245
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21475131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggt 21475228  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  21475229 ctaagttgattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 27250731 - 27250830
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27250731 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 27250829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29298254 - 29298141
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29298254 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29298158  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29298157 ctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 433128 - 433016
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||| |||||    
T  433128 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggt 433033  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  433032 ctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093986
Alignment:
Q  49 aatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgtt-gacttacatttgatattgttatatcatg 147  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaatt-acctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatg 16093922  T
Q  148 --ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
      ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  16093923 agctg-ttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaa 16093986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Original strand, 35981589 - 35981700
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  35981589 tcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatga-attatg-ttgatatt 35981686  T
Q  108 tgagatgttgttga 121  Q
    ||||||||||||||    
T  35981687 tgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21026799 - 21026700
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21026799 agatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21026701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 223
Target Start/End: Original strand, 22123119 - 22123226
Alignment:
Q  115 ttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  22123119 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 22123217  T
Q  215 attaagatg 223  Q
    |||||||||    
T  22123218 attaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29776806 - 29776692
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29776806 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29776709  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29776708 ctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 49261542 - 49261448
Alignment:
Q  25 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 121  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49261542 cagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatat-aaattatg-ttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454680
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847255
Alignment:
Q  127 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20847255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130975
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttggat 22130957  T
Q  160 actgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130958 actgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20637051 - 20636956
Alignment:
Q  25 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 122  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  20637051 cagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22532388 - 22532276
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  22532388 agatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtcta 22532290  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  22532289 agttgatgaagatg 22532276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Original strand, 22468698 - 22468823
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | || |||||||| | ||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22468698 agatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 22468796  T
Q  210 aaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    |  ||||||||||||||| || |||||    
T  22468797 agttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 200
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801479
Alignment:
Q  154 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 38801479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21707325 - 21707171
Alignment:
Q  67 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 165  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21707325 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21707228  T
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21707227 tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21711867 - 21711713
Alignment:
Q  67 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 165  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21711867 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21711770  T
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21711769 tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 13212917 - 13213020
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  13212917 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13213014  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  13213015 aagatg 13213020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860167
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 15860161  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  15860162 aagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 16275419 - 16275522
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  16275419 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatt 16275516  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  16275517 aagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21342203 - 21342100
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  21342203 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21342106  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  21342105 aagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21347068 - 21346965
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  21347068 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21346971  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  21346970 aagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130639
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 51130639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21161932 - 21161746
Alignment:
Q  9 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgttt 108  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||| ||||||  |    
T  21161932 cttgctgttgatgttccagtgagcctaatttgtttaatccaatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatga-tttatg-ttgatg-at 21161836  T
Q  109 gagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
      || |||| ||| || |||| ||||||||||||||| | | | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21161835 atgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgat-gatttgcatactg-ttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatga 21161746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20135306 - 20135181
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||| || | ||| |  ||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  20135306 agatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttgtttaactaagttgcatgagtcagtcta 20135208  T
Q  210 aaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  20135207 agttgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26065107 - 26064959
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgca 158  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| || || | |||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||  |  ||||       
T  26065107 taatgtgatatatttgtatatgtattacttgaatt-atatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 1924914 - 1924996
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1924914 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1924996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 20923928 - 20924010
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  20923928 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 20924010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12271676 - 12271639
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 144  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12271676 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40389261 - 40389158
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||   |||||    
T  40389261 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctg-ttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgatt 40389164  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  40389163 aagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6755 - 6555
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |    
T  6755 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatat 6658  T
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6657 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  6558 ctaa 6555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8696 - 8486
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat--tgtatatacattacatgagtttatg 98  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||| |  | ||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||| ||| || ||     
T  8696 ttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaatt-ata 8598  T
Q  99 tttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 197  Q
    | ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8597 tatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 8499  T
Q  198 tgattcggtctaa 210  Q
    ||| |||||||||    
T  8498 tgagtcggtctaa 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 936 - 1148
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  936 tcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta-aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatgtt 1033  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |  ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1034 tatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1132  T
Q  208 taaaatgattaagatg 223  Q
    |||  |||||||||||    
T  1133 taagttgattaagatg 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12991 - 12786
Alignment:
Q  3 gtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 102  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12991 gtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttg 12893  T
Q  103 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgatt 202  Q
    ||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  12892 atgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagt 12794  T
Q  203 cggtctaa 210  Q
    ||||||||    
