View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2205_high_3 (Length: 583)

Name: NF2205_high_3
Description: NF2205
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2205_high_3
NF2205_high_3
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (17-571)||(8879382-8879931)
chr8 (82-570)||(36565242-36565737)
chr8 (82-568)||(42854005-42854498)
chr8 (148-570)||(18124962-18125385)
chr8 (148-571)||(39946642-39947070)
chr8 (82-570)||(36544938-36545430)
chr8 (81-564)||(36394948-36395443)
chr8 (82-570)||(37077551-37078030)
chr8 (82-569)||(2796342-2796838)
chr8 (82-391)||(11523724-11524040)
chr8 (82-455)||(40813224-40813605)
chr8 (343-570)||(25288688-25288916)
chr8 (343-570)||(25300023-25300251)
chr8 (298-545)||(18752099-18752344)
chr8 (361-568)||(15215557-15215765)
chr8 (347-568)||(12492116-12492336)
chr8 (84-352)||(12491141-12491415)
chr8 (82-410)||(21121105-21121426)
chr8 (82-439)||(45419157-45419516)
chr8 (82-276)||(42469728-42469924)
chr8 (291-497)||(13171865-13172072)
chr8 (84-385)||(8932676-8932982)
chr8 (289-453)||(6510642-6510803)
chr8 (502-570)||(4032922-4032990)
chr8 (321-460)||(13986391-13986530)
chr8 (82-207)||(14742083-14742207)
chr8 (82-259)||(2027632-2027811)
chr8 (314-446)||(2518631-2518761)
chr8 (115-276)||(26904941-26905103)
chr8 (82-231)||(35643609-35643758)
chr8 (502-569)||(25439323-25439390)
chr8 (82-213)||(25288912-25289045)
chr8 (82-213)||(25300247-25300380)
chr8 (82-200)||(15215413-15215533)
chr8 (82-208)||(25473404-25473532)
chr8 (82-191)||(44529395-44529506)
chr8 (82-174)||(490522-490616)
chr8 (82-181)||(44047533-44047634)
chr8 (313-410)||(44681277-44681374)
chr8 (82-138)||(1928588-1928644)
chr8 (82-141)||(35323995-35324054)
chr8 (82-217)||(29520793-29520930)
chr8 (324-410)||(32043537-32043623)
chr8 (300-388)||(12796925-12797011)
chr8 (85-204)||(12025934-12026058)
chr8 (301-393)||(30113423-30113515)
chr8 (289-357)||(45512709-45512777)
chr8 (336-435)||(16351312-16351411)
chr8 (82-217)||(30559837-30559979)
chr8 (82-128)||(1064955-1065001)
chr8 (336-434)||(29520583-29520681)
chr8 (89-156)||(30689940-30690009)
chr8 (82-269)||(35914602-35914791)
chr8 (82-136)||(41031421-41031475)
chr8 (82-136)||(41031527-41031581)
chr8 (82-135)||(3473798-3473851)
chr8 (324-405)||(5908594-5908675)
chr8 (82-164)||(23492231-23492315)
chr8 (82-174)||(26363674-26363767)
chr8 (85-138)||(45041320-45041373)
chr8 (154-226)||(13589614-13589686)
chr8 (298-405)||(9695583-9695690)
chr8 (324-410)||(25985468-25985552)
chr8 (82-137)||(39651029-39651084)
chr8 (287-409)||(10080119-10080239)
chr8 (87-141)||(18741854-18741908)
chr8 (87-141)||(18746818-18746872)
chr8 (364-430)||(25439394-25439460)
chr8 (82-136)||(27556303-27556357)
chr8 (324-408)||(33666748-33666829)
chr8 (82-164)||(36143538-36143622)
chr8 (82-168)||(42584552-42584639)
chr8 (82-126)||(4558209-4558253)
chr8 (82-134)||(10668498-10668550)
chr8 (82-126)||(18473973-18474017)
chr8 (85-129)||(26055655-26055699)
chr8 (82-126)||(31309590-31309634)
chr8 (82-138)||(32276910-32276966)
chr8 (82-138)||(35362651-35362707)
chr8 (82-126)||(39953265-39953309)
chr8 (82-138)||(39967500-39967556)
[»] chr4 (111 HSPs)
chr4 (82-567)||(31959815-31960307)
chr4 (82-570)||(436015-436510)
chr4 (82-570)||(48174094-48174589)
chr4 (86-570)||(33226995-33227486)
chr4 (82-570)||(43433704-43434205)
chr4 (82-570)||(56375076-56375571)
chr4 (82-551)||(52569516-52569992)
chr4 (82-570)||(46582827-46583320)
chr4 (82-570)||(48622544-48623023)
chr4 (82-570)||(1777018-1777511)
chr4 (82-570)||(23906298-23906797)
chr4 (82-568)||(27450181-27450667)
chr4 (82-567)||(53707583-53708075)
chr4 (93-530)||(4440682-4441123)
chr4 (82-571)||(47265196-47265702)
chr4 (86-487)||(33190853-33191261)
chr4 (141-568)||(50286759-50287182)
chr4 (143-570)||(41009414-41009846)
chr4 (82-490)||(39100537-39100949)
chr4 (84-497)||(1793319-1793741)
chr4 (82-567)||(1211393-1211883)
chr4 (82-411)||(37797798-37798132)
chr4 (88-378)||(39708412-39708708)
chr4 (83-570)||(16002714-16003206)
chr4 (321-488)||(12494618-12494786)
chr4 (82-497)||(45204841-45205271)
chr4 (81-369)||(26037505-26037799)
chr4 (82-455)||(28236087-28236463)
chr4 (82-449)||(27983108-27983474)
chr4 (335-569)||(35690091-35690326)
chr4 (420-566)||(39708248-39708395)
chr4 (289-497)||(31458887-31459098)
chr4 (115-448)||(37773485-37773823)
chr4 (82-338)||(32479057-32479319)
chr4 (82-231)||(6957728-6957879)
chr4 (82-231)||(8286569-8286720)
chr4 (82-231)||(12494793-12494944)
chr4 (121-454)||(20601692-20602025)
chr4 (131-382)||(20591356-20591607)
chr4 (82-268)||(21236951-21237139)
chr4 (86-231)||(7947067-7947214)
chr4 (82-407)||(51421682-51422011)
chr4 (84-365)||(20192025-20192311)
chr4 (289-542)||(55578845-55579100)
chr4 (288-535)||(7092433-7092680)
chr4 (148-284)||(20821077-20821212)
chr4 (82-207)||(21528442-21528569)
chr4 (82-275)||(35690357-35690552)
chr4 (82-231)||(37488221-37488372)
chr4 (148-276)||(50679589-50679717)
chr4 (82-218)||(4548165-4548303)
chr4 (82-141)||(55007968-55008027)
chr4 (143-221)||(41009283-41009361)
chr4 (428-496)||(26037835-26037904)
chr4 (81-141)||(3979142-3979202)
chr4 (82-138)||(30634107-30634163)
chr4 (126-231)||(50287988-50288095)
chr4 (324-435)||(54470129-54470240)
chr4 (82-181)||(19154864-19154965)
chr4 (82-181)||(19969361-19969462)
chr4 (503-569)||(54914618-54914684)
chr4 (82-138)||(15665326-15665382)
chr4 (325-393)||(44047598-44047666)
chr4 (82-138)||(45209206-45209262)
chr4 (82-138)||(46236714-46236770)
chr4 (82-134)||(50238616-50238668)
chr4 (82-134)||(50238702-50238754)
chr4 (288-407)||(51252674-51252791)
chr4 (88-174)||(55237918-55238001)
chr4 (82-130)||(56130403-56130451)
chr4 (82-137)||(2557672-2557727)
chr4 (82-137)||(4879110-4879165)
chr4 (365-460)||(20105761-20105856)
chr4 (82-137)||(26024851-26024906)
chr4 (289-372)||(30621418-30621501)
chr4 (82-174)||(34208270-34208364)
chr4 (379-497)||(38904023-38904142)
chr4 (82-129)||(46153942-46153989)
chr4 (86-137)||(50862857-50862908)
chr4 (84-138)||(15661875-15661929)
chr4 (299-393)||(33709888-33709982)
chr4 (297-407)||(49987378-49987488)
chr4 (247-333)||(8286455-8286545)
chr4 (82-168)||(51811281-51811367)
chr4 (82-134)||(19061936-19061988)
chr4 (83-139)||(22873601-22873657)
chr4 (298-402)||(38570970-38571074)
chr4 (82-134)||(49939735-49939787)
chr4 (83-164)||(55388213-55388296)
chr4 (82-174)||(5306483-5306577)
chr4 (82-137)||(25575050-25575105)
chr4 (82-141)||(40424552-40424611)
chr4 (82-129)||(49738551-49738598)
chr4 (287-410)||(10208985-10209104)
chr4 (396-521)||(11389555-11389681)
chr4 (82-136)||(13805266-13805320)
chr4 (82-136)||(28550456-28550510)
chr4 (83-141)||(45184135-45184193)
chr4 (324-449)||(17900388-17900513)
chr4 (82-127)||(28348293-28348338)
chr4 (84-129)||(31459228-31459273)
chr4 (84-129)||(37042667-37042712)
chr4 (82-164)||(51438642-51438726)
chr4 (87-135)||(7544537-7544585)
chr4 (82-134)||(28351788-28351840)
chr4 (82-138)||(29399029-29399085)
chr4 (82-126)||(31961267-31961311)
chr4 (85-137)||(36255526-36255578)
chr4 (82-126)||(44360323-44360367)
chr4 (161-240)||(50862764-50862844)
chr4 (82-138)||(50967029-50967085)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (82-570)||(1210531-1211026)
chr1 (82-556)||(696069-696551)
chr1 (82-570)||(30202131-30202626)
chr1 (82-567)||(22089883-22090377)
chr1 (82-570)||(49347394-49347889)
chr1 (82-560)||(51440766-51441251)
chr1 (82-569)||(9592521-9593015)
chr1 (82-570)||(8671706-8672199)
chr1 (82-494)||(34792350-34792768)
chr1 (82-562)||(15085728-15086203)
chr1 (82-570)||(51601844-51602337)
chr1 (82-570)||(43240380-43240877)
chr1 (82-570)||(8391556-8392053)
chr1 (82-570)||(32082757-32083241)
chr1 (82-441)||(4001456-4001821)
chr1 (82-497)||(38807672-38808093)
chr1 (141-460)||(32231016-32231339)
chr1 (83-541)||(37462878-37463334)
chr1 (82-367)||(4029112-4029403)
chr1 (82-281)||(39318209-39318409)
chr1 (321-568)||(9599640-9599888)
chr1 (82-339)||(25979232-25979495)
chr1 (82-276)||(37311756-37311952)
chr1 (287-560)||(39140310-39140590)
chr1 (82-240)||(52921201-52921361)
chr1 (287-446)||(9509229-9509388)
chr1 (321-541)||(18469328-18469547)
chr1 (155-568)||(34827179-34827596)
chr1 (82-208)||(32079178-32079304)
chr1 (374-568)||(19936310-19936505)
chr1 (81-269)||(52561589-52561779)
chr1 (82-217)||(32404528-32404664)
chr1 (287-411)||(27848017-27848140)
chr1 (82-217)||(8796353-8796490)
chr1 (82-217)||(16141981-16142118)
chr1 (321-411)||(52561857-52561947)
chr1 (82-168)||(44941777-44941865)
chr1 (82-194)||(46423217-46423328)
chr1 (82-178)||(28090695-28090793)
chr1 (82-174)||(41560416-41560510)
chr1 (82-217)||(3818857-3818994)
chr1 (82-130)||(12231591-12231639)
chr1 (82-174)||(4707222-4707315)
chr1 (82-214)||(10200307-10200441)
chr1 (82-217)||(29128927-29129065)
chr1 (82-137)||(43481799-43481854)
chr1 (84-216)||(52532619-52532753)
chr1 (82-181)||(24020268-24020369)
chr1 (298-407)||(19908262-19908371)
chr1 (511-568)||(27445686-27445743)
chr1 (82-164)||(40568411-40568495)
chr1 (464-557)||(41560235-41560328)
chr1 (288-405)||(43423671-43423788)
chr1 (396-568)||(46226603-46226776)
chr1 (82-207)||(4415503-4415630)
chr1 (82-138)||(21769712-21769768)
chr1 (82-138)||(25715327-25715383)
chr1 (82-155)||(28533673-28533748)
chr1 (82-134)||(29577481-29577533)
chr1 (472-568)||(52831846-52831942)
chr1 (287-382)||(1661405-1661500)
chr1 (82-141)||(3777261-3777320)
chr1 (82-137)||(4590533-4590588)
chr1 (82-137)||(34444582-34444637)
chr1 (288-455)||(39894686-39894851)
chr1 (82-174)||(45510834-45510928)
chr1 (82-174)||(48431400-48431494)
chr1 (82-193)||(19936628-19936741)
chr1 (82-128)||(38758021-38758067)
chr1 (82-135)||(22175373-22175426)
chr1 (298-480)||(26016313-26016496)
chr1 (82-168)||(44751677-44751765)
chr1 (82-138)||(2914124-2914180)
chr1 (82-134)||(4318846-4318898)
chr1 (84-164)||(15438800-15438878)
chr1 (86-138)||(19908040-19908092)
chr1 (82-138)||(26299293-26299349)
chr1 (82-134)||(41165511-41165563)
chr1 (82-134)||(42337785-42337837)
chr1 (82-126)||(51584981-51585025)
chr1 (81-137)||(52292265-52292321)
chr1 (82-138)||(52815100-52815155)
chr1 (89-217)||(7762445-7762575)
chr1 (82-174)||(12930312-12930406)
chr1 (82-137)||(36339805-36339860)
chr1 (82-136)||(2544820-2544874)
chr1 (82-136)||(7133303-7133357)
chr1 (426-571)||(11331415-11331561)
chr1 (426-571)||(11489436-11489582)
chr1 (143-217)||(27520271-27520345)
chr1 (82-136)||(31434315-31434369)
chr1 (84-207)||(39140669-39140794)
chr1 (87-129)||(49377535-49377577)
chr1 (86-212)||(52739515-52739644)
chr1 (148-226)||(52878368-52878446)
chr1 (196-269)||(9599511-9599584)
chr1 (374-435)||(12262000-12262060)
chr1 (288-357)||(48431619-48431688)
chr1 (84-129)||(50830637-50830682)
chr1 (82-122)||(3059554-3059594)
chr1 (86-122)||(3862890-3862926)
chr1 (82-134)||(4380189-4380240)
chr1 (148-212)||(7814656-7814720)
chr1 (185-221)||(8676971-8677007)
chr1 (82-134)||(10569072-10569124)
chr1 (82-138)||(32111990-32112046)
chr1 (321-393)||(36624112-36624184)
chr1 (82-134)||(38877344-38877396)
chr1 (298-410)||(51812472-51812584)
[»] chr7 (102 HSPs)
chr7 (82-566)||(43281466-43281955)
chr7 (82-566)||(34869210-34869701)
chr7 (82-570)||(12841276-12841771)
chr7 (88-570)||(35906208-35906697)
chr7 (82-570)||(11593746-11594241)
chr7 (82-568)||(33349807-33350300)
chr7 (197-570)||(31005009-31005387)
chr7 (82-567)||(39906373-39906868)
chr7 (83-570)||(46355858-46356347)
chr7 (82-570)||(49029067-49029556)
chr7 (82-570)||(36651780-36652273)
chr7 (82-489)||(37617811-37618226)
chr7 (82-571)||(38606790-38607273)
chr7 (82-460)||(45836483-45836865)
chr7 (82-446)||(44855175-44855543)
chr7 (205-568)||(33072742-33073108)
chr7 (82-455)||(43491210-43491589)
chr7 (141-544)||(13859070-13859476)
chr7 (249-570)||(7272825-7273151)
chr7 (82-570)||(23404204-23404697)
chr7 (321-568)||(32630383-32630630)
chr7 (82-371)||(2885723-2886018)
chr7 (82-392)||(29650349-29650665)
chr7 (161-454)||(35559075-35559373)
chr7 (82-352)||(31682603-31682879)
chr7 (84-392)||(6374833-6375147)
chr7 (361-566)||(36869575-36869781)
chr7 (82-352)||(22349625-22349901)
chr7 (82-269)||(7273192-7273381)
chr7 (82-240)||(40979929-40980089)
chr7 (82-347)||(15682184-15682455)
chr7 (82-358)||(36869238-36869527)
chr7 (298-570)||(7189449-7189728)
chr7 (482-568)||(37616704-37616790)
chr7 (82-204)||(27648937-27649061)
chr7 (83-284)||(31681022-31681222)
chr7 (82-240)||(38900078-38900237)
chr7 (82-239)||(9210705-9210864)
chr7 (82-227)||(48919246-48919393)
chr7 (143-410)||(36136711-36136982)
chr7 (84-269)||(28627936-28628123)
chr7 (286-393)||(46014392-46014498)
chr7 (84-231)||(45601606-45601755)
chr7 (82-276)||(24598189-24598384)
chr7 (82-204)||(32631721-32631845)
chr7 (82-175)||(28208329-28208424)
chr7 (299-506)||(47848524-47848732)
chr7 (143-226)||(21517444-21517527)
chr7 (290-460)||(42187368-42187537)
chr7 (82-208)||(21078070-21078198)
chr7 (298-446)||(36514430-36514576)
chr7 (288-539)||(25579290-25579536)
chr7 (335-441)||(39811873-39811979)
chr7 (82-209)||(44951307-44951436)
chr7 (82-180)||(34035155-34035255)
chr7 (513-570)||(48919174-48919231)
chr7 (82-214)||(14057625-14057759)
chr7 (82-214)||(14367653-14367787)
chr7 (82-137)||(25891114-25891169)
chr7 (82-174)||(33103113-33103207)
chr7 (82-174)||(36101778-36101872)
chr7 (321-411)||(8492479-8492569)
chr7 (288-437)||(43282325-43282477)
chr7 (83-136)||(6263486-6263539)
chr7 (82-138)||(28708606-28708662)
chr7 (82-134)||(31005434-31005486)
chr7 (82-134)||(31869103-31869155)
chr7 (82-138)||(42187666-42187722)
chr7 (82-137)||(1011272-1011327)
chr7 (287-441)||(19262645-19262797)
chr7 (82-161)||(48515475-48515556)
chr7 (82-131)||(14593984-14594033)
chr7 (82-131)||(16013507-16013556)
chr7 (82-138)||(5418299-5418355)
chr7 (422-497)||(15681216-15681292)
chr7 (82-138)||(17907725-17907781)
chr7 (82-126)||(21244284-21244328)
chr7 (82-167)||(24177628-24177714)
chr7 (289-369)||(27021906-27021986)
chr7 (82-138)||(29318796-29318852)
chr7 (82-126)||(34745984-34746028)
chr7 (143-207)||(35922407-35922471)
chr7 (298-366)||(40169640-40169708)
chr7 (82-134)||(40630663-40630715)
chr7 (82-138)||(47652772-47652828)
chr7 (82-137)||(20158672-20158727)
chr7 (82-174)||(30814126-30814220)
chr7 (86-141)||(33073151-33073206)
chr7 (84-135)||(40149016-40149067)
chr7 (82-136)||(20525053-20525107)
chr7 (82-164)||(33732031-33732113)
chr7 (84-138)||(47852312-47852366)
chr7 (360-409)||(25731638-25731687)
chr7 (361-446)||(27021992-27022077)
chr7 (82-127)||(28021171-28021216)
chr7 (81-138)||(34029676-34029733)
chr7 (81-126)||(39738445-39738490)
chr7 (284-352)||(12966027-12966095)
chr7 (82-126)||(12966253-12966297)
chr7 (82-138)||(29312214-29312270)
chr7 (93-174)||(42969885-42969968)
chr7 (82-138)||(47700057-47700112)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (82-570)||(12492385-12492883)
chr5 (82-570)||(3301635-3302125)
chr5 (82-569)||(28976860-28977352)
chr5 (82-564)||(16347381-16347868)
chr5 (82-570)||(1275051-1275545)
chr5 (83-570)||(2075475-2075970)
chr5 (82-571)||(10639082-10639583)
chr5 (89-568)||(1287587-1288083)
chr5 (82-568)||(24178312-24178791)
chr5 (88-392)||(38684932-38685242)
chr5 (82-431)||(4496308-4496665)
chr5 (82-409)||(14665658-14665993)
chr5 (82-570)||(34272808-34273294)
chr5 (82-352)||(20456778-20457054)
chr5 (82-557)||(27693-28163)
chr5 (354-570)||(20318777-20318985)
chr5 (82-411)||(26884690-26885025)
chr5 (82-269)||(13561387-13561576)
chr5 (85-325)||(38501422-38501668)
chr5 (82-276)||(2915497-2915692)
chr5 (83-275)||(14911258-14911452)
chr5 (82-226)||(29816517-29816663)
chr5 (82-217)||(16913883-16914021)
chr5 (482-570)||(3394496-3394587)
chr5 (141-440)||(36215417-36215708)
chr5 (82-209)||(28276390-28276519)
chr5 (321-405)||(15168744-15168828)
chr5 (82-174)||(20367080-20367174)
chr5 (82-181)||(5558321-5558422)
chr5 (82-164)||(11675727-11675811)
chr5 (283-479)||(31636128-31636319)
chr5 (287-394)||(14749270-14749377)
chr5 (324-446)||(10082988-10083109)
chr5 (86-181)||(30213755-30213852)
chr5 (84-199)||(39040918-39041035)
chr5 (82-134)||(408495-408547)
chr5 (82-138)||(27386565-27386621)
chr5 (82-138)||(38132561-38132617)
chr5 (82-138)||(42576235-42576291)
chr5 (83-134)||(10668569-10668620)
chr5 (82-137)||(43475465-43475520)
chr5 (143-269)||(17340500-17340626)
chr5 (82-136)||(18855834-18855888)
chr5 (82-136)||(36551373-36551427)
chr5 (289-440)||(11002637-11002786)
chr5 (82-215)||(25938115-25938250)
chr5 (82-126)||(28411913-28411957)
chr5 (82-138)||(32442127-32442182)
chr5 (82-125)||(3000977-3001020)
chr5 (82-141)||(7359262-7359321)
chr5 (84-164)||(7640510-7640592)
chr5 (82-141)||(9234108-9234167)
chr5 (289-372)||(15489706-15489789)
chr5 (82-174)||(43557834-43557928)
chr5 (84-134)||(2049290-2049339)
chr5 (86-132)||(7367177-7367223)
chr5 (86-136)||(28985310-28985360)
chr5 (287-357)||(33667216-33667286)
chr5 (143-217)||(42504311-42504385)
chr5 (83-120)||(10668648-10668685)
chr5 (83-136)||(27800055-27800108)
chr5 (83-124)||(33667674-33667715)
chr5 (82-138)||(5860059-5860115)
chr5 (305-409)||(7359489-7359593)
chr5 (82-122)||(10989086-10989126)
chr5 (321-369)||(14667751-14667799)
chr5 (363-435)||(28186956-28187028)
chr5 (375-455)||(36200684-36200764)
[»] chr3 (105 HSPs)
chr3 (82-570)||(52138586-52139081)
chr3 (82-570)||(5168614-5169113)
chr3 (82-567)||(28245226-28245718)
chr3 (82-569)||(51447718-51448204)
chr3 (89-526)||(54278850-54279294)
chr3 (82-438)||(21992-22353)
chr3 (82-570)||(25191165-25191658)
chr3 (82-453)||(47233597-47233974)
chr3 (82-570)||(53519372-53519861)
chr3 (108-350)||(48953446-48953697)
chr3 (82-317)||(48508275-48508516)
chr3 (185-496)||(33272129-33272450)
chr3 (361-570)||(38849880-38850090)
chr3 (82-455)||(54128280-54128660)
chr3 (82-372)||(35033131-35033427)
chr3 (287-539)||(43694977-43695230)
chr3 (396-570)||(47542033-47542207)
chr3 (324-481)||(45728020-45728180)
chr3 (298-568)||(27917360-27917629)
chr3 (82-352)||(38850125-38850402)
chr3 (287-453)||(49503766-49503937)
chr3 (158-557)||(3186568-3186971)
chr3 (298-553)||(26490119-26490374)
chr3 (85-357)||(50960641-50960915)
chr3 (82-217)||(38060858-38060995)
chr3 (82-240)||(12096706-12096866)
chr3 (212-369)||(38060419-38060580)
chr3 (82-221)||(52156085-52156226)
chr3 (298-567)||(29817293-29817563)
chr3 (82-207)||(53262295-53262422)
chr3 (141-276)||(30294183-30294318)
chr3 (143-410)||(39600745-39601016)
chr3 (82-216)||(49042081-49042218)
chr3 (248-411)||(19736942-19737110)
chr3 (248-411)||(19757845-19758013)
chr3 (82-276)||(45289092-45289288)
chr3 (152-269)||(54425038-54425155)
chr3 (321-480)||(344957-345117)
chr3 (374-497)||(48953695-48953818)
chr3 (145-276)||(52678916-52679045)
chr3 (185-276)||(19162693-19162784)
chr3 (87-393)||(38430807-38431129)
chr3 (82-181)||(2133613-2133714)
chr3 (82-192)||(311310-311422)
chr3 (85-137)||(3186972-3187024)
chr3 (82-138)||(45374478-45374534)
chr3 (362-446)||(50621647-50621731)
chr3 (82-137)||(31146925-31146980)
chr3 (82-209)||(15296059-15296188)
chr3 (84-138)||(41529986-41530040)
chr3 (82-181)||(47555333-47555434)
chr3 (82-168)||(7895881-7895969)
chr3 (298-351)||(26388487-26388540)
chr3 (286-410)||(36820172-36820294)
chr3 (90-341)||(39235154-39235409)
chr3 (474-567)||(40674513-40674606)
chr3 (82-134)||(31566162-31566214)
chr3 (83-127)||(44102958-44103002)
chr3 (82-138)||(49503569-49503625)
chr3 (82-137)||(344773-344828)
chr3 (86-432)||(19676086-19676447)
chr3 (82-137)||(24778610-24778665)
chr3 (82-129)||(39512777-39512824)
chr3 (82-174)||(40106621-40106715)
chr3 (82-226)||(42510017-42510163)
chr3 (85-136)||(52927852-52927903)
chr3 (421-570)||(30345313-30345459)
chr3 (83-141)||(35481150-35481208)
chr3 (82-221)||(43694772-43694913)
chr3 (83-141)||(49888409-49888467)
chr3 (84-178)||(32170588-32170684)
chr3 (82-168)||(39208801-39208889)
chr3 (363-460)||(45236753-45236850)
chr3 (361-446)||(46568027-46568112)
chr3 (82-164)||(54364977-54365060)
chr3 (283-455)||(23534778-23534949)
chr3 (82-138)||(37083293-37083349)
chr3 (82-122)||(41965819-41965859)
chr3 (82-134)||(45834601-45834653)
chr3 (82-138)||(46148253-46148309)
chr3 (82-138)||(52882663-52882719)
chr3 (82-138)||(53214872-53214928)
chr3 (82-141)||(388263-388322)
chr3 (82-141)||(30797823-30797882)
chr3 (82-125)||(48532196-48532239)
chr3 (289-411)||(48734349-48734469)
chr3 (84-135)||(49045063-49045114)
chr3 (517-568)||(54425349-54425400)
chr3 (83-129)||(659759-659805)
chr3 (322-436)||(2340961-2341075)
chr3 (82-165)||(4472388-4472473)
chr3 (82-136)||(45486850-45486904)
chr3 (84-130)||(45493695-45493741)
chr3 (82-139)||(7278688-7278745)
chr3 (82-127)||(24084323-24084368)
chr3 (149-218)||(24699571-24699640)
chr3 (82-192)||(48734148-48734260)
chr3 (82-126)||(14415261-14415305)
chr3 (82-134)||(21862742-21862794)
chr3 (82-199)||(29601054-29601173)
chr3 (82-122)||(31454226-31454266)
chr3 (82-134)||(40273206-40273258)
chr3 (298-406)||(45289314-45289425)
chr3 (187-259)||(45728252-45728324)
chr3 (152-212)||(54422916-54422976)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (82-568)||(82509-82999)
scaffold0024 (84-138)||(48119-48173)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (82-568)||(31256-31749)
scaffold0018 (287-357)||(44080-44150)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (83-566)||(8180570-8181060)
chr2 (82-567)||(3865861-3866353)
chr2 (82-543)||(36183264-36183732)
chr2 (82-570)||(11992109-11992602)
chr2 (82-570)||(41763044-41763537)
chr2 (82-560)||(12734502-12734981)
chr2 (90-533)||(38429707-38430157)
chr2 (82-570)||(41197228-41197724)
chr2 (82-570)||(45367626-45368120)
chr2 (82-570)||(3243654-3244147)
chr2 (82-570)||(4807378-4807876)
chr2 (82-570)||(451649-452118)
chr2 (82-443)||(38452687-38453057)
chr2 (83-570)||(23997403-23997882)
chr2 (361-570)||(2610314-2610524)
chr2 (82-386)||(25834650-25834959)
chr2 (287-560)||(16097198-16097480)
chr2 (82-369)||(2610576-2610869)
chr2 (324-568)||(30743411-30743655)
chr2 (82-411)||(18424379-18424711)
chr2 (141-568)||(6237815-6238247)
chr2 (82-257)||(31959625-31959802)
chr2 (82-269)||(28508770-28508959)
chr2 (82-315)||(7326161-7326400)
chr2 (82-350)||(24583632-24583907)
chr2 (374-568)||(24583905-24584100)
chr2 (82-442)||(38434866-38435233)
chr2 (82-226)||(35643083-35643229)
chr2 (82-219)||(9996624-9996766)
chr2 (512-568)||(38453058-38453114)
chr2 (287-359)||(43238305-43238377)
chr2 (82-213)||(9496014-9496147)
chr2 (82-203)||(30306190-30306313)
chr2 (82-231)||(43573131-43573281)
chr2 (82-181)||(3635324-3635425)
chr2 (287-372)||(43752159-43752244)
chr2 (82-163)||(12520063-12520146)
chr2 (82-190)||(227360-227470)
chr2 (83-276)||(39029666-39029867)
chr2 (288-455)||(7825260-7825429)
chr2 (82-217)||(45543074-45543210)
chr2 (82-138)||(9531601-9531657)
chr2 (82-231)||(33287551-33287702)
chr2 (85-217)||(33504367-33504502)
chr2 (141-217)||(41545549-41545625)
chr2 (82-174)||(39709202-39709296)
chr2 (298-440)||(42092436-42092576)
chr2 (82-213)||(12882046-12882179)
chr2 (83-173)||(35755247-35755339)
chr2 (82-134)||(12474928-12474980)
chr2 (82-134)||(17670697-17670749)
chr2 (82-134)||(38328371-38328423)
chr2 (321-372)||(227307-227358)
chr2 (421-496)||(1456095-1456169)
chr2 (82-137)||(9556370-9556425)
chr2 (82-137)||(11412936-11412991)
chr2 (83-231)||(13149462-13149612)
chr2 (82-133)||(44437722-44437773)
chr2 (143-209)||(30743681-30743747)
chr2 (361-557)||(13149112-13149309)
chr2 (82-135)||(16521008-16521061)
chr2 (84-174)||(19336896-19336988)
chr2 (361-442)||(40759014-40759095)
chr2 (82-138)||(3481379-3481435)
chr2 (82-126)||(12489803-12489847)
chr2 (85-133)||(19234988-19235036)
chr2 (82-130)||(19855695-19855743)
chr2 (82-122)||(25284957-25284997)
chr2 (82-141)||(17429272-17429331)
chr2 (143-226)||(17581594-17581677)
chr2 (82-141)||(36993757-36993815)
chr2 (82-128)||(15775846-15775892)
chr2 (82-136)||(18959138-18959192)
chr2 (444-537)||(32443434-32443527)
chr2 (85-135)||(45482989-45483039)
chr2 (288-393)||(13240958-13241063)
chr2 (82-168)||(18790107-18790195)
chr2 (82-126)||(624687-624731)
chr2 (82-122)||(2073308-2073348)
chr2 (288-444)||(9556582-9556737)
chr2 (82-122)||(10403894-10403934)
chr2 (82-138)||(10516750-10516806)
chr2 (321-381)||(11412697-11412757)
chr2 (82-138)||(14444894-14444950)
chr2 (82-134)||(15222474-15222526)
chr2 (314-460)||(19337089-19337234)
chr2 (82-134)||(19863463-19863515)
chr2 (82-134)||(19867795-19867847)
chr2 (82-134)||(19872696-19872748)
chr2 (82-138)||(24214011-24214067)
chr2 (82-138)||(25384694-25384750)
chr2 (82-126)||(28960212-28960256)
chr2 (82-126)||(42543472-42543516)
chr2 (82-138)||(42549838-42549894)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (84-528)||(30031084-30031535)
chr6 (121-569)||(5631605-5632064)
chr6 (82-536)||(28085196-28085657)
chr6 (82-570)||(607945-608442)
chr6 (82-569)||(20427637-20428131)
chr6 (82-568)||(5258149-5258644)
chr6 (210-568)||(10099990-10100351)
chr6 (82-570)||(9706562-9707051)
chr6 (288-570)||(14030592-14030876)
chr6 (82-385)||(12890556-12890856)
chr6 (82-443)||(32755833-32756202)
chr6 (82-490)||(35043442-35043857)
chr6 (185-565)||(2689447-2689810)
chr6 (82-441)||(9593711-9594078)
chr6 (115-415)||(21351871-21352175)
chr6 (341-557)||(2065018-2065239)
chr6 (82-231)||(34143766-34143917)
chr6 (82-231)||(34156382-34156533)
chr6 (335-568)||(6056032-6056264)
chr6 (324-446)||(5080766-5080888)
chr6 (82-346)||(30679417-30679677)
chr6 (486-570)||(30679260-30679344)
chr6 (82-208)||(10098897-10099023)
chr6 (148-497)||(28026896-28027248)
chr6 (82-231)||(34506-34657)
chr6 (141-352)||(33496966-33497179)
chr6 (141-276)||(5080925-5081060)
chr6 (363-517)||(33496023-33496178)
chr6 (82-268)||(5095927-5096115)
chr6 (82-194)||(3206460-3206574)
chr6 (82-190)||(34934831-34934941)
chr6 (185-308)||(7133795-7133922)
chr6 (185-308)||(7136718-7136845)
chr6 (82-217)||(8364700-8364837)
chr6 (287-449)||(33083966-33084128)
chr6 (82-136)||(33730192-33730246)
chr6 (82-181)||(31819011-31819112)
chr6 (86-138)||(2079506-2079558)
chr6 (82-125)||(5053764-5053807)
chr6 (82-141)||(5897679-5897738)
chr6 (82-137)||(18130815-18130870)
chr6 (82-129)||(29931070-29931117)
chr6 (82-226)||(31818666-31818812)
chr6 (83-141)||(30789076-30789134)
chr6 (82-138)||(579643-579699)
chr6 (86-141)||(12119647-12119703)
chr6 (535-567)||(33495986-33496018)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (82-566)||(86610-87101)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (82-393)||(949-1264)
scaffold0570 (399-570)||(2594-2766)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (298-568)||(11819-12092)
scaffold0113 (82-315)||(11550-11787)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (321-488)||(25691-25859)
scaffold0157 (82-231)||(25533-25684)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (82-284)||(4713-4917)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (82-488)||(4281-4686)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (82-240)||(16699-16859)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (82-221)||(14723-14864)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (82-208)||(484-612)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (518-570)||(29-81)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (83-279)||(7523-7720)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (82-168)||(28890-28978)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (82-141)||(1523-1582)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (87-141)||(3659-3713)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (83-136)||(26047-26100)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (82-126)||(99287-99331)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 571
Target Start/End: Original strand, 8879382 - 8879931
Alignment:
Q  17 ttaaaggtgctttttcatgtgtttttgaagaagatacaatgtaacggtttaaattgggtatacgccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8879382 ttaaaggtgctttttcatgtgtttttgaagaagatacaatgtaacggtttaaattggatatacgacaacaacaaccaagctttatcctaataagtggagt 8879481  T
Q  117 cggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8879482 cggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaaccatatttggattcaacttattgacttctaaatcatttttaatggtttctcttatagttt 8879581  T
Q  217 tcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggcacgggtcttctccttacatgcccaaatcatcta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  8879582 tcctacgtctccctcaagctctttggacccgaccctcctccatctgatcaactcttcttacgacggcacgggtcttctctctacatacccaaatcatcta 8879681  T
Q  317 aacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatca 416  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8879682 agtctattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctagtccagtcttaccacttatca 8879781  T
Q  417 agtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgt 515  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8879782 agtgcaacattctcatctccgctacacttacttgattcttgtgctggctcttcaccgcccaacaca------catacaacatagtaggtctgactgctgt 8879875  T
Q  516 ccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccta 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8879876 ccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccta 8879931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 36565242 - 36565737
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  36565242 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaataacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 36565341  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||  |    
T  36565342 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctacccttcttacca 36565441  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  36565442 cggcatctacgggtattctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 36565541  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgt-gtggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  || ||||| ||||||    
T  36565542 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcatcatcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcc 36565641  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565642 caacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 36565737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 82 - 568
Target Start/End: Original strand, 42854005 - 42854498
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  42854005 caacaaccaccaaaccttatcccactaaatggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttatatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 42854104  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  42854105 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacaa 42854204  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || ||    
T  42854205 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttctctgctataggtgttacccccactctctctctgatggt 42854304  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||| ||||||    
T  42854305 gtcattcctaatcctattctgtctagtcttaccacttatccagcgcaacatcgtcatctccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcc 42854404  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854405 caacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgctgtccgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 42854498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 148 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 18125385 - 18124962
Alignment:
Q  148 tatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||    
T  18125385 tatcataaatcatatttggatccaactcattgacttttaaatcttttctaatggtttctctaatagtttttctaggtctccctctacctcttt-aacccg 18125287  T
Q  248 actctcctccatctgatctacttttcttatgacggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctact 343  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18125286 actctcctccatttgatctactattcttacgacggcatctacgggtcttctctctacatgttcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctact 18125187  T
Q  344 ataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacac 443  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||  |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  18125186 ataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcatttctaatcctatcatgtctcgtcttgtcactcatccagcgcaacatgctcatctccgctacac 18125089  T
Q  444 ttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaag 542  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18125088 ttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgttggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcaac-taag 18124990  T
Q  543 tggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||    
T  18124989 tggtactttcttatcacataaaacacct 18124962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 148 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 39947070 - 39946642
Alignment:
Q  148 tatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccg 247  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||| | |||||   ||  |    
T  39947070 tatcataaaccaaatttggattcaactcattgacctctaaatcttttctaatggtttctctaatagtttttctaggtcgtcctctacctcttctaacttg 39946971  T
Q  248 actctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctact 343  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    | ||||||||   |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39946970 agtctcctccatttgatctactcttcttacgacggcatctacaggtcttctttctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctact 39946871  T
Q  344 ataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacac 443  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  39946870 ataggtgctacccccactctttctataatggtgtcattcataatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacac 39946771  T
Q  444 ttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaag 542  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39946770 ttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgctgtccgatagaactttcctttcaatttaag 39946671  T
Q  543 tggtactttcttatcgcacaaaacaccta 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39946670 tggtactttcttatcgcacaaaacaccta 39946642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 36545430 - 36544938
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  36545430 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 36545331  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |  |||||  ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  36545330 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacgtcttttaacttgactatcctccatttgatctactcttcttacca 36545231  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct--aatt 373  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||     
T  36545230 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctctaatg 36545131  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccg 472  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||     
T  36545130 gtgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacca 36545031  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |     |||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545030 cccaacactcggtaccatacaacaacg-----ctggttgctatccgatagaactttcttttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 36544938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 564
Target Start/End: Original strand, 36394948 - 36395443
Alignment:
Q  81 ccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca---gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttat 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| | |  ||   ||||| ||||||| | || ||||||||  |||| ||    
T  36394948 ccaacaacaacgaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaaatgccacaatagtgttctatcatacaccaaatttggatctaactcat 36395047  T
Q  178 tgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttat 277  Q
    |||| | |||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||  | ||||||  ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||     
T  36395048 tgacctctaaatcctttctaacggtttctcaaatagttttcctaggtcttcctatacctcttttaacttgactttcctccatttgatctactcttcttac 36395147  T
Q  278 gacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaa-cttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
     ||||||    | |||||||||  |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36395148 cacggcatctacaggtcttctctctacatgcccaaaccatctaaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaat 36395247  T
Q  373 tgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgct---acacttacttgattcttgtg-tggctcttt 468  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||  || || |||||     
T  36395248 ggtgtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacaacacttacttgattctcatgttgactctta 36395347  T
Q  469 accgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaa 564  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36395348 accgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaa 36395443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 37078030 - 37077551
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |  |   ||||||||| ||||| ||||||    
T  37078030 caacaacaaccaagttttatcccattaagtggggtcggctgcatggatcaaattacgtcagtgttctatcttccaaagtatttggatccaactcattgac 37077931  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  37077930 ctctaaatcctttctaatggtttctcttataattttcctaggtcttcatctacctattttgacccgactctcctccatttgatctactcttcttacgacg 37077831  T
Q  282 gcac----gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgt 377  Q
    |||     ||||| ||||  |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||            || || |||||  | ||| ||||    
T  37077830 gcatctatgggtcctctc--tacatgcccaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctac------------cctcactctcttccgaatggtgt 37077745  T
Q  378 cattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgccca 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  37077744 cattcctaatcctatctcgtctagttttaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgccacacttacttgattctcgtgttggctcttaactgccca 37077645  T
Q  477 acacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||| |||||||||||| ||| |  |||||||||| |||| || | |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37077644 acactccgtaccatacagcatcgacggtctgactgttgtctgacataacttccctttcaacttaagtggtacttacttatcacacaaaacacct 37077551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 2796838 - 2796342
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagcc----ttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaactt 175  Q
    ||||||||||||||||    |||||| | ||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||   |||| ||||| ||| || |||||  |||||||     
T  2796838 caacaacaaccaagccatccttatcccactaagtggggtcgtctacatgaatcaaattacgccatactgttctatcaaaaaccaaatttgagttcaacta 2796739  T
Q  176 attgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctt 275  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  2796738 attgacctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctctacctcttttaacatgactctcctccatttgatttactcttctt 2796639  T
Q  276 atgacggcacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |  | ||||       ||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  2796638 acaatggcatctacagtctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggcgctacccccactctctctctaatggt 2796539  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtc--tagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccg 472  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||     
T  2796538 gtcattcctaatcctatcatgtctatagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctttgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaacca 2796439  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    ||||| || | |||||||| ||||  || ||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2796438 cccaagactcggtaccatataacaacgtcggtctaactgttgtccaatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacagaacacc 2796342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 391
Target Start/End: Original strand, 11523724 - 11524040
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  11523724 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 11523823  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  11523824 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 11523923  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaa-cttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  11523924 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaaagcctattaactaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatgg 11524023  T
Q  375 tgtcattcctaatccta 391  Q
    |||||||||||||||||    
T  11524024 tgtcattcctaatccta 11524040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 40813605 - 40813224
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| |||  |||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| | ||||  ||||| ||||| | | || |||||||| ||||| | ||    
T  40813605 caacaacaacgaagttttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaatgatgtcatagtgttctatcacacaccaaatttggatccaactcactg 40813506  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  40813505 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 40813406  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca--ttctctctctaatt 373  Q
    |||||    | | |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||     
T  40813405 cggcatctacagatcttctctctacatgcccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatg 40813306  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  40813305 gtgtcattcttaatcctattatgtctagtcttaccactcatccaacacaacatcctaatctctgctacacttactttattct 40813224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 343 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25288916 - 25288688
Alignment:
Q  343 tataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctaca 442  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  25288916 tataggtgctacccccacactctctctaatggtgtccttcctaatcctatctcatctagtcttaccactaatccagctcaacatcctcatatctgctaca 25288817  T
Q  443 cttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaa 541  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  25288816 cttatttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaa 25288717  T
Q  542 gtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25288716 ttggtactttcttatcgcacaaaacacct 25288688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 343 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25300251 - 25300023
Alignment:
Q  343 tataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctaca 442  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  25300251 tataggtgctacccccacactctctctaatggtgtccttcctaatcctatctcatctagtcttaccactaatccagctcaacatcctcatatctgctaca 25300152  T
Q  443 cttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaa 541  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  25300151 cttatttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaa 25300052  T
Q  542 gtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25300051 ttggtactttcttatcgcacaaaacacct 25300023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 298 - 545
Target Start/End: Original strand, 18752099 - 18752344
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||    
T  18752099 tacatgtccaaaccatctaagct-attttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcatccctaatcctattatgt 18752195  T
Q  398 ctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaaca 496  Q
    ||||||||| |||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  18752196 ctagtcttaacactcattcagcgcaacattctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgtccagcactccgtaccatacaaca 18752295  T
Q  497 tagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtgg 545  Q
    | |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  18752296 ttgccggtctgactgttgtccgatagaactttcctttgagcttaagtgg 18752344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 361 - 568
Target Start/End: Original strand, 15215557 - 15215765
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  15215557 tctctctctaatggtgtcatttctaatcctatcctgtatagtcttaccactcatccagcacaacatcctcatctccgcttcacttactttactctcgtgt 15215656  T
Q  461 -ggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgc 559  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  15215657 tggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattttcggtctgactactgttcgatagaactttcctttcagcttaagtgatactttcttaccgc 15215756  T
Q  560 acaaaacac 568  Q
    |||| ||||    
T  15215757 acaagacac 15215765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 568
Target Start/End: Original strand, 12492116 - 12492336
Alignment:
Q  347 ggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  12492116 ggtgctacccccattctctct--aatggtgtcattcataatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatatctgctacactta 12492213  T
Q  447 cttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtgg 545  Q
    | |||||||  ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12492214 catgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatgcaacaacgccggtcggacggctgtccgatagaactttcctttcatcttaagtgg 12492313  T
Q  546 tactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12492314 tactttcttatcgcacaaaacac 12492336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 352
Target Start/End: Original strand, 12491141 - 12491415
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||    
T  12491141 acaacaactaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattgac 12491240  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| | || | ||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||    
T  12491241 ctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcataggtcttcatctacctcttttaacttgactctccttcatttgatctactcttcttaccacg 12491340  T
Q  282 gca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgct 352  Q
    |||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491341 gcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgct 12491415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21121426 - 21121105
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  21121426 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggctacatg-atcaaattacgccatagtgttctatcataaaccatattaggatccaactcattg 21121328  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| | ||||||  |||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  21121327 acttctaaatcctttctaatggtttctctaatagatttcttaggtctccctctacctcttttaacctaactctcgtccatttgatctactcttcttacga 21121228  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||            |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  21121227 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaaaccta------------ttttgtactataggtgctacccccactctctctctaatggt 21121140  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    | |||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  21121139 gccatttctaatcctatcccgtctagtcttaccac 21121105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 45419516 - 45419157
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||   |||| ||||||||| || ||||||||  |||| |||     
T  45419516 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacaccataatgttctatcataaaccaaatttggatcaaactcatta 45419417  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
       | |||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  45419416 tgatttaaacctttcctaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctctacctcttcagatctgactctcctccatctgatctactcttcatacta 45419317  T
Q  280 --cggcacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgt 377  Q
      |   || |||||| ||  |||||||||||| || ||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||    
T  45419316 gcctctacaggtcttatctctacatgcccaaaccacctaagtctattttataccatcttttctactataggtgctaccccaattctctct--aatggtgt 45419219  T
Q  378 cattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgct 439  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||    
T  45419218 cattcctaatcttatcccttctagtcttaccactaatccaacgcaacatcttcatctccgct 45419157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 276
Target Start/End: Original strand, 42469728 - 42469924
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  42469728 caacaacaaccaagccttatcccaataagtggggtcagctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 42469827  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42469828 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttctta 42469924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 497
Target Start/End: Original strand, 13171865 - 13172072
Alignment:
Q  291 ttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcct 390  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  13171865 ttctctttatatgcccaaaccacctaagcatattttccaccatcttttctactataggtgcttccccaactctctctctaatcttgtcatttctaatcct 13171964  T
Q  391 atctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtacca 489  Q
    |||  |||||||||||| ||  ||| | |||||||| |||||||| | |   |||| || ||| || || ||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  13171965 atcccgtctagtcttactacacatccaatgcaacattctcatctctgatgtgcttaatttatttttatgttggttcttaaccgcccaacactctgtacca 13172064  T
Q  490 tacaacat 497  Q
    ||||||||    
T  13172065 tacaacat 13172072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8932982 - 8932676
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||||||||| ||||   | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||  ||||||| ||| ||||| ||| ||    
T  8932982 acaacaaccaagctttatttcactaagtggggtcagctacatggatcaaatgacgccatagtgttttatcaaaagccatattttgatccaactcattaac 8932883  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||| ||||| |||| |||| ||||||  | |    
T  8932882 ctttaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcttccatttgatttactcttcttacaatg 8932783  T
Q  282 gca-----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtg 376  Q
    |||     ||| ||||||   |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||||| |||    
T  8932782 gcatttaacggatcttctttctacatgtccaaaccatctaaatctattttctaccaacttttctactgtatgtgctaccccca--ctctctctaatggtg 8932685  T
Q  377 tcattccta 385  Q
    |||||||||    
T  8932684 tcattccta 8932676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 289 - 453
Target Start/End: Original strand, 6510642 - 6510803
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatc 388  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | | |  |||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  6510642 tcttctctctacatgcccaaaccatctaaatttgttttctaccaacttttctattataggtgctacgctc--tctctcttcaatggtgtcatttctaatc 6510739  T
Q  389 ctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgatt 453  Q
     |||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  6510740 atatctcatctagtcttaccacttatccaacacaacatcatcatc-ccgctacacttactcgatt 6510803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 502 - 570
Target Start/End: Original strand, 4032922 - 4032990
Alignment:
Q  502 ggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4032922 ggtctgactgttgtccgataaaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 4032990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13986530 - 13986391
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtg 420  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| | || |||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||    
T  13986530 tattttctaccatattttgtactataggtgctaccccaaatccctctttaatgatgtcattcctaattatatctcgtctagtattaccactcatccagtg 13986431  T
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  13986430 taacatcctcatctccgctatgcttacctgattctcgtgt 13986391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Original strand, 14742083 - 14742207
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| ||   |||||||||| ||||| ||||    
T  14742083 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaa---atatttggatccaactcattg 14742179  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctc 207  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14742180 acttctaaatcttttctaatggtttctc 14742207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2027811 - 2027632
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggag-tcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| |||| ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||  |||| |||    
T  2027811 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgggggttggctaca-ggatcaaatggcgtcatagtgttctatcataaaccatatttgaatataactcatt 2027713  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccat 259  Q
    ||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||| |||||||||||||    
T  2027712 gacctctaaatcatttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccat 2027632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 446
Target Start/End: Original strand, 2518631 - 2518761
Alignment:
Q  314 ctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccactta 413  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  2518631 ctaaacctattttccaccatcttttctacttgaggtgctaccccaattttctctctaatt-tgtcatttctaatcctatctcatctagtcttaccacaca 2518729  T
Q  414 tcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
    || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2518730 tccaatgcaacattctcatc-ccgctacactta 2518761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 276
Target Start/End: Original strand, 26904941 - 26905103
Alignment:
Q  115 gtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttata 212  Q
    |||| ||| |||||| |||||||| ||  ||||| ||| |||||  |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26904941 gtcgactatatggatcaaattacgacatagtgttttattataaactatatttgg-tccaacttattgacctctaaatcttttctaatggtttctctaata 26905039  T
Q  213 gttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||  | | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  26905040 gttttcctaggtctccctctacctctttttatctgactctcttccatttgatctactcttctta 26905103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 35643609 - 35643758
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |     
T  35643609 caacaacaaccaagcattatcccactaagtggggtaggctacatggatcaaaatatggcagtgttctatcataaaccatatttcgatccaactcattaat 35643708  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
     | || |||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  35643709 ctctagatctttcttaataatttctcttatagtttttctaggtcttcctc 35643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 502 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 25439390 - 25439323
Alignment:
Q  502 ggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25439390 ggtctgactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacc 25439323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25289045 - 25288912
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||| ||| |||| || ||| |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25289045 caacaacaaccaagccttataccactaggtggggtcagctaaatagatcaaattatgtcatagagttatatcataaaccatatttggatccaactcattg 25288946  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatag 213  Q
    || | |||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25288945 acctctaaatcctttctaaaggtttctcttatag 25288912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25300380 - 25300247
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||| |||||||||| | | | || |||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25300380 caacaaccaccaagccttgttccactaggtggggtcagctacatagatcaaattatgtcatagtgttatatcataaaccatatttggatccaactcattg 25300281  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatag 213  Q
    || | |||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25300280 acctctaaatcctttctaaaggtttctcttatag 25300247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 200
Target Start/End: Original strand, 15215413 - 15215533
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||||  |||||| ||| | ||| |||||||||||  |||| ||||    
T  15215413 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtcggctacatggatcatatgacgtcatagtgttctattaaaaaccatatttggatcaaactcattg 15215512  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatg 200  Q
    |  | |||||||||| |||||    
T  15215513 atctctaaatcttttctaatg 15215533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Original strand, 25473404 - 25473532
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg--tcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||    |||||| ||||||| | || ||||||||  |||| ||||    
T  25473404 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgctatagtgttctatcatacaccaaatttggatcaaactcattg 25473503  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctct 208  Q
    || | |||||| ||| |||||||||||||    
T  25473504 acctctaaatcctttctaatggtttctct 25473532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44529506 - 44529395
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| | | |  |||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  44529506 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgatgccatagtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 44529407  T
Q  180 acttgtaaatct 191  Q
    || | |||||||    
T  44529406 acctctaaatct 44529395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 490616 - 490522
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  490616 caacaacaaacaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatatttggatccaact 490522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 44047533 - 44047634
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  44047533 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaatgacgccatggtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 44047632  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  44047633 ac 44047634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 410
Target Start/End: Original strand, 44681277 - 44681374
Alignment:
Q  313 tctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || | | | ||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44681277 tctaagcttattttccaccatcttttctattataggtgctaccacaactgtctctctaatgttgtcatttctaatcttatctcgtctagtcttaccac 44681374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 1928588 - 1928644
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1928588 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 1928644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35324054 - 35323995
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35324054 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacgtggatcaaattacgtca 35323995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29520930 - 29520793
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||| ||| || |||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  29520930 caacaacaaccaagcattatcccactaaatggggtgggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatatttggatccaactcatta 29520831  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |  | |||||| ||  |||  |||||||||||||||||    
T  29520830 atctctaaatcgttcctaacagtttctcttatagtttt 29520793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32043623 - 32043537
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  32043623 tttctaccatcttttgtactataggtgataccccaactctctctctaatgttgtcatttctaattctatcccgtctagtcttaccac 32043537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 388
Target Start/End: Original strand, 12796925 - 12797011
Alignment:
Q  300 catgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatc 388  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||  |||| |||||| |||| ||||||||||    
T  12796925 catgcctaaatcatctaagcctattttctaccaacttttcttctataggtgttacctcca--ctctttctaatggtgttattcctaatc 12797011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12026058 - 12025934
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc-----agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||| |     |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12026058 caacaaccaaaccttattccactaagtagggtcggttacatggatcaaatgacgacgtcatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaacttattg 12025959  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggttt 204  Q
    || | |||||||||| |||||||||    
T  12025958 acctctaaatcttttctaatggttt 12025934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 393
Target Start/End: Original strand, 30113423 - 30113515
Alignment:
Q  301 atgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatc 393  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  30113423 atgcccaaaccaattaaacctattttctaccatcttttctactatatgtgttaccccgactctctctctaataatgtcattcataatcttatc 30113515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 357
Target Start/End: Original strand, 45512709 - 45512777
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccc 357  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  45512709 tcttctctttatatgcccaaaccatctaagcttattttccatcatcttttctactataggtgctacccc 45512777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16351411 - 16351312
Alignment:
Q  336 tttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctc 435  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||   ||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||    
T  16351411 tttctactataggtgctaccctaattctctctctaatgttgtcatttctaactctattccgtctagtcttaccacatatccaacgcaacatcttcatctc 16351312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30559979 - 30559837
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggct-----acatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||     |||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  30559979 caacaacaaccaagccttatcccactaactggggtcggctacattacatggatcaaattacgtcataatgttctatcataaaccatatatggatccaact 30559880  T
Q  175 tattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
     ||| |  | |||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  30559879 cattaatctctaaatctttcctgatagtttctcttatagtttt 30559837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1065001 - 1064955
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  1065001 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgga 1064955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29520681 - 29520583
Alignment:
Q  336 tttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatct 434  Q
    |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  29520681 tttctactatagatgccaccccaactctctctctaatggtatcatttctaatcctatcccatctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatct 29520583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30690009 - 30689940
Alignment:
Q  89 aaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaa 156  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  30690009 aaccaagcattatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgtcataatgttatatcataaa 30689940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 269
Target Start/End: Original strand, 35914602 - 35914791
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| |||     
T  35914602 caacaacaaccaagtcttatctcactaagtggggtcagctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatattttggtccaactcatta 35914701  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctact 269  Q
    |  |  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||   ||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  35914702 atcttcaagtctttcctaatagtttctcttatagtttttctatgtcttcctctgtctctagggatctgactatcctccatctgacctact 35914791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 41031421 - 41031475
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  41031421 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctatatggatcaaatta 41031475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 41031527 - 41031581
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  41031527 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctatatggatcaaatta 41031581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3473851 - 3473798
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt 135  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3473851 caacaacaacaaagccttatcccactaagtggggtcggctaaatggattaaatt 3473798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5908675 - 5908594
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtctt 405  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  5908675 tttcaaccatcttttctactataggttctaccccaactctctctctaatgttgtcatttctaatcttatcccgtctagtctt 5908594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23492315 - 23492231
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |  |||||| ||||||| |||||||||    
T  23492315 caacaacaaacaagccttatctcactaagtggggtcggctacatggattaaatgacaccatagtgttctatcatatatcatattt 23492231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26363767 - 26363674
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac-gtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | ||||| |||| |||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  26363767 caacaacaaccaagtcttatcccactgagtggggtcgactacatggatcaaattacactaagtgttctatcataaaccatatttagatccaact 26363674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 138
Target Start/End: Original strand, 45041320 - 45041373
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  45041320 caacaaccaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaattacg 45041373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13589686 - 13589614
Alignment:
Q  154 aaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13589686 aaatcatattttgattcaactcattaatctttaaatcttttctaatagtttctcttatagtttttctaagtct 13589614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 9695690 - 9695583
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||||||||| || |||| |  | |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||  ||    
T  9695690 tacatgcccaaaccacctaagccgagtttccaccatcttttctactataggtgctaccccaaatatctctataatgttgtcatttctaattctatcctgt 9695591  T
Q  398 ctagtctt 405  Q
    ||||||||    
T  9695590 ctagtctt 9695583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25985552 - 25985468
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  |||| || ||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  25985552 tttctaccatcttttctactataggtgctaccccaa--ctctctctaatgttgtcgtttctaattctatcctgtcttgtcttaccac 25985468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 39651029 - 39651084
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  39651029 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcgggtatatggatcaaattac 39651084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 409
Target Start/End: Original strand, 10080119 - 10080239
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| |  | || |||| |||| |||||||||| ||| |||| || | | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  10080119 ggtcttctctctacatgcccaaaccatc-aggcctagtttccaccatcttttctact-tagatgctacctcaactctctctctaatgttgtcatttctaa 10080216  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttacca 409  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  10080217 tcttatctcgtctagtcttacca 10080239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18741908 - 18741854
Alignment:
Q  87 acaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18741908 acaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacttggatcaaattacgtca 18741854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18746872 - 18746818
Alignment:
Q  87 acaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18746872 acaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacttggatcaaattacgtca 18746818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25439460 - 25439394
Alignment:
Q  364 ctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctc 430  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25439460 ctctctaatggtatcgttcctattcctatctcatctagtcttaccactaatccagcgcaacatcctc 25439394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 27556303 - 27556357
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27556303 caacaacaaccaagctttaacccactaagtggggtcggctacatggatcaaatta 27556357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 408
Target Start/End: Original strand, 33666748 - 33666829
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttacc 408  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||   ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  33666748 tttctaccatcttttctacgataggtgctaccccaactctctctcttat---gtcattcttaatcctatctcatctagccttacc 33666829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36143622 - 36143538
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||| | || |||||  | |||| ||||||||| |||||||    
T  36143622 caacaacaaccaagccttttccgactaggtggggtcggctacatggatcagatgacgtcataatgttctatcataaaccatattt 36143538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42584639 - 42584552
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||| | || |||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42584639 caacaacaatcaagtcttatcccactaagtggggtcggctacaag-atcaaattacgtcataatgttctatcataaaccatatttggat 42584552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 4558209 - 4558253
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  4558209 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatg 4558253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 10668498 - 10668550
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  10668498 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatcgatcaaat 10668550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 18473973 - 18474017
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  18473973 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggtgtcggctacatg 18474017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26055699 - 26055655
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  26055699 caacaaccaagccttatcccactaagtgggatcggctacatggat 26055655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31309634 - 31309590
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  31309634 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggtgtcggctacatg 31309590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32276966 - 32276910
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  32276966 caacaacaaccaagctttatcccactaagtgggttcgtctacatggatcaaattacg 32276910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 35362651 - 35362707
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  35362651 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggttggctgcatggatcaaattacg 35362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 39953265 - 39953309
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  39953265 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatg 39953309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 39967500 - 39967556
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  39967500 caacaacaaccaagcattatcacaataagtgggatcggctacatggatcaaactacg 39967556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 111)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 82 - 567
Target Start/End: Original strand, 31959815 - 31960307
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  31959815 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 31959914  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  31959915 acctctaaatcctttctaatagtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 31960014  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  31960015 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 31960114  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  31960115 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 31960214  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960215 caacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 31960307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 436510 - 436015
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||  ||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  436510 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgatgccatagtgttctatcatacaccaaatttggattcaactcattg 436411  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  436410 acctctaaatcctttctagtggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 436311  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    | |||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  436310 cggcatctacaggtcttctctctacatgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 436211  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  436210 gtcattcttaatcctatcatgtctagtcttacgactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 436111  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436110 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 436015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 48174094 - 48174589
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||   |||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  48174094 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtctgctacatggatcaaatgacgccataatgttttatcatacaccaaatttggatccaactcattg 48174193  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  48174194 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 48174293  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||    
T  48174294 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctaatggt 48174393  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |  || || ||||| |||| |    
T  48174394 gtcattcctaatcatatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctatacttacttgattttcatgttgactcttaaccgtc 48174493  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48174494 caacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacct 48174589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 86 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 33227486 - 33226995
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgactt 183  Q
    |||||||||||||||| | | || ||||  |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |    
T  33227486 aacaaccaagccttattccactaggtgggatcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattgacct 33227387  T
Q  184 gtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc 283  Q
     |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| | || | ||||||  ||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  33227386 ctaaatcctttctaatggtttttctaatagttttcctaggtcttcatctacctcttttaacttgactctcttccatttgatctactcttcttaacacggc 33227287  T
Q  284 a----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtca 379  Q
    |    |||||||||||  ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  33227286 atctacgggtcttctctctacatgcccaaacaatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtca 33227187  T
Q  380 ttcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaac 478  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||||||||    
T  33227186 ttcttaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttacatgattctcatgttgactcttaaccgcccaac 33227087  T
Q  479 acaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    || |||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33227086 actccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgtacaaaacacct 33226995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 43434205 - 43433704
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||| |||| ||| |  |||||| |||| || |||| |||||||| | ||| ||||    
T  43434205 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgggctcgactacatggatcaaatgacgccgtagtgttctatcctacatcaaatttggatccgactcattg 43434106  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |    
T  43434105 acctctaaatcattttcaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatttactcttcttacca 43434006  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct------ 369  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||          
T  43434005 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctct 43433906  T
Q  370 aattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctcttt 468  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||     
T  43433905 aatggtgtcattcctaatcctatcttgtctagtcttgccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactctta 43433806  T
Q  469 accgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43433805 accgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgattgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtgacactttcttatcgcacaaaacac 43433706  T
Q  569 ct 570  Q
    ||    
T  43433705 ct 43433704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 56375571 - 56375076
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||     
T  56375571 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtgaggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattc 56375472  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||  |    
T  56375471 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccattttatctactcttcttacca 56375372  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  56375371 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctgttttctaccaacttttctattataggtgctacccctactctctctctaatggt 56375272  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  || || ||||| ||||||    
T  56375271 gtcattcctaatcttatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttgtttgattctcatgttgactcttaaccgcc 56375172  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| ||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56375171 caacactccgtaccatacaataacgctggtctgactgctgtccgatagatctttcctttcaaattaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 56375076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 82 - 551
Target Start/End: Original strand, 52569516 - 52569992
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  52569516 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 52569615  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  52569616 acctctaaatcctttctaatggtttctttaatagttttcgtaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 52569715  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  52569716 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 52569815  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||      
T  52569816 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttacccctcatccaacacaacatcctgatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgaa 52569915  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtacttt 551  Q
    |||||| |||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52569916 caacactccgtaccatacaacaacaccggtctgactgttgtccaatagaactttcctttcaacttaagtggtacttt 52569992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 46582827 - 46583320
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||  | ||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  46582827 caacaacaaccaagccttatcctactaagtgg-gtaggctacatggatcaaatgacgccatagggttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 46582925  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| |||  |||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  46582926 acctttaaatcctttccaatggtttctctaatagttttcataggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 46583025  T
Q  280 cggcac-----gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    || ||      ||||||||||  |||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |    
T  46583026 cgacatctacggggtcttctc--tacatgcccaacccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctatccccactctctctcgaatgg 46583123  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgc 473  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||||    
T  46583124 tgtcattcctaatcctatgctgtctagtcttaccacttctctaatgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgc 46583223  T
Q  474 ccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46583224 ccaacactccgtaccatacaacagcgccgatctgactgctgtccaatagaactttcctttcaaattaagtgatactttcttatcgcacaaaatacct 46583320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 48622544 - 48623023
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| | || ||||||||  |||| ||||    
T  48622544 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggattaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatcaaactcattg 48622643  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||  |    
T  48622644 acctctaaatcttttctaatgatttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatcttcttttcttacca 48622743  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  48622744 cggcatttacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatgggtgctaccccca--ctctctctaatggt 48622841  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||| | |||       
T  48622842 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaaagcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcctaacc--- 48622938  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
               ||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622939 -----------accatacaataacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 48623023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 1777018 - 1777511
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||   |||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  1777018 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatactgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 1777117  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  1777118 acctctaaatcttttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 1777217  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    | | ||||||||  || ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    |||  ||||||||||| ||    
T  1777218 cggcatctatgagtcttctctctagatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttttactataggtgctatttcca--ctctctctaatggt 1777315  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |  || || ||||| |||       
T  1777316 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctatacttacttgattttcatgttgactcttaaccttt 1777415  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1777416 caacactccgtatcatacaacaacgtcggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 1777511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 23906298 - 23906797
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  23906298 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 23906397  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |  | || |||  ||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||  |    
T  23906398 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagtttttctaggtcttcatttaccttttttaacttgactctcctccatttaatctactcttcttacca 23906497  T
Q  280 cggcacgg--gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct------aa 371  Q
    |||||     ||||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||      ||    
T  23906498 cggcatctacgtcttctctctacatgctcaaaccatctaagcctattttctacaaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctctaa 23906597  T
Q  372 ttgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttac 470  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||    
T  23906598 tggtgtcattcctaatcctatcttgtctagtcttgccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaac 23906697  T
Q  471 cgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906698 cgcccaacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 23906797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 568
Target Start/End: Original strand, 27450181 - 27450667
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27450181 caacagcaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatca-aaatcatatttggatccaactcattg 27450279  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | ||||||||||  |||||||||||  ||  ||||| || |||| |||  | ||||||  ||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||  |    
T  27450280 acctctaaatcttttccaatggtttctcgaatgattttcttaggtcttcctttacctcttttaacctgattctactccatttgatctactcttcttacaa 27450379  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  27450380 cggcatctacgggtcttctctctacatgtcaaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggt 27450477  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||    || |||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| || |||    
T  27450478 gtcatt----attctatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaactgcc 27450573  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450574 caacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 27450667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 53708075 - 53707583
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||  |||| ||| |||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  53708075 caacaacaatcaagccttatcccactaagtgatgtcgactaaatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 53707976  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| | ||||||  ||  |||| |||||||| |||| |||| ||||||  |    
T  53707975 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctcggtcttcctctacctcttttaacttgactatcctccatttgatatactcttcttacca 53707876  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||| ||    
T  53707875 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctttctaatggt 53707776  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  53707775 gtcattcctagtcctatcatgtctagtcttactactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 53707676  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    |||||| |  ||||||||| ||  |  |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707675 caacactctctaccatacatcaacgccggtcggaatgctggccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 53707583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 93 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 4441123 - 4440682
Alignment:
Q  93 aagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatc 190  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  4441123 aagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattgacctctaaatc 4441024  T
Q  191 ttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cg 286  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |||    ||    
T  4441023 ctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaccacagcatctacg 4440924  T
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  || ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  4440923 ggtcttctctctagatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctgccccca--ctctctctaatggtgccattcctaa 4440826  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgt 485  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||| ||||||| ||||    
T  4440825 tcctatcatgtctagtcttaccactcatcgaacgcaacatcctaatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccg-ccaacaccccgt 4440727  T
Q  486 accatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttc 530  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440726 atcatacaacaacgttggtctgactgctgtccgatagaacttttc 4440682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 571
Target Start/End: Original strand, 47265196 - 47265702
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||   |  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  47265196 caacaataaccaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatggatcaaattacactatagtgttctatcatagatcaaatttggatccaactcattg 47265295  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  || |||||||||| |  |||||| |||||| ||    
T  47265296 acctctaaattctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaactagaatctcctccatttagtctactcttcttacga 47265395  T
Q  280 cggca-----------cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctc 368  Q
    |||||           || ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||     
T  47265396 cggcatctacggactacgtgtcttctctctacatgcccaaatcatctaaacctattttctactaccttttctactataggtgttacccccactctctcta 47265495  T
Q  369 taattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctt 467  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| || |||||    
T  47265496 taatggtgtcattcataatcttatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctttgctacacctacttgattctcgtgttgactctt 47265595  T
Q  468 taccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtgg---tactttcttatcgcacaaa 564  Q
     |||| |||| ||   |||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  47265596 aaccgtccaatactttgtaccatacaacatcgctggtctgactgttgtcagatagaactttcatttcaacttaagtggtactactttcttatcgcacaaa 47265695  T
Q  565 acaccta 571  Q
    |||||||    
T  47265696 acaccta 47265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 487
Target Start/End: Original strand, 33190853 - 33191261
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgactt 183  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| | |||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||| |    
T  33190853 aacaaccaagccttatcccactaggtggggtcggctacatgggtcaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggattcaactcattgacct 33190952  T
Q  184 gtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc 283  Q
     |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||| |||||| ||||||||  ||||||  |||||    
T  33190953 ctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactcttctccatttgatctacccttcttaacacggc 33191052  T
Q  284 a----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtca 379  Q
    |    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  33191053 atctacgggtcttctctctacatgcccaaacaatctaagtctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtca 33191152  T
Q  380 ttcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaac 478  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| | ||||||||    
T  33191153 ttcctaatcctatcctatctaatcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaatcgcccaac 33191252  T
Q  479 acaccgtac 487  Q
    || ||||||    
T  33191253 actccgtac 33191261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 141 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 50287182 - 50286759
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||||| || |||| ||||||||| || |||| | || | ||||||    
T  50287182 agtgttctatcatacatcaaatttagatccaactcattgacctctaaatcctttataatgattactctaatagttttcataggtcttcttctacctcttt 50287083  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactt 336  Q
      ||  |||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||    
T  50287082 taacttgactctcctccattcgatctactcttcttaccacggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatccaagtctattttctaccaactt 50286983  T
Q  337 ttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctcc 436  Q
    |||||||||||||      |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||     
T  50286982 ttctactataggt------ccc---ctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacttcctcatctct 50286892  T
Q  437 gctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttca 535  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  || | |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50286891 gctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtatcatacaacaacgtcgatctgacggttgtccgatagaactttcctttca 50286792  T
Q  536 acttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50286791 acttaaatggtactttcttatcgcacaaaacac 50286759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 570
Target Start/End: Original strand, 41009414 - 41009846
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttgg 242  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| | | |||| |    
T  41009414 tgttatatcataaaccatatttgaatccatctcattgacttctaaatcatttctaatagtttctcttatagttttcc-aggtcttcctctaccacttttg 41009512  T
Q  243 acccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttct-accaacttt 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    |  |||||||   ||||||| |||| |||||||   |||||| | |||||||||    
T  41009513 acctgactctcctccatctgatctatttttcttacgactgcatcaacatgtcttctttctacatgcacaaaccatctaagtctatttttttaccaacttt 41009612  T
Q  338 tctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccg 437  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||  | ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  41009613 tctactataggtgctacccccattatctccctaatgatgtcatttctaatcctaccatgtctagtcttaccgatcatccaacgcaacatcctcatttccg 41009712  T
Q  438 ctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaa 536  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| || ||||| ||||||||||| |  |||    
T  41009713 ctacacttacttgattctcatgttggctcttaatcgcccaacactccgtactatacaacatcgctggtctgattgttgtccaatagaacttttttcccaa 41009812  T
Q  537 cttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  41009813 cttaagtggtattttcttatcatacaaatcacct 41009846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 490
Target Start/End: Original strand, 39100537 - 39100949
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||| ||| |||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  39100537 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggattatattacgccataatgttctatgataaacaatatttggatccaactcattg 39100636  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || |  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||  |    
T  39100637 acctccaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacctgactatcttccatctgatctactcttcttacaa 39100736  T
Q  280 cggc---acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtg 376  Q
    ||     |||| |||||||  ||||||  |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||    
T  39100737 cgcatctacggatcttctctctacatgttcaaaccatctaagcctattttctatcaacttttcttctataggtgctaccccca--ctctctctaatggtg 39100834  T
Q  377 tcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgccc 475  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || | ||    
T  39100835 tcattcctaatcctatcatttctagtcttaccactcatttggcgcaacatcctcatctccgctacacttacatgactctcgtgttggctcttaactgtcc 39100934  T
Q  476 aacacaccgtaccat 490  Q
    ||||| | |||||||    
T  39100935 aacactctgtaccat 39100949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1793741 - 1793319
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||   ||||||||||| || |||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1793741 acaacaactaagccttatctcactaagtgagatcggctacatgaatcaaattacgtcatagtgctctatcataaatcatatttggatccaactcattgac 1793642  T
Q  182 ttgtaaatctttt----ttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttat 277  Q
     | ||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||| | |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||     
T  1793641 ctctaaatcttttctaattaatggtttctcttatagtttttcgaggtctttctctacctcttttgatacgactc--ctccatctgatctactattcttac 1793544  T
Q  278 gacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaatt 373  Q
    |||| ||    |  ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||     
T  1793543 gacgacatcaacaagtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcttattttctaccaacttttttactataggtgctacccccgctctctccctaatg 1793444  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccg 472  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||  | ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  1793443 gtgtcattcctaatcttatcccgttaagtcttaccgttcatccaacacaacatcctcatctccgctacacttacttgattctagtgttggctcttaaccg 1793344  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
    || ||||| | ||| ||||||||||    
T  1793343 ccaaacactctgtatcatacaacat 1793319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 567
Target Start/End: Original strand, 1211393 - 1211883
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt-acgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |  |||||| ||| | ||| || ||  |||| ||||| |||    
T  1211393 caacaacaaccaagtcttatcccattaagtggggtcggctacatgaatcaaatttacgccttagtgttctatgagaaaccaaat--ggatccaactcatt 1211490  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    ||| | ||| | |||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||| |||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  1211491 gacctctaatt-ttttctaataatttatcttatagttctcctatgtcttcctctatctcttttgatccgactctactccatctgatctactcttcttacg 1211589  T
Q  279 acggcacg----ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttatttt--ctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
    ||   |      |||||||||  ||||| |||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||  ||||||| |||    
T  1211590 acaatatctataggtcttctctctacattcccaaaccatttaagcatatatttcctaccaacttgtttactataggtgctgctccca--ctctctcgaat 1211687  T
Q  373 tgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttacc 471  Q
     ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  1211688 ggtgtcattcctaatcatatcatgtctagttttaccactcatccagtgcaacatcctcatatccgctacacttacttgattctcgtgttggctcttaacc 1211787  T
Q  472 gcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    | ||||||| | |||||| |||||||    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1211788 gtccaacactctgtaccacacaacatcaccggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcatacaaaaca 1211883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37798132 - 37797798
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37798132 caacaataaccaagccttatcccactaaatggagtcggctacattgatcaaatgacgtcatattgttctatcataaaccatatttggattcaactcattg 37798033  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||| |  |||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37798032 acttctaaatcctttctaatgatttctctaatagttttcctagatcttcctcta-atcttttaacctgactctcatccatttgatctactcttcttacga 37797934  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    |||  |||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||    
T  37797933 cggcatctacgaatcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctctctaatggt 37797834  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  37797833 gtcatttctaatcttatcatgtctagtcttatcact 37797798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39708708 - 39708412
Alignment:
Q  88 caaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgt 185  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |    
T  39708708 caaccaagtcttatcccactaagtggggtcgactacatggatcaaattacgacatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattgacctct 39708609  T
Q  186 aaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc-- 283  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||      
T  39708608 aaatcctttctaatggtttctcttatagttttcctaggtcttcctctacctcttttgacctgactctcctccatctgatctactcttcttacgacggcat 39708509  T
Q  284 --acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtc 378  Q
      | | ||||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||    
T  39708508 ctatgtgtcttctctatacatgctcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttatactacaggagctaccctcactctctccctaatggtgtc 39708412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16003206 - 16002714
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||| |||  |||  || ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  16003206 aacaacaaccaagttatatcctattaaatgggatcgcttatatggattaaattacgtcatagtgttttatcataaatcatatttagatccaactcattga 16003107  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacg-tctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| | | |||| |  ||||| |||   ||| || |||||||||| |||  |||||||||    
T  16003106 cctctaaattttttctaatggtttctcttatagttttt-tacggtattcctctatttcttttgacataactttcatccatctgatttacccttcttatga 16003008  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  || |||  |||  |||||||   ||||||||| |||||||| ||| ||||||||   || || || |||| |||| ||    
T  16003007 cggcatctacgggtcttctctctaaatgttcaac-catctaagactattttctatcaacttttataccataggtgccatcctcactcactctataatggt 16002909  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||    
T  16002908 gtcattcctaatcctatttcgtctagtcttaccactcatccagcacaacatcatcgtcttcactacacttacttgattctcgtgttgactcttaacctcc 16002809  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||  ||| | ||||||||| |  ||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16002808 caacacttcgttc-atacaacatcgctggtctaactgatgtctgataaaacttttctttgaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacct 16002714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 321 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12494786 - 12494618
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |    
T  12494786 tattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacg 12494687  T
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtacc 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  12494686 caacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtacc 12494618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 497
Target Start/End: Original strand, 45204841 - 45205271
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc-agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||| ||| |||||||| | | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  45204841 caacaacaaccaagccttatcccactaagttgggtgggctacatagatcaaattacgcctaatgttctatcataaaccatatttggatccaacttattaa 45204940  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgac 280  Q
      | |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||    
T  45204941 actctaaatctttcctaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctccacctcttttgatctg-ctctcctccatctgatctactcttcgtacaac 45205039  T
Q  281 ggca-----------cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaactt--attttctaccaacttttctactataggtgcttcccccat-tctctc 366  Q
      ||           | |||||||||  ||| ||| |||| || |||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||||    
T  45205040 atcatctacagactacaggtcttctctctacgtgcacaaaccacctaaaagtctattttctaccatcttttctactataggcactacccccaactctctc 45205139  T
Q  367 tctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctc 465  Q
      |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||    
T  45205140 gttaatggtgtcattcctaatcctatcccgtctagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctccgctacgcttacttgattctcgtgttggttc 45205239  T
Q  466 tttaccgcccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45205240 ttaactgcccaacactccgtaccatacaacat 45205271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 369
Target Start/End: Original strand, 26037505 - 26037799
Alignment:
Q  81 ccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  26037505 ccaacaacaaccaaaccttatcccactaagtggggtcggctacatggatccaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcatt 26037604  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
     || | |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  26037605 cacctctaaatctttcctaatagtttctcttatggttttcctaggttttcctctgcctcttttaacctgactctcctccatctgatctactcttcttacg 26037704  T
Q  279 acggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct 369  Q
    |||||    || |||||||||  || |    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26037705 acggcatttacaggtcttctctctataatatcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctct 26037799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28236463 - 28236087
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||   | || ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28236463 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaattacaccataatattctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 28236364  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||| | |  |||  ||  || ||||| |||| ||||| ||| |||||| ||    
T  28236363 acctctaaatcatttataaagatttctctaatagttttcctaggtcttcctctaccatttta-acttgattctccgccatttgatcaactcttcttacga 28236265  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    || ||    |  ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  28236264 cgacatctacaagtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttccaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggt 28236167  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||| | ||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28236166 gtcattcctaatcctatcatatctaatcttaccattcatccaatgcagcatcataatctctgctacacttacttgattct 28236087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27983474 - 27983108
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| | ||  ||||||| ||| ||| | ||||    
T  27983474 caacaacaaccaaaccttatcccattaattgggatcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctataaaaatccatattttgatccaattcattg 27983375  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |  | |||||||||| ||| ||||| ||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |    
T  27983374 aactctaaatcttttctaaaggtttatcgaatggttttcttatgtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatatactcttcttacaa 27983275  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    || ||||||||  ||||||  |||| ||||||| |       |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||    
T  27983274 cggcatctacgagtcttctctctacatgttcaaaccatctaagc-------ctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctctaatggt 27983182  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttactt 449  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27983181 gtcattcctaatcctatcatgtatagtcttaccactcatctagcacaatatcctcatctccgctacacttactt 27983108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 335 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 35690326 - 35690091
Alignment:
Q  335 ttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatct 434  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||    
T  35690326 ttttctactataggtgctaccccaactctctctttaaaggtgtcattcctaatcctatctcgtctagtcttactactcatccaacgcaacatcctcatct 35690227  T
Q  435 ccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttcttt 533  Q
    | |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||| | |||||  || || |||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| ||| || |    
T  35690226 cggctacacttacttgattctcatgttggttcttaaccacacaacattccatatcatacaacatcgtcggtctaactgttgtctgatagaattttcctct 35690127  T
Q  534 caacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    ||||||||  || ||||||||||| || ||||||||    
T  35690126 caacttaaacggcactttcttatcacataaaacacc 35690091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 420 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 39708395 - 39708248
Alignment:
Q  420 gcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtggc-tctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccg 518  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||| || |||    
T  39708395 gcaacatcctcatctgcactacacttacttgattctcgtgttgcctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcgatcggactgttgcccg 39708296  T
Q  519 atagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 566  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39708295 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacaaaaaac 39708248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 289 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31459098 - 31458887
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattc--tctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | | ||  |||||||||| || ||||||||||    
T  31459098 tcttctctttacatgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctcgactctgtctctctaatggtatcattcctaa 31458999  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgt 485  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||| ||| |||| || ||||||||| ||||    
T  31458998 tcctatcatgtctagtcttaccactcaaccaacgcaacatcctcatctgtgctacacttactttattttcgtgttggttcttaactgcccaacactccgt 31458899  T
Q  486 accatacaacat 497  Q
    |||||| |||||    
T  31458898 accataaaacat 31458887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 448
Target Start/End: Original strand, 37773485 - 37773823
Alignment:
Q  115 gtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttata 212  Q
    |||||||| || ||| |||||| ||||  ||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  37773485 gtcggctatatagatcaaattatgtcatagtgttctatcataaaccaaatctggatccaactcattgacctccaaatcctttctaatggtttctctaata 37773584  T
Q  213 gttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaa 308  Q
    ||||||||| || | | || | ||||||  |   ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  |||  |    |||||| |||   |||||||||||    
T  37773585 gttttcctaggtattcatctacctcttttaaattgactctcatccatttgatctactctacttacaacgatatttacgggtcgtctatctacatgcccaa 37773684  T
Q  309 atcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttacc 408  Q
    | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| || |||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  37773685 accatctaagcctattttctaccgacttttctactataggtgc-taccccttactctctctaatggtatcattcataattctatcatgtctagtcttacc 37773783  T
Q  409 acttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttact 448  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  37773784 actcatccagcgcaacattctcatctctcctacacttact 37773823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32479319 - 32479057
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  32479319 caacaacaaccaagcctttttccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatattttgatccaactcattg 32479220  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  32479219 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctctttcaacctgtctctcctccatttgatctactcttcttacaa 32479120  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactttt 338  Q
    ||||    || ||||| |||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32479119 cggcctctacaggtctcctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaactttt 32479057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6957879 - 6957728
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  6957879 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgggatcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcatacatcaaatttggatccaactcattg 6957780  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  6957779 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctc 6957728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8286720 - 8286569
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  8286720 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgggggcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 8286621  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  8286620 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctc 8286569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12494944 - 12494793
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  12494944 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtccgctacatggattaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 12494845  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  12494844 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctc 12494793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 454
Target Start/End: Original strand, 20601692 - 20602025
Alignment:
Q  121 tacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttc 218  Q
    |||||| || |||||||||||   |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||       ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20601692 tacatgaatcaaattacgtcataatgttctatcataaatcatatttgaatccaactcattgacctgac-----tttctaatggtttctcttatagttttc 20601786  T
Q  219 ctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatc 314  Q