T  12793 cggtctaa 12786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6838 - 6618
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6838 ttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 6740  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||   ||| || | |||| |||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6739 tgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat-catgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 6641  T
Q  201 ttcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
     |||||||||  |||||||||||    
T  6640 gtcggtctaagttgattaagatg 6618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14218 - 13998
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14218 ttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 14120  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||   ||| || | |||| |||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14119 tgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat-catgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 14021  T
Q  201 ttcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
     |||||||||  |||||||||||    
T  14020 gtcggtctaagttgattaagatg 13998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8242 - 8094
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8242 ttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtt 8144  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8143 tgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 8094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7036 - 6826
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7036 ttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtt 6938  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| ||||||   ||||||| || ||||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6937 tgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatga 6842  T
Q  201 ttcggtctaaaatgat 216  Q
     ||||||||| |||||    
T  6841 gtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 7626 - 7839
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| |     
T  7626 ttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttga-attatata 7724  T
Q  101 tg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7725 tgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatg 7823  T
Q  200 attcggtctaaaatga 215  Q
    |||| |||||| ||||    
T  7824 attcagtctaagatga 7839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25176077 - 25175870
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||    
T  25176077 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaatt-atgt 25175979  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175978 t-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 25175881  T
Q  200 attcggtctaa 210  Q
    | || ||||||    
T  25175880 aatctgtctaa 25175870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28406204 - 28405996
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |       
T  28406204 ttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaag-- 28406107  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28406106 ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatg 28406007  T
Q  200 attcggtctaa 210  Q
    | |||||||||    
T  28406006 agtcggtctaa 28405996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18786796 - 18787004
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  18786796 ttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtt 18786894  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    ||||| ||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786895 tgatg-ttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactgg-tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcat 18786992  T
Q  199 gattcggtctaa 210  Q
    || |||||||||    
T  18786993 gagtcggtctaa 18787004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679592
Alignment:
Q  62 atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatac 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatac 7679654  T
Q  162 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||    
T  7679653 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23791502 - 23791288
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| |     
T  23791502 ttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatata 23791404  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||    
T  23791403 taatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacat 23791305  T
Q  199 gattcggtctaaaatga 215  Q
    || ||||||||| ||||    
T  23791304 gagtcggtctaagatga 23791288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22105531 - 22105416
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105531 ttgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22105433  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  22105432 ctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23207498 - 23207292
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | | ||| |    
T  23207498 tcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatttataatg-t 23207401  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23207400 tgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 23207302  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  23207301 tctaagatga 23207292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 298816 - 298929
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  298816 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 298915  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||||||||||    
T  298916 agttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708720
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || ||||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||     
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgt 23708659  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23708660 tg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaa 23708720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25109109 - 25108902
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||    
T  25109109 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtt 25109011  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  25109010 tgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaact-attttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcgg 25108912  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  25108911 tctaagatga 25108902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Original strand, 32214965 - 32215092
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32214965 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 32215062  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  32215063 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072050
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 23071999  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23072000 actgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaa 23072050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23060632 - 23060520
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23060632 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23060534  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  23060533 agttgatgaagatg 23060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6726113 - 6725999
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6726113 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6726016  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  6726015 ctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23076561 - 23076462
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076561 agatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23076463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19671998 - 19671850
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  19671998 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcat 19671901  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19671900 actgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 19671850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22337238 - 22337122
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22337238 tttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22337140  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||| ||||||    
T  22337139 tctaagttgatgaagatg 22337122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 571515 - 571401
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  571515 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 571418  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  571417 ctaagttgattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18809061 - 18808947
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18809061 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18808964  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  18808963 ctaagttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23130980 - 23130866
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23130980 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23130883  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  23130882 ctaagttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23133447 - 23133333
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23133447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23133350  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  23133349 ctaagttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23135708 - 23135594
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23135708 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23135611  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  23135610 ctaagttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 23709576 - 23709690
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23709576 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23709673  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  23709674 ctaagttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 23712057 - 23712171
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23712057 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23712154  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  23712155 ctaagttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26505497 - 26505383
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26505497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26505400  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  26505399 ctaagttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26507975 - 26507861
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26507975 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26507878  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  26507877 ctaagttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 34402566 - 34402680