      | |||| | || | |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||    | |||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  20601787 a-aggtcttcttctacctcttttgacctgactctcctccatcttatatactcttcttacaacggcatctacaggtcttctctctacatgcacaaaccatc 20601885  T
Q  315 taaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttat 414  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||| |||||| ||| | |||||||||  ||| |||||  || | |||||| | || ||    
T  20601886 taatcctattttctaccaacttttctactataagtgttatctccactctctccctagtggtgtcattctcaattctatcatgtattgtcttagcgctcat 20601985  T
Q  415 caagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattc 454  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20601986 ccagcgcaacatcctcatatccgctacacttactggattc 20602025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 382
Target Start/End: Original strand, 20591356 - 20591607
Alignment:
Q  131 aaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctcc 228  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| || |||| |    
T  20591356 aaattacgtcattgtgttctatcataac-catatttgaatccaactcattgacctctaaatcctttctaatggggtctcttatagttttcttaggtcttc 20591454  T
Q  229 ctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttat--gacggc-acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattt 325  Q
    ||| | ||||    ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||   |||  | | | ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20591455 ctctacctct----acttgactctcctccatctgatatactcttcttacacgacatctatgagtcttctctctacatgcccaaaccatctaatcttattt 20591550  T
Q  326 tctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattc 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  20591551 tctaccaacttttctactataagtgctacccccactctctccctaatggtgtcattc 20591607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21237139 - 21236951
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| || |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  21237139 caacaacaaccaatccttatcccactaagtggggttggctacatgtatcaaatgacgccatagtgttctatcatataccaaatttggatccaactcattg 21237040  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctac 268  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21237039 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctac 21236951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7947214 - 7947067
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgactt 183  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  7947214 aacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacatgatagtgttctatcataaatcaaatttggatccaactgattgacct 7947115  T
Q  184 gtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
     |||||| |||  |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  7947114 ctaaatcctttcaaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctc 7947067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 51422011 - 51421682
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||   | |||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | |||     
T  51422011 caacaacaaccaagctttatcccactaagtgagattggctacatggatcaaattacgtcataatgttctatcataaaccatttttggatccaattcatta 51421912  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||| | |||||| || | |||   ||||||| ||||||||| ||| ||| |    
T  51421911 acctctaaatctttcctaatagtttctcttatagtttttctaaatcttcctctacctcttttgatctgacaaacctccatttgatctactcttcgtatta 51421812  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |  |    || |||||||||  || ||||||||| || |||| | ||||||||| || ||  ||||||||| ||||| |||| |  | ||||||||| ||    
T  51421811 caacatctaccggtcttctctgtatatgcccaaaccacctaagcctattttctatcatctaatctactatatgtgctaccccaa--cactctctaatggt 51421714  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttac 407  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51421713 gtcattcataatcctatctcgtctagtcttac 51421682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20192311 - 20192025
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||| || || |||| ||||||   |||| ||||||| |||| |||||||| ||||  | ||||    
T  20192311 acaacaaccaagctttatcccactaagtagggtcggctacttg-atcaaataacgtcataatgttctatcatacatcaaatttggatccaacccactgac 20192213  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||   | |||| || | | ||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||     
T  20192212 ctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttttcaggtcttccactacctcttttaacttgactctcctccatttgatatactcttcttaccaca 20192113  T
Q  282 gca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctct 365  Q
    |||    |||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  20192112 gcatctacgggtcttctctctacatgcccaaactatctaagcttattttctatcaacttttctactataagtgctacccccactctct 20192025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 289 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 55579100 - 55578845
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaa--ttgtgtcattcctaa 386  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||| |   || | ||||||| |||  | ||||||||| |||    
T  55579100 tcttctctttacatgcccgaaccacctaagcatattttctaccattttttc-actataggtgttattccaactctctctataaaatagtgtcattcataa 55579002  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgt 485  Q
    || ||||| || |  |||||||||||||  |   |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||  | |    
T  55579001 tcttatctcgtttcctcttaccacttattcaacacaacatcctcatatatgctacacttaattgattctcgtgttggttcttaaccgcccaacacttcat 55578902  T
Q  486 accatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaag 542  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  55578901 accatacaacattgttggtctgactgttgtccgatagaattttccttccaacttaag 55578845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 535
Target Start/End: Original strand, 7092433 - 7092680
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaat 387  Q
    ||||||||  || ||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||   || | ||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  7092433 gtcttctctctatatgcccaaaccacttaaacctattttctatcatattttctactataggtgctattccaactctgtctctaatcatgtcattc-taat 7092531  T
Q  388 cctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgta 486  Q
    | ||||   ||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||| || || |||||    
T  7092532 catatcccttctagacttaccactcatccagcacaacatcctcatctctgctacacttacttgcttctcgtgttggttcttaactgcctaaaactccgta 7092631  T
Q  487 ccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttca 535  Q
    ||||||||||| |  | ||| |||||||||  |||||| ||| ||||||    
T  7092632 ccatacaacatcgccgatctaactgctgtctaatagaattttcctttca 7092680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 284
Target Start/End: Original strand, 20821077 - 20821212
Alignment:
Q  148 tatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccg 247  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | || | |||||| || | |    
T  20821077 tatcataaatcatatttgaatccaactcattgacctttaaatcctttctaatg-tttctcttatagttttcctaggtcttcatctacctcttttgatctg 20821175  T
Q  248 actctcctccatctgatctacttttcttatgacggca 284  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  20821176 attctgctccatctaatctacttttgttatgaaggca 20821212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21528569 - 21528442
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat--tacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||   ||   |||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| ||||    
T  21528569 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgccaccatagtgttctatcaaaaaccatatttgaatccaactcattg 21528470  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctc 207  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||    
T  21528469 acctctaaatcttttctaatggtttctc 21528442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35690552 - 35690357
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| | |  ||||||  |||| |||     
T  35690552 caacaaaaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccctgattggatcaaactcatta 35690453  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctt 275  Q
    || | ||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||| || | |||| |||||||||| ||| ||| |||||    
T  35690452 acctctaaatttttcgtaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctctacctcttttgatctgactttcctccatctaatccactcttctt 35690357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37488372 - 37488221
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||| |||||||| |  | || | |||||| || ||||||| |||  ||||||||     
T  37488372 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggctggctacatggatcaaattacgccataatgctctatcattaaccatattttgatcaaacttatta 37488273  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    | || || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  37488272 atttctagatctttcttaatagtttctcttatagtttttctaggtctacctc 37488221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50679717 - 50679589
Alignment:
Q  148 tatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccg 247  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||   ||  |    
T  50679717 tatcataaaccaaatttggatccaactcattgacctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttctaacttg 50679618  T
Q  248 actctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  50679617 actctcctccatttaatctactcttctta 50679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4548303 - 4548165
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg--tcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  4548303 caacaacaaccaagcattatcccactaagttgggttggctacatggatcaaattacgccttagtgttctatcataaaccaaatttagatccaacttattg 4548204  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttc 218  Q
    || | ||||   ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  4548203 acctctaaaatatttctaatgatttctctaatagttttc 4548165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 55008027 - 55007968
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  55008027 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgtca 55007968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 221
Target Start/End: Original strand, 41009283 - 41009361
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttccta 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  41009283 tgttatatcataaaacatatttgaatccaactcattgacttctaaatcatttctaattgtttctcttatagtttaccta 41009361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 26037835 - 26037904
Alignment:
Q  428 ctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaaca 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26037835 ctcatctccgctccacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtatcatacaaca 26037904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3979202 - 3979142
Alignment:
Q  81 ccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3979202 ccaacaacaaccaagccttatcccactatgtggagtaggctacatggatcaaattacgtca 3979142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 30634107 - 30634163
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30634107 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 30634163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Original strand, 50287988 - 50288095
Alignment:
Q  126 ggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacg 223  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |    
T  50287988 ggattaaattacgacatagtattatatcataaaacatatttgcattcaattcattgacctctaaatcttttttaataatttatcttatagtttttctaag 50288087  T
Q  224 tctccctc 231  Q
    ||| ||||    
T  50288088 tcttcctc 50288095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54470240 - 54470129
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaa 423  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||| ||| | |||| ||||   ||||||||||||||  ||| | |||||    
T  54470240 tttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctctaatgttgttatttcaaatcatatcccatctagtcttaccacacatccaatgcaa 54470141  T
Q  424 catcctcatctc 435  Q
    ||||||||||||    
T  54470140 catcctcatctc 54470129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 19154864 - 19154965
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19154864 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcagctgcatggatcaaataacgccatagtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 19154963  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  19154964 ac 19154965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19969462 - 19969361
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  || ||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19969462 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagcgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 19969363  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  19969362 ac 19969361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 503 - 569
Target Start/End: Original strand, 54914618 - 54914684
Alignment:
Q  503 gtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  54914618 gtctgactcctgaccgatagaattttcctttcaacttaagtggtattttcttatcacataaaacacc 54914684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15665382 - 15665326
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15665382 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaattacg 15665326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 393
Target Start/End: Original strand, 44047598 - 44047666
Alignment:
Q  325 ttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatc 393  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  44047598 ttctaccaccttttctactataggtgctaccccaactctctctctaatgttgtcatttctaattctatc 44047666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 45209206 - 45209262
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  45209206 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaactacg 45209262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46236770 - 46236714
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  46236770 caacaaccaccaagccttatcctactaagtggggtcggctacatggatcaaagtacg 46236714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 50238616 - 50238668
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50238616 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 50238668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 50238702 - 50238754
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50238702 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 50238754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 51252674 - 51252791
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaat 387  Q
    ||||||||  |||||||||| | || |||| | || |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||   |||||| |||||    
T  51252674 gtcttctctctacatgcccataccacctaagcctagtttccaccatcttttctactagaggtgctaccccaa--ctctctctaatgtagtcatttctaat 51252771  T
Q  388 cctatctggtctagtcttac 407  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  51252772 cctatctcgtctagtcttac 51252791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Original strand, 55237918 - 55238001
Alignment:
Q  88 caaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||| ||||||  | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  55237918 caaccaagtcttatctcactaattagagtcggctacatggatcaaattacgtc---gtttgatcataaatcatatttggattcaact 55238001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 56130451 - 56130403
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  56130451 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatt 56130403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 2557672 - 2557727
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  2557672 caacaacaaccaagccttatcccactaaatggagttggctacatggatcaaattac 2557727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 4879110 - 4879165
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  4879110 caacaacaaccaagccttatcccagtaagtgaggtcggctacatggatcaaattac 4879165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 460
Target Start/End: Original strand, 20105761 - 20105856
Alignment:
Q  365 tctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |  |||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  20105761 tctctaatgttgtcatttctaatcatatctcgtctagtcttaccacacatccatcgcaacatcatcatctccgctacatttatattattcttgtgt 20105856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 26024851 - 26024906
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  26024851 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatggataaaattac 26024906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 372
Target Start/End: Original strand, 30621418 - 30621501
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||    
T  30621418 tcttctctctacgtgcccaaatcacctaaacctattttccaccatcttttctactataagtgctaccccaactccctctctaat 30621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 34208270 - 34208364
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||| ||||| || |  | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34208270 caacaacaaccaagccttatcccaataaggggggtcgagtacatggatcaaattgcgccataatgttctatcataaaccatatttggatccaact 34208364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 497
Target Start/End: Original strand, 38904023 - 38904142
Alignment:
Q  379 attcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaa 477  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||| | |||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  38904023 attcctaatcctatatcttctagtcttactacaaatcaaatacaacattctcatctttgctacacttattttattcttgtgttggttttttactgcccaa 38904122  T
Q  478 cacaccgtaccatacaacat 497  Q
    ||| ||||  ||||||||||    
T  38904123 cactccgttgcatacaacat 38904142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 46153989 - 46153942
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  46153989 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggat 46153942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 50862908 - 50862857
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  50862908 aacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattac 50862857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Original strand, 15661875 - 15661929
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15661875 acaacaaccaaaccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 15661929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33709982 - 33709888
Alignment:
Q  299 acatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatc 393  Q
    ||||||| ||| || |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  33709982 acatgcctaaaccacctaaacctagtttccaccatcttttctactataggtgttaccccaactctctctctaatgttgccatttctaatcctatc 33709888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 49987488 - 49987378
Alignment:
Q  297 ttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctgg 396  Q
    ||||||| ||||| || |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||   |||  | ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  |    
T  49987488 ttacatgaccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataggtgtgacccagactctctatctaatgttgtcatttctaatcctatcatg 49987389  T
Q  397 tctagtcttac 407  Q
    |||||||||||    
T  49987388 tctagtcttac 49987378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8286545 - 8286455
Alignment:
Q  247 gactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaa 333  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    |||||||||||  |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8286545 gactctcctccatttcatctactcttcttacgacggcatctacgggtcttctctctacatgcctaaaccatctaagcctattttctaccaa 8286455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 51811281 - 51811367
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  51811281 caacaacaac-aagccttatcccactaagtgg-gtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcaaaaaccatatttggat 51811367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 19061936 - 19061988
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||    
T  19061936 caacaacaaccaagccttatcccactaggtggggtcggctacatggatcaaat 19061988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 22873601 - 22873657
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgt 139  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22873601 aacaactaccaagccttatcccactaaatggggttggctacatggattaaattacgt 22873657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 402
Target Start/End: Original strand, 38570970 - 38571074
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||||||||| || |||| | || |||| || | ||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||  ||||||| | |||||||||| ||    
T  38570970 tacatgcccaaaccacctaagcctagtttccactatcttttgtactataggtgcttccccagctctctctcaaatgttgtcatttccaatcctatcttgt 38571069  T
Q  398 ctagt 402  Q
    |||||    
T  38571070 ctagt 38571074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 49939735 - 49939787
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49939735 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 49939787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 55388213 - 55388296
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatattt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||| |||||||  ||   |||| |||||||||||||||||    
T  55388213 aacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcgacaacatggatcaaattacaccacaatgttctatcataaatcatattt 55388296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5306577 - 5306483
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||  |||| |||||| |||||||| |  | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  5306577 caacaacaaccaagccttatcccaccaagtggggttagctatatggatcaaattacgccataatgttatgtcataaaccatatttggatccaact 5306483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25575105 - 25575050
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  25575105 caacaacaaccaagccttatcccactaaatggggtctgctacatggatcaaattac 25575050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40424611 - 40424552
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  40424611 caacaacaaccaagtcttatcctactaaatgaggtcgactacatagattaaattacgtca 40424552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Original strand, 49738551 - 49738598
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||    
T  49738551 caacaacaaccaagccttatcccactaaatggggtcggctacatggat 49738598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10209104 - 10208985
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| |    |||||||||  ||||||| ||||    
T  10209104 ggtcttctcgctacatgcccaaaccaactaagtttagtttctgccatcttttctactataggttctaccccaa----ctctctaatgttgtcatttctaa 10209009  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    | |||||   ||||||||||||||    
T  10209008 ttctatcccatctagtcttaccac 10208985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 11389681 - 11389555
Alignment:
Q  396 gtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaa 494  Q
    ||||||| |||||||  ||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | | ||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||    
T  11389681 gtctagttttaccacacatccaatccaacatcctcatctctgctacgcttactttattctcgagttggttcttaaccgcccaacactactttccatacaa 11389582  T
Q  495 catagtaggtctgactgctgtccgata 521  Q
    ||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  11389581 cattgtcggtcttacaactgtccgata 11389555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 13805266 - 13805320
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  13805266 caacaacaaccaagccatatcccactaagtggggttggctacatggatcaaatta 13805320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 28550456 - 28550510
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  28550456 caacaacaaccaaaccttatcccaataagtggggtcagctacattgatcaaatta 28550510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Original strand, 45184135 - 45184193
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  45184135 aacaacaactaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgaatcgaattacgtca 45184193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17900513 - 17900388
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaa 423  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||   |||||| |||||  ||||   ||||||||||||||  ||| |  ||||    
T  17900513 tttctaccgtcttttctactataggtgctaccccaactccgtctctaatgtcgtcatttctaattttatcccatctagtcttaccacacatccaacgcaa 17900414  T
Q  424 catcctcatctccgctacacttactt 449  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||    
T  17900413 catcctcatttctgctacgcttactt 17900388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28348338 - 28348293
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgg 127  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||    
T  28348338 caacaacaaccaagccttatcccactaagcggggtcggctacatgg 28348293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31459273 - 31459228
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  31459273 acaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcgggtacatggat 31459228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 129
Target Start/End: Original strand, 37042667 - 37042712
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  37042667 acaacaaccaagccttatcccactaagtcgggtcggctacatggat 37042712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 51438726 - 51438642
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| | ||| ||||||||||| |||||||| |  | |||||||| ||||| |||||||    
T  51438726 caacaacaaccaagccttatcccacaaagttgggtcagctacatggatcaaattacgccataatgttatattataaaccatattt 51438642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 135
Target Start/End: Original strand, 7544537 - 7544585
Alignment:
Q  87 acaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt 135  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7544537 acaaccaaggcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatt 7544585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28351840 - 28351788
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28351840 caacaacagccaagccttaccccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 28351788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29399085 - 29399029
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  29399085 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcagctacatgaatcaaattacg 29399029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 31961267 - 31961311
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  31961267 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatg 31961311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 36255526 - 36255578
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  36255526 caacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggccacatggatcaaattac 36255578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 44360367 - 44360323
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44360367 caacaataaacaagccttatcctattaagtggggtcggctacatg 44360323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50862844 - 50862764
Alignment:
Q  161 atttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctctt-atagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  50862844 atttggatccaactcattgacctctaaatcctttctaatggtttcttttaatagttttcctaggtcttcctctacctcttt 50862764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 50967029 - 50967085
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||| |||| | | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  50967029 caacaacaaccaagctttattccactaagtgaggtcggctacatggatcaaattacg 50967085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 1211026 - 1210531
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  1211026 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 1210927  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  1210926 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 1210827  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  1210826 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 1210727  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  1210726 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 1210627  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210626 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 1210531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 82 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 696551 - 696069
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca---gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||   ||||| ||||| ||| |||||||||||  |||| |||    
T  696551 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacattgatcaaatgacgccaatagtgttctatcaaaaaccatatttggatcaaactcatt 696452  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  696451 gacctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatatgatctactcttcttaca 696352  T
Q  279 acggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    ||||||    |||||||||||  |||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  696351 acggcatctacgggtcttctctctacatgtccaagccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatgg 696252  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgc 473  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||| |    
T  696251 tgtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccac 696152  T
Q  474 ccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttat 556  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  696151 ccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttat 696069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 30202131 - 30202626
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  30202131 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 30202230  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |    
T  30202231 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcgtccatttgatctactcttcttacca 30202330  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  30202331 cggcatctacgggtcttctctctacatgaccaaaccatctaagcctattttctaccaacctttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 30202430  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  30202431 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 30202530  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| | |||||| ||||||  |  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202531 caacactctgtaccacacaacaacgccggtcggactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 30202626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 82 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 22090377 - 22089883
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  22090377 caacaacaaccaagccttatcccacttagtggggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 22090278  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  22090277 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctaccccttttaacttgactctcctccatttgatctacttttcttacca 22090178  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca--ttctctctctaatt 373  Q
    |||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||     
T  22090177 cggcatctacgggtcttctccctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatg 22090078  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccg 472  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||    
T  22090077 gtgtcattcataatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacacagcatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccg 22089978  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22089977 cccaacactccgtaccacacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtattttcttattgcacaaaaca 22089883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 49347394 - 49347889
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  49347394 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 49347493  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  49347494 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 49347593  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  | |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||| ||    
T  49347594 cggcatctacgggtcttctctctgcatgaccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagatgctacccctactctctctccaatggt 49347693  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  49347694 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 49347793  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||  ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347794 caacacttcgtaccatacaacaaggttggtcggactgctgtccgatagatttttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 49347889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 82 - 560
Target Start/End: Original strand, 51440766 - 51441251
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| || |||| ||| |  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  51440766 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggttacatgaatcaaatgacgccgtagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 51440865  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||| ||  ||  ||||||||||||| || |||||| ||||||  |    
T  51440866 acctataaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcctttaacttgactctcctccatttgctctactcttcttacca 51440965  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||    
T  51440966 cggcatctccgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctaatggt 51441065  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  51441066 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcgtccaatgcaacatcctcatctctgctacactcacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 51441165  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgca 560  Q
    |||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51441166 caacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgca 51441251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 82 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9593015 - 9592521
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||| ||||||| | || ||||  ||  |||| ||||    
T  9593015 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgctatagtgttctatcatacaccaaatttaaatctaactcattg 9592916  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  9592915 acctctaaatcatttctaatggtttctctaataggtttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 9592816  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  9592815 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaacccatctaagcctattttctacaaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 9592716  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||  |||| ||||||    
T  9592715 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgattcttaaccgcc 9592616  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592615 caacactccgtaccatacaacaacgtcagtctgactattgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 9592521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8672199 - 8671706
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||| |||  |  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  8672199 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggttggctatatggatcaaatgacgctatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 8672100  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  8672099 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 8672000  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  8671999 cggcatctacggatcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggt 8671902  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||| |    
T  8671901 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatccttatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtc 8671802  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||   ||||||||||||||  |  |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671801 caacatttcgtaccatacaacaacgccggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 8671706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 494
Target Start/End: Original strand, 34792350 - 34792768
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  34792350 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 34792449  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  34792450 acctttaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 34792549  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  34792550 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctactttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 34792649  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  34792650 ttcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacactt-cttgattctcgtgttgactcttaaccgcc 34792748  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaa 494  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  34792749 caacactccgtaccatacaa 34792768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15086203 - 15085728
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15086203 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcaaaaatcatatttggatccaactcattg 15086104  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| | | |||||||||            || || |||| |||| | ||||||  | | ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |    
T  15086103 acctctaaatcctatctaatggttt------------tcttaggtcttcctctacctcttttaatctgactctcctccatttgatctactcttctaacaa 15086016  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15086015 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 15085916  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||    
T  15085915 gtcattcctaatcctatcctatctagtcttaccactcgtccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcc 15085816  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcaca 562  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15085815 caacactccgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctgatagaactttcctttcagcttaagtggtgctttcttatcgcaca 15085728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 51602337 - 51601844
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||   |||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  51602337 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaatgacgccatgatgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 51602238  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | ||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  51602237 acctctaaatcccttctaatggtttttctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 51602138  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    || ||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||    
T  51602137 cgacatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctca--ctctctctaatggt 51602040  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||| ||    
T  51602039 gtcattcctaatcatatcatgtctagtcttaccactcatctaacgcaacatcctcatatctactacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacc 51601940  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  51601939 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactactgtccgatagaactttcatttcaacttaaggggtactttcttatcgaacaaaacacct 51601844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 43240380 - 43240877
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| || |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  43240380 caacaacaactaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatgaatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 43240479  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | || |||  ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  43240480 acatataaatcatttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctaccttttttaacttaactctcctccatttgatctactcttcttacca 43240579  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct--aatt 373  Q
    |  ||    |||||||||||  ||||||| ||||  |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||     
T  43240580 caacatctacgggtcttctctctacatgctcaaactatctaagcctattttctatcaatttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatg 43240679  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccg 472  Q
    | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||     
T  43240680 gcgtcattcataatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacct 43240779  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43240780 cccaacactccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacct 43240877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8392053 - 8391556
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||  || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8392053 caacaacgactaagtcttttcctactaagtggggttggctacatggatcaaatgacgccatagtattctatcaaaaatcatatttggatccaacttattg 8391954  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||| ||||||  || |||||| || |||| | |  | ||| ||  ||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |    
T  8391953 acctctaaatcttttctaatgatttctcgaatggttttcttaggtcttcatatacctcctttaacatgactctccttcatttgatctactcttcttacaa 8391854  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||||||| |||  |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  8391853 cggcatctacgggtctcctctctacatgtccaaacaatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 8391754  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  8391753 gtcattcctaatcctatcttgtgtagtcttaccactcatccaacacaacatcttcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcc 8391654  T
Q  475 caacacaccgtacc--atacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| | |||||  |||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391653 caacactctgtaccatatacgacattgccggtctgactgctgtccgataaaacattcctttaagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 8391556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 32082757 - 32083241
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc---agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |   |||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||    
T  32082757 caacaaaaactaagccttttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgactgccgtagtgttctatcaaaaaccatatttgaatccaactcatt 32082856  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||            || || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  32082857 gacctctaaatcttttctaatggttt------------tcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttaca 32082944  T
Q  279 acggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    ||||||    ||||||| |||  | |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  32082945 acggcatctacgggtctcctctctgcatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatgg 32083044  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgc 473  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| || ||||| |||||    
T  32083045 tgtcattcctaatcctaccctgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacatactttactctcgtgttgactcttaaccgc 32083144  T
Q  474 ccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32083145 ccaacactctgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcatagaacacct 32083241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 441
Target Start/End: Original strand, 4001456 - 4001821
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||| |||| | ||||  | ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  4001456 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggttggctacatggatcaaatgatgtcatagggttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 4001555  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  4001556 acctctaaatcttttttaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacaa 4001655  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  4001656 cggcatctacgggtctcctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 4001755  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctac 441  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  4001756 gtcattcctaatcctattttgtctagtcttaccactcatctagcgcaacatcctcatcttcgctac 4001821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 497
Target Start/End: Original strand, 38807672 - 38808093
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||    
T  38807672 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggaacaaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcgttg 38807771  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  38807772 acctctaaatcctttctaatggtttctcttatagttttcttaggtcttcccctagctcttttgatctgactctcctccatctggtctactcttcttacga 38807871  T
Q  280 cggcac----gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccat----tctctctctaa 371  Q
    |||||     |||||||||| ||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||    
T  38807872 cggcatctaagggtcttctctttacatgcctaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccattctctctctctctaa 38807971  T
Q  372 ttgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtggctctttacc 471  Q
    | |||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||| |   |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||   |||||| |||    
T  38807972 tggtgtcatttctaattctatcccgtctggtcttaccac-tatccaacacaacatcctcatatccgccacgcttacttaattctcgt---gctcttaacc 38808067  T
Q  472 gcccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
     |||||||| | ||||| ||||||||    
T  38808068 tcccaacactctgtaccgtacaacat 38808093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 141 - 460
Target Start/End: Original strand, 32231016 - 32231339
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||| ||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  32231016 agtgttctatcatagaccaactttggatccaactcattgacctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttt 32231115  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactt 336  Q
      ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    |  ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  32231116 taacttgactctcctccatttgatctactcttcttatgacggcatctacaagtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaattt 32231215  T
Q  337 ttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctcc 436  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||     
T  32231216 ttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctaatcttaccactcatctagcgcaacatcctcatctct 32231315  T
Q  437 gctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  32231316 actacacttacttgattctcgtgt 32231339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 541
Target Start/End: Original strand, 37462878 - 37463334
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |    
T  37462878 aacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccataatgttctatgataaaccatatttg-atcaaactcattaa 37462976  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttg-gacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    | | |||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||| ||   |||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  37462977 cctctaaatcattcctgatcgtttctcttatagtttttctaggtaatcctctacctctttttgatccgactctcctccatctgatctactcttcgtacta 37463076  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |  |||| |||  ||   ||||||| || |||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||    
T  37463077 cggcatctacatgtctactctata---gcccaaaccacctaagcctattttctactgtcttttctactataggtgctaccccaa--ctctctctaatggt 37463171  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  37463172 gtcattcctaatcctaacctgtctagtcttaccactcatccaatgaaacatcctcatctcctctac----acttgattcttgtgttggttcttaaccacc 37463267  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaa 541  Q
    |||||| | |||||||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  37463268 caacactctgtaccatacaacattgctagtctgactgttgtctgatagaattttcctttcaacttaa 37463334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4029403 - 4029112
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  4029403 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgtcgccatagtgttatatcatacaccaaatttggatccaactcattg 4029304  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||  |    
T  4029303 acctttaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctattcttcttacca 4029204  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctct 367  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  4029203 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccttctaagcctattttctaccaacttgtctactctaggtgctacccccactctctct 4029112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39318409 - 39318209
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  39318409 caacaacaaacaagccttatcccactaagcgg-gtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 39318311  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  39318310 acctctaaatcctttctaatggtttctcttatagttttcctaggtcttcctctacctcttttgacccgactctcctccatctgatctgctcttcttacga 39318211  T
Q  280 cg 281  Q
    ||    
T  39318210 cg 39318209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 568
Target Start/End: Original strand, 9599640 - 9599888
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtg 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |       
T  9599640 tattttctaccatcttttctactataggtgttactccaactctctctctaatgatgtcattcctaatcatatcccgtctagtcttaccactcatccaaca 9599739  T
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccga 519  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||| ||||||   ||| ||||| |||| |  ||||||||||| ||| ||    
T  9599740 caacatcctcatctctgctacgcttacttgattattgtgttggttctcaaccgcacaacactttgtatcataccacatcgctggtctgactgcggtctga 9599839  T
Q  520 tagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  9599840 tagaattttcatttcaactgaagcggtactttcttatcacataaaacac 9599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 339
Target Start/End: Original strand, 25979232 - 25979495
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25979232 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 25979331  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||| | ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| | ||||  |    
T  25979332 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcatgggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccattcgatctactctccttacaa 25979431  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttc 339  Q
    | ||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||    
T  25979432 cagcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctagtttctactaacttttc 25979495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 276
Target Start/End: Original strand, 37311756 - 37311952
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  37311756 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 37311855  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37311856 acctctaaatcttttctaatggtttctcaaatggttttcctaggtctacctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttctta 37311952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 39140590 - 39140310
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | || | ||||||| |||| || ||||||||||    
T  39140590 ggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagccaattttttgccatcttttctactataggtgctacgccaactctctctgtaatggtttcattcctaa 39140491  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatca-------agtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaac 478  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| ||       |  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |  || ||| |||| || |||||||    
T  39140490 tcctatctcatctagtcttaccagttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctactacgcttacttgattttcatgatggttcttaactgcccaac 39140391  T
Q  479 acaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgca 560  Q
    || | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39140390 actc-gtaccatacaacatcaccggtctgactgctgtccgatagaatttgcctttcaatttaagcggtactttcttatcgca 39140310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52921361 - 52921201
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  52921361 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgcaatagtgttctatcataaaccatatttggatccaattcattg 52921262  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  52921261 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttt 52921201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9509388 - 9509229
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  9509388 ggtcttctctctacatgcccaaactacctaagcctattttttaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctctaatggtgtcatttctaa 9509289  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
    || ||||  ||||||||||| |||| ||| |   ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9509288 tcatatcctgtctagtcttatcactcatccaacacaacatcctcatctctgctacgctta 9509229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 321 - 541
Target Start/End: Original strand, 18469328 - 18469547
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtg 420  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  |  |    
T  18469328 tattttctatcatcttctctactataggtgttaccccaa--ctctctctaattgtgtcattcctaatcatatcatgtctagtcttaccactcatacaacg 18469425  T
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccga 519  Q
    || |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  ||   ||| ||||||||||  | || ||||||| ||||| |    
T  18469426 cagcatcgtcatctccgctacgtttacttgattctcgtgttggttcttaaccgcccagtacttagtatcatacaacatctttggcctgactgatgtccaa 18469525  T
Q  520 tagaacttttctttcaacttaa 541  Q
    || || ||||||| ||||||||    
T  18469526 tataaattttcttgcaacttaa 18469547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 568
Target Start/End: Original strand, 34827179 - 34827596
Alignment:
Q  155 aatcatatttggattcaacttattga-cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctc 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||  |  | ||   |||  ||||||    
T  34827179 aatcatatttggattcaactgattaaacctctaaatcttttctaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctttattttttctaaccttactctc 34827278  T
Q  254 ctccatctgatctacttttcttatgacggcacg----ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |  |||      ||||||||| ||||||| ||||| ||   || | |||||||||||| |||| || ||||| |     
T  34827279 ctccatctaatctacttttcttactagagcatctatcggtcttctctttacatgtccaaaccaaagaagcctattttctaccatctttacttctatatgc 34827378  T
Q  350 gcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttactt 449  Q
    ||| |||| | |||||   |||| ||  |||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  34827379 gctaccccaactctctacataatagt--catttctaatcttatatcgtctagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctcagttacacttattt 34827476  T
Q  450 gattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtac 548  Q
    | || | |||| || |||| ||||  |||||| | |||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| |||||  ||||    
T  34827477 gtttttcgtgttggttcttaaccgaacaacactctgtaccatacaacatcgttgatctgactgttgtccaatataattttcctttcaatttaagcagtac 34827576  T
Q  549 tttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  34827577 tttcttatcacataaaacac 34827596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Original strand, 32079178 - 32079304
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  32079178 caacaacaaccaagccttatcccaccaagtggggtcggctacatcgatcaaatgacgccagtgttctatcataaaccagatttggatccaactcattgac 32079277  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctct 208  Q
     | |||||| ||| | |||||||||||    
T  32079278 ctctaaatcctttctgatggtttctct 32079304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 19936505 - 19936310
Alignment:
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccg 472  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| |   |||||| |||||||||||||  |||| ||||||||  ||| || |||| ||||    
T  19936505 gtgtcattcctattcctatcccatctagtcttaccactcatccaacacaacattctcatctccgctatgcttatttgattctcatgttggttcttaaccg 19936406  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||| |  |||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  19936405 cccaacactctataccctataacattgctggtctaactgctgtccgatataattttcctttcattttaagcggtactttcttatcacataaaacac 19936310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 269
Target Start/End: Original strand, 52561589 - 52561779
Alignment:
Q  81 ccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  | |||| || |  ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  52561589 ccaacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatttcgccataatgttctacccgaaaccatatttggatccaactcatt 52561688  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctact 269  Q
     || | |||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||   | |  ||||||||||||||||||||||    
T  52561689 aacctctaaatctttcctaacagtttctcttatagtttttctaagtcttcctctacctcttctaatctaactctcctccatctgatctact 52561779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Original strand, 32404528 - 32404664
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagt--gttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||     
T  32404528 caacaacaacca-gccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccattatgttatatcataaaccatgtttggatttaactcatta 32404626  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  32404627 atctctaaatctttcctaatagtttctcttatagtttt 32404664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Original strand, 27848017 - 27848140
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || | | |||||||||||| |||| |||||| |    
T  27848017 ggtcttctctctgcatgcccaaaccacctaagcttattttctaccatcttttctaccacaggtgctaccacaactctctctctaatggtgttattcct-a 27848115  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  27848116 tcctatcccgtctagtcttaccact 27848140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8796490 - 8796353
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| |||||||  || ||| | |||     
T  8796490 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggattaaattacgccataatgttctatcataaaccatatttcaatccaagtcatta 8796391  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |  | || |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8796390 atatctagatctttcttaatagtttctcttaaagtttt 8796353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Original strand, 16141981 - 16142118
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||   ||||  |||||||| |||| ||||||  ||||||||     
T  16141981 caacaacaacaaagctttgtcctattaagtgtagtcaactacatggatcaaattacgtcatattgttcgatcataaaccataattggatctaacttatta 16142080  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16142081 aactctaaatcttttctaatggtttctcttatagtttt 16142118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 52561857 - 52561947
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  52561857 tattttctatcatcatttctactaaaggtgctaccccaactctctctctaatggtgtcattcctaatcatatcccgtctagtcttaccact 52561947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 44941777 - 44941865
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  44941777 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccaaatttggat 44941865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 194
Target Start/End: Original strand, 46423217 - 46423328
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  46423217 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgcca-tgttcaatcaaaaaccatatttggatccaactcattgac 46423315  T
Q  182 ttgtaaatctttt 194  Q
     | ||||||||||    
T  46423316 ctctaaatctttt 46423328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 178
Target Start/End: Original strand, 28090695 - 28090793
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28090695 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatatttggatccatcttatt 28090793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41560510 - 41560416
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41560510 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataacccatatttggatccaact 41560416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Original strand, 3818857 - 3818994
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||  || |  | ||||  |||||||| |||||||  |||||||| |||     
T  3818857 caacaacgaccaagccttatcccactaagtgcagtcggctacatggatcaaatggcgacataatgttccatcataaaccatatttctattcaactcatta 3818956  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3818957 atctctaaatctttcttaatagtttctcttatagtttt 3818994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12231639 - 12231591
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12231639 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtcggctacatggatt 12231591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 4707222 - 4707315
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |  |||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  4707222 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacat-gatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccaaatttggatccaact 4707315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 10200307 - 10200441
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||   |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  10200307 caacaacaaccaagcattatcccattaagtgaggtcggctacatggatcaaattacaccatgatgttctatcataaaccatatttggatccaactcatcg 10200406  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagt 214  Q
    |  | |||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  10200407 atctctaaatcttttctaatagtctctctcatagt 10200441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29129065 - 29128927
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgg-attaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| || | |||||  ||   |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  29129065 caacaaaaaccaagccttatctcactaagtggggtcggctacatgggatcatattacaccataatgttctatcataaaccatatttggatccaacttgtt 29128966  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
     || | |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  29128965 aacctctaaatctttcctaatagtttctcttatagtttt 29128927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 43481799 - 43481854
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43481799 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattac 43481854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Original strand, 52532619 - 52532753
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||| | | ||||| ||| |     
T  52532619 acaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggctacatgaatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatattttgttccaactcattaat 52532718  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttt 216  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  52532719 ttctaaatctttcctaatagtttctcttattgttt 52532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 24020268 - 24020369
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||||| |||| ||| |  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24020268 caacaacaaccaagccttatcccacaaagtggggttggctgcatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaatcaaatttggatccaactcattg 24020367  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  24020368 ac 24020369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 407
Target Start/End: Original strand, 19908262 - 19908371
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||    
T  19908262 tacatgcccaaatcacctaaacttggtttcccccatcttttttactataggtgctaccacaactctctctttaattttgtcatttctaaccctgtcatgt 19908361  T
Q  398 ctagtcttac 407  Q
    ||||||||||    
T  19908362 ctagtcttac 19908371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 27445743 - 27445686
Alignment:
Q  511 gctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27445743 gctgcccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcacataaaacac 27445686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Original strand, 40568411 - 40568495
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||| |  ||| || ||||||||| |||||||    
T  40568411 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaattacgccatagttttctatcataaaccatattt 40568495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 41560328 - 41560235
Alignment:
Q  464 tctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatc 557  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |  |||||||| ||  || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41560328 tcttaaccgcccaatactccgtatcatacaacatcgctggtctgacagcgttcggatagaattttcctttcaacttaagcggtactttcttatc 41560235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 43423788 - 43423671
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaat 387  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || |||| | || |||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||   |||||| |||||    
T  43423788 gtcttctctctacatggccaaaccacctaagcctagtttccaccatcttttctactataggtgttaccccaactctctctctaatgtggtcatttctaat 43423689  T
Q  388 cctatctggtctagtctt 405  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  43423688 cctatcctgtctagtctt 43423671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 568
Target Start/End: Original strand, 46226603 - 46226776
Alignment:
Q  396 gtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaa 494  Q
    ||||||||| |||||| ||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | || |  || |||||   ||||||||||||    
T  46226603 gtctagtctcaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgctaaacttacttgattctcgtgttggttgttaattgctcaacatttcgtaccatacaa 46226702  T
Q  495 catagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||| ||   | |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| | || |||||||    
T  46226703 catcgtcactatgacagttgtctgatagaatttttctttcaacttaagcactactttcttagcacataaaacac 46226776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4415630 - 4415503
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||   |||| ||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  4415630 caacaacaaccaagtctttttccactaaatggagtcggctacatggatcaaatgatgccataatgttctataaaaaatcatatttagatccaactcattg 4415531  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctc 207  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||    
T  4415530 acctctaaatcttttctaatggtttctc 4415503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 21769712 - 21769768
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21769712 caacaacaaccaagccttatcacactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 21769768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 25715327 - 25715383
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  25715327 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatggatcaaattacg 25715383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28533748 - 28533673
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataa 155  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||    
T  28533748 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcataa 28533673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29577533 - 29577481
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29577533 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 29577481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 52831942 - 52831846
Alignment:
Q  472 gcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  52831942 gcccaacacttcgtatcatacaacattgtcggtctaactgtcgtccgatacaatttttctttcaatttaaatgacactttcttatcgcataaaacac 52831846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1661500 - 1661405
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattc 382  Q
    |||||||||  ||||||| |||| ||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||  ||||||||    
T  1661500 ggtcttctctctacatgctcaaaccatctgagcctattttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctcaaatattgtcattc 1661405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 3777261 - 3777320
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  3777261 caacaacaaccaagcattatcctactaagtgggatcggctacatggatcaaatgacgtca 3777320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 4590533 - 4590588
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4590533 caacaacaaccaaaccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattac 4590588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34444637 - 34444582
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34444637 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaattac 34444582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 39894851 - 39894686
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaat 387  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| |  |||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||| |||| ||||    
T  39894851 gtcttctccgtacatgcccaaaccacctagatctatttt-tcccatcttttctactataggggctaccca-attctctctatgatagtgttattcttaat 39894754  T
Q  388 cctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||| |    |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  39894753 cctatctcatctaatcttgccacttatccaacttaacaacctaatctccactacacttactttattct 39894686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 45510834 - 45510928
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||| || |||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  45510834 caacatcagccaagctttatcccactaagtggggtcggctacatggattaaattacgctatggtgttctatcataaaccatattccgattcaact 45510928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 48431400 - 48431494
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||| | ||   |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  48431400 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtcagctacaaggatcaaattaagccatgatgttttatcacaaaccatatttggatccaact 48431494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19936741 - 19936628
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |  | |||| |||||| || |||||||||||  |||| |||     
T  19936741 caacaacaatcaagtcttatcccactaagcggagtcggctacatggatcaaattacgccgtaatgttctatcattaaccatatttggatctaactcatta 19936642  T
Q  180 acttgtaaatcttt 193  Q
    || | |||||||||    
T  19936641 acatctaaatcttt 19936628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 128
Target Start/End: Original strand, 38758021 - 38758067
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  38758021 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgga 38758067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22175426 - 22175373
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt 135  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22175426 caacaccaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatt 22175373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26016496 - 26016313
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    ||||| |||||| || |||||  || ||||||||| |||||||  |||||||| | |||| | ||||||||||||    | |||  ||||  ||||  ||    
T  26016496 tacatacccaaaccacctaaatctagtttctaccatcttttctcatataggtgttaccccaactctctctctaatgccattatttataattatatcctgt 26016397  T
Q  398 ctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttga--ttcttgtgtggctctttaccgcccaacac 480  Q
    |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26016396 ctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatctctgctacgcttactttatgttcttgt-tggttctttaccgcccaacac 26016313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44751765 - 44751677
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || ||||||||    
T  44751765 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggat 44751677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 2914124 - 2914180
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||| ||||    
T  2914124 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaagtacg 2914180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 4318846 - 4318898
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4318846 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 4318898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 15438800 - 15438878
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  15438800 acaacaaccaagccttat-ctactaagtggggtcggctacatgcatcaaataacgtca-ttttctatcataaaccatattt 15438878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Original strand, 19908040 - 19908092
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19908040 aacaatcaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggataaaattacg 19908092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26299349 - 26299293
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26299349 caacagcaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 26299293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41165563 - 41165511
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41165563 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 41165511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42337837 - 42337785
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  42337837 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaat 42337785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 51585025 - 51584981
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  51585025 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtctgctacatg 51584981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52292321 - 52292265
Alignment:
Q  81 ccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  52292321 ccaacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggttacatggatcaaattac 52292265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 52815155 - 52815100
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  52815155 caacaacaaccaagccttatcct-ctaagcggggtcggctacatggatcaaattacg 52815100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Original strand, 7762445 - 7762575
Alignment:
Q  89 aaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgta 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||  || |||||||  ||   |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||| || | ||    
T  7762445 aaccaagccttatcctattaagtgtaaacggttacataaatcaaattacaccataatgttctattataaaccatatttagatccaactcattaacatcta 7762544  T
Q  187 aatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7762545 aatcttttctaatagtttctcttatagtttt 7762575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 12930312 - 12930406
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||||||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12930312 caacaacaaccaatccttattttgctaagtggggttggctacacggatcaaattacgtcataatcttctatcataaatcatatttggatccaact 12930406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 36339805 - 36339860
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    ||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36339805 caacaacaaccaagcattttcccactaagtggagtcagctacatggatcaaattac 36339860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2544874 - 2544820
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2544874 caacaacaaccaagccttttaccactaagtggggtcggctacatggatcaaatta 2544820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 7133303 - 7133357
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  7133303 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcagctacatggatcaaatta 7133357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 571
Target Start/End: Original strand, 11331415 - 11331561
Alignment:
Q  426 tcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaa 524  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| || |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||   ||||| || |||| |||| ||    
T  11331415 tcctcatctccgctatgctaacttgattcttgtgttggttcctagccgcacaacactctgtaccatacaacatcgtcaatctgattgttgtctgatataa 11331514  T
Q  525 cttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccta 571  Q
     ||| ||||||||||||   |||| || ||||| || ||||||||||    
T  11331515 ttttcctttcaacttaatcagtacatttttatcacataaaacaccta 11331561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 571
Target Start/End: Original strand, 11489436 - 11489582
Alignment:
Q  426 tcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaa 524  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| || |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||   ||||| || |||| |||| ||    
T  11489436 tcctcatctccgctatgctaacttgattcttgtgttggttcctagccgcacaacactctgtaccatacaacatcgtcaatctgattgttgtctgatataa 11489535  T
Q  525 cttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccta 571  Q
     ||| ||||||||||||   |||| || ||||| || ||||||||||    
T  11489536 ttttcctttcaacttaatcagtacatttttatcacataaaacaccta 11489582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 217
Target Start/End: Original strand, 27520271 - 27520345
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  27520271 tgttctatcataaatcatatttggatccagctcattaatctctaaattttttctaatagtttctcttatagtttt 27520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 31434315 - 31434369
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31434315 caacaacaaccaagctttatctcactaagtgaagtcggctacatgaattaaatta 31434369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39140794 - 39140669
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||| |  | |||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  39140794 acaacaaccaagcattatcccactaagtggggtcggctacatgaatcaaattacgccataatgttctatctgaaaccatatttggatccaactaattaac 39140695  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctc 207  Q
     | ||||| |||  |||| |||||||    
T  39140694 ctctaaatttttcctaatagtttctc 39140669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 49377577 - 49377535
Alignment:
Q  87 acaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  49377577 acaaccaagccttatcccactaactggagtcggctacatggat 49377535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 212
Target Start/End: Original strand, 52739515 - 52739644
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatc-ataaatcatatttggattcaacttattgact 182  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||| || |||||| ||||   |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  52739515 aacaatcaagccttatgctactaggtgaagttggctacatgaatcaaattaagtcataatgttctatccataaattatatttggattcaactcattaacc 52739614  T
Q  183 tgtaaatcttttttaatggtttctcttata 212  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  52739615 taaaaatctttcctaatagtttctcttata 52739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Original strand, 52878368 - 52878446
Alignment:
Q  148 tatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||| || | |||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||    
T  52878368 tatcataaatcgtagttggattcaactcattaacctctaaatcttttataataattactcttataattttcctaagtct 52878446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 9599511 - 9599584
Alignment:
Q  196 taatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctact 269  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||| | |||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  9599511 taatagtttctcttgtagtttttctaggtcttcctctacctcttatgatctgactctcctccatctgatctact 9599584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Original strand, 12262000 - 12262060
Alignment:
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctc 435  Q
    |||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  12262000 gtgtcatttctaaatctatctcgtctagtcttaccacatatcaa-tgtaacatcctcatctc 12262060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Original strand, 48431619 - 48431688
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccc 357  Q
    ||||||||  |||||||||||| || |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  48431619 gtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataggggctacccc 48431688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 129
Target Start/End: Original strand, 50830637 - 50830682
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  50830637 acaacaaccaagccttaccccactaagtggggtcggctacatggat 50830682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3059594 - 3059554
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3059594 caacaacaaccaagccttatcccaccaagtggagtcggcta 3059554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3862926 - 3862890
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3862926 aacaaccaagccttatcccaataagtggtgtcggcta 3862890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4380240 - 4380189
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4380240 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtgg-gtcggctacatggataaaat 4380189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7814720 - 7814656
Alignment:
Q  148 tatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttata 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7814720 tatcataaatcgtatttagatcaaacttattaatttctaaatcttttttaatagtttcttttata 7814656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Original strand, 8676971 - 8677007
Alignment:
Q  185 taaatcttttttaatggtttctcttatagttttccta 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8676971 taaatcttttttaatagtttctcttatagatttccta 8677007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 10569072 - 10569124
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  10569072 caacaacaaccaagccttatccctttaagtggaaccggctacatggatcaaat 10569124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 32111990 - 32112046
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  32111990 caacaacaaccaagccttttccaactaagtgggttcggctacattgatcaaattacg 32112046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 393
Target Start/End: Original strand, 36624112 - 36624184
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatc 393  Q
    |||||||||| | ||||||||||  | || || |||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36624112 tattttctacaatcttttctactgcaagtactaccccaactctctctctaatggtgtcattcctaattctatc 36624184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 38877344 - 38877396
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  38877344 caaccacaaccaagccttatcccactaagtgggttcggctacatggatcaaat 38877396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51812584 - 51812472
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||| |||| |||||||||||||| || | |||| | |||||||||||    |||||| |||||| ||||  ||    
T  51812584 tacatgcccaaatcacataagcctagtttccaccatcttttctactatagttgttaccccaactctctctctaaagtagtcatttctaatcttatcgtgt 51812485  T
Q  398 ctagtcttaccac 410  Q
    ||| |||||||||    
T  51812484 ctaatcttaccac 51812472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 102)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 82 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 43281955 - 43281466
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  43281955 caacaacaaccaagccttgtcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 43281856  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  43281855 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacaa 43281756  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  43281755 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggt 43281658  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  43281657 gtcattcctaatcctatattgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatccccgctacacttactttactcttgcgttggctcttaaccgcc 43281558  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 566  Q
    |||||| | |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281557 caacactctgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 43281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 82 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 34869701 - 34869210
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  34869701 caacaacaaccaagccttatcccactaattagggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 34869602  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||||| ||||  |||||||| ||||||  |    
T  34869601 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctccaccattggatctactcttcttacca 34869502  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  34869501 cggcatttacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 34869402  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  34869401 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctactacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 34869302  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 566  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869301 caacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 34869210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 12841276 - 12841771
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  12841276 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccaaatttggatacaactcattg 12841375  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  12841376 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 12841475  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |     
T  12841476 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctctctaatggg 12841575  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||| ||    
T  12841576 gtcattcctaatcctatcatgtctagttttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacc 12841675  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841676 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcagactgctgtacgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 12841771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 88 - 570
Target Start/End: Original strand, 35906208 - 35906697
Alignment:
Q  88 caaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgt 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |      
T  35906208 caaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattgacctcg 35906307  T
Q  186 aaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca- 284  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||     
T  35906308 aaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatatgatatactcttcttaccacggcat 35906407  T
Q  285 ---cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcatt 381  Q
       |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  35906408 ctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctctctaatggtgtcatt 35906507  T
Q  382 cctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacac 480  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||| ||||||||    
T  35906508 cctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacac 35906607  T
Q  481 accgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
     ||||| |||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906608 tccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 35906697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 11594241 - 11593746
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  11594241 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 11594142  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  11594141 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 11594042  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
     ||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||    
T  11594041 tggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaaccgtattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctcaaatggt 11593942  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||| |    
T  11593941 gtcattcctaatcttatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtc 11593842  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11593841 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacct 11593746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 82 - 568
Target Start/End: Original strand, 33349807 - 33350300
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||| ||  ||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  33349807 caacaacaaccaagccttatcccattaagtgaggtcggctacatggatcaaatgacgctatagtgttctactatacaccaaatttggatccaactcattg 33349906  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  33349907 acctctaaatcatttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 33350006  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||    
T  33350007 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctagcaacttttctactataggtgcaacccccactctctctctaatggt 33350106  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  33350107 gtcattcttaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaaggcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 33350206  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33350207 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctgtcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 33350300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 197 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 31005387 - 31005009
Alignment:
Q  197 aatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    ||||||||    
T  31005387 aatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaccacggcatctacgggtctt 31005288  T
Q  293 ctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctat 392  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31005287 ctctctacatgcccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgttattcctaatcctat 31005188  T
Q  393 ctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccata 491  Q
    |  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  31005187 cctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccata 31005088  T
Q  492 caacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005087 caacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 31005009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 82 - 567
Target Start/End: Original strand, 39906373 - 39906868
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||    
T  39906373 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaagtcattg 39906472  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||  |||||| ||||||||| ||||||  |    
T  39906473 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactc--ctccatttgatctactcttcttacca 39906570  T
Q  280 cggcac----gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    || ||     ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||    
T  39906571 cgacatctatgggtcttctctctacatgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctctaatggt 39906670  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatc-----ctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctcttta 469  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||     |||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |    
T  39906671 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcagcatcctcatctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaa 39906770  T
Q  470 ccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906771 tcgcctaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 39906868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 83 - 570
Target Start/End: Original strand, 46355858 - 46356347
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  46355858 aacaacaaccaagccttatctcactaagtggggtcggctacatggatcaaatgatggcatagtgttctatcatacaccagatttggatccaactcattga 46355957  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgac 280  Q
    | | |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| || | |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  46355958 cctttaaatcctttctaatggtttctttaatagttttcctaggttttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaccac 46356057  T
Q  281 ggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtg 376  Q
      ||    || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  46356058 aacatctacgtgtcttctctctacatgcccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccattctctctctgatggtg 46356157  T
Q  377 tcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgccc 475  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |  ||||||||| |||||| |||||    ||||||||||  || || ||||| |||||||    
T  46356158 tcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcattcaacgcaacatcc-catctctgctac----acttgattctcatgttgactcttaaccgccc 46356252  T
Q  476 aacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46356253 aacactccgtaccatacaacaatgccggtctgactactgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcgcacaaaacacct 46356347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 49029556 - 49029067
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  49029556 caacaacaacca-gccgtatcccactaagtggggttggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 49029458  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| |  |||||  |    
T  49029457 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctattcgtcttacca 49029358  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  49029357 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 49029258  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  49029257 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgtaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 49029158  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||     |||  |||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49029157 caacactccgtaccatacaacaacaccggttggactgctgtccgatagaactttcctttc-----aagtggtattttcttatcgcacaaaacacct 49029067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 36652273 - 36651780
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  36652273 caacagcaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggattcaactcattg 36652174  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  |||| ||||| || ||||||||| ||||||  |    
T  36652173 acctctgaatcctttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctctacctcttttaacttgactatcctctatttgatctactcttcttacca 36652074  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||| | | ||||||||| ||    
T  36652073 cggcatctacgggtcttctctctacatgctgaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatggatgc--cacccctaccctctctaatggt 36651976  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  36651975 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgttacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 36651876  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651875 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcggattgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 36651780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 37618226 - 37617811
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  37618226 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacaccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaacttattg 37618127  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  37618126 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 37618027  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttatttt-ctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  37618026 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctatttttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatgg 37617927  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgc 473  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||| |||||    
T  37617926 tgtcattcctaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttgcttgattctcatgttgactcttaaccgc 37617827  T
Q  474 ccaacacaccgtacca 489  Q
    |||| || ||||||||    
T  37617826 ccaagactccgtacca 37617811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 38607273 - 38606790
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  38607273 caacaacaaccaagccttaacccactaagtggagtcggctacatggatcaaacgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 38607174  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||| |||||  || |||||    |||||||      ||   ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |    
T  38607173 acctctaaatcctttctaatggttt-tcttag-gtcttcct----ctccctc------ttctaacgtgactctcctccatttgatctactcttctaacaa 38607086  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |    
T  38607085 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacctttctactataggtgctacccccactctctct-taatgtt 38606987  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||    
T  38606986 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacattatcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcc 38606887  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccta 571  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38606886 caacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccta 38606790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 82 - 460
Target Start/End: Original strand, 45836483 - 45836865
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  45836483 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 45836582  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |   |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  45836583 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttgtcctaggtctccctctacctcata--acctaactctcctccatttgatctactcttcttacaa 45836680  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  45836681 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 45836780  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  45836781 gtcattcctaatcctatcttgtctactcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctgcacttacttgactctcgtgt 45836865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 446
Target Start/End: Original strand, 44855175 - 44855543
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||  ||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  44855175 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggaccaaattacgccatagtgttatcataaaccaaatttggatccaactcattgac 44855274  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |  |||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44855275 ctctaaatcttttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacttcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttatgacg 44855374  T
Q  282 gca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgt 377  Q
    |||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  44855375 gcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtactatccccactctctctctaatggtgt 44855474  T
Q  378 cattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44855475 cattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccagcacaacatcctgatctctgctacactta 44855543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 205 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 33073108 - 33072742
Alignment:
Q  205 ctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttac 300  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||| ||    |||||||||||  |||    
T  33073108 ctctgatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactcttctccatttgatctactcttcttaccacgacatctacgggtcttctctctac 33073009  T
Q  301 atgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtcta 400  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33073008 atgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcttgtcta 33072911  T
Q  401 gtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatag 499  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  ||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |    
T  33072910 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctctgctacacttatttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacaacg 33072811  T
Q  500 taggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
      ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072810 ccggtctaactgttgtccgatagaactttccttttaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 33072742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 43491589 - 43491210
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43491589 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatgaaattacatcatagtgttctatcataaatcatatttggatccaacttattg 43491490  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  43491489 acctctaaattctttctaatggtttctcttataattttcctaggtcttcctctacctcttttgacctgactctcctccatctgatcaactcttcttacga 43491390  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| | |||||| | ||| ||    
T  43491389 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaatttttatactataggtgttacccctactctctccccaatggt 43491290  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| || ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43491289 gtcattcctaatcatatcccatctaatcttaccgctcatccagcacaacatcctcatctcggctacacttactagattct 43491210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 141 - 544
Target Start/End: Original strand, 13859070 - 13859476
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||| | | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||     
T  13859070 agtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattggcctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttc 13859169  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactt 336  Q
      ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  13859170 taacttgactctcctccatttgatctactcttcttacgacagcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaactt 13859269  T
Q  337 ttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctcc 436  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||     
T  13859270 ttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcgtccaacgcaacatcctcatctct 13859369  T
Q  437 gctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttca 535  Q
    |||  |||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||  |  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  13859370 gct--acttacttgattctcgtgttaactcttaaccgcccaacattccgtaccaaacaacactgccggtctaactgctgttcaatagaactttcctttca 13859467  T
Q  536 acttaagtg 544  Q
    |||||||||    
T  13859468 acttaagtg 13859476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 249 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 7273151 - 7272825
Alignment:
Q  249 ctctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctacta 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || | |||||    | |||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7273151 ctctcctccatctgatctactcttcatacggcggcatctacaggtcttctctgtacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctacta 7273052  T
Q  345 taggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacact 444  Q
    |||||| | | ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  7273051 taggtgatactcccgttctctccctaaaggtgtcattcctaatcctatcccgtgtagtcttaccgctcatccagcacaacatcctcatctccggtacact 7272952  T
Q  445 tacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagt 543  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  7272951 tacttgattctcgtgttggctctcaaccgcccaacactctgtatcatacaacattgtcggtttgactgctgaccgatacaactttcctctcaacttaagt 7272852  T
Q  544 ggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7272851 ggtactttcttatcacacaaaatacct 7272825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23404697 - 23404204
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||| | |||| |||||||  ||   |||| ||||||| | |||||||||||  |||| ||||    
T  23404697 caacaacaactaaaccttatcctatcaagtgg-gtcggctatacggataaaattacaccataatgttctatcatacaccatatttggatcaaactcattg 23404599  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |  | |||||   || ||||||||||| ||||| |||||||| |||| | || | |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23404598 atctataaattaattgtaatggtttcttttataattttcctaggtcttcttctacctcttttgacctgactctcctccatttgatctactcttcttatga 23404499  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    || ||    || ||||||    |||||||| || |  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||| ||    
T  23404498 cgacatctacgagtcttcaatctacatgccaaactg-tctaagcctattttctcccaacttttctactataagtgttacccccactctctccctaatggt 23404400  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  23404399 gtcattcctaatcctatcatgtatagtcttaccgctcatccagcgcaacatcctcatttccaatacacttacttgattctcgtgctggcttttaaccgcc 23404300  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||| ||  |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  23404299 caaaacttcgtaccatacaatatcgtcggtctgactgttgtccgatagaattttcctttcaacttaagtggtcctttcttatctcagaaaacacct 23404204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 321 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 32630630 - 32630383
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||      
T  32630630 tattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctccaatggtatcat-cctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccagct 32630532  T
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||    
T  32630531 caacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgtcggtctgattgatgtccga 32630432  T
Q  520 tagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32630431 tagaactttcctttcagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacac 32630383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 371
Target Start/End: Original strand, 2885723 - 2886018
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  2885723 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacaccatagtgttctatcataaaccatatttgggtccaactcattg 2885822  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    ||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  2885823 accactaaatcatttctaatggtttctcttatagttttcctaggtcttcttctacctcttttgacctgactctcctccatctgatctactcttcgtacaa 2885922  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaa 371  Q
    ||||    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  2885923 cggcatctacggatcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctccctaa 2886018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29650665 - 29650349
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||| ||||    
T  29650665 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccttagtgttctatcaaaaaccatatttggatcaaactcattg 29650566  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || || | |||  | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  29650565 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggttttcctttacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacaa 29650466  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||    
T  29650465 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaatttttctactataggtgctgcccccactctctctcgaatggt 29650366  T
Q  376 gtcattcctaatcctat 392  Q
    |||||||||||||||||    
T  29650365 gtcattcctaatcctat 29650349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 454
Target Start/End: Original strand, 35559075 - 35559373
Alignment:
Q  161 atttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatc 260  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||||||||||     
T  35559075 atttggatccaactcattgacctctaaatcttttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatt 35559174  T
Q  261 tgatctacttttcttatgacggcac----gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactat-aggtgcttcc 355  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||     ||||||||||  || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  35559175 tgatctactcttcttaccacgacatctaggggtcttctcactaaatgtccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataaggtgctacc 35559274  T
Q  356 cccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattc 454  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  35559275 cccactctctctcaaatggtgtcattcctaatcctatcaaatctgatcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttactacacttacttgattc 35559373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 352
Target Start/End: Original strand, 31682603 - 31682879
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| || || ||||| ||| | ||||    
T  31682603 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccaaatatggatccaattcattg 31682702  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||   ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31682703 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttctaacttgactctcctccatttgatctactcttcttatga 31682802  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgct 352  Q
    |||||    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31682803 cggcatctacgggtcttctctctacatacccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatatgtgct 31682879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6375147 - 6374833
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| |  | |||||||| ||||| | ||||    
T  6375147 acaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacactaaatttggatccaactcactgac 6375048  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||  || |||||| ||| ||||||||  ||||||  ||     
T  6375047 ctctaaattctttctaatggtttctctaatagttttcctagatcttcctctacctcttttaacttgattctcctacatttgatctacccttcttaccaca 6374948  T
Q  282 gca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgt 377  Q
    |||    | |||||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  6374947 gcatctactggtcttctctctacatgctcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgt 6374848  T
Q  378 cattcctaatcctat 392  Q
    |||||||||||||||    
T  6374847 cattcctaatcctat 6374833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 361 - 566
Target Start/End: Original strand, 36869575 - 36869781
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  36869575 tctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtccagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattcacgtgt 36869674  T
Q  461 gg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgc 559  Q
     | |||||   ||| |||||  |||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869675 tgactcttagtcgctcaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgc 36869774  T
Q  560 acaaaac 566  Q
    |||||||    
T  36869775 acaaaac 36869781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22349901 - 22349625
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||  || || ||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  22349901 caacaacaatcaagccttatcccactaagtggggtcgactacatggatcaaatgacgccatagtattctatcatataccaaatttggatccaacttattg 22349802  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  22349801 acctttaaatcctttttaatggtttctctaatagttttcctagttcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 22349702  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgct 352  Q
     | |    ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349701 tgacaattacgggtcttctctctacatgccaaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgct 22349625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7273381 - 7273192
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  7273381 caacaacaatcaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgtcatagtgctatatcataaaccatatttgaatccaactcattg 7273282  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctact 269  Q
    || | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  7273281 acctctgaatattttctaatggtttctcttatagttttcataggtcttcctctacctcttttgacctgactctcctccatccaatctact 7273192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Original strand, 40979929 - 40980089
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  40979929 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 40980028  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  40980029 acctctaaatcttttctaatagtttctcttatagttttcctaggtcttcctctacctcttt 40980089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15682455 - 15682184