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34402566 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 34402663  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  34402664 ctaagttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39682431 - 39682317
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39682431 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 39682334  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  39682333 ctaagttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 20520145 - 20520299
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 157  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||      
T  20520145 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactg-ttttat 20520241  T
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
     |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20520242 gtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 20520299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 21155104 - 21155218
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21155104 ttgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21155201  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  21155202 ctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24367892 - 24367782
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24367892 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 24367795  T
Q  207 ctaaaatgattaa 219  Q
    ||||  |||||||    
T  24367794 ctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28577217 - 28577103
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28577217 ttgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28577120  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  28577119 ctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413244
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat--tgttatatcatg 147  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatg 22413175  T
Q  148 --ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
      ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  22413176 agctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga 22413244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 22731238 - 22731348
Alignment:
Q  112 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaa 211  Q
    |||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22731238 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaac 22731336  T
Q  212 atgattaagatg 223  Q
     |||| ||||||    
T  22731337 ttgatgaagatg 22731348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38215
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 38215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 24898239 - 24898354
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24898239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24898336  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  24898337 tctaagttgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 24900722 - 24900837
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24900722 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24900819  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  24900820 tctaagttgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 24903199 - 24903314
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24903199 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24903296  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  24903297 tctaagttgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 24905676 - 24905791
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24905676 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24905773  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  24905774 tctaagttgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 24908151 - 24908266
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24908151 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24908248  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  24908249 tctaagttgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 32039542 - 32039656
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32039542 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagccggt 32039639  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  32039640 ctaagttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43137417 - 43137303
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43137417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 43137320  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  43137319 ctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309115
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20309129  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    | ||| | ||||||    
T  20309128 agatgttgaagatg 20309115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Original strand, 22134208 - 22134306
Alignment:
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22134208 tgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtc 22134304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103509
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 23103492  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||| ||| | ||||||    
T  23103493 ctaagatgttgaagatg 23103509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 32451949 - 32452030
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32451949 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaa 32452030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697713
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 147  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaa 24697646  T
Q  148 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    || ||||    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  24697647 ct-gtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatga 24697713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 45029898 - 45030012
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45029898 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 45029995  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  45029996 ctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23285942 - 23285872
Alignment:
Q  152 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  23285942 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23285872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23004878 - 23004763
Alignment:
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||   |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23004878 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaacta-ttttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 23004780  T
Q  199 gattcggtctaaaatga 215  Q
    || ||||| ||| ||||    
T  23004779 gagtcggtttaagatga 23004763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23660141 - 23660030
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  23660141 agatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcct-gtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggtcta 23660044  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  23660043 agttgatgaagatg 23660030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 22459455 - 22459598
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||  |  | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  22459455 ttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagtt-atatg 22459553  T
Q  101 tga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 144  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22459554 tgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 24529573 - 24529687
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24529573 ttgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggt 24529670  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  24529671 ctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 22738182 - 22738293
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22738182 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22738279  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  22738280 agttgatcaagatg 22738293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38967493 - 38967378
Alignment:
Q  107 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38967493 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgt-tgtgtcgatgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 38967396  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  38967395 tctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8946735 - 8946664
Alignment:
Q  151 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  8946735 gttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8946664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 23654388 - 23654487
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| ||  |||| || ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23654388 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23654486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643108
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040303
Alignment:
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23040303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1283748 - 1283666
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1283748 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1283666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 30344776 - 30344858
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  30344776 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 30344858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5863 - 5663
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgt 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |    
T  5863 tcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatat 5766  T
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5765 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttt-catactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggt 5667  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  5666 ctaa 5663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19491 - 19284
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  19491 ttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgt 19393  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19392 t-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 19295  T
Q  200 attcggtctaa 210  Q
    | |||||||||    
T  19294 agtcggtctaa 19284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 100601 - 100394
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  100601 ttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatt-atgt 100503  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100502 ta-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 100405  T
Q  200 attcggtctaa 210  Q
    | |||||||||    