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15682455 caacaactaccaagctttatctcactaagtggggttggctacatggatcaaagtacgccatagtgttctatcataaatcatatttggatccaacttattg 15682356  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  ||| | |||||| |||  |||| ||||| || ||||||||| |||||| ||    
T  15682355 acctctaaatcctttctaatgatttctcttatagttttcctaggtttttctccacctcttttgacttgactttcctcaatttgatctactcttcttacga 15682256  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactatag 347  Q
    ||||    | || |||||||  ||| |||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15682255 cggcatctatggatcttctctctacctgcctaaaccatctaagcctatttcctaccaacttttctactatag 15682184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 358
Target Start/End: Original strand, 36869238 - 36869527
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggatta-------aattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |       ||| ||| ||  ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||    
T  36869238 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggggtcggctacatggatcatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaatcaaatttgaatctaa 36869337  T
Q  173 cttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctactttt 272  Q
    || |||||| | |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| | |||| |||| | || ||   ||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  36869338 ctcattgacatctaaatcctttctaatggtttctttaatagttttcccaggtcttcctctacctattctaacttgactctcctccatttgatctactctt 36869437  T
Q  273 cttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccc 358  Q
    ||| |||| |||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36869438 cttctgacagcatctacgggtcttctctctacatgaccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccc 36869527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 570
Target Start/End: Original strand, 7189449 - 7189728
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca--------ttctctctctaattgtgtcattcctaatcc 389  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |        ||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  7189449 tacatgcccaaaccacctaagcttattttctaccatcttttctactataggtgcgaccccaactctctctttctctctctaatggtgtcattcata-tcc 7189547  T
Q  390 tatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgtacc 488  Q
    ||||| ||||| |||||||  | ||  |   |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||| | |||||    
T  7189548 tatctcgtctaatcttaccggtcattcaacacaacatcctcatctccactatgcttacttgatttttgtgttggttcttaaccacccaacactctgtacc 7189647  T
Q  489 atacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| | ||| || || |||||||| ||||||  ||||||||||||  | |||||||||    
T  7189648 atacaacatcgtcggtctgactactgt-ctataaaatttctctttcaatttaagtaatactttcttatcaaataaaacacct 7189728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 482 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 37616790 - 37616704
Alignment:
Q  482 ccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37616790 ccgtaccatacaacaatgtcggtctgactgctggccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 37616704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27649061 - 27648937
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg--tcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  27649061 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccacagtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 27648962  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggttt 204  Q
    || | |||||||||| |||||||||    
T  27648961 acctctaaatcttttctaatggttt 27648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 284
Target Start/End: Original strand, 31681022 - 31681222
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  31681022 aacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgtcatagtattctatcataagccatatttggatccaactcattga 31681121  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgac 280  Q
    |   |||||| ||| ||||||||||||   || |||||||| ||||||||| | || |||  | | ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  31681122 cccttaaatcctttctaatggtttctc---taattttcctaggtctccctctacctgttttaaactgactctcttccatttgatcaactcttcttacgac 31681218  T
Q  281 ggca 284  Q
    ||||    
T  31681219 ggca 31681222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38900237 - 38900078
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||  |||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  38900237 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgg-gtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttcaatcatacaccaaatttggatccaactcattg 38900139  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  38900138 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttt 38900078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 239
Target Start/End: Original strand, 9210705 - 9210864
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  9210705 caacaacaacgaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaattacgccataatgttgtatcataaaccatatttggatccaactcatta 9210804  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctt 239  Q
    || | ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  9210805 acctctaaatttttcctaaaagtttctcttatagttttcctaggtcttcctcaacctctt 9210864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48919393 - 48919246
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||  ||| | ||||||||| |||||||||||  |||| ||||    
T  48919393 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggggtcgactacatggatcaaatgacgccatagtggtttatcataaaccatatttggatcaaactcattg 48919294  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctc 227  Q
    || | |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  48919293 acctctaaatcatttctaatggtttttctaatagttttcctaggtctc 48919246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36136982 - 36136711
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttgg 242  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||| || | |||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |  ||||  |    
T  36136982 tgttctatcataaaccatatttggatccaattcattaacatctaaatctttccaaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctctacttcttctg 36136883  T
Q  243 acccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggcacg----ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactttt 338  Q
    | | |||||||||||||||||||| || ||| ||  ||  ||      ||| |||||  || |||||||||  | ||||   |||||||||||| |||||    
T  36136882 atctgactctcctccatctgatctgctcttcgtactacaacatctataggtattctctctatatgcccaaacaacctaagactattttctaccatctttt 36136783  T
Q  339 ctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  36136782 ctactataggtgctaccccaactctctctctaatggtgtcattcctaaacctatcccttctagtcttaccac 36136711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 269
Target Start/End: Original strand, 28627936 - 28628123
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| || ||||| || ||||| ||| |     
T  28627936 acaacaactaagccttatcccactaagtggagtcggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccacatttgcatccaactcattaat 28628035  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctact 269  Q
     | |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||  ||   |||| ||||||||| ||||||||    
T  28628036 ctctaaatctttcctaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctctacctcttgtgatttgactatcctccatcggatctact 28628123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 393
Target Start/End: Original strand, 46014392 - 46014498
Alignment:
Q  286 gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattccta 385  Q
    ||||||||||  |||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  46014392 gggtcttctctctacatgtccaac-catctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgcaacccccactctctctctaatggtgtcatttcta 46014490  T
Q  386 atcctatc 393  Q
    ||| ||||    
T  46014491 atcttatc 46014498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45601755 - 45601606
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||   || ||||||||||| |||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |     
T  45601755 acaacaaccaagccttatcccactaagtgagttcagctacatggatcaaattacaccatagtgttctatcataaatcatattttgatccaactcattaat 45601656  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
     | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  45601655 ctctagatctttcttaatggtttctcttatagtttttctaggtcttcctc 45601606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 276
Target Start/End: Original strand, 24598189 - 24598384
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||| | | ||   | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24598189 caacaacaaccaagtcttatcccattaaatg-agtcggctacatggatcaaatgatgccaaaatattctatcaaaaatcatatttggattcaactcattg 24598287  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  24598288 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatgattttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactcaccttcatttgatctactcttctta 24598384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32631845 - 32631721
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |  || ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  32631845 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaatgacgccatagcgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 32631746  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggttt 204  Q
    || | |||||||||| |||||||||    
T  32631745 acctctaaatcttttctaatggttt 32631721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 175
Target Start/End: Original strand, 28208329 - 28208424
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaactt 175  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28208329 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactt 28208424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 299 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 47848732 - 47848524
Alignment:
Q  299 acatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtc 398  Q
    ||||||||||| || |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||  | ||| | || ||||||||  |||    
T  47848732 acatgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataggcgctaccccaactctctctctaatgttatcacttctgatcctatcccgtc 47848633  T
Q  399 tagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
    ||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||| |||| ||| |||||||| || | |||| || |||    
T  47848632 tagtcttaccacacatccaacacaacatcctcatctcccctagacttattttattctcgtgttggttcttaaccacccaacactccattccattcatcat 47848533  T
Q  498 agtaggtct 506  Q
    ||| |||||    
T  47848532 agtcggtct 47848524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 21517444 - 21517527
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21517444 tgttatatcataaatcatatttggatccaacttattaatctctaaatattttttaatagtttctcttatagtttttctaggtct 21517527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 42187537 - 42187368
Alignment:
Q  290 cttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcc 389  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||  || |||| |||||      
T  42187537 cttctctttacatgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctattataggtgctaccccgactctctttctaatgctgccatttctaat-a 42187439  T
Q  390 tatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    ||||  |||||||||||| ||  ||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  42187438 tatcccgtctagtcttactacacatccaacacaacatcctcatctccgctacgcttactctattcttgtgt 42187368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21078198 - 21078070
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||| ||| |  | |||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  21078198 caacaacaaccaagccttatcccactaaatgaagtcggctacatggatcaaatgacgccataatgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 21078099  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctct 208  Q
    || | |||||||||  |||||||||||||    
T  21078098 acctctaaatctttactaatggtttctct 21078070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 446
Target Start/End: Original strand, 36514430 - 36514576
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||||||||| || ||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  |||| || ||||| |||||  ||    
T  36514430 tacatgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgctaccccaa--ctctctctaatgttgtcctttctaattctatcccgt 36514527  T
Q  398 ctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
     ||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36514528 ttagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatctctgctacactta 36514576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 539
Target Start/End: Original strand, 25579290 - 25579536
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttc-ccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    ||||||||  ||||| |||||| || |||| | ||||||| ||||  |||||| |||| |||||| | |||||  |||||||||||   |||||| ||||    
T  25579290 gtcttctctctacatccccaaaccacctaagcctattttccaccattttttctgctatgggtgctactcccca--ctctctctaatgtggtcatttctaa 25579387  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgt 485  Q
    ||||||||     ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||| || |||| |||||||||||  ||||    
T  25579388 tcctatct-----agtattaccacacatccaacgcaacatcctcatctcctctacgcttattttattctcgtgttggttcttaaccgcccaacattccgt 25579482  T
Q  486 accatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaactt 539  Q
     ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  25579483 tccatacaacatcgccggtcttacagctgtccgatagaattttcccttcaactt 25579536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39811979 - 39811873
Alignment:
Q  335 ttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatct 434  Q
    |||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| |    
T  39811979 ttttctatgataggtgctgccccaactctctctctaatgttgtcatttctaatcctatcacgtctagtcttaccacacatccaaagcaacatcctcatat 39811880  T
Q  435 ccgctac 441  Q
    |||||||    
T  39811879 ccgctac 39811873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44951436 - 44951307
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||| |||||| | | |||||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||  || | ||||    
T  44951436 caacaacaaccaaaccttataccactaagtattgtcggctacatggatcaaattacgtcatagtgttctatcataaataatatttgaatctaagtaattg 44951337  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctctt 209  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  44951336 acttttaaatattttctaaaggtttctctt 44951307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Original strand, 34035155 - 34035255
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  34035155 caacaacaaccaagcctaatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatgaaccatatttggatccaactcattg 34035254  T
Q  180 a 180  Q
    |    
T  34035255 a 34035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 513 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 48919231 - 48919174
Alignment:
Q  513 tgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48919231 tgtccgatataaccttcctttcaacttaaggggtactttcttatcgcacaaaacacct 48919174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14057759 - 14057625
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||  |  | |||| ||||||||| |||||||| ||  |||  |||     
T  14057759 caacaacaactaagccttatcctactaagtggggttggctacatggatcaaattaccccataatgttctatcataaaccatatttgaatcgaacgcatta 14057660  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagt 214  Q
    || | |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  14057659 acctctaaatctttcctaatagtttctcttatagt 14057625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14367787 - 14367653
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||  |  | |||| ||||||||| |||||||| ||  |||  |||     
T  14367787 caacaacaactaagccttatcctactaagtggggttggctacatggatcaaattaccccataatgttctatcataaaccatatttgaatcgaacgcatta 14367688  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagt 214  Q
    || | |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  14367687 acctctaaatctttcctaatagtttctcttatagt 14367653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25891169 - 25891114
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25891169 caacaacaaccaagccttatcgtactaagtggggtcggctacatggatcaaattac 25891114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33103207 - 33103113
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  33103207 caacatcagccaagccttatcctactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgctatggtgttctatcataaaccatattccgattcaact 33103113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 36101778 - 36101872
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  36101778 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcaactacatggatcaaattacgtcataatgttctatcataaaccatattttgatccaact 36101872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 8492479 - 8492569
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  8492479 tattttctaccatcatttttactataggtgttaccccaaatctctccctaatggtgtcattcgtaatcctatcccgtctagtcttgccact 8492569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 43282477 - 43282325
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct---aattgtgtcattcct 384  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |||| | || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||   |||  ||||||| ||    
T  43282477 gtcttctctctacatgcccaattcacctaagcctagtttccaccgacttttctactataggtgctaccccaactctctctctctaaatgttgtcatttct 43282378  T
Q  385 aatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccg 437  Q
    |||| ||||  |||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  43282377 aatcatatcatgtctagacttaccacacatctaacgcaacatcctcatatccg 43282325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6263539 - 6263486
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6263539 aacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatta 6263486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28708662 - 28708606
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28708662 caacatcaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 28708606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31005486 - 31005434
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31005486 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 31005434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 31869103 - 31869155
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31869103 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 31869155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42187722 - 42187666
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  42187722 caacaacaacaaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 42187666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1011327 - 1011272
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  1011327 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaattac 1011272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 441
Target Start/End: Original strand, 19262645 - 19262797
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  ||||||| |||| || |||| |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||  ||||||| ||||    
T  19262645 ggtcttctctctacatgctcaaaccacctaagccaagtttctaccatcttttctacaataggtgctaccccaa--ctctctctaatattgtcatttctaa 19262742  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctac 441  Q
      |||||  ||||||| ||||||| |||||   | ||||||||||||||| ||||    
T  19262743 ctctatcatgtctagtattaccacatatcacacgtaacatcctcatctccactac 19262797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48515556 - 48515475
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcata 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  48515556 caacaaaaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacacggatcaaattacgtcatagtgtactatcataaatcata 48515475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14594033 - 14593984
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggatta 131  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  14594033 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgaatta 14593984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16013556 - 16013507
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggatta 131  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  16013556 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgaatta 16013507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5418355 - 5418299
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  5418355 caacaacaaccaagccttatcccactaaatggggtcgactacatggatcaaattacg 5418299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15681292 - 15681216
Alignment:
Q  422 aacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15681292 aacattctaatctccactacacttacttgagtctcgtgttggctcttaaccgcccaacactctataccatacaacat 15681216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 17907725 - 17907781
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17907725 caacaacaaccaagtcttatcctgctaaatggggtcggctacatggatcaaattacg 17907781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 21244284 - 21244328
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21244284 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatg 21244328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Original strand, 24177628 - 24177714
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttgga 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||| ||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24177628 caacaacaaccaagctttatcctactaagtggggttggctacatgga-tcaatgacgccatagtgttctatcataaaccatatttgga 24177714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 369
Target Start/End: Original strand, 27021906 - 27021986
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct 369  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||| | || |||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  27021906 tcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctagttttcaccaacttttctactataggtgctaccccaactctctctct 27021986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 29318796 - 29318852
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  29318796 caacaacaaccaagccttatcccactaagctgggtcggctacatggatcaaattacg 29318852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 34746028 - 34745984
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  34746028 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatg 34745984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35922471 - 35922407
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctc 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||| ||||| |||||||    
T  35922471 tgttctatcataaatcatatttagattcaactcattaacctctaaatctttcttaatagtttctc 35922407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40169708 - 40169640
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctc 366  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40169708 tacatgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataagtgctaccccaattctctc 40169640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40630715 - 40630663
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40630715 caacaacaaccaagccttttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 40630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47652828 - 47652772
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  47652828 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacagggatcaagttacg 47652772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 20158672 - 20158727
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  20158672 caacaacaaccaagccttatcccactaagtagggtcagctacatggatcaaattac 20158727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 30814126 - 30814220
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgt--cagtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||||| |||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||   | |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  30814126 caacaactaccaagcctcttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgtgataatgttctatcataaaacatatttcgatccaact 30814220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33073206 - 33073151
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  33073206 aacaaccaagccttatcccactaagtgggatcggctacatggatcaaatgacgtca 33073151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Original strand, 40149016 - 40149067
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt 135  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  40149016 acaacaaccaagccttatcccactaagtggattcggctacatagatcaaatt 40149067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 20525053 - 20525107
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20525053 caacaacaaccgagccttatcccgctaagtggggtcggctacatggatcaaatta 20525107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33732113 - 33732031
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||| ||||| |   | |||| ||||||||| |||||||    
T  33732113 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgggaccggctacatggatcaaattgccataatgttctatcataaaccatattt 33732031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47852366 - 47852312
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47852366 acaacagccaagccttatccccctaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 47852312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 409
Target Start/End: Original strand, 25731638 - 25731687
Alignment:
Q  360 ttctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttacca 409  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25731638 ttctctctctaaaggtgtcattcttaatcctttctcgtctagtcttacca 25731687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 446
Target Start/End: Original strand, 27021992 - 27022077
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||  ||| | |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  27021992 tctctctctaatgttgtcatttttaatcctatcctgtctagtcttatcacacatccaatgcaacattctcattgccgctacactta 27022077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28021216 - 28021171
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgg 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  28021216 caacaacaaccaagccttatcccaccaagtggagtaggctacatgg 28021171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Original strand, 34029676 - 34029733
Alignment:
Q  81 ccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  34029676 ccaacaacaaccaagccttatcccacttggtggggttggctacatggatcaaattacg 34029733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 39738445 - 39738490
Alignment:
Q  81 ccaacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  39738445 ccaacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatg 39738490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12966095 - 12966027
Alignment:
Q  284 acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgct 352  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||| | || |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  12966095 acgggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcatagtttccaccatcttttcttctataggtgct 12966027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12966297 - 12966253
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  12966297 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgggatcggctacatg 12966253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29312270 - 29312214
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  29312270 caacaacaaccaagccttatcccactaagctgggtcggcttcatggatcaaattacg 29312214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42969968 - 42969885
Alignment:
Q  93 aagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta--cgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||  | ||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  42969968 aagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattatacgataatgttcaatcataaaccatatttggatccaact 42969885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 47700057 - 47700112
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47700057 caacaacaaccaagccttttcccaccaagtgg-gtcggctacatggatcaaattacg 47700112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 12492385 - 12492883
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  12492385 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgcatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 12492484  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  12492485 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaaca 12492584  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactatag---gtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||    
T  12492585 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagtaggtgctacccccactctctctctaat 12492684  T
Q  373 tgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttacc 471  Q
     ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||    
T  12492685 ggtgtcattcctaatcttatcctgtctagtcttaccactcatccaacgtaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacc 12492784  T
Q  472 gcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12492785 gcccaacactccgtaccatacaacaaagccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacct 12492883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3302125 - 3301635
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3302125 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccgtagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 3302026  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | | |||| |  |    
T  3302025 acctctaaatcttttataatggtttctctaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgattcattcttctaacaa 3301926  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||    
T  3301925 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggggctaccctcactctctctctaatggt 3301826  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtggctctttaccgccc 475  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |||||||    
T  3301825 gacattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatcaagcgcaacatccccatctccgctacacttactt---tcgtgt-tggctcttaaccgccc 3301730  T
Q  476 aacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3301729 aacacttcgtaccatacaacattgtcagtctgactactgtccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 3301635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 569
Target Start/End: Original strand, 28976860 - 28977352
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  28976860 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgaatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 28976959  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||  |    
T  28976960 acctctaaatcctttataatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctacccttcttacca 28977059  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  28977060 cggcatatacgggtcttctctctacatgcacaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggt 28977157  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||| |   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||    
T  28977158 gtcattcctaatcctatcatttctagttttaccactcatccaacacaacatactcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 28977257  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    |||||| |||||||||||||||  || | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977258 caacactccgtaccatacaacaacgtcgttcggactgatgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 28977352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 564
Target Start/End: Original strand, 16347381 - 16347868
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||| | ||||||    
T  16347381 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtagggtcggctacatggatcaaatgacgccagtgttctatcataaaccatatttgtatccaaatcattgac 16347480  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||   | |    
T  16347481 ctctaaatcttttctaatggtttctttaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttgcaaag 16347580  T
Q  282 gca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgt 377  Q
    |||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |    
T  16347581 gcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccgctctctctctaatggttt 16347680  T
Q  378 cattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgccca 476  Q
    ||||  ||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||| ||    
T  16347681 catttttaatcatatattgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctccgctacacttacttaactctcgtgttggctcttaaccgctca 16347780  T
Q  477 acacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaa 564  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16347781 acactccgtaccatacaatatcgtcggtctgagtgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtaatttcttattgcacaaa 16347868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 1275545 - 1275051
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   |||| ||||| | | || |||||||||||||| |||     
T  1275545 caacaacaactatgccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgtcataatgttctatcaaacaccaaatttggattcaactgatta 1275446  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| | | || |  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  1275445 acctctaaatcctttataatggtttctctaatagtttttctaggtcttcctctacccctgttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 1275346  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  1275345 cggcatttacggatcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccc-actctctctctaatggt 1275247  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| | ||| | ||||||    
T  1275246 gtcattcctaatcctaccatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctatgcttacttgattctcatgttgactcgtaaccgcc 1275147  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275146 caacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 1275051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 83 - 570
Target Start/End: Original strand, 2075475 - 2075970
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||||| || |||| ||| ||  || || ||||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  2075475 aacaacaatcaagccttatcccactaagtggggttggctacatgaatcaaatgacgccatagtattctatcatacaccaaatttggatccaactcattga 2075574  T
Q  181 cttgtaaatcttttt-taatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    | | |||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  2075575 cctctaaatccttttctaatggtttctctaatagttatcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 2075674  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||  |    
T  2075675 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattgtctaccaacttttctactgtaggtgttacccccactctctctctaatgtt 2075774  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || ||||| ||||||    
T  2075775 gtcattcctaatcctatcttgtctagtcttacaactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgcc 2075874  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2075875 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacct 2075970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 10639583 - 10639082
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  10639583 caacaacaaccaagccttatcccacaaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 10639484  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||  |||||| || |||||| ||||||  |    
T  10639483 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactc--ctccatttgttctactcttcttacca 10639386  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactatag-------gtgcttcccccattctctctc 368  Q
     ||||    | |||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||       |||||  ||||| ||||||||    
T  10639385 tggcatctacaggtcttctctctacatgcccaattcatctaagcctattttctaccaacttttctactatagtctataggtgctagccccactctctctc 10639286  T
Q  369 taattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctt 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  10639285 taatggtgtcattcctaatcctattctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactctt 10639186  T
Q  468 taccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639185 caccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgttcgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 10639086  T
Q  568 ccta 571  Q
    ||||    
T  10639085 ccta 10639082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 89 - 568
Target Start/End: Original strand, 1287587 - 1288083
Alignment:
Q  89 aaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgta 186  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || | ||| ||  ||||  ||||||| | || |||||||| ||||| |||||| | ||    
T  1287587 aaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaactgacgccatagtgtactatcatacaccaaatttggatccaactcattgacctcta 1287686  T
Q  187 aatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca-- 284  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||      
T  1287687 aatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaccacggcatc 1287786  T
Q  285 --cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctc----------tctctaat 372  Q
      || ||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||          ||||||||    
T  1287787 tacgtgtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctctctctaat 1287886  T
Q  373 tgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttacc 471  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||    
T  1287887 gatgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacc 1287986  T
Q  472 gcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |  | || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1287987 gcccaacactccgtaccatacaacaacgccgatcggactgctgttcgatagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacac 1288083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 82 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 24178791 - 24178312
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||| ||| |||| | | ||  ||||| ||||||| |  | |||||||| ||||| ||||    
T  24178791 caacaacaaccaagccttatttcattaagtggggtcggctacatagatcaaatgatgccatagtgttctatcatacactaaatttggatccaactcattg 24178692  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |  | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  24178691 aactctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 24178592  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  24178591 cggcatctacgggtcttctctccacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 24178492  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  24178491 gtcattcttaatcctatcatgtatagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 24178392  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||           |||||   || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178391 caaca-----------acaac---gtcggtctgactgctgcccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 24178312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38685242 - 38684932
Alignment:
Q  88 caaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgt 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |    
T  38685242 caaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatattgttctatcataaaccatatttggatccaactcattgacctct 38685143  T
Q  186 aaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca- 284  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||     
T  38685142 aaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacgacggcat 38685043  T
Q  285 ---cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcatt 381  Q
       |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38685042 ctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcatt 38684943  T
Q  382 cctaatcctat 392  Q
    |||||||||||    
T  38684942 cctaatcctat 38684932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4496665 - 4496308
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  4496665 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgatgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 4496566  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  4496565 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 4496466  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||    
T  4496465 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccagcttttctactataggtgctacccccactctctctctaaaggt 4496366  T
Q  376 gtcattcctaatcctat-ctg-gtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctca 431  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  4496365 gtcattcctaatcctatcctgtgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctca 4496308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14665993 - 14665658
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  14665993 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaattacgccagagttctatcataaaccatatttggatccaactcattgac 14665894  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  14665893 ttctaaattcttcctaatggtttctctaatagttttcctaggtctccctctacctcttttaacctgactctgctccatttgatctactcttcttacgacg 14665794  T
Q  282 gc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca----ttctctctctaatt 373  Q
    ||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||     
T  14665793 gcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctatcaacttctctactataggtgctacccccactctctctctctctaatg 14665694  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttacca 409  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||    
T  14665693 gtgtcatttctaatcctatcatgtctaggcttacca 14665658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34273294 - 34272808
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||  || ||||||||||||  ||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  34273294 caacaacaactaagccttatctcactaagtgaggttggctacatggatcgaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 34273195  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||              ||||||  |    
T  34273194 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctc--------------ttcttacca 34273109  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct------ 369  Q
    || ||    | |||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||          
T  34273108 cgacatctgcaggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctacccccactctctctctctctct 34273009  T
Q  370 ----aattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ct 464  Q
        ||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | | ||    
T  34273008 ctctaatggtgtcattcctaatcct-----gtctagtcttaccactcatccaatgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgact 34272914  T
Q  465 ctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaa 564  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34272913 cttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggccggactgctgtccgattgaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaa 34272814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20457054 - 20456778
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||   |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  20457054 caacaacaatcaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccataatgttctatcatacatcaaatttagattcaacttattg 20456955  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  20456954 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcgtaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 20456855  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgct 352  Q
    ||||    ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20456854 cggcatctacgggtcttctctctacatgttcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgct 20456778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 28163 - 27693
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||| ||||||| ||||||  | ||| ||| ||| |||||||| || |||||| | ||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  28163 caacaaaaaccaagtcttatctaactaaatggggtcagctacatgtatcaaattatgccatagtgttctatcagaaatcatatttggatccaacttatta 28064  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| || | |||||||   ||||||||||||| ||| ||  |    
T  28063 acctctaaatctttcctaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctcaacctcttttgatctgactctcacgcatctgatctactcttcgtacta 27964  T
Q  280 cggcacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtca 379  Q
    |        ||| || | |||  || |||| || |||| | ||||||| | || ||||||||||||||||||| |||  | ||| | || ||| ||||||    
T  27963 caaa-----tctcctacctac--gctcaaaccacctaagcctattttccatcatcttttctactataggtgctaccctaactctttttcaaatggtgtca 27871  T
Q  380 ttcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaac 478  Q
    ||| ||||| ||||| || |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  27870 ttcataatcatatcttgt-tagttttaccactcatctaatgcaacatcctcatctccgttatgcttacttaattctcatgttggttcttaaccgcccaac 27772  T
Q  479 acaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatc 557  Q
    || |||||||||||||||| ||  ||| ||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27771 actccgtaccatacaacatcgtctgtccgactattgtcagatagaattttcctttcaacttaagtggtactttcttatc 27693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 354 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20318985 - 20318777
Alignment:
Q  354 cccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgatt 453  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20318985 cccccactctttctctaatggtgtcattcctaatcctatcc-----agtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgatt 20318891  T
Q  454 cttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttc 552  Q
    ||  ||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    |    
T  20318890 ctcatgttgactcttaaccgcgcaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctatccgatataactttcctttcaacttaagtggta----c 20318795  T
Q  553 ttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20318794 ttatcgcacaaaacacct 20318777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 411
Target Start/End: Original strand, 26884690 - 26885025
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt-ggattcaacttatt 178  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||  |||    
T  26884690 caacaacaatcaagccttattccactaagtggggtcggctacatggatcaaattgcgtcgtagtgttctatcataaatcatattttggatccgacccatt 26884789  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
     || | |||||||||  |||| |||| |||||  |||||||||  ||  |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  26884790 aacctctaaatctttcctaatagtttttctta--gttttcctagctcatcctctacctcttttgacccgactctcctccatctgatctactcttcttacg 26884887  T
Q  279 acggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactttt-ctactataggtgcttcccccattctctctctaatt 373  Q
    ||  |    ||   |||| ||  |||||| ||||| |  |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||| ||||||     
T  26884888 acaacatctacaaatcttatctctacatgtccaaaccgcctaagcctattttctaccaacttttcctgctataggtgctaccctcactctctttctaatg 26884987  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26884988 gtgttattcctaatcctatcccgtctagttttaccact 26885025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 269
Target Start/End: Original strand, 13561387 - 13561576
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  13561387 caacaacaaacaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatagttggatccaactcattg 13561486  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctact 269  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13561487 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctact 13561576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 325
Target Start/End: Original strand, 38501422 - 38501668
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgact 182  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||| | |||||   |  || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38501422 caacaaccaagtcttatcccactaagtgggatcggctacatcgatcatattacactatagttttctatcataaatcatatttggatccaacttattgacc 38501521  T
Q  183 tgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacgg 282  Q
    | |||||  ||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||| | || | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38501522 tctaaatactttctaatagtttcttttatagttctcctaggtcttcatccatctcttttgatccgactctcctccatctaatctactcttcttacgacgg 38501621  T
Q  283 c----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattt 325  Q
    |    ||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  38501622 catctacaagtcttctctttacatgtccaaaccatctaaacctattt 38501668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 276
Target Start/End: Original strand, 2915497 - 2915692
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  2915497 caacaataaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataac-caaatttggatccaactcattg 2915595  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2915596 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttatcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttctta 2915692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14911452 - 14911258
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  || || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  14911452 aacaacaaccaaaccttattccattaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtattctatcaaaaatcatatttggatccaactcattaa 14911353  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctt 275  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  14911352 cctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacccgactctccttcatttgatctacttctctt 14911258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29816663 - 29816517
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  29816663 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 29816564  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29816563 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtct 29816517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Original strand, 16913883 - 16914021
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggag-tcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16913883 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgggggtcggctacatggatcaaatgacgccatggtgttctatcgtaaaccatatttggatccaactcatt 16913982  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    ||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16913983 gacctctaaatcctttctaatggtttctctaatagtttt 16914021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3394587 - 3394496
Alignment:
Q  482 ccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttct---ttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394587 ccgtactatacaacattgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 3394496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36215708 - 36215417
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| | ||||||    
T  36215708 agtgttctatcataagtcatgtttggattcaattaattgacctctaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt----------cctctacctcttt 36215619  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactt 336  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||| |||||   ||| |    ||| || ||||   ||| |||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  36215618 tgacctgactctcctccatccgatctactcttctttcaacgacatatacgagttttctttctacgtgccgaaaccatctaagcatatttcctaccaactt 36215519  T
Q  337 ttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctcc 436  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||   ||||||| ||||| ||||   |||||| ||||  || ||| || ||||||| ||||||||     
T  36215518 ttctactatagatgctacctccactctctccctaat--ggtcattcataatcatatcatatctagttttactgctcatctagcgcaacatactcatctct 36215421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28276519 - 28276390
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||  |  ||| || |||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  28276519 caacaacaaccaagccttatcccgctaagtggagttggctacatggatcaaattacaccatagttttctatcataaacaatatttgaatccaacttattg 28276420  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctctt 209  Q
    || | |||||  ||| ||||||||||||||    
T  28276419 acctctaaattctttctaatggtttctctt 28276390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15168828 - 15168744
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtctt 405  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  15168828 tattttctaccatcttttctactataggtgctaccccccaactccctctaatggtgtcattcttaatcctatctcgtctaatctt 15168744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20367174 - 20367080
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  20367174 caacaacaaccaagccttatcctaccaagtggggttggctatatggatcaaattacgtcataatgttatgtcataaaccatatttggatccaact 20367080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5558422 - 5558321
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| | |  |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||    
T  5558422 caacgacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattatgccatagtgttctatcataaaccatatttggatcctactcattg 5558323  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  5558322 ac 5558321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11675811 - 11675727
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  | |||| ||||||||| |||||||    
T  11675811 caacaacaaccaagccttatccaactaagtggggtcggctacatggattaaactacgccataatgttctatcataaaccatattt 11675727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 479
Target Start/End: Original strand, 31636128 - 31636319
Alignment:
Q  283 cacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattc 382  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || ||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||  |||||||     
T  31636128 cacgggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgctaccccaa--ctttctctaatgctgtcattt 31636225  T
Q  383 ctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaaca 479  Q
     |||| |||||  |||||||||||||||  ||| |    |||||| ||||||| ||||| | || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31636226 ataattctatccagtctagtcttaccacaaatcca----aacatcatcatctctgctacgcataatttatttttgtgttggttctttaccgcccaaca 31636319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14749377 - 14749270
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||||||  | ||||| ||||    
T  14749377 ggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagtctagtttctaccaatttttctactataggtgctacaccaactctctctctaatgttttcatttctaa 14749278  T
Q  387 tcctatct 394  Q
    ||||||||    
T  14749277 tcctatct 14749270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 446
Target Start/End: Original strand, 10082988 - 10083109
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaa 423  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||  | ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||  |||||  ||||    
T  10082988 tttctaccatcttttctactataggtgataccccaatgctctccctaatgttctcatttctaattctatcccgtctagtcttaccacacatcaa-agcaa 10083086  T
Q  424 catcctcatctccgctacactta 446  Q
    |||||||||| | ||||| ||||    
T  10083087 catcctcatccctgctacgctta 10083109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30213852 - 30213755
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||    
T  30213852 aacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattgac 30213755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39041035 - 39040918
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||   |  ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  39041035 acaacaatcaagtcttatcccattaagtggggtcggctacatggatcaaatgacactatggtgttatatcaaaaaccatatttagatgcaacttattgac 39040936  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaat 199  Q
     | |||||||||| ||||    
T  39040935 ctctaaatcttttctaat 39040918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 408495 - 408547
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  408495 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 408547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27386621 - 27386565
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27386621 caacaacaaccatgccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 27386565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38132617 - 38132561
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  38132617 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggccacatggatcaaattacg 38132561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42576291 - 42576235
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  42576291 caacaacaaccaagccttatcccactaagtcgggtcggctacatggatcaaattacg 42576235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10668620 - 10668569
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  10668620 aacaacaaccaagccttatcccaataagtggggtcggctacattgatcaaat 10668569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 43475520 - 43475465
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  43475520 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggagttggctacgtggatcaaattac 43475465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 269
Target Start/End: Original strand, 17340500 - 17340626
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttgg 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| || | ||||||||| ||||| ||| |  ||||| |||| ||| |||| | || | |  ||| |    
T  17340500 tgttatatcataaaccatatttggatcaaactcattaacctctaaatctttcttaatagttacaattataatttttctaagtcttcatctaccctttttg 17340599  T
Q  243 acccgactctcctccatctgatctact 269  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17340600 acctgactctcctccatctgatctact 17340626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18855888 - 18855834
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18855888 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatta 18855834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36551427 - 36551373
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  36551427 caacaacaaccaagccttatctcactaagtggggtcggctacatggatcaaatta 36551373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 440
Target Start/End: Original strand, 11002637 - 11002786
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatc 388  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||   || |||||||||  ||||||||| |||||||| |||  |  |||||||||||  ||||||| |||||     
T  11002637 tcttctacctacatgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatgttttctactgtaggtgctacccgaa--ctctctctaatgttgtcatttctaatt 11002734  T
Q  389 ctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgcta 440  Q
    |||||   ||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  11002735 ctatcccatctcgtcttaccacacatccagcgcaacatcctcatctctgcta 11002786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25938250 - 25938115
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||||  |  |||||||| |||||||  ||||||| |||||||| | ||    
T  25938250 caacaacaaccaagtcttatctcactatgtggagtcggctacatgaatcaaattacaacgtagtgttatgtcataaactatatttgaattcaactcagtg 25938151  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtt 215  Q
    |  | ||||   ||| |||| |||||||||||||||    
T  25938150 atctctaaaaaatttctaatagtttctcttatagtt 25938115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28411957 - 28411913
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  28411957 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatg 28411913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 32442127 - 32442182
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32442127 caacaataaccaagc-ttatcccactaagtggagtcggctacatggatcaaattacg 32442182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3001020 - 3000977
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  3001020 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacat 3000977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 7359262 - 7359321
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7359262 caacaacaaccaagtcttgtcccactaagtggggtcagctacatggatcaaattacgtca 7359321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 7640510 - 7640592
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||    
T  7640510 acaacaaccgagccttattccactaagtgggatcggctacatggatcaaattacgccgtagtgttctatcataaaccatattt 7640592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9234167 - 9234108
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  9234167 caacaacaatcaagccttatcccactaagtggggtcggttacatggatcaaattatgtca 9234108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 372
Target Start/End: Original strand, 15489706 - 15489789
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| || | |||| |||| ||||||||| |||||| || |||| | ||||||||||||    
T  15489706 tcttctctctacatgcccaaaccatctaagctgagtttcaaccatcttttctacaataggtactaccccaactctctctctaat 15489789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 43557834 - 43557928
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||  | |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  43557834 caacaacaaccaggccttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaacttaagtcataatgttctatcataaaccatatttcgatccaact 43557928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2049339 - 2049290
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2049339 acaacaaccaagccttatccca-taagtgcagtcggctacatggatcaaat 2049290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Original strand, 7367177 - 7367223
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaa 132  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  7367177 aacaaccaagccttatcccactaagtcgggtcggctacatggattaa 7367223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28985360 - 28985310
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28985360 aacaaccaagccttgtcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatta 28985310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33667286 - 33667216
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccc 357  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33667286 ggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgctacccc 33667216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 217
Target Start/End: Original strand, 42504311 - 42504385
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||||| | |||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  42504311 tgttctatcataaaccatatttggatataactcattgacatctaaatcctttttattgacttctcttatagtttt 42504385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10668685 - 10668648
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10668685 aacaacaaccaagccttatcccaataagtggggtcggc 10668648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27800108 - 27800055
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  27800108 aacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatgtatcaaatta 27800055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33667715 - 33667674
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  33667715 aacaacaaccaagccttatcccaataagtggggttggctaca 33667674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5860115 - 5860059
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5860115 caacaacaatcaagccttatcccactaagtagggtcggctacatagatcaaattacg 5860059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 305 - 409
Target Start/End: Original strand, 7359489 - 7359593
Alignment:
Q  305 ccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtct 404  Q
    ||||| || |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||   | |||||||||||   ||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  7359489 ccaaaccacctaaacctattttccaccatattttctactataggtgttacctgaactctctctctaacattgtcatttctaattctatctcgtccagtct 7359588  T
Q  405 tacca 409  Q
    |||||    
T  7359589 tacca 7359593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Original strand, 10989086 - 10989126
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10989086 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggcta 10989126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14667799 - 14667751
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct 369  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  14667799 tattttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctct 14667751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 363 - 435
Target Start/End: Original strand, 28186956 - 28187028
Alignment:
Q  363 tctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctc 435  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||    
T  28186956 tctctctaatgttgtcatttctaatcctaccatgtctagtcttaccacacatccaatgcaacattctcatctc 28187028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 375 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 36200764 - 36200684
Alignment:
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    |||||||||||||| ||||   | |||||||||| || ||| |  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  36200764 tgtcattcctaatcttatcctatttagtcttaccgctcatccaacgcaacatcctcatctctgatacgcttacttgattct 36200684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 105)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 52139081 - 52138586
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  52139081 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaataacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 52138982  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  52138981 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttaatctattcttcttacca 52138882  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    | |||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  52138881 cggcatctacaggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 52138782  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgt-gtggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  || ||||| ||||||    
T  52138781 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatcttgactcttaaccgcc 52138682  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||  ||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52138681 caacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcgcacaagacacct 52138586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 5169113 - 5168614
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  5169113 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 5169014  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |    
T  5169013 acctataaatcctttctaatggtttctctaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaactagactctcctccatttgatctactcttctaacaa 5168914  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca----ttctctctctaa 371  Q
    ||||    ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     |||||||||||    
T  5168913 cggcatctacgggtcttctctctacatgttcaaaccatctaagcgtattttctaccaacttttctaccataggtgctacccccactctctctctctctaa 5168814  T
Q  372 ttgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttac 470  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||| ||    
T  5168813 tggtgtcattcctaatcctatcctgtctagtcttacctatcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcatgttggctcttaac 5168714  T
Q  471 cgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5168713 cgcccagcactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 5168614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 28245718 - 28245226
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||  | |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| ||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  28245718 caacagcaatcaagccttatctcactaagtgggatcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctattatacaccaaatttggatccaactcattg 28245619  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| | || | ||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |    
T  28245618 acctctaaatcatttctaatcgtttctctaatagttttcctaggtcttcatctacctcttttaacttgactctcctccatttgatatactcttcttacca 28245519  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||||| |||||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  28245518 cggcatctacgggttttctctctacatgcccaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatgat 28245419  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || || || || ||||||    
T  28245418 gtcattcctaatcctatccaggctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctacacttacttaattctcatgttgacttttaaccgcc 28245319  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    |||||| ||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28245318 caacactccgtaccgtacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 28245226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 569
Target Start/End: Original strand, 51447718 - 51448204
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||| || |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  51447718 caacaacaaccaagccttatcccactaaatggggccggctacatgaatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 51447817  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |       |||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  51447818 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttc-------tcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 51447910  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||| |||||||  ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||    
T  51447911 cggcatctacggatcttctctctacatgcccaaactatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccct-actctctctctaatggt 51448009  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| | ||||| ||||||    
T  51448010 gtcattcctaatcctatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttagttgattctcatgttgactcttaaccgcc 51448109  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
     ||||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51448110 taacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 51448204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 89 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 54279294 - 54278850
Alignment:
Q  89 aaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgta 186  Q
    ||||||| |||||| || |||||||  |||||||||| ||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||||| | ||    
T  54279294 aaccaagtcttatcttattaagtgggatcggctacattgatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattgacctcta 54279195  T
Q  187 aatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca-- 284  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| | || | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||      
T  54279194 aatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcttctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactctttttaccacggcatc 54279095  T
Q  285 --cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattc 382  Q
      |||||||||||  ||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  54279094 tacgggtcttctctctacgtgcccaaaccgtctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccctactctctctctaatggtgtcattc 54278995  T
Q  383 ctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacaca 481  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||     
T  54278994 ctaattctatcttgtctagtcttaccacttatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacctgattcttatgttgactcttaactgcccaacact 54278895  T
Q  482 ccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaact 526  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  54278894 ccgtaccatacaacaacgctggtctgactgctgtccgatagaact 54278850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22353 - 21992
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22353 caacaacaaccaagctttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 22254  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |    
T  22253 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatggttttcttaagtcttcctctacctcttttaacccgactctcctccatttaatctactcttcttacaa 22154  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  22153 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattt-ctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 22055  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgc 438  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  22054 gacattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgc 21992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25191658 - 25191165
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||  || ||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||| |||  || | ||||    
T  25191658 caacaacaaccaagcattatcccactaagtgggatcagctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatattttgatctaattcattg 25191559  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| ||  ||| |||| | ||||||  ||| | ||||||||||| |||||| || ||||||  |    
T  25191558 acctctaaatcttttctaatggtttctcaaatgattttcttagttcttcctctacctcttttaaccgggctctcctccatttgatcttctcttcttacaa 25191459  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||| |    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||   |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |    
T  25191458 cggtatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagtctattttcttccaatttttctactataggtgctacccccattctctct--aatgat 25191361  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| | ||||| || |||    
T  25191360 gtcattcttaatcatatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgactcttaacagcc 25191261  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| | ||||||||||||||    |||||||||  ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191260 caacactctgtaccatacaacatttccggtctgactattgttcgatagaaccttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 25191165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 453
Target Start/End: Original strand, 47233597 - 47233974
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| |||||||||||  || | ||||    
T  47233597 caacaacaaccaagccttatcccactaactggggtcggctacatgaatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatctaattcattg 47233696  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |    
T  47233697 acctctaattcctttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcttcaacatcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttctaacaa 47233796  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  47233797 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccattctctctctaatggt 47233896  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgatt 453  Q
    |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  47233897 gtcatttctaatcttatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaatatcctcatcttcgctacacttactagatt 47233974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 53519861 - 53519372
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  53519861 caacaacaaccaagccttatctcactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcaaaaaccttatttggatccaactcattg 53519762  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | ||||||||||||||||||||            || || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  53519761 acctctaaatcttttttaatggttt------------tcttaggtcttcctctacctcttttaacatgactctcctccatttgatctactcttcttacaa 53519674  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactata------ggtgcttcccccattctctctct 369  Q
    |||||    ||| |||||||  | |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||| ||||| |||    
T  53519673 cggcatctacggttcttctctattcatgtccaaaacatctaagcctattttctaccaacttttctactatatatataggtgctacccccactctctgtct 53519574  T
Q  370 aattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctcttt 468  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||     
T  53519573 aatggtgtcattcttaatcctatcctgtctagtattaccactcatccaacgcaacatcctcatttccgctacactaactttactctcgtgttggctctta 53519474  T
Q  469 accgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||  ||||| |||||| | ||||||| |  | ||||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53519473 accgcttaacactccgtacaacacaacattgccgatctgactgctgtccgatagatttttcctttaagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacac 53519374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 350
Target Start/End: Original strand, 48953446 - 48953697
Alignment:
Q  108 aagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac--ttgtaaatcttttttaatggtt 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||| |  ||||||||| ||    
T  48953446 aagtggcgtcggctacatggattaaattacgtcatagtgttctatcataaatcatatttggatccaactcattgacctttataagttctttttaatgatt 48953545  T
Q  204 tctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtc-ttctcctt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    |||||| ||||| ||    
T  48953546 tctcttatagttttcctaggtcttcctctacttcttttgacccgactctcctccatctgatctactcttcttacgacaacatctgcgggtctttctcttt 48953645  T
Q  299 acatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtg 350  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48953646 acatgcccaaatcatctaagtttattttctaccaacttttctactataggtg 48953697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48508516 - 48508275
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  48508516 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttgaatccaactcattg 48508417  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48508416 acctctaaatcctttctaatggtttctcttatagttttcctaggtcttcctctacctcttttgacctgactctcctccatctgatctactcttcttacga 48508317  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaa 317  Q
    |  |    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  48508316 caacatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaa 48508275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 185 - 496
Target Start/End: Original strand, 33272129 - 33272450
Alignment:
Q  185 taaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca 284  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| |||| |||  ||||||  ||||||    
T  33272129 taaatcatttctaatggtttctctaatagttttcgtaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatatacacttcttaccacggca 33272228  T
Q  285 cgg---gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactata----ggtgcttcccccattctc--tctctaattgt 375  Q
          ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||| ||||  |||||||| ||    
T  33272229 tctacagtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatatataggtgctacccccactctctctctctaatggt 33272328  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| || |||    
T  33272329 gtcattcttaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaatgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaactgcc 33272428  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaaca 496  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  33272429 caacactccgtaccatacaaca 33272450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 361 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 38850090 - 38849880
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38850090 tctctctctcatgatgtcattcctaatcatatcatgtctagtcttactactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgt 38849991  T
Q  461 gg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgc 559  Q
     | ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38849990 tgactcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacatcgtcggtgtgactgttgtccgataaaaaatttctttcaacttaagtggtactttgttatcgc 38849891  T
Q  560 acaaaacacct 570  Q
    |||||||||||    
T  38849890 acaaaacacct 38849880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 54128660 - 54128280
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||   |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  54128660 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcgcctacatggatcaaattatgccataatgttctatcataaaccatatttgggtccaactcattg 54128561  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctctta-tagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    || | |||||||||  | || |||||||||| ||||||| ||| |||| |||| | |||||| || | ||||  ||||||||||||||||| | | ||      
T  54128560 acctctaaatctttccttatagtttctcttaatagtttttctaggtcttcctctacctctttcgatctgactaacctccatctgatctactctacgtact 54128461  T
Q  279 acggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
     |  ||    | |||||| ||  |||||||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |    
T  54128460 gcatcatctacaggtcttttctctacatgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctaccccaacactctctctaatgg 54128361  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  54128360 tgtcattcataatcctatcgcgtctagttttaccactcatcaaacgcaacatcctcatctctgctaagcttacttgattct 54128280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35033427 - 35033131
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  ||  ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  35033427 caacaacaaccaagccttatcccactagatgaggtcggctacatggatcaaataacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 35033328  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |    
T  35033327 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatttactcttcttacaa 35033228  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
     |||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35033227 tggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatataagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaat 35033131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 287 - 539
Target Start/End: Original strand, 43694977 - 43695230
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccc-attctctctctaattgtgtcattccta 385  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||      ||||||||||    
T  43694977 ggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcaaattttctaccaacttttctactataggtgctaccccccactctctctct------gtcattccta 43695070  T
Q  386 atcctatc-tg----gtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtggct-ctttaccgcccaaca 479  Q
    |||||||| ||    |||| ||||||||| | ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||   | ||  ||| |||||||    
T  43695071 atcctatcatgtcatgtctggtcttaccattcatccaacgcaacatcctcatctctgttacacttacttgattctcgtgttaattctcaaccacccaaca 43695170  T
Q  480 caccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaactt 539  Q
    | |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43695171 ctccgtaccatacaacatcgccggtctaactgctgtccgatagaacttttctttcaactt 43695230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 396 - 570
Target Start/End: Original strand, 47542033 - 47542207
Alignment:
Q  396 gtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaa 494  Q
    |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  47542033 gtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacactttctt-attctcatgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaa 47542131  T
Q  495 catagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||  |  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47542132 caacgccggtcagaccgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 47542207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 324 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 45728180 - 45728020
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg-tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgca 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||| || |||    
T  45728180 tttctaccaacttttctactatatgtgctacccccactctctctctaaatgatgtcatttctaatcctatttcgtctcgtcttaccactcatccagcgca 45728081  T
Q  423 acatcctcatctccgctacacttacttgattct--tgtgtggctctttaccgcccaacaca 481  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||    
T  45728080 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgggctcttaaccgcccaacaca 45728020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 298 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 27917629 - 27917360
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||| | |||||||||||||  |||| ||    
T  27917629 tacatgtccaaaccatctaagcctatttcctaccatcttttctactataggtgctaccccaa--ctttctctaatggggtcattcctaatcaaatctcgt 27917532  T
Q  398 ctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttg-tgtggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaaca 496  Q
    |||| ||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||| |||| || || || |||   |||||||||||||    
T  27917531 ctaggcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacgcttacttgattctcgttttggttcttaactgcacatcactttgtaccatacaaca 27917432  T
Q  497 tagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    | |  ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  27917431 tcgccggtgtgactgatgttcgatagaatttttcattcaacttaagtggtacttttttatcacataaaacac 27917360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38850402 - 38850125
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||||    
T  38850402 caacaacaactaagttttatcctactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgtcatagtgttctatcataaaccaaatttgaattcaattcattg 38850303  T
Q  180 acttgtaaat-cttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    |||| || || ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||| | |||||   ||  |||||||||||||  |||||||| |||||| |    
T  38850302 acttctagatccttttctaatggtttatctaataattttcctaggtcttcctctacctcttctaacttgactctcctccattcgatctactcttcttacg 38850203  T
Q  279 acggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgct 352  Q
    ||| |    || | |||||||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38850202 acgacctctactgatcttctctctacatgcccaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctactatatgtgct 38850125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 453
Target Start/End: Original strand, 49503766 - 49503937
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||| |||||||||| ||    
T  49503766 ggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctgaactctctctctaatggtgtcattcccaa 49503865  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagt-----gcaacatcctcatctccgctacacttacttgatt 453  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |     |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49503866 tcctatctcgtctagtcttaccactcatccaatccaacgcaacatccttatctccgctacacttacttgatt 49503937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 3186971 - 3186568
Alignment:
Q  158 catatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctcc 257  Q
    |||||||||||  |||| |||||| | |||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||| || || |  ||| | |||||| |||| |||| | |||     
T  3186971 catatttggatctaactcattgacctttaaattctttctaatgatttttcttatagttttcttaggtatttctccacctcttttgacctgacttttctca 3186872  T
Q  258 atctgatctacttttctta---tgacggc-acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgctt 353  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||  | ||   |||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  3186871 atctgatctatttttcttacaatgacatctacaaatcttctctctacatgcccaaatcatctagcct-attttctaccaactttcccactataggtgcta 3186773  T
Q  354 cccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgatt 453  Q
    || ||| ||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| || ||| |    || || ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3186772 ccaccactctttccataatggtgtcattcctaatcttatcccgccaagtcttaccgctcatccaacataagattctcatctacgctacatttacttgatt 3186673  T
Q  454 cttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttc 552  Q
    || |||| | ||||| | ||||||||||    || |||||||||| || |||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3186672 ctcgtgttgactcttaatcgcccaacactatatatcatacaacatcgttggtgggactgttgtccgatataactttcctttcaacttaagtgatactttc 3186573  T
Q  553 ttatc 557  Q
    |||||    
T  3186572 ttatc 3186568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26490374 - 26490119
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||| ||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |  |||| ||||||   |||||| |||||| ||||  ||    
T  26490374 tacatgtccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctcaa--ctctgtctaatgacgtcattgctaatcatatcccgt 26490277  T
Q  398 ctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccat--acaa 494  Q
    || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||| | | ||||||  ||||    
T  26490276 cttgtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattctcttgttggttcttaaccgcccaacata-cttaccatacacaa 26490178  T
Q  495 catagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttct 553  Q
    ||| |  |||||||||| ||||||||| || ||| |||| || ||||| |||| |||||    
T  26490177 catcgccggtctgactgttgtccgatataattttcctttaaatttaagcggtattttct 26490119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Original strand, 50960641 - 50960915
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgact 182  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||| |||||||  ||   || | ||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| |      
T  50960641 caacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctaaatggatcaaattacaccataatggtctatgatacaccatatttggatccaactcattaatc 50960740  T
Q  183 tgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacgg 282  Q
    | |||| ||||  |||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||      
T  50960741 tctaaacctttcctaatagtttctcttaaattttttctaggtcttcctctccctctttcgatccgactctcctccatctgatctactcttctttctacaa 50960840  T
Q  283 cacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccc 357  Q
    ||  |||||||||  |||||||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  50960841 cataggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacccc 50960915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38060995 - 38060858
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  38060995 caacaacaaccaattcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatggtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 38060896  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38060895 acttctaaaacctttctaatggtttctctaatagtttt 38060858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Original strand, 12096706 - 12096866
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  12096706 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 12096805  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    || | |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  12096806 acctctaaatcctttctaatggtttttctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttt 12096866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38060580 - 38060419
Alignment:
Q  212 agttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgccca 307  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||  ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    | |||||||||  |||||| |||    
T  38060580 agttttcctaggtctccctctaccttttttaacctgactctcctccatttaatctactcttcttacgacggcatctacaggtcttctctctacatgtcca 38060481  T
Q  308 aatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct 369  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  38060480 aaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctacccccactctctctct 38060419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 52156085 - 52156226
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  52156085 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcagatgacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 52156184  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttccta 221  Q
    || | |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  52156185 acctctaaatcctttctaatgatttctctaatagttttccta 52156226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 298 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 29817563 - 29817293
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||   ||||||||||||||  ||||  ||    
T  29817563 tacatgtccaaaccacctaaacttactttctacaatcttttctactataggtgctacaccaattctatttctatcagtgtcattcctaattatatcatgt 29817464  T
Q  398 ctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgt-gtggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaaca 496  Q
    | ||| ||  |||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||  | | |||| ||| |  ||||| || ||  ||||||||    
T  29817463 ccagttttgtcacttatccaacgcaacatcctcatctttgctacacttgattgatttttgtattagttcttaaccacttaacactccatattatacaaca 29817364  T
Q  497 tagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    |  | ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  29817363 ttatcggtctaactgttgtccggtagaaattttctttcaacttaagcgttactttcttatcacataaaaca 29817293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 53262422 - 53262295
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |  |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  53262422 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 53262323  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctc 207  Q
    || | ||||||| || ||||||||||||    
T  53262322 acctctaaatctcttctaatggtttctc 53262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 276
Target Start/End: Original strand, 30294183 - 30294318
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||| |||| | ||||||    
T  30294183 agtgttttatcataaatcatacttagatccaactcattgacctataaatcttttttaatagtttatcttatagttcttctaggtcttcctctacctcttt 30294282  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
     ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  30294283 tgacccgactctccttaatctaatttactcttctta 30294318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 410
Target Start/End: Original strand, 39600745 - 39601016
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttgg 242  Q
    |||| |||| |||| || |||||||| ||||| ||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||       
T  39600745 tgttctatcgtaaaccagatttggatccaactcattaacctctaaatctttcttaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctctacctcttgca 39600844  T
Q  243 acccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactttt 338  Q
    | | |||| ||||| |||||||||||| | ||    || | |    | ||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  39600845 atctgactatcctcgatctgatctactctcctcgctacagaatctacaggtcttctctttacatgccaaaaccacctaagcttgttttccaccatctttt 39600944  T
Q  339 ctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    ||||||||||| || |||| | ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||    
T  39600945 ctactataggtactaccccaactctctctctaatgttgtcatttctaatcttatcccatctagtcttaccac 39601016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49042218 - 49042081
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcat-aaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  49042218 caacaacaaccaagccttatctcaccaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaaccatatttggatccaactcatt 49042119  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttt 216  Q
     || | |||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  49042118 aacctctaaatctttcctaatagtttctcttatagttt 49042081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19737110 - 19736942
Alignment:
Q  248 actctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctact 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||    | |||||||||  | ||||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19737110 actctcctccatctgatctactcttcttactacaacatctacaggtcttctctctgcatgctcaaaccacctaaacctattttctaccatcttttctact 19737011  T
Q  344 ataggtgcttccccc-attctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||  | ||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  19737010 ataggtgctgcccccaactctctctctaatgatttcacttctaatcgtatcccgtctagtcttaccact 19736942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19758013 - 19757845
Alignment:
Q  248 actctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctact 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||    | |||||||||  | ||||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19758013 actctcctccatctgatctactcttcttactacaacatctacaggtcttctctctgcatgctcaaaccacctaaacctattttctaccatcttttctact 19757914  T
Q  344 ataggtgcttccccc-attctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||  | ||| | |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19757913 ataggtgctgcccccaactctctctctaatgatttcacttctaatcgtatctcgtgtagtcttaccact 19757845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 276
Target Start/End: Original strand, 45289092 - 45289288
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||| |||||| |  |   |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  45289092 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggcgacatggatcaaattatgctataatgttctatcataaaccatatttggatccaactcatta 45289191  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    |  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||| | |||||   | |  ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  45289192 atctctaaatctttcctaatagtttctcttatagttttcatagatcttcctctatctcttgtaatctaactatcctccatctgatctactcttctta 45289288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Original strand, 54425038 - 54425155
Alignment:
Q  152 ataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactc 251  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||| | |||||| |||| || ||    
T  54425038 ataaaccatatttggatccaacccattgacctctaaatcctttttaatggtccctcttatagctttcttaggtcttcctctacctcttttgacctgaatc 54425137  T
Q  252 tcctccatctgatctact 269  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54425138 tcctccatctgatctact 54425155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 480
Target Start/End: Original strand, 344957 - 345117
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtg 420  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |       
T  344957 tattttctaacatcttttctactataagtgctaccccaactctctctctaatgtcatcatttctaatcctatctcgtctagtcttaccacaaatccaaca 345056  T
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacac 480  Q
     |||||||| || |||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  345057 taacatcctaatttccgctatgcttactttattcttgtgttggttcttaaccgctcaacac 345117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Original strand, 48953695 - 48953818
Alignment:
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccg 472  Q
    ||||||||| |||||||||||  || | ||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||    
T  48953695 gtgtcattcttaatcctatctcatccaatcttaccgctcatccaacgcaacatcctcatctccgc-acacttacttgtttcttgtgttggatcttaaacg 48953793  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  48953794 cccaacactccgtaacatacaacat 48953818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 276
Target Start/End: Original strand, 52678916 - 52679045
Alignment:
Q  145 ttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggac 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||| |||| | || |  |||||  ||    
T  52678916 ttatatcatgaatcatatttgaattcaactcattaacctctaaatctttcataatagtttctct--tagttttcctaggtcttcttctacatcttttaac 52679013  T
Q  245 ccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52679014 ccgactctcctccatccgatctatttttctta 52679045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 276
Target Start/End: Original strand, 19162693 - 19162784
Alignment:
Q  185 taaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19162693 taaatctttcctaatagtttctcttatagatttcctaggtcttcctctaactcttttgacctgactctccttcatctgatctactcttctta 19162784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38431129 - 38430807
Alignment:
Q  87 acaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc-------agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||| |       | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  38431129 acaaccaagcctcatcctacttagtggggtcgactacatggatcaaattacgccgtaacgtaatgttctatcataaaccatatttggatccaactcatta 38431030  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||| |||    ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||| | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  38431029 acctctaaaccttccacaatagtttctcttgtagtttttctaagtcttcctctacctcttttgatttgactctcctccatctgatctactcttcatacta 38430930  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctct-----ctcta 370  Q
    |  ||    | |||| ||||  |||||||||||   | |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |  ||||     |||||    
T  38430929 caacatctgcaggtcgtctctctacatgcccaatcaacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctcaacgctctaaacgctcta 38430830  T
Q  371 attgtgtcattcctaatcctatc 393  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  38430829 atggtgtcattcctaatcctatc 38430807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 2133613 - 2133714
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  2133613 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcgagtacatggatcaaatcacgccatagtgttctatcataaactatatttggattcaactcattg 2133712  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  2133713 ac 2133714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 192
Target Start/End: Original strand, 311310 - 311422
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||| ||| |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  311310 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgtatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatctggatccaactaattg 311409  T
Q  180 acttgtaaatctt 192  Q
    || | ||||||||    
T  311410 acctctaaatctt 311422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3187024 - 3186972
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3187024 caacgaccaagccttatcctactaagtggagtcggctacatgaattaaattac 3186972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 45374478 - 45374534
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45374478 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggattaaattacg 45374534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 446
Target Start/End: Original strand, 50621647 - 50621731
Alignment:
Q  362 ctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||     |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50621647 ctctctctaatgttgtcatttctaatcctatcattcatagtcttaccacatatcaaatgcaacattctcatctccgctacactta 50621731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31146980 - 31146925
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31146980 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggagtcggctacatggatcaaattac 31146925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15296188 - 15296059
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |  | |||| ||||  ||||||||||||||| ||| | |||     
T  15296188 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggccacatggatcaaattacaccataatgttctatccgaaatcatatttggatccaattcatta 15296089  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctctt 209  Q
    || | |||||||||  |||| |||||||||    
T  15296088 acctctaaatctttcctaatagtttctctt 15296059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41530040 - 41529986
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41530040 acaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 41529986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 47555333 - 47555434
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  47555333 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 47555432  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  47555433 ac 47555434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 7895881 - 7895969
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || ||||||||    
T  7895881 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggat 7895969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26388540 - 26388487
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgc 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26388540 tacatgcccaaatcacctaaacctattttctaccatcttttctattataggtgc 26388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 410
Target Start/End: Original strand, 36820172 - 36820294
Alignment:
Q  286 gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattccta 385  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| || |||| | || |||| |||| |||| ||| |||||||||| |||| |  |||||||||||   |||||| |||    
T  36820172 gggtcttctctttacatgtctaaaccacctaagcctagtttccaccatctttgctaatataggtgctaccccaa--ctctctctaatgtcgtcatttcta 36820269  T
Q  386 atcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  36820270 atcctatctcgtctagtcttaccac 36820294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39235409 - 39235154
Alignment:
Q  90 accaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaa 187  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || | ||| ||   |||| |||| |||| ||||||| ||| ||||| ||| |||| |||    
T  39235409 accaagccttatcctactaagagg-gtcggctacatggatcaa-tcacgacataatgttctatcgtaaaccatatttagatccaactcattaacttctaa 39235312  T
Q  188 atcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc---- 283  Q
    ||||||  |||| |||| || |||||||||  |  |||| |||| | |||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||  |        
T  39235311 atctttcctaatagtttatcctatagtttttttgggtcttcctctacctcttttgatctgactttcctccatctgatctactcttcgtactacaacatct 39235212  T
Q  284 acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttcta 341  Q
    || |||||||||  |||||||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  39235211 acaggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttcta 39235154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 567
Target Start/End: Original strand, 40674513 - 40674606
Alignment:
Q  474 ccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || | |||| ||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  40674513 ccaacactccgtactatacaacattgttgatctgcctgatattcgatagaattttcctttcaacttaagtgatactttcttatcacataaaaca 40674606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 31566162 - 31566214
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31566162 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 31566214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Original strand, 44102958 - 44103002
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44102958 aacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtcggctacatgg 44103002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 49503569 - 49503625
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  49503569 caacaacaaccaagccttatcccactaagtagggtcggctacatggatcaaattacg 49503625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 344773 - 344828
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  344773 caacaacaaccaagccttatcctactaagttgggtcggctacatcgatgaaattac 344828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 432
Target Start/End: Original strand, 19676086 - 19676447
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgactt 183  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||   || | ||||||| | ||||||||||| ||||| ||| || |    
T  19676086 aacaaccaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaatcacgccataatgctctatcatacagcatatttggatccaactcattaacct 19676185  T
Q  184 gtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc 283  Q
     ||||| |||  |||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||| |  |||||| || | |||||||||| ||||||||| || ||  ||  || ||    
T  19676186 ctaaatttttcctaatagtttctcttacagtttttctaggtcttccttac-ctcttttgatctgactctcctctatctgatcttctctttgtactacagc 19676284  T
Q  284 a----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccat----------tctctctct 369  Q
    |    | |||||||||  |||||||| | | || |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |           |||||||||    
T  19676285 atctacaggtcttctctctacatgccaataccacctaagccaattttctatcatcttttgtactataggtgctaccccaacactctctctctctctctct 19676384  T
Q  370 aattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcat 432  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||   |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  19676385 aatggtgtcactcctaatcttatcccatctagtcttaccgctcatccaatgcaacatcctcat 19676447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 24778610 - 24778665
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24778610 caacaacagccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattac 24778665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 39512824 - 39512777
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  39512824 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggat 39512777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 40106621 - 40106715
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||| ||| |||||| |||  | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40106621 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtccactacattgatcaaattatgtcataatgttctatcataaaccatatttggatccaact 40106715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Original strand, 42510017 - 42510163
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | ||||  |||||||| ||||||| | | ||||| |||     
T  42510017 caacaacagccaagccttttccctctaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccataatgttcaatcataaaccatattttggtccaactcattt 42510116  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    | ||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  42510117 atttccaaatctttcctaatggtttctctgatagtttttctaggtct 42510163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Original strand, 52927852 - 52927903
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52927852 caacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatta 52927903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 30345459 - 30345313
Alignment:
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgat 520  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| ||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||   ||||| |   ||| | |    
T  30345459 caacatcctcatctccgctatacttaatt--ttcatgt-tggttcttaaccgcccatcactccgtacaatataacatcgtcaatctgattttcgtctggt 30345363  T
Q  521 agaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30345362 agaattttcctttcaatttaagcggtactttcttatcgcataaaacacct 30345313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35481208 - 35481150
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| || |||||||||||    
T  35481208 aacaacaaccaagccttatcccattaagtggggtcggctaaatgaatcaaattacgtca 35481150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 43694772 - 43694913
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||| ||| |||| |||||| ||| |||| |||||  | |||| ||||||||| |   ||| ||| |||   ||||    
T  43694772 caacaacaacccagctttatcccactaaatggggtcgactacatagatcaaatgacgtcgtattgttctatcataaacctagtttagatccaatccattg 43694871  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttccta 221  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43694872 acctctaaatcttttttaatggtttctctaatagttttccta 43694913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 49888467 - 49888409
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  49888467 aacaacaaccaaaccttttccaactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgtca 49888409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32170684 - 32170588
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||    
T  32170684 acaacaaccaagctttatctcactaagtggggtcggctacatggatcaaattatgtcataatgttatatcatagaccatatttctatccaacttatt 32170588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39208889 - 39208801