T  100404 agtcggtctaa 100394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 40076 - 40275
Alignment:
Q  9 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||    
T  40076 cttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatt 40173  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  40174 tgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtc 40272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 17484 - 17600
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17484 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17581  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgtt 225  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  17582 ctaagttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 94529 - 94415
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  94529 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 94432  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  94431 ctaagttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44573 - 44458
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44573 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 44476  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  44475 tctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119895
Alignment:
Q  157 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 119895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101519
Alignment:
Q  153 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaa 101519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 2539 - 2746
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  2539 ttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgt 2637  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    | ||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2638 t-gatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgattta-catactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatg 2735  T
Q  200 attcggtctaa 210  Q
    | |||||||||    
T  2736 agtcggtctaa 2746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1302 - 1091
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||  | ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1302 tcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaatt-atgtttgatgtt 1204  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    ||| |||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1203 tgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1105  T
Q  208 taaaatgattaaga 221  Q
    |||  |||||||||    
T  1104 taagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 10435 - 10642
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10435 ttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtt 10533  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10534 tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataa 10632  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  10633 gtcggtctaa 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 62422 - 62222
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt-ataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  62422 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatt-atgt 62324  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    | ||| |||||||||||||||   | |||| |||||| ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  62323 t-gatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgttttt-catactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatg 62229  T
Q  200 attcggt 206  Q
    | |||||    
T  62228 agtcggt 62222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 132765 - 132672
Alignment:
Q  123 ttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 216  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  132765 ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 136798 - 136684
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  136798 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 136701  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  136700 ctaagttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 139267 - 139153
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  139267 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 139170  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  139169 ctaagttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 144205 - 144091
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  144205 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 144108  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  144107 ctaagttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 134329 - 134215
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  134329 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 134232  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||   |||||||||||    
T  134231 ctatgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 141736 - 141622
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  141736 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 141639  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  141638 ctaagttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 130132 - 129925
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  130132 ttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtt 130034  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  130033 tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatga 129935  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  129934 gtcggtctaa 129925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Original strand, 60710 - 60822
Alignment:
Q  103 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  60710 atgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 60807  T
Q  201 ttcggtctaaaatga 215  Q
     ||||| ||| ||||    
T  60808 gtcggtttaagatga 60822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8175
Alignment:
Q  17 tgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||    
T  7983 tgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatga-attatatatgatg-ttgtgatgtt 8080  T
Q  117 gttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8081 gttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactgg-tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 29238 - 29354
Alignment:
Q  62 atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatac 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| | | |||| ||||    
T  29238 atgttatataattgtatatacagtacatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatag-tttgaatac 29332  T
Q  162 tgcctatgttgctgtttgttat 183  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  29333 tacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 22613 - 22771
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  22613 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 22711  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22712 gattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 82190 - 82076
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  82190 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggt 82093  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  82092 ctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 6188 - 6401
Alignment:
Q  13 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  6188 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgaga 6286  T
Q  113 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6287 tgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagct-gttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaa 6385  T
Q  211 aatgattaagatgttgag 228  Q
     ||||  |||||||||||    
T  6386 gatga--aagatgttgag 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13855
Alignment:
Q  164 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgag 228  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttgag 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 14598 - 14798
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||| |    
T  14598 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaatt-atgtt-gatat 14695  T
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgatttt-cttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  14795 ctaa 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 136261 - 136475
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatct-aatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  136261 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgt 136359  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 197  Q
      ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  136360 acgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgca 136457  T
Q  198 tgattcggtctaaaatga 215  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  136458 tgagtcggtctaagatga 136475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 144969 - 145183
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatct-aatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  144969 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgt 145067  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 197  Q
      ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  145068 acgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgca 145165  T
Q  198 tgattcggtctaaaatga 215  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  145166 tgagtcggtctaagatga 145183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174786
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 174790  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  174789 ctaa 174786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121773
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 121773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 160910 - 160704
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  160910 ttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgactt-atgtt 160812  T
Q  101 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  160811 tgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatga 160714  T
Q  201 ttcggtctaa 210  Q
     |||||||||    
T  160713 gtcggtctaa 160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 501202 - 501085
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  501202 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 501105  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttg 226  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  501104 ctaagttgattaagatgttg 501085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 85635 - 85738
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  85635 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatt 85732  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  85733 aagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 149
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |    