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  39208889 caacaacaaccaagccatatcccactaactggggtcctctacatggatcaaattacgtcataatgttctatcataaaccatatttggat 39208801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 363 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 45236850 - 45236753
Alignment:
Q  363 tctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||    
T  45236850 tctctctaatggtgtcatttctaatcatatccagtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctaatctcggctaggcttactttattctcgtgt 45236753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 46568112 - 46568027
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacactta 446  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46568112 tctctctctaatgttgtcatttctaattcaatctggtctagtcttaacacacatccaacacaacatcctcatctctgctacactta 46568027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Original strand, 54364977 - 54365060
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatattt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  54364977 caacaacagccaagccttatcccacta-gtgtggtcggctacatggatcaaattacgtcatagtgttctatcataaaccatattt 54365060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 455
Target Start/End: Original strand, 23534778 - 23534949
Alignment:
Q  283 cacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttatttt--ctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcat 380  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||| ||||||| ||||| ||  |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||  |||||||||||  ||||||    
T  23534778 cacgggtcttctc--tacatatccaaaccatctaagcttatattatctaccatcttttttactataaatgctacccccaa-ctctctctaatattgtcat 23534874  T
Q  381 tcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    | |||||| |||||| |||||| ||| ||   ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  23534875 ttctaatcttatctgatctagttttatcaaacatctaacgcaacatcctcttctccgctacgcttattttattct 23534949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 37083293 - 37083349
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  37083293 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacaaggaccaaattacg 37083349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41965859 - 41965819
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41965859 caacaacaaccaagccttatcccattaagtggagtcggcta 41965819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 45834601 - 45834653
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  45834601 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaat 45834653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46148309 - 46148253
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  46148309 caacaacaaccaagccttgacccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 46148253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 52882663 - 52882719
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  52882663 caacaacaaccaagccttctcccactaagtggggttggctacatggatcaaattacg 52882719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 53214872 - 53214928
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  53214872 caacaacaaccaagccttatccgactaaatggggtcggctgcatggatcaaattacg 53214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 388263 - 388322
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||    
T  388263 caacgacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacattgatcaaattacgtca 388322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 30797823 - 30797882
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  30797823 caacaacaaccaagccttattccactaagtggggtcggttacatagatcaaattacgtca 30797882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48532239 - 48532196
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  48532239 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacat 48532196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 411
Target Start/End: Original strand, 48734349 - 48734469
Alignment:
Q  289 tcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatc 388  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||| | |||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  48734349 tcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctattttctaccatctgttctactatacgcgctaccccaa--cactctctaatggtgtcattcataatc 48734446  T
Q  389 ctatctggtctagtcttaccact 411  Q
     ||||  | ||||| ||||||||    
T  48734447 ttatcccgcctagttttaccact 48734469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 49045114 - 49045063
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt 135  Q
    |||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  49045114 acaacaaccaagccttgtcccactgagtggggtcggctacatggattaaatt 49045063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 568
Target Start/End: Original strand, 54425349 - 54425400
Alignment:
Q  517 cgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54425349 cgataaaattttccttccaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacac 54425400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 659805 - 659759
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  659805 aacaacaaccaagccttaccccactaagtggggtcggctacatggat 659759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 436
Target Start/End: Original strand, 2340961 - 2341075
Alignment:
Q  322 attttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgc 421  Q
    |||||| |||| ||||||||| |  |||||| |||| |  | |||||||||  | ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||  ||| | |||    
T  2340961 attttccaccatcttttctacgaatggtgctaccccaacaccctctctaatgttttcatttctaattctatcatgtctagtcttaccacacatccaatgc 2341060  T
Q  422 aacatcctcatctcc 436  Q
    |||||||||||||||    
T  2341061 aacatcctcatctcc 2341075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 165
Target Start/End: Original strand, 4472388 - 4472473
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttg 165  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||| || ||||  |  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  4472388 caacaacaaccaagctttatcgaactaagtgtagtcggctacatggatcaagttacaccatagtgttctattataaatcatatttg 4472473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 45486850 - 45486904
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  45486850 caacaacaaccaagctttatcccactaagtggggccggctacatggatcaaatta 45486904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 130
Target Start/End: Original strand, 45493695 - 45493741
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggatt 130  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45493695 acaacaaccacgctttatcctactaagtggggtcggctacatggatt 45493741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7278745 - 7278688
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgt 139  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  7278745 caacaacaactaagctttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgt 7278688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 24084323 - 24084368
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgg 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24084323 caacaacaaccaaaccttatcccactaagtggagtcggttacatgg 24084368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 218
Target Start/End: Original strand, 24699571 - 24699640
Alignment:
Q  149 atcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttc 218  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  24699571 atcatagatcatatttagatccaaatcattgacttaaaaatcttttttaatagtttctctcataattttc 24699640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 192
Target Start/End: Original strand, 48734148 - 48734260
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |  | |||| ||||||||| ||| ||||||  |||||  |||    
T  48734148 caacaacaatcaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaacttacgccataatgttctatcataaaccatgtttggacccaactcgttg 48734247  T
Q  180 acttgtaaatctt 192  Q
    || | ||||||||    
T  48734248 acctttaaatctt 48734260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 14415261 - 14415305
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  14415261 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatg 14415305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 21862742 - 21862794
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21862742 caacaacaagcaagccttatctcactaagtggggtcggctacatggatcaaat 21862794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29601173 - 29601054
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||  | |||| |||||||||  ||||||| || ||||| |||     
T  29601173 caacaagaaccaagccgtatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaattacatcataatgttctatcataaactatatttgaatccaactcatta 29601074  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaat 199  Q
    |  | ||||||||| |||||    
T  29601073 atctctaaatctttcttaat 29601054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Original strand, 31454226 - 31454266
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  31454226 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggcta 31454266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 40273206 - 40273258
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40273206 caacaacaaccaaaccttttcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 40273258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 406
Target Start/End: Original strand, 45289314 - 45289425
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctact--ataggtgcttcccccattctctctcta-attgtgtcattcctaatcctatct 394  Q
    ||| |||||||| || |||| | ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||  | ||||||||| |||||| ||||     
T  45289314 tacgtgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactgaataggtgctaccccaactctctctctctaatgtgtcatttctaatcttatcc 45289413  T
Q  395 ggtctagtctta 406  Q
     |||||||||||    
T  45289414 cgtctagtctta 45289425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45728324 - 45728252
Alignment:
Q  187 aatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccat 259  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||||||||||    
T  45728324 aatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctatctcttttaacatgactctcctccat 45728252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Original strand, 54422916 - 54422976
Alignment:
Q  152 ataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttata 212  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  54422916 ataaaccatatttggatccaactcattgacctctaaatcctttttaatggtccctcttata 54422976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 82 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 82999 - 82509
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  82999 caacaacaaccaagccttattccattaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcataaatcatatttggatccaactcattg 82900  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |  |||  |||||||||||| |||| |||  |||||| ||    
T  82899 acctctaaatcctttctaatggtttctct-atagttttcctaggtcttcctctacctctcttaacc--actctcctccatttgatatacccttcttacga 82803  T
Q  280 cggcac----gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    | |||     || |||||||  || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  82802 ctgcatctatggatcttctctctatatgtccaaatcatctaagcccattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 82703  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  82702 gtcattcttaatcctatcatgtctagtcttactactcatccagtgcaacatcctcatctccgctgcacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcc 82603  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  82602 caacactccgtaccatacaagatcgtcggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaaggagtactttcttatcgcacaaaacac 82509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Original strand, 48119 - 48173
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48119 acaacaactaagcctaatcctactaagtggagtcggctacatggatcaaattacg 48173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 82 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 31749 - 31256
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  31749 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacttcacagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 31650  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |  |||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  31649 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctgggtcttcctctacatcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 31550  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
     ||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  31549 tggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 31450  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||| ||    
T  31449 gtcattcctaatcttatcctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctaatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacc 31350  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349 caacactccgtaccgtacaacaccgccggtctgactgctgttcgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 31256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 357
Target Start/End: Original strand, 44080 - 44150
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccc 357  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44080 ggtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctattttccgccatcttttctactataggtgctacccc 44150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 83 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 8181060 - 8180570
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||   |  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  8181060 aacaacaacgaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacactatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattga 8180961  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgac 280  Q
    | | |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  8180960 cctctaaatcctttctaatggtttatctaatagttttcctatgtcttcctctaccgcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaccac 8180861  T
Q  281 ggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtg 376  Q
    ||||    | |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  8180860 ggcatccacaggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcttattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtg 8180761  T
Q  377 tcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgccc 475  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||| ||    
T  8180760 tcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtcc 8180661  T
Q  476 aacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 566  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180660 aacactccgtaccatacaacaacgctggtctgactgatgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 8180570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 3866353 - 3865861
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  3866353 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtcggctacatggatcaaatgatgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 3866254  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||| | ||||||  |   | ||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  3866253 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggttttcctctacctcttttaatttgtctctcctccatttgatctactcttcttacca 3866154  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    || ||    |||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||    
T  3866153 cgacatctacgggtcttctctctacatgcacaaaccatctaagcctattttctaccaacttttttactataggtgctacccccactctctctccaatggt 3866054  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||| |    
T  3866053 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtc 3865954  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    |||||| |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3865953 caacactccgtaccatacaacaacgtcggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcacacaaaaca 3865861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36183732 - 36183264
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |  ||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  36183732 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtcggctacatggatcaaatggcaccatagtgttctatcatacatcaaatttggatccaactcattg 36183633  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||  |    
T  36183632 acttctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccattttatctactcttcttacca 36183533  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  36183532 cggcatctacgggtcttctctctacatgccgaaaccaactaagattattttctaccaacttttctactataggtgctacccctactctctctctaattgt 36183433  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  36183432 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 36183333  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagt 543  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36183332 caacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagt 36183264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 11992109 - 11992602
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||   |||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||    
T  11992109 caacaacaaccaagccttattccactaagtggggtcagctacatggatcaaataacgccataatgttctatcaaaaatcatatttggatctaactcattg 11992208  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||| |||| || || |||||| || |||| |||  | ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  |    
T  11992209 acctctaaatcctttctaatgatttccctaatggttttcttaggtcttcctttacctcttttaacccgactctcctccatttgatccactcttctaacaa 11992308  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||    
T  11992309 cggcatctacgggtcttctctctatatgtccaaaccatctaagcttattttctaccaacttttctactataggtgctaccctca--ctctctctaatggt 11992406  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  11992407 gtcattcctaatcttatcatgtctagtattaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcc 11992506  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    || ||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992507 catcactccgtaccatacaacattgccggtcagactgctgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 11992602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 41763044 - 41763537
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |  |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  41763044 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgcccgggtgttctatcaaaaaacatatttggatccaactaattg 41763143  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | || |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  41763144 acct-taaattttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctaccttttttaacctgactctcctccatttgatctacttttcttacaa 41763242  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    | |||||||||  | |||| ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  41763243 cggcatctacaggtcttctctctgcatgtccaaaccacctaagcctattttctaccaacttttctactataggtg-ttaccccactctctctctaatggt 41763341  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| |||| ||||||    
T  41763342 gtcattcctaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccatcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcc 41763441  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| | |||||||||||||| |  ||||||| || | | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763442 caacactctgtaccatacaacattgccggtctgattgttcttcgatagaactttccttttagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 41763537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 12734981 - 12734502
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  12734981 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcgactacatggatcaaattacaccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 12734882  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagc-tctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  12734881 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtctccctctaccctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacc 12734782  T
Q  279 acggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    ||||||    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  12734781 acggcatctacgggtcttctctttacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaatttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatgg 12734684  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgc 473  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    ||||||  ||| ||||||  |||||    
T  12734683 tgtcatttctaatcctatcccgtctagtcttaccactcatccagcacaacatcctcatctccactacactt----gattctcatgttggctctaaaccgc 12734588  T
Q  474 ccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgca 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |  ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12734587 ccaacactctgtaccatacaacatcgatggtttgactgttgtc-gatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttgtcgca 12734502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 90 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38430157 - 38429707
Alignment:
Q  90 accaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaa 187  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  38430157 accaagccttatctcactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattgacctctaa 38430058  T
Q  188 atcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca--- 284  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| |  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||       
T  38430057 atcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacttcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacaacggcatat 38429958  T
Q  285 -cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcc 383  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38429957 acgggtcttctctttacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctgcccccactctctctctaatggtgtcattcc 38429858  T
Q  384 taatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacac 482  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||| |||| |||||||||||| |    
T  38429857 taatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctccgctacacttactctactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactc 38429758  T
Q  483 cgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttcttt 533  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38429757 cgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctgatagaactttccttt 38429707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 41197228 - 41197724
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||   |||| ||||| ||| |||||| |||| |||||  |||    
T  41197228 caacaacaaccaagccttatcccatcaagtggggtcgactacatggatcaaatgacgccataatgttctatcaaaaaccatattgggatccaactcgttg 41197327  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggaccc-gactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||  ||| | || |||  | || ||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  41197328 acctctaaatcttttataatggtttctcaaatggttttcttaggtctttctctacctttttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttaca 41197427  T
Q  279 acggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    ||||||    ||| |||||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||| |    
T  41197428 acggcatctacggatcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctaccctcactctatctctaatgg 41197527  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgc 473  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||    
T  41197528 tgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatctagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgc 41197627  T
Q  474 ccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||   |||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41197628 ccaacactttgtaccatacaacattgctggtctgactgttgttcgatagaactttcctttcagcttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacct 41197724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 45367626 - 45368120
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| ||||  |||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||     
T  45367626 caacaacaaacaagttttatcccactaagtggggtcggcgacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcaaaaatcatatttggatccaactcattt 45367725  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||| ||||||| || |||||| |  |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||  |||| |  |    
T  45367726 acctctaaatcctttctaatgatttctctaatggttttcttgagtcttcctctacctcttttaactagactctcctccatttgatctacccttctaacaa 45367825  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||    
T  45367826 cggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaaggttattttctaccaacttttctactataggtgctacccccca-ctctctctaatggt 45367924  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |||| ||||||| | ||||    
T  45367925 gtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccattcatccagcgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaatcgcc 45368024  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368025 cagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgttgtccgataaaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 45368120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 3243654 - 3244147
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || | |||||| ||||| ||||    
T  3243654 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacctggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaacttggatccaactcattg 3243753  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||   ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||  |    
T  3243754 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctgcctcttttaacttgactctcctccatttgatctattcttcttacca 3243853  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  3243854 cggcatctacgggtcttctctctacattcccaaaccatctaagcctattttccatcaacttttttactataggtgctaccccca--ctctctctaatggt 3243951  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||| ||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| || | |    
T  3243952 gtcattcataatcctatcatgtgtagtcttactactcatccaacgcaacatccttatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaactgtc 3244051  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| ||||||||| |||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244052 caacactccgtaccattcaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacataagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 3244147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 4807876 - 4807378
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||| || | |  |||||||| ||||| ||||    
T  4807876 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcgtacaccgaatttggatccaactcattg 4807777  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| | || | ||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |    
T  4807776 acctctaaatactttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcatctacctcttttaacttgactctccttcatttgatctactcttcttacca 4807677  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct----aa 371  Q
    || ||    || ||||||||  || ||||| |||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    ||    
T  4807676 cgacatctacgagtcttctctctatatgccgaaactatctaagcctattt-ctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctaa 4807578  T
Q  372 ttgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttac 470  Q
    |  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| | ||||| ||    
T  4807577 tgatgtcattcataatcctatcatgtctattcttaccattcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaac 4807478  T
Q  471 cgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||| |||||| | ||  |||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807477 cgctcaacactctgtgtcatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacct 4807378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Original strand, 451649 - 452118
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| |  | |||||||| ||||| | ||    
T  451649 caacaacaaccaagccttgtcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacactaaatttggatccaactcactg 451748  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | || |||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  451749 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctaccttttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttacca 451848  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    |||||||| ||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||           ||||| |||||| ||||||||||||       
T  451849 cggcatctacgggtcttttctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaactt-----------gtgctacccccactctctctctaat--- 451934  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcc 474  Q
                ||||||  |||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||    
T  451935 ------------cctatcatgtctagtcttaccactcatctaacgcaacatactcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcc 452022  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452023 caacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 452118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 443
Target Start/End: Original strand, 38452687 - 38453057
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||| ||  ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  38452687 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcgaatgacaccatagtgttttatcatacaccaaatttggatccaactcattg 38452786  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||| |||||||| ||||||| | ||||||  |    
T  38452787 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactttcctccatttgatcta-tcttcttacca 38452885  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca----ttctctctctaa 371  Q
    |||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     |||||||||||    
T  38452886 cggcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagatgctacccccactctctctctctctaa 38452985  T
Q  372 ttgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacac 443  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||    
T  38452986 tggtgtcattcctaatcctatgatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatgtctgctacac 38453057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23997882 - 23997403
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    ||||| || |||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||| || |||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  23997882 aacaataatcaagtcttatctgaataagtggggtcggatacatgaatcaaataacgccatagtgttttatcaaaaaccatatttggatccaactcattga 23997783  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgac 280  Q
    | | |||||||||| |||||||||            || || |||| | || | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  23997782 cctctaaatcttttctaatggttt------------tcttaggtcttcttccacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacaac 23997695  T
Q  281 ggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtg 376  Q
    | ||    ||||||||||   |||||| | ||| |||||||   ||||||||||||| |||||||   |||||||| | |||| ||| |||||||| |||    
T  23997694 gacatctacgggtcttctttctacatgtcaaaaccatctaaggctattttctaccaaattttcta---taggtgctacacccactctatctctaatggtg 23997598  T
Q  377 tcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgccc 475  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||| || ||||    
T  23997597 tcattcctaatccgatcatgtctagtcttaccactcatccagcgcaacatcttcatctccgttacacttacttggctctcgtgttgactcttaactgccc 23997498  T
Q  476 aacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||  ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23997497 aacacttcgtaccatacaacattgtcggtcttactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtattttctcatcgcacaaaacacct 23997403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 361 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 2610524 - 2610314
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  2610524 tctctctctaatggtgtcattcctaatcctgtcctgtctagtcttaccactcatccaacgcagcatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgt 2610425  T
Q  461 gg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgc 559  Q
     | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610424 tgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccagtctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgc 2610325  T
Q  560 acaaaacacct 570  Q
    | |||||||||    
T  2610324 ataaaacacct 2610314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25834959 - 25834650
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg--tcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||   ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25834959 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccacagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 25834860  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| | ||||||  |||  |  ||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  25834859 acctctaaatcctttctaatggtttct-ttaaagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacctaa--ctcctccatttgatctactcttcttacaa 25834763  T
Q  280 cgg----cacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca--ttctctctctaatt 373  Q
    |||    ||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||     
T  25834762 cggcatccacaggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatg 25834663  T
Q  374 gtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||||||    
T  25834662 gtgtcattcctaa 25834650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 287 - 560
Target Start/End: Original strand, 16097198 - 16097480
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattct----ctctctaattgtgtcattc 382  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    ||||||||  ||||||||     
T  16097198 ggtcttctctctacatgtccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctacccccactctaactctctctaacggtgtcattt 16097297  T
Q  383 ctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctcttta----ccgcccaa 477  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |    ||| ||||    
T  16097298 ctaatcatatcccatctagtcttaccactcatccagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaaccgtccgtccaa 16097397  T
Q  478 cacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgca 560  Q
     |   ||||||||||||||     ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16097398 gatttcgtaccatacaacaacactggtctgactgctgtttgatagaactttcctttcaacttaagtggtaccttcttatcgca 16097480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2610869 - 2610576
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  2610869 caacaacaaccaagccttatctcactaagtggggtcggttacatggatcaaataacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 2610770  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | ||||||  ||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |    
T  2610769 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcataggtcttcctctacctcttttaacttgactctcatccatttgatctactcttcttacca 2610670  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct 369  Q
    || |    ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2610669 cgacatctacgtgtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttccactataggtgctacccccactctctctct 2610576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 324 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 30743655 - 30743411
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaa 423  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| | |||||  ||||  ||| |||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||| | ||||    
T  30743655 tttctaccaatttttctaccataagtgctacccc-actctcttcctaacggtgacattcccaatcctatcccgtctagtcttagcactcatcatgcgcaa 30743557  T
Q  424 catcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatag 522  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| || | |||| ||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||     
T  30743556 catcctcatctccacaacacttacttgattctcgtgttggcttttaatcgcctaactctccgtaccatacaacatcgtcggtctgaccgctatccggtaa 30743457  T
Q  523 aacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30743456 aactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacac 30743411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 411
Target Start/End: Original strand, 18424379 - 18424711
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  18424379 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggacgg-tacatggatcaaatgacgtcatagtgttctatcataaaccatattcggatcaaacttattg 18424477  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |  | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||| |     
T  18424478 atctctaaatcctttataatggtttctctaatagttttcctatgtcttcctctacctcttttaacctgactctcatccaattgatctaatcttcttacgt 18424577  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||| ||    
T  18424578 cggcatctacgggtcgtctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagatgctacaccca--ctctctctaatggt 18424675  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccact 411  Q
     |||||| ||||| ||||   |||||||||||||||    
T  18424676 atcattcttaatcatatcatatctagtcttaccact 18424711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 568
Target Start/End: Original strand, 6237815 - 6238247
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| || ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||  ||| | ||||||    
T  6237815 agtgttctatcataaactatatttgaatccaactgattgacctctaaatcatttctaatggtttatcttctagtttttctaggtcttactctacctcttt 6237914  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaactt 336  Q
     |||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    |||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  6237915 tgacatgtctctcctccatctgatctactcttcttacgacgacgtttacgggtctactctctacatgtccaaaccatctaagcatgttttctaccaactt 6238014  T
Q  337 ttctactat--aggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatct 434  Q
     |||  | |  |||||||    ||| |||||| | | | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||  |    
T  6238015 atcttttttttaggtgctatgtccactctctccc-attggtgtcattcctaattctatcatgtctagtcttaccgctcatccagcgcaacatcctcacat 6238113  T
Q  435 ccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttcttt 533  Q
     |||| || ||| |||||||| |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||  |||    
T  6238114 tcgctgcaattatttgattctcgtgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgtcagtctaactgttgtccgatagaattttctttt 6238213  T
Q  534 caacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  6238214 caacttaagtggta-ttttttatcacacaaaacac 6238247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31959802 - 31959625
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  31959802 caacaacaaccaagccttatcctactaagtggggtctgctacatggatcaaattatgccatagtgttctatcataaaccatatttggatccaactcattg 31959703  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctcc 257  Q
    || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | | |||||| |||| |||||||||||    
T  31959702 acctctaaatcctttctaatggtttctcttatagttttcctaggtcttcgcctaactcttttgacctgactctcctcc 31959625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28508959 - 28508770
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28508959 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcattg 28508860  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctact 269  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |  |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  28508859 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacatcttttaacttgactctcctccatttgatctact 28508770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 315
Target Start/End: Original strand, 7326161 - 7326400
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  7326161 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggttggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 7326260  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |    
T  7326261 acctctaaatcatttctaatggtttctctaatagttttcctatgtcttcctctacctcttttaacttgactctccttcatttgatctactcttcttacca 7326360  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatct 315  Q
    ||||    || |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  7326361 cggcatctacaggtcttctctctacatgcccaaaccatct 7326400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 350
Target Start/End: Original strand, 24583632 - 24583907
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaa--tcatatttggattcaacttat 177  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||  ||||| |||  ||| ||||| || ||||| ||    
T  24583632 caacaacaaccaagccttatctcattaagtggggtcggcaacattgattaaattacgtcatagtgtgctatcacaaaactcaaatttg-atccaactcat 24583730  T
Q  178 tgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttat 277  Q
    |||| | |||||| ||| |||||||||||||  |||||||  |  |||| | || | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  24583731 tgacctctaaatcctttctaatggtttctctattagtttttttttgtcttcatctatctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttac 24583830  T
Q  278 gacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtg 350  Q
    ||| |||    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24583831 gacagcatctacgggtcttctctctacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtg 24583907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 568
Target Start/End: Original strand, 24583905 - 24584100
Alignment:
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccg 472  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| |||  |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  24583905 gtgtcattcttaatcatatcatgtttagtcttaccactcatcccgcacaacatcttcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccg 24584004  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||    |||||||||||||| || ||||||  | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24584005 cccaacattttgtaccatacaacatcgtcggtctggatactatctaacagaacttttctttcaacttaagtggtattttcttttcgcacaaaacac 24584100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 38435233 - 38434866
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||   ||||  |||||||| || |||| ||| ||||  |||     
T  38435233 caacaacaaccaagccttatgccactaagtgggatcggctacatggatcaaattacgccataatgttcaatcataaaccaaatttcgatccaacacatta 38435134  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |  | || |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||   ||||   || | |||| |||||||| ||||||||| | ||||  |    
T  38435133 atctctagatctttcttaatagtttctcttgtagtttttctaggtctacctctgcctctagtgatctgactatcctccatatgatctactctccttacta 38435034  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaact-tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
      |||    |  |||||||| ||||||||||||| || | ||| | || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  38435033 aagcatctacaagtcttctctttacatgcccaaaccacccaaagtctagtttccaccatcttttctactataggtgctaccccaattctctctctaatgt 38434934  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctaca 442  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38434933 tgtcatttctaatcttctctcgtctagttttaccacgcatccaatgcaacatcctcatctccgctaca 38434866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35643229 - 35643083
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  35643229 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgtattaaatgatgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 35643130  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35643129 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtct 35643083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Original strand, 9996624 - 9996766
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcc---taataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaactta 176  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||  |||||  |||||||| ||||||||||| |||||      
T  9996624 caacaacaaccaagccttatccctcttctaagtggggtcggctacatggatcaaattatgccatagtgtttaatcataaaccatatttggatccaactcg 9996723  T
Q  177 ttgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcc 219  Q
    ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9996724 ttgacctctaaatcctttctaatggtttctcttatagttttcc 9996766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 512 - 568
Target Start/End: Original strand, 38453058 - 38453114
Alignment:
Q  512 ctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38453058 ctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 38453114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 359
Target Start/End: Original strand, 43238305 - 43238377
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43238305 ggtcttctctttacatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca 43238377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9496147 - 9496014
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  9496147 caacaacaaccaagccttgtcccactaagtggggttggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatatttggatccaactcatta 9496048  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatag 213  Q
    || | ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  9496047 acctctaaatctttctgaatagtttctcttatag 9496014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30306313 - 30306190
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||||| || |||||||| ||||| | ||    
T  30306313 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcataaaccaaatttggatccaactcaatg 30306214  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtt 203  Q
    || | |||||| ||| ||||||||    
T  30306213 acctctaaatcctttctaatggtt 30306190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 43573131 - 43573281
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |  |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  43573131 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccataacgttcgatcataaatcatatttggatccaactcatta 43573230  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    || | |||||||||  || | |||| |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  43573231 acct-taaatctttcctagttgtttttcttatagtttttctaggtcttcctc 43573281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 3635324 - 3635425
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3635324 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 3635423  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  3635424 ac 3635425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 43752159 - 43752244
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  43752159 ggtcttctctctacatgtccaaatcacctaagcctattttctaccaccttttctactataggtgctaccccaactctctctctaat 43752244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Original strand, 12520063 - 12520146
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatt 163  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||    
T  12520063 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttttatcataaaccatatt 12520146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 227470 - 227360
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  227470 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 227371  T
Q  180 acttgtaaatc 190  Q
    || | ||||||    
T  227370 acctctaaatc 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39029867 - 39029666
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctaca------tggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||      ||||| |||| ||| ||   |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  39029867 aacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacacctacatggatcaaatgacgccataatgttctatcaaaaaccatatttggatccaact 39029768  T
Q  175 tattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttct 274  Q
     |||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| || |||| |||| | ||||||  ||| |||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  39029767 cattgacctctaaatcttttctaatggtttctcgaatgtttttcttaggtcttcctctacctctttttacctgactttcctccaattgatctactcttct 39029668  T
Q  275 ta 276  Q
    ||    
T  39029667 ta 39029666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 7825429 - 7825260
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccc--cattctctctctaattgtgtcattccta 385  Q
    ||||||||  ||||||| |||| || |||| ||||||||  ||||  ||| | |||||||||||| | ||  || |||||||||||| |||||||| |||    
T  7825429 gtcttctctctacatgctcaaaccaactaagcttatttttcaccatatttacaactataggtgctactccaacactctctctctaatagtgtcatttcta 7825330  T
Q  386 atcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattct 455  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  7825329 atcatatccagtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctaatctctgctacgcttactttattct 7825260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Original strand, 45543074 - 45543210
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |  | |||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||     
T  45543074 caacaacaagcaagcattatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaagtacgccataatgttctatcataaaccatatttggatcgaactcatt- 45543172  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45543173 acctctaaatcttttctaatagtttctcttatagtttt 45543210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 9531601 - 9531657
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9531601 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacg 9531657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33287702 - 33287551
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||   |||| ||||||||| ||||||| |||  |||| |||     
T  33287702 caacaacaaccaagtcttgtcccactaagtggagttggctacaaggatcaaactatgtcataatgttctatcataaaccatatttcgatctaactcatta 33287603  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    | || || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  33287602 atttctagatctttcttaatagtttctcttatagtttttctaggtcttcctc 33287551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33504502 - 33504367
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgact 182  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |  | |||| ||||||| | |||||||  || ||||||||| | |    
T  33504502 caacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctagatggatcaaattacgccataatgttctatcatataccatatttcaatccaacttattaaat 33504403  T
Q  183 -tgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
     | || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33504402 ctctagatctttcttaatagtttctcttatagtttt 33504367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41545625 - 41545549
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41545625 agtgttctatcataaaccatatttgaattcaactcatggacctctacatcttttataatggtttctcttatagtttt 41545549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 39709202 - 39709296
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  39709202 caacaacaaccaagccatatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttcaatcataaaccatattttgatccaact 39709296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 42092576 - 42092436
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggt 397  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| |  ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  ||    
T  42092576 tacatgcccagatcacctaatcttagtttctaccatcttttctagtataggcgctaccccaa--ctctctctaacattgtcatttctaatcatatcccgt 42092479  T
Q  398 ctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgcta 440  Q
    |||||||||| ||  ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  42092478 ctagtcttactacacatccaatgcaacatcatcatctctgcta 42092436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Original strand, 12882046 - 12882179
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||     
T  12882046 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgaggtaggctacatggatcaaattacgccaaaatgttctatcacaaaccatatttggatccaactcatta 12882145  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatag 213  Q
    || | ||||| |||  || | |||||||||||||    
T  12882146 acctctaaatatttcctagtagtttctcttatag 12882179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 173
Target Start/End: Original strand, 35755247 - 35755339
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg--tcagtgttatatcataaatcatatttggattcaac 173  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35755247 aacaacaaccaagccttatcccactaagtagggtcggctgcatggatcaaattacggcacaatgttctatcataaaccatatttggatccaac 35755339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 12474928 - 12474980
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12474928 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 12474980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17670749 - 17670697
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17670749 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 17670697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 38328371 - 38328423
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38328371 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaat 38328423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 227358 - 227307
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaat 372  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  227358 tattttctacaaacttttctaccataggtgctacccccactctctctctaat 227307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1456169 - 1456095
Alignment:
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaaca 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  1456169 caacatcctcatctccgctacacttattttattcttgt-tggttctttaccttccaacactccgtcccatataaca 1456095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 9556370 - 9556425
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9556370 caacaacaaccaagcctcatcccactaagtggagtcggctacatgtatcaaattac 9556425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11412991 - 11412936
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  11412991 caacaacaaccaagccttatcctactaagtgagttcggctacatggatcaaattac 11412936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13149612 - 13149462
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||| ||   ||||||| |||||| |||||| ||||   |||| |||||| ||  |||||||||||| ||| ||| |    
T  13149612 aacaacaaccaagtcttatctcattaattgagatcggctatatggatcaaattatgtcataatgttctatcatcaacgatatttggattctactcattaa 13149513  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    | | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13149512 cctctaaatctttcataatagtttctcttatagttttcctaagtcttcctc 13149462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Original strand, 44437722 - 44437773
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44437722 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatgaattaaa 44437773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30743747 - 30743681
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctctt 209  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  30743747 tgttctattataaatcatatttggattcaactcattgacctctaaatcatttctaatggtttttctt 30743681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13149309 - 13149112
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg- 459  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| || |   ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| | |||     
T  13149309 tctctctcaaatggtgtcattcctaatcttatcccttttagtcttaccacttgtccaacacaacaccctcatctctgttacacttgcttgattttcgtgt 13149210  T
Q  460 tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatc 557  Q
    ||| |||| ||| ||  |||| | ||||| |||||||| ||  | |||  || ||||| ||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13149209 tggttcttaaccacctgacactctgtaccgtacaacatcgttagcctggttgttgtccaatataattttccttttaacttgagtggtactttcttatc 13149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 16521008 - 16521061