T  307 atgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 209  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  208 gattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaa 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 45735 - 45893
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 149  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  45735 atgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaatt-atgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgat 45833  T
Q  150 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45834 gattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 45893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12795 - 12583
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  12795 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaatt-atata 12698  T
Q  101 tga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    | | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  12697 taagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatg 12599  T
Q  200 attcggtctaaaatga 215  Q
    | ||||||||| ||||    
T  12598 agtcggtctaagatga 12583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 128870 - 129076
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  128870 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaatt-atatatgatgtt 128968  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  128969 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggt 129067  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  129068 ctaagatga 129076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 78542 - 78345
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||| |    
T  78542 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaacgatg-t 78445  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  || |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  78444 tgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaact-gttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 78347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 116548 - 116434
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  116548 tttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 116452  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  116451 tctaagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 2698 - 2913
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatg- 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||   ||||||     
T  2698 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata--attgtatatatat-acat---tttatga 2791  T
Q  99 -tt----tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 193  Q
     ||    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2792 attaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagc 2890  T
Q  194 tgcatgattcggtctaaaatgat 216  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  2891 tgcatgagtcggtctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2281
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  2112 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-attatg- 2209  T
Q  100 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 172  Q
     |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  2210 ctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38538 - 38339
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||   ||||||| |||||  ||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  38538 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 38440  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  38439 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcgg 38341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15826 - 15668
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  15826 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgtat 15732  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  15731 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11312
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  11457 taatgttatataatagtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 11363  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11362 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 11312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2017
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 2068  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2067 actgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28421
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  28434 agttgatgaagatg 28421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4572
Alignment:
Q  174 tgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 4572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 53442 - 53655
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  53442 ttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atata 53540  T
Q  101 tga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 199  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53541 tgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatg 53639  T
Q  200 attcggtctaaaatga 215  Q
    | || |||||| ||||    
T  53640 aatcagtctaagatga 53655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3309
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatg 232  Q
    ||||  |||| |||||| ||| ||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1183
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 1119  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  1120 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 27744 - 27850
Alignment:
Q  103 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  27744 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 27842  T
Q  203 cggtctaa 210  Q
    ||||||||    
T  27843 cggtctaa 27850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 19785 - 19991
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || | ||||| ||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||| |    
T  19785 tcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagtt-atttatgatgct 19883  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  19884 -gagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  19982 tctaagatga 19991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40031 - 39920
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  40031 agatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtcta 39934  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  39933 agttgatgaagatg 39920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 48939 - 49021
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  48939 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 49021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 103539 - 103732
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||     
T  103539 tcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatga-attatgtatgatgt- 103636  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
         |||||||   || ||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||    
T  103637 -----tgttgtt---ttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggt 103728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 97227 - 97020
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  97227 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 97129  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||    
T  97128 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtggg 97030  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  97029 tctaagatga 97020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 106505 - 106298
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  106505 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 106407  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||    
T  106406 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtggg 106308  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  106307 tctaagatga 106298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1047
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1155 tttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1057  T
Q  206 tctaaaatga 215  Q
    ||||| ||||    
T  1056 tctaagatga 1047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 16095 - 16201
Alignment:
Q  103 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  16095 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 16193  T
Q  203 cggtctaa 210  Q
    ||||||||    
T  16194 cggtctaa 16201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13252 - 13143
Alignment:
Q  105 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcg 204  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  13252 gtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 13154  T
Q  205 gtctaaaatga 215  Q
    |||||| ||||    
T  13153 gtctaagatga 13143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2676
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Original strand, 38700 - 38822
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  38700 tttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtagg 38798  T
Q  206 tctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    |||||  ||||||||||| |||||    
T  38799 tctaagttgattaagatgatgagg 38822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 44705 - 44821
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  44705 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 44803  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||||||||||    
T  44804 tctaagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Original strand, 3149 - 3264
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3149 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 3246  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||| ||||||    
T  3247 tctaagttgatgaagatg 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25275 - 25126
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 157  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||  ||| ||||      
T  25275 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctg-ttttat 25179  T
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25178 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 25126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 620
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 147  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  715 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 15763 - 15891
Alignment:
Q  94 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 193  Q
    ||||||||||||| |  |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15763 ttatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 15861  T
Q  194 tgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  15862 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15726 - 15764
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 39  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15726 ttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39599 - 39497
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39599 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39502  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  39501 tctaa 39497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17340
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg--gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcg 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  205 gtctaaaatgattaagatgttgaggatg 232  Q
    ||||||  |||| |||||| ||| ||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 79328 - 79434
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  79328 ttgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 79425  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  79426 ctaagatga 79434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Original strand, 75213 - 75315
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75213 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 75310  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  75311 tctaa 75315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 226 - 54
Alignment:
Q  8 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  || || | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||    
T  226 tcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtt 128  T
Q  108 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgt 180  Q
    ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  127 tgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11406 - 11279
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 11309  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11308 ctaatttgattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 7952 - 8161
Alignment:
Q  1 ttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtt 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||| |     
T  7952 ttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttga-attatata 8050  T
Q  101 tg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 197  Q
    || |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  8051 tgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagct-gatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgca 8149  T
Q  198 tgattcggtcta 209  Q
    ||  ||||||||    
T  8150 tgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10773
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttga 227  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  10793 ctaagttgattaagatgttga 10773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4869
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16714
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatg 16714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34288 - 34143
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||| ||    
T  34288 taatgttatataattgtatatatattacttga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-gttgtat 34194  T
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34193 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaa 34143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 13141
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgt 180  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13211 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 293
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaa 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11494
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 11545  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11544 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatga 11494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38347
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 38296  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38297 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatga 38347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 24605 - 24690
Alignment:
Q  60 taatgttatataattg--tatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  24605 taatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Original strand, 12293 - 12420
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  12293 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 12390  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 236  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  12391 ctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23001 - 22890
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23001 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22904  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||||||||||    
T  22903 agttgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32205 - 32112
Alignment:
Q  123 ttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32205 ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52032 - 51920
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52032 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 51934  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  51933 agttgatgaagatg 51920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 167980 - 168079
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  167980 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 168078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 267872 - 267675
Alignment:
Q  17 tgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || | ||| ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||| ||    
T  267872 tgttgtttcagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt-gagatatt 267775  T
Q  117 gttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatg 214  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  267774 gttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13510 - 13396
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13510 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13413  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  13412 ctaagttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20865 - 20751
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20865 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20768  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  20767 ctaagttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37939 - 37825
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37939 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 37842  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  37841 ctaagttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16120
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatg 16120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 32959 - 33070
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32959 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 33056  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  33057 agttgatgaagatg 33070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 46046 - 45935
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46046 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 45949  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  45948 agttgatgaagatg 45935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 23901 - 23984
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 23984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 158494 - 158608
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  158494 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 158591  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  158592 ctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340048
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggt 340044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4812 - 4692
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4715  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttgagg 229  Q
    ||||  |||||| |||| |||||    
T  4714 ctaagttgattaggatgatgagg 4692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 765 - 565
Alignment:
Q  13 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || || |   |||| | |||| | ||||||| |||||||||| || || | ||||||| | ||    
T  765 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgttgg-ga 668  T
Q  113 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  667 tgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactg-ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 570  T
Q  211 aatga 215  Q
     ||||    
T  569 gatga 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13330 - 13218
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13330 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 13232  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  13231 agttgatgaagatg 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33060 - 32949
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33060 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtcta 32963  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  32962 acttgatgaagatg 32949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38879 - 38768
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38879 agatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtcta 38782  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  38781 agttgatgaagatg 38768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9867 - 9753
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9867 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9770  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9769 ctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 24304 - 24404
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 208  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24304 agatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 24402  T
Q  209 aa 210  Q
    ||    
T  24403 aa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8605 - 8486
Alignment:
Q  103 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgatt 202  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  8605 atgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgct-attgttatttaaccaagctgcatgagt 8507  T
Q  203 cggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||  |||| ||||||    
T  8506 cggtctaagttgatgaagatg 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9242
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  207 ctaaaatgattaagatgttga 227  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  9262 ctaagttgattaagatgttga 9242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14065 - 13951
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14065 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttatctaagctgcatgagtcggt 13968  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  13967 ctaagttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4630 - 4528