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt 135  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16521008 caacaacaaccgagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatt 16521061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 174
Target Start/End: Original strand, 19336896 - 19336988
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaact 174  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  19336896 acaacaaccaagctttatcccaataagtgggattggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatatttcgatccaact 19336988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 40759095 - 40759014
Alignment:
Q  361 tctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctaca 442  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |  ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  40759095 tctctctctaatgttgtcatttctaatcttatcttgtctagtcttacaccacatctagtgaaacatcctcatctcagctaca 40759014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3481435 - 3481379
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  3481435 caacaacaaccaagccttttccaactaagtggggtcagctacatggatcaaattacg 3481379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 12489803 - 12489847
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  12489803 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatg 12489847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 133
Target Start/End: Original strand, 19234988 - 19235036
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaa 133  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19234988 caacaactaagccttatcccactaagtggagttggctacatggattaaa 19235036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19855743 - 19855695
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggatt 130  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19855743 caacaacaaccacgctttatcctactaagtggggtcggctacatggatt 19855695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Original strand, 25284957 - 25284997
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25284957 caacaacaaccaagccttatcccagtaagtggagtcggcta 25284997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17429331 - 17429272
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||    
T  17429331 caacaacaaccaagccttatctcactaagtggggtcggctacatgaatcaaattatgtca 17429272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17581677 - 17581594
Alignment:
Q  143 tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |  |||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  17581677 tgttctatcataaatcatatttagattcaactcataaatatgtaaatctttcgtaatagtctctcttatagtttttctaggtct 17581594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36993815 - 36993757
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||||||| |||||||||||    
T  36993815 caacaacaaccaagccttatcccactaagttg-gtaggctacatggatcaaattacgtca 36993757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 128
Target Start/End: Original strand, 15775846 - 15775892
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatgga 128  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  15775846 caacaacaaccaagccttattccactaagtggggtcggctacatgga 15775892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18959192 - 18959138
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  18959192 caacaataaccaagccttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaatta 18959138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32443527 - 32443434
Alignment:
Q  444 ttacttgattcttgtgtggct-ctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaac 537  Q
    |||||||||||| |||| | | ||| ||| |||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  32443527 ttacttgattctcgtgttgattcttaaccacccaacactctgtaccatacaacattgt-ggtttgactgctatacgatagaatttttctttcaac 32443434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 135
Target Start/End: Original strand, 45482989 - 45483039
Alignment:
Q  85 caacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatt 135  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  45482989 caacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatagatcaaatt 45483039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 393
Target Start/End: Original strand, 13240958 - 13241063
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaat 387  Q
    ||||||||  |||||||||||| || |||| | || |||| |||| ||||||||  |||  |||| | || ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13240958 gtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctagtttccaccatcttttctaacatacttgctactccaattctctctctaatgttgtcatttctaat 13241057  T
Q  388 cctatc 393  Q
    ||||||    
T  13241058 cctatc 13241063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 18790107 - 18790195
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||| |||||||| ||| |||| ||   || |||||||||||||||||||||||    
T  18790107 caacaacaactaagccttctcccactaaatggggtcggcgacatggatgaaagtacgacatgatggtatatcataaatcatatttggat 18790195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 624687 - 624731
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  624687 caacaacaaccaagccttatcccactaagcggggtcggctacatg 624731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Original strand, 2073308 - 2073348
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  2073308 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggcta 2073348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Original strand, 9556582 - 9556737
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaat 387  Q
    ||||||||  |||||||| ||| || |||| | ||||||| ||||  |||||||||||| ||| | |||| | | ||||||||||  ||||||| |||||    
T  9556582 gtcttctctctacatgcctaaaccacctaagcctattttccaccat-ttttctactataagtgttaccccaactttctctctaatgttgtcatttctaat 9556680  T
Q  388 cctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacact 444  Q
    | ||||  ||||| |||||||||  ||| |   ||||||||||| |||| |||||||    
T  9556681 catatcccgtctaatcttaccacacatccaacacaacatcctcaactccactacact 9556737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Original strand, 10403894 - 10403934
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggcta 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10403894 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggcta 10403934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 10516750 - 10516806
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  10516750 caacaacaaccaagccttatcccactaagtgagatcagctacatggatcaaattacg 10516806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11412757 - 11412697
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcatt 381  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||    
T  11412757 tattttccaccatattttctactataggtgctaccccaactctctctctaatgttgtcatt 11412697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14444950 - 14444894
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||    
T  14444950 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggatggctacatggatcaaagtacg 14444894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15222526 - 15222474
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||| ||||    
T  15222526 caacaacaaccaagtcttatcctactaggtggggttggctacatggatcaaat 15222474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 460
Target Start/End: Original strand, 19337089 - 19337234
Alignment:
Q  314 ctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtcta-gtcttaccactt 412  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||  | |||||  ||||||||||  | ||| ||||||||||      
T  19337089 ctaagcttattttccaccatctttactactataggtgctaccccaa--ctctctctaatgttctcatttataatcctatcctgcctaagtcttaccacac 19337186  T
Q  413 atcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt 460  Q
    ||| |  | ||||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||    
T  19337187 atccaacgtaacatcctcatctccactacgcttattttattctcgtgt 19337234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19863515 - 19863463
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19863515 caacaacaaccaagctttatcccactaagtggggacggctacatggatcaaat 19863463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19867847 - 19867795
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19867847 caacaacaaccaagctttatcccactaagtggggacggctacatggatcaaat 19867795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19872748 - 19872696
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaat 134  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19872748 caacaacaaccaagctttatcccactaagtggggacggctacatggatcaaat 19872696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24214067 - 24214011
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24214067 caacaacaaccaaatcttatcccacaaggtggggtcggctacatggattaaattacg 24214011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25384750 - 25384694
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||  || |||||||||||| ||||||||    
T  25384750 caacaaccaccaagccttatcccactaagtgaggttggctacatggatcaaattacg 25384694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 28960212 - 28960256
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  28960212 caacaacaaccaagccttatcccactaaatggagtcgactacatg 28960256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 42543516 - 42543472
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  42543516 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggccggctacatg 42543472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 42549838 - 42549894
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  42549838 caacaacaaccaagctttatcccactaagtggggttggctacatgaatcaaattacg 42549894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 84 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30031535 - 30031084
Alignment:
Q  84 acaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||  || ||||| ||||||    
T  30031535 acaacaaccaagccttatcccactaagtgaggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttaaatccaactcattgac 30031436  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  30031435 ctctaaatcctttctaattgtttctctaatagttttcctaggtctccctctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacgacg 30031336  T
Q  282 gcac----gggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgt 377  Q
    |||     ||||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||     
T  30031335 gcatctatgggtcttctctctacatgtccaactcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactccctctctaatggtga 30031236  T
Q  378 cattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgccca 476  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||    
T  30031235 catttctaatcctatcccgtctagtcttaccactcatccaacacaacaacctcatctccgctacactaacttgattctcatgttggctcttaaccgccca 30031136  T
Q  477 acacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttt 528  Q
    |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30031135 acactccgtaccatacaacatcattggtctgactgctgtccgatagaacttt 30031084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 121 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 5632064 - 5631605
Alignment:
Q  121 tacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttc 218  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  5632064 tacatggatcaaatgacgtcatagtgttatatcaaaaaccatatttggatccaactcattgacctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttc 5631965  T
Q  219 ctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatc 314  Q
     || |||| |||    ||||||  | | ||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||    |||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  5631964 ttaagtcttcctttgtctcttttaatctgactctcctccatttgatctactattcttacgaaggcatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatc 5631865  T
Q  315 taaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca----ttctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccac 410  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5631864 taagcatattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctctctaatggtgtcattcctaatcatatccggtctagtcttaccac 5631765  T
Q  411 ttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgac 509  Q
    | ||| |   |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||    
T  5631764 tcatccaacacaacatcctcatcttcgctacacttactttactctcgcgttggctcttaaccgcccaacactccataccatacaacattgtcggtctgac 5631665  T
Q  510 tgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    || |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631664 tgttgtccgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 5631605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 28085657 - 28085196
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  28085657 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacaccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 28085558  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||  |||||| |||||| ||||||||| ||||||  |    
T  28085557 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctactccatttgatctactcttcttacca 28085458  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |   |    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  28085457 ctttatttacgggtcttctctctacatggccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggt 28085358  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||  |||||    
T  28085357 gtcattcgtaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttagccgcc 28085258  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaa 536  Q
    |||||| |||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28085257 caacactccgtaccatacagcaacaccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaa 28085196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 608442 - 607945
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  || || ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  608442 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtagggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtattctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 608343  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctac----gtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttctt 275  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||     |||| | |||| ||||||  | | ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  608342 aactctaaatcttttctaatggtttctcgaatagttttcttaattaggtcttcatcaacctcttttaatctgactctcctccatttgatccactcttctt 608243  T
Q  276 atgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaa 371  Q
    |  | ||||    | |||||||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  608242 acaaaggcatctacaggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctatcaacttttctactataggtgataccctca--ctctctctaa 608145  T
Q  372 ttgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttac 470  Q
    | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  608144 tggtgtcattcctaatcctatcctatctagtcttaccactcatccaacggaacatcctcatctccgctacacttactttattctcgtgttggctcttaac 608045  T
Q  471 cgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  608044 cgcccaacactccgtacaatacaacattgccggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcagtttaagtggtcatgtcttatcgcacaaaacacct 607945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 569
Target Start/End: Original strand, 20427637 - 20428131
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagcctt-atcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||  || ||  || || ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20427637 caacaacaaccaagtctttatcccactaagtcgggtcggctacattgattaaatgtcgccatagtattctattaaaaaccatatttggatccaactcatt 20427736  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
     || | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||   ||| ||||| |||| || |||| |||| ||||||      
T  20427737 aacctctaaat-ttttctaatggtttctctaatagttttcttaggtcttcctcaacctcttgtaacctgactcccctctatttgatttactcttcttaca 20427835  T
Q  279 acggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattg 374  Q
    ||||||    |||||||||||  |||| |  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  20427836 acggcatctacgggtcttctctatacacgttcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatgg 20427935  T
Q  375 tgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgc 473  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||| |    
T  20427936 tgtcattcctaatcctatcctgtcttgtcctaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttatttgactctcgtgttggctcttaaccac 20428035  T
Q  474 ccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 569  Q
    ||||||| | |||| |||||||||  |  || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20428036 ccaacactctgtactatacaacatttttagtttgactgctgtccaatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacc 20428131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 568
Target Start/End: Original strand, 5258149 - 5258644
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||  |||||  |||| ||| |||||||||||  | || ||||    
T  5258149 caacaacaaccaagacttatcccactaagtggggtcggctacgtggatcaaatgacgccatagtgtttaatcaaaaaccatatttggatctagctcattg 5258248  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||| | ||||| ||||||  || |||||| || ||||  ||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  5258249 acctctaaatcttgtctaatgatttctcgaatggttttcttaggtctttctctacctcttttaacatgactctcctccatttgatctactcttcttacaa 5258348  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctct--aatt 373  Q
    ||| |    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||      
T  5258349 cggaatctacgggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaacg 5258448  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccg 472  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||||  |||    
T  5258449 gtgtcattcataatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacattctcacctccgctacacttactttgctctcgtgttggctcttcgccg 5258548  T
Q  473 cccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5258549 cccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttctcatcgcaaaaaacac 5258644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 210 - 568
Target Start/End: Original strand, 10099990 - 10100351
Alignment:
Q  210 atagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcc 305  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||  | | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||    || ||||||||  |||||| |    
T  10099990 atagttttcctaggtcttcctctacctcttttaaactgactctccttcatttgatctactcttcttacaacggcatctacgagtcttctctctacatgtc 10100089  T
Q  306 caaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtctt 405  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  10100090 caaaccatctaagcttattttctaccaacttttctactatatgtgcgaccccca--ctctctctaatggtgtcatttctaatcatatattgtctagtctt 10100187  T
Q  406 accacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggt 504  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  10100188 accactcatctaacgcaacatcctcatctccgctacacttacttgactctcgtcttggctcttaacctcccaacactccgtaccatacaacatcgtcggt 10100287  T
Q  505 ctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10100288 ctgactactgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatctcacaaaacac 10100351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 9707051 - 9706562
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||     
T  9707051 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgatgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcatta 9706952  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||  ||| ||||| ||| || |||| | ||   || ||   | ||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |  |    
T  9706951 acctctaaatccttcctaacggtttatctaatggtttacttagcccttcccgtacctcttttaacctgactcttctccatttgatctactcttctaacaa 9706852  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    | ||||||||||  ||||      || ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| ||    
T  9706851 cggcttctatgggtcttctctctaca------aaccatctaagcctattttctaccaacttttctacaataggtgctacctccactctctctctaatggt 9706758  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||| ||    
T  9706757 gtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccagtgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccacc 9706658  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
     |||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706657 taacacttcgtaccatacaacattgccggtctgactgctgttcgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 9706562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 288 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 14030876 - 14030592
Alignment:
Q  288 gtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaat 387  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  14030876 gtcttctctatacatgtccaaaccatttaagcctattatctaccaacttttctactataggtgctacccccactatctctctaatggtgtcattcctaat 14030777  T
Q  388 cctatctggtctagtctt-accacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgt 485  Q
    ||||||  |||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| || || || |||||||||||| ||||    
T  14030776 cctatcctgtctagtcttaaccactcatccatcgcaacatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgacttttaaccgcccaacactccgt 14030677  T
Q  486 accatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||||||| |   || |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030676 accatacaacattgctagtttgactgttgtccgatagaactttcatttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 14030592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12890856 - 12890556
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||    
T  12890856 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatctaactcattg 12890757  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | || | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12890756 acgtctaaatcctttctaatggtttctcttatagttttcctaggtcttcatctacctcttttgaccttactctcctccatctgatctactcttcttacga 12890657  T
Q  280 cggcacgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtca 379  Q
    |||||    || | |   |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  12890656 cggca----tc-tatgggtacatgcccaaaccatgtaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctccctaatggtgtca 12890562  T
Q  380 ttccta 385  Q
    ||||||    
T  12890561 ttccta 12890556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32756202 - 32755833
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||| ||||| |||| || | |||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  32756202 caacaacatccaagtcttaccccactaagtgggatcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 32756103  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  32756102 acctctaaatcttttctaatggtttctctaatagttttcctaggtctttctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttatta 32756003  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca--ttctctctctaatt 373  Q
    || ||    ||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||     
T  32756002 cgacatcttcgggtcttccctctacatgaccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatg 32755903  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacac 443  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  32755902 gtgtcattcctaatattatcatgtctagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacac 32755833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 490
Target Start/End: Original strand, 35043442 - 35043857
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||  || ||||||| ||| |||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  35043442 caacaacaaccaagccttatctctttaagtgggatcagctacattgatcaaatgacgtcatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaacacattg 35043541  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||| | || |  |||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  35043542 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatggttttcttaggtcttcatctacttcttttaacctgactctcgtccatttgatctacttttcttacaa 35043641  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    |||||    ||||| |||||  |||||| |||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||| ||    
T  35043642 cggcatctacgggtattctctctacatgtccaaacaatctaagcctattttcaaccaacttttctactttaggtactaccctcactctccctctaatggt 35043741  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||| |    
T  35043742 gtcattcataatcctatcatgtctaatcttaccaatcatccagcgcaacatcttcatctccgctacacttacttgactctcatgttggctcttaaccgtc 35043841  T
Q  475 caacacaccgtaccat 490  Q
    |||||| |||||||||    
T  35043842 caacactccgtaccat 35043857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 185 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 2689810 - 2689447
Alignment:
Q  185 taaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||      ||| |||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2689810 taaatcttttttaatggtttctcttatagtttttctaggtctacctc------ttttgacatgactctactctatctgatctactcttcttatgacggca 2689717  T
Q  285 ----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcat 380  Q
        |  ||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||  |                || |||||||    
T  2689716 tctacatgtcttctctctacatgctcaaatcatctaagcctattttctacaaacttttcaactataggtgcaac----------------atggtgtcat 2689633  T
Q  381 tcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaaca 479  Q
    |||||||||||||   | |||||||||  || ||| |   |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | || |||| || |||||||||||    
T  2689632 tcctaatcctatcctatttagtcttactgctcatccatcacaacatcctcatctccactacatttacttaattctcgcgttggctgttaaccgcccaaca 2689533  T
Q  480 caccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaa 565  Q
    | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  2689532 ctccgtaccatacaacatcgacggtctgactgctgtccgattgaactttcctttcaacttaagtagtgctttcttatcacacaaaa 2689447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 441
Target Start/End: Original strand, 9593711 - 9594078
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| |||| |||||| |||||||   | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |     
T  9593711 caacaacaaccaagccttatgccactaagtgtggtcagctatatggatcaaattaccataatgttctatcataaaccatattgggatccaactcattaat 9593810  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
     | ||| |||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||| | |||||  ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  9593811 ctctaagtctttcctaatagtttctcttataatttttctaggtcttcctctacctctt--gatttgactctcctccatctgatctactcttcttactaca 9593908  T
Q  282 gca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattc------tctctctaa 371  Q
    |||    |  ||||||||  |||||||||||| || |||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| | ||      |||||||||    
T  9593909 gcatctacatgtcttctctctacatgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactaatggtgctaccccaactccctctctctctctaa 9594008  T
Q  372 ttgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctac 441  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9594009 tggtgtcattcctaatcctatcccgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctccgctac 9594078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 415
Target Start/End: Original strand, 21351871 - 21352175
Alignment:
Q  115 gtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttata 212  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||| |||||||||||||  |     
T  21351871 gtcggctacatggatcaattaacgtcatagtgttctatcaaaaatcatatttggatccagctcattgacctctaaatcttttctaatggtttctctattg 21351970  T
Q  213 gttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaa 308  Q
    |||||| || |||| |||| | ||||||  ||| |||||| |||||| || |||| | |||| |  | ||||    | |||||||||  |||||| ||||    
T  21351971 gttttcttaggtcttcctctacctcttttaacctgactcttctccatttgttctattcttctaacaatggcatcgacaggtcttctctctacatgtccaa 21352070  T
Q  309 atcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttacc 408  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||||||||   ||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21352071 atcatctaagcctattttctaccaatttttctactataggtgctacctcca--ctctctctaacgatgttattcctaatcctatcatatctagtcttacc 21352168  T
Q  409 acttatc 415  Q
    |||||||    
T  21352169 acttatc 21352175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 341 - 557
Target Start/End: Original strand, 2065018 - 2065239
Alignment:
Q  341 actataggtgcttcccccattctctct----ctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctcc 436  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||| |||||||||||   | |||||||||| || ||| || | | |||||||||||||    
T  2065018 actataggtgcttcccccactctctctttttctaatggtgtcattactaatcctatcatatgtagtcttaccgctcatccagggtagcatcctcatctcc 2065117  T
Q  437 gctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttca 535  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |   || | || | |||||||||||| ||| ||||||    
T  2065118 gctacacgtacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacattccgtaccatacaacatcgccagttttacggttgtccgatagaagtttcctttca 2065217  T
Q  536 acttaagtggtactttcttatc 557  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  2065218 acttaagatgtactttcttatc 2065239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 34143766 - 34143917
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  34143766 caacaacaaccaagccttatcccaataagtggggtcgactacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 34143865  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  34143866 acctctaaatcctttgtaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctc 34143917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 34156382 - 34156533
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  34156382 caacaacaaccaagccttatcccaataagtggggtcgactacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 34156481  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  34156482 acctctaaatcctttgtaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctc 34156533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 335 - 568
Target Start/End: Original strand, 6056032 - 6056264
Alignment:
Q  335 ttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatct 434  Q
    |||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||  |||   ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||| |    
T  6056032 ttttctactataggtgttaccccaa--ctctctctaatggtgtcattcttaatcacatcctttctagtcttaccactcatccaacgcaacatccgcattt 6056129  T
Q  435 ccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttcttt 533  Q
    |  |||| ||||||||||| | |||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  6056130 ctactacgcttacttgattttcgtgttggttcttaaccacccaacactccgtatcatataacattgtcggtctgaccgttgtccgatagaattatccttt 6056229  T
Q  534 caacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  6056230 caacttaaatgatattttcttatcgcataaaacac 6056264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 324 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5080888 - 5080766
Alignment:
Q  324 tttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaa 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  5080888 tttctaccaacttttctactataggtgatacccccactcgttctctaatggtgtcattcctaatcttattatgtctaatcttaccagttatccagcgcaa 5080789  T
Q  424 catcctcatctccgctacactta 446  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  5080788 catcctcatctccactacactta 5080766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30679677 - 30679417
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||| |||| |||| |   |||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||    
T  30679677 caacaacaaccaagtcttatcccattaagtgggatcggctacatagatcaaatgacgttataatgttctatcatagaccgaatttggatccaacttattg 30679578  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||           | |||||   ||  |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||    
T  30679577 acttctaaatcctttttaatggtttctctaatagtcttcctat----------acctcttataacttgactctactccatttgatctactattcttacga 30679488  T
Q  280 cggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactata 346  Q
    || ||    ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30679487 cgacatctacgggtctcctctctacatgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactata 30679417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 30679344 - 30679260
Alignment:
Q  486 accatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30679344 accatacaacatcgtcggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaacttatgtggtactttcttatcgctcaaaacacct 30679260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Original strand, 10098897 - 10099023
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| | |||||||  || ||||| ||||||    
T  10098897 caacaacaatcaagtcttatcccactaagtggggtcgattacatggatcaaatgacgttagtgttctatcatacaccatatttaaatccaactcattgac 10098996  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctct 208  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  10098997 ctctaaatcttttttaatggtttctct 10099023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 497
Target Start/End: Original strand, 28026896 - 28027248
Alignment:
Q  148 tatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccg 247  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| | ||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  || |||| |||| | |||||   | | |    
T  28026896 tatcataaaccatatttgaatacaaatcattaacctgtaaatctttcataatggtttttcttatagtttttttaggtcttcctctacctcttctaatctg 28026995  T
Q  248 actctcctccatctgatctacttttcttatgacggca----cgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctact 343  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || |||    | ||| || ||  |||||| ||||| || | || | ||||||||||||  |||||||||    
T  28026996 actctcctccatctgatatactcttcgtactaccgcatctacaggtgttatctctacatgtccaaaccacc-aagcctattttctaccacattttctact 28027094  T
Q  344 ataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacac 443  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||| ||||  |    
T  28027095 ataggtgc-taccccattctctatctaacgacgtcattcctaatcctatgccatctagtcttaccactcatccaacataacatcctcgtctctgctatgc 28027193  T
Q  444 ttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
    ||||||||||||  || ||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  28027194 ttacttgattctcatgttggttcttaacctcccaacactccataccatacaacat 28027248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 34506 - 34657
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| |||||||  || ||||| |||     
T  34506 caacaacaaccaagtcttatcccactaagtggggtcagctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatatttcaatccaactcatta 34605  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    |  | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  34606 atctttagatctttcttaatggtttctcttatagtttttctaggtcttcctc 34657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33497179 - 33496966
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  33497179 agtgttatatcataaatcatatttggatccaactcattgacctttaaatcctttctaaaggtttctctaatagtttttctagatctccctctacctcttt 33497080  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaactta-ttttctaccaact 335  Q
      ||  ||  ||||| ||| |||||| || |||||| ||| ||    || |||||||||  |||||| ||||| ||||||| | || |||||||| ||||    
T  33497079 taacttga--ctccttcatttgatcttctcttcttacgacagcgtttac-ggtcttctctctacatgtccaaaccatctaagcctatttttctactaact 33496983  T
Q  336 tttctactataggtgct 352  Q
    ||||||| |||||||||    
T  33496982 tttctaccataggtgct 33496966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5081060 - 5080925
Alignment:
Q  141 agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| | || | ||||||    
T  5081060 agtgttctatcataaatcatatttgtatccaactcattgacctctaaataattttgaatgatttctctaatagttttcctaggtcttcatctatctcttt 5080961  T
Q  241 ggacccgactctcctccatctgatctacttttctta 276  Q
      ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  5080960 taacgagactctcctccatttgatttactcttctta 5080925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 33496178 - 33496023
Alignment:
Q  363 tctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tg 461  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| ||||   | || |||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || ||    
T  33496178 tctctgtaatggtgtcatttctaatcttatcctatttaatcttaccattcatccaatgcaacatcatcatctccgttacacttacttgattctcatgttg 33496079  T
Q  462 gctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtcc 517  Q
    | | || |||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  33496078 gtttttaaccgtccaacactctgtaccatacaacattgcaggtctgactgttgtcc 33496023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5096115 - 5095927
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| ||| |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||     
T  5096115 caacaacaaccaaaccttatcccactaagtgggatcggctacatagatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatattttgatccaactcatta 5096016  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctac 268  Q
    ||   |||||||||  |||  ||||||||| ||||||| ||| |||| |||| | |||||  || |  |||||| ||||||||||||||    
T  5096015 accactaaatctttcctaagagtttctcttctagtttttctaggtcttcctctacctcttctgatctaactctcttccatctgatctac 5095927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 194
Target Start/End: Original strand, 3206460 - 3206574
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3206460 caacaataaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctattaaaaaccatatttggatccaactcattg 3206559  T
Q  180 acttgtaaatctttt 194  Q
    || | ||||||||||    
T  3206560 acctctaaatctttt 3206574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 190
Target Start/End: Original strand, 34934831 - 34934941
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| | | |  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  34934831 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgaggccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 34934930  T
Q  180 acttgtaaatc 190  Q
    || | ||||||    
T  34934931 acctctaaatc 34934941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7133922 - 7133795
Alignment:
Q  185 taaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca 284  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  7133922 taaatcatttctaatggtttctctaatagtttttctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaccacggca 7133823  T
Q  285 ----cgggtcttctccttacatgcccaa 308  Q
        |||||||||||  |||||||||||    
T  7133822 tcttcgggtcttctctctacatgcccaa 7133795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7136845 - 7136718
Alignment:
Q  185 taaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacggca 284  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| | ||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  7136845 taaatcatttctaatggtttctctaatagtttttctaggtcttcctctacctcttttaacttgactctcctccatttgatctactcttcttaccacggca 7136746  T
Q  285 ----cgggtcttctccttacatgcccaa 308  Q
        |||||||||||  |||||||||||    
T  7136745 tcttcgggtcttctctctacatgcccaa 7136718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8364837 - 8364700
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcag--tgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||||| ||| |||   | |||||||||     
T  8364837 caacaacaataaagccttttcccactaagcggggtcggctacatggatcaaattacgccataatgttctatcataaaccatgtttcagtccaacttatta 8364738  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagtttt 217  Q
    | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8364737 atttctaaatctttcttaatagtttctcttatagtttt 8364700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 33084128 - 33083966
Alignment:
Q  287 ggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaa 386  Q
    |||||||||  ||||| |||||| || ||||   || ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||   |||||| ||||    
T  33084128 ggtcttctctctacattcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctaccataggtgctaccccaactctctctctaatatcgtcatttctaa 33084029  T
Q  387 tcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttactt 449  Q
    | |||||   ||||||||||||||  ||| |  ||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  33084028 ttctatcccatctagtcttaccacacatccaacgcagcatcctcatttctgctacgcttactt 33083966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33730246 - 33730192
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33730246 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatgaaatta 33730192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31819112 - 31819011
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  31819112 caaccacaaccaagcattatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 31819013  T
Q  180 ac 181  Q
    ||    
T  31819012 ac 31819011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2079558 - 2079506
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2079558 aacaaccaaaccttaccccactaagtcgagtcggctacatggattaaattacg 2079506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5053807 - 5053764
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5053807 caacaacaaccaagccttatcctactaaatggggtcggctacat 5053764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5897738 - 5897679
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||| |||||||||||    
T  5897738 caacaacaatcaagccttatcccactaagtgggatccgctacatggatcaaattacgtca 5897679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 18130815 - 18130870
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattac 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18130815 caacaacaactaagccttatcccattaggtggggtcggctacatggatcaaattac 18130870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29931117 - 29931070
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggat 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  29931117 caacaagaaccaagccttatcctactaagcggggtcggctacatggat 29931070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31818812 - 31818666
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||| |||| || ||| ||||| |||     
T  31818812 caacaacaaccaagctttttcccgctaagtggggtcggctacatggatcaaattacgacataatgttctatcataaaccatactttgatccaactcatta 31818713  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtct 226  Q
    |  |  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31818712 atctccaaacctttcctaatagtttctcttatagtttttctaggtct 31818666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Original strand, 30789076 - 30789134
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  30789076 aacaacaaccaagccttatcccactaagtaggatcggctacatggatcaaatgacgtca 30789134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 579699 - 579643
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacg 138  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  579699 caacaacaaccaagctttatcccactaagtgggatcggctacatagatcaaattacg 579643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 141
Target Start/End: Original strand, 12119647 - 12119703
Alignment:
Q  86 aacaaccaagccttatcctaataagt-ggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12119647 aacaaccaagccttatcccactaagtgggggtcggctacatggatcaaatgacgtca 12119703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 535 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 33496018 - 33495986
Alignment:
Q  535 aacttaagtggtactttcttatcgcacaaaaca 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33496018 aacttaagtggtactttcttatcacacaaaaca 33495986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 566
Target Start/End: Original strand, 86610 - 87101
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | | |    
T  86610 caacaacaaacaagtcgtatcccactaagtggagccgactacatggatcaaattacgtcatagtgttctatcatacatcatatttggatccaacctgtcg 86709  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| || |||||||||| | |||||||||| |||||| || | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  86710 acctctaaatcctttctagtggtttctctaacagttttcctaggtctccatctacctcttttaacctgactctcctccatttgatctactcttcttacga 86809  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||| |   |   || | |  |||||||||||| ||    
T  86810 cggcatctacgggtcttctctttacatgtccaaactatctaagactattttctaccaacttttctactct--ctctctctctctctctctctctaatggt 86907  T
Q  376 gtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgt-ggctctttaccgcc 474  Q
    |||||| |||||| ||||   ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||    
T  86908 gtcatttctaatcttatcctttctggtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctcctctacacttacttgagtctcatgtcggctcttaaccgcc 87007  T
Q  475 caacacaccgtaccatacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaactttt-----ctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaac 566  Q
        |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||      |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  87008 ---aacactgtaccatacaaaatcgttggtctgactgctgtccaatagagcttttttttcttttcaacttaagtgatactttcttattgcataaaac 87101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 393
Target Start/End: Original strand, 949 - 1264
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  949 caacaacaaccaagccttatcccactaaatggggtcagctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 1048  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||  |   |||||| |||||| ||||||||| ||||||  |    
T  1049 acctctaaatcttttttaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctctacctcttttaatttgactcttctccatttgatctactcttcttacca 1148  T
Q  280 cggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgt 375  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||    
T  1149 cggcatctacgggtcttctctctacatggccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctca--ctctctctaatggt 1246  T
Q  376 gtcattcctaatcctatc 393  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  1247 gtcattcataatcctatc 1264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 399 - 570
Target Start/End: Original strand, 2594 - 2766
Alignment:
Q  399 tagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtgtgg-ctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaacat 497  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||     
T  2594 tagtcttaccactcatccaatgaaacatcctcatctctgctacacttacttgattatcatgttgactcttaaccgcccaacactccataccatacaacaa 2693  T
Q  498 agtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 cgtcagtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 2766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 298 - 568
Target Start/End: Original strand, 11819 - 12092
Alignment:
Q  298 tacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttccccca--ttctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctg 395  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||       
T  11819 tacatgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactatctctctctgatggtgtcattcctaatcctattat 11918  T
Q  396 gtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtaccatacaa 494  Q
    ||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||  ||||||||||    ||||||| |||    
T  11919 gtctagtcttaccgctcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacatacttgattctcatgttgactcttacccgcccaacattttgtaccatgcaa 12018  T
Q  495 catagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacac 568  Q
    ||     | ||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12019 caactccgttctgattgctgaccgataaaactttccttttaacttaagaggtactttcttatcgcacaaaacac 12092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 315
Target Start/End: Original strand, 11550 - 11787
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtcagtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattgac 181  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||  | |   ||| || |||||||| ||||  ||||||    
T  11550 caacagcaaccaaaccttatcctactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgtcatagtactctatcaaaccaaatttggatccaaccaattgac 11649  T
Q  182 ttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatgacg 281  Q
    || |||||  ||| ||| | ||||||| |||||||||||| || | | || | |||||   ||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11650 ttctaaattctttctaacgatttctctaatagttttcctaggtattcgtctacctcttctaacttgactctcatccatttgatctactcttcttatgacg 11749  T
Q  282 gc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatct 315  Q
    ||    |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  11750 gcatctacgggtcttcgctctacatgcccaaatcatct 11787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 321 - 488
Target Start/End: Original strand, 25691 - 25859
Alignment:
Q  321 tattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |       
T  25691 tattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaaca 25790  T
Q  421 caacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccgcccaacacaccgtacc 488  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  25791 caacatcctaatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtacc 25859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 25533 - 25684
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||    
T  25533 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtccgctacatggattaaatgacgtcatagtgttctatcatacaccaaatttggatccaactcattg 25632  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctc 231  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  25633 acctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctaggtcttcctc 25684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4917 - 4713
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  4917 caacaacaaccaagcgttatcccacaaagtggggtcggctacacggatcaaattacgccatagtgttctatcataaaccatatttggatttaactcattg 4818  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    || | |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | || | ||||||  | |  |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4817 acgtctaaatcctttctaatggtttctcttatggttttcctacgccttcatctacctcttttaatcttactctcctccatctgatctactcttcttacga 4718  T
Q  280 cggca 284  Q
    |||||    
T  4717 cggca 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 488
Target Start/End: Original strand, 4281 - 4686
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggag-tcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttatt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| ||| | ||| |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| ||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  4281 caacaagaaccaagccttatcccattaaatgggggtcgcctacatggatcaaataacgtcatagtgttctattataaaccaaatttagatccaactcatt 4380  T
Q  179 gacttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatg 278  Q
    ||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||           | ||||||  ||  || |||||||||| ||||||||| ||||||      
T  4381 gacctctaaatcctttctaatggtttctctaatagttttcctat----------acctcttttaacttgattctcctccatttgatctactcttcttacc 4470  T
Q  279 acggc----acgggtcttctccttacatgcccaaatcatctaaacttattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccat-tctctctctaatt 373  Q
    || ||    ||| |||||||   ||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||     
T  4471 acagcttctacgagtcttctttctacatgcccaaactatctaagcctattttttaccaacttttctactataggtgccaccccactctctctctctaatg 4570  T
Q  374 gtgtcattcctaatcctatctggtctagtcttaccacttatcaagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattcttgtg-tggctctttaccg 472  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||| || | || | |||||||||||| ||| || ||| | ||||    
T  4571 gtgtcatttataatcctatcatgtctagtcttaccattcatccaacgcaacatcctcatatctgttaaatttacttgattctcgtgttgactcataaccg 4670  T
Q  473 cccaacacaccgtacc 488  Q
     ||||||| |||||||    
T  4671 tccaacactccgtacc 4686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16859 - 16699
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |  |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16859 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggagtcggctacatagatcaaatgacgccatagtgttctatcaaaaaccatatttggatccaactcattg 16760  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctcttt 240  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||| |||| | ||||||    
T  16759 acctctaaatcttttctaatggtttctcgaatggttttcttaggtcttcctctacctcttt 16699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14864 - 14723
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca--gtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||||||||  |||||| | || |||| || |||||||||||| |||||||| ||  |||||  |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  14864 caacaacaaccaagatttatcccactacgtggggttggctacatggatcaaattacgccatagtgttcaatcataaaccatatttgaatccaactcattg 14765  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttccta 221  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14764 acctttaaatcctttctaatggtttctcttaaagttttccta 14723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 612 - 484
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || |||||| | ||||| ||||    
T  612 caacaacaatcaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttgggtacaactcattg 513  T
Q  180 acttgtaaatcttttttaatggtttctct 208  Q
    || | |||||| ||| |||||||||||||    
T  512 acctctaaatcctttctaatggtttctct 484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 518 - 570
Target Start/End: Original strand, 29 - 81
Alignment:
Q  518 gatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacct 570  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29 gatagaactttcctttcaacttaattggtactttcttatcgcacaaaacacct 81  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7720 - 7523
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggattcaacttattga 180  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||||||| |  |||||| |||| | || |||||||| || ||||| | |||    
T  7720 aacaacaaccaagctttatcccactaagtggagatggctgcatggatcaaattacgccatagtgttctatcgtgaaccatatttgaatccaactaaatga 7621  T
Q  181 cttgtaaatcttttttaatggtttctcttatagttttcctacgtctccctcaagctctttggacccgactctcctccatctgatctacttttcttatga 279  Q
    | | | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||   | |  |||||| |||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7620 cctctgaatcttttctaatagtttatcttatagttttcttatgtcttgat-acactcttttgacttcactctcctccatctgatatactcttcttatga 7523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 28890 - 28978
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtc--agtgttatatcataaatcatatttggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||||| | || ||||||||    
T  28890 caacaacaaccaagccttatcccactaagtggggtcggctacatggatcaaatgacgccatagtgttctatcatacaccaaatttggat 28978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1582
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  1523 caacaacaaccaagctttatcttaataagtggggtcagctacattgatcaaattacgtca 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3713 - 3659
Alignment:
Q  87 acaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaattacgtca 141  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3713 acaaccaagtcttatcccactaagtggggtcggctacttggatcaaattacgtca 3659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26100 - 26047
Alignment:
Q  83 aacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatggattaaatta 136  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  26100 aacaacaagcaagccttatcgtactaagtggggtcggctacatggctcaaatta 26047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 99287 - 99331
Alignment:
Q  82 caacaacaaccaagccttatcctaataagtggagtcggctacatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||    
T  99287 caacaacaaccaagccttatcccactatgtggtgtcggctacatg 99331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University