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4630 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 4533  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  4532 tctaa 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12212 - 12110
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12212 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 12115  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  12114 tctaa 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22164 - 22062
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22164 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 22067  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  22066 tctaa 22062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16902 - 16788
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16902 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16805  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  16804 ctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30050 - 29949
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30050 ttgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 29953  T
Q  207 ctaa 210  Q
    ||||    
T  29952 ctaa 29949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 1706 - 1904
Alignment:
Q  16 ttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||| | || || | ||||||| |||||||    
T  1706 ttgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaatt-atatatgatgtt-gagatgt 1803  T
Q  116 tgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 213  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||| ||||||||  |||| |||   |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1804 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaagat 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3477
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3589 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtcta 3491  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  3490 agttgatgaagatg 3477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 363
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  461 agatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgcta-ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18128
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 18067  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    || || |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18068 tg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 18128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2283
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatt 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1970 - 1858
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1970 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1872  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  1871 agttgatgaagatg 1858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 1050 - 1149
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1050 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 8535 - 8643
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8535 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtcta 8629  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    |  |||| ||||||    
T  8630 agttgatgaagatg 8643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20930
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  210 a 210  Q
    |    
T  20930 a 20930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40518 - 40404
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  40518 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggt 40421  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  40420 ctaagttgattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51654 - 51602
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51654 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26018 - 25916
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26018 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcgg 25921  T
Q  206 tctaa 210  Q
    |||||    
T  25920 tctaa 25916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39980 - 39865
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  39980 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttgg 39883  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  |||| ||||||    
T  39882 tctaagttgatgaagatg 39865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1296
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  1359 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 1296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7273
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15352
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4643 - 4545
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4643 agatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10524
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtcta 10523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16382 - 16289
Alignment:
Q  127 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  16382 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 4218
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  4321 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactg-ctgtgtcgctg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 4224  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  4223 aagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2071 - 1959
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 209  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2071 agatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 1973  T
Q  210 aaatgattaagatg 223  Q
    | ||| | ||||||    
T  1972 agatgttgaagatg 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4301
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4318  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  4317 ctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 6123 - 6238
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgattcggtc 207  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6123 agatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6222  T
Q  208 taaaatgattaagatg 223  Q
    |||  |||| ||||||    
T  6223 taagttgatgaagatg 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4732
Alignment:
Q  138 ttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 4732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 20423 - 20528
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20423 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20519  T
Q  207 ctaaaatga 215  Q
    |||| ||||    
T  20520 ctaagatga 20528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 128869 - 128824
Alignment:
Q  110 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  128869 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 128824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13517
Alignment:
Q  151 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13575 gttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  50 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgc 225488  T
Q  149 tggttttgcatactgcctatgttg 172  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  225487 t-gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 110
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  224 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 127  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  126 ctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2780 - 2690
Alignment:
Q  126 catttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2780 catttgatattgttatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatga 2690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5242
Alignment:
Q  164 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 5242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Original strand, 3529 - 3588
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  3529 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32137 - 32087
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32137 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 47002
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatg 47002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12176 - 12068
Alignment:
Q  107 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||       |||||||||||||||||| |||||    
T  12176 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactg-ctgtgttgctg-------tttaactaagctgcatgagtcggt 12085  T
Q  207 ctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||  |||||||||||    
T  12084 ctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28871
Alignment:
Q  153 tttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1163
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  1098 atactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 1163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 206
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11540
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 206  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15564
Alignment:
Q  129 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 210  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1439
Alignment:
Q  118 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  1336 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 1433  T
Q  218 aagatg 223  Q
    ||||||    
T  1434 aagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 161133 - 161248
Alignment:
Q  107 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcgg 205  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  161133 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcgg 161230  T
Q  206 tctaaaatgattaagatg 223  Q
    |||||  || ||||||||    
T  161231 tctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 154
Target Start/End: Original strand, 2398 - 2488
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  2398 taatgttatataattgtatatacattaaatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 2488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11978
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 11978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 6
Alignment:
Q  60 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  88 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27953 - 27911
Alignment:
Q  106 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27953 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 223
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4947
Alignment:
Q  163 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||| ||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Original strand, 602 - 697
Alignment:
Q  48 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 144  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  602 taatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University